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Le grand avantage de la thermo-ablation par rapport aux médicaments est qu'il s'agit le plus souvent d'un traitement curatif, permettant d'éliminer les causes de l'arythmie, tandis que les médicaments ne peuvent que diminuer ou bloquer le phénomène, sans le guérir. Lorsque le traitement est réussi, il conduit à une amélioration importante de la qualité de vie du patient.
En plus d'améliorer la qualité de vie, l'ablation par cathéter présente aussi des avantages du point de vue économique: si l'on fait le compte des frais de traitement d'une maladie sur plusieurs années, une intervention unique, même chère à première vue, sera au bout du compte plus économique que la prise de médicaments et les visites chez les médecins pendant cette période.