新宿駅
大塚家具 新宿ショールーム
南口(JR・小田急)、ルミネ口(京王)
甲州街道新宿跨線橋上のJR東日本と小田急の出口で、東西に出られる。京王のルミネ口はルミネ1内の階段を通じてJR・小田急の南口に接続している。この階段の途中には京王百貨店口に通じる通路があり、ルミネ口が閉鎖されている時間帯は専らその通路を用いて京王線と南口の連絡を行う。
小田急ミロード - 小田急の南口直結
甲州街道(国道20号)
JR東日本専用の改札口および出口で、南口とは新宿跨線橋を挟んで南側の人工地盤上にある。
バスタ新宿(タクシー乗降場・高速バスターミナル)
JR九州ホテル ブラッサム新宿 - 2021年3月10日より、駅ナカシェアオフィス「STATION WORK」の提携が開始された(事前予約制)。
甲州街道(国道20号)
新南改札、ミライナタワー改札
こちらもJR東日本専用の改札口および出口で、新南改札は人工地盤の中央部付近に、ミライナタワー改札は東端に位置している。タカシマヤタイムズスクエアや新宿サザンテラスと接続している。
バスタ新宿(タクシー乗降場・高速バスターミナル)
JR新宿ミライナタワー - 2021年3月18日より、駅ナカシェアオフィス「STATION WORK」のブース型「STATION BOOTH」が利用可能。
髙島屋新宿店(新宿高島屋)
ハンズ 新宿店
ユニクロ 新宿高島屋店
日本貨物鉄道 本社
HIS 新宿本社営業所 - 旅行会社のカウンターとしては日本最大級の店舗
ジェクサー・フィットネス&スパ 新宿 - 2021年3月18日より、駅ナカシェアオフィス「STATION WORK」のブース型「STATION BOOTH」が利用可能。
新宿マインズタワー - 都営地下鉄大江戸線のA1出口に直結
サンルートプラザ新宿 - 2021年3月5日より、駅ナカシェアオフィス「STATION WORK」の提携が開始された(事前予約制)。
小田急電鉄 本店
地下鉄丸ノ内線の駅の地上出入口はJR線の北側にある。東西にそれぞれ丸ノ内線の改札口があり、東側の各出口(新宿通り)と西側の各出口(西口広場)に大別できる。東西の各出口間は地下通路「メトロプロムナード」で改札外がつながる。各出入口はJR・京王・小田急の各線の西口と中央東口改札口およびJRの中央西口(出口)と東口改札口の改札外とつながっているため、事実上JR・京王・小田急の各線の駅の地上出入口としても使用できる。
新宿三丁目駅と地下道(メトロプロムナード)でつながっているため、同駅と出口番号が連続している。紀伊國屋書店方面(B9・B8・B7・B6など)は新宿三丁目駅を参照のこと。
また、都営地下鉄大江戸線の新宿西口駅とも改札外でつながっているが、西側の改札口が近く、同駅に属する各地上出入口も共通で利用できる。さらに西武新宿駅と地下街「新宿サブナード」を介してつながってはいるものの、A9、B13出口などから地上に出た方が早い場合がある。
新宿通りにある出入口(JR線東側)
A6 中村屋
A7 タカノ
A8 ルミネエスト新宿、JR線東口方面
A9 ルミネエスト新宿、JR線東口方面
B9 マルイカレン
B10 新宿サブナード(西武新宿駅方面)
B11 新宿富士ビル(みずほ銀行)、歌舞伎町方面
B12 三井住友銀行新宿ビル(三井住友銀行)、洋服の青山
B13 新宿アルタ・はとバス東口乗り場・歌舞伎町・西武新宿駅・新宿プリンスホテル・西武新宿PePe 方面
西口広場付近にある出入口(JR線西側)
A10 メトロ食堂街、小田急百貨店方面
A11 メトロ食堂街
A12 JR西口、京王西口、小田急西口方面
A13 新宿駅地下駐車場
A14 JR西口、京王西口、小田急西口方面
A15 小田急百貨店
A16 新宿駅西口地下広場、小田急百貨店
A17 新宿駅西口地下広場
A18 新宿エルタワー、新生銀行、損保ジャパン本社ビル、伊予銀行方面
B14 メトロ食堂街
B15 JR西口、京王西口、小田急西口方面、新宿パレット
B16 小田急百貨店別館ハルク(小田急ハルク)
B17 新宿駅西口35(一部の便が発着する小田急ハルク前の小田急系バス乗り場)・36番バス乗り場
B18 小田急百貨店別館ハルク(小田急ハルク)
地下駅である京王新線と都営地下鉄の地上出入口は、甲州街道のJR線より西側、JRと小田急の駅の南西側にある(ただしA1出口は甲州街道西新宿1丁目交差点より約200メートル南のマインズタワー地下にある)。京王線 - 京王新線・都営新宿線 - 都営大江戸線は改札内移動が可能である。
京王新線と都営地下鉄の2 - 8出口は、JR・小田急の南口改札外と「ルミネ1」を介してつながっている。また、大江戸線C改札口を除く改札外フロアは「京王モール」を介してJR・京王・小田急の各線の西口・中央地下西口とつながっている。
1 ルミネ、新宿ミロード
2 新宿サザンテラス、JR新宿ビル
3 ファーストキッチン
4 新宿駅南口郵便局 方面
5 ヤマダ電機LABI新宿西口館、ソフマップ方面
6 トクラス新宿ショールーム方面
7 本間ゴルフ、国民生活金融公庫方面
8 ワンデーストリート方面
ワンデーストリートは、東京都庁、京王プラザホテル方面に連絡する。
A1(大江戸線C改札口専用出入口) 新宿マインズタワー、JR東京総合病院、JR東日本本社ビル、ホテルセンチュリーサザンタワー方面
1991年(平成3年)3月16日から2012年3月17日のダイヤ改正まで、小田急電鉄と東海旅客鉄道(JR東海)が特急列車の相互乗り入れ(「あさぎり」)を行い、「小田急のホームにJRの車両が入線する」という光景が見られた。一方、2002年(平成14年)12月1日のダイヤ改正からJR東日本と東京臨海高速鉄道が相互乗り入れを開始したことで、「JRのホームに他社車両が入線する」光景も見られるようになった。さらに、2006年(平成18年)3月18日のダイヤ改正でJR東日本と東武鉄道が特急列車の相互乗り入れ(「日光」「きぬがわ」「スペーシア日光」「スペーシアきぬがわ」)を開始。さらに、2019年(令和元年)11月30日の埼京線と相鉄線の直通運転開始で、相模鉄道の車両も姿を見せるようになった。なお現在では、小田急小田原線や代々木上原駅から直通している東京メトロ千代田線で大幅なダイヤ乱れが生じた際、常磐緩行線所属のE233系2000番台や、千代田線所属の16000系が小田急線のホームに入線する場合がある。
2006年(平成18年)7月31日より当駅限定でSuicaポスター「SuiPo」のサービスが開始された。利用するには事前に広告の横にある登録機で登録を行う必要がある。2007年(平成19年)4月2日からは池袋駅・上野駅・東京駅・新橋駅・渋谷駅を加えた計6駅に設置箇所が拡大された。
当初の計画では上越新幹線の起点は新宿駅で、ここから大宮駅まで建設される計画があった。鉄道総合技術研究所の小野田滋は「このルートは工事費が巨額となることから現実的ではないと判断され打ち切られた」 としている。また、かつてはリニア中央新幹線の起点駅となるなどの構想などが語られたものの、2000年代に入ってからはそのようには考えられていない。
※東日本旅客鉄道の特急列車ならびに臨時快速列車の停車駅、小田急電鉄の特急列車ならびに京王電鉄の有料列車の停車駅は各列車の記事を参照。
東日本旅客鉄道(JR東日本)
代々木駅 (JY 18) - 新宿駅 (JY 17) - 新大久保駅 (JY 16)
埼京線( 相鉄線直通含む)
#f06通勤快速・#09f快速・各駅停車
渋谷駅 (JA 10) - 新宿駅 (JA 11) - 池袋駅 (JA 12)
特急「踊り子」(臨時)停車駅、「成田エクスプレス」「スペーシア日光」「きぬがわ」「湘南」発着駅、「あかぎ」終着駅
#09f特別快速・快速・普通
渋谷駅 (JS 19) - 新宿駅 (JS 20) - 池袋駅 (JS 21)
中央線(快速)
特急「あずさ」「かいじ」「富士回遊」「はちおうじ」「おうめ」「成田エクスプレス」停車駅、「新宿さざなみ」「新宿わかしお」発着駅
#f06通勤特快(平日上りのみ)
四ツ谷駅 (JC 04) ← 新宿駅 (JC 05) ← 国分寺駅 (JC 16)
特別快速「ホリデー快速おくたま」(土休日のみ)・#03f中央特快・#396青梅特快・#909通勤快速(平日下りのみ)・快速
四ツ谷駅 (JC 04) - 新宿駅 (JC 05) - 中野駅 (JC 06)
中央・総武線(各駅停車)
代々木駅 (JB 11) - 新宿駅 (JB 10) - 大久保駅 (JB 09)
#d07「京王ライナー」、「Mt.TAKAO号」発着駅
特急・急行・olive区間急行・blue快速・gray各駅停車
京王線新宿駅 (KO01) - 笹塚駅 (KO04)
急行・olive区間急行・blue快速・gray各駅停車
(都営新宿線) - 新線新宿駅 (KO01) - 初台駅 (KO02)
東京都交通局(都営地下鉄)
(京王新線) - (新線)新宿駅 (S 01) - 市ヶ谷駅 (S 04)
(京王新線) - (新線)新宿駅 (S 01) - 新宿三丁目駅 (S 02)
代々木駅 (E 26) - 新宿駅 (E 27) - 都庁前駅 (E 28)
特急ロマンスカー「スーパーはこね」「はこね」「さがみ」「モーニングウェイ」「ホームウェイ」「えのしま」「ふじさん」発着駅
快速急行・通勤急行(上り到着列車のみ)・急行
新宿駅 (OH 01) - 代々木上原駅 (OH 05)
新宿駅 (OH 01) - 南新宿駅 (OH 02)
東京地下鉄(東京メトロ)
西新宿駅 (M 07) - 新宿駅 (M 08) - 新宿三丁目駅 (M 09)
京王新線と都営新宿線は新線新宿駅を介して直通運転するが、両事業者の路線に跨って「急行」「各駅停車」として運転される列車を除いて、新線新宿駅に到着した際に直通先事業者の種別に変更する。
丸ノ内線における当駅 - 新宿三丁目間の駅間距離0.3キロは東京メトロとしては最短である。
小田急小田原線の準急は2018年3月17日ダイヤ改正を以て新宿発着の設定がなくなり、通勤準急共々原則として千代田線直通のみの運行で、当駅発着の運行はダイヤが乱れた時に限られる。この場合、新宿駅の次の停車駅は代々木上原駅となる。