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Comme l'ont souligné les spécialistes de ce document , parler d' une seule souche et omettre la variation génétique du virus peut avoir de graves conséquences sur la planification et la réponse de santé publique. Compte tenu des multiples variations au sein de chaque infection individuelle, il est important de rapporter une représentation plus complète des séquences génétiques virales.
Dans ce travail, les scientifiques du CWRU ont analysé les données épidémiologiques de 360 patients dont les infections virales ont été génétiquement séquencées. Peter Zimmerman, professeur au Département de pathologie de la CWR School of Medicine et auteur principal de l'article, a déclaré: «La concentration et le consensus majoritaire vers une seule variante du virus détournent l'attention de la variation génétique que nous avons trouvée. Ceci peut contribuer de manière significative à l' évolution continue de la pandémie COVID-19. »
Selon ce groupe de spécialistes, avoir découvert que chaque contagion de coronavirus comprend plus d'une variante peut conduire à comprendre comment ces changements génétiques se propagent et interagissent potentiellement avec d'autres conditions chez les patients.
Dans ce cadre, l'équipe de recherche du CWRU a effectué le séquençage complet du génome des virus SARS-CoV-2 de 250 patients dans le nord-est de l'Ohio, aux États-Unis , et a utilisé des données similaires de 110 autres patients. Cette dernière a été rendue possible grâce aux informations génomiques fournies par des collaborateurs de recherche internationaux.
Les données en question ont été recueillies durant les premiers jours de la pandémie. Selon ces experts, les mutations trouvées dans Omicron BA.1 et Omicron BA.2 étaient déjà présentes, sous forme de variations relativement mineures, au moins un an avant qu'elles ne deviennent une préoccupation pour le système de santé et pour la société.
De cette manière, les scientifiques du CWRU ont confirmé que toutes les personnes, lorsqu'elles infectent les autres , transmettent plus d'une variante présente à des degrés différents dans leur charge virale. Cette analyse s'est concentrée sur la notification de la présence de la mutation avec la charge la plus élevée dans chaque échantillon, mais cela ne signifierait pas qu'elle serait la seule variable présente chez le patient analysé.
« Notre travail attire l'attention sur la complexité des maladies infectieuses, ce qui est souvent simplifié à l'excès lorsque seul le virus le plus abondant dans une contagion est pris en compte. Nous démontrons et soulignons l'importance d'examiner toutes les variations qui ont été historiquement considérées comme du simple bruit », a complété Ernest Chan , directeur du noyau de bioinformatique à la Case Western Reserve School of Medicine . "Nous voyons que les variants génétiques observés à faible fréquence dans les infections par le SRAS-CoV-2 peuvent être des indicateurs précoces de souches nouvelles et futures responsables de vagues ultérieures de transmission et de contagion", a conclu l'expert.
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