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Die portugiesische Regierung anerkannte 1815 die Neutralität der Schweiz. Aus dieser Zeit stammen die konsularischen Beziehungen zwischen den beiden Ländern, auch wenn das erste entsprechende Abkommen erst 1883 unterzeichnet wurde.
1817 eröffnete die Schweiz in Lissabon ein Konsulat, das 1874 in ein Generalkonsulat umgewandelt wurde. Eine diplomatische Kanzlei der Schweiz in der portugiesischen Hauptstadt folgte 1936; sie wurde 1945 zur Legation, und 1959 zur Botschaft aufgewertet. Portugal richtete das erste Konsulat in der Schweiz 1855 in Genf ein. Von 1892 an bestand in Bern eine portugiesische Legation, die 1959 durch eine Botschaft abgelöst wurde.
Die Zugehörigkeit beider Länder zur European Free Trade Association (EFTA) förderte 1960–1985 die zwischenstaatlichen Beziehungen. 1963–75 vertrat der Bund die portugiesischen Interessen in Senegal.
Ab 1977 vertieften sich die gegenseitigen Besuche. 2003 reisten Bundespräsident Pascal Couchepin, 2004 und 2006 Bundesrat Samuel Schmid und 2007 Bundespräsidentin Micheline Calmy-Rey zu den portugiesischen Amtskollegen. Am 17./18. Oktober 2016 weilte Präsident Marcelo Rebelo de Sousa für einen Staatsbesuch in der Schweiz, woraufhin am 28./29.11. 2017 ein Staatsbesuch in Lissabon von Bundespräsidentin Doris Leuthard folgte.
Portugal, Historisches Lexikon der Schweiz