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Une forme un peu moins connue du clonage est la régénération, pratiquée par exemple par certaines sortes d'étoiles de mer. Lorsque l'on coupe un bras à une étoile de mer, de nouvelles étoiles de mer vont se former à partir des deux parties du corps. On assiste, chez le lézard, à la même capacité mais de façon atténuée: si, par exemple, l'on arrache la queue d'un lézard en fuite, il va s'en former une nouvelle. Toutefois, il ne se formera pas de nouveau lézard à partir de la queue arrachée. Plus les organismes sont supérieurs, plus petite sera leur capacité de régénération. Chez les oiseaux et les mammifères, elle est limitée à la cicatrisation d'une plaie et à la guérison des fractures.