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Ziel des Projektes ist es, Methoden zu entwickeln, die es ermöglichen die genetische Diversität von Tumoren durch Einzelzellsequenzierungen zu charakterisieren. Die Bestimmung von DNS-Sequenzen in einzelnen Zellen ist erst seit kurzem möglich und bringt viele technische Schwierigkeiten mit sich. Die Analyse solcher Daten bedarf daher der sorgfältigen mathematischen und statistischen Modellierung. Wir werden sowohl Punktmutationen als auch strukturelle genomische Veränderungen, wie z.B. Insertionen und Deletionen, in Krebszellen modellieren und anhand dieser Merkmale die Evolutionsgeschichte einzelner Tumore rekonstruieren. Unser Ziel ist es die neuen Methoden sowohl in einem einheitlichen mathematischen Rahmenwerk zu formulieren, als auch in effizienten Open-Source-Computerprogrammen zu implementieren.
Das Projekt schafft die mathematischen, statistischen und rechnerischen Grundlagen für die effiziente Nutzung von Tumor-Einzelzellsequenzierdaten für die Krebstherapie. Die zu entwickelnden Methoden werden es erlauben, Tumore detailliert genomisch zu charakterisieren und die individuelle Therapie einzelner Patienten zu optimieren.