コナミ矩形波倶楽部
ときめきメモリアル ドラマシリーズVol.3 ~旅立ちの詩~ オリジナル・ゲームサウンドトラック (1999/4/23 KMCA-4)
MIDI POWER Pro 7 ~グラディウス~ (1999/4/23 KMCA-5)
Dance Dance Revolution 2nd MIX ORIGINAL SOUNDTRACK (1999/4/28 TOCP-64024-5) 2枚組
聖少女艦隊バージンフリート ソングス&サウンドトラックス (1999/5/28 KMCA-9)
10thアニバーサリー コナミレーベル ボーカルヒストリーコレクション (1999/7/2 KMCA-13)
10thアニバーサリー コナミレーベル テーマソングコレクション (1999/7/2 KMCA-14)
drummania original soundtracks (1999/8/6 KMCA-18)
GUNGAGE オリジナル・サウンドトラック (1999/8/6 KMCA-19)
ヴァンダルハーツII ~天上の門~ オリジナル・サウンドトラック (1999/8/6 KMCA-20)
Harlem Beat MUSIC VOX (1999/11/26 KMCA-33)
ときめきメモリアル2 オリジナル・ゲーム・サントラ vol.1 (1999/12/3 KMCA-34-35) 2枚組
ときめきメモリアル2 オリジナル・ゲーム・サントラ vol.2 (1999/12/3 KMCA-36-37) 2枚組
KEYBOARDMANIA Original Soundtracks (2000/3/16 KMCA-51)
あいたくて… ~your smiles in my heart~ オリジナル・ゲーム・サントラ vol.1 (2000/3/24 KMCA-25-6) 2枚組
あいたくて… ~your smiles in my heart~ オリジナル・ゲーム・サントラ vol.2 (2000/3/24 KMCA-27-8) 2枚組
幻想水滸伝II音楽集 ~Orrizonte~オリゾンテ (2000/5/10 KMCA-57)
幻想水滸外伝 Vol.1 ハルモニアの剣士 ORIGINAL SOUNDTRACK (2000/10/4 KMCA-75)
GAME SOUND LEGEND SERIES コナミ・ゲーム・ミュージック (2000/11/1 SCDC-00050)
KEYBOARDMANIA 2nd MIX+consumer 1 new songs (2000/12/6 KMCA-74) 2枚組
GAME SOUND LEGEND SERIES コナミ・ゲーム・ミュージック VOL.2 (2001/1/11 SCDC-00060)
幻想水滸外伝 Vol.2 クリスタルバレーの決闘 ORIGINAL SOUNDTRACK (2001/4/4 KMCA-97)
KEYBOARDMANIA 3rd MIX Original Soundtracks (2001/4/25 KMCA-90)
Silent Scope TRILOGY オリジナルサウンドトラック (2001/6/27 KMCA-109-10) 2枚組
グラディウス アーケードサウンドトラック (2002/04/24 KMCA-155-156) 2枚組
実況パワフルプロ野球 パワプロ音楽館 (2003/1/8 KOLA-10)
沙羅曼蛇 アーケード サウンドトラック (2003/4/9 KOLA-030)
コナミミュージック名曲コレクション VOL.01~VOL.15 (2004/10/1)
GAME SOUND LEGEND ARRANGE SERIES SPEED&WIND (2004/11/17 SCDC-00375)
GAME SOUND LEGEND SERIES コナミック・ゲーム・フリークス (2005/10/19 SCDC-00465)
KONAMI FAMICOM SUPER MEDLEY (2005/10/19 SCDC-00467)
GAME SOUND LEGEND SERIES コナミ・ゲーム・ミュージック VOL.4 ~A-JAX~ (2005/11/23 SCDC-00472)
悪魔城ドラキュラXクロニクル オリジナルサウンドトラック (2008/11/8 LC1609-10)
パチスロ 悪魔城ドラキュラ ORIGINAL SOUNDTRACK (2009/6/24 GFCA173)
悪魔城ドラキュラ Best Music Collections BOX (2010/03/24 GFCA195-212) CD18枚+DVD1枚組
パチスロ 悪魔城ドラキュラII ORIGINAL SOUNDTRACK (2010/7/21 GFCA228)
GRADIUS ULTIMATE COLLECTION (2011/1/13 LC1949-1956) CD8枚組
KONAMI SHOOTING COLLECTION (2011/09/22 LC2039-2048) CD10枚組
パチスロ悪魔城ドラキュラIII ORIGINAL SOUNDTRACK (2012/02/22 GFCA310)
MSX RACING SPIRIT SOUNDTRACKS (2014/5/19 EMCA-0015)
ワイワイワールド1&2 サウンドコレクション (2014/5/19 EMCA-0016)
エスパードリーム1&2 さうんどめもりある (2014/7/1 EMCA-0017)
コナミ・ファミコン・クロニクル Vol.1 ディスクシステム編 (2014/9/1 EMCA-0018)
コナミ・ファミコン・クロニクル Vol.2 ディスクシステム編 (2014/10/31 EMCA-0019)
魂斗羅クロニクル Vol.1 coupling with "HARD CORPS:UPRISING" (2015/2/19 EMCA-0020)
LAGRANGE POINT SOUNDTRACKS RETURNS (2015/5/22 EMCA-0021)
コナミ・ファミコン・クロニクル Vol.3 ROMカセット編 (2015/8/21 EMCA-0022)
魍魎戦記MADARA 1&2 SOUNDTRACKS RETURNS (2015/11/13 EMCA-0023)
X68000 グラディウスII GOFERの野望 COMPLETE SOUNDTRACKS (2016/1/23 EMCA-0024)
魂斗羅クロニクル Vol.2 The Beginning of the Legends (2016/6/24 EMCA-0025)
がんばれゴエモン さうんど玉手箱 ~オリジナル・サウンドトラック BOX~ (2017/5/26 EMCA-0027)
ミュージック フロム コナミアーケードシューティング (2021/01/20 GFCA501-10_S) CD10枚組
ミュージック フロム 悪魔城ドラキュラ 黒 (2021/12/15 LC2480-92_S) CD13枚組
ミュージック フロム 悪魔城ドラキュラ 赤 (2021/12/15 LC2493-05_S) CD13枚組
Lagrange Point (ラグランジュポイント) (2016/10/28 STS-012(LP))
Castlevania II Simon's Quest Original Video Game Soundtrack (ドラキュラII 呪いの封印) (2017/1/11 MOND-072(LP))
Contra III The Alien Wars Original Video Game Soundtrack (魂斗羅スピリッツ) (2017/3/1 MOND-107(LP))
SNATCHER (スナッチャー) (2017/3/7 STS-020(LP))
Castlevania III Dracula's Curse Original Video Game Soundtrack (悪魔城伝説) (2017/3/22 MOND-073(LP))
Super Castlevania IV Original Video Game Soundtrack (悪魔城ドラキュラ(SFC)) (2017/6/21 MOND-074(LP))
Contra Original Video Game Soundtrack (魂斗羅) (2017/7/19 MOND-106(LP))
The Adventures Of Bayou Billy (マッド・シティ) (2017/9 STS-021(LP))
Kid Dracula (悪魔城すぺしゃる ぼくドラキュラくん) (2018/1 STS-026(LP))
Rocket Knight Adventures (ロケットナイトアドベンチャーズ) (2018/1 STS-019(LP))
Bio Miracle Bokutte Upa! (バイオミラクル ぼくってウパ) (2018/6 STS-035(LP))
Castlevania Rondo Of Blood / Dracula X Original Video Game Soundtrack (悪魔城ドラキュラX 血の輪廻/悪魔城ドラキュラXX) (2018/7/19 MOND-126(LP))
Gradius(FAMICOM/MSX) (グラディウス(FC)/グラディウス(MSX)) (2018/9 STS-030(LP))
Castlevania Symphony of the Night Original Video Game Soundtrack (悪魔城ドラキュラX 月下の夜想曲) (2018/11/24 MOND-126(LP))
GradiusII(Gradius II(FAMICOM)/GRADIUS 2(MSX)) (グラディウスII(FC)/グラディウス2) (2018/12 STS-031(LP))
GradiusIII(SNES/AC) (グラディウスIII(SFC)/グラディウスIII -伝説から神話へ-) (2018/12 STS-032(LP))
Metal Gear Solid Original Video Game Soundtrack (メタルギアソリッド)(2019/9 MOND-185 (LP))
Teenage Mutant Ninja Turtles Turtles in Time Vinyl Soundtrack (T.M.N.T.タートルズインタイム(SFC)) (2019/12 8BIT-8099B(LP))
Metal Gear Original MSX2 Video Game Soundtrack (メタルギア(MSX2)/メタルギア(NES))(2020/1 MOND-170(LP))
Life Force Original Video Game Soundtrack LP (沙羅曼蛇(FC)/沙羅曼蛇(MSX)) (2020/4 STS-051(LP))
Konami Wai Wai World 1+2 Original Video Game Soundtrack LP (コナミワイワイワールド/コナミワイワイワールド2) (2020/7 STS-041(LP))
Sparkster: Rocket Knight Adventures 2 Original Video Game Soundtrack (スパークスター ロケットナイトアドベンチャーズ2) (2020/10 STS-046(LP))
THE LEGEND OF THE MYSTICAL NINJA  Original Video Game Soundtrack (がんばれゴエモン ゆき姫救出絵巻) (2020/11 STS-042(LP))
Esper Dream 1+2 Original Video Game Soundtrack (エスパードリーム/エスパードリーム2) (2021/2 STS-066(LP))
コナミ矩形波倶楽部の音楽のアレンジ企画CDがコナミレーベルからいくつかリリースされており、その中の「パーフェクト・セレクション」シリーズのCDをリリースするにあたりバンド「矩形波倶楽部」のメンバーでもあった「なぞなぞ鈴木」はコナミを退社する1992年までコナミ社外の「入江純」、「松武秀樹」といったメンバーと組んで矩形波倶楽部以外に「nazo2 project」というユニット組んでいた。
同じくコナミレーベルよりコナミ矩形波倶楽部の音楽のヘヴィメタルアレンジ企画CDとして似通った名称の「パーフェクト・セレクション・バトル」シリーズがあり「柴田直人」率いる「柴田直人プロジェクト」がアレンジを担当しているがこちらはコナミ矩形波倶楽部のメンバー自体は直接関わってはいない。
アルファレコードのG.M.O.レーベルから発売された『コナミック・ゲーム・フリークス』『コナミ・ゲーム・ミュージックVol.4』はサイトロンからGAME SOUND LEGEND SERIESとして復刻されているが、この2つのアルバムは一部曲削除やゲームタイトル表記の変更が行われている。前者は『WECル・マン24』が全曲削除、『火の鳥 鳳凰編 我王の冒険』は「コナミ ファミコンアクションゲーム」とタイトルを変更、後者は『F1 SPIRIT』が「MSXレーシングゲーム」とタイトルを変更されている。これらについては画像も削除されている。理由は商標問題のためであり、このことによって復刻盤が一度発売中止になった経緯がある。
2014年にはプロジェクトEGGにより『F1 SPIRIT・F1 SPIRIT 3D SPECIAL』のサントラ復刻及び『コナミワイワイワールド』初のサントラ化などが行われたが、上記ケースと同様に『F1 SPIRIT』は『MSX RACING SPIRIT』(3Dも同様)へタイトルの変更が行われており、コナミワイワイワールドのサントラではマイキー及びコングがそれぞれキャラクターM、キャラクターKと名前を伏せられている。「コナミ・ファミコン・クロニクル Vol.2 ディスクシステム編」においても「リサの妖精伝説」から「アイドルの妖精伝説」へのタイトル名変更が行われての収録となっている。
ゲーメスト大賞からの企画でゲームミュージック部門10位以内に入ったゲームの音楽を収録したCD(ビデオゲームミュージック年鑑)をサイトロンから発売する事になったが、当時コナミはキングレコードからCDを発売しており、キングレコードが音源の提供を拒否したため、上位に入った『パロディウスだ!』と『サンダークロス』は収録されず、以後数年間に及び発売された「ビデオゲームミュージック年鑑」シリーズにコナミゲームの曲が収録されることは無かった。この事は後々まで尾を引き、GMフェスティバル'92で行われたゲームミュージックバンドのライブを収録したCDもサイトロンから発売されたためにコナミ矩形波倶楽部の曲は収録されず、代わりに『コナミオールスターズ1993』(キングレコード)に収録された。ただし、ライブの模様は全て入っておらず2曲のみで、なおかつ途中でフェードアウトするというものであった。またこれ以外にもゲームミュージックバンドの中ではライブ映像などを収録した映像メディアが希少になっている。