Maaaring malawakang paghiwalayin sa dalawang uri ang mga mikroskopyo : ang mga mikroskopyong ginagamitan ng teoriyang optiko ( may mga salaming @-@ lente na kumikinabang sa paggamit ng liwanag ) , at ang mga mikroskopyong paniktik ( mga mikroskopyo para sa pangmalawakang mapanghimasok at mapang @-@ tiktik na pagsusuri at pananaliksik o tinatawag sa wikang Ingles bilang mga scanning probe microscope ).
