國民政府軍事委員會
抗日戰爭（1937年－1945年） > 1938年至1946年的军事委员会

战地党政委员会（39.3）：为加强战地党务、瓦解与收编伪军。职责仅限于对战区中的国民党和政府进行指导、检查与督促，提出建议，不直接领导战区政府的工作。主任委员蒋介石兼，副主任委员李济深，主持日常工作。战地党政委员会委员张友渔、梅龚彬、胡兰畦、陶行知、黄炎培、季方、刘一峰等进步人士。派往各地的指导员和视察员。创办了《战地通讯》杂志，作为战地党政委员会的机关刊物。钱俊瑞创办《战地评论》。在重庆组织“战地座谈会”、星期五聚餐会。1940年4月19日参谋次长程潜兼任副主任。
战时工作干部训练团（战干团）：于军委会下，设置四个战时工作干部训练团，以战区为单位，召集和训练逃亡至后方来的战地及敌占区失学失业青年及各机关团体人士。正规训练时间为六个月。前三个月为入伍训练(军事训练)主要为基本军事操练、野外演习、实弹射击和兵器、地形、筑城、谍报、游击战术等军事课程。后三个月为分科训练(政工训练)。
战干一团：1938年1月在武昌珞珈山成立。蒋介石自任团长，陈诚兼任副团长。教育长桂永清，政治部主任邓文仪（1939年后滕杰)，另有教育、军需、军医、副官四个处，教育处长为王章；还有一个军乐队和一个特务连。后来，政治部又成立了一个“忠诚剧团”，负责人李英。沿袭了中央军校教导总队的风气。1938年7月第一期(第一总队和直属女生大队)在武昌毕业。第二期(第二总队)1938年8月在武昌毕业。1938年7月第三期开学。1938年9月初迁往湖南湘西辰溪。1939年4月第三期在桃源毕业。1939年夏迁綦江县。创办了《自强日报》和《力行》月刊。1939年秋第四期在綦江毕业。1940年9月第五期毕业后不久，桂永清调走，由周振强代理教育长。1941年1月第六期毕业即结束停办。
战干二团：前身是1937年12月第五战区抗敌青年军团。李宗仁兼任团长，副团长张任民中将，教育长潘宜之中将，下设政训处(处长黄季陆、刘世衡)、军训处(处长邓昌藩)、总务处、军需处、军械处、军医处等，编有4个大队及1个女生大队：第1大队少将大队长梁松樵，第2大队上校大队长陈大中，第3大队上校大队长陈步藩，第4大队上校大队长张敬，第5女生大队少校大队长裴曼纳。教官有匡亚明、张百川、佟子实、安翰华、许德瑗、温朋久、郝惊涛、何德润、许大川、满吉云等。诗人臧克家在宣传科工作。1938年1月青年军团迁到河南潢川。又在豫东南、安徽、鄂东北一带继续扩大招生，学员达5000人。1938年1月底正式开始训练。第1期学员受训8个月毕业，其学籍后来叙列为中央军校第14期政治科。后改称战干二团，团长蒋中正、副团长李宗仁。
战干三团：1938年6月1日，战干三团成立于武昌。旋在武汉招生，并派招生委员分赴湘、赣、皖、浙、苏诸省招考学生，第一期共招考学生及学员三千六百余人。7月中旬迁江西吉安，团部驻建国路。1938年8月1日正式始业，蒋题词：奋卧薪尝胆之精神，赴报国复仇之志事。团长由蒋介石兼，第三战区司令长官顾祝同兼副团长，唐冠英(超伯)任中将教育长，负实际责任。政治部主任胡轨，少将副主任沈沛霖(沈清尘)、葛建时。第一期学生，包括男生十九个中队，女生两个中队，于1939年1月28日按期毕业。派员至浙、皖、闽、赣等省续招第二期新生二千余名。后蒋经国嫡系王昇，即为战干三团第二期。1939年3月底，南昌会战期间，战干三团奉令南迁雩都。后奉令又迁瑞金。建制撤消，归并成立于1939年7月的中央军校第三分校，其第二期学生均以第三分校十六期学生政训总队名义毕业。
战干四团：1938年10月，国民革命军第一军随军服务团解散，改为战干四团，借用西安城西南隅前东北大学校舍。蒋介石兼任团长，胡宗南兼教育长，周士冕历任副教育长、教育长。后葛武棨任副教育长。蒋坚忍任教育处处长。办公厅主任邱是膺。政治部主任王大中。1939年8月在咸阳棉花打包厂成立的“国民政府军事委员会战时工作干部训练团第四团特训总队”，受训青年八百多人，都是胡宗南系统的特务、宪兵拦下来扣押的赴延安（陕甘宁边区）的高中程度以上的青年学生，其中不仅有大学生，还有留学生，归国华侨青年；总队长萧作霖中将，总队副为胡长怡少将。1939年10月奉蒋介石电令改名为“军事委员会天水行营西北青年劳动营”。1941年战干四团更名为“中国国民党中央训练委员会战时工作干部训练团”，“办理陕西、山西、山东、河南、河北、苏北、皖北各省区战时工作干部人员训练”。1944年初陕西省训练团奉令改隶战干团，更名为地方行政干部训练班。1945年8月底奉令结束。
战时新闻检查局（39.4）
校阅委员会（40年）
中央总动员设计委员会：主任委员蒋介石兼，秘书长张群/熊式辉
国防外事局（41年底）：太平洋战争爆发后，接待外国来华军人。局长商震/何浩若（1942.12）/杨宣诚（1944.3）
中央干部训练团
国民政府军事委员会国防研究院：1942年成立，蒋介石兼任主任，副主任杜建时主持工作。第一期研究员韩练成。
全国知识青年志愿从军编练总监部（知青从军编练总监部）：1943年4月组建。训练总监罗卓英，副监彭位仁、彭善，政治部主任蒋经国。
军事委员会桂林办公厅（40.5.15-44.12）：主任李济深
军事委员会西安办公厅（40.4-）：主任熊斌（代）/蒋鼎文（41.3）/卫立煌（42.1）/朱绍良（42.3）/胡宗南（代）
军事委员会技术研究室(习称“军技室”)：1939年底将国民政府军委会机要室密电报股、中统国际密电室、军统侦收总台、军令部二厅中苏特种情报所、外交部、交通部电政司密电检译所等6个电讯侦测、研究部门整合组建。本部设在重庆长江南岸的黄角桠刘家花园。主任温毓庆（同中将，时任交通部电政司司长，1939年底-1940年底）/毛庆祥（1941-）；副主任毛庆祥（委员长侍从室）、魏大铭（军统同少将，1939年底-1942年2月）。主任秘书王维钧（同少将）
秘书室：刘成如（同上校）、何寿春（同中校）。
专员：杨汝淦（同上校）
稽核：金家X（同中校）
收发员：蒋孝珍（同少尉）等。
第一组：负责日本密电的研译，兼及其他国家。组长霍实子（同少将）；副组长：孟广治（同少将）/王瀛（同上校）。组员20余人
一科：研究日本外交密电。科长袁学海（同上校）。
二科：研究日本军用密电。科长王瀛。
三科：统计日本外交、特务密电。科长池步洲（同上校）。
四科：整理及保管日本密电。科长张淡英（同中校） 。
第二组，负责日本在华外交特务密电研译。组长杨贻清（同少将）；副组长李立民（同上校）/王良诚、丁绪曾。组员30余人
一科：研究日本外交密电。科长陈振泰（同上校）。
二科：研究日本军用密电。科长丁绪曾（同上校或中校）。
三科：研究日本军用密电。科长王良诚（同上校）。
四科：整理保管日本密电。科长杨贻波（军统中校）。
第三组，负责外国密电的统计分类工作。由军统局密电侦测部门并入。1941年12月军统另立破译机构后，三组人员调离军技室，由第二组中划出一部分人员重新组建第三组。组长：杨肆（同少将）/李立民（1941.12-）；副组长陈祖舜（军坛上校，实际负责人）/陈振泰（1941.12-）。组员20余人
一科：统计日本外交密电。科长刘宝善（同少校）。
二科：统计日本军用密电。
三科：分类整理及收发。
第四组，负责各类电讯的侦收、测向。组长方砚农（军统同少将）；副组长张稚焯（同上校）。组员初为80余人，后来发展到200余人。
一科：侦收日本外交密电。科长陈宇泽（同上校或中校）。
二科：用快机侦收日本外交密电。科长贝进华（同中校）。
三科：侦收日本军用密电。科长钟德华（中校）/黄道援（同上尉）。
四科：侦收中文密电。科长罗成三（同中校）。
五科：修理各类业务器材。科长张立杰（同中校）。
第五组：负责总务工作。组长：施家帧（同少将）；副组长：吴烁英（同上校）/余惠笃。
文书科：科长沈其道（同上校）。1941年前后并入秘书室。
事务科：科长张廷启（同上校）。
会计科：科长萧忠（同上校）。
出纳科：科长严道新（同上校）。
人事科：科长刘必（同上校）。
医务科：科长周服之。
机要科：科长孙琨（同中校）。
第六组，负责国内中文各类密电的研译工作，主要针对中共及杂牌派系。组长黄季弼（同少将）；副组长：李直峰/聂文逊/黄绵民（同上校）。未分科。组员40余人。
第七组：研究英、美、法、苏联等国的外交密电。1942年军技室与特技室分离后组建。组长丁于正（同少将）；副组长王俊杰（同上校）。未分科。
专员室（或称顾问室）：1942年军技室与特技室分离后组建。指导战地工作队侦收日本密电。人员从各组调入。
战时运输管理局：1945年1月1日成立。由交通部公路总局、运输会议、西南督运委员会合并。局长俞飞鹏（交通部长兼），副局长龚学遂主持工作、派克鲁少将（Mclaire）/后白利上校代理，主力副局长马罗（Marrow）上校。1945年12月撤销。
1939年1月，中國國民黨五届五中全會決議国防会议改组为國防最高委員會，以統一黨政軍之指揮，由中國國民黨總裁蔣中正出任委員長；军事委员会的国家总动员设计委员会改隶国防最高委员会；军事委员会添设战地党政委员会；军事委员会为国防最高委员会的下级机关，但国防最高委员会的主要工作为代行国民党中央政治会议的职权，对于狭义的国防并不甚过问，所以军事委员会的机构仍相当庞大。军事委员会委员长之下，除设参谋总长一人、副参谋总长二人之外，又设军事参议官多名，备委员长的咨询。军事委员会所属机构有：委员长侍从室、办公厅、军令部、军政部、军训部、政治部、航空委员会、军法执行总监部、铨叙厅、军事参议院、兵站总监部(后方勤务部)、战地党政委员会(后撤销)、海军总司令部、抚恤委员会、军事运输统制局(后裁撤)、调查统计局、中央干部训练团。
1941年12月，日軍突襲珍珠港，中國躍為同盟國之一，並與美英等國為作戰夥伴。1942年1月1日，中美英蘇等26國在美國華盛頓簽訂反侵略共同宣言，蔣委員長受推舉為同盟國中國戰區最高統帥，指揮中、泰、越等地區的同盟國軍隊作戰。
1941年－1945年的第二次世界大戰期間，雖然蔣中正在中國推行的軍事委員會戰時政府與西方民主理念有很大差距，但是由於同為同盟國盟友，當時西方世界；尤其美國政府、國會、一般民眾對於蔣中正頗有好感。也因此不但中國民眾普遍尊稱蔣中正為委員長，而說英語的外國人；特別是美國人，自此都稱為蔣中正為「Gimo」。而此稱呼，其實就是大元帅（Generalissimo）的英語簡寫。
1943年9月，林森逝世，修改了《国民政府组织法》，国民政府主席由虚位职务改为负政治责任，蒋介石正式继任国民政府主席。