Miesten Superpesiksen kausi 2006

Miesten Superpesiksen kausi 2006 oli Suomen Pesäpalloliiton järjestämän pesäpallon korkeimman sarjatason Superpesiksen 17. kausi. Kausi alkoi 9. toukokuuta ja päättyi 24. syyskuuta 2006.
Suomen-mestaruuden voitti yhden välivuoden jälkeen Sotkamon Jymy, jolle mestaruus oli 11:s Superpesiksessä ja 12:s Suomen-mestaruus yhteensä. Jymy kukisti loppuottelusarjassa Pattijoen Urheilijat 3–2. Puijon Pesis otti seurahistoriansa ensimmäisen mitalin kukistamalla kerrasta poikki -menetelmällä käydyssä pronssiottelussa hallitsevan mestarin Kiteen Pallo -90:n jaksoin 1–0.
Kauden päätteeksi sarjasta putosi Kouvolan Pallonlyöjät ja sen tilalle nousi Seinäjoen Maila-Jussit. Alun perin sarjapaikkansa säilyttänyt Imatran Pallo-Veikot kuitenkin luopui sarjapaikastaan lokakuussa 2006. Sen seurauksena sarjaan nousivat sekä Kouvolan Pallonlyöjät että Jyväskylän Kiri. Kouvola nousi Imatran ja Kouvolan välisten neuvotteluiden seurauksena. Jyväskylä taas nostettiin siksi, että Imatran luopuessa sarjapaikastaan olisi kilpailumääräysten perusteella vapautunut paikka kuulunut Superpesiskarsinnan viidenneksi sijoittuneelle Kirille. Näiden päällekkäisyyksien vuoksi kaudella 2007 sarjassa pelasi poikkeuksellisesti 13 joukkuetta.
Joukkueet.
&lt;section begin="joukkueet"/&gt;
&lt;section end="joukkueet"/&gt;
Sarjajärjestelmä.
Runkosarjassa joukkueet oli jaettu kolmen joukkueen lohkoihin. Lohkojen sisällä pelattiin nelinkertainen sarja. Lisäksi pelattiin muiden yhdeksän joukkueen kanssa kaksinkertainen sarja. Kaikilla joukkueilla oli lisäksi kauden alussa yksi Finnair Stadionilla pelattu lisäottelu. Runkosarjassa pelattiin siis 27 ottelua joukkuetta kohden.
Runkosarjan kahdeksan parasta joukkuetta pelasi yksinkertaisen jatkosarjan, jonka neljä parasta etenivät pudotuspeleihin. Pudotuspelit ratkaistiin paras viidestä -järjestelmällä lukuun ottamatta pronssiottelua, joka ratkaistiin yhdessä ottelussa.
Runkosarjan neljä heikointa joukkuetta joutui karsimaan sarjapaikoista Ykköspesiksen neljää parasta joukkuetta vastaan Superpesiskarsinnassa. Myös Superpesiskarsinta pelattiin yksinkertaisena.
Lohkojako.
Seuraavat joukkueet kohtasivat toisensa neljästi runkosarjassa:
Lohko A
Lohko B
Lohko C
Lohko D
Jatkosarja.
Jatkosarjassa pelattiin yksinkertainen sarja. Runkosarjan kuusi parasta joukkuetta saivat hyvityspisteitä sijoituksensa perusteella (Sotkamo 6, Raahe 5, Kitee 3, Kuopio 2 ja Nurmo sekä Hyvinkää 1). Neljä parasta joukkuetta etenivät pudotuspeleihin.
Pudotuspelit.
Välieräparit muodostettiin jatkosarjan neljästä parhaasta joukkueesta siten, että sarjan voittaja kohtasi neljänneksi sijoittuneen ja toiseksi sijoittunut kolmanneksi sijoittuneen. Pudotuspelisarjojen voittoihin vaadittiin kolme osaotteluvoittoa paitsi pronssiottelussa, joka ratkaistiin yhdellä ottelulla. 
Superpesiskarsinta.
Superpesiskarsinnassa Superpesiksen runkosarjan neljä heikointa kohtasivat Ykköspesiksen neljä parasta joukkuetta yksinkertaisessa sarjassa. Neljä parasta saivat oikeuden pelata Superpesistä kaudella 2007.
Imatran Pallo-Veikot kuitenkin vetäytyi sarjasta lokakuussa 2006 luovuttaen paikkansa Kouvolan Pallonlyöjille. Lisäksi Suomen Pesäpalloliitto nosti Superpesikseen Superpesiskarsinnan viidennelle sijalle sijoittuneen Jyväskylän Kirin sarjaan kilpailumääräysten perusteella.