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Suivant la forme et la cause de la dysphagie, plusieurs méthodes thérapeutiques peuvent être prises en compte.
La thérapie de la déglutition orientée à un niveau fonctionnel se doit d'utiliser des exercices dont l'efficacité a été prouvée dans des cas spécifiques.
Pharmacothérapie: par exemple en cas de reflux gastro-oesophagien, hyper- ou hyposalivation ou dysfonction du sphincter supérieur de l'oesophage.
Procédés chirurgicaux: comme myotomie crico-pharyngée, PEG, trachéotomie
Il existe plusieurs concepts de thérapie orientée à un niveau fonctionnel. Les plus importants sont la prise en charge fonctionelle de la déglutition et F.O.T.T. Pour certains groupes de patients
ou d'autres troubles, il existe d'autres traîtements comme la thérapie d'après Castillo Morales, l'électrostimulation ou la PNF (facilitation proprioceptive neuromusculaire).