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中等教育分为两级。初级中等教育结束后，义务教育也就结束了。90%以上的学生毕业后继续接受高级中等教育。
中等教育
初级中等教育
初级中等教育是初等教育之后的下一个教育阶段。学生们在大约12岁时进入这一教育阶段。在大部分州，初级中等教育都为期三年。根据学生初等教育结束时的成绩、教师的建议——经常也考虑到家长的意见——，以及有些情况下进行的升学考试的成绩，决定将该名学生划分入初级中等教育中哪一个细分等级。各州和各种模式下的升学程序都各不相同。这一阶段的授课教师一般都是该学科的专业人士。
高级中等教育
义务教育结束后，90%以上的毕业生都继续接受高级中等教育。他们可以从两种教育路径中选择一种：一种是职业教育，一种是通识教育。高级中等教育为期三至四年。
在瑞士，职业教育是绝大部分人的第一个学历。三分之二的青少年通过职业教育学习掌握一种职业。职业教育期间，学生们主要在一家企业上班学习，另外也在职业专科学校中学习理论课程。这种职业教育模式称为“双轨制职业教育”。
通识教育主要在高级中学进行，这种高级中学让学生们为今后进入大学学习而做好准备。高级中学毕业文凭也是大学的入学资质，持有该文凭的学生可以升入综合性大学和联邦理工大学。