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Depuis son apparition en novembre 2021, la variante Omicron du coronavirus s'est imposée comme dominante dans le monde. Non seulement à cause de sa grande capacité de contagion, mais aussi à cause de sa prédominance et de la capacité qu'elle avait à générer plusieurs sous-variantes , encore plus contagieuses. Bien que les variantes Alpha, Gamma et Delta du COVID-19 ne circulent plus parmi les humains, elles continuent de se propager dans le règne animal.
Au 31 décembre 2022, un total de 699 épidémies de SRAS-CoV-2 avaient été enregistrées dans 26 espèces animales de 36 pays des Amériques, d'Afrique, d'Asie et d'Europe, y compris des chats, des chiens, des lions et des visons. , selon à un rapport de l' Organisation mondiale de la santé animale (OMS) qui recueille toutes les données enregistrées dans le monde sur les espèces animales touchées par le SRAS-CoV-2 au cours de l'année 2022.
"Bien que le principal moteur de la propagation communautaire et internationale de la pandémie actuelle soit la transmission de personne à personne, les cas d'infection par le virus SARS-CoV-2 chez les animaux, bien qu'ils restent occasionnels, continuent d'augmenter", a déclaré l'OMSA. .
Vacciner les animaux de compagnie et de ferme
En décembre de l'année dernière, 7 foyers ont été enregistrés dans 5 pays (Canada, Estonie, Italie, Mexique et Suisse) chez 4 espèces animales (chats, chiens, lions et visons d'Amérique).
L'OMSA a inclus dans son rapport quelques conclusions sur les avantages et les inconvénients de la vaccination des animaux de compagnie et d'élevage qui ont été menées entre un groupe de travail de cette organisation et la FAO.
Ils ont déclaré que les animaux de ferme sont dans une situation plus complexe que les animaux de compagnie. Prenant comme exemple le cas du vison (qui se propage généralement par contact avec l'homme), les chercheurs encouragent le personnel travaillant dans les fermes à se faire vacciner comme méthode de prévention avant de vacciner les populations de vison, une espèce qui a enregistré des infections au cours du dernier mois de 2022.
« Bien que les vaccins humains n'induisent pas d'immunité stérile, ils réduisent la durée de l'excrétion virale et la charge virale. Par conséquent, la vaccination des travailleurs peut réduire le risque d'introduction dans les animaux de ferme, mais n'éliminerait pas le risque », a déclaré l'OMSA.
Covid chez le cerf
Dans une nouvelle étude publiée ce mois-ci, des chercheurs de l'Université Cornell à Ithaca, New York, ont collecté 5 700 échantillons de ganglions lymphatiques de cerfs de Virginie de 2020 à 2022 dans cet État, et ont comparé les séquences génomiques des variants trouvés chez le cerf avec le mêmes séquences variantes prélevées sur des humains de tout New York. Ils ont découvert que les virus avaient muté chez les cerfs , suggérant que les variantes circulaient probablement parmi les animaux depuis plusieurs mois.
"L'une des découvertes les plus frappantes de l'étude a été la détection de la co-circulation des trois variantes inquiétantes [Alpha, Gamma et Delta] dans cette population d'animaux sauvages", a déclaré Diego Diel, professeur agrégé de médecine des populations et de sciences diagnostiques. de l'université.
Lorsque les chercheurs ont détecté les variantes Alpha et Gamma chez le cerf, il n'y avait aucune preuve que ces souches virales circulaient encore chez l'homme et ne l'avaient pas été depuis quatre à six mois. "Lorsque nous avons effectué des comparaisons de séquences entre ces virus récupérés à partir de cerfs de Virginie avec les séquences humaines, nous avons observé un nombre important de mutations dans le génome du virus", a déclaré Diel.
Certains des virus avaient jusqu'à 80 mutations , par rapport aux séquences humaines. Cela a fourni une preuve supplémentaire que les virus circulaient probablement parmi les cerfs depuis un certain temps. Le virus aurait pu s'adapter au cerf, le rendant peut-être plus transmissible entre animaux.
Les cerfs ont été infectés par le COVID-19 par contact continu avec des humains, peut-être par la chasse, la réhabilitation de la faune, l'alimentation d'animaux sauvages, ou par les eaux usées ou les sources d'eau, selon l'étude. "Un virus qui a émergé chez l'homme en Asie, très probablement à la suite d'un événement de transmission d'un réservoir animal à l'homme, a maintenant apparemment ou potentiellement trouvé un nouveau réservoir dans la faune en Amérique du Nord", a déclaré Diel.
Une étude de 2022 menée par cet expert et d'autres a révélé que dans cinq États interrogés en 2021, le virus COVID-19 a été trouvé chez jusqu'à 40 % des cerfs de Virginie. Il y a 30 millions de ces animaux aux États-Unis. Les chercheurs ont fait remarquer que davantage d'études sont nécessaires pour confirmer si ces variantes disparaîtront des cerfs au fil du temps ou se propageront à d'autres animaux sauvages, tels que les prédateurs.
"Compte tenu des preuves obtenues dans notre étude, il est très important de continuer à surveiller le virus dans ces populations animales pour vraiment comprendre et suivre les changements qui pourraient conduire à une retransmission aux humains et à d'autres animaux sauvages", a ajouté Diel. . Les résultats de l'étude ont été publiés dans le numéro du 31 janvier des Actes de l'Académie nationale des sciences .
Bryan Richards, biologiste de la faune et coordinateur des maladies émergentes au National Center for Wildlife Health de l'US Geological Survey à Madison, Wisconsin, convient que les cerfs ne semblent pas encore poser de risque. "Sur les millions d'humains qui ont interagi avec la chasse au cerf l'année dernière, nous connaissons maintenant un grand total d'un qui pourrait avoir été infecté", a déclaré l'expert.
Pour vraiment comprendre la situation, il faudra plus d'échantillons d'animaux. Certains chercheurs se sont lancés dans des études longitudinales dans lesquelles ils revisitent les sites d'échantillonnage au cours de plusieurs saisons de chasse.
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