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Eine von Staudingers wertvollsten und dauerhaftesten Leistungen war die Publikation von drei Katalogen der Schmetterlingsfauna Europas und der gesamten Paläarktis als Grundlage faunistischer Bearbeitungen. 1861 veröffentlichte Staudinger zusammen mit Max Ferdinand Wocke einen Catalog der Lepidopteren Europas und der angrenzenden Länder, in dem er die sogenannten Großschmetterlinge und Wocke die sogenannten Kleinschmetterlinge bearbeitete. Weitere Verbreitung fand die zweisprachige deutsch-französische Ausgabe von 1871 (Catalog der Lepidopteren des Europaeischen Faunengebiets) in der gleichen Autoren. Ein Standardwerk wurde der zusammen mit Hans Rebel bearbeitete und von diesem 1901 herausgegebene Catalog der Lepidopteren des palaearctischen Faunengebietes. Staudinger kaufte nicht nur Ausbeuten aus der östlichen Paläarktis und aus vielen tropischen Gebieten auf und bearbeitete sie taxonomisch, sondern er sandte auch ganz gezielt Sammler in entomologisch noch wenig bekannte oder ganz unerforschte Gebiete.