ju_gerichte · ADM 2016 157 · 2018-04-04 · de

Nouvelle pisciculture à Courtételle : admission du recours contre l¿arrêté d¿octroi de la concession de droit d¿eau d¿usage délivrée par le Gouvernement | Environnement

RÉPUBLIQUE ET CANTON DU JURA
TRIBUNAL CANTONAL
COUR ADMINISTRATIVE
ADM 157 / 2016
Présidente
:
 Sylviane Liniger Odiet
Juges
:
 Jean Moritz, Daniel Logos, Philippe Guélat et Gérald Schaller
Greffière
:
 Carine Flury
ARRET DU 4 AVRIL 2018
en la cause liée entre
1.
A.,
2.
B.,
3.
Société C.,
-
représentées par Me Stéphane Voisard, avocat à Genève,
recourantes,
et
le Gouvernement de la République et Canton du Jura, Hôtel du Gouvernement, Rue de 
l'Hôpital 2, 2800 Delémont,
intimé no 1,
D. SA,
-
représentée par Me Henri-Joseph Theubet, avocat à Porrentruy,
intimée no 2,
relative à l'arrêté d'octroi de la concession de droit d'eau d'usage et ses annexes du 
2 novembre 2016 rendu par le Gouvernement de la République et Canton du Jura.
______
2
CONSIDÉRANT
En fait :
A.
La D. SA, avec siège social à E., exploite depuis plusieurs décennies trois 
piscicultures pour l'élevage de truites à E., F. et G.. Afin d'optimiser l'activité piscicole 
moderne et en raison des débits moyens et d'étiage supérieurs pour la H. à I. ainsi 
que d'une température de l'eau de la H. considérablement plus basse comparée à 
l'eau de J., les propriétaires ont recherché un autre emplacement et porté leur choix 
sur le lieu-dit K..
B.
En 2015, D. SA a déposé auprès de l'Office de l'environnement (ENV) une demande 
de concession comprenant une demande de permis de construire portant sur la 
construction d'une nouvelle pisciculture sur les parcelles xxx (2663 m2) et yyy (15454 
m2) du ban de I.. Elle prévoit notamment la construction sur la parcelle no yyy sise en 
zone agricole de 6 bassins piscicoles parallèles suivis par 4 bassins en parallèle, 
suivis par 4 bassins en parallèles, tous en béton d'une largeur totale de 47.90 m et 
d'une longueur variant de 51.91 m à 85 m, d'un bassin à boue, avec filtre à tambour 
à l'est des bassins, de 12 m sur 11.60 m, d'un bâtiment dessableur et stock de 
nourriture de 16 m sur 14 m, d'une clôture de retenue des poissons de 150 cm de 
hauteur, d'un bâtiment d'exploitation de la pisciculture avec une zone d'abattage et 
un bassin à carpes pour une longueur totale de 56.80 m et une largeur variant de 
8.20 m à 20.72 m et de l'installation de rampes d'oxygénation. Le projet nécessite 
également la démolition du bâtiment 38 C sur la parcelle xxx sise en zone de 
construction Centre Ancien CAa et l'abattage d'arbres. Le nouveau bâtiment 
d'exploitation et de conditionnement comprenant une installation de fumage sera 
construit en partie sur chaque parcelle, donc en partie en zone agricole et en partie 
en zone à bâtir (demande de permis de bâtir du 24 juin 2015 intitulé plan provisoire 
suite à TM 1177). Il comprendra également une partie magasin permettant la vente 
directe, ainsi qu’un studio et un appartement pour la famille et un ouvrier (dossier 
Gouvernement, pièces complémentaires, feuillet 3 lettre F/2 ; rapport technique plan 
des étages). L'objectif de production des futures installations piscicoles est de l'ordre 
de 100 tonnes par année, soit environ 1'100 truites à 250 g par jour. Le projet 
nécessite une prise d'eau dans la H réalisée par une déviation du canal existant en 
direction du futur bassin de dessablage et le maintien de la vanne existante (rapport 
technique version 2 du 3 novembre 2015 et plans du projet). 
C.
Le projet de concession de droit d'eau d'usage a fait l'objet d'une publication dans le 
Journal Officiel du zzz. Les recourantes ont formé opposition dans le délai imparti.
D.
Le 2 novembre 2016, le Gouvernement a accordé la concession de droit d'eau NO 
SO-Usu-10 sur la H à I au lieu-dit "L." à la D. SA pour une période de 35 ans à compter 
de la mise en service des installations et concédé un débit de 450 l/s (art. 1 à 3). 
L'arrêté prévoit également qu'il porte dérogation au sens des articles 24 LAT et 206 
RCC (art. 6). Il comporte différentes conditions relatives notamment au débit résiduel 
minimal, au débit d'étiage, aux échelles et marques limnimétriques, à la mesure de la 
3
température, à l'entretien et au vidage des installations, aux déchets, à la qualité des 
eaux de rejet, au traitement des boues et des eaux, aux dangers naturels et au 
patrimoine naturel (art. 8 à 12). Il porte extinction des concessions de E. et F. et 
impose leur démantèlement dans les deux ans dès la mise en service du site de I 
(art. 13 et 14). Pour G, il prévoit que seules des activités d'alevinage et d'élevage de 
juvéniles seront tolérées, interdisant strictement tout engraissement, et exigeant 
l'adaptation des installations (art. 15). Le Gouvernement a également levé toutes les 
oppositions.
E.
Par mémoire du 16 décembre 2016, A et B, ainsi que la Société C ont recouru contre 
cette décision, concluant principalement à l'annulation de l'arrêté du 2 novembre 
2016, subsidiairement au renvoi de la cause à l'ENV, le Gouvernement et la D. SA 
devant être condamnés aux frais judiciaires et aux dépens. 
Sur le fond, les recourantes contestent l'application de la loi sur l'utilisation des eaux, 
en vigueur jusqu'au 31 janvier 2016 (LUE), respectivement la compétence de l'intimé 
pour accorder la concession. Elles allèguent que la loi sur la gestion des eaux 
(LGEaux), entrée en vigueur le 1er février 2016 aurait dû s'appliquer à la présente 
procédure, de telle sorte que c'est l'autorité communale qui aurait été compétente 
pour accorder le permis de construire, la concession n'étant qu'un élément du permis 
de construire. Elles sont donc privées d'une voie de recours. En outre, le projet n'est 
pas conforme à l'affectation de la zone agricole et au périmètre de protection de la 
nature. Elles estiment non seulement que le projet n'est pas imposé par sa 
destination, mais encore qu'il nécessite une planification eu égard à son impact. Enfin, 
les recourantes invoquent des risques d'atteinte à l'eau dans la mesure où le débit 
résiduel légal n'est pas garanti et où l'exploitation de la pisciculture produira une 
quantité d'ammonium autrement supérieure à celle qu'exige la décision querellée.
Préalablement, les recourantes sollicitent la suspension de la procédure jusqu'à droit 
connu sur les pourparlers transactionnels que mènent les parties.
F.
Par ordonnance du 22 février 2017, la procédure de recours a été suspendue jusqu'au 
31 mars 2017, une requête dans ce sens ayant également été déposée par D. SA. 
Elle a été reprise le 3 avril 2017, les pourparlers n’ayant pas abouti.
G.
Par mémoire du 9 mai 2017, D. SA a conclu au rejet du recours et à la confirmation 
de l'arrêté litigieux, sous suite des frais et dépens. Elle renonce à prendre position sur 
les griefs formulés au titre de la procédure suivie par le Gouvernement, qu'elle a 
acceptée. Elle relève que le projet s'inscrit dans un contexte d'amélioration notable 
de la situation qui prévaut à ce jour et qu'elle financera seule la renaturation d'un 
tronçon de la H sur une longueur de 335 mètres en augmentant la section du cours 
d'eau dans le secteur engendrant une protection accrue contre les crues et une 
surface de compensation "Nature" de l'ordre de 2'000 m2. Avant de présenter le projet, 
elle a parcouru le territoire cantonal pour trouver l'endroit idéal, le long d'un cours 
d'eau. Les sites potentiels sont inexistants à Q. La réalisation d'un projet sur M se 
heurtait notamment à la proximité des stations d'épuration en amont de N et de O.
4
H.
Le 16 mai 2017, le Gouvernement a conclu au rejet du recours, sous suite des frais 
et dépens. Après avoir pris position sur les différents aspects techniques du dossier, 
il relève que sa compétence pour octroyer la concession conformément à la LUE est 
admise par la jurisprudence et la doctrine pour des questions d'économie de 
procédure. Il reste également compétent même sous le nouveau droit, ayant déjà été 
saisi de l'affaire. S'agissant de la non-conformité à l'affectation de la zone agricole, il 
considère que l'implantation des installations de la pisciculture est imposée par leur 
destination, de telle sorte qu'il a octroyé une dérogation au sens de l'article 24 LAT. 
Quant au périmètre de protection de la nature, il n'existe aucun intérêt public 
s'opposant à déroger au règlement communal sur les constructions. Le 
Gouvernement conteste également toute obligation de planifier, la quantité de 
poissons produite étant inférieure aux 30 tonnes par jour exigées par l'annexe de 
l'ordonnance relative à l'étude d'impact sur l'environnement. Il relève en outre que les 
installations destinées à l'exploitation piscicole occupent une surface qui n'excédera 
pas 0.8 hectare, les bassins occupant moins de la moitié de la surface, le reste 
demeurant en groise. L'activité n'aura pas d'effets notables sur l'environnement, le 
trafic automobile n'augmentant pas significativement suite à la réalisation du projet. 
Enfin, dans la mesure où l'implantation du projet est imposée par sa destination, cette 
zone ne rentre pas dans la notion de zone à bâtir légalisée au sens de l'article 38a 
LAT. Elle est dénuée d'impact sur le dimensionnement de la zone à bâtir cantonale. 
Enfin, le Gouvernement conteste toute atteinte aux eaux en raison des mesures 
prises dans l'arrêté.
I.
Le 11 octobre 2017, les recourantes ont transmis à la Cour de céans un "rapport 
d'expertise du 29 septembre 2017" relatif à la pollution liée à la pisciculture de G et 
requis l'audition en qualité de témoin de son auteur.
J.
Le 15 novembre 2017, la juge instructrice a versé au dossier plusieurs pièces, dont 
le plan d’aménagement local de I et le règlement communal sur les constructions 
approuvé le 12 novembre 2015, ainsi que le jugement du 24 mai 2016 (ADM 
150/2016) relatif à la limitation de l’effet suspensif au recours dans la procédure ADM 
139/2015. Elle a également limité les débats à la question de la dérogation au sens 
de l’article 24 LAT et rejeté les autres compléments de preuves requis par les parties, 
sous réserve d’une décision contraire de la Cour.
K.
Le nouveau plan d'aménagement local (PAL) de I et le règlement sur les constructions 
(RCC) ont été approuvés par le Service du développement territorial le 12 novembre 
2015. Ils ont fait l'objet d'un recours devant la Cour administrative (ADM139/2105). 
L'effet suspensif du recours a été limité par décision du 24 mai 2016 (ADM 150/2016) 
à certaines parcelles spécialement désignées dans la décision et dont ne font pas 
partie les parcelles xxx et yyy concernées par la pisciculture. La parcelle yyy se trouve 
ainsi en zone agricole, zone de protection des crues (ZAa ; art. 171ss RCC) et 
périmètre de protection de la nature (PNa ; art. 203ss RCC). La parcelle xxx se situe 
en zone centre Cab (zone sauvegarde B de l'ISOS ; art. 51ss RCC) avec une partie 
en zone de danger naturel. Le PAL n'intègre pas la pisciculture.
5
L.
Dans ses remarques finales du 12 décembre 2017, le Gouvernement n’a pas contesté 
que la pisciculture n’est pas conforme à la zone agricole, mais estime que les 
conditions d’octroi d’une dérogation au sens de l’article 24 LAT sont remplies, 
considérant qu’une pisciculture, comme en l’espèce, peut être imposée par sa 
destination en dehors de la zone à bâtir.
M.
Le 21 décembre 2017, les recourantes ont considéré que lorsqu’elle n’est pas 
exercée à titre accessoire par un exploitant agricole, une pisciculture doit 
nécessairement être implantée en zone à bâtir ou dans une zone spéciale prévue à 
cet effet. Elles contestent également que les conditions cumulatives de l’article 24 
LAT soient réalisées. 
N.
Prenant position le 3 janvier 2018, D. SA a relevé qu’elle a mené son projet de concert 
avec les services de l’Etat qu’elle a associés dans toutes les phases de réflexions. 
Alors qu’elle avait recherché tous les sites d’implantation possible pour son projet, 
elle n’a pas ignoré la proposition formulée par les recourants d’implanter sa 
pisciculture sur M. Elle a déposé un rapport technique intitulé étude de variantes. 
O.
Il sera revenu ci-après sur les autres éléments du dossier en tant que besoin.
En droit :
1.
La Cour administrative est compétente en vertu de l'article 160 let. a Cpa. 
La recourante no 1 a manifestement qualité pour recourir (art. 12 al. 1 let. b et al. 2 
LPN et 55 LPE ; art. 1 de l'annexe à l'ODO ; RS 814.076), d’autant qu’il est admis 
qu’en procédure cantonale, les sections locales puissent représenter les associations 
nationales (RJJ 2005 p. 192 consid. 1.2.2). Il en va de même de la recourante no 2 
en tant que section cantonale d’une association écologique (RJJ 2005 p. 192 consid. 
1.2.1), de telle sorte que la qualité pour recourir de la recourante no 3 peut être laissée 
ouverte. Pour le surplus, interjeté dans les forme et délai légaux par une personne 
disposant manifestement de la qualité pour recourir, le recours est recevable et il y a 
lieu d'entrer en matière. 
2.
Prévu en grande partie dans la zone agricole (bassins, bâtiment dessableur, filtre à 
boue et une partie de l'immeuble 38 A), le projet de construction de la pisciculture 
n'est pas conforme à l'affectation de cette zone (art. 22 al. 2 let. a LAT). Les parties 
ne le contestent d'ailleurs pas. Il ne peut dès lors être autorisé que s'il remplit les 
conditions dérogatoires de l'article 24 LAT, ce que les recourantes contestent.
2.1
En vertu de l'article 24 LAT, en dérogation à l'article 22 al. 2 let. a LAT, une 
autorisation dérogatoire peut être délivrée pour de nouvelles constructions ou 
installations hors de la zone à bâtir lorsque l'implantation de ces constructions ou 
installations est imposée par leur destination (let. a) et qu'aucun intérêt prépondérant 
ne s'y oppose (let. b). 
6
Selon la jurisprudence, une construction est imposée par sa destination au sens de 
l'article 24 let. a LAT lorsqu'elle est adaptée aux besoins qu'elle est censée satisfaire 
et qu'elle ne peut remplir son rôle que si elle est réalisée à l'endroit prévu : une 
nécessité particulière, tenant à la technique, aux conditions d'exploitation d'une 
entreprise, ou encore à la configuration ou à la nature du sol, doit imposer le choix de 
l'endroit (implantation imposée positivement par la destination de la construction). De 
même, l'implantation hors de la zone à bâtir peut se justifier si l'ouvrage en question 
ne peut être édifié à l'intérieur de celle-ci en raison des nuisances qu'il occasionne 
(implantation imposée négativement par la destination de la construction). Tel est le 
cas lorsqu’aucune zone à bâtir existante ne s’y prête et que le projet ne peut donc 
être réalisé à l’intérieur de la zone à bâtir existante. Seuls des critères particulièrement 
importants et objectifs sont déterminants, à l'exclusion de points de vue subjectifs du 
constructeur ou de motifs de convenance personnelle (TF 1C_268/2015 du 9 février 
2016 consid. 4.1 ; ATF 136 II 214 consid. 2.1 ; 129 II 63 consid. 3.1 ; 123 II 256 consid. 
5a ; MUGGLI, Commentaire pratique LAT : Construire hors zone à bâtir, 2017, nos 5 
et 13 ad art. 24 LAT). L'application de la condition de l'article 24 let. a LAT doit être 
stricte, dès lors que cette dernière contribue à l'objectif de séparation du bâti et du 
non-bâti (ATF 124 II 252 consid. 4a ; 117 Ib 270 consid. 4a ; TF 1C_877/2013 du 31 
juillet 2014 consid. 3.1.1). La condition de l'implantation imposée par la destination de 
l'ouvrage ("Standortgebundenheit"), selon l'article 24 let. a LAT, est proche de la 
condition de l'article 5 al. 2 let. a LFo, qui exige que l'ouvrage pour lequel le 
défrichement est sollicité ne puisse être réalisé qu'à l'endroit prévu (TF 1A.80/2001 
du 31 mai 2002 consid. 3.1). Par ailleurs, l’existence de variantes au projet de 
construction doit être examinée en relation avec l’article 24 let. a LAT (ATF 129 II 69 
consid. 3.2). 
2.2
De jurisprudence constante, l'article 24 let. b LAT exige que l'autorité compétente 
procède à une pesée globale des intérêts en présence au sens de l'article 3 OAT. 
Cette dernière disposition permet d'inscrire la décision d'octroyer une dérogation dans 
le contexte de l'organisation spatiale du territoire concerné, le but étant que les 
conséquences de la dérogation sur le développement territorial souhaité soient 
considérées dans une perspective globale (MUGGLI, op. cit., no 19 ad art. 24 LAT). La 
pesée des intérêts comprend tous les intérêts, publics et privés, touchés par le projet 
(art. 3 al. 1 let. a OAT). Il s'agit évidemment d'abord des intérêts poursuivis par la LAT 
elle-même (notamment la préservation des terres cultivables, l'intégration des 
constructions dans le paysage, la protection des rives, sites naturels et forêts - art. 3 
al. 2 LAT -, la protection des lieux d'habitation - art. 3 al. 3 let. b LAT), mais aussi des 
autres intérêts protégés dans les lois spéciales (LPE, LPN, LFo, OPB, OPAir) ; les 
intérêts privés sont également pris en compte (ATF 134 II consid. 3.1 ; 129 II 63 
consid. 3.1). L'autorité doit ensuite apprécier ces intérêts notamment en fonction du 
développement spatial souhaité et des implications qui en résultent (art. 3 al. 1 let. b 
OAT). La pesée des intérêts proprement dite tient compte, dans la mesure du 
possible, de l'ensemble des intérêts en présence, et doit être motivée (art. 3 al. 1 let. 
c et al. 2 OAT ; TF 1C_877/2013 du 31 juillet 2014 consid. 3.2.1). Selon la 
jurisprudence récente, la décision d’accorder, au titre de l’article 24 LAT, une 
dérogation pour une construction ou une installation donnée, implantée à un endroit 
7
déterminé, présuppose cependant que tous les avantages et inconvénients des sites 
raisonnablement envisageables à l’intérieur et à l’extérieur de la zone à bâtir soient 
connus et puissent être comparés entre eux, afin d’identifier la solution qui soit 
globalement la meilleure et exerce les plus faibles effets possibles sur le territoire et 
l’environnement. Cela exclut qu’une décision intermédiaire attaquable soit prise quant 
au critère de l’implantation imposée par la destination de la construction avant que ne 
soit effectuée la pesée des intérêts découlant de l’article 24 let. b LAT (MUGGLI, op. 
cit., no 9 ad art. 24 LAT et la jurisprudence citée, en particulier ATF 141 II 245 consid. 
7).
2.3
Les deux conditions énumérées à l'article 24 let. a et b LAT doivent être remplies 
cumulativement : même si l'implantation d'une construction ou installation à un endroit 
donné peut manifestement être considérée comme imposée par sa destination, la 
dérogation doit être refusée si des intérêts prépondérants s'y opposent (MUGGLI, op. 
cit., no 19 ad art. 24 LAT).
3.
En l’espèce, l’autorité intimée estime que les conditions de l’article 24 LAT sont 
remplies. Elle ne saurait toutefois être suivie pour les motifs qui suivent.
3.1
A titre préliminaire, il convient de constater que la pisciculture se situe en zone 
agricole, y compris une partie du nouveau bâtiment d'exploitation 38A (lettre B et K 
ci-dessus). On ne saurait donc retenir, comme le précise la décision litigieuse, que 
tous les bâtiments se situent en zone à bâtir. Les bassins piscicoles, le bassin à boue, 
le filtre à tambour, le bassin dessableur et le bâtiment stock de nourriture, tous situés 
en zone agricole, constituent indéniablement des constructions au sens de l'article 22 
LAT, de telle sorte qu'elles nécessitent une dérogation selon l’article 24 LAT. Il en va 
de même pour la partie du bâtiment 38 A qui déborde sur la zone agricole. 
3.2
Pour justifier la dérogation, l’autorité intimée retient notamment l’économie d’énergie 
grâce à l’utilisation d’un seuil et d’un canal existants, qui permettra d’éviter de pomper 
de l’eau sur une longue distance, la qualité des eaux de H à l’endroit considéré ainsi 
que le fait d’éviter de devoir creuser et retourner de la terre pour y enterrer des tuyaux 
jusqu’en zone constructible. Si les motifs en faveur de l’emplacement particulier hors 
de la zone à bâtir paraissent réfléchis, il n’en demeure pas moins que les raisons pour 
lesquelles l’intimée s’est détournée d’un emplacement en zone à bâtir ne consistent 
qu’en un point de vue subjectif ou en des motifs de convenances personnelles, 
lesquels ne peuvent être valablement pris en considération dans le cadre de 
l’application de l’article 24 LAT (cf. consid. 2.1). Des motifs subjectifs ne suffisent en 
effet pas pour que l'implantation d'une construction puisse être considérée comme 
imposée par sa destination, dans la mesure où de tels arguments seraient invoqués 
dans tous les cas (MUGGLI, op. cit., no 11 ad art. 24 LAT ; TF 1A.88/1999 du 8 
novembre 1999 consid. 3a in fine ; VLP-ASPAN 6/2013, Lexique des constructions 
hors de la zone à bâtir, p. 31), ce qui reviendrait à nier la séparation entre les parties 
constructibles et non constructibles. Par ailleurs, il n’est pas établi que la construction 
ne pouvait être implantée qu’à l’endroit retenu en dehors de la zone à bâtir (dans ce 
sens TF 1C_188/2016 du 20 octobre 2016 consid. 4.2). Le dossier ne permet en 
8
particulier aucune comparaison avec d’éventuels emplacements en zone à bâtir faute 
de références au dossier, le seul site également pris en considération se situant lui 
aussi en zone agricole (PJ 5 intimée). Bien que l’intimée précise qu’aucun autre site 
ne présente de tels avantages, à l’exception du site précité, on ignore tout des autres 
endroits pris en considération, notamment de ceux se situant en zone à bâtir, de telle 
sorte que le dossier ne permet pas véritablement l’examen de variantes sises en zone 
de construction. Or, comme l’a déjà admis la jurisprudence (TF 1A.88/1999, op. cit., 
consid. 3a), les bassins en béton d’une pisciculture peuvent être construits dans une 
zone de construction avec une amenée d’eau dans des conduites, même s’il en 
résulte des coûts supplémentaires, ou dans une zone spéciale prévue à cet effet au 
sens de l’article 18 LAT. Cette jurisprudence a certes été rendue sous l’empire de 
l’ancien article 24 al. 1 let. a LAT en vigueur jusqu’au 31 août 2000. Elle n’en garde 
pas moins toute sa validité dans la mesure où l’article 24 let. a LAT correspond à 
l’ancien article 24 al. 1 let. a LAT (TF 1A.161/2004 du 1er février 2005 consid. 2), 
contrairement à ce que semble soutenir l’autorité intimée dans ses remarques finales. 
Enfin, il sied encore de relever que la construction du bâtiment no 38 A comportant 
notamment un magasin pour la vente directe, un studio et un appartement ne répond 
pas non plus aux conditions de l’article 24 LAT. Le fait que seule une partie de la 
construction se trouve en zone agricole ne permet pas de faire abstraction du fait que 
l’implantation de cette construction en zone agricole n’est pas imposée par sa 
destination, ceci d’autant moins au vu de la pesée des intérêts effectuée ci-dessous.
3.3
Il ressort du dossier que c’est avant tout pour des motifs financiers que le site a été 
retenu, dans la mesure où il est possible de travailler sans aucun pompage grâce au 
seuil existant et où l’alimentation des bassins à l’endroit retenu se ferait par gravité, 
de telle sorte que l’énergie électrique nécessaire pour le pompage est de zéro (PJ 5 
intimée, p. 7). Si cet avantage n’est pas négligeable, y compris également sous l’angle 
de l’efficacité énergétique, il n’en demeure pas moins que des motifs essentiellement 
financiers ne suffisent pas pour que l’implantation d’une construction puisse être 
considérée comme imposée par sa destination (MUGGLI, op. cit., no 11 ad art. 24 LAT 
et les références citées). 
3.4
S’agissant de la pesée des intérêts en présence, en l'état de la législation, le projet 
devrait également s'implanter dans un périmètre de protection de la nature (PNa) qui 
correspond, selon le RCC de I, à des secteurs dont les structures géologiques sont 
remarquables avec des milieux associés ainsi qu'à des secteurs de forêt ou de 
prairies en lien avec des cours d'eau en zone humide (art. 203 al. 2 let. a RCC). Tous 
travaux ou interventions humaines ayant pour conséquence la modification de 
l'équilibre naturel sont interdits, à l'exception des travaux courants de gestion agricole 
ou sylvicole conformes aux buts de protection (art. 206 al. 1 RCC). Sont en particulier 
interdits les constructions, la construction de routes et de chemins, les modifications 
du terrain naturel, les creusages, déblais et remblais, les drainages ou l'irrigation (art. 
206 al. 2 let. a à e RCC). Cette disposition est entrée en vigueur en même temps que 
le plan d'aménagement local de I (cf. considérant K ci-dessus), soit après le dépôt de 
la demande de concession. Toutefois, dans la mesure où les dispositions des articles 
203ss RCC visent la protection de la nature et de l'environnement, elles s'appliquent 
9
aux procédures en cours dès leur entrée en vigueur (TF 1C_113/2014 du 3 septembre 
2014 consid. 3.1 ; ATF 139 II 243 consid. 11.1, ATF 135 II 384 consid. 2.3), de telle 
sorte qu'il convient d'en tenir compte dans le projet litigieux. 
L'intimé estime qu'en application de l'article 25 al. 1 LCAT, il est possible de déroger 
à certaines prescriptions. Selon cette disposition, des dérogations à certaines 
prescriptions peuvent être autorisées pour des motifs importants et pour autant 
qu'elles ne portent pas atteinte à un intérêt public. Or il faut bien admettre que le projet 
litigieux, à tout le moins pour la partie sise en zone agricole et périmètre de protection 
de la nature, porte atteinte à un intérêt public important, la protection de la nature, 
que la Commune de I a décidé de protéger de manière stricte dans son règlement 
communal en y interdisant toute construction. Le seul intérêt privé des promoteurs à 
pouvoir réaliser leur pisciculture à l'endroit retenu ne saurait l'emporter sur l'intérêt 
public à la protection de la nature spécialement protégé dans la règlementation 
communale, et ceci même si le projet prévoit différentes mesures de compensation. 
Une réalisation de la pisciculture à l’endroit souhaité nécessite ainsi une adaptation 
de la planification, en particulier du plan d’aménagement local de I avec une extension 
de la zone à bâtir (dans ce sens TF 1A.80/2001 du 31 mai 2002 consid. 3.1). A cet 
égard, la Cour ne peut que s’étonner que la problématique de la pisciculture n’ait pas 
été intégrée dans la révision du plan d’aménagement local de I qui a eu lieu à la même 
époque (dossier Gouvernement, p. 6), d’autant plus que la zone à bâtir est contiguë 
à la parcelle yyy et que la parcelle xxx se trouve déjà en zone de construction. A ce 
sujet se pose encore la question de l’application de l’article 30 LCAT, selon lequel les 
constructions et installations qui s’écartent notablement des prescriptions 
communales ne peuvent être autorisées qu’en vertu d’un plan spécial. Cette 
problématique peut être laissée irrésolue en l’espèce, dès lors que les conditions de 
l’article 24 LAT ne sont pas remplies. Elle pourrait toutefois se poser en relation avec 
une éventuelle modification du plan de zones de I.
En outre, il faut rappeler qu’il n’est pas possible de procéder à une véritable pesée 
des intérêts avec d’autres sites à l’exception du site de O (PJ 5 intimée), faute de 
références au dossier. Ce dernier site se trouve également en zone agricole, mais ne 
se prête pas, selon le mémoire technique du 30 mars 2017 (PJ 5 intimée) à la 
pisciculture en raison de sa proximité avec la station d’épuration des eaux de P et 
environs.
4.
Il ressort de ce qui précède que les conditions pour l'octroi d'une dérogation au sens 
des articles 24 LAT et 25 LCAT ne sont manifestement pas données, de telle sorte 
que le projet ne peut pas être autorisé en l’état. L'arrêté d'octroi de la concession de 
droit d'eau d'usage et ses annexes du 2 novembre 2016 doivent être purement et 
simplement annulés, sans qu'il soit nécessaire d'examiner les autres griefs soulevés 
par les recourantes. Il convient toutefois de préciser qu'une éventuelle nouvelle 
procédure devrait être reprise dès le départ et devrait être conduite par les autorités 
compétentes conformément à la loi sur la gestion des eaux et non plus selon 
l'ancienne loi sur l'utilisation des eaux. S'agissant de la présente procédure, dans la 
10
mesure où l'arrêté litigieux doit être annulé, il n'y a pas lieu de trancher la question de 
l'autorité compétente.
5.
…
PAR CES MOTIFS 
LA COUR ADMINISTRATIVE
admet
le recours ;
annule
l'arrêté d'octroi de la concession de droit d'eau d'usage et ses annexes du 2 novembre 2016 ;
met
les frais de la procédure par CHF 2'000.00 à raison de la moitié à la charge de D. SA, le solde 
étant laissé à l'Etat ;
prélève
la part des frais de la procédure à charge de D. SA par CHF 1'000.00 sur l’avance effectuée 
par les recourantes, D. SA étant condamnée à rembourser cette somme aux recourantes ;
restitue
aux recourantes le solde de leur avance de frais par CHF 3'000.00 ;
alloue
aux recourantes une indemnité de dépens de CHF 10'000.00, à payer à raison de la moitié 
par D. SA et l'autre moitié par le Gouvernement ;
informe
les parties des voie et délai de recours selon avis ci-après ;
ordonne
la notification du présent arrêt :

aux recourantes, par leur mandataire, Me Stéphane Voisard, avocat à Genève ;
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
à D. SA, par son mandataire, Me Henri-Joseph Theubet, avocat à Porrentruy ;

à l’intimé, le Gouvernement de la République et Canton du Jura, Hôtel du 
Gouvernement, Rue de l'Hôpital 2, 2800 Delémont ;

à l'Office fédéral du développement territorial ARE, 3003 Berne.
Porrentruy, le 4 avril 2018 
AU NOM DE LA COUR ADMINISTRATIVE
La présidente :
La greffière :
Sylviane Liniger Odiet
Carine Flury
Communication concernant les moyens de recours :
Le présent arrêt peut faire l'objet, dans les trente jours suivant sa notification, d'un recours au Tribunal fédéral. Le 
recours en matière de droit public s'exerce aux conditions des articles 82 ss de la loi du 17 juin 2005 sur le Tribunal 
fédéral (LTF - RS 173.110), le recours constitutionnel subsidiaire aux conditions des articles 113 ss LTF. Le 
mémoire de recours doit être adressé au Tribunal fédéral, 1000 Lausanne 14; il doit être rédigé dans une langue 
officielle, indiquer les conclusions, les motifs et les moyens de preuve, et être signé. Les motifs doivent exposer 
succinctement en quoi l’acte attaqué viole le droit. Si le recours n'est recevable que s'il soulève une question 
juridique de principe, il faut exposer en quoi l'affaire remplit cette condition. Les pièces invoquées comme moyens 
de preuve doivent être jointes au mémoire, pour autant qu’elles soient en mains de la partie; il en va de même de 
la décision attaquée.