广东省广州市花都区人民法院
民 事 判 决 书
（2017）粤0114民初524号
原告（反诉被告）：广州市香根草业科技有限公司，住所地广州市天河区，统一社会信用代码91440106721935295B。
法定代表人：冯子元。
委托诉讼代理人：张永准，广东羊城律师事务所律师。
被告（反诉原告）：广州白云国际机场集团综合开发有限公司，住所地广州市白云区，统一社会信用代码91440101190497053H。
法定代表人：古广汉。
委托诉讼代理人：范嘉君，该公司职员。
原告广州市香根草业科技有限公司（以下简称香根草业）与被告广州白云国际机场集团综合开发有限公司（以下简称白云公司）建设工程合同纠纷一案，本院于2017年1月5日立案后，白云公司在答辩期内提起了反诉，本院经审查后予以受理。本院依法适用简易程序公开开庭进行了审理。香根草业委托诉讼代理人张永准及白云公司委托诉讼代理人范嘉君均到庭参加诉讼。本案现已审理终结。
原告向本院提出诉讼请求：1.判令被告立即支付原告建设工程款259321.50元；2.判令被告按上述应付建设工程款每逾期一天按万分之一支付原告违约金至清付之日止，暂计违约金（自2015年7月21日起至2016年11月30日止）12914元；3.判令被告支付逾期建设工程款利息，按中国人民银行同期同类贷款利率自应付建设工程款逾期之日起至全部清付之日止，暂计（自2015年7月21日起至2016年11月30日止）利息16806元；4.本案诉讼费由被告承担。
事实和理由：原告与被告于2014年10月15日签订一份《花都颐和山庄（云梯山庄）建设工程园建施工合同》（合同编号：YHBY-440-E-YL[2014]001），随后又签订了《补充协议一》。上列合同签订后，原告如约履行合同义务，E区合同应结算工程合同款为511621.5元，除已支付进度款252300元外，尚余259321.59元应付建设工程款至今尚未支付。上述事实有施工合同书、工作联系函、工程量确认单、工程量计量表、银行结算单据等为据。原告曾就上述款项多次向被告催讨，并于2016年5月20日发律师函催告未果。
被告辩称，一、原告主张的应付工程款额有误，被告应付而付的工程款暂为140700元，最终支付的款项以工程结算为准。根据《花都颐和山庄(云梯山庄)建设工程园建施工合同》及补充协议约定：补充协议增加价款暂为39万元，原合同造价为134000元，现变更后的合同总造价调整为524000元；工程完工经甲方(被告)书面确认后，甲方支付至乙方(原告)合同造价的75％给乙方；工程结算后90天内，甲方支付至工程合同结算总造价的95％给乙方；余额5％待保修期满后无质量问题情况下结清。保修期内如果出现工程质量问题，待整改合格后保修金才予以支付。目前工程已完工但末结算。根据上述约定，被告应支付合同造价的75％即393000元。被告累计已付252300元，尚欠140700元。被告最终应付款金额应待工程结算后确认。
二、关于逾期支付工程款的违约责任问题。对于逾期支付工程款问题双方在施工合同中有明确约定，应以约定为准：甲方(被告)应按时付款，每逾期l天，支付当期应付款万分之一的违约金。原告要求既支付违约金又支付利息，被告对此不予认可。另外，被告认为违约金的计算时间应以《工程量确认单》中最后一方签字确认的次日起算，而非原告主张的自2015年7月21日起算。
三、原告施工的工程质量存在问题，暂未通过被告验收，暂不具备结算条件。被告于2016年5月20日收到原告提交的440亩E区香根草工程验收申请表，随后双方到现场初验，发现工程质量存在以下问题，并要求原告尽快整改：l、E区临湖边坡种植的香根草局部未完善；2、边坡按种植方案中需点缀的开花灌木长势不佳，未形成相应的景观效果。但原告一直没有整改，被告其后将验收资料退回原告，并通过邮件方式通知原告：部分边坡种植生长情况较差，暂不予以验收。
最后，被告认为，原告仅凭《工程量确认单》上的种植面积请求支付工程款既不公平也不合理。涉案工程是香根草种植，植物成活率、长势等是验收应考量的重要因素，只有经过验收确认的工程量才能作为结算的依据。因现阶段双方对工程尚未结算，工程总价款仍是未知数，暂不具备支付余款条件。综上，请求驳回原告的诉讼请求。
白云公司向本院提出反诉请求：1.判令香根草业向白云公司开具金额为252300元的有效发票；2.判令香根草业向白云公司支付违约金26200元（以合同价524000元的5%计算）；3.诉讼费用由香根草业承担。
事实与理由：白云公司与香根草业于2014年10月15日签订《花都颐和山庄（云梯山庄）建设工程园建施工合同》，约定：香根草业承包花都颐和山庄440亩E区03组团边坡种植香根草工程；合同暂定总价为134000元；乙方（香根草业）收款时需同时向甲方（白云公司）提供税务局认可的等额有效发票，否则甲方有权拒绝付款，且不需承担任何违约责任；乙方若有违反合同约定的，应向甲方支付合同价的5%违约金并赔偿甲方的实际损失。其后，双方于2014年12月1日签订《花都颐和山庄（云梯山庄）建设工程园建施工补充协议（一）》，约定：合同总造价调整为524000元；本补充合同没有约定的，仍按原合同条款执行。上述合同签订后，白云公司向香根草业支付工程款累计252300元，但香根草业至今仍未向白云公司提供任何发票。白云公司多次催促，香根草业仍拒不履行。香根草业的行为已违反合同约定，理应承担相应的违约责任。
香根草业针对反诉辩称，不同意白云公司的反诉请求。理由如下：一、双方诉争的工程合同款项至今尚未清结。我方在双方未能解决全部工程款的情况下，对开具发票的金额无法确定，故不会也不可能向白云公司出具发票。二、在我方未收齐全部工程款时，双方已约定由我方向白云公司暂时开出收据，待全部工程款结清后再一次性开具发票。香根草业在涉案工程中先后三次向白云公司出具收据，白云公司根据收据的金额支付了相应的工程款。根据《合同法》有关交易惯例的规定，双方这一支付方式已构成交易惯例。双方在全部工程款未结清的情况下，由香根草业向白云公司出具支付收据，白云公司先行支付部分工程款，待全部工程款结清后再开具发票，既符合双方交易惯例，也符合建设工程的实际交易习惯。三、在诉争工程款没有结清的情况下，香根草业没有开具正式发票符合交易惯例，也没有违约，不须承担违约责任。
本院经审理查明如下事实，2014年10月15日,原告香根草业（乙方、承包方）与被告白云公司（甲方、发包方）签订《花都颐和山庄（云梯山庄）建设工程园建施工合同》（合同编号：YHBY-440-E-YL[2014]001），合同相关内容如下：第一条工程概况，工程名称为花都颐和山庄440亩E区03组团边坡种植香根草工程，工程地点在广州市花都区梯面镇。承包范围以甲方的书面委托及设计变更为准。承包方式为由乙方按照甲方提供的《预算审核书》采用包设计、包工包料、包工期、包某甲、包质量、包验收合格、包利润、包某乙金、包物价上涨及各项风险的包干方式承包。第二条工程造价及结算方式，合同暂定总价为134000元，（详见附件《花都颐和山庄440亩E区边坡种植香根草工程预算审核书》）。第三条，工期60个日历天，自2014年8月30日至2014年10月30日。乙方不得以任何理由（下述情况除外）延误工期。在履约过程中，因设计变更或不可抗力延误的工期，经甲、乙双方签证认可后可进行调整，从而确定竣工日期，乙方应按此日期竣工。第四条工程质量验收标准及保修期限，按照国家及省、市有关规定执行。按甲方提供的园建设计、施工图纸规定的材料规格、质量标准。保修期为2年，保修期自工程竣工验收合格之日起计算。如质量有瑕疵，乙方无偿返修。第六条工程款支付和结算，工程进度款支付：合同签订且乙方人员进场施工后，甲方支付合同造价的20%备料款给乙方。工程量完成50%时提供实际完成工程量的附表并经甲方书面确认后，甲方支付至工程合同造价的45%工程款给乙方。工程完工经甲方书面确认后，甲方支付至工程合同结算总造价的75%给乙方。工程结算后90天内，甲方支付至工程合同结算总造价的95%给乙方，余额5%待保修期满后无质量问题情况下结清。保修内如果出现工程质量问题，待整改合格后保修金才予以支付。乙方收款时需同时向甲方提供税务局认可的等额有效发票，否则甲方有权拒绝付款，且不需承担任何违约责任。工程验收与竣工结算：1.工程竣工验收以甲、乙双方确认后的施工图及说明书、图纸会审记录、国家颁发的施工及验收规范和质量检验标准为依据。2．隐蔽工程在隐蔽前3天乙方书面通知甲方到场验收，双方签字确认。3.工程(包括单项工程)竣工前7天，乙方自检合格并备齐相关竣工验收资料后在5天内通知甲方配合乙方进行验收，甲方须在接到通知后3天内派员工与乙方共同验收。如质量不合格，由乙方在商定的期限内补建或返修后再验收，直至符合要求为止。最后验收合格的日期为竣工日期，由此发生的质量或其他问题山乙方负责。第八条违约责任：1.乙方若有违反合同约定的，应向甲方支付合同价的5％违约金并赔偿甲方的实际损失，有具体违约规定的，按具体规定执行……合同还对其他事项进行了约定。
上述合同附件工程造价清单中显示，E区边坡种植香根草含税包干单价为26元/平方米。
2014年12月1日，白云公司与香根草业就上述合同签订《花都颐和山庄（云梯山庄）建设工程园建施工补充协议》（编号：YHBY-440-E-YL[2014]001-1），约定：增加工程款暂为390000元，原合同造价为134000元，现变更后的合同总造价为524000元。结算方式：工程内容具体按施工图及甲方确认的内容为准，以合同综合单价包干，工程量按实结算。
合同签订后，香根草业进场施工。2015年11月15日全部工程完工。白云公司已向香根草业支付涉案工程工程款共252300元。白云公司付款时，香根草业均以出具《收据》形式确认收款情况。
2016年1月20日，双方对花都颐和山庄440亩E区边坡种植香根草工程《工程量确认单》（编号：20151202-01）予以确认，白云公司确认香根草业施工的工程量为：按方案三种植香根草实际面积为4217.25平方米，按方案四种植香根草实际面积为6324.50平方米。
2016年5月26日，双方对花都颐和山庄440亩E区边坡种植香根草工程《工程量确认单》（编号：20160520-01）予以确认，白云公司确认香根草业施工的工程量为：按合同中方案四种植香根草实际面积为3982.50平方米。
原告解释根据施工合同附件约定，方案三按每平方米26元单价计算；方案四则根据香根草业与白云公司在另外一个区域（颐和山庄AB区）所签订的施工合同约定的单价计算，按每平方米39元计算。由此原告计算本案涉案工程款为511621.5元（4217.25×26+6324.5×39+3982.5×39）。对此，香根草业提交了另一区域的《花都颐和山庄（云梯山庄）建设工程园建施工补充协议(一)》（编号：YHBY-440-A、B-YL[2014]001-1）和《工程预算审核书》（AB边坡补充工程）拟证明其主张。该审核书中显示AB区边坡种植香根草方案四的包干单价为每平方米39元。被告白云公司确认工程单价为每平方米26元；对香根草业主张的方案四按每平方米39元计算不予确认，认为E区和AB区工程种植方案没有可比性，不能直接将AB区的种植单价适用在本案涉案工程上。
本院认为：原告与被告就涉案工程签订的《花都颐和山庄（云梯山庄）建设工程园建施工合同》及补充协议是双方的真实意思表示，内容不违反法律、行政法规的强制性规定，合法有效。双方均应依约履行各自义务。
涉案工程于2015年11月15日完工，之后双方已对工程量进行了确认。工程量确认结果为按方案三种植香根草实际面积为4217.25平方米、按方案四种植香根草实际面积为10307平方米（6324.50平方米+3982.5平方米），因此，白云公司应按实际工程量向香根草业支付相应的工程款。根据施工合同附件显示，涉案E区边坡种植香根草单价为每平方米26元，该单价为统一价，并未区分不同方案不同价格，原告要求所谓的“方案四”按每平方米39元计算没有依据。原告提交的《花都颐和山庄（云梯山庄）建设工程园建施工补充协议(一)》（编号：YHBY-440-A、B-YL[2014]001-1）和《工程预算审核书》（AB边坡补充工程）为另一区域的工程施工合同和审核书，与涉案区域不属于同一区域，其要求将另一区域工程所约定的单价直接适用于涉案工程工程理由不充分。因此，涉案工程应统一按每平方米26元计算工程款，即被告应付工程款总额为377630.5元[（4217.25平方米+6324.5平方米+3982.5平方米）×26元/平方米]。扣除已付金额，被告尚欠原告工程款为125330.5元（377630.5元-252300元）。
合同约定，工程结算后90天内，甲方（白云公司）支付至结算总造价的95%给乙方（香根草业），余额5%待保修期满后无质量问题情况下结清。双方于2016年5月26日对剩余工程量进行了确认，该时间应认定为结算时间。2016年5月26日至本案法庭辩论结束时尚未超过两年，即工程保修期尚未届满，按约定白云公司应向香根草业支付总工程款的95%即358749元（377630.5元×95%）。综上，白云公司应向香根草业支付工程款106449元（358749元-252300元）。被告未按时支付工程款，原告要求支付逾期付款利息合理合法，逾期付款利息应自结算后第91天即2016年8月25日起计算。对工程余款18881.5元（125330.5元-106449元），香根草业可在保修期满后另行主张。关于逾期付款违约金，合同并未进行约定，香根草业要求白云公司按每天万分之一支付违约金缺乏事实和法律依据，本院不予支持。
白云公司提交的证据无法充分证明工程存在质量问题。即使工程存在质量问题，白云公司亦可按照约定要求香根草业承担保修责任。因此，白云公司以工程质量存在问题为由拒付工程款依据不足，本院不予采纳。
对于白云公司要求香根草业开具发票的请求，因发票管理属税务部门的职能，不属民事案件审理范围，白云公司可向税务部门申请解决。合同约定“乙方收款时需同时向甲方提供税务局认可的等额有效发票，否则甲方有权拒绝付款，且不需承担任何违约责任”，现白云公司在香根草业未开具发票的情况下，已向香根草业支付部分工程款，应视为白云公司放弃要求香根草业收款时提供发票的权利或双方已就开具发票时间或方式达成新的协议，故白云公司要求香根草业支付违约金26200元依据不足，本院不予支持。
综上，依照《中华人民共和国合同法》第六十条、第一百零七条，《中华人民共和国民事诉讼法》第六十四条第一款的规定，判决如下：
一、被告广州白云国际机场集团综合开发有限公司于本判决发生法律效力之日起十日内，向原告广州市香根草业科技有限公司支付工程款106449元及利息（按中国人民银行同期同类贷款利率标准，自2016年8月25日起计算至付清款之日止）；
二、驳回原告广州市香根草业科技有限公司的其他诉讼请求；
三、驳回反诉原告广州白云国际机场集团综合开发有限公司的反诉请求。
如果未按本判决指定的期间履行给付金钱义务，应当依照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条之规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。
案件受理费2818元，由原告广州市香根草业科技有限公司负担1616元，被告广州白云国际机场集团综合开发有限公司负担1202元；反诉案件受理费327.50元，由反诉原告广州白云国际机场集团综合开发有限公司负担。
如不服本判决，可在判决书送达之日起十五日内，向本院递交上诉状，并按对方当事人的人数提出副本，上诉于广州市中级人民法院。
审判员 陈耿俊
二〇一七年六月六日
书记员 孙雪芳