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La dottoressa ha assolto i suoi studi in medicina all'Università di Zurigo e all'Universita di Montpelier (F).
Ha ricevuto il titolo di medico nel 1999.
È stata promossa nel 2000 all'Università di Zurigo con il dottorato e la tesi "Il cambiamento del ciclo dell'emoglobina relativo misurato al fundus".
È stata medico assistente e capo-clinica per conseguire la specializzazione in Oftalmologia e Oftalmochirurgia al Triemlispital di Zurigo, alla Clinica Universitaria di Zurigo e all'Ospedale Regionale di Lugano, dove ha lavorato per tre anni come capo-clinica (2004 -2007).
Nel 2004 ha ricevuto il titolo di European Board of Ophtalmology a Parigi, e sempre nel 2004 ha eseguito l'esame per il conseguimento del titolo FMH in Oftalmologia a Berna. Nel 2007 ha ricevuto il titolo FMH in Oftalmochirurgia a Berna.
Nello stesso tempo ha effettuato diversi interventi umanitari presso gli ospedali oftalmologici del Nepal e dell'India e ha seguito dei corsi presso l'Università di Standford (USA).
Considerato il suo speciale interesse per l'oculoplastica, ha eseguito diverse visite e approfondimenti in materia presso le cliniche specializzate di Glasgow (UK) e di Treviri (D).
Nel 2007 ha aperto lo studio medico a Locarno e da allora svolge l'attività di medico aggiunto all'ospedale Regionale di Lugano, dove esegue gran parte degli interventi.
Nel 2014 ha conseguito il diploma della SIM (Swiss Insurance Medicine).
Nel 2016 ha completato il Postgraduate Diploma in Cataract and Refractive Surgery (University of Ulster, UK)
Inoltre la Dr.ssa Naef è regolarmente impegnata in progetti di aiuto per l'Asia e per l'India.