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Il confronto di fotografie aeree scattate in momenti diversi è un modo rapido ed economico per individuare eventuali cambiamenti nel paesaggio. Ol modulo di telerilevamento esamina quindi i cambiamenti in tutti i 7'000 biotopi d'importanza nazionale attraverso il confronto delle immagini aeree. Un sistema di allarme preventivo offre inoltre alla Confederazione e ai Cantoni la possibilità di individuare i cambiamenti positivi e negativie, se necessario, di adottare misure.
Nell'ambito della prima indagine WBS (2012-2017), lo stato dei biotopi al momento dell'inventario dei biotopi di importanza nazionale degli anni 1980-1990 (fotografie aeree stereo in bianco e nero) è stato confrontato con lo stato 2010-2015 (fotografie aeree stereo a infrarossi a colori). Dal 2018, nei nuovi rilievi vengono utilizzate le più recenti fotografie aeree stereoscopiche.
L'interpretazione dei cambiamenti viene eseguita manualmente con l'aiuto di uno schermo 3D. I dati illustrano e quantificano sia i processi negativi come l'imboschimento dovuto alla cessazione della gestione, sia gli sviluppi positivi a seguito di misure di rigenerazione o di regimi di gestione adattati.
Per poter valutare le condizioni e i cambiamenti nelle zone di riproduzione degli anfibi, paludi, torbiere e praterie e pascoli secchi in modo riproducibile e spazialmente differenziato mediante fotografie aeree, è stata posata una griglia con maglie di 50m x 50m su ogni biotopo in praterie e pascoli secchi, torbiere e paludi, zone di riproduzione degli anfibi e zone golenali alpine. All'interno delle celle della griglia vengono stimati visivamente semplici indicatori come la percentuale di copertura del suolo aperto, dell'acqua e delle piante legnose, nonché il tipo di piante legnose (ad es. albero singolo, strutture arboree lineari, gruppi di alberi) e la presenza di elementi infrastrutturali. Per le zone golenali e i delta d’importanza nazionale, tuttavia, non viene interpretata alcuna griglia, ma vengono registrate formazioni come banchi di ghiaia privi di vegetazione o diversi tipi di foresta.