Genomas Africanos
Autor: Prós | Publicado: 2010-02-18T13:59:00-08:00

A capa da revista Nature publicada hoje com a sequência completa do genoma de mais dois seres humanos.Na edição de hoje da revista Nature foram publicados mais 2 genomas completos de seres humanos(!), além da sequência completa de todos os exons (exoma) de mais 3 indivíduos.No resumo do artigo que vem assinado por uma equipe multinacional, com pesquisadores dos Estados Unidos, Austrália, Namíbia e África do Sul, argumenta-se que a estrutura genética de indígenas caçadores-coletores habitando o sul da África é de grande importância para o estudo da diversidade genética humana, uma vez que estes indivíduos correspondem possivelmente à uma das mais velhas linhagens de seres humanos conhecidas. Estudos anteriores a este trabalho têm mostrado que os caçadores-coletores conhecidos como Khoisan, San ou Bushmen são geneticamente diferentes do resto dos outros humanos. Entretanto é esta a primeira vez em que genomas humanos inteiros desses indivíduos foram coletados e sequenciados. Abrindo aqui um parêntese divagatório, lembro-me de ter tido conhecimento sobre essa tribo indígena ao assistir ao excelente filme de comédia "Os deuses devem estar loucos".Os dois genomas humanos foram sequenciados num único trabalho, capa da Nature desta semana, que apresenta tanto o genoma de um indígena caçador-coletor do deserto de Kalahari (como o do filme supracitado) quando o genoma de um sul-africano da tribo Bantu, do sul da África. Este último indivíduo é o ganhador do prêmio Nobel da paz de 1984, clérigo e ativista dos direitos humanos na África Desmond Tutu. Foram encontrados nesses indivíduos 13,146 novas variantes aminoacídicas em posições protéicas e, de forma impressionante, foi observado que dois caçadores coletores do deserto de Kalahari têm tantas diferenças genéticas entre si quanto têm diferenças um Europeu e um asiático. Sendo a África o berço de dispersão e de diversidade genética de nossa espécie, isso poderia ser talvez esperado, uma vez que todas as espécies apresentam máxima diversidade em seu local de origem. Segundo os autores, as diferenças genômicas entre caçadores-coletores e outros seres humanos podem vir a permitir encontrar adaptações genéticas que estariam presentes em indivíduos vivendo da agricultura.O arcebispo e ativista dos direitos humanos Desmond Mpilo Tutu (1931-) da tribo Bantu (a maior do sul da África), cujo genoma foi completamente sequenciado e já se encontra hoje disponível para estudos.Como estamos aqui focados em NGS, vale notar que o genoma do indíviduo Kalahari foi sequenciado com cobertura de 10,2 vezes utilizando o sequenciador da Roche/454 GS FLX através da química Titanium, onde foram gerados reads de tamanho médio igual a 350 pares de bases. Foram utilizados para a produção desses dados insertos contendo clones de até 17Kb. Já o genoma do arcebispo Tutu foi sequenciado com cobertura de 30x utilizando a tecnologia de short-reads da Applied Biosystems, o SOLiD 3.0.Prometo dar uma lidinha com mais calma no artigo e voltar para comentar outras coisas que eu tenha achado interessantes. Para os interessados em ir diretamente à publicação original, ela pode ser acessada através deste link..: Referências Bibliográficas :. Schuster SC et al. Complete Khoisan and Bantu genomes from southern Africa. Nature 463, 943-947 (18 February 2010) | doi:10.1038/nature08795; Received 11 August 2009; Accepted 6 January 2010.