江苏省南通经济技术开发区人民法院
民 事 判 决 书
（2016）苏0691民初922号
原告：南通某集团股份有限公司。
法定代表人：张某，该公司董事长。
委托诉讼代理人：李军、孙超，江苏普泰律师事务所律师。
被告某（南通）纺织科技有限公司。
法定代表人：洪某，该公司董事长。
委托诉讼代理人：张亚周，江苏通南律师事务所律师。
原告南通某集团股份有限公司诉被告某（南通）纺织科技有限公司建设工程施工合同纠纷一案，本院于2016年5月18日立案受理后，适用简易程序进行了审理，后转为普通程序，组成合议庭公开开庭进行了审理。原、被告的委托诉讼代理人到庭参加了诉讼。本案现已审理终结。
原告向本院提出诉讼请求：判决被告支付原告工程款3840822.24元并承担逾期付款利息（审理过程中，原告将逾期付款利息损失起算点变更为2016年8月11日）。事实和理由：原、被告于2012年5月18日签订总包工程施工合同，由原告承包被告位于南通开发区厂区内的建设工程施工，合同总价4500万元，并就施工内容、工程款支付等作出约定。原告完工后，双方于2013年6月进行了验收和结算。验收合格后，被告接受了该工程并进行使用。原、被告结算确认增加部分工程款为180万元，总结算价为4680万元。被告尚欠工程款409万元，扣除水电费249177.76元，被告还需向原告支付3840822.24元。
被告辩称，原告延期交付，应承担违约责任，请求在工程款中抵扣；原告承接的工程有质量问题，未履行修复义务，保留追究原告赔偿责任，维修费用在质保金中扣除；被告按约定付款，未有逾期违约行为；原告未履行合同约定的开票义务。
本院经审理认定事实如下：2012年5月18日，原、被告签订建设工程施工合同，由原告承包被告“某（南通）纺织科技有限公司总包工程”。合同约定工期为8个月，总价4500万元。如不能按工期完成施工进度，每逾期一天，承包人向发包人交付总价万分之三点五延期罚款，上限不超过总价的2%。工程款支付：预付款100万元；每月按当月核定的实际完成的合同工程款的70%拨付；工程完工后付至总价款的85%，竣工验收合格后付至工程总价的90%，工程报备并结算经双方确认后在30日内付至工程结算总价的93%，承包人配合发包人取得产权证后付至95%，余下5%作为保修金，一年后付清；承包人须在发包人指定的税务局交纳工程在当地须交纳的税金并向发包人开具、提供相应的发票及相关资料后，发包人履行付款义务。由于承包人未能及时开具并提供发票而导致发包人付款延迟，发包人不承担责任。竣工验收与结算：初验合格后，发包人组织由设计单位、监理人、承包人共同参加竣工验收，单位工程综合竣工验收日期即为工程实际竣工日期。承包人及时向城市档案馆办理工程资料验收和移交，属于发包人应提供的资料由发包人负责及时提供给承包人，由承包人汇总整理后移交档案馆……质量保修期：从工程实际竣工之日算起。分单项竣工验收的工程，按单项工程分别计算质量保修期。土建工程为1年，水电消防安装工程为1年，钢结构系统工程为1年。质量保修责任：属于保修范围和内容的项目，承包人应在接到修理通知之日后7天内派人修理。承包人不在约定期限内派人修理，发包人可委托其他人员修理，保修费用从质量保修金内扣除。质量保修金为施工合同价款的5%，保修期一年满后一次性付清。此后，原、被告签订委托支付农民工保证金协议书，约定被告在办理施工许可证前须向开发区安监站缴纳合同总额2%农民工工资保证金，被告将农民工工资保证金90万元先支付给原告，委托原告代为缴纳，该发票直接开给原告，最后退给原告，在最终工程结算时冲抵原告质量保证金。2012年8月15日，原告代被告向南通市经济技术开发区管理委员会缴纳了上述农民工工资保障金90万元。原告施工完毕后，被告组织设计单位、监理单位、勘察单位及原告共同参加竣工验收，于2013年6月20日出具竣工验收证明书，验收意见为工程质量评定合格。2014年5月，原、被告签署工程结算确认单，最终总结算价为4680万元（不含由原告代被告采购材料款527000元），工程施工水电费按实结算。2014年7月3日，南通市公安消防支队向被告出具建设工程消防验收意见书，综合评定该工程消防验收合格。2012年5月24日至2016年2月3日，被告共计付款44137000元（含上述被告先行支付给原告，最终冲抵质量保证金的农民工工资保障金90万元）。2016年3月4日，经南通市崇川公证处公证，原告向被告发出律师函，内容为原告于2015年8月6日向被告发函，要求被告及时支付到期工程款并在接函7日内将工程报备资料向档案馆申报或交付原告，由原告统一移交。因被告未付款并移交工程资料，认为被告以实际行动表示不再要求原告配合办理产权证，故向被告主张未付工程款319万元、返还垫付农民工工资保障金90万元，合计409万元。
另查明，原告施工过程中发生水电费249177.76元，被告予以确认。2016年8月10日，原告向被告开具2663000元的工程款发票，至此全部4680万元的工程款发票开具完毕。被告为证明其实际使用案涉工程的时间，向本院提交了两份水费清单，户号849943为建设过程中的临时用水户，显示水费发生至2013年8月1日止；户号866024为正常用水户，显示水费自2014年10月1日开始发生。
审理过程中，本院组织原、被告至南通经济技术开发区建设局进行工程竣工验收备案，因被告缺少环保部门出具的认可文件或准许使用文件等致目前无法通过审核。
本院认为，原、被告签订的建设工程施工合同系当事人真实的意思表示，不违反法律规定，合法有效。本案主要的争议焦点为原告主张尚余工程款的付款条件是否成就及被告主张质量问题的抗辩理由是否成立。被告付款44137000元，扣除原告代被告采购材料款527000元，43610000元达到总结算价46800000元的93.18%，原告主张的工程款包括合同约定的承包人配合发包人取得产权证后付至95%及剩余保修金5%。就产权证问题，办理产权证的前提是建设工程审核通过竣工验收备案，经本院组织，原告提供了竣工资料，现因被告的原因导致无法通过审核，本院认定原告已履行了配合义务，且虽然案涉建设工程未领取产权证，被告已实际使用，故被告不得以未取得产权证拒付款项，应当将工程款支付至95%。就保修金问题，根据建设工程施工合同及工程质量保修书约定，保修金在质量保修期一年满后付清。质量保修期从2013年6月20日工程实际竣工之日算起，即被告组织设计单位、监理单位、勘察单位及原告共同参加竣工验收评定工程质量合格时。对于被告抗辩的工程存在质量问题，其提供的均为自行制作的材料，未得到原告的签字确认，且形成于质量保修期一年即2014年6月20日之后，故本院对被告的该抗辩理由不予采信，本案建设工程经竣工验收评定质量合格，质量保修期届满，被告应当支付剩余5%的保修金。对于原告代被告支付农民工工资保障金90万元的问题，该保障金的缴纳义务主体系被告，原、被告订立协议约定由原告代为支付，最终退给原告冲抵质量保证金未尝不可，但现因被告的原因导致不能通过竣工验收备案审核，该保障金目前无法退还，待条件成就后相关部门亦会将上述款项返还给被告，再将该风险由原告承担有失公平，故原告主张由被告返还垫付的农民工工资保障金90万元本院予以支持。在被告支付该款后，已缴纳农民工工资保障金90万元的权利归属被告。综上，原告已向被告开具了全部工程款发票，扣除水电费后，被告应当给付原告剩余工程款3840822.24元[46800000-（44137000-527000-900000）-249177.76]。对于逾期付款利息损失，合同约定由于承包人未能及时开具并提供发票而导致发包人付款延迟，发包人不承担责任。虽然2014年6月20日已满质量保修期一年，但原告至2016年8月10日才向被告开具了全部工程款发票，故原告变更诉讼请求后，要求自2016年8月11日起计算逾期付款利息损失，本院予以支持。至于被告主张原告延期交付工程，不能作为拒付工程款的抗辩理由，如原告存在违约行为，被告可另行主张原告承担违约责任。
依照《中华人民共和国合同法》第六十条、最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第十七条之规定，判决如下：
被告某（南通）纺织科技有限公司于本判决发生法律效力之日起十日内给付原告南通某集团股份有限公司工程款3840822.24元，并自2016年8月11日起按中国人民银行同期贷款利率给付原告南通某集团股份有限公司逾期付款利息至实际给付之日止。
如果未按本判决指定的期间履行给付金钱义务，应当依照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条之规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。
案件受理费40350元，由原告负担5350元，被告负担35000元（诉讼费用原告已预交，待执行时由被告一并给付原告）。
如不服本判决，可在本判决书送达之日起十五日内向本院递交上诉状，并按对方当事人的人数提交副本，上诉于江苏省南通市中级人民法院，同时向该院预交上诉案件受理费40350元（户名：南通市财政局，开户行：中国银行南通市西被闸支行，账号：47×××82）。
审 判 员 张邢霖
人民陪审员 周袁芳
人民陪审员 刘 梅
二〇一六年十二月二十六日
书 记 员 唐贞贞