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Les attentes de la société en matière de détention des animaux de rente sont très élevées en ce qui concerne la santé animale et le respect de la dignité de l'animal. La santé animale au sens le plus large du terme désigne la santé physique et psychique d'un animal de rente. Le champ de recherche concerne principalement l'étude des mesures préventives visant à promouvoir la santé des animaux d'élevage. Elle inclut la recherche sur le comportement, les conditions de détention ainsi que la caractérisation des caractères génétiques relatifs à la santé. Dans le cas des abeilles, vient s’ajouter l'aspect de la lutte contre des maladies spécifiques
La détention et l'utilisation des animaux se trouvent dans un champ de tension entre les exigences sociales et une production durable, adaptée au site et rentable pour les exploitations agricoles. L'objectif est la détention d’animaux de rente en bonne santé, capables de fournir des performances optimales en matière de production de lait et de viande, de pollinisation, d’entretien et d'utilisation du paysage. Les activités de recherche sont axées sur le contrôle et le développement de systèmes d'élevage respectueux des animaux, l'analyse de l'impact de facteurs environnementaux et de pratiques agricoles potentiellement nuisibles, des conditions et de l'intensité d'utilisation, des limitations aux comportements naturels sur la santé des animaux de rente (y compris les abeilles et les chevaux) ainsi que sur les pratiques d'alimentation conformes aux besoins.