愛媛マンダリンパイレーツ
前期は開幕から4連敗(1分含む)を喫する。その後も成績は上向かず、4期連続の最下位となった。勝利数は9勝にとどまり、3期連続して10勝を下回った。
後期も序盤は1勝5敗と出遅れたが、8月に4連勝と3連勝を記録して一時は首位に並んだ。その後も徳島と優勝を争うも、9月17日の直接対決に敗れて3年ぶりの後期優勝はならなかった。個人タイトルは仁木敦司が最多打点のタイトル(徳島の井上絢登と同数)を獲得した。
10月20日のNPBドラフト会議の育成ドラフトで、上甲凌大が横浜DeNAベイスターズから1巡目で指名される。育成選手も含めたNPBドラフト指名は11年ぶりとなった。
11月24日、監督及びコーチ全員が来シーズンも留任(伊藤隼太はコーチ専任に変更)することが発表された。
球団は2007年よりリーグの経営補填金を実質的に受けない独立採算になったが、2008年のシーズン終了後、法人化以来3シーズンの累積赤字が1億8千万円にのぼり、その全額をスポンサーである星企画が補填していることが明らかにされた。これを受けて2009年1月に県や市および地元経済界の関係者による「経営改革協議会」が発足し、改善策を検討している。2009年2月25日の中間報告では、後援会員を増やしたりすることで財政基盤を強化する方向が示された。また、現在は民間の賃貸住宅に分散して居住している選手を、既存のスポーツ施設を寮に転用する形で集めることも検討されていると報じられた。その後、2010年のシーズンより選手寮が実現した。
2009年9月7日に愛媛県が発表した補正予算案に、運営会社に対する3000万円の出資が盛り込まれ、松山市ほか県下の20市町と民間企業も出資する見通しであることが報じられた。
2009年10月30日のリーグ首脳の記者会見によると、2009年度は売上高8800万円に対して収支は4900万円の赤字となる見込みである。売上高はリーグで香川に次ぐ2番目であるが、赤字額はリーグ6球団では最も大きい。
最終的に県をはじめとする自治体より6000万円の出資を受け、2010年3月31日付で球団運営会社名が「愛媛県民球団」に変更された。
2011年2月24日のリーグ首脳による記者会見では、2009年度の収支が4300万円の赤字であったこと、2010年度は前年より2000万円の改善(2300万円の赤字)となる見込であることが公表された。同会見では2011年度の収支目標が1400万円の赤字であることもあわせて明らかにされた。
2013年2月15日、愛媛県民球団は2012年度の決算について、経常損益が160万円の黒字となりチームの独立採算制移行以来初の黒字決算となると発表した。スポンサー収入が前年比で1800万円増加したことに加え、県の緊急雇用対策による補助金も寄与したと報じられている。当初予定より1年早い達成で、リーグで単年度黒字となる球団は2011年度の高知に続き2球団目である。
2015年2月25日、2014年度の収支について、経常損益は約180万円の黒字(前年は約311万円)で3年連続黒字達成の見込であることが発表された。
2016年3月31日にリーグが発表した2015年度の決算では経常損益が216万円の黒字となり、4年連続で黒字達成となった。スポンサー数は前年の122から209に増加した。
2017年2月20日に発表された2016年度の決算では経常損益が250万円の黒字となり、黒字決算は5年連続となった。2017年以降も2019年まで黒字決算を継続しており、この間の観客動員は1試合平均600人台で推移している。
2022年3月31日に発表された2021年度の決算では、前年に引き続いて入場者数が減少したものの、経費の削減で500万円の経常利益を記録し、10期連続の黒字を達成した。同年8月に実施した健全経営委員会(愛媛FCと合同)では、2024年に平均来場者数を1000人とする目標に向けた、3か年の集客計画を報告した。
2023年4月10日に発表された2022年度の決算では入場者数が回復して、前年に続き5百万円台の経常利益となり、黒字決算は11期連続に伸びた。
マスコットキャラクターは、ミカンの顔に水軍をイメージした甲冑姿をしており、名前は「マッピー」。ホームゲームでは着ぐるみも登場する。球団では以前着ぐるみが依頼に応じて幼稚園や保育園に出向くサービスを行っていたことがあるほか、「マッピー体操」というオリジナルの体操があり、以前は球団ホームページで振り付けが紹介されていた。2015年8月には、愛媛のローカルアイドルひめキュンフルーツ缶の歌うマッピーのテーマソング「Happy☆Mappy」がリリースされている。
2011年シーズンからは「29番目の選手」(当時、愛媛の支配下保有選手は28人だった)というふれこみの覆面キャラクター「ますくまん」が新たに加わりただし、引退時の愛媛新聞記事では前年9月に誕生したとあり、その月にマッピーとともに「謎の覆面マスクマン」の名前で訪問サービスをおこなっていたことが、前記「トピックス」の記事に記されている。、ブログももうけられていたが、2013年3月限りで引退した。ますくまんを演じていたのは、元選手(2005年 - 2008年)で2013年3月まで球団職員を務めた福西太志である。
2015年4月28日の試合には、「ますくまんの意志を継ぐ者」というふれこみで極真空手を習得した「極真マスクマン」が登場した。
2015年10月11日、坊っちゃんスタジアムでおこなわれた新潟アルビレックス・ベースボール・クラブとのグランドチャンピオンシップ第4戦では始球式のゲストとして福西が招かれ(新潟にも選手として在籍経験があるため)、試合中にますくまんが2年ぶりに登場した。翌10月12日に開催された第5戦には、ますくまんと極真マスクマンがそろって登場している。
2016年11月30日、愛媛球団は「ファンのためのマスコットキャラクター」を公募すると発表した。その後、2017年にニホンカワウソをモチーフとした「ひめピー」(女子という設定)が発表され、着ぐるみも製作されている。
応援歌に、愛媛県出身のアーティスト(ジャパハリネットなど)が集結して作られた「VICTORY」がある。
私設応援団は「愛勇会」である。
基本的に「走れコウタロー」、「コンバットマーチ」、「狙いうち」など、高校野球の応援でも耳にする既存曲を選手の応援歌に使用している。
2016年シーズンに、球団は松山市在住の女子大学生3人による応援隊「Mandarin Loves」を結成、広報活動などに起用している。
選手・指導者については愛媛マンダリンパイレーツの選手一覧を参照。
2006年6月3日に、地域密着の一環で選手たちが小学生の通学路を見守る「見まもり隊」が発足した。選手、コーチ28人がそれぞれ分担して一週間に一回、ユニフォームに腕章を付け松山市内の小学校の下校時間に通学路で警戒に当たる。同様の活動はリーグの他の球団でも実施されている。
2010年4月、愛媛県の地方銀行である愛媛銀行が「応援定期預金」(2年満期)を募集した。募集終了時に預け入れ残高の0.005%相当額を球団に寄付するもので、2010年に愛媛が優勝した場合には2年目の金利が上昇することになっていた。このシーズン、愛媛は優勝できなかったが、シーズン終了後に残高の一部が愛媛球団に寄付された。2011年度以降も毎年この定期預金が設定されており、2015年に定期預金創設から6年目で愛媛が優勝、初めて「2年目の金利上昇」が実施されることとなった。
2011年8月26日の徳島戦(坊っちゃんスタジアム)の試合前、ファンやスポーツ少年団の選手らが「最大人数で行う始球式」に挑戦した。111組222人が成功を収め、ギネス世界記録に認定された。なお、この日の観客動員数は2858人で、2011年シーズン最多人数であった。