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Depuis le début de l' urgence du coronavirus , plus de 627 millions de cas de personnes atteintes de la maladie COVID-19 ont été signalés. Plus de 6,5 millions de personnes sont mortes. Parmi les personnes guéries, il y a des patients avec différentes séquelles. Une nouvelle étude scientifique menée par des chercheurs de la Grossman School of Medicine de l'Université de New York, aux États-Unis, publiée dans la revue scientifique Nature, a révélé que le coronavirus peut altérer le microbiome des patients. C'est-à-dire qu'il réduit les bactéries bénéfiques et augmente les plus dangereuses .
Le microbiome est la communauté de micro-organismes (tels que les champignons, les bactéries et les virus) qui existent dans un environnement donné. Chez l'homme , il comprend les micro-organismes qui vivent dans ou sur une partie particulière du corps, comme la peau ou le tractus gastro-intestinal. Ces groupes de micro-organismes sont dynamiques et changent en réponse à différents facteurs environnementaux , tels que l'exercice, l'alimentation, les médicaments et d'autres expositions .
Désormais, des chercheurs de différentes institutions américaines ont découvert que l'infection par le coronavirus SARS-CoV-2 peut réduire le nombre d'espèces bactériennes dans l'intestin d'un patient . Cette faible diversité crée un environnement favorable au développement de microbes dangereux, ont-ils rapporté dans la revue Nature Communications .
L'étude est basée sur la découverte que l'utilisation généralisée d'antibiotiques pour combattre les infections a permis aux individus d'espèces de micro-organismes plus résistants de survivre plus longtemps. De plus, des altérations des ratios de bactéries intestinales ont déjà été liées à un COVID-19 plus grave.
Cependant, selon les chercheurs, jusqu'à présent, on ne savait pas laquelle venait en premier, l'infection à coronavirus qui altérait le microbiome intestinal ou un intestin déjà affaibli qui rendait le corps plus vulnérable au virus. La nouvelle étude semble privilégier la première explication.
La recherche a également révélé que les espèces résistantes aux antibiotiques peuvent passer dans la circulation sanguine. Cette altération augmente le risque d'infections secondaires potentiellement mortelles chez les patients.
Il s'agit d'un travail qui a été mené par des chercheurs de la Grossman School of Medicine de l'Université de New York. Nous avons inclus 96 hommes et femmes hospitalisés avec COVID-19 en 2020 à New York et New Haven, Connecticut . Les résultats ont montré que la plupart des patients avaient une faible diversité du microbiome intestinal, avec un quart complet dominé par un seul type de bactérie. Dans le même temps, les populations de plusieurs microbes connus pour inclure des espèces résistantes aux antibiotiques ont augmenté, probablement en raison de l'utilisation généralisée d'antibiotiques au début de la pandémie.
Ces bactéries résistantes aux antibiotiques trouvées dans l'intestin se sont également avérées avoir migré dans la circulation sanguine chez 20% des patients. Les auteurs de l'étude notent que des recherches supplémentaires sont nécessaires pour déterminer pourquoi ce groupe présentait un risque accru d'infection secondaire, tandis que d'autres restaient protégés.
"Nos résultats suggèrent que l'infection à coronavirus interfère directement avec l'équilibre sain des microbes dans l'intestin, mettant en danger les patients dans le processus", a déclaré le co-auteur de l'étude et microbiologiste Ken Cadwell. "Maintenant que nous avons découvert la source de ce déséquilibre bactérien, les cliniciens peuvent mieux identifier les patients atteints de coronavirus qui sont les plus à risque d'infection secondaire du sang", a ajouté Cadwell.
L'étude est la première à montrer que l'infection à coronavirus seule , et non l'utilisation initiale d'antibiotiques pour traiter la maladie comme le pensaient d'autres experts, endommage déjà le microbiome intestinal, a déclaré Cadwell, qui est également professeur aux départements de microbiologie et de médecine de la santé. Langon New York. Il a ajouté que l'étude fournit également la première preuve que les mêmes bactéries intestinales pénètrent également dans la circulation sanguine des patients et peuvent provoquer des infections dangereuses.
Pour la recherche, les scientifiques ont d'abord infecté des dizaines de souris avec le coronavirus et analysé la composition des espèces bactériennes dans leurs échantillons de selles. Cette étape leur a permis de déterminer si le coronavirus pouvait modifier directement le microbiome indépendamment de l'hospitalisation et du traitement.
Ils ont ensuite collecté des échantillons de selles et des tests sanguins de patients COVID-19 dans les hôpitaux Langone Health New York et Yale University pour évaluer la composition du microbiote intestinal et la présence d'une infection secondaire. Si un groupe de bactéries constituait la majorité de celles vivant dans l'intestin, il était considéré comme dominant.
"Nos résultats mettent en évidence la façon dont le microbiome intestinal et les différentes parties du système immunitaire du corps sont étroitement interconnectés", a déclaré l'auteur principal de l'étude, le Dr Jonas Schluter, professeur agrégé au Département de microbiologie de NYU Langone et membre de son Institut de génétique des systèmes. . "Une infection dans l'un de ces systèmes peut provoquer des perturbations importantes dans l'autre."
Schluter a averti que parce que les patients ont reçu différents types de traitements pour leur maladie, la recherche n'a pas été en mesure de tenir pleinement compte de tous les facteurs qui peuvent avoir contribué à modifier leur microbiome et à aggraver leur maladie.
Ils prévoient d'examiner à l'avenir pourquoi certaines espèces microbiennes sont plus susceptibles de s'échapper de l'intestin pendant le COVID-19. Les chercheurs disent qu'ils ont également l'intention d'explorer comment différents microbes interagissent, un facteur qui peut contribuer à leur migration dans la circulation sanguine.
L'étude a été financée par les National Institutes of Health. Yale School of Public Health, Beatrice Kleinberg Neuwirth Fund, Howard Hughes Medical Institute, Crohn's and Colitis Foundation, Kenneth Rainin Foundation, Judith and Stewart Colton Center for Autoimmunity, Jan Vilcek Scholarship Endowment Funds/David Goldfarb, the G. Harold and Leila Y. La Mathers Charitable Foundation, le Yale COVID-19 Research Resource Fund et la Bristol Meyers Squibb Foundation ont également apporté des fonds.
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