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L'Institut de microbiologie est situé le long de la rue Bugnon, à côté de l'hôpital universitaire. Il est facilement accessible de la gare de Lausanne en prenant le métro M2 direction "Croisettes" et en s'arrêtant à "CHUV". Pour entrer à l'intérieur de l'Institut, veuillez sonner en appuyant sur le bouton rouge lorsque vous êtes devant la porte principale.
Pour atteindre le laboratoire de microbiologie conventionnelle et le laboratoire central, allez à l'Hôpital Universitaire et utilisez l'ascenseur jusqu'au 18ème étage.