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La ventilation de ces données, par mode de financement met en évidence la manière dont l’Etat soutient la R D. L’Etat dispose de deux canaux principaux pour amener son financement auprès des exécutants de la R D : le financement d’institutions d’exécution de la R D (organismes qui réalisent la R D de leur choix à l’intérieur de leurs propres murs) et le financement de programmes/projets de R D (activités de recherche pour lesquelles les conditions-cadres (thématiques, objectifs, règles, etc.) sont fixés par le financeur. Les programmes/projets de R D font l’objet d’appels à propositions et sont attribués sur concours.
En 2022, pour la R-D réalisée en Suisse, la Confédération privilégie fortement le canal de financement des institutions (fonds généraux des universités essentiellement) plutôt que des programmes de R-D. Par contre pour la R-D réalisée à l’étranger, la Confédération finance plus généreusement les programmes de recherche (essentiellement les Programmes-cadres de recherche de l’Union européenne) que les institutions.