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De nombreux résidus médicamenteux, difficiles à filtrer par les stations d'épuration, se trouvent dans l’eau de surface, les eaux souterraines et l’eau potable. Ceci a un impact nocif sur la santé publique, surtout des troubles de développement des enfants, et sur l’environnement. Ce qui suit est le résumé d’un rapport présenté par les membres des Médecins suédois pour l’environnement (LfM), « Pharmaceuticals, Permanent Pollutants in the Environment ». Voir plus d'informations en anglais sur LfM.
Les résidus pharmaceutiques des humains et des animaux sont éliminés dans les urines et les selles. Leurs ingrédients actifs ne peuvent pas être totalement traités par les stations d’épuration. En zones rurales, les systèmes d’épuration sont souvent moins efficaces. Des résidus sont aussi répandus dans l’environnement par les processus de fabrication et l’élevage industriel où les animaux sont traités avec de grandes quantités de médicaments, surtout des antibiotiques. Les hôpitaux et les ménages jettent souvent les médicaments inutilisés aux toilettes et dans les égoûts. On dépose aussi les médicaments avec les ordures qui sont incinérées ou enterrées dans des décharges non étanches, et dont les écoulements peuvent contaminer les eaux souterraines.