辽宁省沈阳市中级人民法院
行 政 判 决 书
（2017）辽01行终1131号
上诉人（原审被告）：辽宁省国土资源厅，住所地辽宁省沈阳市皇姑区。
法定代表人：王桂芬，女，系厅长。
委托代理人：付强，系该厅工作人员。
委托代理人：王楠，女，辽宁华轩律师事务所律师。
被上诉人（原审原告）：瓦房店市华铜矿业有限公司，住所地辽宁省瓦房店市。
法定代表人：孙立禄，系董事长。
委托代理人：赵峥、荀思虑，国浩律师（北京）事务所律师。
原审第三人：大连市国土资源和房屋局，住所地辽宁省大连市中山区。
法定代表人：王晋良，系局长。
委托代理人：孙颖，女，系该局工作人员。
委托代理人：王孝楠，辽宁智库律师事务所律师。
上诉人辽宁省国土资源厅因被上诉人瓦房店市华铜矿业有限公司诉履行采矿权许可延续登记职责一案，不服沈阳市和平区人民法院（2016）辽0102行初252号行政判决，向本院提出上诉。本院依法组成合议庭，公开开庭审理了本案。上诉人辽宁省国土资源厅的委托代理人付强、王楠，被上诉人瓦房店市华铜矿业有限公司的委托代理人赵峥、荀思虑，原审第三人大连市国土资源和房屋局的委托代理人孙颖、王孝楠到庭参加诉讼。本案现已审理终结。
原审查明，2010年8月11日，省国土厅向华铜矿业颁发了《采矿许可证》，有效期限自2010年8月11日至2013年5月11日。在有效期限届满前，2013年3月，华铜矿业向瓦房店市国土资源局提交了采矿权延续申请。2013年4月19日，瓦房店市国土资源局出具《采矿权出让县级审查表》，记载了华铜矿业的基本情况，并在基层地矿主管部门初步审查意见处记载：鉴于大连市政府已将该企业列为华铜塌陷区整体搬迁对象，根据《行政许可法》第五十条第二款之规定，建议不再给该企业办理有偿出让手续和采矿权延续登记，请大连市局审查上报。2013年5月17日，省国土厅向大连国土局下发辽国土资项[2013]35号《关于瓦房店市华铜矿业有限公司采矿许可证延续有关问题的批复》，针对大连国土局报请的大国土房屋发[2013]108号《关于对瓦房店市华铜矿业有限公司采矿许可证不予延续的请示》作出批复，该批复载明：瓦房店华铜矿业有限公司采矿许可证（证号C2100002009042120072619）有效期至2013年5月11日。根据《中华人民共和国矿产资源法》第二十一条、《中华人民共和国矿产资源法实施细则》第三十三条及《矿产资源开采登记管理办法》第十六条之规定，关闭矿山属于行政审批行为，应依据采矿权人的申请办理采矿许可证注销登记手续。鉴于省、市政府没有关闭瓦房店市华铜矿业有限公司的书面决定，瓦房店市华铜矿业有限公司又于2013年3月向瓦房店市国土资源局提出了采矿权延续登记申请，而不是关闭该矿山的注销申请，根据《矿产资源开采登记管理办法》第七条之规定，应当对其延续登记申请予以受理。2013年6月7日，大连国土局给瓦房店市人民政府复函，将省国土厅上述批复转发给瓦房店市政府，并请瓦房店市政府按照省国土厅的批复意见认真研究、妥善处理。2013年7月12日，大连国土局再次向瓦房店市政府发函，针对华铜矿业职工不断上访的事项，请瓦房店市政府按照大连市政府的有关会议精神，结合国土资源部和省国土厅的指导意见，加紧研究华铜矿业公司采矿许可证延续等有关问题，提出具体的处理意见，并做好华铜矿业职工的社会稳定工作。2013年9月11日，瓦房店市人民政府向大连国土局复函，说明如下情况：一、瓦房店市国土局已经履行采矿许可证延续申请初步审查程序；二、瓦房店市政府及国土资源部门不具备采矿权许可证是否准予延续登记的审批权限；三、建议大连国土局对落实《会议纪要》和上级批复提出具体意见。2016年9月29日，原告华铜矿业递交起诉状，以省国土厅和大连国土局为被告，请求判令二被告履行办理采矿许可证延续登记的法定职责，为原告办理采矿权延续登记手续。庭审后，原告增加一项诉讼请求：确认被告未履行办理采矿许可证延续登记的法定职责违法。
原审认为，本案为履行职责之诉，此类案件人民法院主要审查三个方面的问题，一是原告是否依法提出申请，包括是否在法定期限内提出申请以及是否向正确的机关提出申请；二是原告所提请求是否属于被告的法定职责范围；三是被告应否依原告申请履行相应的职责。就上述三个问题分述如下：一、关于原告是否依法提出申请的问题。根据《中华人民共和国行政许可法》第五十条规定：被许可人需要延续依法取得的行政许可的有效期的，应当在该行政许可有效期届满三十日前向作出行政许可决定的行政机关提出申请。但是，法律、法规、规章另有规定的，依照其规定。行政机关应当根据被许可人的申请，在该行政许可有效期届满前作出是否准予延续的决定；逾期未作决定的，视为准予延续。即对于已经取得行政许可的相对人，需要延续行政许可有效期限的，应当在行政许可有效期届满三十日前向作出行政许可决定的行政机关提出申请。根据国务院《矿产资源开采登记管理办法》第七条规定：采矿许可证有效期满，需要继续采矿的，采矿权人应当在采矿许可证有效期届满30日前，到登记管理机关办理延续登记手续。根据《辽宁省矿产资源管理条例》第二十八条规定：采矿许可证有效期届满，需要继续采矿的，采矿权人应当在采矿许可证有效期届满的30日前，到原登记部门办理延续登记手续。上述行政法规和地方性法规规定的办理延续许可的申请期限和申请机关与《行政许可法》的规定相一致，即在行政许可有效期届满的30日前，向原许可机关提出申请。本案中，原告华铜矿业已于2010年8月11日取得采矿许可资格，许可期限至2013年5月11日届满，原告华铜矿业自述于2013年2月即向瓦房店市国土资源局提交采矿权许可的延续申请。在原审法院审查中，通过被告省国土厅提交的证据，可以证明省国土厅在其作出的批复中认定原告华铜矿业于2013年3月向瓦房店市国土资源局提出了行政许可的延续申请。根据国土资源部《关于办理矿产资源行政复议案件有关意见的通知》（国土资发[2009]180号）第三条规定：地方政府或者地方国土资源行政主管部门规定应当或者可以向下级国土资源行政主管部门递交矿业权行政许可申请，矿业权申请人根据该规定向下级国土资源行政主管部门递交矿业权行政许可申请的，应当认定矿业权申请人向登记管理机关提出了行政许可申请，申请的起算时间为矿业权申请人向下级国土资源行政主管部门递交行政许可申请的时间。参照《辽宁省国土资源厅转发国土资源部办公厅关于做好探矿权采矿权延续审批登记工作有关问题的通知》（辽国土资办发[2008]58号）第一条规定：对于需要报上级登记管理机关决定行政许可的勘查许可证、采矿许可证延续申请，下级登记管理机关须于受理延续申请之日起20日内审查完毕。参照辽宁省国土资源厅《关于进一步加强矿业权管理有关问题的通知》（辽国土资发[2007]16号）第三条规定：矿业权人要严格按照《矿产资源法》等法律法规规定程序和要求，在规定时限内到登记管理机关办理矿业权延续登记手续。采矿权人申请办理采矿权延续登记手续的，应当在采矿许可证有效期届满的30日前，对采矿权价款进行评估、确认、处置后，到登记管理机关办理采矿权延续登记手续。矿业权人逾期办理矿业权延续登记手续的，登记管理机关不予受理。各市、县（市、区）国土资源部门对矿业权人提交的矿业权延续、变更登记有关资料要及时提出初步审查意见。由于市、县（市、区）国土资源部门延误时间，导致矿业权人不能按规定时限到登记管理机关办理矿业权延续、变更登记手续的，由此造成延误的由国土资源部门承担责任。参照《辽宁省国土资源厅关于规范采矿权审批要件目录的公告》（2012年第3号公告）规定，申请采矿权延续登记时，应提交采矿权延续登记申请报告等多项要件，属于省级国土资源主管部门管理权限的，还需提供市、县级国土资源主管部门的复核意见。以上可知，辽宁省关于矿业权行政许可审批的体制设计为三级审查制，对属于省级国土资源主管部门审批矿业权行政许可的，矿业权申请人应当先向属地县级国土资源主管部门提出申请，由县级国土资源主管部门进行初步审查并提出具体意见，然后层报至市级、省级国土资源主管部门，由省级国土资源主管部门作出最终的处理决定，市、县级国土资源主管部门受省级国土资源主管部门委托办理矿业权行政许可的初步审查工作，省级国土资源主管部门对下级机关作出的审查意见承担法律责任。本案中，原告华铜矿业向瓦房店市国土资源局提出采矿许可证延续申请，应当视为原告华铜矿业向省国土厅提出了行政许可延续申请。故原告华铜矿业于2013年3月向瓦房店市国土资源局申请采矿许可证延续申请，符合法律规定的时限要求和级别管辖的要求。二、关于原告华铜矿业申请采矿许可证延续事项是否属于被告省国土厅的法定职责范围问题。根据《中华人民共和国矿产资源法》第十一条第二款规定：省、自治区、直辖市人民政府地质矿产主管部门主管本行政区域内矿产资源勘查、开采的监督管理工作。根据《中华人民共和国矿产资源法实施细则》第五条规定：国家对矿产资源的勘查。开采实行许可证制度。开采矿产资源，必须依法申请登记，领取采矿许可证，取得采矿权。根据国务院《矿产资源开采登记管理办法》第七条规定：采矿许可证有效期，按照矿山建设规模确定：大型以上的，采矿许可证有效期最长为30年；中型的，采矿许可证有效期最长为20年；小型的，采矿许可证有效期最长为10年。采矿许可证有效期满，需要继续采矿的，采矿权人应当在采矿许可证有效期届满30日前，到登记管理机关办理延续登记手续。根据《辽宁省矿产资源管理条例》第二十四条规定：地矿主管部门应当在收到采矿登记申请后1个月内作出审查决定，并通知采矿权申请人。准予登记的，采矿权申请人应当在收到通知之日起1个月内，按国家规定到批准登记的地矿主管部门缴纳当年采矿权使用费，领取采矿许可证，成为采矿权人。第二十八条规定：采矿许可证有效期届满，需要继续采矿的，采矿权人应当在采矿许可证有效期届满的30日前，到原登记部门办理延续登记手续。根据以上规定，省国土厅是辽宁省地质矿产主管部门，主管辽宁省区域内矿产资源勘查、开采的监督管理工作。国家实行开采许可证制度，省国土厅在其批准权限范围内，审查采矿登记申请，决定是否登记并颁发采矿许可证。对于省国土厅决定许可采矿权登记并颁发采矿许可证的，由省国土厅负责办理采矿许可延续登记手续。本案中，原告华铜矿业采矿权许可由省国土厅于2010年8月审查决定，在采矿许可证有效期届满时，对于华铜矿业提出的延续申请属于省国土厅的职责范围。在本案中，大连国土局仅承担许可延续登记工作中的初审职责，不是许可延续登记的决定机关，其不属于本案的适格被告，列其为第三人参加诉讼。三、被告省国土厅应否依原告华铜矿业申请履行相应的职责。《中华人民共和国行政许可法》第三十二条规定：行政机关对申请人提出的行政许可申请，应当根据下列情况分别作出处理：（一）申请事项依法不需要取得行政许可的，应当即时告知申请人不受理；（二）申请事项依法不属于本行政机关职权范围的，应当即时作出不予受理的决定，并告知申请人向有关行政机关申请；（三）申请材料存在可以当场更正的错误的，应当允许申请人当场更正；（四）申请材料不齐全或者不符合法定形式的，应当当场或者在五日内一次告知申请人需要补正的全部内容，逾期不告知的，自收到申请材料之日起即为受理；（五）申请事项属于本行政机关职权范围，申请材料齐全、符合法定形式，或者申请人按照本行政机关的要求提交全部补正申请材料的，应当受理行政许可申请。行政机关受理或者不予受理行政许可申请，应当出具加盖本行政机关专用印章和注明日期的书面凭证。第三十四条第一款规定：行政机关应当对申请人提交的申请材料进行审查。第三十八条规定：申请人的申请符合法定条件、标准的，行政机关应当依法作出准予行政许可的书面决定。行政机关依法作出不予行政许可的书面决定的，应当说明理由，并告知申请人享有依法申请行政复议或者提起行政诉讼的权利。根据以上规定，行政许可机关实施行政许可的程序主要分为两个阶段，首先是程序上的受理阶段，其次是实体上的审查阶段。程序上受理阶段的审查结论是决定是否受理；实体上的审查结论为作出是否准予行政许可的决定。法院应当通过对这两个阶段的审查，判断省国土厅应否履行相应的职责。针对第一个阶段审查受理阶段。本案中，被告省国土厅针对原告华铜矿业许可延续请求，已经作出实质性的批复，即其于2013年5月17日向大连国土局下发的辽国土资项[2013]35号《关于瓦房店市华铜矿业有限公司采矿许可证延续有关问题的批复》，明确了应当对于华铜矿业的延续登记申请予以受理的意见。省国土厅作出应当予以受理的依据是《矿产资源开采登记管理办法》第七条规定，适用条件是省、市（大连）政府没有关闭华铜矿业的书面决定及华铜矿业提出了采矿权延续登记申请，截至本案诉讼期间，从被告省国土厅和大连国土局提交的证据来看，仍没有省、市（大连）政府关闭华铜矿业的书面决定，即上述适用条件没有发生变化，应当认定华铜矿业提出的采矿权延续登记申请仍然符合受理条件的要求，被告省国土厅应当予以受理。虽然省国土厅上述批复系针对下级机关的内部行文，并未向原告华铜矿业送达产生对外的效力，但从实质性解决纠纷、减少循环诉讼的角度出发，针对原告的诉讼请求，确认被告省国土厅对于原告的申请已经予以受理。针对实体上的审查决定阶段。根据《矿产资源法》及其实施细则、《矿产资源开采登记管理办法》、《辽宁省矿产资源管理条例》的规定，办理采矿权许可登记和延续登记的，应当提交包括采矿权价款评估报告及备案证明、采矿权价款缴纳凭证，环境保护与治理恢复方案及专家评审意见，土地复垦方案及专家评审意见等相关材料。这是行政许可机关在进行实体审查时需要审查的要件。根据辽宁省国土资源厅《关于采矿权授予有关问题的通知》（辽国土资发[2002]91号）第二条第一款规定：无偿取得国家出资勘查形成矿产地的中、小型矿山企业采矿许可证有效期满30日前，矿山企业提出继续开采申请的，依照有关法律法规对该采矿权评估、确认、价款处置后，办理采矿权审批相关手续。否则，将注销其采矿许可证。根据辽宁省国土资源厅《关于矿山企业采矿权评估确认授予有关问题的通知》（辽国土资发[2002]131号）第三条规定：采矿权出让时间的确定。（一）出让的起始时间要求。矿山企业采矿许可证有效期满需要继续采矿的，采矿权人应当在采矿许可证有效期满的6个月前，到登记管理机关申请办理采矿权有偿受让手续，同时向采矿权评估机构提供采矿权评估有关资料。对采矿权评估、确认、价款处置后，按采矿权协议出让方式，办理采矿权延续登记手续。第四条第二款规定：采矿权评估的委托方是具有法定采矿许可证颁发权限的登记管理机关。根据辽宁省国土资源厅《辽宁省矿业权价款评估管理暂行规定》（辽国土资发[2012]30号）第五条规定：矿业权评估工作，按照矿业权审批发证权限进行组织管理。第九条第一款规定：采矿权出让评估由发证机关按发证权限进行委托。根据上述规定，办理采矿权延续登记的审查要件中，涉及评估、确认、价款处置等法律要件，需要登记机关的组织、指导、委托以及采矿权人企业的配合，而非采矿权人企业单方即可以取得的。通过以上法律规定的采矿权许可及延续的审查程序可知，采矿权许可及延续审查具有较强的专业性，在行政诉讼中，法院很难针对法律规定的审查要件一一作出准确的判断，故不宜针对此类申请事项作出具体到位的判决。具体到本案，被告省国土厅应当针对原告华铜矿业的申请，自己或者依照其确定的内部职责划分指令下级国土资源主管部门，履行组织评估、确认、价款处置等职责，并根据实际情况作出是否准予采矿权许可延续登记的决定。综上，被告省国土厅在接到原告华铜矿业的采矿权许可延续登记申请并作出予以受理的决定后，应当依法履行相应的职责并作出实质性的审查决定。被告省国土厅至今未作出决定，违反法律规定。原告要求被告履行办理采矿许可证延续登记职责的请求，予以支持。原告进而提出确认被告不履行职责行为违法的请求，一般情况下，人民法院认定被告不履行或者拖延履行法定职责情形存在，但是判决被告继续履行职责已经没有实际意义的，人民法院可依原告的诉请判决确认被告不履行或者拖延履行法定职责的行为违法。本案中，原告华铜矿业仍期待被告为其办理采矿权许可延续登记，被告亦存在继续履行职责的必要性，判决被告依法履行相应职责对原告的权利救济更为有利，且判决被告履行职责就是对被告之前不履责情形的违法确认，故不再针对原告的确认违法请求重复判决。依照《中华人民共和国行政诉讼法》第七十二条之规定，判决：责令被告辽宁省国土资源厅于本判决生效之日起三十日内针对原告瓦房店市华铜矿业有限公司的采矿权许可延续申请作出行政行为。案件受理费50元由被告负担。
上诉人辽宁省国土资源厅上诉称，一、原审判决认定事实错误。被上诉人华铜矿业仅向瓦房店市国土资源局提交了延续申请，大连市国土局现仍未实际受理，不满足上报省国土厅受理并作出最终决定的条件。二、原审判决适用法律错误。因被上诉人所提供的申请材料并不满足上诉人省国土厅受理的条件，因此不存在上诉人不履行法定职责的问题，原审认定事实错误，在此情况下适用《中华人民共和国行政诉讼法》第七十二条显属适用法律错误。请求本院撤销原审判决，依法改判驳回被上诉人的诉讼请求，由被上诉人承担本案全部诉讼费用。
被上诉人瓦房店市华铜矿业有限公司答辩称，原审判决认定事实、适用法律均没有错误，应维持原判。
原审第三人大连市国土资源和房屋局在庭审中述称，原审原告提出的诉讼请求实际与我局无关，我局并没有进行采矿权延续登记审批的职责，并不属于行政诉讼的适格被告，至于我局作为系统内部机关工作流程中间环节需履行的上传下达工作职责并不是对系统外部公司的具体行政行为，而只是系统内部业务沟通交流，也不具备行政诉讼的可诉性，而且实际情况是我局并没有收到瓦房店局上报的全套档案资料，只收到过一份“建议不予办理”的简要初审意见，而该意见与资源系统内部一贯工作要求相违背，因为正常情况下瓦房店局只需要核实资料是否齐备，应该提交同意办理的初审意见，但是该意见体现资料齐备却不同意办理，与常规不符，所以我局就该简要初审意见请示省厅，在收到省厅意见后也下转给瓦房店市政府、瓦房店市局，所以从实际情况角度，我局也履行了上传下达的中间环节职责，一审判决最终结果与我局事实上无关。
原审被告向原审法院提供的证据有：1、2013年5月17日辽宁省国土资源厅给大连市国土资源和房屋局下达的辽国土资项[2013]35号《关于瓦房店市华铜矿业有限公司采矿许可证延续有关问题的批复》，证明被告对于原告申请采矿权许可延续的意见；2、辽宁省国土资源厅2012年第3号公告《关于规范采矿权审批要件目录的公告》，证明采矿权延续登记所需材料。被告还提供《矿产资源开采登记管理办法》等法律依据，证明办理采矿权许可延续的申请程序。
原审原告向原审法院提供的证据材料有：1、2013年9月11日瓦房店市人民政府瓦政函[2013]44号《瓦房店市人民政府关于对做好华铜矿业有限公司采矿许可证延续相关问题及稳定工作的复函》，证明原告于采矿权许可证到期前向瓦房店市国土资源局提出采矿权许可延续申请；2、原告持有的《采矿许可证》正副本，证明原告系采矿权人；3、辽宁省国土资源厅2012年第3号公告《关于规范采矿权审批要件目录的公告》，证明该公告要求办理采矿权许可延续时需要提交县、市级主管部门的审核意见，故原告先向瓦房店市国土资源局提出延续申请；4、2013年5月17日辽宁省国土资源厅下发的辽国土资项[2013]35号《关于瓦房店市华铜矿业有限公司采矿许可证延续有关问题的批复》，证明辽宁省国土资源厅已经知道原告提出的采矿权许可延续申请事项；5、2013年7月12日大连市国土资源和房屋局出具的大国土房屋函发[2013]45号《关于做好华铜矿业有限公司采矿许可证延续相关问题及稳定工作的函》，证明原告已在法定期限内向辽宁省国土资源主管部门提交了采矿权延续登记申请资料；上述证据还证明如下事项：瓦房店市国土资源局对原告申请文件进行了受理并出具初步意见，并于2013年4月23日上报大连市国土资源和房屋局及辽宁省国土资源厅；2013年5月17日，辽宁省国土资源厅要求大连市国土资源和房屋局对原告采矿权延续登记予以受理；大连市国土资源和房屋局向瓦房店市人民政府就原告采矿权延续登记事项进行沟通。
原审第三人向原审法院提供的证据材料有：1、辽宁省国土资源厅网站下载的采矿权延续办事流程，证明根据省厅要求的审批要件以及办事流程，实践当中采矿许可证延续确实是需要逐层上报，最终报到省厅，省厅设置的这一流程是否合理合法由法庭最终确认；2、2013年4月19日瓦房店市国土资源局作出的《采矿权出让县级审查表》，证明瓦房店市国土资源局的意见是建议不给原告公司办理有偿出让和期满延续审批。此项业务瓦房店市国土资源局仅向市局申报了前置的申请资料，而且意见是不予办理。在这种情况下，我们市局根据省厅的业务流程要求已经向省厅进行业务请示，得到省厅35号批复，省厅的批复要求我局对此项业务予以受理，我局作为审批的中间环节也将相关意见下转给了相关单位；3、2013年6月7日大连市国土资源和房屋局出具的大国土房屋函发[2013]38号《关于华铜矿业有限公司采矿权延续有关问题的复函》，证明我局已经将上级指导意见下转给基层部门，但在此之后基层业务部门没有继续申报符合要件要求的详细资料，所以我局也无法继续向上申报原告所要求办理的相关事项。
上述证据均已随案移送本院。
原审法院经质证，对原审原告、原审被告、原审第三人提供的证据，主要是基于原告申请采矿权延续一事，各级主管机关文书往来的函件，具有真实性，对各方提供的证据均予以采信。
经审查，本院认为，原审法院对证据的认证正确，本院予以确认。
本院审理查明的事实与原审法院审理查明的事实一致。
本院认为，根据《矿产资源开采登记管理办法》第七条之规定，上诉人辽宁省国土资源厅作为采矿许可证原发证机关，系法定采矿许可证延续登记机关。
本案的焦点问题是，被上诉人瓦房店市华铜矿业有限公司是否在其采矿权到期之前按照法律、法规的规定提出了采矿许可延续登记申请。首先，按照上诉人辽宁省国土资源厅及原审第三人大连市国土资源和房屋局所述，辽宁省关于矿业权行政许可审批的体制设计为三级审查制，对属于省级国土资源主管部门审批矿业权行政许可的，矿业权申请人应当先向属地县级国土资源主管部门提出申请，由县级国土资源主管部门进行初步审查并提出具体意见，然后层报至市级、省级国土资源主管部门，由省级国土资源主管部门作出最终的处理决定。由此可见，辽宁省对矿业权许可的审批由行政机关自设了逐级报批的内部审核程序，故原审以大连市国土资源和房屋局不是采矿许可延续登记的决定机关为由，认定其不是本案适格被告以及诉讼地位是第三人正确。其次，关于采矿许可延续的申请、受理、初审、复核以及最终决定，辽宁省执行的依据是国土资源部国土资发[2009]180号《关于办理矿产资源行政复议案件有关意见的通知》、辽国土资办发[2008]58号《辽宁省国土资源厅转发国土资源部办公厅关于做好探矿权采矿权延续审批登记工作有关问题的通知》、《辽宁省国土资源厅关于规范采矿权审批要件目录的公告》（2012年第3号公告）等规定。本案中，辽宁省国土资源厅针对华铜矿业许可延续的问题，专门作出过批复，即2013年5月17日向大连国土局下发的辽国土资项[2013]35号《关于瓦房店市华铜矿业有限公司采矿许可证延续有关问题的批复》，据此，原审法院判定本案上诉人辽宁省国土资源厅已经受理了被上诉人瓦房店市华铜矿业有限公司的申请并无不当。综上，行政机关自行设定逐级审核报批程序后，由于逐级审批过程中不同级别的机关未按照流程要求完成审核工作，不宜归责于行政相对人，上诉人辽宁省国土资源厅的上诉理由不能成立。
综上所述，原审判决事实清楚，适用法律正确，裁判结果适当。上诉人的上诉请求，本院不予支持。依照《中华人民共和国行政诉讼法》第八十九条第一款（一）项之规定，判决如下：
驳回上诉，维持原判。
二审案件受理费50元，由上诉人辽宁省国土资源厅承担。
本判决为终审判决。
审判长 杨 帅
审判员 唱英梅
审判员 张振岭
二〇一七年十二月七日
书记员 刘 娇
本案判决所依据的相关法律
《中华人民共和国行政诉讼法》第八十九条人民法院审理上诉案件，按照下列情形，分别处理：
（一）原判决、裁定认定事实清楚，适用法律、法规正确的，判决或者裁定驳回上诉，维持原判决、裁定；