Ito ay nabuo noong 1993 kaalinsunod ng isang repormang pang @-@ unibersidad na kung saan nahati ang pinakamatandang unibersidad sa banda , ang Unibersidad ng Yaounde , sa dalawang magkahiwalay na mga entidad : ang Unibersidad ng Yaounde I at Unibersidad ng Yaounde II.
