生物鹼
生物鹼的分類

与大多数其他天然化合物相比，生物碱的特征在于其丰富的结构多样性，没有统一分类。
| 類別 | 主要結構 | 主要合成路線 | 例子 |
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與含氮雜環生物鹼（真正生物鹼）
| 吡咯烷 類衍生物  |  | 鳥氨酸 或 精氨酸 → 腐胺 → N-甲基腐胺 → N-methyl-Δ1-pyrroline  | Cuscohygrine（英语：）, hygrine（英语：）, hygroline, stachydrine |
| 托烷 類衍生物  | 阿托品類  原子取代於位置 3, 6 或 7  | 鳥氨酸或精氨酸→腐胺→N-甲基腐胺→N-甲基-Δ1-吡咯烷酮  | Atropine, scopolamine, hyoscyamine |
| 托烷 類衍生物  | 可卡因類   原子取代於位置 2, 3  | 鳥氨酸或精氨酸→腐胺→N-甲基腐胺→N-甲基-Δ1-吡咯烷酮  | Cocaine, ecgonine（英语：）  |
| 吡咯里西啶 類衍生物  | 非酯類 | 鳥氨酸，精氨酸→腐→類精脒→惹卓裂鹼  | Retronecine（英语：）, heliotridine, laburnine  |
| 吡咯里西啶 類衍生物  | 一元羧酸的複合酯 | 鳥氨酸，精氨酸→腐→類精脒→惹卓裂鹼  | Indicine, lindelophin, sarracine  |
| 吡咯里西啶 類衍生物  | 大環內二酯 | 鳥氨酸，精氨酸→腐→類精脒→惹卓裂鹼  | Platyphylline, trichodesmine |
| 吡咯里西啶 類衍生物  | 1-氨基吡咯烷類 (lolines（英语：）) | L-脯氨酸+ L-高絲氨酸→N-（3-氨基-3-羧丙基）脯氨酸→降黑麥草堿  | Loline, N-formylloline, N-acetylloline |
| 哌啶 類衍生物  |  | 賴氨酸 → 屍胺 → Δ1-piperideine  | Sedamine, lobeline, anaferine, piperine  |
| 哌啶 類衍生物  |  | 辛酸 → coniceine → 毒芹碱  | Coniine, coniceine  |
| 喹 類衍生物  | 羽扇豆碱 類 | 賴氨酸 → 屍胺 → Δ1-piperideine  | Lupinine（英语：）, nupharidin  |
| 喹 類衍生物  | 野靛碱 類 | 賴氨酸 → 屍胺 → Δ1-piperideine  | 野靛碱  |
| 喹 類衍生物  | 司巴丁 類 | 賴氨酸 → 屍胺 → Δ1-piperideine  | 司巴丁, lupanine, anahygrine |
| 喹 類衍生物  | 苦參鹼 類 | 賴氨酸 → 屍胺 → Δ1-piperideine  | Matrine, oxymatrine, allomatridine |
| 喹 類衍生物  | 苦豆鹼 類 | 賴氨酸 → 屍胺 → Δ1-piperideine  | Ormosanine, piptantine |
| 吲哚聯啶 類衍生物  |  | 賴氨酸 → δ-semialdehyde of Α-氨基己二酸 → pipecolic acid（英语：） → 1 indolizidinone  | Swainsonine（英语：）, castanospermine（英语：）  |
| 吡啶 類衍生物  | 吡啶簡單衍生物 | 烟酸 → dihydronicotinic acid → 1,2-dihydropyridine  | Trigonelline（英语：）, ricinine, arecoline（英语：）  |
| 吡啶 類衍生物  | 多環芳烴非冷凝吡啶衍生物 | 烟酸 → dihydronicotinic acid → 1,2-dihydropyridine  | Nicotine, nornicotine（英语：）, anabasine（英语：）, anatabine  |
| 吡啶 類衍生物  | 多環芳烴冷凝吡啶衍生物 | 烟酸 → dihydronicotinic acid → 1,2-dihydropyridine  | Actinidine（英语：）, gentianine, pediculinine  |
| 吡啶 類衍生物  | Sesquiterpene（英语：） pyridine derivatives | 烟酸, 異亮氨酸  | Evonine, hippocrateine, triptonine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Simple derivatives of isoquinoline  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Salsoline, lophocerine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Derivatives of 1- and 3-isoquinolines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | N-methylcoridaldine, noroxyhydrastinine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Derivatives of 1- and 4-phenyltetrahydroisoquinolines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Cryptostilin  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Derivatives of 5-naftil-isoquinoline  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Ancistrocladine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Derivatives of 1- and 2-benzyl-izoquinolines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Papaverine, laudanosine（英语：）, sendaverine |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Cularine group | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Cularine, yagonine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Pavine（英语：）s and isopavines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Argemonine, amurensine（英语：）  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Benzopyrrocolines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Cryptaustoline  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Protoberberines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Berberine, canadine（英语：）, ophiocarpine, mecambridine, corydaline  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Phthalidisoquinolines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Hydrastine, narcotine（英语：） (Noscapine)  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Spirobenzylisoquinolines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Fumaricine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Ipecacuanha（英语：） alkaloids | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Emetine, protoemetine, ipecoside  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Benzophenanthridines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Sanguinarine, oxynitidine, corynoloxine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Aporphine（英语：）s  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Glaucine（英语：）, coridine, liriodenine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Proaporphines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Pronuciferine, glaziovine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Homoaporphines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Kreysiginine, multifloramine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Homoproaporphines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Bulbocodine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | 嗎啡s | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | 嗎啡, 可待因, 蒂巴因, 青藤碱 , 海洛因 |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Homomorphines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Kreysiginine, androcymbine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Tropoloisoquinolines  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Imerubrine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Azofluoranthenes  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Rufescine, imeluteine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Amaryllis alkaloids | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Lycorine, ambelline, tazettine, galantamine（英语：）, montanine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Erythrina alkaloids | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Erysodine, erythroidine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Phenanthrene derivatives  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Atherosperminine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Protopine（英语：）s  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Protopine（英语：）, oxomuramine, corycavidine  |
| 異喹啉 類衍生物及相關生物鹼  | Aristolactam  | Tyrosine or 苯丙氨酸 → 多巴胺 or 酪胺 (for alkaloids Amarillis)  | Doriflavin  |
| 噁唑 類衍生物[  |  | Tyrosine → tyramine  | Annuloline, halfordinol, texaline, texamine |
| 異噁唑 類衍生物  |  | Ibotenic acid → Muscimol | Ibotenic acid, Muscimol |
| 噻唑 類衍生物  |  | 1-Deoxy-D-xylulose 5-phosphate（英语：） (DOXP), tyrosine, cysteine  | Nostocyclamide, thiostreptone  |
| 喹唑啉 類衍生物  | 3,4-Dihydro-4-quinazolone derivatives | Anthranilic acid or phenylalanine or ornithine  | Febrifugine |
| 喹唑啉 類衍生物  | 1,4-Dihydro-4-quinazolone derivatives | Anthranilic acid or phenylalanine or ornithine  | Glycorine, arborine, glycosminine |
| 喹唑啉 類衍生物  | Pyrrolidine and piperidine quinazoline derivatives | Anthranilic acid or phenylalanine or ornithine  | Vazicine (peganine)  |
| 吖啶 類衍生物  |  | Anthranilic acid  | Rutacridone, acronicine |
| 喹啉 類衍生物  | Simple derivatives of quinoline derivatives of 2 – quinolones and 4-quinolone | Anthranilic acid → 3-carboxyquinoline  | Cusparine, echinopsine, evocarpine |
| 喹啉 類衍生物  | Tricyclic terpenoids | Anthranilic acid → 3-carboxyquinoline  | Flindersine |
| 喹啉 類衍生物  | Furanoquinoline derivatives | Anthranilic acid → 3-carboxyquinoline  | Dictamnine, fagarine, skimmianine |
| 喹啉 類衍生物  | Quinines | Tryptophan → tryptamine → strictosidine（英语：） (with secologanin（英语：）) → korinanteal → cinhoninon  | Quinine, quinidine, cinchonine, cinhonidine  |
吲哚 類衍生物  参见：indole alkaloids: 非異戊二烯吲哚生物鹼
| 吲哚 類衍生物  参见：indole alkaloids | Simple indole derivatives  | Tryptophan → tryptamine or 5-hydroxitriptofan  | Serotonin, psilocybin, dimethyltryptamine (DMT), bufotenin  |
| 吲哚 類衍生物  参见：indole alkaloids | Simple derivatives of β-carboline（英语：）  | Tryptophan → tryptamine or 5-hydroxitriptofan  | Harman, harmine（英语：）, harmaline（英语：）, eleagnine  |
| 吲哚 類衍生物  参见：indole alkaloids | Pyrroloindole alkaloids  | Tryptophan → tryptamine or 5-hydroxitriptofan  | Physostigmine (eserine), etheramine, physovenine, eptastigmine |
吲哚 類衍生物  参见：indole alkaloids: 半萜類吲哚生物鹼'
| 吲哚 類衍生物  参见：indole alkaloids | Ergot alkaloids | Tryptophan → chanoclavine → agroclavine → elimoclavine → paspalic acid → lysergic acid  | Ergotamine, ergobasine, ergosine |
吲哚 類衍生物  参见：indole alkaloids: 單萜吲哚生物鹼
| 吲哚 類衍生物  参见：indole alkaloids | Corynanthe type alkaloids | Tryptophan → tryptamine → strictosidine（英语：） (with secologanin（英语：）)  | Ajmalicine, sarpagine, vobasine, ajmaline, yohimbine, reserpine, mitragynine（英语：）, group strychnine and (Strychnine brucine（英语：）, aquamicine, vomicine ) |
| 吲哚 類衍生物  参见：indole alkaloids | Iboga（英语：）-type alkaloids | Tryptophan → tryptamine → strictosidine（英语：） (with secologanin（英语：）)  | Ibogamine（英语：）, ibogaine（英语：）, voacangine（英语：） |
| 吲哚 類衍生物  参见：indole alkaloids | Aspidosperma-type alkaloids | Tryptophan → tryptamine → strictosidine（英语：） (with secologanin（英语：）)  | Vincamine（英语：）, vinca alkaloids（英语：）, vincotine, aspidospermine |
| 咪唑 類衍生物  |  | Directly from histidine | Histamine, pilocarpine, pilosine, stevensine |
| 嘌呤 類衍生物  |  | Xanthosine（英语：） (formed in purine biosynthesis) → 7 methylxantosine → 7-methyl xanthine → theobromine → caffeine  | Caffeine, theobromine, theophylline, saxitoxin（英语：）  |
側鏈上含氮原子的生物側鏈鹼
| β-苯乙胺 類衍生物  |  | Tyrosine or phenylalanine → dioxyphenilalanine → dopamine → adrenaline and mescaline tyrosine → tyramine phenylalanine → 1-phenylpropane-1,2-dione → cathinone（英语：） → ephedrine and pseudoephedrine  | Tyramine, ephedrine, pseudoephedrine, mescaline, cathinone（英语：）, catecholamines (adrenaline, noradrenaline, dopamine) |
| 秋水仙素 類衍生物   |  | Tyrosine or phenylalanine → dopamine → autumnaline → colchicine  | Colchicine, colchamine |
| 毒蕈鹼   |  | Glutamic acid → 3-ketoglutamic acid → muscarine (with pyruvic acid) | Muscarine, allomuscarine, epimuscarine, epiallomuscarine |
| 芐胺  |  | Phenylalanine with valine, leucine or isoleucine | Capsaicin, dihydrocapsaicin, nordihydrocapsaicin, vanillylamine |
多胺生物鹼
| 腐胺 衍生物  |  | ornithine → putrescine → spermidine → spermine | Paucine  |
| 亞精胺 衍生物  |  | ornithine → putrescine → spermidine → spermine | Lunarine, codonocarpine |
| 精胺 衍生物  |  | ornithine → putrescine → spermidine → spermine | Verbascenine, aphelandrine  |
Peptide (cyclopeptide) alkaloids
| Peptide alkaloids with a 13-membered cycle  | Nummularine C type | From different amino acids  | Nummularine C, Nummularine S  |
| Peptide alkaloids with a 13-membered cycle  | Ziziphine type | From different amino acids  | Ziziphine A, sativanine H  |
| Peptide alkaloids with a 14-membered cycle  | Frangulanine type | From different amino acids  | Frangulanine, scutianine J  |
| Peptide alkaloids with a 14-membered cycle  | Scutianine A type | From different amino acids  | Scutianine A  |
| Peptide alkaloids with a 14-membered cycle  | Integerrine type | From different amino acids  | Integerrine, discarine D  |
| Peptide alkaloids with a 14-membered cycle  | Amphibine F type | From different amino acids  | Amphibine F, spinanine A  |
| Peptide alkaloids with a 14-membered cycle  | Amfibine B type | From different amino acids  | Amphibine B, lotusine C  |
| Peptide alkaloids with a 15-membered cycle  | Mucronine A type | From different amino acids  | Mucronine A  |
Pseudoalkaloids (terpenes and steroids)
| Diterpenes   | Lycoctonine type | Mevalonic acid → izopentenilpyrophosfate → geranyl pyrophosphate（英语：）  | Aconitine, delphinine（英语：）  |
| Steroids  |  | Cholesterol, arginine | Solasodine, solanidine（英语：）, veralkamine, batrachotoxin（英语：） |