台灣民政府
反對聲音

2009年10月16日，台灣教授協會會長陳儀深表示：
林志昇、何瑞元企圖從「戰時國際法」和「佔領法」來論述戰後台灣的國際地位，戰後台灣的地位是「美國軍事管轄下海外未合併領土」。個人認為，此一論述的弱點是：既然中華民國政府只是被美國委託的「次要佔領權國」，竟然在1945年10月受降的時候宣稱台灣光復，隨後且宣告台灣人集體歸化為中華民國國民，美國為何沒有「即時糾正」？
又，既然引述19世紀末波多黎各和古巴曾經是「在USMG（美國軍事政府）管轄之下的未合併領土」作為台灣的範例，但波多黎各和古巴都確實有一個短暫的USMG、以及當地成立的平民政府予以取代的過程。而台灣有自己的歷史因緣，這些事在台灣從未發生過；今日如何能夠讓歷史倒轉，炮製一個在台灣的USMG，然後說台灣「目前的地位」是處於USMG之下未合併的領土？
……台灣地位問題錯綜複雜，至少涵蓋國際法、憲法、歷史與政治等「多學科途徑」（multi-disciplinary approach）才講得清楚；不能只根據戰後某項宣言的效力或某條約的文字解釋，就以為找到台灣地位的真相或答案。
2009年11月8日，台獨人士兼美國律師江建祥表示，林志昇等所謂“理想派”的控美案對於台獨來說是非常危險的：林志昇等的講法是，希望美國從中國國民黨手上“拿回”台灣主權，然後幫助所謂的“平民政府”完成“獨立”；但美國沒有台灣主權，美國已公開反對台獨、不准台獨公投，一旦台灣變成美國屬地，美國會讓台灣“獨立”嗎？他批評，控美案的心態非常可議，應該用一個“奴”字來形容，“看美國人臉色的‘建國程序’，這能夠做嗎？不能做”。他說，林志昇等說“台灣、美國和日本同一國”，他深不以為然，“同一國？這就是奴性！那是懦夫，才會甘心當被保護的‘奴’”。他說，林志昇等聲稱《舊金山和約》中顯示日本擁有台灣的“殘留主權”，這是他頭一次看到“殘留主權”這個名詞，他不知道“殘留主權”是什麼意思；但《舊金山和約》中，日本放棄台灣與朝鮮的主權時的法律用語一模一樣，“如果日本敢說擁有朝鮮的‘殘留主權’，一定被朝鮮打死”。
2013年3月4日，台灣軍事史作家許劍虹（維基數據所列：）表示，台灣民政府是一個標準的統派團體，但其奮鬥目標是追求台灣恢復1945年以前的政治地位、也就是“回歸”大日本帝國的懷抱，故其主張台灣目前的國家元首仍然是日本天皇；但台灣民政府無法忽略大日本帝國於太平洋戰爭後瓦解、乃至於目前日本仍然遭受美軍佔領的事實，故其在法理上認為，目前的台灣與澎湖均為美國軍事政府佔領下的屬地，但同時在美國默許下有一個“中華民國流亡政府”存在於這塊土地上；台灣民政府亦認為，在中華民國體制下參與政黨選舉活動的民主進步黨，也同樣是這個“中國流亡政權”的一份子；台灣民政府主要的宣傳對象不是美國人、甚至也不是台灣人，而是日本人，“根據東森新聞對該組織領導人林志昇的訪問，台灣民政府認為：目前台灣人的身分是美國人，但是最終要成為日本人！”“台灣民政府想要把美國政府拖入一場與中共的全面戰爭中，讓這兩個超級強權彼此打到兩敗俱傷，甚至也不惜讓台灣一起同歸於盡，為日本爭取喘息與壯大的機會。一旦等到中共與美國的戰爭結束後，在他們的認知裡，日本將會成為全亞洲唯一的贏家，然後大日本帝國也將在廢墟中重新站立起來，而台灣人民也將在最後重新成為「驕傲的日本人」；這在筆者眼中，可能才是林志昇這票人的真正目的。”
2013年7月9日，台灣基督長老教會聲明：
台灣的國際地位在1951年9月8日簽訂的《舊金山和約》第二條中明確說到「日本政府放棄對台灣、澎湖等島嶼的一切權利、名義與要求」，並未提及台灣的歸屬。而第二次世界大戰後的潮流及普世人權的價值影響之下，「自決權」是戰時殖民地解決歸屬的最高原則。台灣的未來應依照「住民自決」的原則，由台灣的住民來決定自己的國家；這也是台灣基督長老教會在(19)70年代發表三篇重要宣言的基礎。這些與台灣民政府主張台灣為「日本天皇保有所有權，美國總統握有佔領權」是相互矛盾的。
雖然台灣民政府反對台灣屬於美國的一部份，但他們同時也反對台灣的獨立、建國、自治等的選項。這與台灣基督長老教會所堅持的「面對現實，採取有效措施，使台灣成為一個新而獨立的國家」是矛盾的。
台灣民政府在這兩年不斷強調「參拜靖國神社」以展示其主張之「日本天皇保有所有權」。但參拜靖國神社具有高度的政治及宗教的敏感度及爭議性，不宜鼓勵。
2013年8月12日，台灣國家聯盟主席姚嘉文在台灣基督長老教會「台灣民政府及兩岸基督教論壇對策說明會」台北場表示，台灣民政府強調台灣不是一個國家，這與台灣基督長老教會強調「要建立一個新而獨立的國家」的立場大相逕庭，但台灣基督長老教會仍有許多牧長、信徒堅信台灣民政府的說法，令他非常擔憂；他說，台灣民政府對台獨運動及台獨團體的傷害很重，大家一定要好好分辨，不要被台灣民政府騙了，「台灣不是日本、美國、中國的，台灣是台灣人民的，這就是事實！」
2014年1月30日，前民進黨中央黨部公共政策研究中心幹事蔡百銓表示，台灣民政府期盼美國與日本勢力重返台灣，類似萬那杜塔納島居民的船貨崇拜期盼美軍重返該島；如今美國確實會加強其在西太平洋的勢力，但是絕不可能恢復《中美共同防禦條約》的程度；台灣想要加強台美關係，最迫切的工作就是加入跨太平洋戰略經濟夥伴關係協議（TPP）。
2015年5月31日，台獨人士張繼昭表示，《臺灣關係法》與六項保證都證明美國不是臺灣的主要佔領國，否則美國早在1978年總統吉米·卡特宣佈與中華民國斷交時就直接接管臺灣了；《舊金山和約》第1條規定結束同盟國對日本的戰爭狀態，第2條規定日本放棄臺灣及澎湖主權、但沒有規定美國對臺灣及澎湖有佔領權，第6條規定佔領軍於該條約生效後90天內退出「所有的」佔領地區，沒有佔領就沒有佔領權；台灣民政府與美國臺灣政府都主張美國是臺灣的主要佔領國，但他們都沒有美國的授權書，「就等於美國不承認他們」。2015年6月15日，張繼昭說，《臺灣關係法》是美國國會制定的國內法，美國國會沒有行政權，現在的美國只能承認「臺灣治理當局」（governing authorities on Taiwan）、不能同時承認其他政治實體，美國國會當然不會授權任何團體在臺灣治理當局之外組織政府，所以美國不可能承認台灣民政府或美國臺灣政府。
2016年6月11日，Facebook台灣國護照貼紙粉絲專頁管理員表示，前一陣子台灣民政府成員不斷在該頁張貼台灣民政府官方宣傳影片，還以台灣民政府在七大工業國組織（G7）雜誌花錢買的廣告宣稱台灣民政府「已被G7邀請以觀察員身分去參與」；上列言論被該頁管理員揭穿以後，台灣民政府成員不但沒有回答管理員的質疑，反而找來多人到該頁護航；希望大家不要花錢申請台灣民政府身分證，也希望蔡英文政府早日處理台灣民政府，「不要再讓他們繼續抹黑台灣建國運動」。
2016年6月14日，AIT臺北辦事處處長梅健華表示，台灣民政府身分證無法免簽進美國。
2016年6月15日，台灣民族同盟資深成員張先生向信傳媒表示，陳水扁在其總統任期末期出很多事，「國內許多『愛台灣』的支持者突然覺得台灣前途飄搖」，林志昇趁勢宣稱台灣民政府背後有美國中央情報局（CIA）支持，他問林志昇「憑什麼說CIA支持？拿出證據來」，林志昇支吾其詞；嘉義曾有一批醫生熱衷參加台灣民政府活動，其中一人被說服以新臺幣三千萬元買下未來台灣民政府執政後的「州長」職位，「事隔多時，那位醫生覺得不對勁，錢也討不回，那幾個醫生就跟林志昇決裂了，但也不敢四處張揚」。同日，政治評論家汪笨湖向信傳媒說，台灣民政府是在馬英九政府任期內壯大，其很多行為已經違法，「馬政府卻默許其行徑，為的是醜化台獨」，其實很多真正從事台獨運動的人早已跟林志昇劃清界線。信傳媒向台灣民政府台北州辦公室求證林梓安是否擁有中華人民共和國國籍，對方強烈否認、說「那是從我們這邊背叛出去的人亂放話」；信傳媒追問林志昇與林梓安是否結婚，對方不願回應。
2016年6月16日，政治評論家曹長青表示，台灣民政府利用「一些台灣人對日本的親和情懷（包括今天對民主日本的好感）」，主張台灣是日本的一部分，其組織架構也模仿日本政府。他說，林志昇一邊說台灣是日本的一部分，一邊又宣稱第二次世界大戰以後的台灣是美國屬地，還自稱在美國提起訴訟（控美案）要求確認美國對台灣的管轄權；但在美國，只要找一個律師寫訴狀就可到法院遞狀，但「遞狀不等於法院受理」。他說，美國聯邦地方法院與美國聯邦上訴法院皆以純屬政治問題為由，根據《聯邦民事訴訟法》將控美案程序駁回，「連請求的內容都拒絕予以實質裁判」；林志昇卻謊稱控美案已經進入「林志昇律師團可以向被告（包含白宮、國務院、國防部、法務署等行政部門）調閱與本案相關之文件」的狀況，林志昇在台灣演講時甚至自稱「美國願意提供它的機密檔案給我，這個機密檔案都是英文的，差不多有兩個我的身高那麼多」。
2018年5月11日，全民拔菜總部總指揮盧朝財率眾到台灣民政府中央會館，放鞭炮慶祝台灣民政府遭桃園地檢署搜索，高喊「中華民國萬歲」、「檢調加油，替天行道」。盧朝財透露，他在宜蘭縣一個朋友誤信台灣民政府的謊言，加入以後被騙走很多錢，「但他現在已經死了，死不瞑目」。同日，台灣建國黨主席黃國華說，他也報名參加台灣民政府課程，他認為台灣民政府確實削弱中華民國政府，台灣民政府遭桃園地檢署搜索事件代表中華民國總統兼民主進步黨主席蔡英文想藉此肅清政敵；林志昇豪宅被搜出新台幣1.3億元現金，這筆錢沒有運用在台灣獨立建國，印證林志昇的主張最後是用於自己的賺錢，台灣民政府強大的組織與動員能力是獨派所不及。前台灣獨立黨副主席藍大山說，台灣民政府剛開始的吸收對象都是對台獨運動有熱情的人，林志昇從台獨社團找出熱情可愛的支持者當幹部，但是財務不公開、教材理論錯誤百出，很多人事後發現受騙。
2018年5月11日，政治評論家葉柏祥表示，臺灣總督府民政長官後藤新平曾說台灣人貪生怕死、貪財愛錢、愛面子，台灣民政府詐騙案正是台灣人「好騙難教、貪官愛財」的寫照。2018年5月14日，葉柏祥表示，台灣民政府絕對不是台獨團體，「没有建國的意識，也没有獨立的信念，反而是一個『打著台灣反台灣』的團體」，實質是政治詐騙集團；台灣民政府起始成員確實有許多人來自李登輝之友會，「而且是大金主」。2018年5月19日，新北市議員劉美芳說，AIT早已證實台灣民政府發行的身分證與護照等文件不獲美國認可，台灣民政府卻仍繼續經營，檢調必須仔細清查；蔡英文政府也該好好思考，為何有民眾寧可自稱是日本人、美國人，也不願認同台灣這塊土地。
2019年2月20日，台灣智庫諮詢委員張國城批評，台灣民政府長年利用操弄似是而非的理論與新聞事件來搏取媒體版面，受眾鎖定在受教育程度較低的弱勢族群，利用知識差距形成讓人看不清的知識壁壘，藉以榨取弱勢族群的「棺材本」。