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Probenvorbereitung
- Isolierung der DNA: Um mit einem Microarray zu untersuchen, ob die DNA eines Patienten bestimmte Sequenzen enthält , muss die DNA zunächst aus dem Blut gewonnen werden. Dies geschieht z. B. mithilfe eines DNA-Isolierungs-Kits.
Vervielfältigung der Patienten-DNA: Polymerasekettenreaktion (PCR)
- Die zu untersuchenden Teilstücke der DNA werden mithilfe der Polymerasekettenreaktion (PCR) millionenfach vervielfältigt.
- Hierbei legen zwei Starter-DNA-Moleküle (Primer) den Bereich fest, der kopiert werden soll. Wenn die Patienten-DNA den passenden Abschnitt (Zielsequenz) enthält, können die Primer sich daran binden und es wird eine Kopie der Zielsequenz hergestellt.
- Diese Reaktion wird mehrmals wiederholt, so dass die DNA-Region zwischen den Primern sehr stark (exponentiell) vervielfältigt wird.
- Die entstehenden PCR-Produkte sind mit einem Fluoreszenz-Farbstoff markiert, der später den Nachweis auf dem Microarray ermöglicht. Wenn die Zielsequenzen in der Patientenprobe fehlen, können die Primer sich nicht binden: Die DNA wird nicht vervielfältigt.
Untersuchung der PCR-Produkte auf dem Microarray: DNA-Microarray-Hybridisierung
- Die PCR-Produkte werden mit dem Microarray inkubiert.
- Hierzu werden sie zunächst mit einem Hybridisierungspuffer gemischt, der die optimalen Bedingungen für die Anlagerung der PCR-Produkte an die komplementären Sonden auf dem Microarray schafft.
- Diese Bindungen werden über die an den Spots entstehenden Fluoreszenzsignale gemessen.
- EUROArray-Objektträger und BIOCHIP nach der Inkubation.
- Array-Plattform basiert auf der bewährten BIOCHIP-Technologie.
- Gebrauchsfertige PCR-Komponenten.
- Einfache Arbeitsprotokolle.
- Standardisierte Inkubation mit der erprobten TITERPLANE®-Technik.
- Integrierte Kontrollreaktionen zur Sicherstellung der Spezifität und Sensitivität jedes Testansatzes.
- Vollautomatische standardisierte Auswertung, Befunderstellung und Archivierung (EUROArrayScan-Software).
- Keine DNA-Isolierung mit EUROArray Direct: Die Untersuchung erfolgt direkt aus vorbehandeltem Blut.
- Kompletter Prozess vom Probeneingang bis zur Befundausgabe – nach IVD-Richtlinie validiert und CE-gekennzeichnet (DNA-Extraktion, Testreagenzien, Microarray Scanner, Software).
- LIMS-Anbindung vorbereitet.
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