Kaspersky'i kapatarak Malwarebytes'ı kuruyorum ve tarama yaptıktan sonra siliyorum fakat ikisi de agresif yazılımlar olduğundan dolayı Kaspersky hasar görebilir mi?

Malwarebytes'ı sil Kaspersky zaten yeterli.

Malwarebytes'ın Premium deneme sürümünü devre dışı bırakın. Böylece gerçek zamanlı koruması da kapanmış olur. Halihazırda zaten Kaspersky'ın gerçek zamanlı koruması mevcut. Malwarebytes sistemde kalabilir, sadece tarama amaçlı kullanırsınız. Arka planda çalışmasın yeterli.