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Das Zentrum für Phenogenomik (CPG) der EPFL unterstützt die Forschungsarbeiten mit massgeschneiderten Services und sorgt in Übereinstimmung mit geltendem Gesetz und ethischen Grundsätzen für das Wohl der Labortiere. Das CPG hält Mäuse, Ratten und Fische in modernen, akkreditierten Tierhaltungseinrichtungen.
Die Forschenden der EPFL müssen gelegentlich Versuche an anderen Tierarten durchführen. Solche Versuche werden an hoch spezialisierten Zentren vorgenommen, die speziell für die betreffende Tierart eingerichtet wurden. Die Kommission für Tierversuchsethik (KTVE) der EPFL prüft Tierversuche, die von Forschenden der EPFL im Ausland durchgeführt werden, unter ethischen Gesichtspunkten.
Die EPFL ist Mitglied bei verschiedenen regionalen, nationalen und internationalen Exzellenz-Netzwerken, die die Zusammenarbeit und Innovation im Bereich Tierhaltung, 3R, Transgenese, Lehre und Fortbildung fördern: