Natalie Ahn

Natalie G. Ahn, Boulder'daki Colorado Üniversitesi'nde kimya ve biyokimya profesörü. Araştırmaları, fosforilasyon ve kanserlerde uzmanlaşarak hücre sinyalleme mekanizmalarını anlamaya odaklanmıştır. Ahn'ın çalışması, genetik kodu ve genetiğin yaşam süreçlerini nasıl etkilediğini anlamak için "klasik kimya" araçlarını kullanmaktadır. 2003 yılından günümüze Boulder'daki Colorado Üniversitesi'nde profesör olarak görev yapmakta ve burada Seçkin Profesör konumundadır. 1994 ve 2014 yılları arasında Howard Hughes Tıp Enstitüsü araştırmacı olarak çalışmıştır. 2018 yılında ise Ulusal Bilimler Akademisi'nde Amerikan Sanat ve Bilim Akademisi üyeliğine seçilmiştir.
Biyografi
Ahn, 1979'da Seattle, Washington Üniversitesi'nden kimya alanında lisans derecesini aldı. Lyle Jensen'in laboratuvarında X-ışını kristalografisine odaklanan araştırmalar yaptı. Bu araştırmaya katılımı, X-ışını kristalografisi ile hesaplama teknikleri kullanarak protein katlanmasının daha iyi anlaşılmasına ve proteinlerin 3 boyutlu yapısının görselleştirilmesine yardımcı olmuştur. Ahn ayrıca protein hidrodinamiğini araştıran proteinlerin sulu ortamlarına göre hareketlerinin, içinde asılı kalabilecekleri veya çözülebilecekleri bir araştırma görevlisi olarak David Teller'ın laboratuvarında çalışmıştır.
1985 yılında Berkeley'deki California Üniversitesi'nde kimya alanında doktorasını aldı. Judith Klinman ile birlikte burada enzimoloji eğitimi aldı.
Ahn'ın doktora sonrası ilk işi, Christoph de Haen ile Washington Üniversitesi'nde hormon reseptör bağlanmasını incelemekti. Daha sonra Edwin Krebs'in laboratuvarına taşındı ve burada sinyal iletiminde kariyerine başladı. Bu laboratuvarda, "MAP kinazlarını ve MAP kinaz kinazlarını ilk tanımlayanlardan biri" olmuştur. 1992'de Colorado Boulder Üniversitesi'nde çalışmaya başladı ve 1993 yılında genç bilim adamlarının çalışmalarını finanse eden Searle Scholars Programının bir parçası oldu. Tek bir hücre tipindeki proteinleri tanımlamak için WM Keck Vakfı'ndan burs kazanan sekiz proje işbirlikçisinden biriydi. 2012 yılında Colorado Üniversitesi'nde Kolej Ayrım Profesörü seçildi. 2014 yılında Savunma İleri Araştırma Projeleri Ajansı (DARPA) tarafından desteklenen bir biyokimyasal proje olan Subselüler Pan-Omics for Advanced Rapid Threat Assessment (SPARTA) ekibinin bir parçası oldu.
2015 yazında daha önce konsey üyesi olduğu Amerikan Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Derneği (ASBMB) başkanlığına seçildi. Berkeley'deki California Üniversitesi'nde doktora öğrencisiyken ASBMB'nin yıllık toplantısına katılmaya başladı ve bu toplantılardan birinde ilk halka açık araştırma konuşmasını yaptı.
Uzmanlık Alanları
Hücre Sinyali
Bilişim ve Proteomik
Moleküler Biyofizik
Mevcut araştırmaları
Ahn şu anda Colorado Üniversitesi'nde çalışmakta ve hücre sinyalizasyonu, bilgi ve proteomik ve moleküler biyofizik üzerine araştırmalar yürütmektedir. Araştırmasının belirli konuları şunları içerir:
Proteomik ve Sinyal İletimi:
Laboratuvarın amacı, düzenleme ve hücre sinyalleşmesinden sorumlu yeni mekanizmaları araştırmaktır. Bunu yapmak için Ahn, bir hücrenin sinyal yollarına tepkisini daha iyi anlamak için biyokimyasal ve hücresel yaklaşımlarla birlikte protein profili oluşturmak için kütle spektrometrisini kullanır.
Buna ek olarak, Ahn protein kinazların iç hareketlerini araştırmakta, özellikle onların bağlanma protein dinamiklerini ve katalitik fonksiyonlarını incelimektedir.
"Melanomda aktive olan ve kanser ilerlemesini ve hücre davranışını etkileyen sinyal yollarını" inceleyerek kanserin gelişimini inceliyor.
Wnt5A sinyali:
Wnt5A, embriyonik vücut ekseni oluşumunu kontrol etmekten sorumludur ve melanomlarda yüksek seviyelerde bulunabilir ve bu da hücre istilasına neden olur. Ahn ve laboratuvarı, membran retraksiyonunu tetikleyerek yönlü hücre hareketlerine yardımcı olan "Wnt5a reseptör-aktin-miyosin-polarite (WRAMP) yapısını" keşfetti. Ahn, organel proteomiklerini kullanarak WRAMP yapısını belirleyebildi.
B-Raf sinyalizasyonu:
Melanom hücrelerinin yarısında B-Raf proteini, hücre transformasyonu, istila ve metastazdan sorumlu olan bir yanlış anlamlı mutasyon (V600E mutasyonu) içerir. Ahn, fosfoproteinlerin profilini çıkarmak için fosfopeptidleri keşfetmek ve saymak için negatif öncü iyon kütle spektrometrisini kullanır. Ahn, bu yöntemle çok sayıda farklı protein tanımladı ve bu bilgilerle kanser tedavisinde kullanılan hücre mekanizmalarının protein-protein sinyalleşmesinden nasıl etkilendiğini inceledi.
Proteomik Teknolojileri:
Ahn'ın laboratuvarında, her MS dizisinde 8.000'den fazla proteini tanımlamak için çok boyutlu sıvı kromatografisi-MS/MS kullanıyor. Ahn'ın amacı, atama proteinlerinde bu 2-D-LC-MS/MS tekniklerinde daha doğru ve hassas olmaktır.
Protein Kinaz Dinamiği:
Ahn'ın laboratuvarında, enerji dalgalanmalarının meydana geldiği kinazların içindeki protein hareketlerini keşfetmek ve daha iyi anlamak için hidrojen değişim kütle spektrometrisini (HX-MS) kullanıyor. Ahn'ın amacı, farklı protein dinamiklerinin belirli enzimlerdeki, özellikle de protein kinazdaki katalitik aktiviteyi nasıl düzenleyebildiğini anlamaktır. Ahn, aktivite ve protein dinamikleri arasındaki açık bağlantı nedeniyle ideal bir model sağlayan ERK2 MAP kinazlarına odaklanan araştırmalar yürütmektedir.
Bilimsel Yayınları
Couts, KL, Anderson, EM, Gross, MM, Sullivan, K. ve Ahn, NG (2012) Melanom hücrelerinde Onkojenik B-Raf sinyali, kombinatoryal fonksiyonlara sahip bir mikroRNA ağını kontrol eder. Onkogen, Basında.
Wang, D., Zhang, Z., O'Loughlin, E., Lee, T., Houel, S., O'Carroll, D., Tarahovsky, A., Ahn, NG ve Yi, R. (2012) Argonaute proteinlerinin memeli gelişiminde kantitatif işlevleri. Genes Dev., Baskıda.
Luo, Y., Ellis, LZ, Dallaglio, K., Takeda, M., Robinson, WA, Robinson, S., Lewis, KD, McCarter, MD, Gonzalez, R., Norris, DA, Roop, DR, Ahn, NG ve Fujita, M. (2012) İnsan melanom tümörlerinden yan popülasyon hücreleri, çeşitli kemorezistans mekanizmalarını ortaya koymaktadır. J. Yatırım. Dermatol., Basında.
Yen, CY, Houel, S., Ahn, NG ve Old, WM (2011) Proteom çapında bir spektral kitaplık kullanarak spektrumdan spektruma arama. Mol. Hücre. Proteomik Baskıda, 10, M111.007666.
Oyeyemi, OA, Sours, KM, Lee, T., Kohen, A., Resing, KA, Ahn, NG ve Klinman, JP (2011) 25 C'de mezofilik ve termofilik dihidrofolat redüktaz için karşılaştırmalı hidrojen-döteryum değişimi: Tanımlama mezofilik proteinde gelişmiş esnekliğe sahip tek bir aktif bölge bölgesinin. Biyokimya 50, 8251-8260.
Meyer-Arendt, K., Old, WM, Houel, S., Renganathan, K., Eichelberger, B., Resing, KA ve Ahn, NG (2011) IsoformResolver: Protein çıkarımı için peptit merkezli bir algoritma. J Proteome Res. 10, 3060-3075.
Sours, KM ve Ahn, NG (2010) MAP kinazlarının hidrojen değişim kütle spektrometrisi ile analizi. MAP Kinaz Signaling Protocols, R. Seger, Ed., Methods in Molecular Biology, 661, 239-255.
Ring, AY, Sours, KM, Lee, T. ve Ahn, NG (2010) ERK1 ve ERK2 arasındaki yapısal hareketlilikte farklı aktivasyona bağlı değişiklikler. Uluslararası J. Kütle Spektrometresi, 302, 101-109.
Houel, S., Abernathy, R., Renganathan, K., Meyer-Arendt, K., Ahn, NG ve Old, WM (2010) Büyük ölçekli proteomik çalışmalarda kimera MS/MS spektrumlarının peptit tanımlaması üzerindeki etkisinin ölçülmesi. J. Proteom Araş. 9, 4152-4160.
Oyeyemi, O., Sours, KM, Lee, T., Resing, KA, Ahn, NG ve Klinman, JP (2010) Bir termofilik dihidrofolat redüktazda protein hareketlerinin sıcaklığa bağımlılığı ve katalitik verimlilikle ilişkisi. Proc. Natl. Acad. Bilim, ABD. 107:10074-10079.
Kabuyama, Y., Litman, ES, Templeton, P., Metzner. SI, Witze, ES, Argast, GM, Langer, SJ, Polvinen, K., Shellman, Y, Chan, D., Shabb, JB, Fitzpatrick, JE, Resing, KA, Sousa, MC ve Ahn, NG (2009) ) Bir metionin kurtarma enzimi olarak melanom ay ışıklarında Rho'ya bağlı sinyalleşmenin bir aracısı. Mol. Hücre. Proteomik. 8(10):2308-2320.
Yazarın Seçimi makalesi olarak vurgulanmıştır.
Argast, GM, Croy, CH, Couts, KL, Zhang, Z., Litman, ES, Chan, DC ve Ahn, NG (2009) Melanom hücrelerinde B-Raf sinyali ile pleksin B1'in çapraz regülasyonu. Onkogen 28(30):2697-2709.
Old, WM, Shabb, JS, Houel, S., Wang, H., Couts, KH, Yen, CY., Litman, ES, Croy, CH, Meyer-Arendt, K., Miranda, JG, Brown, RA, Witze, ES, Schweppe, RE, Resing, KA ve Ahn, NG (2009) Fonksiyonel proteomik, melanomda B-Raf sinyali ile fosforilasyon hedeflerini tanımlar. Moleküler Hücre, 34(1):115-131.
Yen, C.-Y., Meyer-Arendt, K., Eichelberger, B., Houel, S., Old, WM, Knight, RD, Ahn, NG, Hunter, LE ve Resing, KA (2008) A teorik Proteinlerin büyük ölçekli tanımlanmasında spektrumdan spektruma arama için MS/MS kütüphanesi. Mol. Hücresel Proteomik, 8(4):857-869.
Gehrke, AS, Sun, S., Kurgan, L., Ahn, N., Resing, K., Kafadar, K. ve Cios, K. (2008) Peptidlerin Gaz Faz Kimyasının Analizi için Geliştirilmiş Makine Öğrenimi Yöntemi. BMC Biyoinformatik, 9:515.
Levin-Salomon, V. , Kogan, K. , Ahn, NG., Livnah, O. ve Engelberg, D (2008). MAP kinazların ERK ailesinin kendinden aktif (MEK'ten bağımsız) varyantlarının izolasyonu. J. Biol. Kimya 283:34500-34510.
Sours, KM, Kwok, SC, Rachidi, T., Lee, T., Ring, A., Hoofnagle, AN, Resing, KA ve Ahn, NG (2008) Hidrojen değişim kütle spektrometrisi, konformasyonel hareketlilikte aktivasyon kaynaklı değişiklikleri ortaya koymaktadır. p38a MAP kinazı. J. Mol. Biol., 379(5):1075-1093.
Witze, ES, Litman, ES, Argast, GM, Moon, RT ve Ahn, NG (2008) Wnt5A yapışma reseptörlerinin polarize yeniden dağıtılmasıyla hücre polaritesinin ve yönlü hareketin kontrolü. Bilim, 320(5874):365-369.
Witze, ES, Old, WM, Resing, KA ve Ahn, NG (2007) Protein translasyon sonrası modifikasyonların kütle spektrometrisi ile haritalanması. Nat. Yöntemler, 4, 798-806.
Ahn, NG, Shabb JS, Old, WM ve Resing, KA (2007) Kütle spektrometrisi ile derinlemesine proteomik profil oluşturma. ACS Kimyasal Biyoloji, 2:39-52.
Sun, S., Meyer-Arendt, K., Eichelberger, B., Brown, R., Yen, CY, Old, WM, Pierce, K., Cios, K., Ahn, NG ve Resing, KA (2007) ) Spektral yoğunluk tahmini ve fragman iyonlarının tam açıklaması kullanılarak peptit MS/MS atamalarının geliştirilmiş doğrulaması. Mol. Hücre. Proteomik, 6,1-17.
Shi, Z., Resing, KA ve Ahn, NG (2006) Protein kinazların allosterik kontrolü için ağlar. Kör. Op. Yapı. Biol. 16, 686-692
Emrick, MA, Lee, T., Starkey, P., Mumby, MC, Resing, KA ve Ahn, NG (2006) ERK2'deki kapı bekçisi kalıntısı, molekül içi bağlantı yolu yoluyla otomatik aktivasyonu kontrol eder. Proc. Natl. Acad. bilim ABD, 103, 18101-18106.
Schweppe, RE, Cheung, TH ve Ahn, NG (2006) ERK5 ve ERK1 / 2 sinyalinin global gen ekspresyonu analizi, ERK5 aracılı tepkilerde HIF-1'in rolünü ortaya koymaktadır. J. Biol. Chem., 281(30):20993-21003.
Roberts EC, Hammond, K., Yin, H., Traish, AM, Resing, KA ve Ahn, NG (2006) Fonksiyonel proteomik ile MAP kinaz yolu için G2/M hedeflerinin belirlenmesi. Proteomik, 6(16):4541-53.
Ma, Z., Izumi, H., Kanai, M., Kabuyama, Y., Ahn, NG ve Fukasawa, K. (2006) Mortalin, p53'ün sentrozomal lokalizasyonunu modüle ederek sentrozom çoğaltmasını kontrol eder. Onkogen, 25(39):5377-90.
Kabuyama, Y., Langer, SJ, Polvinen, K., Homma, Y., Resing, KA ve Ahn, NG (2006) Fonksiyonel proteomik, protein tirozin fosfataz 1B'yi RhoA sinyalinin bir hedefi olarak tanımlar. Mol. Hücre. Proteomik. 5(8):1359-67.
Lee, T., Croy, CH, Resing, KA ve Ahn, NG (2006) Proteinlerde hidrojen değişim ölçümleri. "Handbook of Hydrogen Transfer" (Schowen, RL, Klinman, JP, eds), Wiley VHC, Ekim 2006, Bölüm 14, sayfa 1361-1392'de. .
Ruth, MC, Old, WM, Emrick, MA, Meyer-Arendt, K., Aveline-Wolf, LD, Pierce, KG, Mendoza, AM, Sevinsky, JR, Hamady, M., Knight, RD, Resing, KA ve Ahn, NG (2006) İnsan kronik miyeloid lösemi hücrelerinden membran proteinlerinin analizi: Çok boyutlu LC-MS/MS için ekstraksiyon yöntemlerinin karşılaştırılması. J. Proteome Res, 5(3):709-719.
Yen, CY, Russell, S., Mendoza, AM, Meyer-Arendt, K., Sun, SJ, Cios, KJ, Ahn, NG ve Resing, KA (2006) azaltılmış karmaşıklık: MS/MS spektrumlarının veri madenciliğinden proteaz bölünmesi ve SCX elüsyon kuralları. Anal. Chem., 78:1071-1084.
Lee, T., Hoofnagle, AN, Resing, KA ve Ahn, NG (2006) Elektrosprey iyonizasyon kütle spektrometrisi ile ölçülen protein hidrojen değişimi. "Cell Biology: A Laboratory Handbook", Üçüncü Baskı, JE Celis, Ed., Elsevier Science. cilt 4: 443-449.
Lee, T., Hoofnagle, AN, Resing, KA ve Ahn, NG (2005) Bir ATP analoğu tarafından hidrojen değişim solvent koruması, aktivasyon üzerine ERK2'de konformasyonel değişiklikleri ortaya çıkarır. J. Mol. Biol. 353:600-612.
Old, WM, Meyer-Arendt, K., Aveline-Wolf, K., Pierce, KG, Mendoza, A., Sevinsky, JR, Resing, KA ve Ahn, NG (2005) Ölçme için etiketsiz yöntemlerin karşılaştırılması av tüfeği proteomikleri ile insan proteinleri. Mol. Hücre. Proteomik, 4:1487-1502.
Kabuyama, Y., Resing, KA ve Ahn, NG (2004) Proteomiklerin sinyalleşme ağlarına uygulanması. Genetik ve Gelişimde Güncel Görüşler, 14(5):492-8.
Liang, ZX, Tsigos, I., Lee, T., Bouriotis, V., Resing, KA, Ahn, NG ve Klinman JP(2004) Termofilik homologuna göre psikrofilik alkol dehidrojenazda artan yerel esnekliğin kanıtı. Biyokimya 43(46)::14676-83.
Resing, KA, Meyer-Arendt, K., Mendoza, AM, Aveline-Wolf, LD, Jonscher, KR, Pierce, KG, Old, WM, Cheung, HT, Russell, S., Wattawa, JL, Goehle, GR, Knight, RD ve Ahn, NG (2004) Av tüfeği proteomikleri ile insan proteinlerinin tanımlanmasında tekrarlanabilirlik ve duyarlılığın geliştirilmesi. Anal. Chem., 76:3556-68.
Liang, Z.-X., Lee, T., Resing, KA, Ahn, NG ve Klinman, JP (2004) Termal aktive protein hareketliliği ve termofilik alkol dehidrojenazda kataliz ile korelasyonu. Proc. Natl. Acad. bilim ABD, 101:9556-61.
Kabuyama, Y., Polvinen, K., Resing, KA ve Ahn, NG (2004) Sinyalleme hedeflerinin tanımlanması için iki boyutlu elektroforez. "Sinyal İletim Protokolleri"nde, RC Dickson, MD Mendenhall, Eds. Mol'deki Yöntemler. Biol. 284:37-49.
Lee, T., Hoofnagle AN, Kabuyama, Y., Stroud, J., Min, X., Goldsmith, EJ, Chen, L., Resing, KA ve Ahn, NG (2004) MAP kinazlarındaki yerleştirme bölgesi etkileşimleri ortaya çıktı hidrojen değişim kütle spektrometrisi ile. Moleküler Hücre, 14:43-55
Sevinsky JR, Whalen, AM ve Ahn, NG (2004) ERK, MafB/Kreisler aracılığıyla megakaryosit geni GPIIb/CD41'i indükler. Mol. Hücre. Biol., 24(10):4534-45
Hoofnagle AN, Resing, KA ve Ahn, NG (2004) Döteryum değişimi/kütle spektrometrisi için pratik yöntemler. "MAP kinaz protokolleri"nde, R. Seger, Ed., Meth. Mol. Biol. 250, 283-298.
Hoofnagle AN, Stoner, JW, Lee, T., Eaton, SS ve Ahn, NG (2004) ERK2'deki yapı ve dinamiklerdeki fosforilasyona bağlı değişiklikler, sahaya yönelik dönüş etiketlemesi ve elektron paramanyetik rezonansı ile tespit edildi. Biyofizik Dergisi, 86(1 Bölüm 1):395-403
Haydon, CE, Eyers, PA, Wolf, LA, Resing, KA, Maller, JL ve Ahn, NG (2003) Xenopus laevis Aurora A üzerinde yeni fosforilasyon bölgelerinin belirlenmesi ve IMAC ile fosfopeptid zenginleştirmesinin analizi. Mol. Hücre. Proteomik, 2(10):1055-1067.
Bernard, K., Litman, E., Fitzpatrick, J., Shellman, Y., Argast, G., Polvinen, K., Everett, A., Fukasawa, K., Norris, D., Ahn, NG ve Resing, KA (2003) Melanom ilerlemesinin fonksiyonel proteomik analizi. Kanser Araş. 63:6716-6725.
Schweppe, RE, Melton AA, Brodsky, KS, Aveline, LD, Resing, KA, Ahn, NG ve Gutierrez-Hartmann, A. (2003) Bazal transkripsiyona bağlanan fonksiyonel hipofiz Ets faktörü olarak GABP'nin saflaştırılması ve kütle spektrometrik tanımlaması prolaktin promotörünün elemanı. J. Biol. Chem, 278:16863-72.
Schweppe RE, Resing, KA ve Ahn, NG (2003) Kütle spektrometrisi ile translasyon sonrası modifikasyonların karakterizasyonu. Hesaplar Kimya. Araş. 36, 453-61.
Hoofnagle AN, Resing, KA ve Ahn, NG (2003) Hidrojen değişim kütle spektrometrisi ile protein analizi. Anne. Rev. Biyofiz. biyomol. Yapı. 32, 1-25.
Aurandt, J., Vikis, HG, Gutkind, JS, Ahn, N. ve Guan, KL (2002) Semaforin reseptörü pleksin B1, Rho'ya özgü nükleotid değiştirici, LARG ile doğrudan etkileşim yoluyla sinyal verir. Proc. Natl. Acad. bilim ABD 99, 12085-90.
Roberts, EC, Shapiro, PS, Nahreini, TS, Pages, G., Pouyssegur, J. ve Ahn, NG (2002) Somatik hücre mitozunda ERK ve PI3K sinyal yolları için farklı hücre döngüsü zamanlama gereksinimleri. Mol. Hücre. Biol. 22, 7226-41.
Galasinski, SC, Resing, KA, Goodrich, JA ve Ahn, NG (2002) Fosfataz inhibisyonu, histon deasetilaz 1/2 fosforilasyonuna ve yardımcı baskılayıcı etkileşimlerinin bozulmasına yol açar. J. Biol. Kimya 277, 19618-26.
Galasinski S., Louie DF, Gloor, KK, Resing, KA ve Ahn, NG (2002) Çekirdek histonlar üzerinde post-translational modifikasyonların küresel düzenlemesi. J. Biol. Kimya 277, 2579-88
Emrick, MA, Hoofnagle, AN, Miller, AS, Ten Eyck, LF ve Ahn, NG (2001) Sinerjistik nokta mutasyonları ile hücre dışı sinyalle düzenlenen kinaz 2'nin yapıcı aktivasyonu. J. Biol. Kimya 276, 46469-79.
Jesch SA, Lewis, TS, Ahn, NG ve Linstedt, AD (2001) Golgi istifleme proteini 55'in mitojenle aktifleştirilmiş protein kinaz ERK2 ile mitotik fosforilasyonu. Mol. Biol. Hücre 12, 1811-1817.
Hoofnagle AN, Resing, KA, Goldsmith, EJ ve Ahn, NG (2001) Hidrojen değişimi ile tespit edildiği gibi, ERK2'nin aktivasyonu üzerine protein konformasyonel hareketliliğinde değişiklikler. Proc. Natl. Acad. bilim ABD 98, 956-961.
Lewis, TS, Hunt, J., Aveline, LD, Jonscher, KR, Louie, DF, Yeh, J., Nahreini TS, Resing, KA ve Ahn, NG (2000) Fonksiyonel proteomik ile yeni MAP kinaz yolu sinyalleme hedeflerinin tanımlanması ve kütle spektrometrisi. Moleküler Hücre 6, 1343-1354.
Seiwert, S., Nahreini, TS, Aigner, S., Ahn, NG ve Uhlenbeck OC (2000) yola-özgü MAP kinaz inhibitörleri olarak RNA aptamerleri. Kimya ve Biyoloji 7, 833-843.
Prowse, CN, Hagopian, JC, Cobb, MH, Ahn, NG ve Lew J. (2000) Mitojenle aktive olan protein kinaz, ERK2 için katalitik reaksiyon yolu. Biyokimya, 39:6258-66
Rak, J., Mitsuhashi, Y., Sheehan, C., Tamir, A., Viloria-Petit, A., Filmus, J., Mansour, SJ, Ahn, NG, Kerbel, RS (2000) Oncogenes and tümör anjiyogenez : ras ile dönüştürülmüş epitel hücrelerinde ve fibroblastlarda vasküler endotelyal büyüme faktörü yukarı regülasyonunun farklı modları. Kanser Araş. 60, 490-498.
Louie, DF, Gloor, KK, Galasinski, SC, Resing, KA ve Ahn, NG (2000) Kütle spektrometrisi ile analiz edilen yüksek mobilite grubu proteinleri 14 ve 17'nin fosforilasyonu ve hücre içi yeniden dağılımı. Protein Bilimi. 9, 170-179.
Boeshans, KM, Resing, KA, Hunt, JB, Ahn, NG ve Shabb, JB (1999) Kütle spektrometrisi ile tip I cAMP'ye bağlı protein kinazın membranla ilişkili düzenleyici alt biriminin yapısal karakterizasyonu: Ser81'in in vivo fosforilasyon olarak tanımlanması RIa'nın sitesi. Protein Bilimi. 8, 1515-1522.
Resing, KA, Hoofnagle, AN ve Ahn, NG (1999) İkincil yapıyı araştırmak için pepsin eşleştirmesini kullanarak ERK2'nin döteryum değişim davranışını modelleme. J. Am. Soc. Kütle Spek. 10, 685-702.
Shapiro, PS, Whalen, AM, Tolwinski, NS, Froelich-Ammon, SJ, Garcia, M., Osheroff, N. ve Ahn, NG (1999) ERK, fosforilasyondan bağımsız bir mekanizma yoluyla topoizomeraz IIa'yı aktive eder. Mol. Hücre. Biol. 19, 3551-3560.
Tolwinski, NS, Shapiro, PS, Goueli, S. ve Ahn, NG (1999) MAP kinaz kinaz-1'in nükleer lokalizasyonu, serum stimülasyonu ve G2/M ilerlemesi ile desteklenir. Aktivasyon dudağındaki fosforilasyon gereksinimi ve MKK'nın akış aşağısında sinyalleşme. J. Biol. Kimya 274, 6168-6174.
Resing, KA ve Ahn, NG (1999) Kütle spektrometrisinin sinyal transdüksiyonuna uygulamaları. prog. Biyofiz. Mol. Biol. 71, 501-523.
Shapiro, PS, Vaisberg, E., Hunt, AJ, Tolwinski, NS, Whalen, AM, McIntosh, JR ve Ahn, NG (1998) Somatik hücre mitozu sırasında MKK/ERK yolunun aktivasyonu. Aktif ERK'nin kinetokorlarla doğrudan etkileşimleri ve mitotik 3F3/2 fosfoantijenin düzenlenmesi. J. Hücre Biol. 142, 1533-1545.
Duesbery, NS, Webb, C, Leppla, S, Gordon, VM, Klimpel, KR, Copeland, TD, Ahn, NG, Oskarsson, MK, Fukasawa, K, Paull, KD ve Vande Woude), GF (1998). MAPKK'nın şarbon öldürücü faktör ile proteolitik inaktivasyonu. bilim _ 280, 7347
Lewis, TS, Shapiro, PS ve Ahn, NG (1998) MAP kinaz basamakları yoluyla sinyal iletimi. reklam Kanser Araş. 74, 49-139.
Shapiro, PS ve Ahn, NG (1998) Raf-1 ve mitojenle aktive olan protein kinaz kinaz 1 ve 2'nin MKP-1 fosfataz tarafından geri besleme regülasyonu. J. Biol. Kimya 273, 1788-1793.
Resing, KA ve Ahn, NG (1998) Protein kinaz aktivasyonunun bir probu olarak Döteryum değişim kütle spektrometrisi. MAP kinaz kinazın vahşi tip ve yapısal olarak aktif mutantlarının analizi 1. Biochemistry 37, 463-475.
Resing, KA ve Ahn, NG (1997) Elektrosprey iyonizasyon kütle spektrometrisi ile protein fosforilasyon analizi. Yöntemler Enzimol. 283, 29-44.
Whalen, AM, Galasinski, SC, Shapiro, PS, Nahreini, TS ve Ahn, NG (1997) MAP kinaz kinazın yapısal aktivasyonu ile indüklenen megakaryositik farklılaşma. Mol. Hücre. Biol. 17, 1947-1958.
Mansour, SJ, Candia, JM, Matsuuda, J., Manning, M. ve Ahn, NG (1996) MAP kinaz kinazın enzimatik aktivitesini kontrol eden birbirine bağlı alanlar 1. Biochemistry 35, 15529-15536.
Louie, DF, Resing, KA, Lewis, TS ve Ahn, NG (1996) Rat-1 fibroblastlarından 40S ribozomal proteinlerinin kütle spektrometrik analizi. J. Biol. Kimya 271, 28189-28198.
Matten, WT, Mansour, SJ, Copeland, T., Ahn, NG ve Vande Woude, GF (1996) Xenopus oosit olgunlaşması sırasında MAPK'dan Mos'a pozitif bir geri besleme sinyali. geliştirici Biol. 179, 485-492.
Choi, T., Rulong, S., Resau, J., Fukasawa, K., Matten, W., Kuriyama, R., Mansour, S., Ahn, N., Vande Woude, GF (1996) Mos/MAP kinaz, MPF'nin yokluğunda erken mayotik fenotipleri indükleyebilir: Mayoz I sırasında iğ oluşumunu analiz etmek için yeni bir sistem, Proc. Natl. Acad. bilim ABD, 93, 4730-4735.
Mansour, SJ, Candia, JM, Gloor, K. ve Ahn, NG (1996) Yapısal olarak aktive edilmiş MAPKK1 ve MAPKK2, benzer transkripsiyonel ve morfolojik tepkilere aracılık eder. Hücre Büyüme Farkı 7, 243-250.
Resing, KA, Mansour, SJ, Hermann, AS, Johnson, RS, Candia, JM, Fukasawa, K., Vande Woude, GF ve Ahn, NG (1995) MAP üzerinde v-Mos katalizli fosforilasyon bölgelerinin ve otofosforilasyon bölgelerinin belirlenmesi ESI/MS ile kinaz kinaz. Biyokimya 34, 2610-2620.
Mansour, SJ, Matten, WT, Hermann, AS, Candia, JM, Rong, S., Fukasawa, K., Vande Woude, GF ve Ahn, NG (1994) MAP kinaz kinazındaki fonksiyon kazanımı mutasyonları memeliyi teşvik eder hücre dönüşümü. Bilim 265, 966-970.
Mansour, SJ, Resing, KA, Candia, JM, Hermann, AS, Gloor, JW, Herskind, KR, Wartmann, M., Davis, RJ ve Ahn, NG (1994) Mitojenle aktive olan protein kinaz fosforilasyonu protein kinaz-kinaz: in vitro fosforilasyon bölgelerinin analizi. J. Biochem. 116. 304-314.
Posada, J., Yew, N., Ahn, NG, Vande Woude, GF ve Cooper, JA (1993) Mos, Xenopus oositlerinde MAP kinazı uyarır ve in vitro olarak bir MAP kinaz kinazını aktive eder. Mol. Hücre. Biol. 13, 2546-2553.
Ahn, NG (1993) MAP kinaz şelalesi. Yeni bir sinyal iletim yolunun keşfi. Mol. Hücre. Biyokimya. 127/128, 201-209.
Ahn, NG, Campbell, JS, Seger, R., Jensen, AL, Graves, LM ve Krebs, EG (1993) A431 hücrelerinde mitojenle aktive olan protein kinaz kinazın metabolik etiketlemesi, serin ve treonin kalıntıları üzerinde fosforilasyonu gösterir. Proc. Natl. Acad. bilim ABD 90, 5143-5147.
Ahn, NG, Seger, R. ve Krebs, EG (1992) Mitojenle aktive olan protein kinaz aktivatörü. Kör. Op. Hücre Biol. 4, 992-999.
Seger, R., Seger, D., Lozeman, FJ, Ahn, NG, Graves, LM, Campbell, JS, Ericsson, L., Harrylock, M., Jensen, AM ve Krebs, EG (1992) Human T-cell mitojenle aktive olan protein kinaz kinazlar, maya sinyal transdüksiyon kinazları ile ilgilidir. J. Biol. Kimya 267, 25628-25631.
Seger, R., Ahn, NG, Posada, J., Munar, ES, Jensen, AJ, Cooper, JA, Cobb, MH ve Krebs, EG (1992) epidermal büyüme faktörü ile uyarılan A431 hücreleri. J. Biol Chem. 267, 14373-14381.
Ahn, NG, Robbins, DJ, Haycock, JW, Seger, R., Cobb, MH ve Krebs, EG (1992) Sinir büyüme faktörü veya bradikinin ile uyarılan PC12 hücrelerinde MAP kinazları ERK1 ve ERK2'nin bir aktivatörünün tanımlanması. J. Neurochem., 59, 147-156.
Haycock, JW, Ahn, NG, Cobb, MH ve Krebs, EG (1992). İki mikrotübül ilişkili protein 2 kinazı olan ERK1 ve ERK2, in situ serin 31'de tirozin hidroksilazın fosforilasyonuna aracılık eder. Proc. Natl. Acad. bilim ABD, 89, 2365-2369.
Seger, R., Ahn, NG, Boulton, TG, Yancopoulos, GD, Panayotatos, N., Radziejewska, E., Ericsson, L., Bratlien, RL, Cobb, MH ve Krebs, EG (1991). Mikrotübül ile ilişkili protein 2 kinazlar, ERK1 ve ERK2, hem tirozin hem de treonin kalıntıları üzerinde otofosforilasyona uğrar: Aktivasyon mekanizmaları için çıkarımlar. Proc. Natl. Acad. bilim ABD, 88, 6142-6146.
Ahn, NG, Seger, R., Bratlien, RL ve Krebs, EG (1991). Büyüme faktörü ile uyarılan fosforilasyon basamakları: Büyüme faktörü ile uyarılan MAP kinazın aktivasyonu. CIBA Vakfı Sempozyumu, 164, 113-131.
Ahn, NG, Seger, R., Bratlien, RL, Diltz, CD, Tonks, NK ve Krebs, EG (1991) Bir epidermal büyüme faktörü ile uyarılan protein kinaz kaskadı içinde çoklu bileşenler. Bir MBP/MAP2 kinazın in vitro aktivasyonu. J. Biol. Kimya 256, 4220-4227.
Ahn, NG ve Krebs, EG (1990) İsviçre 3T3 hücrelerinde epidermal büyüme faktörü ile uyarılan protein serin/treonin kinaz kaskadı için kanıt. Serin peptit kinaz aktivitesinin in vitro miyelin bazik protein kinazlar tarafından aktivasyonu. J. Biol. Kimya 265, 11495-11501.
Ahn, NG, Weiel, JE, Chan, CP ve Krebs, EG (1990) İsviçre 3T3 hücrelerinden çoklu epidermal büyüme faktörü ile uyarılan protein serin/treonin kinazlarının tanımlanması. J. Biol. Kimya 265, 11487-11494.
Ahn, NG ve Klinman, JP (1989) Bölümlere ayrılmış bir enzim sisteminde hız sınırlayıcı adımların doğası. Yeniden kapatılmış kromaffin granül hayaletlerinde dopamin taşınması ve hidroksilasyon oranlarının niceliği. J. Biol. Kimya 264, 12259-12265.
Ahn, NG, Teller, DC, Bienkowski, MJ, McMullen, BA, Lipkin, EW ve de Haën, C. (1988) İnsan plasentasından beş lipokortin ile ilişkili fosfolipaz A2 inhibitörünün sedimantasyon denge analizi. J. Biol. Kimya 263, 18657-18663.
Ahn, N. ve Klinman, JP (1987) Yeniden kapatılmış kromaffin granül hayaletlerinde dış ve iç elektron donörleri tarafından dopamin b-monooksijenazın aktivasyonu. J. Biol. Kimya 262, 1485-1492.
Ahn, N. ve Klinman, JP (1983) Başlangıç hızı ve birincil döteryum izotop etkisi çalışmalarından çıkarsanan, pH ve fumarat ile dopamin b-monooksijenaz modülasyonunun mekanizması. Biyokimya 22, 3096-3106.