黑龙江省逊克县人民法院
民 事 裁 定 书
（2018）黑1123民初77号
原告：逊克县国土资源局，地址：逊克县奇克镇。
法定代表人：肖奇，该局局长。
委托诉讼代理人：申凌云，该局工作人员。
委托诉讼代理人：邹立广，男，1963年12月14日出生，达斡尔族，高中文化，个体，现住逊克县。
被告：逊克县宏建房地产开发有限责任公司，地址：逊克县奇克镇。
法定代表人：徐秀信，该公司经理。
委托诉讼代理人：宋春雨，男，1982年2月5日出生，汉族，本科文化，法律工作者，现住北安市兆麟区22委*组。
委托诉讼代理人：周广明，男，1962年1月30日出生，汉族，初中文化，无业，现住北安市法华社区3委*组。
原告逊克县国土资源局（以下简称国土局）诉被告逊克县宏建房地产开发有限责任公司（以下简称宏建公司）建设用地使用权出让合同纠纷一案，本院于2018年2月11日受理后，依法适用普通程序，于2018年3月13日、6月6日、7月5日公开开庭进行了审理。原告国土局委托诉讼代理人申凌云、邹立广，被告宏建公司委托诉讼代理人宋春雨出庭参加诉讼，被告宏建公司委托诉讼代理人周广明第一次庭审参加诉讼。本案现已审理终结。
国土局向本院提出诉讼请求：1.请求法院判令宏建公司补缴超出合同约定使用国有土地建筑面积出让金622,934.00元，给付违约金31,146.70元，合计654,080.70元；2.由宏建公司承担诉讼费用。
事实与理由：宏建公司2007年5月在通过招拍挂方式取得了2007－03号墅源小区的国有土地使用权，并签订了合同。宏建公司在取得土地使用权后向建设部门递交了建筑申请报告并取得了两证一书。国土局核准的宗地编号为逊克县（2007）逊国土地建字第003号建设用地批准书载明：宏建公司建设项目名称为墅源小区综合楼，批准用地面积2477.42平方米，建筑物占地面积4680平方米。宏建公司2007年5月28日开工建设，第一栋楼于2007年11月20日竣工，第二栋楼于2008年5月竣工。逊克县住房和城乡建设局于2008年5月20日对该工程进行验收备案。在审查办理土地证时，国土局发现该工程建设过程中存在宏建公司违反双方合同约定，在没有取得有关单位批准的状况下，根据测算，宏建公司实际建筑面积超过审批面积2975.15平方米，违反了双方签订的协议约定，需补缴国有土地出让金622,934.00元。国土局认为这种行为违反，故诉至法院。
本案在审理过程中，国土局变更诉讼请求：1.判令宏建公司补缴超出合同约定使用国有土地建设用地面积401.68平方米，每平方米185.67元，计74,579.92元；2.住宅超建筑面积1270.13平方米，每平方米66.77元，计84,802.76元；3.商服超建设面积2014.74平方米，每平方米230.08元，计463,551.38元，总计金额622,934.06元；4.宏建公司承担诉讼费用。
本案在审理过程中，国土局再次变更诉讼请求：1.判令宏建公司补缴超出合同约定使用国有土地用地面积401.68平方米，国土局批准用地面积3477.42平方米，宏建公司实际用地面积2879.10平方米，每平方米185.67地出让金，计74,579.92元；2.住宅建筑面积超批准1269.57平方米，国土局批准建筑面积3900平方米，实际建筑面积5169.57平方米，每平方米66.77地，计84,769.20元；3.商服超批准面积2015.30平方米，国地局批准780平方米，实际建筑2795.30平方米，每平方米230.08元，计463,680.20元，以上总计金额623,029.32元；4.要求宏建公司承担房屋面积评测费用；5.由宏建公司承担诉讼费用。
宏建公司辩称，1.宏建公司有明确证据能够证实即建设用地许可证，2007逊国土建字第32号批准书中批准用地面积为2477.42平凡米，建筑物审批面积为7874.97平方米，结合本案国土局所述事实与审批件不符，宏建公司使用面积并未超出审批面积，请求法院依法驳回诉讼请求。2.案件属于民事纠纷，应当受到诉讼时效的限制，即使本案国土局存在涉案的权利也已超过诉讼时效，请求法院驳回国土局诉讼请求。宏建公司承建的楼房在2008年5月20日已经竣工，在国土局诉状中所述的逊克县建成房产对该面积实测中，从此时就应该已经知道竣工验收面积已经超出，但从未向宏建公司主张过权利，合同纠纷主张补缴出让金应受到两年诉讼时效限制。
当事人围绕诉讼请求依法提交了证据,本院组织当事人进行了证据交换和质证,国土局向本院提交如下证据：
一、2008年5月20日逊克县房屋面积测算报告书，证明宏建公司在竣工后实际使用国土面积为2164.23平方米。
二、2007年10月20日逊克县房屋面积测算报告书，证明宏建公司在竣工后实际使用国土面积是5796.96平方米，1号、2号楼系宏建公司开发，并对外销售。
三、《国有土地使用权出让合同》，证明土地地址是逊克县国防路南，边防路东，土地编号是2007－03号地，面积是2477.42平方米。宏建公司在开发工程中超合同面积使用土地，应当补缴超出面积的土地出让金。
四、2007年4月26日建设项目选址意见书，宏建公司向逊克县城市规划管理部门提出选址意见，规划部门批准用地面积为2447平方米，建设面积为4600平方米。
五、国土局依据规划部门提出的选址地点，按照法定程序进行公告，用地性质为商业住宅，根据国土局调查人员实地勘察，用地总面积为2477.42平方米，建筑总面积4680平方米。
六、宏建公司与国土局签订的《国有土地使用权出让合同》及补充合同，合同约定出让地名为3号地，面积为2477.42平方米，每平方米185.677元，出让金额为460000.00元，建筑容积率1.89，面积为4680平方米。
七、宏建公司向政府缴纳的土地出让金收据。
八、2007年3月11日国土局出具的宗地估价意向审批表，审批编号为2007005，该审批表载明土地使用面积2477.42平方米。
九、土地评估意向申请表，该表载明被评估土地范围在规划区域内2477.42平方米。
十、2007年3月11日国土局出具的委托书，委托逊克县地价评估事务所对出让的3号地进行评估，评估的数额为2477.42平方米。
十一、2007年3月11日逊克县地价评估事务所出具的报请逊克县人民政府地价审评领导小组地价确认申请书，证明经过评估该地商业地价为434.85元每平方米，住宅为126.19元每平方米，地价总额为440,071.35元。
十二、2007年3月13日逊克县人民政府地价审批领导小组出具的编号为200号地价确认审批件，对逊克县地价审批事务所评估的金额予以认定，认定金额为440,071.35元，评估土地地数为2477.42平方米。
十三、2007年3月13日逊克县地价评估事务所地价评估报告，评估地面积为2477.42平方米，单位面积地价商业为443.85元每平方米，住宅为126.19元每平方米，总价440,071.35元。证明从宗地立项到政府审批，宏建公司建设用地面积应为2477.42平方米。
十四、2007年5月2日基本建设用地审批表，申请单位为宏建公司，建设项目是墅源公寓，经办人安学勇。
十五、用地申请报告，经相应有关部门批准，墅源公寓综合楼面积为5000平方米，投资4,060,000.00元，申请办理相关手续。
十六、2007年5月25日逊克县人民政府建设用地审批件（2007）32号，宏建公司经过竞买获得编号为200703号地块的国有土地使用权，面积为2477.42平方米，年限为30年。
十七、由逊克县规划办2007年5月2日出具的用地规划许可证，批准用地面积2477.42平方米。
十八、由逊克县规划办2007年5月10日出具的建设工程规划许可证，批准建设规模5389.85平方米。
十九、逊克县计划经济局出具的2007年4月30日计划通知，宏建公司在选址3号地块投资总金额4060000.00元，建设用地是5000平方米。
二十、国土局出具的建设用地批准书，国土局经过调查认定，向宏建公司出具批准书第32号，批准面积2477.42平方米，建筑面积4680平方米。
二十一、宏建公司委托建成有限责任公司对建筑的1、2号楼进行测绘，第一份报告书时间为2007年10月20日，经过现场测绘宏建公司1号墅源公寓建筑总面积为5800.64平方米，第二份报告时间为2008年5月20日，经过现场测绘宏建公司2号墅源公寓建筑总面积为2164.23平方米，超过了国土局所批准的建筑面积4680平方米。超出的面积商服是2014.74平方米，住宅超1270.13平方米，应当补交出让金。
二十二、国土局委托黑龙江时代国土咨询评估咨询有限责任公司，在2008年4月4日对宏建公司所建墅源公寓占地面积实地测量，实占面积为2879.1平方米，超出审批面积401.68平方米，应补交每平方米185.67元超面积的出让金。
宏建公司提供如下证据：
一、逊克县经济计划局2007年38、39号文件两份，证明宏建公司开发墅源公寓综合楼1号、2号总建筑面积为8000平方米。
二、2007年8月20日、2007年5月10日建设工程规划许可证两份，明确证明其中建筑规模为5389.85平方米，另一份记载的是2485.12平方米，如国土局所说在计委立项后宏建公司严格按照规划单位确定了建筑面积7874.97平方米，向国土局申请建设用地批准书，并且国土局在审批数额上加盖公章，予以确认建筑面积，并最后与逊克县房产处备案数字相符，宏建公司不存在超出出让面积进行施工建设。
三、建设用地批准书，国土局2007年5月25日下发，批准用地面积为2477.42平方，建构筑物占地面积为7874.97平方米，宏建公司按照审批的两项面积进行开工建设，同时现有建筑面积也在审批范围内，宏建公司不应再另行缴纳土地出让金。
本案通过庭审质证，对双方提供的证据，因均为在建设工程施工过程中的各类相关文件、审批手续，双方均对对方提供的证据本身无异议，对上述证据予以采信。
根据当事人陈述和经审查确认的证据，本院认定事实如下：
2007年3月28日宏建公司向国土局提交竞买申请书，参加墅源小区地块国有土地使用权挂牌活动。竞拍方案中国土局确定土地面积为2477.42平方米，建筑面积为4680平方米，其中一层商业用地面积为412.90平方米，建筑面积780平方米，二层至六层住宅用地面积为2064.52平方米，建筑面积为3900平方米。2007年4月10日宏建公司通过竞拍的方式，取得了墅源小区土地使用权，并建设墅源综合楼。国土局与宏建公司签订《国有土地使用权出让合同》约定土地面积为2477.42平方米，价格为460,000.00元，建筑物性质为商业、住宅，建筑容积率为1.89%，批准宏建公司建筑物的面积为4860平方米，土地面积2477.42平方米。5月25日宏建公司取得《关于逊克县宏建房地产开发有限责任公司建墅源公寓综合楼用地的批复》，该批复中记录了用地面积为2477.42平方米，出让年限为30年。
在宏建公司准备竞拍及竞拍前后，2007年4月30日逊克县经济计划局向宏建公司下发逊经计字（2007）38号文件，写明“经审查研究，同意你公司2007年立项建设墅源公寓综合楼工程，工程总建筑面积5000平方米，计算总投资406万元。其中工程公司业务用房面积300平方米，投资24万元，资金来源为单位自筹；药监局业务用房面积435平方米，投资50万元，资金来源为上级部门拨款；张玉国个人用房560平方米，投资44.8万元，资金来源自筹；商服用房面积3705平方米，投资287.2万元，资金来源企业自筹。该项目建设期限自2007年5月至2007年10月。”同日该单位又下发逊经计字（2017）39号文件，写明“同意你公司2007年立项建设逊克县墅源公寓2号楼。建设地点为逊克县国防路南、边防街东。项目拟用地面积2477.42平方米。新建公寓1栋，建设面积3000平方米。项目计划总投资300万元。资金来源为企业自筹。建设期限自2007年7月31日至2008年10月30日。”2007年5月2日宏建公司取得建设用地规划许可证，用地面积为2447平方米，位置国防路南，边防待东。2007年5月10日取得建设工程规划许可证，建设项目名称墅源公寓综合楼，建设规模5389.85平方米。2007年8月20日取得建设工程规划许可证，建设项目名称墅源公寓二号楼，建设规模2485.12平方米。逊克县（2007）逊国土建字第32号批准书中，批准用地面积为2477.42平方米，建构筑物面积4680平方米改为7874.97平方米，在更改处加盖了国土局的公章，土地用途为商业、住宅。
国土局认为宏建公司建设的1号楼、2号楼超出合同约定的容积率，并且超出已批准的土地面积建设楼房，诉至本院，最后确定诉讼请求为：1.判令宏建公司补缴超出合同约定使用国有土地用地面积401.68平方米，国土局批准用地面积3477.42平方米，宏建公司实际用地面积2879.10平方米，每平方米185.67地出让金，计74579.92元；2.住宅建筑面积超批准1269.57平方米，国土局批准建筑面积3900平方米，实际建筑面积5169.57平方米，每平方米66.77地，84769.20元；3.商服超批准面积2015.30平方米，国地局批准780平方米，实际建筑2795.30平方米，每平方米230.08元，计463680.20元，以上总计金额623029.32元；4.要求宏建公司承担房屋面积评测费用；5.由宏建公司承担诉讼费用。
本院认为：国土局第一项诉讼请求系要求宏建公司补缴超出《国有土地使用权出让合同》外占用的土地面积的出让金，但这401平方米土地是在国土局审批的2477.42平方米土地之外而占用的，宏建公司无合法依据使用该土地，应由国土局依据相关法律规定给予处理。国土局第二项、第三项诉讼请求，要求宏建公司缴纳超出《国有土地使用权出让合同》中约定的容积率而建设楼房的建筑面积的土地出让金，认为其超出了招拍挂时确定的4860平方米建筑面积。《中华人民共和国城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第十七条第二款规定，未按合同规定的期限和条件开发利用土地的，市县人民政府土地管理部门应当予以纠正，并可以给予警告、罚款直至无偿收回土地使用权的处罚。根据该规定，当土地使用者擅自改变土地用途时，土地管理部门可以责令限期改正，土地使用者拒不改正的，可以责令交还土地，处以罚款。第十八条规定，土地使用者需要改变土地使用权出让合同规定的土地用途的，应当征得出让方同意，并经土地管理部门和城市规划部门批准，依照本章的有关规定重新签订土地使用权出让合同，调整土地使用权让出金，并办理登记。结合本案，宏建公司在建设过程中，取得了规划部门的批准，建设两栋楼房，第一栋综合楼面积为5389.85平方米，第二栋楼面积为2485.12平方米，两栋楼面积之和为逊克县（2007）逊国土建字第32号批准书中改变的建构筑物面积7874.97平方米，批准书中加盖了国土局的公章，而批准书中原面积为4680平方米，与招拍挂时确定的建筑面积相符，对于超出4680平方米建筑面积双方并未签订书面协议，也无其他证据佐证对于超出面积双方做出了相应的约定，并且在各类批准书中对于宏建公司的建筑面积、土地使用面积数字不统一，根据上述两条之规定，国土地局的三项请求均是主张宏建公司超出国土局审批范围之外的面积的土地出让金，但应从行政管理的角度予以处理，不适用以民事法律予以调整，故本案并不是法院受理民事诉讼的范围。依据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十九条（四）之规定，裁定如下：
驳回原告逊克县国土资源局的起诉。
案件受理费10,341.00元退回原告逊克县国土资源局。
如不服本裁定，可于裁定书送达之日起十日内，向本院递交上诉状，并按对方当事人或者代表人的人数提出副本，上诉于黑龙江省黑河市中级人民法院。
审 判 长 马红霞
人民陪审员 石 丽
人民陪审员 高丽红
二〇一八年七月二十日
书 记 员 迟程程