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Des rendements satisfaisants et une qualité irréprochable des produits ne peuvent être obtenus qu’avec un approvisionnement du sol en éléments fertilisants suffisant et équilibré. L’essai de démonstration réalisé depuis 1989 devait montrer d’une part l’efficacité des différents engrais (lisier, fumier et engrais minéral), et d’autre part les effets d’une fertilisation déséquilibrée. Aucune différence n’a été observée entre les parcelles fertilisées avec soit du lisier, soit des engrais minéraux en quantités adaptées aux besoins des cultures. L’application par année d’uniquement 25 tonnes de fumier par hectare amène par contre à des pertes de rendement et de qualité, du fait de l’efficacité insuffisante de l’azote et de la faible teneur en potasse. L’absence d’un élément nutritif (N, P ou K) dans les variantes minérales agit négativement après peu d’années déjà sur le rendement, tout comme sur la teneur des produits et du sol. Des symptômes de carence peuvent en outre être observés dans toutes les cultures de la rotation.
La fixation symbiotique de l'azote par des bactéries dans le sol en cohabitation avec des légumineuses entraîne une réduction du besoin en engrais. Dans les exploitations agricoles, ce paramètre n’est toutefois pas facilement mesurable. Or, des chercheurs d'Agroscope ont développé une méthode qui permet d'évaluer, au niveau de l’exploitation, les apports d'azote par la fixation symbiotique.
En Suisse aussi, la période de végétation s'est nettement allongée suite à l'augmentation des températures globales et régionales. À l’aide de données de l'Office fédéral de météorologie et de climatologie, Agroscope montre l'évolution de la période de végétation depuis le début du siècle dernier.
La réserve de minéraux phosphatés utile à la fabrication d’engrais pourrait être épuisée d’ici quelques décennies à l’échelle mondiale. Cette étude présente une piste pour recycler un sous-produit industriel suisse en engrais phosphaté.