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Si la Suisse est exempte de la plupart des maladies infectieuses (hautement contagieuses) des animaux d'élevage grâce à des activités intensives de contrôle et de surveillance, l'incidence des maladies de la production n'a guère diminué, malgré des efforts intensifs. Dans le même temps, il existe un risque croissant de transfert d'agents pathogènes par le commerce international ainsi qu'à partir de réservoirs situés en dehors des exploitations agricoles, comme les espèces sauvages. Pour relever ces défis, il faut une collaboration étroite entre la recherche fondamentale (physiologie et pathologie animales, diagnostics, recherche sur les maladies de la faune sauvage), la recherche au niveau des troupeaux (grandes cliniques vétérinaires, gestion de la santé des troupeaux) et les approches de médecine des populations (épidémiologie, surveillance), ainsi que des contributions d'autres disciplines telles que les sciences sociales.
La recherche de l'axe est centrée sur la surveillance et le contrôle des maladies infectieuses et de production chez les animaux, tant au niveau des exploitations que des populations. Pour atteindre ces objectifs, le Focus intègre les différentes expertises et disciplines, et propose et met en œuvre des solutions. Ce dernier aspect, en particulier, exige une participation importante de la recherche translationnelle.