ケネディ大統領暗殺事件
オズワルドの両手からは硝煙反応が出たが、頬からは硝煙反応が出なかった(通常ライフルを使用すると手だけではなく顔や上半身全体に硝煙が付着する)。これは、銃口が窓の外に出ており、カルカノの構造上、硝煙ガスが銃口のみから出て、顔付近から漏れにくいためであると考えられる。凶器とされたライフルからは、検査では指紋は発見されなかった。オズワルド殺害の翌日(11月25日)に掌紋が発表された。銃床を外した内部部分に掌紋があった。押収後すぐに採取されていたが発表したものと勘違いしていたため、発表が遅れた。
暗殺直後オズワルドは逃げもせずビル内の食堂でコーラを飲んでくつろぐなどした。狙撃地点とされる部屋から食堂へ向かう階段には女性が2人いたが、その女性はオズワルドは通っていないと証言した。食堂のオズワルドを警官が1度やり過ごしている。だが、コーラは手に持っていただけで、くつろいではいない。エレベーターを利用可能にするように、同僚に前もって指示していた。警官は銃を突きつけながら、責任者に従業員かどうか確認の上やり過ごした。
教科書ビルから撃たれたとした警官が包囲に10分もかかったのに対し、その後オズワルドを逮捕するまでの経緯は不自然なまでに鮮やかだった。ディーリープラザではどこからの発砲か特定するのに時間がかかっただけであり、テキサス劇場とティピット巡査殺害現場までは徒歩で行ける近さであり、パトカー無線により市民からティピット巡査殺害の一報を受け、現場へ複数パトカーが急行していたからである。また、テキサス劇場まで靴屋の店主ブリューワーが追跡していた。
証拠物件の公開が政府によって、2029年(下院暗殺調査委員会)もしくは2039年(ウォーレン委員会)まで不自然にも制限されている(後に情報公開法により短縮)。資料はアメリカ公文書図書館に保管されているが、現在でも資料の多くが紛失しているため、完全に真実が明らかになるかどうかは未知数である。
物的証拠、映像、写真から、最低7発の銃弾が放たれていた事が確認できるとする見解がある。最初の銃弾は逸れ、ケネディ大統領の首、背中、右側頭部、コナリー知事の背中、リムジンのフロントグリル(およびフロントガラス)、見物人の足元の縁石。オズワルド単独での犯行は不可能に思える。一方、車内から発見された銃弾は2発分なので、証拠から考えると、残り5発は蒸発しなければならないので、この考えはあり得ないと言える。
「パレードルート変更の謎」説:当時のダラス市長、アール・カベルの指示で、事件当日に狙撃されやすいルートにパレードコースが変更されたという説。カベルがピッグス湾事件で更迭された CIA 副長官のチャールズ・カベルの弟であったことや、歴代大統領は慣例で直線コースをパレードするにも関わらず、迂回ルートが車の速度を落とさなければならないルートであったことから、この説が提唱された。
しかしながら、この説は多くの記事ですでに否定されている。パレードが迂回ルートに変更になったのは、直進ルートだった場合、その先の高速道路の入口道路の形状の影響でパレード車列が渋滞してしまうことが予測されたためであり、保安上の理由から妥当なルートであった。メインストリートからは分離帯があって、物理的に進入できない。交通ルールを無視すれば、180度Uターンを2回すれば、進入できなくはないが、大統領専用車の大型車では切り返しなしでは難しいと考えられる。その際停車することになるのでより危険性が増す。追走しているプレスの乗ったバスには、180度Uターンを2回は不可能である。
事件当日のダラスは快晴だったにもかかわらず、ザプルーダー・フィルムに黒いこうもり傘をさした人物が映っている。この人物は通称アンブレラマン (The umbrella man) と呼ばれ、映画『JFK』にも登場する。アンブレラマンを暗殺グループの一員とする説もある。なお、自分がアンブレラ・マンであると主張する人物、ルイス・ウイット (Louis Witt) はケネディ暗殺下院特別調査委員会(1978年) において証言をおこなっている。(cf. Umbrella man (JFK assassination))
本来なら大統領の近辺にいなければならないシークレットサービスが後ろへ退くように命令された(大統領狙撃時に車に飛び乗ったクリント・ヒルによると車両間隔は 5 ft≒1.5m。大統領のリムジンには2人のシークレットサービスが同乗していた(ロイ・ケラーマン、ビル・グリアー)。後続車と白バイ警官はリムジンを追い、クリント・ヒルら4人のシークレットサービスは後続車のサイドステップに立っていた)。
傷口が変造されていたとする見解があるが、単に救命措置で気管挿入するために切開され広げられただけである。
検視の医者は弾丸の検視の専門医ではなかった。このためか、ケネディが背中の古傷のせいで猫背気味であることが失念され、命中時の入射角の判定に誤りが生じたと言われる。
発見された銃弾は本物かという話がある。銃弾(証拠物件399、コナリー知事の担架(stretcher)から発見された)は、垂直方向(銃弾の進行方向)には変形せず、水平方向には圧縮されたように変形していた。弾頭部分は損傷していなかった。水平方向に圧縮された変形は特殊であり捏造する事が難しいと言えるし、なぜありえなさそうな形状にわざわざ捏造するのか意味が不明である。専門家の調査の上で、本物と判定され、証拠物件に採用されている。弾丸が水平方向に圧縮されたのは、ケネディの首を出た後、回転し、下向き(あるいは上向き)でコナリーの背中に入って、肋骨に当たって変形したと考えられる。
暗殺事件発生当時、閣僚の大半は外遊しており、また、ケネディ死亡の公式発表から、ジョンソンの宣誓式までの数十分間、いわゆる「権力の空白」時間が流れている。もっと正確に言えばケネディが撃たれて即死に近い状態であったことを考えると12時30分から14時38分まで権力の空白が生じたことになる。
2013年11月21日に放送された『BS世界のドキュメンタリー』では、専門家たちによりケネディ暗殺の状況を再現する実験が行われた。この中では、ケネディの首を貫いた弾丸がコナリーの背中と右手を貫いてもほぼ変形しない状態に保たれること、オズワルドが単独でケネディとコナリーを銃撃することは可能だったことが実験によって立証されたとする。ケネディに致命傷を負わせた弾丸は、背後からの銃撃によるものだったことも専門家の調査によって立証されたとしている。弾丸の変形は、ケネディの骨には当たっておらず、ケネディの首を出てから、回転し、下向け(あるいは上向き)の状態で、コナリーの背中に当たったため、コナリーの背中の傷は、縦長の「キーホール(鍵穴)」型になっている。
当初、本事件に関する機密資料は「この事件と関連する無実の人々が被害を受けないよう保護するため」という理由で政府により2039年まで非公開の予定だった。しかしながら、情報公開法(Freedom of Information Act)によりウォーレン委員会による記録の98%は一般公開された 。そして、1992年にジョージ・H・W・ブッシュ大統領は、25年以内に暗殺関連の機密文書を全面公開することを義務付ける法律、ジョン F. ケネディ大統領暗殺記録収集法に署名した。この法案の成立には1991年に公開されたオリバー・ストーン監督の映画JFKの影響による大衆の関心の再燃があった。その後、2017年にドナルド・トランプ大統領は当初は機密保持の延長をしないことを表明していたが、CIA等が公開延期を求めた一部の資料についての公開を180日後まで保留、7月24日に機密資料3810点、法律の期限切れとなる10月26日に2891点が公開された。一方で、公開が保留された一部の資料については、最終的に判断が延期され、2021年10月までに改めて公開の是非を検討することとなった。2021年10月23日、ジョー・バイデン大統領は未公表の資料の全面公開を2022年12月15日まで再延期することを発表、同年12月15日に新たに機密資料1491点が公開された。2022年12月15日には機密資料1万3000点を公開した。ホワイトハウスは今回の公開で、全体の97%以上が公表されたことになると発表、同時に2023年6月まで一部資料の非公開を決めた。理由は「特定による危害」を防ぐためだと説明した。
暗殺の瞬間をザプルーダーよりも間近でフィルム撮影していたと思われる身元不明の女性がおり、研究家により、バブーシュカ・レディーと呼ばれている。他のフィルムや写真には、メアリー・モーマンとジーン・ヒルの右後方で、彼女がフィルム撮影をしている姿がはっきりと映っている。この女性の身許は特定されておらず、フィルムも確認されていない。1970年に、自分がバブーシュカ・レディーであると主張する女性が現れているが、その証言には複数の矛盾点が指摘されている。そもそも、この女性が暗殺事件に何の関係があるのか誰も明らかにしていない。
暗殺当日に撮影された  が、テキサス市の  によって新たに2007年2月20日に公開された。フィルムは実際の暗殺の90秒ほど前に、ジョージ・ジェフリーズ (George Jefferys) によって現場から数ブロック離れた地点で撮影されたものである。
ジョン・F・ケネディが暗殺された5年後の1968年、実弟であるロバート・ケネディも暗殺された。ロバートはカリフォルニア州で行われた民主党大統領予備選に圧勝し、同6月5日に同州ロサンゼルスのアンバサダーホテルで予備選勝利宣言を行ったが、その直後にサーハン・サーハンによって銃撃を受け倒れ、右脳を損傷し意識不明の重体となった。この模様は当時テレビが実況中継している最中に起こり、床に倒れたロバートの傷ついた姿は4時間後には衛星中継で日本にも送られた。そして意識を回復することなく翌6月6日に死去した。
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