以巴冲突
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参见：阿克萨群众起义、加沙戰爭、2014年以巴衝突、美國駐以色列大使館、2019年5月以哈衝突、2021年以巴冲突、2022年8月加以冲突和以色列—哈瑪斯戰爭
在談判破裂後，巴勒斯坦開始了第二次暴動，被稱為阿克薩群眾起義，衝突開始的時間就發生在以色列反對派領袖訪問耶路撒冷聖殿山之後不久。協商的失敗以及暴力事件的爆發使得許多以色列人對巴拉克政府感到失望，並且也使和平協議的支持度大減。
在一場總理的特別選舉後，艾里爾·夏隆在2001年2月成為了新的總理，右翼聯合黨在不到兩年後重新主政，稍後又在2003年的選舉中成功連任。開始從加薩走廊單方面撤軍，並撤出數千名以色列定居者。 以色列因此聲稱已經結束佔領。 然而，這一說法受到了質疑，因為儘管加薩不是以色列的一部分，而且加薩人沒有以色列護照，但以色列繼續對加薩的領海和領空行使控制權。
以色列開始在西岸地區邊界建立了圍牆，目的是為了保護以色列免遭武裝巴勒斯坦團體的攻擊。為了建立長達681公里的圍牆，接近圍牆的緩衝地區也連帶的減少了9.5%的西岸地區面積，使得巴勒斯坦居民的經濟狀況遭遇困難。圍牆的建立的確有效減少了對以色列平民的恐怖攻擊，不過，遭致了國際間的許多批評，也遭到一些以色列極左派的批評。。
2006年6月25日凌晨，8名巴勒斯坦武装人员通过地下通道潜入位于加薩地带南部附近的以軍軍事哨所，向坦克和碉堡发射火箭弹，并炸毁一辆装甲车。以军发言人证实，2名士兵被炸身亡，4名士兵受伤。遭绑架的以军士兵是19岁的吉拉德·沙利特。当晚，以色列内阁举行特别会议，决定同意国防军着手营救这名士兵。以色列對此展開了夏雨行動，大量轟炸哈瑪斯目標以及其他橋樑、道路、以及發電站。以色列也派軍佔領此地區。
2007年6月，哈瑪斯通過加薩之戰從法塔赫手中奪得加薩走廊的控制權，自此法塔赫僅控制約旦河西岸地區，而加薩走廊由哈瑪斯控制。以色列從此開始嚴密封鎖加薩走廊，埃及亦關閉加薩走廊南部的邊界，居民只能依靠救濟和從與埃及間的地道掙扎求生。
以色列自2007年3月開始準備對加薩地帶進行軍事干預。6月，當雙方正在進行協商時，國防部長埃胡德·巴拉克下令以色列國防軍（IDF）制定針對加薩的作戰計劃。2008年6月19日，在埃及的調停下，以色列與哈瑪斯達成為期六個月的「休戰」協議，暫停敵對行動。然而，由於該協議沒有共同商定的文本或執行機制，最終失效。該協議的目的是為IDF的作戰準備贏得時間。
該協議規定，哈瑪斯必須停止對以色列的火箭和迫擊砲攻擊，而以色列則需停止對加沙的軍事行動並逐步在13天內減少對加薩的封鎖。
雙方未能達成共識的議題包括哈瑪斯在加薩的軍事建設以及釋放被俘的以色列士兵沙利特。
哈瑪斯呼籲加薩的所有武裝組織遵守停火，並對此充滿信心。以色列的談判代表、國防部官員阿莫斯·吉拉德強調，以色列要求全面停火，即便一枚火箭被發射都將被視為違反協議。他還補充說，埃及也承諾將阻止加薩的走私行為。此外，吉拉德表示，以色列將對來自加薩的所有襲擊事件追究哈瑪斯的責任。
在英國外交事務委員會的一次調查中，阿爾巴索斯博士表示：「不幸的是，在2008年11月4日，以色列軍隊殺死了六名巴勒斯坦人。當晚我正準備離開加薩前往英國。我記得當時以色列軍隊入侵了加薩中部地區，並殺死了六人。我認為這是以色列方面的嚴重違規，破壞了停火協議。我相信，包括哈瑪斯在內的巴勒斯坦派系當時已經遵守停火，並有意在近期內重啟協議。」然而，巴爾-亞科夫女士反駁道：「以色列方面對停火增加了一個條件，擔心哈瑪斯正在挖掘隧道穿越邊境以綁架更多士兵。條件規定，如果哈瑪斯靠近邊境500米內，以色列將會發動攻擊，而這正是2008年11月4日所發生的事情。」
英國律師兼教授杰弗里·奈斯（Geoffrey Nice）與將軍尼克·帕克（Nick Parker）在一次講座中表示：「挖掘隧道並不構成違反停火協議，但以色列武裝入侵加薩則明顯是違規行為。」
2008年12月15日，以色列在傑寧暗殺巴勒斯坦高級指揮官，引發以色列和哈馬斯之間的一輪攻擊。
2008年12月17日，一名40歲的巴勒斯坦人在加薩北部被以色列國防軍炮火打死。第二天，12 月 18 日，哈馬斯宣布停火結束，距離停火正式到期的前一天。當天有20多枚火箭從加薩發射到以色列南部。
2008年12月19日，哈馬斯拒絕參加續簽六個月停火協議的談判，哈馬斯發言人宣布不會延長停火協議。發言人艾曼·塔哈指出，哈馬斯拒絕是因為敵人沒有遵守其義務，以放鬆對加薩地帶的嚴重封鎖，並且沒有停止所有襲擊。
2008年12月22日，以色列國防部長埃胡德·巴拉克表示，以色列不會接受加薩走廊巴勒斯坦武裝分子持續發射火箭彈，此前一直支持停戰的以色列外交部長齊皮·利夫尼建議對巴勒斯坦人採取軍事行動。
2008年12月23日，哈馬斯高級領導人馬哈茂德·扎哈爾表示，哈馬斯願意根據最初的條款延長停火，要求以色列承諾不在加薩地帶採取任何軍事行動，並保持邊境口岸開放。札哈爾在接受埃及報紙《金字塔報》採訪時表示，一旦哈馬斯發誓停止發射火箭彈的 24 小時結束，運動將重新評估加薩局勢。儘管巴勒斯坦武裝派系宣布暫時停火，八枚卡薩姆火箭和八枚迫擊砲彈仍然擊中了內蓋夫。同一天，以色列國防軍擊斃了三名巴勒斯坦武裝份子，表示他們在邊境安放爆炸物。
2008年12月24日，以色列的空襲打擊了加薩地帶的一群武裝分子。以色列軍方發言人表示，這些武裝分子向以色列發射了迫擊砲。巴勒斯坦醫護人員表示，襲擊中一名哈瑪斯人員死亡，另外兩名巴勒斯坦人受傷，其中包括一名哈瑪斯電視台的攝影師。
同日，哈瑪斯的軍事部門發表聲明，宣佈啟動代號為「油漬行動」（Operation Oil Stain）的行動。87枚巴勒斯坦的迫擊砲、喀秋莎火箭和卡桑火箭擊中了內蓋夫地區。哈瑪斯聲稱將擴大「油漬行動」，讓數千名以色列人「置於火線下」。此外，哈瑪斯表示已為戰爭做好準備：「這遠比向以色列威脅屈服更重要，我們現在的準備程度比以往任何時候都更充分，以應對以色列的侵略並自我防衛。」
2008年12月25日，以色列「完成了大規模攻勢的準備」後，以色列總理埃胡德·奧爾默特在接受阿拉伯語衛星頻道Al-Arabiya的採訪時發出最後警告。他表示：「我現在告訴他們，這可能是最後一刻，我在告訴他們停止。我們（以色列）更強大。」當天又有六枚卡桑火箭落入以色列南部。
2008年12月27日以色列和哈馬斯之間的臨時休戰協議破裂後，以色列F-16戰鬥機對加薩目標發動了一系列空襲。
以色列在衝突開始前六個月就開始籌劃軍事行動，目標是蒐集情報以識別可能的攻擊目標。以色列國防軍（IDF）還進行了虛假信息行動，旨在讓哈瑪斯感到安全，從而出其不意地發動攻勢。國防部長埃胡德·巴拉克（Ehud Barak）表示，此次攻勢是由於以色列對火箭攻擊的「耐心已經耗盡」，而哈瑪斯在11月4日以色列摧毀一條隧道後重新開始發射火箭。
以色列官員稱，12月27日的軍事行動讓哈瑪斯措手不及，從而增加了其武裝分子的傷亡數量。
2014年5月15日，兩名巴勒斯坦青少年在貝圖尼亞大屠殺紀念活動中被以色列軍警槍殺。
2014年6月12日，三名以色列青少年在約旦河西岸被綁架。
2014年7月8日，以色列国防部队发动了名为“保护边缘行动”针对哈馬斯，军事入侵加薩，釀成巴勒斯坦平民死傷慘重。
2014年8月27日，以色列和哈马斯达成停火协议，2014年以巴冲突结束。
2015年10月11日，以色列國防軍在加薩走廊邊界和參與示威遊行的巴勒斯坦人爆發一連串衝突，造成6人死亡和50多人受傷。
2018年5月14日，美國駐以色列耶路撒冷大使館開幕，正值以色列的獨立日，亦是巴勒斯坦「災難節」的前一日。加沙地帶爆發新一輪示威反對美國和以色列，批評兩國認定耶路撒冷為以色列的首都，侵佔巴勒斯坦的主權。其後以色列警方開槍鎮壓示威，超過50人死亡、至少2,000人受傷。巴勒斯坦人稱之為「大屠殺」，外界相信此次示威為近年以巴衝突中最血腥的一日。多國批評以色列的行動，其中土耳其更加驅逐外交官，以色列則以對方不尊重外交禮儀為由，驅逐土耳其外交官。而美國則支持以色列，指責哈馬斯挑起衝突。
2018年12月10日，以色列军人进入拉姆安拉打伤27名巴勒斯坦人。
2019年5月3日至6日，自加薩地带两名以色列士兵在加薩-以色列边境的每周抗议活动中受到狙击手射击，加薩-以色列冲突于2019年5月3日开始升级，作为回应，以色列空军进行了空袭，造成四名巴勒斯坦人死亡。此后，加沙向以色列发射了数百枚火箭弹，而以色列空军袭击了加沙地带内的许多目标。此外，以色列增加了在加沙-以色列边界附近的部队人员。在埃及的调解下停火协议于5月6日生效。
2019年9月28日，马来西亚首相马哈迪·莫哈末在第74届联合国大会上发表演说时表明，马来西亚无法接受以色列「公然占领巴勒斯坦领土作为定居点，同时侵占耶路撒冷」。
2020年5月，巴勒斯坦总统馬哈茂德·阿巴斯宣布与美国和以色列的所有协议无效。不過在當年11月17日，巴方决定与以色列恢复双边安保和民事合作。
火箭攻击以色列南部影片，2009年3月
阿卡桑火箭从加沙平民区向以色列南部发射，2009年1月
2008年加沙戰爭期間，以色列對加沙的空袭
2021年5月7日，由於以色列最高法院準備審理驅逐東耶路撒冷謝赫傑拉區巴勒斯坦人出住處一案，加之以色列警方以防疫為理由，限制巴勒斯坦民衆齋月期間前往聖殿山祈禱，引爆大規模衝突，以色列部隊衝入阿克薩清真寺導致衝突升級。11日哈馬斯向以色列中部城市特拉維夫發射火箭彈，以色列隨即在加沙轟炸展開還擊。
2022年8月5日，以色列国防军以“破晓行动”的名义向加沙地带的武装分子和基础设施发动空袭。
2023年1月26日，以色列军方在杰宁市与巴勒斯坦武裝分子发生冲突，导致至少9名巴勒斯坦人死亡、20人受伤，9名死者中包括1名年長婦女和8名男性。這起衝突成為傑寧鎮20年來，死傷最嚴重的一次。巴勒斯坦总统马哈茂德·阿巴斯宣布为遇难者哀悼三天。同時巴方决定中断与以方的安全协调。巴勒斯坦武装人员同時从加沙地带向以色列发射两枚火箭弹。1月27日，以军表示两枚火箭弹已被防空系统拦截。
2023年2月22日晚，以色列军队对纳布卢斯发动突袭，造成11人死亡。2月底，約旦河西岸北部城鎮胡瓦拉有兩名以色列人遭巴勒斯坦人槍殺，引發住在附近猶太定居點的以色列人不滿。大批以色列人襲擊巴勒斯坦人的房屋，有多間房屋和十多架汽車被人放火。襲擊中有一名巴勒斯坦男子中槍身亡，4人嚴重受傷，近一百人吸入催淚氣體接受治疗。同時以色列与巴勒斯坦官员在约旦会谈，承诺采取措施以缓解不断升级的暴力冲突。同時以色列承诺在未来4个月停止讨论建立任何新的定居点，并在未来6个月停止批准任何新的定居点。
2023年3月7日，以軍進入約旦河西岸傑寧難民營搜捕，期間與巴勒斯坦人發生衝突，導致6名巴勒斯坦人被以軍擊斃，另有26名巴勒斯坦人受傷。3月9日，有3名巴勒斯坦人在杰宁被以色列军人打死。4月6日，以色列军队对加沙地带发动空袭。
2023年5月9日凌晨起，以色列国防军出动战机空襲對加沙地带發動多輪空襲，截至5月11日，襲擊已造成30人死亡，76人受伤。死者中包括傑哈德的3名领导人。以色列方面遭到火箭弹襲擊，造成至少1人死亡。5月12日下午，以色列国防军对加沙地带中部一处公寓发动空袭，造成包括一名杰哈德高级成员在内的多人死亡。5月13日，杰哈德同以色列达成停火协议。5月22日，巴勒斯坦卫生部表示，以色列军队在纳布卢斯打死3名巴勒斯坦人。
2023年6月19日，以色列突袭杰宁难民营，打死了包括一名儿童在内的5名巴勒斯坦人，總共有691人受伤，其中包括7名以色列士兵。另外這也是以色列20年年來首次動用飛機轰炸约旦河西岸目标。
2023年6月20日，两名巴勒斯坦哈马斯武装人员在约旦河西岸的一处犹太人定居点开枪，造成4名以色列人死亡，另有4人受伤。两名袭击者被以军开枪打死。之後以色列国防军宣布向约旦河西岸增派兵力。同時大批犹太定居者攻击了位于约旦河西岸的多个巴勒斯坦城镇，冲突導致至少有30多名巴勒斯坦人受伤。
2023年6月21日，以色列軍方使用無人機對傑寧一輛汽車發動空襲，造成3名巴勒斯坦人死亡。這是以軍2005年以來，首次在西岸地區利用無人機實施暗殺行動。
2023年7月3日，以色列军队对杰宁难民营发起突袭，導致至少12名巴勒斯坦人死亡，140人受傷。巴勒斯坦總統阿巴斯宣佈中断与以方的联系和安全协调。7月4日，特拉维夫北部一街区发生一起驾车袭击事件，造成7人受伤。袭击者被开枪打死。巴勒斯坦伊斯兰抵抗运动发表声明确认袭击者为该组织成员，称袭击目的是为报复以色列正在杰宁进行的大规模军事行动。加沙地带有人朝以色列發射火箭弹。以色列战斗机隨即朝加沙地带北部巴勒斯坦伊斯兰抵抗运动的一处地点以及加沙城以西的另一处地点發射導彈。
2023年10月7日（第四次中东战争五十周年纪念日），巴勒斯坦武裝組織哈馬斯由加沙地帶發動代號「阿克薩洪水」的軍事行動，發射逾5,000枚火箭彈襲擊以色列並派員進入其南部領土。并俘虏了多名以色列国防军将领，以色列國防軍隨後向對方空襲予以還擊，並發出「戰爭狀態警報」。，以色列总理内塔尼亚胡敦促以色列人离开加沙，10月9日，以色列国防部长加兰特表示已下令全面包围加沙地带。
2023年10月18日，联合国安理会就巴以冲突举行了会议，对巴西提出的一份呼吁“实行人道主义暫時停火”的决议草案进行表决，12票赞成、1票反对和2票弃权。由于联合国常任理事国美国，使用了一票否决权，草案最终未能通过。
2023年11月13日，以色列拒絕國際社會的停火呼聲和示威浪潮，繼續在加沙北部難民營對哈馬斯武裝分子發動進攻。加沙巴人政府稱，在空襲中喪生的居民人數已上升至11180人，受傷人數超過28000人。
2023年11月14日，聯合國近東巴勒斯坦難民救濟和工程處主任專員稱，加沙南部一幢聯合國工作人員居住的大樓因空襲而遭受嚴重損壞，聯合國駐加沙的工作人員在另一棟建築物內避難，沒有收到任何工作人員傷亡的報告；另外，聯合國總部降半旗，為衝突中遇難的101名工作人員誌哀，聯合國官員和各地工作人員默哀一分鐘。
2023年11月16日，聯合國安理會投票通過由馬耳他提出、呼籲在加沙實施人道主義暫時停火的決議案，這是安理會自以巴爆發衝突以來首次通過相關決議。
2023年11月20日，由沙特阿拉伯、約旦、埃及和巴勒斯坦外長組成的阿拉伯國家外長代表團，於周一（20日）抵達北京，與外長王毅會晤，推動為以巴衝突降溫。
2023年11月24日，以色列和哈馬斯為期4天的交換人質和臨時停火協議，於當地時間11月24日 上午7時生效。
2023年11月28日，馬斯克會晤以色列總理內塔尼亞胡，並表示他希望在以巴衝突結束後幫助重建加沙。
2023年12月1日，以色列軍方表示，哈馬斯違反停火協議，並向以色列領土開火，已在加沙恢復與哈馬斯的戰鬥。
2023年12月12日，聯合國大會以壓倒性多數投票通過決議，要求加沙停火。美國總統拜登稱，以色列總理內塔尼亞胡「必須作出改變」。
2023年12月14日，白宮國家安全顧問沙利文訪問以色列，尋求降低以軍在加沙的作戰強度。美國總統拜登則表示，希望內塔尼亞胡政府更加聚焦於「如何拯救平民的生命」。
2023年12月18日，伊朗支持的也門胡塞武裝對紅海的威脅有增無減，近日接連有貨船受襲下，4家航運巨頭相繼宣布停駛紅海航道。
2023年12月19日，以巴衝突引發海運樞紐紅海局勢動盪，由於支持巴勒斯坦的也門胡塞武裝組織襲擊途經商船，導致油價上升，美國及盟國已同意組建紅海海軍特遣部隊保障航道。
2023年12月21日，美國準備組建多國海軍特遣隊，來保護紅海航運貿易，但也門胡塞武裝組織不為所動，誓言打擊更多商船，警告美國若出手，將攻擊美軍艦隻。
2023年12月29日，加沙衞生部門稱，以軍在周四（28日）再發動20次空襲，導致最少210人死亡、360人受傷，令戰爭爆發以來巴人累積死亡數字超過2.13萬。
2024年1月2日，以色列將在未來幾天從加沙撤出5個旅，將戰爭性質轉變為更具針對性的行動。
2024年1月3日，美國政府批評兩名以色列部長呼籲在加沙走廊以外地區重新安置巴勒斯坦人的言論。
2024年1月5日，美國國務卿布林肯本周將展開以巴衝突以來第四次中東之行。他此行是試圖避免中東爆發更廣泛衝突。
2024年1月8日，美國國務卿布林肯警告，以巴衝突可能很容易就會演變成一場全面的地區衝突。他正在中東穿梭外交，希望給緊張局勢降溫。
2024年1月9日，以色列繼續攻擊哈馬斯。加沙衛生部門表示，自去年10月7號衝突爆發以來，加沙已有超過2.3萬人死於戰火。
2024年1月12日，美英兩國對也門的胡塞武裝目標發動空襲，導致衝突升級。胡塞武裝之前多次發動襲擊，已嚴重干擾紅海的商業運輸。
 針對當前紅海局勢和針對也門的空襲行動，中國外交部發言人毛寧在例行記者會上表示，中方對紅海局勢緊張升級感到憂慮，呼籲有關各方保持冷靜克制，避免衝突進一步擴大。
2024年1月16日，胡塞武裝在亞丁灣向一艘美國貨船發射導彈，並擊中目標。英國海上貿易行動局發布聲明，表示根據船長報告，船的左舷被一枚導彈從上方擊中。
2024年1月17日，卡塔爾政府表示，以色列和哈馬斯已達成協議，向加沙的以色列人質提供緊急藥物，換取當地平民獲得藥物及人道援助。
法國總統馬克龍表示，法國不會加入美英空襲胡塞武裝目標的行動，因為擔憂會令局勢升級。美軍對也門境內的胡塞武裝目標發動新一輪攻擊。胡塞武裝營運的傳媒報道，美英在當地1月17日凌晨時份，轟炸也門北部及中部的多處地點。
2024年1月18日，美國政府將也門胡塞武裝重新列入恐怖組織名單。白宮國家安全顧問沙利文發表聲明說，為應對也門胡塞武裝持續的威脅和襲擊，美國將胡塞武裝列為「特別認定全球恐怖份子」實體，以阻止恐怖份子向他們提供資金，進一步限制胡塞武裝進入金融市場，並追究他們襲擊往來紅海和亞丁灣商船的責任。如果胡塞武裝停止襲擊，美國將立即重新評估有關決定。
2024年4月19日，以色列疑似對伊朗發動大規模空襲，伊朗消息稱繼今晨除伊朗中部城市伊斯法罕外，設有導彈基地的西北部城市塔普里茲(Tabriz)也傳出爆炸聲。
2024年5月26日，以軍隨即於5月26日晚間，空襲拉法一個難民營。哈馬斯衛生部表示，至少40名巴人死亡。
2024年6月12日，哈馬斯已就美國支持的停火提議，向埃及和卡塔爾作出答覆，希望修改協議內容。哈馬斯和巴勒斯坦伊斯蘭聖戰組織在一份聯合新聞聲明中稱，協議應「優先考慮我們巴勒斯坦人民的利益，以及完全停止對加沙走廊的持續侵略。
2024年7月30日，哈馬斯領導人哈尼亞(Ismail Haniyeh)訪問伊朗首都德黑蘭，參加伊朗新總統就職典禮期間，遇襲身亡。哈馬斯發表聲明稱，哈尼亞死於以色列發動的空襲。