நிறமாலையிலிருந்து எடுக்கப்பட்ட அளவுருக்கள், முக்கியமாக NOESY குறுக்கு-சிகரங்கள் மற்றும் இணைப்பு மாறிலிகள் , கிளைகோசிடிக் பிணைப்பு கோணங்கள், டைஹெட்ரல் கோணங்கள் ( கார்ப்ளஸ் சமன்பாட்டைப் பயன்படுத்தி ) மற்றும் சர்க்கரை பக்கர் இணக்கங்கள் போன்ற உள்ளூர் கட்டமைப்பு அம்சங்களைத் தீர்மானிக்கப் பயன்படுத்தலாம் . பெரிய அளவிலான கட்டமைப்பிற்கு, இந்த உள்ளூர் அளவுருக்கள் பிற கட்டமைப்பு அனுமானங்கள் அல்லது மாதிரிகளுடன் கூடுதலாக வழங்கப்பட வேண்டும், ஏனெனில் இரட்டை ஹெலிக்ஸ் கடக்கப்படும்போது பிழைகள் சேர்க்கப்படுகின்றன, மேலும் புரதங்களைப் போலல்லாமல், இரட்டை ஹெலிக்ஸ் ஒரு சிறிய உட்புறத்தைக் கொண்டிருக்கவில்லை மற்றும் அதன் மீது மீண்டும் மடிக்காது. வளைந்த ஹெலிஸ்கள் , வாட்சன்-கிரிக் அல்லாத அடிப்படை இணைத்தல் மற்றும் கோஆக்சியல் ஸ்டேக்கிங் போன்ற தரமற்ற வடிவவியலை ஆராய்வதற்கும் NMR பயனுள்ளதாக இருக்கும். ஸ்டெம்-லூப்கள் மற்றும் சூடோநாட்கள் போன்ற சிக்கலான இணக்கங்களை ஏற்றுக்கொள்ளும் இயற்கை RNA ஒலிகோநியூக்ளியோடைடுகளின் கட்டமைப்பை ஆராய்வதில் இது குறிப்பாக பயனுள்ளதாக உள்ளது . நியூக்ளிக் அமில மூலக்கூறுகளை புரதங்கள் அல்லது மருந்துகள் போன்ற பிற மூலக்கூறுகளுடன் பிணைப்பதை ஆராய்வதற்கும் NMR பயனுள்ளதாக இருக்கும் , மற்ற மூலக்கூறின் பிணைப்பில் எந்த அதிர்வுகள் மாற்றப்படுகின்றன என்பதைப் பார்ப்பதன் மூலம்.  
**கார்போஹைட்ரேட்டுகள்**  
கார்போஹைட்ரேட் NMR நிறமாலையியல், கார்போஹைட்ரேட்டுகளின் அமைப்பு மற்றும் இணக்கம் குறித்த கேள்விகளுக்கு பதிலளிக்கிறது . 1H NMR மூலம் கார்போஹைட்ரேட்டுகளின் பகுப்பாய்வு, செயல்பாட்டுக் குழுக்களில் உள்ள வரையறுக்கப்பட்ட மாறுபாடு காரணமாக சவாலானது, இது NMR நிறமாலையின் குறுகிய பட்டைகளில் குவிந்துள்ள 1H அதிர்வுகளுக்கு வழிவகுக்கிறது. வேறு வார்த்தைகளில் கூறுவதானால், மோசமான நிறமாலை சிதறல் உள்ளது. அனோமெரிக் கார்பன்கள் இரண்டு ஆக்ஸிஜன் அணுக்களைத் தாங்குவதால் அனோமெரிக் புரோட்டான் அதிர்வுகள் மற்றவற்றிலிருந்து பிரிக்கப்படுகின்றன. சிறிய கார்போஹைட்ரேட்டுகளுக்<nowiki/>கு, அனோமெரிக் புரோட்டான் அதிர்வுகளின் சிதறல், தனிப்பட்ட கார்போஹைட்ரேட் எச்சங்களின் முழு சுழல் அமைப்புகளையும் ஆராய 1D TOCSY சோதனைகளைப் பயன்படுத்துவதை எளிதாக்குகிறது.  
**மருந்து கண்டுபிடிப்பு**  
கரைசலில் உள்ள சிறிய மூலக்கூறுகளின் ஆற்றல் மினிமா மற்றும் சுழற்சி ஆற்றல் தடைகள் பற்றிய அறிவை NMR ஐப் பயன்படுத்திக் காணலாம், எ.கா. இலவச லிகண்ட் இணக்க விருப்பத்தேர்வுகள் மற்றும் இணக்க இயக்கவியல் ஆகியவற்றை முறையே பார்ப்பது. சோதனை மற்றும் கணக்கிடப்பட்ட மதிப்புகள் ஒப்பிடத்தக்கவை என்பதால், மருந்து வடிவமைப்பு கருதுகோள்களை வழிநடத்த இதைப் பயன்படுத்தலாம். எடுத்துக்காட்டாக, அஸ்ட்ராஜெனெகா அதன் புற்றுநோயியல் ஆராய்ச்சி மற்றும் மேம்பாட்டிற்காக NMR ஐப் பயன்படுத்துகிறது.  
**உயர் அழுத்த NMR நிறமாலையியல்**  
NMR சோதனைகளில் அழுத்தத்தை மாறி அளவுருவாகப் பயன்படுத்துவதற்கு அர்ப்பணிக்கப்பட்ட முதல் அறிவியல் படைப்புகளில் ஒன்று, 1994 ஆம் ஆண்டு "ஆண்டு மதிப்பாய்வு ஆஃப் பயோபிசிக்ஸ்" இதழில் வெளியிடப்பட்ட ஜே. ஜோனாஸின் படைப்பு ஆகும். NMR நிறமாலையியல் ஆய்வில் உயர் அழுத்தங்களைப் பயன்படுத்துவது முதன்மையாக உயிர்வேதியியல் அமைப்புகளைப் படிக்கும் விருப்பத்தால் இயக்கப்படுகிறது, அங்கு உயர் அழுத்த<nowiki/>த்தின் பயன்பாடு குறிப்பிடத்தக்க இடையூறுகள் இல்லாமல் மூலக்கூறு இடைவினைகளில் கட்டுப்படுத்தப்பட்ட மாற்றங்களை அனுமதிக்கிறது.  
நிச்சயமாக, உயர் அழுத்த NMR நிறமாலையியல் பயன்படுத்தி அறிவியல் சிக்கல்களைத் தீர்க்க முயற்சிகள் மேற்கொள்ளப்பட்டுள்ளன. இருப்பினும், உயர் அழுத்தத்தை உருவாக்குவதற்கும் பராமரிப்பதற்கும் உபகரணங்களின் சிக்கல் காரணமாக அவற்றில் பெரும்பாலானவை இனப்பெருக்கம் செய்வது கடினமாக இருந்தது. இல் உயர் அழுத்த NMR சோதனைகளை உணர்தலுக்கான மிகவும் பொதுவான வகையான NMR செல்கள் கொடுக்கப்பட்டுள்ளன.  
உயர் அழுத்த NMR நிறமாலையியல் பல்வேறு பயன்பாடுகளுக்கு பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது, முக்கியமாக புரத மூலக்கூறுகளின் கட்டமைப்பின் தன்மையுடன் தொடர்புடையது. இருப்பினும், சமீபத்திய ஆண்டுகளில், ஒரு சூப்பர் கிரிட்டிகல் திரவ சூழலில் சிறிய மூலக்கூறுகளின் வேதியியல் மற்றும் இடஞ்சார்ந்த கட்டமைப்புகளை வகைப்படுத்த மென்பொருள் மற்றும் வடிவமைப்பு தீர்வுகள் முன்மொழியப்பட்டுள்ளன, அத்தகைய மாற்றங்களுக்கு உந்து சக்தியாக நிலை அளவுருக்களைப் பயன்படுத்துகின்றன.