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UniProt: une base de donnée unique au monde sur les protéines

Annoncé depuis plus d'un an, le lancement d'UniProt, la nouvelle base de connaissance universelle sur les protéines, est effectif depuis le 15 décembre dernier. Né de la fusion des bases de données Swiss-Prot, TrEMBL et PIR, ce consortium permettra d'avoir accès depuis Internet à toutes les informations disponibles sur l'ensemble des protéines actuellement connues.
En octobre 2002, le National Institute of Health (NIH) annonçait qu'il financerait l'établissement d'une "base de connaissance unique et universelle" sur les protéines. Totalisant 15 millions de dollars sur trois ans, cette subvention devait permettre la création d'une base de données unique sur les protéines en associant deux groupes européens et un groupe américain.
Réunir l'existant
C'est ainsi qu'en réunissant les points forts de ces trois bases de données, une seule et unique ressource UniProt (United Protein Databases) est née. Cette ressource publique est aujourd'hui composée de deux parties, l'une contenant des informations enregistrées manuellement et l'autre des données obtenues automatiquement. Ces deux sections - qui comportent des protéines différentes - continuent d'être nommées Swiss-Prot et TrEMBL, respectivement. Chaque entrée d'UniProt contient entre autres des informations sur la fonction de la protéine et sa classification, ainsi que des liens sur plus de 40 autres bases de données, constituant ainsi une plaque tournante pour toutes les données disponibles sur cette protéine.
Ce nouvel outil constitue un pas en avant et va devenir très vite la "pierre angulaire" d'une grande partie des chercheurs en sciences de la vie, spécialement dans le domaine de la protéomique.
Historique
Sylvie Détraz
Université de Genève
Presse Information Publications
Janvier 2004
2004