東武東上本線
川越市駅 - 元川越電車区、現川越工場を併設。駅の1番線横に2本、引き上げ線として2本の計4本存在する。なお、他に工場内の留置線も存在する。
坂戸駅(現在は越生線車両が留置され、東上本線用としては原則使われない)
高坂駅 - 主に川越工場出場車の試運転の折り返しに使われる。かつては貨物列車の運転停車にも使われたが、貨物廃止後に行われた駅舎改築時に大規模な構内の配線替えが行われたため、当時の配線はプラットホームを含め現在とは全く異なる。駅のホームを挟む形で2本存在する。
森林公園駅 - 森林公園検修区を併設。
小川町駅 - 駅の4番線横に1本、引き上げ線1本の計2本存在する。駅の横の線路は主に回送列車が使用する。有楽町線・副都心線直通列車は当駅が始発・終着駅である。
寄居駅 - 秩父鉄道経由で新車の受け渡し、転入出車、東武鉄道南栗橋工場入出場車の受け渡しなどが行われる。波久礼方に引き上げ線として1本、2番線横に1本存在する。他にも秩父鉄道との間に数本線路が存在するが、現在は使用されていない。
過去には池袋駅にも留置線が存在した。同駅5番(現在の1番)ホームから南(目白駅方向)に、山手線に沿って敷設されていて、引き上げ線として利用されていた。メトロポリタンプラザビル建設着工時に撤去された。
西山信号所(現・池袋 - 北池袋間、1947年5月1日 - 1964年9月14日)
金井窪駅(現・下板橋 - 大山間、1931年9月27日 - 1945年4月15日)
水谷信号所(現・みずほ台駅、1927年2月1日 - 1938年6月1日)
みずほ台信号所(現・みずほ台駅、1951年9月1日 - 1954年6月26日)
ききょう原信号所(現・ふじみ野駅、1951年9月1日 - 1954年3月1日)
田面沢駅(現・川越市 - 霞ヶ関間、1914年5月1日 - 1916年10月27日)
入間川水泳場駅(現・川越市 - 霞ヶ関間、1920年7月11日 - 1951年8月20日、夏季のみの臨時駅)
東武啓志線:上板橋 - 練馬倉庫 - 啓志(グラントハイツ)間 6.3 km
日本が太平洋戦争に敗れ、米軍を中心とした連合国軍の占領下に置かれたことを受け、米軍は関係者とその家族を居住させる住宅地を接収地に建設した。その住民の交通の便を図るため、上板橋からグラントハイツ(現在の光が丘)に向けて建設された路線。「啓志」という名称は当時のグラントハイツ建設工事責任者のケーシー中尉の名から取られた。グラントハイツは東武練馬駅が最寄りであったが、敗戦前に上板橋から東京第一陸軍造兵廠練馬倉庫(現在の陸上自衛隊練馬駐屯地)付近まで既に敷設されていた引き込み線の延長で対応したため、上板橋駅が起点となった。1959年(昭和34年)7月に廃止され、1960年代に線路設備が撤去された。上板橋駅付近の廃線跡には、東武鉄道が1972年(昭和47年)に分譲マンションを建設している。
埼玉県営鉄道霞ヶ関砂利線:的場(現・霞ヶ関)- 入間川 間 2.4 km
元は入間川砂利株式会社が建設した専用鉄道、軌間762mmの軽便線。1920年(大正9年)7月20日全通。1923年(大正12年)県営砂利事業開始のために埼玉県に譲渡された。1957年(昭和32年)(推定)廃止。
東武高坂構外側線(日本セメント東松山専用鉄道高本線・秩父鉱業東松山鉱業所専用線):高坂 - 葛袋 - 高本間 5.5 km
貨物専用線。1955年(昭和30年)10月に開通。後年電化されたが、1984年(昭和59年)8月1日全線廃止された。関越自動車道の高坂SA - 東松山IC間にかかる架線柱の残された橋が残存していたが、2013年(平成25年)6月3日から4日にかけて撤去された。
東武根古屋線:小川町 - 大河 - 槻川 - 根古屋間 4.3 km
石灰石運搬用の貨物線。1926年(大正15年)9月5日開通、1967年(昭和42年)4月1日廃止。
東上線では下記の企画乗車券を発売している。
このほか、東上線サイクリングクーポンを2015年12月まで、日光・鬼怒川リレーきっぷ・東上東急線トライアングルチケットを2019年9月まで発売していた。
かつて、東上線を担当する現業部門として、本社鉄道事業本部の直下に「東上業務部」が置かれていた。東上業務部は営業・運転・運行管理などの部署と駅務・乗務員を持ち、車両・施設系(保線・工務・電気)を除く現業部門は本線のそれとは別個の組織となっていた。その背景は、元々別会社(本線系統が本社で、東上線は東上鉄道)が建設した路線であり、特に、東上線は東武鉄道内で唯一山手線と池袋というターミナルで接続する路線であることで、否応にも「他者」の目を強く意識し「普通の鉄道」として振舞わなければならないことが挙げられる。また、組織上東上業務部と本線の部署とは、業務をする場所が離れていることもあり人事交流がほとんどなく、営業や接客面について本社は東上業務部に対して不干渉で、そのため、東上線ではまるで別会社であるかのような独立色を強く打ち出せた。一例としては、本線系統の優等列車愛称が単純化された1970年代以降においても、東上線の休日の行楽特急の愛称はバラエティーに富んでいて、森林公園・小川町・寄居方面行きの「むさしの」・「さだみね」・「たまよど」、秩父鉄道に乗り入れていた「ながとろ」・「みつみね」、越生行きでは「くろやま」・「第1かまきた」など、列車ごとに愛称が付けられていた。また記事冒頭に掲出した「東武東上線」のエンブレムを作成したのも東上業務部であった。一方、東上線内で東上業務部が管轄しない施設には森林公園検修区(本社車両部所属)、川越工場(現・廃止、かつては車両部南栗橋車両管理区の管轄下)、川越工務管理所、川越電気管理所(両者とも本社施設部)、診療所川越分院(本社人事部所属)があり、東上線自体が本社から独立した存在というわけでもなかった。
2015年7月1日付で東武鉄道社内の業務組織一部改正に伴い、東上業務部は廃止され、運行管理部門については、本線系統と同じ鉄道事業本部の直下の運輸部内の東上運行管理所に移管、営業関連部門については、本社鉄道事業本部営業部に輸送企画課、営業推進課、お客様サービス課およびエリア別に支社を新たに新設、その新設支社の1つである東上営業支社に移管された。なお、同時に本線系統でも、スカイツリーライン営業支社、アーバンパークライン営業支社、北関東営業支社が新設・移管されている。2021年6月23日時点で、本社鉄道事業本部の営業関連部門は、営業統括部の直下に営業部があり、その傘下に東上営業支社や本線系統の支社がある組織になっていたが、2022年4月1日付で東上営業支社を含む営業支社は廃止された。
2011年3月11日の発生当日は、即日で運行停止を決め、駅のシャッターを閉めた。なお西武池袋線、都営三田線は共に同3月11日21時過ぎに運転を再開し、他の私鉄も深夜には運転を再開した。
東上線は翌3月12日の朝5時54分に池袋駅 - ふじみ野駅間で運行を再開した。同日7時までに全線で運行を再開した。
2019年10月12日、東日本台風(台風19号)接近に備え、13時から全線を運休。翌10月13日の6時30分に池袋駅 - 川越市駅間、8時に川越市駅 - 坂戸駅間、8時5分に森林公園駅 - 小川町駅間、8時23分に小川町駅 - 寄居駅間、16時49分に坂戸駅 - 森林公園駅間の運転を再開した。
2018年度の設備投資計画によれば、ホームドアを2020年度末までに池袋駅(5番ホームは固定柵)・和光市駅・朝霞駅・志木駅・川越駅、2021年度以降に北池袋 - 成増間各駅・朝霞台駅・ふじみ野駅・上福岡駅に整備する予定としている。
当線において、板橋区内の区間を立体化する計画が存在する。この事業は、道路と鉄道を連続的に立体交差化することで交通渋滞や踏切事故、鉄道による地域の分断を解消し、街の一体化を確保する 目的で行われる。
2019年現在、板橋区の大山駅付近(大山金井町・山手通り交差地点付近 - 大山駅 - 仲町)約1.6 kmについて、立体化される都市計画道路補助第26号線とともに連続立体交差事業(鉄道高架化)の事業化を行う計画が進められている。構造形式は高架式(かさ上式)および地表式で、高架化後も大山駅は相対式ホーム2面2線となる予定。本事業に伴い、対象区間に存在する踏切8ヶ所が撤去される。事業主体は東京都で、2021年度に都市計画事業の認可を取得し、2030年度の完了を想定している。
「東京都踏切対策基本方針」  において、ときわ台駅 - 上板橋駅付近間を高架化する計画が「鉄道立体化の検討対象区間」に位置づけられている。この区間は板橋区が「大山駅付近」の事業の進捗状況を見極めながら、さらに都市計画道路補助第86号線及び第244号線の整備計画と同時に調査するとしている。
東武池袋駅では、2017年に発表された東武鉄道の中期経営計画で、西口の再開発事業と併せて3面3線から2面4線への拡張が計画されている。