中華民國中央行政機關
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標示粗字體者，其首長為內閣成員，有出席參加行政院會議之權利及義務。下附部會所屬的中央三級機關（不含事業機構），依照其類型與最初創立或改組時間（含1949年政府遷台前）排列。
| 名稱 | 名稱 | 名稱 | 最初創立時間 | 年度預算額（新臺幣） （民國104年度） | 備註 |
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| 行政院 | 行政院 | 行政院 | 1928年10月25日 | 1,212,326,000元 |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 行政院人事行政總處 | 行政院人事行政總處 | 1967年9月16日 | 2,458,051,000元 | 原 行政院人事行政局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 公務人力發展學院 | 2017年7月7日 |  | 原 行政院人事行政局公務人力發展中心、行政院人事行政總處地方行政研習中心 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 行政院主計總處 | 行政院主計總處 | 1931年 | 1,059,325,000元 | 原 行政院主計處 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 行政院公共工程委員會 | 行政院公共工程委員會 | 1995年7月20日 | 364,529,000元 |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 內政部 | 內政部 | 1912年1月3日 | 27,275,638,000元 | 原 清代民政部、北京政府內務部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國土管理署 | 1981年3月2日 | 23,506,718,000元 | 原 內政部營建司、內政部營建署 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國家公園署 | 2023年9月20日 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 警政署 | 1946年8月15日 | 20,122,470,000元 | 原 內政部警察總署 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 消防署 | 1995年3月1日 | 1,502,988,000元 | 原 內政部警政署消防組 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 移民署 | 1952年 | 4,004,546,000元 | 原 內政部入出國及移民署 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 建築研究所 | 1995年10月30日 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 空中勤務總隊 | 2005年11月9日 |  | 原 內政部警政署空中警察隊 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 外交部 | 外交部 | 1912年1月3日 | 22,689,991,000元 | 原 清代外務部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 領事事務局 | 1992年 | 1,409,701,000元 |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 外交及國際事務學院 | 2012年9月1日 |  | 原 外交部外交領事人員講習所 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 國防部 | 國防部 | 1946年6月1日 | 1,453,510,000元 | 原 國民政府軍事委員會、軍政部、國防最高委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 全民防衛動員署 | 2022年1月1日 |  | 原 國防部全民防衛動員室、參謀本部作戰計畫室、國防部後備指揮部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 政治作戰局 | 1923年 |  | 原 國防部總政治作戰部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 軍備局 | 2002年3月1日 |  | 原 軍備局規劃組、軍備局籌備室 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 軍事情報局 | 1928年 |  | 原 國民政府軍事委員會調查統計局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 主計局 | 2002年3月1日 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 軍醫局 | 2002年3月1日 |  | 原 參謀本部軍醫局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 參謀本部 | 1946年 |  | 原 中華民國參謀部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 陸軍司令部 | 1912年 |  | 原 北京政府陸軍部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 海軍司令部 | 1912年 |  | 原 海軍部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 空軍司令部 | 1921年 |  | 原 國民政府軍事委員會航空司令部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 憲兵指揮部 | 1932年 |  | 原 國防部憲兵司令部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 資通電軍指揮部 | 2017年7月1日 |  | 原 資電作戰指揮部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國防部總督察長室 | 2013年 |  | 原 國防部聯合作戰委員會、國防部聯合作戰訓練部、國防部聯合作戰訓練暨督察部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 財政部 | 財政部 | 1912年1月3日 | 18,775,537,000元 |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國庫署 | 1911年 | 136,823,913,000元 | 原 財政部國庫司 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 賦稅署 | 1950年5月 | 14,487,794,000元 | 原 財政部地方財政司、國稅署、田糧署 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 關務署 | 1854年 | 5,823,742,000元 | 原 海關總稅務司署、財政部關稅總局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國有財產署 | 1960年12月12日 | 1,849,113,000元 | 原 財政部國有財產局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 臺北國稅局 | 1967年7月1日 |  | 原 財政部臺北市國稅局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 高雄國稅局 | 1979年7月1日 |  | 原 財政部高雄市國稅局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 北區國稅局 | 1992年7月1日 |  | 原 財政部臺灣省北區國稅局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 中區國稅局 | 1992年7月1日 |  | 原 財政部臺灣省中區國稅局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 南區國稅局 | 1992年7月1日 |  | 原 財政部臺灣省南區國稅局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 財政資訊中心 | 1968年5月 | 1,067,493,000元 | 原 財政部財稅資料中心 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 教育部 | 教育部 | 1912年1月3日 | 120,011,164,000元 | 原 國民政府教育行政委員會、大學院 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國民及學前教育署 | 2013年1月1日 | 87,755,766,000元 | 原 教育部中部辦公室、臺灣省政府教育廳業務移撥 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 體育署 | 1997年7月16日 | 7,771,174,000元 | 原 國民政府體育委員會、行政院體育委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 青年發展署 | 1966年1月28日 | 389,460,000元 | 原 行政院青年輔導委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國家教育研究院 | 2011年3月30日 |  | 原	國立編譯館、國立教育資料館、國家教育研究院籌備處 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 法務部 | 法務部 | 1928年11月16日 | 1,751,737,000元 | 原 司法行政部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 廉政署 | 2011年7月20日 | 420,820,000元 | 原 法務部政風司、法務部中部辦公室 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 矯正署 | 2011年1月1日 | 11,766,654,000元 | 原 法務部矯正司 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 行政執行署 | 2000年1月1日 | 1,250,619,000元 | 原 行政執行法研究修正委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 最高檢察署 | 1928年11月 |  | 原 最高法院檢察署 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 臺灣高等檢察署 | 1896年 |  | 原 臺灣高等法院檢察署　　 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 調查局 | 1927年 | 5,478,629,000元 | 原 中國國民黨中央執行委員會調查統計局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 司法官學院 | 2013年7月1日 |  | 原 法務部司法官訓練所 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 法醫研究所 | 1998年7月1日 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 經濟部 | 經濟部 | 1912年1月3日 | 21,645,300,000元 | 原 臨時政府實業部、北洋政府農商部、國民政府農礦部、全國經濟委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 水利署 | 1947年7月1日 | 15,627,124,000元 | 原 經濟部水利處、經濟部水資源局、臺灣省政府水利處業務移撥 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 產業發展署 | 1970年2月25日 | 6,690,489,000元 | 原 經濟部工業局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國際貿易署 | 1969年1月1日 | 1,915,826,000元 | 原 經濟部國際貿易局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 標準檢驗局 | 1930年 | 2,241,547,000元 | 原 經濟部商品檢驗局、經濟部中央標準局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 智慧財產局 | 1927年 | 1,664,444,000元 | 原 經濟部中央標準局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 能源署 | 1979年1月11日 | 201,744,000元 | 原 經濟部能源局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 地質調查及礦業管理中心 | 2023年9月26日 |  | 原 經濟部礦務局、經濟部中央地質調查所、臺灣省政府建設廳礦務局業務移撥 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 產業園區管理局 | 1966年12月3日 | 448,585,000元 | 原 經濟部加工出口區管理處 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 中小及新創企業署 | 1981年1月 | 2,168,061,000元 | 原 經濟部中小企業處 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 商業發展署 | 1916年 |  | 原 經濟部商業司 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 交通部 | 交通部 | 1912年1月3日 | 47,215,188,000元 | 原 清代郵傳部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 民用航空局 | 1947年1月20日 | 311,205,000元 | 原 航空主管官署 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 中央氣象署 | 1941年 | 1,995,048,000元 | 原 交通部中央氣象局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 觀光署 | 1971年6月24日 | 5,196,329,000元 | 原 交通部觀光局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 航港局 | 2012年3月1日 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 高速公路局 | 1970年6月8日 |  | 原 交通部臺灣區國道高速公路局、交通部臺灣區國道新建工程局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 鐵道局 | 2018年6月11日 |  | 原 交通部鐵路改建工程局、交通部高速鐵路工程局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 公路局 | 1943年4月 | 50,341,944,000元 | 原 交通部公路總局、臺灣省政府交通處公路局業務移撥 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 運輸研究所 | 1970年8月1日 |  | 原 交通部交通研究所、交通部運輸計劃委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 衛生福利部 | 衛生福利部 | 1971年3月17日 | 136,514,818,000元 | 原 行政院衛生署 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 疾病管制署 | 1999年7月1日 | 5,425,160,000元 | 原 行政院衛生署疾病管制局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 食品藥物管理署 | 2010年1月1日 | 2,395,879,000元 | 原 行政院衛生署食品藥物管理局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 中央健康保險署 | 1995年1月28日 | 5,522,757,000元 | 原 行政院衛生署中央健康保險局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國民健康署 | 2001年7月12日 | 2,881,868,000元 | 原 行政院衛生署國民健康局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 社會及家庭署 | 1999年11月20日 | 22,504,806,000元 | 原 內政部兒童局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國家中醫藥研究所 | 1963年10月22日 |  | 原 國立中國醫藥研究所 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 文化部 | 文化部 | 1981年11月11日 | 11,482,435,000元 | 原 行政院文化建設委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 文化資產局 | 2007年10月 | 970,187,000元 | 原 行政院文化建設委員會文化資產總管理處 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 影視及流行音樂產業局 | 2012年5月20日 | 1,603,898,000元 |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 蒙藏文化中心 | 2017年9月15日 |  | 原 蒙藏委員會蒙藏文化中心 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 勞動部 | 勞動部 | 1987年8月1日 | 114,961,763,000元 | 原 行政院勞工委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 勞動力發展署 | 1981年3月2日 | 1,940,281,000元 | 原 內政部職業訓練局、行政院勞工委員會職業訓練局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 職業安全衛生署 | 2014年2月17日 | 731,464,000元 | 原 行政院勞工委員會勞工安全衛生處 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 勞工保險局 | 1960年4月16日 | 3,405,197,000元 | 原 臺灣省政府臺閩地區勞工保險局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 勞動基金運用局 | 2007年7月2日 | 180,372,000元 | 原 行政院勞工委員會勞工退休基金監理會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 勞動及職業安全衛生研究所 | 1992年8月1日 | 282,467,000元 | 原 行政院勞工委員會勞工安全衛生研究所 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 數位發展部 | 數位發展部 | 2022年8月27日 | 2,518,144,000元 |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 數位產業署 | 2022年8月27日 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 資通安全署 | 2022年8月27日 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 農業部 | 農業部 | 1948年10月1日 | 98,617,194,000元 | 原 中國農村復興聯合委員會、行政院農業發展委員會、行政院農業委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 農糧署 | 1946年 | 1,689,400,000元 | 原 行政院農業委員會農糧署、臺灣省政府糧食局業務移撥 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 漁業署 | 1984年7月20日 | 4,481,593,000元 | 原 行政院農業委員會漁業處、行政院農業委員會漁業署、臺灣省政府農林廳漁業局業務移撥 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 農田水利署 | 2004年1月30日 |  | 原 行政院農業委員會農田水利處、農田水利會、行政院農業委員會農田水利署 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 動植物防疫檢疫署 | 1998年8月1日 | 1,787,787,000元 | 原 行政院農業委員會動植物防疫檢疫局、臺灣省政府農林廳檢驗局業務移撥 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 農業金融署 | 2004年1月30日 | 295,179,000元 | 原 行政院農業委員會農業金融局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 林業及自然保育署 | 1945年10月 | 6,234,648,000元 | 原 行政院農業委員會林務局、國軍退除役官兵輔導委員會榮民森林保育事業管理處、臺灣省政府農林廳林務局業務移撥 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 農村發展及水土保持署 | 1961年4月11日 | 4,278,359,000元 | 原 行政院農業委員會水土保持局、臺灣省政府農林廳水土保持局業務移撥 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 農業科技園區管理中心 | 2003年 |  | 原 行政院農業委員會屏東農業生物技術園區籌備處 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 環境部 | 環境部 | 2023年8月22日 | 2,066,700,000元 | 原 行政院環境保護署 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 氣候變遷署 | 2023年8月22日 |  | 原 行政院環境保護署氣候變遷辦公室、溫室氣體減量管理辦公室 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 資源循環署 | 2023年8月22日 |  | 原 行政院環境保護署資源循環辦公室、行政院環境保護署廢棄物管理處、行政院環境保護署資源回收管理基金管理會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 化學物質管理署 | 2023年8月22日 |  | 原 行政院環境保護署毒物及化學物質局、行政院環境保護署環境衛生及毒物管理處 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 環境管理署 | 2023年8月22日 |  | 原 行政院環境保護署環境督察總隊、臺灣省政府衛生處環境保護局業務移撥 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國家環境研究院 | 2023年8月22日 |  | 原 行政院環境保護署環境檢驗所、行政院環境保護署環境保護人員訓練所 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 國家科學及技術委員會 | 國家科學及技術委員會 | 1959年2月 | 45,604,597,000元 | 原 國家長期發展科學委員會、行政院國家科學委員會、科技部 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國家科學及技術委員會新竹科學園區管理局 | 1980年12月15日 | 883,757,000元 | 原 行政院國家科學委員會科學工業園區管理局、科技部新竹科學工業園區管理局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國家科學及技術委員會中部科學園區管理局 | 2003年3月21日 | 1,406,460,000元 | 原 行政院國家科學委員會中部科學工業園區管理局、科技部中部科學工業園區管理局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國家科學及技術委員會南部科學園區管理局 | 2003年1月25日 | 1,116,370,000元 | 原 行政院國家科學委員會南部科學工業園區管理局、科技部南部科學工業園區管理局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 僑務委員會 | 僑務委員會 | 1926年10月 | 1,365,641,000元 |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 客家委員會 | 客家委員會 | 2001年6月14日 | 2,589,817,000元 | 原 行政院客家委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 客家文化發展中心 | 2012年5月12日 |  | 原 臺灣客家文化中心籌備處 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 金融監督管理委員會 | 金融監督管理委員會 | 2004年7月1日 | 219,405,000元 | 原 行政院金融監督管理委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 銀行局 | 1981年 | 339,511,000元 | 原 財政部金融局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 證券期貨局 | 1960年9月1日 | 331,974,000元 | 原 財政部證券暨期貨管理委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 保險局 | 1981年 | 143,395,000元 | 原 財政部保險司 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 檢查局 | 2004年7月1日 | 407,458,000元 |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 國家發展委員會 | 國家發展委員會 | 2014年1月22日 | 1,821,726,000元 | 原 行政院經濟建設委員會、行政院研究發展考核委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 檔案管理局 | 2001年11月23日 | 313,370,000元 | 原 行政院研究發展考核委員會檔案管理局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 法制協調處 | 1995年3月6日 |  | 原 國家發展委員會法制協調中心 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 國軍退除役官兵輔導委員會 | 國軍退除役官兵輔導委員會 | 1954年11月1日 | 125,819,256,000元 | 原 行政院國軍退除役官兵輔導委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 退除役官兵職業訓練中心 | 1974年1月 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 原住民族委員會 | 原住民族委員會 | 1996年12月10日 | 6,983,218,000元 | 原 行政院原住民族委員會 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 原住民族文化發展中心 | 2016年1月15日 | 125,695,000元 | 原 原住民族文化園區管理局 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 東埔活動中心 | 2021年 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 | 海洋委員會 | 海洋委員會 | 2018年4月28日 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   |  |  |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 海巡署 | 2000年1月28日 | 2,172,407,000元 | 原 國防部臺灣警備總司令部、行政院海岸巡防署 |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 海洋保育署 | 2018年4月28日 |  |  |
| 行政院本部及附屬部會組織跟獨立機關以及其他機構 |   | 國家海洋研究院 | 2019年4月24日 |  | 原 國家海洋研究院籌備處 |