# Swiss Caselaw Document

**Case Identifier:** 323d2f5b-3ed2-5e65-8ec2-f7190f325153
**Source:** Vaud (VD)
**Court Level:** cantonal
**Decision Date:** 2015-01-21
**Language:** fr
**Title:** Vaud Tribunal cantonal Cour de droit administratif et public 21.01.2015 FI.2009.0002
**Docket/Reference:** 
**URL:** https://entscheidsuche.ch/docs/VD_Omni/VD_TC_031_FI-2009-0002_2015-01-21.html

## Full Text

TRIBUNAL CANTONAL

  COUR DE DROIT ADMINISTRATIF ET PUBLIC

  
	
   

  	
  Arrêt du 21 janvier 2015 

  
	
  Composition

  	
  M. Xavier Michellod, président; MM. Alain Maillard et Bernard
  Jahrmann, assesseurs; M. Vincent Bichsel, greffier. 

  

 

	
  Recourants

  	
  1.

  	
  A. X.________, à 1******** (VD),
  représenté par Me Eric MUSTER, avocat à Lausanne,  

  

 

	
   

  	
  2.

  	
  B. Y.________ X.________, à 1********
  (VD), représentée par Me Eric MUSTER, avocat à Lausanne,  

  

   

	
  Autorité intimée

  	
   

  	
  Administration cantonale des impôts,
  à Lausanne, 

  

   

	
  Autorité concernée

  	
   

  	
  Administration fédérale des
  contributions, Division principale DAT, à Berne. 

  

   

 

	
  Objet

  	
  Impôt fédéral, cantonal et communal (soustraction)      

  
	
   

  	
  Recours A. et B. X.________ c/ décision de
  l'Administration cantonale des impôts du 4 décembre 2008

  

 

Vu les faits suivants

A.                    
A. X.________ a une formation de base dans le génie civil acquise dans
son pays d'origine, la Roumanie. Après son arrivée en Suisse, il a entrepris
des études post-grades en informatique, en statistique et en génie civil; il a
également obtenu un MBA de la Faculté des hautes études commerciales (HEC) de
l'Université de Lausanne.

L'intéressé et son épouse, B. Y.________ X.________,
sont domiciliés à 1******** (VD), à la rue 2********.

B.                    
C.________ SA (C.________, parfois C.________ dans les citations) est
une société anonyme créée le 15 février 1990 par A. X.________ et inscrite au
Registre du commerce du canton de Vaud le 20 février de la même année, dont le
siège est à 1******** (à l'adresse des époux X.________). Son capital-actions s'élève
à 300'000 fr. et est entièrement libéré; il est composé de 390 actions
nominatives de 500 fr. et de 1'050 actions nominatives de 100 francs. Le but de
cette société, tel qu'inscrit au registre du commerce, consistait dans un
premier temps dans la "conception, fabrication et commercialisation de
produits informatiques"; il a été modifié le 22 juin 2006 et est désormais
décrit comme il suit: "services informatiques dans le domaine de la finance,
notamment l'installation de systèmes et location d'espaces informatiques,
service de bureau, conseils, gestion de projets, support et assistance,
formation des utilisateurs."

Jusqu'au mois de janvier 2013, le conseil d'administration
de C.________ était composé d'A. X.________, administrateur président, et de B.
Y.________ X.________, administratrice et secrétaire. Les époux X.________ détiennent
la totalité des actions de la société (savoir 197 actions à 500 fr. et 665
actions à 100 fr. en mains d'A. X.________, respectivement 193 actions à 500
fr. et 385 actions à 100 fr. en mains de B. Y.________ X.________).  

Selon les déclarations d'A. X.________, C.________ a
été créée pour des raisons d'image, dans l'optique de la vente de produits et
pour couvrir le risque d'une éventuelle faillite. Au début de son activité,
elle n'avait ni employés ni locaux; ce n'est qu'en 1995 que l'intéressé a
installé les locaux de cette société dans la propriété de 1******** qu'il
venait d'acquérir et qu'elle a encaissé son premier chiffre d'affaires, et ce
n'est que dès l'année 1998 environ qu'elle a eu des employés.

C.                    
D.________ SA (D.________, parfois D.________ dans les citations) est
une société anonyme créée le 12 mars 1991 par A. X.________, dont le siège se
situe en Roumanie. L'intéressé détient la quasi-totalité du capital-actions de
cette société (entre 98 et 99%).

S'agissant des relations entre C.________ et
D.________, figure au dossier un contrat du 10 février 1993 dont il résulte en
particulier ce qui suit:

"[…] Préambule

Les sociétés D.________ et
C.________ conviennent:

-      
de développer des programmes informatiques pour les milieux
financiers et bancaires ci-après dénommés le PRODUIT 

[…]

Dans le cadre de ce projet:

-      
C.________ est chargée de la commercialisation dans tous ses
aspects et sera la seule responsable de la vente et de la distribution du
PRODUIT ainsi que seul partenaire contractuelle du client.

-      
D.________ s'occupe du développement, de la production, de
l'installation, de la maintenance et du suivi technique, mais n'apparaîtra pas
officiellement en tant que partenaire commercial ou fournisseur envers le
client. 

[…]

OBLIGATIONS DE C.________ 

La connaissance du marché

C.________ met à disposition de
D.________ tout son know-how et son savoir-faire concernant le marché et les
besoins des clients pour faciliter au mieux et plus rapidement la conception et
l'évolution du PRODUIT.

Flux d'informations
financières

C.________ a l'obligation
d'assurer toutes les sources d'informations financières nécessaires au fonctionnement
et au développement du PRODUIT indifféremment de leurs origines.

Ces sources d'informations doivent
être disponibles dans les locaux choisis par C.________ […]

Lignes de communications de
données

C.________ assure les lignes de
communication nécessaires pour le développement, les tests et la production
reliés au service d'informations financières ainsi qu'aux réseaux de
télécommunications nationaux, TRANSPAC, TELEPAC, etc.

Ces lignes de communication seront
disponibles dans les locaux choisis par C.________.

Tous les frais liés à
l'installation et au fonctionnement de ces lignes sont pris en charge
intégralement par C.________ y inclus le matériel informatique de traitement de
l'information (PC, serveurs, router, etc.)

Logistique de fonctionnement

C.________ assure la prise en
charge de tous les frais relatifs au déplacement, hébergement et formation des
spécialistes nécessaires, aux développements, aux tests, à la mise en place, à
la production et au support client du PRODUIT. 

[…]

C.________ prend en charge d'une
manière intégrale tous les frais engendrés par l'utilisation des moyens logistiques
par le personnel de D.________ en déplacement hors de Roumanie.

[…]

Conditions de
commercialisation

C.________ est chargée de la
commercialisation du PRODUIT. Elle sera seule responsable, notamment en ce qui
concerne toutes les questions de tarification et des contrats avec la
clientèle.

Elle est libre de fixer les prix
de vente du PRODUIT ainsi que la stratégie de marketing et de vente à la
clientèle pour tous les marchés.

Territorialité

C.________ est seule responsable
au niveau international de la vente et d la distribution du PRODUIT sur les
marchés de son choix sous la forme qu'elle estime nécessaire.

OBLIGATIONS DE D.________

Ressources

D.________ met à disposition du
projet les ressources humaines et techniques nécessaires au développement, aux
tests, à la production et au support technique du PRODUIT. 

D.________ assure à ses frais
l'installation de tout le matériel et logiciel nécessaires dans ses locaux à Bucarest.

[…]

Développement

D.________ est en charge du
développement continu du PRODUIT.

Les développements se font sur la
base de cahiers des charges établis en fonction des demandes des clients […]

C.________ demande des nouveaux
développements sur la base des cahiers des charges détaillant les
fonctionnalités

D.________ répond avec une étude
de faisabilité et si c'est le cas avec une planification des développements à
faire. […]

Production

D.________ est seule responsable
pour la production du PRODUIT sur les sites désignés par C.________ en
utilisant le cas échéant son propre personnel.

Maintenance

D.________ assure la maintenance
technique et le suivi du PRODUIT sur les sites désignés par C.________.

Téléassistance et Support
technique remote

D.________ assure à la clientèle
une téléassistance en langue anglaise […]

Personnel

D.________ emploie à ses frais des
informaticiens/techniciens, pour le développement, l'installation, la
maintenance et le support technique du PRODUIT sur les sites désignés par
C.________. 

Les interventions auprès des
clients seront toujours faites au nom de C.________.

D.________ garantit, sur la base
des invitations faites par C.________, la disponibilité du personnel nécessaire
muni d'un visa pour tous les pays en question.

DISPOSITIONS GENERALES

Rémunération

D.________ établit ses factures à
C.________ en fonction des prestations fournies sur une base mensuelle et/ou
trimestrielle dans la monnaie de son choix.

Les factures ainsi générées
couvrent la totalité des rémunérations de D.________ découlant de ce contrat.

D.________ ne pourra faire valoir
aucune autre rémunération à quelque titre que ce soit tant qu'il s'agit du
PRODUIT faisant l'objet de ce contrat.

Visas

C.________ accepte de faire les
invitations nécessaires pour le personnel D.________ provenant de Roumanie dans
les pays où la présence de ses spécialistes est requise. 

[…]

Donneur d'ordres

Pour des raisons de clarté et
simplicité, D.________ accepte des ordres de développement du PRODUIT
uniquement de la part de C.________ qui exerce un rôle de coordinateur par
rapport aux demandes des clients.

Toutes les demandes de
développement concernant le PRODUIT sont à adresser exclusivement à C.________.

[…]

Propriété du PRODUIT

C.________ est la seule
responsable du PRODUIT et des programmes source afférents et elle détient tous
les droits qui relèvent de la protection de la propriété intellectuelle. 

[…]

D'une manière générale D.________
est responsable de la protection générale des données informatiques concernant
le PRODUIT. 

[…]

Licence

C.________ est l'unique
propriétaire du PRODUIT, elle est seule habilitée à distribuer des licences
d'exploitation ou à céder tout autre droit qui relèvent de la propriété
intellectuelle.

Durée du contrat

Le présent contrat prend effet le
10 février 1993 et est conclu pour une durée indéterminée. 

Toute modification de ce contrat
doit se faire sur la forme écrite par des avenants annexés à ce document et
font partie intégrante de ce contrat.

Résiliation

La résiliation de ce contrat peut
se faire avec un préavis d'une année pour la fin d'une année calendaristique
sous la forme d'une lettre recommandée avec avis de réception. 

[…]"

Ce contrat a été signé par A. X.________ pour
C.________ et par E. F.________ pour D.________.

D.                    
Le 3 novembre 1997, A. X.________ a obtenu une licence de pilote d'avion.

Le 19 juin 1998, C.________ a acquis un avion de type Piper Dakota PA 28-236 pour le prix de 67'000 fr.; cet achat a été
partiellement réglé au moyen d'une somme de 50'000 fr. prélevée sur un compte
bancaire (no 3********) détenu par la société auprès du B. B.________. Dans les
livres comptables de C.________, cet avion n'a jamais été porté à l'actif du
bilan. Quant au montant de 50'000 fr., il trouve sa contrepartie au débit du
compte courant de l'actionnaire.

Interpellé, A. X.________ a indiqué que le prix
mentionné sur le contrat de vente était faux et qu'il avait en réalité déboursé
40'000 ou 50'000 fr. pour cet avion; quant au règlement de ce montant,
l'intéressé a exposé penser qu'il avait été fait avec l'argent du groupe, tout
en précisant qu'il n'y avait pas, à l'époque, de séparation stricte entre son
patrimoine et celui de la société - son unique but étant de faire fonctionner
cette dernière.

E.                    
En 1999, A. X.________ a créé les nouvelles entités juridiques suivantes:

- 8 mars 1999: G.________ SA (G.________), dont le
siège est à 4******** (Liechtenstein). Cette société a été constituée et est
représentée par H.________., à 4******** également. Son capital-actions, de
50'000 fr., a été entièrement versé par A. X.________, qui est membre de
son conseil d'administration avec signature individuelle; ce conseil
d'administration comporte en outre deux membres, avec signature collective à
deux, I.________ et J.________, tous deux domiciliés à 4********. Le but social
de G.________ consiste à effectuer "toutes activités en relation avec des
produits informatiques, soit notamment la conception, le développement, la
fabrication, la commercialisation et le service après-vente de matériel et de
logiciels informatiques"; selon les explications d'A. X.________,
G.________ a été créée dans le but de vendre les produits de D.________ à des
clients étrangers. Sur le plan fiscal, la société est soumise à un impôt forfaitaire
de 1'000 fr. par an (plus quatre pourcents sur les dividendes distribués).

S'il a nié le fait que, depuis sa création, la
gestion de G.________ avait été effectuée depuis la Suisse, soit depuis les
locaux de C.________ à 1********, A. X.________ n'en a pas moins confirmé la
présence des fichiers de gestion de G.________ dans les disques durs de
C.________, précisant qu'ils s'y trouvaient à titre de copie.

- 8 mars 1999: K.________ AG, dont le siège est à 4********.
Cette société a le même capital-actions (également versé par A. X.________) que
G.________, les mêmes représentants et membres du conseil d'administration (à
l'exception d'A. X.________, qui n'y siège pas) - ces derniers disposant d'une
signature individuelle. Son but social consiste à réaliser "toutes
activités dans le domaine de l'aéronautique et du transport, notamment l'achat
d'avions et la commercialisation de vols d'affaires".

Après la constitution de K.________ AG, l'appareil
Piper Dakota acquis en 1998 a été porté à l'actif du bilan de cette société pour
un montant de 63'593 fr. 50 (montant comprenant une facture de la société L.________
SA par 13'593 fr. 50). La demande de modification de l'inscription dans le
registre matricule suisse des aéronefs a été déposée le 3 janvier 2000; il en
résulte que le nouveau propriétaire de l'avion est K.________ AG et que
l'exploitant est C.________.

S'il a nié le fait que, depuis sa création, la
gestion de K.________ AG avait été effectuée depuis la Suisse, soit depuis les
locaux de C.________ à 1********, A. X.________ n'en a pas moins confirmé la
présence des fichiers de gestion de K.________ AG dans les disques durs de
C.________, précisant qu'ils s'y trouvaient à titre de copie.

Dans un fax adressé à un tiers le 15 février 1999,
Me Gani a confirmé que son client A. X.________ souhaitait constituer par
l'intermédiaire de ce tiers deux sociétés anonymes du droit de Liechtenstein -
soit G.________ et K.________ AG - et précisé les modalités de constitution de
ces sociétés, relevant en particulier ce qui suit:

"J'ai soumis votre tarif à M.
A. X.________ et vous communiquerai prochainement son accord à ce sujet; d'ores
et déjà, le client m'indique que le travail administratif sera effectué depuis
son bureau de 1********, de telle sorte que ce poste sera en principe
extrêmement réduit, sous réserve des bouclements comptables et de la
révision."

- 12 mai 1999: Fondation M.________, dont le siège
est à 4******** également. Cette fondation, dont le capital s'élève à 30'000
fr., a pour objet la gestion de sa fortune et l'octroi de prestations aux bénéficiaires
désignés par le conseil de fondation, dont les membres sont I.________ et J.________,
à 4********, et N.________, à 5******** (avec signature collective à deux). La
fondation est représentée par H.________., à 4********; A. X.________ en est
l'ayant droit économique, selon déclaration signée par l'intéressé le 14
septembre 2000. 

- 31 mai 1999: Etablissement O.________, dont le
siège est à 6******** (Liechtenstein). Cet établissement, dont le capital
s'élève à 30'000 fr., a pour but le placement et l'administration de sa fortune
et, dans ce cadre, l'acquisition, l'administration et l'exploitation de biens
immobiliers, titre de participation et droit, ainsi que la mise en œuvre de
toutes les affaires en relation avec ce but - étant précisé que l'activité
menée ne sera pas exercée sous une forme commerciale. Son conseil
d'administration est composé de P.________ et Q.________, à 6********, et de N.________,
à 7********; A. X.________ en est l'ayant droit économique, selon déclaration
signée par l'intéressé le 14 septembre 2000. 

Depuis le 9 juin 1999, l'Etablissement O.________
détient l'entier du capital-actions de G.________, grâce à un prêt consenti par
la Fondation M.________.

- 25 juin 1999: R.________ SA, dont le siège était à
8********. Cette société, dont le capital-actions s'élevait à 250'000 fr.,
avait pour but l'achat, l'administration et la vente d'avions, les activités
dans le domaine de l'aéronautique et du transport aérien, et le commerce avec
des avions et commercialisation de vols d'affaires. A sa création, son
administrateur était S.________, beau-frère d'A. X.________, lequel a par la
suite été remplacé par T.________. Elle a été dissoute par suite de faillite
prononcée par jugement du 8 janvier 2014.

Selon les déclarations d'A. X.________, R.________
SA a été créée pour acquérir et exploiter l'avion qui appartenait auparavant à
C.________ et pour acquérir un nouvel avion. L'intéressé a en particulier précisé
ce qui suit à cet égard: 

"J'avais besoin d'un avion
pour gérer mes affaires, c'est pourquoi j'ai constitué deux sociétés. M. U.________
m'a conseillé de procéder de la sorte, celui-ci étant d'avis que le fisc
vaudois aurait refusé de passer par la société l'acquisition de l'avion et les
frais inhérents. Ces sociétés font partie du groupe de mes sociétés et ne
servent que celui-ci."

A une date indéterminée, l'Etablissement O.________
a acquis l'entier du capital-actions des sociétés K.________ AG et R.________
SA; les fonds servant à ces acquisitions lui ont été prêtés par la Fondation M.________.

Dès le mois de juin 1999, le "groupe C.________"
se composait ainsi selon l'organigramme suivant (selon un schéma daté du 2 juin
1999 et intitulé "Groupe C.________" / "Etat des
participations", saisi auprès de la fiduciaire d'A. X.________ et de
C.________):  

Concernant la constitution de ces sociétés, Me Gani
avait auparavant indiqué ce qui suit dans une note du 13 janvier 1999:

"C.________ (const. sociétés)

Dangereux

Pas de double facturation pour services fournis par la suisse à des
suisses

Société roumaine: à vendre en faisant un bénéfice

Noir? […]

Facturation aux étrangers; pas de problème

Brevets

Achat de royalties

Achat de services "bidon" → contrats de sociétés de
pays de l'Est"

 

F.                    
Le 7 mai 1999, R.________ SA a acquis un avion de type Pilatus PC-12/45
pour le prix de 2'953'315 USD. 

Cet achat a été financé par deux prêts: le premier,
d'un montant de 

3'400'000 fr., a été octroyé par la société de financement V.________, selon
une confirmation de prêt du 15 février 2000; selon les déclarations d'A.
X.________, cette société a accepté de lui accorder un tel prêt à la condition
que la société acquérante soit suisse 

- c'est pourquoi l'intéressé a été contraint de créer la société R.________ SA
alors qu'il détenait déjà la société K.________ AG. 

Quant au second prêt, d'un montant de 1'560'000 fr.,
il a été consenti par l'Etablissement O.________ - par le biais de fonds qui
lui avaient préalablement été prêtés par la Fondation M.________. La convention de prêt entre les deux entités a formellement été signée
le 20 mai 2001; consulté afin d'en établir le contenu, le conseil de C.________
a notamment proposé quelques modifications dans un fax adressé à C.________,
ceci "afin de renforcer le caractère vraisemblable du contrat de
prêt".

Par convention du 15 janvier 2000, R.________ SA a
cédé l'exploitation de l'avion concerné à K.________ AG pour le prix annuel de
600'000 fr., TVA en sus, payable par trimestre d'avance, à réception des
factures adressées par R.________ SA. Dès 2001, le montant de la redevance a
été augmenté à 720'000 fr. par an.

G.                   
Il résulte des pièces versées au dossier que, dans le courant de l'année
 2001, A. X.________ a envisagé de transférer les droits de propriété
intellectuelle des produits à l'Etablissement O.________. Dans cette optique,
un projet de "contrat de distribution et de licence pour logiciels" a
été établi entre cet établissement et C.________; dans un fax accompagnant ce
projet, adressé à A. X.________ le 1er juin 2001, Me Gani a relevé
en particulier ce qui suit:

"Par ailleurs, je t’informe
ci-après du résultat de mon entretien téléphonique de cette semaine avec mon
correspondant au Liechtenstein au sujet de ces contrats:

[…]

b. Provenance des droits sur les
logiciels: comme je l’avais également relevé, mon correspondant considère qu’il
est impératif de pouvoir établir de quelle manière O.________ est devenue
titulaire des droits qu’elle prétend concéder à des tiers; il ne serait en
effet pas crédible que O.________ puisse concéder des droits dont elle ne peut
justifier l’acquisition; j’ai évoqué la possibilité d’un contrat par lequel la
société roumaine pourrait céder ces droits à O.________; cela lui paraît
parfaitement acceptable, bien que l’identité des noms (C.________ Roumania/C.________
SA/G.________ AG) soit susceptible de faire naître des soupçons sur la réalité
de l’opération; si aucune autre solution ne peut être trouvée pour justifier la
propriété, par O.________, des droits sur les logiciels, un contrat entre C.________
(Roumanie) et O.________ devrait donc être envisagé;

c. ainsi que je l’ai déjà fait à
plusieurs reprises, mon correspondant attire ton attention sur le soupçon que
pourra également faire naître auprès du fisc l’utilisation d’une structure qui
permet à une société suisse (C.________ SA) de transférer à une entité 

« off-shore » des montants importants; il convient donc d’une part de rédiger
les contrats de manière soigneuse et crédible et d’autre part de s’apprêter à
répondre aux questions qui vont inévitablement être posées à ce sujet; sans
doute faudrait-il également prévoir une documentation annexe (par exemple un
échange de correspondances) susceptible d’étayer la réalité du contrat; comme
discuté lundi dernier, je laisse à M. U.________ le soin de nous indiquer si, à
son avis, le dossier est suffisamment complet et crédible du point de vue
fiscal; […]"

Me Gani a par ailleurs rencontré M. U.________ au
mois de juin 2001. Il ressort ce qui suit des notes prises par l'intéressé à
l'occasion de cet entretien:

"C.________ – propriété intellectuelle

A. → O.________: non (trop évident)

prêt → dr. roumanie: non (pas poss. d'établir un contrat)

W.________ (Romania) → O.________: il va étudier et me redit"

 

Le 12 juin 2001, Me Gani a rencontré A. X.________. Il
résulte ce qui suit d'une note en lien avec cet entretien: 

"C.________ / Licence de propriété intellectuelle

Transfert Roumanie → O.________ (contrat non signé!)

→ Tél. M. U.________ pour savoir si faisable que A. vende les
dts de C.________ ou bien C.________ Roumanie ?"

 

Le 29 novembre 2001, Me Gani a encore adressé un fax
à A. X.________ au sujet des contrats de licence et la facturation des
redevances de licence à C.________. Il y proposait en substance à l'intéressé
de constituer une société aux Etats-Unis, à laquelle l'Etablissement O.________
aurait concédé une licence qu'elle aurait ensuite concédée à C.________ en lui
facturant des redevances - lesquelles seraient ensuite reversées par la société
américaine à l'Etablissement O.________.

Il apparaît toutefois qu'aucun de ces projets n'a
abouti.

H.                    
Entre 1995 et 2002, A. X.________ et B. Y.________ X.________ ont
régulièrement déposé leurs déclarations d'impôts. Les périodes fiscales 1995-1996,
1997-1998 et 1999-2000 ont fait l'objet d'une taxation définitive, alors que la
période 2001-2002 est demeurée provisoire. Les éléments retenus dans ce cadre
et qui font l'objet de la présente procédure de reprises se présentent en substance
comme il suit: 

 

	
  Période fiscale

  	
  Impôt cantonal et communal

  	
  Impôt fédéral direct

  
	
  Taxations définitives

  	
  Revenu imposé

  	
  Fortune imposée

  	
  Revenu imposé

  
	
  1995-1996

  	
   

  	
   

  	
  75'700.-

  
	
  1997-1998

  01.01.1997-10.01.1998

  11.10.1998-31.12.19981

  	
   

  	
   

  	
   

  82'400.-

  84'900.-

  
	
  1999-2000

  01.01.1999-31.12.1999

  01.01.2000-31.12.20002

  	
   

  235'800.-

  223'100.-

  	
   

  652'000.-

  635'000.-

  	
   

  227'800.-

  216'400.-

  
	
  Taxation provisoire

  	
  Revenu déclaré

  	
  Fortune déclarée

  	
  Revenu déclaré

  
	
  2001-2002

  	
  186'300.-

  	
  911'000.-

  	
  178'100.-

  

1
Taxation intermédiaire pour
dévolution de fortune à la suite d'un décès

2
Taxation intermédiaire pour changement de profession de Mme Y.________
X.________

I.                      
A la suite d'un contrôle périodique de l'Administration cantonale des
impôts (ACI) et d'une enquête préliminaire de la Division d'enquêtes fiscales spéciales (DEF) de l'Administration fédérale des contributions
(AFC), cette dernière a été autorisée le 26 juillet 2003 par le Chef du
département fédéral des finances à mener une enquête sur C.________, A.
X.________ et B. Y.________ X.________, au motif qu'il existait un soupçon
fondé de graves infractions fiscales.

Dans le cadre de cette enquête, de nombreux
documents ont été saisis lors de perquisitions réalisées en septembre 2003 dans
les locaux de C.________, au domicile privé des époux X.________-Y.________ et
chez des tiers.

Le 7 septembre 2004, l'ACI a informé A. X.________
et B. Y.________ X.________ de l'ouverture à leur encontre d'une enquête
portant sur les périodes fiscales 1995 et suivantes. Par courrier du 15
septembre 2004, les intéressés, par l'intermédiaire de leur conseil, ont
manifesté leur souhait de collaborer à cette enquête. Dans le cadre de cette
procédure, A. X.________ a été entendu à trois reprises par la DEF, les 28
septembre 2004, 28 janvier 2005 et 14 juin 2005. 

Dans son rapport d'enquête du 21 septembre 2006, la DEF a retenu en particulier ce qui suit à titre de "Résultats d'enquête" (chapitre
3):

 

"3.1 Constatations
générales et observations

Les principales soustractions
d’impôt ont été réalisées notamment au travers de trois procédés.

Le premier a consisté à intercaler
entre C.________ SA, à 1********, et ses clients une société-écran, en
l’occurrence G.________ AG dont le siège social est au Liechtenstein, à 4********
plus précisément. Cette société était chargée de traiter les affaires
commerciales avec les clients sis en dehors du territoire suisse. L’activité
effective de cette société n’a jamais été déployée au Liechtenstein bien au
contraire, c’est C.________ SA, à 1******** et son personnel qui a déployé
cette activité en Suisse.

Le second procédé était lié à des
frais de sous-traitance en relation avec des projets de développement
informatique. Ces projets sensés être effectués par D.________, à Bucarest
étaient facturés à C.________ SA, à 1******** et à G.________ AG, à 4********.
En réalité, les montants facturés par D.________ n’ont jamais été encaissés par
ladite société […].

Le troisième procédé était lié à
l’utilisation d’un aéronef de type PC-12. Ces frais considérés comme
commerciaux étaient facturés par K.________ AG, à 4******** (qui fait également
partie du groupe) à C.________ SA, à 1******** et à G.________ AG, à 4********.
Or, il s’avère que la plus grande partie de ces frais relevait d’un usage
strictement privé.

Finalement, les fonds dégagés par
les deux premiers procédés ont en grande partie été versés sur des comptes
numériques ainsi que sur des comptes dont le titulaire est la fondation de
famille M.________, au Liechtenstein. Ces fonds ont notamment permis à cette
fondation de détenir et de financer la holding, soit l’établissement O.________,
au Liechtenstein qui à son tour a créé et financé G.________ AG et K.________
AG, à 4******** ainsi que R.________ SA, à 8********. Ces entités, bénéficiant
d’un statut fiscal privilégié, ont donc acquitté un impôt dérisoire sur le
revenu et la fortune en question alors même que M. X.________ qui apparaît
comme le seul et unique bénéficiaire économique n’a jamais acquitté d’impôt sur
ces éléments (Durchgriff).

[…]"

J.                     
Le 11 octobre 2007, l'ACI a adressé à A. X.________ et B. Y.________
X.________ une décision de rappel d'impôts et de taxation définitive ainsi
qu'un prononcé d'amendes concernant l'impôt cantonal et communal pour les périodes
fiscales 1999-2000 et 2001-2002, respectivement l'impôt fédéral direct pour les
périodes fiscales 1995-1996, 1997-1998, 1999-2000 et 2001-2002. Le dispositif
de cette décision a la teneur suivante:

"l'Administration
cantonale des impôts,

respectivement l'Administration
cantonale de l'impôt fédéral direct :

A.      En matière d'impôt cantonal
et communal

I.        p
r o c è d e          au rappel de l'impôt cantonal et communal et à la
taxation définitive suivants à l'endroit d'A. et B. X.________-Y.________ […]:

Impôt sur le
revenu

Compléments d'impôt
correspondant à la différence entre les éléments imposables et les éléments
imposés et déclarés

	
  Années

  	
  Canton

  	
  Commune

  	
  Total

  
	
   

  	
   

  	
  1********

  	
   

  
	
   

  	
  Fr.

  	
  Fr.

  	
  Fr.

  
	
  1999

  	
  161'526.55

  	
  62'607.20

  	
  224'133.75

  
	
  2000

  	
  161'495.40

  	
  62'595.10

  	
  224'090.50

  
	
  2001

  	
  171'907.50

  	
  73'293.90

  	
  245'201.40

  
	
  2001 bis (Art. 273 LI)

  	
  272'696.85

  	
  116'266.10

  	
  388'962.95

  
	
  2001 (Art. 49 LI)

  	
  22'038.50

  	
  9'306.25

  	
  31'434.75

  
	
  2002

  	
  171'907.50

  	
  79'957.00

  	
  251'864.50

  
	
  2002 bis (Art. 273 LI)

  	
  265'130.40

  	
  123'316.45

  	
  388'446.85

  
	
  Totaux

  	
  1'226'702.70

  	
  527'432.00

  	
  1'754'134.70

  

 Impôt sur la fortune

Compléments d'impôt
correspondant à la différence entre les éléments imposables et les éléments
imposés et déclarés

	
  Années

  	
  Canton

  	
  Commune

  	
  Total

  
	
   

  	
   

  	
  1********

  	
   

  
	
   

  	
  Fr.

  	
  Fr.

  	
  Fr.

  
	
  1999

  	
  13'569.20

  	
  5'259.35

  	
  18'828.55

  
	
  2000

  	
  13'569.20

  	
  5'259.40

  	
  18'828.60

  
	
  2001

  	
  32'885.70

  	
  14'021.05

  	
  46'906.75

  
	
  2002 

  	
  32'885.70

  	
  15'295.70

  	
  48'181.40

  
	
  Totaux

  	
  92'909.80

  	
  39'835.50

  	
  132'745.30

  

 

	
  Récapitulation générale
  (canton et commune)

  	
  Total

  
	
   

  	
  Fr.

  
	
  Compléments d'impôt pour le
  canton

  	
  1'319'612.50

  
	
  Complément d'impôt pour la
  commune

  	
  567'267.50

  
	
  Total des compléments d'impôts

  	
  1'886'880.00

  

II.       p r
o n o n c e       à l'encontre d'A. X.________-Y.________ […] des peines d'amendes de

          a)      Fr. 696'600.-- (six cent nonante six
mille six cents francs) pour les soustractions d'impôt cantonal et communal
commises durant la période fiscale 1999-2000, à savoir:

                                 Fr.                    502'000.--  pour
le canton et

                                 Fr.                    194'600.--  pour
la commune de 1********,

          b)      Fr.529'300.-- (cinq cent vingt neuf mille
trois cents francs) pour les soustractions d'impôt cantonal et communal tentées
durant la période fiscale 2001-2002, à savoir:

                                 Fr.                    366'100.--  pour
le canton et

                                 Fr.                    163'200.--  pour
la commune de 1********,

          c)      Fr. 777'400.-- (sept cent septante sept
mille quatre cents francs) pour les soustractions d'impôt cantonal et communal
tentées durant la période fiscale 2001-2002 bis (revenus extraordinaires), à
savoir:

                                 Fr.                    537'800.--  pour
le canton et

                                 Fr.                    239'600.--  pour
la commune de 1********,

          d)      Fr. 31'400.-- (trente et un mille quatre
cents francs) pour les soustractions d'impôt cantonal et communal tentées
durant la période fiscale 2001-2002 bis (prestations de prévoyance), à savoir:

                                 Fr.                     22'000.--   pour
le canton et

                                 Fr.                     
9'400. --  pour la commune de 1********.

	
  Récapitulation des amendes
  cantonales et communales

  	
  Totaux

  
	
   

  	
  Fr.

  
	
  Amendes cantonales

  	
  1'427'900.00

  
	
  Amendes communales

  	
  606'800.00

  
	
  Total des amendes

  	
  2'034'700.00

  

 

B.        
En matière d'impôt fédéral direct

III.      p r o c è d e          au
rappel de l'impôt fédéral direct et à la taxation définitive suivants à
l'endroit d'A. et B. X.________-Y.________ […]:

Impôts sur le revenu

Compléments d'impôt
correspondant à la différence entre les éléments imposables et les éléments
imposés et facturés

	
  Années

  	
  Dus

  	
  Facturés

  	
  Compléments
  à payer

  
	
   

  	
  Fr.

  	
  Fr.

  	
  Fr.

  
	
  1995

  	
  18'143.00

  	
  1'555.00

  	
  16'588.00

  
	
  1995 [recte: 1996]

  	
  18'143.00

  	
  1'555.00

  	
  16'588.00

  
	
  1997

  	
  49'639.00

  	
  1'700.00

  	
  47'939.00

  
	
  1998 (280 jours)

  	
  38'608.10

  	
  1'322.20

  	
  37'285.90

  
	
  1998 (80 jours)

  	
  11'106.00

  	
  410.65

  	
  10'695.35

  
	
  1999

  	
  129'881.00

  	
  18'881.00

  	
  111'000.00

  
	
  2000

  	
  128'558.50

  	
  17'399.00

  	
  111'159.50

  
	
  2001

  	
  126'707.00

  	
  12'420.00

  	
  114'287.00

  
	
  2001 (Art. 218 LIFD)

  	
  344'344.50

  	
  0.00

  	
  344'344.50

  
	
  2001 (Art. 38 LIFD)

  	
  9'085.40

  	
  0.00

  	
  9'085.40

  
	
  2002

  	
  126'707.00

  	
  12'420.00

  	
  114'287.00

  
	
  2002 (Art. 218 LIFD)

  	
  335'041.00

  	
  0.00

  	
  335'041.00

  
	
  Totaux

  	
  1'335'963.50

  	
  67'662.85

  	
  1'268'300.65

  

 

IV.     p
r o n o n c e       à l'encontre d'A. X.________-Y.________ […] des peines d'amendes de

          a)       Fr.    49'700.-- (quarante neuf
mille sept cents francs) pour les soustractions d'impôt fédéral direct commises
durant la période fiscale 1995-1996,

          b)       Fr.   143'800.-- (cent quarante trois mille
huit cents francs) pour les soustractions d'impôt fédéral direct commises
durant la période fiscale 1997-1998,

          c)       Fr.   333'200.-- (trois cent trente trois
mille deux cents francs) pour les soustractions d'impôt fédéral direct commises
durant la période fiscale 1999-2000,

          d)       Fr.   228'500.-- (deux cent vingt huit
mille cinq cents francs) pour les soustractions d'impôt fédéral direct tentées
durant la période fiscale 2001-2002,

          e)       Fr.   679'300.-- (six cent septante neuf
mille trois cents francs) pour les soustractions d'impôt fédéral direct tentées
durant la période fiscale 2001-2002 bis (revenus extraordinaires),

          f)       Fr.     9'000.-- (neuf mille francs) pour
les soustractions d'impôt fédéral directe tentées durant la période fiscale
2001-2002 bis (prestations de la prévoyance).

	
  Récapitulation
  des amendes pour l'impôt fédéral direct

  	
  Totaux

  
	
   

  	
  Fr.

  
	
  Année 1995

  	
  24'850.00

  
	
  Année 1996

  	
  24'850.00

  
	
  Année 1997

  	
  71'900.00

  
	
  Année 1998

  	
  71'900.00

  
	
  Année 1999

  	
  166'600.00

  
	
  Année 2000

  	
  166'600.00

  
	
  Année 2001

  	
  114'250.00

  
	
  Année 2001 bis (Art. 218 LIFD)

  	
  344'300.00

  
	
  Année 2001 bis (Art. 38 LIFD)

  	
  9'000.00

  
	
  Année 2002

  	
  114'250.00

  
	
  Année 2002 bis (Art. 218 LIFD)

  	
  335'000.00

  
	
  Total des amendes

  	
  1'443'500.00

  

 

	
  Total général (ICC et IFD)

  	
  Fr.
  6'633'380.65

  

 

V.        
l a i s s e              les frais de l'enquête pénale
fiscale à la charge de l'Etat;

VI.       d
i t                      que l'exécution des la présente décision / du
présent prononcé se fera ultérieurement par bordereau(x) d'impôts, de petites
différences dues aux arrondis étant réservées;

VII.      précise
                que les compléments d'impôts calculés ne tiennent pas compte
des paiements effectués, mais correspondent à la différence entre les éléments
imposables et les éléments imposés et déclarés."

Le même jour, l'ACI a également adressé une décision
de rappel d'impôts et de taxation définitive ainsi qu'un prononcé d'amendes à
C.________ concernant l'impôt cantonal et communal pour les périodes fiscales
en cause.

K.                    
A. X.________ et B. Y.________ X.________, par l'intermédiaire de leur
conseil commun, ont formé réclamation contre la décision les concernant par
courrier du 15 novembre 2007, étant précisé que, "comme convenu",
cette réclamation serait motivée ultérieurement.

Par courrier du 20 décembre 2007, l'ACI a accusé
réception de la réclamation et imparti un délai au 31 janvier 2008 aux
intéressés pour déposer la motivation de leur réclamation.

Se référant à des pourparlers transactionnels en
cours, le conseil d'A. X.________ et B. Y.________ X.________ a proposé, par
courrier du 4 janvier 2008, que la motivation de la réclamation ne soit déposée
que si les parties n'arrivaient pas à s'entendre, et requis que le délai
imparti par courrier du 20 décembre 2007 soit suspendu; par courrier du 23
janvier 2008, l'intéressé a notamment relevé qu'une entrevue avait été fixée le
1er avril 2008 et qu'il en déduisait que sa proposition avait été
acceptée - en ce sens que les intéressés n'étaient pas tenus de faire parvenir
la motivation de leur réclamation dans le délai au 31 janvier 2008.

Les parties se sont rencontrées le 1er
avril 2008. Les pourparlers transactionnels engagés n'ont pas abouti.

L.                     
Par décision sur réclamation du 4 décembre 2008, l'ACI a rejeté la
réclamation, retenant en substance ce qui suit:

"Eléments de revenus non
déclarés ou erronés

[…]

Reprise 1.01: Prestations
appréciables en argent obtenues par C.________ SA

[…]

Reprise 1.01 (tableau des
reprises C.________ SA): frais de sous-traitance non probants (./. montants
effectivement reversés aux employés roumains et évalués à 331/3 %)

[…]

Les montants repris correspondent
aux factures émises par D.________ SA vis-à-vis de C.________ SA pour les
prestations qui auraient été effectuées par la société roumaine pour les années
1995 à 2002. L'enquête a permis de démontrer que cette facturation était
fictive et avait pour but de permettre à l'actionnaire ultime du groupe de
prélever des liquidités sur les comptes de C.________ SA et de créditer ces
montants sur des comptes dont il était l'ayant-droit économique.

[…]
à défaut d'être justifiés commercialement (à l'exception du tiers des factures
admises comme charges de salaires pour les employés roumains), ces prélèvements
opérés sur les comptes de C.________ SA sur la base de factures fictives
établies par D.________ pour un montant total d'environ CHF 7'900'000.- entre
1995 et 2002 (pour les chiffres précis, cf. tableau des reprises […]), seront donc ajoutés au bénéfice
imposable de C.________ SA et constituent également des prestations appréciables
en argent en faveur de l'actionnaire majoritaire, M. A. X.________.

Reprise 1.02 (tableau des
reprises C.________ SA): frais relatifs à un aéronef non justifié
commercialement

Cette rubrique concerne la reprise
des factures émises par K.________ AG au titre de frais de location du PC-12. […]

[…]
si l'on peut admettre une justification commerciale pour les quelques vols à 
destination de la Roumanie, de Milan, de la France, ou de l'Angleterre, la part commerciale ne peut être évaluée à plus de 20 % des frais facturés aux
entreprises concernées, à savoir C.________ et G.________ […]

Outre le fait que la justification
commerciale des frais de location du Pilatus PC-12 n'a pas été démontrée par la
réclamante, la présente autorité relève que la facturation desdits frais était
pour le moins fantaisiste et semblait avoir en réalité pour unique but de
couvrir les frais d'exploitation de l'avion et non de correspondre à une
quelconque activité commerciale.

[…]
80 % des frais de location de l'avion pris en charge par C.________ SA seront
ajoutés au bénéfice de cette dernière à titre de charges non justifiées
commercialement, ces montants constituant en outre des prestations appréciables
en argent en faveur de l'actionnaire.

Reprise 1.03 (tableau des
reprises C.________ SA): chiffre d'affaires non comptabilisé (G.________ AG)

Cette reprise a pour objet d'attribuer
à C.________ SA le résultat comptabilisé dans les comptes de G.________ dès
1999, date de sa création au Liechtenstein ainsi que les charges non justifiées
commercialement imputées à G.________ selon le même schéma que les charges non
justifiées commercialement de C.________ SA, à savoir les factures fictives
(cf. reprise 1.01) et les frais d'avion (cf. reprise 1.02). Les montants repris
pour les années 1999 à 2002 s'élèvent au total à CHF 5'331'124.- (cf. le
tableau des reprises […]).

[…]
les éléments imposables de G.________, à savoir son bénéfice ainsi que les
charges non justifiées commercialement […]
seront intégrés au bénéfice de C.________ SA. […]
Ces montants n'ayant pas été déclarés par C.________ SA, ils constituent en
outre une distribution dissimulée de bénéfices en faveur de M. X.________.

Reprise 1.02 (tableau des
reprises M. et Mme X.________): indemnité Helsana

[…]
les époux X.________ n'ont pas indiqué, dans leur déclaration d'impôt 2001, le
montant de CHF 432'000.- reçu suite au décès de leur fils. Cette prestation
étant imposable […], elle sera ajoutée à
leur revenu imposable.

Reprise 1.03 (tableau des
reprises M. et Mme X.________): transparence des entités 

« offshore » pour M. X.________

[…]
M. X.________ a constitué en 1999 la Fondation M.________ et l'Etablissement O.________ au Liechtenstein, la première détenant la seconde qui elle-même
détenait, en juin 1999, 3 sociétés: G.________, à 4********, Liechtenstein, K.________
AG, Liechtenstein et R.________ SA, 8********.

L'enquête a permis de démontrer
que l'unique ayant droit économique de cette structure était M. X.________.

[…]
Comme cette construction juridique n'était pas adaptée aux données économiques
relatives à la situation du recourant (qui disposait d'une structure
commerciale en Suisse) et que cette façon de procéder ne s'expliquait que pour
des motifs fiscaux, l'autorité fiscale peut faire abstraction de la forme
juridique pour attribuer les éléments imposables directement à M. X.________, à
savoir en l'espèce le résultat net de la Fondation M.________ en 1999 (CHF 3'667.-) et en 2000 (CHF 69'068.-) et de l'Etablissement O.________
en 1999 (CHF 14'693.-) et en 2000 (CHF 16'970.-) […]

Reprise 1.04 (tableau des
reprises de M. et Mme X.________): revenus nets des comptes bancaires non
déclarés

M. et Mme X.________ disposaient
de deux comptes bancaires non déclarés auprès de la banque Z.________ & Cie
SA à 8******** (aujourd'hui après fusion, A.A.________ & Cie SA, succursale
de 8********).

[…]

Eléments de la fortune non
déclarés ou erronés

1.           Eléments
soustraits ou à reprendre

Reprise 1.03 (tableau des
reprises de M. et Mme X.________): transparence des entités offshore pour M. A.
X.________

Comme exposé ci-dessus au ch. 1.03
du tableau des reprises (éléments de revenus non déclarés ou erronés), les
éléments de fortune des sociétés offshore doivent être imputés à M. X.________.

En l'espèce, est visé le
patrimoine de la Fondation M.________ […],
lequel détient l'Etablissement O.________ […]
et les participations G.________ AG […]
et K.________ AG et R.________ SA.

[…]

Reprise 1.04 (tableau des
reprises de M. et Mme X.________): Z.________ & Cie SA, comptes numériques
non déclarés

La Fondation M.________, bien que disposant de deux comptes auprès de la Banque Z.________ & Cie SA […], n'a pas mentionné
les avoirs déposés auprès de ces banques dans les comptes de la Fondation. En application du principe de la transparence développé sous le chiffre 1.03
ci-dessus (tableau de reprises de M. et Mme X.________), les avoirs figurant
sur ces comptes doivent être attribués à M. X.________.

[…]

Les autres comptes non déclarés
sont le compte […] (titulaire M.
X.________) […] et le compte […] (compte-joint de M. et Mme X.________) […].

Reprise 1.05 (tableau des
reprises de M. et Mme X.________): B. B.________, comptes non
déclarés

Cette rubrique concerne la fortune
déposée dans six comptes au B. B.________, dont le titulaire est M. X.________
et qui ne figurent pas dans son état des titres. […]

2.               
Eléments de reprises ne constituant pas une soustraction

Reprise 2.01 (tableau des
reprises de M. et Mme X.________): estimation des titres C.________ SA

[…]

L'autorité fiscale a procédé à une
estimation des titres et, par conséquent, corrigé la déclaration sur ce point […].

[…]

C.4         Fixation de
l'amende

[…]

En l'espèce, au titre des
circonstances atténuantes, il est à relever que le contribuable n'a pas
d'antécédents en matière pénale fiscale, qu'il est marié avec un enfant à
charge, que, s'agissant de son état de santé, M. A. X.________ souffre de
surpoids et d'hypertension artérielle et qu'il a été tenu compte des sanctions
infligées à la société C.________ SA, ainsi que des répercussions en matière
d'impôt anticipé.

Au titre des circonstances
aggravantes, on s'aperçoit que l'activité incriminée porte sur neuf ans sur le
plan de l'impôt fédéral direct, respectivement six ans pour l'impôt cantonal et
communal, que le total des éléments soustraits s'élève à 9'990'403.- (ICC) et
CHF 11'034'185.- (IFD) et que le total des éléments de fortune repris en
soustraction d'élève à CHF 3'763'522.- (ICC), […]
que la soustraction commise résulte d'un montage particulièrement astucieux
faisant usage de structures étrangères pour dissimuler des recettes imposables
en Suisse, que des faux (factures fictives) ont été confectionnés pour induire
les administrations fiscales en erreur, que ces montages avaient pour but de
dissimuler d'importants bénéfices en faveur d'A. X.________-Y.________,
actionnaire majoritaire de la société C.________ SA et ayant droit économique
des différentes entités offshore et des comptes numériques ainsi constitués et
que M. A. X.________ s'était adjoint les services de professionnels dans les
domaines de la comptabilité et de la fiscalité lors de l'accomplissement de ces
faits.

[…]

Au vu de l'ensemble du dossier et
compte tenu de la situation financière du contribuable, la faute du réclamant
peut être qualifiée de grave te la quotité de l'amende sera fixée à 1,5 fois le
montant de l'impôt soustrait pour les périodes fiscales pour lesquelles la
taxation est définitive […], quotité qui
sera réduite d'un tiers pour les périodes fiscales pour lesquelles la taxation
était provisoire à la date de l'ouverture en soustraction […]." 

On reproduit ci-dessous les tableaux des reprises
auxquels il est fait référence, étant précisé que le tableau portant sur les
"éléments de la fortune non déclarés ou erronés" des époux X.________
a été corrigé à cette occasion (les corrections en cause étant toutefois sans
incidence sur la taxation, compte tenu notamment de la brèche fiscale due au passage
au système postnumerando):

 

Par une autre décision sur réclamation du même jour,
l'ACI a également rejeté la réclamation formée par C.________ à l'encontre de
la décision du 11 octobre 2007 la concernant.

M.                   
A. X.________ et B. Y.________ X.________ ont formé recours contre la
décision sur réclamation les concernant devant la Cour de droit administratif et public du Tribunal cantonal (CDAP) par acte du 5 juillet 2009.
Ils ont en substance fait valoir que l'ACI avait statué alors que des pourparlers
étaient en cours et sans leur laisser la possibilité de motiver leur
réclamation, en violation de leur droit d'être entendus, et principalement
conclu à l'annulation de la décision sur réclamation attaquée - charge à
l'autorité intimée de convenir avec eux d'un délai raisonnable pour motiver
leur réclamation. Pour le reste, ils se sont plaints d'une mauvaise application
des règles fédérales et cantonales sur la détermination du bénéfice imposable,
et ont conclu, à titre subsidiaire, à l'annulation de la décision sur
réclamation attaquée après qu'un second échange d'écritures aurait été ordonné,
respectivement après qu'ils auraient été invités à déposer un mémoire complétif.
Les intéressés produisaient notamment, à l'appui de leur recours, un avis de
droit établi le 23 juin 2004 par le Prof. C.C.________, lequel concluait que
D.________ était titulaire des droits d'auteur sur les logiciels informatiques
commercialisés par le groupe, ainsi qu'un "rapport d'expertise relatif à
la répartition internationale des produits du groupe C.________" établi le
5 janvier 2004 par D.D.________ SA dont il résulte que, sur la base du principe
de pleine concurrence, le taux de marge des sociétés assurant la distribution
des produits (soit de C.________ et de G.________) pouvait être estimé à 30 %
(après rabais).

Dans sa réponse du 13 mars 2009, l'ACI a conclu au
rejet du recours. Par écriture du 13 mars 2009, l'AFC, invitée à participer à
la procédure en tant qu'autorité concernée, a également (implicitement) conclu
au rejet du recours.

Les recourants ont en substance maintenu leurs
conclusions et développé leurs arguments dans leurs observations
complémentaires du 28 août 2009. Ils ont notamment produit un rapport intitulé
"Evaluation de l'effort et des compétences nécessaires au développement
des produits de D.________ SA" établi le 8 août 2009 par le Prof.
E.E.________, professeur honoraire auprès de la Faculté HEC de l'Université de Lausanne, ainsi qu'un "rapport d'expertise relatif à la
facturation de D.________ SA aux sociétés commerciales du groupe C.________"
établi le 27 août 2009 par D.D.________ SA - dont il résulte en particulier, en
référence notamment au rapport établi par le Prof. E. E.________, que les
facturations de D.________ aux sociétés du groupe n'étaient ni fictives ni
surévaluées, respectivement que les fonds résultant des activités de D.________
n'avaient pas servis à couvrir des dépenses privées de ses actionnaires.  

Par écriture du 19 novembre 2009, l'ACI s'est
déterminée sur les arguments des recourants et les pièces produites, et a
principalement conclu au rejet du recours. Par écriture du 19 novembre 2009, l'AFC
a également conclu au rejet du recours.

N.                    
Dans l'intervalle, C.________ a également formé recours contre la
décision sur réclamation de l'ACI du 4 décembre 2008 la concernant, invoquant
en substance les mêmes arguments et prenant des conclusions similaires à celles
prises par les recourants dans le cadre de la présente procédure.

Par arrêt FI.2009.0001 du 4 août 2010, la CDAP a
très partiellement admis le recours et réformé la décision sur réclamation
attaquée en ce sens que le rappel d'impôt et l'amende en matière d'impôt
cantonal et communal pour la période 1999 étaient supprimés en raison de la
prescription. Le dispositif de cet arrêt a été précisé par arrêt rectificatif
du 14 septembre 2010, en ce sens que la décision sur réclamation attaquée était
entièrement confirmée en matière d'impôt fédéral direct.

Par arrêt 2C_724/2010 et 2C_796/2010 du 27 juillet
2011, le Tribunal fédéral a partiellement admis le recours en matière d'impôt
fédéral direct et réformé l'arrêt attaqué en ce sens que le rappel d'impôt et
l'amende relatifs à la période fiscale 1995 étaient supprimés en raison de la
prescription, le recours étant pour le reste rejeté dans la mesure de sa
recevabilité en matière d'impôt cantonal et communal.

O.                   
A la suite de ce dernier arrêt, les recourants ont personnellement déposé
un "complément au recours" (non daté, parvenu le 4 décembre 2012 à la CDAP), maintenant leur conclusion principale dans le sens de l'annulation de la décision sur
réclamation attaquée - charge à l'autorité intimée de convenir avec eux d'un
délai raisonnable pour motiver leur réclamation. Ils ont notamment produit, à
l'appui de cette écriture, un nouvel avis de droit établi le 20 avril 2012 par
le Prof. C.C.________ concernant la "titularité des droits de propriété
intellectuelle dans le groupe C.________", et conclu, à titre subsidiaire,
que soient ordonnées des expertises indépendantes portant sur la pertinence des
conclusions de l'expertise financière réalisée par D.D.________ SA
respectivement des avis de droit délivrés par le Prof. C.C.________.

Par écriture du 15 janvier 2013, l'autorité intimée
a maintenu sa conclusion dans le sens du rejet du recours.

Par écriture du 31 janvier 2013, les recourants, par
l'intermédiaire de leur nouveau conseil, ont requis la suspension de la cause
jusqu'à droit connu sur la plainte qu'ils avaient déposée le 7 juin 2012 auprès
de la Cour des plaintes du Tribunal pénal fédéral (en lien avec le fait que la
restitution de certaines pièces saisies en 2003 leur avait été refusée); à
titre subsidiaire, ils ont requis la tenue d'une audience, et produit une liste
de témoins dont l'audition était requise à cette occasion. Par écriture du 14
février 2014, les intéressés ont encore requis la suspension de la présente cause
jusqu'à droit connu sur la plainte pénale déposée par l'AFC contre A.
X.________ - étant précisé que ce dernier avait formé opposition à l'ordonnance
de condamnation rendue à son encontre dans ce cadre.

L'ACI et l'AFC se sont opposées à toute suspension
de la procédure par écritures respectives des 19 et 21 février 2014.

Le 25 mars 2014, les recourants ont maintenu leurs
requêtes tendant à l'audition de témoins, respectivement à la mise en œuvre
d'une expertise judiciaire, et requis que la dénonciation ayant donné lieu à
l'enquête de la DEF soit versée au dossier. Ils ont par ailleurs procédé à une
synthèse de leurs griefs, et confirmé "les conclusions prises au pied de
leur recours". Ils ont produit un nouveau lot de pièces, comprenant
notamment différents documents produits dans le cadre d'une procédure
judiciaire dirigée contre D.________ en Roumanie en lien avec les montants
versés "au noir" à cette société par A. X.________ durant les années
1992 à 1998 à titre de salaires, loyers et autres dépenses courantes.  

P.                    
Une audience d'instruction a été mise en œuvre le 27 mars 2014. Il
résulte en particulier ce qui suit du procès-verbal établi à cette occasion:

"Interpellé, le conseil des
recourants expose les motifs pour lesquels il estime qu'il se justifie
d'entendre les différentes personnes dont l'audition est requise en qualité de
témoins, en lien notamment avec l'activité déployée par la société D.________
SA, respectivement les frais de sous-traitance annoncés dans ce cadre par C.________
SA, ou encore l'usage de l'aéronef de la société K.________ AG; l'intéressé
maintient en outre, le cas échéant, sa requête tendant à la mise en œuvre d'une
expertise en vue de confirmer les constatations de l'expert privé F.F.________
(D.D.________ [SA]).

L'autorité intimée conteste pour
sa part la pertinence de la mise en œuvre des mesures d'instruction
complémentaires requises par les recourants, se référant en particulier à la
teneur de l'arrêt 2C_724/2010 et 2C_796/2010 rendu le 27 juillet 2011 par le
Tribunal fédéral dans la cause l'opposant à C.________ SA. 

[…]

Sont successivement introduits
pour être entendus en qualité de témoin, après avoir été exhortés à dire la
vérité et rendus attentifs aux conséquences pénales en cas de faux témoignage: 

          -        G. G.________, né en 1948, domicilié à 10********,
Directeur commercial de H. H.________ France (actuellement en « semi-retraite »).

Le témoin indique avoir été en
relation d'affaires avec le recourant A. X.________ dès le début des années
1990, durant « quatre à cinq ans », avant de le perdre de vue jusqu'en 2008. A
la question du conseil des recourants, il expose qu'il ignorait que la société
de l'intéressé déployait une activité en Suisse - il pensait que « tout se
faisait en Roumanie »; il précise que la société qui l'employait ne voulait pas
conclure un contrat avec une société roumaine, raison pour laquelle le contrat
a été conclu avec la société suisse. Il confirme pour le reste que l'ensemble
des prestations étaient réalisées par des informaticiens roumains,
respectivement par la société roumaine.

N'ayant rien d'autre à déclarer,
le témoin se retire.

          -        I.I.________,
né en 1947, domicilié à 10********, retraité.

Le témoin indique avoir exercé une
activité d'informaticien pour J.J.________ & Cie de 1991 à 2010. Il a dans
ce cadre entretenu une relation d'affaires avec le recourant A. X.________ dès
1994, en lien avec l'acquisition d'un logiciel de trading; le système en cause
a été implanté dès 1996 sur le marché suisse, puis élargi à d'autres marchés et
implanté dans les succursales du Luxembourg et du Canada de la société dès
2000. Le témoin précise qu'une équipe de Roumanie, composée de 3 à 25 employés,
se déplaçait à chaque nouvelle étape dans les locaux de J.J.________ & Cie
(lui-même ne s'est jamais rendu en Roumanie). Interpellé par le conseil des
recourants, il confirme que l'ensemble des prestations en lien avec le logiciel
de trading concerné étaient réalisées en Roumanie; il estime ainsi qu'environ
98 % de l'activité était déployée dans ce pays - la société suisse se
contentant en substance de réceptionner les demandes d'assistance et de les
transmettre à la société roumaine.

A la question de l'autorité
intimée, le témoin indique que le service juridique de J.J.________ & Cie a
été quelque peu « déstabilisé » lorsqu'il s'est agi de conclure le contrat de
2000 avec une société basée au Liechtenstein - alors que le contrat de 1994
avait été conclu avec la société suisse -, et que ce service n'a donné son
accord qu'après avoir « regardé de très près » la situation.

N'ayant rien d'autre à déclarer,
le témoin se retire.

[…]

Le président informe les parties
qu'il est en l'état renoncé à entendre en qualité de témoins les autres
personnes dont l'audition est requise par les recourants, étant précisé qu'il
est loisible à ces derniers, s'ils le souhaitent, de produire des déclarations
écrites des intéressés.

[…]

Les recourants indiquent qu'ils
retirent leur requête tendant à la suspension de la cause jusqu'à droit connu
sur la procédure pénale dirigée contre A. X.________."   

Q.                   
Dans leurs observations finales du 12 mai 2014, les recourants ont notamment
produit diverses attestations écrites de personnes dont ils avaient demandé
l'audition en qualité de témoins, et requis que quatre personnes soient
interpellées par le tribunal en vue d'une déclaration écrite, subsidiairement
qu'elles soient convoquées à une audience afin d'être entendues en tant que
témoins. Ils ont par ailleurs produit un avis de droit (non daté) du Prof. K.K.________,
professeur honoraire auprès de la Faculté HEC de l'Université de Lausanne, lequel estimait en particulier que les expertises établies par D.D.________ SA les 5
janvier 2004 et 27 août 2009 respectaient les règles comptables et fiscales
suisses - de sorte que leurs conclusions avaient pleine force probante; ils ont
également produit une "étude sur le « Coût d'utilisation d'un aéronef
»" réalisée le 8 mai 2014 par M. L.L.________, instructeur de vol et
pilote consultant, ainsi qu'un "complément au rapport du 13 août
2009" établi en avril 2014 par le Prof. E. E.________ en lien avec le
"coût du développement des logiciels bancaires". Ils ont enfin
maintenu leur requête tendant à ce que soit ordonnée une expertise judiciaire
"destinée à faire valider les constatations des nombreuses expertises
privées versées au dossier".

Par écriture du 19 novembre 2014, les recourants ont
notamment produit le jugement rendu par le Tribunal de police d'arrondissement
de Lausanne le 3 septembre 2014 à l'encontre d'A. X.________, condamnant ce
dernier à une peine pécuniaire de 120 jours-amende pour usage de faux - étant
précisé que l'intéressé avait fait appel de ce jugement; les intéressés
invoquaient les considérants de ce jugement s'agissant en particulier du rôle
et de la comptabilité de G.________, de la facturation des prestations de
D.________ à C.________ et G.________ respectivement de la répartition des
frais de l'avion Pilatus PC-12/45.   

R.                    
Le tribunal a statué par voie de circulation.

Considérant en droit

1.                     
Interjeté en temps utile (art. 95 de la loi vaudoise du 28 octobre 2008
sur la procédure administrative - LPA-VD; RSV 173.36), le recours satisfait par
ailleurs aux autres conditions formelles de recevabilité (cf. en particulier
art. 79 al. 1 LPA-VD, applicable par analogie par renvoi de l'art. 99 LPA-VD),
de sorte qu'il y a lieu d'entrer en matière sur le fond.

2.                     
Lorsque, comme en l'espèce, le tribunal est appelé
à se prononcer sur une question relevant tant de l'impôt fédéral direct que des
impôts cantonal et communal, il doit en principe rendre deux décisions; ces
dernières peuvent toutefois figurer dans un seul acte, avec des motivations et
des dispositifs distincts ou du moins un dispositif distinguant expressément
les deux impôts (cf. ATF 135 II 260 consid. 1.3.1 et les références).

3.                     
Il convient en premier lieu d'examiner d'office la question de la
prescription 

- s'agissant d'une créance de droit public à l'égard d'un particulier (cf. ATF
106 Ib 357 consid. 3a; TF, arrêt 2P.296/2006 du 28 mars 2007 consid. 2; arrêt
FI.2010.0078 du 9 février 2011 consid. 2a). En l'occurrence, deux prescriptions
sont susceptibles d'entrer en ligne de compte: la prescription du droit de
taxer et la prescription de la poursuite pénale.

a) En l'absence d'une réglementation expresse
contraire, est applicable à la taxation le droit en vigueur pendant la période
fiscale en cause (TF, arrêt 2C_637/2012 et 2C_638/2012 du 4 octobre 2012
consid. 7 et les références). Les règles concernant la prescription sont ainsi celles
en vigueur au moment de la naissance de la créance d'impôt (arrêt FI.2011.0032
du 29 mai 2012 consid. 3 et les références).

S'agissant en l'espèce de l'impôt fédéral direct,
les reprises et amendes ont trait aux périodes fiscales 1995-1996 à 2001-2002;
la loi fédérale du 14 novembre 1990 sur l'impôt fédéral direct (LIFD; RS
642.11), entrée en vigueur le 1er janvier 1995, s'applique dès lors
à toute les périodes concernées.

S'agissant de l'impôt communal et cantonal, les
reprises et amendes portent sur les périodes fiscales 1999-2000 et 2001-2002. La
loi vaudoise du 4 juillet 2000 sur les impôts directs cantonaux (LI; RSV
642.11) est entrée en vigueur le 1er janvier 2001; elle a abrogé la
loi homonyme du 26 novembre 1956 (aLI). Le litige est dès lors soumis aux
dispositions de l'aLI pour la période 1999-2000, respectivement de l'actuelle
LI pour la période 2001-2002.

aa) En matière d'impôt fédéral direct, l'art. 120
LIFD prévoit que le droit de procéder à la taxation se prescrit par cinq ans à
compter de la fin de la période fiscale 

(al. 1). La prescription ne court pas ou est suspendue notamment pendant la
durée des procédures de réclamation, de recours ou de révision (al. 2 let. a).
Elle est interrompue notamment par tout acte de l'autorité tendant à fixer ou
faire valoir la créance d'impôt 

(al. 3 let. a). Elle est acquise, dans tous les cas, quinze ans après la fin de
la période fiscale (al. 4). 

L'art. 120 al. 1 LIFD réserve l'application de
l'art. 152 LIFD relatif au rappel d'impôt. Selon cette dernière disposition, le
droit d'introduire une procédure de rappel d'impôt s'éteint dix ans après la
fin de la période fiscale pour laquelle la taxation n'a pas été effectuée,
alors qu'elle aurait dû l'être, ou pour laquelle la taxation entrée en force
était incomplète (al. 1). Le droit de procéder au rappel de l'impôt s'éteint
quinze ans après la fin de la période fiscale à laquelle il se rapporte (al.
3). La jurisprudence a eu l'occasion de préciser que, pour les périodes
fiscales bisannuelles (cf. art. 40 al. 2 LIFD dans sa teneur applicable avant
le 1er janvier 2001), ce dernier délai commençait à courir après la
fin de la deuxième année concernée, qui serait une année paire (ATF 140 I 168
consid. 6.1 et les références). 

aaa) En l'espèce, les périodes fiscales 1995-1996 à
1999-2000 ont fait l'objet d'une taxation définitive, dont la modification est
ainsi soumise aux dispositions sur le rappel d'impôts. Dès lors que l'ACI a
introduit une procédure de rappel d'impôt en notifiant aux recourants un avis
d'ouverture de procédure pour soustraction fiscale le 7 septembre 2004 (cf.
let. I supra), la prescription de dix ans prévue par l'art. 152 al. 1
LIFD n'était pas acquise pour la plus ancienne période fiscale en cause (1995-1996)
et, partant, pas davantage pour les autres périodes litigieuses.

S'agissant en revanche de la prescription absolue du
droit de taxer, il s'impose de constater que le délai de 15 ans prévu par
l'art. 152 al. 3 LIFD est arrivé à échéance à la fin de l'année 2011 pour la
période 1995-1996, respectivement à la fin de l'année 2013 pour la période
1997-1998, soit au cours de la présente procédure; il convient dès lors de
réformer la décision sur réclamation attaquée sur ce point, en ce sens que le
rappel d'impôt pour les périodes 1995-1996 et 1997-1998 est annulé. 

bbb) En ce qui concerne la période fiscale
2001-2002, la taxation n'est que provisoire. L'autorité intimée ayant notifié
un avis d'ouverture de procédure pour soustraction fiscale le 7 septembre 2004 aux
recourants, elle a valablement interrompu la prescription (art. 120 al. 3 let.
a LIFD), laquelle ne court pas, respectivement est suspendue, pendant les
procédures de réclamation, de recours ou de révision (art. 120 

al. 2 let. a LIFD). La prescription absolue de 15 ans prévue par l'art. 120 al.
4 LIFD n'est en outre pas acquise.

bb) En matière d'impôts cantonal et communal, l'art. 98a aLI prévoyait que, sous réserve des art. 107 ss aLI (cas de
révision) et 128 ss (cas de soustraction), le droit de procéder à une taxation
se prescrivait quatre ans après la fin de la période de taxation (al. 1). La
prescription ne courrait pas ou était suspendue pendant la durée des procédures
de réclamation, de recours et de révision (al. 2 let. a). La prescription était
acquise, dans tous les cas, douze ans après la fin de la période de taxation
(al. 4). 

S'agissant de la procédure de révision
des décisions définitives, il résulte de l’art. 109 aLI que l’autorité de
taxation pouvait réviser la taxation dans les trois mois dès la découverte du
motif de révision, mais au plus tard dans les quatre ans dès la communication
de la décision en cause, lorsqu’elle découvrait des faits nouveaux importants
ou des preuves qu’elle n’avait pu invoquer dans la procédure de taxation, de
réclamation ou de recours. Quand le motif de révision était lié à une
soustraction, 

l'art. 133 aLI prévoyait un délai de prescription de quatre ans après la fin de
la période de taxation.

Sous l'empire du nouveau droit tel
qu'en vigueur depuis le 1er janvier 2001, il résulte de
l'art. 170 LI que le droit de procéder à la taxation se prescrit
par cinq ans à compter de la fin de la période fiscale, les art. 208 (cas du
rappel d'impôt) et 254 (prescription de la poursuite pénale) LI étant réservés
(al. 1). La prescription du droit de procéder à la taxation est acquise dans
tous les cas quinze ans après la fin de la période fiscale (al. 4).

aaa) En l'espèce, concernant l'impôt
cantonal et communal, seule la période fiscale 1999-2000 a fait l'objet d'une
taxation définitive. Le motif de révision étant lié à une soustraction, la
prescription du droit de taxer concernant cette période est ainsi arrivée à échéance
à la fin de l'année 2004, en application de l'art. 133 aLI. La prescription
n'était dès lors pas acquise lorsqu'un avis d'ouverture de procédure
pour soustraction fiscale a été adressé le 7 septembre 2004 aux recourants. 

S'agissant en revanche de la prescription absolue du
droit de taxer, il apparaît que le délai de 12 ans prévu par l'art. 98a al. 4
LI est arrivé à échéance à la fin de l'année 2012 pour la période 1999-2000,
soit en cours de procédure; il convient dès lors de réformer la décision sur
réclamation attaquée sur ce point, en ce sens que le rappel d'impôt pour la
période en cause est annulé. 

bbb) Quant à la période 2001-2002, qui n'a fait l'objet
en l'état que d'une taxation provisoire, il s'impose de constater que les délais de prescription tant relatif qu'absolu sont respectés, au
regard de l'art. 170 LI.

b) S'agissant du droit applicable à la
prescription de la poursuite pénale, il résulte de la jurisprudence que les
dispositions du nouveau droit sont applicables aux infractions commises avant
leur entrée en vigueur si elles sont plus favorables à l'auteur que celles de l'ancien
droit (principe de la lex mitior); si, au contraire, le nouveau droit
prévoit un délai de prescription plus long, on appliquera l'ancien droit à une
infraction commise sous son empire (principe de la non-rétroactivité; cf. ATF
129 IV 49 consid. 5.1; TF, arrêt 6B_496/2012 et 6B_503/2012 du 18 avril 2013
consid. 8.2).

aa) En matière d'impôt fédéral direct
et comme déjà relevé, toutes les périodes fiscales litigieuses sont postérieures
à l'entrée en vigueur de la LIFD et, partant, sont soumises à cette loi.
S'agissant de la prescription de la poursuite pénale, l'art. 184 LIFD prévoit
ce qui suit:

"1
La poursuite pénale se prescrit:

a. en cas de
violation des obligations de procédure par deux ans et en cas de tentative de
soustraction d’impôt par quatre ans à compter de la clôture définitive de la
procédure au cours de laquelle la violation des obligations de procédure ou la
tentative de soustraction a été commise;

b. en cas de
soustraction d’impôt consommée, par dix ans à compter de la fin de la période
fiscale pour laquelle la taxation n’a pas été effectuée ou l’a été de façon
incomplète, ou pour laquelle l’impôt à la source n’a pas été perçu conformément
à la loi, ou par dix ans à compter de la fin de l’année civile au cours de
laquelle une restitution d’impôt illégale ou une remise d’impôt injustifiée a été
obtenue, ou des biens ont été dissimulés ou distraits dans la procédure
d’inventaire.

2 La prescription est interrompue par tout acte de procédure tendant à
la poursuite du contribuable ou de l’une des personnes visées à l’art. 177.
L’interruption est opposable tant au contribuable qu’à ces autres personnes. Un
nouveau délai commence à courir à chaque interruption; la prescription ne peut
toutefois être prolongée de plus de la moitié de sa durée initiale."

aaa) En l'espèce et comme on l'a vu
ci-dessus, le rappel d'impôt pour les périodes 1995-1996 et 1997-1998
est annulé compte tenu du fait que la prescription absolue du droit de taxer a
été atteinte en cours de procédure - s'agissant des périodes concernées, la
poursuite pénale est au demeurant également prescrite, en application de l'art.
184 al. 2 LIFD. Il convient dès lors de réformer la décision sur réclamation
attaquée sur ce point, en ce sens que les amendes pour les périodes 1995-1996
et 1997-1998 sont annulées.

S'agissant de la période 1999-2000 - qui a également
fait l'objet d'une décision de taxation définitive, de sorte que la
soustraction est consommée -, la prescription a été valablement
interrompue par l'avis d'ouverture de procédure du 7 septembre 2004
(art. 184 al. 1 let. b LIFD). La prescription absolue n'est en outre pas
atteinte (art. 184 al. 2 LIFD).

bbb) Concernant la période fiscale 2001-2002, seule
une décision de taxation provisoire a été rendue, de sorte qu'il s'agit d'une
tentative de soustraction. Cela étant et en application de l'art. 184 al. 1 let. a LIFD, la prescription n'a pas commencé à courir pour
la période en cause.

bb) S'agissant de l'impôt cantonal et
communal, se pose la question du droit applicable.

Sous l'empire de l'ancien droit,
l'art. 133 aLI prévoyait que la contravention était prescrite quatre ans après
la période de taxation, la prescription pouvant toutefois être interrompue par
tout avis informant le contribuable d'une enquête en cours (al. 1), sauf si
aucune suite ne lui était donnée dans le délai d'une année (al. 2) - en ce sens
que l'avis interruptif de la prescription devait être validé par une opération
d'instruction dans le délai d'une année (arrêts FI.1996.0057 du 5 novembre 1996
et FI.1996.0088 du 17 juin 1997). Cette disposition ne prévoyait aucun délai de
prescription absolue; selon la jurisprudence, l'art. 98a al. 4 aLI - qui
prévoyait un délai de prescription absolue de douze ans - était également applicable
à la contravention (arrêts FI.1998.0009 du 14 décembre 2000 consid. 2 et
FI.1996.0088 précité). 

Dans l'actuelle LI, la question de la
prescription de la procédure pénale est régie par l'art. 254, dont la teneur
est calquée sur le modèle de l'art. 184 LIFD.

Il apparaît en définitive qu'il
convient en l'occurrence d'appliquer les art. 133 aLI et 98a al. 4 aLI, qui
prévoyaient des délais plus courts que la nouvelle loi (quatre ans au lieu de
dix ans s'agissant du délai relatif, respectivement douze ans au lieu de quinze
ans s'agissant du délai absolu) et se révèlent ainsi plus favorables aux
contribuables, pour la période fiscale 1999-2000. S'agissant de la période
fiscale 2001-2002, ce se sont en revanche les dispositions de la nouvelle LI
qui doivent être appliquées.

aaa) En l'espèce et comme déjà relevé
ci-dessus, le rappel d'impôt pour la période 1999-2000 est annulé compte
tenu du fait que la prescription absolue du droit de taxer a été atteinte en
cours de procédure - il en va de même au demeurant de la prescription absolue
de la poursuite pénale, en application de l'art. 98a al. 4 aLI. Il
convient dès lors de réformer la décision sur réclamation attaquée sur ce
point, en ce sens que les amendes pour la période 1999-2000 sont annulées.

bbb) Quant à la période fiscale 2001-2002, elle n'a
pas fait l'objet d'une taxation définitive, de sorte que la prescription n'a
pas commencé à courir (art. 254 al. 1 let. a LI).

c) En définitive, il apparaît ainsi que, compte tenu
de la prescription, la décision sur réclamation attaquée doit être réformée en
ce sens que le rappel d'impôt et l'amende pour les périodes 1995-1996 et
1997-1998 sont annulés s'agissant de l'impôt fédéral direct, respectivement que
le rappel d'impôt et l'amende pour la période 1999-2000 sont annulés s'agissant
de l'impôt communal et cantonal.

4.                     
Dans leur recours du 5 janvier 2009, les recourants ont notamment fait
valoir que l'ACI avait statué alors que des pourparlers étaient en cours et
sans leur laisser la possibilité de motiver leur réclamation, en violation de
leur droit d'être entendus, et ont principalement conclu à l'annulation de la
décision sur réclamation attaquée - charge à l'autorité intimée de convenir
avec eux d'un délai raisonnable pour motiver leur réclamation. Les intéressés
ont expressément maintenu cette conclusion principale dans leur écriture (non
datée) parvenue au tribunal le 4 décembre 2012; dans leur écriture du 25 mars
2014, ils ont encore indiqué, sous la plume de leur nouveau conseil, qu'ils
confirmaient "les conclusions prises au pied de leur recours".

Il s'impose de constater que cette conclusion
principale est identique à celle prise par C.________ dans le cadre de son
recours contre la décision sur réclamation la concernant, étant pour le reste
précisé que les procédures respectives devant l'ACI se sont déroulées en
parallèle et de façon similaire. Dans l'arrêt FI.2009.0001 du 4 août 2010, la
cour de céans a retenu en particulier ce qui suit sur ce point (consid. 4):

            "a) Tel qu’il est
garanti par l’art. 29 al. 2 Cst., le droit d’être entendu comprend le droit
pour l’intéressé de s’expliquer avant qu’une décision ne soit prise à son
détriment, celui de fournir des preuves quant aux faits de nature à influer sur
le sort de la décision, celui d’avoir accès au dossier, de participer à
l’administration des preuves essentielles et de se déterminer sur son résultat
lorsque cela est de nature à influer sur la décision à rendre (ATF 129 II 497
consid. 2.2 p. 504; 126 I 15; 124 I 49 et les réf. cit.). En outre, pour autant
qu’elle ne soit pas d’une gravité particulière, une violation du droit d’être
entendu en instance inférieure est réparée lorsque l’intéressé a eu la faculté
de se faire entendre en instance supérieure par une autorité disposant d’un
plein pouvoir d’examen en fait et en droit (ATF 130 II 530 consid. 7.3 p. 562;
127 V 431 consid. 3d/aa pp. 437 s.; 126 V 130 consid. 2b pp. 131 s. et les
arrêts cités).

            Aux termes de l'art.
132 al. 1 LIFD, le contribuable peut adresser à l'autorité de taxation une
réclamation écrite contre la décision de taxation dans les trente jours qui
suivent sa notification. En matière d'impôt cantonal et commune, les art. 185
et 186 LI prévoient la même chose. Dès lors que la décision de taxation ne doit
pas contenir une motivation, mais simplement indiquer les modifications
apportées à la déclaration, il n'est pas exigé que la réclamation, qui doit
néanmoins être formulée par écrit, soit motivée, sous réserve du cas
particulier de la taxation d'office. Il suffit donc que le réclamant exprime –
au moins implicitement – sa volonté d'attaquer la décision. Cela n'empêche pas
que l'on puisse attendre du réclamant qu'il exprime, au cours de la procédure
de réclamation, quels sont les points contestés et les griefs soulevés à
l'encontre de la décision litigieuse (CR, op. cit., Casanova, n. 18 ad. art.
120 LIFD).

            b) En l'espèce, il
convient tout d'abord de relever que la motivation d'une réclamation n'est pas
une condition de forme de sa recevabilité. Comme corollaire, on doit admettre
qu'être en présence d'une réclamation écrite sans motivation ne signifie pas
encore une violation du droit d'être entendu. Dès lors, dans l'absolu,
l'autorité intimée était en droit de statuer sur la réclamation sans disposer
d'une motivation écrite de celle-ci, si la recourante avait auparavant pu
exposer son point de vue de telle manière à ce que son droit d'être entendu
soit respecté. Et l'occurrence, tel est bien le cas. En effet, la recourante,
dans le cadre de la procédure de réclamation, s'est entretenue avec l'autorité
intimée, dans l'espoir de trouver une solution transactionnelle au litige les
opposant. Il ne fait pas doute que, lors de cet entretien, elle a pu exposer
son point de vue et motiver sa réclamation. Il est évident que sans expliciter
les motivations d'une réclamation, on ne peut tenter une transaction. Par
ailleurs, durant la procédure d'enquête pour soustraction, ainsi que pendant la
période des mesures spéciales entreprises par l'AFC, la recourante a, à de
nombreuses reprises, eu l'occasion de s'exprimer sur les griefs soulevés à son
encontre. En particulier, elle a été auditionnée à trois reprises par l'AFC et
l'ACI. Enfin, et bien qu'un tel droit lui ait été donné, elle a renoncé à se
déterminer sur la rapport de l'AFC, rapport sur lequel l'ACI s'est ensuite basé
pour rendre sa décision du 11 octobre 2007. En conséquence, le droit d'être
entendu de la recourante a été largement respecté dans la cadre de la procédure
de première instance et aucune violation à cet égard ne peut être constatée, de
sorte que, mal fondé, ce premier grief doit être rejeté.

            On relèvera en outre
que, de toute manière, même si une telle violation avait dû être constatée,
elle aurait pu être réparée en deuxième instance, la cours de céans disposant
d'un plein pouvoir d'examen en fait et en droit."

Dans l'arrêt 2C_724/2010 et 2C_796/2010 du 27
juillet 2011, le Tribunal fédéral a confirmé le rejet de ce grief, exposant en
particulier ce qui suit (consid. 4.2):

"[…] la recourante a eu tout loisir de déposer une motivation,
déjà au moment de sa réclamation en novembre 2007, puis dans le délai imparti
au 31 janvier 2008. C'est elle-même qui y a renoncé et a proposé de suspendre
ce délai dans l'attente d'un éventuel accord entre les parties. Après l'échec
de la transaction en avril 2008, il lui appartenait donc de présenter une
motivation ou à tout le moins de demander à l'autorité fiscale un nouveau délai
pour ce faire, étant rappelé qu'une motivation n'est pas exigée en procédure de
réclamation […]. La recourante n'a rien
fait, alors que la décision sur réclamation n'a pourtant été rendue que huit
mois plus tard. En pareilles circonstances, son reproche aux autorités d'avoir
été empêchée de faire valoir ses droits confine à la témérité. Le grief doit
donc être rejeté, sans qu'il y ait au surplus lieu d'examiner si la procédure
devant le Tribunal cantonal aurait un effet guérisseur, ce que conteste la
recourante."  

Le tribunal ne voit aucun motif de s'écarter de ces
considérants dans le cas d'espèce, en ce sens en substance qu'il convient de
retenir que les recourants ont eu l'occasion d'exposer leur point de vue dans
le cadre notamment des échanges avec l'autorité intimée en vue d'une éventuelle
conciliation, et qu'il leur appartenait le cas échéant, après l'échec de cette
conciliation, de déposer spontanément la motivation de leur réclamation - ou à
tout le moins de requérir l'octroi d'un délai pour ce faire. En l'absence de violation
de leur droit d'être entendus dans le cadre de la procédure devant l'autorité inférieure,
leur grief sur ce point doit en conséquence être rejeté. 

5.                     
Dans leur dernière écriture du 12 mai 2014, les recourants ont par ailleurs
requis que quatre personnes soient interpellées par la cour de céans en vue de
l'établissement de déclarations écrites, subsidiairement qu'elles soient convoquées
à une audience en tant que de témoins. Ils ont en outre maintenu leur requête
tendant à ce qu'une copie de la dénonciation ayant donné lieu à l'enquête de la
DEF soit versée au dossier, ainsi que leur requête tendant à la mise en œuvre
d'une expertise judiciaire.

a) Comme rappelé au consid. 4a de l'arrêt
FI.2009.0001 du 4 août 2010 reproduit ci-dessus, le droit d'être entendu, tel
qu'il est garanti par l'art. 29 al. 2 Cst., comprend notamment le droit pour
l'intéressé de prendre connaissance du dossier, de s'exprimer sur les éléments
pertinents avant qu'une décision ne soit prise touchant sa situation juridique,
de produire des preuves pertinentes, d'obtenir qu'il soit donné suite à ses
offres de preuves pertinentes, de participer à l'administration des preuves
essentielles ou à tout le moins de s'exprimer sur son résultat, lorsque cela
est de nature à influer sur la décision à rendre (ATF 137 II 266 consid. 3.2).

La cour de céans établit les faits d'office (art. 28
al. 1 LPA-VD). Elle peut recourir à différents moyens de preuve (art. 29 al. 1
LPA-VD), notamment à des expertises (let. c), à des renseignements fournis par
les parties, des autorités ou des tiers (let. e) et à des témoignages (let. f).
Aux termes de l'art. 34 LPA-VD, les parties participent à l'administration des
preuves (al. 1), et peuvent en particulier présenter des offres de preuve (al.
2 let. d). L'autorité n'est toutefois pas liée par les offres de preuve
formulées par les parties (art. 28 al. 2 LPA-VD; cf. ég. art. 34 al. 3 LPA-VD,
dont il résulte que l'autorité doit administrer les preuves requises, si ces
moyens n'apparaissent pas d'emblée dénués de pertinence); de jurisprudence
constante en effet, le droit d'être entendu n'empêche pas l'autorité de mettre
un terme à l'instruction lorsque les preuves administrées lui ont permis de
former sa conviction et que, procédant d'une manière non arbitraire à une
appréciation anticipée des preuves qui lui sont encore proposées, elle a la
certitude que ces dernières ne pourraient l'amener à modifier son opinion (ATF
130 II 425 consid. 2.1 et les références; TF, arrêt 2C_937/2013 et 2C_938/2013
du 6 juin 2014 consid. 2.1).

b) En l'espèce, les recourants ont requis l'établissement
d'une déclaration écrite, subsidiairement l'audition en qualité de témoin, du
beau-frère d'A. X.________, ancien directeur de C.________ et qui serait à
l'origine de leur dénonciation auprès des autorités fiscales; ils ont également
requis qu'une copie de la dénonciation en cause soit versée au dossier, estimant
que les "nombreuses contre-vérités" alléguées par l'intéressé avaient
"dû orienter l'opinion initiale" des autorités fiscales. Cela étant,
il importe peu, en définitive, de savoir sur quelle base a été décidée l'ouverture
d'un contrôle fiscal - est bien plutôt seul déterminant le résultat de l'enquête
à laquelle il a été procédé; le bien-fondé des reprises et amendes litigieuses
doit ainsi être apprécié en fonction de l'ensemble des circonstances, étant
précisé que ni la DEF ni l'autorité intimée ne se réfèrent dans ce cadre à des
allégations du beau-frère d'A. X.________. Quant aux autres points sur lesquels
les recourants souhaitaient que ce dernier soit interpellé respectivement
entendu (en particulier la propriété intellectuelle des logiciels
informatiques, ou encore l'utilisation professionnelle des avions), le tribunal
s'estime d'ores et déjà suffisamment renseigné sur la base du dossier tel que
constitué, respectivement considère, par appréciation anticipée, que les
déclarations de l'intéressé ne sauraient remettre en cause la conviction qu'il
s'est forgée sur cette base.

Les recourants ont également requis l'établissement
de déclarations écrites, subsidiairement l'audition en qualité de témoin, d'un
collaborateur de la DEF, afin que celui-ci soit entendu notamment sur la
manière dont ont été obtenues les coordonnées bancaires des sociétés ou encore
les informations utilisées dans la demande de levée des scellés auprès du
Tribunal fédéral. Il convient de relever à cet égard que le rapport établi le
21 septembre 2006 par la DEF contient un chapitre consacré aux "actes
d'enquête" (ch. 2), avec des indications relativement précises tant
s'agissant des perquisitions (ch. 2.2) que s'agissant de la levée des scellés
sur les papiers séquestrés (ch. 2.3.2; cf. ég. ch. 2.5.2 concernant la demande
d'édition d'actes); il en résulte en particulier que les recourants ont formé
opposition aux perquisitions et que le Tribunal fédéral a admis, sous réserve
de quelques documents, la demande de levée des scellés présentée par l'AFC. Cela
étant, il n'apparaît pas pour le reste que les précisions demandées par les
recourants seraient de nature à avoir une quelconque incidence sur l'issue du
litige.

Les recourants ont encore requis l'établissement de
déclarations écrites, subsidiairement l'audition en qualité de témoins, de deux
collaborateurs de l'ACI, en lien notamment avec les résultats de contrôles
fiscaux de C.________ réalisés en 2000 et 2002, avec de prétendues menaces de
la part d'un collaborateur de la DEF afin qu'A. X.________ accepte un
arrangement fiscal ou encore avec les motifs pour lesquels il n'aurait jamais
été répondu à une proposition transactionnelle faite par leur conseil le 1er
avril 2008. Sur ces points également, le tribunal ne voit pas en quoi des
déclarations écrites ou l'audition des intéressés seraient de nature, au stade
actuel de la procédure, à avoir une quelconque incidence sur l'issue du litige.

S'agissant enfin de la requête des recourants
tendant à ce que soit ordonnée une expertise judiciaire "destinée à faire
valider les constatations des nombreuses expertises privées versées au dossier",
il convient de rappeler qu'une expertise privée n'a, sur le plan procédural,
que valeur de simple allégué (cf. TF, arrêt 2C_802/2011 du 22 mars 2012 consid.
4.1 et la référence). Cela étant et comme on le verra plus en détail ci-après, il
n'apparaît pas que la teneur des différentes expertises privées produites par
les intéressés dans le cas d'espèce serait de nature à remettre en cause le
bien-fondé des reprises litigieuses, respectivement qu'il se justifierait de ce
chef d'ordonner l'expertise judiciaire requise.

c) En définitive, le tribunal considère ainsi, par
appréciation anticipée, que les différentes preuves qui lui sont encore
proposées par les recourants ne seraient pas de nature à modifier la conviction
qu'il s'est formée sur la base des éléments au dossier tel que constitué, de
sorte que les requêtes respectives des intéressés tendant à la mise en œuvre de
mesures d'instruction complémentaires doivent être rejetées.

6.                     
Avant d'examiner le bien-fondé des reprises litigieuses, il convient de
rappeler le cadre légal applicable, étant précisé qu'en matière d'impôt
cantonal et communal, seule doit être prise en considération la période
2001-2002 en regard des dispositions de la nouvelle LI - le droit de taxer la
période antérieure étant prescrit, comme on l'a vu ci-dessus (cf. consid.
3a/bb/aaa). 

a) En droit fiscal suisse, le
bénéfice imposable des sociétés anonymes se détermine d'après le solde du
compte de résultats (art. 58 al. 1 let. a LIFD; art. 94 al. 1 

let. a LI). A ce solde sont ajoutés tous les prélèvements opérés avant le
calcul de celui-ci, qui ne servent pas à couvrir des frais généraux justifiées
par l'usage commercial (art. 58 al. 1 let. b LIFD; art. 94 al. 1 let. b LI).

Parmi les prélèvements opérés avant le calcul du
solde du compte de résultats figurent les "les distributions ouvertes ou
dissimulées de bénéfice et les avantages procurés à des tiers qui ne sont pas
justifiés par l'usage commercial" (art. 58 al. 1 let. b, 5ème
tiret, LIFD; art. 94 al. 1 let. b, 5ème tiret, LI). Selon la
jurisprudence, il y a distribution dissimulée de bénéfice lorsque les quatre
conditions cumulatives suivantes sont remplies: 1) la société fait une
prestation sans obtenir de contre-prestation correspondante; 2) cette
prestation est accordée à un actionnaire ou à une personne le ou la touchant de
près; 3) elle n'aurait pas été accordée dans de telles conditions à un tiers;
4) la disproportion entre la prestation et la contre-prestation est manifeste
de telle sorte que les organes de la société auraient pu se rendre compte de
l'avantage qu'ils accordaient (ATF 131 II 593 consid. 5; ATF 119 Ib 116 consid.
2; TF, arrêt 2C_708/2012 du 21 décembre 2012 consid. 4.3, non publié in
ATF 139 I 64). 

Les prestations appréciables en argent
faites aux actionnaires doivent être reprises aussi bien dans la société que
chez l'actionnaire bénéficiaire, car celui-ci est présumé avoir perçu ces
montants à titre de dividende dissimulé; il s'agit d'une conséquence de la
distinction, sur le plan fiscal comme sur le plan civil, entre la société et
ses actionnaires, qui conduit à une double imposition économique (arrêt
FI.2009.0005 du 18 mai 2011 consid. 3a et les références).

b) La procédure de taxation est régie
par la maxime inquisitoriale (ATF 92 I 253 consid. 2). Cette maxime est
également applicable dans le cadre de la procédure de recours en matière
fiscale, à défaut d'une disposition contraire de la loi fiscale 

(cf. art. 142 al. 4 LIFD; art. 199 LI et 28 al. 1 LPA-VD; TF, arrêt 2P.215/2002
et 2A.479/2002 du 7 avril 2003 consid. 4.1). 

L'autorité doit vérifier la
déclaration (cf. art. 123 et 126 LIFD; art. 172 et 176 LI). Elle doit
déterminer d'office tous les éléments pertinents en vue de la taxation, même en
cas de violation de son obligation de coopérer par le contribuable. Il
appartient ainsi à l'autorité d'établir les faits qui fondent la créance
d'impôt ou qui augmentent la taxation, tandis que le contribuable doit prouver
les faits qui diminuent la dette ou la suppriment (ATF 133 II 153 consid. 4.3;
121 II 257 consid. 4c/aa). Quand des indices clairs et précis rendent
vraisemblable l'état de fait établi par l'autorité, il revient ensuite au
contribuable de réfuter, preuves à l'appui, les faits avancés par celle-ci; les
parties ont en effet l'obligation de collaborer à l'établissement de la
taxation (art. 126 al. 1 LIFD et 176 al. 1 LI), et ce également dans le cadre
de la procédure de rappel d’impôt (cf. art. 153 al. 3 LIFD et 209 al. 3 LI; TF,
arrêt 2C_239/2013 et 2C_240/2013 du 27 mai 2014 consid. 5.1). La justification
commerciale des dépenses revendiquées en déduction d’une recette doit en
conséquence être établie par le contribuable; ce principe est issu de l'art. 8 CC,
selon lequel chaque partie doit alléguer et prouver les faits dont elle entend
déduire son droit (cf. TF, arrêt 2C_1081/2013 et 2C_1164/2013 du 2 juin
2014 consid. 5.5 et les références). 

Le fisc et le contribuable sont donc
tenus de collaborer dans l'administration des preuves, soit en précisant les
allégations qu'il appartient à la partie chargée de la preuve de détruire, soit
en apportant des preuves ou indices positifs contraires; l'omission ou l'échec
de ces preuves contraires peut être considéré comme un indice suffisant de la
véracité des allégations de la partie adverse si celles-ci sont vraisemblables.
L'autorité de recours apprécie les preuves apportées par les parties avec un
large pouvoir d'appréciation (ATF 120 Ia 31 consid. 4b et les références; TF,
arrêt 2P.185/2006 et 2A.429/2006 du 27 novembre 2006 consid. 8.1; arrêt
FI.2009.0005 précité, consid. 3b).

7.                     
En l'espèce, il convient en premier lieu d'examiner,
parmi les reprises litigieuses, les "prestations appréciables en argent
obtenues de C.________ SA" 

(qui comprend les "frais de sous-traitance non probants", les "frais
relatifs à un aéronef non justifiés commercialement" et le "chiffre
d'affaires non comptabilisé" de G.________; s'agissant de la systématique
des reprises, cf. la décision sur réclamation attaquée en partie reproduite
sous let. L supra). Les reprises concernées ont en effet d'ores et déjà
fait l'objet d'un examen par la cour de céans, respectivement par la Tribunal fédéral, dans le cadre du recours formé par C.________ contre la décision sur
réclamation la concernant, et ont été confirmées (sous réserve des périodes
atteintes par la prescription; cf. let. N supra); il convient toutefois
d'apprécier si et dans quelle mesure les pièces produites postérieurement par les
recourants et les allégations de ces derniers sont de nature à remettre en
cause le bien-fondé de ces reprises.

a) La première des reprises relevant
des "prestations appréciables en argent obtenues de C.________ SA"
porte sur les "frais de sous-traitance non probants". 

aa) A cet égard, la cour de céans a
retenu en particulier ce qui suit dans l'arrêt FI.2009.0001 du 4 août 2010
(consid. 6.1.1):

            "6.1.1.1)
Sous ce poste, l'ACI a repris le deux tiers des montants inscrits dans le
compte no 4460 intitulé «
sous-traitant » de C.________ de 1995
à 2002. Ce compte correspond aux factures émises par D.________ à l'égard de
C.________ pour les prestations qu'elle aurait effectuées pour elle durant les
années 1995 à 2002. 

            Ce
compte 4460 présentait les montants suivants:

	
  1995

  	
  1996

  	
  1997

  	
  1998

  	
  1999

  	
  2000

  	
  2001

  	
  2002

  
	
  486'100 fr.

  	
  660'000 fr.

  	
  1'022'424 fr. 60

  	
  1'172'000 USD

  	
  470'000 USD

  	
  434'794 fr. 50

  	
  870'173 fr.

  	
  709'086 fr.

  

 

            6.1.1.2)
L'ACI a repris deux tiers de ces montants au motif en substance que la
facturation de ces frais de sous-traitant « était fictive et avait pour but de permettre à l'actionnaire ultime du
groupe de prélever des liquidités sur les comptes de C.________ et de créditer
ces montants sur des comptes dont il était l'ayant droit économique. »

            Selon
l'ACI, la facturation de D.________ comportait deux volets. Un premier volet,
non contesté, correspondant aux coûts de fonctionnement de D.________ et qui
étaient facturés mensuellement à C.________ qui les payait par virement bancaire.
Ce chiffre d'affaires de D.________ était comptabilisé dans le compte de charge
de C.________ sous un poste 3000 intitulé « Fournitures ». Le deuxième
volet a trait au compte 4460 précité. Sous ce compte, C.________ comptabilisait
des factures de D.________, établies a posteriori, mais qui ne figuraient pas
en tant que recettes dans les comptes de D.________. Le montant des factures était
bien prélevé du compte de C.________, mais en espèce ou sous forme de chèque,
et n'était pas versé à D.________. L'ACI a résumé de la manière suivante le
système de prélèvement de ces montants:

« a) comptabilisation de
factures fictives (par tranche variant de CHF 100’000.- à CHF 400’000.-).

Ecriture de type “frais de sous-traitance à c/c D.________”.

b) Prélèvement en espèces de fonds sur les comptes bancaires en vue du
règlement de ces factures contre remise d’une quittance fictive soi-disant
établie par D.________ (système pratiqué jusqu’en 2000)

Ecriture de type “c/c D.________ à liquidités”

c) Dès 2000, une étape supplémentaire est ajoutée pour C.________ SA, 

M. X.________ se substituant à C.________ SA à l’égard de D.________ en
reprenant à son nom et en partie les dettes correspondantes inscrites au bilan
de la société suisse.

Ecriture de type “c/c D.________ à c/c actionnaire”

d) L’actionnaire prélève les fonds en espèces sur les comptes bancaires
de C.________. 

Ecriture de type “c/c actionnaire à liquidités ».

            Dès lors
que D.________ n'avait pas enregistré de recettes, l'ACI a cherché à connaître
la destination de ces fonds sortis des comptes de C.________. Selon l'ACI,
seule une partie de la version d'A. X.________ sur ce point est correcte en ce
sens qu'une part de ces fonds, évaluée à un tiers par l'ACI, a servi à payer
les employés roumains de D.________ au noir. Quant à l'autre partie, l'ACI a
déterminé que, contrairement à ce qu'a soutenu A. X.________, soit que ces
fonds servaient pour le roulement du groupe, ils avaient en réalité été versés
sur des comptes bancaires dont le seul ayant droit économique était A.
X.________, ce qui démontrait que ces charges n'étaient pas justifiées
commercialement.

            6.1.1.3)
La recourante conteste ce point de vue à plusieurs titres:

            Tout
d'abord, elle considère que l'ACI a effectué sa reprise de deux tiers précitée
en se fondant sur l'hypothèse que les droits de propriété intellectuelle sur
les logiciels commercialisés par le groupe C.________ appartiennent à
C.________. Or, selon elle, cette hypothèse est fausse. Elle appuie son
raisonnement sur un avis de droit qu'elle avait requis de M. C.C.________,
professeur en droit à l'Université de Lausanne, en 2004. On peut en extraire
les passages suivants:

« I. Faits

Les faits qui m’ont été exposés sont les suivants.

A. M. X.________, citoyen roumain, et vivant en Suisse depuis les
années 80, a eu l’idée d’une plate-forme et de logiciels notamment pour le
traitement d’ordres en bourse et d’autres opérations au moyen d’une plate-forme
utilisée par des courtiers.

B. Au début des années 90, les sociétés C.________ (ci-après C.________),
à 1********, et C.________ Roumanie (ci-après D.________) ont été constituées.

C. D.________ s’est chargée du développement des logiciels, avec un
personnel assez nombreux en Roumanie (40 personnes aujourd’hui). C.________ se
chargeait du contact avec la clientèle et du marketing. Il s’agit d’une petite
société qui n’emploie que quelques employés.

D. Une société de droit du Liechtenstein, C.________, (ci-après
G.________) a été constituée en 1999.

E. Suite à la constitution de G.________, le marketing à l’échelon
international a été fait par l’entremise de celle société. En revanche, le
développement informatique s’est poursuivi chez D._