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AGRIDEA est responsable de la Coordination nationale pour la protection des troupeaux. Les activités de la coordination nationale sont définies dans le cadre d'un mandat de l'Office fédéral de l'environnement (OFEV). La Coordination nationale pour la protection des troupeaux d’AGRIDEA travaille en collaboration avec différents partenaires :
- l'OFEV,
- le groupe mobile d'intervention,
- les spécialistes de la protection des troupeaux des relais régionaux,
- les responsables du suivi des grands prédateurs (KORA).
La Coordination nationale pour la protection des troupeaux :
- est le répondant en matière de protection des troupeaux pour les détenteurs de petit bétail, les offices fédéraux, les administrations cantonales, les stations de recherche, la vulgarisation agricole et les associations de protection de l'environnement,
- dirige et coordonne les activités du groupe mobile d'intervention, qui soutient les personnes concernées en cas d'attaques pendant la période d'estivage et sur les pâturages de printemps et d'automne, par des mesures de protection (gardiennage, intégration de chiens de protection, clôtures),
- coordonne les activités des relais régionaux et administre le soutien financier aux éleveurs et aux réseaux de compétence nationaux,
- est une plate-forme d'information, pour diffuser de l'information sur la protection des troupeaux par le biais de brochures, de dépliants, de panneaux d'information, un film et ce site internet.
En automne 2009, le mandat confié par l'OFEV à AGRIDEA a été reconduit pour une durée de 3 ans jusqu'à fin 2012.