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L'Office fédéral de l'environnement (OFEV) est l'agence suisse pour l'environnement. Il s'agit entre autres de l'agence spécialisée de la Confédération pour la surveillance nationale des eaux souterraines (quantité et qualité) et pour les synthèses hydrogéologiques nationales. L'OFEV est responsable de la surveillance nationale des eaux souterraines (NAQUA), qui surveille à l'échelle nationale la qualité et la quantité des eaux souterraines ainsi que les isotopes présents dans le cycle de l'eau. Le réseau national de mesure de surveillance des eaux souterraines est composé des quatre modules QUANT, SPEZ, TREND et ISOT. La quantité d'eau souterraine est enregistrée dans le module QUANT et la qualité de l'eau souterraine est enregistrée dans les deux modules SPEZ et TREND. Le module ISOT observe les isotopes stables de l'eau dans les précipitations et les rivières.
Outre le comité consultatif, la connexion avec l'OFEV s'effectue via des échanges bilatéraux, par exemple en relation avec les observatoires. Le réseau est notamment en contact étroit avec la section suivante de l'OFEV, qui assure également la coordination interne de l'OFEV : Service d'hydrologie - Section Fondements hydrogéologiques.