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「師範」一詞最早出源自西漢揚雄的《揚子法言·學行》「師哉！桐子之命也。務學不如務求師。師者，人之模範也。模不模，範不範，為不少矣！」而首次將「師範」二字連用則出自《後漢書·趙壹傳》「君學成師範，縉紳歸慕，仰高希驥，歷年滋多。」其中的「師範」都有「可以師法的模範」、「可以學習的榜樣」的意思。中國近代著名教育家陶行知為「師範」留下最好的注解——學高為師，身正為範。師範教育對中國而言為舶來品，世界上最早成立的師範學校為法國巴黎的「高等師範學校」，明治維新之後的日本也效法歐洲國家建立師範教育制度，以培育優秀的教育師資，東京師範學校（今筑波大學）於是誕生，其他官立師範學校也陸續成立。明治維新的成功，成為大清帝國戊戌變法最好的借鏡，戊戌變法的教育改革也間接推動了中國師範教育的發展。光緒28年，庚子新政之下，時任管學大臣張百熙頒布了《欽定學堂章程》，確立了中國第一個新式學制系統「壬寅學制」，其中對於師範學校做出明確規範，設置了「師範學堂」（相當於中學堂）與「師範館」（相當於高等學堂），京師大學堂師範館（今北京師範大學）因此成立；同年，張謇在南通創辦通州民立師範學校（今南通師範高等專科學校）。但在此前，光緒23年盛宣懷成立的南洋公學（今國立交通大學）已成立「師範院」。上述三間學校被視為中國師範教育的三大源頭。
辛亥革命爆發，中華民國肇建，北洋政府教育總長蔡元培根據《師範教育令》制定《高等師範學校規程》，在全國規劃六大學區，各設置一所國立高等師範學校，分別為：國立北京高等師範學校（今北京師範大學）、國立南京高等師範學校（今國立中央大學）、國立武昌高等師範學校（今武漢大學）、國立廣東高等師範學校（今國立中山大學）、國立成都高等師範學校（今四川大學）、國立瀋陽高等師範學校（今東北大學），培育各級學校的教師，以彌補師資的嚴重不足。民國11年，北洋政府頒行《學校系統改革案》，確立新的學制「壬戌學制」，伴隨而來的是「高師改大」運動，高等師範學校升格為師範大學，並開始朝綜合型大學發展，其中以國立南京高等師範學校尤其積極，直接改制為綜合型大學，更名為「國立東南大學」；至於其他高等師範學校則陸續升格，然後合併或改制成為綜合型大學，最後僅剩國立北京師範大學一所國立師範學校。高等師範學校紛紛改制為綜合型大學，對師範教育產生莫大的影響，師範教育發展受阻，各級學校教師素質與數量開始下降，也為日後抗日戰爭的師範教育改革埋下伏筆。民國23年，國民政府教育部頒布《師範學校規程》，明定師範學校設置辦法、宗旨、課程與修業年限等，而實施的效果有限，仍未解決教師素質與數量的問題。民國26年，盧溝橋事變爆發，日軍全面侵華，在淪陷區對中國國民進行奴化教育，領政的中國國民黨終於意識到教育的重要性，決定振興師範教育。翌年，國民政府教育部依據中國國民黨臨時全國代表大會的《抗戰建國綱領》頒布《師範學院規程》，明確指出「師範學院以全國分區單獨設立為原則，或附設於國立大學之中，女子師範學院可單設。」將師範教育提升至新的高度，而這也確立了師範學院制度，影響今日中國大陸與臺灣地區師範學校的發展。
根據統計，截至民國38年12月31日，全國共有十所獨立設置的國立師範學院，分別為：
*國立師範學院（今湖南師範大學）
*國立湖北師範學院（原湖北省立教育學院，今湖北大學）
*國立南寧師範學院（原廣西省立桂林師範學院，原名為「國立桂林師範學院」，今廣西師範大學）
*國立貴陽師範學院（今貴州師範大學）
*國立昆明師範學院（原國立西南聯合大學師範學院，今雲南師範大學）
*國立西北師範學院（原國立西北聯合大學師範學院，今西北師範大學）
*國立長白師範學院（隨中華民國政府遷往臺灣，因復校復課未成而廢止）
*國立女子師範學院（今西南大學）
*國立海南師範學院（今海南師範大學）
*國立山東師範學院（今山東師範大學）
此外，省立師範學院有河北省立女子師範學院（今河北師範大學）、山東省立師範學院（今山東師範大學）與臺灣省立師範學院（今國立臺灣師範大學）三所。另外，附設師範學院的國立大學有國立中央大學、國立四川大學、國立浙江大學與國立中山大學四所。
民國27年7月27日，教育部發電報聘請時任私立光華大學副校長兼附屬中學主任廖世承為國立師範學院籌備委員會主任，廖世承在接到電報後隨即開始國立師範學院的籌備工作，商討校址問題，聘請學校教師，起草《國立師範學院組織大綱》。關於教師，廖世承面向全國各界邀請眾多學者任教，並且擔任職員。關於校址，廖世承一方面要求在貴州省相擇院址，一方面考察湖南省各處。最終，廖世承在長郡中學校長魯立剛的建議與推薦下決定以湖南省安化縣藍田鎮的李園為校址，李園為辛亥革命元勳李燮和的故居，當時主人為李燮和的胞弟李卓然，李桌然熱愛革命與教育，欣然同意將李園借出創辦國立師範學院。廖世承就擇定院址一事致電教育部，在獲得核定之後繼續完成各項籌備工作，教育部決定將國立山東大學與安徽省立安徽大學的儀器設備與圖書借予國立師範學院。另外，學院也訂購一批長沙市商務印書館與中華書局的書籍文具，又租借了南軒圖書館圖書數萬冊。10月27日，教育部正式行文聘任廖世承為國立師範學院院長，而後訂該日為國立師範學院校慶日（也是現金湖南師範大學校慶日）。11月8日，招生工作順利完成，國立師範學院籌備委員會至此解散。12月1日，國立師範學院正式開學，籌備至開學歷時僅四個月，實為罕見。民國28年1月14日，待校務安頓之後，國立師範學院廣要社會各界，補行隆重的開學典禮，實現社會各界對教育復興的無限期望。
民國33年6月19日，湖南省長沙市在第四次長沙會戰中淪陷，國立師範學院緊急召開院務會議，決議西遷，最終地址湖南省漵浦縣。民國34年，抗日戰爭勝利，國立師範學院照理應該前往首都南京市，並且更名為「國立中央師範學院」，卻因「政治因素」遭到教育部拒絕，至於遷往省會長沙市擇因長沙市遭逢文夕大火尚未復原為由拒絕，最終教育部要求國立師範學院遷往湖南省衡山縣繼續辦學，對於教育部的決定，國立師範學院全體師生感到錯愕與憤怒，也開啟以「遷院改大」為名的抗爭。「遷院」是指遷往首都南京市或省會長沙市，「改大」是指更名為「國立中央師範學院」並改制為師範大學。國立師範學院確定遷往湖南省衡山縣之後，湖南省政府在國立師範學院的安化縣藍田鎮舊址成立「湖南省立第十五中學」，該校為今日的「漣源市第一中學（湖南師範大學附屬藍田中學）」。民國36年8月，廖世承辭去院長返回上海市，院長由教務處長皮名舉代理。民國37年4月，教育部指派康辛元為院長，皮名舉結束代理，但康辛元為正式上任，馬上遭到全校師生抵制，師生自行推舉謝扶雅為代理院長，以表達對教育部不願「遷院改大」的不滿。同年10月，陳東原擔任院長。民國38年5月，王兆澄任代理院長，期間因應第二次國共內戰的情勢，教育部要求國立師範學院南遷，院長不願南遷而使教育部不給予任何經費，王兆澄為求取經費而殉職。民國38年8月，汪梧封任代理院長至學校併入國立湖南大學。新中國成立後學校由中南教育部接管，並受指示併入國立湖南大學。四年後，因院系調整，以原國立師範學院為基礎成立湖南師範學院，後改制為湖南師範大學，繼承並弘揚國師精神。
倡導師範仁道，追求高尚；
作詞：錢基博
譜曲：張子瑜
孰與我少艾？五千年之文明，煥彩菲芳靄。國何曾老大？
勤以精業，博愛之謂仁，明德親民，舊邦命維新。國何害老大？
撫萬里之山河，滄海以為帶，萬國莫我奈，好作新兆民。
好作新兆民，一代師表重自珍，莫辜負羣倫。
作詞：廖世承
譜曲：唐學詠
國師，國師，文化的先進，國民的導師，
陶甄人才，作育多士，建樹一代良規。
忠於為人，勇於克己，披荊斬棘，履險如夷，宏施教澤，
百年以為期，千載有餘思。
國師，國師，青年的先導，建國的良師，
愛護幼童，扶植少壯，創立和平始基。
誠以待人，義以接物，摩頂放踵，念茲在茲，風行草偃，
*主任委員：私立光華大學副校長 廖世承
*委員：中華民國教育部高等教育司司長 吳俊升
*委員：中國國民黨宣傳部副部長 潘公展 → 中華民國陸軍第三十一集團軍總司令部秘書 袁哲
*委員：湖南省教育廳廳長 朱經農
*委員：國立西南聯合大學教授 汪德耀
原國立師範學院籌備委員會主任委員，曾任私立光華大學副校長
原國立師範學院教務長，曾任國立師範學院史地學系主任
因中國共產黨煽動的學潮罷課抗拒而未到任，曾任教於國立西北工業學院（今西北工業大學）
原國立師範學院公民訓育學系主任，曾任教於廣東省廣州市的嶺南大學
原中華民國教育部資料研究室主任，曾任安徽省立圖書館館長
原國立師範學院博物學系主任，代理院長任內為請領學校經費而遇害殉職
原國立師範學院英語學系主任，代理院長任內成立「營救被捕師生委員會」
*教務處：註冊組、圖書組、出版組。
*訓導處：生活管理組、體育組、課外活動組。
*總務處：庶務組、保管組、文書組、出納組。
*公民訓育學系（民國27年設立，民國34年併入教育學系）
*體育童子軍專修科（民國28年設立）
*國文專修科（民國30年設立）
*數學專修科（民國30年設立）
*音樂專修科（民國31年設立，民國34年停辦）
*大學先修班（民國28年設立，民國35年停辦）
*體育師資訓練班（民國31年設立，民國33年停辦）
*小學教師進修班（民國32年設立，民國33年停辦）
東口車站大樓「」
南口遠景（2005年5月）
新宿站位於日本東京都新宿區與澀谷區之間，為東日本旅客鐵道（JR東日本）、京王電鐵、小田急電鐵、東京地下鐵、東京都交通局（都營地下鐵）的鐵路車站，是東京主要公共交通樞紐之一。該站亦是全世界最繁忙的車站（獲健力士世界紀錄認可）。站內總共有36個月臺，超過200個出入口。若把與該站直接連結的5個車站計算在內，月臺總數則為51個。
新宿站是東京副都心新宿的鐵路總站。1885年3月1日啟用時，為日本鐵道赤羽至品川路線（山手線前身）的一站。1889年4月11日，甲武鐵道（中央本線前身）新宿至立川通車，同年8月服務延長至八王子。大正時期，隨著市區擴大，眾多私鐵連結至此。1915年5月1日，京王電氣軌道（今京王電鐵）新宿站啟用，1927年4月1日，小田原急行鐵道（今小田急電鐵）新宿站啟用，成為鐵路總站的新宿站周邊開始發展，使用者逐漸上升，也使新宿逐漸發展成為繁榮的街區。1931年，新宿站成為日本使用人次最高的車站。1959年，地下鐵新宿站開始提供服務。1966年（昭和41年），使用人次達41萬人次的國鐵新宿站以兩人之差超越國鐵池袋站。1960年代起，新宿站西側一帶開始進行新宿副都心計畫。70年代起摩天大樓陸續完工，持續帶動使用人次成長。
2000年（平成12年），入選關東車站百選（第四回）。2011年一日平均上下車人次約326萬人，並獲得金氏世界紀錄認證為世界上使用人次最多的車站。
現在的新宿站透過JR、私鐵、地下鐵等眾多路線連結周邊地區的臥城，加上周邊是日本最大的繁華街、歡樂街，無論日夜人潮絡繹不絕。以JR車站為中心，東、西、南口可透過通道或地下街連通周邊各地下鐵車站或商業設施。
現在1日平均上下車人次約353萬人（2017年），並獲得金氏世界紀錄認證為世界上使用人次最多的車站，加上以地下道等連通的西武新宿站、新宿西口站的使用人次則達到約377萬人（2017年），該數字可與橫濱市與靜岡縣人口匹敵。
新宿站是JR東日本、京王電鐵、小田急電鐵、東京地下鐵、東京都交通局等5家鐵路業者停靠的轉乘站。其中京王線與小田急小田原線以此站為起點。
; JR東日本
: JR東日本路線的軌道名稱為山手線與中央本線（詳情請參見路線條目和「」），山手線是本站的所屬線。本站的運行系統可見下方。依據特定都區市內制度，本站屬於「東京都區內」與東京山手線內。設有「」。
: 本站山手線除了停靠行駛於電車線的環狀線山手線電車外，也停靠行駛於山手貨物線的埼京線與湘南新宿線列車。以上路線在旅客資訊上視為不同路線。機場聯絡特急「成田特快」與東武日光線直通特急等也經由山手貨物線駛進本站。
: 中央本線分為行駛於急行線的中央線快速電車與行駛於緩行線的中央·總武線各站停車2系統。另外還有往甲府站、松本站方向的特急列車（在複複線區間行駛急行線）。
:* JY 山手線：行駛電車線的環狀線。往澀谷站、品川站方向為內環，往池袋站、上野站方向為外環 - 車站編號「JY 17」
:* JA 埼京線：行駛山手貨物線。往大宮站方向（北行）與川越線互相直通運行、大崎站方向（南行）與臨海線互相直通運行 - 車站編號「JA 11」
:* JS 湘南新宿線：行駛山手貨物線的中距離電車。往大宮站方向（北行）與宇都宮線、高崎線互相直通運行，往橫濱站方向（南行）與東海道線、橫須賀線互相直通運行 - 車站編號「JS 20」
:* JC 中央線（快速）：行駛中央本線的中距離電車。包含往八王子站、高尾站方向的列車與立川站起直通青梅線的列車 - 車站編號「JC 05」
:* JB 中央·總武線（各站停車）：行駛中央本線的近距離電車 - 車站編號「JB 10」
: 京王電鐵的路線在軌道名稱上為京王線，運行系統則分為本站起點的「京王線」以及與都營地下鐵新宿線直通運行的「京王新線」，後者停靠的車站稱為「新線新宿站」。新宿站與新線新宿站共同使用「KO01」的車站編號。
: 小田急以此站為起點的各站停車班次屬於小田原線，但有經相模大野站直通江之島線、經新百合丘站直通多摩線的快速急行、急行線列車。車站編號為「OH 01」。
; 東京地下鐵、東京都交通局（都營地下鐵）
: 地下鐵有以下2間公司3條路線停靠，各路線都設有車站編號。
:* M 東京地下鐵丸之內線。車站編號「M 08」
:* S 都營地下鐵新宿線。車站編號「S 01」
:* E 都營地下鐵大江戶線。車站編號「E 27」
以下各站透過地下通道連結，也有鐵路公司將其定為轉乘站。
* 西武新宿站（西武鐵道新宿線） - 透過連結。
* 新宿西口站（都營地下鐵大江戶線）
* 新宿三丁目站（東京地下鐵丸之內線、副都心線、都營地下鐵新宿線） - 都道430號下方地下通道連結
本站的京王、小田急、東京地下鐵、都營地下鐵之間並非全部皆有轉乘優惠。例如東京地下鐵丸之內線與都營地下鐵新宿線、大江戶線兩站間距離較遠，不適用轉乘優惠。丸之內線與新宿線在新宿三丁目站轉乘、丸之內線與大江戶線在東京地下鐵新宿站與都營地下鐵新宿西口站間轉乘的話則適用70圓優惠。
是否適用轉乘優惠（○：適用、×：不適用）
都營新宿西口站
新宿站站名來自於江戶時代甲州道中（甲州街道）日本橋與高井戶之間新設的宿驛「內藤新宿」。
1885年（明治18年），日本鐵道開通赤羽 - 品川間路線（現在的山手線）並設新宿站。但是當時的新宿僅是市外小站，1日使用人數僅50人左右，雨天時乘客更為稀少。
1889年（明治22年），開通至立川的路線（現中央本線），同年8月延伸至八王子。當時電車線用的月臺除了原來新宿站月臺，在站內大久保方向的青梅街道附近亦有月臺。
之後私鐵陸續在此設站。1915年（大正4年）京王電氣軌道（現京王電鐵）於南口甲州街道上、1923年（大正12年）帝國電燈西武軌道線（之後的）於東口、1927年（昭和2年）小田原急行鐵道（現小田急電鐵）於西口分別設站。
京王線在新宿的端點原非今日的新宿站，而是在新宿追分交差點，也就是現在的新宿三丁目站位置一帶（伊勢丹交差點南側路上）。之後移往本站站旁並定名為京王新宿站，1945年（昭和20年）因空襲造成初臺變電所毀損，京王線電壓下降無法行駛南口跨線橋的急彎，同年7月再遷至預定地，也就是現在的西口。1952年（昭和27年），西武鐵道的新宿線延伸至現今之西武新宿站（歌舞伎町附近）。
京王與小田急的月臺過去都在地面，月臺編號以國鐵（現JR）→小田急→京王的順序編製。當時各公司之間設有連絡天橋供乘客轉乘。另外，軌距相同的國鐵與小田急之間也設有連絡線。
隨著戰後復甦與經濟成長，出新宿站後立刻行駛於甲州街道上的京王線改為地下化，小田急小田原線也受限於空間限制，為了確保月臺數量而改建為兩層，之後地下鐵各線通車、總站大樓建設等帶動下逐漸形成現在的樣貌。
* 1885年（明治18年）3月1日：日本鐵道在東京府南豐島郡設站。同時開始貨運業務。
* 1889年（明治22年）4月11日：車站開業。
** 10月1日：甲武鐵道依國有化。
** 11月1日：日本鐵道依鐵道國有法國有化。
* 1909年（明治42年）10月12日：制定線路名稱，本站屬山手線。
* 1915年（大正4年）5月1日：京王電氣軌道（京王電鐵前身）車站於甲州街道上開業。
* 1923年（大正12年）12月1日：帝國電燈西武軌道線（之後的都電）車站於東口開業。
* 1927年（昭和2年）4月1日：小田原急行鐵道（小田急電鐵前身）車站開業。
* 1942年（昭和17年）5月1日：戰時合併，小田急電鐵車站成為東京急行電鐵小田原線的車站。
* 1944年（昭和19年）5月31日：戰時合併，京王電氣軌道車站成為東京急行電鐵車站。
** 7月24日：現在的京王電鐵車站移至西口。
* 1948年（昭和23年）6月1日：東京急行電鐵分割，該公司的新宿車站分為京王帝都電鐵（現：京王電鐵）與小田急電鐵車站。
* 1952年（昭和27年）3月25日：西武新宿站開業。
* 1959年（昭和34年）3月15日：營團地下鐵丸之內線車站開業。
** 2月8日：營團地下鐵荻窪線（現在的丸之內線新宿至荻窪路段）通車。
** 12月7日：國鐵甲州口（之後的南口）站房因火災全毀。
** 4月1日：京王帝都電鐵新宿站成為地下車站。
** 12月1日：廢除都電杉並線。
** 12月20日：國鐵甲州口（南口）站房重建。
** 2月17日：小田急電鐵新宿站第1次大改善工程完工。立體式總站地下月臺啟用。
** 5月18日：地上8層、地下3層的國鐵東口站房完工。
* 1966年（昭和41年）11月30日：西口站前廣場完工。
** 8月8日：，1,100班次取消。
** 11月21日：地上14層、地下3層的小田急新宿站大樓完工。
* 1968年（昭和43年）10月21日：爆發新宿騷亂事件。學生運動變得活躍。
** 6月28日：新宿西口反戰民謠游擊戰事件。民謠歌手們以反戰歌曲等表達反對越戰的需求，最高聚集4萬人參與。
** 10月21日：激進派闖入新宿站線路內，爆發。
* 1970年（昭和45年）3月26日：東京都電廢除，新宿的路面電車從此消失。
* 1973年（昭和48年）4月24日：首都圈國電暴動。新宿站內也遭到破壞。
* 1976年（昭和51年）3月10日：國鐵南口站房改建。新宿LUMINE開幕。
** 10月31日：京王帝都電鐵新線新宿站開業。
** 11月17日：國鐵東口站房改建。車站大樓改稱新宿MY CITY（新宿マイシティ，之後）。
** 3月16日：都營地下鐵新宿線車站開業，與京王帝都電鐵直通。
** 4月1日：小田急電鐵新宿站第2次大改善工程完工。地上站、地下站皆可停靠10輛編組列車）。
** 9月1日：國鐵南口大廳拓寬。
* 1984年（昭和59年）2月1日：國鐵車站貨物業務廢除。
* 1986年（昭和61年）3月3日：國鐵埼京線運行區間延伸。使用第1月臺（現1、2號線）。
* 1987年（昭和62年）4月1日：國鐵分割民營化，國鐵車站成為東日本旅客鐵道（JR東日本）車站（屬於山手線）。
* 1991年（平成3年）3月19日：「成田特快」開始運行，使用第2月臺（現3、4號線）。新南口啟用。
* 1993年（平成5年）12月1日：時刻表改點，中央本線中距離列車取消停靠本站。
* 1995年（平成7年）5月5日：本站發生氰化氫氣事件（，奧姆真理教（→阿雷夫）信眾的犯行）。
* 1997年（平成9年）12月19日：都營地下鐵大江戶線車站開業。
* 2000年（平成12年）：入選關東車站百選。
** 3月27日：時刻表改點，新增準特急，為其起訖站。
** 11月18日：IC卡Suica啟用。
** 12月1日：湘南新宿線開始停靠本站。
* 2003年（平成15年）2月1日：因甲州街道跨線橋替換工程，中央線特急月臺移至現在使用的臨時月臺。之前使用的第3月臺動工。
** 4月1日：營團地下鐵民營化，丸之內線車站成為東京地下鐵車站。
** 9月25日：因甲州街道跨線橋替換工程，中央線快速上行月臺移至第3月臺。之前使用的第4月臺動工。
** 3月18日：東武線直通特急「（SPACIA）日光、鬼怒川」開始運行。
** 4月16日：因甲州街道跨線橋替換工程，Southern Terrace口啟用。中央線快速下行月臺移至第4月臺。之前使用的第5月臺動工。
** 3月18日：JR新宿站因中央線快速、特急月臺拓寬，山手線、中央·總武線各站停車的路線編號加2（11 - 14號線→13 - 16號線）。
** 4月15日：因甲州街道跨線橋替換工程，中央線快速下行月臺移至第5月臺（11、12號線）。之前使用的第4月臺（9、10號線）動工。
** 11月25日：因甲州街道跨線橋替換工程，中央線特急月臺從臨時月臺移至第4月臺。
* 2008年（平成20年）3月15日：時刻表改點，「成田特快」與東武線直通特急等停靠月臺從第2月臺移至臨時月臺。
* 2010年（平成22年）11月28日：因甲州街道跨線橋替換工程，新南口搬遷。
** 9月2日：相模鐵道車輛首次駛入本站（與JR實施相互直通運轉試營運）。
** 11月30日：與相鐵線開始直通運轉。基本上列車從本站起訖，但部分電車直通往埼京線武藏浦和、大宮方向。
**2月25日：新南口剪票口外的VIEW PLAZA結束營業。
**7月19日：東西自由通道開放通行。
新宿站位於東京都新宿區新宿三丁目至西新宿一丁目、及澀谷區代代木二丁目至千駄谷五丁目的範圍。
JR之車站出口分為西口、東口、南口等各方向。西口和東口都有幾個通路。亦有地下道連接廣大范圍。
山手線月臺的擁擠情況
JR東日本站區共有8座島式月臺16線，均位於地面。月臺沿南北兩方延伸，而編號則從東邊的埼京線、湘南新宿線開始往西依序排列。其中1至6號月臺位於較南方的位置，特別是5、6號線月臺的最北側與7、8號線最南側位置幾乎相同，月臺幾乎全屬甲州街道（國道20號）南側的澀谷區。而5、6號月臺更與南邊的代代木站相隔只有約200米，兩站的月臺甚至能聽到對方的發車廣播。
站區內共有4條換乘通道，分別是稱作「北通道」、「中央通道」的地下道、南口天橋、與JR新宿MIRAINA TOWER、Busta新宿連結的天橋（舊新南口、舊Southern Terrace口）。
新南口開業初期時，換乘通道只連接1至6號月臺。其後於2006年4月16日Southern Terrace口開設之後，該處新增一條換乘通道與新南口的通道連接，才可到達其他月臺。
現在JR東日本正改善新宿站的設施，原因有以下數點：
* 東西向的甲州街道天橋（新宿天橋）已經開始老化，為了解決交通阻塞，需要另建一條跨線橋代替。而有關工程需要預留土地，因此需要更改部分軌道配置。
* 規劃新建5、6號月臺時，將車站的保養基地及中線、橫渡線等設施集中化，令站內不少道岔可以被廢除。其中有關中央線快速的道岔已於2007年（平成19年）4月15日的工程後被廢除。至於其他改善工程，例如改善1－4號月臺往池袋方向的軌道配置等也在計畫中，原先預定在中央線特急月臺移設前實施，但已為了工程時程的安排而延後。
# 之前1－6號月臺與7－16號線月臺需要轉乘時間，但在2006年（平成18年）4月15日的工程後已大幅改善。
* 在搬遷月臺前，中央線下行特急列車均使用5、6號月臺，進入新宿站時需要橫過與快速線上行軌道（上行線使用7、8號月臺），形成一個瓶頸。其後特急專用月臺於2007年（平成19年）11月25日遷至快速線上下行月臺中間的9、10號月臺，問題才得到解決。
改良工程完成後，新南剪票口、甲州街道剪票口與MIRAINA TOWER剪票口上將建造設有計程車與高速巴士乘車處（Busta新宿）與車站大樓（JR新宿MIRAINA TOWER）、人工綠地。南口一帶的工程已在2016年（平成28年）度完成。
本站由管轄，為『シク』。
山手線與中央、總武線各站停車的是在埼京線開業前就已設置，外觀老舊。
2007年（平成19年）5月起，各閘門前裝設螢幕顯示東京近郊系統路線運行狀況。
+JR新宿站月臺
JS 湘南新宿線
橫濱、大船、小田原、逗子方向
JA 埼京線
澀谷、大崎、臨海線、相鐵線方向
池袋、大宮、川越方向
只限此站始發
澀谷、大崎、相鐵線方向
17時以後只限此站始發
此站始發的列車（有一部分大崎方向開抵的列車）
大崎方向開抵的列車（有一部分此站始發）
大宮、宇都宮、高崎方向
成田機場方向
其他「Swallow赤城」「（Saphir）踴子」「」到發
TN 東武線直通（特急）
東武日光、鬼怒川溫泉方向「（SPACIA）日光、么怒川」
JC 中央線（快速）
御茶之水、東京方向特急「梓」「甲斐路」
7號月臺只限一部分列車
中央本線（特急）
甲府、松本方向「梓」「甲斐路」「富士回遊」「八王子」「青梅」
中野、立川、高尾方向
11號月臺只限一部分列車
JB 中央·總武線（各站停車）
水道橋、秋葉原、千葉方向
原宿、澀谷、品川方向
池袋、田端、上野方向
東中野、中野、三鷹方向
JR Shinjuku Station Platform 1?2.jpg|1、2號月臺（埼京線、湘南新宿線）（2019年9月）
JR Shinjuku Station Platform 3?4.jpg|3、4號月臺（埼京線、湘南新宿線）（2019年9月）
JR Shinjuku Station Platform 5?6.jpg|5、6號月臺（成田特快、東武線）（2019年9月）
JR Shinjuku Station Platform 7?8.jpg|7、8號月臺（中央快速線）（2019年9月）
JR Shinjuku Station Platform 9?10.jpg|9、10號月臺（中央本線特急）（2019年9月）
JR Shinjuku Station Platform 11?12.jpg|11、12號月臺（中央快速線）（2019年9月）
JR Shinjuku Station Platform 13?14.jpg|13、14號月臺（中央·總武線、山手線）（2019年9月）
JR Shinjuku Station Platform 15?16.jpg|15、16號月臺（中央·總武線、山手線）（2019年9月）
各線北行方向的列車為下行，南行方向的列車為上行。也有稱作內回與南行的路線（山手線與中央緩行線、湘南新宿線），但在線路名稱上都統一為上行、下行方向。
2號線月臺的方向標識上沒有註明湘南新宿線，但該線有部分本站始發的班次在該月臺發車。
2008年（平成20年）3月15日改點起，取消1號線發車的埼京線下行列車，進行線路替換工程，1號線往池袋方向折返的出發信號機與轉轍器也被拆除。但是2009年（平成21年）11月7日將1、2號線恢復剪式轉轍器構造，重新設置出發信號機，1號線可折返大宮方向。2010年（平成22年）3月13日改點正式恢復1號線發車的埼京線下行列車。
埼京線大宮方向的本站折返列車主要使用3號線，部分使用1、2、4號線。2020年1月6日起，為減緩月臺人潮，17時以後的本站始發列車改至2號線發車。相鐵線直通的本站折返列車基本上使用2號線，大宮方向直通列車使用1號線，但也有部分列車使用2號線。但在2020年1月6日以後，17時以後的列車在3號線發車。在部分時段，埼京線新宿起訖列車與相鐵、JR直通線海老名起訖列車可在對面月臺轉乘。
過去，湘南新宿線南行往橫須賀線方向使用橫須賀線的路線色（藍色）（與赤羽、池袋、澀谷、惠比壽、大崎等站相同）。在2004年（平成16年）10月16日改點後，2008年（平成20年）3月15日現在南行（1號線）與北行（4號線）皆用橘色藍色並列表示。誤點時，本站始發的湘南新宿線常在2、3號線發車。由於5、6號線也可停靠15輛編組，包含埼京線在內的全列車進行折返運轉等情形導致1至4號線不敷使用時，湘南新宿線會改用5號線。
相鐵·JR直通線（相鐵線直通）列車在1、2（17時以後在3）號線發車。誤點時會使用5、6號線。列車資訊顯示器基本上與埼京線南行共用，但部分區域有相鐵線直通專用的列車資訊顯示器。
5、6號線北側設有電扶梯。7、8號線南口天橋下也設有電扶梯與電梯方便前往5、6號線。
7、8號線（中央線快速上行）往東京方向基本上全日使用8號線，平日早晨尖峰時刻（7 - 9點）往東京方向班次在7號線與8號線交互發車，各列車因應本站大量乘客而延長停靠時間。本月臺往東京的列車，除特急、Liner以外的全列車依四谷、御茶之水、神田、東京的順序停車，因此到站列車全部顯示「快速 東京」。7號線有往東京、千葉的「梓號」、「甲斐路」、終停的「超級梓號」、「梓號」與往東京的橙色列車使用。止於本站的「超級梓號」、「梓號」、「甲斐路」停靠7號線後回送至東京站，再變為東京始發的「甲斐路」、「中央Liner」、「青梅Liner」執行載客服務。
9、10號線特急月臺的站名標在上行方向沒有箭頭與上一站站名（但這不代表沒有來自東京方向的中距離列車。）。下行鄰站方面，特急「甲斐路」的下一站表記為三鷹。
7號線側與11號線（舊9號線）側方向標的背景色在以前使用藍色，註記「中央本線（普通）　大月、甲府方向」（之後無註記），但在湘南新宿線登場後改為與快速相同的橘色。現在7號線的方向標仍無註記，但11號線方向標註記已與12號線相同。以前與9、10號線特急月臺一樣，下行的鄰站顯示三鷹。三鷹是特急與（現在僅臨時運行）中距離列車（中電）的下一站。而上行則與快速一樣註記四谷。現在上下行與快速一樣，下行的鄰站顯示中野，上行的鄰站顯示四谷。但現在樓梯附近的顏色仍同時使用中距離的藍色與快速的橘色。
現在新宿站中距離列車（停靠特急月臺除外）原則上為上行停靠7號線，下行停靠7、11號線，不使用8、12號線（不包含高尾以西作為中距離列車運行的快速班次。）。
11、12號線（中央線快速下行）月臺，下行電車基本上使用12號線。平日早晨8 - 9點後半與傍晚18 - 19點與11號線交互發車。相較其他月臺，本月臺寬度較窄。因此誤點時與周五等假日前夕的夜晚返家尖峰時段，月臺上擠滿等待列車的旅客，加上停靠12號線的列車有大量旅客下車，十分危險。
13、14號線與15、16號線採用方向別配線，方便同一方向列車轉乘。
另外，上表中未有顯示的列車班次，則在下表顯示開出的月臺：
部分列車（本站始發）
橫濱、大船、逗子方向
部分列車大船站直通JO 橫須賀線
高崎、前橋方向
大宮站直通高崎線
大船站直通JT 東海道線
特急「（超景）踴子」
熱海、伊東、伊豆急下田方向
特急「新宿若潮」特急「」
千葉、安房鴨川、館山方向
特急「梓號」、「」
東京、千葉方向
「假日快速奧多摩、秋川」部分列車
往奧多摩、武藏五日市
立川站直通JC 青梅線、 JC 五日市線
「中央Liner、青梅Liner」
往高尾（八王子）、青梅
立川站直通JC 青梅線（青梅方向列車）
特急「（超級）梓號」
超級梓號6號、梓號8號
臨時夜行快速「」
「（奧多摩、秋川、富士山、VIEW山梨）」、臨時特急
奧多摩、武藏五日市、小淵澤、河口湖方向
2008年（平成20年）3月15日訂正時刻表，取消1號月臺的埼京線下行列車。之後進行線路切換工程，並移除1號月臺往池袋方向折返所需的出站信號機與轉轍器。但2009年（平成21年）11月7日，1、2號月臺恢復剪式橫渡線，並重設出站信號機，1號月臺可折返大宮方向。2010年（平成22年）3月13日訂正時刻表，恢復1號月臺的埼京線下行列車。
以下提供JR在新宿車站月臺的使用狀況。
第1月臺（現1、2號月臺）
第2月臺（現3、4號月臺）
臨時月臺（現5、6號月臺）
第3月臺（現7、8號月臺）
第4月臺（現9、10號月臺）
第5月臺（現11、12號月臺）
第6月臺（現13、14號月臺）
第7月臺（現15、16號月臺）
- 1986年（昭和61年）3月2日
1、2號月臺中央線特急
3、4號月臺中央線快速（上）
5、6號月臺中央線快速（下）
7、8號月臺中央·總武線各停（東）山手線（內）
9、10號月臺山手線（外）中央·總武線各停（西）
1986年（昭和61年）3月3日 -
1、2號月臺埼京線
3、4號月臺中央線特急
5、6號月臺中央線快速（上）
7、8號月臺中央線快速（下）
9、10號月臺中央·總武線各停（東）山手線（內）
11、12號月臺山手線（外）中央·總武線各停（西）
1991年（平成3年）3月19日 -
3、4號月臺成田特快
5、6號月臺中央線特急
7、8號月臺中央線快速（上）
9、10號月臺中央線快速（下）
11、12號月臺中央·總武線各停（東）山手線（內）
13、14號月臺山手線（外）中央·總武線各停（西）
1995年（平成7年）12月1日 -
3、4號月臺埼京線宇都宮線·高崎線成田特快
2001年（平成13年）12月1日 -
1、2號月臺埼京線湘南新宿線
3、4號月臺埼京線湘南新宿線■成田特快
2003年（平成15年）2月1日 -
2004年（平成16年）9月25日 -
2006年（平成18年）3月18日 -
3、4號月臺埼京線湘南新宿線東武線直通特急成田特快
2006年（平成18年）4月16日 -
2007年（平成19年）3月18日 -
13、14號月臺中央·總武線各停（東）山手線（內）
15、16號月臺山手線（外）中央·總武線各停（西）
2007年（平成19年）4月15日 -
11、12號月臺中央線快速（下）
2007年（平成19年）11月25日 -
5、6號月臺部分列車
9、10號月臺中央線特急
2008年（平成20年）3月15日 -
3、4號月臺埼京線湘南新宿線
5、6號月臺東武線直通特急成田特快
1986年（昭和61年）埼京線延伸至本站，在現在的1、2號線的位置增加一座1面2線的月臺。當時國鐵以「線從距離站長室最近（本站為東側）的開始編號」為方針對原有月臺重新編號。
1991年（平成3年），成田特快開始運行，因本站為始發站，新設第2月臺（現3、4號線）。之後中央線特急月臺進行改良工程，2003年將其機能（平成15年）移至代代木側的新設臨時月臺（現5、6號線），進行改良工程的第3月臺在2004年（平成16年）起由中央線快速上行使用（現7、8號線），同時在此之前中央線快速上行使用的第4月臺動工。該月臺在2006年（平成18年）4月16日起由中央線快速下行使用（新9、10號線），原來中央快速下行使用的第5月臺（舊9、10號線）開工，2007年（平成19年）4月15日再由中央線快速下行使用該月臺的新11、12號線。第4月臺重新動工後，同年11月25日起成為中央線特急月臺。另外，原先中央線特急使用的5、6號線改停靠「」與部分「梓號」終停班次、「」全列車、高崎線及宇都宮線方向特急與Liner等。2008年（平成20年）3月15日時刻表改點後，「成田特快」全列車，東海道、高崎、宇都宮線方向Liner與特急多輛列車停靠該月臺。
湘南新宿線登場時，相對於不能停靠15輛編組的1、2號線，3、4號線是之前就停靠成田特快與東海道線、宇都宮線、高崎線直通特急列車與宇都宮線、高崎線直通普通列車，可對應15輛編組。因此，1、2號線就作為埼京線的專用月臺，湘南新宿線在3、4號線發車。但是3、4號線由於有前述各列車與惠比壽方向的埼京線使用，難以增班。加上南行列車也在4號線發車，造成同一月臺人潮擁擠混亂。因此，1、2號線也改建為對應15輛編組以供湘南新宿線使用。2008年（平成20年）3月15日，南行的湘南新宿線與南行的埼京線在1號線，新宿折返的埼京線在2、3號線，北行的湘南新宿線與北行的埼京線在4號線。
由舊有連結7 - 16號線北端的東西向地下通道北通道寬17米擴建至25米形式，通道兩端設置的東口閘口（→東閘口）、西口閘口（→西閘口）移動至通道南側，將既有的通道變成自由通道，2020年7月19日啟用。自由通道啟用後，此站東口、西口間的移動不再需要迂回途經南側的甲州街道與北側的Metro Promenade（地下街）、角筈Guard、大Guard（靖國通），方便乘客。
東端的東口可至地下1番街。西端的西口可至新宿店，西口地下廣場可通往巴士總站。雖然剪票口在地下，但地面設有綠色窗口。東口還有通往中央通道的地下通道，稱作「阿爾卑斯廣場」。該廣場除了7、8號線用的電扶梯與廁所外，還有。
15?16號線往北通道僅有往下的電扶梯。
SuiPo（Suica連動型廣告）設在東口附近。
JRE-Shinjuku-STA East-Gate.jpg|東口剪票口（2021年）
JRE-Shinjuku-STA West-Gate.jpg|西口剪票口（2021年）
Shinjuku Station 200719b.jpg|東西自由通道（2020年7月）
1 - 6號線北側與7 - 16號線中央的東西向連絡地下通道。東端的中央東口可通往LUMINE EAST新宿地下1番街南端。與東口連通，自動售票機也與北通道共通。由於5、6號線月臺距離較遠，設有地下通道連結。
中央東口剪票口鄰接京王線及小田急線剪票口，皆由JR東日本執行剪票口業務。這裡也有京王線與小田急線的票價表與自動售票機。經由JR付費區內（中央通道）的轉乘剪票口可至京王與小田急的付費區。若要在中央通道使用Suica、PASMO搭乘京王線與小田急線，必須經由中央東口剪票口入站（反之亦然）。京王線、小田急線售票機不能進行Suica、PASMO的儲值，只能在JR線的售票機進行。另外，京王線、小田急線售票機也不能使用Suica、PASMO。
西端的中央西口剪票口有5處。地下道所見的最左邊與右邊第二個是小田急線連絡口，最右邊是出口專用剪票口。出口專用剪票口外可通往小田急百貨店新宿店地下與西口地下廣場。兩個小田急線連絡口之間是往京王線連絡口的通道。其通道右邊是京王線連絡口，左邊是出入口兼用的JR中央西口（通稱京王口）剪票口，可通至地下入口與南區、方向。京王口由京王執行剪票業務。
廁所在JR中央東口向外的右側與北通道連接的阿爾卑斯廣場。
7 - 14號線各月臺與中央通道間有電扶梯，7、8號線與中央通道之間有電梯。9、10號線月臺在與7、8號線月臺相同位置保留有未來增建電扶梯的空間。
中央東口附近的列車資訊顯示器是比一般還小的樣式。
JR Shinjuku Station Central East Gates (20210410).jpg|中央東口剪票口（2021年）
JR Shinjuku Station Central West Gates (Keio Entrance) (20210410).jpg|中央西口（京王口）剪票口（2021年）
JR Shinjuku Station Central West Gates.jpg|中央西口剪票口（2021年）
Shinjuku Station JR?Odakyu Transfer Gates (Central West).jpg|JR·小田急聯絡剪票口（中央西口，2021年）
Shinjuku Station JR?Keio Transfer Gates.jpg|JR·京王聯絡剪票口（2021年）
1、2號線中央，3、4號線北側，7 - 16號線南側的東西向聯絡天橋。其上方是新宿LUMINE2。南邊的南口剪票口與甲州街道天橋直通。西端是小田急線連絡口。3、4號線與7、8號線之間有直通新宿LUMINE2的LUMINE口，東端是東南口。東南口剪票口的營業時間是6 - 24時。天橋有Doutor。出剪票口往右可至小田急線剪票口、小田急百貨店新宿店、新宿店。
廁所靠近LUMINE口。
全部月臺皆有電梯與電扶梯（5、6號線除外，須由地下通道前往7、8號線。）。13 - 16號線的電扶梯只有往上方向。
13 - 16號線在2006年（平成18年）4月16日因配合新南口天橋伸將月臺往南延伸以連接新南口與Southern Terrace口，縮減原來月臺南端的階梯（原先位於尾端，因此全部月臺都作為階梯使用，但往南延伸須確保行人空間因此縮減階梯寬度）。
JR Shinjuku Station South Gates (20210410).jpg|南口剪票口（2021年）
JR Shinjuku Station South East Gates (20210410).jpg|東南口剪票口（2021年）
Shinjuku Station JR?Odakyu Transfer Gates.jpg|JR·小田急聯絡剪票口（南口，2019年9月）
1 - 6號線中央與7 - 16番線南端連通的天橋，是Busta新宿的最下層，相當於2樓。
北側東西通道西端有廁所，其東側是甲州街道剪票口（舊Southern Terrace口。7、8號線電扶梯的位置）。東西通道東端是MIRAINA TOWER剪票口。由於MIRAINA TOWER的位置，1、2號線僅有電扶梯直通剪票口，另有階梯專用通道供1、2號線使用。甲州街道檢票口亦有通道往南延伸，其南端為新南剪票口（舊新南口）。
北側的東西通道有往7 - 16號線的樓梯與電扶梯。
甲州街道剪票口直通甲州街道。新南剪票口靠近高島屋時代廣場。MIRAINA TOWER剪票口面向與站房直通的JR新宿MIRAINA TOWER出入口。
天橋於1991年（平成3年）3月19日開設，當時僅有1 - 4號線可使用，東端有舊新南口。廁所在剪票口外。
2003年（平成15年）2月1日，由於新設5、6號線，西側也增設電扶梯、樓梯連結新月臺。
2006年（平成18年）4月16日，天橋繼續延伸並設置「Southern Terrace口」。同日起7 - 14號線（現7 - 16號線）可直通天橋。
2010年（平成22年）11月28日，中央通道延伸，設置新南口，5、6號月臺皆梯與電扶梯遷移，設置廁所，關閉東端的舊新南口。
2011年（平成23年）2月27日，3、4號線月臺樓梯遷移，與5、6號線月臺同位置。
2012年（平成24年），1、2號線樓梯遷移。
2013年（平成23年），Southern Terrace口搬至新南口對面，7、8號線月臺與9、10號線月臺階梯之間。廁所設於舊Southern Terrace口剪票口正面的13-16號線樓梯旁。
2016年3月7日，1、2號線側（近舊新南口）新設MIRAINA TOWER剪票口，同時新南口改稱新南剪票口、Southern Terrace口改稱甲州街道剪票口。
2016年4月15日，上層與MIRAINA TOWER內的站內商店街NEWoMan開幕。
Shinjuku Station New South Concourse 2018.jpg|Busta新宿、JR新宿剪票口（2018年5月）
Suica's Penguin Park 2018.jpg|Suica的企鵝廣場（2018年5月）
JR Shinjuku Station Koshu-kaido Gates.jpg|甲州街道剪票口（2019年9月）
JR Shinjuku Station MIRAINA TOWER Gates.jpg|MIRAINA TOWER剪票口（2019年9月）
JR Shinjuku Station New South Gates.jpg|新南剪票口（2019年9月）
;舊新南口、Southern Terrace口天橋
File:Shinjuku station Southern-terrace entrance.jpg|舊Southern Terrace口（2007年8月7日）
File:Shinjuku Station-2008.02.02 1.jpg|舊Southern Terrace口（2008年1月27日）
File:Shinjuku station New-south entrance.jpg|舊新南口（2007年8月7日，2010年11月27日結束營業）
JR東日本在過去委託山葉進行發車音樂播放系統的開發，並於1989年（平成元年）3月11日由本站與澀谷站首次引入，之後擴展至其他車站。
1997年（平成9年）11月29日，3、4號線改採用制作的樂曲。2001年（平成13年）12月16日，隨著1、2號線更換發車音樂，全部月臺更新完成。
現在的發車音樂
由制作，并且已經投入使用。
mellow time
すすきの高原
小川のせせらぎ
木々の目覚め
File:Shinjuku Station Tokyo 2015.jpg|站內通道（2015年6月24日）
File:NTT DoCoMo Yoyogi Building from Shinjuku Station platforms - dec 22 2015.jpg|傍晚的月臺人潮（2015年12月22日）
File:Shinjuku Station Sign (Yamanote Line).jpg|山手線站名牌（2015年9月15日）
為了與新線新宿站區別，旅客導覽多寫作京王線新宿站。
月臺為3面3線頭端式，位於小田急線的西鄰、位置相當於新宿店地下2樓與新宿LUMINE1地下3樓。站內路線為南北向，出站後會轉向西行。東側起為1 - 3號線，除1號線外皆是兩側有月臺的配置。3個月臺中，中央的月臺是下車專用。3號線乘車月臺北側有無障礙廁所。
本站是管區長所在站，管理新宿管區本站與新線新宿站。
本站發車的所有列車皆不停靠初臺站與幡谷站。要到這兩站可搭乘京王新線。另外，本站末班車是0時30分發車的各停往若葉臺，而新線新宿站更晚還有往杜鵑丘與往櫻上水的末班車。因此，在末班車時段，站員會宣達「末班車在新線車站!」。京王兩班首班車（往高尾山口）也在新線新宿站發車。
1963年（昭和38年）完成當時，月臺是對應18公尺級車輛6輛編組的頭端式月臺5面4線構造，由於西口地下廣場下有西口停車場等設施，月臺無法往頭端方向延伸，因此之後的月臺延伸工程須關閉或移動部分月臺與線路。1968年（昭和43年）7輛對應工程時，月臺往京王八王子方向延伸，1975年（昭和50年）20公尺級車輛8輛編組對應工程時，4號線乘車月臺、下車月臺（不同於現在的新線新宿站4號線）與線路關閉，成為4面3線構造，1982年（昭和57年）改建為10輛編成對應時，撤除1號線下車月臺（當時）並移動線路，且在京王八王子方向設置剪式橫渡線，形成現在的3面3線構造。
2011年（平成23年）2月8日，京王電鐵宣布本站加建月臺門。2011年（平成23年）度開工，2012年（平成24年）度3號線完工，2013年（平成25年）度1號線與2號線陸續啟用。
明大前、調布、京王多摩中心、橋本、京王八王子、高尾山口方向
特急、準特急、急行、區間急行、快速、各站停車
特急、準特急、急行、區間急行
* 午間時段1號線列車為各停往京王八王子，各停往高尾山口，2號線列車為準特急往橋本，3號線列車為準特急往京王八王子與特急往高尾山口（假日不同）。往府中方向的特急在明大前站可與京王新線往橋本的區間急行轉乘，往府中方向的準特急可在笹塚站與往橋本的快速轉乘。
* 由於是複線區間，2線同時運行的狀態十分頻繁。這是由於第2出發信號機位於剪式橫渡線前方，因此可以作此調度。誤點時，1號線或2號線與3號線可同時發車。相對的，往1號線或2號線的列車上未完全到站時3號線的特急與準特急就可先行發車。
京王線剪票口都在地下。本站雖是大手私鐵總站常使用的頭端式月臺構造，但與其他車站不同，剪票口不在月臺正面。從頭端部上樓可至往西口地下廣場的出口專用廣場口剪票口。另外從其他樓梯還有早晨尖峰時刻專用的出口專用臨時口剪票口（僅7:10 - 9:00開放，出口往C&C新宿本店前。）。
中央樓梯往上後可分為北側的京王西口（桃紅色）、南側的京王百貨店口（深藍色），兩者使用不同顏色以作區別。這兩色也是京王線內的方向色，止衝擋方向的西口代表色桃紅色代表上行，笹塚站側京王百貨店口代表色深藍色代表下行。京王百貨店口鄰接JR中央西口剪票口，東鄰有JR連絡口與往中央東口的中間剪票口（自動驗票閘門為黃色）。
南側樓梯往上是LUMINE口剪票口，可通往新宿LUMINE1地下2樓。樓梯往上出建物後可前往小田急南口。
3番線南端有樓梯往新線新宿站。
廁所在3號線乘車月臺北側。
電梯連結京王西口、京王百貨店口層與3號線乘車月臺。另外，京王百貨店口附近的地下通道與地上亦有電梯。
電扶梯方面，各乘車月臺北側有往京王西口、京王百貨店口層的電扶梯，南側有往LUMINE口的電扶梯。北側各月臺皆是雙向配置（但是早晨尖峰時刻3號線乘車月臺兩座電梯皆往剪票口層。），南側各月臺有一座電梯往往剪票口層，依據時段單向運轉。
剪票口層的列車資訊看板顯示下5班列車的發車時刻、種別、目的地、月臺、備註。雖然京王全部車站都相同，但本站種別表示與其他站不同，是採用全彩顯示。
下車專用月臺的列車接近裝置是少見的顯示「請注意電車」（電車にご注意ください）。
File:Shinjuku Station （Keio）.JPG|京王線剪票口（2012年1月31日）
File:KEIO-Shinjuku Station-Keio Department Store gate wicket 20150425.jpg|京王百貨店口（2015年4月25日）
File:Shinjuku-Sta-Keio-Concourse.JPG|大廳（2016年6月18日）
File:Shinjuku-Sta-Keio-Platform.JPG|京王線月臺（2016年6月18日）
File:Keio Shinjuku.jpg|2020年3月起使用的發車標。以前的LED型發車標已拆去。
大江戶線站區位於京王新線、都營新宿線站區南側，副站名是「京王百貨店前」。月臺位於地下7樓，為島式月臺1面2線設計，月臺往南北方向延伸。
本站的月臺及軌道為鑽挖隧道，而大堂及出入口則以明挖回填方法興建。
由於本站不設過渡線，列車不能切換軌道。因此當1997年（平成9年）12月19日練馬站延伸至本站時，都廳前至本站區間是以雙單線方式運行。至2000年（平成12年）4月20日，本站至國立競技場站通車後才改用現時的複線運行方式。
E 大江戶線
六本木、大門、門前仲町方向
都廳前、光丘、（都廳前轉乘）飯田橋方向
（來源： 都營地下鐵:車站構內圖 ）
Shinjuku Station-4.jpg|6號月臺（2018年4月7日攝）
Shinjuku Station-5.jpg|7號月臺（2018年4月7日攝）
Oedo-Shnjuku-Sta-Platform.JPG|月臺（2010年4月）
月臺北側的樓梯與電扶梯至地下1樓為剪票口B，面向京王新線口。其付費區內南側的電扶梯可至地下4樓前往都營新宿線與京王新線月臺。
月臺中央的樓梯或月臺端（六本木方向）的電梯至地下3樓為剪票口C，可前往等。亦有電梯往地面層，可前往新宿燦路都廣場大飯店。
此外，從站外前往大江戶線月臺，除了剪票口B，從京王新線口付費區前往地下4層的「大江戶線連絡通道」也能到達。
大江戶線單獨剪票口的售票機雖也販賣京王線的乘車券，但機器都是都營樣式，與京王線（含新線）不同。都營剪票口可使用京王線售票機的入場券，但都營精算券不能出京王剪票口（反之可通過）。
廁所在地下4樓。電梯連結月臺（地下7樓） - 地下4樓 - 剪票口C層。
File:Shinjuku-Sta-Toei-Mayndstower-District-Gate.JPG|MAYNDS TOWER方向出口（2016年6月）
位於JR新宿站的西側，樓上是新宿店本館與新宿。本站是小田原線的起點，以及小田急電鐵東京側總站。是管區長、站長所在站，管理新宿管區新宿 - 代代木上原站區間。
1964年完成現在的地上4面3線與地下3面2線雙層構造。各層北端是頭端式月臺，列車在南側發車。地上東側起為1 - 6號月臺（1 - 3號線）、地下東側起為7 - 10號月臺（4、5號線），1、2號月臺（1號線），……，9、10號月臺（5號線）皆使用相同線路。2、3號月臺與7號月臺，4、5號月臺與8、9號月臺，6號月臺與1號月臺有階梯與電梯通往南口剪票口（2、3號月臺也設有電扶梯）。
3、4號月臺是浪漫特快與急行、準急等列車使用。浪漫特快到站時的自動廣播只在3號月臺，急行、準急在4號月臺側。但在特急列車發車時，為提醒4號月臺行人注意，會由站員廣播「特急列車發車」。
1996年2月，地上、地下月臺、各大廳的列車資訊顯示器更換為三色LED樣式。
1號月臺因長期作為下車專用月臺，設有候車空間，除了分散2號月臺乘客人潮外，也是拍攝列車入站的場地之一，之後因安全與旅客狀況變化等因素於2005年～2006年停止使用。現在上下車皆整合至2號月臺，該空間已用柵欄圍起，僅有小田急相關人士才可進入。
2007年1月，地上、地下月臺、各大廳的列車資訊顯示器更換為全彩LED樣式。
地上4、5號月臺在2012年（平成24年）9月2日完成可動式月臺門的設置，並於9月30日啟用。
基本上地下月臺以6、8輛編組（各站停車）、地上月臺以浪漫特快與10輛編組（急行、快速急行、準急）作為始發列車。而列車到達本站時則從最內側（最靠近西口地上／地下剪票口）開始停車。
上下車雖然使用不同月臺，但早晨尖峰時刻也有在同一月臺上下車的班次存在。由於現在甲州街道天橋替換工程，浪漫特快下車月臺停止使用。因此，浪漫特快列車在乘客下車後會進行車廂清掃與檢查，之後在同月臺登車。
地上月臺的下一站是代代木上原。這裡出發的列車有浪漫特快、快速急行、急行、準急，除浪漫特快以外所有車種皆停靠該站。而地下月臺的下一站是各站停車的南新宿。
月臺看板僅表記月臺編號與車種（或下車專用），未寫明停靠站名。
地上線與地下線的分岐點（會合點）在都道四谷角筈線平交道附近。
（使用停止中）
小田原、箱根湯本、藤澤、片瀨江之島方向
特急浪漫特快
特急浪漫特快（4號月臺到站列車的下車月臺）
快速急行、急行、準急
（5號月臺到站列車的下車月臺）
（8號月臺到站列車的下車月臺）
新松田、唐木田方向
（9號月臺到站列車的下車月臺）
夜間，5、6號月臺會停靠10節編成列車，9、10號月臺停靠8節編成列車。
各層頭端部有西口地上剪票口與西口地下剪票口。西口地下剪票口東邊是往JR的中央地下連絡口與往中央東口的中間剪票口（閘門為黃色）。
地上月臺南側有天橋連結。天橋南側是南口，鄰接JR南口。其東側有往JR的南口連絡口。
廁所在西口地下剪票口內與南口剪票口內（面相出口閘門的左側，付費區內）。多功能廁所在西口地下剪票口外與南口剪票口內。西口地下剪票口外的廁所沒有一般用的西式馬桶。
付費區內的電梯連結南口付費區與各月臺。剪票口外的電梯在剪票口外右側的小田急百貨店。2、3號月臺往南口剪票口有單向電扶梯。
4、5號月臺從後方（西口地上剪票口側）數來4、5輛車之間（10輛編組時為6、7號車之間）有分割看板A表示分割後的列車種別與目的地。
本站發車時會響發車鈴。
2006年（平成18年）3月31日，西口地上剪票口旁的1、2號月臺頭端部開設「小田急浪漫特快咖啡廳」（ロマンスカーカフェ）。西口地下剪票口7、8號月臺前有連鎖果汁吧「OASIS Sta.」（オアシスステーション，新宿店）。
File:OER Shinjuku station South.jpg|南口剪票口（2007年11月2日）
File:Shinjuku-Sta-Odakyu-West-Ground-Gate.JPG|西口地上剪票口（2016年6月18日）
File:OER Shinjuku station West Underground.jpg|西口地下剪票口（2007年11月2日）
File:Odakyu_Shunjuku_Sta_Information_Board.jpg|地上月臺發車看板（4、5號月臺）（2007年7月）
File:Odakyu Shinjuku Station 2016-10-07 (30025727194).jpg|站內指標（2016年11月7日）
File:Shinjuku-Sta-Odakyu-1F-Platform.JPG|地上月臺（2016年6月）
File:Shinjuku-Sta-Odakyu-B1-Platform.JPG|地下月臺（2016年6月）
File:Odakyu 3000 series (2nd gen) at Shinjuku Station 2016-10-07 (30025717814).jpg|10號月臺末端（2016年11月7日）
File:Odakyu-electric-railway-Odawara-line-Shinjuku-station-sign-20130517-134814.jpg|站名牌（2013年5月17日）
File:OER Odawara Line Shinjuku Terminal.jpg|地上線與地下線的分岔點。
位於JR新宿站的北側附近到新宿通的地下2層，採東西向1面2線的島式月臺設計。西新宿方向有拖上線，提供本站始發、終停的列車使用。
車站鄰接JR、京王、小田急車站與新宿西口站（都營地下鐵大江戶線）、西武新宿站（西武新宿線）。但不鄰接都營地下鐵新宿線、都營地下鐵大江戶線新宿站。
本站是站務管區所在站，管理新宿站務管區新宿地域、荻窪地域、四谷地域、中野坂上地域。
M 丸之內線
西新宿、中野坂上、荻窪、方南町方向
赤坂見附、銀座、大手町、池袋方向
（來源： 東京地下鐵:構內圖 ）
1號線的進站廣播可聽見「往中野富士見町、方南町方向請在中野坂上轉乘」。
都營地下鐵大江戶線新宿西口站開業後，廣播增加「新宿西口站接都營大江戶線請在本站轉乘」。
2006年（平成18年）10月，本站設置可動式月臺門，並移動發車蜂鳴器至線路側。2008年（平成20年）6月啟用發車音樂。
月臺東西兩側皆有往地下1樓的樓梯，分別有剪票口。剪票口外是自由通道往東可至新宿三丁目站。東側剪票口近JR東口與，西側剪票口可前往JR、京王線、小田急線的西口、西口地下廣場與巴士總站。東側剪票口附近與西側剪票口附近在早晨深夜時段無法通行。
東側有電梯與電扶梯連結剪票口層與月臺層，但電扶梯只有單向往剪票口層。
付費區外有兩處廁所。
Shinjuku Station, Marunouchi Line200505-1.jpg|設置月臺門前的月臺（2005年5月）
2017年度各公司1日平均上下車人次總計約353萬人，其使用人數是世界第一。但該值包含了京王新線、都營新宿線之間的相互直通人次，與都營地下鐵線之間的轉乘人次。比起開業當初的1日平均乘車人次僅36人相比增長了約5萬倍。