II Escola e Bioinformática Estrutural da Ulbra
Autor: Laboratório de Bioinformática Estrutural | Publicado: 2012-04-04T18:30:00-03:00

Programa preliminar





07/05 (10h às 12h) –&nbsp;Aula
Teórica:&nbsp;Introdução à Modelagem Molecular e à Bioinformática –
Definições básicas; o dogma central da biologia molecular, genômica,
proteômica, bioinformática modelagem molecular, bioinformática estrutural, quimioinformática.


LaBiE


07/05 (14h00min às 16h00min) –&nbsp;Aula
Teórica:&nbsp;Bioinformática: bancos de dados de seqüência, matrizes de
substituição, alinhamento de seqüências.


LaBiE


07/05 (16h30min às 19h00min) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;Bioinformática aplicada à Genômica e Proteômica. Homologia e
similaridade, análise de sequências, alinhamento par-a-par e pesquisa em bancos
de dados. Alinhamento múltiplo de sequências, árvores filogenéticas, perfis.


LaBiE


08/05 (9h00min às 13h00min) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;Bioinformática aplicada à Genômica e Proteômica. Homologia e
similaridade, análise de sequências, alinhamento par-a-par e pesquisa em bancos
de dados. Alinhamento múltiplo de sequências, árvores filogenéticas, perfis
(continuação).


LaBiE


08/05 (14h às 16h) –&nbsp;Palestra
I: BIOINFORMÁTICA nas Ciências
Biológicas e Biomédicas&nbsp;


Dra Ana Beatriz Veiga&nbsp; (UFCSPA)


08/05 (16h30min às 19h00min) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;Visualização de estruturas de proteínas e cálculo de
propriedades estruturais. Ferramentas encontradas na Web. Visualização e
classificação. Alinhamento estrutural.


LaBiE


09/05 (9h00min às 10h30min) –&nbsp;Palestra
II:&nbsp;Métodos experimentais de determinação da estrutura tridimensional
(3D) de macromoléculas biológicas: cristalografia de raios-X, RMN, limitações 


Dr. Rafael Andrade Caceres (PUCRS)


09/05 (10h30min às 13h00min) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;Visualização de estruturas de proteínas e cálculo de
propriedades estruturais. Trabalhando com o mapa de densidade eletrônica. 


LaBiE


09/05&nbsp; (14h às 18h) -&nbsp;Aula
Teórica:&nbsp;Modelagem Molecular, Métodos baseados na Química Quântica:
semi-empírico,&nbsp;ab initio, funcional de densidade. Métodos Baseados na
Mecânica Molecular. Minimização de energia. Análise conformacional. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 


Dr. Luiz Antônio Mazzini Fontoura (Ulbra)


10/05 (9h00min às 13h00min) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;programas&nbsp;ArgusLab&nbsp;e&nbsp;Gaussian;


minimização de energia e análise
conformacional.


LaBiE


10/05 (14h00min às 15h30min) –&nbsp;Palestra
III:&nbsp;Docking&nbsp;molecular.


LaBiE


10/05 (16h00min às 18h00min) –&nbsp;Palestra
IV:&nbsp;Screening&nbsp;virtual de fármacos. 


Dr. Walter Azevedo (PUCRS)


11/05 (9h00min às 13h00min) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;Programa&nbsp;AutoDock; Docking&nbsp;molecular.


LaBiE


11/05 (14h às 18h) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;Docking&nbsp;molecular (continuação).


LaBiE


14/05 (9h00min às 10h30min) –&nbsp;Palestra
V:&nbsp;Modelagem por homologia.


LaBiE


14/05 (11h00min às 13h00min) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;Introdução ao sistema operacional Linux.


LaBiE


14/05 (14h00min às 19h00min) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;Modelagem por homologia usando o programa&nbsp;Modeller


LaBiE


15/05 (8h30min às 12h30min)


15/05 (14h às 18h) 


16/05 (8h30min às 12h30min) –&nbsp;Aula
Teórica:&nbsp;Simulações por Dinâmica Molecular. 


Dr. Paulo Augusto Netz (UFRGS)


16/05 (14h às 18h) –&nbsp;Aula Prática:&nbsp;Simulações
por Dinâmica Molecular de um complexo fármaco-enzima.


LaBiE


17/05 (8h30min às 10h30min) –&nbsp;Palestra
VI:&nbsp;Princípios práticos de parametrização de ligantes.


LaBiE


17/05 (10h30min às 12h) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;Simulações por Dinâmica Molecular de um complexo
fármaco-enzima (continuação).


LaBiE


17/05 (12h às 18h) –&nbsp;Aula
Prática:&nbsp;Simulações por Dinâmica Molecular de um complexo
fármaco-enzima (final).


LaBiE


18/05 (8h30min às 10h30min) –&nbsp;Palestra
VII:&nbsp;Simulação por Dinâmica Molecular de Ácidos Nucléicos. 


Dr. Osmar Norberto de Souza (PUCRS)


18/05 (10h30min às 12h30min) –&nbsp;Palestra
VIII:&nbsp;


LaBiE


18/05 (14h00min às
16h00min) –&nbsp;Palestra IX:&nbsp;Simulações de Membranas
Biológicas&nbsp; 


Dr. Hubert Stassen (UFRGS)


18/05 (16h30min às 19h00min) –&nbsp;Palestra
X:&nbsp;Simulações ADMET (Absorção, Distribuição, Metabolização e
Toxicidade).

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