Kingdom Hearts Magical Puzzle Clash is 'n arcade styl legkaart spel soortgelyk aan Bejeweled. Die speletjie begin met 'n klein plot opsomming van Kingdom Hearts 358/2 Days, sê wat as lede van die Organisasie, Roxas, Xion en Axel moet die Heartless verslaan en die vrylating van vasgelegde harte. Dan, die speler toegelaat word om te kies watter karakter te speel. Die doel van die speletjie is om te ruil twee teëls sodat daar 'n ry van ten minste drie, waarna die teëls verdwyn, en meer val bogemelde die speletjie Raad. Soos vuurhoutjies is gemaak, HP is geneem uit die Heartless.
By die dieselfde tyd, in 'n kleiner speletjie Raad, die Heartless maak sy beurt, wat ook handel skade en depletes HP van die karakter. Die spel sluit 'n krag-up vir elke karakter, asook teëls wat verteenwoordig magie uitspel wat gebruik kan word om die teenstander belemmer. Hierdie teëls kan slegs verkry word deur sodat hulle los aan die onderkant van die spel Raad. Daarbenewens, twee spesiale teëls laat toe vir volledige skoonmaak van teëls horisontaal en beide horisontaal en vertikaal. Soos die spel vorder, HP verhoog word vir beide die karakter en die opponerende Heartless. Daar is vyf wêrelde wat in gespeel kan word: Agrabah, Wonderland, Olympus Coliseum, Neverland en Beast se Kasteel. Elke wêreld het vyf vlakke, insluitend 'n finale baas vlak om voltooi die wêreld.
Roxas's Power Up "Gebruik hierdie krag op om te vernietig al die bewyse teenwoordig op die bord wat ooreenstem met sy kleur."
Block "'N pet verskyn op die boonste deel van die Raad tydelik voorkom dat nuwe bewyse val in die spel."