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Die aus EPA hergestellten Leukotriene Serie 5 sind die Gegenspieler der Leukotrienen Serie 4 aus AA. Leukotriene Serie 4 begünstigen als Mediatoren entzündliche und allergische Reaktionen. Das Blut besteht aus vielen kleinen Plättchen. Die AA wirkt indirekt verklebend auf die Blutplättchen, resp. blutverdickend, was nicht erwünscht ist. Im Gegensatz wirkt die EPA positiv und im übertragenen Sinne blutverdünnend. Beide sind an der Regulation des Blutdrucks beteiligt und haben Einfluss auf die Blutgerinnung. AA und EPA wirken indirekt über die Prostaglandine auf die Funktion der glatten Muskulatur und die Muskulatur der Gebärmutter. Am Darm kommt es unter Prostaglandin E zu einer Relaxation, während Prostaglandin F die Kontraktion des Darmes stimuliert. Prostaglandine greifen auch regulierend in die Sekretionsabläufe, insbesondere am Magen und Darm, ein und sind mitbeteiligt beim Zustandekommen der verschiedensten entzündlichen Gewebsreaktionen. Die Omega-3 Fettsäure EPA hat hier eine wichtige schützende Wirkung.
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