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[830] Génomique évolutionnaire computationnelle
Le Groupe de Génomique Evolutionnaire Computationnelle du Prof. Zdobnov étudie la génomique comparée des eucaryotes. La génomique comparée ne se limite pas à l'annotation de génomes (une branche complexe ayant d'importantes répercussions pratiques), elle inclut aussi l'étude des principes de l'évolution moléculaire, lesquels permettent d'approcher les questions fondamentales concernant l'évolution et la complexité du vivant. Par l'analyse multiple de génomes animaux, nous essayons d'élucider et de quantifier les processus évolutifs qui déterminent les répertoires d'éléments génomique fonctionnels comme les gènes de protéines et d'ARNs (p.ex. les micro-ARNs) et les séquences conservées non-géniques, de même que prédire leurs fonctions en se basant sur la variabilité de séquence au sein des espèces et des populations. Accordant la priorité aux questions médicales et évolutionnaires, nous nous concentrons sur deux directions stratégiques, la génomique des insectes et celle des vertébrés, dans lesquelles nous participons à des projets internationaux d'analyse de génomes et collaborons avec des laboratoires de génomique fonctionnelle. L'importance de la génomique des vertébrés pour la caractérisation du génome humain est évidente; celle des insectes est intéressante à plusieurs titres: ils comprennent un ensemble d'hématophages de grande importance médicale qui ont évolué indépendamment comme vecteurs de maladies virales et parasitaires (p. ex paludisme), ils sont connnus pour leur évolution moléculaire rapide et comprennent des représentants à divers degrés de divergence, au-delà de ce qui est observé chez les vertébrés. En outre, la richesse des données expérimentales qui s'accumule sur les organismes modèles nous aide à comprendre la biologie humaine.