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Pharynx définitif: Dérivés des 3ème et 4ème arcs pharyngiens
Vus de l'extérieur, les 3ème et 4ème arcs pharyngiens ne sont jamais aussi proéminents que les 1er et 2ème arcs. En particulier l'arc hyoïdien (2ème arc pharyngien) dont l'expansion rapide va recouvrir totalement les 3ème et 4ème arcs (operculum).
Thymus
Le thymus se forme à partir des 3ème (gemma thymica major) et 4ème (gemma thymica minor) poches pharyngiennes situées de chaque côté du cou au fond du sinus cervical.
Les parties endodermiques de l'ébauche thymique croissent bilatéralement sous forme d'évagination ventrale à l'extrémité des poches pharyngiennes (les glandes parathyroïdes se développent quant-à elles à l'extrémité dorsales) et envahissent le mésenchyme sous-jacent. Lorsque les poches pharyngiennes perdent leurs connexions avec la surface, elles entraînent également avec elles du tissu ectodermique issu du sinus cervical voisin et destiné à entourer les cordons épithéliaux endodermiques. La fusion des ébauches des 3ème et 4ème poches pharyngiennes respectivement des dérivés du sinus cervical, sera à l'origine d'un organe thymique unique bilobé situé dans le médiastin antéro-supérieur.
Glande parathyroïde et corps ultimobranchial
Les glandes parathyroïdes se développent initialement à partir d'expansions épithéliales bilatérales dorsales des 3ème et 4ème poches pharyngiennes. Peu de temps après se forment des cordons épithéliaux solides, les corpuscules épithéliaux, qui se déplacent en direction caudale avec la descente du coeur.
Les ébauches à partir des 3ème poches pharyngiennes, [partie la plus volumineuse du thymus (Gemma thymica major) et les glandes parathyroïdes inférieures], croissent plus rapidement et se déplacent plus caudalement que celles des 4ème poches pharyngiennes [partie la moins volumineuse du thymus (Gemma thymica minor) et les glandes parathyroïdes supérieures]. Cela explique pourquoi les glandes parathyroïdes supérieures n'atteignent que le pôle supérieur de la thyroïde médiane (stade 17, env. 41 jours), alors que les glandes parathyroïdes inférieures - issues de la 3ème poche pharyngienne - atteignent son pôle inférieur (stade 19, env. 46 jours).
L'ébauche du corps ultimobranchial provient d'une invagination ventrale de la 4ème poche branchiale qui se détache de la paroi pharyngienne pour migrer dans la paroi dorsale de la glande thyroïde où elle se différenciera en cellules parafolliculaire (ou cellules C) productrices de calcitonine et de somatostatine.