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Les récents progrès dans les techniques séquençage de l’ADN ont permis au cours de la dernière décennie de réaliser une cartographie presque complète des régions du génome qui régulent l’expression des gènes. Cependant, les mécanismes qui permettent l’activation de ces régions du génome à un temps précis du développement d’un organisme sont mal compris. Par exemple, la fixation coordonnée de facteurs de transcription est vue comme un évènement décisif dans l’activation d’un gène. Cependant, la résolution des techniques actuelles ne permet pas la mesure des interdépendances entre les facteurs de transcription pour se fixer sur le génome (coopérativité ou antagonisme).
Ce projet a pour but de développer une nouvelle méthodologie qui permet la mesure de la fixation des facteurs de transcription à la résolution de molécules d’ADN individuelles sur le génome entier. Dans un premier temps, cette technique sera utilisée pour déterminer les dépendances qui existent dans le réseau de facteurs de transcription qui contrôlent la pluripotence des cellules souches embryonnaires. Dans un second temps, la dynamique de ce réseau lors de la différentiation des cellules souches en neurones sera étudiée. Les conclusions de ce projet contribueront à notre compréhension des mécanismes complexes utilisés par les facteurs de transcription pour réguler précisément l’expression des gènes lors de transitions cellulaires.
Le projet relève de la recherche fondamentale. La compréhension fine de des mécanismes de régulation par les facteurs de transcription à des retombées potentielles sur des champs de recherche très variés. Par exemple la manipulation de l’expression des gènes par les facteurs de transcription est à la base de la génération de cellules souches induites utilisées pour les approches de régénération cellulaires.