舊金山49人
歷年戰績

| 赛季 | 胜 | 负 | 平 | 常规赛季 | 季后赛 |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- |
舊金山四九人（AAFC）
| 1946 | 9 | 5 | 0 | AAFC西區第二 | -- |
| 1947 | 8 | 4 | 2 | AAFC西區第二 | -- |
| 1948 | 12 | 2 | 0 | AAFC西區第二 | -- |
| 1949 | 9 | 3 | 0 | AAFC聯盟第二 | 分區季後賽以17-7擊敗Brooklyn Yankees AAFC冠軍賽以7-21敗給克里夫蘭布朗 |
合併到NFL之後
| 1950 | 3 | 9 | 0 | NFL國聯第六 | -- |
| 1951 | 7 | 4 | 1 | NFL國聯第二（並列）　 | -- |
| 1952 | 7 | 5 | 0 | NFL國聯第三 | -- |
| 1953 | 9 | 3 | 0 | NFL西區第二 | -- |
| 1954 | 7 | 4 | 1 | NFL西區第三 | -- |
| 1955 | 4 | 8 | 0 | NFL西區第五 | -- |
| 1956 | 5 | 6 | 1 | NFL西區第三 | -- |
| 1957 | 8 | 4 | 0 | NFL西區第一（並列）　 | 分區季後賽以27-31敗給底特律雄獅 |
| 1958 | 6 | 6 | 0 | NFL西區第四 | -- |
| 1959 | 7 | 5 | 0 | NFL西區第三（並列） | -- |
| 1960 | 7 | 5 | 0 | NFL西區第二（並列） | -- |
| 1961 | 7 | 6 | 1 | NFL西區第五 | -- |
| 1962 | 6 | 8 | 0 | NFL西區第五 | -- |
| 1963 | 2 | 12 | 0 | NFL西區第七 | -- |
| 1964 | 4 | 10 | 0 | NFL西區第七 | -- |
| 1965 | 7 | 6 | 1 | NFL西區第四 | -- |
超級盃時代
| 1966 | 6 | 6 | 2 | NFL西區第四 | -- |
| 1967 | 7 | 7 | 0 | NFL海岸區第三 | -- |
| 1968 | 7 | 6 | 1 | NFL海岸區第三 | -- |
| 1969 | 4 | 8 | 2 | NFL海岸區第四 | -- |
大聯盟合併
| 1970 | 10 | 3 | 1 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以17-14擊敗明尼蘇達維京人 國聯冠軍賽以10-17敗給達拉斯牛仔 |
| 1971 | 9 | 5 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以24-20擊敗華盛頓紅人 國聯冠軍賽以3-14敗給達拉斯牛仔 |
| 1972 | 8 | 5 | 1 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以28-30敗給達拉斯牛仔 |
| 1973 | 5 | 9 | 0 | 國聯西區第三 | -- |
| 1974 | 6 | 8 | 0 | 國聯西區第二 | -- |
| 1975 | 5 | 9 | 0 | 國聯西區第二 | -- |
| 1976 | 8 | 6 | 0 | 國聯西區第二 | -- |
| 1977 | 5 | 9 | 0 | 國聯西區第三 | -- |
| 1978 | 2 | 14 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 1979 | 2 | 14 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 1980 | 6 | 10 | 0 | 國聯西區第三 | -- |
| 1981 | 13 | 3 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以38-24擊敗紐約巨人 國聯冠軍賽以28-27擊敗達拉斯牛仔 贏得第十六屆超級盃（以26-21擊敗辛辛那提孟加拉虎） |
| 1982 | 3 | 6 | 0 | 國聯第十一+ | -- |
| 1983 | 10 | 6 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以24-23擊敗底特律雄獅 國聯冠軍賽以21-24敗給華盛頓紅人 |
| 1984 | 15 | 1 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以21-10擊敗紐約巨人 國聯冠軍賽以23-0擊敗芝加哥熊 贏得第十九屆超級碗（以38-16擊敗邁阿密海豚） |
| 1985 | 10 | 6 | 0 | 國聯西區第二 | 外卡季後賽以3-17敗給紐約巨人 |
| 1986 | 10 | 5 | 1 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以3-49敗給紐約巨人 |
| 1987 | 13 | 2 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以24-36敗給明尼蘇達維京人 |
| 1988 | 10 | 6 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以34-9擊敗明尼蘇達維京人 國聯冠軍賽以28-3擊敗芝加哥熊 贏得第二十三屆超級碗（以20-16擊敗辛辛那提孟加拉虎） |
| 1989 | 14 | 2 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以41-13擊敗明尼蘇達維京人 國聯冠軍賽以30-3擊敗聖路易公羊 贏得第二十四屆超級碗（以55-10擊敗丹佛野馬） |
| 1990 | 14 | 2 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以28-10擊敗華盛頓紅人 國聯冠軍賽以13-15敗給紐約巨人 |
| 1991 | 10 | 6 | 0 | 國聯西區第三 | -- |
| 1992 | 14 | 2 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以20-13擊敗華盛頓紅人 國聯冠軍賽以20-30敗給達拉斯牛仔 |
| 1993 | 10 | 6 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以44-3擊敗紐約巨人 國聯冠軍賽以21-38敗給達拉斯牛仔 |
| 1994 | 13 | 3 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以44-15擊敗芝加哥熊 國聯冠軍賽以38-28擊敗達拉斯牛仔 贏得第二十九屆超級盃（以49-26擊敗聖地牙哥電光） |
| 1995 | 11 | 5 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以17-27敗給綠灣包裝工 |
| 1996 | 12 | 4 | 0 | 國聯西區第二 | 外卡季後賽以14-0擊敗費城老鷹 分區季後賽以14-35敗給綠灣包裝工 |
| 1997 | 13 | 3 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以38-22擊敗明尼蘇達維京人 國聯冠軍賽以10-23敗給綠灣包裝工 |
| 1998 | 12 | 4 | 0 | 國聯西區第二 | 外卡季後賽以30-27擊敗綠灣包裝工 分區季後賽以18-20敗給亞特蘭大獵鷹 |
| 1999 | 4 | 12 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 2000 | 6 | 10 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 2001 | 12 | 4 | 0 | 國聯西區第二 | 外卡季後賽以15-25敗給綠灣包裝工 |
| 2002 | 10 | 6 | 0 | 國聯西區第一 | 外卡季後賽以39-38擊敗紐約巨人 分區季後賽以6-31敗給坦帕灣海盜 |
| 2003 | 7 | 9 | 0 | 國聯西區第三 | -- |
| 2004 | 2 | 14 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 2005 | 4 | 12 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 2006 | 7 | 9 | 0 | 國聯西區第三 | -- |
| 2007 | 5 | 11 | 0 | 國聯西區第三 | -- |
| 2008 | 7 | 9 | 0 | 國聯西區第二 | -- |
| 2009 | 8 | 8 | 0 | 國聯西區第二 | -- |
| 2010 | 6 | 10 | 0 | 國聯西區第三 | -- |
| 2011 | 13 | 3 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以36-32擊敗紐奧良聖徒 國聯冠軍賽以17-20敗給紐約巨人（1次加時） |
| 2012 | 11 | 4 | 1 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以45-31擊敗綠灣包裝工 國聯冠軍賽以28-24擊敗亞特蘭大獵鷹 第四十七屆超級盃以31-34敗給巴爾的摩烏鴉 |
| 2013 | 12 | 4 | 0 | 國聯西區第二 | 外卡季後賽以23-20擊敗綠灣包裝工 分區季後賽以23-10擊敗卡羅萊納黑豹 國聯冠軍賽以17-23敗給西雅圖海鷹 |
| 2014 | 8 | 8 | 0 | 國聯西區第三 | -- |
| 2015 | 5 | 11 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 2016 | 2 | 14 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 2017 | 6 | 10 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 2018 | 4 | 12 | 0 | 國聯西區第三 | -- |
| 2019 | 13 | 3 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以27-10擊敗明尼蘇達維京人 國聯冠軍賽以37-20擊敗綠灣包裝工 第五十四屆超級盃以20-31敗給堪薩斯城酋長 |
| 2020 | 6 | 10 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 2021 | 10 | 7 | 0 | 國聯西區第三 | 外卡季後賽以23-17擊敗達拉斯牛仔 分區季後賽以13-10擊敗綠灣包裝工 國聯冠軍賽以17-20敗給洛杉磯公羊 |
| 2022 | 13 | 4 | 0 | 國聯西區第一 | 外卡季後賽以41-23擊敗西雅圖海鷹 分區季後賽以19-12擊敗達拉斯牛仔 國聯冠軍賽以7-31敗給費城老鷹 |
| 2023 | 12 | 5 | 0 | 國聯西區第一 | 分區季後賽以24-21擊敗綠灣包裝工 國聯冠軍賽以34-31擊敗底特律雄獅 第五十八屆超級盃以22-25敗給堪薩斯城酋長 |
| 2024 | 6 | 11 | 0 | 國聯西區第四 | -- |
| 總計 | 630 | 526 | 16 | （NFL常規賽） | （NFL常規賽） |
| 總計 | 39 | 25 | 0 | （NFL季後賽） | （NFL季後賽） |
| 總計 | 669 | 551 | 16 | （所有比賽） | （所有比賽） |
+：因為球員罷工的關係，使球季縮短，在同分區的所有球隊以名次作出季後賽資格。