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Die Trüffelarten gehören zur Gattung Tuber (echte Trüffeln), der Familie Tuberaceae, der Ordnung Tuberales (trüffelartige Pilze) und sind in der Klasse der Ascomyceten (Schlauchpilze) zu finden. Es sind also keine Basidiomyceten (Ständerpilze) wie zum Beispiel der allgemein bekannte Champignon, Steinpilz, Eierschwamm oder Fliegenpilz. Der Hauptunterschied dieser beiden Klassen ist unter dem Mikroskop in der Fruchtschicht zu finden. Ascomyceten haben Asci (Schläuche oder Säcke) in denen sich die zur Vermehrung dienenden Sporen befinden. Im Gegensatz dazu besitzen Basidiomyceten Basidien (Trägerzellen) auf denen die Sporen ungeschützt reifen.