ticoAg/ChineseCorpus-Kaggle-fanti huggingface dataset:
轉譯開始時，核糖體的一個小單位與的起始密碼子結合，而細胞中的氨基酸被激活，和結合，而將氨基酸帶至核糖體。的起始密碼子標志著上蛋白質的信息的開始位置。一般起始密碼子的順序是，不過在原核生物中有不少其它的碼。細菌的蛋白質以一個改變了的''N''-甲酰甲硫氨酸開始。在甲酰甲硫氨酰中，胺基被一個甲酰代替而形成了一個酰胺，這個改變使得這個碼無法與一個氨基酸相結合，但這不是問題，因為這個碼標志著一個蛋白質的開始。在原核細胞中與核糖體的結合由一個被稱為夏因-達爾加諾序列的基組導入，這個序列一般位于開始位置前8到13個核苷酸的地方。
一個激活的進入核糖體的A位，上的反密碼子和上的密碼子進行互補鹼基配對，上的胸腺嘧啶(T)和上的腺嘌呤(A)配對;DNA上的腺嘌呤(A)和上的尿嘧啶(U)配對;而胞嘧啶(C)和鳥嘌呤(G)互相配對。上的編碼氨基酸。肽酰轉移酶在鄰近的氨基酸間建立一個肽鍵，此后在P位上的氨基酸離開它的與A位上的結合，核糖體則相對于向前滑動，原來在A位上的移動到P位上，原來在P位上的空的移動到E位上，然后在下一個進入A位之前被釋放，將氨基酸遂一加上。這個過程被稱為易位。
以上的過程不斷重復直到核糖體遇到三個終止密碼子之一，翻譯過程終止。相鄰的氨基酸在編碼後以肽鍵連接，產生多肽，多個多肽再透過氫鍵，離子鍵等弱鍵摺曲，形成有三維構象的蛋白質。同時蛋白質不再延長，一種模仿的蛋白質進入核糖體的A位將合成的蛋白質從核糖體內釋放出來。
在真核細胞中轉錄是在細胞核中進行的，然后被運輸到細胞質進行翻譯。在運輸過程中受到特別的結構的保護。但需要注意的是，在真核細胞中粒線體和葉綠體中的轉錄與轉譯行為都與原核生物類似（參見內共生理論）。
在真核細胞中核糖體與中的起始密碼子結合，在真核生物和古細菌中起始密碼子的碼與甲硫胺酸的碼相同，與甲硫胺酸相連的是核糖體的一個組成部分。
延長和終止的過程與原核細胞相似。
生物學家和化學家用手或-{zh-cn:計算機;zh-tw:電腦}-來模擬翻譯過程來理解一個基因所編碼的蛋白質的結構。
首先要從導出：
DNA -> RNA
A  ->  U
T  ->  A
G  ->  C
C  ->  G
然后將每三個碼組合為一個密碼子，最后察看表格將每個密碼子轉化為氨基酸。
這是蛋白質的氨基酸順序。按照蛋白質內親水和疏水部分的排列可以對蛋白質折疊方式作出一些推斷。但要完全預測一個蛋白質的形狀是相當不容易的。
* Virtual Cell Animation Collection: Introducing Translation
* Translate tool (from DNA or RNA sequence)
mRNA在真核細胞中的交互作用。Pre-mRNA經由轉錄被創造出來；在經過增加5'端帽、剪接和加上多聚腺苷酸尾鏈之後成為mRNA，被運送到細胞質，然後由核糖體進行轉譯產生蛋白質。
信使核糖核酸（，縮寫：），是由DNA經由轉錄而來，帶著相應的遺傳訊息，為下一步轉譯成蛋白質提供所需的訊息。在細胞中，mRNA從合成到被降解，經過了數個步驟。在轉錄的過程中，第二型RNA聚合酶（RNA polymerase II）從DNA中複製出一段遺傳訊息到前mRNA（尚未經過修飾或是部分經過修飾的mRNA，英文pre-messenger RNA，簡稱pre-mRNA，或是heterogeneous nuclear RNA，簡稱hnRNA）上。在原核生物中，除了5'加帽之外mRNA並未被進一步處理（但有些罕有的特例），而經常是邊轉錄邊轉譯。在真核生物中，轉錄跟轉譯發生在細胞的不同位置，轉錄發生在儲存DNA的細胞核中，而轉譯是發生在細胞質中。不過，曾有研究學者認為真核生物亦有邊轉錄邊轉譯的現象，只是這個觀點未被廣泛接受。
在真核生物中，mRNA在準備好轉譯前需要經過多個處理步驟：
# 首先pre-mRNA需要加上一個5'端帽（capping）--經過甲基化（methylation）修飾的鳥嘌呤被加到mRNA的3'端。這個5'端帽對於mRNA運輸到細胞質並與之後接到適當的核糖體，以及mRNA本身的穩定是相當重要的。mRNA如果缺乏5'端帽，則很容易就被降解掉。而mRNA由5'到3'的降解亦是由移除5'端帽開始。
# mRNA剪接（mRNA splicing）--mRNA前體去除掉內含子而保留外顯子的修飾過程。通常mRNA前體能經由數種不同的剪接方式，產生不同組態／型式的mRNA，使一段基因在不同的組織或發育過程中能經過轉錄-剪接-轉譯後產生不同型式的蛋白質，進而擁有不同的作用，或是產生出穩定性差的mRNA達到調控基因表達的目的。這種剪接型態叫做選擇性剪接。絕大部分mRNA的剪接都是由剪接體所執行，只有少數例外，例如histone mRNA沒有內含子，但是其pre-mRNA卻需要經由另外的剪接方式才能產生成熟mRNA。以上所述為分子內剪接（''cis''-splicing），而mRNA剪接作用亦可發生在不同mRNA分子之間（''trans''-splicing），後者常見於原生生物的mRNA剪接。除了mRNA之外，有些RNA分子也有能力催化自身的修剪，例如核酸酶會做自我切除，而第I或第II型外顯子在特殊環境下可以不藉由蛋白質酵素的作用而進行剪接，稱為自剪接作用。
# 多聚腺苷酸化（polyadenylation）--藉由酵素多聚腺苷酸聚合酶（poly(A) + polymerase），在mRNA前體的3'端上加上了一段數個腺嘌呤序列（通常是數百個），（這項修飾並不會出現在原核生物中）。這段多聚腺苷酸尾鏈在轉錄的時候，會因為mRNA上一段特殊的訊息，AAUAAA，而在mRNA後方特定位置上加上多聚腺苷酸尾鏈。多聚腺苷酸尾鏈會被多聚腺苷酸結合蛋白（poly(A) + tail-binding protein, PABP）辨識並保護住。這段AAUAAA訊號的重要性可以從以下這個例子看出：當要轉錄時，DNA分子上的AATAAA片段如果產生突變，將會導致某些血紅素缺陷。另外，對於部分histone mRNA而言，此過程是不被需要的。改變tRNA對mRNA上密碼子的識別，更可能改變了蛋白質上胺基酸的組成。
多聚腺苷酸化（polyadenylation）能增加轉錄的半生期，使得mRNA在細胞中的存在時間能延長得久一些，因此能再轉譯出更多的蛋白質。
在pre-mRNA在被修飾過之後（包含RNA剪接及加上5'端帽與3'端上多聚腺苷酸尾），形成成熟的mRNA，從而可準備進行轉譯。成熟mRNA從細胞核被送出到細胞質中，然後核糖體結合在其上，開始轉譯出蛋白質。隨著時間進行，mRNA的多聚腺苷酸尾會被專門的外切核酸酶縮短，而5'端帽也可能被除去，使得該聚合物易受到核酸外切酵素的影響而被降解。
成熟真核細胞的mRNA的結構。一個完整的mRNA包括有5'端帽、5'非翻譯區、編碼區、3'非翻譯區和poly(A)尾鏈。
在RNA起始密碼子之前，與終止密碼子（stop codon）之後，各有一段非編碼區，各被稱作5'UTR與3'UTR，（5'與3'非編碼區，因為DNA與RNA分子都是由5'端到3'端，也就是說這些區域是在RNA分子的兩端）是屬於不轉譯出蛋白質的序列。然而，這些區域的重要性在於它們的序列有可能藉由這些區域與不同的RNA結合蛋白（RNA-binding protein）結合，進而改變在細胞中的位置、決定mRNA的穩定性／半生期，以及對細胞受到刺激時的反應而生的轉譯調控。這些都是與細胞調控本身的活性有關。
在UTRs上的某些蛋白質複合物不僅能影響RNA的穩定度，也能促進轉譯效率或是抑制轉譯，這多是依據位在UTRs上的序列而定。有些在UTR上的基因遺傳的變異也會造成上述的RNA穩定度或是轉譯效率的改變。
一些包含在UTRs的功能性序列，常能形成一些有特性的二級結構，這些造成二級結構也牽扯到調節mRNA本身。某些序列，。。另外，。換句話說，mRNA分子可以進行自我調控。
在許多真核生物中，當反義RNA上的鹼基與基因的某段mRNA互補時，反義RNA可以抑制轉譯。反義RNA存在於細胞中之時，其互補的基因就不會合成蛋白質。這也許是一種對抗反轉錄轉座子或病毒複制的一種機制（retrotransposons是以雙股RNA作中介狀態的轉座子），因為這兩者都能使用雙鏈RNA當中介物。在生物化學的研究中，藉由使用一段反義mRNA使得標靶mRNA無法作用（RNA干擾），這種方法已經被廣泛用于研究基因的功能；例如利用RNA干擾技術，秀麗隱桿線蟲中所有基因的作用幾乎已經被研究完了。
轉運核糖核酸，又稱傳送核糖核酸、轉移核糖核酸，通常簡稱為tRNA，是一種由76-90個核苷酸所組成的RNA，其3'端可以在氨酰-tRNA合成酶催化之下，接附特定種類的氨基酸。轉譯的過程中，tRNA可藉由自身的反密碼子識別mRNA上的密碼子，將該密碼子對應的氨基酸轉運至核糖體合成中的多肽鏈上。每個tRNA分子理論上只能與一種氨基酸接附，但是遺傳密碼有簡并性（degeneracy），使得有多於一個以上的tRNA可以跟一種氨基酸接附。
在tRNA被發現以前，佛朗西斯·克里克就假設有種可以將RNA訊息轉換成蛋白質訊息的適配分子存在。1960年代早期，亞歷山大·里奇、等生物學家開始研究tRNA的結構，1965年，羅伯特·W·霍利首次分離了tRNA，並闡明了其序列與大致的結構，他因此貢獻而獲得1968年的諾貝爾生理學或醫學獎。tRNA最早由羅伯特·M·博克（Robert M. Bock）成功結晶，之後陸續有人提出tRNA苜蓿葉狀的二級結構，此結構於1973年由與亞歷山大·里奇的X射線繞射分析證實。另一個由阿龍·克盧格領導英國團隊，在同一年發布同樣的射線晶體學的發現。
1955年Zamecnik認為標記的ATP可能參與RNA的生物合成。于是他將14C標記的ATP與微粒體（Microsome）和細胞抽提液的可溶性部分一起保溫后，發現RNA居然也被標記了。他有點懷疑。可是，當他將14C標記的氨基酸與微粒體和可溶性部分在同樣條件下保溫后，他驚奇地發現，與RNA合成無關的14C氨基酸也標記了RNA，而且更意想不到的是14C標記的RNA不是核糖體的大分子RNA，而是可溶性部分中的小分子RNA。進一步，僅將可溶性部分與14C標記的氨基酸和ATP一起保溫，則這種14C標記的氨基酸仍能與其中的小分子RNA結合。因此，這種可溶性部分中的小分子RNA被稱為稱sRNA（soluble RNA）。1956年Watson曾訪問Zamecnik實驗室，并對他們說，1955年Crick已經提出過“適配子”的設想。后來，這種 sRNA被命名為tRNA。
來自酵母轉運核糖核酸苯丙氨酸次級三葉草結構
tRNA的結構
tRNA為74~95個鹼基的小片段RNA鏈，會折疊成苜蓿葉狀的核酸二級結構，呈三葉草形，它由氨基酸臂、二氫尿嘧啶環、反密碼環、額外環和TΨC環五部分組成。
tRNA有一級結構（5'到3'的核苷酸方向），二級結構（通常顯示為三葉草結構）和三級結構（所有的tRNA具有類似L-形的三維結構，允許它們與核糖體的P、A位點結合）。
# 5'端磷酸。
# 受體臂（accept stem，也被稱作''amino acid stem''）是一個7個鹼基長的臂，其中包含5'端，與有3'端羥基（OH，能結合胺基酸於其上）的3'端。受體臂有可能含有非Watson-Crick所發現的鹼基對。
# CCA尾（CCA tail）是tRNA分子3'端的CCA序列，在翻譯時，幫助酶識別tRNA。
# D臂（D arm）是在一個環（D loop）的端部4個堿基的臂，通常含有二氫尿嘧啶（dihydrouridine）。
# 反密碼子臂（anticodon arm）有5個堿基，包括反密碼子（anticodon）。每一tRNA包括一個特異的三聯反密碼子序列，能夠與氨基酸的一個或者多個密碼子匹配。例如賴氨酸（lysine）的密碼子之一是AAA，相應的tRNA的反密碼子可能是UUU（一些反密碼子可以與多于一個的密碼子匹配被稱為“擺動”）。
# T臂（T arm）是5個堿基的莖，包括序列TψC。
# 修飾堿基（Modified bases）是tRNA中的一些不常見的堿基，如腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶的修飾形式。
氨酰化（Aminoacylation）是添加一個氨酰基團到化合物的過程。
在氨酰tRNA合成酶（aminoacyl tRNA synthetase）的作用下，tRNA與特異的氨基酸進行氨酰化反應（aminoacylated）。對于一種氨基酸而言，盡管可能有多種 tRNA和多種反密碼子，但是通常只有一種氨酰tRNA合成酶。合成酶對合適的tRNA的識別不僅僅是反密碼子，受體臂也起了顯著的作用。
# 氨基酸 + ATP →氨基酰- AMP + PPi
# 氨基酰-AMP + tRNA →氨基酰 - tRNA + AMP
某些生物可能缺少一種或多種氨酰基tRNA合成酶。 這導致通過化學相關的氨基酸被氨酰化的tRNA，并且通過使用一種或多種酶，tRNA被修飾為正確的被氨酰化。
*轉運-信使核糖核酸（TmRNA）
核糖體RNA是生物細胞中主要的核糖核酸之一，是一種具有催化能力的核糖酶，但其單獨存在時不能如其他核糖核酸那樣發揮作用，僅在與多種核糖體蛋白質共同構成核糖體（一種無膜細胞器）后才能執行其功能。23S和28S rRNA在轉譯過程中作為肽酰轉移酶催化多肽（包括蛋白質）中氨基酸之間肽鍵的形成。rRNA是單鏈RNA，但通過折疊形成了廣泛的雙鏈區域。
原核生物與真核生物的核糖體都能被分為兩個可相互分離的亞基：
50S（5S、23S）
30S（16S）
60S（5S、5.8S和28S）
40S（18S）
注意：“S”（沉降速度）這個單位是不能直接簡單相加的，因為它代表沉降速度的度量而不是質量。每個亞基的沉降速度既受到其形狀的影響，又受到其質量的影響。
原核細胞及真核細胞內共生體的70S核糖體中包含3種沉降系數不同的rRNA，其中30S核糖體亞基中包含16S rRNA，50S核糖體亞基中包含5S rRNA和23S rRNA。這3種rRNA在結構上有明顯的不同。
編碼細菌三種rRNA的基因常被按16S-23S-5S的順序組合在同一操縱子中共同轉錄。在細菌基因組中，往往有多個rRNA操縱子（例如大腸桿菌有七個：rrnA、B、C、D、E、G和H ），當其中一部分被敲除后，仍可通過基因轉換的方式從其他操縱子上獲得。古菌則存在只有單組rRNA操縱子的情況。
70S核糖體中的16S和23S rRNA由30S rRNA前體經加工產生，30S rRNA前體的相對分子質量約為2 MDa。在該加工過程中，30S rRNA前體的特定堿基被甲基化，然后經水解斷裂產生17S和25S rRNA中間產物，再經核酸酶的作用去除少量核苷酸殘基才最終分別得到16S和23S rRNA。而5S rRNA是從30S rRNA的3'端分離的。
原核生物的30S核糖體亞基中含有16S rRNA。16S rRNA的相對分子質量約為0.6 MDa，長度約為1540 nt。在30S核糖體亞基組裝過程中，16S rRNA與其核糖體蛋白質S4、S7、S8、S15、S17和S20結合先行成初級復合物。
16S rRNA約有一半的核苷酸形成鏈內堿基對，使其具有約60個螺旋；分子中未配對部分則形成突環。在濃度足夠的Mg2+存在下分離得到的16S rRNA處于緊密狀態，與30S核糖體亞基的結構相似。已發現16S rRNA中的一些序列與蛋白質合成時30S核糖體亞基、mRNA及一些翻譯因子的結合有關。核糖體16S rRNA的3'端能識別待翻譯mRNA的5'端的夏因-達爾加諾序列，起始翻譯。另有研究表明，16S rRNA也能與進入核糖體P位點的tRNA相互作用。
16S rRNA作為研究分類學和系統進化的分子受到很大重視，16S rRNA序列分析是當前對細菌進行分類學研究中較精確的一種技術。隨著分子生物學的快速發展以及該技術在醫學微生物研究中的應用，對16S rRNA作為微生物分類依據的研究也逐漸發展起來并已得到廣泛認同。
位于原核生物70S核糖體A位點的16S rRNA部分的是氨基糖苷類抗生素的作用靶位，該類抗生素通過與16S rRNA的A位點結合而阻礙原核翻譯。但由質粒介導的16S rRNA甲基化酶能將16S rRNA甲基化，從而導致細菌產生對該類抗生素較高的抗藥性。
基本上所有70S核糖體與80S核糖體（除了少數真菌、少數原生動物和少數較高級動物的線粒體核糖體）的大亞基中都含有5S rRNA。
5S rRNA相對分子質量約為40 kDa，長度約為120 nt，分子中有5個螺旋。它在70S核糖體的50S核糖體亞基中與核糖體蛋白質L5、L18及L25結合。5S rRNA約60%的核苷酸形成了鏈內堿基對。已有研究表明，5S rRNA具有一個與tRNA特定序列互補的序列。
70S核糖體中的5S rRNA被認為是一種傳感裝置，能促進核糖體中各功能中心的交流并組織翻譯的進行。缺少5S rRNA的核糖體的肽酰轉移酶活性會下降。
23S rRNA的相對分子質量約為1.2 MDa，長度約為2900 nt，分子一半以上核苷酸以分子內雙鏈形式存在，產生超過100個螺旋。 它在70S核糖體的50S亞基中與核糖體蛋白質L1、L2、L3、L4、L9和L23結合形成初級復合物。對緊密狀態下23S rRNA的電鏡研究表明，23S rRNA的形狀與50S核糖體亞基相似。
23S rRNA是核糖體催化功能的核心，其結構域Ⅴ具有肽酰轉移酶活性。位于核糖體P位點的23S rRNA部分有特定區域能與進入核糖體的tRNA形成互補堿基對。
P位點的23S rRNA部分是大環內酯類抗生素的作用靶位，該類抗生素通過與23S rRNA阻礙肽鏈延伸。但一些細菌可利用erm基因介導23S rRNA甲基化酶使23S rRNA的甲基化，從而降低核糖體對抗生素的親合性；也有細菌能通過核糖體變構來影響抗生素作用。
小亞基核糖體RNA的5'端域，來自Rfam數據中。該例子是： RF00177
80S核糖體中包含4種沉降系數不同的rRNA，其中，40S核糖體亞基（小亞基）中包含18S rRNA，而60S核糖體亞基（大亞基）中包含5S rRNA、5.8S rRNA和28S rRNA。
28S、5.8S與18S rRNA由單獨的一個轉錄單位（45S rDNA）所轉錄，它們之間被兩個內轉錄間隔區分隔。45S rDNA被組織于5基因簇中，每個簇中大約有30-40次重復（真核生物在串聯重復序列中通常擁有多個rDNA的備份），人類大概有300-400個rDNA重復段存在于五個基因簇中（分別在13、14、15、21和22號染色體上）。
80S核糖體中的28S rRNA、5.8S rRNA和18S rRNA由長度約為14,000 nt的45S rRNA前體在細胞核的核仁加工產生。加工過程中，該rRNA前體的100多個核苷酸會被甲基化，再經過一系列酶促反應被剪切成幾條RNA鏈。
18S rRNA是16S rRNA的同源RNA，其相對分子質量約為0.7 MDa，長度約為1900 nt。18S rRNA除了比16S rRNA稍長且多一些臂和環結構外，兩者空間結構十分相似，在核糖體中起到的作用也基本相同。
真核細胞中的5S rDNA存在于串聯重復基因中（大約有200-300個真5S rDNA，且另有許多分散的假基因），人類的最大的一個位于1號染色體長臂41號帶-42號帶上。5S rDNA與其余三種80S核糖體的rRNA的基因不同，該基因并不位于核仁組織區，且由RNA聚合酶III所轉錄。
5.8S rRNA的相對分子質量約為40 kDa，長度約為160 nt。也存在于古菌細胞中。
核糖體中的5.8S rRNA被認為起到輔助核糖體易位的作用。
5.8S rRNA可以用作探測miRNA的內參基因。
28S rRNA是23S rRNA的同源RNA，其相對分子質量約為1.7 MDa，長度約為4700 nt。真核生物28S rRNA的結構與大腸桿菌23S rRNA的相似。
*哺乳動物細胞的線粒體中含有一種55S核糖體，其28S核糖體亞基（小亞基）中含有長度約為950 nt的12S rRNA，其39S核糖體亞基（大亞基）中則含有長度約為1560 nt的另一種16S rRNA。
*部分植物細胞的葉綠體中也含有80S核糖體，故也擁有4種rRNA分子。
rRNA的某些特征在物種進化及醫藥方面的研究十分重要。
* rRNA是所有細胞中都會表達的基因，即所有擁有細胞結構的生物都擁有rRNA。因此可以通過對編碼rRNA的基因進行測序來對某種生物進行分類學上的分類、計算出相關的種群或估測物種的差異度。已有逾千種rRNA已被測序，測序的結果被儲存在特殊的數據庫（如RDP-II和 SILVA ）中。
* 核糖體中的rRNA是多種臨床有關抗生素的靶位點，例如：巴龍霉素可特異性地與原核生物核糖體的30S小亞基的A區（該區存在16S rRNA）結合，干擾翻譯過程的正常進行。其他通過與rRNA反應起到殺菌作用的抗生素還有：氯霉素、紅霉素、春雷霉素、微球菌素、蓖麻毒素、帚曲霉素、大觀霉素、鏈霉素及硫鏈絲霉素。
在近年的系統發育樹中，rRNA序列（尤其是小亞基rRNA，SSU rRNA）成爲最常用的做樹依據，因爲SSU rRNA具有以下特點：
* 長度適中，通常為1200-1900 nt，能夠提供足夠的信息但又不過長。
* 完全廣泛分佈于所有具有細胞結構的生物，而且進化過程相對緩慢。其中保守區可用於構建所有生命的統一進化樹，而易變的區域可用來區別屬或者種。
* rRNA基因的水平轉移非常難發生，因爲它們的功能十分基本且重要，需要翻譯機制的精細調控才能夠正常實現功能。
RPL1、RPL2、RPL3、 RPL4、 RPL5、 RPL6、 RPL7、 RPL8、 RPL9、 RPL10、 RPL11、 RPL12、 RPL13、 RPL14、 RPL15、 RPL16、 RPL17、 RPL18、 RPL19、 RPL20、 RPL21、 RPL22、 RPL23、 RPL24、 RPL25、 RPL26、 RPL27、 RPL28、 RPL28、 RPL30、 RPL31、 RPL32、 RPL33、 RPL34、 RPL35、 RPL36、 RPL37、 RPL38、 RPL39、 RPL40、 RPL41
MRPL1、 MRPL2、 MRPL3、 MRPL4、 MRPL5、 MRPL6、 MRPL7、 MRPL8、 MRPL9、 MRPL10、 MRPL11、 MRPL12、 MRPL13、 MRPL14、 MRPL15、 MRPL16、 MRPL17、 MRPL18、 MRPL19、 MRPL20、 MRPL21、 MRPL22、 MRPL23、 MRPL24、 MRPL25、 MRPL26、 MRPL27、 MRPL28、 MRPL29、 MRPL30、 MRPL31、 MRPL32、 MRPL33、 MRPL34、 MRPL35、 MRPL36、 MRPL37、 MRPL38、 MRPL39、 MRPL40、 MRPL41、 MRPL42
RPS1、 RPS2、 RPS3、 RPS4、 RPS5、 RPS6、 RPS7、 RPS8、 RPS9、 RPS10、 RPS11、 RPS12、 RPS13、 RPS14、 RPS15、 RPS16、 RPS17、 RPS18、 RPS19、 RPS20、 RPS21、 RPS22、 RPS23、 RPS24、 RPS25、 RPS26、 RPS27、 RPS28、 RPS29
MRPS1、 MRPS2、 MRPS3、 MRPS4、 MRPS5、 MRPS6、 MRPS7、 MRPS8、 MRPS9、 MRPS10、 MRPS11、 MRPS12、 MRPS13、 MRPS14、 MRPS15、 MRPS16、 MRPS17、 MRPS18、 MRPS19、 MRPS20、 MRPS21、 MRPS22、 MRPS23、 MRPS24、 MRPS25、 MRPS26、 MRPS27、 MRPS28、 MRPS29、 MRPS30、 MRPS31、 MRPS32、 MRPS33、 MRPS34、 MRPS35
*  “SILVA”rRNA數據庫計劃 （包含真核細胞rRNA（18S）及核糖體大亞基rRNA（23S/28S））
*   歐洲核糖體小亞基rRNA數據庫
*  16S rRNA，BioMineWiki
戦國七雄田齊概要図(紀元前260年)
田氏齊國，史稱田齊，為田氏代齊后的齊國，是戰國七雄之一，媯姓。
田氏出于陳厲公之子陳完（田完）。前672年，陳完因避難入齊，事齊桓公，為齊國大夫，陳與田古音相近，故古書往往作田。人稱「田氏」，田桓子時田氏開始強大，到了田和時流放了齊康公，自立為君，是為田和代齊。前386年周安王承認田和取代了姜齊。
田和傳三代到齊威王，進行改革，國力強盛，大敗魏國，開始稱王，成為戰國七雄之一。此后長期與秦國東西對峙。前284年五國聯合攻齊，齊被燕將樂毅攻破，從此國力衰弱。前221年為秦所滅。
前707年陳他殺太子免而自立，太子免有三弟，長為公子躍，次公子林，次公子杵臼。前706年八月，三人怨恨陳他，就讓蔡國人謀殺陳他，陳他被殺后，公子林等擁公子躍為君，是為陳厲公。
據《左傳》記載，相傳在陳厲公的兒子公子完年少的時候，周朝廷的太史拿著《周易》見厲公，厲公要他給公子完卜卦，在六十四卦中得到“《觀》之《否》”的結果。太史預言公子完將要享有國家，但不在本國，也不是他這一代人，而是在其子孫。而被他的子孫取得的那個國家，將會是一個姜姓國。然而事物不可能兩全其美，要等到陳國衰亡後，他的子孫才會昌盛。
前700年八月，公子林繼立，是為陳莊公。莊公在位七年卒，弟公子杵臼立，是為陳宣公。
公子完和陳宣公的太子御寇交好。前672年宣公想要改立太子，於是殺了太子御寇，公子完逃往齊國，當時齊國為姜姓為大國，最強勢時疆域東到海，西到黃河，南到泰山，北到無棣（今河北鹽山南）。其君主為姜太公的後裔，齊桓公。桓公頗為賞識，命公子完任工正，陳完入齊後，人稱田完。
田完生田孟夷，田孟夷生子田孟莊、田孟莊生子田文子，文子時，田氏逐漸變強，死後傳位田桓子。
前532年，齊惠公後代的欒氏、高氏被田桓子聯合鮑氏所滅，欒施和高彊奔魯國，齊國姜姓公族勢力大大減弱。桓子傳田武子，武子卒，無子，弟田乞即位，是為田僖子。
田僖子在位時，甚至以「大斗出小斗進」等手段極力拉攏平民和失勢的公族，僖子向百姓征收賦稅時用小斗收進，借給百姓糧食時用大斗，向百姓施以恩德，晏嬰多次向齊景公進諫，齊景公卻不干涉。晏嬰認為田家的先祖箕伯、直柄、虞遂、伯戲和先君陳胡公、大姬已經來到齊國，接受祭祀了。齊國將要成為田氏的了。
田氏的支系子孫田穰苴因打敗晉、燕兩軍被任為大司馬，因田氏勢力擴大而警惕的高張、國夏對齊景公說穰苴的壞話，司馬穰苴被免官。田僖子立志要除掉高氏和國氏。
前500年，晏嬰去世。由高氏、國氏兩大夫把持朝政。前489年，景公病重，遺命國夏、高張扶立少子公子荼為太子，驅逐群公子，把他們發配至東萊。
不久，田乞發動宮廷政變，滅高、國兩家，高張被殺、國夏奔莒、晏圉奔魯。田乞弒殺安孺子，與鮑牧及諸大夫另立年齡較長的公子陽生為國君，是為悼公。
前485年，田成子田恆唆使大夫鮑息弒齊悼公，立公子壬為國君，是為簡公。前481年，田恆發動政變，殺死了闞止和簡公，擁立簡公弟弟公子驁為國君，是為平公。
自此之後，田成子獨攬齊國大權，盡誅鮑、晏諸族。田氏家族專權於齊國平公、宣公、康公三代。
陳完後人田和擔任齊相國時，將齊康公放逐到海上，自立為君，于是，姜姓齊國成了田齊。這就是歷史上的田氏代齊。
田齊立國時，已進入戰國時期，齊成為戰國七雄之一。田和是第一代田齊之君，是為太公和。田和之孫齊桓公午臨淄置稷下學宮，“設大夫之號”，招聚天下賢士。前386年周安王承認田和為齊侯。到威王、宣王時，稷下人才濟濟，成為東方學術文化的中心。齊威王任用鄒忌為相，改革政治，齊國遂強大。前353年，齊大敗魏國于桂陵。前341年，齊又大敗魏軍于馬陵。前334年，齊威王與魏惠王“會徐州相王”，正式稱王。威王晚年，相邦鄒忌與將軍田忌爭政。前322年，田忌攻臨淄，求鄒忌，不勝，逃亡楚國。
前314年，燕國發生“子之之亂”；在孟軻勸說下，齊宣王命匡章率“五都之兵”、“北地之眾”攻破燕國，齊國實力極盛。前301年，齊聯合韓、魏國攻楚，大敗之。前298年-前296年，齊聯合韓、魏連年攻秦，入函谷關，迫秦求和。前288年，齊、秦并稱東、西帝，旋皆放棄帝號。次年，蘇秦、李兌合趙國、齊、楚、魏、韓攻秦，罷于成皋。前286年，齊湣王乘宋國內亂，於是出兵滅宋。由於齊國獨自霸佔宋國國土，引來其他各國不滿，秦國於是與趙、楚等和談，前284年，燕昭王以樂毅為上將軍，合燕、秦、韓、趙、魏伐齊攻入臨淄，連下七十余城，齊城不下者只有莒縣和即墨。湣王逃入莒，被淖齒殺死。王孫賈與莒人殺淖齒，立湣王子法章為齊襄王。燕引兵東圍即墨，城中推舉田單為將。雙方相持達五年。前279年，田單組織反攻，用“火牛陣”大敗燕軍，收復失地。齊雖復國，但元氣大傷，無力再與秦抗衡。
前236年，秦王乘趙國進攻燕國之際，分兩路大軍攻趙，拉開了統一戰的序幕。秦國重金收買了齊丞相-{后}-勝，齊王建聽信了-{后}-勝的主張，使齊國即不合縱抗秦，也不加強武力戰備。秦國滅五國后，齊王才頓感到秦國的威脅，慌忙將軍隊集結到西部邊境，準備抵御秦軍的進攻。前221年，秦王在滅亡韓、魏、楚、燕、趙之后，以齊拒絕秦使者訪齊為由，命王賁率領秦軍伐齊，秦軍避開了齊軍西部主力，由原來的燕國南部南下直奔齊都臨淄（今山東淄博北）。齊軍面對秦軍突然從北面來攻，措手不及，土崩瓦解。齊王建出城投降，齊國滅亡。秦國滅除六國，統一天下，在齊地設置齊郡和瑯邪郡。
喀什地區是中華人民共和國新疆維吾爾自治區下轄的地區，位于新疆西部。全區總面積111,398平方公里。
1306年，察合臺汗國分裂，喀什噶爾成為東察合臺汗國（蒙兀兒）首都。1353年，東察合臺汗禿忽魯帖木兒（Tughluq Timur）皈依伊斯蘭，伊斯蘭在喀什噶爾的地位再次上升。1387年，東察合臺汗國往北遷都伊犁。1389年，帖木兒起兵，三年後，喀什噶爾被帖木爾帝國攻下，直到1432年才被東察合臺汗國收復。1466年後，喀什噶爾陷入長期戰亂，成為杜格拉特氏族屬地。1514年， 薩亦德打敗了杜格拉特部埃米爾阿布·巴克爾，建立了葉爾羌汗國，喀什噶爾成為他遷都葉爾羌（今莎車）前的首都。
*民國二年（1913年），設喀什噶爾道，管轄疏附、伽師、葉城、皮山、于闐、洛浦、疏勒、莎車、英吉沙、蒲犁、巴楚、和闐12縣，以及陸續成立的麥蓋提、烏恰、澤普、阿圖什、岳普湖、墨玉6縣。
*民國九年（1920年），原隸屬喀什的葉城、皮山、于闐、洛浦、和闐、墨玉6縣析出，劃歸新成立的和闐道管轄。
*民國十九年（1930年）廢道改行政區，設喀什行政區，列為新疆第三行政區。
1933年11月，沙比提大毛拉、穆罕默德·伊敏在喀什噶爾成立東突厥斯坦第一共和。1934年2月6日，青海回族馬家軍第36師馬福元將軍率領回族（東干）軍隊攻打喀什噶爾的維吾爾吉爾吉斯（柯爾克孜）聯軍。5月22日，他解了喀什噶爾新城馬占倉的圍，之後為了報復東突厥對回族的克孜爾大屠殺，喀什噶爾老城有2,000 至8,000名維吾爾平民被回族軍隊殺死。3月16日，英國領事館的幾名英國公民被第36師打死打傷。4月7日，馬家軍首腦馬仲英抵達喀什噶爾，在艾提尕爾清真寺發表演講，要求維吾爾族效忠南京的中華民國政府。東突厥斯坦第一共和宣告滅亡。
*民國三十一年（1942年），析出莎車、澤普、麥蓋提3縣與和闐區的葉城縣合并，設立新疆第十行政區（莎車區），管轄莎車、澤普、麥蓋提、葉城4縣。
*1949年：設置喀什專區，屬新疆省。
*1952年，中華人民共和國由疏勒縣析置喀什市。
*1955年：撤銷喀什專區，轄縣劃歸南疆行政公署直轄。
*1956年：恢復喀什專區，原屬莎車專區的莎車、澤普、葉城、麥蓋提四縣亦劃入喀什專區。
*1971年1月11日：喀什專區改為喀什地區。
*1981年10月31日，喀什的騷亂導致三人死亡。
*1986年喀什被定為中國國家歷史文化名城。目前為喀什地區行政公署駐地。
*2010年5月，中共中央新疆工作會議上中央正式批準喀什設立經濟特區，成為中國第六個經濟特區，享受產業、稅收、金融、土地、外貿等特殊扶持政策。
*2008年8月4日，發生2008年喀什襲擊事件，造成至少16死16傷。
*2014年7月，艾提尕爾清真寺發生襲擊事件，大毛拉居瑪·塔伊爾遭殺害。
喀什地區地處歐亞大陸中部，中華人民共和國西北部，新疆西南部。地處在東經71.39′～79.52′、北緯35.28′～40.16′之間。西北與克孜勒蘇柯爾克孜自治州相鄰，東與阿克蘇地區相鄰，東南與和田地區相鄰，西與塔吉克斯坦、阿富汗、巴基斯坦接壤。全區總面積16.2萬平方千米，東西寬約750千米，南北長535千米。喀什地區三面環山，北有天山南脈，西有帕米爾高原，南部是喀喇昆侖山，東部為塔克拉瑪干大沙漠。葉爾羌河、喀什噶爾河沖積平原鑲嵌其中。整個地勢由西南向東北傾斜。印度洋的濕潤氣流難以到達，北冰洋的寒冷氣流也較難穿透，造成喀什地區干旱炎熱的暖溫帶的荒漠景觀。而山區的冰雪融水給綠洲的開發創造了條件，形成喀什噶爾河和葉爾羌河兩大著名綠洲。
喀什地區最高的喬戈里峰海拔8611米，最低處塔克拉瑪干大沙漠海拔1100米，喀什市城區的平均海拔高度1289米。境內四季分明，光照長，氣溫年和日變化大，降水很少，蒸發旺盛。夏季炎熱，但酷暑期短；冬無嚴寒，但低溫期長；春夏多大風、沙暴、浮塵天氣。因地形復雜、氣候差異較大，大體可分為5個區：喀什平原氣候區、沙漠荒漠氣候區、山地丘陵氣候區、帕米爾高原氣候區、昆侖山氣候區。喀什地區水系的源頭都位于冰川、山區積雪帶，隨著山區水分的融凍而使各河的年內枯洪變化明顯。各河都為融補型河流。全區有5大河流，另有短程河3條。喀什地區地下水的動儲量約在50億～60億立方米（包括上層滯水）。地下水主要補給區是在洪積扇、沖積扇。各大河流在出山口后的礫質洪積物上大量滲漏，其滲漏量約占河水的30%以上，是平原區地下水徑流形成的主要來源。地下水運動規模在上游扇形地上主要為補給形成區，至下游則為蒸發消耗區。
+喀什地區四大機構現任領導人
中國共產黨喀什地區委員會書記
新疆維吾爾自治區人民代表大會常務委員會喀什地區工作委員會主任
新疆維吾爾自治區人民政府喀什地區行政公署專員
中國人民政治協商會議新疆維吾爾自治區委員會喀什地區工作委員會主任
艾尼瓦爾·吐爾遜
鐵木爾·買買提
新疆維吾爾自治區葉城縣
喀什地區下轄1個縣級市、10個縣、1個自治縣。
* 縣：疏附縣、疏勒縣、英吉沙縣、澤普縣、莎車縣、葉城縣、麥蓋提縣、岳普湖縣、伽師縣、巴楚縣
* 自治縣：塔什庫爾干塔吉克自治縣
喀什地區行政區劃圖
111,398.39(109,423.98)
1,003.39(1,003.39)
吾斯塘博依街道
2,709.47(2,709.47)
2,159.31(2,100.92)
3,424.87(3,400.18)
987.97(987.97)
8,956.69(8,945.39)
28,558.89(28,322.40)
10,882.99(10,007.74)
3,128.09(2,981.21)
6,527.68(6,022.35)
18,376.89(18,261.98)
24,682.15(24,682.15)
塔什庫爾干鎮
根據2010年第六次全國人口普查，全地區常住人口為3979321人，同第五次全國人口普查相比，十年共增加573608人，增長率16.84%。年平均增長率為1.57%。其中，男性人口為2015637人，占50.65%；女性人口為1963684人，占49.34%。總人口性別比（以女性為100）102.65。0－14歲人口為1048398人，占26.35%；15－64歲人口為2738329人，占68.81%；65歲及以上人口為192594人，占4.84%。漢族人口318281人，占總人口的8%，各少數民族人口3661040人，占總人口的92%。
截止2010年，全區總人口共布397.94萬人，境內民族包括維吾爾族、漢族、塔吉克族、回族、柯爾克孜族、烏孜別克族、蒙古族等31個民族。
+ 喀什地區民族構成（2010年11月）
中華人民共和國國家發展和改革委員會2010年初發布《關于2009年西部大開發進展情況和2010年工作安排的通知》，表示2010年將推動廣西東興市、云南瑞麗市、新疆喀什地區、內蒙古滿洲里市等為沿邊經濟特區。2010年5月新疆工作座談會議在北京召開，設立喀什經濟特區，率先在新疆進行資源稅費改革。5年后全區人均GDP將達全國平均水平
喀什噶爾石榴：中國地理標志產品。
阿克蘇地區是中華人民共和國新疆維吾爾自治區下轄的地區，位于新疆中西部。區境北界伊犁州，東接巴音郭楞州，南鄰和田地區，西毗喀什地區、克孜勒蘇州，西北抵吉爾吉斯斯坦、哈薩克斯坦，中部將阿拉爾市包圍。地處天山山脈中段南麓，塔里木盆地北部，地勢北高南低。北部天山山脊海拔4,500至7,000米，其中托木爾峰海拔7,435米，為天山最高峰。北部為拜城盆地，西南部為柯坪山丘陵，中部為河流沖積平原，南部為塔克拉瑪干沙漠。主要河流有阿克蘇河、渭干河、塔里木河等。全區總面積127,817平方公里，人口253.05萬，維吾爾族占75.9%，漢族占22.9%，地區行政公署駐阿克蘇市。
阿克蘇一名來自阿克蘇河，突厥語意為「白水」，與相鄰的七河地區（Zhetysu）命名邏輯相通。「蘇」（Su）於突厥語言中有河水之意。阿克蘇地區溫宿縣（Onsu） 意為「十河」，克孜勒蘇（Kizilsu）則意為「紅河」。
*2015年9月18日，阿克蘇地區煤礦發生一起武裝襲擊事件。一群武裝分離主義份子襲擊了煤礦工人和保安人員，造成至少50人死亡，50人受傷。
*2019年12月，撤銷庫車縣，設立縣級庫車市。
阿克蘇地區位于天山南麓塔里木盆地北緣，地處南疆中部，東接巴音郭楞蒙古自治州，西與吉爾吉斯斯坦、哈薩克斯坦交界，南鄰和田地區、喀什地區、克孜勒蘇柯爾克孜自治州，北鄰伊犁哈薩克自治州。全地區總面積13.25萬平方千米，邊境線長235千米。阿克蘇地區地勢北高南低，由西北向東南傾斜。海拔7435.3米的托木爾峰是地區最高點；海拔945米的塔里木河則是地區最低處。北部是天山山區，南部是塔克拉瑪干沙漠，中部為山麓礫質扇形地、沖積平原區、戈壁、綠洲相間。中、低山丘陵帶分布有大面積水草豐茂的天然草場，其間有黑音山盆地、拜城盆地、柯坪盆地以及烏什谷地。山前洪積-沖積傾斜平原中、下部地勢平坦，水量豐富，土地肥沃，是地區的綠洲所在。阿克蘇地區是新疆水資源最為豐富的地區之一，境內重要的有塔里木河、阿克蘇河、多浪河，水資源總量6.3億立方米，地下水儲量5億立方米。塔里木河南岸有勝利水庫、北岸有多浪水庫，均為平原水庫，總庫容1.48億立方米。最大的天然淡水湖為艾西曼湖，面積26.57平方千米。
阿克蘇地區位于亞歐大陸深處，遠離海洋，為暖溫帶干旱型氣候，具有大陸性氣候的顯著特征：氣候干燥，蒸發量大，降水稀少，且年、季變化大，晴天多，日照時間長，熱量資源豐富，氣候變化劇烈，寒冬酷暑，晝夜溫差大，年均風速很小。阿克蘇地區北部、西部山區濕潤多雨，夏季涼爽，冬季寒冷，高山帶四季降雪。平原區除拜城盆地、烏什谷地以外都比較干燥，夏季炎熱，冬季寒冷。拜城盆地、烏什谷地則夏季略短，冬季略長，降水稍多。南部沙漠區干燥少雨，多風沙，夏季酷熱，冬季干冷。
+阿克蘇地區四大機構現任領導人
中國共產黨阿克蘇地區委員會書記
新疆維吾爾自治區人民代表大會常務委員會阿克蘇地區工作委員會主任
新疆維吾爾自治區人民政府阿克蘇地區行政公署專員
中國人民政治協商會議新疆維吾爾自治區委員會阿克蘇地區工作委員會主任
吐魯洪·阿不都熱依木
尼牙孜·阿西木
阿不力孜·吐尼亞孜
新疆維吾爾自治區疏勒縣
阿克蘇地區下轄2個縣級市、7個縣。
* 縣：溫宿縣、沙雅縣、新和縣、拜城縣、烏什縣、阿瓦提縣、柯坪縣。
阿克蘇地區行政區劃圖
127,816.66(124,909.49)
14,415.16(13,563.57)
14,525.13(14,525.13)
14,335.16(13,457.67)
31,848.17(31,668.03)
5,820.46(5,820.46)
15,890.99(15,890.99)
9,051.54(8,693.17)
13,017.89(12,443.92)
8,912.16(8,846.55)
根據2010年第六次全國人口普查，全地區常住人口為2370809人，同第五次全國人口普查相比，10年共增加390455人，增長19.7%。年平均增長率為1.82%。其中，男性人口為1225608人，占51.7%；女性人口為1145201人，占48.3%。總人口性別比（以女性為100）為107.02。0－14歲人口為542590人，占22.9%；15－64歲人口為1697360人，占71.6%；65歲及以上人口為130859人，占5.5%。
常住人口中，漢族人口542713人，占總人口的22.9%，各少數民族人口1828096人，占總人口的77.1%。
+ 阿克蘇地區民族構成（2010年11月）
阿克蘇蘋果、阿克蘇核桃、阿克蘇紅棗：中國地理標志產品。
和田地區（；舊稱“和闐”，1959年改稱“和田”）是中華人民共和國新疆維吾爾自治區下轄的地區，位于新疆西南部。和田地區位于新疆維吾爾自治區最南端。南枕昆侖山和喀喇昆侖山，北部深入塔克拉瑪干大沙漠腹地。東與巴音郭楞蒙古自治州的且末縣相接，西連喀什地區的葉城、麥蓋提、巴楚縣，北與阿克蘇地區的沙雅、阿瓦提縣接壤，南鄰西藏自治區；西南與印度、巴基斯坦在克什米爾的實際控制區毗鄰，東西長約670公里，南北寬約600公里，邊界線264公里。總面積24.78萬平方公里，其中山地占33.3%，沙漠戈壁占63%，綠洲僅占3.7%，且被沙漠和戈壁分割成大小不等的300多塊。和田屬干旱荒漠性氣候，年均降水量只有35毫米，年均蒸發量高達2480毫米。境內有大小河流36條，其中喀拉喀什河、玉龍喀什河是最大的兩條河流，年徑流量73億多立方米。
古代和田稱為「于闐」（üdün），為一綠洲城邦，是絲路西域南道（漠南道）上的要衝。「于闐」是西方古藏語中「玉城」、「玉村」之意，因為該地產玉，成為該處居民的名稱。
玄奘法師翻譯的梵語文獻中稱其為「瞿薩旦那」，原音為Gaustana、Godana或Godaniya，意為「牛地」或「大地乳房」。這個稱呼可能對藏語產生影響，因而轉音為于闐。藏語至今仍有Gosthana這一稱呼 。此城還有一古突厥語別名「伊里斉」。
「于闐」在中古漢語中音轉為「和闐」（Hotan、Khotan、Hetian或Hotien），維吾爾語沿用，也將此名稱用作「產玉處」之意。
*光緒九年（1883年），置和闐直隸州，駐喀拉喀什（今墨玉縣城）。
*光緒二十八年（1902年），設皮山縣；分和闐縣東境23莊與于闐縣西境15莊設洛浦縣。
*民國二年（1913年），改和闐直隸州為和闐縣。
*民國四年（1915年），自和闐縣析置墨玉縣。
*民國九年（1920年），設和闐道。
*民國十七年（1928年），改和闐道為和闐行政區，設行政長官公署。
*民國十八年（1929年），設策勒縣。
1931年哈密事變後，1933年和闐與其他城市叛軍合流，成立東突厥斯坦伊斯蘭共和國。隔年2月5日，馬仲英的部下馬福元聯合馬占倉攻克了疏附，東突厥斯坦伊斯蘭共和國瓦解，官員四散而逃。穆罕默德·伊敏（Muhammad Amin Bughra）逃回和闐，在4月建立和闐伊斯蘭王國。6月12日，馬仲英的先頭部隊攻克和闐，和闐伊斯蘭王國滅亡。6月底，馬仲英的姐夫馬虎山率36師主力從皮山來到和闐，和闐以「Khotan」一名成為回族政權東干斯坦（Tunganistan）的中心，並維持獨立到1937年被蘇聯支持的盛世才攻克為止。
*民國三十二年（1943年），改和闐行政區為和闐專區，設行政督察專員公署。
*民國三十六年（1947年），設民豐縣。
*1949年12月22日，中國人民解放軍十五團抵達和闐
*1950年，設立和闐專區專員公署。
*1959年9月，改和闐為和田。
*1971年6月，改和田專區為和田地區。
*1977年，建立和田地區行政公署。
*1979年，建立和田行政公署。
*1983年9月，自和田縣析置和田市。
1991年6月至1992年3月，和田地區發生了六起對漢族居民的持槍襲擊事件。據文匯報記者在烏魯木齊的報導，2005年1月至8月，當局在和田地區查獲了6個「地下非法教經點」，查收非法宗教書刊100餘本、音像製品972盒和帶有違法的各類物品1,874件
*2016年，和田地區析置昆玉市。
和田地區南越昆侖山抵藏北高原，東部與巴音郭楞蒙古自治州毗連，北部與阿克蘇地區相鄰，西部連喀什地區，西南枕喀喇昆侖山與印度、巴基斯坦爭議之克什米爾接壤，有邊界線210公里。東西長約670公里，南北寬約600公里，總面積24.78萬平方公里。北低南高，并由西向東緩傾。地勢由北部的海拔1050米上升到南部山地7167米。山區、山地、北部平坦區界限分明，從地貌上粗略劃分，一半為盆地，一半為山區山地。綠洲面積9730平方千米。和田地區南部昆侖高山成弧形橫貫著東西，峰巒重疊，山勢險峻。北坡為淺丘低山區，峽谷遍布，南坡則山勢轉緩。山脈高峰一般海拔為6000米左右，最高達7000米以上。由于氣候干燥，荒漠高度一般達3300米，個別地段可達5000米，南北坡雪線分別在6000米和5500米以上。
和田地區境內有安迪爾河、尼雅河、克里雅河、策勒河、玉龍喀什河、喀拉喀什河、桑株河、皮山河、加勒萬河、天南河、昌隆河、薩利吉勒干西河、奇普恰普河等大小河流36條，年徑流量74億立方米。河流季節反差極大，夏季洪澇，秋冬嚴重干旱，春季極為缺水，4-5月來水量僅占全年的7%。和田地區河流大都是內陸河。一般可劃分為皮山、和田-墨玉-洛浦、策勒-于田-民豐及羌塘高原湖區等5個內流區。此外尚有印度洋流域的奇普恰普河外流區（年外流水量2.93億立方米）。平原區有大小河流36條，引用灌溉和人畜飲水的有30條。
和田地區位于歐亞大陸腹地，帕米爾高原和天山屏障于西、北，西伯利亞的冷空氣不易進入；南部的昆侖山、喀喇昆侖山阻隔了來自印度洋的暖濕氣流，形成了暖溫帶極端干旱的荒漠氣候，四季分明，夏季炎熱，冬季冷而不寒，春季升溫快而不穩定，常有倒春寒發生，多風沙天氣，秋季降溫快；全年降水稀少，光照充足，熱量豐富，無霜期長，晝夜溫差大。春季多沙暴、浮塵天氣，夏季炎熱干燥，年均降水量35毫米，年蒸發量2 480毫米。四季多風沙，每年沙塵天氣220天以上，其中濃浮塵（沙塵暴）天氣在60天左右，和田浮塵天氣日數平均每年增加2.5天，全年無一、二類天氣，三、四類天氣28天，五類天氣300天左右，月平均降塵量124噸/平方公里。全區大致可分為南部山區，綠洲平原區，北部沙漠區三種氣候類型。
+和田地區四大機構現任領導人
中國共產黨和田地區委員會
新疆維吾爾自治區人民代表大會常務委員會和田地區工作委員會
新疆維吾爾自治區人民政府和田地區行政公署
中國人民政治協商會議新疆維吾爾自治區委員會和田地區工作委員會
艾爾肯·依不拉音
多力坤·阿不都熱依木
新疆維吾爾自治區阿圖什市
和田地區下轄1個縣級市、7個縣。
* 縣：和田縣、墨玉縣、皮山縣、洛浦縣、策勒縣、于田縣、民豐縣
和田地區行政區劃圖
奴爾巴格街道
和田市古江巴格街道
根據2010年第六次全國人口普查，全地區常住人口為2014362人，同第五次全國人口普查相比，十年共增加333052人，增長19.81%。年平均增長率為1.82%。其中，男性人口為1028276人，占51.05%；女性人口為986086人，占48.95%。總人口性別比（以女性為100）為104.28。0－14歲人口為528320人，占26.23%；15－64歲人口為1398333人，占69.42%；65歲及以上人口為87709人，占4.35%。
常住人口中，漢族人口72279人，占總人口的3.59%，各少數民族人口1942083人，占總人口的96.41%。維吾爾族占96.3%、漢族占3.5%、其他民族占0.2%，有維吾爾、漢、回、塔吉克、柯爾克孜等22個民族成份。
+ 和田地區民族構成（2010年11月）
Khotan-mercado-d37.jpg|鐵器商場
Khotanese silks.jpg|絲綢店
Khotan-mercado-d65.jpg|機械零件業
Khotan-ciber-d01.jpg|網咖街
Khotan-mercado-d62.jpg|伐木業
Weaving silk, Khotan.jpg|手工紡織業
Khotan-mercado-d56.jpg|竹蓆市場
Khotan-mercado-d41.jpg|維吾爾族攤販
吐魯番市（，意為富庶豐饒的地方，《回回館譯語》中稱土魯番）是中華人民共和國新疆維吾爾自治區下轄的地級市，位于新疆東部。市境西北接烏魯木齊市，北鄰昌吉州，東毗哈密市，南、西界巴音郭楞州。地處天山山脈東段南麓，北半部為吐魯番盆地，南半部為庫木塔格沙漠和南湖戈壁。北有博格達山，南有庫魯克塔格山。位于吐魯番盆地中心的艾丁湖面比海平面低154米，是中國大陸的海拔最低點。全市總面積69,759平方公里，人口65.19萬，市政府駐高昌區。
生活于吐魯番盆地一帶的土著居民是姑師人。他們在吐魯番盆地上建立了姑師（后稱車師）國、狐胡國、小金附國、車師后城長國、車師都尉國。
漢武帝建元三年（前138年），派張騫出使西域，聯合西域各國。由此，西漢王朝與匈奴對姑師展開了長期的反復爭奪。漢武帝元封三年（前108年），漢遣將軍趙破奴和王恢率騎數萬克樓蘭，破姑師。姑師改稱車師，臣屬于西漢王朝。車師以博格達山南北形成車師國。不久，匈奴又控制了車師。漢武帝天漢三年（前99年），漢以匈奴降將介和王成娩為開陵侯，率樓蘭國兵擊車師，匈奴遣右賢王率數萬騎救援，漢兵敗歸。漢征和四年（前89年），漢又派開陵侯率樓蘭等六國兵共圍車師，車師王投降漢朝。漢昭帝元平元年（前74年），匈奴重新占領車師，派四千騎兵在此屯田。漢宣帝本始三年（前71年），漢朝與烏孫聯兵從東西夾擊匈奴，車師屯田匈奴兵驚懼逃走，車師又屬漢。之后車師王與匈奴聯姻，漢又失車師。漢宣帝地節二年（前68年），漢侍郎鄭吉率兵攻占車師交河城，派駐士兵300人屯田車師。匈奴派兵再次爭奪。漢宣帝元康四年（前62年），漢放棄車師。漢宣帝神爵二年（前60年），匈奴內亂，匈奴日逐王率眾降漢。車師之地隨之歸屬漢朝。這五次重大的車師之爭，史稱“五爭車師”。西漢在統一西域的同年（前60年），在西域設立西域都護府，鄭吉為首任都護。車師歸漢后，漢“分以為車師前后王及山北六國”，把原來車師人的領地按地理形勢劃分為八國，其中車師前國在博格達山南現吐魯番境內。《漢書·西域傳》載“車師前國，王治交河城（今吐魯番市交河故城），河水分流繞城下，故號交河。去長安長八千一百五十里，戶七百，口六千五十，勝兵千八百六十五人”。漢元帝初元元年（前48年），漢朝在車師前國設置戊已校尉，駐交河城，掌管西域屯田事務。漢咸帝陽朔四年（前21年），戊已校尉移駐高昌壁（今吐魯番市高昌故城）。到東漢光武帝建武元年（25年）車師前國已全部吞并了吐魯番境內諸國，交河城成為吐魯番第一個政治、經濟、文化中心。東漢明帝永平十八年（75年）后，匈奴圍攻車師.匈奴與漢朝又反復爭奪。戊已校尉隨之幾經撤回、恢復。東漢安帝延光二年（123年），西域長史班勇率兵五百出屯柳中（今鄯善縣魯克沁），攻克車師。延光三年（124年），復置戊已校尉。
魏晉時期，為了躲避中國內地戰亂，眾多內地的漢族人口移往高昌，與當地土著融合。北涼王族沮渠氏（屬於盧水胡人）消滅了車師國，450年建立了漢化的高昌國。高昌國後被柔然壓迫而衰弱，其後在北方遊牧民族（柔然、高車、突厥）之影響下變成了闞、張、馬、麴四氏王。晉朝，車師前國歸晉，晉朝戊已校尉仍設在高昌。西晉滅亡后，涼州（今甘肅武威）建立了前涼。東晉咸和二年（327年），前涼王張駿攻占高昌，擒獲叛將戊已校尉趙貞，始置高昌郡，立田地縣。隸屬沙州（今甘肅敦煌）。東晉太元元年（376年），前秦苻堅滅前涼。高昌郡屬前秦、隸屬涼州。東晉太元十年（386年），奉命西討龜茲（今庫車）的前秦大將呂光入破伊吾關、攻占涼州。后涼建立後，高昌、車師前國屬后涼。太元十八年（394年），呂光遣其子呂覆為西域大都護、鎮守高昌。東晉安帝隆安一年（397年），后涼建康（今甘肅酒泉西南）太守段業為大都督，涼州牧，建康公，改元神璽，占據高昌。東晉隆安四年（400年），李暠建立西涼，在高昌設郡。車師前國臣屬西涼。東晉義熙八年（412年），沮渠蒙遜建立北涼。公元420年，北涼主沮渠蒙遜攻滅西涼，高昌易主北涼，車師前國向其稱臣。北魏太延五年（439年），北魏滅北涼，闞爽自立為高昌太守。北涼殘部西奔鄯善（今若羌縣境）。北魏太平真君三年（442年），北涼殘部在沮渠無諱的率領下，攻占高昌，于翌年改元承平，號涼王。并西攻車師前國。北魏太平真君十一年（450年），車師前部王伊洛隨魏軍西征，留子歇守國。沮渠安周與柔然聯兵圍攻車師前國交河城，車師兵敗，西奔焉耆，車師前國亡。
北魏和平元年（460年），柔然殺高昌王，高昌人立闞伯周為高昌王，高昌城為國都，建立了一個漢族地方王朝。高昌城成為吐魯番的政治、經濟、文化中心。北魏文帝太和五年（481年），高昌人立張孟明為高昌王。公元496年，高昌人殺張孟明，另立馬儒為王。公元501年，高昌人殺馬儒而立麴嘉為王。麴氏高昌王國曾先后依附于柔然、高車、突厥，臣服于北魏、西魏、周和隋，并受其冊封。王國建置為郡，縣、城制，縣下設鄉，鄉下設里。從闞伯周開始，吐魯番進入高昌王國時期。唐朝征服了高昌國，并設置安西大都護府，吐魯番在此期間一直遵循與內地較一致的制度和風俗習慣。唐朝的國力影響至9世紀直到後來高昌回鶻國佔據吐魯番之前。高昌回鶻國是回鶻人西遷至現在的新疆一帶后在當地建立的，與之前當地建立的漢化的高昌國是兩回事。
唐滅高昌時，高昌王國有交河、田地、南平3郡；白蘇、永安、無半、鹽城、柳婆、始昌、林、新興、龍泉、安昌、酒泉、威神、橫截14縣；高寧、臨川、寧戎、永昌、諸城、篤進、東鎮7城。唐貞觀十三年（639年）高昌叛唐，投西突厥，阻斷西域通道。唐貞觀十四年（640年），唐派吏部尚書候君集為交河道行軍大總管率師伐高昌。平定高昌后，設西昌州，改為西州，實行縣（鄉）、里制，下轄五縣。高昌縣、柳中縣、交河縣、天山縣（今托克遜縣境內）、蒲昌縣（今鄯善縣境內）。唐置西州的同年，設安西大都護府于交河城，以喬師望為首任安西都護兼西州刺史。安西大都護府領轄22個都督府，118個州。唐貞觀二十二年（648年），安西大都護府遷至龜茲。唐永徽元年（651年），復撤回西州。唐顯慶三年（658年），再次遷龜茲。西州改置為西州都督府。唐龍朔二年（662年），吐蕃軍隊進入西域，開始了與唐長年的西域爭奪。唐咸亨元年（670年），吐蕃與西突厥聯兵攻陷西域十八州，唐放棄安西四鎮，退守西州。唐昌元年（689年）安西大都護府復移至西州。唐長壽元年（692年），又遷于龜茲。唐開元二年（714年），唐置天山軍于西州境。唐天寶元年（742年），改西州為交河郡。唐乾元元年（758年），又恢復西州原建置。唐貞元六年（790年），吐蕃與回鶻爭奪北庭（今吉木薩爾），吐蕃占北庭。隨后，攻占西州。吐蕃與回鶻對西州進行了長年反復的爭奪，最終回鶻控制了西州。唐咸通七年（866年），北庭回鶻仆固俊克西州，建立以高昌為中心的高昌回鶻王國，國都高昌城。史稱“西州回鶻”或“高昌回鶻”，後為西遼所滅。蒙古帝國征服了西遼，領有察合臺汗國，其分裂為東察合臺汗國（吐魯番汗國）和西察合臺汗國（葉爾羌汗國）。吐魯番的名字由明朝開始流行，意思是「窪地」。據西域番國志，15世紀初明永樂帝受命的陳誠由陸路到訪此地。
清乾隆二十年（1755年）平定準格爾，控制吐魯番地區。乾隆二十一年（1756年），蒙古額敏和卓率部遷回魯克沁（今鄯善縣魯克沁）。乾隆二十三年（1758年）封額敏和卓為郡王。清乾隆二十四年（1759年），清置辟展（今鄯善縣城）辦事大臣及同知，隸甘肅布政司。建吐魯番六城：辟展（今鄯善縣城）、吐魯番城（今吐魯番市東南）、魯克沁、色更木（今勝金）、哈喇和卓、托克遜。辦事大臣駐辟展。設辦事大臣后，吐魯番實行軍府制與扎薩克制并行，扎薩克由郡王擔任。清乾隆三十六年（1771年）設辟展巡檢。清乾隆四十四年（1779年），辟展辦事大臣改為吐魯番領隊大臣，及同知，移駐廣安城（今吐魯番市老城），行政中心移吐魯番市。光緒十年（1884年）新疆建省，吐魯番直隸廳成立，轄今吐魯番、鄯善、托克遜范圍。光緒二十八年（1902年），辟展巡檢改置為鄯善縣，隸屬吐魯番廳。
榮赫鵬于1887年在由北京去印度途中經過吐魯番。他提到吐魯番當時由兩個分開的城池組成，其中一個是人口近5000的漢城，另一個是位于漢城西邊一英里（1.6千米）的回城，人口在12,000至15,000人之間。回城城池四方各有一個城門，城門為磚砌并有結實的木門板，木門上裝飾著鐵片且被半圓形防御工事包裹著。粘土夯砌的城墻保養得很好，有大約35英尺（10.7米）高、20至30英尺（6米至9米）厚，墻頂有射擊孔。筑城墻外圍的空地約15碼（14米）處又有一層約6英尺（2.4米）高的步槍射擊用墻，墻下更有條12英尺（3.7米）深、20英尺（6米）寬的壕溝。鼓樓部署在幾個入口處，小方塔立在城池的四個角，城門與城墻轉角處之間設有兩座小的方形防御工事，“每面各兩個”。四周圍的田野中種植了小麥、棉花、罌粟、瓜果葡萄等。
吐魯番圖書館
*民國二年（1913年），吐魯番直隸廳改置為吐魯番縣，轄今吐魯番市高昌區、托克遜縣范圍。同與鄯善縣隸屬新疆省迪化道（今烏魯木齊）。
*民國九年（1920年），吐魯番縣、鄯善縣屬焉耆道。
*民國十七年（1928年），縣公署改為縣政府，縣知事改為縣長，縣下設鄉，改鄉約為農官。
*民國十九年（1930年），置托克遜設治局。
*民國二十五年（1936年），置托克遜縣。
*民國二十七年（1938年），吐魯番、鄯善、托克遜三縣隸屬迪化專區。
*民國三十八年（1949年），吐魯番縣共有3鎮、9鄉、68保、795甲；鄯善縣2鎮、5鄉、24保、196甲；托克遜縣1鎮、3鄉、20保，120甲。
*1950年至1957年，吐魯番、鄯善、托克遜三縣隸屬新疆省迪化專區（后改為烏魯木齊專區）。