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Biofilter bestehen aus einer Masse organischen Materials (Torf, Kompost, Heidekraut, Rinde oder Mischungen davon), die normalerweise 1,0 bis 1,5 m dick ist. Im Bett wird eine bakterielle Mikroflora ausgewählt und entwickelt, die in der Lage ist, die Moleküle der in der zu behandelnden Luft enthaltenen Schadstoffe (organische und anorganische) abzubauen und zu mineralisieren. Das Funktionsprinzip des Biofilters ist daher die Metabolisierung von Schadstoffen (insbesondere Gerüchen) durch die im Bett lebenden Bakterien.