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La protéine MBP est le principal composant de la myéline. Lorsque la myéline est endommagée (comme c'est par exemple le cas dans la sclérose en plaques), le liquide céphalorachidien du patient présente souvent une teneur anormalement élevée en MBP.
Lorsque, dans le cadre d’une expérience, on injecte la protéine MBP dans le corps d'animaux de laboratoire, elle déclenche une encéphalomyélite allergique expérimentale (EAE), une maladie chronique de la moelle épinière présentant des similitudes avec la SEP.
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