安徽省淮南市田家庵区人民法院
民 事 判 决 书
（2016）皖0403民初7007号
原告（反诉被告）：淮南华中置业有限公司，住所地安徽省淮南市田家庵区洞山西路98号，统一社会信用代码913404006808180839。
法定代表人：王世清，该公司执行董事兼总经理。
委托诉讼代理人：吴雷，该公司法律顾问。
被告（反诉原告）：安徽凯源建设集团有限责任公司，住所地合肥市包河区大连路徽商总部广场C座16层1607室，统一社会信用代码91340100705054519Q。
法定代表人：杨邦凯，该公司执行董事兼总经理。
委托诉讼代理人：胡茂平，安徽承义律师事务所律师。
委托诉讼代理人：沈阳，安徽承义律师事务所律师。
原告（反诉被告）淮南华中置业有限公司（以下简称华中公司）与被告（反诉原告）安徽凯源建设集团有限责任公司（以下简称凯源公司）建设工程施工合同纠纷一案，本院于2016年11月3日立案后，依法组成合议庭，公开开庭进行了审理，双方当事人的委托诉讼代理人均到庭参加诉讼。本案现已审理终结。
华中公司向本院提出诉讼请求：1.判令凯源公司偿付延期竣工违约金及造成的华中公司损失179.86万元；2.判令凯源公司赔偿因工程质量造成的华中公司损失1149.8219万元；3.凯源公司承担本案全部诉讼费用。华中公司于2017年1月9日变更诉讼请求为：1.判令凯源公司偿付延期竣工违约金及造成的华中公司损失933000元（其中违约金864000元、迟延交房损失69000元）；2.判令凯源公司赔偿因工程质量造成的华中公司损失4169857元；3.凯源公司承担本案全部诉讼费用。事实与理由：2010年1月15日，华中公司与凯源公司签订一份协议书；2010年5月17日，双方又签订一份《建设工程施工合同》。上述协议书、合同约定华中公司将其开发的泉山十字路口鸿山家园小区1-14号楼及地下室工程（以下总成A区工程）发包给凯源公司施工，工期22个月（开工时间应为2010年6月2日）。凯源公司在承包施工期间，由于资金、管理、技术等多方面原因，造成A区工程直至2013年6月9日才竣工验收，实际延误工期432天。按协议书第二条规定，以每天2000元计算延期竣工违约金并承担华中公司延期交房的经济损失。因凯源公司施工的工程质量存在严重问题，A区工程外墙多处开裂、脱落、室内装潢变形、地下室顶、地下室墙面、地面多处渗水、防火门变形等。现华中公司诉至法院，请求判如所诉。
凯源公司辩称，一、华中公司主张工期延误违约金及损失933000元依法不能成立。1.华中公司主张工期延误违约金已超过诉讼时效。民法通则第一百三十七条规定：“诉讼时效期间自知道或应当知道权利被侵害时起计算。”案涉工程系2013年6月9日竣工验收合格，此时，实际施工工期已经确定。华中公司如果认为，案涉工程逾期完工，责任在凯源公司，则华中公司自该工程竣工验收合格之日即2013年6月9日应当知道自己权利被侵害，根据法律规定，诉讼时效期间应当从此时开始计算，按两年诉讼时效计算，应至2015年6月9日到期。但截止目前，华中公司未提交任何证据能够证明在2013年6月9日至2015年6月9日期间向凯源公司主张过工期延误的违约责任。因此，诉讼时效未有任何中断情形，华中公司在2015年6月9日以后向凯源公司主张工期延误违约责任，显然超出法律规定的诉讼时效。2.案涉工程工期应依法顺延，顺延后，凯源公司没有延误工期。首先，华中公司没有履行法定和约定义务，迟延办理案涉工程施工许可证，工期应当顺延。《中华人民共和国建筑法》第七条规定：“建筑工程开工前，建设单位应当按照国家有关规定向工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门申请领取施工许可证”。《建筑工程施工许可管理办法》第三条也规定：“本办法规定应当申请领取施工许可证的建筑工程未取得施工许可证的，一律不得开工。”双方签订的《建设工程施工合同》通用条款第8.1条约定，发包人有总计9项应完成的义务，其中第（5）项义务就是办理施工许可证及其他施工所需证件。而该合同通用条款8.3条约定：“如发包人未能履行8.1款各项义务，导致工期延误或给承包人造成损失的，发包人赔偿承包人有关损失，顺延延误的工期。”根据上述法律规定和合同约定，办理施工许可证既是华中公司的法定职责，也是华中公司的合同义务。而本案中，华中公司直到2011年4月26日才办妥施工许可证。所以，华中公司在未取得施工许可证的情况下指令违法开工，既是违法行为，也是违约行为。对此，华中公司应承担全部责任。而由于华中公司未取得施工许可证，凯源公司为规避建设主管部门的检查，也无法组织正常施工，从而严重影响施工进度。因此，据以上述事实，本案案涉工程的施工工期应自办理施工许可证之日即2011年4月26日起算，至2013年6月9日竣工验收合格之日，工期共775天，比约定工期630天延期145天，而不并是华中公司陈述的432天。其次，华中公司未按约定支付工程进度款，依法应当顺延工期。根据《建设工程施工合同》专用条款第26条的约定：“单体主体结构至一层结束后，从第二层主体结构开始，每月按甲方核实后的形象进度的80%支付当月的工程进度款，以此类推，工程验收合格后支付至工程总价的85%，决算审计确认后支付工程总价的95%，留5%作为维修保证金，自验收合格起两年期满一次付清。”本工程决算总价为60927730元，而根据上述合同约定，竣工验收合格后应付至总造价的85%，即应付款为60927730×85%=51788570.50元，而华中公司实际付款45827595.36元，仅支付到75%，并未达到85%。所以，华中公司未按约定支付工程款，也是导致凯源公司不能如期完工的重要原因，依法也应当顺延工期。工期应顺延至进度款付清之日止。按此计算，工期应顺延至2015年2月。再次，案涉工程量的增加，依法也应当顺延工期。案涉工程是按固定费率中标的，故中标时，只有中标的费率，没有中标的价款。而根据华中公司办理的施工许可证可知，华中公司根据中标费率预算的合同价款为4888万元，而本案工程结束后，双方决算工程价款为60927730元，比原合同价款高出12047730元。众所周知，合同价款与工程量、工期的确定紧密相关。原确定的合同工期630天系建立在合同价款4888万元的基础之上，而如今决算价款比合同价款高出一千二百多万元，因此，增加的工程量应当顺延工期。顺延工期=增加工程量12047730÷（合同价款48880000÷约定的工期630）=155天，即案涉工程，因工程量增加应当顺延工期155天。最后，因华中公司原因和其他客观原因，造成了凯源公司阶段性停工，工期应当顺延。2011年6月21日，因华中公司需挖沟埋设下水管道，造成1-2号楼的结构施工暂停7天。另外，高考期间，政府规定施工单位禁止施工等，属于不可抗力，也应当顺延工期。综上，上述事实表明，工期依法顺延后，凯源公司并未延误工期，华中公司主张凯源公司工期延误违约责任依法不能成立。3.华中公司主张凯源公司赔偿逾期交房损失于法无据。根据仲裁查明的事实，华中公司与购房者签订商品房买卖合同时约定的交房时间为2013年6月30日，而涉案工程是2013年6月9日竣工验收合格的，也即在华中公司交房前，凯源公司施工工程已经竣工验收合格，具备凯源公司向华中公司交付工程的条件且实际已交付。因华中公司向购房者交房，除具备工程竣工验收合格条件外，还要求环保、规划、消防等专业验收合格并办理备案，而该部分专业验收的工作不是凯源公司的义务范围，而案涉工程专业验收和备案时间为2013年8月13日。因此，案涉工程专业验收和备案的延迟而导致华中公司向购房者迟延交房的违约责任与凯源公司无关，凯源公司依法不应承担赔偿责任。
二、华中公司主张凯源公司赔偿因工程质量造成损失4169857元没有事实及法律依据。案涉工程于2013年6月9日竣工验收合格并交付华中公司。工程交付后，保修期内存在凯源公司保修范围内的质量问题，凯源公司也一直履行保修义务。现华中公司提出仍然存在部分质量问题，凯源公司认为，有无质量问题、质量问题的具体部位均需双方共同核查、确认。核查后，如存在的质量问题确属凯源公司保修范围，凯源公司无条件履行保修义务。但本案中，华中公司在既没有自己维修，也没有委托他人维修而产生维修费用的情况下，径行向凯源公司主张赔偿损失显然没有事实及法律依据，请人民法院依法不予支持。综上所述，凯源公司认为，华中公司各项诉请均无事实及法律依据，请人民法院在查清事实基础上，依法驳回华中公司的诉请，并判决由华中公司全额承担本案诉讼费用。
凯源公司向本院提出反诉请求：1.请求依法判令华中公司立即向凯源公司支付工程款6100134.64元、违约金4348208元(违约金暂计算至2017年2月15日，后续违约金按日万分之五计算款项实际付清之日止)，合计10448342.64元；2.本案反诉费用由华中公司负担。事实与理由：2010年1月15日，凯源公司与华中公司(原名称淮南化三建置业有限公司，2011年6月24日更名为淮南华中置业有限公司)签订协议书一份。协议约定华中公司将位于淮南市泉山路口鸿业家园住宅小区A区1#-4#楼土建安装、装饰工程发包给凯源公司施工。协议书同时对工程承包范围、定额执行、取费标准、材料价格及凯源公司分包工程、工程款支付、违约责任等进行了约定。2010年5月17日，双方签订正式《建设工程施工合同》并办理了合同备案。合同约定被反诉人将位子淮南市泉山十字路口鸿业家园1#-4#楼及地下室工程发包给反诉人施工。承包范围为施工图纸以内的土建、水电施工安装等所有涉及内容，合同价款为固定费率。合同同时对工程款支付及保修金返还等进行了约定。上述协议及合同签订后，凯源公司精心组织，规范施工，并按约完成了合同约定的施工任务。2013年6月9日，案涉工程竣工验收合格。工程竣工验收合格后，凯源公司向华中公司报送了案涉工程竣工结算资料，但华中公司在接受材料后迟迟未能予以确认。2015年12月31日，经安徽启创工程咨询有限公司审定并经双方确认案涉工程总造价为60927730元。截止目前，华中公司仅仅支付凯源公司工程款54827595.36元，下欠工程款61000134.64元。根据双方约定，华中公司应在工程竣工验收合格后15日内付至工程总造价的85%，决算审计确认后15日内付款至工程总造价的95%，尾款5%质保期满后付清。延期付款按应付款项日万分之五计算违约金。
华中公司辩称，一、案涉工程的质保期未满，凯源公司主张返还包括质保金在内的全部剩余工程款没有事实和法律依据。根据建设工程施工合同《房屋建筑工程质量保修书》中的明确约定，案涉工程的屋面防水工程等质量保修期为5年，案涉工程自2013年6月9日竣工验收至今尚未满5年，凯源公司要求支付质量保证金没有事实依据。因此，本案总工程总价款60927730元中，应扣除5%的质量保证金3046386.5元【60927730元*5%=3046386.5元】。二、华中公司已经按建设工程施工合同约定足额支付了到期应付的全部工程款，并无拖欠工程进度款的情形，凯源公司要求支付工程款6100134.64元、违约金4348208元完全没有事实依据。截止到2016年2月，华中公司已经支付工程进度款57836574.36元，与约定应付的工程进度款57881343.5【60927730元*95%】持平，再扣除施工期间必要的费用外，并不存在拖欠工程进度款的情形。凯源公司要求支付工程款6100134.64元、违约金4348208元的诉讼请求完全没有事实和法律依据。综上，凯源公司的反诉请求没有事实和法律依据，请求人民法院依法驳回反诉。
当事人围绕诉讼请求依法提交了证据，本院组织当事人进行了证据交换和质证。对当事人无异议的证据，本院予以确认并在卷佐证。对于有争议的证据和事实，本院认定如下：1.华中公司提交的《建设工程施工合同》、A区工程《协议书》、开工申请及通知单、开工令、《工程竣工验收报告》，凯源公司对该组证据的真实性均未提出异议，本院经审查对该组证据的真实性均予以认定，对其证明观点应结合其他证据予以综合认定。2.华中公司提交的工程维修问题的联系函五份（邮寄回执）、公证书一份、工程现场需要维修的问题照片五十五张，凯源公司对对五份联系函真实性、合法性、关联性均有异议，称其没有收到华中公司提供的五份函件，本院经核实对该五份函件的真实性予以认定，无法判断凯源公司是否收到该函件；凯源公司对公证书的真实性无异议，本院对其真实性予以认定；凯源公司对华中公司提交的照片真实性、合法性、关联性均有异议，认为工程是否存在质量问题应经由双方进行核查确认，本院经审查对照片内容真实性予以确认，案涉工程是否存在质量问题应结合其他证据综合予以认定。3.华中公司提交的《房屋维修工程施工合同》、建筑安装工程（结）算表、转账流水打印件三份、维修费用汇总表打印件一份，维修费用收据六十二份，针对华中公司的提交的该组证据，因《房屋维修工程施工合同》、建筑安装工程（结）算表、转账流水、维修费用汇总表等证据能够相互印证，因经审查对该证据的真实性及证明观点依法予以确认。4.华中公司提交的A区外墙新统计维修表、业主申报维修部位的现场核实照片打印件41张，凯源公司对该份证据持有异议，认为是否存在质量问题及责任问题需要现场核查，本院经审查认为该份证据能否证实案涉房屋确系存在质量问题，本院对该份证据的真实性依法予以确认。5.华中公司提交的淮南仲裁委员会裁决书四份、决定书六分、收据七份，凯源公司对该证据的真实性无异议，本院经审查对该证据的真实性依法予以确认。6.凯源公司提交的建设工程规划许可证及工程通知单，因华中公司对该证据的真实性无异议，本院经审查对该证据的真实性与依法予以确认，并认定案涉工程规划许可证于2010年6月21日取得。7.凯源公司提交的建筑工程施工许可证，因华中公司对该证据的真实性无异议，本院经审查对该证据的真实性与依法予以确认，并认定案涉工程施工许可证于2011年4月26日取得。8.凯源公司提交的淮南市建设（建筑）工程质量监督登记表，因华中公司对该证据的真实性无异议，本院经审查对该证据的真实性与依法予以确认。9.凯源公司提交的工程联系单2份，因华中公司对该证据的真实性无异议，本院经审查对该证据的真实性与依法予以确认，并认定案涉工程经双方协商一致工程施工暂停7日。10.凯源公司提交的工程造价咨询定案表，因华中公司对该证据的真实性无异议，本院经审查对该证据的真实性与依法予以确认，并认定案涉工程最终审定总造价60927730元。11凯源公司提交的付款明细表，华中公司未对该证据的真实性提出异议，认为时间、金额基本一致，但明细表是不完整的，本院你经审查对该证据的真实性依法予以确认。12凯源公司提交的维修记录单16份，华中公司未对该证据的真实性提出异议，认为质量存在问题是客观事实，本院经审查对该证据的真实性予以确认。13.凯源公司提交收条10份，华中公司认为真实性待核实，但可以作为参考，本院经审查对该证据的真实性予以确认。14.华中公司提交的中国招商银行业务回单、收据，本院经审查对该证据依法予以确认，并认定华中公司于2015年8月17日向凯源公司淮南分公司转账支付案涉工程款300万元，凯源公司淮南分公司向华中公司出具了收据。
根据当事人陈述和经审查确认的证据，本院认定如下：2010年元月15日，发包方淮南化三建置业有限公司（甲方）与承包方凯源公司（乙方）签订《协议书》，双方约定：一、工程名称鸿业家园住宅小区A区1#～4#楼，工程地址淮南市泉山，工程内容施工图纸范围内的土建、安装、装饰。二、总工期为二十一个月，不含业主分包工程工期，实际开工时间以开工令为准，工期要求按期完工，如推迟一天工期，发包方每日扣罚承包方2000元人民币，作为工期延误的处罚，且承担因工期延误造成甲方不能按期交房的连带责任；如因甲方的原因造成工期延误的，工期相应顺延。三、承包方式包工包料。四、履约保证金贰佰万元分两次返还，一层结构齐返还70%，主体结构封顶返还30%。五、乙方自愿将工程按总承包的方式将其主体垫资到结构一层齐，各栋主体结构十八层封顶后付本栋一层以下已完工程量的80%工程款；主体结构至一层结束后，从第二层主体结构开始，每月按甲方核实后的形象进度的80%支付当月的工程进度款，以此类推；工程竣工验收合格后15日内付至工程总造价的85%，决算审计确认后15日内付至工程总造价的95%，尾款5%质保期满后付清。六、甲方如不能按协议约定及时支付工程款，超过15日后，每延误一日，甲方按当月应付进度款的万分之五支付滞纳金。2010年5月17日，双方就案涉工程签订《建设工程施工合同》，该合同包含协议书部分、通用条款部分、专用条款部分及房屋建筑工程质量保修书部分，双方均作出具体约定。双方在协议书部分约定开工日期2010年2月，竣工日期2011年11月，合同工期总日历天数630天。双方在专用条款约定单体主体结构至一层结束后，从第二层主体结构开始，每月按甲方核实后的形象进度的80%支付当月的工程进度款，以此类推；工程竣工验收合格后15日内付至工程总造价的85%，决算审计确认后15日内付至工程总造价的95%，留5%作为维修保证金，自验收合格起两年期满一次性付清。双方在房屋建筑工程质量保修书部分约定：地基基础工程和主体结构工程为设计文件规定的该工程合理使用年限；屋面防水工程、有防水要求的卫生间、房间和外墙的防渗漏保修期为5年……关于工程保修金返还，双方另约定：本工程质量保修金为合同价款的5%，发包人在质量保修期满，经核查无异议后15天内将剩余保修金无息返还承包人。上述合同签订后，凯源公司于2010年6月2日提交开工申请及通知单，监理单位于同日经审查后签发开工令，案涉工程于2010年6月21日取得规划许可证，于2011年4月26日取得施工许可证。工程施工过程中，双方于2011年6月22日协商一致工程施工暂停7日。2013年6月9日案涉工程竣工验收。2015年12月31日，案涉工程经安徽启创工程咨询有限公司审核，案涉工程定审金额为60927730元。因案涉房屋存在质量问题，甲方华中公司与乙方淮南市技超幕墙钢构工程有限公司（有限简称技超公司）签订《房屋维修工程施工合同》，双方约定由乙方维修鸿业家园住宅小区A区部分住宅楼屋面、外墙体漏雨及室内外墙面、棚面发霉维修等工程，共计产生维修费用398400元。因华中公司于2013年9月25日取得楼房大房产证，导致华中公司延迟交付房屋，并赔偿部分业主迟延交房损失61369元。
另查明，华中公司（或淮南化三建置业有限公司）共计向凯源公司支付工程款明细如下：2011年1月28日付款50万元；2011年4月1日付款200万元；2011年4月22日付款684350元；2011年5月19日付款672059.4元；2011年6月13日付款100万元；2011年6月28日付款100万元；2011年7月11日付款100万元；2011年7月22日付款100万元；2011年8月4日付款981989.36元；2011年8月19日付款200万元；2011年9月1日付款753273.4元；2011年9月8日付款80万元；2011年9月21日付款210010元；2011年9月21日付款289990元；2011年9月28日付款20万元；2011年9月30日付款30万元；2011年10月18日付款4611139元；2011年11月3日付款100万元；2011年11月18日付款531103.6元；2011年11月22日付款824000元；2011年10月10日付款100万元；2011年12月8日付款50万元；2011年12月20日付款30万元；2012年1月13日付款300万元；2012年1月17日付款200万元；2012年2月17日50万元；2012年3月2日付款50万元；2012年3月8日付款1939281元；2012年3月30日付款237000元；2012年3月30日付款19万元；2012年5月8日付款585185.6元；2012年5月11日付款399380元；2012年5月14日付款581000元；2012年6月14日付款1239366元；2012年7月16日付款15万元；2012年7月18日付款50万元；2012年7月20日付款69300元；2012年8月15日付款691200元；2012年9月3日付款15万元；2012年9月6日付款410610元；2012年9月21日付款855200元；2012年9月28日付款20万元；2012年10月23日付款20万元；2012年10月29日付款1439000元；2012年11月13日付款1302261元；2012年12月7日付款328000元；2013年1月6日付款832913元；2013年2月1日付款510313元；2013年2月6日付款2565913元；2013年2月6日付款30万元；2013年3月6日付款766500元；2013年3月28日付款50万元；2013年4月26日付款727258元；2014年1月27日付款300万元；2014年9月5日付款100万元；2015年2月9日付款20万元；2015年2月12日付款200万元；2015年2月15日付款80万元；2015年8月17日付款3000000元；2016年2月1日付款200万元。上述款项合计为5782595.36元。
再查明，淮南化三建置业有限公司系淮南华中置业有限公司历史名称。
本院认为，发包人华中公司与承包人凯源公司签订的相关协议均系双方真实意思表示，且不违反法律强制性规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。
关于本案本诉部分，本院评判如下：
针对华中公司第一项诉讼请求，本院认为：根据双方约定，案涉工程工期为630日历天，案涉工程于2010年6月2日开工，于2011年6月22日暂停施工7日，于2013年6月9日竣工验收，历时1096日历天，凯源公司逾期达466日历天。根据双方于2010年1月15日签订的《协议书》约定，凯源公司每推迟一天工期，发包方每日扣罚承包方2000元，凯源公司应当按照约定支付华中公司相应的违约金。凯源公司于2013年6月9日将案涉房屋华中公司，导致华中公司延期向购房者交付房屋，凯源公司应按照双方约定赔偿华中公司相应损失。华中公司要求凯源公司承担违约金864000元及迟延交房损失69000元，于法有据，本院依法予以支持。凯源公司对该项诉讼请求的辩解，本院评判如下：关于诉讼时效问题，案涉工程于2015年12月31日经专业审计定审金额为60927730元，华中公司于2016年11月3日向本院提起诉讼并未超过诉讼时效。关于施工许可证问题，施工许可证作为行政机关颁发的准予建筑工程开工的文件，是行政管理性规定，华中公司在未取得施工许可证的前提的下与凯源公司达成有关施工的约定并不违反法律强制性规定，华中公司与凯源公司均有义务按照约定履行各自义务。关于增加工程量的问题，凯源公司提出合同价款48880000元，经审计价款为60927730元，应当增加相应的工期；根据双方约定，工程内容施工图纸范围内的土建、安装、装饰，合同价款按中标费率计算，经审定双方确认后作为合同价款，因此施工许可证的合同预算价并不能作为最终依据，凯源公司的该部分辩解，本院依法不予采信。
针对华中公司第一项诉讼请求，本院认为：因案涉房屋存在质量问题，华中公司因维修鸿业家园住宅小区A区1#-4#楼部分住宅楼屋面、外墙体漏雨及室内外墙面、棚面等，共计产生维修费用398400元。该部分损失有《房屋维修工程施工合同》、银行客户回执、维修费用汇总表、《收条》等证据予以证实，本院依法予以确认。当事人应当全面履行自己的义务，凯源公司所交付的工程存在相应的质量问题，凯源公司应当承担相应的民事责任。华中公司要求凯源公司赔偿因工程质量造成的损失，本院对其有事实与法律规定的部分予以支持。
关于本案反诉部分，本院评判如下：
根据双方约定，工程竣工验收合格后15日内付至工程总造价的85%，决算审计确认后15日内付至工程总造价的95%。案涉工程总造价为60927730元，华中公司应当在2013年6月9日案涉工程竣工验收合格后15日内付至工程总造价的85%，即51788570.5元，华中公司应当在2015年12月31日案涉工程经安徽启创工程咨询有限公司决算审计确认后15日内付至工程总造价的95%，即57881343.5元。华中公司截至2013年6月25日实际累计支付凯源公司案涉工程款45827595.36；华中公司截至2016年1月15日实际累计支付凯源公司案涉工程款55827595.36元；华中公司截至2016年2月1日实际累计支付凯源公司案涉工程款57857595.36元，华中公司尚欠凯源公司到期工程款23748.14元。华中公司未按照双方约定足额支付凯源公司工程款，应当承担相应的违约责任。截止本院宣判之日，华中公司应当承担的违约金为668437.87元{[（51788570.5元-45827595.36元）×（2013年6月25日-2014年1月27日）×0.5‰]=643785.32元+[（57881343.5元-55827595.36元）×（2016年1月15日-2016年2月1日）×0.5‰]=17456.86元+[(57881343.5元-57857595.36元)×（2016年2月1日-2017年9月29日）×0.5‰]=7195.69元}。双方约定本工程质量保修金为合同价款的5%，发包人在5年质量保修期满，经核查无异议后15天内将剩余保修金无息返还承包人，即华中公司应当在2018年6月9日质量保修期满经核查无异议后15天内将该保修金3046386.5元无息返还凯源公司，凯源公司该部分的诉讼请求，本院依法不予支持。
综上，依据《中华人民共和国合同法》第六十条、第一百零七条、第一百零九条、第一百一十二条、第一百一十四条、第二百六十九条、第二百八十一条、第二百八十二条，《中华人民共和国民事诉讼法》六十四条第一款及《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第二条之规定，判决如下：
一、被告安徽凯源建设集团有限责任公司于本判决生效后十日内一次性赔偿原告淮南华中置业有限公司延期竣工违约金864000元、迟延交房损失69000元，合计933000元；
二、被告安徽凯源建设集团有限责任公司于本判决生效后十日内一次性赔偿原告淮南华中置业有限公司因工程质量造成的损失398400元；
三、反诉被告淮南华中置业有限公司于本判决生效后十日内一次性反诉原告安徽凯源建设集团有限责任公司工程款23748.14元及违约金668437.87元（违约金暂计算至2017年9月28日，此后违约金以23748.14元为基数按日万分之五计算至款项实际付清之日止）；
四、驳回原告淮南华中置业有限公司其他诉讼请求；
五、驳回反诉原告安徽凯源建设集团有限责任公司其他诉讼请求。
如果未按本判决指定的期间履行给付金钱义务，应当依照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条之规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。
本案本诉案件受理费47520元，原告淮南华中置业有限公司负担35121元，被告安徽凯源建设集团有限责任公司负担12399元；本案反诉案件受理费84490元，依法减半收取42245元，反诉原告安徽凯源建设集团有限责任公司负担39446元，反诉被告负担2799元。
如不服本判决，可在判决书送达之日起十五日内，向本院递交上诉状，并按对方当事人的人数提出副本，上诉于安徽省淮南市中级人民法院。
审 判 长 李保平
代理审判员 刘克永
人民陪审员 蒋保洲
二〇一七年九月二十八日
书 记 员 马晓宁
附1：本案证据目录
一、原告华中公司提交证据和证明目的如下
证据一、原告营业执照、公司变更信息，证明原告诉讼主体资格。
证据二、被告营业执照、企业信息查询单，证明被告主体资格。
证据三、建设工程施工合同、A区工程协议书、开工申请（原件在档案馆）、通知单、开工令（原件在档案馆）、竣工验收报告，证明1、双方存在建设工程施工合同关系，施工合同中约定的是固定汇率，没有工程总款约定，双方是按照图纸工程量确定工期，而不是工程款。2、工程约定的工期是21个月630天，协议书特别约定迟延一天扣罚2000元，实际是违约金，要承担工期延误造成原告无法按期交房的连带责任，通知单是被告向监理申请开工的，有被告项目部的章，实际开工时间被告是盖章认可的，竣工时间从验收报告上是2013.6.9，按照合同约定，工程延误工期432天，按照一天2000元违约金标准，应当支付违约金864000元。3、合同约定了工程质量保证金，尤其是房屋建筑工程保修书，屋面防水是五年，五年后如果没有质量问题，质保金无息返还，质保金现在还没到返还时间继续扣留。4、开工令表明了监理单位要求迅速开始施工。
证据四、工程延期及质量维修问题联系函5份（邮寄回执），公证书是由于通知被告但无人维修才进行了公正，原件1份、证据照片打印件5张。证明1、工程有严重质量问题。2、工程竣工后原告多次向被告发函要求被告承担保修责任，即使对业主投诉进行维修，但被告始终不理睬。
证据五、房屋维修工程施工合同原件、建筑安装工程费结算单、转账流水打印件三份，维修费用汇总表打印件1份，维修费用收据62份。证明1、工程质量问题而被告长期拖延不维修，原告多次催告才联系施工单位进行维修。2、施工单位对维修造价进行了计算。
证据六、业主投诉统计，41张照片打印件，证明1、被告施工工程有质量问题，业主多次投诉，一部分正在等待维修。2、后续维修费用是按照维修单位计算继续支付，有房号、投诉内容、业主联系电话。
证据七、淮南仲裁委裁决书原件4份、决定书6份、收据7份，证明被告延误工期，小区交房迟延，部分业主要求赔偿损失，具体赔付情况共61369元。
二、被告凯源公司提交证据和证明目的如下
证据一、建设工程规划许可证及准建工程通知单，证明原告于2010.6.21才取得案涉工程规划许可证。
证据二、建筑工程施工许可证，证明原告于2011.4.26才取得案涉工程施工许可证，施工合同价款4888万元。
证据三、淮南市建设（建筑）工程质量监督登记表，证明原告于2010.8.27才申请办理工程质量监督手续。
证据四、工程联系单2份，证明案涉工程因原告原因中途造成停工的事实，有盖章签字确认。
证据五、工程造价咨询定案表，汇总表中工程是有签证、增加、变更费用的产生的，与差额的产生是吻合的，证明案涉工程经最终审定为总造价60927730元，比原合同价款4888万元高出12047730元。
证据六、付款明细表，证明收到工程款情况，付款节点情况，竣工验收合格时仅付到75%，决算审计没有达到95%，反映原告没有按照约定付款违约的事实。
证据七、维修记录单16份，证明被告认真履行质量保修义务，维修完成后，得到业主的签字认可。
证据八、收条10份，证明被告在质保期内安排工人维修而支出的工人工资情况.
三、反诉原告凯源公司提交证据和证明目的如下
证据一、协议书，证明反诉人与被反诉人签订建设工程施工合同的事实，合同对工程承包范围、承包方式、工程款支付、违约责任等进行了约定。
证据二、建设工程施工合同，证明反诉人与被反诉人签订真实建设工程施工合同并办理备案的事实。
证据三、工程咨询报告书，证明涉案工程经最终审计确定工程款总额为60927730元的事实。
四、反诉被告华中公司提交的证据和证明目的如下
证据一、中国工商银行业务回单、收据，原件，证明2015.8.17付了三百万A区工程款实施，2、一直按照约定付款没有违约。
证据二、建筑工程施工合同、协议书、竣工验收报告、工程咨询报告书。证明1、案涉工程质量保证金5%期满无息返还，反诉原告提供的保修书约定防水工程等保修期五年，涉案工程保证金还未到保修期满，要求返还没有证据。
本案适用的法律条文：
《中华人民共和国合同法》
第六十条当事人应当按照约定全面履行自己的义务。
当事人应当遵循诚实信用原则，根据合同的性质、目的和交易习惯履行通知、协助、保密等义务。
第一百零七条当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
第一百零九条当事人一方未支付价款或者报酬的，对方可以要求其支付价款或者报酬。
第一百一十二条当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，在履行义务或者采取补救措施后，对方还有其他损失的，应当赔偿损失。
第一百一十四条当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。
第二百六十九条建设工程合同是承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。
建设工程合同包括工程勘察、设计、施工合同。
第二百八十一条因施工人的原因致使建设工程质量不符合约定的，发包人有权要求施工人在合理期限内无偿修理或者返工、改建。经过修理或者返工、改建后，造成逾期交付的，施工人应当承担违约责任。
第二百八十二条因承包人的原因致使建设工程在合理使用期限内造成人身和财产损害的，承包人应当承担损害赔偿责任。
《中华人民共和国民事诉讼法》
第六十四条当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。
当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。
人民法院应当按照法定程序，全面地、客观地审查核实证据。
《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》
第二条当事人对自己提出的诉讼请求所依据的事实或者反驳对方诉讼请求所依据的事实有责任提供证据加以证明。
没有证据或者证据不足以证明当事人的事实主张的，由负有举证责任的当事人承担不利后果。