kuigi kasvuhoonegaaside saastekvootidega kauplemise süsteemi võib pooldada seetõttu et atmosfääris toimuvad ja kliimat mõjutada võivad keemilised muutused panevad muretsema (ettevaatuspõhimõte) ning seetõttu et fossiilkütuseid on piiratud hulgal ja neid kasutatakse ebamõistlikult on süsteemil siiski kahtlusi tekitavaid külgi