Psd olarak kaydediyor ama, bütün layerler birleşik geliyor dosya PNG'den farksız oluyor.

Bu hatayı verdikten sonra çıkartmıyor mu?

Geçenlerde fontlar uyumlu değil diye hata almıştım ama sorun yok galiba, resim için en iyileştirme ayarını seçer misiniz belki daha iyi olur. Olmazsa pdf'e çevirip photoshop ile açmayı deneyin.

Bu hatayı neden alıyorum ve nasıl düzeltebilirim?

Layers panelinin ss'ini atabilir misiniz?