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Le indagini geologiche permettono di approfondire le conoscenze sul sottosuolo delle regioni che potrebbero ospitare un deposito di scorie radioattive in strati geologici profondi. Secondo quanto stabilito dalla legge federale sull'energia nucleare (LENu) tali indagini possono essere effettuate solo previa licenza rilasciata dal Dipartimento federale dell'ambiente, dei trasporti, dell'energia e delle comunicazioni (DATEC). Non tutte le indagini geologiche, tuttavia, sono subordinate a tale autorizzazione: ne sono esonerate, ad esempio, i rilevamenti geologici in superficie o le misurazioni dei gas al suolo.
L'obbligo di licenza vale invece per le trivellazioni di sondaggio: esse permettono di raccogliere informazioni più precise sugli strati rocciosi presenti all'interno del perimetro di un possibile deposito di scorie nucleari e di studiare così le condizioni geologiche in relazione a tutti i tipi di deposito che si potrebbero realizzare in quel sito (SDM, SAA e depositi combinati). L'obbligo di licenza si applica anche alle trivellazioni nei terreni del Quaternario. Esse raggiungono strati meno profondi rispetto alle trivellazioni di sondaggio e permettono di raccogliere informazioni preziose sull'evoluzione geologica a lungo termine.
L'UFE è l'autorità preposta al rilascio della licenza e collabora a tal fine con i servizi specializzati della Confederazione e con i Cantoni interessati. Per ogni sito di trivellazione viene condotta una procedura di autorizzazione separata. Con l'avvio di ciascuna procedura viene pubblicata la relativa domanda di trivellazione. A partire dall'inizio del deposito pubblico le domande possono essere scaricate da questo sito Internet. Le persone interessate dalle trivellazioni possono presentare all'UFE un'opposizione contro il progetto.