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Das Allergen (also die Allergie-auslösende Substanz) sind bestimmte Eiweisse auf der Pollen-Oberfläche, welche beim Kontakt mit Schleimhäuten von Menschen mit Heuschnupfen innerhalb von Sekunden Entzündungsreaktionen auslösen, wie z. B. dem Anschwellen der Schleimhaut (folglich die verstopfte Nase).
Eine Veranlagung für Heuschnupfen kann familiär vererbt werden. Jede Person kann aber daran erkranken und dies in der Regel im Schulalter. Schätzungsweise jede fünfte Person in der Schweiz ist von Heuschnupfen betroffen.