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La chlorella est capable de multiplier le nombre des bonnes bactéries lactiques pour une meilleur l’absorption des nutriments dans le flux sanguin. La chlorelle combattent la production dans le tractus intestinal de pathogènes tels que Candida albicans. La chlorella possède donc un potentiel probiotique : en stimulant les lymphocytes du tractus intestinal qui combattent les éléments étrangers tels que les bactéries anaérobies.
Selon deux études distinctes (2008 et 2009), la chlorella exercerait aussi : 1) une action protectrice significative sur la barrière intestinale de la muqueuse en cas d’ictère occlusif et protègerait contre le stress oxydatif. 2) un effet bénéfique en cas de syndrome du côlon irritable en améliorant certains paramètres impliqués dans la maladie.