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L'endobrachysophage (EBO) est trouvé chez plus de 11% des patients ayant une symptomatologie de reflux. Cette prévalence est plus importante si l'on recherche systématiquement des segments courts d'EBO ou si le dépistage est étendu à des sujets asymptomatiques. L'EBO est plus fréquent chez les sujets mâles caucasiens de plus de 40 ans.Les facteurs physiopathologiques essentiels de l'EBO sont les périodes prolongées de reflux gastro-sophagien et la présence de bile dans le liquide de reflux. D'autres facteurs génétiques, immunologiques ou environnementaux encore mal connus participent à la survenue de l'EBO. L'évolution des lésions dysplasiques sur EBO est liée à des anomalies de renouvellement de l'épithélium qui sont favorisées par l'acide et les sels biliaires. L'agression de l'épithélium de l'EBO par l'acide et la bile provoque des mutations génétiques qui favorisent l'apparition des cellules dysplasiques.