东北剿匪总司令部
陈诚时期

陈诚上任后，大刀阔斧，将13个保安区司令部及大部分总队、支队番号全部撤銷；步兵整编为11个暂编师（暂30、暂50-59师），全部纳入国军正规军序列；两个骑兵支队扩编为三个骑兵师。11月中又成立了4个暂编师：暂60-63师。
暂编第30师：驻沈阳。130师副师长张儒彬晋升暂30师师长。编入第五十三军。
第一保安区：改编为暂编第50师，师长吴宝雲；驻山海关。编入新五军。
第二保安区、第九保安区改编为暂编第59师。新六军第14师参谋长梁铁豹升任暂59师师长； 编入新三军。
第三保安区改编为暂编第51师师长许颖、唐葆黄
第四保安区改编为暂编第52师师长刘伯中（黄埔八期交通科、劉詠堯胞弟）。1947年初其塔木战斗中，对所属陈团被围坐视不救，在该团被歼灭后，因“借机侵吞全团粮饷达两个月”，并且还“枉杀士兵多名”等罪状被“撤职押办”。1947年秋，东北交警总局吉林铁路警务处（辖三个警务段（相当于团）、三个独立大队 （相当于独立营）编制数千人的“护路”武装）与东北第四保安区改编的暂编第52师并编，师长李嵩（黄埔六期，俞济时的浙江保安部队出身）、副师长欧阳午（黄埔六期，宋希濂第36师出身），第一团团长胡家驹、副团长贺良汉；第二团团长周曙初、副团长王鹏；第三团团长谢绍贤、副团长熊国桢。铁路警察编为第二、三两个团，原暂52师缩编为第一团并调拨一部分轻重机枪、六零炮外，其余武器仍是原铁路警察之步枪。因而该师重火器甚少。全师约6000余人，战斗力弱。交第六十军指挥。后编入第六十军。1948年3月第六十军从吉林市撤退到长春市后，暂编52师奉命在市区以东的二道河子一带布防，左翼与守东大桥一带的182师（师长白肇学）衔接，右翼于在市东南设防的暂编21师（师长陇耀）衔接，像一个楔子被放在两个师的中间，把六十军防地分割成两半。
第五保安区：改编为暂编第53师师长许庚扬；编入新三军。驻沈阳。
第六保安区：保安第十一支队改编。再改编为暂编第54师，驻辽阳，师长马辙。1948年2月9日在辽阳被全歼。1948年3月第五十二军重建该师，师长黄建镛。后编入新八军
第七保安区：伪满第五军管区第35团团长王景南部改编为东北暂编保安第一总队，任总队长。后改编为东北保安第七区。再改编为暂编第55师（对外称独立第三师），师长王天任（通辽人。生于1911年6月2日。毕业于东北大学、日本陆军士官学校、陆军大学第六期、中央训练团党政班第四期。曾任第三集团军高级参谋。1941年1月21日任骑兵第三军副军长。1946年任第169师少将师长，1946年12月31日任辽北省政府委员兼中国国民党辽北省党部委员，军事调停处三人小组国方代表、组长。后任国防部少将参议。1948年国大代表。1949年任桂林的国防部突击第一总队少将总队长。去台湾后，在革命实我研究院第十五期、联战班第七期受训）。1947年6月从热河长城沿线调辽南，约3000多人，6月29日在大石桥被全歼，毙600余人，俘1800余人，东北民主联军伤亡370余人。1948年2月孙渡离任第六兵团司令官调任热河省主席，滇军另一派系的卢浚泉接任兵团司令官。孙渡派系干部和东北保安第四支队(热东建昌、凌（源）南的地主还乡团武装，支队长于大川）在锦州合编为暂编第55师，第六兵团原参谋长安守仁任师长。编入新八军。1948年10月初从锦州松山调入老城。10月8日调入锦州西南郊守备飞机场。10月13日调入市中心担任兵团预备队，师主力配置在锦州火车站以东靠近兵团部。10月14日解放军攻城，第三团团长杨应琦被炮弹炸死。10月14日下午15时，第六兵团司令官卢浚泉命令暂55师限黄昏前反击收复锦州市北部的暂18师主阵地，暂18师师长景阳和部队归暂55师指挥。安守仁和副师长梁炳芳、参谋长梁尔昌、第一团团长周宇宽、第二团副团长王鉴、第三团团长霍荣亭（热河地主还乡团改编的保安第四支队）、辎重营长庞卫国、炮兵营长邓大松决定起义投共。
第八、第十保安区合编为暂编第60师，师长陈膺华（黄埔八期，新22师第66团团长）；驻山海关。编入新五军。
第二、第七、第九保安区各抽出一个团合编为暂编第30师，师长刘德裕;
第十一保安区：伪满铁血部队“反正”后，改称为东北挺进军混成第一旅，旅长刘德溥。1945年8月下旬，为第九路军暂编独立第一师，师长刘德溥。1945年10月，东北行营改编为东北暂编保安第2总队，总队长刘德溥。1946年1月空运长春。1946年4月14日解放长春时被全歼。后刘德溥又收罗残兵及土匪武装于1946年夏重建第二纵队。1947年1月改编为东北第十一保安区，司令刘德溥。下辖41、42、43、44等4个团，其中43团在沐石河子被全歼。其余3个团于1947年9月改编为暂编第56师。1947年秋季在范家屯一带又被歼灭1个团。1947年11月编入新七军。1948年4月在机场被歼灭近1个团。1948年5月24日第六纵队与独立第十师在长春外围大房身机场作战中歼其两个团的大部。1948年4月该师改为甲种师编制：配以原新一军留长春之武器，补充兵员，加强人事，调换干部。师长更换为张炳言。全师原为7 000余人，后剩残部两三千人，只好改为师属两团制。
第十二保安区：抗战胜利后，华北先遣军新编第27军（军长姜鹏飞）第9师改编为东北暂编保安第三总队、再编为暂编第6师、东北保安第12区。改编为暂编第57师，师长陈天熹。第169团在彰武被歼；另外两个团在新立屯被东野七纵歼灭。后任师长朱茂榛，参谋长李柳侠。隶属第九十三军。
第十三保安区：改编为暂编第五十八师，师长王家善。前身系东北暂编保安第二、第四总队,1946年4月于长春战役中被歼，4月末在铁岭重建东北暂编保安第四总队，王家善任总队长。6月3日，第四总队移驻长春整编，并担任长春守备任务。8月该总队改编为东北第十三保安区。
暂编第61师：1947年11月以东北保安第12支队（后改称保安第3支队）及嫩江保安队改编。成份为土匪、伪军及铁路警察。军官均换为新一军新30师所派，并有一部分南方老兵，东北兵员占80%。全师7000余人，战斗力较强于暂编第56师。师长邓士富，编入新七军。1948年5月长春外围作战中，该师第一团被歼5个连，第二团被歼7个连，共被歼12个连。
暂编第62师：师长刘梓皋。3个团均为中央军嫡系组建，编入新六军。
暂编第63师：伪满姜鹏飞冀东挺进军改编。第4师副师长欧孝全升任暂63师师长。编入第十三军。后改番号为第297师。
第52军军长赵公武立即称病请辞，由副军长梁恺代理军长；陈诚上任后，即调三青团中央干事、青年军205师师长覃异之出任52军军长。
1947年11月10日，东北行辕宣布成立三个军：
新三军：龙天武任军长
新六军龙天武14师：副师长许颖升任师长
13军宋邦纬54师
暂编59师：14师参谋长梁铁豹任师长。新六军新二十二师第六十四团团长李平升为副师长。1947年12月15日，东北冬季攻势中第二团被消灭，团长何景华被俘虏。
新五军：陈林达任军长
52军陈林达195师：副师长谢代蒸升任师长
94军留光天43师
暂编54师：第六保安区司令马辙（抗战时期任第200师、第五军战车团团长）
新七军：李鸿任军长
新一军李鸿新38师：新一军参谋长史说接任新38师师长
暂编56师：原伪满铁石部队，反正后改编为东北保安第二总队，刘德溥为总队长，此次改编为正规军，仍以刘德溥任暂56师师长（不久，刘德*溥升任王铁汉第49军副军长，新七军参谋长张炳言接任师长）
暂编61师：新38师副师长邓士富任暂61师师长，此次改编后，该师中下级军官全部换成原新一军军官。
对各老骨干部队补充：
暂编53师划归潘裕昆新一军建制，由长春市警察局长兼第五保安区司令许赓扬任师长；
暂编62师划归李涛新六军建制。 东北交警总局第13、第14总队编为第169师调入新六军，张羽仙任师长；这个师初为两旅四团编制。组建暂编第62师时，3个团分别是东北行辕警卫第2团（即第5军200师598团，系杜聿明自昆明带至东北）、169师4团制变3团制多出来的1个团、新六军军直工兵营搜索营和辎重营抽调官兵加上辽东师管区新兵组建的一个团。因而暂编62师是标准的中央军嫡系。原14师42团团长、东北交警总局警备师副师长刘梓皋任暂62师师长
暂编63师划归石觉13军建制，该部即大名鼎鼎的伪满姜鹏飞冀东挺进军，由第4师副师长欧孝全任师长；
暂编58师划归覃异之52军建制，该部系满伪，反正后改编为东北保安第四总队，此次改编为正规军，仍以原总队长王家善任师长；
秋季攻势中，53军116师覆没，周福成将暂30师番号改为116师，以53军参谋长刘德裕任师长；另征募新兵补充暂30师，张儒彬仍任该师师长。
暂编52师纳入60军建制，以原东北保安司令长官部三处处长刘伯中任师长，使60军恢复三个师的建制（在沈阳整训的杨朝纶所部重建184师，但转隶属卢浚泉93军）。不久，刘伯中被军统揭发贪污、侵吞军饷被革职，以吉林铁路警务处长李嵩接任师长，并将吉林铁路交警总队亦并入暂52师。
设立的兵团为：
第一兵团：孙渡。驻锦州。辖：
第九十三军卢浚泉驻义县
暂编第18师，师部率第一团驻义县，第二团驻朝阳，第三团驻锦州
暂编第20师，师部率第一、第二团驻北票，第三团驻阜新
暂编第22师，驻新民县
暂编第57师，师部率第一团驻彰武，第二团驻哈尔套，第三团驻新立屯
第六十军曾泽生驻吉林
第182师，师部率第544、第546团驻吉林，第545团驻小丰满
第184师，驻北镇、沟帮子整训
暂编第21师，驻吉林
暂编第52师，师部率第一团驻九台，第二团驻西阳，第三团驻吉林
东北保安第四支队，假称第174师，驻锦西，其中一个团驻高桥
交警第三总队：驻义县、朝阳之间金岭寺区段
秦葫港口司令部：司令何士礼，驻葫芦岛
暂编第50师
暂编第60师
骑兵第3师；
第二兵团：陈明仁/刘安祺。辖潘裕昆新一军（长春）、陈明仁71军、骑兵第1师；
第三兵团：周福成。驻开原。辖覃异之52军、周福成53军
第四兵团：廖耀湘。驻沈阳。辖李涛新六军、罗友伦青年军207师、骑兵第2师；
行辕直辖：
驻热河石觉第13军
驻锦西、锦州王铁汉第49军。
鉴于13军89师师长刘建章（原新六军新22师副师长）在13军难以立足，陈诚遂调刘建章升任新六军副军长，89师副师长胡冠天升任师长。东北秋季攻势结束后，北平行辕主任李宗仁同意将94军留光天43师留在东北
撤销原有5个绥靖区，成立沈阳、长春、松北3个绥靖公署：
长春绥署主任：吉林省主席梁华盛；
沈阳绥署主任：沈阳防守司令楚溪春；
松北绥署主任：原东北保安副司令长官马占山。
设立征兵机构：
吉林师管区 司令李玉春
吉林团管区
长春团管区
辽东师管区 司令赵锡庆
沈阳团管区
辽阳团管区
辽西师管区 司令黄大定
新民团管区
辽北独立团管区 司令邓殿起
安东独立团管区 司令康永福
12月下旬，当林彪发起冬季攻势后，蒋介石同意将胶东半岛的阙汉骞第五十四军调往东北。