Í flestum rannsóknum frá 1996 og síðar hafa stilkormar verið taldir heyra undir yfirfylkinguna trochozoa sem inniheldur m.a. lindýr en rannsókn frá 2008 benti til þess að stilkormar væru náskyldir mosadýrum.
Í flestum rannsóknum frá 1996 og síðar hafa stilkormar verið taldir heyra undir yfirfylkinguna trochozoa sem inniheldur m.a. lindýr en rannsókn frá 2008 benti til þess að stilkormar væru náskyldir mosadýrum.