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Alors que la pandémie est toujours présente et qu'Ómicron reste En vigueur sur toute la planète, un groupe de scientifiques de l'université de Boston a décidé de connaître les raisons pour lesquelles cette variante génère des conditions plus douces , malgré sa forte transmissibilité. Avec cet objectif en tête, ils ont combiné la protéine S de BA.1 avec la version originale qui a émergé à Wuhan . Ce qui a fait que ce virus hybride est devenu une version 80% plus létale que les précédentes.
Comme indiqué dans les travaux développés chez la souris et publiés dans bioRxiv sous forme de prépublication, qui n'ont pas encore de validation par les pairs, ce "nouveau" pathogène " se réplique efficacement dans les lignées cellulaires et les cellules pulmonaires ", étant donné que "des mutations dans (protéine ) S n'expliquent pas complètement la capacité de réplication atténuée d'Omicron dans les cellules humaines en culture."
« Le variant Omicron (BA.1) du SRAS-CoV-2 récemment identifié et prédominant dans le monde est hautement transmissible, même chez les personnes entièrement vaccinées, et provoque une maladie atténuée par rapport aux autres variants viraux majeurs reconnus à ce jour. », ont déclaré les scientifiques dans le document, tout en indiquant que l' objectif de cette recherche était de déterminer si "la fuite du vaccin Ómicron est définie par des mutations en S " ou si "les principaux déterminants de la pathogénicité virale résident en dehors du Oui ".
Les scientifiques ont expliqué que la protéine spike (S) d'Omicron possède "un nombre inhabituellement élevé de mutations" , qui sont considérées comme "les principaux moteurs de ces phénotypes". C'est pourquoi, pour déterminer son comportement, les chercheurs de Boston ont généré un « SARS-CoV-2 recombinant chimérique codant pour le gène Omicron S dans le squelette d'un isolat ancestral du SARS-CoV-2 ». Ou en d'autres termes, ils ont combiné la version BA.1 d'Ómicron avec le virus apparu à Wuhan.
Les résultats ont été décisifs, « le virus porteur d'Omicron S échappe fortement à l'immunité humorale induite par le vaccin », c'est-à-dire qu'il échappe à la réponse immunitaire générée par la vaccination, en conséquence des mutations qu'il présente en « se liant au récepteur (RBM ) ». Ce dernier se produit en raison des particularités qu'il a dans la couronne (qui donne son nom à l'agent pathogène).
Jusqu'à présent, comme indiqué, son comportement était le même que le BA.1 d'origine. Cependant, le soi-disant Ómicron S a montré qu'il "se réplique efficacement dans les lignées cellulaires et les cellules pulmonaires distales du type primaire" , ce qui signifie que cette combinaison "inflige une maladie grave avec un taux de mortalité de 80%". "Cela indique que si l'évasion vaccinale d'Omicron est définie par des mutations dans S , les principaux déterminants de la pathogénicité virale résident en dehors de S ", ont-ils expliqué. En d'autres termes, alors que la capacité d'infecter se trouve dans la protéine S, sa létalité n'y est pas.
Pas à pas : ce que cherchaient les scientifiques
Les raisons de son enquête sont devenues claires. Cependant, pour déterminer les résultats, ils ont développé une série d'étapes. Après avoir donné chacun, ils ont effectué une analyse et ont fourni des conclusions.
La première étape franchie par les scientifiques a été de comparer "l'efficacité d'infection d'Omi-S avec un virus ancestral et d'Omicron en culture cellulaire ", pour cela ils ont utilisé des microscopes et des cellules infectées par ces pathogènes. « Le virus ancestral [ci-après de type sauvage (WT)] et Omi-S se propagent rapidement dans les cellules », notent les scientifiques, notant qu'au bout de 24 heures, le premier provoque une infection de 89 % des cellules, tandis que l'autre a montré 80%. Pendant ce temps, Ómicron « s'est reproduit plus lentement, ce qui a causé 48 % des cellules infectées ».
« Le test sur plaque a montré que bien qu'Omi-S et Ómicron produisaient des niveaux inférieurs de particules virales infectieuses par rapport au virus ancestral, le titre viral d'Omi-S était significativement plus élevé que celui d'Ómicron », ont expliqué les chercheurs. "Ces résultats indiquent que, bien que les mutations de la protéine S influencent l'efficacité d'infection d'Ómicron, elles n'expliquent pas complètement le comportement d'infection d'Ómicron en culture cellulaire", ont-ils conclu après cette première analyse.
La deuxième étape consistait à étendre l'étude aux cellules épithéliales pulmonaires , "un site important de réplication virale chez les patients atteints de COVID-19 sévère", ont-ils noté. Pour analyser le comportement des virus, les scientifiques ont utilisé des "cellules épithéliales alvéolaires pulmonaires", qui sont "essentielles dans le poumon distal et constituent l'une des principales cibles de l'infection par le SARS-CoV-2". Les résultats ont corroboré « la conclusion selon laquelle les mutations de S n'expliquent pas entièrement la capacité de réplication atténuée d'Omicron dans des cellules humaines en culture ».
Cependant, ils ont noté que malgré la littérature publiée conseillant que "l'inoculation intranasale de souris (âgées de 12 à 20 semaines) avec Omicron ne provoque pas de perte de poids significative, l'inoculation avec le virus ancestral a déclenché une diminution rapide du poids corporel, avec tous animaux perdant plus de 20 % de leur poids corporel initial 8 jours après l'infection.
Cette situation a été mise en évidence dans la version « chimérique ». "Il est important de noter que 80% des animaux infectés par l'Omi-S ont également perdu plus de 20% de leur poids corporel à 9 jours ", ont-ils noté. Dans le même temps, ils ont souligné que la santé des souris infectées par le virus ancestral et Omi-S se détériorait "rapidement". "Selon les résultats de la perte de poids corporel et du score clinique, le virus ancestral et Omi-S ont causé des taux de mortalité de 100% (6/6) et 80% (8/10), respectivement " tandis que "tous les animaux infectés par Omicron ont survécu". ”. Par conséquent, comme l'expliquent les scientifiques, "ces résultats indiquent que la protéine S n'est pas le principal déterminant de la pathogénicité d'Omicron chez la souris"
Il est à noter que, comme indiqué après l'enquête in vitro , « le titre de virus infectieux dans les poumons des souris infectées par le virus ancestral était supérieur à celui détecté chez les souris infectées par deux autres virus ». Notamment, cependant, les souris infectées par Omi-S ont produit 30 fois plus de particules virales infectieuses que les souris infectées par Omicron, bien qu'elles aient constaté que cette variante, malgré la production d'une infection légère, peut être "persistante".
Un autre point pertinent de l'étude indique où la plus grande quantité de virus a été détectée. « Alors que le virus Omi-S provoquait une infection bronchiolaire sévère avec environ 15 à 20 % de bronchioles positives pour la protéine S chez toutes les souris examinées, moins de 1 % des bronchioles étaient positives pour S chez les souris infectées par Omicron », notent les scientifiques. Parallèlement, ils ont indiqué que cette infection bronchiolaire était associée à une nécrose épithéliale ( mort des tissus corporels ) pour les rongeurs infectés par Omi-S, situation qui n'était pas mise en évidence dans la version BA.1.
"Cela suggère que la réplication d'Omicron dans les poumons de souris, en particulier dans les bronchioles, est considérablement atténuée par rapport à Omi-S, ce qui étaye notre conclusion selon laquelle les mutations de la protéine S ne sont que partiellement responsables de la pathogénicité. Omicron atténué ", ont conclu les experts. Dans le même temps, ils ont averti que "cette étude fournit des informations importantes sur la pathogénicité" de la variante la plus récente du SARS-CoV-2.
« Dans les tests d'infection in vitro, le SRAS-CoV-2 (Omi-S) ancestral porteur de pointes d'Omicron présente une efficacité de réplication beaucoup plus élevée par rapport à Omicron. De même, chez la souris, Omi-S contraste avec l'Omicron non mortel et provoque une maladie grave entraînant une mortalité d'environ 80 %. Cela suggère que les mutations hors pointe sont les principaux déterminants de la pathogénicité atténuée d'Omicron chez la souris », ont conclu les scientifiques.