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L’ombre commun est un poisson qui vit principalement dans les rivières. Il ne faut pas le confondre avec l’omble chevalier, qui est une espèce lacustre. L’ombre commun est une espèce menacée dans toute l’Europe. Dans le canton de Vaud, ses populations ont également chuté ces dernières années. En 1994, pour préserver l’espèce dans l’Orbe à la Vallée de Joux, site où elle était très présente, le canton de Vaud a décidé d’interdire sa pêche pendant une période de trois ans. Ce sont notamment ces évènements qui ont fait démarrer ce travail de thèse sur la biologie et l’écologie de l’ombre commun. La fermeture de la pêche a permis d’étudier la population d’ombres dans des conditions optimales en l’absence de pression de pêche. A partir de 1997, date de la réouverture de la pêche, il a été possible de suivre l’effet de cette activité sur la population. Cette espèce a été principalement étudiée dans l’Orbe à la Vallée de Joux, mais également dans le lac de Joux où la rivière s’y jette.