tbuckley/cabot-search huggingface dataset:
Abstract 16752: Restoration of Defective Hydrogen Sulfide Production in Bone Marrow Cells From Diabetic Mice Rescues Their Impaired Tissue Reparative Function
Authors: Zhongjian Cheng, Venkata Naga Srikanth Garikipati, Emily Nickoloff, Chunlin Wang, David J Polhemus, Jibin Zhou, Cynthia Benedict, Mohsin Khan, Suresh K Verma, Joseph E Rabinowitz, David Lefer, Raj Kishore
Journal: Circulation (2016)

Background: Bone marrow cell (BMC)-based treatment for critical limb ischemia (CLI) in diabetic patients yielded a modest therapeutic effect due to cell dysfunction. Therefore, approaches that impr...
Comprehensive Analyses of Early Lymphocyte Reconstitution after Haploidentical HSCT with Posttransplant Cyclophosphamide: Coordinated Treg-Dominant T-Cell Reconstitution and Stem Cell-Derived Mature B-Cell with Broad BCR-Repertoir Diversity
Authors: Miki Iwamoto, Ken-ichi Matsuoka, Yusuke Meguri, Takeru Asano, Takanori Yoshioka, Yuriko Kishi, Makoto Nakamura, Yasuhisa Sando, Ryuji Suzuki, Kazutaka Kitaura, Yoshinobu Maeda, Mitsune Tanimoto
Journal: Blood (2016)
ANKLE BIOMECHANICS AND JUMP PERFORMANCE IN HEALTHY AND CHRONIC ANKLE INSTABILITY INDIVIDUALS DURING LANDING: A TRIPLE BLIND RANDOMIZED CLINICAL TRIAL OF ANKLE TAPING EFFICACY
Authors: Hyung-pil Jun, Young-min Chun, Jin-ah Kim, Russell Baker, Jeff Seegmiller, Sae Yong Lee
Journal: British Journal of Sports Medicine (2017)

Background Clinicians regularly utilize ankle taping procedures to prevent ankle sprains during practice/competition. Though many different ankle taping applications are employed, the effect of these on biomechanics and performance is unknown. Objective To investigate changes in ankle biomechanics during landing and jump performance with ankle taping. Design Triple-blind randomized. Setting University laboratory. Participants Twenty-eight participants (14 healthy, 14 with chronic ankle instability [CAI]). Interventions Each participant was assigned to a randomized order of three taping applications (1: Traditional Taping [TT], 2: Mulligan Concept Taping [MT], and 3: Kinesiology Taping [KT]) and performed maximum vertical jump and running-stop jump-landings (3 before and 3 after) each ankle taping application. An eight infrared optical cameras system (Vicon Motion Systems Ltd. Oxford, UK) and force plate (AMTI, Watertown, MA) were used to collect all kinematics and kinetics data during running-stop jump-landing. Main Outcome Measurements Maximum height of vertical jump and excursion of dorsiflexion (DF) and inversion (IV) of the ankle between 100 ms before and after initial contact (IC). Results A statistically significant difference for the main effects of tape application [ F (2,26) =0.06, p =0.94, M±SD: 0.82±12.55(TT), 1.29±8.64 (MT), 0.42±10.31 (MT); F (2,26) =0.58, p =0.46, M±SD: 0.58±1.38(TT), 0.67±0.65(MT), 0.48±0.97(MT)] and interactions [ F (2,26) =0.89, p =0.51; F (2,26) =0.46, p =0.41] on changes of DF and IV were not found regardless of tape application. For MVJ, a statistically significant change across tape application was not found [ F (2,26) =0.65, p =0.49]; however, a statistically significant interaction on MVJ was found in the CAI group with KT application[ F (2,26) =3.50, p =0.04, M±SD: 0.30±0.69 [Healthy]; −0.36±0.88 [CAI]). Conclusions The use of tape did not have any significant impact on ankle biomechanics during landing. Using KT produced a significant change in MVJ in participants with CAI, but the improvement is unlikely to be clinically meaningful. The use of these taping methods to improve ankle biomechanics or improve jump performance in healthy athletes, or those with CAI, is questionable.
PTH-014 A comparison of patient tolerance of colonoscopy with ct colonography and colon capsule endoscopy
Authors: H Ojidu, H Palmer, J Lewandowski, J Hampton, T Blakeborough, O Epstein, ME McAlindon
Journal: Endoscopy (2017)

<h3>Introduction</h3> Poor tolerance of laxatives may be associated with inadequate bowel cleansing and reduced pathology detection. [1] Colonoscopy (CS), the gold standard, is uncomfortable, may require sedation and is not without risk. [2] CT colonography (CTC) is less invasive, requires less laxatives, but involves irradiation. Colon capsule endoscopy (CCE) is non-invasive, directly visualises the mucosa, but requires a more vigorous laxative regimen. [3] In this study, patient tolerance of each was compared. <h3>Method</h3> Split dose Kleenprep (4L) was used for CS and gastrografin (3 × 30 ml) and rectal insufflation for CTC. The regimen for CCE was either (STH) split dose Kleenprep (4L) plus two phosphosoda 'boosters' or (RFH) split dose Moviprep (2L) with phosphosoda/gastrografin 'boosters'. A bisacodyl suppository was used to promote capsule excretion if needed. Patients graded severity of laxative-related symptoms and recorded a Gloucester Comfort Score (GCS) for each procedure. They scored their overall experience (of bowel preparation and procedure combined) on a visual analogue scale (VAS 0–10: no-intolerable). <h3>Results</h3> CS was performed in 153 patients (86M, mn age 58.6±1.2). Prior failed CS, or refusal to have CS, occurred in 30.1% and 18.4%, respectively, of CTC patients (n=103; 36M, mn age 69.5±1.1), and 22.6% and 9.7% of CCE patients (n=31; 8M, mn age 42.9±3.6). CTC and CCE patients were predominantly female (p=0.003 cf. CS cohort, Kruskal Wallis). Moderate to severe laxative-related symptoms prior to CS, CTC and CCE (respectively) were nausea (12.4%, 2.9%, 29.1%; p&lt;0.001), vomiting (2.6%, 3.9%, 8.7%; p=0.004), bloating (11.8%, 1.0%, 16.1%; p&lt;0.001), pain (4.6%, 1.0% and 12.9%; p&lt;0.001), headache (4.6%, 3.9% and 19.4%; p=0.019). GCS scores of moderate to severe discomfort occurred in 40.1%, 7.8% and 0% (p&lt;0.001) and mean VAS scores for the overall experience were 4.9, 2.5 and 3.4 (p&lt;0.001) respectively. Overall CS experience was worse than both CTC (p&lt;0.001, Mann Whitney) and CCE (p=0.01) which yielded similar results. <h3>Conclusion</h3> Laxatives may cause distress and the less used, the better. However, procedural discomfort accounts for the overall poorer experience of CS patients compared to CTC and CCE, even though the latter cohorts contain more patients at risk of poorer tolerance (prior failed colonoscopy, refusal of colonoscopy and female predominance.[4] Investigation should be tailored according to the likely diagnoses and patient preference. <h3>References</h3> . Holt EW, et al., J Gastrointest Liver Dis 2014;23:135–40. . Standards of practice committee of the ASGE. Gastrointest Endosc 2011;74:745–752. . Spada C, et al., Gut 2015;64:272–281. . Ojidu H, McAlindon ME. Gut2016;65(1):A61. <h3>Disclosure of Interest</h3> None Declared
Pose d’une prothèse ésophagienne sous contrôle endoscopique seul: Evaluation de la faisabilité et de l’innocuité de cette procédure
Authors: E Ben Soussan, M Antonietti
Journal: Endoscopy (2004)

Objectif: L’accès à une salle de radioscopie est parfois difficile dans certains centres et entraîne un retard de la prise en charge voire le transfert de malades vers un autre centre pour une pose de prothèse ésophagienne. Par ailleurs, la répétition des examens radioscopiques expose le personnel à des doses importantes. Le but de cette étude a été d’évaluer la faisabilité et l’innocuité de la pose d’une prothèse ésophagienne sous contrôle endoscopique seul. Matériels et Méthodes: De janvier 2002 à août 2003, 22-malades ont été inclus pour une pose de prothèse ésophagienne sous contrôle endoscopique seul. Le matériel utilisé était une prothèse ésophagienne expansive couverte à libération proximale (Ultraflex, Boston Microvasive®), qui par sa libération initialement proximale permet cette procédure. La technique de pose était la suivante: introduction d’un gastroscope de petit calibre (Olympus:GIF160) jusqu’au niveau de la lésion avec franchissement si possible de celle-ci. Une évaluation endoscopique de la longueur de la sténose était alors effectuée. En cas de sténose infranchissable par le gastroscope, des dilatations aux bougies de Savary (diamètre maximal 11mm) étaient réalisées après passage d’un fil guide Jagwire 0,035 inch (Boston Microvasive) ou de Savary au-delà de la sténose. Cette dilatation permettait ensuite le franchissement de la sténose par le gastroscope et l’évaluation de sa longueur. Le pose prothèse étaitensuite introduit sur le fil guide et la collerette supérieur de la prothèse était placée au-dessus du pôle supérieur de la tumeur sous contrôle endoscopique (endoscope introduit en parallèle). Le largage de la prothèse était alors effectué sous contrôle endoscopique permanent. Résultats: Les indications d’une pose de prothèse ésophagienne étaient une sténose tumorale (n = 18) et une fistule éso trachéale (n = 4). La sténose siégeait au niveau du 1/3 supérieur (n = 4), 1/3 moyen (n = 5) et 1/3 inférieur (n = 9). La pose d’une prothèse ésophagienne a été réalisée chez 21/22-malades. Dans un cas une sténose du 1/3 supérieur anfractueuse n’a pas permis l’utilisation de cette procédure. Le transit ésophagien de contrôle a confirmé le bon positionnement de la prothèse chez les 21-malades. Des complications ultérieures sont survenues dans 4 cas: obstruction par un envahissement tumoral extra prothétique (n = 2) ou par un bezoard (n = 1) et perforation ésophagienne par les mailles de la collerette supérieure. Conclusion: La pose d’une prothèse ésophagienne à libération proximale est réalisable sous contrôle endoscopique seul, de façon sûre et efficace. Elle permet donc de pallier la carence de certains centres en matériel de radioscopie.
Abstract 174: The BH3-Only Protein BNIP3 Induces Mitochondrial Clearance via Multiple Pathways
Authors: Eileen R Gonzalez, Babette Hammerling, Rita Hanna, Dieter A Kubli, Åsa B Gustafsson
Journal: Circulation Research (2015)

Autophagy plays an important role in cellular quality control and is responsible for removing protein aggregates and dysfunctional organelles. BNIP3 is an atypical BH3-only protein which is known to cause mitochondrial dysfunction and cell death in the myocardium. Interestingly, BNIP3 can also protect against cell death by promoting removal of dysfunctional mitochondria via autophagy (mitophagy). We have previously reported that BNIP3 is a potent inducer of mitophagy in cardiac myocytes and that BNIP3 contains an LC3 Interacting Region (LIR) that binds to LC3 on the autophagosome, tethering the mitochondrion to the autophagosome for engulfment. However, the molecular mechanism(s) underlying BNIP3-mediated mitophagy are still unclear. In this study, we discovered that BNIP3 can mediate mitochondrial clearance in cells even in the absence of a functional autophagy pathway. We found that overexpression of BNIP3 led to significant clearance of mitochondria in both wild type (WT) and autophagy deficient Atg5-/- MEFs. BNIP3 caused an increase in LC3II levels in WT MEFs, indicating increased formation of autophagosomes. In contrast, LC3II was undetectable in Atg5-/- MEFs. Furthermore, we found that BNIP3-mediated clearance in WT and Atg5-/- MEFs did not require the presence of Parkin, an E3 ubiquitin ligase which plays a critical role in clearing dysfunctional mitochondria in cells. Also, overexpression of Parkin did not enhance BNIP3-mediated mitochondrial clearance. When investigating activation of alternative cellular degradation pathways, we found that BNIP3 induced activation of the endosomal-lysosomal pathway in both WT and Atg5-/- MEFs. Mutating the LC3 binding site in BNIP3 did not interfere with the activation of the endosomal pathway and clearance of mitochondria in Atg5-/- MEFs. Thus, these findings suggest that BNIP3 can promote clearance of mitochondria via multiple pathways in cells. The role of autophagy in removing mitochondria is already well established and we are currently exploring the roles of the endosomal and alternative autophagy pathways in BNIP3-mediated mitochondrial clearance in myocytes.
Traitement endoscopique du carcinome épidermoïde superficiel et de la dysplasie de haut grade de l’ésophage
Authors: JM Canard, A de Leusse, L Palazzo, C Cellier, R Jian
Journal: Endoscopy (2004)

Introduction: La mucosectomie est actuellement reconnue comme étant un des traitements curatifs du carcinome épidermoïde superficiel et de la dysplasie de haut grade de l’ésophage. Buts: évaluer le traitement endoscopique par mucosectomie des lésions néoplasiques superficielles de l’ésophage: faisabilité des techniques, résultats, complications et taux de récidive. Patients et Méthodes: De septembre 1997 à juillet 2003, 35 patients (19 H, âge moyen 67 ans) présentaient un total de 39 lésions néoplasiques superficielles de l’ésophage: dysplasie de haut grade (28%) et carcinome épidermoïde superficiel de l’ésophage (72%). Il s’agissait en majorité de lésion de taille inférieure à 20 mm (79%) toutes classées au maximum T1 en échoendoscopie standard (72%) ou T1sm1 en mini sonde (28%). Après coloration au lugol, la mucosectomie était réalisée selon la technique d’aspiration section sur bague (43%) ou de traction section (31%) avec un appareil à double canal ou par une technique combinée (26%). Chez les premiers patients, la mucosectomie était parfois associée à une destruction par APC de résidus tumoraux. Un contrôle endoscopique était réalisé à 3 mois puis tous les 6 mois. Résultats: La résection muqueuse (par fragments = 22, en bloc = 17) était techniquement possible chez tous les patients et a été complétée par APC chez 5 patients (14%). Le traitement endoscopique de la lésion était considéré macroscopiquement complet chez 33 patients (94%). Une complication précoce à type de pseudo perforation a été observée chez 2 patients, traitée médicalement. Aucune hémorragie secondaire nécessitant une reprise endoscopique ou une transfusion n’a été notée. Chez 3 patients, un saignement au cours de la mucosectomie nécessitant la mise en place de clip n’a pas été pas considéré comme une complication. Une patiente âgée de 90 ans est décédée d’une détresse respiratoire aiguë sans lien direct avec la mucosectomie. Une sténose ésophagienne secondaire a été observée chez 3 patients après mucosectomie d’une lésion de taille supérieure à 20 mm chez 2 patients. L’analyse histologique objectivait une lésion infiltrante chez 8 patients (23%). Après résection curative (n = 25, 71%) et après un suivi endoscopique médian de 18 mois (extrêmes: 3–39 mois), une récidive était notée chez 1 patient (4%). Conclusion: Le traitement endoscopique par mucosectomie des lésions néoplasiques superficielles de l’ésophage est un traitement curatif efficace compte tenu de l’excellent taux de résécabilité, du faible risque de complication et de récidive. L’analyse histologique de l’envahissement tumoral permet de justifier un éventuel traitement complémentaire (chirurgie, radio chimiothérapie).
Cirulaire »Prions« du 14 mars 2001, deux ans après: Modalités pratiques d’application dans une Unité d’Endoscopies Digestives d’un Centre Hospitalier Général
Authors: A Fleury, P Martres, F Lémann, S Monat, S Manet-Lacombe, G Laurens, O Danne
Journal: Endoscopy (2004)

But: La circulaire DGS/DH N° 138 du 14 mars 2001 relative à la prévention du risque de transmission d’agents transmissibles non conventionnels (ATNC) prend en compte le risque iatrogène lié au nouveau variant de la Maladie de Creutzfeldt Jakob (MCJ) et préconise entre autres l’utilisation de l’acide peracétique (APA) pour la désinfection des endoscopes. Nous avons évalué le surcoût généré par ces nouvelles recommandations puis avons mis en éuvre uniquement les mesures financées. Matériels et Méthodes: Après avoir défini avec le CLIN les actes à risque de transmission des ATNC, nous avons évalué les conséquences financières de la nouvelle circulaire en terme d’usure et de temps d’immobilisation des endoscopes, de consommation de détergent et désinfectant à base d’APA, d’acquisition de matériel à usage unique. Avec l’appui du CLIN, un financement à la hauteur du coût des mesures évaluées a été demandé à la Direction de l’Hôpital. Résultats: Dans l’Unité d’Endoscopies Digestives de notre Centre Hospitalier (810 lits), le coût de la mise en place des nouvelles recommandations de la circulaire 138 a été évalué à 100000 euros par an au titre de dépenses d’exploitation (achat d’équipement à usage unique principalement), et à 80000 euros au titre de dépenses d’investissement (endoscopes, laveurs désinfecteurs d’endoscopes). Tous les actes endoscopiques digestifs (3000 par an), quelles que soient les caractéristiques du patient, ont été considérés comme des actes à risque de transmission des ATNC. En conséquence, un double nettoyage systématique de tous les endoscopes a été mis en place grâce à l’acquisition d’un deuxième laveur désinfecteur répondant aux recommandations de la circulaire, à la mise aux normes du laveur désinfecteur déjà en service et à l’augmentation du parc d’endoscopes (OLYMPUS®). Le désinfectant à base de glutaraldéhyde a été remplacé par un désinfectant à base d’APA. Après 2 ans d’utilisation de l’APA de juin 2001 à mai 2003, 1795 coloscopies, 3719 gastroscopies et 76 duodénoscopies ont été réalisées et aucune détérioration à titre de tube plissé, de fuites au niveau des manettes ou des bouchons, n’a été constatée. Seuls 4 cas de canaux bouchés ont été relevés. Cependant 60% du parc a été acquis de façon contemporaine ou postérieure au passage à l’APA et la procédure de désinfection machine reste majoritaire. Conclusion: La plupart des recommandations de la circulaire »prions« est appliquée dans notre Unité d’Endoscopies Digestives grâce à un financement spécifique que nous avons nous même sollicité. L’utilisation pendant 2 ans d’APA n’a entraîné que des dommages mineurs vis à vis d’un parc d’endoscopes OLYMPUS® majoritairement récent.
Inactivation of STAT1 by promoter methylation contributes to squamous cell carcinogenesis
Authors: Sichuan Xi, Kevin F. Dyer, Mark Kimak, William E. Gooding, J. Richard Chaillet, Robert E. Ferrell, Jennifer Rubin Grandis
Journal: Cancer Research (2005)

5278  Signal Transducers and Activators of Transcription (STAT) proteins have been linked to transformation and tumor progression. Among the 7 members of the STAT family, STAT1 has been implicated as a tumor suppressor gene in several human cancers, although studies to date have not elucidated the mechanisms of tumor repression. We analyzed the role of STAT1 in squamous cell carcinoma of the head and neck (SCCHN) by determining expression and activation levels in human tissues and the consequences of STAT1 overexpression in a xenograft model of SCCHN. Increased expression and activation of STAT1 decreased the growth of SCCHN cells in vitro and in vivo. In tissues from 28 individuals with SCCHN, STAT1 activation levels were decreased in all of the tumors compared with levels in adjacent normal mucosa. To determine the tumor suppressive mechanism of STAT1 in SCCHN, DNA was isolated from paired tumors and peripheral blood lymphocytes (PBL) from 16 SCCHN patients, and primers were designed to sequence all exons of human STAT1. No specific mutations of STAT1 in the SCCHN tumors were detected. Using a microsatellite marker that mapped to chromosome 2 (the location of STAT1), 25% of SCCHN tumors were found to demonstrate loss of heterozygosity (LOH) in this region. Methylation of CpG islands in the promoter of STAT1 were screened in fresh tumor and paired peripheral blood lymphocytes (PBL) from the 16 SCCHN patients as well as SCCHN cell lines. Methylation of CpG islands in the promoter of STAT1 was found in 75% of 16 SCCHN tumors (p
<i>Notes from the Field</i>: Increase in Coccidioidomycosis — California, 2016
Authors: Gail Sondermeyer Cooksey, Alyssa Nguyen, Kirsten Knutson, Farzaneh Tabnak, Kaitlin Benedict, Orion McCotter, Seema Jain, Duc Vugia
Journal: MMWR Morbidity and Mortality Weekly Report (2017)

Coccidioidomycosis, or Valley Fever, is an infectious disease caused by inhalation of Coccidioides spp. spores (1). This soil-dwelling fungus is endemic in the southwestern United States, with most (97%) U.S. cases reported from Arizona and California (1,2). Following an incubation period of 1-3 weeks, symptomatic patients most often experience self-limited, influenza-like symptoms, but coccidioidomycosis also can lead to severe pulmonary disease and to rare cases of disseminated disease, including meningitis (1). Those at increased risk for severe disease include persons of African or Filipino descent, pregnant women, adults in older age groups, and persons with weakened immune systems (1). In 2016, a large increase in coccidioidomycosis incidence was observed in California compared with previous years (3). Using data reported by health care providers and laboratories via local health departments to the California Department of Public Health as of May 9, 2017, incidence rates were calculated by estimated year of illness onset as the number of confirmed coccidioidomycosis cases per 100,000 population (3). Estimated year of illness onset was extracted from the closest date to the time when symptoms first appeared for each patient. From 1995, when coccidioidomycosis became an individually reportable disease in California, to 2009, annual incidence rates ranged from 1.9 to 8.4 per 100,000, followed by a substantial increase to 11.9 per 100,000 in 2010 and a peak of 13.8 per 100,000 in 2011 (Figure). Annual rates decreased during 2012-2014, but increased in 2016 to 13.7 per 100,000, with 5,372 reported cases, the highest annual number of cases in California recorded to date.
2006년 대한간학회 학술연구기금 당선과제 결과 및 중간결과보고 : HBsAg (+)인 간경변증 환자의 간세포암종 발생에 있어 음주의 역할과 HBsAg (-), anti-HCV (-)인 알코올간경변환자의 간세포암종 발생에 있어 anti-HBc (+) 혹은 occult hepatitis B virus 감염의 의미
Authors: 권오상, 김연수, 김주현, 김상균, 김영석, 이정일, 이진우, 김영수, 천병철
Journal: Clinical and Molecular Hepatology (2007)