重庆市江津区人民法院
民 事 判 决 书
（2016）渝0116民初1241号
原告（反诉被告）：重庆市金刚建筑工程公司，住所地重庆市江津区金刚场，组织机构代码20359826-8。
法定代表人：李华，总经理。
委托诉讼代理人：王建宇，重庆兴众律师事务所律师，一般代理。
委托诉讼代理人：李千仞，重庆兴众律师事务所律师，一般代理。
被告（反诉原告）：重庆市迪桑工贸有限公司，住所地重庆市江津区德感街道平溪路25号，统一社会信用代码915001166733635516。
法定代表人：倪霞，执行董事。
委托诉讼代理人：徐迎龙，北京市中伦（重庆）律师事务所律师，一般代理。
委托诉讼代理人：袁泽瑜，北京市中伦（重庆）律师事务所律师，一般代理。
原告（反诉被告）重庆市江津区金刚建筑工程公司（下称重庆金刚建司）与被告（反诉原告）重庆市迪桑工贸有限公司（下称重庆迪桑公司）建设工程施工合同纠纷一案，本院受理后，依法适用简易程序公开开庭进行了审理，原告（反诉被告）重庆金刚建司的委托诉讼代理人李千仞，被告（反诉原告）重庆迪桑公司的委托诉讼代理人徐迎龙、袁泽瑜到庭参加了诉讼。本案现已审理终结。
原告（反诉被告）重庆金刚建司向本院提出诉讼请求：1、被告支付原告工程款1462675.94元及资金占用损失（从2014年1月1日起，按中国人民银行同期贷款利率计算，至付清时止）；2、被告支付原告违约金100000元。事实和理由：原、被告于2009年6月2日签订《建设工程施工合同》，约定原告承包被告位于江津区德感工业园区的厂房、库房、综合楼。该工程经验收合格，工程款经双方结算为5823151.19元，被告分期支付工程款共计4360475.25元，欠工程款1462675.94元至今未支付。此款经原告多次催收无果，故提出以上诉讼请求。
被告（反诉原告）重庆迪桑公司辩称：1、双方尚未就涉案工程的结算达成一致意见。原告报送的价格明显虚高，被告认为涉案工程建筑面积8571.01平方米，根据双方签订的合同约定，按照每平方米580元计算（为包干价格），工程结算价应为4971185.80元，截止2016年1月19日，被告已支付原告工程款4708385.97元，已付至工程造价的94%；2、原告方承建的涉案工程存在大量质量问题，被告有权暂停付款，并要求原告方承担违约责任。根据双方于2011年7月20日签订的协议内容约定，原告方应在2011年9月19日之前完成涉案工程全部施工内容，并做好清洁卫生，交付被告使用，完成涉案工程竣工验收，并将所有建筑资料交被告，否则，原告需承担工程总价15%的违约金。由于原告拖延竣工，直到2015年2月15日涉案工程才取得竣工验收备案登记证，原告方存在严重的工期违约。另外涉案工程还存在外墙砖鼓包脱落，墙面返潮渗水等质量问题。原告未履行工程维保义务，应承担相应违约责任。根据2009年6月2日双方签订的补充协议第9.5条约定，被告有权停止支付工程款。综上，请求驳回原告的诉讼请求。
被告（反诉原告）重庆迪桑公司向本院提出反诉请求：1、原告支付被告工期延误违约金745677.87元；2、原告立即对涉案工程的外墙鼓包脱落、墙面返潮渗水等质量问题进行整改；3、原告支付被告质量问题违约金100000元。事实及理由：2009年6月2日，原、被告签订《建设工程施工合同》和《重庆市迪桑化学制品有限公司新建厂房工程施工合同补充协议》，约定原告承建被告位于江津区德感工业园区的新建厂房工程，施工范围包括一期（1号厂房、2号厂房、综合楼、仓库）和二期（3号厂房）的基础工程、主体工程、外装工程、水电安装工程等。涉案工程采用双包方式，由原告负责施工管理和对分包项目进行总协调。涉案工程价款按照建筑面积每平方米单价包干计算，建筑面积综合单价为580元/平方米（含税）。涉案工程一期部分工期150天，二期部分工期暂定2个月，发生影响工程进度的情况后14天内，原告应以书面形式向被告提出报告，否则视为原告没有延长工期的要求。该协议还对工程款支付方式、违约行为与违约金、工程质量管理、设计变更以及甲乙双方其他权利义务进行了明确约定。2009年11月13日，原、被告签订了《关于重庆市迪桑化学制品有限公司新厂建设二期工程（三号厂房）施工建设及付款的补充协议》，对涉案工程二期部分（即三号厂房）的工程款支付和竣工时间等事宜进行了约定，要求3号厂房在2010年3月31日前竣工及验收完毕。施工过程中，被告妥善地履行了合同义务。但是原告由于自身资金实力不足、管理不到位，导致工程进展缓慢，工期一再延误。为了推动工程进展，被告分别于2010年8月16日、2011年7月20日与原告签订《关于江津金刚建筑工程公司与重庆市迪桑化学制品有限公司在厂房建设收尾工程中的协议》和《关于重庆市迪桑化学制品有限公司与江津区金刚建筑工程公司施工收尾工程协议》，重新调整了对涉案工程各部分（包括1号厂房、2号厂房、综合楼、仓库和3号厂房）的工期约定，要求原告应在60天内（即2011年9月19日之前）完成涉案工程全部施工内容，在做好清洁卫生后交付被告使用，完成涉案工程的竣工验收，并将所有建筑资料交被告，否则原告需承担工程总造价15%的违约金。双方同时还约定了被告向原告提前支付部分工程款等事宜。协议签订后，被告依约提前支付了部分工程款，但原告仍未能在约定期限（2011年9月19日）内履行全部义务。依据《关于重庆市迪桑化学制品有限公司与江津区金刚建筑工程公司施工收尾工程协议》之约定，原告应按照涉案工程结算总价的15%向被告支付工期延误违约金。2014年底，双方在办理结算过程中，被告屡次要求原告承担该违约金，但均遭到拒绝。另外，原告承建的涉案工程存在大量质量问题，虽经被告多次通知，但原告一直未就涉案工程的外墙鼓包脱落、墙面返潮渗水等质量问题进行整改，拒绝履行工程保修义务。该行为显属违约，原告应当按照《重庆市迪桑化学制品有限公司新建厂房工程施工合同补充协议》第14.5条向被告支付违约金100000元。故提出以上反诉请求。
原告（反诉被告）重庆金刚建司针对被告（反诉原告）重庆迪桑公司的反诉辩称：1、涉案工程被告已经在2011年初提前使用，并没有造成工期延误；2、竣工验收的手续是由于被告资金不到位，施工许可证是2011年11月5日才取得，造成竣工备案时间延后，是被告的责任而不是原告的责任；3、被告提出质量整改问题在竣工备案就要提出来，竣工备案说明工程合格。现有渗水现象是其他单位造成的，相关的施工单位是进行了处理的，因他们之间达成的是口头协议，没有书面证据。另外，本案的工程款已经结算，被告将原告提交的工程结算书已经提交城建档案馆留存，不存在未结算问题。综上，被告的反诉不能成立。请求驳回被告的反诉请求。
经审理查明：2009年6月2日，原、被告签订《建设工程施工合同》，合同第一部分第一条约定：工程名称：1号、2号、3号厂房、丙类库房和综合楼；工程地点：江津区德感工业园区；工程内容：江津区建筑勘察设计院设计的2008-31号图纸之内容，含土建、水电、装饰、附属工程；资金来源：自筹。第三条约定：开工日期：2009年6月6日，以开工报告时间为准；竣工日期：2009年11月6日；合同工期总日历天数：150天。第五条约定：合同价款金额：2999150元。第八条约定：承包人向发包人承诺按照合同约定进行施工、竣工并在质量保修期内承担工程质量保修责任。第九条约定：发包人向承包人承诺按照合同约定的期限和方式支付合同价款及其他应当支付的款项。合同附件3中的《房屋建筑工程质量保修书》第二条：双方根据《建设工程质量管理条例》及相关规定，约定本工程的质量保修期如下：1、地基基础工程和主体结构工程为设计文件规定的该工程合理使用年限；2、屋面防水工程、有防水要求的卫生间、房间和外墙面的防渗漏为五年；3、装修工程为一年；4、电气管线、给排水管道、设备安装工程为1年；5、供热与供冷系统为X个采暖期、供冷期；6、住宅小区内的给排水设施、道路等配套工程为一年；质量保修期自工程竣工验收合格之日起计算。第三条约定：1、属于保修范围、内容的项目，承包人应当在接到保修通知之日起7天内派人保修。承包人不在约定期限内派人保修的，发包人可以委托他人修理。2、发生紧急抢修事故的，承包人在接到事故通知后，应当立即到达事故现场抢修。3、对于涉及结构安全的质量问题，应当按照《房屋建筑工程质量保修办法》的规定，立即向当地建设行政主管部门报告，采取安全防范措施；由原设计单位或则具有相应资质等级的设计单位提出保修方案，承包人实施保修。4、质量保修完成后，由发包人组织验收。第四条约定：保修费用由造成质量缺陷的责任方承担。同日，原告重庆金刚建司（乙方）与被告重庆迪桑公司（甲方）签订《重庆市迪桑化学制品有限公司新建厂房工程施工合同补充协议》，合同约定主要内容为：第2.1条：重庆市迪桑化学制品有限公司新建厂房工程为一期工程：1、2号厂房、综合楼及仓库，二期工程：3号厂房。施工图范围内和甲方确认的建筑工程主要包括：第2.1.1基础工程、主体工程、楼地面工程、屋面工程、墙面及外装工程、水电安装工程以及施工图设计出的其他施工内容。第2.2条：合同承包范围内包人工、包材料、报机具、包工期、包质量、包安全、包文明施工、包括乙方各种税、费等在内（有乙方按相关文件规定自行交纳）。第6.7.3条：乙方必须为甲方对本工程负全责，包括对整个项目的进度、质量、安全施工等进行总控制，对各独立专业承包人、分包单位进行专业总协调及管理。并满足政府部门之要求，及时解决因承包人及分包人施工而引发投诉等问题。第6.21条：由于甲方施工设计图提供不及时、甲方供应的材料设备不及时、重大设计变更（如重大结构体系变更）等影响工程进度，发生上述情况的14天内，乙方就延误的工期以书面形式向甲方提供报告。甲方在收到报告后14天内予以确认或提出处理意见。乙方逾期不提出报告，则视乙方对变更无相关要求（包括相关费用）；甲方对报告不予确认也不提出处理意见，则视甲方同意顺延工期。延误的工程工期由甲方驻工地代表签认，且只延长工期，不作其他任何经济补偿。第7.1.2条：合同价格：本工程合同价款：按照建筑面积每平米单价包干计算：建筑面积综合单价为580元/平方米（含税）。建筑面积确认按照《建筑工程建筑面积计算规范》编号为GB/T50353-2005计算……。第8.1.1条：一期工程（1、2号厂房、库房、综合楼）：开工时间2009年6月，竣工时间2009年11月，工期150天。第8.1.2条：二期工程（3号厂房）工期暂定2个月，开工日期及付款方式另行确定。第8.2.1条：本合同规定的竣工日期是指甲方认可的合同约定工程承包内容及甲方指定分包的工程全部完工，并通过甲方组织的有建设单位、设计单位、施工单位、勘察单位、消防单位、质监单位参加的竣工验收之后，施工单位完成初步验收中提出的整改工作并达到甲方要求且签字确认之日，如承包内容中及分包工程中任何一项部分工程未完工或经甲方组织的验收评定为不合格，均视为工程未竣工。第9.1条：本工程不支付预付款，其付款方式分2阶段进行，第一阶段为一期工程施工期间直到竣工验收合格后支付一期工程总价的50%；第二阶段为工程验收合格后一年内付清一期工程总价剩余的50%。第9.5条：出现下列情况之一，甲方有权暂停支付乙方的工程款和余款，直到停止付款原因消除为止：……2、本工程中存在重大缺陷或明显的违约行为；4、本工程存在质量问题，还待整改；6、因乙方原因造成工期滞后，不能满足甲方要求的或工程实际施工进度明显落后，存在不能如期完工风险的。第10.3条：工程竣工应当同时具备以下条件：江津区建设工程质量监督站批准竣工报告的时间就是本工程的竣工时间。第13.1条：保修范围：工程保修按《建设工程质量管理条例》和《房屋建设质量保修办法》，保修范围包括地基基础和主体结构工程，屋面及屋面防水，内外墙面装饰、楼地面工程，给排水、电气安装工程。乙方承包范围内工程项目，由于乙方施工质量问题和材料设备质量问题，均属乙方保修范围；甲方分包工程的保修由甲方负责且不排除乙方应负的相关责任。第13.2条：保修期限：工程保修期从工程验收备案合格并交付甲方使用之日其开始计算。保修期限以国家规定及重庆市规定保修时间。其中地基基础与主体结构在合理使用设计寿命期限内保修结构安全。外墙、砼结构、门窗周边等部位防渗漏保修5年零6个月，屋面防水和有防水要求的卫生间房间和外墙面的渗漏保修期5年零6个月，其他分部分项工程保修期为2年零6个月。第14.5条：甲乙双方如一方违约，则违约方支付守约方违约金拾万元整，并承担因违约所造成的其他全部损失；乙方原因中途退场，其所做工程不予工程款，所本协议有其他违约条款的，按具体条款的约定执行。
2009年11月13日，原告重庆金刚建司（乙方）与被告重庆迪桑公司（甲方）签订《重庆市迪桑化学制品有限公司新建二期工程（三号厂房）施工建设及付款的补充协议》，协议第二条约定：1、现三号厂房基础已完工，甲方支付给乙方工程进度款按工程总造价的15%；2、三号厂房竣工验收合格，交付给甲方后，甲方支付给乙方工程进度款按工程总造价的25%~35%；3、剩余款项在该工程竣工验收合格，交付甲方后，在保证一期付款的基础上，一年内付清。第三条约定：该工程工期2010年3月31日前竣工及验收完毕。2010年8月16日，原告重庆金刚建司（乙方）与被告重庆迪桑公司（甲方）签订《关于江津金刚建筑工程公司与重庆市迪桑化学制品有限公司在厂房建设收尾工程中的协议》，协议约定：江津金刚建筑工程公司重庆市迪桑化学制品有限公司工程建设项目部，由于自身资金短缺，资金计划失策，现乙方给甲方提出需得到甲方的资金支持，甲方在与乙方协商后同意在超出双方签订施工合同工程款支付方式上，提前支付一定金额的工程款给乙方；协议还对提前支付部分工程款进行约定。2011年7月20日，原告重庆金刚建司（乙方）与被告重庆迪桑公司（甲方）签订《关于重庆市迪桑化学制品有限公司与江津区金刚建筑工程公司施工收尾工程协议》，该协议约定：乙方在签订此协议起陆拾天内保质保量完成甲方所有厂房的施工内容，并将所有房屋打扫好清洁卫生全部交付甲方使用，且完成该工程的竣工验收并将所有建筑资料交给甲方。甲方承诺在此期间分两次支付乙方工程款伍拾伍万元整。甲方在签订此协议并受到乙方支付农民工工资确认表后，支付乙方工程款贰拾伍万元整。剩余款项在甲方收到黄勇房租后立即支付乙方。如甲方不能按时收到黄勇房租则保证在8月15日左右将余款支付乙方。如甲方不能在此期间按时将此协议的工程款支付给乙方，甲方愿按结算时工程总造价的15%支付给乙方违约金。如乙方不能在陆拾天内完成该工程的竣工验收，不能保质保量完成该工程施工交付给甲方，所有建筑资料（办理产权证）不能按时交给甲方。乙方愿按结算时工程总造价的15%支付给甲方违约金。如乙方违约，在乙方未将上述条款完善前，甲方不在支付乙方工程款，乙方也不能以任何借口和形式向甲方要求支付工程款项。根据重庆市江津区国土资源和房屋管理局出具的（2016）江津区不动产权第000084422号权证，位于江津区德感街道平溪路25号（重庆市迪桑化学制品综合楼1至3层1号）不动产系重庆市迪桑工贸有限公司所有，面积为房屋建筑面积1973.90平方米。根据重庆市江津区国土资源和房屋管理局出具的（2016）江津区不动产权第000078321号权证，位于江津区德感街道平溪路25号（重庆市迪桑化学制品库房1层1号）不动产系重庆市迪桑工贸有限公司所有，面积为房屋建筑面积920.19平方米。根据重庆市江津区国土资源和房屋管理局出具的（2016）江津区不动产权第000078214号权证，位于江津区德感街道平溪路25号（重庆市迪桑化学制品1#厂房1层号）不动产系重庆市迪桑工贸有限公司所有，面积为房屋建筑面积792.35平方米。根据重庆市江津区国土资源和房屋管理局出具的（2016）江津区不动产权第000078670号权证，位于江津区德感街道平溪路25号（重庆市迪桑化学制品2#厂房1至2层1号）不动产系重庆市迪桑工贸有限公司所有，面积为房屋建筑面积2047.42平方米。根据重庆市江津区国土资源和房屋管理局出具的203房地证2015字第13317号权证，位于江津区德感街道平溪路25号（重庆市迪桑化学制品3#厂房1层1号）房屋系重庆市迪桑工贸有限公司所有，面积为房屋建筑面积2837.15平方米。2012年12月30日，相关单位就涉案工程竣工验收召开会议并形成会议纪要，其中质监站提出部分质量问题并要求整改。2013年2月26日，原告向重庆市江津区质监站作出竣工验收整改回复，回复意见主要是对质监站提出的相关质量问题予以整改并处理完毕。2015年2月15日，涉案工程取得《重庆市建设工程竣工验收备案登记证》，该证载明：涉案工程竣工验收时间2012年12月30日。2012年8月21日，被告向重庆市江津区质量监督站出具承诺书，载明：位于江津区德感工业园区的重庆市迪桑化学制品有限公司厂房工程施工中由于工期短、资金匮乏、老厂房已拆除，需急于投产来满足市场需求，所以外墙节能未做，以后如因外墙未做造成的损失由我公司自行承担，请予支持。承诺书下部有重庆市江津区德感工业园管理委员会盖章并标注“属实”。庭审中，被告提交录像光盘1张，照片17张，拟证明原告承建的工程存在墙砖脱落、墙面受潮、渗水等质量问题，原告予以否认。被告提供施工现场会议纪要及签到表3份、厂房施工检查记录、监理月报以及监理例会会议纪要，拟证明在2009年9月到12月期间的施工和检查中，并未因任何可以归责于被告的事由造成停工，原告对此予以否认，坚持认为系被告原因导致工期延误。被告提交25张收据、收据和转账支票存根，拟证明已向原告支付工程款4708385.97元，原告认为2010年2月2日的标号为09805376号，金额为100000元的转账支票存根包含于2010年2月8日出具的50万收据中；对收据00069889号，金额为247910元的收据（该收据注明建附属设施，未加盖原告印章）有异议，认为该笔款系合同外工程款项。原告对其余22笔交易明细的票据无异议。原告出具二份工作联络函，拟证明因被告未提供有效施工图，导致工序无法正常进行，导致工期延误，被告不予认可，且表示从未收到。
另查明：根据重庆市江津区城乡建委登记材料显示：原告重庆市金刚建筑工程公司具备房屋建筑工程施工总承包三级、建筑装修装饰工程专业承包三级、施工总承包市政公用工程三级资质。根据重庆市工商行政管理局江津区查询点出具的材料显示：2016年3月11日，原告重庆市江津区金刚建筑工程公司变更名称为重庆市金刚建筑工程公司；2015年11月26日，被告重庆市迪桑化学制品有限公司变更名称为重庆市迪桑工贸有限公司。2009年9月22日，重庆市迪桑化学制品有限公司厂区工程取得《建设用地规划许可证》。2011年11月9日，环保型机床冷却润滑液、无磷清洗剂及防锈剂生产线工程取得《建设工程规划许可证》。2011年12月5日，环保型机床冷却润滑液、无磷清洗剂及防锈剂生产线工程取得《建筑工程施工许可证》。涉案工程于2009年6月5日取得开工报告。2009年10月19日，重庆市江津区德感工业园管理委员会出具《停工通知书》，因涉案工程未办理完善相关建设手续及施工许可证，在9月25日园区组织的大检查中检查出问题且没有进行整改，存在重大安全隐患。责令江津区金刚建筑工程有限公司暂停施工，完善相关建设手续，对存在的问题切实进行整改，并以书面形式回复园区工程部，经园区工程部现场核实后，方可进行施工。2011年12月25日，原告与涉案工程监理公司共同出具涉案工程的4份《单位（子单位）工程竣工报告（竣工申请书）》，载明：合同竣工日期：2009年11月6日；实际完工日期：2010年12月30日；延期说明：因建设方资金不到位造成延期。2016年12月1日，国网重庆市电力公司江津供电分公司出具材料：2011年1月到12月、2012年1月到12月、2013年1月到12月，共计3年间，被告公司月应收电量约5000千瓦时。2016年12月9日，重庆市江津区公共业务管理办公室出具材料：经社保系统查询，重庆市迪桑工贸有限公司于2011年4月在江津区社保局参加社会保险，现公司参保人数为17人，单位参保状态正常。
再查明：2011年3月30日，原告制作《重庆市建设工程计算书》，结算工程规模为8900.404平方米，工程造价为5823151.19元。2014年10月29日，被告出具收条，载明：今收到重庆市江津区金刚建筑工程公司交来的重庆市建设工程结算书壹本，工程造价金额为人民币5823151.19元。被告将该结算书作为工程备案资料报送至重庆市江津区城乡建设档案馆，重庆市江津区城乡建设档案馆对该结算书原件予以备案。2015年1月6日，被告出具收条，收到原告5200000元的发票，发票号为00474291#，被告认可该发票已入帐。
上述事实，有双方当事人的陈述及提供的《建设工程施工合同》、《房屋建筑工程质量保修书》、《重庆市迪桑化学制品有限公司新建厂房工程施工合同补充协议》、《重庆市迪桑化学制品有限公司新建二期工程（三号厂房）施工建设及付款的补充协议》、《关于江津金刚建筑工程公司与重庆市迪桑化学制品有限公司在厂房建设收尾工程中的协议》、《单位（子单位）工程竣工报告（竣工申请书）》、《关于重庆市迪桑化学制品有限公司与江津区金刚建筑工程公司施工收尾工程协议》、不动产权证、会议纪要及签到表、竣工验收整改回复、《重庆市建设工程竣工验收备案登记证》、承诺书、光盘、照片、厂房施工检查记录、监理月报、监理例会会议纪要、收据、转账支票存根、登记材料、《建设用地规划许可证》、《建设工程规划许可证》、《建筑工程施工许可证》、《停工通知书》、用电材料、参保材料、《重庆市建设工程计算书》、收条、工作联络函等经庭审在卷可证，应予采信。
本院认为：原告重庆金刚建司具备建设工程施工资质，其与被告重庆迪桑公司签订建设工程施工合同及附件、补充协议系双方真实意思表示，不违反法律及行政法规的强制性、效力性规定，合法有效。该工程于2009年6月6日开工。2009年10月19日，重庆市江津区德感工业园管理委员会出具《停工通知书》，因涉案工程未办理完善相关建设手续及施工许可证。2011年12月5日，涉案工程取得《建筑工程施工许可证》。2015年2月15日，涉案工程取得《重庆市建设工程竣工验收备案登记证》。
关于原告请求支付工程款、资金占用损失及违约金的问题。因涉案施工合同有效，且该工程已经过竣工验收，故原告请求支付工程价款的条件已满足。根据《中华人民共和国民法通则》第五十六条规定：民事法律行为可以采取书面形式、口头形式或者其他形式。法律规定是特定形式的，应当依照法律规定。原告出示的《重庆市建设工程计算书》，被告于2014年10月29日出具收条表示收到结算金额为5823151.19元金额的结算书，并以工程发包方将该结算书作为工程备案资料报送至重庆市江津区城乡建设档案馆予以备案，并将原告提交金额为5200000元的发票入帐，虽然未明确表示认可该结算金额，但是其提交备案的行为表示认可该结算金额5823151.19元。关于已付工程款的问题，双方对22笔工程款支付均无异议，本院予以确认。被告出示2010年2月2日的编号为09805376号，金额为100000元的转账支票存根，出具2010年2月8日的50万收据，主张已向原告支付60万工程款，但其提供的50万收据收款方式为转账，且未提供编号为09805376号，金额为100000元的转账支票存根的收据或提交于2010年2月8日打款50万的银行票据，同时，该收据出具在转账存根之后，符合先转账后出具收据的一般交易规则，且被告支付工程款均为转账方式支付。故本院采纳原告提出的该10万元专款包含于50万元收据之中的意见。被告出具编号为00069889号，金额为247910元、项目为建附属设施的收据，原告认可收到该款，但表示该款属于修建围墙、堡坎等额外工程的费用，不应计算在原定的工程范围及结算金额内，根据双方合同约定，施工范围为1、2号厂房、综合楼及仓库、3号厂房及施工图范围内确认的建筑工程，主要包括：基础工程、主体工程、楼地面工程、屋面工程、墙面及外装工程、水电安装工程以及施工图设计出的其他施工内容，并未包含该收据项下附属设施的工程量，故本院采纳原告要求不应计算在已付工程款项内的质证意见。综上，涉案工程结算款为5823151.19元，已付工程款为4360475.97元，欠付工程款为1462675.22元。关于资金占用损失，根据补充协议9.1条，双方约定工程验收合格后一年内付清工程总价剩余款项，涉案工程竣工验收时间2012年12月30日，被告应在2013年12月29日前付清全部工程款，故原告申请以欠付工程款1462675.22为基数，按中国人民银行同期贷款利率从2014年1月1日起算至付清之日止的诉讼请求，本院予以支持。原告在请求支付资金占用损失的情况下，同时请求被告支付违约金100000元的诉讼请求，于法无据，且损失大于违约金，故其违约金的诉讼请求，本院不予支持。
关于反诉要求支付工期延误违约金的问题。根据原告与监理单位出具的《单位（子单位）工程竣工报告（竣工申请书）》载明：合同竣工日期：2009年11月6日；实际完工日期：2010年12月30日，可以认定涉案工程存在工期延误的事实。通过已经审理查明的事实可以反映，造成工期延误的原因包括被告在工程完工后才取得施工许可证，被告建设资金不到位，原告施工存在部分质量问题及安全隐患造成整改等原因，双方对工期延误都存在过错且被告存在的过错明显大于原告，故本院酌情酌情按照原告承担该违约金三成，被告承担该违约金七成的比例予以分担。根据双方约定，违约金计算标准为工程结算总价的15%，故该违约金金额为873472.68元，原告应承担工期延误违约金金额为262041.80元。
关于反诉中质量问题整改以及质量问题违约金问题。根据双方签订的《重庆市迪桑化学制品有限公司新建厂房工程施工合同补充协议》第13.2条：保修期限：工程保修期从工程验收备案合格并交付甲方使用之日其开始计算。保修期限以国家规定及重庆市规定保修时间。其中地基基础与主体结构在合理使用设计寿命期限内保修结构安全。外墙、砼结构、门窗周边等部位防渗漏保修5年零6个月，屋面防水和有防水要求的卫生间房间和外墙面的渗漏保修期5年零6个月，其他分部分项工程保修期为2年零6个月。涉案工程竣工验收时间为2012年12月30日，根据国家电网提供的用电量材料，被告的用电量在2011年2月的403千瓦时增长为2011年3月的8577千瓦时，之后在2012年、2013年一直处于约5000千瓦时，可以认定存在大量生产任务，已经使用涉案工程。涉案工程于2011年3月投入使用，于2012年12月30日竣工验收，故根据约定，保修期应当从2012年12月30日起算。该案于2016年1月22日立案，故部分工程质量问题并未过保修期。被告反诉要求原告对涉案工程外墙转鼓包脱落、墙面返潮渗水等质量问题进行整改，其根据《重庆市迪桑化学制品有限公司新建厂房工程施工合同补充协议》第13.2条，外墙面防水的保修期为5年6个月，故墙面返潮渗水仍在保修期内，外墙墙砖鼓包脱落系其他工程，保修期为2年6个月，已经经过保修期。故被告反诉要求原告立即对墙面返潮渗水进行整改的诉讼请求，本院予以支持，对外墙墙砖鼓包脱落等质量问题的诉讼请求，本院不予主张。被告基于《重庆市迪桑化学制品有限公司新建厂房工程施工合同补充协议》第14.5条向原告主张质量问题违约金10万元，但第14.5条约定的是对合同整体或部分违约的违约金支付的总数，并非对质量问题单独约定的违约金，应当理解为：一个违约行为或多个违约行为，都应当支付违约金10万元。原告在工期延误违约行为上已经被判令支付违约金262041.80元，该违约责任已经涵盖其质量问题的违约责任，故被告反诉要求原告支付质量问题违约金的诉讼请求，本院不予支持。
综上，依照《中华人民共和国民法通则》第五十六条，《中华人民共和国合同法》第八条、第四十四条第一款、第六十条、第一百零七条、第一百一十三条、第一百一十四条第一款规定，判决如下：
一、被告（反诉原告）重庆市迪桑工贸有限公司于本判决生效后7日内向原告（反诉被告）重庆市江津区金刚建筑工程公司支付工程款1462675.22元及利息（该利息以1462675.22为基数，从2014年1月1日起，按中国人民银行同期贷款利率算至付清之日止）。
二、原告（反诉被告）重庆市江津区金刚建筑工程公司于本判决生效后10日内对被告（反诉原告）重庆市迪桑工贸有限公司所有的，位于重庆市江津区德感街道平溪路25号（1、2、3号厂房、综合楼及仓库）不动产的外墙、砼结构、门窗周边等存在渗漏质量问题的部位履行保修义务。
三、原告（反诉被告）重庆市江津区金刚建筑工程公司于本判决生效后7日内向被告（反诉原告）重庆市迪桑工贸有限公司支付违约金262041.80元。
四、驳回原告（反诉被告）重庆市江津区金刚建筑工程公司的其余诉讼请求。
五、驳回被告（反诉原告）重庆市迪桑工贸有限公司的其余反诉请求。
如果原告（反诉被告）重庆市江津区金刚建筑工程公司、被告（反诉原告）重庆市迪桑工贸有限公司未按判决指定期间履行给付金钱义务的，应当依照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条的规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。
案件受理费18864元，减半收取9432元；反诉案件受理费12256元，减半收取6128元，由原告（反诉被告）重庆市江津区金刚建筑工程公司负担3765元，由被告（反诉原告）重庆市迪桑工贸有限公司负担11795元。
如不服本判决，可在判决书送达之日起十五日内，向本院递交上诉状，并按对方当事人的人数提出副本，上诉于重庆市第五中级人民法院。双方当事人在法定上诉期内，均未提出上诉或仅有一方上诉后又撤回的，本判决发生法律效力。当事人应自觉履行判决的全部义务。一方不履行的，自本判决内容生效后，权利人可以向人民法院申请强制执行。申请执行的期限为二年，该期限从法律文书规定履行期间的最后一日起计算。
审判员 漆恒邦
二〇一七年九月五日
书记员 蔡媛媛