ge_gerichte · ATA/396/2009 · 2009-08-25 · fr

Résumé:
 Action pécuniaire intentée par le Conseil d'Etat contre la société des mouettes genevoises rejetée. Les contrats de prestations prévoyaient que la société était responsable de ses résultats financiers. Il s'agissait d'accords spécifiques qui dérogeaient au principe de non-thésaurisation prévu par la aLGAF et la LIAF. Par ailleurs, le Conseil d'Etat ne peut pas invoquer d'erreur dans l'établissement des budgets. Ceux-ci ont fait l'objet de négociations et aucun élément du dossier ne permet de considérer que la SMGN a dissimulé certains faits ou qu'il y a eu tromperie de sa part. Le Conseil d'Etat ne peut ainsi pas réclamer la restitution d'un trop-perçu de subventions pour les années 2004, 2005 et 2006.

RÉPUBLIQUE ET 
 
CANTON DE GENÈVE
POUVOIR JUDICIAIRE 
A/367/2008-CE 
ATA/396/2008 
ARRÊT 
DU TRIBUNAL ADMINISTRATIF 
du 25 août 2009 
 
dans la cause 
 
 
 
 
CONSEIL D'ÉTAT 
 
 
 
 
contre 
 
 
 
 
SOCIÉTÉ DES MOUETTES GENEVOISES NAVIGATION S.A. 
représentée par Me Pierre de Preux, avocat 
 


- 2/24 - 
A/367/2008 
EN FAIT 
1. 
a. 
La Société des Mouettes Genevoises Navigation S.A. (ci-après : SMGN) est 
une société anonyme qui a pour but l’exploitation d’un service de bateaux à 
moteur dans la rade de Genève, le petit lac et d’une manière générale sur le lac 
Léman, le Rhône et autres eaux, le cas échéant, selon les concessions octroyées 
par la Confédération. 
 
b. 
Les actions de la société sont détenues par Monsieur Roland Charrière et par 
son fils, Monsieur Joël Charrière. M. R. Charrière exerce la fonction de directeur, 
M. J. Charrière celle de directeur-adjoint. Le président du conseil d'administration 
est Monsieur Antoine Böhler. 
2. 
 
Depuis le 2 juin 2008, M. J. Charrière est également directeur de 
"SwissBoat Joël Charrière" exploitée sous la forme d'une entreprise individuelle et 
dont le but est le commerce et la location de bateaux, les excursions nautiques et 
l'exploitation d’un chantier naval. Ces activités étaient précédemment exercées par 
M. R. Charrière, en raison individuelle, sous l'enseigne "Swissboat". " 
3. 
 
Le 27 décembre 2000, l'office fédéral des transports (ci-après : OFT) a 
accordé à la SMGN une nouvelle concession pour une durée de 25 ans qui porte 
sur le Rhône, entre le pont de la Machine et le barrage de Verbois, et sur le petit 
lac, jusqu'au creux de Genthod et Bellerive. 
4. 
 
Depuis 2001, la SMGN est membre, avec les CFF et les TPG, de la société 
simple "Unireso" qui forme la communauté tarifaire de transports publics en 
offrant une billetterie unique pour les transports dans les trois entreprises. 
5. 
a. 
Le 1er juin 2001, la République et canton de Genève, représentée par le 
département de justice et police et des transports, selon la terminologie alors en 
vigueur, et la SMGN ont conclu un contrat de prestations pluriannuel 2001-2004 
relatif à la desserte lacustre des lignes régulières de transport sur le bas lac, soit les 
lignes M1, M2 et M3 (ci-après : contrat 2001-2004), valable du 1er janvier 2001 
au 31 décembre 2004. 
 
 
Par ce contrat, les parties désiraient préserver et développer les prestations 
de transport offertes entre les deux rives du lac et assurer cette prestation au 
moindre coût, tant pour l’usager qui bénéficiait des avantages de la communauté 
tarifaire que pour le département qui versait une contribution complémentaire à 
l’exploitant. A cette fin, la SMGN s’engageait à assurer auprès des usagers la 
desserte lacustre des lignes M1, M2 et M3 entre mars et octobre selon les horaires 
et conditions convenus (art. 2 du contrat 2001-2004). En échange, le département 
versait une contribution forfaitaire de CHF 531’000.- pour l’année 2001, de 


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CHF 559’000.- pour l’année 2002, de CHF 605’000.- pour l’année 2003 et de 
CHF 653’000.- pour l’année 2004. Les art. 35 ss de la loi sur la gestion 
administrative et financière de l’Etat de Genève du 7 octobre 1993 (LGAF - D 1 
05), applicable aux organismes subventionnés étaient réservés (art. 8 al. 1 du 
contrat 2001-2004). 
 
 
Le contrat spécifiait que la contribution financière était fixée pour chaque 
année sur la base d’une part des recettes de la communauté tarifaire de 0,66 %, 
s'élevant au minimum à CHF 541’000.- par année. Si le montant des recettes de la 
communauté tarifaire accordé à la SMGN excédait CHF 541’000.-, la contribution 
du canton était réduite d’autant (art. 8 al. 2 du contrat 2001-2004). Les 
contributions financières annuelles avaient par ailleurs été définies en prenant en 
considération les recettes nécessaires à la SMGN ainsi que les coûts 
d’investissement prévus à l’annexe 3 du contrat (art. 8 al. 3 du contrat 2001-
2004). Dès le second exercice annuel, la contribution forfaitaire était indexée à 
l'augmentation du coût de la vie (art. 8 al. 4 du contrat 2001-2004). 
 
 
L’art. 8 al. 6 du contrat 2001-2004 prévoyait encore que, sous réserve des al. 
1 et 2, la SMGN était responsable de ses résultats financiers. Elle conservait les 
excédents des produits et supportait les excédents de charges. 
 
 
Enfin, la SMGN remettait au département son rapport d'activité comprenant 
les états financiers, le rapport de révision y relatif, le procès-verbal de l'assemblée 
générale approuvant les comptes, ainsi que des statistiques d'exploitation 
détaillées et dûment complétées, selon le modèle ATG au plus tard le 30 juin qui 
suivait l'exercice budgétaire (art. 12 du contrat 2001-2004). 
 
b. 
Ce contrat succédait à une convention financière pluriannuelle, signée le 9 
avril 1998 et valable du 1er janvier 1998 au 31 décembre 2000, dont la fonction 
essentielle était de couvrir les déficits d'exploitation des deux seules lignes 
lacustres alors intégrées au réseau des transports publics. 
6. 
 
Durant l'année 2004, l'offre en transports lacustres a été annualisée et une 
nouvelle ligne M4 entre Genève-Plage et la Perle du lac a été créée. Ces nouvelles 
prestations ont été formalisées dans un courrier adressé le 24 mars 2004 par le 
département de l’intérieur, de l’agriculture et de l’environnement (ci-après : 
DIAE) à la SMGN. 
 
 
Ainsi, pour 2004, les heures d'exploitation, initialement convenues à 6'900 
heures/an dans le contrat 2001-2004, passaient à 19'080 heures/an. La contribution 
forfaitaire était fixée à CHF 1’885’592.- pour l’année 2004. Ce montant prenait en 
compte la part des recettes accordée à la SMGN par la communauté tarifaire 
intégrale Unireso et des produits liés aux indemnités et compléments tarifaires, 
ainsi que les éventuels revenus publicitaires escomptés, soit un montant de 


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CHF 702'712.-. L'art. 8 al. 2 du contrat 2001-2004 n'était pas applicable car les 
recettes susmentionnées faisaient foi. 
7. 
 
Un nouveau contrat de prestations a été conclu pour les années 2005-2006 
entre la République et canton de Genève, représentée alors par le DIAE, et la 
SMGN (ci-après : contrat 2005-2006). 
 
 
Selon l'art. 11 al. 1 de ce dernier, la contribution financière de l’Etat était de 
CHF 1’818’692.- pour 2005 et de CHF 1’870’407.- pour 2006. 
 
 
Les montants de la contribution cantonale prenaient en compte, comme suit, 
la part de recettes attribuée à la SMGN par la communauté tarifaire intégrale 
Unireso, sous réserve de décisions ultérieures éventuelles en matière de 
tarification : 
Produits planifiés 
2005 
2006 
Recettes nettes 
Unireso 
 CHF 745'859.- 
 CHF 771'804.- 
Contribution du canton CHF 1'818'692.- 
 CHF 1'870'407.- 
 
 
L'Etat garantissait le montant des recettes, net de frais de fonctionnement 
Unireso, mentionnées ci-dessus (art. 11 al. 3 du contrat 2005-2006). 
 
 
La SMGN était responsable de ses résultats financiers sous réserve des al. 1 
et 2. Elle conservait les excédents des produits et supportait les excédents de 
charges (art. 11 al. 5). 
8. 
a. 
De septembre 2005 à juillet 2006, l’inspection cantonale des finances (ci-
après : ICF) a procédé au contrôle des comptes 2004 et 2005 de la SMGN. 
 
b. 
Le 21 août 2006, l’ICF, suspectant l'existence de délits, a rendu un pré-
projet de rapport au département du territoire (ci-après : DT). Ce dernier a alors 
déposé une dénonciation pénale le 5 septembre 2006 auprès du Procureur général 
qui, sur la base de la décision de soit-communiqué du Juge d'instruction du 28 
septembre 2006, a classé le dossier le 5 octobre 2006. 
 
c. 
Le 12 janvier 2007, l'ICF a rendu son rapport portant sur les exercices 2004 
et 2005. Celui-ci faisait état d’un certain nombre de problèmes dus à l'imbrication 
des activités subventionnées, des activités privées de la SMGN et de celles de 
Swissboat. En l’absence de pièces comptables, la vérification de la ventilation 
correcte des charges salariales entre la SMGN et Swissboat n'avait pas été 
possible. Toutefois, selon certains témoignages, la subvention accordée à la 
SMGN avait servi à payer des salaires relatifs à l'activité de Swissboat des 
dépenses salariales qui ne la concernaient pas. De même, des revenus générés par 


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les croisières privées de la SMGN n'avaient vraisemblablement pas été 
intégralement enregistrés dans les comptes. Il existait également un risque que des 
factures concernant Swissboat aient été payées par la SMGN. 
 
 
Par ailleurs, la direction de la SMGN avait présenté des budgets inexacts. 
Selon l'ICF, il y avait eu une sur-budgétisation de CHF 490'000.- en 2004, dont 
près de CHF 220'000.- constituaient des erreurs qui auraient dû être relevées lors 
de l'établissement du budget, et de CHF 227'000.- pour l'exercice 2005. Ces 
erreurs avaient permis à la société de bénéficier d’une subvention trop élevée et, 
en conséquence, de conserver des bénéfices qui n’étaient pas liés à la qualité de sa 
gestion. Les résultats des exercices 2004 et 2005 de la SMGN étaient encore 
faussés par l'existence de charges injustifiées à hauteur d’environ CHF 170’000.- 
pour 2004 et CHF 167’000.- pour 2005. Ces charges étaient constituées de 
provisions injustifiées et du versement à Swissboat d’un montant de CHF 50’000.- 
pour des travaux qui n’avaient pas été réalisés en tout ou partie. En donnant une 
image erronée de la situation financière de la SMGN, la comptabilisation de 
charges injustifiées aboutissait à la surestimation des besoins financiers de la 
SMGN et biaisait le mécanisme des négociations de l’aide financière entre l’Etat 
et la société. 
 
 
La SMGN n’avait également pas restitué spontanément des montants dus à 
l’Etat en vertu des dispositions contractuelles et le département n’avait pas assumé 
sa mission de contrôle. Le montant de la rémunération du conseil d’administration 
de la SMGN était, de l’avis de l’ICF, trop élevé. Les états financiers révisés de la 
SMGN n’étaient pas présentés de manière claire et intelligible. Leur lecture était 
peu aisée et ne permettait pas de vérifier l’adéquation de l’utilisation de la 
subvention versée par l’Etat en faveur des lignes subventionnées. Enfin, les 
chiffres communiqués à l’office cantonal de la mobilité (ci-après : OCM) 
concernant le nombre de passagers transportés sur les lignes subventionnées 
étaient surestimés. 
 
 
Le rapport concluait à la nécessité de mettre en place un système de gestion 
permettant de garantir que la subvention versée par l’Etat soit utilisée de manière 
économe et à bon escient. Pour corriger les erreurs budgétaires et comptables 
constatées durant les exercices 2004 et 2005, l’ICF recommandait au département 
de réclamer la restitution d’une partie de l’enveloppe budgétaire, à la SMGN de 
demander à Swissboat le remboursement de la partie de l’avance des 
CHF 50’000.- qui n’avait pas été dépensée, d'une part, et à la SMGN de retraiter 
ses comptes à la lumière des observations faites sur les provisions injustifiées, 
d'autre part. 
9. 
 
Le contrat de prestations 2005-2006 a été prolongé par deux avenants, 
signés respectivement les 22 décembre 2006 et 28 mars 2007. Un troisième 
avenant a étendu la durée de validité du contrat de prestations au 31 décembre 
2007 et a modifié certaines clauses du contrat. 


- 6/24 - 
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10. 
a. 
Le 21 mars 2007, le Conseil d’Etat a chargé l'OCM, en collaboration avec le 
département des finances (ci-après : DF), de recalculer le montant des subventions 
indûment versé à la SMGN pour les exercices 2004 et 2005 par l’Etat de Genève. 
 
b. 
L'OCM a étendu son investigation à l'année 2006. Il a procédé à des 
analyses des comptes et budgets des années considérées et vérifié les questions 
salariales et autres prestations sociales des employés avec le département de la 
solidarité et de l'emploi. 
 
 
Selon son rapport rendu le 25 juin 2007, pour 2004, 2005 et 2006, les 
charges salariales relatives à l'activité de transport public comptabilisées étaient 
chaque année inférieures au montant budgétisé. L'écart entre les montants prévus 
et ceux résultant des comptes correspondait à CHF 231'014.- pour 2004, 
CHF 147'982.- pour 2005 et CHF 269'074.- pour 2006. Il correspondait en partie à 
la sous-budgétisation des charges salariales relatives à l'activité de transport privé. 
Quant aux amortissements, il s'agissait de charges calculées selon des règles 
précises qui, sauf investissement imprévu en cours d'exercice, pouvaient être en 
principe déterminées avec certitude lors de l'élaboration budgétaire. En 
l'occurrence, les amortissements avaient été sur-budgétisés pour ce qui était des 
bateaux et sous-estimés pour les autres types d'amortissements. Globalement, il y 
avait ainsi eu une sur-budgétisation qui s'élevait à CHF 45'342.-. Enfin, Swissboat 
avait effectué des travaux pour un montant de CHF 49'711,20, attestés par une 
facture du 29 novembre 2006. Une somme résiduelle de CHF 288,80 devait être 
restituée à la SMGN qui avait avancé un montant de CHF 50'000.-. 
 
 
Le montant des subventions indûment versées à la SMGN par l’Etat 
s’élevait donc à CHF 693’412.- pour les années 2004, 2005 et 2006. 
11. 
 
Le 5 juillet 2007, la SMGN s’est déterminée sur ce rapport. Le contrat 2005-
2006 ne réservait pas de mécanisme d’ajustement de la contribution forfaitaire de 
l’Etat. Ce dernier ne disposait dès lors d’aucune base légale ou contractuelle pour 
réclamer la restitution de montants versés en application de ce contrat. 
12. 
 
Le 12 juillet 2007, le département a contesté les arguments développés par 
la SMGN. 
 
 
Le mécanisme de restitution concernait la situation où les recettes étaient 
supérieures à celles prévues dans le cadre du contrat de prestations. En 
l’occurrence, les montants réclamés résultaient d’erreurs substantielles dans 
l’élaboration des budgets 2004, 2005 et 2006 et d’un usage inadéquat des 
contributions publiques pour assurer la rémunération des collaborateurs effectuant 
des prestations en lien avec l’activité touristique privée de la SMGN. 


- 7/24 - 
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La SMGN ne pouvait remettre en question son engagement à rembourser les 
montants dus alors qu’elle s’était déclarée prête à le faire de manière répétée et 
dans des circonstances diverses. 
13. 
 
Le 23 juillet 2007, l’OCM a envoyé une facture de CHF 693’412.- à la 
SMGN. 
14. 
 
Lors d'une réunion le 25 juillet 2007 à laquelle assistaient MM. Charrière et 
des représentants du DT, M. Böhler a expliqué que la SMGN ne disposait pas des 
liquidités nécessaires pour payer le montant réclamé et que ce remboursement 
n’était pas conforme au contrat de prestations. Si la facture devait être maintenue, 
la société serait alors dans l’obligation de déposer le bilan car les bateaux ne 
valaient plus rien en l’absence de contrat de prestations et les actifs ne 
couvriraient donc plus les dettes sociales. 
15. 
 
Un échange de courriers a eu lieu entre le département et la SMGN, chacun 
campant sur ses positions. 
16. 
 
Le 1er puis le 25 octobre 2007, l’OCM a adressé deux rappels à la SMGN. 
17. 
 
Par acte daté du 3, mais reçu le 7 février 2008, le Conseil d’Etat de la 
République du canton de Genève, soit pour lui le DT, auquel est rattaché l'OCM, a 
déposé une demande en paiement auprès du Tribunal administratif contre la 
SMGN à laquelle il réclame le paiement de CHF 693’412.- avec intérêts à 5 % 
l’an dès le 23 juillet 2007. 
 
 
Les subventions accordées en 2004 et en 2005 à la SMGN étaient soumises 
à la loi sur la gestion administrative et financière de l’Etat de Genève du 7 octobre 
1993 (LGAF - D 1 05) dans sa version antérieure au 1er janvier 2006 (ci-après : 
aLGAF). En application de l'art. 36 al. 4 aLGAF une entité subventionnée n’avait 
pas le droit de thésauriser les montants qui n’avaient pas été dépensés dans 
l’exécution de son activité subventionnée. Elle n’avait dès lors, à plus forte raison, 
pas le droit de disposer librement de ces montants non dépensés, et encore moins 
de les utiliser à des fins privées dans le cadre d’activités commerciales qui 
n’étaient pas comprises dans les prestations subventionnées. Ni le contrat 2001-
2004, ni le contrat 2005-2006 ne prévoyaient la possibilité pour la SMGN de 
thésauriser les montants non dépensés. Le département n’aurait d’ailleurs pas pu 
valablement s’engager à laisser à la libre disposition de la SMGN les montants 
des subventions annuelles qu’elle avait reçus en trop du fait de calculs budgétaires 
erronés. En l’espèce, des erreurs dans l'établissement des budgets qui avaient 
déterminé les montants des subventions avaient engendré des écarts très nets entre 
les montants alloués à la SMGN pour les exercices 2004 et 2005 et les montants 
effectivement dépensés par cette société pour exécuter ses prestations de transport 
public. Les montants correspondant à ces écarts devaient donc être restitués à 
l’Etat, soit un montant total de CHF 421’193.- pour les années 2004 et 2005. 


- 8/24 - 
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Le même raisonnement s’appliquait à la subvention 2006 qui était soumise 
aux dispositions de la loi sur les indemnités et les aides financières du 15 
décembre 2005 (LIAF - D 1 11) par renvoi de l’art. 35 al. 2 LGAF. La subvention 
versée à la SMGN répondait à la définition d’indemnités au sens de l’art. 2 al. 2 
LIAF et aucune des exceptions mentionnées à l’art. 4 LIAF n’était réalisée. En 
particulier, l’exception prévue à l’art. 4 let. b LIAF devait être interprétée de 
manière restrictive et ne pouvait s’appliquer que dans le cadre de contrats de droit 
privé. En l’occurrence, les sommes reçues par la SMGN l’étaient sur la base de 
contrat de droit public. Quant à l'exception prévue à l’art. 4 let. i LIAF, elle ne 
s'appliquait pas, car la SMGN ne percevait aucun montant fondé sur la loi fédérale 
sur les transports publics du 4 octobre 1985 (LTP - RS 742.40). Les prestations 
fournies par la SMGN découlaient du contrat de prestations et n’étaient pas des 
prestations supplémentaires au sens de l’art. 8 LTP. Quant aux sommes versées en 
application de l’art. 11 LTP pour permettre des facilités tarifaires, elles n’étaient 
pas versées à la SMGN mais à la communauté tarifaire Unireso. La subvention 
accordée à la SMGN pouvait d’ailleurs être qualifiée d’aide financière au sens de 
l’art. 2 al. 1 LIAF. De toute manière, qu’il s’agisse d’une aide financière ou d’une 
indemnité, il convenait d’appliquer l’art. 17 LIAF qui avait, en substance, la 
même portée que l'art. 36 al. 4 aLGAF. Dans le cas d'espèce, il existait un écart de 
CHF 272’219.-, entre le montant de la subvention alloué à la SMGN pour l’année 
2006 et le montant effectivement dépensé cette année-là pour exécuter à 
satisfaction les prestations de transport public, qui devait être restitué à l’Etat. 
 
 
Si, par impossible, le Tribunal administratif devait considérer que les 
dispositions de droit public précitées n'étaient pas applicables, il convenait de se 
référer aux dispositions de la loi fédérale, du 30 mars 1911, complétant le code 
civil suisse (CO - RS 220) relatives à l’enrichissement illégitime. Il avait été 
démontré que des erreurs de calcul des budgets, identifiées tardivement par les 
services de l’Etat, avaient amené les parties aux contrats 2001-2004 et 2005-2006 
à surestimer les montants des subventions nécessaires à la fourniture des 
prestations. Ces erreurs de calcul n’infirmaient pas la validité des contrats mais 
devaient être corrigées. Partant, le trop-perçu des subventions 2004 à 2006 avait 
été encaissé par la SMGN sans cause valable et devait donc être restitué à l’Etat. 
Ce dernier avait déterminé le montant dû le 25 juin 2007, date du rapport 
interdépartemental. Il avait ainsi agi à temps eu égard à la prescription annale de 
l’art. 67 CO. 
18. 
 
La SMGN s'est déterminée le 31 mars 2008. Elle conclut à l’irrecevabilité 
de la demande en paiement, subsidiairement à son rejet. 
 
 
La demande était intentée par le Conseil d’Etat et non par la République et 
canton de Genève. Le Conseil d’Etat n’était qu’un pouvoir et ne possédait pas la 
capacité d’être partie, faute d’existence juridique propre. Il affirmait agir par le 
biais du DT sans produire d'explication ou de preuve quant à cette délégation de 


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compétences. Si une telle délégation de compétences devait exister, le 
département pourrait éventuellement agir au nom de la République et canton de 
Genève, pour autant que celle-ci ait décidé d’ouvrir action en paiement contre la 
défenderesse. Or, rien ne permettait de considérer que tel était le cas. La demande 
était donc irrecevable pour ces trois raisons. 
 
 
L’irrecevabilité de la demande devait également être prononcée car les 
conclusions prises ne spécifiaient pas en faveur de qui le paiement devrait 
intervenir. 
 
 
Sur le fond, la SMGN exerçait son activité en application de la LTP et elle 
était au bénéfice d'une concession fédérale. En vertu de l'art. 8 al. 2 LTP qui 
imposait aux collectivités publiques d'indemniser complètement les entreprises, 
elle avait conclu avec la République et le canton de Genève des contrats de 
prestations. Selon la doctrine, dans le cas d’une concession de service public, le 
concessionnaire exerçait l’activité concédée à ses propres risques et profits. 
 
 
En l’espèce, les contrats de prestations 2001-2004 et 2005-2006 prévoyaient 
explicitement l'octroi par l’Etat d'une certaine somme pour fournir les prestations 
convenues. De son côté, la société était responsable de ses résultats financiers. 
Elle conservait les excédents des produits et supportait les excédents de charges. 
 
 
Il ressortait des textes des deux contrats que le montant de la prestation 
étatique était fixe et immuable. Aucun remboursement d’un montant susceptible 
d’être thésaurisé n’avait été envisagé contractuellement. D'ailleurs, l’Etat n’avait 
jamais rien réclamé à ce titre avant l’introduction de la présente demande. De 
plus, les résultats comptables pour les exercices 2004 et 2005 affichaient un profit 
global de CHF 148’258,58 et une perte pour les activités touristiques de 
CHF 24’257.-. Il s’ensuivait que le bénéfice réel réalisé suite à des erreurs de 
calcul des budgets avait été affecté à couvrir les pertes des activités touristiques à 
concurrence de ce montant. Le demandeur devait donc être débouté de ses 
prétentions en restitution du trop-perçu pour les années 2004 et 2005, sauf à 
considérer que l’Etat de Genève pouvait signer des contrats de prestations puis 
librement recalculer le prix qu’il entendait payer pour celles-ci après que le 
prestataire de services ait complètement exécuté ses obligations. 
 
 
S’agissant de l’année 2006, la LIAF n’était pas applicable, le contrat 2005-
2006 ayant été conclu avant l’entrée en vigueur de cette loi. Par ailleurs, 
contrairement aux allégués de la demanderesse, la SGMN était au bénéfice des 
exceptions prévues à l’art. 4 let. b et i LIAF. En commandant des prestations de 
transport à la SMGN, l’Etat de Genève devait en payer le prix et, selon la 
terminologie tant fédérale que cantonale, il s’agissait bien d’indemnités et non pas 
d’aides financières au sens de l’art. 2 al. 1 LIAF, ce d’autant que la SMGN 
agissait sur la base d’une concession de transport octroyée par la Confédération. 
Si l’art. 17 al. 1 LIAF devait s’appliquer, ce serait au Conseil d’Etat de lui fixer un 


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délai pour la restitution des montants non dépensés et non au département 
concerné. Or, le Conseil d’Etat n’avait jamais rendu de décision dans ce sens. 
Enfin, le texte même des contrats de prestations stipulait que la SMGN était seule 
responsable de ses résultats financiers car elle conservait les excédents des 
produits et supportait les excédents de charges. 
 
 
Le CO n’était pas plus applicable. Les montants avaient été versés par l’Etat 
de Genève en exécution de contrats signés et exécutés ponctuellement par les 
deux parties. Ces contrats n’avaient jamais été invalidés pour cause d’erreur 
essentielle ou pour un autre vice de la volonté. En ayant encaissé les montants qui 
lui revenaient au titre de ces contrats, la défenderesse ne s’était nullement enrichie 
au sens de l’art. 62 CO et l’Etat de Genève n’avait pas volontairement payé ce 
qu’il ne devait pas au sens de l’art. 63 CO. Par ailleurs, l’Etat de Genève n’avait 
pas invalidé lesdits contrats dans le délai d’un an fixé par l’art. 31 CO de sorte que 
ceux-ci étaient tenus pour ratifiés. 
19. 
 
Une audience de comparution personnelle des parties a eu lieu le 18 avril 
2008. A cette occasion, le DT a déclaré qu'il n'y avait plus matière à discussion et 
que le litige devait être tranché. Il a reconnu que, s'agissant des prestations de 
transports, la SMGN avait exécuté correctement ses obligations. Pour 2008, le 
contrat de prestations était appliqué mais devait encore être ratifié par le Grand 
Conseil. 
 
 
La SMGN était, de son côté, prête à discuter même si, juridiquement, elle 
considérait ne pas devoir les montants réclamés. Si la demande était acceptée en 
totalité, elle se trouverait en état de faillite. 
20. 
 
Le Conseil d’Etat a répliqué le 12 juin 2008. Il a maintenu sa position et a 
repris son argumentation. 
 
 
Aux termes de l’art. 101 de la Constitution de la République et canton de 
Genève, du 24 mai 1847 (Cst-GE ; RS A 2 00), il détenait le pouvoir exécutif et 
l’administration générale du canton. Il lui appartenait donc de procéder au 
recouvrement de la créance litigieuse. Par ailleurs, la LGAF prévoyait que chaque 
département, par délégation du Conseil d’Etat, était compétent pour la défense 
adéquate de ses droits en matière pécuniaire à l’égard de tiers. L’art. 2 al. 1 de la 
loi sur l’exercice des compétences du Conseil d’Etat et l’organisation de 
l’administration du 16 septembre 1993 (LECO - B 1 15) ne prescrivait pas la 
forme que devaient revêtir les délégations de compétence. En l’occurrence, le DT 
était en charge des questions de mobilité en application de l’art. 7 al. 1 let. f du 
règlement sur l’organisation de l’administration cantonale du 18 juin 2008 
(ROAC - B 4 05.10). Il bénéficiait donc déjà, par cette seule disposition 
réglementaire, d’une délégation de compétences pour traiter des dossiers en 
matière de mobilité. Le département, qui était en charge du dossier et dans 
l’obligation légale de défendre ses droits en matière pécuniaire, n’avait dès lors 


- 11/24 - 
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pas formellement besoin d’une décision pour ouvrir action en paiement contre la 
SMGN. Enfin, il apparaissait évident que le département réclamait pour le compte 
du Conseil d’Etat et donc de la République et canton de Genève la restitution des 
montants indûment versés. 
 
 
Il convenait de ne pas confondre la régale des transports de voyageurs et les 
concessions délivrées par la Confédération et la volonté d’un canton de financer 
une entité tierce pour effectuer une tâche revêtant un caractère d’utilité publique. 
Plus précisément, le financement des prestations de transport relevait, pour le 
trafic régional, de la compétence commune de la Confédération et des cantons. La 
compétence était toutefois exclusivement cantonale pour le financement du trafic 
local et d’excursion. Le trafic assuré par la SMGN étant local, le financement de 
celui-ci relevait d’une compétence cantonale exclusive. Ainsi, seuls le droit public 
cantonal et le contrat de prestations régissaient la question du financement de 
l’offre de base des prestations publiques de la SMGN. 
 
 
Une dérogation au principe de non-thésaurisation devait poursuivre un but 
en rapport direct avec la finalité de la subvention comme l’un ou l’autre des buts 
énumérés à l’art. 36 al. 4 aLGAF. L’art. 36 al. 2 aLGAF corroborait cette 
interprétation, l’une des conditions d’octroi d’une subvention étant que les 
objectifs visés correspondent à des buts d’utilité publique. S’il était vrai que les 
art. 8 al. 6 du contrat 2001-2004 et 11 al. 5 du contrat 2005-2006 prévoyaient que 
la SMGN était responsable de ses résultats financiers et qu’elle conservait les 
excédents des produits et supportait les excédents de charge, il n’en demeurait pas 
moins que l'on ne se trouvait pas en présence de l’un ou l’autre des buts énumérés 
par la dernière phrase de l’art. 36 al. 4 aLGAF, ni même d'un but similaire en 
rapport direct avec la finalité de la subvention. La disposition contractuelle 
commune aux deux contrats ne prévoyait ainsi pas de déroger au principe de non-
thésaurisation. Au contraire, le contrat 2001-2004 envisageait l'application de 
cette disposition sous réserve des art. 35 ss LGAF et non pas l’inverse. Les 
excédents des produits dont il était question ne concernaient donc pas les 
montants de subventions perçus en trop par la SMGN. 
 
 
La SMGN ne pouvait pas se prévaloir du fait que les bénéfices n'étaient pas 
suffisants pour rembourser les sommes dues à l'Etat et qu'il n'y avait plus de 
montants non dépensés, du moment où ils avaient été affectés à des fins étrangères 
à tout objectif d'utilité publique, en violation des contrats 2001-2004 et 2005-2006 
et des normes de droit public en matière de subventions. Par ailleurs, il n'était pas 
nécessaire de prévoir à l'avance les modalités de restitution du trop-perçu. Il n'était 
également pas nécessaire de prévoir dans le contrat la restitution des montants non 
dépensés par l'entité subventionnée puisqu'il s'agissait d'une disposition de droit 
public. 
 
 
Si le tribunal de céans devait refuser d'appliquer l'art. 36 aLGAF et la LIAF, 
il convenait de se référer par analogie aux art. 24 al. 3 et 62 CO. Vu l'intérêt 


- 12/24 - 
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public au bon usage des deniers publics, les erreurs dans le calcul des budgets 
devaient être corrigées et le trop-perçu des subventions restitué. 
21. 
 
La SMGN a dupliqué le 15 septembre 2008. Elle s'est référée à ses 
arguments déjà développés et a persisté intégralement dans ses précédentes 
conclusions. 
 
 
Pour le surplus, le Conseil d’Etat ne pouvait agir qu’au nom et pour le 
compte de la République et canton de Genève. Or, il avait introduit la demande en 
paiement en son nom et pour son compte exclusivement, ce qui rendait celle-ci 
irrecevable. Le DT pouvait effectivement introduire une action contre la SMGN 
mais il devait le faire au nom et pour le compte de l’Etat. L'informalité par 
laquelle le Conseil d’Etat avait initié une procédure sans être formellement 
titulaire de la créance invoquée et/ou sans l’avoir fait pour la collectivité publique, 
était irréparable. La désignation des parties, l’exposé des faits et la prise de 
conclusions faisaient partie des éléments devant figurer, sous peine 
d’irrecevabilité, dans une requête présentée devant une autorité judiciaire. Il 
s’agissait d’un formalisme minimal. En l'occurrence, il ne s’agissait pas de 
corriger une simple erreur de calcul ou une lacune grossière dans les conclusions, 
mais l’identité d’une partie à la procédure. Par conséquent, il n'y avait pas de 
formalisme excessif, les conditions minimales n’ayant pas été remplies. 
 
 
Selon un avis donné sur sa demande par l'OFT, le transport régulier de 
voyageurs était soumis à la LTP, ce qui signifiait que l’art. 8 al. 2 LTP 
s’appliquait aux coûts non couverts des prestations définies à l’al. 1 de cette même 
disposition. Les dispositions cantonales ne pouvaient pas contourner la législation 
fédérale en imposant des règles plus défavorables aux entreprises prestataires de 
transport. D’un point de vue juridique et économique, la SMGN n’était donc pas 
tenue par le principe de non-thésaurisation invoqué par le Conseil d’Etat. 
 
 
Les deux contrats de prestations consacraient expressément le principe de la 
responsabilité unique de la SMGN s'agissant de ses profits et de ses charges. Il 
s'agissait d'un cas d'application de l'activité exercée aux risques et périls du seul 
concessionnaire. La clause d'ajustement de la subvention étatique en fonction de 
la recette d'Unireso prévue dans le contrat 2001-2004 avait été abrogée dès 
l'exercice 2004. A la suite du rapport de l'ICF, le DT avait adressé à la SMGN une 
facture de CHF 60'205,43 afin de régulariser le montant des contributions perçues 
pendant les années 2001 à 2003. Cette question avait ainsi été réglée. Le montant 
de la participation étatique était fixe et immuable pour les années 2004, 2005 et 
2006. 
 
 
En recalculant a posteriori le montant des contributions, le Conseil d'Etat 
n'avait pas pris en compte les résultats financiers réels de la SMGN qui révélaient 
des bénéfices largement inférieurs aux montants réclamés. 


- 13/24 - 
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22. 
 
Le 3 avril 2009, le juge délégué a requis l'apport de la procédure pénale 
(P/13925/2006). 
23. 
 
Le 30 juin 2009, la SMGN s'est déterminée après avoir pris connaissance de 
la procédure pénale. 
 
 
L'instruction pénale avait démontré qu'elle n'avait jamais cherché à tromper 
les représentants de l'Etat ni tenté de dissimuler la moindre information lors des 
discussions entourant la fixation de la contribution étatique. Le calcul des 
subventions s'était fait sur la base de négociations entre deux parties, libres de 
conclure ou de refuser les termes d'un accord. L'Etat était entouré de spécialistes. 
Aucune des parties n'avait été en mesure de détecter les erreurs commises par le 
réviseur externe de la SMGN qui avait reconnu s'être trompé. L'Etat avait 
souhaité, dans l'urgence, une augmentation considérable des prestations en même 
temps qu'il exigeait de la SMGN qu'elle supporte seule les pertes en cas de déficit. 
Il lui appartenait donc de se montrer d'autant plus vigilant dans le cadre des 
négociations. 
 
 
La SMGN s'était déclarée prête à restituer un montant à l'Etat sans 
reconnaissance d'une responsabilité découlant d'une obligation légale ou 
contractuelle. La somme maximale qu'elle était ainsi disposée à verser ne pouvait 
correspondre qu'aux bénéfices réalisés lors des exercices 2004, 2005 et 2006, sauf 
à exiger qu'elle prenne à sa charge des pertes pour des prestations fournies à 
satisfaction et fondées sur un contrat librement négocié et conclu en toute bonne 
foi. Faute de s'appuyer sur une base juridique valable, le Conseil d'Etat ne pouvait 
pas modifier les termes de conventions signées et exécutées, en recalculant 
rétroactivement, selon sa seule appréciation, le montant de ses subventions. 
24. 
 
Le Conseil d'Etat n'a pas transmis d'observations. 
25. 
 
Sur quoi, la cause a été gardée à juger. 
26. 
a. 
La procédure pénale a fait apparaître les éléments suivants résultants des 
auditions de : 
 
i. 
Monsieur Fabrice Etienne, ingénieur à l'OCM, a expliqué que, dans les 
rapports avec la SMGN, l'Etat était représenté par le DT qui gérait le dossier. Lui-
même avait la charge de celui-ci. 
 
 
Avant d'être soumis au Conseil d'Etat pour signature, les contrats de 
prestations étaient remis au DF qui examinait les incidences financières de ceux-
ci. Le contrat de transition pour l'année 2004 n'avait pas été analysé par le DF car 
le développement de l'offre de la SMGN résultait d'une décision du DT. Au sein 
de ce dernier, les aspects financiers du mandat 2004 et du contrat 2005-2006 
avaient été examinés par un économiste. 


- 14/24 - 
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Les subsides alloués à la SMGN tenaient compte à la fois des recettes 
versées par Unireso et des charges liées à l'exploitation des lignes exploitées. La 
conclusion de chacune des conventions ou mandat, soit en 2001, 2004 et 2005, 
avait été précédée de négociations entre le département et la SMGN au terme 
desquelles les montants des subsides annuels avaient été arrêtés. Comme les 
recettes n'étaient pas maîtrisées, les négociations portaient sur les charges. Les 
montants des subventions alloués à la SMGN pour les années 2001 à 2003 avaient 
été convenus sur la base d'une étude menée par le bureau Team+. Ils avaient été 
fixés définitivement lors d'une séance du 14 décembre 2000. 
 
 
Aucun contrôle de la conformité de ces comptes aux budgets présentés 
n'avait été effectué lorsque le DT avait reçu les états financiers de la SMGN. 
 
ii. 
Monsieur Alain Decosterd, économiste au DF, était intervenu dans le 
dossier de la SMGN lors de l'élaboration des budgets 2005 et 2006. Le DF agissait 
en tant que département d'appui pour les aspects financiers. Il prenait 
connaissance des budgets et des états financiers de la SMGN pour vérifier la 
fiabilité des chiffres présentés au budget. La négociation portait sur les chiffres 
contenus dans les budgets prévisionnels, car le montant de la subvention annuelle 
de la SMGN était arrêté en fonction de ces budgets. Avant 2005, le dossier avait 
été traité par un de ses collègues qui avait mentionné un problème relatif à la 
durée de la période d'amortissement des bateaux. Les montants d'amortissement 
proposés étaient calqués davantage sur la durée pendant laquelle le crédit devait 
être remboursé que sur celle d'utilité du bien acquis, ce qui pouvait avoir tendance 
à gonfler le budget. 
 
 
Dans le cadre de la négociation du contrat 2005-2006, il avait requis les 
comptes prévisionnels 2004 mais n'avait pas pu les obtenir car la SMGN ne 
voulait pas les communiquer, arguant la particularité de cette année-là. Lorsque la 
subvention 2005-2006 avait été négociée, les résultats 2004 n'étaient pas connus. 
Il avait examiné les budgets et émis un certain nombre de remarques. Les charges 
salariales étaient quasiment invérifiables, vu le changement de périmètre des 
activités de la SMGN subventionnées avec l'augmentation des lignes et 
l'annualisation de cette activité. 
 
iii. 
Monsieur Christophe Genoud avait pris ses fonctions comme secrétaire 
adjoint au DT en septembre 2004. Il n'était pas intervenu directement dans les 
discussions entre celui-ci et la SMGN, sauf lors d'une discussion fixant le montant 
de la subvention 2005. La subvention était négociée en fonction des budgets 
présentés. Depuis qu'il suivait le dossier, la question de la ventilation des charges 
de la société entre les activités de la SMGN et de Swissboat s'était posée. La 
SMGN était une entreprise à caractère familial avec une gestion du personnel 
paternaliste et une gestion financière artisanale. Lors des discussions sur la 
subvention 2005-2006, le DT savait que l'ICF allait procéder à un audit des 


- 15/24 - 
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comptes de l'exercice 2004 et pensait utiliser le résultat de cet audit lors des 
discussions relatives au contrat de prestations 2007-2010. 
 
 
Le DT ne disposait pas du personnel nécessaire pour contrôler les aspects 
financiers et la gestion des entreprises subventionnées. Cette tâche était donc 
effectuée par l'ICF. 
 
iv. 
Madame Christine Robin, expert-comptable, a procédé à la révision externe 
de la SMGN depuis 1999 ou 2000. La SMGN utilisait le "modèle ATAG" 
préconisé par l'Etat qui permettait de ventiler les charges entre les activités 
subventionnées et non. 
 
 
En 2004, lorsque le contrat de prestations avait été modifié, les calculs 
avaient été effectués sur la base d'un nombre d'heures annuel prévisible. Ce travail 
avait été réalisé en fonction d'une réalité que la SMGN ne maîtrisait pas. Lors de 
l'établissement du coût horaire, elle-même avait commis une erreur car elle avait 
pensé qu'il y avait une indemnisation pour les dimanches et jours fériés. La 
SMGN avait rencontré de gros problèmes pour engager le personnel 
supplémentaire requis. C'était la raison pour laquelle la masse salariale 2004 avait 
été inférieure à celle budgétée. Divers employés de la SMGN, rémunérés au mois, 
avaient dû piloter des bateaux alors que ce n'était pas leur fonction. Il en était 
résulté une économie de personnel et une diminution du coût horaire moyen. Par 
ailleurs, elle avait effectué des calculs selon lesquels le coût horaire moyen de 
CHF 27.- était trop bas et aurait dû être de CHF 28,72.-. Pour l'année 2005, le coût 
moyen effectif passait à CHF 30,94. 
 
 
S'agissant de la sur-budgétisation liée à des amortissements indus relevée 
par l'ICF, elle avait effectivement commis une erreur et un montant de 
CHF 84'000.- avait été budgété deux fois. Cette erreur avait été prise en 
considération dans le cadre des négociations puisque le montant final des 
amortissements admis par l'Etat avait été réduit. 
 
b. 
Pour le surplus, les investigations et constatations effectuées par le juge 
d'instruction seront reprises, en tant que de besoin, dans la partie "en droit" du 
présent arrêt. 
EN DROIT 
1. 
 
Le 18 septembre 2008, le Grand Conseil de la République et canton de 
Genève a modifié la loi d’organisation judiciaire du 22 novembre 1941 (LOJ - E 2 
05). Avec l'entrée en vigueur le 1er janvier 2009 de cette novelle, l'action 
pécuniaire est devenue une action contractuelle réservée aux prétentions fondées 
sur le droit public qui ne peuvent pas faire l'objet d'une décision et qui découlent 
d'un contrat de droit public. 


- 16/24 - 
A/367/2008 
2. 
 
En principe, le nouveau droit s’applique à toutes les situations qui 
surviennent depuis son entrée en vigueur. En particulier, en l’absence de 
dispositions transitoires, les nouvelles règles de nature procédurale doivent 
s’appliquer immédiatement à toutes les affaires pendantes (ATF 130 V 560, 562 ; 
111 V 46, 47 ; Arrêt du Tribunal administratif fédéral A-5714/2007 du 18 mars 
2008, consid. 3.4 et les réf. citées ; ATA/356/2008 du 24 juin 2008 ; voir aussi 
U. HAEFELIN/G. MÜLLER/F. UHLMANN, Allgemeines Verwaltung-srecht, 
Zurich, 2006, p. 66, no 327a ; P. MOOR, Droit administratif, vol. I, Berne, 1994, 
p. 171), sous réserve de deux exceptions. Premièrement, si une autorité 
compétente selon l’ancien droit a été saisie avant l’entrée en vigueur du nouveau 
droit et n’a pas été abolie par ce dernier, elle reste compétente pour connaître de 
l’affaire en cause (ATF 130 V 90, 93). Deuxièmement, les nouvelles règles de 
procédure ne peuvent être appliquées immédiatement que si elles restent dans une 
certaine continuité avec le système antérieur, sans en bouleverser les fondements 
(ATF 112 V 356, 360 ; U. HAEFELIN/G. MÜLLER/F. UHLMANN, op. cit., 
p. 66, n° 327a). Une règle nouvelle qui modifie la procédure à suivre devant 
l'autorité dont la décision est entreprise ne saurait être appliquée par l'autorité de 
recours. Une telle application conférerait un effet rétroactif à la règle de procédure 
(B. KNAPP, Précis de droit administratif, Bâle, 1991, p. 123, n° 594). 
3. 
 
En l'espèce, la modification de la LOJ est intervenue alors que la procédure 
était pendante et aucune disposition ne traite du droit applicable à l'action 
pécuniaire déposée avant l'entrée de la modification législative. Le tribunal de 
céans, conformément aux principes généraux arrêtés par le Tribunal fédéral, fera 
application du nouvel art. 56G LOJ, étant précisé que, contrairement aux 
décisions relatives au statut et aux rapports de service des fonctionnaires et autres 
membres du personnel de l'Etat (cf ATA/178/2009 du 7 avril 2009), la procédure 
pour les prétentions fondées sur un contrat de droit public est restée similaire à 
celle prévue auparavant. 
4. 
a. 
Le Tribunal administratif connaît en instance unique des actions fondées sur 
le droit public qui ne peuvent pas faire l'objet d'une décision au sens de l'art. 56A 
al. 2 LOJ et qui découlent d'un contrat de droit public (art. 56G LOJ). 
 
b. 
Conformément à la jurisprudence développée pour l'action pécuniaire, sous 
réserve de la prescription ou de la péremption du droit invoqué, l'action n'est 
subordonnée à aucun délai. Les règles de la procédure administrative concernant 
les recours sont applicables par analogie (ATA/685/2004 du 31 août 2004). 
 
 
En l'espèce, le Conseil d'Etat réclame à la SMGN le remboursement d'un 
trop-perçu de subventions pour les années 2004, 2005 et 2006 versé sur la base de 
contrats de droit public conclus entre les parties. Partant, l'action contractuelle 
intentée devant le tribunal de céans est, de ce point de vue, recevable. 


- 17/24 - 
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5. 
 
La SMGN prétend que la demande est irrecevable car ni le Conseil d'Etat, ni 
le DT n'ont la qualité pour agir. 
6. 
a. 
Aux termes de la Cst-GE, le Conseil d'Etat détient le pouvoir exécutif et 
l'administration générale du canton (art. 101 Cst-GE). Il est chargé de l'exécution 
des lois et prend à cet effet les règlements et arrêtés nécessaires (art. 116 Cst-GE). 
Il rend compte, chaque année, au Grand Conseil de l'administration et des finances 
(art. 117 Cst-GE). 
 
b. 
Le Conseil d'Etat prend les décisions de sa compétence (art. 1 LECO). Il 
règle les attributions des départements, en constituant des offices ou des services 
et en leur déléguant les compétences nécessaires (art. 2 al. 1 LECO). 
 
 
Lorsque des attributions leur ont été conférées directement par la loi, les 
départements, les offices ou les services les exercent sous l'autorité du Conseil 
d'Etat (art. 2 al. 2 LECO). 
 
c. 
Le DT comprend la direction générale de la mobilité, composée de la 
direction de la planification et des offres de mobilité ainsi que de la direction de 
l'organisation et de l'exploitation du réseau routier (art. 7 ROAC). 
 
d. 
La LGAF et la LIAF prévoient que l'autorité compétente au niveau du 
département concerné s'assure que le bénéficiaire exécute la tâche conformément 
aux dispositions en la matière et que les conditions légales sont bien remplies. Le 
Conseil d'Etat et le Grand Conseil peuvent en tout temps faire procéder à des 
vérifications et des contrôles de gestion (art. 38 LGAF ; 22 LIAF). 
 
 
Par ailleurs, chaque département, par délégation du Conseil d'Etat, est 
compétent pour la défense adéquate de ses droits, en matière pécuniaire, à l'égard 
de tiers (art. 70 al. 1 let. b LGAF). 
7. 
 
La capacité pour ester en justice appartient aux personnes morales, non pas 
aux subdivisions qui les composent. Une autorité ne peut recourir en son nom 
propre. Toutefois, la législation spéciale peut accorder directement la capacité 
d'ester en justice à des entités dépourvues de la personnalité morale. Elle peut 
aussi, dans certains domaines, conférer à des autorités qualité pour recourir, 
laquelle implique la capacité d'ester en justice dans le domaine en cause : c'est en 
réalité une compétence donnée pour agir au nom de la collectivité dont elle relève. 
Il peut arriver qu'une autorité se présente dans une procédure sous son propre 
nom, mais agisse manifestement pour la collectivité. Le vice est dans la 
désignation de la partie véritable : la pratique admet sa rectification (P. MOOR, 
Droit administratif, 2ème éd., Berne, 2002, p. 60). 
8. 
 
En l'espèce, les contrats de prestations ont été conclus entre la SMGN et la 
République et canton de Genève, représentée alors par le DJPT puis par le DIAE, 
devenu depuis lors le DT, suite au rattachement de l'office des transports et de la 


- 18/24 - 
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circulation à ce département. La demande, quant à elle, a été déposée par le 
Conseil d'Etat, soit pour lui par le DT. Toutefois, la demande est introduite pour le 
compte de l'Etat et, au vu des lois précitées, il convient de reconnaître au Conseil 
d'Etat et au DT la compétence de réclamer le versement du montant litigieux. La 
qualité pour agir du Conseil d'Etat dans la présente procédure sera dès lors 
admise. 
9. 
 
La SMGN se prévaut encore de l'irrecevabilité de la demande en raison de 
l'absence de conclusions susceptibles d'exécution du fait d'un doute quant à 
l'identité du créancier de la somme réclamée. 
10. 
a. 
Selon l’art. 65 al. 1 LPA, l’acte de recours contient sous peine 
d’irrecevabilité, la désignation de la décision attaquée et les conclusions du 
recourant. 
 
b. 
Compte tenu du caractère peu formaliste de cette disposition, il convient en 
particulier de ne pas se montrer trop strict sur la manière dont sont formulées les 
conclusions du recourant. Le fait que ces dernières ne ressortent pas expressément 
de l’acte de recours n’est d’ailleurs pas, en soi, un motif d’irrecevabilité, pourvu 
que le tribunal et la partie adverse puissent comprendre avec certitude les fins du 
recourant (ATA/242/2007 du 15 mai 2007 et les références citées). Une requête en 
annulation d’une décision doit par exemple être déclarée recevable dans la mesure 
où le recourant a de manière suffisante manifesté son désaccord avec la décision, 
ainsi que sa volonté qu’elle ne développe pas d’effets juridiques (P. MOOR, Droit 
administratif, Vol. II, Berne 2002, 2ème éd., p. 674 n. 5.7.1.4). 
 
 
En l'espèce, il ressort clairement de la demande que le Conseil d'Etat, soit 
pour lui le DT, défend les intérêts de la collectivité et réclame la restitution des 
montants à l'Etat. Les exigences de 65 LPA sont dès lors satisfaites. 
 
 
En conséquence, la présente action sera déclarée recevable. 
11. 
 
Le demandeur soutient que la défenderesse ne pouvait pas thésauriser des 
montants non dépensés dans l'exécution de son activité subventionnée et les 
utiliser dans le cadre de son activité privée. 
12. 
a. 
Le 1er janvier 2006 sont entrées en vigueur la LIAF ainsi que les nouveaux 
art. 35 ss LGAF relatifs aux subventions. 
 
 
Aux termes de son art. 34 al. 1, la LIAF s'applique à l'ensemble des 
indemnités et des aides financières cantonales existantes. Les demandes 
d'indemnités et d'aides financières en cours lors de son entrée en vigueur sont 
soumises au nouveau droit (art. 35 al. 1 LIAF). Les contrats conclus et les 
décisions prises avant l'entrée en vigueur du nouveau droit doivent être adaptés 
pour autant et dès que les règles qui les régissent le permettent (art. 35 al. 2 
LIAF). 


- 19/24 - 
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b. 
En vertu du principe de la non-rétroactivité, le nouveau droit ne s'applique 
pas aux faits antérieurs à sa mise en vigueur (P. MOOR, op. cit., p. 170 ; 
B. KNAPP, op. cit., p. 116). Le droit nouveau ne peut avoir un effet rétroactif que 
si la rétroactivité est prévue par la loi, est limitée dans le temps, ne conduit pas à 
des inégalités choquantes, est motivée par des intérêts publics pertinents et ne 
porte pas atteinte à des droits acquis (B. KNAPP, op. cit., p. 118). 
 
c. 
En l'espèce, les contributions financières accordées en 2004 et 2005 sont 
antérieures à l'entrée en vigueur de la LIAF et ne sont donc pas soumises à cette 
loi. Elles seront donc examinées au regard de l'aLGAF. 
 
 
En revanche, bien que découlant d'un contrat conclu avant le 1er janvier 
2006, la contribution cantonale 2006 était due lorsque la LIAF était en vigueur 
(art. 34 al. 1 LIAF). Le montant versé par le demandeur est une indemnité au sens 
de l'art. 2 al. 2 LIAF et aucune des exceptions prévues à l'art. 4 LIAF n'est 
réalisée. En particulier, l'art. 4 let. i LIAF n'est pas applicable car les prestations 
de transport en cause qui relèvent du trafic local, soit de la compétence exclusive 
des cantons, ne font pas l'objet d'une indemnité fixée de manière impérative par le 
droit fédéral, soustraite du champ d'application de la LIAF (art. 3 du règlement 
d'application de la loi sur les indemnités et les aides financières du 31 mai 2006 - 
RIAF - D 1 11.01). Il convient dès lors d'appliquer la LIAF à l'aide financière 
octroyée en 2006. 
13. 
a. 
Selon l'art. 36 al. 4 aLGAF, les montants non dépensés après détermination 
du résultat comptable établi selon les normes fixées à l'art. 1 ne peuvent pas être 
thésaurisés par l'entité. Ils sont restituables à l'Etat selon des modalités à définir. 
Restent réservées des dispositions du droit cantonal ou un accord spécifique 
(contrat de prestations ou analogue) visant notamment à encourager la recherche 
de fonds privés, une répartition du résultat entre l'entité et l'Etat, la constitution 
d'une réserve pour déficits futurs. 
 
b. 
L'art. 17 LIAF reprend les termes de l'art. 36 al. 4 aLGAF. 
14. 
a. 
L'art. 8 al. 1 du contrat 2001-2004 fixe le montant de la contribution 
forfaitaire due, chaque année, par l'Etat et réserve l'application des art. 35 ss 
aLGDAF. 
 
 
La contribution financière prend en considération les recettes nécessaires à 
la SMGN ainsi que les coûts d'investissement tel que prévus à l'annexe 3 du 
contrat (art. 8 al. 3 du contrat 2001-2004). Elle est déterminée sur la base d'une 
part aux recettes de la communauté tarifaire de 0,66 %, mais au minimum à 
CHF 541'000.- par année. Si les recettes provenant de la communauté tarifaire 
sont supérieures à ce montant, la contribution du canton est réduite d'autant (art. 8 
al. 2 du contrat 2001-2004). 


- 20/24 - 
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Cependant, selon l'art. 8 al. 6 du contrat 2001-2004, sous réserve des al. 1 et 
2, la SMGN est responsable de ses résultats financiers. Elle conserve les 
excédents des produits et supporte les excédents de charges. 
 
b. 
En 2004, le contrat a été modifié. Aux termes du courrier du 24 mars 2004, 
l'art. 8 al. 2 du contrat 2001-2004 n'est plus applicable car la contribution 
financière 2004 est arrêtée sur la part de recettes dues à la SMGN par la 
communauté tarifaire intégrale, soit CHF 633'861.- et des produits liés aux 
indemnités et compléments tarifaires, soit CHF 68'851.- ainsi que les éventuels 
revenus publicitaires escomptés. 
 
c. 
Le contrat 2005-2006 fixe le montant de la contribution forfaitaire en 
prenant en compte la participation de la SMGN aux recettes de la communauté 
tarifaire intégrale Unireso de CHF 745'859.- pour 2005 et de CHF 771'804.- pour 
2006 (art. 11 al. 1 et 2 ducontrat 2005-2006). La SMGN reste responsable de ses 
résultats financiers (art. 11 al. 5 contrat 2005-2006). Aucun mécanisme de 
restitution n'est prévu. 
15. 
 
En principe, le contrat de droit administratif devrait s'interpréter selon la 
volonté des parties lors de sa conclusion comme un contrat de droit privé. 
Toutefois, il convient de présumer que l'autorité, en concluant un contrat de droit 
administratif, a entendu respecter son devoir d'appliquer la loi et d'agir dans 
l'intérêt public. On peut aussi penser que l'administré n'a pas eu l'intention de 
violer la loi ou de porter atteinte à l'intérêt public et qu'il devait connaître le devoir 
de l'autorité. Il en résulte que le contrat de droit administratif doit être interprété 
de façon qu'il soit conforme à la loi. Entre deux interprétations répondant à ce 
premier test, on choisira celle qui correspond le mieux à l'intérêt public 
(B. KNAPP, op. cit., p. 323 n° 1533ss). 
16. 
 
En l'espèce, les contrats de prestations prévoient que la défenderesse 
s'engage à assurer la desserte des lignes lacustres et que le demandeur verse une 
contribution forfaitaire annuelle. La défenderesse est responsable de ses résultats 
financiers, c'est-à-dire qu'elle conserve les excédents des produits et supporte les 
excédents de charges. Excepté la clause de restitution prévue à l'art. 8 al. 2 du 
contrat 2001-2004, abandonnée dès 2004, aucune rétrocession ni versement 
complémentaire de l'aide financière n'est prévu. L'idée sous-jacente de ce 
mécanisme est de responsabiliser le subventionné et de l'inciter à améliorer la 
qualité de sa gestion afin de permettre à celui-ci de dégager des bénéfices qu'il 
pourra conserver et, à l'Etat, de diminuer le montant de l'aide apportée (cf à ce 
sujet : note de travail de l'ICF, procédure pénale, p. 200'665 ; C. STUCKI, "Le 
contrat de prestations des transports publics genevois" in "les contrats de 
prestations", 2002, p. 95). Il ressort ainsi des clauses contractuelles que l'aide 
financière annuelle du canton est acquise. 


- 21/24 - 
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Ce système n'est pas contraire aux art. 36 al. 4 aLGAF et 17 LIAF qui 
mentionnent expressément la possibilité de déroger à l'obligation de restitution par 
un accord spécifique, tel un contrat de prestations. Les buts permettant de s'écarter 
du principe de non-thésaurisation énumérés par ces articles ne sont pas exhaustifs, 
comme l'atteste l'utilisation du terme "notamment". En rendant la défenderesse 
responsable de ses résultats financiers, les contrats de prestations poursuivent un 
but d'intérêt public, soit la diminution de la participation financière de la 
collectivité. Les contrats 2001-2004 et 2005-2006 sont donc des accords 
spécifiques qui dérogent au principe posé aux art. 36 al. 4 aLGDAF et 17 al. 1 
LIAF. 
 
 
Cette interprétation est corroborée par l'exposé des motifs relatif au projet de 
loi accordant une indemnité de CHF 2'075'150.- et de CHF 2'153'117.- à la 
SMGN pour les années 2009 et 2010 selon lequel la défenderesse est une 
entreprise privée assumant les risques propres liés à son activité. Jusqu'en 2007, 
celle-ci assumait seule les pertes et les profits résultant de son activité. Depuis 
2008, conformément aux dispositions de la LIAF et à l'arrêté du Conseil d'Etat du 
30 janvier 2008 relatif à la politique de l'Etat en matière de thésaurisation des 
subventions, la société doit, en cas de bénéfice, restituer en principe 75% du 
montant du bénéfice à l'Etat (MGC [En ligne], Séance 1 du 13 novembre 2008 à 
17h00, Disponible sur:http://www.geneve.ch/grandconseil/memorial/data/560401/
1/560401_1_partie14.asp [consulté le 15 juillet 2009]). 
 
 
C'est donc à tort que le demandeur se prévaut des art. 36 al. 4 aLGDAF et 
17 al. 1 LIAF pour solliciter le remboursement du montant non dépensé des 
subventions 2004, 2005 et 2006. 
17. 
 
Reste à déterminer si le demandeur peut invoquer des erreurs de calcul des 
budgets qui ont servi de base au calcul des subventions. 
18. 
 
La doctrine et la jurisprudence considèrent que le droit d'obtenir la 
restitution de ce qui a été payé indûment est une institution générale du droit qui 
doit trouver application en droit public, même en l'absence d'une disposition 
légale formelle (P.MOOR, Droit administratif, vol. II, 2002, p. 147). Un 
versement ne pourra être répété s'il a eu lieu en raison d'un acte législatif ou d'une 
décision, même illégaux, entrés en force, que si ces actes sont nuls. Dans les 
autres cas, le paiement a une cause, puisque l'acte ou la décision sur lesquels ils se 
fondent sont réputés valables tant qu'ils n'ont pas été révoqués. En matière de 
subventions et autres aides financières, la restitution doit être exigée lorsque la 
décision allouant la subvention est révoquée en raison des vices qu'elle comporte 
car elle perd sa cause juridique (B. KNAPP, op. cit., p. 166-167, n° 756ss). 
19. 
 
Il ressort des contrats que les montants des contributions financières 2004, 
2005 et 2006 ont été calculés en fonction, non pas des recettes effectives, mais de 
budgets de fonctionnement. Les fonctionnaires du DT et du DF, entendus par le 


- 22/24 - 
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juge d'instruction, ont expliqué que les budgets avaient été négociés et contrôlés 
par le DT avec l'appui du DF. Aucun contrôle de la conformité des comptes aux 
budgets présentés n'avait été effectué lors de la réception des états financiers de la 
défenderesse. Lors de la négociation du contrat 2005-2006, le DT, qui avait 
connaissance du prochain audit de la défenderesse par l'ICF, pensait utiliser les 
résultats de celui-ci dans le cadre du contrat de prestations 2007-2010. 
L'ordonnance de soit-communiqué du 28 septembre 2006 relève que les montants 
des contributions retenus dans le contrat 2001-2004 ont été définis sur la base d'un 
rapport de Team+ d'octobre 2000 et ont été arrêtés lors d'une réunion entre les 
parties le 14 décembre 2000. En 2004, le mandat de la défenderesse a été étendu 
et le montant de la contribution augmenté. Cette contribution, fixée initialement à 
CHF 653'000.- dans le contrat 2001-2004, a passé à CHF 1'885'592.-. Le budget 
2004 a fait l'objet de plusieurs projets et d'une nouvelle analyse tenant compte de 
l'augmentation de l'offre projetée. Les charges salariales ont été calculées selon un 
coût horaire moyen de CHF 41,72/heure dont les différents postes ont été détaillés 
dans un tableau fourni par la défenderesse. Le poste des amortissements a été 
discuté à partir des chiffres prévisionnels contenus dans un tableau préparé par le 
réviseur de la société et a été revu à la baisse. Quant aux montants de la 
contribution de l'Etat retenus dans le contrat 2005-2006, ils résultent des chiffres 
contenus dans deux projets de budgets définitifs présentés par la défenderesse et 
annexés au contrat. Un coût horaire moyen de CHF 41,72 a été pris comme 
référence pour les charges salariales et le poste amortissement budgétisé à 
CHF 236'000.- a été réduit à CHF 191'000.- pour 2005. 
 
 
Ainsi, en arrêtant le montant de la subvention en fonction d'un budget, les 
parties aux contrats ont accepté une part d'incertitude. Celle-ci était d'autant plus 
grande qu'en 2004, la défenderesse a étendu ses prestations et que le montant de la 
contribution a presque triplé. Dans ces circonstances, comme l'a relevé le juge 
d'instruction, il ne pouvait pas échapper aux représentants de l'Etat que le montant 
de la subvention pouvait ultérieurement se révéler inexact. En l'absence 
d'éléments permettant de considérer que la défenderesse a dissimulé des faits ou 
qu'il y a eu tromperie de sa part, le demandeur ne peut pas, ultérieurement, faire 
valoir des erreurs dans l'établissement des budgets alors que ceux-ci ont fait l'objet 
de négociations, que les collaborateurs du DT, aidés par ceux du DF, pouvaient 
solliciter des compléments d'informations et qu'aucun contrôle n'a été effectué 
lorsque les comptes ont été remis. Les contrats ont arrêté les montants des 
contributions financières sans prévoir de clauses de réajustement ou de restitution. 
Le demandeur a accepté de verser une subvention sur la base d'estimations 
susceptibles d'imprécision sans se prémunir contre une éventuelle surestimation 
du budget. Dans ces circonstances, le demandeur ne peut pas invoquer d'erreur 
dans l'établissement des budgets et les montants versés reposent sur une cause 
valable. Le grief tiré de l'enrichissement illégitime sera dès lors écarté. 


- 23/24 - 
A/367/2008 
20. 
 
Mal fondée, la demande sera rejetée. Un émolument de CHF 3'000.- sera 
mis à la charge du demandeur, qui succombe. Une indemnité de procédure de 
CHF 3'000.- sera allouée à la défenderesse, à charge de l'Etat de Genève (art. 87 
LPA). 
 
* * * * * 
 
 
PAR CES MOTIFS 
LE TRIBUNAL ADMINISTRATIF 
à la forme : 
déclare recevable l'action contractuelle interjetée le 3 mais reçue le 7 février 2008 par le 
Conseil d'Etat contre la société des Mouettes genevoises navigation S.A. ; 
au fond : 
la rejette ; 
met à la charge du Conseil d'Etat un émolument de CHF 3'000.- ; 
alloue à la société des Mouettes genevoises navigation S.A. une indemnité de procédure 
de CHF 3'000.- à la charge de l'Etat de Genève ; 
dit que, conformément aux art. 82 et ss de la loi fédérale sur le Tribunal fédéral du 
17 juin 2005 (LTF - RS 173.110), le présent arrêt peut être porté dans les trente jours 
qui suivent sa notification par-devant le Tribunal fédéral, par la voie du recours en 
matière de droit public ; le mémoire de recours doit indiquer les conclusions, motifs et 
moyens de preuve et porter la signature du recourant ou de son mandataire ; il doit être 
adressé au Tribunal fédéral, 1000 Lausanne 14, par voie postale ou par voie 
électronique aux conditions de l’art. 42 LTF. Le présent arrêt et les pièces en possession 
du recourant, invoquées comme moyens de preuve, doivent être joints à l’envoi ; 
communique le présent arrêt au Conseil d'Etat ainsi qu'à Me Pierre de Preux, avocat de 
la société des Mouettes genevoises navigation S.A. 
Siégeants : M. Thélin, président, Mmes Bovy et Mme Hurni, juges, MM. Bonard et 
Grodecki, juges suppléants. 
 


- 24/24 - 
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Au nom du Tribunal administratif : 
la greffière-juriste : 
 
 
C. Del Gaudio-Siegrist 
 
le vice- président : 
 
 
Ph. Thélin 
 
 
Copie conforme de cet arrêt a été communiquée aux parties. 
 
Genève, le 
 
 
 
 
 
 
la greffière :