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La modélisation est un outil essentiel pour la recherche environnementale. Nous utilisons des modèles d'une part pour analyser les données des études en laboratoire et sur le terrain. La question principale est ici de savoir si les modèles de comportement environnemental que nous avons développés sont corroborés par les observations. Nous utilisons d'autre part des modèles pour faire des prédictions quantitatives sur l'apparition de polluants organiques et de leurs produits de transformation dans les écosystèmes aquatiques.
Les modèles et outils de simulation utilisés peuvent varier fortement en fonction du questionnement. Nous développons par exemple des modèles chimioinformatiques (Eawag-PPS), fondés sur des règles spécifiques, pour la prédiction de la dégradation microbienne d’un grand nombre de substances chimiques. Pour l'analyse spatiale de l'exposition aux polluants dans les bassins versants, on utilise des modèles hydrologiques fondés sur les SIG.