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瑞士的科研工作基本上由两大领域分工负责：应用型的科研活动，以及将科研成果转化为能为市场接受的创新成果，主要是私营经济界和应用科学大学的任务；公共部门则打造最佳的科研条件，并负责综合性大学及联邦理工大学开展的基础研究。
科研的组织和融资
瑞士在科研和创新方面极具竞争力。瑞士研发投入占国内生产总值的百分比，高于世界上绝大多数国家。2017年，瑞士的研发投入占GDP的3.4%，亦即超过220亿瑞士法郎。在瑞士，基础研究主要由两座联邦理工大学和各个综合性大学开展；而应用型的研发活动，以及将科研成果转化为能为市场接受的创新成果，则主要是私营经济界和应用科学大学的任务。
私营部门围绕产品开发从事科研活动
私营企业承担了瑞士研发总开支的70%以上。在这方面，制药、机械制造以及研发领域的大企业发挥着关键作用。ABB、诺华、罗氏、现代电气、甲骨文和Biogen等，都属于这类企业的典型代表。尽管企业也从事基础研究，不过，它们还是以进行应用型科研活动为主，最关注的是开发出能为市场接受的产品。瑞士为企业的科研活动提供优异的条件。也正因如此，拥有诺贝尔奖的IBM研究实验室和谷歌的欧洲研究中心，都设在瑞士。
公共部门夯实基础
分布于各级政治层面上的国有机构，为人们开展卓越的科研工作和成功的创新活动而提供肥沃的土壤。其中包括保障所有教育等级上的教育质量，提供公共基础设施，并打造一个可靠的政治和法律环境。联邦政府运营多种多样的科研计划和机构，并为这些计划和机构提供资金，以促进科研活动：
- 分别位于苏黎世和洛桑的两座联邦理工大学，以其在自然科学领域的杰出成就而享誉全球。另外还有四座研究所，也属于“联邦理工大学及研究所联合体”的范畴。其中一座研究所就是在欧洲名列前茅的保罗·谢尔研究所。世界各地的科学家都慕名前来，以便利用这里的设备进行科学研究，如“瑞士同步辐射光源”和“散裂中子源”。
- 瑞士国家基金会（SNF）支持在所有科学领域的基础研究活动，从历史、医学直至工程技术科学。它每年为超过5,800个项目提供支持，参与这些项目的科研人员总计大约18,700人。
- 瑞士创新促进署（Innosuisse）支持为经济和社会的利益而开展基于科学的创新活动，从而加强瑞士中小企业和初创企业的竞争力。
- 联邦还资助“瑞士高校联盟”以及独立于高校之外的将近30个研究机构。
各州对科研活动的投入，体现在由各州负责的州立综合性大学和应用科学大学上。与综合性大学不同的是，应用科学大学肩负着开展应用型研究的任务。这是因为应用科学大学高度参照就业市场的需求。
公共部门在提供科研资金时，遵循自由主义的基本原则。这就意味着，基于科研人员的自发动议并依照竞争原则提供资金，起决定作用的是资金申请书的质量。此外，瑞士科研政策的另一个重要支柱就是支持国际合作。