Ang pinakamahalagang kayamanan ng museo ay ang mga labi ng Luzia Woman , ang mount fossil ng Maxakalisaurus , at ang koleksyon ng Pompeii frescos ; ang gusali mismo ay nakalista sa mga ito bilang numero 6 , na binabanggit ang mga neokolonyal na elemento , ang kolonyal na kasaysayan nito at ang personal na extension ng pamilya ng hari ng mga Portuges , at ang kasaysayan ng imperyo pagkatapos ng kalayaan.
