甘肃省临泽县人民法院
民 事 判 决 书
（2015）临民初字第677号
原告（反诉被告）王志平，男，1971年2月4日出生，汉族，无业。
委托代理人梁顺伟，北京开越律师事务所律师。
被告（反诉原告）安徽绿雨种业股份有限公司，住所地安徽省蚌埠市解放北路136号。
法定代表人程战启，系该公司董事长。
委托代理人王康阳，安徽事茂律师事务所律师。
原告王志平与被告安徽绿雨种业股份有限公司委托合同纠纷一案，本院受理后，被告安徽绿雨种业股份有限公司在诉讼期间提起反诉，本院依法适用普通程序公开开庭进行了合并审理，原告（反诉被告）王志平的委托代理人梁顺伟、被告（反诉原告）委托代理人王康阳均到庭参加了诉讼，本案现已审理终结。
原告（反诉被告）王志平诉称：2014年4月10日，原被告签订了一份《玉米杂交种子委托生产合同》，约定由原告为被告在甘肃省临泽县办理玉米种子新安5号基地的落实等工作，并给原告出具了种子生产委托书和被告的种子生产许可证、种子经营许可证。按照合同约定，原告为被告落实制种面积460亩，如果平均亩产低于300公斤，被告按照每亩2350元的保底价向原告结算玉米价款，并另付给原告每公斤代繁费1.50元，代繁费包括原告生产管理费、村社干部服务费、隔离区补偿费、晾晒、脱粒加工费等。种子基地的生产、加工、收购需被告技术人员指导，被告应于2014年11月20前付清90%的种子款及应承担的费用，并提取完毕所有的种子。合同签订后，被告给原告按照每亩400元的标准预付农户前期借款，460亩共计预付借款184000元。原告接受委托后，在临泽县倪家营镇马郡村落实制种面积442.78亩，并安排农户在被告技术人员汪承琢的指导下种植玉米新安5号。秋收后，原告共计收购种子80576.5公斤，在被告联系北京豪赛德生物技术有限公司检测新安5号种子纯度合格后，原告购买包装袋包装种子，将种子全部交付给了被告，但被告至今再未给原告支付过种子款。为解决制种农户玉米款兑付问题，原告筹措资金，兑付了农户的制种款。由于被告未按合同履行付款义务和承担包装费、检测费用，故原告起诉要求：一、被告补偿原告制种款856533元，包衣费1900元，编制袋费用2560元，质量检测费1500元；二、支付原告代繁费120864.75元；三、赔偿原告差旅费19636.50元。
被告（反诉原告）安徽绿雨种业股份有限公司辩称并反诉：原被告签订的《玉米杂交种子委托生产合同》约定，被告委托原告生产杂交玉米新安5号种子，生产面积460亩，每亩单产300公斤，预计产量138000公斤，原告应选择上等肥力、集中连片的耕地耕种，并负责全部制种工作；如因不可抗力因素造成减产，原告应当及时通知被告派人现场考察核定损失；合同还约定了违约责任。合同签订后，被告按照合同约定提供给原告生产所需亲本种子，同时通知原告提供制种农户名单和原告与农户签订的分户制种合同，以便被告办理该基地的种子生产许可证，但直到种子收获后，原告都没有提供相关材料，导致涉案种子生产许可证无法办理，种子也无法销售，只能做报废处理。其次，按照合同约定，在种子调运时，原告应提供植物检疫证，但原告没有办理植物检疫证，而是利用临泽县禾丰种业有限公司的阳光98玉米种子的检疫证运送种子，运送的是阳光98还是新安5号不确定，最终导致该批种子于2015年6月19日被安徽省蚌埠市淮上区农林委员会以涉嫌购进侵权玉米种子为由，将涉案玉米种子进行证据登记保全，并规定在保存期间不得使用、销售、转移、毁损、隐匿。根据法律规定，该批种子将被依法销毁，由于原告因涉嫌严重违法，使得被告签订合同的目的无法实现，该责任应该由原告承担。另外，按照合同约定，若由于自然灾害或者不可抗力，种子亩产低于300公斤，被告同意按照2350元保底价向原告结算，并另付代繁费每公斤1.5元；若平均亩产高于300公斤，按每亩2350元保底价计算种子款，并另付代繁费每公斤1.6元。根据上述约定，只有出现自然灾害或不可抗力的情况下，亩产低于300公斤时，才适用保底价2350元的结算条款，而根据张掖市农委网站农业信息网显示，2014年张掖市没有出现自然灾害或不可抗力情况，制种玉米平均亩产达到430公斤以上，在这种情况下，原告在秋收后只交付种子80576.5公斤，且未达到亩产300公斤，与合同约定的制种亩数460亩，单产300公斤，共计应收入138000公斤的玉米种子的约定不符，故原告要求按照442.78亩，亩保底价2350元计算种子款，无合同依据。综上，原告不按照合同约定履行义务，构成违约，给原告造成了直接经济损失和可得利益损失，请求法庭驳回原告诉讼请求，并提起反诉请求：一、反诉被告王志平返还反诉原告安徽绿雨种业股份有限公司制种预付款18.4万元，并支付违约金36.8万元：二、反诉被告王志平赔偿反诉原告安徽绿雨种业股份有限公司经济损失132.46万元，其中包括直接经济损失12.4万元，可得利益损失120.06万元。
反诉被告（原告）王志平针对反诉原告（被告）安徽绿雨种业股份有限公司的反诉请求辩称：办理种子生产许可证是反诉原告安徽绿雨种业股份有限公司的义务，而且办理种子生产许可证根本不需要制种农户名单和分户合同，反诉原告诉称被相关部门保全登记的种子是否是反诉被告交付的种子，反诉被告不知情。合同虽然约定植物检疫证由反诉被告提供，但办理产地检疫证的前提是反诉原告必须提交亲本种子的植物检疫证，由于反诉原告没有提交亲本种子的植物检疫证，而是提交了48件新安5号的检疫证，导致反诉被告不能办理该批种子的植物检疫证，反诉原告又不配合运输种子，因而反诉被告借用临泽县禾丰种业有限责任公司的阳光98的植物检疫证运送种子，以避免运输过程中被查，原被告也都知道运输的种子不是阳光98，而是新安5号，责任在反诉原告。因此，反诉原告要求反诉被告承担违约金和损失的诉讼请求不能成立。其次，2014年反诉被告接受委托在组织农户制种期间，反诉原告派人现场技术指导，丈量了制种面积并予以签字确认，其生产部的工作人员和技术人员均认可张掖地区阴雨连绵，新安5号锈病严重，致使种子产量低，故本诉原告的诉讼请求成立，应予以支持。
案经审理查明：2014年4月10日，原被告签订了一份《玉米杂交种子委托生产合同》，约定被告安徽绿雨种业股份有限公司委托原告王志平在甘肃省临泽县落实玉米种子新安5号的制种基地，并组织实施该批玉米杂交种子的生产，被告给原告出具了种子生产委托书和被告的种子生产许可证、种子经营许可证。合同约定，原告为被告落实新安5号制种面积460亩，预计单产300公斤，预计总产13800公斤，若由于自然灾害或不可抗力，种子平均亩产低于300公斤，被告同意按每亩2350元的保底价向原告结算玉米价款，并另付给原告每公斤代繁费1.50元；若种子平均亩产高于300公斤，被告同意按每亩2350元保底价向原告结算，并按实际产量另付原告代繁费每公斤1.6元；代繁费包括原告生产管理费、村社干部服务费、隔离区补偿费、晾晒、脱粒加工费等；被告向原告提供制种所需的亲本种子，并运送至原告所在地，运费由被告承担，亲本种子款由原告承担，若播种后，亲本种子有剩余，原告必须在播种结束后30日内按照被告提供的地点退还给被告，并承担相应的运费；被告向原告提供制种技术方案，并在播种、去杂、去雄、收获晾晒、加工等关键性环节派驻技术人员指导；被告必须按期全部收购原告生产的质量合格的种子；原告按照被告的要求包装种子，包装袋及相应的运输费用由被告承担，种子精选加工包装费用由原告承担；被告应按照原告的通知及时验货、提货，被告应于2014年11月20前付清90%的种子款及应承担的费用，并提取完毕所有的种子；原告若未按照被告提供的制种技术方案操作导致经济损失，按照预付款的2倍向被告支付违约金。合同签订后，被告给原告按照每亩400元的标准预付农户前期借款，460亩共计预付借款184000元，并运送给原告价值21600元的亲本种子。原告接受委托后，在临泽县倪家营镇马郡村落实制种面积442.78亩，由被告的技术人员汪承琢签字确认，原告安排农户在被告技术人员汪承琢的指导下种植玉米新安5号。秋收后，原告共计为被告收购、精选种子80576.5公斤，并于2014年10月20日双方委托北京豪赛德生物技术有限公司对新安5号种子纯度予以检测为合格。2014年12月19日，原告王志平作为发货人，借用临泽县禾丰种业有限责任公司的植物检疫证，以临泽县禾丰种业有限责任公司为发货单位，发送的货物名称为玉米种子（阳光98），实际将收获的新安5号玉米种子80576.5公斤装运至被告处，被告接收了玉米种子并按合同约定支付了运费。因被告未结算清种子款，原告自筹资金，按照439.4亩制种面积，以2350元的亩保价，给临泽县倪家营镇马郡村结算了种子款等费用，现原被告因种子款的结算发生争议，诉讼至法院要求处理。
本案争议的焦点是：在委托合同履行过程中，原被告是否存在违约行为，因违约给双方造成的损失额。围绕争议的焦点，原告向法庭提交的证据有：一、被告单位的《法人营业执照》、《农作物种子经营许可证复印件》，《种子生产委托书》和《玉米杂交种子委托生产合同》，以证明2014年被告委托原告在临泽县落实新安5号杂交种子的基地和种植工作，被告应按照每亩2350元的保底价结算种子款，按照每公斤1.5元的价格支付代繁费；经质证，被告对上述证据材料无异议，但认为被告按照2350元结算玉米款的前提是，在亩产不足300公斤的情况下，遇到自然灾害或不可抗力时，才按照2350元的亩保价结算种子款，但2014年张掖市没有发生自然灾害，更没有出现不可抗力情形，在此情况下按照2350元计算玉米价款，没有合同依据。二、面积丈量表，2014年马郡村二社农作物种植面积表、2014年马郡村一社农作物种植面积表、马郡村2014-5亲本发放表，以证明原告为被告落实制种面积为442.78亩，被告的技术人员汪承琢予以签字确认；经质证，被告认为面积丈量表上汪承琢的签字，是汪承琢在原告的要求下补签的，就没有进行实地测量面积，对其他证据因没有被告的签字确认，不认可。三、2014年马郡村与王志平玉米结算单、汇款单据凭证9份、2014年马郡村一社制种玉米款发放表2页、2014年马郡村二社制种玉米款发放表3页，以证明原告王志平与马郡村结算玉米款时，按照439.4亩结算种子款1032590元，已经支付97万元，目前还欠马郡村制种款56036.50元。经质证，被告认为本组证据的发放单系复印件，不能证明原告已经向农户发放了制种款，即使发放了制种款，原告也不能以发放的数额向被告主张结算制种款，应按合同约定履行。四、发货清单、货运配载信息服务中介合同、货运司机驾驶证复印件两份，证明原告向被告发运并交付种子80576.5公斤，经质证，被告无异议，予以确认。五、关于甘肃基地新安5号玉米制种结算的请示报告，以证明原告给被告交付的种子为新安5号，种子总量为80576.5公斤，结算的种子款为103.87万元，经质证，被告认为证据不是原件，不予认可。六、新安5号作业指导书，以证明2014年原告生产的品种为新安5号，技术规程由被告制定、提供；经质证，被告认为该证据系复印件，不能作为证据使用。七、新安5号审定公告，以证明该品种感南方锈病（病级7级），被告在制种前没有在制种技术规程中特别说明；经质证，被告认为该证据材料系从百度上搜索的，不准确。八、甘肃制种工作总结，邮件页面打印件及网页打开、邮件下载打印过程录像，以证明新安5号产量低的原因是低温阴雨天气偏多，光照、积温不足，新安5号母本自交系抗性差，锈病发生严重。经质证，被告认为没有进行公证，不予认可。九、检验报告，以证明被告联系并邮寄繁殖材料由北京豪赛德生物技术有限公司检测，检测结论为新安5号纯度合格，检测费由原告缴纳。经质证，被告认为该检测报告是原告送检的，不是被告送检的，不予认可。十、新疆神州种业有限公司《主要农作物种子生产许可证》，以证明涉案的新安5号已经在新疆办理了生产许可证，被告向原告提供该证时，明确告知原告无需在甘肃重复办理新安5号的生产许可证，可以借用新疆的许可证顺利实现甘肃新安5号的销售。经质证，被告认为，该许可证属实，但并不意味着在甘肃不办理生产许可证，原告的理由不能成立。十一、2014年新安5号收获后果穗照片7张、叶片照片4张，种子样品袋照片2张，以证实新安5号棒子短小，但粒子饱满，叶片照片证明种子生产时发生了严重的锈病，样品袋照片证明原告和被告的技术人员汪承琢共同封存了种子样品，并签字确认；经质证，被告认为果穗照片不能证明是涉案品种，叶片照片不能证明发生了严重的锈病，样品袋照片是原告和汪承琢共同封存的，但不能证明原告向被告交付的种子就是样品。十二、2014年3月11日，被告给原告提交的48件新安5号的植物检疫证，临泽县植保植检站文件，以证实办理产地植物检疫证，需要被告提供新安5号的父本和母本的检疫证，而被告提交了48袋新安5号的检疫证，没有提交新安5号的父母本检疫证，导致原告无法办理新安5号在甘肃临泽的植物检疫证，同时也证明被告在新疆也种植新安5号；经质证，被告认为该检疫证是被告提供给原告的，但根据法律规定，办理检疫证不需要父母本检疫证，只需要产地检疫并出具检疫证即可。十三、原告王志平到被告处索要种子款时的差旅费票据、编制袋票据、检测费票据，以证明原告的差旅费为19636.50元，包衣费1900元，编织袋费用为2560元，质量检测费为1500元；经质证，被告认为，上述费用，根据合同约定不应由被告承担。十四，证人李宏东出庭作证，证实了原告为给被告运送新安5号，因没有新安5号的检疫证，就借用临泽禾丰公司的阳光98检疫证，发送了新安5号；经质证原被告对证人证言均无异议，法庭予以采信。
被告围绕争议的焦点，向法庭提交的证据有：一、《玉米杂交种子委托生产合同》复印件一份，以证明双方约定，预计单产为300公斤，在出现自然灾害或不可抗力的情况下，亩产低于300公斤结算价款的方式，在没有出现自然灾害或不可抗力的情况下，原告应该向被告交纳300公斤以上的种子；其次证明，原告负责提供种子的植物检疫证；而原告在没有自然灾害或不可抗力的情况下，没有按照合同约定交纳13800公斤种子，也不提供植物检疫证，构成违约；经质证，原告认为，该证据属实，但合同约定的是预计，根据实际情况，2014年张掖地区阴雨连绵，种子锈病严重，被告的工作人员是认可的，产量低于300公斤，按照保底价格每亩2350元结算种子款，符合合同约定。二、张掖农业信息网截图，证明2014年张掖市未出现影响玉米种子产量的自然灾害等情形，制种玉米的平均亩产达430公斤左右，原告提交的种子没有达到合同约定的亩产300公斤，构成违约；经质证，原告认为，对该证据的关联性有异议，签订合同时双方只是预计了产量，在临泽土地上，有的种子产量达到1400公斤，有的只有产量16公斤，而本案涉及的种子产量为亩产180公斤，被告的技术人员汪承琢认可的。三、提交证人汪承琢、党云岳、吴子兵的情况说明，以证明制种面积丈量表上汪承琢的签字是事后应原告的要求补签的，原告王志平不提供制种农户花名册和分户合同，导致种子的生产许可证不能办理，2014年该品种的产量在650公斤以上；经质证，原告认为，证人应当出庭作证，证明材料证明的内容不证实，不予认可。四、植物检疫证两份，以证明调运的种子是临泽禾丰公司生产的阳光98，如果不是阳光98，说明原告没有提供植物检疫证，构成根本违约；经质证，原告认为借用临泽禾公司的检疫证的目的是，运送种子时不被查处，没有该品种的植物检疫证，是因为被告没有提供亲本的检疫证，导致原告不能办理该植物检疫证。五、证据登记保存清单，以证明安徽省蚌埠市淮上区农林委员会于2015年6月19日对原告发运的该批种子，以涉嫌购进侵权种子为由，予以证据登记保全，并规定在保存期间不得使用、销售、转移、毁损，导致该批种子不得销售，给被告造成了很大的损失；经质证，原告认为，蚌埠市淮上区农林委员会属于党的机构，不是行政执法部门，无权对任何单位的财产进行查封，原告于2014年12月19日发运给被告的种子是新安5号，是白粒子的，被告也知情，被证据保全的种子不是原告发运给被告的新安5号，不存在侵权问题。六、出库单复印件和运费报销单及发票，证实被告给原告发运了价值21600元的亲本种子，承担了2142元的运费；经质证，原告认为出库单系复印件，且看不清楚，无法确认真实性，根据合同约定，运费应该由被告承担。七、客户回单复印件，证明被告给原告预付184000元种子款，经质证，原告无异议，予以采信。八、被告给原告雇佣的司机支付运费报批凭证复印件，司机驾驶证复印件、中介合同复印件和客户回执复印件，以证实被告支付运费43511元；经质证，原告认为，按照合同约定，运费应是被告承担的，与原告无关。九、种子销售合同复印件三份，以证实新安5号的销售价格，原告未按照合同约定交纳138000公斤种子，给原告造成的损失为120.06万元；经质证，原告认为，根据该三份合同复印件，被告没有提交买受人给被告支付种子款的凭证，合同是否生效不能确定，被告已经收到原告培制的新安5号种子，不存在无法销售的问题。
法庭综合双方当事人提交的证据并审查后认为，原告向法庭提交的第一组、第四组、第十组、第十二组证据，被告对真实性无异议，该四组证据能证明被告单位的经营范围等基本情况以及原被告签订委托生产合同的内容，原告通过中介机构联系司机给被告发运种子的情况及种子的数量，被告给原告提供了新疆神州种业有限公司的《主要农作物种子生产许可证》、48袋新安5号杂交种的植物检疫证；临泽县植保植检站文件证明亲本来源必须提交检疫证明及相关程序要求，对上述证据材料，法庭予以采信。原告提交的第二、三组证据证实的制种面积得到了被告技术人员汪承琢的签字确认，亲本发放情况有农户的签字确认，在发放制种款时，最终以439.4亩和村委会结算种子款，并附有付款凭证和发放表，法庭根据委托合同的特点，以439.4亩确认制种面积，并认定原告已经垫付种子款的事实。原告提交的第五、六、七、八组证据，能够证明被告的技术人员汪承琢对2014年甘肃临泽的制种基地进行总结，证明了在种植过程中严格按照作业标准作业，分析了产量低的原因是持续低温阴雨天气和锈病严重造成的，与第五组证据证明的产量低的原因相互吻合，对上述证据材料，法庭均予以采信。原告提交的第九组证据，证明原告培植的新安5号纯度合格，被告无相反证据反驳，予以采信。原告提交的第十一组证据，证明了原告和被告技术人员汪承琢在2014年10月10日封存了种子样品，在生产过程中玉米锈病严重及种子的外观情况，与上述第五、八组证据证明的锈病严重相互印证，被告虽否认，但无相反证据反驳，法庭对上述证据材料予以采信。原告提交的第十三组证据，证明了向被告索要种子款时产生的费用，其中2014年11月5日至9日，产生交通费893.50元，住宿费176元，误工费以2015年甘肃省颁布的从事农业人员的日平均工资87.53元计算，以原告起诉的5天计算为437.65元，合计1507.15元；2014年12月8日至12月14日，产生交通费911.50元，误工费以原告主张的5天计算为437.65元，合计1349.15元；2015年1月10日至1月27日，2月6日，产生交通费672.50元，住宿费1444元，误工费以原告主张的27天计算为2363.31元，合计4479.81元；2015年3月2日、3月30日、4月5日至6日，产生交通费704元，住宿费3月3日至3月30日产生2406元，4月1日至6日产生住宿528元（6天x88元），误工费以原告主张的34天计算为2976元，合计6614元；以上费用总计13950.11元。编织袋费用以票据计算为2560元，检测费凭票计算为1500元。被告向法庭提交的第一组、四组、七组证据，原告对真实性无异议，且与本案有关联，来源合法，予以采信。被告提交的第二组证据，虽然真实，但只是计算了张掖市范围内制种的平均亩产，不能证明涉案新安5号的亩产，且新安5号在临泽产量低的原因，已经被告的工作人员分析确认，故该证据不能作为认定本案事实的依据。被告提交的第三组证据系证人证言，证人没有出庭作证，不能确定证据的真实性，不予采信。被告提交的第五组证据，不能证明被登记保存的种子就是原告生产的新安5号，且原告将该批种子运送到被告处时，被告接受了种子，支付了运费，在没有证据证明种子质量不合格的情况下，可视为验收合格，不存在购进侵权种子的涉嫌，故该组证据不能作为认定本案事实的依据。被告提交的第六组、第八组证据，因被告确实给原告提供了亲本种子，并运送到原告所在地，原告也收到了亲本种子，并给农户进行发放，根据原告提交的亲本种子发放表证明的情况看，就发放的母本和父本的总量，和该组证据基本吻合；其次，原告指派的司机已将培植的种子交付给了被告，第八组证据能相互证明运费的支付情况，符合该案实际，故对该两组证据予以采信。被告提交的第九组证据，没有其他证据补强印证，不能作为认定被告损失的依据。
本院认为，委托合同是委托人和受托人约定，由受托人处理委托事务的合同，受托人应当按照委托人的指示处理委托事务，受托人完成委托事务的，委托人应当向受托人支付报酬。本案中，原被告签订了《玉米杂交种子委托生产合同》，约定被告委托原告在甘肃临泽发展新安5号的制种基地，并在种植过程中派驻技术人员从播种到加工环节进行指导，由被告支付原告代繁费，制种的整个过程有被告的技术人员参与指导，原告为完成被告的委托事务而付出的劳动，实为原告处理被告委托的事务，与制种回收合同的特征不符，故双方形成委托合同法律关系，应予以保护。从合同的整个履行情况看，原告在落实制种面积，组织农户种植新安5号种子时，由被告的技术人员汪承琢按照技术规程指导农户作业，在受到持续阴雨天气和积温不足、农作物锈病的影响下，收获新安5号种子80576.5公斤，经双方封存种子样品检测种子纯度合格后，交付给被告，在被告无证据证明种子质量存在问题的情况下，可视为合格种子，原告已严格按约履行了受托人的义务，不存在违约行为。被告辩解原告没有提供制种农户名单和与农户的分户合同，导致被告没有办法办理临泽基地的种子生产许可证，使得种子无法销售，做报废处理，原告违约的理由，根据《农作物种子生产经营许可证管理办法》第八条的规定，办理种子生产许可证无需提交制种农户名单和分户合同，被告的该辩解理由不能成立。被告辩解，按照合同约定，应由原告提供产地《植物检疫证》，因原告没有提供检疫证，导致被告购进了侵权种子，该批种子被相关部门查处，原告存在严重违法行为，根本违约；根据《植物检疫条例》的规定，省间调运种子，被告需配合提供检疫要求和亲本种子的检疫证等相关材料，才能在调出单位所在地办理产地植物检疫证，在被告不配合原告办理检疫证的情况下，原告借用其他单位其他种子的检疫证发运涉案种子至被告处，被告接受并保管了种子，并未改变种子的性质，原告不存在违约行为。被告辩解，原告没有按照合同约定交付138000公斤种子，存在违约行为；根据庭审查明的情况，造成种子产量低的原因系长期阴雨天气和在制种过程中出现农作物锈病，实属自然灾害所致；其次，原告提交的证据和被告技术人员及生产部均证实，仅收获了种子80576.5公斤，被告无证据证实原告交付的种子数量与实际生产的种子数量不相符，因而不能认定原告有私藏或私售等情形；故被告的辩解理由不能成立。由于双方在合同中没有约定按照交付种子的数量来结算种子款，也没有约定在不存在自然灾害或不可抗力的情况下，亩产低于300公斤的结算方式，按照合同约定，种子平均亩产高于300公斤，按照2350元亩保价结算，则按照权利义务对等原则，在被告技术人员指导种植下，平均亩产低于300公斤的情况下，也应按2350元结算种子款，可体现公平原则，且由于自然灾害造成的产量减产，涉案种子款按照亩产2350元的保底价结算，符合合同约定。合同约定亲本种子的运费由被告承担，亲本种子款由原告承担，剩余的亲本种子，原告必须在播种结束后30日内退还被告，并承担运费，制种收获后，包装袋及相应的运费由被告承担，种子精选加工包装费由原告承担；依此约定，被告应承担原告包装种子的编制袋费用、检测费用及运费，并按照合同约定支付原告代繁费；原告应承担亲本种子款、包衣费。《中华人民共和国合同法》第三百九十八条之规定“委托人应当预付处理委托事务的费用，受托人为处理委托事务垫付的必要费用，委托人应当偿还该费用及其利息”，第四百零五条规定“受托人完成委托事务，委托人应当向其支付报酬”，本案中，被告违反合同约定，没有按期支付原告种子款，导致原告垫资支付农户的制种款，已构成违约，应承担继续履行和赔偿损失的违约责任，并承担原告实现合同之债的必要费用。由于原告王志平在履行合同过程中，不存在违约行为，不应承担支付违约金和赔偿损失的违约责任，故被告的反诉请求，本院不予支持。
综上，法庭对涉案的证据进行了分析认定，对合同当事人的违约行为及造成的损失进行认定，对责任的承担予以划分，案经合议庭评议，根据《中华人民共和国合同法》第三百九十八条、第四百零五条，《中华人民共和国民事诉讼法》第六十四条之规定，判决如下：
一、被告安徽绿雨种业股份有限公司支付原告王志平制种款1032590元（439.4亩×2350元），扣除被告已预付的184000元，亲本种子款21600元外，再支付826990元；
二、被告安徽绿雨种业股份有限公司支付原告王志平代繁费120864.75元，赔偿编织袋费用2560元，质量检测费1500元，差旅费13950.11元，合计138874.86元；
三、驳回反诉原告（被告）安徽绿雨种业股份有限公司的诉讼请求。
上述一、二项合计965864.86元，限被告安徽绿雨种业股份有限公司在判决生效10日内付清。
案件受理费13827元，由原告王志平承担1000元，被告安徽绿雨种业股份有限公司承担12827元，案件保全费4920元，由被告安徽绿雨种业股份有限公司承担；反诉案件受理费21689元，由反诉原告（被告）安徽绿雨种业股份有限公司承担。
如不服本判决，可在判决书送达之日起十五日内，向本院递交上诉状，并按对方当事人的人数提交副本，上诉于甘肃省张掖市中级人民法院。
审 判 长 熊生平
审 判 员 李英楠
人民陪审员 曹天武
二〇一五年七月二十日
书 记 员 曹冬兰
附法律条文：
《中华人民共和国合同法》
第三百九十八条委托人应当预付处理委托事务的费用。受托人为处理委托事务垫付的必要费用，委托人应当偿还该费用及其利息。
第四百零五条受托人完成委托事务的，委托人应当向其支付报酬。因不可归责于受托人的事由，委托合同解除或者委托事务不能完成的，委托人应当向受托人支付相应的报酬。当事人另有约定的，按照其约定。
《中华人民共和国民事诉讼法》
第六十四条当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。
当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。
人民法院应当按照法定程序，全面地、客观地审查核实证据。