ইনজুরি থেকে ফিরে আর্সেনালের বিপক্ষে প্রথম মাঠে নামেন আগুয়েরো
সেপ্টেম্বর ফুলহ্যামের বিপক্ষে আগুয়েরো মৌসুমে তার প্রথম গোল করেন
খেলায় ম্যানচেস্টার সিটি ব্যবধানে জয় লাভ করে
অক্টোবর সান্ডারল্যান্ডের বিপক্ষে সিটির ব্যবধানে জয়ের খেলায়ও তিনি একটি গোল করেন
এরপর তিনি গোল করেন নভেম্বর টটেনহামের বিপক্ষে সিটির গোলে জয়ের খেলায়
পরের সপ্তাহে অ্যাস্টন ভিলার বিপক্ষে তিনি জোড়া গোল করেন খেলায় সিটি গোলের ব্যবধানে জয় লাভ করে
এছাড়া আগুয়েরো ঘরের মাঠে চ্যাম্পিয়নস লিগের খেলায় আয়াক্স এবং রিয়াল মাদ্রিদের বিপক্ষেও গোল করেন
এরপর তিনি গোল করেন ডিসেম্বর নিউকাসল ইউনাইটেডের বিপক্ষে খেলায় সিটি গোলের ব্যবধানে জয় লাভ করে
ডিসেম্বর নরউইচের বিপক্ষে সিটির গোলে জয়ের খেলায়ও তিনি গোল করেন
সালের জানুয়ারি স্টোক সিটির বিপক্ষে পেনাল্টি থেকে একটি গোল দেওয়ার পর খেলার তম মিনিটে হ্যামস্ট্রিং ইনজুরিতে আক্রান্ত হন আগুয়েরো
জানুয়ারি ইনজুরি থেকে ফিরে ফুলহামের বিপক্ষে খেলার তম মিনিটে বদলি হিসেবে মাঠে নামেন আগুয়েরো
ফেব্রুয়ারি লিভারপুলের বিপক্ষে তিনি সমতাসূচক গোল করেন
ফেব্রুয়ারি এফএ কাপে লিডস ইউনাইটেডের বিপক্ষে খেলায় তিনি জোড়া গোল করেন
খেলায় সিটি গোলের ব্যবধানে জয় লাভ করে
ফেব্রুয়ারি চেলসির বিপক্ষে গোলে জয়ের খেলায় হাঁটুর ইনজুরিতে আক্রান্ত হন আগুয়েরো
এই ইনজুরি কারণে ফিফা বিশ্বকাপ বাছাইপর্বের বলিভিয়া এবং ইকুয়েডরের বিপক্ষে খেলায় আর্জেন্টিনা দল থেকে বাদ পড়েন তিনি
মার্চ ইনজুরি থেকে ফিরে নিউকাসলের বিপক্ষে উষ্ণ অভ্যর্থনার সাথে বদলি হিসেবে মাঠে নামেন তিনি
খেলায় সিটি গোলের ব্যবধানে জয় লাভ করে
এপ্রিল ম্যানচেস্টার ডার্বিতে খেলার তম মিনিটে সামির নাসরির বদলি হিসেবে নামেন আগুয়েরো
তম মিনিটে তার একমাত্র গোলেই জয়ের দেখা পায় ম্যানচেস্টার সিটি
এপ্রিল চেলসির বিপক্ষে এফএ কাপের সেমিফাইনালে হেডে গোল করে দলকে ফাইনালে পৌছাতে সাহায্য করেন আগুয়েরো
খেলার তম মিনিটে তিনি ডেভিড লুইজকে দুই পায়ে অত্যন্ত বাজেভাবে ট্যাকল করেন এর আগে অবশ্য লুইজও তাকে ট্যাকল করেছিলেন
এই ঘটনা সত্ত্বেও তাকে লাল কার্ড দেখানো হয়নি
বরং এফএ ঘোষণা করে যে আগুয়েরোকে কোনো প্রকার শাস্তি প্রদান করা হবেনা যেহেতু রেফারি ক্রিস ফয় ঘটনাটির অন্তত কোনো অংশ প্রত্যক্ষ করেছেন এবং সে অনুযায়ী খেলা চলাকালে তার দায়িত্বও পালন করেছেন
তবে অনেকেই এই সিদ্ধান্ত মেনে নিতে পারেননি এবং তারা মনে করেন যে এফএ এক্ষেত্রে ব্যর্থ হয়েছে
এপ্রিল আগুয়েরো প্রকাশ করেন যে তিনি লুইজের কাছে তার ঐ কাজের জন্য ক্ষমা চেয়েছেন
এপ্রিল উইগানের বিপক্ষে খেলার সময় হ্যামস্ট্রিংএ টান অনুভব করেন আগুয়েরো ফলে প্রথমার্ধ্ব শেষে তাকে উঠিয়ে নেওয়া হয়
এপ্রিল টটেনহামের বিপক্ষে সিটি গোলের ব্যবধানে পরাজিত হয় সে খেলায় তিনি অব্যবহৃত বদলি খেলোয়াড় হিসেবে ছিলেন
আগুয়েরো মৌসুমে তার শেষ গোল করেন রিডিংএর বিপক্ষে সে খেলায় ম্যানচেস্টার সিটি গোলের ব্যবধানে জয় লাভ করে
ইংরেজ সংবাদ মাধ্যম দাবী করে যে গ্রীষ্মকালীন স্থানান্তর মৌসুমে স্পেনীয় ফুটবল ক্লাব রিয়াল মাদ্রিদের মূল লক্ষ্য ছিলেন আগুয়েরো
কিন্তু আগুয়েরো বলেন যে আমি সিটিতে খুবই সুখী এবং আমি এখানে অনেক প্রশংসা ও ভালোবাসা পেয়ে থাকি যা আমার কাছে অনেক কিছু
ম্যানচেস্টার সিটির প্রধান নির্বাহী ফেরান সরিয়ানো স্থানান্তরের পরিকল্পনা অস্বীকার করেন এবং বলেন যে আগুয়েরো সিটিতেই থাকবেন
কিন্তু আর্জেন্টিনীয় কিংবদন্তী দিয়েগো মারাদোনা তাকে রিয়াল মাদ্রিদে যোগ দেওয়ার জন্য উত্সাহিত করেন
কারণ তিনি মনে করেন আগুয়েরোর উপস্থিতিতে ক্রিস্তিয়ানো রোনালদো আরও বেশি কিছু করতে পারবেন
সালের মে আগুয়েরো ম্যানচেস্টার সিটির সাথে তার চুক্তির মেয়াদ আরও এক বছর বাড়িয়ে নেন সাল পর্যন্ত
সালের মে আগুয়েরো ম্যানচেস্টার সিটির কাছে তার প্রতিশ্রুতির কথা বিবৃত করে বলেন আমি ম্যানচেস্টার সিটির কাছে প্রতিজ্ঞাবদ্ধ এটি একটি মহান ক্লাব
হাঁটুর ইনজুরির কারণে ক্লাবের হয়ে প্রাকমৌসুমের কোনো খেলাতেই মাঠে নামতে পারেননি আগুয়েরো
ইনজুরি থেকে ফিরে মৌসুমের প্রথম খেলায় নিউকাসলের বিপক্ষে তিনি একটি গোল করেন
খেলায় ম্যানচেস্টার সিটি গোলের ব্যবধানে জয় লাভ করে
ম্যানচেস্টার ডার্বিতে ম্যানচেস্টার ইউনাইটেডের বিপক্ষে তিনি জোড়া গোল করেন এবং দলকে গোলের ব্যবধানে জয় এনে দেন
এভারটনের বিপক্ষে খেলায় তিনি একটি গোল করেন এবং দলকে গোলের ব্যবধানে জয় এনে দেন
অক্টোবর ওয়েস্ট হ্যামের বিপক্ষে তিনি ম্যান অফ দ্য ম্যাচ নির্বাচিত হন
খেলায় তিনি জোড়া গোল করেন এবং দাভিদ সিলভার গোলে সহায়তা করেন এবং সিটিকে গোলের ব্যবধানে জয় এনে দেন
অক্টোবর চ্যাম্পিয়নস লীগে সিএসকেএ মস্কোর বিপক্ষেও তিনি জোড়া গোল করেন
খেলায় ম্যানচেস্টার সিটি গোলের ব্যবধানে জয় লাভ করে
অক্টোবর তিনি চেলসির বিপক্ষে গোল করেন অবশ্য খেলায় ম্যানচেস্টার সিটি গোলের ব্যবধানে পরাজিত হয়
এই প্রথমবারের মত প্রিমিয়ার লীগের কোন খেলায় আগুয়েরো গোল করার পরও ম্যানচেস্টার সিটি পরাজিত হয়
নভেম্বর নরউইচের বিপক্ষে তিনি একটি গোল করেন
খেলায় ম্যানচেস্টার সিটি গোলের বড় ব্যবধানে জয় লাভ করে
নভেম্বর চ্যাম্পিয়নস লীগে সিএসকেএ মস্কোর বিপক্ষে আগুয়েরো জোড়া গোল করেন এবং আলভারে নেগ্রেদোর একটি গোলে সহয়তা করেন
খেলায় সিটি গোলের ব্যবধানে জয় লাভ করে
ডিসেম্বর আর্সেনালের বিপক্ষে সিটির গোলে জয়ের খেলায় আগুয়েরো পায়ের ইনজুরিতে আক্রান্ত হন
এবং ধারণা করা হয় যে তাকে এক মাস মাঠের বাহিরে থাকতে হবে
সালের ডিসেম্বর ইনজুরি থেকে ফিরে এফএ কাপের খেলায় ব্ল্যাকবার্ন রোভার্সের বিপক্ষে বদলি হিসেবে মাঠে নামেন আগুয়েরো
খেলার তম মিনিটে মাঠে নেমে তম মিনিটেই একটি গোল করেন তিনি
সালের জানুয়ারী ওয়াটফোর্ডের বিপক্ষে এফএ কাপের খেলায় আগুয়েরো হ্যাট্রিক করেন এবং সিটিকে গোলের জয় এনে দেন
এটি তার সালের প্রথম হ্যাট্রিক
জানুয়ারী টটেনহাম হটস্পারের বিপক্ষে খেলায় আগুয়েরো পুনরায় হ্যামস্ট্রিং ইনজুরিতে আক্রান্ত হন
এই ইনজুরি তাকে এক মাস মাঠের বাহিরে রাখবে বলে ধারণা করা হয়
আর্জেন্টিনার সিনিয়র দলের হয়ে আগুয়েরোর অভিষেক হয় সালের সেপ্টেম্বর ব্রাজিলের বিপক্ষে একটি প্রীতি খেলায়
একজন টিনএজার হিসেবে তিনি আর্জেন্টিনার হয়ে ফিফা যুব চ্যাম্পিয়নশীপগুলোতেও অংশগ্রহন করেন
লিওনেল মেসি এবং ফেরন্যান্দো গ্যাগোর সাথে তিনি ফিফা যুব চ্যাম্পিয়নশীপ জিতেন
এছাড়া গ্রীষ্মকালীন অলিম্পিকেও তারা বিজয়ী হয়
দক্ষিণ আমেরিকান অনূর্ধ্ব চ্যাম্পিয়নশীপে অংশগ্রহন করার জন্য আর্জেন্টিনা অনূর্ধ্ব দলে ডাক পান আগুয়েরো
গ্রুপ পর্বের সবকয়টি খেলায়ই তিনি মাঠে নামেন
যুক্তরাষ্ট্র এবং ইকুয়েডরের বিপক্ষে খেলায় তিনি গোল করেন
কোয়ার্টার ফাইনালে পেরুর বিপক্ষে আর্জেন্টিনার হয়ে একমাত্র গোলটি করেন আগুয়েরো
কিন্তু সেমি ফাইনালে কলম্বিয়ার বিপক্ষে ব্যবধানে হেরে আর্জেন্টিনাকে প্রতিযোগিতা থেকে বিদায় নিতে হয়
কানাডায় অনুষ্ঠিত ফিফা অনূর্ধ্ব বিশ্বকাপের জন্য ঘোষিত আর্জেন্টিনা দলে জায়গা পান আগুয়েরো
গ্রুপ পর্বের দ্বিতীয় খেলায় পানামার বিপক্ষে তিনি জোড়া গোল করেন এবং তিনটি গোলে সহায়তা করেন
তৃতীয় খেলায় উত্তর কোরিয়ার বিপক্ষে তিনি ফ্রি কিক থেকে একটি গোল করেন
রাউন্ড অব এর খেলায় পোল্যান্ডের বিপক্ষে তিনি জোড়া গোল করেন এবং দলকে ব্যাবধানের জয় এনে দেন
আর্জেন্টিনা কোয়ার্টার ফাইনালে মেক্সিকো এবং সেমি ফাইনালে চিলিকে হারায়
ফাইনালে আর্জেন্টিনা মুখোমুখি হয় চেক রিপাবলিকের যাদের সাথে গ্রুপ পর্বে তারা গোলে ড্র করেছিল
আগুয়েরো খেলায় অধিনায়কের দায়িত্ব পালন করেন
খেলার তম মিনিটে আর্জেন্টিনার হয়ে সমতাসূচক গোল করেন আগুয়েরো
তম মিনিটে জারাতের গোলে ব্যবধানে জয় লাভ করে আর্জেন্টিনা
প্রতিযোগিতায় খেলায় গোল করে গোল্ডেন বুট জিতেন আগুয়েরো এবং প্রতিযোগিতার সেরা খেলোয়াড় হিসেবে গোল্ডেন বলের পুরস্কারও জিতেন তিনি
গ্রীষ্মকালীন অলিম্পিকে আর্জেন্টিনার স্কোয়াডের সদস্য ছিলেন আগুয়েরো
সেমি ফাইনালে ব্রাজিলের বিপক্ষে তিনি জোড়া গোল করেন এবং দলকে ব্যবধানের জয় এনে দেন
ফাইনালে নাইজেরিয়াকে হারিয়ে টানা দ্বিতীয়বারের মত অলিম্পিক ফুটবলে স্বর্ণপদক জেতে আর্জেন্টিনা
সালের বিশ্বকাপ ফুটবলে আর্জেন্টিনা দলে জায়গা পান আগুয়েরো
গ্রুপ পর্বের দ্বিতীয় খেলায় দক্ষিণ কোরিয়ার বিপক্ষে তার অভিষেক হয়
খেলার তম মিনিটে কার্লোস তেবেসের বদলি হিসেবে নামেন তিনি
খেলায় গঞ্জালো হিগুয়েইনের তৃতীয় গোলে তিনি সহায়তা করেন
আর্জেন্টিনা খেলায় ব্যবধানে জয়লাভ করে
তবে কোয়ার্টার ফাইনালে জার্মানির বিপক্ষে হেরে যাবার ফলে আর্জেন্টিনাকে প্রতিযোগিতা থেকে বিদায় নিতে হয়
কোপা আমেরিকায় আর্জেন্টিনা দলে ডাক পান আগুয়েরো
আর্জেন্টিনা গ্রুপ ভাগাভাগি করে কলম্বিয়া বলিভিয়া এবং কোস্টা রিকার সাথে সাথে
জুলাই গ্রুপ পর্বের প্রথম খেলায় তম মিনিটে ইজেকুয়েল ল্যাভেজ্জির বদলি হিসেবে মাঠে নামেন আগুয়েরো এবং তম মিনিটে আর্জেন্টিনার হয়ে সমতাসূচক গোল করেন
জুলাই কলম্বিয়ার বিপক্ষে খেলায় তম মিনিটে ল্যাভেজ্জির বদলি হিসেবে মাঠে নামেন তিনি
গ্রুপ পর্বে আর্জেন্টিনার তৃতীয় খেলায় কোস্টা রিকার বিপক্ষে আগুয়েরো জোড়া গোল করেন এবং দলকে ব্যবধানের জয় এনে দেন
ফলে আর্জেন্টিনা গ্রুপে দ্বিতীয় স্থানে থেকে কোয়ার্টার ফাইনালে পৌছায়
কিন্তু কোয়ার্টার ফাইনালে উরুগুয়ের বিপক্ষে পেনাল্টিতে ব্যবধানে হেরে প্রতিযোগিতা থেকে তাদের বিদায় নিতে হয়
তবে তাকে সম্পূর্ণরূপে একজন সেন্টার ফরোয়ার্ড হিসেবেও অ্যাখ্যায়িত করা হয়
তিনি একজন দ্বিতীয় স্ট্রাইকার হিসেবেও খেলতে পারেন
অ্যাটলেটিকো মাদ্রিদে থাকাকালে দিয়েগো ফরলানের সাথে তিনি প্রায়ই এই দায়িত্ব পালন করতেন