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Les fonctions d’une cellule sont contrôlées par des mécanismes de régulation de l’expression génique. La régulation dite post-transcriptionnelle contrôle l’expression des gènes au niveau de l’ARN, entre la transcription et la traduction. Il existe des nombreuses protéines qui participent à la régulation post-transcriptionnelle en se liant à l’ARN ; en anglais ces protéines sont appelées « RNA-binding proteins » ou « RBPs ». Les RBPs agissent par divers mécanismes ; par exemple, certaines s’apparient avec la séquence 5' d'ARN messagers cibles, le plus souvent dans la région qui contient le site de fixation du ribosome et le codon de démarrage de la traduction. En effet, la présence de la protéine interfère avec le démarrage de la traduction et, directement ou indirectement, entraîne la dégradation de ces ARN messagers par des ribonucléases. Le récent intérêt suscité par la découverte de nouveaux mécanismes de régulation post-transcriptionnelle impliquant des RBPs a stimulé de nombreux travaux visant à identifier ces protéines.
Chez les bactéries, les RBPs participent à l’optimisation de la croissance et à l'adaptation aux changements environnementaux à travers la régulation de multiples fonctionnalités (métabolisme, motilité, virulence en cour d’une infection, etc…). Chez bactéries modèles comme E. coli et Salmonella, une trentaine de RBPs a été identifiée par différentes méthodes. Toutefois, pour la grande majorité d'entre elles, leur mécanisme d’action n’est pas encore connu. Pseudomonas aeruginosa est une bactérie pathogène opportuniste qui entraîne une mortalité élevée chez les personnes immunodéprimées et les patients atteints de mucoviscidose. Ce projet vise à identifier des RBPs qui participent à la régulation de la croissance et de la virulence de P. aeruginosa, ainsi que leurs gènes cibles. Dans ce but, deux stratégies seront employées : la première stratégie cible de potentiels RBPs identifiés par leur homologie avec des RBPs récemment étudiés chez les bactéries modèles, mais dont le mécanisme d’action n’est pas encore bien compris ; la deuxième stratégie utilise une technique biochimique pour identifier et caractériser des RBPs à partir d’un extrait cellulaire. Ce projet permettra de comprendre les mécanismes post-transcriptionnels à la base des certaines fonctions de P. aeruginosa, comme la motilité, la virulence et/ou la résistance aux antibiotiques. Finalement, ce projet pourrait ouvrir la voie à l'élaboration de nouvelles stratégies thérapeutiques pour combattre les infections crées par P. aeruginosa en bloquant l’action des RBPs.