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Les Musée et jardins botaniques cantonaux ont été créés en 1824 déjà. Leurs missions consistaient à conserver les collections botaniques vaudoises, à les étudier et à publier les résultats de ces études, à les faire connaître à la population et à tenir à jour l’inventaire de la flore cantonale. Les collections emplissent 2000 mètres de rayonnages et présentent aussi bien des plantes à fleurs et des fougères que des algues, des mousses et lichens, des champignons, des graines et des pollens, des portraits de botanistes et des herbiers historiques, des manuscrits et des archives. Il possède une collection d'herbiers peints, dont le plus ancien est celui de Rosalie de Constant, datant de la fin du XVIIIe siècle et du début du XIXe. Celui de Marie Mousson a été réalisé au milieu du XIXe siècle, alors que les autres sont contemporains (Pierre Boven, Florian Cosandey, Henri Waridel). La bibliothèque du musée contient quelque 35'000 titres et plus de 800 périodiques spécialisés. Le Musée botanique cantonal n’est pas une simple exposition. Il joue un rôle majeur dans la protection de la flore du canton en dressant la liste des plantes rares et des espèces menacées. Il expose ses collections in situ à l’aide de deux jardins botaniques, le premier situé en pleine ville de Lausanne, sur la colline de Montriond, l’autre niché au fond d’un vallon alpin, à Pont-de-Nant (1260 m).