LeadLearners.Org | Numeriese modellering van groei hoek beheer oor die hoër plante
LeadLearners.Org™ Thanks to all our 1162417 visitors today, Thursday, 17/Oct/2019
Universiteit van Leeds Hoër plante Numeriese modellering Europese PhD Europa UK-studente Groei hoek beheer Januarie 2013 Biologiese Wetenskappe
As deel van deurlopende pogings gebruik computational en stelsels benaderings in die ontwikkeling biologie ons is op soek na 'n gegradueerde te stel met 'n wiskundige / rekenaargebaseerde agtergrond te studeer vir 'n PhD op die beheer van hoek van die groei van laterale wortel en skiet takke in hoër plante. Die regulering van die fundamentele aspek van die plant vorm tot nou heeltemal geheimsinnige: Dit is 'n onder-waardeer die feit dat die hoeke waarteen sytakke groei uit die hoof plant-as is nie toevallig nie, maar eerder is hoogs bepaal aspekte van hul individuele ontwikkelingsprogramme. Inderdaad, as die plante vertikaal gedraai, baie laterale organe sal vinnig buig so as om terug te keer na hul oorspronklike hoek van groei met betrekking tot die swaartekrag, 'n hoeveelheid wat bekend staan ​​as die gravitropic Setpoint hoek (GSA). Terwyl die GSA van die primêre wortel en loot tipies ongeveer vertikale, die GSA waardes van laterale lote en wortels is die meeste nie-vertikale, sodat die plant van die inname van hulpbronne beide bo-en onder-grond te optimaliseer. Hierdie ruimtelike regulering van GSA is duidelik regdeur die natuur in die vorm van kenmerkende spesies-spesifieke patrone van GSA beheer, miskien die meeste opvallend in die diverse vertakkings patrone van die bome. Hierdie projek bied die geleentheid om hierdie fassinerende patrone van GSA regulasies te verken en te verstaan ​​wat in die natuur binne 'n computational raamwerk.
Die projek is gebaseer op onlangse bevindinge in die Kepinski laboratorium, asook die inwerkingstelling van die basiese gravitropic reaksie in plante (die meganisme waardeur alle organe hul GSA te handhaaf), het ons getoon dat ouksien reaksie in 'n enkele sel tipe spesifiseer die GSA program van elke laterale orrel. Hierdie werk bied konseptuele raamwerk vir die begrip van die spesifikasie van GSA dwarsdeur die hoër plante en 'n beginpunt vir die generasie van rekenaar modelle van GSA beheer. Die modelle sal geredelik getoets in die laboratorium-en veld, sodat die student direk betrokke te raak in die iteratiewe proses van model-gerig eksperiment (in samewerking met eksperimenteerders in die gasheer laboratorium) en data-gedrewe model verfyn. Hulle sal ook gebou word sodat die verhouding tussen ouksien en algehele plant argitektuur kan ondersoek word oor 'n verskeidenheid van spesies, sodat die student ouer, beskrywende modelle van die boom vertakking byvoorbeeld te kontras met nuwe ondeurdagte en voorspellende modelle te ontwikkel binne die projek.
Die projek sal gesamentlik onder toesig van Dr Stefan Kepinski (Skool vir Biologie) en prof Netta Cohen (Skool vir Rekenaarkunde) by Leeds en in samewerking met medewerkers aan die Universiteit van Calgary. Potensiële aansoekers word aangemoedig om informele navrae te maak deur Dr Stefan Kepinski kontak per e-pos: s.kepinski @ leeds.ac.uk of telefoon: +44 113 343 2865
4 jaar BBSRC stipendium, onder die Wit Rose Meganistiese Biologie DTP.
Die suksesvolle aansoeker sal fooie en toelae ontvang (C.? 13590 vir 2013-14). Die PhD in Oktober 2013 begin. Aansoekers moet hê, of word verwag om te ontvang, 'n 2.1 Hons-graad in 'n toepaslike onderwerp. EU moet kandidate woonagtig gewees het in die Verenigde Koninkryk vir 3 jaar om volle ondersteuning te ontvang.