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L'IVI est le seul laboratoire suisse autorisé à travailler avec des agents responsables d'épizooties hautement contagieuses. Pour ce faire, les locaux du laboratoire et les bâtiments réservés aux animaux doivent satisfaire aux exigences du niveau de sécurité maximum (BL4). La sécurité dans un laboratoire comme l'IVI implique que l'on identifie les risques, que l'on introduise des procédures, des pratiques et des équipements de sécurité et que l'on construise les bâtiments correspondants.
Deux points constituent l'élément central de la "sécurité":
- la protection de l'animal et de l'environnement contre une libération involontaire de microorganismes,
- a protection du personnel contre les infections.