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Man unterscheidet grundsätzlich zwei verschiedene Typen von Melanin, die für die unterschiedlichen farblichen Varianten des menschlichen Haares verantwortlich sind.
1. Das Eu-Melanin ist das Schwarz-Braun-Pigment. Dieses Melanin entscheidet hauptsächlich über die Farbtiefe des Haares. Es kommt in schwarzem und braunem Haar in klar erkennbaren Körnchen vor.
2. Das Phaeo-Melanin ist das Rot-Pigment. Dieses Melanin ist für rote, blonde und hellblonde Haare verantwortlich. In seiner Struktur ist es sehr viel kleiner und feiner als das Eu-Melanin.
Durch das Mischungsverhältnis der beiden Melanin-Typen entstehen die unterschiedlichen Haarfarben.
Rotes Haar enthält wenig Eu-Melanin und sehr viel Phaeo-Melanin.
Blondes Haar hat ebenfalls wenig Eu-Melanin, aber viel Phaeo-Melanin.
Dunkles Haar enthält dagegen viel Eu-Melanin und wenig Phaeo-Melanin.
Graues Haar entsteht mit zunehmenden Alter, wenn die Produktion von Melanin nachlässt. In diesem Prozess wird das Melanin zunehmend durch die Einlagerung von Luftbläschen in den Haarschaft ersetzt.