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Pour l'essentiel l'intestin est irrigué par trois troncs impairs issus de l'aorte abdominale, à savoir:
- Le tronc coeliaque
- L'artère mésentérique supérieure
- L'artère mésentérique inférieure
Le tronc coeliaque bifurque immédiatement après le passage de l'aorte à travers le hiatus aortique du diaphragme. Un peu plus loin il donnera une branche splénique - l'artère splénique, une branche pour l'estomac - l'artère gastrique gauche et aussi l'artère hépatique commune, qui donnera ultérieurement l'artère gastrique droite.
L'artère mésentérique supérieure irrigue la totalité de l'intestin grêle et s'étend jusqu'au tiers moyen du côlon transverse. L'innervation jusqu'à ce niveau est assurée par le nerf vague (NC X).