oorlede 4 September 2010 in Pretoria) was 'n Suid-Afrikaanse politikus van die Nasionale Party (NP), wat tussen 1968 en 1976 Minister van Waterwese en Bosbou was.
Hy het daarna vir die Nywerheidsontwikkelingskorporasie (N.O.K.) gewerk en in hierdie rol 'n sleutelrol gespeel in die stigting van die Tobacco and Industrial Conglomerate Rembrandt Group in 1948 deur Anton Rupert. In 1955 vestig hy hom as boer in Louis Trichardt en werk intensief aan besproeiingsboerdery.
In 1958 is Botha vir die eerste keer as kandidaat van die Nasionale Party (NP) as lid van die Nasionale Vergadering verkies, en het hy die Soutpansberg-kiesafdeling tot 1983 verteenwoordig. Daarna word hy voorsitter van die landegroep van die Nasionale Party en voorsitter van die Nasionale Party in die provinsie Transvaal. Hy het ook op die direksies van die dagblaaie Dagbreek en Die Vaderland gedien.
In die loop van 'n kabinetskommeling vervang Fanie Botha vir Marais Viljoen in 1976 as Minister van Arbeid. Terselfdertyd het hy Piet Koornhof in 1976 opgevolg as Minister van Mynwese en was hy ook verantwoordelik vir energie in hierdie rol. Aan die einde van die sogenaamde Muldergate-skandaal bedank die Minister van Inligting, Connie Mulder, wat as die belowendste opvolger van premier Vorster beskou is, saam met P.W. Botha en die minister van Buitelandse Sake, Pik Botha, onder die moontlike kandidate vir die pos van premier, maar uiteindelik neem P.W. Botha oor.