Corona-virus versprei: Via Duitsland en Singapoer na Italië - Nuus - 2021
Corona-virus versprei: Via Duitsland en Singapoer na Italië
SARS-CoV-2 het Italië via Duitsland en Singapoer bereik
Die wêreldwye verspreiding van die nuwe coronavirus SRAS-CoV-2 kan gerekonstrueer word op grond van die genetiese inligting wat versamel is, en 'n huidige data-ontleding toon hoe drie verskillende soorte SARS-CoV-2-virus vanaf China oor die hele wêreld migreer. Die virusse het Italië via Duitsland en Singapoer waarskynlik bereik.
'N Internasionale navorsingspan het die wêreldwye verspreiding van die nuwe korona-virus op grond van die sogenaamde "filogenetiese netwerkanalise", wat in argeologie gebruik word om die geskiedenis van die menslike stam te rekonstrueer, geanaliseer en sodoende belangrike nuwe insigte oor die verspreidingsweë en die sirkulerende virustipes verkry. Die virus het byvoorbeeld nie China direk vanaf Italië bereik nie, maar via Duitsland en Singapoer. Dit word ook duidelik dat ander virustipes in Europa en Amerika algemeen voorkom as in China.
Die navorsingsgroep rondom Dr. Michael Forster van die Instituut vir Kliniese Molekulêre Biologie (IKMB) van die Universiteits Mediese Sentrum Schleswig-Holstein (UKSH) en die Christian Albrechts Universiteit van Kiel (CAU) asook Dr. Peter Forster van die McDonald-instituut vir argeologiese navorsing aan die Universiteit van Cambridge het die GISAID-databasis ('Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data') gebruik vir haar navorsing, waarin wetenskaplikes die resultate geneties toets sedert die ontdekking van die nuwe SARS-CoV-2-virus Het die opeenvolging van die virus aangegaan.
GISAID databasis met genome van die virus
"Aan die begin van Maart 2020 bevat die GISAID-databasis (https://www.gisaid.org/) 'n samestelling van 253 volledige en gedeeltelike genome van die ernstige akute respiratoriese sindroom coronavirus 2 (SARS-CoV-2)," berig die Universiteitshospitaal Schleswig- Holstein. Onder hulle was 244 SARS-CoV-2, wat in mense geïsoleer was, nog nege van Chinese pangolien (pangolien), wat as 'n moontlike tussengasheer beskou word, en 'n genoom van die vlermuisspesie Rhinolophus affinis.
Voorgangers van die virus het reeds in die dierewêreld versprei
Dit het duidelik geword dat voorouers van die nuwe SARS-CoV-2-virus reeds in diere-gashere ontwikkel het voordat 'n mens vir die eerste keer besmet geraak het, berig die navorsingspan. Die vergelyking van die virusgenome het ook getoon dat, volgens die huidige kennis, 'n vlermuis-coronavirus die meeste ooreenstem met die menslike SARS-CoV-2. Die navorsers het ook 'n filogenetiese netwerkanalise, dit wil sê 'n ondersoek na die genetiese verwantskappe, uitgevoer in die eerste 160 volledige virusgenome uit menslike monsters, met verrassende resultate.
Drie sleutelvariante van die virus
Die navorsingspan het drie sleutelvariante van SARS-CoV-2 geïdentifiseer wat hulle A, B en C noem. Tipe A is die soortgelyk aan die nouverwante vlermuis-koronavirus en is dus waarskynlik die voorouer van alle menslike korona-virusse. "Dit is bevestig deur verdere vergelykings met twee verwante pangolien-koronavirus-stamme," het die navorsers berig. Interessant genoeg is die tipe B wat in Wuhan algemeen voorkom, nie die oorspronklike menslike virustipe nie. Tipe A, die oorspronklike genoom van die menslike virus, kom wel voor in Wuhan, maar tipe B is oorheersend.
Verskillende tipes virusse in Europa as in Oos-Asië
Terwyl die B-tipe van die virus die algemeenste in Oos-Asië voorkom, is die A- en C-tipes veral in die eerste fase van die koronavirus-uitbraak aangetref in diegene wat in Europa, Australië en Amerika geraak word, berig die navorsers. Die C-Type is onder meer vroeg in Singapoer gedokumenteer, en is dikwels in die eerste Europese gevalle van infeksie verteenwoordig.
Besmettingsroetes word presies opgespoor
Op grond van die filogenetiese netwerkanalise, kan die besmettingsroetes vir gedokumenteerde COVID-19-presies opgespoor word, en sodoende onduidelikhede uitgeskakel word. In die geval van infeksies in die noorde van Italië is daar byvoorbeeld aanvaar dat 'Patient One' besmet is deur 'n sekere kontakpersoon van Wuhan uit sy vriendekring. Hierdie kontakpersoon is egter negatief getoets en die soeke na die Italiaanse "pasiënt-nul" het in 'n doodloopstraat geëindig -' n effektiewe kwarantyn van moontlik besmette mense was onmoontlik.
Van Duitsland en Singapoer na Italië
Die nuwe data-ontleding verskaf nou inligting dat ten minste twee onafhanklike vroeë infeksie-roetes in Italië teenwoordig was. Die navorsers berig dat een hiervan gekoppel kan word aan die eerste bekende geval in Duitsland en die ander aan die uitbraak in die sogenaamde "Singapore tak".
Genomiese volgorde en filogenetiese netwerkanalise
In die toekoms kan filogenetiese naspeuring help om COVID-19-bronne van infeksie van onbekende oorsprong te identifiseer en dit te gebruik om die virus te bevat, sê die navorsingspan. Terselfdertyd onderstreep die resultate "die behoefte aan genomiese volgorde en die gebruik van die metode van filogenetiese netwerkanalise", benadruk Dr. Michael Forster. (FP)
Universiteit Mediese Sentrum Schleswig-Holstein: Opsporing van die genetiese oorsprong van die koronavirus (gepubliseer 9 April 2020), uksh.de
Peter Forster, Lucy Forster, Colin Renfrew, Michael Forster: Filogenetiese netwerkanalise van SARS-CoV-2 genome; in: PNAS (gepubliseer 04/08/2020), pnas.org