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Me Bernard Ayer a obtenu son brevet d'avocat en 1998 (stage auprès de l'étude Me René Monferini et Me Laurent Schneuwly à Fribourg).
Dès 2001 auprès de la Chancellerie fédérale, il a pris la tête des projets www.ch.ch et vote électronique. Il en a ainsi dirigé l'ensemble des aspects stratégiques et contractuels. Il a représenté la Suisse auprès du comité d'experts « droit et informatique » du Conseil de l'Europe et s'est spécialisé en droit des nouvelles technologies.
Dans le même temps, il a mené différents projets de recherche et d'enseignement comme lecteur auprès de la Faculté de droit de l'Université de Fribourg (Prof. Nicolas Michel, 1998-2004).
Associé au sein de l'étude Notter Mégevand & Associés (2004-2005), il a pratiqué le droit commercial et administratif à Fribourg et Berne.
En 2006, il a fondé LexPublica, bureau de conseil en droit des affaires publiques, avec Me Thierry Gachet.
Me Bernard Ayer est particulièrement actif dans les domaines suivants:
- Droit des nouvelles technologies
- Droit de la construction
- Aménagement du territoire
- Droit de l'environnement