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Sheet: Sheet1

Table S1. Klebsiella pneumoniae strains used in this study and results of the K3 and phoE PCR assays | Unnamed: 1 | Unnamed: 2 | Unnamed: 3 | Unnamed: 4 | Unnamed: 5 | Unnamed: 6 | Unnamed: 7 | Unnamed: 8
Strain code | Strain name | Taxonomic designation | C-pattern | K type | Sequence type | [NAME] | phoE PCR | rpoB PCR
SB165 | A 5054 | K. p. subsp. pneumoniae | C1a | 1 | 82 | - | - | +
SB3178 | CIP 52.208 | K. p. subsp. pneumoniae | C1a | 1 | 82 | - | - | +
SB3928 | [NAME] | K. p. subsp. pneumoniae | C1a | n.a. | 23 | - | - | +
SB166 | B5055 | K. p. subsp. pneumoniae | C2a | 2 | 66 | - | - | +
SB3194 | CIP 52.145 | K. p. subsp. pneumoniae | C2a | 2 | 66 | - | - | +
SB3341 | KP52145 | K. p. subsp. pneumoniae | C2a | n.a. | 66 | - | - | +
SB1109 | 05D002 | K. p. subsp. pneumoniae | C3c | 3 | 8 | + | - | +
SB132 | ATCC 13883 T | K. p. subsp. pneumoniae | C3a | 3 | 3 | + | - | +
SB2396 | cur24329 | K. p. subsp. pneumoniae | C3a | 3 | 13 | + | - | +
SB2761 | V9301316 | K. p. subsp. pneumoniae | C3b | 3 | 71 | + | - | +
SB2819 | [NAME] | K. p. subsp. pneumoniae | C3d | 3 | 153 | + | - | +
SB3204 | CIP 52.146 | K. p. subsp. pneumoniae | C3a | 3 | 3 | + | - | +
SB3206 | CIP 82.91 T | K. p. subsp. pneumoniae | C3a | 3 | 3 | + | - | +
SB3211 | 538 | K. p. subsp. pneumoniae | C3a | 3 | n.a. | + | - | +
SB3215 | 1509 | K. p. subsp. pneumoniae | C3a | 3 | 13 | + | - | +
SB3216 | 1635 | K. p. subsp. pneumoniae | C3a | 3 | 13 | + | - | +
SB3217 | 1649 | K. p. subsp. pneumoniae | C3a | 3 | 13 | + | - | +
SB3327 | 1576 | K. p. subsp. pneumoniae | n.a. | 3 | n.a. | + | - | +
SB3419 | 2368 | K. p. subsp. pneumoniae | C3a | 3 | 159 | + | - | +
SB3430 | 4239 S2 | K. p. subsp. pneumoniae | C3a | 3 | 169 | + | - | +
SB167 | C5046 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB1785 | 475 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB1793 | SB1793 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB3177 | 03-2455 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB3205 | CIP 52.210 T | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB3207 | ATCC 6908 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB3208 | CIP 54.45 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB3209 | CIP 54.129 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB3210 | 475 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB3212 | 745 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | n.a. | + | + | +
SB3213 | 746 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB3218 | 34.81 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB3219 | 42.79 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB1782 | CIP 52.210 T | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB1783 | 745 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | n.a. | 67 | + | + | +
SB3432 | 04-6021 | K. p. subsp. rhinoscleromatis | C3a | 3 | 67 | + | + | +
SB168 | KLSP04 | K. p. subsp. ozaenae | C4a | 4 | n.a. | - | - | +
SB176 | ATCC 11296 T | K. p. subsp. ozaenae | C4a | 4 | 91 | - | - | +
SB3220 | CIP 52.211 T | K. p. subsp. ozaenae | C4a | 4 | 91 | - | - | +
SB3227 | 748 | K. p. subsp. ozaenae | C4e | 4 | n.a. | - | - | +
SB3464 | DeChamps1 | K. p. subsp. ozaenae | C4g | n.a. | 90 | - | - | +
SB169 | KLSP05 | K. p. subsp. pneumoniae | C16a | 5 | 97 | - | n.a. | +
[NAME] | KLSP06 | K. p. subsp. pneumoniae | C16a | 6 | n.a. | - | n.a. | +
SB179 | Aerogenes4140 | K. p. subsp. pneumoniae | C7a | 7 | n.a. | - | n.a. | +
SB3237 | CIP 52.205 | K. p. subsp. pneumoniae | C7a | 7 | 154 | - | n.a. | +
SB180 | [NAME] | K. planticola | C7a | 8 | n.a. | - | n.a. | +
SB181 | Klebs.1056 | K. p. subsp. pneumoniae | C9a | 9 | n.a. | - | n.a. | +
SB3244 | CIP 52.207 | K. p. subsp. pneumoniae | C15a | 9 | n.a. | - | n.a. | +
SB182 | Klebsiella 919 | K. p. subsp. pneumoniae | C10a | 10 | n.a. | - | n.a. | +
SB3245 | CIP 52.214 | K. p. subsp. pneumoniae | C10a | 10 | n.a. | - | n.a. | +
SB183 | 390 | K. p. subsp. pneumoniae | n.a. | 11 | n.a. | - | n.a. | +
SB3247 | CIP 52.215 | K. p. subsp. pneumoniae | C11a | 11 | n.a. | - | n.a. | +
SB184 | 313 | K. p. subsp. pneumoniae | C12a | 12 | n.a. | - | n.a. | +
SB3248 | CIP 52.216 | K. p. subsp. pneumoniae | C12a | 12 | n.a. | - | n.a. | +
SB185 | 1470 | K. p. subsp. pneumoniae | C13a | 13 | n.a. | - | n.a. | +
SB3249 | CIP 52.217 | K. p. subsp. pneumoniae | C13a | 13 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | 138 | K. planticola | C14a | 14 | n.a. | - | n.a. | +
SB3250 | CIP 52.218 | K. planticola | C14a | 14 | n.a. | - | n.a. | +
SB187 | SB187 | K. p. subsp. pneumoniae | C15a | 15 | n.a. | - | n.a. | +
SB3251 | CIP 52.219 | K. p. subsp. pneumoniae | C15a | 15 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | SB188 | K. p. subsp. pneumoniae | C16a | 16 | n.a. | - | n.a. | +
SB3252 | CIP 52.220 | K. p. subsp. pneumoniae | C16a | 16 | n.a. | - | n.a. | +
SB189 | SB189 | K. p. subsp. pneumoniae | C17a | 17 | n.a. | - | n.a. | +
SB3254 | CIP 52.221 | K. p. subsp. pneumoniae | C17a | 17 | n.a. | - | n.a. | +
SB190 | SB190 | K. p. subsp. pneumoniae | C18a | 18 | n.a. | - | n.a. | +
SB3255 | CIP 52.222 | K. p. subsp. pneumoniae | C18a | 18 | n.a. | - | n.a. | +
SB191 | SB191 | K. p. subsp. pneumoniae | C19a | 19 | n.a. | - | n.a. | +
SB3256 | CIP 52.223 | K. p. subsp. pneumoniae | C19a | 19 | n.a. | - | n.a. | +
263 | CIP 52.224 | K. p. subsp. pneumoniae | C15a | 20 | n.a. | - | n.a. | +
SB192 | SB192 | K. p. subsp. pneumoniae | C20a | 20 | n.a. | - | n.a. | +
SB3340 | 1582 | K. p. subsp. pneumoniae | C20b | 20 | n.a. | - | n.a. | +
SB193 | SB193 | K. p. subsp. pneumoniae | C21a | 21 | n.a. | - | n.a. | +
SB3257 | CIP 52.225 | K. p. subsp. pneumoniae | C21a | 21 | n.a. | - | n.a. | +
SB194 | SB194 | K. p. subsp. pneumoniae | C22,37a | 22 | n.a. | - | n.a. | +
SB3258 | CIP 52.226 | K. p. subsp. pneumoniae | C22,37a | 22 | 155 | - | n.a. | +
SB195 | SB195 | K. p. subsp. pneumoniae | C23a | 23 | n.a. | - | n.a. | +
SB3259 | CIP 52.228 | K. p. subsp. pneumoniae | C23a | 23 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | 1680/49 | K. p. subsp. pneumoniae | C24a | 24 | 59 | - | n.a. | +
SB3260 | CIP 52.229 | K. p. subsp. pneumoniae | C24a | 24 | 59 | - | n.a. | +
SB197 | 2002/49 | K. p. subsp. pneumoniae | C25a | 25 | 47 | - | n.a. | +
SB3262 | CIP 52.230 | K. p. subsp. pneumoniae | C25a | 25 | 47 | - | n.a. | +
SB198 | 5884 | K. oxytoca | C26a | 26 | n.a. | - | n.a. | +
SB3265 | CIP 53.6 | K. oxytoca | C26a | 26 | n.a. | - | n.a. | +
SB199 | 6613 | K. p. subsp. pneumoniae | C27a | 27 | n.a. | - | n.a. | +
SB3266 | CIP 52.232 | K. p. subsp. pneumoniae | C27a | 27 | n.a. | - | n.a. | +
SB200 | 5758 | K. p. subsp. pneumoniae | C28a | 28 | n.a. | - | n.a. | +
SB3267 | CIP 52.233 | K. p. subsp. pneumoniae | C28a | 28 | n.a. | - | n.a. | +
SB317 | 5725y | K. oxytoca | C29a | 29 | n.a. | - | n.a. | +
SB3268 | CIP 52.234 | K. oxytoca | C29a | 29 | n.a. | - | n.a. | +
SB318 | 7824 | K. p. subsp. pneumoniae | C30a | 30 | n.a. | - | n.a. | +
SB3269 | CIP 52.235 | K. p. subsp. pneumoniae | C30a | 30 | 43 | - | n.a. | +
SB319 | 6258 | K. p. subsp. pneumoniae | C31a | 31 | n.a. | - | n.a. | +
SB3273 | CIP 52.231 | K. p. subsp. pneumoniae | C31a | 31 | n.a. | - | n.a. | +
SB3274 | CIP 53.7 | K. planticola | C32a | 32 | n.a. | - | n.a. | +
SB339 | SB339 | K. planticola | C32a | 32 | n.a. | - | n.a. | +
SB3275 | CIP 53.8 | K. p. subsp. pneumoniae | n.a. | 33 | n.a. | - | n.a. | +
SB473 | 6168 | K. p. subsp. pneumoniae | C166 | 33 | n.a. | - | n.a. | +
SB3276 | CIP 53.9 | K. p. subsp. pneumoniae | n.a. | 34 | n.a. | - | n.a. | +
SB474 | 7522 | K. p. subsp. pneumoniae | n.a. | 34 | n.a. | - | n.a. | +
SB28 | 06A093 | K. p. subsp. pneumoniae | C35c | 35 | 10 | - | n.a. | +
SB5 | 15A006 | K. p. subsp. pneumoniae | C35c | 35 | 12 | - | n.a. | +
SB3277 | CIP 53.10 | K. planticola | C35a | 35 | n.a. | - | n.a. | +
SB475 | 7444 | K. planticola | C35a | 35 | n.a. | - | n.a. | +
SB3280 | CIP 53.11 | K. p. subsp. pneumoniae | C36a | 36 | n.a. | - | n.a. | +
SB476 | 8306 | K. p. subsp. pneumoniae | C36a | 36 | n.a. | - | n.a. | +
SB3281 | CIP 53.12 | K. p. subsp. pneumoniae | C22,37a | 37 | 171 | - | n.a. | +
SB477 | 8238 | K. p. subsp. pneumoniae | C22,37a | 37 | n.a. | - | n.a. | +
SB3282 | CIP 53.13 | K. p. subsp. pneumoniae | C38a | 38 | n.a. | - | n.a. | +
SB3283 | CIP 53.14 | K. planticola | C39a | 39 | n.a. | - | n.a. | +
SB478 | SB478 | K. p. subsp. pneumoniae | C39a | n.a. | n.a. | - | n.a. | +
SB479 | 7749 | K. planticola | C39a | 39 | n.a. | - | n.a. | +
SB3285 | CIP 53.15 | K. p. subsp. pneumoniae | C40a | 40 | n.a. | - | n.a. | +
SB480 | 8588 | K. p. subsp. pneumoniae | C40a | 40 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | 6177 = Br32 | K. oxytoca | C41a | 41 | n.a. | - | n.a. | +
SB3286 | CIP 53.16 | K. p. subsp. pneumoniae | C41a | 41 | n.a. | - | n.a. | +
SB3287 | CIP 53.17 | K. p. subsp. pneumoniae | C42a | 42 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | 1702 | K. p. subsp. pneumoniae | C42a | 42 | n.a. | - | n.a. | +
SB3288 | CIP 53.19 | K. p. subsp. pneumoniae | C43a | 43 | n.a. | - | n.a. | +
SB483 | KLSP43 | K. p. subsp. pneumoniae | C43a | 43 | n.a. | - | n.a. | +
SB3289 | CIP 53.20 | K. planticola | C44a | 44 | n.a. | - | n.a. | +
SB484 | 7730 | K. planticola | C44a | 44 | n.a. | - | n.a. | +
SB3290 | CIP 53.21 | K. p. subsp. pneumoniae | C45a | 45 | n.a. | - | n.a. | +
SB485 | 8464 | K. p. subsp. pneumoniae | C45a | 45 | n.a. | - | n.a. | +
SB3291 | CIP 53.22 | K. p. subsp. pneumoniae | C46a | 46 | n.a. | - | n.a. | +
SB486 | 5281 | K. p. subsp. pneumoniae | C46a | 46 | n.a. | - | n.a. | +
SB3292 | CIP 53.23 | K. p. subsp. pneumoniae | C47a | 47 | n.a. | - | n.a. | +
SB487 | 9682 | K. p. subsp. pneumoniae | C47a | 47 | n.a. | - | n.a. | +
SB3295 | CIP 53.24 | K. planticola | C48a | 48 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | 1196 | K. planticola | C48a | 48 | n.a. | - | n.a. | +
SB3296 | CIP 52.199 | K. planticola | C49a | 49 | n.a. | - | n.a. | +
SB489 | 6115 | K. planticola | C49a | 49 | n.a. | - | n.a. | +
SB3297 | CIP 52.200 | K. p. subsp. pneumoniae | C50a | 50 | n.a. | - | n.a. | +
SB490 | 1303/50 | K. p. subsp. pneumoniae | C50b | 50 | n.a. | - | n.a. | +
SB3298 | CIP 52.201 | K. p. subsp. pneumoniae | C51a | 51 | n.a. | - | n.a. | +
SB491 | 4715/50 | K. p. subsp. pneumoniae | n.a. | 51 | n.a. | - | n.a. | +
SB3299 | CIP 53.25 | K. p. subsp. pneumoniae | n.a. | 52 | n.a. | - | n.a. | +
SB492 | 5759/50 | K. p. subsp. pneumoniae | n.a. | 52 | n.a. | - | n.a. | +
SB3301 | CIP 53.26 | K. planticola | C53a | 53 | n.a. | - | n.a. | +
SB493 | 1756/51 | K. planticola | C53a | 53 | n.a. | - | n.a. | +
SB3302 | CIP 53.27 | K. planticola | C54a | 54 | n.a. | - | n.a. | +
SB494 | Stanley | K. planticola | C54a | 54 | n.a. | - | n.a. | +
SB495 | 3958/51 | K. p. subsp. pneumoniae | C55a | 55 | n.a. | - | n.a. | +
SB496 | 3534/51 | K. planticola | C56a | 56 | n.a. | - | n.a. | +
SB497 | 4425/51 | K. planticola | C57a | 57 | n.a. | - | n.a. | +
SB498 | 636/52 | K. planticola | C58a | 58 | n.a. | - | n.a. | +
SB500 | 4463/52 | K. p. subsp. pneumoniae | C60a | 60 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | 5710/52 | K. p. subsp. pneumoniae | C61a | 61 | n.a. | - | n.a. | +
SB502 | 5711/52 | K. p. subsp. pneumoniae | C62a | 62 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | 5845/52 | K. p. subsp. pneumoniae | C63a | 63 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | [NAME] | K. p. subsp. pneumoniae | C64a | 64 | n.a. | - | n.a. | +
SB505 | Sw4 | K. terrigena | n.a. | 65 | n.a. | - | n.a. | +
SB506 | 438(3a) | K. oxytoca | C66a | 66 | n.a. | - | n.a. | +
SB507 | 264(1) | K. p. subsp. pneumoniae | C67a | 67 | n.a. | - | n.a. | +
SB508 | SB508 | K. p. subsp. pneumoniae | n.a. | 69 | n.a. | - | n.a. | +
SB509 | SB509 | K. oxytoca | n.a. | 70 | n.a. | - | n.a. | +
SB510 | 4349 | K. planticola | C71a | 71 | n.a. | - | n.a. | +
SB511 | 1205 | K. planticola | C72a | 72 | n.a. | - | n.a. | +
SB512 | 371 | K. oxytoca | n.a. | 74 | n.a. | - | n.a. | +
SB513 | 325 | K. planticola | C79a | 79 | n.a. | - | n.a. | +
SB514 | SB514 | K. p. subsp. pneumoniae | C80a | 80 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | SB515 | K. p. subsp. pneumoniae | C81a | 81 | n.a. | - | n.a. | +
[NAME] | 3454-70 | K. p. subsp. pneumoniae | C82a | 82 | n.a. | - | n.a. | +
SB3818 | 50938 | K. p. subsp. pneumoniae | C174 | n.a. | 35 | - | n.a. | +
SB316 | 30D135 | K. planticola | C164 | n.a. | n.a. | - | - | +
n.a.: not analyzed.