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Grazie a diversi livelli di barriere, i depositi in strati geologici profondi devono garantire la protezione dell'uomo e dell'ambiente sul lungo periodo. Le scorie radioattive devono essere smaltite in modo tale da non imporre oneri e obblighi inaccettabili alle future generazioni. Nel corso dell'operazione di stoccaggio, la liberazione dei radionuclidi non può superare una dose individuale superiore a 0,1 millisievert (mSv) l'anno, un valore che rappresenta alcuni punti percentuali dell'esposizione media alle radiazioni di origine naturale.
La sicurezza a lungo termine del deposito in strati geologici profondi è garantita da diverse barriere. Grazie alle barriere tecniche e alla roccia ospitante scelta (barriere naturali) le scorie sono completamente isolate. Gran parte delle sostanze radioattive decadono nel periodo in cui i contenitori delle scorie sono ancora intatti. I minerali argillosi per il riempimento delle caverne (bentonite) e la roccia fissano eventuali particelle di sostanze nocive che dovessero fuoriuscire.