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Hans-Peter Hauri war von 1983 bis 2010 am Biozentrum, zuerst als unabhängiger Gruppenleiter und von 1992 bis 2010 als Professor für Zellbiologie auf dem Gebiet der Proteinsekretion tätig. Er etablierte das ER-Golgi Zwischenkompartiment (ERGIC) als neues Organell des Sekretionsweges. Darüber hinaus war Hauri Studienleiter des Biologie II-Curriculums sowie des gemeinsamen Biologie-Curriculums und Dekan der Naturwissenschaftlichen Fakultät der Universität Basel.