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Les produits phytosanitaires (PPh) ne doivent pas avoir d’impacts inacceptables sur l'environnement. Le contrôle se fonde principalement sur les données fournies par les demandeurs d’une homologation et sur les directives de l'UE relatives aux méthodes d'évaluation des risques. L'écotoxicologie des PPh est évaluée pour les principaux organismes végétaux et animaux tels que les algues, les poissons, les insectes, y compris les abeilles, les vers de terre et les oiseaux. Le projet évalue également les effets négatifs potentiels sur l'environnement des produits utilisés pour la protection biologique des plantes (par ex. les prédateurs contre les ravageurs). Les méthodes de contrôle sont mises à jour en fonction de l'évolution des exigences et des nouvelles découvertes scientifiques. Les résultats des études de monitoring et des projets de recherche sont également pris en compte.
L'efficacité, l'utilisation recommandée et le potentiel de résistance sont testés dans le cadre de la procédure d’autorisation des PPh. Les expert-e-s des impacts évaluent l’utilité agronomique, l'adéquation et la compatibilité pour les applications. L'application efficace des PPh n'est connue que partiellement pour différentes cultures et stratégies phytosanitaires. Des connaissances plus détaillées permettent de mieux comprendre et d'optimiser la protection phytosanitaire, l'acceptation économique et les risques écologiques.