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La prise en charge de la transposition des gros vaisseaux a beaucoup changé au cours des dernières décennies. De nouvelles techniques de diagnostic sont utilisées et les interventions chirurgicales se sont améliorées. Ceci a amené à une augmentation des survivants à long terme qui nécessitent un suivi spécialisé. Les complications à long terme chez ces patients nécessitent des approches spécifiques, par pharmacothérapie, cathétérisme cardiaque interventionnel ou chirurgie. Ces séquelles complexes impliquent que les patients avec transposition des gros vaisseaux ne sont jamais complètement guéris et auront probablement une espérance de vie limitée.