重庆市江北区人民法院
民 事 判 决 书
（2016）渝0105民初1693号
原告：杨昌东，男，汉族，1967年9月27日出生，住重庆市大足区。
委托诉讼代理人：周彬，重庆宏州律师事务所律师。
委托诉讼代理人：罗秋燕，重庆宏州律师事务所律师。
被告：长航武汉汽车物流有限公司重庆分公司，住所地重庆市江北区桥北苑2号2幢13-9、13-10号。
负责人：ＸＸ元，职务经理。
被告：长航武汉汽车物流有限公司，住所地武汉市江汉区沿江大道69号。
法定代表人：张爱国，职务总经理。
二被告共同委托诉讼代理人：肖东升，北京盈科（武汉）律师事务所律师。
二被告共同委托诉讼代理人：刘念，北京盈科（武汉）律师事务所律师。
原告杨昌东与被告长航武汉汽车物流有限公司(以下简称长航公司)、长航武汉汽车物流有限公司重庆分公司（以下简称长航重庆分公司）劳动争议一案，本院于2016年1月22日立案后，依法适用简易程序，公开开庭进行了审理。原告委托诉讼代理人周彬、罗秋燕，二被告共同委托诉讼代理人肖东升、刘念到庭参加诉讼。本案现已审理终结。
原告杨昌东向本院提出诉讼请求：1.确认杨昌东与长航重庆分公司的劳动关系于2015年9月9日解除；2.长航公司与长航重庆分公司共同向杨昌东返还2005年3月1日至2015年9月9日期间扣除的基本工资115920元[920元/月（23天×40元/天)×126个月（在职月数）]；3.长航公司与长航重庆分公司共同支付解除劳动合同的经济补偿金101486元[(绩效工资7976元+基本工资1250元)×11个月]，上述请求均参照2015年2月工资计算，23天为出勤天，40元为公司每天扣除的金额，按1250元÷30天计算。事实和理由：2005年3月1日，杨昌东到长航重庆分公司工作，交纳作业风险金5000元，双方建立劳动关系。2008年1月1日，杨昌东与长航公司签订劳动合同，合同期限为2008年1月1日至2009年12月31日。2010年1月1日，杨昌东与长航重庆分公司签订劳动合同，合同期限为2010年1月1日至2017年12月31日。两份合同均约定：用人单位为长航重庆分公司，在杨昌东正常出勤并付出正常劳动后，执行“月基本工资+行车劳务包干费”的方式获得劳动报酬，公司为杨昌东提供符合国家及当地规定的劳动条件。劳动合同约定的基本工资应为每月固定1250元，而自杨昌东入职起，待令天就按最低工资标准发放，出勤天按40元/天被扣除，与《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》规定的基本工资发放方式一致。杨昌东每月的工资为全部劳务费，包含了生活费与主驾津贴等。杨昌东于2005年3月1日至2015年9月9日期间一直在长航重庆分公司工作，工资也由该公司发放，但公司未按劳动合同约定支付基本工资，且直至2015年1月才开始为杨昌东办理生育保险。长航重庆分公司未按劳动合同约定向杨昌东提供劳动条件（工作工具：机动车），其向杨昌东提供的机动车擅自改变了外形和已登记的有关技术数据，不符合国家规定，致使杨昌东驾驶该机动车上路曾多次受到公安交通管理部门处罚，且公司违章指挥杨昌东驾驶擅自改变外形的机动车上路，危及杨昌东人身安全，故杨昌东于2015年9月9日提出与长航重庆分公司解除劳动关系。后，杨昌东以长航重庆分公司为被申请人，向重庆市江北区劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁，该委逾期未作出仲裁裁决，杨昌东诉至本院。
被告长航重庆分公司及长航公司答辩称，长航公司与杨昌东建立劳动关系，长航重庆分公司代长航公司对杨昌东进行考勤及发放工资，并委托重庆长江轮船公司缴纳社保。关于杨昌东的工资情况，劳动合同作了明确约定，公司管理制度进行了规定，且经公司职工会议等通过，长航重庆分公司也组织杨昌东等进行了学习，其工资具体组成为基本工资加绩效工资，基本工资是作为补充，绩效工资以出车次数等计算，如果出车，基本工资是含在绩效工资里面的，如不出车，则按1250元计算，公司一直按此支付工资，杨昌东未提出异议，杨昌东所主张的1250元的基本工资是理解错误，且杨昌东仅以2015年2月的工资表进行计算不符合事实，故长航公司及长航重庆分公司不存在克扣杨昌东工资的情形。关于工资组成部分的问题，生活费为原告在沿途的餐饮费，是按公路里程数计算得出，按包干费的20%支付,其系《关于工资总额组成的规定》第十一条第（六）项所规定的不属工资组成的费用，主驾津贴属于该规定第十一条第（二）项规定的费用，也不属于工资的组成部分，应当扣除。关于车辆外形变更的问题，长航公司及长航重庆分公司对车辆全部加长，但总长在30米以内，该做法与国内通用做法没有冲突，符合国家法律和地方规定，且公司参照了四川省的相关规定，经过公安相关部门的审核，也通过了年审年检，不存在不合格的情形。杨昌东的生育保险是从2015年1月开始缴纳，因为公司员工基本为男性，重庆市政府给予公司优惠政策，且重庆长江轮船公司没有办理生育保险，所以公司此前才没有办理生育保险，此后杨昌东不同意公司为其补缴生育保险和发放补贴，公司才没有补缴之前的生育保险费。杨昌东的第二、三项诉讼请求均已过诉讼时效，故杨昌东的诉求无事实和法律依据，请求予以驳回。
本院经审理认定事实如下：2008年1月1日，杨昌东（乙方）与长航公司（甲方）签订劳动合同书，约定用人单位为长航重庆分公司，合同期限为2008年1月1日至2009年12月31日，工作岗位为轿运车驾驶，工作地点为重庆至国内各地，劳动报酬为月基本工资+行车劳务包干费，报酬中含甲方给予乙方的所有福利待遇，计发形式为人民币现金形式；甲方为乙方提供符合国家及当地规定的劳动条件及安全卫生的工作环境；甲方为乙方提供以下福利待遇：基本养老保险金、基本医疗保险金、失业保险金、工伤保险金、生育保险金；甲方依法制定的规章制度（包括但不限于员工手册、岗位职责、培训协议、保密协议、安全准则等）均属本合同的主要附件，其效力与合同条款同等。
2010年1月1日，杨昌东（乙方）与长航重庆分公司（甲方）签订了劳动合同书，合同内容为：用人单位为长航重庆分公司，合同期限自2010年1月1日起至2017年12月31日止，甲方聘用乙方从事轿运车驾驶工作，工作地点为公司经营范围所在地，劳动报酬为基本工资+出车包干工资，劳动报酬按甲方制订的《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》的相关规定计发。甲方于每月20日以人民币形式支付乙方上月工资。甲方为乙方提供以下福利待遇：基本养老保险金、基本医疗保险金、失业保险金、工伤保险金。甲方依法制定的规章制度，包括但不限于《轿运车司机管理办法》、《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》均属本合同的主要附件，其效力与合同条款同等。
长航重庆分公司委托重庆长江轮船公司为杨昌东办理了养老、医疗、失业、工伤保险，并于2015年1月办理生育保险，且未补缴此前未缴纳的生育保险费。
2014年5月5日，长航公司召开工会及职工代表会议，就《轿运车司机人事管理办法》进行讨论，并提出修改意见后正式行文。同年5月8日，长航公司下发《轿运车司机人事管理办法》，该办法的适用范围为公司所属轿运车司机，第四条第（一）款规定出勤天是指司机从重庆出车之日起至回到重庆之日止的工作时间天，待令天是指根据调度指令，司机在重庆市（或车管常住地）等派运输任务的时间天。第（三）款规定出勤天按《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》的规定享受出车劳务包干费的相关待遇，待令天按《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》的规定享受相关工资待遇。第六条规定，重庆分公司负责公司所属司机的总体管理工作，即负责公司司机人事管理制度的拟定，负责渝、汉、宁三地司机的聘解、升降、奖惩、调配等审批、调剂工作；渝、汉、宁三地司机的聘解和使用按属地原则进行日常管理，即重庆地区的司机使用和管理由重庆分公司负责，渝、汉、宁三地司机的聘解程序由各部门结合地区实际情况按本办法的相关规定执行，但须经其公司分管领导签字，完善相关报表手续后，报重庆分公司审批，报公司管理部备案；重庆地区招聘的司机，由重庆分公司负责相关社保和雇主责任险的投保、理赔工作。第十条规定，本办法的解释权属重庆分公司，具体管理部门是重庆分公司车管室。
2014年5月15日，长航公司召开工会及职工代表大会，就《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》进行了讨论，并提出修改意见后正式行文。同年5月22日，长航公司下发《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》，该办法的适用范围为西南地区公司所属轿运车司机，第三条规定工薪由月基本工资、出车劳务包干费中的工资部分组成（工薪收入不得低于重庆市政府公布的年度社会职工最低工资标准）。月基本工资标准＝年度社会职工最低工资标准/30天×考勤待令天。出车劳务包干费是指出车期间的包干工资、生活费、主驾津贴、杂支费等费用的总和，其所占比例分别为60%、20%、4%和16%（含应提取的安全基金5%，其余部分为轿运车在途零星自检自修费用及市外交通费等占11%），发放方式以趟次为计算单位，月度进行结算。第五条规定，轿运车营运费用以包干方式按《公司轿运车营运包干费结算标准》进行结算。第七条规定，本办法的解释权属重庆分公司。
杨昌东在关于学习《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》、《公司轿运车营运包干费结算标准》和新《人事管理办法》的学习记录上签字，杨昌东否认其签名的真实性，但未在规定的期间内申请对签名进行鉴定。长航公司及长航重庆分公司陈述新《人事管理办法》即《轿运车司机人事管理办法》。
2015年9月9日，杨昌东委托重庆宏州律师事务所律师周彬向长航重庆分公司发出《告知函》，内容为：杨昌东等人要求与贵司解除劳动关系，本所已接受委托，指派律师周彬承办本案，特告知贵司。双方均认可劳动关系解除的时间为2015年9月9日。
后，杨昌东以长航重庆分公司擅自改变机动车外形等行为违法、克扣工资及未依法缴纳社会保险费为由，向重庆市江北区劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁，仲裁请求为：确认双方的劳动关系已于2015年9月9日解除，长航重庆分公司支付经济补偿金101486、长航重庆分公司退还扣除的基本工资115920元。2015年9月21日，该委受理了杨昌东的仲裁申请，并于同年12月29日作出仲裁决定书，终结了对案件的审理。
2015年11月19日，重庆市江北区人民法院作出（2015）江法民初字第11528号民事判决，判决长航重庆分公司退还杨昌东作业风险金5000元。
2016年9月7日，杨昌东放弃要求返还2015年9月1日至2015年9月9日期间基本工资的诉讼请求。
另查明，长航重庆分公司每月20日前以打卡方式发放上一自然月工资。长航公司和长航重庆分公司举示的工资汇总表中载明了劳务费、生活费和主驾津贴的金额，其中劳务费为基本工资（待令工资）与绩效工资之和，而绩效工资包括了生活费与主驾津贴等，即表中的劳务费包含了生活费和主驾津贴。生活费属于出车劳务包干费的一部分，按《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》规定的比例支付、并非按实际消费计算。原告按绩效工资与基本工资之和缴纳个人所得税。杨昌东每月发放的主要费用为：2014年9月劳务费2531元、10月劳务费647元、11月劳务费1344元、12月劳务费1148元、2015年1月工资7500元、2月工资6000元、3月工资5000元、4月工资6000元、5月劳务费1107元、6月劳务费1230元、7月劳务费1250元、8月劳务费1250元。
再查明，曾有轿运车司机因驾驶长航重庆分公司所有的改变了外形的车辆被处罚，具体情形如下：2013年11月18日，秦仲驾驶车牌号为渝BFXX**的车辆在兰海高速公路被处罚，违法内容为，擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据；2014年11月4日，彭祖志驾驶车牌号为渝BXX**的车辆在G05京昆高速被处以罚款，违法内容为擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据，机动车载货长度、宽度、高度超过规定；2014年12月2日，孙勇驾驶车牌号为渝BFXX**的车辆在成赤高速公路被处以罚款，违法内容为擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据；2015年4月8日，谭昌德驾驶车牌号渝BFXX**的车辆在省道106线被处以罚款，违法内容为：驾驶机件不符合技术标准的机动车；2015年7月14日，彭祖正驾驶渝BFXX**的车辆在兰海高速公路被处以罚款，违法内容为：机动车载货长度、宽度、高度超过规定。
上述事实，有劳动合同书、收据、《告知函》、《轿运车司机人事管理办法》、《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》、违法记录、公安交通管理行政处罚决定书、整改通知书、工资表、工资证明、社保查询记录、民事判决书、仲裁申请书、仲裁决定书及当事人当庭陈述等证据在卷佐证，并经庭审质证。
本院认为，关于时效的问题，《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条第一款规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。第四款规定，劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受本条第一款规定的仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。杨昌东主张长航公司和长航重庆分公司返还扣除的基本工资，应属于因拖欠劳动报酬发生的争议，应自劳动关系解除之日起计算时效，而经济补偿金的诉讼时效也应自解除劳动合同之日起计算。杨昌东于2015年9月9日向长航重庆分公司发出解除劳动合同的告知函，重庆市江北区劳动人事争议仲裁委员会于2015年9月21日受理了杨昌东关于解除劳动关系、劳动报酬及经济补偿金的劳动争议案，故杨昌东关于返还基本工资及支付经济补偿金的诉讼请求未超过仲裁时效，对于长航公司及长航重庆分公司的抗辩，本院不予采纳。
关于杨昌东的劳动关系问题，《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第四条规定，劳动合同法规定的用人单位设立的分支机构，依法取得营业执照或者登记证书的，可以作为用人单位与劳动者订立劳动合同；未依法取得营业执照或者登记证书的，受用人单位委托可以与劳动者订立劳动合同。可知，长航重庆分公司具备独立的用人资格，可以单独与劳动者建立劳动关系。杨昌东的第一份劳动合同与长航公司签订，与其建立劳动关系的相对方应为长航公司，其第二份劳动合同与长航重庆分公司签订，则其用人单位应为长航重庆分公司。
关于基本工资的问题，杨昌东自愿放弃2015年9月1日至2015年9月9日期间基本工资的主张，系其处分自身诉讼权利的行为，本院予以确认。2014年5月，长航公司召集工会及职工代表讨论通过了《轿运车司机人事管理办法》和《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》，该办法经过了民主程序制定，应适用于长航公司所有员工，亦包括长航重庆分公司员工。虽然学习记录上载明的是“新《人事管理办法》”，其名称上少了“轿运车司机”字样，但从《轿运车司机人事管理办法》的发布时间来看，与学习时间相隔较近，且没有证据证明存在其他新的人事管理办法，故长航公司及长航重庆分公司关于新《人事管理办法》即《轿运车司机人事管理办法》的陈述，具有合理性，本院予以确认。对于杨昌东是否学习过以上管理办法的问题，虽然杨昌东抗辩学习记录上的签名非本人所签，但其未提供相应的反驳证据，也未对其签名申请鉴定，应当承担对其不利的法律后果，应视为其学习并知晓以上管理办法，该办法对杨昌东具有约束力。对于杨昌东的抗辩，本院不予采纳。对于2014年5月之前的基本工资，杨昌东陈述其待令时按最低工资标准发放基本工资，但出勤时却扣除了基本工资，该发放方式与《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》中规定的发放标准一致，而长航公司及长航重庆分公司亦陈述不出车时发放基本工资，出车时，基本工资包含在绩效工资中，可知杨昌东的基本工资标准一直与《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》规定的标准相符。
《最低工资规定》第三条规定，最低工资标准，是指劳动者在法定工作时间或依法签订的劳动合同约定的工作时间内提供了正常劳动的前提下，用人单位依法应支付的最低劳动报酬。《轿运车司机工薪及杂支报销管理办法》规定工薪由基本工资与出车劳务包干费中的工资部分组成，其中月基本工资标准=年度社会职工最低工资标准/30天×考勤待令天，劳动合同书中约定杨昌东的工资实行基本工资+行车劳务包干费的计算方式。由此可知，杨昌东的劳动报酬由基本工资与劳务包干费组成，杨昌东并未与长航重庆分公司约定基本工资按最低工资标准计发，而基本工资以待令天为基础计算得来，即全月待令则应按最低工资标准发放基本工资，如有出勤，则按待令的基本工资+出勤的劳务包干费发放劳动报酬，数额不固定，那么杨昌东的全部劳动报酬就并未低于最低工资标准。且，最低工资标准因年份而存在差异，每月的出勤天也各有不同，杨昌东均以2015年2月工资数额和出勤天为参照基数，不具有合理性。故，杨昌东要求以最低工资标准1250元为基数返还基本工资，无事实和法律依据，对于该项诉讼请求，本院不予支持。
关于月工资标准的问题，《关于工资总额组成的规定》第四条第（四）项规定津贴和补贴等组成工资总额。第十一条第（六）项规定，出差伙食补助费、误餐补助、调动工作的旅费和安家费不列入工资总额的范围。主驾津贴属于津贴，应计入工资总额；生活费为每月按固定比例支付的费用，非《关于工资总额组成的规定》第十一条第（六）项规定的费用，且该费用被纳入绩效工资进行缴税，该项费用亦应为工资组成部分，故，杨昌东的工资不应扣除生活费与主驾津贴，对于长航公司及长航重庆分公司的抗辩意见，本院不予采纳。杨昌东在解除劳动合同前12个月的月平均工资为5245.63元[（4901元+4185.50元+4855.50元+5356元+6027元+8263元+7548.50元+5953.50元+5526元+5308.50元+3089元+1934元）÷12个月]。
关于杨昌东的入职时间，《中华人民共和国劳动合同法》第七条规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。用人单位应当建立职工名册备查。长航公司及长航重庆分公司作为用人单位对杨昌东的入职时间负有证明责任，其举示的劳动合同书仅能证明双方签订劳动合同的日期，而不能证明杨昌东的入职时间，故公司应当承担举证不能的法律后果。杨昌东主张其于2005年3月1日入职，并于当日向长航重庆分公司缴纳作业风险金，而从（2015）江法民初字第11528号民事判决书可知，杨昌东交纳作业风险金为实，故对于杨昌东的主张，本院予以采纳，本院确认杨昌东于2005年3月1日入职长航公司。
关于解除劳动合同的问题，《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条规定，用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：（一）未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的；（二）未及时足额支付劳动报酬的；（三）未依法为劳动者缴纳社会保险费的。杨昌东在2015年9月9日以告知函的形式向长航重庆分公司提出解除劳动关系，且以公司未依法缴纳社会保险费、克扣工资、擅自改变机动车外形等为由申请仲裁，要求确认解除劳动关系，从其前后意思表示可知，其不可能作出不利于己的主张，故杨昌东要求解除劳动关系的理由应为未依法缴纳社会保险费等上述情形。关于解除原因：其一，《中华人民共和国道路运输条例》第七十一条第二款规定，违反本条例的规定，客运经营者、货运经营者擅自改装已取得车辆营运证的车辆的，由县级以上道路运输管理机构责令改正，处5000元以上2万元以下的罚款。长航重庆分公司擅自对其所属车辆进行了加长，但该行为是否违反了法律规定，应由相应的行政主管部门进行处理，而非本案审查范围，故，对于杨昌东的该项解除理由，本院不作支持。其二，劳动条件指用人单位为劳动者顺利完成工作任务提供的生产、工作条件，包括劳动工具等，本案中，杨昌东等人从事轿运车驾驶工作，公司已提供车辆供其驾驶，则已为其提供相应的劳动条件，对于该项主张，本院不予采纳。其三，《中华人民共和国劳动法》第七十二条规定，用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，缴纳社会保险费。《中华人民共和国社会保险法》第五十八条规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。第六十条规定，用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。自行申报、按时足额为原告办理社会保险是长航重庆分公司的法定义务，且双方在劳动合同中亦约定长航重庆分公司为杨昌东提供“五险”，则长航公司及长航重庆分公司应当及时、足额为杨昌东办理社会保险，但是长航重庆分公司在办理了养老、医疗、失业、工伤保险后，直至2015年1月起才为杨昌东办理生育保险，且并未补缴，违反了法律规定，杨昌东据此解除与长航重庆分公司的劳动合同，符合法律规定。对于长航重庆分公司关于公司员工基本为男性，重庆市政府给予公司优惠政策才没有办理生育保险的抗辩，无相关依据，本院不予采纳。杨昌东与长航重庆分公司均认可双方的劳动关系于2015年9月9日解除，本院予以确认。
关于经济补偿金的问题，《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条规定，劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。第四十七条规定，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。杨昌东依据该法第三十八条的规定向长航重庆分公司提出解除劳动合同，应获得经济补偿。
关于杨昌东的工作年限的计算问题，《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释（四）》第五条规定，劳动者非因本人原因从原用人单位被安排到新用人单位工作，原用人单位未支付经济补偿，劳动者依照劳动合同法第三十八条规定与新用人单位解除劳动合同，或者新用人单位向劳动者提出解除、终止劳动合同，在计算支付经济补偿或赔偿金的工作年限时，劳动者请求把在原用人单位的工作年限合并计算为新用人单位工作年限的，人民法院应予支持。用人单位符合下列情形之一的，应当认定属于“劳动者非因本人原因从原用人单位被安排到新用人单位工作”：劳动者仍在原工作场所、工作岗位工作，劳动合同主体由原用人单位变更为新用人单位。据此，杨昌东自2005年3月1日起与长航公司建立劳动关系，虽然用人单位由长航公司变更为长航重庆分公司，但其工作地点、工作岗位均未发生变化，故杨昌东在长航公司的工作年限应合并计算为其在长航重庆分公司的工作年限。
《中华人民共和国劳动合同法》第九十七条规定，本法施行之日存续的劳动合同在本法施行后解除或者终止，依照本法第四十六规定应当支付经济补偿的，经济补偿年限自本法施行之日起计算；本法施行前按照当时有关规定，用人单位应当向劳动者支付经济补偿的，按照当时有关规定执行。杨昌东于2005年3月1日入职，《中华人民共和国劳动合同法》于2008年1月1日起施行，杨昌东以公司未依法办理社会保险为由解除劳动合同，不属于该法施行前支付经济补偿金的情形，故应自2008年1月1日起计算经济补偿金的年限。杨昌东于2015年9月9日解除与长航重庆分公司的劳动关系，故杨昌东获得经济补偿金的月数为8个月。杨昌东解除劳动关系前12个月的月平均工资为5245.63元，故长航重庆分公司应支付杨昌东解除劳动关系的经济补偿金41965.04元（5245.63元/月×8个月）。
《中华人民共和国公司法》第十四条规定，公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。据此，因长航重庆分公司系长航公司设立的分公司，故长航公司应对长航重庆分公司所负债务承担给付义务，但因长航重庆分公司毕竟有长航公司授予其经营和管理的财产，故，长航公司应对长航重庆分公司给付不足部分承担补充清偿责任。
综上所述，依照《中华人民共和国劳动法》第七十二条、《中华人民共和国劳动合同法》第七条、第三十八条、第四十六条、第四十七条、第九十七条、《中华人民共和国社会保险法》第五十八条、《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条第一款、第四款、《中华人民共和国公司法》第十四条、《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释（四）》第五条之规定，判决如下：
一、确认原告杨昌东与被告长航武汉汽车物流有限公司重庆分公司的劳动关系于2015年9月9日解除。
二、被告长航武汉汽车物流有限公司重庆分公司于本判决生效之日起七日内支付原告杨昌东经济补偿金41965.04元。
三、被告长航武汉汽车物流有限公司对长航武汉汽车物流有限公司重庆分公司给付不足部分承担补充清偿责任。
四、驳回原告杨昌东的其他诉讼请求。
如果未按本判决指定的期间履行给付金钱义务，应当依照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条之规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。
本案案件受理费减半收取5元，由被告长航武汉汽车物流有限公司、长航武汉汽车物流有限公司重庆分公司负担。
如不服本判决，可在判决书送达之日起十五日内，向本院递交上诉状，并按对方当事人的人数提出副本，上诉于重庆市第一中级人民法院。
代理审判员 姚丽君
二〇一六年十月十七日
书 记 员 贾 欢