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En cette fin septembre 2016, l’expédition se trouve dans l'archipel de Vava'u, dans les îles Tonga. Fleur de Passion passe d'un mouillage à un autre parmi toutes les îles qui s'offrent à l’équipage, lequel poursuit en parallèle ses activités d’enregistrement des sons sous-marins et de prélèvement d’échantillons d’eau de surface dans le cadre des deux programmes scientifiques.
Aux Samoa, plus tôt dans le mois, l’escale dans la capitale Apia a été l’occasion d’une visite à bord de scientifiques du Programme régional océanien pour l’environnement (Secretariat of the Pacific Regional Environment Programme), à l’invitation de la consul honoraire de Suisse dans l’île.
Trois nouveaux membres d’équipage ont rejoint le bateau à Apia: deux passagers, Laure et Philippe, et un quatrième jeune du programme socio-éducatif Jeunes en mer.