kontrollikoda kontrollib alati ainult jooksva aasta eelarve täitmist ja seepärast kaasnevad sellega metoodikaprobleemid sest regionaalpoliitika raames kohaldatakse kolmandat auditeerimistasandit samas kui kontrollikoja igaaastane audit toimub juba esimesel auditeerimistasandil ja seetõttu on siin alati suurem veamäär kui programmitsükli lõpus mida saame juba tõestada