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L'endobrachysophage (EBO) est caractérisé sur le plan endoscopique par le remplacement de la muqueuse malpighienne de l'extrémité distale de l'sophage par une muqueuse glandulaire, et sur le plan histologique, par la présence au sein de cette métaplasie d'un épithélium spécialisé de type intestinal. Cette définition nouvelle ne tient plus compte de la hauteur de l'EBO. Le diagnostic endoscopique d'EBO peut être difficile en cas de hernie hiatale, d'sophagite ou de sténose peptique. Des techniques visant à identifier au cours de l'endoscopie les foyers de métaplasie intestinale ou à détecter les lésions de dysplasie sont en cours d'évaluation : coloration au bleu de méthylène, endoscopie grossissante. Ces techniques visent à améliorer les performances diagnostiques de l'endoscopie par un meilleur ciblage des zones à biopsier.