Mas ainda que se entenda que a percepção do Tribunal cabe ainda dentro dos limites daquilo que é sua capacidade de intervenção, não entrando naquilo que é o domínio da Administração substituindo-se à mesma na fundamentação da situação), é preciso notar que, apesar da violação dos deveres de cooperação do contribuinte, se a AT tiver condições de apurar com efectividade os rendimentos a tributar, não deve enveredar pela metodologia indirecta, a qual pressupõe uma situação que se mostre "marcada por uma inultrapassável incerteza e exigindo uma cuidadosa fundamentação”.