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Les commissions extraparlementaires peuvent se composer de membres d’organisations du monde politique, de l’économie et de la société. L’administration bénéficie ainsi de leur expertise. Environ 15 commissions conseillent l’OFSP sur les questions de santé.
La CFV agit en tant qu’organe consultatif auprès du Conseil fédéral, du Département fédéral de l’intérieur (DFI) et de l’Office fédéral de la santé publique (OFSP) pour toutes les questions en lien avec la vaccination.
Le Conseil fédéral et lʼadministration fédérale consulte la CFANT pour les questions fondamentales liées aux addictions et à la prévention des maladies non transmissibles ainsi que pour les affaires politiques dans ces domaines.
La CPR a été fondée le 1er janvier 2001. Elle découle d'une fusion de la Commission fédérale de protection contre les radiations (CFR) et de la Commission fédérale pour la surveillance de la radioactivité (CFSR).
La Commission des professions de la psychologie conseille le Conseil fédéral et le département sur la loi sur les professions de la psychologie (LPsy) et statue sur la reconnaissance des diplômes et des titres postgrades étrangers.