Spreadsheet: 772e41ec-2515-40a6-9c3b-a0f161e8a5f9
Sheet: N1 (prior to 2001)

leading | trailing | dN/dS (leading) | dN/dS (trailing) | epitiope (leading) | epitiope (trailing) | # of subst at leading site | # of subst at trailing site | # of consec subst | # of inverse consec subst | phys dist | E_tau | nomial P-val | mean time btw consec subst (in syn subst) | std in time btw consec subst (in syn subst) | mean time btw consec subst (in years) | std in time btw consec subst (in years)
105 | 86 | 0.773268241177 | 0.39141693621 | NaN | NaN | 2 | 2 | 2 | 1 | NaN | 1.63861 | 0 | 8 | 8.13941029804985 | 2.80512602902487 | 2.85400896099659
369 | 86 | 2.48790218967 | 0.39141693621 | NaN | NaN | 6 | 2 | 2 | 1.5 | NaN | 1.70947 | 0 | 6.33335 | 6.6718737997657 | 2.22073061699058 | 2.33943085726148
105 | 200 | 0.773268241177 | 1.09851661026 | NaN | NaN | 2 | 4 | 4 | 1 | NaN | 2.20108 | 0 | 29.375 | 36.3481430062115 | 10.3000721378257 | 12.7451402566802
105 | 250 | 0.773268241177 | 1.69827757645 | NaN | NaN | 2 | 5 | 4 | 1 | NaN | 2.61929 | 0 | 19 | 23.3157671973281 | 6.66217431893406 | 8.17545818148864
332 | 270 | 0.989573579274 | 1.4615315059 | NaN | NaN | 4 | 5 | 4 | 2 | NaN | 3.08374 | 0 | 10.666675 | 11.6111799572653 | 3.7401709607061 | 4.0713528907271
248 | 329 | 3.64045333873 | 0.835091546655 | NaN | NaN | 12 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.84425 | 0 | 3.25 | 3.33541601603158 | 1.13958244929135 | 1.16953278552458
83 | 434 | 1.42008627216 | 2.79896259896 | NaN | NaN | 4 | 6 | 4.5 | 2.5 | NaN | 3.57854 | 0 | 9.22222222222222 | 9.46337971105226 | 3.23368695012589 | 3.31824659375231
222 | 434 | 3.53185211488 | 2.79896259896 | NaN | NaN | 7 | 6 | 5.5 | 4.5 | NaN | 4.42855 | 0 | 8.72727272727273 | 8.99747439310307 | 3.06013748620894 | 3.15488120194727
339 | 434 | 1.54797065748 | 2.79896259896 | NaN | NaN | 3 | 6 | 4.5 | 1.5 | NaN | 3.57854 | 0 | 9.22222222222222 | 9.46337971105226 | 3.23368695012589 | 3.31824659375231
454 | 434 | 0.40879650898 | 2.79896259896 | NaN | NaN | 2 | 6 | 3 | 2 | NaN | 2.74086 | 0 | 3.66666666666667 | 4.20317340430616 | 1.28568276330306 | 1.47380389011553
70 | 454 | 1.13674482988 | 0.40879650898 | NaN | NaN | 4 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.77609 | 0 | 4.75 | 4.75657439761011 | 1.66554357973351 | 1.66784883146617
83 | 454 | 1.42008627216 | 0.40879650898 | NaN | NaN | 4 | 2 | 2 | 1 | NaN | 1.77609 | 0 | 4.75 | 4.75657439761011 | 1.66554357973351 | 1.66784883146617
339 | 454 | 1.54797065748 | 0.40879650898 | NaN | NaN | 3 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.77609 | 0 | 4.75 | 4.75657439761011 | 1.66554357973351 | 1.66784883146617
332 | 23 | 0.989573579274 | 1.24466311349 | NaN | NaN | 4 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.54793 | 0.001 | 10.25 | 10.2530483272049 | 3.59406772468811 | 3.59513659243655
105 | 270 | 0.773268241177 | 1.4615315059 | NaN | NaN | 2 | 5 | 5 | 1 | NaN | 2.26027 | 0.001 | 41.1 | 49.3027382606687 | 14.4113349741152 | 17.2875492996502
200 | 270 | 1.09851661026 | 1.4615315059 | NaN | NaN | 4 | 5 | 4 | 2 | NaN | 3.08374 | 0.001 | 10.666675 | 11.6111799572653 | 3.7401709607061 | 4.0713528907271
430 | 274 | 2.08175646351 | 1.77855142838 | NaN | NaN | 3 | 3 | 2.5 | 1 | NaN | 2.25199 | 0.001 | 4.2 | 4.39317652729776 | 1.47269116523805 | 1.540426728353
105 | 390 | 0.773268241177 | 0.539182222218 | NaN | NaN | 2 | 2 | 2 | 1 | NaN | 1.63861 | 0.001 | 8 | 8.13941029804985 | 2.80512602902487 | 2.85400896099659
367 | 418 | 0.998658795243 | 1.01009672328 | NaN | NaN | 3 | 3 | 3 | 0 | NaN | 2.18556 | 0.001 | 12.8333333333333 | 13.3447867473907 | 4.49988967156072 | 4.67922608211145
86 | 435 | 0.39141693621 | 2.63704713738 | NaN | NaN | 2 | 3 | 3 | 0 | NaN | 1.83646 | 0.001 | 19.6666666666667 | 19.7399763593239 | 6.8959348213528 | 6.92164018723437
390 | 435 | 0.539182222218 | 2.63704713738 | NaN | NaN | 2 | 3 | 3 | 0 | NaN | 1.83646 | 0.001 | 19.6666666666667 | 19.7399763593239 | 6.8959348213528 | 6.92164018723437
222 | 454 | 3.53185211488 | 0.40879650898 | NaN | NaN | 7 | 2 | 2 | 3 | NaN | 1.77609 | 0.001 | 4.75 | 4.75657439761011 | 1.66554357973351 | 1.66784883146617
367 | 15 | 0.998658795243 | 1.15716537969 | NaN | NaN | 3 | 5 | 4 | 0 | NaN | 2.94023 | 0.002 | 12.375 | 12.5772612281053 | 4.33917932614784 | 4.41010035560042
220 | 34 | 1.37091214642 | 1.79826647575 | NaN | NaN | 3 | 6 | 4 | 2 | NaN | 2.81075 | 0.002 | 14.25 | 14.6244658022097 | 4.99663073920054 | 5.12793371029529
367 | 93 | 0.998658795243 | 0.631937646018 | NaN | NaN | 3 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.54793 | 0.002 | 10.25 | 10.2530483272049 | 3.59406772468811 | 3.59513659243655
200 | 173 | 1.09851661026 | 0.645091123335 | NaN | NaN | 4 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.54793 | 0.002 | 10.25 | 10.2530483272049 | 3.59406772468811 | 3.59513659243655
83 | 234 | 1.42008627216 | 0.434075301769 | NaN | NaN | 4 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.58786 | 0.002 | 9.25 | 9.33407735129724 | 3.24342697106 | 3.27290791688192
339 | 336 | 1.54797065748 | 1.43747806139 | NaN | NaN | 3 | 5 | 4.25 | 1.75 | NaN | 2.81628 | 0.002 | 16.9607764705882 | 18.0867842555243 | 5.94713944376494 | 6.34196366206605
454 | 336 | 0.40879650898 | 1.43747806139 | NaN | NaN | 2 | 5 | 3 | 2 | NaN | 2.10859 | 0.002 | 14.3333333333333 | 14.9499163877261 | 5.02585080200289 | 5.24204994886947
200 | 418 | 1.09851661026 | 1.01009672328 | NaN | NaN | 4 | 3 | 3 | 0 | NaN | 2.18556 | 0.002 | 12.8333333333333 | 13.3447867473907 | 4.49988967156072 | 4.67922608211145
70 | 434 | 1.13674482988 | 2.79896259896 | NaN | NaN | 4 | 6 | 4 | 2 | NaN | 3.19875 | 0.002 | 9 | 9.25337776166087 | 3.15576678265297 | 3.24461135195435
232 | 435 | 0.872787081585 | 2.63704713738 | NaN | NaN | 3 | 3 | 3 | 0.5 | NaN | 1.99719 | 0.002 | 16.8889 | 18.1771101480222 | 5.92193662394976 | 6.37363560108365
200 | 15 | 1.09851661026 | 1.15716537969 | NaN | NaN | 4 | 5 | 4 | 0 | NaN | 2.94023 | 0.003 | 12.375 | 12.5772612281053 | 4.33917932614784 | 4.41010035560042
250 | 15 | 1.69827757645 | 1.15716537969 | NaN | NaN | 5 | 5 | 5 | 0 | NaN | 3.0955 | 0.003 | 19.6 | 20.4132310034448 | 6.87255877111092 | 7.15771070303255
332 | 15 | 0.989573579274 | 1.15716537969 | NaN | NaN | 4 | 5 | 4 | 0 | NaN | 2.94023 | 0.003 | 12.375 | 12.5772612281053 | 4.33917932614784 | 4.41010035560042
367 | 23 | 0.998658795243 | 1.24466311349 | NaN | NaN | 3 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.54793 | 0.003 | 10.25 | 10.2530483272049 | 3.59406772468811 | 3.59513659243655
287 | 34 | 0.760168847727 | 1.79826647575 | NaN | NaN | 2 | 6 | 4 | 1 | NaN | 2.38854 | 0.003 | 23.875 | 29.3981291921782 | 8.37154799287108 | 10.3081821752019
83 | 45 | 1.42008627216 | 0.436712732027 | NaN | NaN | 4 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.67396 | 0.003 | 7.25 | 7.94512429103535 | 2.54214546380378 | 2.78588436907762
454 | 95 | 0.40879650898 | 0.956159847242 | NaN | NaN | 2 | 3 | 3 | 0 | NaN | 1.74269 | 0.003 | 23.8333333333333 | 26.9644828122724 | 8.35693796146991 | 9.45484657448736
15 | 114 | 1.15716537969 | 0.895753846054 | NaN | NaN | 5 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.62977 | 0.003 | 8.5 | 9.86154146165801 | 2.98044640583892 | 3.4578583300506
332 | 173 | 0.989573579274 | 0.645091123335 | NaN | NaN | 4 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.54793 | 0.003 | 10.25 | 10.2530483272049 | 3.59406772468811 | 3.59513659243655
84 | 220 | 2.31014410231 | 1.37091214642 | NaN | NaN | 4 | 3 | 3 | 2 | NaN | 1.98636 | 0.003 | 18.5 | 22.4258035902098 | 6.48685394212 | 7.8634006715871
105 | 332 | 0.773268241177 | 0.989573579274 | NaN | NaN | 2 | 4 | 4 | 1 | NaN | 2.20108 | 0.003 | 29.375 | 36.3481430062115 | 10.3000721378257 | 12.7451402566802
220 | 385 | 1.37091214642 | 0.584790818832 | NaN | NaN | 3 | 2 | 2 | 1 | NaN | 1.67376 | 0.003 | 7.5 | 9.30053761886914 | 2.62980565221081 | 3.26114751982685
95 | 396 | 0.956159847242 | 1.02334991305 | NaN | NaN | 3 | 4 | 3 | 0 | NaN | 2.23201 | 0.003 | 11.8333333333333 | 11.8497538652356 | 4.14924891793261 | 4.15500662561381
248 | 434 | 3.64045333873 | 2.79896259896 | NaN | NaN | 12 | 6 | 6 | 6 | NaN | 4.62571 | 0.003 | 10.75 | 12.0329408984947 | 3.76938810150216 | 4.21923946501067
314 | 435 | 0.85913383281 | 2.63704713738 | NaN | NaN | 2 | 3 | 2 | 1 | NaN | 1.72155 | 0.003 | 6 | 6.02079728939615 | 2.10384452176865 | 2.11113689899594
248 | 454 | 3.64045333873 | 0.40879650898 | NaN | NaN | 12 | 2 | 2 | 3 | NaN | 1.77609 | 0.003 | 4.75 | 4.75657439761011 | 1.66554357973351 | 1.66784883146617
367 | 173 | 0.998658795243 | 0.645091123335 | NaN | NaN | 3 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.54793 | 0.004 | 10.25 | 10.2530483272049 | 3.59406772468811 | 3.59513659243655
105 | 232 | 0.773268241177 | 0.872787081585 | NaN | NaN | 2 | 3 | 2 | 1 | NaN | 1.63861 | 0.004 | 8 | 8.13941029804985 | 2.80512602902487 | 2.85400896099659
105 | 248 | 0.773268241177 | 3.64045333873 | NaN | NaN | 2 | 12 | 5 | 1 | NaN | 3.14327 | 0.004 | 19.9 | 22.4176269930606 | 6.97775099719935 | 7.8605336234006
339 | 254 | 1.54797065748 | 1.96940939506 | NaN | NaN | 3 | 5 | 4.5 | 1.5 | NaN | 2.5572 | 0.004 | 24.3333333333333 | 27.0760246548697 | 8.53225833828397 | 9.49395769023674
64 | 329 | 0.989212683531 | 0.835091546655 | NaN | NaN | 3 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.53454 | 0.004 | 11.25 | 13.3837588143242 | 3.94470847831622 | 4.69289127703146
336 | 367 | 1.43747806139 | 0.998658795243 | NaN | NaN | 5 | 3 | 3 | 1 | NaN | 2.20916 | 0.004 | 14.3333333333333 | 19.7357543559906 | 5.02585080200289 | 6.92015978080375
454 | 45 | 0.40879650898 | 0.436712732027 | NaN | NaN | 2 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.26728 | 0.005 | 21 | 25.8069758011279 | 7.36345582619027 | 9.04897744376983
93 | 352 | 0.631937646018 | 1.29382039292 | NaN | NaN | 2 | 3 | 2 | 0 | NaN | 1.47243 | 0.005 | 12.25 | 12.2525507548428 | 4.29534923194433 | 4.29624363054474
369 | 390 | 2.48790218967 | 0.539182222218 | NaN | NaN | 6 | 2 | 2 | 1.5 | NaN | 1.70947 | 0.005 | 6.33335 | 6.6718737997657 | 2.22073061699058 | 2.33943085726148
332 | 418 | 0.989573579274 | 1.01009672328 | NaN | NaN | 4 | 3 | 3 | 0 | NaN | 2.18556 | 0.005 | 12.8333333333333 | 13.3447867473907 | 4.49988967156072 | 4.67922608211145
369 | 250 | 2.48790218967 | 1.69827757645 | NaN | NaN | 6 | 5 | 4.5 | 2 | NaN | 3.14635 | 0.006 | 16.5555555555556 | 21.7957692122934 | 5.80505247673202 | 7.64248494250287
250 | 332 | 1.69827757645 | 0.989573579274 | NaN | NaN | 5 | 4 | 3 | 2 | NaN | 2.4578 | 0.006 | 8.05556666666667 | 8.44645882406744 | 2.82460996690147 | 2.96167268755979
83 | 336 | 1.42008627216 | 1.43747806139 | NaN | NaN | 4 | 5 | 4.25 | 2.75 | NaN | 2.81628 | 0.006 | 16.9607764705882 | 18.0867842555243 | 5.94713944376494 | 6.34196366206605
434 | 336 | 2.79896259896 | 1.43747806139 | NaN | NaN | 6 | 5 | 4 | 3 | NaN | 2.95241 | 0.006 | 12.75 | 14.5902364614149 | 4.47066960875838 | 5.11593150844281
105 | 388 | 0.773268241177 | 2.72772149852 | NaN | NaN | 2 | 5 | 3 | 1 | NaN | 2.1978 | 0.006 | 14 | 18.5607111932706 | 4.90897055079352 | 6.50814176068206
427 | 430 | 1.30282410913 | 2.08175646351 | NaN | NaN | 2 | 3 | 2.5 | 1 | NaN | 1.47469 | 0.006 | 24.6 | 29.7741498619188 | 8.62576253925146 | 10.4400303462194
386 | 15 | 2.04391752416 | 1.15716537969 | NaN | NaN | 4 | 5 | 5 | 1 | NaN | 2.70109 | 0.007 | 25.6 | 26.9666460650931 | 8.97640329287957 | 9.4556050990867
163 | 34 | 1.15200532042 | 1.79826647575 | NaN | NaN | 2 | 6 | 4 | 1 | NaN | 2.31046 | 0.007 | 23 | 24.8168289674567 | 8.06473733344649 | 8.7017916118089
332 | 93 | 0.989573579274 | 0.631937646018 | NaN | NaN | 4 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.54793 | 0.007 | 10.25 | 10.2530483272049 | 3.59406772468811 | 3.59513659243655
34 | 95 | 1.79826647575 | 0.956159847242 | NaN | NaN | 6 | 3 | 3 | 0.5 | NaN | 2.21674 | 0.007 | 13.0833333333333 | 16.1180540595528 | 4.58754985996775 | 5.65164662246018
270 | 352 | 1.4615315059 | 1.29382039292 | NaN | NaN | 5 | 3 | 3 | 0 | NaN | 1.98799 | 0.007 | 17 | 18.2802261109284 | 5.96089281167784 | 6.40979226002814
287 | 385 | 0.760168847727 | 0.584790818832 | NaN | NaN | 2 | 2 | 2 | 1 | NaN | 1.30673 | 0.007 | 17.25 | 17.7658380044399 | 6.04855300008487 | 6.22942682671168
200 | 23 | 1.09851661026 | 1.24466311349 | NaN | NaN | 4 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.54793 | 0.008 | 10.25 | 10.2530483272049 | 3.59406772468811 | 3.59513659243655
263 | 34 | 1.41333032523 | 1.79826647575 | NaN | NaN | 2 | 6 | 4 | 1 | NaN | 2.31046 | 0.008 | 23 | 24.8168289674567 | 8.06473733344649 | 8.7017916118089
200 | 93 | 1.09851661026 | 0.631937646018 | NaN | NaN | 4 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.54793 | 0.008 | 10.25 | 10.2530483272049 | 3.59406772468811 | 3.59513659243655
23 | 264 | 1.24466311349 | 1.20713091735 | NaN | NaN | 2 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.24077 | 0.008 | 19.75 | 21.0386548999692 | 6.92515488415514 | 7.37700980944691
173 | 264 | 0.645091123335 | 1.20713091735 | NaN | NaN | 2 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.24077 | 0.008 | 19.75 | 21.0386548999692 | 6.92515488415514 | 7.37700980944691
274 | 344 | 1.77855142838 | 1.28756286027 | NaN | NaN | 3 | 3 | 2 | 3 | NaN | 1.84396 | 0.008 | 3.25 | 3.25960120260132 | 1.13958244929135 | 1.14294902220722
105 | 435 | 0.773268241177 | 2.63704713738 | NaN | NaN | 2 | 3 | 3 | 0.5 | NaN | 1.61824 | 0.008 | 25.25 | 26.0456010361315 | 8.85367902910973 | 9.13264917600618
34 | 15 | 1.79826647575 | 1.15716537969 | NaN | NaN | 6 | 5 | 4 | 0 | NaN | 2.94023 | 0.009 | 12.375 | 12.5772612281053 | 4.33917932614784 | 4.41010035560042
250 | 200 | 1.69827757645 | 1.09851661026 | NaN | NaN | 5 | 4 | 3 | 2 | NaN | 2.4578 | 0.009 | 8.05556666666667 | 8.44645882406744 | 2.82460996690147 | 2.96167268755979
388 | 200 | 2.72772149852 | 1.09851661026 | NaN | NaN | 5 | 4 | 3 | 2.5 | NaN | 2.4578 | 0.009 | 8.05556666666667 | 8.44645882406744 | 2.82460996690147 | 2.96167268755979
367 | 274 | 0.998658795243 | 1.77855142838 | NaN | NaN | 3 | 3 | 3 | 0.5 | NaN | 1.69888 | 0.009 | 24.5 | 26.9644828122724 | 8.59069846388865 | 9.45484657448736
15 | 329 | 1.15716537969 | 0.835091546655 | NaN | NaN | 5 | 2 | 2 | 0 | NaN | 1.53454 | 0.009 | 11.25 | 13.3837588143242 | 3.94470847831622 | 4.69289127703146
48 | 344 | 1.10024283087 | 1.28756286027 | NaN | NaN | 4 | 3 | 2 | 2 | NaN | 1.84396 | 0.009 | 3.25 | 3.25960120260132 | 1.13958244929135 | 1.14294902220722
344 | 432 | 1.28756286027 | 0.948111132993 | NaN | NaN | 3 | 2 | 1.5 | 1.5 | NaN | 1.3192 | 0.009 | 5.33333333333333 | 6.67083203206317 | 1.87008401934991 | 2.33906557104915