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Certaines espèces de lichens ont subi des variations de population au cours des dernières décennies. Il s'agit souvent d'espèces au spectre écologique très étroit (spécialistes) dont les populations sont en déclin, alors que les espèces qui peuvent supporter des conditions de vie très diverses (généralistes) sont en augmentation. Cela conduit à une banalisation de la végétation de lichens et en même temps à une égalisation géographique de la composition des espèces. Par exemple, l'apport élevé d'azote dans de nombreuses régions favorise les populations d'espèces aimant les nutriments, alors que les espèces liées aux forêts naturelles avec une forte proportion de vieux arbres et de bois mort sont en déclin. La liste rouge des espèces de lichens menacées en Suisse fournit des informations sur le statut d'espèce menacée des lichens épiphytes et terricoles en Suisse.