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La bactérie Staphylococcus aureus, aussi connue comme Staphylocoque doré, est présente dans les narines de 20 à 30% de la population sans causer des problèmes. Cependant dans certains cas, cette bactérie opportuniste peut être la source de problèmes qui vont d‘infections cutanées comme des furoncles, jusqu’à des infections systémiques et graves, comme les ostéomyélites, endocardites, chocs toxiques ou sepsis. Pour survivre en compétition avec d’autres bactéries dans les narines ou lors d’une infection, la bactérie doit adapter l’expression de facteurs de virulence. Dégrader des ARNs pour changer l’expression ou réguler la traduction des ARN messagers, ARNm, sont des mécanismes qui sont rapidement suivit d’effets.
Notre laboratoire étudie depuis de nombreuses années des hélicases à ARN de la famille à boîte DEAD, nommée selon un motif d’acides aminés présents dans les protéines de cette famille. Nous avons pu démontrer que l’hélicase CshA est impliquée dans la dégradation de l’ARN, en faisant partie d’une machinerie qu’on appelle chez les bactéries le dégradosome. En utilisation des cribles génétiques, le séquençage de l’ARN, et la génétique moléculaire, nous avons montré qu’en absence de cette hélicase, l’ARNm de la pyruvate déshydrogénase est stabilisé ce qui entraine un déséquilibre d’acides gras dans la membrane. Nous sommes actuellement en train d’analyser cet effet plus en détail.
L’autre hélicase à ARN de la famille à boîte DEAD est CshB. En absence de CshB l’ARNm d’une protéine, MpfA, impliquée dans l’export du magnésium, est surabondant, ce qui entraine une croissance réduite à basse température. En utilisant des cribles génétiques nous avons pu identifier deux protéines impliquées dans l’export du magnésium, et trois protéines impliquées dans l’import du magnésium. Au jour d’aujourd’hui nous ne connaissons cependant pas les détails mécanistiques qui sont responsables de la surabondance de cet ARNm codant pour MpfA. Notre projet porte sur une caractérisation détaillée de la fonction de CshB dans le métabolisme de cet ARNm et des ARN de S. aureus en générale et de détecter des cibles directes de CshB et CshA.