スターフォックス64
ライラット系の中心に位置する惑星。恒星のような姿をしているが、実態はマントル対流層が地表に露出した状態が長年続いている灼熱の惑星である。アンドルフがバイオウェポンの実験を行っている。所々でヘビのようなプロミネンスが吹き上がり、マグマの波が襲い来る。熱気の影響で、常にアーウィンがダメージを受け続け、地表に近づくほど体力の減る速度が速くなる。
ボスは溶岩に覆われた上半身といった外見のバイオウェポン「サンガー」。
カタリナを経由していると道中でビルが現れ、シルバーリングをばらまいてフォックス達を支援してくれる。
海洋の割合が90%を占め、アクアスと共に水の双子星として知られる。元々は有名なリゾート地であり、ペッピーの新婚旅行先はこの惑星だった。しかし、現在はアンドルフのバイオウェポンの汚染にさらされ、かつての面影を全く残さない汚染惑星と化している。水棲生物は巨大・凶暴化しており、アンドルフ軍は海洋補給基地を建設している。キャットが登場し、スターフォックスを援護する。
ボスは違法改造戦艦「サルマリン号」。ボスとしての登場よりも前にも、ステージの道中で何度か潜望鏡でこちらを確認しているのが見える。
ルート分岐条件は、途中で海面に浮いているサーチライトを全て破壊すること。破壊に失敗するとサーチライトが赤くなり、敵増援が多数登場する。ルート分岐のヒントとしてスリッピーとファルコがサーチライトの破壊を勧めてくる。
荒涼たる砂漠と岩山ばかりの惑星。別名「禁断の惑星」。古代人絶滅後、何万年も生き延びた生体兵器や防衛システムが未だに稼働し続けており、異星人の進入を阻んでいる。そのためアンドルフ軍も手が出せず、偵察部隊が上空に駐留しているだけとなっている。戦略上意味の薄い星だが、セクターXから吹っ飛ばされたスリッピーがこの惑星に不時着したため、フォックスがランドマスターを用いてスリッピー救出作戦を行う。このステージを選択した場合はボルスを経由しベノム1に行くことになり、バッドエンドが確定する。
ボスは古代化石獣「ゴラス」。
このステージのストーリーの都合上、例えセクターXで作戦完了して本来のルートからタイタニアにルート変更してもスリッピーは一時的にいない状態になる。
豊富な鉱物資源に恵まれ、無数の採掘場を取り巻く工業製品の生産施設とそれを取り巻く居住区が建造され、中規模のコロニーを形成していたが、アンドルフ軍に占領された後は軍事生産補給基地に改造され、兵器の生産・輸送の大半をこの基地が担っている。セクターZで登場する惑星間巡航ミサイル「マン・ドリル」もこの基地から発射されている。この基地は両軍にとって、戦略上の最重要ポイントである。ここでもランドマスターが活躍。ステージ開始直後から輸送列車がランドマスターの左隣を走行しており、道中で攻撃を仕掛けてくる。
ボスは最新鋭凧型実験兵器「ベンジャミン」。
ルート分岐条件は、道中の8つの安全装置を解除し、線路の進路ポイントを切り替えること。暴走した輸送列車は燃料庫に突っ込みボス、基地もろとも破壊できる。ルート分岐のヒントとしてファルコが燃料庫の存在を、ペッピーが進路の切り替え方を教えてくれる。
惑星ゾネスを経由しているとキャットが登場し、ポイント切り替えの手助けをしてくれる。
ライラット系の最外縁に位置する荒涼とした辺境の惑星。地表は見渡す限りの岩場と断崖、海は高濃度の硝酸、大気中の酸素濃度も極めて低く生物の棲息には適さず流刑地となっていた。しかし、追放されたアンドルフの手により数年の間に改造され、アンドルフ軍の本拠地となっている。アンドルフの軍事基地は地下に建造されているため、実態がよくつかめていない。しかも張り巡らされた地下輸送網によって、地上のあらゆる場所で迎撃部隊の出動が可能になっている。2種類のステージがあり、ボルスを経由すると「ベノム1」、エリア6から経由すると「ベノム2」になる。勲章はどちらのステージで入手してもよい。また、最終ボス戦は必ずフォックス1人で行くことになる。
ベノム1は通常のステージのように長い道を進んでいく(途中に分かれ道あり)が、ベノム2はベノム1の最後にたどり着く中枢の入り口付近からいきなりスタートし、いきなりボス戦が始まる。
ベノム1のボスは謎の巨大ゴーレム「バムバム」。最終ボスはアンドルフが作り上げた自身の偽者のロボット「アンドルフ・ダミー」。
ベノム2のボスはウルフェンに改良を加えた「ウルフェンII」。最終ボスはアンドルフ本人で、こちらも2つの形態に分かれる。第1形態はダミーと同様。これを倒すと第2形態であり真の姿である「アンドルフ・アイ」と「アンドルフ・ブレイン」となる。
なお、こちらのルートでは撃墜しただけではクリアにはならず、アンドルフは死ぬ寸前に基地の自爆装置を作動させ、プレイヤーはフォックスを導いてくれるジェームズ機を追い掛けて出口まで脱出しなければならない。この際の脱出ルートは複数パターンあり、入ってきた通路をそのまま逆走するわけでは無い。ジェームス機と同じルートを通って脱出する必要があり、ルートを間違えると爆発に巻き込まれてミスとなり、脱出をやり直しとなる。
この惑星は『大乱闘スマッシュブラザーズDX』のステージの1つとして登場した。
鮮やかな星雲が浮かぶ幻想的な宙域だが謎の多い不可解な宙域でもあり、磁場の異常から予想もつかない諸現象が起こる危険地帯になっている。
青いXの文字が浮かび上がる謎の宙域。アンドルフは秘密兵器を開発するため、あえてこの危険な宙域に基地を建設していたが、その秘密兵器が開発途中で暴走を起こしたために基地設備のほとんどが壊滅、基地ごと放逐されており自動兵器が残るのみとなっている。
ボスは製造途中で暴走した秘密兵器「HVC-09」。開発途中であるため上半身しか存在していない人型ロボット。
また、かねてから存在の可能性が示唆されていたワープホールを兵器輸送に利用しているという噂があり、実際にセクターZへのワープゾーンが内部に存在している。唯一、「作戦完了」の条件が2つ存在するステージ。どちらの条件でクリアしても、もう一方の作戦完了ルートを選択することは不可能。もう片方のルート分岐は、スリッピーがボスに吹っ飛ばされるイベントが発生する前に倒すこと。
カタリナを経由し、なおかつステージ内分岐でワープゲートがある左ルートを選んだ場合のみ、ビルが登場し、ワープゲートの開錠の手助けをしてくれる。また、ボス戦とそれによるルート分岐の都合で前ステージでスリッピーがやられてもボス戦前で強制復活する。
ワープゲートはレーザーを撃ち込み続けることで蓋が開き、開いた枠の中を通ることで通過となり、これを3回繰り返すとワープ成功となり青い色の空間に入る。空間内では柱状の障害物が回転しており、ぶつからないように避ける必要がある。
緑のYの文字が浮かび上がる宙域。惑星コーネリアにもっとも近いこの宙域は磁場の異常が比較的安定しており、ほかのセクターと比較すると事件や事故は少ない。コーネリアへの進軍を図るアンドルフ軍によって緑色の人型パワードスーツロボットの対艦兵器「サルジャー」が投入され、コーネリア防衛軍の艦隊は苦戦を強いられており、フォックス達はコーネリア防衛軍を援護する事になる。道中には青色や赤色の、他よりも耐久力の高いサルジャーも出現する。
ボスはサルジャーの強化型戦闘ロボット「サルデス」2体と新型の「サルデスII」。
冒頭でファルコが「この仕事は高くつくぜ」と言っているが、これはルート分岐のヒントで、100HIT以上でアクアスまたはカタリナに行く。反対に100HIT未満は強制的にカタリナ行きとなる。
赤のZの文字が浮かび上がる宙域。数十年前、ライラット系で一大勢力を誇った宇宙海賊とコーネリア軍が戦った古戦場。そのまま放置された当時の残骸が戦闘の激しさを物語っている。また、磁気の異常が全セクターの中で最も強く、遭難事故の多発地帯として知られている。アンドルフ軍は惑星間巡航ミサイルによる包囲網をこの宙域にしき、スターフォックスを殲滅しようともくろんでおり、戦闘機及び惑星マクベスから撃ち込まれた合計6基の大型ミサイルがグレートフォックスに襲いかかる。
ボスは惑星間巡航ミサイル「マン・ドリル」。惑星ゾネスを経由しているとキャットが登場し、彼女もミサイルの撃墜を手伝ってくれる。
分岐条件は、ミサイルを全て撃破すること。一発でも命中してしまうと主翼の一つが破壊され、その時点でグレートフォックスがステージを離脱し作戦終了、ボルスへ行く事となる。なお、このルートを通った場合エンディングにおいても主翼が破損したままとなっている。
このステージのみ、グレートフォックスが中央に配置されており、後ろ側の穴に入るとグレートフォックス内部に入り、アーウィンを修理して完全回復できる。
惑星コーネリアの公転軌道よりやや外側を公転する小惑星帯で、良質の資源採掘所であり天然防壁の役割も果たしている。コーネリアとフィチナの間に位置している。アンドルフ軍はコーネリアに大規模な援軍を投入するため、メテオに小惑星破壊艇を導入し、進軍ルートの確保をねらっている。また、カタリナへのワープゾーンが存在する。ワープをするには、青い色をしたリングをすべて通過しなければならない。青い色をしたリングを通ることによって、アーウィンの速度が上昇するうえブレーキが一切効かず制御が難しくなるので、成功させるのは難しい。ワープが成功すると赤い色の空間に入る。その空間に入ってしばらく進むと、複数の岩が出現して爆発する。岩が爆発したところには、レーザーエナジー、ボム、シルバーリング、ウィングリペアが大量に出てくる。またしばらく進むと、大きい岩のようなものが出現し、破壊すると大量のゴールドリング、シルバーリング、レーザーエナジー、ボム、ウィングリペアが出てくる(このメテオのワープはとてもボーナスステージ感がある)。なお、難易度エキスパートではアイテムの数が減っている。
ボスは小惑星破壊艇「メテオ・クラッシャー」。
惑星ベノムを衛星軌道上で守護するアンドルフ軍の防衛衛星。大口径レーザー兵器プラネットキャノンを装備し、艦隊による突破を不可能にした難攻不落の要塞。上部にコアとそれを守るシールドを発生させるためのシールド・リアクターが設置されている。
ボスはエネルギー融合炉「ボルス・コア」。また、ここでも宿敵スターウルフが登場するが、惑星フィチナを経由している場合はフィチナでプレイヤーが倒し損ねたメンバーのみが登場、惑星フィチナを経由していない場合は全メンバーが登場する。惑星フィチナでスターウルフを撃破しているときは登場しない。
辺境の惑星ベノムへの中継ポイントとして設けられた宇宙基地。かつては宇宙農園が造られ、植物の試験栽培などが行われていたが、アンドルフ軍に占領された後は軍の軍事拠点となり、アンドルフ軍の戦艦がひしめく防衛線が三層にわたって張られている。コーネリア防衛軍の戦略会議でも進行不能エリアとみなされ、実質的には戦略から外されている。一方防衛線の厚さから敵側も侵攻に対する意識は薄い盲点でもあった。敵の出現数がかなり多く(ある程度慣れていれば400点以上取ることも可能で、512点以上になるとランキングの点数表示で256点引かれるというバグがある)、グレートフォックスからのレーザーによる支援が受けられる。また、アンドルフからの通信をキャッチする事もできる。
ボスは最終宇宙兵器「デス・ボール」。
ボルスを除いた各ステージの最後には必ずアンドルフ軍の特殊な機体との戦闘が待ち構えており、これらを撃破するとステージクリアとなる(ステージによっては倒さなくともクリアとなる場合がある)。スリッピーが出撃している場合はボスのシールド(体力)が表示される。
アンドルフの項目も参照。ボスによっては戦闘中にその機体の操縦者から無線が入ることもあり、声優はその操縦者のものを指す。
都市占領兵器 グランガ
声:江川央生(N64版)、高口公介(3DS版)
コーネリアのボス。コーネリアの都市を破壊、占領するために開発された都市占領兵器。二足で歩行しながら、上部に取り付けられたホーミングミサイル砲などで攻撃する。
オールレンジモードでの戦闘となる。小回りが利く一方で手足は脆く、脚部を片方でも破壊されると身動きが取れなくなってしまう致命的な弱点を持つ。背後のバックパックが弱点。撃破すると操縦者が大声で『アンドルフさまぁ〜〜〜、ごめんちゃい!!』と騒ぐ。
惑星間戦闘空母 アタック・キャリア
声:郷里大輔(N64版)、最上嗣生(3DS版)
コーネリアのボス。プラズマ砲を装備した戦艦にミサイルランチャー2基と発進口を兼ねた艦載機格納庫を増設した宇宙空母で、SFC版に登場した同名のボスを再現している。
グランガをコーネリアへ運搬してきた艦で、グランガとの戦闘直前にその姿を確認できるが、ある条件を満たしていると追跡、戦闘となる。SFC版同様ミサイルランチャーと艦載機格納庫を備えており、これらを破壊すると本体への攻撃が可能となる。
小惑星破壊艇 メテオ・クラッシャー
声:麻生智久(N64版)、坂本くんぺい(3DS版)
メテオのボス。軍の進行ルートを確保するためにメテオに投入された小惑星破壊艇。小惑星や隕石、宇宙ゴミなどの障害物を粉砕する。
3つの形態に分かれており、第1形態は相手からは何もしない。欠けたピザのような形状のシールドで黄色の弱点を守っており、シールドにレーザーが当たるとレーザーを吸収し、3回吸収すると反撃を仕掛けてくる。4か所の黄色の弱点を破壊するとシールドを切り離し、第2形態へ移行。第2形態は電撃攻撃を行う。中央の黄色く発光する部分が弱点で破壊すると前後を反転させて正面を向き、第3形態へ移行。第3形態は主翼に装備された円錐状の武装からリングレーザーを撃つ。上下2つの黄色に発光する弱点を破壊することで撃破となる。
第2形態の終了時に負けを認めたような発言をするが、ファルコに「サルの言うことを信用するのか」と言われた通り、相手の油断を誘うための虚言だった。
戦闘ロボット サルデス、サルデスII
声:麻生智久(N64版)、坂本くんぺい(3DS版)
セクターYのボス。セクターYに投入された人型の戦闘ロボット、サルジャーの強化版。サルデスは金色と銀色の2体存在し、高い機動力を誇り、宇宙空間を自由に動き回って細かい動きで翻弄し、右手に持っている銃で攻撃する。サルデス2体を破壊すると白い塗装のサルデスIIが母艦と共に登場し、カタパルトで発進する。サルデスIIは機動性をより高めた新型の改良機で、ライフルのほかに盾を装備しており、ある程度の攻撃は受け止められてしまう。盾はシールドを半分減らすと壊れる。また時折母艦の上に着陸して射撃を仕掛けてくることがあり、動きが止まるため絶好の攻撃チャンスでもある。どちらも弱点と呼ぶものは無く、シールド以外はどこを攻撃してもダメージを与えられる。
戦闘はオールレンジモードで行い、最初は2体のサルデスとの戦闘となり、これらを撃破すると引き続いてサルデスIIとの戦闘になる。
なお、海外版では名前が"Shogun"となっている。
超高性能全領域戦闘機 ウルフェン
フィチナのボス。全4機でスターウルフのウルフ、レオン、ピグマ、アンドリューが各機に搭乗し、それぞれがフォックス、ファルコ、ペッピー、スリッピーに執拗な攻撃を仕掛けてくる。ある程度ダメージを与えると仲間が反撃に出る。基地の時限爆弾作動までの時間稼ぎが目的であり、戦闘中、時限爆弾のカウントダウンが始まり、時間内に全滅させないとウルフチームは離脱、基地は爆破され作戦失敗となる。
ボルスにも登場。フィチナ経由の場合はフィチナで撃墜しそこなった機が、経由していない場合は全機が増援として現れ、フォックス達を邪魔してくる。行動パターンは同じだが、こちらはフィチナとは異なり攻略には関係しない。
いずれの場合も倒さなくてもクリア自体は可能である。
超巨大要塞 グレート・ディッシュ
カタリナのボス。円盤状の形をしている。
グレート・ディッシュ自体は攻撃を行わないが、4つのハッチから戦闘機を出撃させて増援を送りこんでくる(なおハッチがいくつ残っていても、一度に出撃する敵の数は変わらない)。中心部に大口径レーザー砲を装備しており、都市や基地を一瞬で破壊できる。
一定以上の時間が経過するか、全てのハッチを破壊するとコアが出現し、コアを破壊すると作戦成功となる。制限時間内に破壊できなかった場合は前線基地を破壊をされ作戦終了となり、強制的にセクターX行きとなる。
なお、コアへの当たり判定は最初から存在するため、ボスの真下で宙返りを行うことなどで貫通すれば、ダメージを与えることもできる。
海外版の名前は"Saucer"(円盤)。
バイオウエポン バクーン
アクアスのボス。2枚貝型の大型バイオウェポン。汚染物質を撒き散らし、海洋生物を巨大・凶暴化させている。また、上殻に「フジツボ」が付けられており、外敵を駆除する「バイオワーム」を寄生させている。貝の上部に寄生している巨大なフジツボから出てくるバイオワームと、貝内部の左右にある砲台が攻撃手段。フジツボは破壊可能。
弱点は中身にある目玉で、このボスにダメージを与えるには、貝柱を破壊する、中央にレーザーで攻撃する、露出した目玉に照明弾を撃つという手順が必要になる。
HVC-09
声:頓宮恭子(N64版)、はやみけい(3DS版)
セクターXのボス。アンドルフ軍がセクターXで極秘に開発していた上半身だけの巨大ロボット。開発中に中枢プログラムが暴走したため外部装甲を貼らないままの状態で未完成に終わり、基地ごと放棄されている。現段階でビーム砲とミサイルアームを装備している。ステージ道中では度々この機体のアームが飛来していくのを確認できる。攻撃手段は頭部のビーム砲からの射撃と、両手の殴打。また時折両腕を切り離しロケットパンチを繰り出してくる。弱点は頭部の黄色い目。
このボスは2つの形態が存在し、体力を半分まで減らすと突然体力が0になり頭部が破壊されてコンピューターが露出し、一時的に機能停止する。その後再起動し、体力が半分まで回復し第2形態へ移行。暴走し瓦礫を投げる攻撃が追加されるほか、挙動が激しくなる。弱点は頭部の破壊で露出したコンピューターそのもの。しばらくするとスリッピーが敵に突撃をかけるが、これを放置するとスリッピーが右腕で弾き飛ばされてタイタニアへ吹っ飛ばされてしまい、強制的にタイタニア行きとなる。なお名前の元ネタはファミリーコンピュータの型番である「Home Video Computer」の略称で、実際のHVC-09は欠番となっている。
海外版では、"Spyborg"となっているが、これは海外版Nintendo Entertainment Systemの型番はNES-001などであり、HVCという型番では無かったためである。
バイオウエポン サンガー
ソーラのボス。ソーラに大規模な地殻変動を起こす為に投入された大型バイオウェポン。超高熱惑星ソーラの環境に適応できる外皮を持つ。自分以外の動くものに対して攻撃衝動を持つよう刷り込まれており、鎌状の腕でプロミネンスやマグマの津波を引き起こし、対象物を攻撃する。腕を破壊されると傷から漏れる超高温の体液や口からの火炎を駆使する。
頭部が弱点だが、先に両腕を破壊しないとダメージが与えられない。
違法改造戦艦 サルマリン号
声:里内信夫(N64版)、大原崇(3DS版)
ゾネスのボス。レーザー攻撃を受け付けない特殊な装甲で覆われており、戦闘だけでなく海洋探査やサルベージ作業などもこなす。パーツが破損、陥落してもクレーンで引き揚げて即時修復できる。逆に言えば、クレーンを破壊すれば修復されることはない。武装は左右の船体に搭載された球状の砲弾を発射する2門の大砲と水雷、そして本体に搭載された目標めがけて射出する鎖付きの鉄球と機銃がある。
頑丈な装甲のためレーザーは全く効かず、スマートボムを直撃させることでしかダメージを与えることができない。本体に至ってはボムすら効かないが、左右の船体を剥がすとレーザーによる攻撃が通るようになる。なお、攻略上ボムが大量に必要となるが、ボムは左右の大砲から発射される砲弾を破壊することで補給することができる。戦艦でありながら潜水する機能を有しており、潜水している時は潜望鏡でこちらを視認しながら攻撃を行う。この潜望鏡はスマートボム2発で破壊することができ、破壊した後は潜水中の攻撃がほとんど当たらなくなる。
古代化石獣 ゴラス
タイタニアのボス。太古からタイタニアに生息する凶暴な魔獣で、タイタニアに墜落したスリッピーを左腕の一つで捕えている。本作に登場するボスの中で唯一、アンドルフ軍が関与していない純粋な生物であるが、生物らしからぬレーザーを装備しており古代人が改造したと考えられている。尻尾や下2本の鎌状の腕による物理攻撃と上2本の腕によるレーザー攻撃を仕掛け、口からは強力な光線を放つ。胸部の肋骨に覆われた心臓のようなものが弱点で、腕を全て破壊すると肋骨が開き剥き出しの状態になるが、しばらくすると腕は再生してしまう。
最新鋭凧型実験兵器 ベンジャミン
声:郷里大輔(N64版)、最上嗣生(3DS版)
マクベスのボス。輸送中の実験兵器であり、列車の車掌曰く「着いたばかりの積荷」。先頭車両の1つ手前の車両に格納されていたものがスターフォックスの襲撃によってその場で急遽出撃する。先頭車両に凧のように牽引されて気流を利用して飛行、移動することでエネルギーのほとんどを攻撃に使用している。
ベンジャミンとの戦闘中に設置されている安全装置を8本全て撃ってロックを解除し、その後出現するレバーを撃って線路のポイントを切り替えると進路が燃料庫に繋がり、加速していた列車はブレーキをかけるも間に合わずにそのまま燃料庫に突っ込んで大爆発を起こし、ボスや列車、基地ごと完全破壊し『作戦完了』となる。この際、+50の撃墜数ボーナスが得られる。
切り替えに失敗した場合、ベンジャミンを直接撃って倒すことになり、倒すとベンジャミンが列車に向かって吹っ飛んで大爆発を起こし、『作戦終了』になる。
惑星間巡航ミサイル マン・ドリル
セクターZのボス。グレートフォックスを目標にマクベスより発射される惑星間巡航ミサイル。自動索敵追尾システムを搭載しており、目標がどんなに回避しようとも確実に命中させる精度と、どんな巨大戦艦でも2発命中させれば半壊できるだけの破壊力を持つ。
3回に分けて飛来し1、2、3発と数が増えていく。合計で6機出現し、破壊する度に同時に出現する数が増えていく。味方はミサイル迎撃に向かってくれるが途中で高確率で敵機の妨害を受けて追われるのでほとんど自力で破壊しなければならない。なお、仲間がミサイルにとどめを刺した場合は撃墜数はカウントされない。
エネルギー融合炉 ボルス・コア
ボルスのボス。6本のエネルギータワーから供給されるバリアで防御されており、それらが破壊されしばらくすると冷却のため外部に露出する。円筒状の形に8つの黄色いコアが貼り付けられており、すべてを破壊すると撃破できる。攻撃手段は持っていないがコアを破壊するとエネルギーが漏れ出し、レーザー状に拡散するようになる。
最終宇宙兵器 デス・ボール
エリア6のボス。スターフォックスにエリア6を突破された際に最後に投入された最終宇宙兵器。その名のとおり装甲を閉じた通常形態は巨大なボール型で、装甲の内側にある3つのエネルギー球でバリアを生み出しコアを防御している。実現不可能と言われた次元移動システムを搭載しており、ベノムに突入しようとするスターフォックスの前に突如姿を現す。伸縮、再生自在な3本の触手状のアームや多数のミサイル、艦載機を発進させて攻撃する。またボルスに搭載されていた大口径レーザー兵器「プラネット・キャノン」を装備しており、殻を開いた後少しのチャージを経て、虹色の極太レーザーを発射する。
このボスを倒すには、触手を破壊する、触手の補充の為殻が開いた際に出現する3つのエネルギーボールを破壊する、中央を攻撃してシールドを破壊する、もう一度触手を破壊する、もう一度3つのエネルギーボールを破壊し、中央を攻撃してダメージを与えるという手順を踏む必要がある。
プラネットキャノンはビームの色彩が高い上にカラフルであり、目に悪影響を与える危険性があった。そのため、Wiiバーチャルコンソール版、3DS版では色が変更されている。
謎の巨大ゴーレム バムバム
ベノム1のボス。ベノムへの侵入者を神殿の奥へ誘う謎の巨大ゴーレム。自身は攻撃を行わず、一見すると逃げているだけに見えるが、奥へと移動しながら通路内のトラップを作動させて障害物を作り出していき、フォックス達の行く手を阻む。
石像のような姿をしているが、これはただの装甲であり正体はロボットである。倒すには頭部以外の装甲を剥がす、頭部の装甲を剥がす、胴体に出現した赤い弱点を撃つ、と手順を踏む必要がある。
あまりにも長期戦になると行き止まりを作られてアーウィンはそれに激突し、強制ミスとなってしまう。
超高性能全領域戦闘機 ウルフェンII
ベノム2のボス。ウルフェンの改良型。仮に惑星フィチナを経由し、全員倒していても4機全員が登場する。従来のウルフェンよりも機動性がアップしているうえ、ツインレーザー標準装備・ローリング機能・爆発ダメージを無効化するバリアを搭載しており、チャージ弾やボムなどはバリアで完全無効化してしまう。強力な装甲を持つが、時々柱にぶつかり自滅してしまうこともある。通信画面ではスターウルフのメンバーの容姿にサイボーグ化などの一部変化が見られている。
ベノム2の前半は、このウルフェンIIと戦闘するオールレンジモードのステージのみで構成されており、全滅させると後半戦へと進む(撃墜が早ければ+50の撃墜数ボーナスを得ることができ、遅いほど撃墜ボーナスが減少する)。
天才科学者 アンドルフ
ベノム1・2共通のボス。巨大な顔と手のみで、アンドルフ自らが自身に改造を施した姿である。左右の手はパンチや指先からのビームで攻撃し、顔は吸い込んでアーウィンの翼を噛み砕く。弱点は左右の手の平にあるコアと目である。ダメージを与えるには先に手の平のコアを攻撃して両手を破壊してから目を攻撃する必要がある。吸い込むときにボムを打ち込むか先に目を攻撃すると怯んで動きが止まり、手の平のコアを攻撃しやすくなるものの、ダメージは与えられない。
撃墜すると皮膚が剥がれ、爆風の中からステージ毎に異なる以下の正体を現し、ラストバトルへと突入する。
アンドルフ・ダミー
ベノム1の最終ボス。アンドルフの影武者のロボット。突進して噛みついてくるのみ。体力は低く、ボム1発で撃墜できる。
アンドルフ・ブレイン
ベノム2の最終ボス。巨大な脳味噌の姿で、自らをバイオウエポンに改造したアンドルフの真の姿。オールレンジモードでの戦闘となる。弱点は目(アンドルフ・アイ)と小脳の部分。大脳の部分に攻撃すると、背後にワープする。
目をレーザーで伸ばしながら、常に回るように移動している。うかつに本体に近付くと脳の下の触手に捕まり、翼を破壊されるなどのダメージを受けてしまう。
本編とは別に、最大4人のプレイヤーで対戦ができるモードが用意されている。ステージは、コーネリア、カタリナ、セクターZの3種類から選択できる(本編と同名だが対戦用にアレンジされている)。最初はアーウィンでしか対戦できないが、一定の条件を満たすとランドマスターやマシンから降りたパイロットで対戦することができる(セクターZは陸地が存在しないためアーウィンのみ)。
パイロットでの戦闘は、常に前進し続ける機体の操作と違い3Dアクションの要領で操作する。移動速度は見た目に反して速いが、空中を飛行できるアーウィンと比べると行動範囲は明らかに狭く扱い辛い。またパイロットに関しては清水隆雄曰く「ベノムに突入する第3のルートとして、要塞の中でバズーカを装備したフォックス(パイロット)がアンドルフと戦うステージを企画していたが、納期の都合上パイロットをバトルモードでのみ使用できるようにした」とのこと。パイロットの武器は縞模様の入ったシンプルな筒状の大型バズーカだが、実は正式な名前が無く、限られたポリゴン数の中で絵的なインパクトを優先するためにブラスターではなくこのような大型兵器が生み出された。攻撃力はアーウィンのレーザーよりも高く、チャージ弾が撃てないものの連射性能が非常に高い。また、前述の通りレーザーエナジーを入手すると武器の性能を強化する事ができ、螺旋状の強力なエネルギー弾を放つことが可能。