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前334年亞歷山大率軍從赫勒斯滂出發渡海到亞洲，他的遠征軍由馬其頓部隊、各希臘城邦的部隊、雇傭兵、以及臣服的色雷斯、培奧尼亞、伊利里亞部族部隊所組成。史料上對於亞歷山大全軍的人數有些許差異，古羅馬歷史學家阿里安使用托勒密的回憶錄作為資料來源，說遠征軍共超過30,000名步兵、5,000名騎兵度過海峽。西西里的狄奧多羅斯提供的人數大致相同，說用32,000名步兵、5,100名騎兵，但狄奧多羅斯提到當時已有一支先遣軍在幾年前就已經渡過海峽了。波利艾努斯在他的《戰略》描述，這支先遣軍人數有一萬人。因此，亞歷山大全軍的人數全部總共大約48,100名步兵、6,100名騎兵，算上海軍的話還有160艘戰船及38,000名水手，雖然這支艦隊沒派上甚麼用場。為了籌組這支大軍。亞歷山大幾乎耗盡他的國庫，原本腓力留給他的資金就沒剩多少，使得他只夠維持30天的補給，國庫還欠了1,300塔蘭同。
當亞歷山大所率領軍隊渡過達達尼爾海峽來到亞洲，據說他是第一位登陸的，當時他丟出一支長槍插入亞洲的土地上，意味著亞洲將是神明給他的禮物，也代表這塊領地他要用武力贏來。這也顯示，不像腓力二世喜好用外交手段，而亞歷山大熱衷用武力解決。在小亞細亞亞歷山大和小部分軍隊首先訪問了特洛伊，他和他童年來的好友赫費斯提翁分別祭拜阿基里斯和阿基里斯的好友帕特羅克洛斯。隨后亞歷山大與帕曼紐帶領的其余部隊會合，繼續進軍。
此時波斯小亞細亞的總督們已經把各行省的軍隊聚集起來，準備與亞歷山大一戰，然而在波斯軍的軍事會議上希臘雇傭軍將領羅德島的門農建議避戰，建議採用焦土戰略阻止亞歷山大的遠征軍獲得補給，但由于波斯地方總督憐惜他們的財產，未被采納。雙方在前334年4月28日於格拉尼庫斯河戰役正面交戰。亞歷山大在戰役中自己率領著夥友騎兵，率先與總督們所率的波斯騎兵交戰纏鬥。在這場激烈的騎兵交戰中，波斯多位地方總督和高級將領紛紛陣亡，顯眼的亞歷山大也是波斯騎兵的目標紛紛朝他殺去，使得亞歷山大不僅受了傷，還差點送了命，幸好及時被克利圖斯相救。因為亞歷山大和馬其頓夥友騎兵的奮戰，殺退波斯騎兵，多位波斯將領陣亡也使波斯軍指揮系統大亂，使波斯軍全線潰敗，除了波斯軍陣營的希臘傭兵部隊還可以井然抱持陣形退到附近山地上。亞歷山大拒絕波斯陣營的希臘雇傭兵的求和，氣憤這些希臘傭兵背棄祖國，以及防止以後還有希臘雇傭兵加入波斯陣營，亞歷山大對殘餘的希臘傭兵發動猛攻，屠殺大部分希臘雇傭兵，其余被押回馬其頓強迫勞動。他將300領波斯鎧甲作為給雅典娜的祭品送回雅典衛城，帶著如下題字：
:「謹獻上從亞洲波斯人手中俘獲的這些戰利品。來自腓力之子亞歷山大和全希臘人敬獻，拉刻代蒙人除外。」
在初次與波斯軍交手且出師大捷後，亞歷山大繼續朝利底亞行省首府的薩第斯前進，當地守將很快就向亞歷山大投降，使他得到了安置於薩第斯的財寶。接著亞歷山大把矛頭轉向愛奧尼亞沿海，當地的希臘城市紛紛推翻親波斯的寡頭政府，倒向亞歷山大。亞歷山大給予愛奧尼亞希臘自治，要他們建立民主體制。然而希臘城市米利都尚有波斯軍隊駐紮，且有波斯艦隊在附近支援，亞歷山大只好率軍前去發動圍城戰。圍城戰結果很快以馬其頓軍勝利告終，但波斯艦隊龐大的實力讓亞歷山大深知馬其頓艦隊實力無法其抗衡，造成日後決定奪取所有波斯海軍基地的戰略方針。
之後，他率領大軍繼續往南至卡里亞，那裡波斯卡里亞總督歐戎托巴提斯（Orontobates）聚集一支軍隊堅守在哈利卡那索斯城，波斯陣營希臘雇傭軍將領羅德島的門農在大流士三世的任命下擔任小亞細亞總指揮和整個波斯艦隊司令，門農他在哈利卡那索斯盡所能的加強防禦，更在港口駐守艦隊防備，準備與亞歷山大長期對抗。亞歷山大於是發動哈利卡那索斯圍城戰，這場攻城城規模相當大，雙方互有攻防，最後門農和歐戎托巴提斯眼看守不下去放火燒了城市，主動從海路撤離，使亞歷山大僅拿到一座殘破的城市而已。亞歷山大讓當地海卡托諾斯家族的阿妲擔任他自己的卡里亞總督，並認阿妲為乾媽。
拿下哈利卡那索斯之後，亞歷山大轉而進攻呂基亞和龐非利亞，之後因為從龐非利亞沿海開始已沒有主要海港後，亞歷山大斷定他已經控制可能成為波斯海軍基地的各個沿海城市，把目標轉向小亞細亞內陸。亞歷山大開始征討皮西迪亞，但在特梅索斯（Termessos），他判斷圍攻這座易守難攻的城市太花時間，放棄攻打。進軍至內陸中部的戈爾迪烏姆（Gordium）並在那裏過冬時，他聽聞當地有個傳說，有神諭說如果有人能解開戈耳狄俄斯牛車上車軛上的繩結，就是未來的「亞細亞霸主」。傳說亞歷山大親眼去見識戈耳狄俄斯之結，傳說他靈機一動，注意到神諭並沒有限定解開的方法，他拔劍往繩結上一砍斬斷了繩結，就這樣解開繩結。
從龐貝農牧神之家挖掘出來的亞歷山大馬賽克，上描繪伊蘇斯戰役場景
前333年春，亞歷山大率領遠征軍從過冬營地開拔，通過托羅斯山脈隘口進入奇里乞亞，這時他生了大病，全軍因此在奇里乞亞停留一陣子。痊癒後他聽聞波斯國王大流士已經聚集一支大軍來到不遠處的敘利亞，亞歷山大便朝大流士的方向進軍，半途中他接到報告，說大流士迂迴至他後方切斷他的後路，亞歷山大連忙折回，雙方在伊蘇斯戰役展開決戰。儘管波斯兵力上的占盡優勢，但波斯步兵素質的低劣斷送了整場戰事，讓亞歷山大成功領導夥友騎兵突破波斯左翼陣列。更重要的是，大流士三世在戰爭末段棄甲逃離戰場，不僅讓他的軍隊崩壞，連母親西緒甘碧絲、妻子和孩子都被亞歷山大俘虜，亞歷山大擄得波斯軍龐大的軍資。大流士戰後向亞歷山大求和，願割讓領土交換和平以及贖回親屬，但這些都被亞歷山大回絕，並自認現在他是亞細亞霸主，要求大流士向他臣服。
伊蘇斯的大勝使敘利亞和黎凡特各城市很快地向亞歷山大投降，然而腓尼基泰爾市民他們想兩頭下注，不願意倒向亞歷山大，這讓亞歷山大相當惱火，於是率領馬其頓軍隊圍攻泰爾。但因泰爾城坐落於小島上，城牆緊鄰海邊的關係，使遠征軍無法以正規方法攻下這座城市，這場泰爾圍城戰歷經七個月之久，終究淪陷。破城後，亞歷山大縱放士兵們的怨氣，屠城，並把倖存的30,000名泰爾市民貶為奴隸。
在圍城戰期間，波斯國王大流士再一次提出和平協議，這次他願把半個波斯帝國割讓給亞歷山大，還願把女兒嫁給他。亞歷山大的老將帕曼紐認為這個條件很好，說如果我是亞歷山大，就會同意這些條件，停止戰爭。但亞歷山大回答：「如果我是帕曼紐，我當然會這么辦，但因為我是亞歷山大，那我就要用亞歷山大實際上會使用的言語去回答大流士。」並對波斯來使說，他不要錢財或獲得波斯國土的一部分而非全部，因為這些遲早都會是他的，至於聯姻，不管大流士三世願不願意，他都可以娶，因為大流士的女兒現在在他手裡。
泰爾圍城戰之後，往埃及沿途上的城鎮都很快向亞歷山大投降，他沿著海岸線往埃及的門戶加薩前進。加薩的波斯宦官兼指揮官巴提斯雇了一支阿拉伯傭兵，準備要依靠加薩牢固的城牆堅守。圍城戰中，加薩城因為座落在高崗上，馬其頓軍的投石機無法利用平射的石彈來轟擊城牆，於是亞歷山大命人在較易攻破的南段城外堆了一道土岡，來利於投石機攻擊。歷經對城內發動突擊失敗三次後，在第四次攻擊下加薩城陷落，如同泰爾城的下場，加薩也遭到洗劫，居民被賣為奴隸。至此在往埃及道路上已經沒有敵人的軍隊阻礙亞歷山大了。
多數古代歷史學家如阿里安都提到亞歷山大結束加薩戰役後，直接奔往埃及。但羅馬帝國時期的猶太歷史學家弗拉維奧·約瑟夫斯記載亞歷山大攻破加薩後，折返往耶路撒冷前進，在耶路撒冷聖殿向上帝獻祭，對猶太人相當優待 。儘管現代學者多認為約瑟夫斯有誤，認為就算亞歷山大真的來過耶路撒冷，也不是在這個時候。
前330年，以埃及聖書體拼出亞歷山大的名字，從右往左書寫，今收藏於羅浮宮。
因為大流士三世在之前曾徵調埃及總督和他的波斯駐軍前來伊蘇斯戰役參戰，隨著波斯軍大敗以及埃及總督戰死，加上波斯在埃及剩餘的力量戰後又被本土的埃及人擊敗，因此當亞歷山大來到埃及後毫無阻礙，埃及人視亞歷山大為他們的解放者，受到他們熱烈歡迎，並被視為埃及法老。亞歷山大決定在埃及海岸進尼羅河口處興建一座城市，以自己的名字名為亞歷山卓，這座城市後來發展成與羅馬城、安條克城、塞琉西亞相媲美的大城市，也是之後托勒密王國的首都。
安頓好埃及事務後，亞歷山大決定前去埃及西方沙漠錫瓦綠洲的阿蒙神廟求神逾，在那裏他被承認是宙斯-阿蒙之子，而往後他遠征東方時時常向阿蒙神獻祭。宙斯-阿蒙的形象是宙斯頭上有公牛角，而在亞歷山大去世後，頭長公牛角的亞歷山大即是描繪他神性的象徵。
前331年亞歷山大率軍離開埃及，並朝東方美索不達米亞的方向進軍，而波斯國王大流士三世此時聚集了一支比伊蘇斯戰役時規模更龐大的軍隊等著亞歷山大前來，雙方在高加米拉戰役開始了亞歷山大最著名的戰役。這場戰役大流士在這次戰役的一些條件比伊蘇斯戰役時更有利，他的軍隊又更龐大，數目上比馬其頓軍多了更多，戰場又由他選定且經過特別整理，使他的調度可以不受限制，大流士還準備大量的刀輪戰車要來對付馬其頓的步兵方陣。戰役中，人數眾多的波斯軍成功迫使馬其頓軍左翼陷入苦戰，在馬其頓中央方陣甚至一度被波斯軍突破，有支波斯騎兵甚至殺入馬其頓後方的大營內企圖解救大流士家眷。但還是無法在短時間內就擊敗馬其頓軍，而訓練有序的馬其頓士兵們也讓大流士的戰車戰術無法起到作用，這讓亞歷山大大帝贏得足夠的時間，藉由巧妙的調度誘使波斯軍中央和左翼自己暴露出個缺口，亞歷山大把握戰機率領夥友騎兵一舉朝著這個缺口衝鋒，在此決定性打擊下，亞歷山大所率領的部隊一路殺到大流士所在的位置前，大流士備感威脅，再度怯懦倉皇逃跑，拋棄他的軍隊率先保命去了。主帥過早逃亡使他的龐大軍隊隨即土崩瓦解。那一天上萬的波斯軍士兵戰死，更多遭到俘虜，這場戰役標誌著波斯帝國的覆滅。
戰後，巴比倫尼亞各城市向亞歷山大投降，其中包含最大的城市巴比倫城。而大流士則逃往更東方米底亞的埃克巴坦那召集敗兵，並且希望能再度組建一支新的軍隊。
波斯門，公路建於1990年代。
從巴比倫出發，亞歷山大接著朝阿契美尼德王朝另一個首都蘇薩進軍，並奪取該地的財寶。隨後他派帕曼紐率領一半的軍隊沿著波斯御道朝波斯帝國禮儀上的首都波斯波利斯前進，自己則率領另一半軍隊經札格羅斯山區波斯門分頭前去波斯波利斯。然而波斯門此時已被波斯將軍阿爾塔巴左斯領軍封鎖，迫使亞歷山大強行突破關口，搶先在波斯波利斯的波斯駐軍掠奪當地財庫前先到達該城。
進入波斯波利斯後，亞歷山大允許他的軍隊大肆掠奪該城數天，自己把則把薛西斯一世的王宮東部放火給燒了，這大火後來擴散到其他城區，放火的理由可能是酒醉後誤事，或是蓄意為薛西斯在希波戰爭曾燒了雅典衛城之事報仇，事後亞歷山大相當後悔自己的燒了波斯波利斯。他在波斯本土那裏待了4個月。
普魯塔克記載了一段亞歷山大停留此地的軼聞，描述他在皇宮見到一座傾倒的薛西斯一世雕像，好像雕像是活人般亞歷山大自言自語向他說話。
亞歷山大大帝的銀幣，正面是亞歷山大頭戴獅皮，裝扮成海格力士的樣子，今收藏於大英博物館.
亞歷山大開始追捕大流士，首先來到米底亞，接著往帕提亞前去。威望盡失的波斯國王最後連自己的命運也無法掌握，被自己的巴克特里亞總督貝蘇斯囚禁。貝蘇斯趁著亞歷山大的追兵接近，讓人刺死大流士，意圖顯示大流士死於亞歷山大手中，之後宣稱自己是新的波斯國王，自命為阿爾塔薛西斯五世。而後貝蘇斯退入中亞，向亞歷山大發起游擊戰術。亞歷山大隆重為大流士舉辦王室葬禮，葬於波斯皇家墓園之中。他宣稱大流士臨死前指定他為波斯王位繼承者，並要為大流士之死向貝蘇斯報仇。波斯阿契美尼德王朝終結於大流士三世之死。
亞歷山大視貝蘇斯為僭位者，開始討伐他。這次征討原本是對付貝蘇斯，後來演變成中亞的征服行動，不僅征服巴克特里亞，還征服索格底亞那。為了鎮壓當地民族，亞歷山大在中亞建立一連串希臘城市，皆命名為亞歷山卓，其中包含今日的阿富汗的坎大哈、絕域亞歷山卓等等。這次征戰遍及帕提亞、阿利亞、德蘭吉亞那（Drangiana）、阿拉霍西亞、巴克特里亞、索格底亞那等地。
其中，貝蘇斯的索格底亞那總督斯皮塔米尼斯於前329年反叛貝蘇斯，他把貝蘇斯交給亞歷山大的夥友托勒密，隨後貝蘇斯就被以叛國的名義處死。之後，當亞歷山大在查可薩提河畔（Jaxartes），即今日錫爾河處理進犯的遊牧民族軍隊時，斯皮塔米尼斯於索格底亞那反叛，亞歷山大他親自在查可薩提河戰役擊敗斯基泰人後，回軍擊敗斯皮塔米尼斯。戰後斯皮塔米尼斯方的軍士為了向亞歷山大求和，反叛並殺了斯皮塔米尼斯。
克利圖斯被殺，安德烈·卡斯泰涅（André Castaigne）所繪
在中亞這段時期，亞歷山大在他的宮廷中採納一些波斯服裝和波斯禮儀，其中最著名的禮儀是服從禮（proskynesis）。服從禮從象徵性地親吻手，到最隆重的向國王匍匐在地施禮，波斯人以此禮來顯示國王尊貴的社會地位。傳統上希臘人僅向神明才會用此禮儀，因此馬其頓人和希臘人他們認為亞歷山大是要把自己提高地位等同神祉，並以此要他們向他施禮。這使亞歷山大的馬其頓和希臘臣民相當反感，最後亞歷山大放棄讓他的馬其頓臣民對他施行服從禮。
期間也透漏有陰謀威脅他的性命。他的重要將領菲羅塔斯，也是遠征軍第二號人物帕曼紐之子，菲羅塔斯被影射涉入一場對亞歷山大的陰謀，而被處死。菲羅塔斯之處死，迫使亞歷山大要在短時間處置遠在後方鎮守埃克巴坦那的寶庫帕曼紐，亞歷山大派人命帕曼紐副官殺了這位老臣來消除報復的可能性。此外，還有一次亞歷山大在撒馬爾罕酒宴中，曾經於格拉尼庫斯河戰役中救了他的性命的克利圖斯大聲斥責亞歷山大數個錯誤，其中最重要的是他指責亞歷山大忘了馬其頓人的傳統，而去喜好腐敗的東方生活風格，喝醉的亞歷山大在大怒下失手殺了克利圖斯。
過了不久，在中亞行動時第二次對國王不利的陰謀再一次被揭發，這一次是他的王室僕從主使，其中他的官方史官卡利斯提尼被懷疑涉入這場陰謀，儘管卡利斯提尼罪嫌不足，但因卡利斯提尼曾反對亞歷山大引入服從禮，失去亞歷山大寵信的他下獄後不久隨即去世。
當初亞歷山大離開馬其頓遠征波斯時，他留下熟練政事和軍事的老臣安提帕特擔任馬其頓的攝政。先前亞歷山大因為屠城底比斯的緣故，使他離開歐洲後其它希臘城邦相對安份 ，然而斯巴達卻蠢蠢欲動。斯巴達在配合波斯小亞細亞統帥門農的誘導下意圖謀反，前331年斯巴達國王亞基斯三世舉兵反抗馬其頓並試圖建立一個反馬其頓陣營，安提帕特迅速帶兵南下希臘，在梅格洛玻利斯戰役壓倒性兵力的擊潰斯巴達軍 。戰勝後安提帕特希望訴諸於科林斯同盟的名義懲處斯巴達，但亞歷山大選擇寬恕他們。另外，安提帕特和亞歷山大的母后奧林匹亞絲相處很不愉快，他們雙方經常寫信給亞歷山大抱怨對方。
整體而言，亞歷山大離開歐洲去征討的這段期間，希臘享受一段和平且繁榮的日子。亞歷山大把他大量從東方掠奪得到的財富送回希臘和馬其頓，刺激了當地經濟，同時亞歷山大發行大量的貨幣也鼓動帝國的商業以及貿易。然而，亞歷山大持續向馬其頓本土要求援軍，使馬其頓本土人力日漸衰竭，尤其是後來的繼業者戰爭及移民東方，更使馬其頓本土人力耗盡，最後導致高盧人南侵肆虐馬其頓本土，直到羅馬人前來之時馬其頓都沒回覆之前的元氣，最終導致馬其頓安提柯王國滅亡於羅馬。
描繪希達斯皮斯河戰役的場景，安德烈·卡斯泰涅（André Castaigne）所繪
在斯皮塔米尼斯死後以及他與巴克特里亞貴族之女羅克珊娜結婚之後，認為已經鞏固中亞的統治，開始把目光轉向印度次大陸。他要求原本臣屬於波斯帝國統治下的健馱邏地區印度各首領來覲見他並向他臣服，此舉卻只有塔克西拉的國王塔克西萊斯回應。其他印度山地部族如阿斯帕西亞（Aspasioi）和堪波佳斯（Kambojas）地區的阿薩西尼亞人（Assakenoi）拒絕臣屬。當亞歷山大往印度方向進軍時，塔克西萊斯匆忙的來向他晉見，他的王國位於今日巴基斯坦從印度河到傑赫勒姆河之間，他除了呈上許多禮物外，還把自己的軍隊納入亞歷山大遠征軍的附屬部隊中。亞歷山大大帝不僅讓他繼續保持國王頭銜、領土、他送的禮物，還送他一個衣櫃的波斯禮服，以及金、銀飾品、30匹良馬、1000塔蘭同重的黃金。
前327/326年冬季，亞歷山大讓他的大軍分成兩個部分，其中一部分由佩爾狄卡斯和赫費斯提翁率領，在塔克西萊斯的協助下先行準備建造橫渡印度河的橋樑和備妥全部遠征軍所需要的各式軍需品。亞歷山大親自率剩下一半軍隊征討庫納河河谷的阿斯帕西亞人、潘吉克拉河河谷的古拉亞人（Guraeans）、斯瓦特河河谷和布內爾河谷的阿薩西尼亞人。其中，在一場與阿斯帕西亞人的激鬥之中，亞歷山大遭到標槍刺傷肩膀，最後此戰阿斯帕西亞人終究敗北。隨後亞歷山大轉戰阿薩西尼亞人，雙方接連在馬薩伽（Massaga）、歐拉（Ora）、阿爾諾斯（Aornos）發生激烈戰鬥。
最先的馬薩伽圍城戰在短短幾天的血戰後就被攻陷，此役亞歷山大因箭矢傷到腳踝。根據古羅馬歷史學家庫爾蒂烏斯記載，亞歷山大不僅把馬薩伽城居民全都屠殺，還摧毀整個城市建築，夷為平地，歐拉城也遭遇類似的屠城情形。在馬薩伽和歐拉遭到攻陷之後，阿薩西尼亞人逃向山區，逃往阿爾諾斯山上堅守，亞歷山大緊隨追擊，並在激戰四天後攻陷這座戰略要地，征服阿薩西尼亞。完成後，亞歷山大率軍與赫費斯提翁合軍，渡過印度河並在塔克西拉接受國王塔克西萊斯的款待。
入侵印度之戰的戰區與路線圖
接著亞歷山大帶著塔克西萊斯的援軍繼續進軍進攻國王波羅斯的王國，波羅斯的領土大致在旁遮普地區，前326年雙方進行了一場大型會戰希達斯皮斯河戰役。這是亞歷山大首次面臨一支擁有龐大戰象的印度軍隊，透過巧妙的渡河策略和戰術，亞歷山大最後以勝利坐收，波羅斯戰敗被俘。
此戰亞歷山大敬佩波羅斯戰場上的勇氣，不僅釋放波羅斯還繼續讓他保有自己的王國，收為屬國，甚至亞歷山大還把其他鄰近地區交給波羅斯管理。亞歷山大多是以此模式來選擇當地貴族來幫助自己統治，如先前的塔克西萊斯，希達斯皮斯河戰後亞歷山大安排波羅斯和塔克西萊斯這兩位宿敵和解，並因之前塔克西萊斯熱情的向亞歷山大表示臣服，以及協助準備遠征軍進軍所需物資以及船隻，亞歷山大不僅讓塔克西萊斯統治原有的王國，還讓他統治希達斯皮斯河和印度河之間的地區。甚至在亞歷山大安排的總督腓力死後，亞歷山大讓塔克西萊斯接管腓力部分轄區，前323年亞歷山大去世之後，塔克西萊斯的領地在特里帕拉迪蘇斯分封協議得到持續認可。
希達斯皮斯河戰後亞歷山大在希達斯皮斯河兩岸建造兩座城市，分別命名為布西發拉斯和尼西亞，其中布西發拉斯是為了紀念他的愛馬布西發拉斯而命名的，牠大約死於這段時期。尼西亞則是戰場大致位置，名字意味著希臘語的「勝利」，位置約是今日巴基斯坦的小鎮蒙（Mong）。
在波羅斯王國更東邊，位於恆河中下流域的是摩揭陀難陀王朝，再往東是今日孟加拉一帶的高達拉達王國（Gangaridai）。經過多年的長途遠征精力疲憊，亞歷山大的馬其頓士兵們又聽聞這些國家的軍隊數量都強於波羅斯，他們不願意繼續向東進軍，當軍隊進軍至比亞斯河時他們向亞歷山大表達拒絕再向東方進軍，使得這條河成為亞歷山大征服地最東方的地界。
事件爆發後亞歷山大試圖勸說他的士兵繼續向東前進，但他的將軍科那斯也勸他改變主意回頭，他向亞歷山大說「士兵們太久沒見自己的父母、妻子、孩子們以及他們的故鄉了」。亞歷山大最後同意士兵的們請求，開始往南沿著印度河進軍，準備返回。沿路他的軍隊征服馬利亞人（Malhi），即今日的木爾坦一帶，以及其他印度部族。在進攻馬利亞人的城市時亞歷山大遭受到重傷，傷癒後他繼續朝印度河出海口的方向進軍。
亞歷山大把他的大軍分成三個部分，命將軍克拉特魯斯率領大部分的軍隊途經卡曼尼亞返回波斯，命尼阿卡斯率領艦隊沿著波斯灣海岸走海路返回，並探查沿海情形，自己則率領剩下的部隊沿著格德羅西亞沙漠、莫克蘭走最艱苦的路徑返回波斯。亞歷山大經歷很大痛苦橫渡沙漠，於前324年返回波斯。
亞歷山大大帝站於被洗劫的居魯士陵墓前
亞歷山大發覺不少他的總督和地方軍事長官趁著自己遠征印度時胡作非為，他在前往蘇薩的沿路上處死數個官員殺雞儆猴
。在他返回波斯時，亞歷山大也發現帕薩爾加德居魯士大帝的陵墓遭到洗劫，他迅速命令他的建築師阿里斯托布魯斯把陵墓修回原狀，還把陵墓的守衛嚴加審問試圖抓住盜墓的匪徒。亞歷山大相當欣賞居魯士，他幼年時讀過色諾芬所著的《居魯士的教育》，提到居魯士在戰場上的英勇事蹟以及當上國王後的統治風格和立法情形。
在蘇薩，亞歷山大為自己帝國的未來畫下藍圖，為了企圖融合馬其頓人和波斯人等東方民族，他於當地舉辦一場大型聯合婚禮，不僅讓他的馬其頓、希臘高級官員與波斯等其他東方貴族之女結婚，也為馬其頓士兵與東方民族的婦女結婚，自己更是帶頭與波斯大流士三世之女斯妲特拉二世、波斯王室的帕瑞薩娣絲二世成婚。然而，對於一些馬其頓貴族而言，他們並不是真心願與波斯貴族之女成親而是受命，在亞歷山大死後許多人拋棄東方的妻子。之後率兵往巴比倫前進。
當軍隊來到俄庇斯（Opis），亞歷山大為了感謝馬其頓士兵們多年的辛勞，他免除士兵們積欠的債務，他還宣布，許諾給與馬其頓老兵龐大的財物且光榮地送他們衣錦還鄉。然而，返鄉這一措施引起馬其頓人的誤會，認為亞歷山大一味親近東方人而準備將曾經與他出身入死的馬其頓士兵解散遣返，他們原本就對亞歷山大的親東方政策和模仿東方風俗、禮儀很反感。馬其頓人當場在全軍的集會中群起向亞歷山大抗議，並嘲笑亞歷山大崇拜古埃及神祇阿蒙的行為。亞歷山大當場命衛兵把帶頭者抓去處死，震驚全場，他隨後向全軍發表演說，他細數從父親腓力二世起至他自己對馬其頓人的貢獻和功業，還強調他多次不畏危險與大夥帶頭衝鋒，得到的戰利品也多把財寶給予馬其頓人，最後他嘲諷馬其頓人，說你們返回家鄉後可以光榮地說自己安全回來了卻把國王丟棄了。儘管如此，馬其頓人聽完並不完全釋懷。
氣憤遭到自己人拋棄的亞歷山大，他在三天內把自己關起來拒絕見客，隨後他賭氣地命波斯貴族接管一些事務，並組建由東方民族所構築的軍事單位，並且依照馬其頓方式為這些新編單位命名。很快地馬其頓人回心轉意，他們向亞歷山大請求寬恕，而亞歷山大也同意了，並舉辦大型宴會與馬其頓人和解，後來亞歷山大命他最有聲望的將軍克拉特魯斯帶領馬其頓老兵返鄉。
亞歷山大大帝,（左）,赫費斯提翁,（右）
之後，亞歷山大前往米底亞的埃克巴坦那去接收大量的波斯財寶，在那裡他最親近的摯友赫費斯提翁突然得了急病病逝，對此亞歷山大非常傷心，他悲慟三天不吃一點東西，甚至還悲憤到把赫費斯提翁的醫生處死，甚至還有許多反常的行為。最後亞歷山大在巴比倫建造造價高昂的火葬臺，為赫費斯提翁舉辦隆重的大型喪禮，以資紀念。之後亞歷山大讓赫費斯提翁的部隊保留他的名號，表示紀念。
當亞歷山大逐漸從悲傷中走了出來，回到巴比倫的他開始計畫新的遠征行動，他把矛頭指向尚未征服的阿拉伯半島。然而，就在遠征前夕他的健康忽然惡化。
一塊巴比倫天文日誌楔形文字泥板上，記載著亞歷山大大帝之死，今收藏於倫敦的大英博物館。
19世紀描繪亞歷山大的靈車隊伍，主要依據西西里的狄奧多羅斯的記載。
前323年6月10或11日，亞歷山大逝世於巴比倫城尼布甲尼撒二世的王宮之內，年僅32歲。關於他死前前幾日的活動，史書上有些些許不同，普魯塔克記載約在去世14天前他與艦隊司令尼阿卡斯和一同飲酒狂歡，接者整個晚上至第二天整天又與邁迪亞斯喝個痛快，接著亞歷山大發了熱病，病情最後相當惡化，在這段期間內馬其頓士兵們很擔心且焦慮他的健康狀況，還傳出亞歷山大已死的謠言。在士兵鼓譟後，在亞歷山大去世前幾日他們被允許可以探望國王。當士兵們排成一排魚貫從亞歷山大病榻走過，此時亞歷山大已經病到無法言語 ，只能點頭示意，向士兵們表達歡迎。阿里安記載的類同普魯塔克，他們都引用《王宮日誌》的記載。另外，狄奧多羅斯則是記載另一種不同版本，說亞歷山大在紀念海克力斯的祭典中用大杯子喝了太多未稀釋的酒，突然產生劇痛而發出慘叫，在11日承受痛苦而漸漸衰弱，他並沒有發展成熱病，最後因痛楚過世。然而，普魯塔克特別否認這個的情節是杜撰，非真實。
此外，亞歷山大的早逝也讓不少歷史學家認為他是被馬其頓貴族謀殺. 。數個古代史料如狄奧多羅斯、普魯塔克、查士丁和阿里安他們全都提到有關亞歷山大被毒殺的傳言。查士丁認為亞歷山大是被安提帕特集團的陰謀所毒殺，普魯塔克提到當時沒人想到是毒殺，毒殺的傳言是繼業者戰爭時才透露出來，並且被廣為流傳。狄奧多羅斯提到安提帕特是主謀，他還記載亞歷山大死後他和他兒子卡山德掌握整個馬其頓和希臘本土，使得當時的人畏於權勢而無法記載毒藥的成分。至於阿里安他僅是為求記史全面而寫下這一說法，只是代表他知道還有毒殺的傳言，但他不採信毒殺的說法。傳言這個陰謀是安提帕特所主導，並設計整個事件，他的動機也相當充足，他與亞歷山大母后奧林匹亞絲不合許久，且奧林匹亞絲常寫信給亞歷山大說安提帕特壞話，在事件發生前亞歷山大前命令克拉特魯斯前往馬其頓去取代安提帕特的位子，且亞歷山大曾命安提帕特前來巴比倫，但被他拖延。很可能安提帕特想起帕曼紐和菲羅塔斯之死而心生恐懼，擔心前去巴比倫只有死路一條。根據狄奧多羅斯和阿里安記載，安提帕特設計讓自己兒子伊奧拉斯執行下毒，當時伊奧拉斯就在巴比倫且是亞歷山大的「舉杯人」，負責幫亞歷山大倒酒，毒藥則是卡山德從歐洲送到巴比倫的。另外，這傳言中還提到亞里斯多德是毒藥的製作者，是他向安提帕特提議毒殺亞歷山大。
對於反駁毒殺說的重要論點是，事實上很難有毒藥從毒發到死亡需經歷12天以上，如此長時間才有效的毒藥很可能不存在。然而，在2003年的BBC的紀錄片調查亞歷山大的死因，的學者認為，這個毒物是，在古代就被古希臘人所知，很可能就是這毒物摻入酒中毒死亞歷山大。在2014年的學術期刊上，學者里奧·謝普進一步建議亞歷山大是被摻入白藜蘆的毒酒所殺，且白藜蘆所造成的中毒影響，都符合《》記敘中亞歷山大之後的癥狀。白藜蘆也擁有長時間毒發過程，這使得亞歷山大如果是被毒殺的話，那白藜蘆則是最有可能的毒物之選。除此之外，在2010年時還提出對亞歷山大之毒殺論點另一項可能的解釋，且吻合亞歷山大之死的狀況，認為亞歷山大是喝了從希臘斯堤克斯河的河水而中毒，在今日伯羅奔尼撒的，這條河的河水在古希臘時被認為有劇毒，因為河水中的細菌產生危險致命的化合物，亞歷山大死前的徵狀與卡奇霉素中毒相吻合。
除了毒殺以外，有關亞歷山大病逝的可能病因也有數個可能，其中包含瘧疾和傷寒。在1998年的學術期刊新英格蘭醫學雜誌上，刊登一篇論文關於亞歷山大之死，並歸於他的死因是傷寒併發和癱瘓。近年，另一份分析則是建議病因是或腦膜炎。其他符合癥狀的病因還有和西尼羅河病毒。因病而去世的論點中，也多會強調亞歷山大在多年的酗酒和受過多次重傷後，身體的健康狀況逐漸下滑，在最親密好友赫費斯提翁劇逝之後所帶的苦痛，也嚴重影響亞歷山大的健康。
被稱為亞歷山大石棺的雕刻細節
亞歷山大大帝的遺體安放於黃金人形石棺內，填滿著香料和一些反腐藥品，石棺再置入一金棺材中，上面用代表皇家的紫袍包覆著。根據埃里亞努斯記載，當時亞歷山大的預言家預言亞歷山大安葬之地將會「人民愉快且永不被征服」，使得亞歷山大的繼業者們對於安葬之處更加吵得不可開交，更有可能繼業者們爭奪遺體是為了這是合法性的象徵，畢竟安葬前一任國王是一種皇家特權。
當亞歷山大的靈車車隊前往馬其頓的路上，埃及的托勒密設計騙取了靈車和遺體，並暫時改放於孟菲斯。他的繼承人托勒密二世把亞歷山大的石棺運到亞歷山卓，並安葬於這座以他命名的城市之中。在托勒密九世之時因為財政困難，把石棺改用玻璃材質，原來的黃金石棺被拿去發行錢幣去了。近年在希臘北部馬其頓境內的安菲波利斯發現一個巨大的陵墓，被稱為，這陵墓建造時間點約在亞歷山大的時代，不禁使人猜想這古墓可能原先設計是亞歷山大的安葬之處，畢竟原先亞歷山大的遺體計畫是葬於馬其頓，雖然更可能是要葬於埃格的皇家墓園之中。
亞歷山大的遺體經過防腐處理，在托勒密埃及時期曾開放過給名人參觀，如龐培、凱撒和奧古斯都都來過亞歷山卓參觀過亞歷山大大帝的遺體，據稱奧古斯都還不小心弄壞亞歷山大的鼻子。羅馬帝國時代羅馬皇帝卡利古拉從亞歷山大的陵墓曾拿走他生前使用過的鎧甲，在公元200年時羅馬皇帝塞普蒂米烏斯·塞維魯封起亞歷山大的陵墓，然而塞維魯的兒子間繼承者卡拉卡拉皇帝時，他相當仰慕亞歷山大，他再度開啟陵墓並參觀過亞歷山大的遺體。之後，有關亞歷山大陵墓的情形就很模糊了。
在西頓所發現，今日收藏於伊斯坦堡考古博物館的亞歷山大石棺，之所以被稱為亞歷山大石棺並不是為了亞歷山大遺體所準備，而是石棺上生動雕刻著亞歷山大和他的夥友們與波斯人作戰和狩獵情節。猜測它原本是西頓國王阿布達洛尼穆斯的，他是亞歷山大在前331年伊蘇斯戰役後所任命的西頓國王 。然而，近年的研究猜測這個石棺的主人可能不是阿布達洛尼穆斯，而是比他更早一點去世的人物，如馬扎亞斯。
前281年亞歷山大繼業者王國勢力圖
亞歷山大突然遽逝使得整個龐大帝國失去領導者，加上亞歷山大當時並沒有合法的兒子可繼承，他與王后羅克珊娜的遺腹子亞歷山大四世還未出世，尚不知性別。根據狄奧多羅斯的記載，亞歷山大夥友們在亞歷山大臨死的病床前，詢問他將把王位傳給誰，他僅僅回答：「給最強者（t?i kratist?i）。」
然而，阿里安和普魯塔克所引用的《王宮日誌》都提到亞歷山大臨死前已經無法言語，暗示狄奧多羅斯這個故事是杜撰的。此外，狄奧多羅斯、查士丁和庫爾蒂烏斯都記載了一個頗合理的描述，就是亞歷山大在眾目睽睽下，親手把象徵王權的印戒交給佩爾狄卡斯，佩爾狄卡斯不僅是夥友騎兵司令、近身護衛官之一，還是亞歷山大倚重的左右手。這象徵亞歷山大提名他。
佩爾狄卡斯起初不敢登上王位，在會議中他建議等王后羅克珊娜腹中的孩子誕生後再決定王位人選，假如是男孩就為王，這得到騎兵派軍官支持。然而，以步兵將領中的墨勒阿革洛斯反對這個提案，他認為就算是男孩為王，佩爾狄卡斯都會成為攝政，他反對佩爾狄卡斯大權在握。會中紛亂中有人提議擁立亞歷山大同父異母的兄弟阿里達烏斯為王，此舉迅速得到步兵派響應，單方面立即擁立阿里達烏斯為王，是為腓力三世。以佩爾狄卡斯為首的騎兵派拒絕接受，隨即帶自己部隊出城封鎖城市，雙方在巴比倫的戰火一觸即發。最後在歐邁尼斯周旋下雙方妥協，腓力三世的國王資格被認可，且假如羅克珊娜腹中的孩子是男孩也會被舉為國王。但佩爾狄卡斯立刻設計處決墨勒阿革洛斯和步兵派軍官，使得大權終落在自己手裡，成為帝國攝政。
不滿和對立持續在馬其頓人中發酵，同時被馬其頓壓制的希臘城邦一得到亞歷山大的死訊後 ，以雅典為首的希臘人發動叛變，爆發拉米亞戰爭。在巴比倫，亞歷山大諸將在巴比倫分封協議中各自得到自己的領地，隨著繼業者戰爭爆發，帝國攝政佩爾狄卡斯於前321年遭到刺殺後，帝國總督各自為政，帝國逐漸裂解。期間國王腓力三世和亞歷山大四世紛紛遭到謀害，前306年，繼業者紛紛自立為王，建立自己的王國。終在前301年伊普蘇斯戰役後，馬其頓帝國分裂的局面已成定局。在這40餘年的紛爭期間後，形成三個主要的繼業者王國，分別為馬其頓的安提柯王朝，亞洲的塞琉古帝國和埃及的托勒密王國，成為希臘化時代的基本局面。
西西里的狄奧多羅斯記載了亞歷山大生前曾命令克拉特魯斯帶著老兵返回馬其頓，順道接替安提帕特歐洲統帥的位置，但克拉特魯斯於半路上得知亞歷山大逝世的消息，便停留在奇里乞亞等待新的人事確認。然而隨著巴比倫的王位繼承紛爭和諸將之間的權力分配，並沒有有意給予克拉特魯斯新的確認，直到希臘本土拉米亞戰爭爆發。在巴比倫分封協議中帝國攝政佩爾狄卡斯決定繼續亞歷山大大帝的命令，讓克拉特魯斯率領老兵返回馬其頓，但並沒有給予克拉特魯斯接替安提帕特歐洲統帥的命令，而是讓他們兩人一同擔任歐洲統帥，試圖讓帝國中這兩位舉足輕重的人物互相爭權，好為自己贏得優勢。
此外，佩爾狄卡斯因獲得亞歷山大生前的文件，得知許多亞歷山大生前的規畫，他向馬其頓人公布這些規畫，並向他們解釋這些計畫會花太多金錢和人力，且過於困難而將被迫取消。這些規畫包含往南方和地中海西方軍事征服、一些紀念物建造方案，以及東方和西方民族的人口遷移。
* 建造一千艘戰艦，其中許多戰艦是大於三列槳戰船的規模，並以此為基礎來合併西西里、征服迦太基、利比亞和伊比利半島。
* 為完成上述遠征，從北非完成一條從利比亞直通直布羅陀海峽的道路，並沿路建造合適的港口。
* 在提洛島、德爾菲、多多納、為宙斯、安菲波利斯為阿耳忒彌斯、特洛伊為雅典娜等六地建造大型神廟。
* 完工赫費斯提翁的超大型火葬臺。
* 建造腓力二世的墳墓，規模必須媲美埃及的大金字塔。
* 建造許多城市，把東方的人口轉移到歐洲，同時把西方的人口轉移到亞洲，透過聯姻的方式讓各族融為一體。
格拉尼庫斯河戰役, 334?BC
伊蘇斯戰役, 333?BC
亞歷山大之所以贏得「大帝」的稱號，是因為作為一位軍事指揮官他有著空前絕後且無人能比的戰果，就算他經常在兵力上居於下風，他也從未輸過任一場戰役。這歸功於他善用地形、優異的方陣和騎兵戰術、大膽的戰略和士兵們堅定地忠誠。其中，馬其頓方陣是他利器之一，這種方陣使用6公尺長的長矛，被稱為薩里沙長矛，經過腓力二世時期發展且改良後，經過嚴格操練，完善而成。透過迅速且靈活地運用方陣，亞歷山大以此來對抗笨拙且龐大的波斯軍隊。亞歷山大自知自己的軍隊中存在使用不同武器、不同民族語言的部隊，他克服這一些不協調，並以馬其頓國王親自身先士卒的傳統作法，來激勵士氣。
亞歷山大大帝死后，他的帝國被他的部下們迅速瓜分。開始還保持帝國形式上的統一，不久統治各塊領地的將領們陷入公開的爭斗，稱之為“繼業者戰爭”。最終，弗里吉亞的伊浦蘇斯之役結束爭執。亞歷山大的帝國最初被分割為四大部分，卡山得統治希臘，萊西馬庫斯占據色雷斯，被稱為“勝利者”的塞琉古一世得到美索不達米亞和波斯，而托勒密一世分得黎凡特和埃及。安提柯一世在小亞細亞和敘利亞建立短暫的統治，但很快就被另外四個將領擊敗。對印度的控制也只是曇花一現，當塞琉古一世被旃陀羅笈多（即月護王，印度孔雀王朝的第一個統治者）擊敗即結束。
到前270年，上述希臘化國家經過吞并戰爭剩下：
:* 以馬其頓-希臘為中心的安提柯王朝
:* 亞洲的塞琉古帝國
:* 占據埃及和敘利亞的托勒密王國
到公元前一世紀大多數西部的希臘化地區都被羅馬共和國吞并。而東部的希臘化地區則由于安息帝國的擴張和巴克特里亞（即大夏，也稱吐火羅）的脫離而被明顯減弱。
亞歷山大的遠征帶來希臘文明在中東和中亞的繁盛，以及大夏-犍陀羅藝術在印度次大陸的發展。
亞歷山大的帝國和其征服路徑
File:Battle of Issus.jpg|表現伊蘇斯戰役的亞歷山大馬賽克全圖
File:Le Brun, Alexander and Porus.jpg|1673年，查理·勒布倫繪畫的〈亞歷山大與波羅斯〉
File:Alexander Aramaic coin.jpg|鑄有亞拉姆語的亞歷山大大帝錢幣
* 西元前356年，生於馬其頓首都佩拉。
* 西元前343 - 340年，從師亞里士多德。
* 西元前338年，腓力二世和亞歷山大在喀羅尼亞戰役中，擊敗以底比斯聖隊為主要力量的希臘聯軍。
* 西元前336年，腓力二世在女兒的婚禮上遇害身亡，時年二十歲的亞歷山大繼位為馬其頓國王。
* 西元前334年，亞歷山大率馬其頓與希臘聯軍渡過赫勒斯海峽，格拉尼庫斯河戰役。
* 西元前333年，伊蘇斯戰役，首戰重創波斯皇帝大流士三世。
* 西元前332年，沿東地中海海岸南進，攻克提爾，到達埃及。
* 西元前331年，高加米拉戰役，最終戰勝大流士三世。
* 西元前330年，抵達波斯都城波斯利斯，大流士三世身亡。
* 西元前329 - 327年在東伊朗高原進行巴克特利亞及索格地亞那戰役。
* 西元前326年，渡過印度河，希達斯皮斯河戰役。沿印度河水系下航。
* 西元前325年，到達印度洋。向西進軍，亞歷山大沿陸路，尼亞丘斯率艦隊走海路。
* 西元前324年，率兵回到波斯利斯。
* 西元前323年，6月10日晚，亞歷山大病逝於巴比倫。
* F. Jacoby, ''Die Fragmente der griechischen Historiker''
;后期傳記《亞歷山大遠征記》
* 阿利安, ''Flavius Arrianus Alexandri Anabasis''
* 狄奧多羅斯, ''Diodori Siculi Bibliotheca Historica Liber 17''
* 查士丁, ''M. Iuniani Iustini Epitoma Historiarum Phlippicarum Pompei Trogi''
* 普魯塔克, ''Plutarchus Vitae Parallelae: Alexander''
* 魯夫斯, ''Quinti Curti Rufi Historiarum Alexandri''
* W. Heckel, J. C. Yardley (ed.), ''Alexander the Great: Historical Sources in Translation'' (Blackwell, Oxford, 2004).
* I. Worthington (ed.), ''Alexander the Great: A Reader'' (Routledge, London, 2003).
* 撲克牌上的梅花K，總是佩帶著配有十字架的珠寶，頭髮向外卷。
* Fate系列中，以Rider職階出場。少年時期的配音員為坂本真綾，成年時期為大塚明夫。
* 游戲《文明VI》中馬其頓王國的領袖。
*  C.H. Oldfather, translator
*  亞歷山大大帝的帝國和遠征
*  亞歷山大大帝繼業者的諸王朝：公元前 301 年之伊普蘇斯戰役以后
香港軍事，最初的歷史始於唐朝廷於屯門設立的屯門軍鎮。經歷1841年和1860年兩次鴉片戰爭後，清政府分階段將香港的主權割讓予英國，除二戰期間一度被日本佔領外，香港防務都是由駐港英軍負責，直至1997年香港主權移交於中華人民共和國政府，就改由中國人民解放軍駐香港部隊（下稱「駐港解放軍」）管理。
1841年1月香港開埠時即有英軍駐守在香港，駐港英軍由派駐到香港的英國陸軍、皇家海軍和皇家空軍組成，港督在名義上身兼香港三軍總司令（Commander-in-Chief of Hong Kong），不過駐港英軍的指揮權實際上是由駐港英軍司令（Commander British Forces）行使，港督雖為香港三軍總司令，卻不能直接指揮駐港英軍的行動，然而駐港英軍司令在作出重要決策時亦需要向港督匯報，徵用土地等涉及民事之項目也要取得港督的同意。駐港英軍的軍費由英國政府及香港政府共同負擔，並通過協商決定分擔的比例。駐港英軍的官兵最初主要來自英國本地及英屬印度，到19世紀後期開始招募香港居民，在二戰前已有不少香港華人在英軍擔任工兵及炮兵，並參與在1941年12月爆發的香港保衛戰，而在二戰後，來自尼泊爾的踞喀兵取代原來的英屬印度士兵，透過本地招募人員（Locally Enlisted Personnel，LEP）身份加入駐港英軍陸軍及皇家海軍香港中隊的香港人亦越來越多，駐港英國陸軍中更設有主要由香港華人居民組成的香港軍事服務團。
除了駐港英軍外，香港本身亦設有後備軍，常被稱為「義勇軍」的皇家香港軍團始建於1854年，是一支直屬於香港政府的軍隊，這支後備軍主要由本地招募的兼職軍人組成，最初的兵員以居港的英國人為主，1920年代起有越來越多的香港華人居民參加，到二戰後主要由本地華人組成。皇家香港輔助空軍成立於1949年，並與皇家香港軍團同源於戰後設立的香港防衛軍，輔助空軍於1970年成為獨立的航空支援部隊。皇家香港軍團及皇家香港輔助空軍皆屬香港本地軍隊，由香港政府招募、調動及提供全部運作經費，平時主要協助執行防衛、治安及救援工作，戰時則由駐港英軍司令統率。香港政府於1940年因應日益緊張的防衛局勢，開設防衛司一職統籌香港防衛及保安的事務，又籌建屬於本地全職正規軍的香港華人軍團，並組織了一支名為曉士兵團的民兵。因此駐守香港的軍事部隊長期由駐港英軍及香港本地軍隊組成，駐港英軍由英國駐軍司令指揮，主要執行對外防衛及抵抗外敵入侵的工作，而兼任香港三軍總司令的港督則可指揮屬於本地部隊的皇家香港軍團及皇家香港輔助空軍，協助防衛香港之餘亦執行內部安全工作，在必要時香港政府也可主動要求駐港英軍出動，惟需要承擔額外的軍費開支，而香港一旦進入戰爭狀態，香港本地軍隊將交由駐港英軍司令統一指揮與駐港英軍一同執行保衛香港的任務。
英國皇家海軍軍官卑路乍率領軍艦於1841年1月25日抵達香港，海軍測量人員測定香港島西面有一片突出的臨海高地，可供登陸後紮營，於是派出工兵開闢從海旁到這片高地的小路，而這處便是上環水坑口。1月26日，英國遠東艦隊支隊司令伯麥乘高爾合號（HMS Calliope）抵港，沿著該小路登上香港島西北的一座小山崗，舉行英國國旗升旗儀式，宣告香港開埠。
西灣國殤紀念墳場內一排又一排的墓碑，該墳場為安葬在香港保衛戰中陣亡及死於日軍戰俘營的軍人而建，由管理。在墳場內埋葬有1,578具遺骸，當中有444具不能辨識身份；這些軍人來自英國、加拿大、印度及香港等地；而在墳場入口的紀念亭，牆壁上刻有2,070位軍人的名字，他們的遺骸已不可尋獲；另有兩塊碑石，分別紀念因宗教理由而採用火葬的軍人，以及於兩次大戰期間在中國殉難後無法保存遺骸的英聯邦軍人。
1938年10月12日，日軍在鄰近香港東北部的大亞灣登陸，並於10月23日攻陷廣州，又於1939年5月攻佔海南島，在珠江口一帶的中國軍隊都已被日軍逐退，英日兩軍隔著深圳河對峙。由於日軍已經控制華南地區，而臺灣亦為日本領地，香港已陷入被日本勢力三面包圍的嚴峻處境，只是日本此時尚未準備好向英美開戰，日軍才沒有立即入侵香港，但日本軍方已開始準備擴大戰爭並謀劃侵佔東南亞。
1941年12月8日凌晨，日本發動太平洋戰爭向英國、美國及荷蘭開戰，日軍於當日清晨進攻香港。英軍當時只有5架空軍飛機駐守啟德機場，日軍用一個上午的時間便取得制空權，而皇家海軍則在戰爭爆發前已將大部分軍艦撤退到新加坡，只有色雷斯人號驅逐艦及合共十餘艘的炮艦及魚雷艇留港抵抗日軍。英軍、印度軍、加拿大軍、香港義勇防衛軍、香港華人軍團及曉士兵團民兵組成13,500人的香港守軍抵抗日軍入侵，而日軍則以日本陸軍第23軍轄下屢次擊敗中國軍隊的第38師團為進攻主力，日本陸軍連同其陸軍飛行戰隊、日本海軍及海軍航空戰隊，日軍約有40,000餘人入侵香港。香港守軍於12月13日退守香港島後，日軍對香港島展開連日空襲及炮轟。12月18日晚上，日軍利用炮轟造成的大火所產生的濃煙掩護，在香港島東北岸登陸，香港守軍在香港島多處與日軍爆發激戰，單是19日清晨至20日凌晨，在黃泥涌峽及渣甸山歷時一天的戰鬥，香港守軍已有451人陣亡，日軍傷亡人數也超過600人。隨著日軍逼近維多利亞城，雙方在銅鑼灣及灣仔一帶展開巷戰，可是已無法扭轉敗局，總督楊慕琦於12月25日投降，而在赤柱炮臺一帶的守軍則抵抗至26日上午，香港至此淪陷。在歷時18天的戰役中，香港守軍有1,679人陣亡，尚未包括在戰役結束後因傷病而亡的士兵。而在香港守軍中的兩營加拿大軍，有290人戰死，另有264人在戰俘營中身亡，到香港增援的1,975名加拿大軍人中有超過四分之一一去不返。
日佔時期初期，軍政府施戒嚴令，日本于九龍尖沙咀半島酒店發布行政指令。日本軍政府（包括政治部、民事部、經濟部、司法部及軍事部等）制定了嚴厲的法例及設立管轄全香港市民的政府。共有7000多名戰俘（包括英軍及市民）被囚禁于深水埗和赤柱的戰俘營，戰俘備受饑餓、病患之苦。同時，日本軍政府封鎖維多利亞港、控制海旁的貨倉。
1942年1月，由印度人及香港人組成的警察被征召成為憲兵隊。日本憲兵將香港的警察局分為5區，東香港、西香港、九龍、新界及水警。總部位于香港島中環前法國外方傳道會大樓。
在香港保衛戰爆發前，香港為支援英國對抗軸心國而在黃埔船塢建造的剛下水，香港淪陷後，日軍將該艘貨輪沒收，並繼續建造完成為。1944年9月18日，曉空號被美國海軍河豚級潛艇發射的魚雷擊沉（北緯35度02分，東經124度24分：）。
香港淪陷時期，民間抗日力量此起彼伏。其中最著名的當屬港九大隊。港九大隊由中國共產黨黨員曾生領導，在1941年日軍進攻香港時，港九大隊從200人擴展到超過6,000位成員。在英軍撤退後，港九大隊隊員獲取被英軍摒棄的武器，並在新界及九龍建立基地，同時在西貢墟建立地下聯絡系統。而第三個和第五個分支在蔡國梁之下，被派遣到香港和九龍，由隊長黃冠芳和副隊長劉黑仔帶領，統領香港及九龍的抗日武裝鬥爭，並讓中國獲取日本對華南、臺灣和東南亞的戰略機密。港九大隊屬下有短槍隊和幾個區中隊，隊員竭力攻擊強盜和日軍，保障農作物及人命安全。港九大隊亦幫助破壞日本在香港的軍事據點，和促進了在中國人、英國人和美國人之間友誼。在使用遊擊戰的常規戰術下，他們殺死了一些漢奸和其同黨，在九龍和廣州保護貿易商人，攻擊大埔的警察局，並轟炸啟德機場。港九大隊在拯救英國和外國人士上亦扮演了重要角色，共有20名英國人、54名印度人、8名美國人、3名丹麥人、2名挪威人、1名蘇聯人，以及1名菲律賓人獲拯救，包括被囚的賴特上校等英軍官兵及美軍飛行員，此外亦有大批內地教育界、新聞界、文化界人士獲救。另外，港九大隊亦協助營救戰俘，包括著名的賴廉士爵士、祈德尊爵士、王國棟教授和David Bosanquet。港九大隊對盟軍最重大的貢獻，是搶救了8名因日軍擊落其飛機而跳傘到九龍的美國飛行員。當時為1944年2月11日，美軍第十四航空飛行指揮員兼教官克爾（Donald W. Kern）中尉在轟炸啟德機場時被日軍擊中，跳傘降落慈雲山，後得到遊擊隊小交通員李石仔等救助才能逃出日軍的搜捕。
英軍服務團（British Army Aid Group）成立於1942年，主要任務是協助營救在日軍集中營被羈押的英國軍民及盟軍戰俘，故此在戰時被編入負責戰俘詢問、英籍人員撤離與處理的軍情九處（MI9），向駐重慶的英國大使館匯報，由印度英軍總司令管轄，而不是受中國戰區統帥的國民政府軍事委員會支配。英軍服務團的骨幹由曾經在駐港英軍、香港義勇防衛軍及香港華人軍團服役的香港華人組成，這些華裔士兵在香港投降時接受長官的指示脫去軍服並混入平民之中，逃過成為日軍戰俘的厄運並繼續為英軍效力，部分人接受訓練後潛伏在香港及華南的日佔區，與混入民眾的華裔英兵建立聯繫，開始在日佔區構建情報網絡，向盟軍提供情報、與集中營的俘虜建立聯繫、秘密救助被拘留的戰俘、監視日軍艦艇在香港及華南的活動、策反船塢工人拖延日艦維修、繪製日軍據點資料、匯報盟軍空襲的戰果，並在戰爭結束前協助組建臨時政府。英軍服務團約有80名敵後人員被日軍揭破身份而失去性命，在戰後有部分陣亡的特工被合葬於鑽石山墳場的「抗日烈士墓」，而部分具軍職人員則被埋葬在赤柱軍人墳場。英軍服務團除了組織守軍士兵在香港淪陷期間蒐集日軍情報，還安排具有前線作戰經驗的其中約130位華裔士兵前往英屬印度再次接受軍事訓練，並於1944年被編組為香港志願連參與緬甸戰役，在日軍佔領區從事敵後破壞、伏擊日軍，為反攻日軍的英軍建立橋頭堡等特戰任務。
皇家海軍不屈號輕巡洋艦於1945年8月30日與夏愨少將率領的太平洋分遣艦隊一同抵達維多利亞港，結束香港日佔時期。
1945年8月30日，夏慤少將率領以不屈號輕巡洋艦為首的皇家海軍太平洋分遣艦隊駛入維多利亞港，在香港升起了英國國旗，象徵結束日本對香港的佔領，港府亦因此將8月30日定為重光紀念日。1945年9月1日，夏慤宣告成立軍政府，並由他本人出任軍政府首長兼三軍總司令。1945年9月16日，夏愨少將舉行受降儀式，接受日本陸軍岡田梅吉少將和海軍藤田類太郎中將投降，於香港總督府簽署香港的受降文件。香港市區出現大規模慶祝活動，紀念戰爭結束及盟軍取得勝利。1946年4月30日，在戰時被俘的楊慕琦爵士遂於5月1日復任港督，宣告軍法管治結束。
皇家香港輔助空軍正於啟德機場操作海豚直升機參與聯合搜救演習（本圖攝於1982年，由參與演習的美國軍方拍攝）
二戰後，香港華人在駐港英軍中所佔的比例大幅提高，並設有主要由本地華人組成的香港軍事服務團，而駐港皇家海軍香港中隊亦主要由香港居民組成，至於直屬於香港政府的皇家香港軍團及皇家香港輔助空軍更以香港居民佔多數。香港境內治安屬香港政府的職責，主要由香港警隊執行，港府可按情勢調動又稱為義勇軍的皇家香港軍團及輔助空軍支援，如有緊急需要亦可向駐港英軍要求增援及協助。六七暴動期間，駐港英軍支援香港警隊平息暴亂，並拆除鬥委會在香港街頭所放的炸彈。直至1995年，駐港英軍負責中港邊界治安，包括堵截走私及非法入境者皆有貢獻，又協助海上拯救工作。駐港皇家空軍及海軍亦聯同皇家香港輔助空軍及水警進行海上救援任務。皇家香港輔助空軍於1988年起逐步擴大編制及全職化，以便在1990年代初逐步接替駐港皇家空軍的工作。
根據香港特別行政區基本法，香港特別行政區的外交和國防事務由中央人民政府（國務院）負責。1997年香港主權移交後，香港防務正式交由中國人民解放軍駐港部隊接管。
中國人民解放軍駐港部隊於1993年初開始組建，1996年1月28日組建完畢。駐軍隸屬中華人民共和國中央軍事委員會，費用由中國中央人民政府負擔。
駐軍的職責是防備和抵抗侵略，保衛香港安全；擔負防衛勤務；管理軍事設施；承辦有關的涉外軍事事宜等，不干預香港地方事務。香港特別行政區在必要時，可向中央政府請求駐軍協助維持社會治安和救助災害。駐軍人員除遵守全國性法律外，還要遵守香港特別行政區的法律。
駐港部隊的直八直升機
駐軍組成：駐軍由陸軍、海軍、空軍部隊組成，是一支合成部隊，下轄1個陸軍步兵旅、1個海軍艦艇大隊、1個空軍航空兵團。
駐港部隊的司令員和政委一般為少將軍銜。
* Exchange of notes constituting an agreement on the arrangements for the future use of the military sites in Hong Kong，1994年軍事用地協議
*駐港英軍→中國人民解放軍駐香港部隊
中國人民解放軍駐香港部隊，簡稱解放軍駐港部隊、香港駐軍，是中華人民共和國中央人民政府（即國務院）派駐香港特別行政區負責防務的國家武裝力量。根據“黨指揮槍”的指導原則，部隊由中國共產黨中央軍事委員會直接領導。
解放軍駐港部隊由中國人民解放軍陸軍、海軍和空軍部隊組成，隸屬中國人民解放軍南部戰區。駐港部隊軍費由中央人民政府負擔。駐港部隊從1993年初開始組建，1996年1月28日組建完畢，1997年7月1日0時進駐香港，取代駐港英軍接管香港防務。
自中英兩國就香港前途問題舉行會談，駐軍問題一直成為兩國爭議的焦點，英方曾向中方提出，因中港邊界連接，而港人對解放軍駐港有戒心，建議中方不必在港駐軍。對於是否在港駐軍，北京內部當時亦有不同意見，而當時的中共中央軍委主席鄧小平一直沒有公開表態，但早在1984年4月，他在審閱外交部《關于同英國外交大臣就香港問題會談方案的請示》報告時，就在關于駐軍問題的一條下達親批：「在港駐軍一條必須堅持，不能讓步」。
時任全國人大常委會副委員長的耿飆在1984年5月21日向香港記者指，中央政府在1997年後不會在香港駐軍，香港居民也不需要負擔中國軍費，此話觸怒了中央軍委主席鄧小平，促使他在5月25日會晤出席全國政協六屆二次會議的港澳委員時公開表態，「黃華、耿飆兩位胡說八道，講的香港駐軍問題不是中央的意見。你們去登一條消息，沒有那么回事。香港要駐軍的，既然是中國的領土，為什麼不能駐軍呢？英國的外相跟我會面的時候，開始他們就說，他們當然希望中國不駐軍，用另一種形式，但是他們承認中國政府既然收回主權，有權在香港駐軍，這個明確得很的，連這一點權都沒有，那還叫中國領土嗎？」事實上，時任全國人大常委會副委員長的黃華當時並無提到駐軍問題，鄧小平後來亦澄清發言時錯怪了他。
1984年10月3日，中顧委主任鄧小平會見港澳同胞國慶觀禮團時重申，中國政府在香港駐軍是體現對港行使主權，並有防止動亂的作用，「那些想搞動亂的人，知道香港有中國軍隊，他就要考慮即使有動亂也能及時解決」。最終兩國達成協議，在《中英聯合聲明》附件一「中華人民共和國政府對香港的基本方針政策的具體說明」中，訂明「香港特別行政區的社會治安由香港特別行政區政府負責維持。中央人民政府派駐香港特別行政區負責防務的部隊不干預香港特別行政區的內部事務，駐軍軍費由中央人民政府負擔」，而1990年頒布的《中華人民共和國香港特別行政區基本法》第二章第十四條亦訂明：
* 中央人民政府負責管理香港特別行政區的防務。
* 香港特別行政區政府負責維持香港特別行政區的社會治安。
* 中央人民政府派駐香港特別行政區負責防務的軍隊不干預香港特別行政區的地方事務。香港特別行政區政府在必要時，可向中央人民政府請求駐軍協助維持社會治安和救助災害。
* 駐軍人員除須遵守全國性的法律外，還須遵守香港特別行政區的法律。
* 駐軍費用由中央人民政府負擔。
駐港部隊在1993年起在深圳開始組建，1994年10月25日在深圳舉行成立大會，正式成軍。1995年12月7日正式對外亮相，1996年1月28日由中國國務院、中央軍委發公告組建完成。深圳市在特區中撥出六處共500多畝土地，作為駐港部隊的基地建設用地。
為駐港部隊處理防務事務建立法律規範，中央軍委在1991年成立「香港駐軍法律問題小組」，1992年由中央軍委法制局研究起草駐軍各項法律草案及法律準備工作，1996年8月中央軍委就《中華人民共和國香港特別行政區駐軍法》草案進行研究，並在12月30日於第八屆全國人民代表大會常務委員會第二十三次會議通過，自1997年7月1日正式施行。根據《駐軍法》規定，駐軍不干預香港地方事務。香港特別行政區政府在必要時，可向中央人民政府請求駐軍協助維持社會治安和災害救援。駐軍人員除了需要遵守《香港基本法》、《駐軍法》等全國性法律外，亦必須遵守《香港法例》。
駐港部隊軍官由全軍範圍選拔，大部分經軍事院校培訓，具大專學歷；士兵一般需要高中以上學歷，入伍後經過一年訓練，再補入部隊。
駐港部隊匯集了多支解放軍精銳部隊，陸軍前身是井崗山時期的紅一團、參與長征的大渡河連、及在抗日戰爭擊斃日本駐蒙軍混成第二旅團長阿部規秀的功臣炮連等；海軍艦艇大隊曾參與萬山群島戰役、八六海戰；空軍航空兵團前身則為空軍運輸航空兵某大隊，曾參與國內及國外救災任務。
1997年至2007年使用的中國人民解放軍駐香港部隊臂章。
中央軍委主席江澤民在1997年6月30日上午10時10分向駐港部隊發出命令，於1997年7月1日0時開始履行香港防務職責。當晚21時，根據中英聯合聯絡小組的協議，509人組成的駐港部隊先頭部隊分乘39輛軍車通過落馬洲口岸進入香港，此前共196人先遣人員分三批抵港，安排軍營的接管事宜。當中，石崗、昂船洲、中環及赤柱軍營分別有146、183、78及102名先頭部隊進駐。
晚上23時58分，兩軍在威爾斯軍營進行軍營交接儀式，駐港部隊譚善愛中校以普通話向英軍艾利斯中校答道，「艾利斯中校，我代表中國人民解放軍駐香港部隊接管軍營。你們可以下崗，我們上崗。祝你們一路平安」。語畢兩方握手，並互相敬禮，艾利斯命令衛兵步操離開軍營大門，而駐港部隊在7月1日0時0分在軍營升起中華人民共和國國旗，象徵駐港部隊正式接管香港防務。
駐港部隊逾6,000人的陸海空主力部隊，在7月1日6時整進入香港。陸軍縱隊從文錦渡、皇崗及沙頭角三個口岸進入香港，車隊在6時15分駛經上水馬會道獲群眾冒雨夾道歡迎，部隊接受群眾獻花，並把活動籌委贈送寫有「威武文明之師」的牌匾架在軍車上，接受民眾歡呼。艦艇部隊10艘軍艦及船隻在4時55分起錨，從深圳媽灣軍港前往香港水域，並於7時24分到達昂船洲海軍基地；空軍直升機部隊因雷雨延後兩小時在深圳起飛，6架直-9直升機在8時35分抵達石崗機場，完成布防。
1997年至2007年間，駐香港、澳門部隊穿著獨特的中國人民解放軍97式軍服。2007年，與解放軍全軍同時換裝07式軍服，以統一著裝。
於2009年-2011年，駐港部隊主力戰鬥的裝備進行了部分更新及更換。陸軍的快速機動、火力突擊及特種偵察等能力明顯地增強了，同時擴充編制了裝甲、特種作戰、工兵和防化分隊；海軍的近海防衛及對空防護能力亦有進一步的提升，將會更新及更換一批艦艇，包括新型護衛艦等，部隊海上輸送、近海防衞及對空防護能力亦將會進一步增強；空軍更新及更換的警戒雷達、直-8運輸搜救型直升機、直-8指揮偵察型直升機、直-9武裝直升機和防空武器〈包括防空導彈〉系統等亦增強了對香港空域的警戒防護能力。
駐港部隊駐守於15年來，總共有逾4,300名軍人被評級為訓練尖子，新兵訓練優良率逐年上升，並且保持在97%以上，所有飛行員亦全部具備了全天候遂行飛行任務能力。為了增進與香港市民的溝通和了解，駐港部隊進駐以來，組織了27次軍營開放活動，58.7萬餘名香港市民參觀過駐軍多個軍營；15次參與「香港植樹日」活動，累計植樹8.2萬餘棵；17次參加香港無償獻血活動，共有6800餘名官兵獻血約306萬毫升；11次參與主辦「香港青少年軍事夏令營」，培訓學員2285名。此外，還組織了與香港大學生互訪聯誼、慰老愛幼等活動。同時，香港各界人士也多次組織探訪團到軍營慰問官兵。
2012年11月25日，駐港部隊進行一年一度的輪換，幾十部通訊車，卡車及裝甲車等於清晨時份由皇崗口岸進入香港及進駐於各軍營，由香港警隊護送組沿途提供協助。海軍導彈護衛艇則在早晨時份陸續進入昂船洲海軍基地。下午2時20分，從廣州駐地起飛的6架直升機陸續抵達石崗軍營；交接後，離開香港的6架直升機依據次序起飛，以單機跟進的形態離開香港。
2013年3月24日，中央電視臺中文國際頻道首次播出駐港部隊航空兵團在3月21日至22日在香港西部某訓練靶場進行了實彈訓練的影像，當中顯示武裝直升機在兩日訓練中，分別以導彈、火箭彈及航炮攻擊了不同目標，百發百中。是次為駐港部隊航空兵團首次在香港境內進行實彈訓練。3月28日，中央電視臺報道，駐港部隊進行了海空聯合巡邏訓練，為同月第二次類似訓練。
2019年6月26日，駐香港部隊出動陸海空三軍部分兵力，在香港附近海空域組織聯合海空巡邏演練，重點檢驗提升部隊緊急出動、臨機處置、聯合行動等作戰能力。7月31日解放軍表示：絕對不容忍「極端暴力事件」。
根據《》，中國人民解放軍駐香港部隊承擔下列防務職責：
駐港部隊由陸軍、海軍、空軍部隊組成，是解放軍第一支陸海空三軍合成的部隊。總部位于中國人民解放軍駐香港部隊大廈。另有深圳基地負責新兵訓練和后勤保障。
駐香港部隊根據《中國人民解放軍駐香港部隊、駐澳門部隊建制單位和士兵輪換規定》，每年實施輪換。駐港部隊費用由中央人民政府負擔，不同于殖民地政府支付一半防衛費用的安排。由於《中華人民共和國兵役法》不在香港實施，因此香港居民不需要、亦不能夠加入駐港解放軍；有別於香港回歸前，香港居民可以參與皇家香港軍團。駐港部隊人員前往香港前，需要學習《基本法》、《駐軍法》、香港法律及了解香港社會的情況。