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A la différence de la recherche fondamentale (réalisée en laboratoire avec des tissus et des animaux), les recherches que mènent les HUG sont orientées patient et sont appelées recherches cliniques. Elles s'effectuent avec des volontaires humains. Le but de ces études cliniques est d'évaluer l'innocuité et l'efficacité d'une méthode de diagnostic ou d'un traitement et d'améliorer la connaissance des médecins sur une pathologie ou une discipline de santé.
Ci-dessous, les domaines dans lesquels sont actuellement menées des études cliniques: