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Saliva or Nasopharyngeal Swab Specimens for Detection of SARS-CoV-2
Anne L. Wyllie, Ph.D. Yale School of Public Health, New Haven, CT and al - DOI: 10.1056/NEJMc2016359
Réviseur : Pr Jean-François Balavoine
Des tests de diagnostic rapides et précis sont essentiels pour contrôler la pandémie de Covid-19. Bien que la norme actuelle implique l'analyse d'échantillons sur écouvillon nasopharyngé par PCR pour détecter le SRAS-CoV-2, les échantillons de salive pourraient être un autre type de prélèvement adéquat pour le diagnostic. Cette étude s’intéresse à la comparaison des deux méthodes.
Un total de 70 patients hospitalisés atteints de Covid-19 ont fourni le cadre de l’étude. Après confirmation de l’infection par un échantillon sur écouvillon nasopharyngé, des échantillons supplémentaires nasopharyngés et salivaires des patients ont été prélevés.
L’analyse a démontré la présence de plus de copies d'ARN du SRAS-CoV-2 dans les échantillons de salive que dans l’échantillon sur écouvillon nasopharyngés.
En outre, un pourcentage plus élevé d'échantillons de salive sont restés positifs au court du temps en comparaison avec les échantillons sur écouvillon nasopharyngé. Ces résultats suggèrent que les échantillons de salive ont au moins une sensibilité similaire que les échantillons sur écouvillon nasopharyngien dans la détection du SRAS-CoV-2 au cours de l'hospitalisation. L’analyse des variations de la concentration d’ARN au cours de l’évolution clinique a mis en évidence des fluctuations moins importantes dans la salive que dans les prélévements nasopharyngés.
Dans trois cas, un échantillon d'écouvillon nasopharyngé négatif a été suivi d'un écouvillon positif lors de la prochaine collecte d'un échantillon. Ce phénomène ne s'est produit qu'une seule fois avec les échantillons de salive.
L’étude s’est aussi intéressée à des personnes asymptomatiques. 495 agents de santé asymptomatiques ont fourni du matériel pour tester à la fois des échantillons de salive et de nasopharynx. Sur 13 agents de santé positifs lors de l’examen salivaire, 9 avaient collecté des échantillons sur écouvillon nasopharyngien appariés le même jour, et 7 de ces échantillons se sont révélés négatifs Le diagnostic des 13 agents de santé a été confirmé par la suite par des tests diagnostiques d'échantillons nasopharyngés supplémentaires.
Les moyens de diagnostic évoluent et il est important de souligner un apport prometteur d’un prélèvement salivaire plus aisé à pratiquer et mieux accepté des patients que les frottis nasopharyngés actuels.