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Ebenso wie manche Bakterien, spielen Hefen und Schimmelpilze bei der Herstellung von Lebensmitteln z. B. von Bier, Wein, Käse und Backwaren eine wichtige Rolle. Einige Vertreter sind in bestimmten Herstellungsprozessen jedoch unerwünscht, da sie zu Fehlaromen führen, die Haltbarkeit der Lebensmittel beeinträchtigen oder auch ernste gesundheitliche Probleme der Konsumenten verursachen können. Die Überwachung der Produktionsprozesse hinsichtlich dieser Mikroorganismen ist daher notwendig.