# อันดับสถาบันอุดมศึกษาในประเทศไทยโดยสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา
การจัดอันดับสถาบันอุดมศึกษาในประเทศไทยโดยสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา (สกอ.) จัดทำขึ้นเมื่อวันที่ 31 สิงหาคม พ.ศ. 2549 ในการจัดทำอันดับมหาวิทยาลัยรัฐ โดยมีมหาวิทยาลัยเข้าร่วม 50 มหาวิทยาลัย และมหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์เป็นมหาวิทยาลัยเดียวที่เข้าร่วมแต่เสนอว่าไม่ต้องการอยู่ในอันดับ และมหาวิทยาลัยเอกชนไม่ได้ร่วมด้วยเนื่องจากสมาคมสถาบันอุดมศึกษาเอกชนแห่งประเทศไทยแจ้งว่ายังไม่ให้ข้อมูลในปีนั้น

การจัดอันดับนี้ใช้ชื่อว่า "โครงการฐานข้อมูลออนไลน์เพื่อประเมินศักยภาพของมหาวิทยาลัยไทย" ได้แบ่งหัวข้อการจัดอันดับออกเป็น 2 ส่วนหลักคือ ด้านการวิจัย และ ด้านการเรียนการสอน ได้จัดทำออกเป็น 2 ส่วนย่อยคือ อันดับในภาพรวมแบ่งแยกตามมหาวิทยาลัยแบ่งออกเป็นกลุ่ม และอันดับแบ่งแยกย่อยในแต่ละสาขาวิชา โดยแบ่งออกเป็น 7 สาขาวิชาย่อย ได้แก่ (1) สาขาวิทยาศาสตร์ (2) สาขาเทคโนโลยี (3) สาขาชีวการแพทย์ (4) สาขามานุษยวิทยาและศิลปกรรมศาสตร์ (5) สาขาสังคมศาสตร์ (6) สาขาเกษตร (7) สาขาศึกษาศาสตร์/ครุศาสตร์

 ตัวชี้วัด 
สำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา ได้จัดอันดับมหาวิทยาลัยของประเทศไทย โดยแบ่งออกเป็น 2 ด้าน ได้แก่ ด้านการเรียนการสอน และด้านวิจัย โดยอาศัยตัวชี้วัดการวัดศักยภาพสถาบันอุดมศึกษาไทย ประจำปี 2548 โดยสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา ดังต่อไปนี้

 ตัวบ่งชี้ด้านการเรียนการสอน 
 Student ratio (20%) คำนวณจาก
 จำนวนนักศึกษาทุกระดับ ต่อ จำนวนอาจารย์ทั้งหมด

 Faculty resources (20%) คำนวณจาก
 จำนวนอาจารย์วุฒิปริญญาเอก ต่อ จำนวนอาจารย์ทั้งหมด
 จำนวนศาสตราจารย์ ต่อ จำนวนอาจารย์ทั้งหมด
 จำนวนรางวัลระดับชาติและนานาชาติ
 จำนวนอาจารย์ทั้งหมด ต่อ จำนวนหลักสูตรทั้งหมด

 Financial resources (20%) คำนวณจาก
 งบประมาณแผ่นดินทุกหมวด+เงินรายได้จากการจัดการเรียนการสอนนอกเวลา ต่อ จำนวนอาจารย์ทั้งหมด
 งบประมาณแผ่นดินทุกหมวด+เงินรายได้จากการจัดการเรียนการสอนนอกเวลา ต่อ จำนวนนักศึกษาทั้งหมด
 งบห้องสมุดต่อจำนวนนักศึกษาทั้งหมด
 ขนาดของแบนด์วิดท์ต่อจำนวนนักศึกษาทั้งหมด

 Internationality (10%) คำนวณจาก
 จำนวนนักศึกษาต่างชาติ ต่อนักศึกษาทั้งหมด
 จำนวนอาจารย์ต่างชาติ ต่อ จำนวนอาจารย์ทั้งหมด

 Quality of Education (10%) คำนวณจาก
 ศิษย์เก่าที่ได้รับรางวัลระดับชาติ/นานาชาติ
 นักศึกษาปัจจุบันที่ได้รับรางวัลระดับชาติ/นานาชาติ 

 ตัวบ่งชี้ด้านการวิจัย (Research Ranking Indicator, RRI) 
 ด้านแหล่งทุน (20%) คำนวณจาก
 เงินรายได้ที่จัดสรรเพื่อการวิจัย+เงินวิจัยจากแหล่งทุนภายนอก ต่อ จำนวนอาจารย์ทั้งหมด
 เงินรายได้ที่จัดสรรเพื่อการวิจัย ต่อ งบประมาณแผ่นดินทุกหมวด
 เงินวิจัยจากแหล่งทุนภายนอกทั้งในและต่างประเทศ ต่อ งบประมาณแผ่นดินทุกหมวด
 เงินวิจัยจากอุตสาหกรรม, กระทรวง, จังหวัด ต่อ งบประมาณแผ่นดินทุกหมวด

 ด้านบุคลากร (20%) คำนวณจาก
 จำนวน (อาจารย์+นักวิจัย) วุฒิปริญญาเอก ต่อ จำนวน (อาจารย์+นักวิจัย) ทั้งหมด
 จำนวนศาสตราจารย์ ต่อ จำนวนอาจารย์ทั้งหมด
 จำนวนรางวัลระดับชาติและนานาชาติ*
 จำนวน (อาจารย์+นักวิจัย) ที่เป็นสมาชิกคณะบรรณาธิการ ของวารสารฐานข้อมูลสากล

 ด้านผลงาน คิดเป็น (45%) คำนวณจาก
 จำนวนสิทธิบัตรในประเทศ
 จำนวนสิทธิบัตรในต่างประเทศ
 จำนวนบทความในฐานข้อมูลสากล ต่อ จำนวน (อาจารย์+นักวิจัย) ทั้งหมด
 เงินรายได้ที่จัดสรรเพื่อการวิจัย+เงินทุนวิจัยจากแหล่งทุนภายนอก ต่อ จำนวนบทความทั้งหมด
 จำนวนบทความในฐานข้อมูล ISI ที่ (อาจารย์+นักวิจัย) เป็นผู้วิจัยหลัก ต่อ จำนวนบทความในฐานข้อมูล ISI
 จำนวนครั้งที่บทความในฐานข้อมูล ISI ได้รับการอ้างอิง ต่อ จำนวนบทความในฐานข้อมูล ISI (ย้อนหลัง 5 ปี)
 จำนวนหนังสือหรือตำราที่เขียนเป็นภาษาต่างประเทศที่ตีพิมพ์โดยสำนักพิมพ์

 ด้านบัณฑิตศึกษา (15%) คำนวณจาก
 จำนวนนักศึกษา ป. เอกที่รับเข้าศึกษา ต่อ จำนวนอาจารย์ทั้งหมด
 จำนวนบัณฑิต ป. เอกที่จบการศึกษา ต่อ จำนวนอาจารย์ทั้งหมด
 จำนวนนักศึกษา ป. เอก ที่ได้รับทุน คปก. หรือเทียบเท่า ต่อ จำนวนนักศึกษาทั้งหมด

 ผลการจัดอันดับ 

 แบบตามอันดับ 
เมื่อ พ.ศ. 2549 สกอ. ได้ประกาศ 50 อันดับมหาวิทยาลัยด้านวิจัย และด้านการเรียนการสอน โดย 10 อันดับแรกคือ
 ด้านการเรียนการสอน (คะแนนเต็ม 80%)  ด้านการวิจัย (คะแนนเต็ม 100%) มหาวิทยาลัยมหิดล 61.11%
 จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย 52.78%
 มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ 47.27%
 มหาวิทยาลัยขอนแก่น 47.16%
 มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลกรุงเทพ 46.12% 
 มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ 45.72%
 มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี 45.37%
 มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ 45.07%
 มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี 43.59%
 มหาวิทยาลัยศิลปากร 43.46% มหาวิทยาลัยมหิดล 100.00% 
 จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย 92.24%
 มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี 81.49%
 มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี 81.36% 
 มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ 78.68%
 มหาวิทยาลัยขอนแก่น 75.70% 
 สถาบันบัณฑิตพัฒนบริหารศาสตร์ 74.10%
 มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ 73.61%
 มหาวิทยาลัยนเรศวร 72.04%
 มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ 71.26%

 แบบแบ่งกลุ่ม 
ได้มีการแบ่งออกเป็นกลุ่ม 5 กลุ่ม ตามระดับคะแนน ได้แก่
 กลุ่ม 1 ดีเลิศ (ร้อยละ 75 ขึ้นไป)
 กลุ่ม 2 ดีเยี่ยม (ร้อยละ 70-75)
 กลุ่ม 3 ดี (ร้อยละ 65-69)
 กลุ่ม 4 ดีพอใช้ (ร้อยละ 55-64)
 กลุ่ม 5 ต้องปรับปรุง (ร้อยละ 55 ลงไป)
โดยในแต่ละกลุ่ม เรียงตามลำดับตัวอักษร (มรภ. = มหาวิทยาลัยราชภัฏ, มทร. = มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคล)

 กลุ่ม ด้านการเรียนการสอน ด้านการวิจัย1จุฬาลงกรณ์, เชียงใหม่, มหิดล,ขอนแก่น จุฬาลงกรณ์, เชียงใหม่, มหิดล, เทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี, เทคโนโลยีสุรนารี มหาวิทยาลัยราชภัฏสวนสุนันทา2เกษตรศาสตร์, เทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี, เทคโนโลยีสุรนารี, เทคโนโลยีราชมงคลกรุงเทพเกษตรศาสตร์, ขอนแก่น, นเรศวร, นิด้า สวนสุนันทา3ทักษิณ, แม่ฟ้าหลวง, วลัยลักษณ์, ศิลปากร, สงขลานครินทร์, อุบลราชธานี, เทคโนโลยีราชมงคลศรีวิชัย, นิด้าบูรพา, ศรีนครินทรวิโรฒ, ศิลปากร, สงขลานครินทร์, เทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง4ม.นเรศวร, ม.บูรพา, ม.มหาสารคาม, ม.แม่โจ้, ม.ศรีนครินทรวิโรฒ, มทร.ธัญบุรี, มทร.พระนคร, มทร.สุวรรณภูมิ, มรภ.นครปฐม, มรภ.วไลยอลงกรณ์ฯ, มรภ.สวนดุสิต, สจ.ลาดกระบัง, สจ.พระนครเหนือม.ทักษิณ, ม.แม่โจ้, ม.แม่ฟ้าหลวง, ม.มหาสารคาม, ม.วลัยลักษณ์, ม.อุบลราชธานี, สจ.พระนครเหนือ, มรภ.นครราชสีมา, มรภ.เลย, มรภ.วไลยอลงกรณ์ฯ, มรภ.สวนดุสิต, มรภ.อุดรธานี5มรภ.จันทรเกษม, มรภ.เชียงใหม่, มรภ.เทพสตรี, มรภ.ธนบุรี, มรภ.นครราชสีมา, มรภ.นครศรีธรรมราช, มรภ.นครสวรรค์, มรภ.บุรีรัมย์, มรภ.พระนคร, มรภ.พิบูลสงคราม, มรภ.ยะลา, มรภ.ราชนครินทร์, มรภ.เลย, มรภ.สกลนคร, มรภ.สุราษฎร์ธานี, มรภ.หมู่บ้านจอมบึง, มรภ.อุดรธานี, มรภ.อุตรดิตถ์, ว.บัณฑิตบริหารธุรกิจ, ว.ตาปีมทร.กรุงเทพ, มทร.ธัญบุรี, มทร.พระนคร, มทร.ศรีวิชัย, มทร.สุวรรณภูมิ, มรภ.จันทรเกษม, มรภ.เชียงใหม่, มรภ.เทพสตรี, มรภ.ธนบุรี, มรภ.นครปฐม, มรภ.นครศรีธรรมราช, มรภ.นครสวรรค์, มรภ.บุรีรัมย์, มรภ.พระนคร, มรภ.พิบูลสงคราม, มรภ.ยะลา, มรภ.ราชนครินทร์, มรภ.สกลนคร, มรภ.สุราษฎร์ธานี, มรภ.หมู่บ้านจอมบึง, มรภ.อุตรดิตถ์, ว.บัณฑิตบริหารธุรกิจ, ว.ตาปี

 แบ่งตามสาขา 
การจัดอันดับนี้จัดเฉพาะมหาวิทยาลัยของรัฐ 50 อันดับแรก แยกตามสาขา ในด้านการวิจัย และด้านการเรียนการสอนเปิด 50 อันดับสาขาด้าย "วิจัย-สอน"  จาก หนังสือพิมพ์มติชน 1 ก.ย. 2549อันดับมหาวิทยาลัยแบ่งตามสาขาวิชา ตามงานวิจัย หนังสือพิมพ์ข่าวสดวันที่ 1 กย. 2549ฉะอันดับมหาวิทยาลัยมั่ว สกอ.ทำผ่านเวบ-ข้อมูลไม่ครบ หนังสือพิมพ์คมชัดลึก 1 ก.ย. 2549
โดย 5 อันดับแรกของแต่ละด้านคือ

สาขา ด้านการสอน ด้านการวิจัย วิทยาศาสตร์  คณะวิทยาศาสตร์ ม.มหิดล  
 วิทยาลัยปิโตรเลียมและปิโตรเคมี จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย 
 คณะวิทยาศาสตร์ ม.เชียงใหม่  
 คณะวิทยาศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
 คณะสิ่งแวดล้อมและทรัพยากรศาสตร์ ม.มหิดล วิทยาลัยปิโตรเลียมและปิโตรเคมี จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย 
 คณะวิทยาศาสตร์ ม.มหิดล  
 สถาบันอณูชีววิทยาและพันธุศาสตร์ ม.มหิดล 
 คณะวิทยาศาสตร์ ม.เชียงใหม่
 คณะวิทยาศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย  เทคโนโลยี คณะวิศวกรรมศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย 
 คณะพลังงานและวัสดุ มจ.ธนบุรี 
 คณะทรัพยากรชีวภาพและเทคโนโลยี มจ.ธนบุรี   
 คณะวิศวกรรมศาสตร์ มทร.กรุงเทพ 
 คณะวิศวกรรมศาสตร์ ม.อุบลราชธานี  บัณฑิตวิทยาลัยร่วมด้านพลังงานและสิ่งแวดล้อม มจ.ธนบุรี  
 คณะพลังงานและวัสดุ มจ.ธนบุรี 
 สถาบันวิจัยและพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี ม.มหิดล 
 คณะวิศวกรรมศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
 สถาบันพัฒนาและฝึกอบรมโรงงานต้นแบบ มจ.ธนบุรี  ชีวการแพทย์ คณะแพทยศาสตร์โรงพยาบาลรามาธิบดี มหาวิทยาลัยมหิดล 
 คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล มหาวิทยาลัยมหิดล  
 คณะเวชศาสตร์เขตร้อน มหาวิทยาลัยมหิดล 
 คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น 
 คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่  สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สุขภาพ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ 
 คณะเวชศาสตร์เขตร้อน มหาวิทยาลัยมหิดล  
 วิทยาลัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
 คณะแพทยศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
 คณะแพทยศาสตร์โรงพยาบาลรามาธิบดี มหาวิทยาลัยมหิดล มนุษยศาสตร์และศิลปศาสตร์ คณะมัณฑนศิลป์ ม.ศิลปากร 
 คณะสังคมศาสตร์และมนุษยศาสตร์ ม.มหิดล 
 คณะสถาปัตยกรรมศาสตร์ ม.เชียงใหม่ 
 สถาบันวิจัยภาษาและวัฒนธรรมเพื่อพัฒนาชนบท ม.มหิดล  คณะวิจิตรศิลป์ ม.เชียงใหม่ 
 คณะสังคมศาสตร์และมนุษยศาสตร์ ม.มหิดล 
 โครงการบัณฑิตศึกษาการพัฒนาทรัพยากรมนุษย์ นิด้า 
 คณะสถาปัตยกรรมศาสตร์ ม.เชียงใหม่
 คณะอักษรศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย สังคมศาสตร์ คณะเศรษฐศาสตร์ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
 สถาบันบัณฑิตบริหารธุรกิจศศินทร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย 
 คณะรัฐศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย 
 วิทยาลัยดุริยางคศิลป์ มหาวิทยาลัยมหิดล 
 คณะเศรษฐศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย  สถาบันวิจัยประชากรและสังคม มหาวิทยาลัยมหิดล 
 คณะบริหารธุรกิจ สถาบันบัณฑิตพัฒนบริหารศาสตร์ 
 คณะรัฐประศาสนศาสตร์ สถาบันบัณฑิตพัฒนบริหารศาสตร์ 
 วิทยาลัยประชากรศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
 คณะรัฐศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย เกษตรศาสตร์ คณะเกษตร กำแพงแสน มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์  
 คณะอุตสาหกรรมเกษตร มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ 
 สำนักวิชาอุตสาหกรรมเกษตร มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง  
 คณะเกษตรศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ 
 คณะเกษตรศาสตร์ วิทยาเขตปทุมธานี มทร.ธัญบุรี  คณะอุตสาหกรรมเกษตร มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ 
 สถาบันวิจัยทรัพยากรทางน้ำ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย 
 สำนักวิชาเทคโนโลยีการเกษตร มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี 
 คณะอุตสาหกรรมเกษตร มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
 คณะเกษตรศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่  ศึกษาศาสตร์ ครุศาสตร์ คณะครุศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย และ คณะศึกษาศาสตร์ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
 คณะครุศาสตร์ มหาวิทยาลัยราชภัฏสวนสุนันทา
 คณะครุศาสตร์ มหาวิทยาลัยราชภัฏนครปฐม
 คณะครุศาสตร์ มหาวิทยาลัยราชภัฏสุราษฎร์ธานี
 คณะครุศาสตร์ มหาวิทยาลัยราชภัฏธนบุรี คณะครุศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย  
 คณะศึกษาศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร 
 คณะศึกษาศาสตร์ มหาวิทยาลัยบูรพา
 คณะศึกษาศาสตร์ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
 คณะศึกษาศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหาสารคาม

 การวิพากษ์วิจารณ์ 
หลังจากที่ สกอ. ได้มีการประชุมโครงการ และประกาศผลการจัดอันดับมหาวิทยาลัยของไทย ครั้งที่ 1 (ปี 2549) เมื่อวันที่ 31 ส.ค. 2549 แล้วนั้น ได้มีเสียงวิพากษ์วิจารณ์จากบุคคลหลายกลุ่ม รวมถึงผู้บริหารมหาวิทยาลัย คณาจารย์ และประชาชนทั่วไป ในข้อดี-ข้อเสียของการจัดอันดับครั้งแรกนี้ ในประเด็นเกี่ยวกับ ตัวชี้วัด ที่เลือกใช้ การกรอกข้อมูลที่ทำโดยแต่ละมหาวิทยาลัยเองนั้นมีความน่าเชื่อถือว่าครบถ้วนหรือไม่ การยอมรับข้อมูลและการนำไปใช้ได้จริงหรือไม่ ซึ่งในกรณีนี้ สกอ.มีวัตถุประสงค์ที่จะให้การจัดอันดับช่วยให้ข้อมูลเพื่อการตัดสินใจในการเลือกคณะและมหาวิทยาลัยในการสอบเอนทรานซ์ ผู้บริหารจากหลายมหาวิทยาลัยออกมากล่าวถึงปัญหาว่าการจัดอันดับนี้อาจนำมาซึ่งการทำลายขวัญและกำลังใจ เป็น "ตราบาป" ให้กับมหาวิทยาลัยหลาย ๆ แห่ง เนื่องจากมหาวิทยาลัย มีงบประมาณและโครงสร้างพื้นฐาน และปัจจัยที่เกี่ยวข้องในการพัฒนาที่ไม่เท่าเทียม ทำให้ไม่ควรนำมาเปรียบเทียบกัน หลายคนวิจารณ์ว่าการทำการจัดอันดับอาจซ้ำซ้อนกับที่ สมศ.ทำอยู่ แต่เร่งประกาศออกมาโดยไม่พร้อม ผู้นำในการแสดงความคิดเห็นไม่เห็นด้วยกับการจัดอันดับของ สกอ. คือ ศ.ดร.สุรพล นิติไกรพจน์ อธิการบดีมหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์, ผศ.ดร.ณรงค์ พุทธชีวิน อธิการบดีมหาวิทยาลัยราชภัฏสุราษฎร์ธานี กล่าวว่า "การจัดอันดับมหาวิทยาลัยเป็นผลงานชิ้นโบว์ดำของ  ดร.ภาวิช ก่อนเกษียณอายุราชการในเดือน กย. ปี 2549 นี้" ศ.ดร.ปรัชญา เวสารัชช์ อธิการบดีมหาวิทยาลัยสุโขทัยธรรมาธิราช (มสธ.) ในฐานะประธานที่ประชุมอธิการบดีแห่งประเทศไทย (ทปอ.) กล่าวว่า ตนคิดว่าการที่มหาวิทยาลัยส่วนใหญ่ไม่ยอมรับผลการจัดอันดับในครั้งนี้ ไม่ถือเป็นความขัดแย้งของมหาวิทยาลัย แต่เนื่องจากมหาวิทยาลัยส่วนใหญ่ไม่แน่ใจในตัวชี้วัดของ สกอ. เพราะเห็นว่าไม่สามารถประเมินคุณภาพที่สอดคล้องกับธรรมชาติของมหาวิทยาลัยได้ นอกจากนี้ ยังมี  ศ.ดร.ธีรวุฒิ บุณยโสภณ อธิการบดีมหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าพระนครเหนือ ซึ่งออกมากล่าวถึงการคิดคะแนนที่ผิดพลาดของการจัดอันดับ และเรียกร้องให้ สกอ. ออกมายอมรับความผิดพลาดของการจัดอันดับครั้งนี้

นอกจากนี้ยังถูกแย้งว่าการจัดอันดับมุ่งเน้นไปที่คณะการเรียนการสอนทางวิทยาศาสตร์โดยเฉพาะอย่างยิ่งคณะแพทยศาสตร์ มีผู้ให้ข้อสังเกตว่ามหาวิทยาลัยที่มีชื่อเสียง เช่น สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง และ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ได้รับการจัดอันดับที่ต่ำกว่ามหาวิทยาลัยที่มีชื่อเสียงน้อยกว่าเนื่องจากไม่มีคณะแพทยศาสตร์ ซึ่งมักมีโรงพยาบาลในสังกัดและทำให้ได้รับเงินประมาณแผ่นดินที่สูง ทั้งที่อาจจะไม่เกี่ยวกับการเรียนการสอนโดยตรง แต่เป็นบริการสังคมซึ่งเป็นอีกหนึ่งพันธกิจของมหาวิทยาลัย จึงไม่น่าแปลกใจที่มหาวิทยาลัยมหิดลซึ่งเน้นทางด้านสาธารณสุขศาสตร์จะได้รับการจัดอันดับเป็นที่หนึ่ง ทั้งๆ ที่คณะวิชาด้านอื่นๆ อาจไม่เป็นที่รู้จักของสังคมนัก มหาวิทยาลัยที่เน้นผลิตบัณฑิตทางด้านสังคมศาสตร์ เช่น มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ จึงปฏิเสธที่จะเข้าร่วมการจัดอันดับตั้งแต่ต้น เพราะศาสตร์และผลงานวิจัยไม่เอื้อให้ได้รับคะแนนประเมินสูง ทั้งๆ ที่บัณฑิตทางสายสังคมศาสตร์กลับเป็นที่ต้องการของตลาดแรงงานและได้รับค่าจ้างแรงงานที่ดีกว่า ตลอดจนนักเรียนระดับมัธยมศึกษาตอนปลายก็ให้ความสนใจในจำนวนสูงมากกว่าคณะทางสายวิทยาศาสตร์ของมหาวิทยาลัยชื่อดัง เช่น มหิดล เกษตรศาสตร์ หลายร้อยเท่าตัว 

ส่วนข้อดีของการจัดอันดับมหาวิทยาลัยนั้น น่าจะอยู่ที่เป็นการกระตุ้นให้มหาวิทยาลัยได้พิจารณาตนเอง และพัฒนามหาวิทยาลัยให้เป็นที่ยอมรับได้ในระดับนานาชาติข่าวมติชน อธิการฯรุมโต้จัดอันดับมหา"ลัย โวยสกอ.เก็บข้อมูลไม่ครบถ้วน  2 กย.49ศึกจัดอันดับมหา"ลัยเดือด 2 อธิการบดีไม่ยอมรับ อ้างสกอ.ไม่พร้อม ข่าวมติชน 1 กย.