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Da die Chinchilla Katze eine Art Perser Katze ist, gibt es einige Überschneidungen zwischen Chinchilla Katzen und anderen Perserlanghaarkatzen. Viele Probleme der Perser Katze treten daher auch bei Chinchillas häufig auf. Da der Kopf verkürzt und das Gesicht abgeflacht ist, können Kieferfehlstellungen vorliegen, die unter Umständen zu Zahnerkrankungen und potenziellen Problemen beim Fressen und Trinken führen. Kleine Nasenlöcher und ein zu langes Gaumensegel können außerdem schwerwiegende Atemprobleme verursachen. Die Tränenkanäle folgen möglicherweise nicht mehr ihrem ursprünglichen Verlauf, so dass das Gesicht ständig nass ist – Hautausschläge und wunde Stellen im Gesicht können die Folge sein. Durch das abgeflachte Gesicht können auch Augenerkrankungen entstehen. Perser tragen ein Gen, das zu Nierenversagen führt (der so genannten autosomal-dominanten polyzystischen Nierenerkrankung, PKD), dadurch dass sich Zysten an der Niere bilden. Als in den 1990er-Jahren entsprechende Tests auf den Markt kamen, wurde dieses Gen bei einem Drittel aller Perser- und Exotic-Shorthair-Katzen gefunden - und obwohl es bei Chinchillas seltener vorzukommen scheint, ist es dennoch vorhanden. Unter Verwendung dieses Tests versuchen Züchter nun das Problem aus der Welt zu schaffen – fragen Sie Ihren Züchter also immer nach den PKD-Zertifikaten von den Elterntieren Ihres Kätzchens.