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L'Ufficio federale dell'energia (UFE) svolge compiti importanti nell'ambito dell'attuazione della legislazione in materia di energia nucleare. Appronta tra l’altro le concessioni per le centrali nucleari, per i depositi di scorie radioattive e le indagini geologiche da parte del Dipartimento federale dell’ambiente, dei trasporti, dell’energia e delle comunicazioni (DATEC).
L'UFE dirige la segreteria del gruppo di lavoro della Confederazione per lo smaltimento delle scorie radioattive (AGNEB). Inoltre è responsabile dell’attuazione del Piano settoriale dei depositi in strati geologici profondi e della gestione della procedura di selezione dei siti.
L’UFE rilascia le licenze relative al trasporto di combustibili e di scorie nucleari e attua le disposizioni di legge riguardanti la garanzia della copertura dei costi per lo spegnimento degli impianti e per lo smaltimento delle scorie. È di competenza dell'UFE anche il controllo e la contabilità nazionale relativa ai combustibili nucleari, nonché altri compiti derivanti da impegni bilaterali e multilaterali della Svizzera in relazione al ciclo dei combustibili nucleari e al controllo delle esportazioni di materiali nucleari.
La sorveglianza tecnica delle centrali nucleari svizzere è di competenza dell'Ispettorato federale della sicurezza nucleare (IFSN), un ente federale autonomo di diritto pubblico.