浙江省桐庐县人民法院
民 事 判 决 书
（2016）浙0122民初5901号
原告：绍兴启明投资有限公司,住所地：浙江省杭州湾上虞经济技术开发区纬五路8号。
法定代表人：张启明，执行董事。
委托诉讼代理人：徐东、张远林，浙江合强律师事务所律师。
被告：华润三九医药股份有限公司，住所地：广东省深圳市龙华新区观澜高新园区观清路1号。
法定代表人：王春城，董事长。
委托诉讼代理人：张家磊、曹奔靖，浙江丰国律师事务所律师。
第三人：宁波梅山保税港区生融股权投资中心（有限合伙），住所地：浙江省宁波市北仑区梅山盐场*号办公楼*号***室。
执行事务合伙人:王军福。
第三人：宁波梅山保税港区仙健股权投资中心（有限合伙），住所地：浙江省宁波市北仑区梅山盐场*号办公楼*号***室。
执行事务合伙人:徐惠琴。
原告绍兴启明投资有限公司（以下简称启明公司）与被告华润三九医药股份有限公司（以下简称华润公司）股权转让纠纷一案，本院于2016年12月2日立案受理后，依法适用简易程序,于2017年1月10日、2月27日、4月12日三次公开开庭进行了审理。第二次庭审后，本院依职权追加宁波梅山保税港区生融股权投资中心（有限合伙）（以下简称生融投资中心）、宁波梅山保税港区仙健股权投资中心（有限合伙）（以下简称仙健投资中心）为第三人。原告的委托诉讼代理人徐东、张远林，被告的委托诉讼代理人曹奔靖到庭参加第一次庭审。原告的委托诉讼代理人张远林，被告的委托诉讼代理人曹奔靖到庭参加第二次、第三次庭审。第三人生融投资中心、仙健投资中心经本院传票传唤，无正当理由拒不到庭。现本案已审理终结。
原告启明公司向本院提出诉讼请求：1、依法判令被告支付原告股权转让款1168022.89元；2、判令被告支付原告迟延履行部分款项的利息85347.33元，并支付拖欠款项12000元从2014年11月27日起及1156022.89元从2016年5月27日起按照日利率万分之五计算至款项付清日止的利息；3、判令被告支付原告因本案诉讼支付的律师代理费30000元；4、本案诉讼费用由被告承担。事实与理由：原告启明公司（原上虞启明投资有限公司，于2016年6月1日变更为绍兴启明投资有限公司）与生融投资中心及仙健投资中心原系目标公司杭州老桐君制药有限公司（以下简称老桐君公司）股东，分别持有该公司30%、45%和25%的股权。2014年11月5日，原告及生融投资中心、仙健投资中心与被告签订了《股权转让协议》，约定将持有的老桐君公司的全部股权转让给被告，并就转让价款与支付、权利义务、违约责任等进行了详细约定。根据该协议第二条约定，原告所持30%股权对应的转让价款为人民币29700000元，被告按转让价款的10%、80%、10%的进度分三期支付给原告，第一次付款时间为协议生效后10个工作日内，第二次付款时间为股权变更登记后10个工作日内，第三次付款时间为交割日第18个月终最后一日届满时10个工作日内。根据协议第8.1款的约定，被告若未足额、按时向原告支付转让款的，每逾期一日应就付款项按日万分之五的利率向原告支付额外罚息。根据协议第11条的约定，因执行该股权转让协议所发生的任何争议，任何一方均可向老桐君公司所在地人民法院提起诉讼。2014年11月12日，原告及生融投资中心、仙健投资中心按照协议约定将持有的老桐君公司的股权变更登记至被告名下。截止2016年5月26日第三期付款期限届满，被告共计向原告支付了款项16360358.10元（其中第二期应付款中908933.33元、25894.83元、172632.17元被告应于2014年11月26日前支付，实际分别于2015年2月15日、2015年5月7日、2016年5月17日支付），加上原告同意被告扣减的借款及利息12171619.01元，共计28531977.11元，尚余1168022.89元未付，经原告催讨无果。为此，原告诉至法院，望判如所请。
被告华润公司辩称：一、被告对于原告是否由上虞启明投资有限公司变更而来不知情，原告应提供合法有效材料予以证明；二、被告已实际支付给原告股权转让款16360358.10元，剩余13339641.90元属于需扣减事项，具体如下：（1）根据协议第2.4款的约定，原告投资关联方借款及利息12171619.01元应扣减，该扣减事项双方无争议。（2）中审华寅五洲会计师事务所对老桐君公司进行了过渡期审计，产生审计费80000元，根据协议第3.1款的约定，由转让方和受让方各承担一半即40000元，受让方应付审计费由被告代扣代付，按原告的股权比例（30%）应从股权转让款中扣减12000元。（3）2014年11月5日即共管期开始日且属过渡期内，在未经被告同意情况下，张启明和沈熊作为目标公司老桐君公司实际股东从老桐君公司账户分别转到张启明和沈熊个人账户各908933.33元。该等行为违反了协议第3.2款关于共管期内的管理的约定以及第5.21款关于过渡期内勤勉、尽责、善意管理义务的约定。根据协议第8.2款、第8.5款的约定，张启明转走的908933.33元应从原告的股权转让款中扣减。（4）因葡萄糖酸钙口服溶液质量问题，珠海友邦医药有限公司于2012年12月至2013年11月期间要求向老桐君公司退货1192件葡萄糖酸钙口服溶液（无糖型），计货款367898.88元。后经协商，老桐君公司实际向珠海友邦医药有限公司补货抵退货款处理，产生损失（按成本计）230830.75元。根据补充协议第二条的约定，该230830.75元的30%应从原告的股权转让款中扣减。（5）老桐君公司生产的批号为20130904葡萄糖酸亚铁糖浆被桐庐县市场监督管理局认定为劣药，对老桐君公司处以195191.04元的行政处罚。根据补充协议第二条约定，该195191.04元的30%应从原告的股权转让款中扣减。（6）老桐君公司于2015年9月22日补交2014年度增值税252995.21元及滞纳金36637.33元，合计289632.54元。因补税相关的业务发生在交割日前，除掉被告认可承担的77407.32元，根据协议第5.23款的约定，剩余212225.22元的税务责任风险应由转让方承担。该212225.22元的30%应从原告的股权转让款中扣减。（7）老桐君公司2014年度实际发生存货报废损失账载金额1235899.18元未按规定向税务机关办理报备手续，导致纳税调整增加额1235899.18元，按15%所得税计增加缴税185384.88元。根据协议第5.23款的约定，老桐君公司因税务责任风险等导致行政处罚而受到实际损失，转让方应向受让方承担连带赔偿责任。该185384.88元的30%应从原告的股权转让款中扣减。第（4）—（7）项被告在支付原告第三期股权转让款时，合计扣减了247089.57元；三、关于原告主张的迟延履行部分款项逾期利息：（1）根据协议第2.3款第1项、第2.4款的约定，被告有权在先决条件和支付条件满足后支付股权转让款。（2）908933.33元系老桐君公司实际股东张启明在共管期并过渡期内擅自从老桐君公司转走的资金，被告先在第二期款中扣减，后经与原告协商，认为从第三期款中扣减更为妥当，因此被告又于2015年2月15日将该款支付给原告，最终在2016年5月25日支付第三期款时扣减。被告认为，908933.33元属扣减款项，实际无须支付，因此不存在逾期支付问题。（3）被告在支付第二期款时扣减了转让方个人销售款及上浮15%的所得税款，合计661756.66元，相应按股权比例扣减了原告198933.33元。待老桐君公司收到张启君返还的个人销售款后，被告在十个工作日内支付给了原告，符合协议2.4款的约定，不存在逾期支付问题；四、原告主张的律师代理费没有事实和法律依据。综上，按照协议及补充协议的约定，被告已完全履行了付款义务，不存在拖欠情形，请求驳回原告全部诉请。
第三人生融投资中心、仙健投资中心未作陈述，亦未提供证据材料。
本院经审理认定事实如下：2014年11月5日，原告启明公司（转让方）、第三人生融投资中心（转让方）、第三人仙健投资中心（转让方）及案外人张启明、沈熊、唐铁民、张增群、陈茵、张雪梅（协议称6名自然人为目标公司实际股东）与被告华润公司（受让方）签订了《股权转让协议》及《补充协议》1份。协议就杭州老桐君制药有限公司及其分支机构股权转让有关事宜达成一系列条款：“定义：过渡期指基准日（2014年2月28日）起至股权变更登记日（2014年11月12日）止的期间、共管期指本协议签署之日（2014年11月5日）起至股权变更登记日（2014年11月12日）止的期间、基准日指目标公司审计及整体资产评估的基准日（2014年2月28日）、交割日指目标公司完成100%股权转让至受让方持有的全部必要事项的工商登记变更之日，包括股东变更的股东名册备案、公司章程备案、法定代表人变更登记…；股权转让价款与支付：款项支付的先决条件…、付款进度…；共管与交割：共管期内受让方向目标公司委派共管期团队，与目标公司原有管理团队共同参与目标公司的经营管理及财务管理，共管期内目标公司的下列事项应取得受让方书面同意方得进行…；税费承担…；转让方和目标公司实际股东的声明与承诺…；受让方的声明和承诺…；不可抗力…；违约责任…等等”。协议双方为本次股权转让委托中审华寅五洲会计师事务所出具了审计报告，作为本次股权转让的作价基础。协议签订后，被告分别于2014年11月10日支付股权转让款2970000元、于2014年11月24日支付股权转让款10468920.66元、于2015年2月15日支付股权转让款908933.33元、于2015年5月7日支付股权转让款25894.83元、于2016年5月17日支付股权转让款172632.17元、于2016年5月25日支付股权转让款1758548.84元、于2016年5月26日支付股权转让款55428.27元给原告，合计共支付原告股权转让款16360358.10元。2014年11月12日，双方完成了股权变更登记手续，该日为股权交割日。2016年5月13日，老桐君公司收到张启君个人销售款575440.57元。
2014年11月5日即合同签订当天，案外人沈熊、张启明在未取得被告书面同意的情况下，从老桐君公司各领走908933.33元。2015年2月13日，老桐君公司收到《桐庐县市场监督管理局行政处罚决定书》1份，载明：“2014年11月25日，本局收到杭州市食品药品监督管理局《关于核查葡萄糖酸亚铁糖浆的函》内容为：要求调查核实我辖区杭州老桐君制药有限公司生产的批号为20130904的葡萄糖酸亚铁糖浆经检验不合格的相关情况……本局认为杭州老桐君制药有限公司生产的批号为20130904葡萄糖酸亚铁糖浆经检验含有絮状沉淀（不符合规定），根据《中华人民共和国药品管理法》第四十九条第三款第（六）项的规定，应按劣药论处……没收违法销售所得81329.6元。处违法生产、销售葡萄糖酸亚铁糖浆货值金额1.4倍罚款，共计113861.44元……”，老桐君公司于2015年3月4日向桐庐县财政局资金专户缴纳罚款20000元。2015年9月15日，桐庐县国家税务局出具《纳税评估认定结论表》1份，载明：“经案头分析，该纳税人在财务、生产经营及其他方面存在4项疑点，通过约谈，纳税人对疑点问题进行了举证，确认存在以下问题…（所属日期起：2013年1月1日，所属日期止：2014年12月31日）共计应补缴增值税252995.21元，产生滞纳金36637.33元，合计289632.54元。老桐君公司于2015年9月22日通过网上缴款289632.54元。2015年12月15日，被告单方向中审华寅五洲会计师事务所转账审计费用40000元，该会计师事务所于2016年9月28日出具《说明》一份，载明：“2014年11月，中审华寅五洲会计事务所接受…的委托对杭州老桐君制药有限公司按照企业会计准则和《企业会计制度》的规定编制的2014年11月12日的资产负债表，2014年3月1日至2014年11月12日止期间的利润表、所有者权益（或股东权益）变动表和现金流量表以及财务报表附注进行审计。我方已完成相关审计工作，但由于各委托方间对审计结果存在争议，截止目前，我所仅能出具审计报告的初稿，以供参考，特此说明”。2016年6月8日，老桐君公司收到珠海友邦医药有限公司发送的确认函1份，载明：“我司于2014年9月2日发给贵公司财务部《关于葡萄糖酸钙口服溶液退货款清理的情况说明》，因贵司产品出现质量问题，我司退回自2012年12月至2013年11月底产生酸钙结晶现象的葡萄糖酸钙口服溶液（无糖型）1192件，应补还给我司货款367898.88元，要求从以后的发货款中进行冲减。后经双方协商一致，同意由贵司以补货抵退货款，贵司于2014年12月30日一次性发货给我司葡萄糖酸钙口服溶液842件和葡萄糖酸锌口服溶液170件，抵冲应退还货款367898.88元”，该补货的实际成本损失计230830.75元。2016年5月26日，被告向原告及第三人发送《关于支付杭州老桐君制药有限公司股权转让款的告知函》1份，告知其具体的股权转让款扣减事项。现原告以被告未支付其剩余股权转让款为由诉至法院，因此实际支出律师费30000元。另，2016年6月1日，原告名称由上虞启明投资有限公司变更为绍兴启明投资有限公司。
以上事实有原告提供的《股权转让协议》及《补充协议》、工商登记基本信息、委托代理合同、浙江省律师服务收费标准、发票、工商变更登记情况复印件；被告提供的《股权转让协议》及《补充协议》、记账凭证、汇款申请单、《关于葡萄糖酸钙口服溶液货款清理的情况说明》、《关于葡萄糖酸钙口服溶液退补货的确认函》、《产品销售代理协议》、《桐庐县市场监督管理局行政处罚决定书》、网上银行转账凭证、《纳税评估认定结论表》、电子缴款凭证打印件、中审华寅五洲会计事务所出具的说明、中国建设银行单位客户专用回单、《关于支付杭州老桐君制药有限公司股权转让款的告知函》、快递单、单位客户专用回单和网上银行电子回执、客户收付款入账通知、CHW津专字[2014]1001号审计报告复印件在案佐证。上述证据结合庭审及双方的陈述、质证，本院予以采信，并对上述事实予以确认。对于原告提供的杭州洁康药业有限公司的决定、股权转让协议（3份）、关于张启明和沈熊薪酬情况的说明，欲证明张启明的薪酬情况及其领走908933.33元属于应发而未发工资的事实。对此，被告提出异议，并提供了工资汇总表、工资清单、公司变更登记申请书复印件、变更登记情况复印件、杭州洁康药业有限公司股东决定复印件、杭州洁康药业有限公司股东会决议复印件、杭州老桐君制药有限公司章程复印件、杭州老桐君制药有限公司股东会决议复印件、杭州老桐君制药有限公司章程修正案复印件予以反驳，欲证明原告的主张不成立，且原告提交的证据属虚假。上述证据与本案的争议无实际关联，在本案中本院不作认定，具体在本院认为中再作分析。关于被告提交的《企业所得税汇算清缴纳税申报鉴证报告》、资产负债表、收款凭证、莫仁与张启明自2014年11月8日至2015年2月27日期间往来邮件打印件的形式真实性本院予以认定。对原、被告提交的证据，第三人生融投资中心、仙健投资中心均未到庭质证。
本院认为,原、被告与第三人之间的《股权转让协议》及《补充协议》系各方当事人的真实意思表示，且不违反法律行政法规的强制性规定，应认定有效，各方当事人均应按约履行义务。原告主张被告应立即支付剩余未付股权转让款1168022.89元及相应利息，现被告提出抗辩称，该1168022.89元根据协议应予在股权转让款中扣减，具体扣减事项如下：一、张启明作为协议约定的老桐君公司实际股东于2014年11月5日从老桐君公司领走的908933.33元；二、交割日后产生的审计费用12000元[40000元×30%（原告转让的在老桐君公司的股权比例）]；三、因葡萄糖酸钙口服溶液质量问题产生的赔偿款损失69249.23元（230830.75元×30%）；四、因葡萄糖酸亚铁糖浆被桐庐县市场监督管理局认定为劣药产生的行政处罚款58557.31元（195191.04元×30%）；五、各类税收款项合计119283.02元（212225.22元×30%+185384.88元×30%）。本院认为，本案的争议焦点是被告主张扣减的理由是否成立，若不成立被告还应支付原告多少股权转让款及逾期利息，现作如下分析：
一、关于案外人张启明于2014年11月5日从老桐君公司领取的908933.33元。原告称该笔款项是原告公司的法定代表人张启明作为老桐君公司的董事长应发而未发的工资。被告不予认可，并抗辩称根据协议3.2款：“共管期内受让方向目标公司委派共管期团队，与目标公司原有管理团队共同参与目标公司的经营管理及财务管理，共管期内目标公司的下列事项应取得受让方书面同意方得进行：…(3)进行任何单独或合计人民币伍万元（RMB50000）以上的资产转让或资本支出事项…”及8.5款：“转让方和目标公司实际股东同意，转让方如按照本协议约定应承担赔偿责任或违约责任的，受让方有权自第三期款项中直接扣减，未免疑义，第三期款项不足以抵偿的部分，转让方和目标公司实际股东仍应继续向受让方履行赔偿责任”的约定，该款项可在剩余未付股权转让款中予以扣减。本院认为，无论该款项性质如何，张启明领取款项的时间为2014年11月5日，处于协议约定的共管期并在过渡期内，现原告主张款项领取在先，协议签订在后，被告并不认可，原告未提供证据证明该领款行为发生在共管期之外，且原告、第三人与被告之间的股权转让事宜并非一日决定，而是经过了一个长期的洽谈过程，领款人张启明作为老桐君公司前董事长，对协议内容应早已悉知，更应了解双方对共管期的管理约定。现张启明作为协议约定的老桐君公司实际股东，在未取得被告书面同意的情况下对老桐君公司进行了超过50000元的资本支出事项，违反了协议3.2条共管约定。根据协议第8.2款：“转让方或目标公司实际股东造成受让方或目标公司在过渡期内遭受损失的，违反共管约定造成受让方或目标公司损失的，即构成对本协议的违反并需应连带承担相应的违约责任，给受让方或目标公司造成的实际损失优先在未付的股权转让款中扣减”。另外，虽然协议里并未明确原告、第三人与张启明等6位自然人之间如何互负连带责任，但根据原、被告的陈述，张启明作为原告公司的法定代表人、实际控制人，应与原告互负连带责任，即张启明违约，则相应的损失应从转让方启明公司的股权转让款中予以扣减。综上，被告的抗辩成立，原告的主张缺乏证据支持，不符合双方的约定，本院不予支持。至于该款项是什么性质、张启明是否可以领取，可另行主张。
二、关于审计费12000元。被告抗辩称，根据《股权转让协议》第3.1款应将12000元审计费及利息在股权转让款中扣减。原告对共同委托事项并不认可，其表示双方并未共同聘请审计机构，该审计费用系被告单方委托审计而产生，且原告对被告单方委托而形成的审计报告存在诸多异议，至今双方也未就过渡期审计达成一致。本院认为，根据协议的约定，转让方和受让方双方在交割日后可共同聘请审计机构，对过渡期损益进行审计。现被告并未提供双方达成一致意见的证据证明原告参与了共同委托，故被告的抗辩，缺乏事实依据与证据支持，本院不予采信。
三、关于葡萄糖酸钙口服溶液产生的损失230830.75元。被告抗辩称，按原告的股权比例30%在股权转让款中扣减69249.23元。本院认为，被告提供的证据可证实该葡萄糖酸钙口服溶液因质量问题导致珠海友邦医药有限公司退货产生于2012年12月至2013年11月底之间，即在双方约定的交割日前，根据《补充协议》第二条：“…交割日前目标公司所有产品发生任何质量问题…由转让方和目标公司实际股东全体承担责任，如因此导致受让方或目标公司遭受实际损失的，则受让方有权根据股权转让协议的约定从第三期款项中扣减相应金额以弥补实际损失…”的约定，被告将款项69249.23元在股权转让款中扣减，符合合同约定，现原告对损失的数额提出有异议，但未提供证据予以反驳，故本院对被告的抗辩予以采信。
四、关于批号为20130904的葡萄糖酸亚铁糖浆被桐庐县市场监督管理局认定为劣药，处以行政处罚195191.04元（没收违法销售所得81329.6元，处违法生产、销售罚款113861.44元）。被告抗辩称，按原告的股权比例30%在股权转让款中扣减58557.31元。本院认为，批号为20130904的葡萄糖酸亚铁糖浆产生于交割日前，原告对罚款事实并无异议，根据《补充协议》第二条的约定，该处罚应由转让方和老桐君公司实际股东全体承担责任，但被告实际缴纳罚款为20000元，故被告从原告股权转让款中扣减6000元（20000元×30%）符合合同约定，本院予以支持。剩余罚款175191.04元并未实际产生，本案中不作处理。
五、关于2014年度补缴增值税252995.21元及滞纳金36637.33元，合计289632.54元；所得税185384.88元。被告辩称扣除其认可承担部分77407.32元（对应明细表中第6、7、23、24、25中第2小项），按照原告的股权比例30%从股权转让款中扣减增值税、滞纳金63667.56元（212225.22元×30%）及所得税55615.46元（185384.88元×30%）。本院认为：1、原告对其中的基准日即2014年2月28日前发生的税收事项17165.25元（对应明细表中第1、2、5、8项，其中增值税14993.92元、滞纳金2171.33元）无异议，愿承担赔偿责任，故被告可从应支付原告的股权转让款中扣减17165.25元×30%。2、根据被告提交的纳税评估认定结论表对应明细的第25项第1小项、26项，该两部分税收事项并没有入账日期，被告亦未提供相应的发票等证据以证实税收产生的时间，且被告依据的《企业所得税汇算清缴纳税申报鉴证报告》,原告对此提出异议,表示被告事先并未与原告协商而共同委托审计机构，该鉴证报告系被告单方委托相关机构出具。当事人对自己提出的主张有责任提供证据，否则应承担举证不能的法律后果，对于两部分税收事项合计170171.66元（其中增值税148645.64元、滞纳金21526.02元）及25项对应的所得税185384.88元，被告合计扣减原告355556.54元×30%，缺乏证据支持，对被告的该项辩称本院不予采信。3、对应明细表中第3-4项及第9-22项，税收事项合计24888.33元（其中增值税21740.04元、滞纳金3148.29元），根据被告提供的发票或收据显示的日期，该16项税收事项均在交割日前、过渡期内，本院认为过渡期内的税收属于过渡期的经营成本，根据合同约定，过渡期的损益可委托审计机构进行审计。现被告认为该税收虽在过渡期内但增值税均于2015年缴纳无法计入2014年，该系财务技术问题，且2014年11月12日交割日后，老桐君公司由被告接手，该增值税于2015年缴纳而不能计入2014年的责任并不能归咎于原告，本院对被告在原告股权转让款中扣除增值税21740.04元×30%的辩称不予采信。另原告对未及时缴纳税收而产生滞纳金应承担相应赔偿责任无异议，本院对被告在原告股权转让款中扣除滞纳金3148.29元×30%的辩称予以采信。
六、逾期利息：1、关于原告主张的85347.33元逾期付款利息由三部分组成，包括以本金908933.33元计算的逾期付款利息36811.8元，以本金25894.83元计算的逾期付款利息2097.48元以及以本金172632.17元计算的逾期付款利息46438.05元，计算的本金均为被告应支付的第二期股权转让款。首先，本金908933.33元为被告主张的应扣除的款项，根据协议第8.5款，受让方有权自第三期款项中直接扣减应由转让方承担的款项，故该908933.33元即便符合扣减的条件，也应在第三期股权转让款中予以扣除，故对原告关于该部分的逾期付款利息主张，本院予以支持；其次，根据协议2.4款，被告支付第二期股权转让款其中一个前提条件为“转让方应促使老桐君公司清理所有通过个人账户所收取的货款，将该等货款统一转入公司账目，并由老桐君公司向受让方出具书面确认函确认”。现被告提供了客户收付款入账通知以证明其于2016年5月13日收到个人销售款575440.57元（其中包括本案涉及的个人销售款172632.17元及该个人销售款产生的企业所得税25894.83元），其已按协议约定在收到后的十个工作日内支付给了原告，故不存在逾期付款的情形。庭审中，原告认可25894.83元及172632.17元属于个人销售款，本院对被告的抗辩予以采信，对原告逾期利息48535.53元的主张，不予支持。2、关于原告要求被告支付审计费12000元的逾期付款利息，被告对第二期股权支付款的应付时间为2014年11月26日并无异议，原告的利息起算期限及计算方式符合双方约定及法律规定，本院予以支持。3、关于原告要求被告支付第三期未支付股权转让款1156022.89元的逾期付款利息，因被告主张从第三期股权转让款中扣减共计990276.61元【908933.33元+（230830.75元+20000元+17165.25元+3148.29元）×30%】，符合合同约定的，故不存在逾期付款利息。剩余第三期未付股权转让款165746.28元（175191.04元+170171.66元+185384.88元+21740.04元）×30%的逾期付款利息本院予以支持。
七、关于原告主张的律师代理费30000元，根据协议8.4款，因违约方的违约行为导致纠纷的，违约方还应承担守约方支出的诉讼费用、合理的律师费用及差旅费用。现被告存在逾期支付股权转让款的情形，需承担原告为此支出的律师代理费用，本院根据案件情况，将律师费适当调整为13000元。
综上所述，被告还应支付原告股权转让款合计177746.28元（被告于第二期股权转让款中扣除的审计费12000元+未产生的行政处罚金52557.31元+税收事项113188.97元）及相应的逾期利息。第三人生融投资中心、仙健投资中心未到庭，视为其放弃当庭陈述、举证、质证等权利。据此，依照《中华人民共和国合同法》第四十四条第一款、第六十条第一款、第一百零七条，《中华人民共和国公司法》第七十一条，《中华人民共和国民事诉讼法》第六十四条第一款、第一百四十四条之规定，判决如下：
一、被告华润三九医药股份有限公司应支付原告绍兴启明投资有限公司股权转让款177746.28元，并支付逾期付款利息（以本金908933.33元为基数自2014年11月27日起至2015年2月15日止按月利1.5%计算的逾期付款利息，以本金12000元为基数自2014年11月27日起至款项实际付清之日止按月利1.5%计算的逾期付款利息，以本金165746.28元为基数自2016年5月27日起至款项实际付清之日止按月利1.5%计算的逾期付款利息），于本判决生效之日起十日内付清。
二、被告华润三九医药股份有限公司支付原告绍兴启明投资有限公司律师费13000元，于本判决生效之日起十日内付清。
三、驳回原告绍兴启明投资有限公司其他诉讼请求。
如果未按本判决指定的期间履行给付金钱义务，应当依照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。
案件受理费16350元，减半收取8175元，由原告绍兴启明投资有限公司负担5300元（已预交），由被告华润三九医药股份有限公司负担2875元。
原告绍兴启明投资有限公司于本判决生效之日起十五日内向本院申请退费；被告华润三九医药股份有限公司于本判决生效之日起七日内，向本院交纳应负担的诉讼费。
如不服本判决，可在判决书送达之日起十五日内向本院递交上诉状，并按对方当事人人数提出副本，上诉于浙江省杭州市中级人民法院。
代理审判员 周 昊
二〇一七年五月十七日
书 记 员 钱红梅
附法律条文：
《中华人民共和国合同法》
第四十四条第一款：依法成立的合同，自成立时生效。
第六十条第一款：当事人应当按照约定全面履行自己的义务。
第一百零七条：当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
《中华人民共和国公司法》第七十一条：有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。
股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。
经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。
公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。
《中华人民共和国民事诉讼法》
第六十四条第一款：当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。
第一百四十四条：被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以缺席判决。
第二百五十三条：被执行人未按判决、裁定和其他法律文书指定的期间履行给付金钱义务的，应当加倍支付迟延履行期间的债务利息。被执行人未按判决、裁定和其他法律文书指定的期间履行其他义务的，应当支付迟延履行金。