江苏省南京市中级人民法院
民 事 判 决 书
（2014）宁民终字第3751号
上诉人（原审原告）杨秀全，男，汉族，1972年11月8日生。
委托代理人熊正春，江苏当代国安律师事务所律师。
上诉人（原审被告）南京金陵石化研究院有限责任公司，组织机构代码79710368-X，住所地南京市栖霞尧化街道尧化门葛家边100号。
法定代表人边家军，该公司董事长。
委托代理人潘兰建，男，汉族。
杨秀全与南京金陵石化研究院有限责任公司（以下简称金陵石化研究院）追索劳动报酬、经济补偿金纠纷一案，南京市栖霞区人民法院于2014年7月10日作出了（2013）栖民初字第1981号民事判决。宣判后，杨秀全与金陵石化研究院均不服原审判决，向本院提起上诉。本院于2014年8月26日立案受理后，依法组成合议庭，并于2014年9月26日公开开庭审理了本案。上诉人杨秀全及其委托代理人熊正春、上诉人金陵石化研究院的委托代理人潘兰建到庭参加诉讼。本案现已审理终结。
原审法院经审理查明，杨秀全1997年8月至金陵石化研究院工作，2003年调入销售部从事化工产品销售。2006年年底，金陵石化研究院单某改制，2007年1月1日，双方签订了为期三年的劳动合同。2008年8月4日，杨秀全向金陵石化研究院递交了解除劳动关系通知书，理由是：公司拒不执行相关提成、奖励等公司规定及承诺，拒发从2008年4月至今的工资。杨秀全因此决定从2008年8月4日起解除劳动合同关系，并要求金陵石化研究院支付经济补偿金，补发拖欠工资、奖励及提成。杨秀全向江苏省劳动人事仲裁委员会申请仲裁，仲裁委以申请人请求事项超过法律规定的仲裁时效为由，决定不予受理。杨秀全在本案中的诉请为判令金陵石化研究院：1、支付被克扣的销售提成奖金809529.77元（2006年11月至2008年3月：（23567358.9元×40%-432168.30元）×9%】和经济补偿金166667.89元（2006年11月至2007年12月31日：809529.77元÷17个月×14个月×25%】；2、支付底薪工资4100元（即2008年4月至8月3日，共4个月3天，每月1000元）；3、支付被克扣的解除劳动合同经济补偿金369185.96元【解除劳动合同前12个月平均工资为［（80929.77元÷17个月＋1000元／月）×8个月＋1000元／月×4个月］÷12个月=32746.27元，1997年8月至2007年12月31日经济补偿金：32746.27元×11个月=360208.97元；2008年1月1日至2008年8月3日经济补偿金：2992.33元／月（南京市2007年在职职工月平均工资）×3倍×1个月=8976.99元】和额外经济补偿金180104.49元（1997年8月至2007年12月31日：360208.97元×50%）。
原审法院另查明以下事实：
1、杨秀全妻子吕某、岳母侯某陈述，杨秀全辞职后多次向金陵石化研究院讨要提成工资，中间间隔从未超过半年。侯某陈述杨秀全长时间讨要不到销售提成，发生家庭矛盾；自己于2010年6月10日陪杨秀全讨要销售提成。证人黄某陈述其在2011年春节前、3月、7月，数次开车送杨秀全至金陵石化研究院讨要销售提成，证人梅某、史某均证实杨秀全多次到金陵石化研究院讨要销售业绩提成。
2、2006年8月，金陵石化研究院职代会决议通过企业改制分流方案，参加改制的职工与金陵石化公司研究院解除劳动合同且获得补偿补助，改制职工获得相应净资产额支付补偿补助，并将该净资产全部转为改制完成后新设立的公司的股权。2012年4月24日，杨秀全收到金陵石化研究院边家军支付的金陵石化研究院股权转让款165621元。
3、2007年1月1日，杨秀全与金陵石化研究院签订劳动合同，订立固定期限劳动合同，期限自2007年1月1月至2009年12月31日。
4、金陵石化研究院2005年《销售部考核办法》规定：专职销售人员底薪为1000元／月；按除税后销售差价（产品销售价-
产品原料成本）的一定比例作为提成（以后简称销售利润），扣除各项销售费用（含差旅费、促销费、通讯费、交通费、招待费、办公费、邮递费、资金占用费、坏账保证金等）后作为销售奖励。货物运费不在销售费用中，进入相应产品成本。新客户按除税后销售利润的11%提成，老客户则为8%。
金陵石化研究院的《2006年奖金发放办法》规定：销售部的奖励办法基本与2005年该部门奖励办法相同，2006年取消新老客户差别，统一按除税后销售毛利（销售额-
直接成本-
销售成本）的9%提成。庭审中，金陵石化研究院认为“销售成本”是专业术语，是已售产品的生产成本，不同于销售费用。“直接成本”是与产品生产工艺直接相关的成本，如原材料、生产工人工资、机器设备折旧等。杨秀全认为：该办法中的直接成本仅为原材料成本；销售成本就是销售费用，销售成本如果采用原告的解释，则必然包括直接成本，套用被告税后销售毛利的计算公式，则销售额要重复减去2次直接成本，毛利将成为负数。
5、金陵石化研究院提交了杨秀全2007年1月至2008年5月销售核算明细表、销售业务涉及的8个种类化工产品的单某平均成本价，杨秀全对单某平均成本价不予认可，认为高出实际价格，并例举了单某其他工作人员（林棕棕）的销售单，其销售价格低于金陵石化研究院列出的平均成本。金陵石化研究院则例举了林棕棕的其他部分销售单，显示销售价格高出平均成本。另经原审法院司法鉴定负责部门查询，目前尚无专业机构受理本案化工产品平均成本的鉴定。本案当事人双方也未能提供相关咨询机构。
6、金陵石化研究院提交了2007年度审计报告。显示其全年主营业务收入为52826776.02元，主营业务成本为40332257.15元，主营业务利润为12170753.61元，全年净利润为5741631元。金陵石化研究院主张其2007年毛利润率为23.65%。
7、金陵石化研究院提交了2008年3月至8月销售部考勤，显示销售部共三人，4月份开始没有杨秀全的考勤记录。金陵石化研究院提交了杨秀全于2008年5月写给单某的材料，材料中杨秀全认可自己通过延交货款来抵业务提成，已还单某15万元，尚余31600元。
8、2010年6月10日，金陵石化研究院向杨秀全出具结算清单，杨秀全预提奖金66000元，销售额为29004440元，到款27573810元，已报销费用432168.3元、不含税毛利5628069.54元，毛利率为23.88%。原告对销售额、到款、预提奖金无异议，对毛利率、不含税毛利不予认可。杨秀全主张毛利润率应为40%。
审理中，原审法院向杨秀全释明如对金陵石化研究院提交的证据关于毛利率的主张有异议，可向法院申请对金陵石化研究院的财务进行司法决定即财务审计，如不申请司法鉴定，法院将根据现有的证据裁判。
上述事实，有双方当事人当庭陈述，杨秀全提交的销售申请单、财会报表、奖金发放办法、解除劳动合同通知书、证人证言，金陵石化研究院提交的销售部考核办法、销售核算明细、运费发票、原材料、销售申请单、审计报告等证据证实。
原审法院认为，劳动者的合法权益受法律保护。本案审理过程中，多名证人证实杨秀全辞职后多次向金陵石化研究院讨要销售提成，间隔时间未超过1年。金陵石化研究院也未向杨秀全书面明示拒绝支付提成工资。因此杨秀全主张的提成工资并未超过时效，原审法院对金陵石化研究院抗辩的杨秀全的诉请超过时效的意见不予采信。
关于杨秀全主张的销售提成奖励问题，金陵石化研究院主张销售毛利润率为23.88%，该数额与2007年金陵石化研究院的审计报告上的主营业务利润率相近。金陵石化研究院提供的运费发票、原材料发票、销售申请单能辅助证实上述毛利润率的真实性。杨秀全主张销售毛利率超过40%，计算的毛利润率只考虑了原料成本，缺乏合理性，其提交的林棕棕的销售单只能反映该员工部分销售情况，不足以否定金陵石化研究院主张的毛利率。金陵石化研究院已最大限度完成了举证义务，法院向杨秀全作了释明，其不提出对金陵石化研究院的财务进行司法审计鉴定，应当对该事实承担举证不能的后果。原审法院确认杨秀全的销售额的毛利润率为23.88%。至于销售费用的扣除，原审法院认为，金陵石化研究院《2006年奖金发放办法》虽然规定销售部的奖励办法基本与2005年该部门奖励办法相同，但其将销售额扣减直接成本后又扣除销售成本，明显改变了2005年的规则。销售成本的含义如果套用专业术语解释，必然导致直接成本重复扣除的错误发生。原告并非专业财会人员，难以区分销售成本与销售费用的区别。上述规定办法系金陵石化研究院单方制定，在双方有歧义的情况下，应作出有利于劳动者一方的解释，故文件中的“销售成本”应作“销售费用”理解。金陵石化研究院销售毛利率为23.88%，杨秀全的除税后销售额为23567358.9元（到款27573810元÷1.17），可计算其直接成本为17939473.6元（除税后销售额23567358.9元-（23567358.9元×23.88%毛利率）），根据2006年奖金发放办法，按除税后销售毛利（销售额-
直接成本-销售成本）的9%提成，杨秀全的奖金提成为467614.53元（（23567358.9元-17939473.6元-432168.3元）×9%）。
关于杨秀全主张的底薪工资，从金陵石化研究院提交的研究院市场部的考勤表来看，自2008年3月至2008年8月，其中2008年3月有杨秀全等3人，2008年4月至8月只有另外两人，所有考勤表均无被考勤人员签名确认或相关考勤公示材料。双方提交的工资发放记录显示，2008年5月、6月、7月、8月杨秀全的工资实发工资为0元。原审法院认为金陵石化研究院提交的考勤记录不能认定杨秀全2008年4月-8月缺勤，其扣发杨秀全的工资是事实，金陵石化研究院应补发杨秀全2008年5、6、7三个月工资计3000元。
关于杨秀全主张经济补偿金，金陵石化研究院扣发杨秀全工资，杨秀全提出解除劳动合同，金陵石化研究院应给予经济补偿。杨秀全因单某改制进入新单某，杨秀全在原单某已获得相应净资产额支付补偿补助，并将该净资产全部转为改制完成后新设立的金陵石化研究院的股权，后该股权被边家军收购，金陵石化研究院只需支付杨秀全2007年1月至2008年8月这段工作年限的经济补偿。2007年1月至2008年7月月均提成奖金为24611.29元（467614.53元÷19个月），加上底薪1000元，杨秀全的月薪为25611.29元。根据劳动部《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》，2007年1月1日至12月31日这段期间杨秀全应获得的经济补偿金为32014.11元（25611.29元＋25611.29元×25%）。2008年1月至2008年8月经济补偿金为8976.99元（南京市2007年在岗职工月平均工资2992.33元／月×3倍），杨秀全应得经济补偿金计40991.1元（32014.11元＋8976.99元）。
综上，杨秀全应得奖金提成467614.53元、工资3000元、经济补偿金40991.1元，合计511605.63元。另外，杨秀全已预提成奖金66000元，其认可自己通过延交货款来抵业务提成，已还单某15万元，尚余31600元，这些部分应予扣除，金陵石化研究院实际还应支付杨秀全414005.63元。
据此，依照《中华人民共和国劳动法》第三十二条第（三）项、《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条第一款第（二）项、第四十六条第（一）项、第四十七条、《中华人民共和国民事诉讼法》第六十四条之规定，原审法院判决：一、南京金陵石化研究院有限责任公司支付给杨秀全414005.63元，此款于判决生效之日起五日内付清。二、驳回杨秀全其他诉讼请求。
如果未按判决指定的期间履行给付金钱义务，应当依照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条之规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。
原审宣判后，杨秀全与金陵石化研究院均不服上述民事判决，向本院提起上诉。
杨秀全上诉称：（一）原审认定毛利率23.88%错误，杨秀全主张销售产品毛利率40%，有事实和科学依据，具有合理性。原审法院完全不顾杨秀全提出的林棕棕等多名销售人员低于平均成本大批销售的事实，以及有大量产品不开票不入账销售，杨秀全仅一年就有近200万元销售款进入单某小金库，证明金陵石化研究院一贯财务造假，虚高成本，审计报告对这些财务虚假未有处理意见，即使审计报告主营业务利润率与之相近，也不能证明毛利率是23.88%，更何况审计报告说的是主营业务利润率，和毛利率不是一个概念。如果审计报告说的是主营业务利润率接近23.88%，那么，实际毛利率应远大于23.88%，所以原审认定毛利率23.88%错误。（二）关于克扣的销售奖金提成、底薪、经济补偿金等具体数额计算问题。1.金陵石化研究院《2006年奖金发放办法》第8条等，销售提成奖金统一按除税后销售毛利（销售额-
直接成本-
销售成本）的9%提成，“销售成本”应作“销售费用”理解，将单某确认的2010年6月10日其工作人员手书的数据代入该条销售提成奖金计算公式，按照毛利率40%，即可计算出杨秀全被克扣的销售提成为809529.77元。2.《劳动合同法》自2008年1月1日施行，劳动部《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》第三条规定，用人单某克扣工资除应全额支付工资报酬外，还需加发相当于工资报酬百分之二十五的经济补偿金。加发经济补偿金的时间段为2007年1月至2007年12月31日计12个月，以共计17个月销售提成奖金809529.77元，计算出每月平均销售提成为基数，乘以12个月，再乘以25%，因此，应加发经济补偿金为142222.90元。3.2008年4月起，金陵石化研究院拒发杨秀全每月1000元底薪工资，直到2008年8月4日杨秀全被迫辞职，共计4个月零3天，依据《劳动合同法》第三十条的规定，金陵石化研究院应支付底薪工资4100元。原审法院仅支持3000元，计算错误。4.根据相关法律法规的规定，杨秀全属于被迫解除劳动合同的情形，单某应当支付劳动报酬和经济补偿金，并可以支付赔偿金。杨秀全解除劳动合同前12个月平均工资为32746.27元{［（809529.77元÷17个月＋1000元／月）×8个月＋1000元／月×4个月］÷12个月}。针对《劳动合同法》实施前后的不同规定，杨秀全1997年8月至2007年12月31日经济补偿金为360208.97元（32746.27元／月×11个月），2008年1月1日至8月3日经济补偿金为8976.99元（2992.33元／月×3倍×1个月），总计经济补偿金应为369185.96元，额外经济补偿金为180104.49元（369185.96元×50%）。5.原审判决扣除31600元不当。首先，该款与本劳动争议无关，且杨秀全实际上不欠该款，该款所涉及的材料是金陵石化研究院有关负责人胁迫杨秀全写的；其次，金陵石化研究院并未提出反诉；再次，金陵石化研究院主张偿还，已过时效。综上所述，金陵石化研究院克扣杨秀全销售奖金提成、底薪、经济补偿金等具体数额为1505143.12元，扣除已预提的66000元，尚欠付1439143.12元。请求依法改判金陵石化研究院支付杨秀全1439143.12元。
金陵石化研究院辩称：（一）杨秀全主张1439143.12元销售提成没有事实和法律依据。杨秀全个人已领取了预提的奖金66000元和在销售过程中产生的报销业务费40余万元。（二）杨秀全在做业务过程中曾经侵占公司18万余元款项，归还后还剩余3万余元，有其个人作出书面说明为证。（三）关于杨秀全主张的4000元工资问题，自2008年4月后，杨秀全就未到公司上班，在杨秀全未提供劳动的情况下，公司不应发放工资。经过核算，杨秀全在2007年1月至2008年4月期间应得提成为8357.9元，由于还欠公司31600元，冲抵之后，杨秀全还应归还公司23242.1元。因此，请求驳回杨秀全的上诉请求。
金陵石化研究院上诉称：（一）关于本案时效问题。杨秀全在2008年8月份的辞职书中已表明“权利受到侵害”，但直到2012年9月才申请劳动仲裁，虽然其申请证人到庭作证，但证人吕某系杨秀全配偶，证人侯某系其丈母娘，上述证人证言显然缺乏证明力。证人黄某的证言未涉及杨秀全辞职后至2010年前讨要销售提成的事实，前期二审开庭时，杨秀全申请证人梅某、史某到庭作证，该两证人与单某之间已产生劳动争议诉讼，其证言不足以采信。根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条等规定，原审法院在明知相关证人与本案有利害关系，且无其他证据相互印证时效中断的情况下，作出杨秀全提起劳动争议仲裁未超过时效的认定，与事实相悖。（二）杨秀全长期侵占单某货款31600元不归还，严重违反单某管理制度，应追究其法律责任。其为逃避法律责任在2008年8月提出辞职，依法不应支付经济补偿金。（三）关于销售提成问题，金陵石化研究院认为，没有任何证据证明杨秀全难以区分销售成本与销售费用的情形，相反，杨秀全受到高等教育，长期从事销售业务工作，知晓双方之间多年来所形成的销售提成计算惯例。对格式条款的理解发生歧义时，首先应按通常的理解予以解释。《2006年奖金发放办法》括号中的“销售成本”，杨秀全决不会理解成“报销费用”或“销售费用”。（四）2006年期间的销售提成，其与杨秀全之间已经结清。其在支付杨秀全2006年提成时，按照2006年奖金发放办法第8条的规定，除提成的比例与2005年不同外，其余计算方式完全相同。其提交的核算表证明杨秀全报销的费用已经在提成奖金中扣除，杨秀全对此扣除的报销费从未提出异议，杨秀全是认可双方2006年计算方式的，也清楚知晓销售成本的用语是用以计算毛利的方法，而不是指减去销售人员个人产生的报销费用。既然2006年的销售提成已实际履行完毕，双方之间的权利义务关系已经终止。本案中杨秀全主张的是2007年的销售提成奖金，如果再引用2006年相关条款缺乏事实和法律依据。（五）2007年销售提成奖金发放办法是董事会决议作出的，也是基本按照2006年的办法考核兑现，因此杨秀全2006年的销售提成奖金计算方式当然成为2007年的计算依据。之前历年预提费用都是在计算销售提成奖之后扣除，2007年的销售提成奖金也应当照此执行。本案中，杨秀全2007年-2008年5月销售提成的计算方式如下：杨秀全回款金额减去平均生产成本其税后毛利是5628069×9%的提成比例减去预提的销售奖66000元，减去报销费432168.3元，杨秀全2007年至2008年期间实际销售提成奖金是8357.9元。由于杨秀全目前侵占公司货款31600元，故其还应该返还公司23242.1元。（六）2006年奖金发放办法与2005年基本相同，不同点在于2006年取消了新老客户的差别，统一按照税后毛利的9%提成。括号内的内容（销售额-
直接成本-
销售成本）是对毛利产生的形式做了批注，其中销售成本直接影响毛利的多少。销售成本是企业在营销活动中的一个专用术语，理论上和财务制度上都与销售费用、业务报销费无关联，销售成本与销售费用是不同概念。一审法院认为销售额减去直接成本，扣除销售成本，改变了2005年的规则，会导致直接成本重复扣除不正确，销售成本和直接成本是产品不同阶段的成本，因此分别扣除不会导致重复。（七）杨秀全自从事销售工作以来发生的业务报销费用，一直都是在计算销售提成奖金后扣除。此前双方没有任何异议。双方申请到庭的证人也证明销售提成的计算方式与公司所述一致，而杨秀全所述的计算提成方式没有任何证据证明。原审判决金陵石化研究院支付杨秀全销售提成467614.53元明显错误。（八）杨秀全2008年5、6、7三个月旷工，依法不应当享受三个月工资。综上，请求查明事实，依法改判驳回杨秀全的所有诉讼请求。
针对金陵石化研究院的上诉，杨秀全辩称：（一）关于仲裁时效问题，根据相关规定，如果劳动者提出请求，单某没有以书面形式明确拒绝，就不受时效限制。事实上，在辞职报告中包括辞职后，杨秀全都提出了工资、奖金和提成的主张，为此已提供了充分的证据。杨秀全每次去主张权利，中间间隔都不超过一年，而单某总是拖延，说暂时没法计算，因此才拖了下来。（二）金陵石化研究院一直在回避其应承担的责任，其所说的销售费用40余万元，没有证据证明。单某称杨秀全侵占单某18万元，也没有依据。（三）金陵石化研究院提出杨秀全2008年4月后没有上班，事实是，单某非法剥夺杨秀全的劳动权利，且单某的考勤表是伪造的。综上，请求驳回金陵石化研究院的上诉请求。
本院审理期间，双方当事人均未提供新的证据，且对原审认定的事实不持异议，本院对原审认定的事实予以确认。同时，金陵石化研究院认为遗漏了以下事实：1.其一审提交了2005年、2006年销售提成方式和表格，但一审未表述。2.杨秀全申请的证人梅某在作证时也曾陈述业务员销售提成的方式，与单某主张的提成方式一致。
本案的争议焦点主要为：1.杨秀全的主张有无超过仲裁时效；2.本案中涉及的销售提成计算方式问题；3.销售毛利润率的标准问题；4.2008年5月至8月杨秀全是否旷工问题；5.杨秀全的离职原因；6.31600元款项在本案中一并处理有无不当问题。
本院认为，劳动者与用人单某的合法权益均应受到法律的保护。关于本案第一个争议焦点，《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条第一、二款规定：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。该仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。本案中，杨秀全离职时即向金陵石化研究院书面提出要求支付业务提成、工资、经济补偿金等，多名证人亦证实杨秀全离职以后多次向金陵石化研究院主张相关权利，中间间隔从未超过一年，而金陵石化研究院均未书面明示拒绝，因此，金陵石化研究院关于杨秀全的主张超过仲裁时效的上诉意见，本院不予采纳。
关于第二个争议焦点，即本案中涉及的销售提成计算方式问题。本院认为，2005年《销售部考核办法》规定：专职销售人员底薪为每月1000元；按除税后销售差价（产品销售价-
产品原料成本）的一定比例作为提成，扣除各项销售费用后作为销售奖励。货物运费不在销售费用中，进入相应产品成本。新客户按除税后销售利润的11%提成，老客户按8%提成。《2006年奖金发放办法》规定：销售部的奖励办法基本与2005年该部门奖励办法相同，取消新老客户差别，统一按除税后销售毛利（销售额-
直接成本-
销售成本）的9%提成。可见，2006年的销售提成方式是将销售额扣减直接成本后再扣减销售成本，之后按一定比例计算提成，此与2005年销售提成办法即产品销售价扣减产品原料成本后按一定比例计算提成相比，规则明显发生变化。直接成本是直接用于生产过程的各项费用，即生产某种产品或提供某项服务时支付的直接费用，如原材料、人员工资支出等。销售成本是指已销售产品的生产成本或已提供劳务的劳务成本以及其他销售的业务成本。对于《2006年奖金发放办法》所规定的提成计算方式，双方当事人理解不一。原审法院认为，杨秀全非专业财会人员，难以区分销售成本与销售费用，而该规则由金陵石化研究院单方制定，在双方当事人发生歧义的情况下，应作出有利于杨秀全的的解释。同时，按照金陵石化研究院的解释，应比照2005年的提成规则，按一定比例计算提成，再扣除各项销售费用后作为销售奖励，但由于2006年的提成规则并未对按比例计算提成后另行扣除销售费用作出明确规定，因此，金陵石化研究院的上述理解亦不具有相应的合理性。原审的认定具有相应的事实与法律依据。
关于第三个争议焦点，即销售毛利率的标准问题。杨秀全主张销售毛利率为40%，而金陵石化研究院主张为23.88%。金陵石化研究院的主张与2007年审计报告载明的主营业务利润率相近，且金陵石化研究院提供的原材料发票等证据可以大致印证其主张的合理性。而杨秀全主张的毛利率只考虑了原料成本，不具有相应的合理性。杨秀全提供的林棕棕销售并不能全面反映销售毛利率的客观情况。原审法院在向杨秀全作了释明的情况下，杨秀全仍不提出对金陵石化研究院的财务进行司法审计鉴定，其应承担相应的法律后果。因此，原审法院最终认定销售毛利润率为23.88%，事实与法律依据充分。
关于本案的第四个争议焦点，即2008年5月至8月杨秀全是否旷工的问题。用人单某应当对劳动者的出勤情况承担举证责任，金陵石化研究院提供的考勤表无劳动者签字确认，杨秀全于2008年8月4日向金陵石化研究院递交解除劳动关系通知书，以金陵石化研究院拒发2008年4月至今的工资等为由，决定自2008年8月4日起解除双方之间的劳动合同关系，因此，不能认定杨秀全2008年4月至8月旷工的事实。原审法院判决金陵石化研究院补发杨秀全2008年5月、6月、7月的工资共计3000元，符合法律规定。
关于本案的第五个争议焦点，即31600元款项在本案中一并处理有无不当问题。因为杨秀全于2008年5月写给金陵石化研究院的材料中认可自己通过延交货款抵业务提成，其已还金陵石化研究院15万元，尚余31600元，原审法院在本案金陵石化研究院应支付的业务提成中扣除该笔尚欠的款项，并无不当。
关于经济补偿金问题，《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条第一款第（二）项、第四十六条第（一）项规定，用人单某未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以解除劳动合同，并主张经济补偿金。因金陵石化研究院扣发杨秀全工资，并欠付业务提成，杨秀全以此为由解除合同，金陵石化研究院应当依法支付经济补偿金。原审判决金陵石化研究院支付杨秀全经济补偿金具有相应的事实与法律依据，本院予以维持。
综上，杨秀全与金陵石化研究院的上诉理由均不能成立，对其上诉请求，本院均不予支持。原审判决认定事实清楚，适用法律正确。依照《中华人民共和国民事诉讼法》第一百七十条第一款第（一）项之规定，判决如下：
驳回上诉，维持原判。
二审案件受理费10元，本院予以免收。
本判决为终审判决。
审判长 陈传胜
审判员 毕艳红
审判员 孙 军
二〇一四年十月二十九日
书记员 尹 琪