Spreadsheet: c94726bf-83aa-44db-b59c-699833c42ff8
Sheet: Sheet7 (2)

"Microarray analysis of microbiota of gingival lesions in noma patients" Huyghe et al. 2013
 | Supplementary Table 2. Changes in probe intensity between group of samples in low-density microarrays
 | two-tailed Student's t-test assuming equal variance ; P-values were adjusted with [NAME] correction
 |  |  | N | G | Nn | N  G | N Nn | Nn | N | Gn | G | N Nn | G Gn | Nn Gn | N G | N Nn G Gn
 |  |  | vs | vs | vs | vs | vs | vs | vs | vs | vs | vs | vs | vs | vs | vs
Probe | ProbeName | Description | Nn | Gn | Gn | Nn Gn | G Gn | C | C | C | C | C | C | C | C | C |  | Legend
1 | Geneva_1 | 701B10_Bacteroidetes |  |  |  |  |  |  |  |  |  | + (*) |  |  |  |  |  | (*) | P<0.01
2 | Geneva_2 | 101D07_Streptococcus_pyogenes |  |  |  | - (*) |  |  |  |  | - (*) |  |  |  | - (*) |  |  | (**) | P<0.001
3 | Geneva_336 | [NAME] | + (*) |  |  | + (*) |  |  | + (***) |  | + (*) | + (***) | + (*) | + (*) | + (***) | + (***) |  | (***) | P<0.0001
4 | Geneva_4 | 502E07_Streptococcus_gordonii |  |  |  | - (*) |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*)
5 | Geneva_5 | 102E06_Neisseria_elongata |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*) |  |  | N | Noma, lesion sites
8 | Geneva_8 | 502G08_Neisseria_subflava;502D04_Neisseria_sp._ | - (*) |  |  | - (***) |  |  | - (***) |  | - (**) | - (**) | - (*) |  | - (***) | - (***) |  | Nn | Noma, non-lesion sites
11 | Geneva_11 | 701C12_Prevotellaceae;102B12_Prevotellaceae;101B10_Prevotellaceae_ | + (***) | + (*) |  | + (***) |  | + (*) | + (***) | + (**) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) |  | G | Gingivitis, lesion sites
12 | [NAME] | Various_Prevotella;702F08_Prevotella_intermedia_strain_2 | + (**) |  |  | + (***) |  |  | + (***) | + (**) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) |  | Gn | Gingivitis, non-lesion sites
14 | Geneva_338 | Prevotella_nigriscens |  |  |  |  |  | + (**) | + (***) | + (**) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) |  | C | Healthy controls
15 | Geneva_339 | Prevotella_nigriscens | + (**) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
19 | Geneva_340 | Streptococcus_genomosporum_and_mitis | - (***) |  |  | - (***) |  |  | - (***) |  | - (*) |  |  |  | - (***)
20 | Geneva_20 | 102E08_Porphyromonas_gulae |  |  |  | + (*) |  |  | + (*) |  | + (**) |  | + (*) |  | + (***) | + (*)
21 | Geneva_21 | 401H01_Pseudomonas_sp. | - (*) |  |  | - (**) |  |  | - (**) |  |  |  |  |  | - (**)
24 | Geneva_24 | 402F06_Actinobacillus_actinomycetemcomitans | - (**) |  |  | - (***) |  |  | - (***) |  | - (**) | - (**) | - (***) |  | - (***) | - (***)
25 | Geneva_25 | 301E09_Prevotella_sp.;302B04_Prevotella_veroralis |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*) |  | - (***) |  | - (*)
29 | Geneva_341 | Streptococcus_genomosporum_and_mitis |  |  |  |  |  | + (*) | + (*) |  |  | + (***) |  | + (*) | + (**) | + (***)
30 | [NAME] | 101A05_Streptococcus_anginosus |  |  |  |  |  | + (*) |  |  |  | + (*)
31 | Geneva_31 | 601C02_Lactococcus_lactis |  |  |  |  |  | + (*) |  |  |  | + (*) |  | + (*)
32 | Geneva_32 | 501C07_Capnocytophaga_sp. | - (***) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
35 | Geneva_35 | 301D12_Peptostreptococcaceae |  |  |  |  |  |  | + (*) |  |  | + (**) |  |  | + (*) | + (*)
36 | Geneva_36 | 102C03_Lautropia_sp. |  |  |  |  |  |  | - (*) |  |  | - (*) |  |  | - (*) | - (**)
40 | Geneva_40 | 202G02_Eubacterium_sp.;401D07_Eubacterium_yurii |  |  |  |  |  |  | + (**) |  | + (**) | + (**) | + (**) |  | + (***) | + (***)
42 | Geneva_42 | 602A03_Prevotella_intermedia |  |  |  |  |  |  | + (***) |  | + (**) | + (***) | + (**) | + (*) | + (***) | + (***)
46 | Geneva_46 | 402G08_Veillonella_sp. |  |  |  |  |  | + (**) |  |  |  | + (*) |  | + (**) |  | + (**)
47 | Geneva_47 | 402B01_Capnocytophaga_sp. | - (**) |  |  | - (***) |  | - (**) | - (***) | - (**) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
48 | Geneva_48 | 602H04_Fusobacterium_sp. |  |  |  |  |  |  | - (***) |  |  | - (**) |  |  | + (***) | + (***)
49 | Geneva_49 | 402B01_Capnocytophaga_sp. |  |  |  |  |  | - (*) | - (***) | - (*) | - (*) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
51 | Geneva_51 | 601H10_Tannerella_forsythensis |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*)
54 | Geneva_54 | 501C03_Haemophilus_sp.;601G09_Haemophilus_segnis | - (*) |  |  | - (*) |  |  | - (***) |  |  | - (***) |  |  | - (***) | - (*)
56 | Geneva_56 | 101D04_Neisseria_sp. | - (*) |  |  | - (**) |  |  | - (***) |  | - (**) | - (***) | - (*) |  | - (***) | - (***)
58 | Geneva_58 | 301C01_Prevotellaceae | + (*) |  |  | + (*) |  | + (*) | + (***) | + (**) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
59 | Geneva_344 | Neisseria_sicca | - (*) |  |  | - (***) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) | - (*) | - (***) | - (***)
60 | Geneva_60 | various_prevotella;301B02_Prevotella_sp. |  |  |  |  |  | + (***) | + (***) | + (**) | + (*) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
61 | Geneva_61 | 102C03_Lautropia_sp. | - (*) |  |  | - (**) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) |  | - (***) | - (***)
63 | Geneva_345 | Neisseria_sicca | - (*) |  |  | - (**) |  |  | - (**) |  | - (*) |  |  |  | - (***) | - (*)
64 | Geneva_346 | Treponema_1 |  |  |  | + (*) |  |  |  |  | + (**) |  | + (*) |  | + (**)
70 | Geneva_70 | 402F06_Actinobacillus_actinomycetemcomitans | - (**) |  |  | - (***) |  |  | - (***) |  |  | - (**) | - (*) |  | - (***) | - (***)
72 | Geneva_72 | 502H07_Capnocytophaga_sp. |  |  |  |  |  | - (*) | - (***) |  |  | - (***) | - (*) | - (*) | - (***) | - (***)
74 | Geneva_74 | 501H09_Capnocytophaga_gingivalis |  |  |  | - (*) |  | - (***) | - (***) | - (*) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
80 | Geneva_348 | Treponema_2 |  |  |  | + (*) |  |  |  |  | + (*) |  |  |  | + (*)
83 | Geneva_81 | 401B03_Streptococcus_sp. |  |  |  | - (*) |  |  |  |  | - (*) |  | - (*) |  | - (**)
85 | Geneva_83 | 402A06_Streptococcus_genomosp. |  |  |  | - (*) |  |  |  |  | - (**) |  | - (*) |  | - (**)
86 | Geneva_84 | 101B06_Filifactor_alocis | + (***) |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) |  | + (***) | + (***)
87 | Geneva_85 | 401F06_Burkholderiaceae |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*)
88 | Geneva_86 | 101D06_Treponema_sp. | + (*) |  |  | + (**) |  | + (**) | + (***) | + (**) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
89 | Geneva_87 | 201F12_Prevotella_sp. |  |  |  |  |  |  | + (***) |  |  | + (**) |  |  | + (***) | + (*)
96 | Geneva_92 | 401A08_Neisseria_pharyngis_;101C07_Neisseria_sicca | - (**) |  |  | - (***) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) |  | - (***) | - (***)
99 | Geneva_95 | various_prevotella;302B03_Prevotella_intermedia |  |  |  |  |  |  | + (*) |  | + (*) | + (*) |  |  | + (***) | + (**)
102 | Geneva_96 | 501C03_Haemophilus_sp. | - (**) |  |  | - (**) |  |  | - (***) |  |  |  |  |  | - (***) | - (*)
103 | Geneva_97 | 701G08_Prevotella_sp.;203003_Prevotella_genomosp. |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | + (*)
104 | Geneva_98 | 501A07_Lautropia_sp. |  |  |  | - (*) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) |  | - (***) | - (***)
108 | Geneva_102 | 402A04_Catonella_sp. | + (***) |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) |  | + (***) | + (***)
111 | Geneva_103 | 502C12_Selenomonas_sp.;501B07_Selenomonas_sp.;201F02_Selenomonas_sp._196 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*) |  | - (**) | - (*)
112 | Geneva_104 | 301F09_Peptostreptococcus_micros;102E10_Peptostreptococcus_sp. |  |  |  |  |  |  | + (*) |  | + (***) |  | + (***) |  | + (***) | + (**)
114 | Geneva_106 | 301D12_Peptostreptococcaceae |  |  |  |  |  |  | + (*) |  |  |  |  |  | + (*)
115 | Geneva_107 | 102C07_Prevotella_melaninogenica | + (*) |  |  | + (*) |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
117 | Geneva_349 | Treponema_2 | + (***) |  | - (*) | + (**) | - (**) |  | + (***) | + (**) | + (***) |  | + (***) |  | + (***) | + (***)
118 | Geneva_110 | 502B09_Capnocytophaga_sp. | - (*) |  |  | - (**) |  |  | - (***) | - (*) | - (***) | - (***) | - (***) | - (**) | - (***) | - (***)
119 | Geneva_111 | 501B07_Selenomonas_sp.;201F04_Selenomonas_sp. | + (*) |  |  | + (*) |  |  | + (***) |  | + (*) | + (***) | + (*) |  | + (***) | + (***)
120 | Geneva_112 | 301F09_Peptostreptococcus_micros |  |  |  |  |  | + (**) | + (**) |  |  | + (***) | + (*) | + (***) | + (***) | + (***)
122 | Geneva_114 | 201F04_Selenomonas_sp. |  |  |  |  |  | + (*) | + (***) | + (*) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
123 | [NAME] | 202B04_Lautropia_sp. | - (*) |  |  | - (*) |  |  | - (***) |  | - (**) | - (*) | - (***) |  | - (***) | - (***)
124 | Geneva_116 | 302E10_Catonella_morbi |  |  |  | + (*) |  |  | + (***) |  | + (**) | + (*) | + (*) |  | + (***) | + (***)
126 | Geneva_118 | 102E10_Peptostreptococcus_sp. |  |  |  |  |  |  | - (**) |  | - (*) | - (*) |  |  | - (***) | - (**)
127 | Geneva_119 | 601G07_Porphyromonaceae |  |  |  |  |  |  | - (*) |  |  | - (**) |  |  | - (*) | - (**)
129 | Geneva_121 | 502G08_Neisseria_subflava |  |  |  |  |  |  | - (*) |  | - (*) |  |  |  | - (**)
130 | [NAME] | 101G04_Staphylococcaceae |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*)
131 | Geneva_123 | 101E06_Lachnospiraceae |  |  |  |  |  |  | + (***) |  |  | + (*) |  |  | + (*)
133 | Geneva_125 | 201C11_Neisseria_sp. | - (***) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
134 | Geneva_126 | 601C05_Fusobacterium_sp. | - (**) |  |  | - (***) |  |  | - (***) |  | - (*) | - (***) |  |  | - (***) | - (***)
136 | Geneva_128 | 101D06_Treponema_sp. |  |  |  |  |  |  | + (***) |  |  | + (**) |  |  | + (**) | + (*)
137 | Geneva_129 | 701H08_Prevotella_intermedia_strain_6 | + (**) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
138 | Geneva_130 | 101B06_Filifactor_alocis | + (***) |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) |  | + (***) | + (***)
142 | Geneva_134 | 501C06_Neisseria_cinerea |  |  |  |  |  | - (*) | - (***) |  | - (**) | - (***) | - (***) | - (**) | - (***) | - (***)
143 | Geneva_135 | Various_Corynebacterium;201F03_Corynebacterium_matruchotii |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*)
144 | Geneva_136 | 102A02_Bacteroidetes | + (**) |  |  | + (**) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (*) | + (***) | + (***)
145 | Geneva_137 | 303D02_Leptotrichia_sp. |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*) |  | - (*) | - (*)
147 | Geneva_139 | 102E08_Porphyromonas_gulae |  |  |  |  |  |  |  |  | + (*) |  | + (*) |  | + (**)
152 | Geneva_144 | 702G03_Selenomonas_sputigena |  |  |  |  |  |  | + (***) |  |  | + (**) |  |  | + (***) | + (***)
153 | Geneva_145 | 401D07_Eubacterium_yurii |  |  |  |  |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  |  | + (***) | + (***)
154 | Geneva_146 | 602A03_Prevotella_intermedia |  |  |  |  |  |  | + (***) |  | + (**) | + (***) | + (***) | + (*) | + (***) | + (***)
155 | [NAME] | 601B09_Bergeyella_sp. |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*) |  | - (*) | - (*)
156 | Geneva_148 | 101B02_Actinobacteria |  |  |  |  |  |  | + (**)
157 | Geneva_149 | 103014_Porphyromonas_endodontalis | + (**) |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (*) | + (**) |  | + (***) | + (***)
158 | Geneva_150 | 102G10_Gemella_morbillorum |  |  |  |  |  |  | - (*) |  |  |  |  |  | - (**)
160 | Geneva_152 | 501C07_Capnocytophaga_sp. | - (***) | - (*) |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
161 | Geneva_153 | 502B09_Capnocytophaga_sp. | - (***) |  |  | - (***) |  | - (**) | - (***) | - (**) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
162 | Geneva_154 | 303B02_Peptostreptococcaceae |  |  |  |  |  |  | + (*) |  |  |  |  |  | + (*)
165 | Geneva_157 | 102E05_Capnocytophaga_granulosa;501H09_Capnocytophaga_gingivalis | - (***) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
168 | Geneva_160 | 401H01_Pseudomonas_sp. | - (*) |  |  | - (*) |  |  | - (***) |  |  | - (***) |  |  | - (***) | - (***)
171 | Geneva_163 | 402A10_Propionibacterium_sp. |  |  |  |  |  |  | - (*) |  | - (*) | - (*) | - (**) |  | - (***) | - (***)
173 | Geneva_165 | 301C01_Prevotellaceae |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | + (*)
176 | Geneva_168 | 502H07_Capnocytophaga_sp. |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*)
178 | Geneva_170 | 601G07_Porphyromonaceae |  |  |  |  |  |  | - (**) |  |  | - (**) |  |  | - (***) | - (**)
180 | [NAME] | 502D04_Neisseria_sp. | - (*) |  |  | - (**) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (*) | - (***) |  | - (***) | - (***)
187 | Geneva_179 | 402E01_Haemophilus_sp. | - (*) |  |  | - (*) |  |  | - (**) |  |  |  |  |  | - (**)
188 | Geneva_180 | 101F05_Clostridiales |  |  |  |  |  |  | - (**) |  |  | - (***) |  |  | - (**) | - (***)
189 | Geneva_356 | Prevotella_sp._2 |  | + (*) |  | + (**) |  | + (*) | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (*) | + (***) | + (***)
195 | Geneva_187 | 501D04_Streptococcus_thermophilus |  |  |  |  |  | + (*) | + (**) |  |  | + (***) |  | + (*) | + (*) | + (***)
196 | [NAME] | 502G08_Neisseria_subflava;502D04_Neisseria_sp.;501C06_Neisseria_cinerea;401A08_Neisseria_pharyngis;101C07_Neisseria_sicca | - (***) | - (*) |  | - (***) |  | - (*) | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) | - (**) | - (***) | - (***)
197 | Geneva_189 | 502H07_Capnocytophaga_sp. | - (**) |  |  | - (***) |  | - (**) | - (***) | - (*) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
198 | Geneva_357 | Prevotella_sp._2 |  |  |  |  |  |  | + (*) |  |  |  |  |  | + (**)
199 | Geneva_191 | 402B02_Prevotellaceae |  |  |  |  |  |  | + (***) | + (*) |  | + (***) | + (***) | + (**) | + (***) | + (***)
200 | Geneva_192 | 101D07_Streptococcus_pyogenes |  |  |  |  |  | + (*) | + (***) |  |  | + (***) |  |  | + (***) | + (***)
201 | Geneva_193 | 201C11_Neisseria_sp. |  |  |  | - (*) |  |  | - (***) |  | - (*) | - (***) | - (**) |  | - (***) | - (***)
202 | Geneva_194 | 501D03_Abiotrophia_sp. |  |  |  |  |  | + (*) | + (***) | + (**) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
205 | Geneva_197 | 502H08_Streptococcus_cristatus |  |  |  | - (*) |  |  | - (*) |  |  |  |  |  | - (**)
206 | Geneva_198 | 501A07_Lautropia_sp. |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*) |  | - (**) |  | - (**) | - (**)
207 | Geneva_199 | VariousNeisseria;401A08_Neisseria_pharyngis | - (*) |  |  | - (**) |  |  | - (***) |  | - (*) | - (*) |  |  | - (***) | - (**)
209 | Geneva_201 | 301F09_Peptostreptococcus_micros |  |  |  |  |  | + (*) | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (*) | + (***) | + (***)
210 | Geneva_202 | 601H01_Capnocytophaga_sp. | - (**) | - (*) |  | - (***) |  |  | - (***) | - (**) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
211 | Geneva_203 | 701B10_Bacteroidetes |  |  |  | + (*) |  |  | + (***) |  |  | + (**) |  |  | + (***) | + (*)
212 | Geneva_204 | 201A08_Streptococcus_sanguinis |  |  |  | - (*) |  |  |  |  |  |  |  |  | - (**)
214 | Geneva_206 | Various_Corynebacterium;201F03_Corynebacterium_matruchotii |  |  |  |  |  |  | - (***) |  | - (*) | - (***) | - (***) | - (*) | - (***) | - (***)
215 | Geneva_207 | 701C02_Prevotellaceae |  |  |  |  |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
216 | Geneva_208 | 402F12_Haemophilus_parainfluenzae | - (***) |  |  | - (***) |  |  | - (**) |  |  |  |  |  | - (***)
217 | Geneva_209 | 502A03_Capnocytophaga_sputigena;402F05_Capnocytophaga_sputigena | - (**) | - (*) |  | - (***) |  | - (**) | - (***) | - (*) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
218 | Geneva_210 | 102E06_Neisseria_elongata |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*) | - (*)
220 | Geneva_212 | 501C06_Neisseria_cinerea | - (**) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (*) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
222 | Geneva_214 | 201D05_Clostridiales | + (***) |  |  | + (**) |  |  | + (**) |  |  |  |  |  | + (**)
223 | Geneva_215 | 701G03_Prevotella_sp. | + (*) |  |  | + (*) |  |  | + (***) |  | + (*) | + (**) | + (*) |  | + (***) | + (***)
226 | Geneva_218 | 601D08_Campylobacter_gracilis |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*) |  | - (***) |  | - (**) | - (**)
228 | Geneva_220 | 502G08_Neisseria_subflava;502D04_Neisseria_sp. | - (*) |  |  | - (***) |  | - (*) | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) | - (**) | - (***) | - (***)
230 | Geneva_222 | 201A08_Streptococcus_sanguinis_ |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*)
231 | Geneva_223 | 301H11_Prevotellaceae |  |  |  |  |  |  | + (***) |  |  | + (*) |  |  | + (**)
232 | Geneva_224 | 502H05_Leptotrichia_sp. |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*)
235 | [NAME] | 102A02_Bacteroidetes | + (*) |  |  | + (*) |  |  | + (*) |  |  |  |  |  | + (*)
237 | Geneva_227 | 302E10_Catonella_morbi | + (*) |  |  | + (*) |  |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (**) | + (***) | + (***)
240 | Geneva_230 | 501H09_Capnocytophaga_gingivalis |  |  |  | - (*) |  | - (**) | - (***) | - (*) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
245 | Geneva_233 | 202D12_Streptococcus_sinensis |  |  |  |  |  |  | + (*)
246 | Geneva_234 | 201E08_Dialister_pneumosintes | + (***) | + (**) |  | + (***) |  | + (***) | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
248 | Geneva_236 | 202A06_Clostridiales |  |  |  |  |  |  | + (*) |  |  | + (*) |  |  |  | + (*)
255 | Geneva_241 | 301D08_Streptococcus_oligofermentans |  |  |  | + (*) |  |  | + (***) |  | + (**) | + (*) |  |  | + (***) | + (*)
256 | Geneva_242 | 101F03_Lachnospiraceae | + (***) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
257 | Geneva_243 | 202B04_Lautropia_sp. |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*)
259 | [NAME] | 101E01_Prevotella_intermedia | + (*) |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (**) | + (***) | + (***)
261 | Geneva_247 | Various_Prevotella;702F08_Prevotella_intermedia_strain_2 | + (***) | + (**) |  | + (***) |  | + (**) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
265 | Geneva_249 | 302E10_Catonella_morbi;402A04_Catonella_sp. | + (*) |  |  | + (**) |  |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
266 | Geneva_250 | 102A02_Bacteroidetes;102F04_Bacteroidetes | + (*) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
267 | Geneva_251 | 302B11_Prevotella_nigrescens |  |  |  |  |  |  | + (*)
270 | Geneva_254 | 501H09_Capnocytophaga_gingivalis | - (***) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
274 | Geneva_256 | 502A03_Capnocytophaga_sputigena;402F05_Capnocytophaga_sputigena | - (**) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (**) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
278 | Geneva_260 | 202F06_Gemella_sp. |  |  |  | + (*) |  |  | + (**) |  | + (**) |  | + (*) |  | + (***) | + (**)
280 | Geneva_262 | 301G11_Prevotella_genomosp. | + (*) |  |  | + (**) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) |  | + (***) | + (***)
281 | Geneva_362 | Fusobacteria_nuc._Group_A_and_B |  |  |  |  |  |  | - (**) |  |  | - (*) |  |  | - (*)
283 | Geneva_265 | Various_Prevotella;702D12_Prevotella_intermedia_strain_5 | + (**) | + (*) |  | + (***) |  | + (**) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
285 | Geneva_267 | 102E05_Capnocytophaga_granulosa;501H09_Capnocytophaga_gingivalis | - (***) |  |  | - (***) |  | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***) | - (***)
287 | Geneva_269 | 501D03_Abiotrophia_sp. |  |  |  |  |  |  |  |  |  | + (**)
288 | Geneva_270 | 402A04_Catonella_sp. | + (**) |  |  | + (*) |  |  | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
289 | Geneva_271 | 301F09_Peptostreptococcus_micros;102E10_Peptostreptococcus_sp. |  |  |  |  |  |  | - (***) | - (*) | - (***) | - (***) | - (***) | - (*) | - (***) | - (***)
305 | Geneva_287 | Archaea_ |  |  |  |  |  |  |  |  | + (***) |  | + (***) |  | + (**) | + (*)
310 | Geneva_292 | [NAME]._ |  |  |  |  |  |  | + (*) |  |  | + (**) |  |  | + (*) | + (*)
314 | Geneva_296 | Crenarchaeota |  |  |  | - (*) |  | + (*) |  |  | - (**) |  | - (**) |  | - (*)
321 | Geneva_303 | Thermoplasmatales |  |  |  |  |  |  | + (*) |  |  |  |  |  | + (*)
324 | Geneva_306 | Desulfurococcales | + (*) |  |  | + (**) |  |  | + (***) |  |  |  |  |  | + (***)
328 | [NAME] | 1.13.1.1.3.1_Peptostreptococcus(genus) |  |  |  |  |  | + (**) | + (***) |  | + (**) | + (***) | + (*) | + (*) | + (***) | + (***)
329 | Geneva_311 | 1.12.3.11.1.7_Moritella(genus) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | + (*)
332 | Geneva_314 | 1.17.1.1.1_Spirochaetaceae(family) | + (**) |  |  | + (***) | - (*) |  |  |  | + (***) |  | + (***) |  | + (***)
333 | Geneva_315 | 1.12.4.3_Desulfobacterales(order) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | - (*)
334 | Geneva_316 | 1.14.1.4.20.3_unclassified_Nocardiaceae | + (***) |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  | + (**) | + (*) | + (*) |  | + (***) | + (**)
336 | Geneva_318 | 1.17.1.1.1.3_Treponema(genus) | + (***) |  |  | + (**) |  |  | + (*) |  | + (***) |  | + (***) |  | + (***) | + (*)
337 | Geneva_319 | 1.17.1.1.1_Spirochaetaceae(family) | + (***) |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  | + (***) |  | + (***) |  | + (***) | + (***)
338 | Geneva_320 | 1.14.1.4.21.1_Tsukamurella(genus) | + (***) |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) |  | + (***) | + (***)
339 | Geneva_321 | 1.13.1.1.8_Syntrophomonadaceae(family) | + (***) |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (*) | + (***) |  | + (***) | + (***)
340 | Geneva_322 | 1.17.1.1.1_Spirochaetaceae(family) | + (***) |  |  | + (***) | - (*) |  | + (***) | + (*) | + (***) | + (**) | + (***) |  | + (***) | + (***)
341 | Geneva_323 | 1.13.1.1.2.6_Catonella(genus) | + (*) |  |  | + (*) |  | + (*) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***) | + (***)
342 | Geneva_324 | 1.13.1.1.3.8_Tissierella(genus) |  |  |  | + (*)
347 | Geneva_325 | 1.14.1.4.25_Nocardioidaceae(family) | + (***) |  |  | + (***) |  |  | + (***) |  | + (***) | + (***) | + (***) |  | + (***) | + (***)
348 | Geneva_326 | 1.17.1.1.1.3_Treponema(genus) | + (*) |  |  | + (*) |  |  | + (***) | + (*) | + (***) | + (***) | + (***) |  | + (***) | + (***)