Die kerkgebou soos op die foto is 'n groot deel van die planne vir die struktuur deur ds. NJR Swart onderneem. Ds. Nicolaas Jacob Renier Swart was die eerste voltydse leraar van die Gereformeerde kerk wat in Pretoria gewoon het. Ds. Swart het reeds in die vorige paar jare met die bouwerk van die kerke in Potchefstroom en Rustenburg sy deel gedoen waar hy daar ook aangebied het om met die bouwerk te help. 'n Vernuftigheid wat hy al in Colesberg opgedoen het. Dieselfde ds. Swart het op 12 Januarie 1867 die ingebruikneming van die Gereformeerde kerk op Potchefstroom waargeneem.
Baie kort na ds. Swart se aankoms (Oktober 1866) is daar reeds planne beraam om 'n verbeterde kerkgebou op te rig. Reeds in Desember 1866 is die tender vir die bou van die kerk in die "Goeverments Courant" geplaas en het Johannes Arnoldi aangebied om die gebou op te rig. Die reghoekige kerk, wat hy sou bou, se struktuur was bekend in daardie tyd waar dit ook genoem is die "waenhuiskerk". Paul Kruger het dadelik sy hulp aangebied deur 125000 stene vir die kerkgebou te laat bak. Dit sou aanvanklik 'n langwerpige gebou wees met 'n staandak en gewels. Die ingang tot hierdie gebou het na die noorde gewys. Die preekstoel is teen die suidelike muur geplaas. In elk van die symure is drie vensters aangebring en die konsistorie is agter die kanselmuur gebou. Op 8 April 1867 was die bouwerk reeds so ver gevorder dat die hoeksteen op hierdie Maandag op uitnodiging deur die staatspresident MW Pretorius gele kon word. 6 Julie 1867 het Arnoldi 'n dringende skrywe tot die kerkraad gerig dat sy stene en brandhout onvoldoende is.
Gedurende 1868 sou die gebou voltooi word in die tyd wat ds. Swart vir 6 maande na Europa gegaan het. In die tyd van sy afwesigheid het die bouprogram 'n wending geneem deurdat Arnoldi voorgestel het deur twintig kamertjies langs die pastorie aan te bou. Alle kopers (huurders) van hierdie kamers moes lidmate van die Gereformeerde kerk van die ZAR wees. 'n Groot gedeelte van die persone aan wie die kamers toegeken was, was dieselfde mense wat reeds by die stigting van die Gereformeerde kerk in 1859 'n prominente rol kon vervul.
Die klassieke kerkbouvorms van protestantse kerkbou in Suid-Afrika word almal gesien in die verskeie kerkgeboue wat die gemeente gehad het sedert 1863.
Die laat 1870’s was ‘n moeisame tyd vir die gemeente, finansieel en geestelik. Swak kerkbywoning en swak offergawes was aan die orde van die dag. Onder die bediening van ds P. Postma sou sake binne kort bestek na sy ampsaanvaarding, in Julie 1882, regruk word, al het die lidmate se aanvanklike entoesiasme weer na die vergrote kerk gebou is, getaan.