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Detektion (C)
Durch Änderung des Stromflusses im Magneten kann die Flugbahn der Ionen so abgelenkt werden, dass sie schliesslich, getrennt nach Massen, auf einen Detektor auftreffen. Leichte Ionen benötigen eine geringere, schwere Ionen eine grössere Magnetstärke, um sie auf den Detektor zu leiten. Beim Auftreffen der Ionen sendet der Detektor ein Signal an einen Recorder. Jedes Signal entspricht einem Molekülion unterschiedlicher Masse und die Signalstärke ist proportional zur Konzentration der aufgetroffenen Ionen. Die Masse des Molekülions kann aufgrund der benötigten Magnetstärke ermittelt werden.
Der Einfachheit halber wurde hier nur die Funktionsweise eines bestimmten Typs eines Massenspektrometers beschrieben. Es gibt heute nämlich nicht nur verschiedene Ionisierungmethoden, sonder auch unterschiedliche Massentrennungsmethoden.