阿利·伯克級驅逐艦
研發過程 > Flight IIA

之後的Flight IIA 構型有許多新功能，也有人建議改名「奧斯卡·奧斯丁級」（Oscar Austin class）来命名这一改型，奧斯卡·奧斯丁號（USS Oscar Austin DDG-79）是Flight IIA 購型的首艦。Flight IIA 增加了兩個反潛直升機停機库，受此影响，向后方覆盖的两面相位陣列雷達的安装位置被升高。另外后期舰艇换裝了新型的5吋/62倍口徑艦砲（裝於DDG-81和之後的艦）。Flight IIA 也修改了煙囪構造將囪斗埋入（裝於DDG-89和之後的艦），這成為外觀上最明顯改變.
由于美國國會關注在愛荷華級戰艦退役後对岸炮击能力的不足，美國海軍最近的現代化升級案是加強其艦砲系統，而 Flight I型的延伸5吋艦砲射程變成當務之急，這升級案希望藉由新型引導式彈藥（ERGMs），讓战舰可以在40海浬外炮击海岸。
完成伯克Flight II的規劃之後，美國海軍作戰部長辦公室（OpNAV）在1988年4月5日啟動伯克級的後續改良研究，為此海上系統司令部（英语：）（NAVSEA）之下負責水面作戰的第三部（op-3）特別組成一個領導小組與一個工作小組，分別研究不同的艦體構型組合與戰鬥系統修改，升級的方案從小規模修改到大規模更動。經過通盤考量作戰能力、成本與技術風險後，海上系統司令部於1989年正式提出伯克Flight IIA方案。
從平克尼號驅逐艦(USS Pinckney DDG-91)開始，原本位於煙囪兩側船舷甲板的Mk 32型水面船艦魚雷管便移至機庫頂部垂直發射器的兩側 ，以拉近與魚雷庫之間的距離，解決了早期伯克Flight 2A不易進行魚雷再裝填的問題。此外，從平可尼號到班布里奇號（USS Bainbridge DDG-96）等六艦，配備新開發的AN/WLD-1遙控偵雷/獵雷載具(Remote Minehunting System，RMS)進行測試，為此也 在後煙囪右側增設一個AN/WLD-1的收容庫，與尾部機庫結構融為一體，平時以庫門密封。目前就只有這六艘伯克Flight 2A設有AN/WLD-1的收容庫，從哈爾西號驅逐艦（USS Halsey DDG-97)開始又將之取消。美軍新一代的DD (X)陸攻驅逐艦與LCS多功能近岸戰鬥艦都將配備此種具備獵雷與反潛偵測能力的遙控載具。
在Flight IIA方案中，第一大變更重點就是增加直昇機庫設施。以往美國海軍水面艦的反潛直昇機均由反潛艦艇（史普魯恩斯級驅逐艦、諾克斯級巡防艦）或護航艦艇（如派里級巡防艦）搭載，因此在提康德羅加級神盾巡洋艦之前，美國海軍擔負防空的飛彈巡洋艦或驅逐艦都只負責替友軍反潛直昇機進行加油掛彈等後勤支援，故只配備直昇機起降甲板與若干油彈儲存/整補設施，並未配置機庫與輔降設施。然而考慮到1970年代建造的派里級、史普魯恩斯級等主要搭載反潛直昇機的艦艇將從1990年代後期開始退役，勢將嚴重影響艦隊搭載直昇機的能力。因此，伯克Flight IIA就把直昇機庫設施納入重點要求之一。由於加入機庫勢必牽涉艦體變更，美國海上系統司令部提出的概念是插入與滑動（plug and slide），盡量維持伯克級原有的艦體區塊配置，基本上是在艦體後段「插入」一個含有機庫的船段，在Flight IIA的機庫中可以停放2台MH-60R反潛直升機。
伯克Flight IIA配置兩組MK-41艦載垂直發射系統模組，艦首仍維持四組八聯裝，而後部八組八聯裝垂直發射器則位於機庫結構的02甲板（原本伯克Flight 1/2的後部垂直發射器位於艦尾01甲板）。這樣的容量與伯克Flight I/II同級，然而伯克Flight IIA撤除了原本首尾各一的再裝填模組，因此實際可用的發射管數又比伯克Flight I/II多出六管，達到96管。 由於這種再裝填起重機的最大起重能力為2噸，只能進行RIM-66飛彈飛彈防空飛彈與阿斯洛克反潛飛彈的再裝填，對於更重的戰斧巡弋飛彈則無能為力。依照冷戰時代的大洋反潛、防空作戰設想，消耗最快的飛彈理當是標準防空飛彈與反潛火箭，然而直到蘇聯解體，冷戰結束，從沒有任何敵國武裝勢力直接從空中或水下挑戰美國海軍艦隊。反倒是從1991年第一次波斯灣戰爭以來，在歷次後冷戰時代的地區性戰爭中，戰斧巡航飛彈成為美國神盾巡洋艦/驅逐艦消耗量最大的彈種。面對最需要再補給的戰斧巡弋飛彈，海上再裝填補給裝置卻無能為力，照樣得返回港口，由碼頭邊更大型的起重機進行戰斧巡弋飛彈的再裝填。此外，實際操作經驗顯示洋面上航行中的飛彈再裝填作業有相當困難性；因此，柏克Flight IIA遂把這兩組實用性不高的再裝填用起重機撤除，再多裝六個發射管。而伯克Flight IIA這種前32、後64管的構型，便稱為MK-41 Mod 7。
近迫防禦方面，原本刪除方陣近迫武器系統、改用RIM-162飛彈的，一方面是簡化艦上的配置，同時也反應當時各國海軍與國防產業對反艦飛彈防禦的看法；當時各國普遍開始質疑射程短、威力有限且一次只能對付一個目標的機砲式近迫武器系統， 將不足以應付新一代超音速反艦飛彈乃至多軸向飽和攻擊；因此，射程較長（意味較遠的攔截距離、更多的反應時間與較多的攔截次數）、威力相對較大、發射後能在空中機動追擊目標且可同時發射多枚的新一代短程防空飛彈，才是未來船艦反飛彈自衛的趨勢。因此，當時許多人建議以發展中的ESSM來取代方陣近迫武器系統，ESSM的靈活度與射程都較先前的AIM-7麻雀飛彈大幅增加，更適合對付新一代刁鑽靈活的反艦飛彈；而且ESSM採用緊致的折疊彈翼，配合特別發展的四合一發射器，每個MK-41發射管都可容納一組四合一ESSM發射器，故單一發射管的攜帶量是過去的四倍。此等近迫接戰能量遠高於過去每次至多連續射擊五個目標、之後就需要花費至少四分鐘重新裝彈的方陣近迫武器系統 。此外，相較於1980年代後期美國開始開發的RIM-116滾體飛彈系統，ESSM射程長得多（RAM Block 0/1只有10公里級），面對超音速掠海而來/終端規避動作的來襲飛彈時，也能比RAM提前開始攔截，增加成功機率。
不過由於ESSM的開發時程趕不上伯克Flight IIA的服役，因此伯克Flight IIA仍保留前、後各一的方陣系統安裝平台，以增加一種選擇。依照原本的計畫，前四艘伯克Flight 2A（DDG-79~82）裝備MK-15 Block 1B方陣近迫武器系統作為墊檔，從接下來的哈沃德號（USS Howard DDG-83）起再以ESSM取代方陣系統，因此從DDG-83開始，各艦下水與完工進行海試時，都沒有裝備方陣系統。然而由於ESSM的研發測試時程超乎預期，直到2003年3月才進入美國艦隊展開實際驗證，因此DDG-83到DDG-102等服役時省略方陣系統的各艦，在日後進塢整修時 便陸續加裝方陣系統； 不過，只有DDG-83、84安裝了兩套方陣，DDG-85以後各艦僅在艦尾直昇機庫上方裝置一座方陣Block 1B。依照美國海軍的計畫，到2013預算年度，所有DDG-85以後的柏克級都會裝備一座方陣Block 1B。美國海軍內部對於完全放棄方陣、全靠ESSM的作法並不是沒有疑慮，即便ESSM帳面數據再漂亮，飛彈總有一段無法彌補的最小射程死角；如果懷有敵意的小型快艇或慢速飛行器（由於識別問題，這種目標不像高速的反艦飛彈，只要出現在偵測範圍就可以逕行攔截） 接近到認定必須接戰時，能夠直接瞄準開火的方陣Block 1B近迫系統才是最有效的最後一道防線。雖然柯爾號遇襲事件之後，美國艦艇多裝備了12.7mm機槍與MK-38 25mm機砲等人力操作火砲來對付迫近的小型船舶，但方陣Block 1B具備由戰情室遙控、對抗船身搖晃的穩定機制、整合紅外線熱影像儀來全天候作業等優勢，都非人工操作的簡單槍砲可比。因此，美國海軍內部對於後期型柏克只裝備一門方陣快砲來節省預算（此外，許多方陣系統也被改造成陸基防衛系統來保護地面目標，導致海軍艦艇可以裝備的方陣數量減少）的作法並不表苟同，認為這危害到在高危險區域作業的驅逐艦的安全。