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Plus que tout autre secteur économique, l'agriculture est tributaire de son environnement. Que ce soit sous la forme de sols fertiles et poreux, de la présence d'insectes qui assurent la pollinisation, ou sous la forme d'eau en suffisance et de qualité pour répondre à ses besoins. L'utilisation de produits phytosanitaires comporte des risques potentiels pour l'environnement. Les risques et les bénéfices doivent être soigneusement évalués avant leur utilisation pour la protection des cultures. Le principe de base de l'agriculture suisse est le suivant : aussi peu de produits phytosanitaires que possible, mais autant que nécessaire. Les exploitations sont tenues de respecter les "bonnes pratiques agricoles" conformément à l'ordonnance sur les produits phytosanitaires (art. 61). L'application systématique des bonnes pratiques agricoles peut réduire considérablement la pollution de l'environnement, et protéger ainsi les eaux, la biodiversité et les sols.