சைலஸால் (த டீச்சர் என்று மட்டும் அறியப்படும் ஒருவருக்கு பதிலாக வருபவர்) கொலை செய்யப்பட்ட பிரையரி ஆஃப் சீயோனின் முக்கியத் தலைவரான ஜாக்கியூஸ் சானியரின், (அந்த நேரத்தில் யாருக்கும் தெரியப்படாமல்) கொலையில், பரிசுத்த கிரெயிலுக்கு வழிகாட்டும் கருப்பொருளான " திறவுகோல் கல்"லின் இருப்பிடத்தை பிடிப்பதாகக் கதை தொடங்குகிறது. சானியர் தன் உடலிலும் அருகிலும் விட்டுச்சென்ற குறியீடை கண்டுபிடிக்க உதவ கொலை நடந்த இடத்திற்கு பாரீசில் பேருரை ஆற்ற வந்திருக்கும் ராபர்ட் லாங்டனை போலீஸ் அழைக்கிறது. லாங்டன் தான் கொலையின் முக்கிய குற்றவாளியாக இருப்பார் என தலைமை துப்பறிவாளர், பிஜு பேச் சந்தேகப்படுகிறார்.  
போலீஸ் குறிகண்டறியும் துப்பறிவாளராக சோபி நிவியூ கொலைச் சம்பவ இடத்திற்கு வருகையில் லாங்டன் மீது நம்பிக்கை கொள்கிறார். ஜாக்கியூஸ் சானியர் நிவியூவின் தாத்தா ஆவார். நார்மாண்டியில் உள்ள அவர்களது வீட்டிற்கு நிவியூ, விடுதி பள்ளியில் இருந்து விடுமுறைக்கு திடீர் பயணம் சென்ற போது, அவருக்கு (ஹைரோஸ் காமோஸ்) எனப்படும் பேகன் பாலியல் சடங்கில் தொடர்பு இருப்பது தெரியவந்தது. அது வரை இருவரும் ஒற்றுமையாகத்தான் இருக்கின்றனர். (அவர் உணர்ந்தவை கதை முழுவதும் பலமுறை குறிப்பிடப்பட்டு எடுத்துரைக்கப்பட்டுள்ளது, ஆனால், அவர் எதைப் பார்த்தாரோ அதனை கதையின் முடிவுக்கு அருகில் ராபர்ட்டிடம் சொல்லும் வரை யாருக்கும் தெரியப்படுத்தப்படவில்லை).  
சானியரின் உடலுக்கு அருகில் லாங்டனும் நிவியுவும் ஒரு மறைக்கப்பட்ட சூன்யத்தைக் கண்டுபிடிக்கிறார்கள். இந்த ரகசியங்கள் இரண்டாவதாக உள்ள ரகசியங்களின் தொகுப்பு ஒன்றுக்கு வழிவகுக்கிறது. தன் தாத்தாவின் ரகசியங்களைக் கண்டறிகையில், நிவியு ரகசியத் திறவுகோளை கொண்ட பெயிண்டிங்கைப் பார்க்கிறார், அந்த திறவுகோளுக்கு பின் பிரையரி ஆஃப் சீயோனுக்குரிய முகவரியும் சின்னங்களும் இருப்பதையும் பார்க்கிறார்கள். இணைந்து செயல்பட்டு, லாங்டனும் நிவியுவும் போலீஸை ஏமாற்றி, அவ்விடத்தில் இருந்து வெளியேறி திறவுகோளின் ரகசியத்தைக் கண்டறியச் செல்கிறார்கள்.  
ஜூரிக்கில் உள்ளா டெபாசிட்டரி வங்கியின் பாரிஸ் கிளையில் உள்ள பாதுகாப்பு வைப்புப் பெட்டியின் திறவுகோளைத் திறக்கிறது. வங்கியில் உள்ள சானியரின் கணக்கு எண்ணில் முதல் எட்டு எண்கள் ஃபிபோனாக்சி எண்களாக உள்ள 10-இலக்க எண்ணைக் காட்டுகின்றது: 1 1 2 3 5 8 13 21  
பாதுகாப்பு வைப்புப் பெட்டியின் உள்ளே ஒரு பெரிய கிரிப்டெக்சாக உள்ள திறவுகோள் கல் ஒன்றைக் காண்கிறார்கள், அது ரகசிய செய்திகளை பரப்புவதற்காக லியோனார்டோ டா வின்சியால் கண்டறியப்பட்ட ஒரு உருளைபோல் உள்ளது. அதனை திறப்பதற்கு சுற்றக்கூடிய கருவிகளின் பொருத்தத்தை சரியான வரிசையில் அமைக்க வேண்டும். கிரிப்டெக்ஸை வலுக்கட்டாயமாக திறந்தால் உள்ளே பொதித்து வைக்கப்பட்ட வினிகரின் குழல் ஒன்று உடைந்து கசிந்து பாபிரஸின் மேல் எழுதி வைக்கப்பட்டிருக்கும் செய்தியை அழித்துவிடும். பெரிய கிரிப்டெக்ஸை கொண்டுள்ள ரோஸ்வுட் பெட்டியில் கிரிப்டெக்ஸின் ரகசியங்கள் கொண்ட பொருத்தமும் அடங்கியிருக்கும், அது லியானோர்டாவின் குறிப்புகளில் எழுதப்பட்ட அதே முறையில் பின்னோக்கிய எழுத்துரை அமைக்கப்பட்டிருந்தது.  
துப்பாக்கி முனையில் சைலசிடம் சானியர் கூறிய விதிமுறைகள் அப்பட்டமான பொய்யாகும், அதாவது புனித சல்பைசின் ஆலயத்தில் திறவுகோல் கல் புதைக்கப்பட்டதாகவும், அது பழங்கால "ரோஸ்-லைனுக்கு" (கிரீன்விச் மறு அமைப்பு செய்யப்படுவதற்கு முன் பாரீஸ் வழியாக கடந்து சென்ற பழைய பிரைம் மெரிடியன்) மிக அருகில் உள்ள நான்கு முனை கோபுரத்துக்கு அருகில்) உள்ளதாகக் கூறப்பட்டது. நான்கு முனை கோபுரத்துக்கு அருகில் உள்ள செய்தியில் யோபு புத்தகத்தின் (38:11அ)வில் உள்ளதைக் குறிப்பதாக குறிப்பிடப்பட்டிருந்தது, அதாவது "இம்மட்டும் வா, மிஞ்சி வராதே" என்பதாகும். (KJV) சைலஸ் இதனைப் படிக்கையில், அவன் ஏமாற்றப்படுவதாக உணர்கிறான்.  
போலீசால் இன்னும் துரத்தப்பட்டாலும், லாங்டனும் நிவியுவும் திறவுகோல் கல்லை எடுத்துக் கொண்டு சார் லீ டீபிங் (பரிசுத்த கிரெயில் பற்றிய நிபுணரும் லாங்டனின் நண்பர்) என்பவரிடம் சென்றனர். டீபிங்கின் தனியார் விமானத்தில் பறந்தபடி, கிரிப்டெக்ஸை எப்படி திறப்பது என்பதை கண்டுபிடித்தார்கள், ஆனால் அந்த பெரிய கிரிப்டெக்சில் இரண்டாவது சிறிய கிரிப்டெக்ஸ் அடங்கியிருந்தது, அதில் அதன் பொருத்தம் அடங்கிய இரண்டாவது புதிர் தெரியவந்தது. "ஒரு போப்பின் காவலாளி குறுக்கிடும்" கல்லறையின் மீது இருக்கும் விண்மீனைக் கண்டடையும்படி புதிர் சொல்கிறது, அது வரலாற்று இடைக்கால போர்வீரனைக் குறிக்கவில்லை, ஆனால் வெஸ்ட்மின்ஸ்டர் அபேயில் புதைக்கப்பட்டுள்ள சர் ஐசக் நியூட்டனின் கல்லறையைக் குறிக்கிறது, அது அலெக்சாண்டர் போப்பால் (A. போப்) இறங்கல் புகழுரை பெற்றதாகும்.  
பின்னர் டீபிங் ஜாக்கியூஸ் சானியரைக் கொல்ல சைலசை அனுப்பிய அந்த டீச்சர் என்பது தெரியவருகிறது, அவரிடம் பிரையரி ஆஃப் சீயோனின் தலைவர்களின் அடையாளங்கள் தொடர்பான தகவல் அவரிடம் இருப்பதாகவும், அவர் தான் அவர்களது அலுவலகங்களை வேவு பார்த்து அவர்களைக் கொல்ல சைலசை நியமித்ததாகவும் தெரியவருகிறது. ரெமி அவருடைய ஒருங்கிணைப்பாளர். தன் அடையாளத்தை மறைத்து கிரெயிலைக் கண்டுபிடிக்க பிஷப் ஆரிங்கரோசாவிடம் தொடர்பு கொண்டு அந்த திட்டத்துக்கு பண உதவி செய்ததும் டீபிங் தான். ஆரிங்கரோசாவிடம் கிரெயிலைக் கொடுக்க வேண்டும் என்ற எண்ணமே இல்லை, ஆனால் அதனைக் கண்டுபிடிக்க ஓபஸ் டீயின் தீர்வைப் பயன்படுத்திக் கொள்கிறார். நியமிக்கப்பட்ட நேரத்தில் கிரெயிலின் ரகசியத்தை உலகுக்கு வெளியிடும் உறுதியை பிரையரி ஆஃப் சீயோன் முறித்துவிட்டதாக டீபிங் நம்புகிறார். கிரெயிலின் ஆவணங்களை திருடுவதற்கு திட்டமிட்டு தானே உலகுக்கு வெளிப்படுத்திவிடத் திட்டமிடுகிறார். லாங்டனும் சோபி நிவியுவும் அவருடைய வீட்டில் இருப்பதாக சைலசிடம் அவர் தான் தகவல் தருகிறார். தன் அடையாளத்தை வெளிப்படுத்த வேண்டாம் என நினைத்ததால் அவர்களிடம் இருந்து திறவுகோள் கல்லை பறித்துக் கொள்ளவில்லை. அவருடைய வீட்டில் வைத்து திறவுகோல் கல்லை பறிக்கும்படி சைலசை கேட்டுக் கொண்டார், ஆனால் கிரிப்டெக்ஸ் குறியீட்டைக் கண்டறிய லாங்டன் மற்றும் சோபியின் உதவி தேவை என்பதால் அவரே சைலசின் ஆர்வத்தை நிறுத்தி வைக்கிறார். அதன் தொடர்ச்சியாக, வங்கியில் இருந்து தப்பிக்கையில் லாங்டன் திருடிவந்த பின்தொடர் கருவியின் மூலம் கண்டுபிடித்து வீட்டைச் சோதனையிட போலீஸ் வருகிறது. லண்டனின் டெம்பிள் சர்ச்சுக்கு நிவியூவையும் லாங்டனையும் அழைத்துச் சென்றார் டீபிங், அதில் மேற்கொண்டு செல்ல வழியில்லை என்பதை அறிந்திருந்தும், ரெமி மூலம் திறவுகோல் கல்லை கடத்திப் பெற்றுக்கொண்டு, அதன் மூலம் லாங்டன் மற்றும் நிவியுவிடம் தன் நிஜப் பாத்திரத்தை வெளிப்படுத்தாமலும் இருக்கலாம் என முயற்சிக்கிறார்.  
தன் செயல்பாடுகளின் தடம் அனைத்தையும் அழிக்க, ரெமிக்கு கடலைப் பருப்புகளில் கடுமையான ஒவ்வாமை இருப்பது தெரிந்தும், பிரான்சு நாட்டு போதைப் பொருளான காக்னக் கலந்த கடலைப் பருப்பு பொடியை ரெமிக்கு கொடுத்து அவனைக் கொல்கிறார் டீபிங். அதனால் காப்புப் பிறழ்ந்த அதிர்ச்சியால் ரெமி இறக்கிறான். தன் அடையாளத்தை மறைத்தபடி ஓபஸ் டீயின் லண்டன் தலைநகரில் சைலஸ் ஒழிந்திருப்பதாக போலீசுக்கு தகவல் டெரிவிக்கிறார் டீபிங்.  
வெஸ்ட்மினிஸ்டர் அபேயில் டீபிங் உடனான சச்சரவின் காரணமான சந்தேகத்தை அடுத்து, டீபிங் முன்பு அழிப்பதற்கு முன் இரண்டாவது கிரிப்டெக்ஸை ரகசியமாக பிரித்து அதற்குள் இருப்பவற்றை அகற்றிவிடுகிறார், லாங்டன். இரண்டாவது கிரிப்டெக்ஸ் மற்றும் கிரெயிலின் இரண்டாவது இருப்பிடத்தை பற்றிய உள்ளிருந்தவற்றைப் பற்றி தன்னிடம் சொல்லும்படி வீணாகக் கெஞ்சிக் கொண்டிருக்கையில், டீபிங் கைது செய்யப்பட்டு அங்கிருந்து அழைத்துச் செல்லப்பட்டார்.  
பிஷப் ஆரிங்கரோசா தன் தவறை ரகசியமாக அழைத்து சொன்னபின் நிவியுவும் லாங்டனும் நிரபராதிகள் என்பதை அறிந்து கொள்கிறார், பெசு பேக். நிவியுவையும் லாங்டனையும் கைது செய்வதற்கான வாரண்டுகளை ரத்து செய்கிறார் ஃபேக்.  
ஓபஸ் டீயின் லண்டன் தலைமையிடத்துக்கு வெளியே போலீசிடம் இருந்து தப்புகையில் ஆரிங்கரோசாவை தெரியாமல் சைலஸ் சுட்டுவிடுகிறான். தன்னைப் போல் வேடமிட்டு செய்யப்பட்ட மாபெரும் தவறை உணர்ந்து, பிரையரி ஆஃப் சீயோனின் கொலை செய்யப்பட்ட தலைவர்களின் குடும்பங்களுக்கு தன் பெட்டியில் இருந்த ஈட்டுப் பத்திரங்களை கொடுத்துவிடும்படி பெசு ஃபேக்கிடம் ஆரிங்கரோசா சொல்கிறார். மரணக் காயங்களின் காரணத்தால் இறந்து போகிறான் சைலஸ்.  
டேவிட்டின் நட்சத்திரத்தின் கீழ் தரையில் (இரு இடைக்குறுகிடும் முக்கோணங்களான "கத்தி" மற்றும் கிண்ணம்," அதாவது., ஆண் மற்றும் பெண் சின்னங்கள்) கிரெயில் ஒரு காலத்தில் புதைக்கப்பட்டிருந்தாலும், இரண்டாவது திறவுகோல் கல்லில் இருந்த இறுதிச் செய்தி ரோஸ்லின் சேப்பலைக் குறிக்கவில்லை.  
ரோஸ்லின் சேப்பலின் டோசன்டாக இருப்பது சோஃபியின் நெடுநாளாக காணாமல் போன சகோதரன். குழந்தையாக இருக்க்கையில் ஒரு கார் விபத்தில் தன் பெற்றோர்கள் மற்றும் பாட்டியுடன் பலியாகிவிட்டதாக சோஃபிக்கு சொல்லப்பட்டிருந்தது.  
ரோஸ்லின் சாப்பலின் காப்பாளராக இருப்பது நெடுநாட்களாக காணாமல் போயிருந்த சோஃபியின் பாட்டியான மேரி சாவல், அவர்தான் ஜாக்கியூஸ் சானியரின் மனைவி. அவர் தான் ஜாக்கியூஸ் சானியருடன் பாலியல் சடங்கில் பங்கேற்ற அந்த பெண்மணி. அதோடு சோஃபி இயேசு கிறிஸ்து மற்றும் மகதலேனா மரியாளின் சந்ததியில் தோன்றியவர் என்றும் தெரிவிக்கப்படுகிறது. அவருடைய உயிருக்கு ஏற்படக்கூடிய அச்சுறுத்தல்களில் இருந்து பாதுகாக்கும்படி பிரையரி ஆஃப் சீயோன் அவரைப் பற்றிய அடையாளங்களை மறைத்து விட்டது.