埔里歷史
清治時期

1684年第一任諸羅縣知縣季麒光在《臺灣雜記》提到水沙連的名詞和地理位置，這是目前有關水沙連年代最早的文獻。1693年高拱乾編寫《台灣府志》，其中在<規制志>有提到水沙連思麻丹社「康熙三十二年新附(歸附)」成為「供賦熟番」，這是目前有關邵族最早的歷史記載;賦役志則有對邵族族人的記載;<外志>中也有對水沙連地理概念的描述。
1697年郁永河寫《番境補遺》記錄並描述了水沙連的風土民情，其中有關於「水沙廉」的記載。。
1713年豎立石碑標明界限，嚴格執行不得跨越番界的禁令 。1717年周鍾瑄編修《諸羅縣志》<卷一．封域志：山川>中提到水沙連內山有十社(十個部落)；<風俗志．番俗考中>亦有對水沙連男女悅合的記載和南北港番的分類與記述，<古蹟>和<外紀>更有對邵族的風土民俗的詳細記載。
1721年水沙連與阿里山各社，因為對漢人通事蠻橫而暴利貪斂的態度感到痛恨，乘著「朱一貴抗清事件」殺死通事。水沙連與阿里山各社殺死通事的事件被清廷視為叛亂，因此知縣孫魯前來招徠，先展示兵威火力，再賞賜煙、布、銀牌，軟硬兼施的招撫手段，在十二月間讓阿里山各社與水沙連南港土官接受招撫，而水沙連北港土官麻思來隔年（雍正元年，1723年）元月間也接受招撫。1723年清廷增設彰化縣，並將原本參將駐紮於諸羅之北路協鎮移駐彰化，進而得以同時控制南邊的諸羅縣和北邊的淡水廳。
1725年水沙連社頭目骨宗聯絡附近的蛤里難社（埔里社）等社，連續在東勢、藍興半線社、大武郡、柴裡社、竹腳寮等地殺人，引起官方的注意。1726年九月間總督高其倬命令臺灣道吳昌祚及北路參將何勉、淡水同知王汧、巡察御史索琳等共出兵二千人，共同圍剿骨宗等人，十月間直搗水沙連北港之蛤仔難社，然後再進入水裡湖社逮捕到骨宗父子三人，搜出積存的頭顱八十五個，又逮到阿密氏麻等二十多人，亦搜出頭顱無數，並將骨宗等人押解回軍前，解省伏誅。
1734年清政府為了加強控制內山地區，將濁水溪流域一帶的原住民領域成立「沙連堡」，其範圍即清朝末年沙連、集集、五城等堡廣闊的內山地區。1737年清廷解除攜眷渡臺之禁令，從閩粵兩個省分前來拓墾的漢人逐漸增加。1740年清朝政府賜姓「潘」給岸童社土目,成為埔里平埔族人的潘姓由來。1743年沙連堡設立。
1744年清廷下令禁止漢人爭奪開墾番地。1752年清廷豎立石碑於原住民生活領域的邊界，禁止漢人進出。1755年政府准許水沙連地區開墾升科。1756年劉宰予開闢水圳東埔蚋圳完成。1759年設置南投縣縣丞，由彰化縣知縣管轄，是輔助機構，但有管轄刑名錢穀的功能。
1762年彰化知縣胡邦翰籲請水沙連已報陞科之沖崩壓壞田園減則，並免舊欠回賦。1764年三月巡臺御史李宜青實地調查水沙連，九月以水沙連地脊租重(土地貧瘠稅負沉重)，奏請處蠲租(免除租稅)。
1765年二月臺灣道莊允焄嚴禁採製軍工樟木放流水圳之水道，並將告示刻於石碑立於濁水莊。1766年設置南北路理番同知。1771年閩籍漳州府漢人合股招募佃農在沙連堡淺山地區積極拓墾，陸續建立了林尾庄、湳底庄、吳厝庄、柴橋頭庄、八張犁庄。1781年泉州人進入集集開墾，形成一大聚落，稱作集集舖。1782年 爆發閩粵漳泉互相爭鬥的慘案。
1783年業戶楊東興進入集集埔開墾，修築水圳引濁水溪水灌溉，拓墾洞角、大坵園等莊。1788年臺灣知府楊紹裘奉旨，率領水沙連化番頭目毛天福與阿里山頭目等三十名地方官員進入京師前往拜見皇帝，獲得賜謁七次賞宴十次，並給予朝服等禮物，並由福建巡撫頒給銀牌，觀光一年多的時間才回去。水沙連社原住民頭目毛天福被任命為通事，黃漢被任命為社丁首。
林爽文事件時，水沙連地區的通事、社丁首等率領歸化生番，效忠清廷，有功於掃蕩平定。福康安於是上奏請求讓臺灣的熟番設置屯防。於全臺灣共設屯所十二處四千人，在水沙連地區設柴裡小屯及北投小屯，水沙連化番隸屬於迆裡小屯，其養贍埔地為將八娘坑埔地九十甲分給水沙連社屯丁九十名，每名得一甲。除了屯丁以外，禁止民間私自擁有兵器。
1789年分配膽養埔地給熟番平埔族以設置屯田。1790年詳細測量土地並重新豎立標明界限的石碑，以永久禁絕越界紛爭。1791年實施屯番之制。1792年命令將屯番制事務之經營管理改由屯丁自收、發給。
1790年成立番屯制度, 後有「郭百年事件」開啟了平埔族群遷移埔里盆地爭佔埔地、殺害社番、死去過半，未幾再遭北來兇番窺我社慘，微少番丁，遂生欺凌擾害，難以安居。幸有邵族親來社相商，云及前日間上山捕鹿，偶遇北投社平埔族人亦入山捕鹿，相會敘出情因。言及在外被漢奸勒佔, 棲身無地, 大慘難言。阿密、大舌(埔社頭目與社主)以及邵族社番親竊思。自我祖上以來原與北投社平埔族一脈相生, 同氣連枝。聞此大慘, 不得不為之悲哉! 是故輾轉尋思: 「而今此本社地廣番少, 屢被北番擾害, 慮乏壯丁共守此土, 如得該北投社平埔族來社同居墾耕,  一則可以相助抗拒兇番,  二則北投社平長久棲身之處, 所謂一舉兩得而無虞矣! 」
由上述可知平埔族群入墾埔里的契機, 是由於埔社族人因「郭百年事件」導致人丁稀薄, 無力抵禦外族入侵,恰巧洪雅族北投社族人在一次偶然的機會, 與邵族人於山中打獵相遇, 得知埔社族人在一邊是急需人力抵禦敵對外族; 一邊是飽受漢人欺凌, 另覓新天地安居, 於是透過與埔社族人關係親密的邵族人居中撮合, 使得進入埔里盆地開闢新家園, 而位於草屯鎮的洪雅族北投社因地利之便, 不僅是入埔的開路先鋒, 更是後來大舉入墾的主要勢力! 當在西部的平埔族群備受漢人侵壓, 日感生活困頓知時, 聞知埔里地廣人稀, 漢人悉遭政府驅逐出山, 並且原住埔社族人亦歡迎入墾，時北至苗栗通霄，南至雲林斗六廣大區域內的平埔五大族群包括道卡斯、巴宰、巴布拉、巴布薩、洪雅諸族，即透過屯制的聯繫，組織成大規模的集體移墾行動。
後招平埔族群入墾埔里的埔社族人失去了埔里盆地南半部主人的地位, 而北半邊的原住主人眉社族人, 雖拒絕了平埔族群進入其領地開墾, 但平埔族不斷侵墾眉社族人的領地。在無力抵禦大量入墾的平埔族移民之下, 無奈地交出北埔里盆地世代居住的領地。至此, 平埔族可說是成為埔里盆地的新主人了!
1793年業戶楊東興創建集集埔媽祖廟，祈求開墾拓殖平安。1811年泉州人林評募集資金招來佃農開墾牛轀轆（今水里鄉永豐村），拓墾白仔腳山南邊山腳一百幾十甲，開鑿水圳灌溉。
1814年水沙連隘丁首黃林旺，聯合陳大用、郭百年及臺灣知府衙門門丁等，貪圖水沙連非常豐腴的土地，發動「郭百年侵墾事件」，到處隨意焚燒殺戮，佔領奪取水沙連的土地，使得水沙連的原住民流離失所。1816年臺灣鎮總兵武隆阿巡視檢閱臺灣北部得知郭百年入侵開墾及焚燒殺戮事件，下令嚴正處理，並命令彰化縣令吳性誠請諭墾戶，驅逐大多數佃戶離開山區，同時臺灣鎮撤回臺灣府的告示。
1817年清廷傳喚郭百年等人到地方行政中心訊問，郭百年被戴上枷鎖並用棍杖拷打，其餘的人則被赦免。署鹿港同知張儀盛、彰化縣知縣吳性誠、呂志恆，前往沈鹿社拆毀泥土建造的城郭，將水沙連全部的耕地租佃撤銷，各個部落的原住民族人才開始返回。清廷於烏溪口、濁水溪口豎立刻有公告禁止事項的石碑，石碑在北邊豎於龜仔頭坪（今國姓鄉龜仔頭）刻著「原作生番厲，不造漢民巢」，在南邊豎於風谾口（今集集洞角）刻著「嚴禁不容奸入，再入者斬」的告示，嚴禁漢人超越開墾界限。
1823年西部平原平埔族透過邵族恩貓丹社（水社）打里摺番親的引薦和介紹，以埔里盆地部份埔地的永耕權，做為西部平埔族群移入的補償。正月(農曆一月)間西部平原平埔族群訂立「公議同立合約字」，各個部落互相約定選出並調派壯丁，自備斧資往水沙連內山開墾尚未被開發的土地。萬斗六社革通事田成發首先集結招募其他部落的熟番作為保衛，並提供尚未開發的土地給他們開墾耕作。北投社兩百多人分成幾次移民進入埔里盆地開墾耕作，陸續形成茄苳腳、枇杷城、鹽土三聚落。
北路理番同知鄧傳安，注意到水沙連的侵入開墾事件，擔心有邊界衝突發生的可能，親自率領兵勇進入水沙連番地視察，安撫部落裡的多數居民，並且寫成《水沙連紀程》。
1824年王增榮、陳坑二人為墾首，企圖開墾水沙連邵族領域，先投入大量資金修築道路，以便聯結集集地方，並建土地公祠於嶺頂，以祈求行路平安，因該嶺形狀看似馬騴，於是稱為土地公鞍嶺。北路理番同知鄧傳安向福建巡撫孫爾準大力陳述開放水沙連的好處，孫爾準原本有意要採納，但經過駐守在臺灣的官吏研議，仍然劃界封鎖，更在集集鋪（今集集鎮），及內木柵（今草屯鎮、土城）南北二處入山隘口設置汛(兵營)專管防範，並由北路理番同知及彰化知縣每年分上下兩班，輸流巡查，以禁絕違法闖越。
1825年社寮張天球設立學塾，取名「文峰齌」，延請老師教育後生晚輩。朴仔籬社、葫蘆墩社、岸裡社、烏牛欄社、阿里山社男女七百餘人移入埔里盆地，在眉社領地建立聚落開墾耕作，但因位於泰雅族出草威脅地帶，不久就放棄耕作。
1828年十月間蛤美蘭社（土目阿密、社主大舌等透過思貓丹社在其中協助，與各平埔族群訂立「望安招墾永耕字」，收受當時價值銀伍仟餘圓的禮物，再撤出埔地與田園山林以供平埔族群打里摺番親墾耕，各族群、各部落並共同訂立「承管埔地合同約字」分配土地。兩次大規模招墾後，土地所有權落入平埔族群間，平埔族群成為埔里盆地的新主人。
1830年於埔里社設置總通事官職，下面另外設有土官官職。羅良吉被舉為總通事管理各部落，各部落並設置土官，治理移住埔里盆地的平埔族群，此為清廷默認平埔族群移居開墾埔里盆地。
1836年閩籍漳州人抵達銃櫃山區從事侵墾。臺灣兵備道熊一本、給事中朱成烈何清廷上奏表示臺灣還沒開發的土地很多，應該准許開墾，清廷命令閩浙總督顏伯壽討論並答覆。總兵武攀鳳、臺灣巡道熊一本、臺灣知府仝卜年等進入水沙連地區實地調查，之後向閩浙總督顏伯壽獻上「條覆籌辦番社議」精確陳述開墾水埔六社的利益，但顏伯籌認為這樣會侵犯到原住民的生活空間，後患難防而援舉例子奏請禁止。
1838年閩籍漳州人抵達頭社，泉州人進入水社侵墾。1841年臺灣知府大力陳述關於開墾水沙連六社的政策，遭到閩浙總督禁止。
1846年北路理番同知史密、北路協副將葉長春、南投縣丞冉正品，率領通事土目進入水沙連。當時埔裡社番目(原住民頭目)督律、水裡社番目毛蛤肉、田頭社番目擺典、貓蘭社番目六改二、沈鹿社番目排塔母、眉裡社番目改努等，率領六個部落的住民，向這些官員獻上地圖，表達亟欲開墾之意。史密於是向上級報告「籌辦番社議」，先描述原住民的情況，再討論到控制綏靖、馭治備禦等具體方案，大力推薦開墾水沙連。
北路理番同知的「籌辦番社議」由巡道熊一本、知府仝卜年向閩浙總督劉韻珂清楚說明，於是劉韻珂向朝廷上摺「奏開番地疏」。臺灣府北路理番同知曹士桂，首先進行實地調查水沙連。
1847年閩浙總督劉韻珂，率領北路理番同知史密、淡水同知曹士桂、北路協將葉長春、北路營參將呂大陞還有其他官兵實地調查水沙連六社，並向道光皇帝呈上「奏勘番地疏」，詳細解說水沙連六社「開之則易於成功，禁之竟難以弭患」。他大力陳述開墾政策的奏摺並未被朝廷接受。閩浙總督劉韻珂視察眉社時，將違法私自開墾並欺凌侮辱眉番的徐戇棋正法，以懲罰警告橫行於埔里盆地之不法之徒。
1848年新任分巡臺灣兵備道徐宗幹，接受水沙連六社番目群到官署的開墾要求，於是請設屯丁書，擬將原本屬於迆裡小屯的水沙連六社化番，獨立為水沙連大屯，屯兵四百名。茄苳腳圳興建工程開始。
1849年總社丁黃肥招得墾首王增榮，開墾原來審鹿社的埔地(即今魚池鄉盆地的平原地帶，大約今魚池鄉魚池、東池、大林、東光、共和、中明、新城各村)，面積大約有二十一平方公里。埔社眉社總通事羅良吉過世，再推選北投社族人巫春榮為總通事，因處事不公，偏袒南、北投社，紛爭不斷，於是平埔族群水火不容，分為南、北兩黨，南投社北投社稱為「南番」，頂九番（牛眠山等聚落）、下九番（日南、房裡、吞霄等聚落）、大肚番（水裡、生番空等聚落）稱為「北番」，雙方對立，勢均力敵，不肯讓步。
1850年埔社眉社頭人篤律、斗禮、眉西弄、代毛甲非等人立出招墾字據，將埔里盆地眉溪以北草埔地交付平埔族頭人潘永成管理耕作事宜，招募佃戶開墾，每年配納草地租（生番租），每甲納粟壹百石，此為泰雅族系統的眉社、水眉社讓出土地供平埔族群開墾耕作，導致眉社、水眉社勢力衰微，最後眉社躲避入內山併入萬大群，水眉社併入眉原群。
1851年茄苳腳圳、北烘圳、守城份圳等水利設施陸續開鑿完工，平埔族群之定耕農作開始有一定規模，埔里盆地的開發奠定基礎。
1854年(陳希亮等人開鑿三角潭仔圳。1855年漳州籍漢人移居崙龍及水社。1856年黃達理等六戶三十人，移來卜吉（又被稱作剝吉，今德化社），邵族十八戶遷居珠嶼（今光華島）及水社。
1857年泉州人鄭勒先率領群眾進入埔里盆地，與平埔族群進行交易，他並依順原住民習俗，改姓名成平埔族名培奕（uaiyek），而且與平埔族人互相約定毋侵奪、毋欺詐、毋強佔土地等事，獲得平埔族群之信任，並獲得准許居住在埔里社。自此之後漢人移入日漸增多。
1858年漢人墾戶首王增榮的孫子王達德將木屐蘭的埔地分成三十二份田業，交給漢人佃戶前去開墾，並建立木屐蘭聚落。大規模的瘟疫傳染事件使邵族族人二十八戶九十六人遷往石印社。1860年漢人二十戶，總共一百一十人，進入日月潭湖邊的水社和卜吉兩地拓墾。
1862年臺灣中部發生「戴萬生之亂」，清廷展開圍剿，亂黨之一的洪欉據守今草屯鎮北勢湳一帶頑強抵抗，其弟洪益竄入 。
1866年埔里盆地「南番」、「北番」勢力因既得利益衝突，不斷發生武力對抗，時常發生械鬥，時稱「南北併」，埔里社街區曾遭兩次焚燒，此一械鬥直到1873年（同治十二年）才逐漸平息。
1868年受定耕農作與漢文化影響，平埔族人於烏牛欄創建福德爺廟，平埔族人之粟作文化和祖靈信仰逐漸式微。1869年6月林評在拓墾時遇害而死，當地居民因為感念他的功勞，建造廟祠以奉祀他。
1871年埔里盆地烏牛欄巴宰族頭人潘孝希開山，因打獵槍傷，獲同族岸里社族人引介，前往臺南療傷，住院期間得基督福音，邀請李豹、甘為霖牧師(William Campbell)前來，基督教信仰自此後傳入埔里盆地。甘為霖牧師並資助埔裡社之巴宰族人興建烏牛欄禮拜堂，成為水沙連地區基督教傳教之起源地，其後兩年間陸續完成牛眠山、大湳禮拜堂的興建與傳教事宜。平埔族人倡議興建「恆吉宮」於大肚城，供奉天上聖母。
1873年設鹿港理番同知分廳於大肚城，是為水沙連地區的政治中樞，並兼置義塾，教育平埔族及漢系子弟，官員、商賈群居於此。水社化番頭目改只，將與木屐蘭相連的長寮內外加道坑交給吳忠鳳等前去開墾耕種，並建立聚落。甘為霖牧師再次前來埔里盆地傳教，並試圖在日月潭之水社對邵族進行基督教的傳教工作，將日月潭命名為Lake Candidius，用以紀念17世紀間一位荷蘭籍教師Candidius在臺南地區熱心傳播基督福音的事蹟。
1874年牡丹社事件發生，日軍前來臺灣征伐，清廷派出船政大臣兼臺灣督辦防務沈葆楨找出完善的解決方案，隨後開放「開山撫番」，解除漢人渡臺禁令，並允許漢人進入番地。理番廳委員李世英廢埔里盆地原有之通事制，將埔里盆地的各聚落分為東西南北四角，各置總理一名，各聚落設社長職。
1875年元月至11月，總兵吳光亮親自督導兵勇開鑿中路，由林圮埔（今竹山）抵東臺灣之樸石閣（今花蓮縣玉里鎮）。同時另鑿一路，由集集街，經牛轀轆而於大坪頂匯合前者。改北路理番同知為中路撫民理番同知，新設埔裡社廳而移駐。撤銷進入山區與販賣鐵、竹等先前的禁令。將進入埔里盆地南路要衝的銃櫃、水社、貓蘭、司馬按及新城五庄自沙連堡移出，獨立為五城堡。
為了防範甘為霖牧師在日月潭珠子嶼（今光華島）上興建禮拜堂，總兵吳光亮在島上興建正心書院，命令在水沙連駐屯的丁汝霖與幕僚吳裕明、黃允元等人同時管理書院的教育事務，並教化邵族族人。正心書院的主建築是一座長十六公尺，寬五公尺的房舍，是一個具有規模的建築物。 設置鹿港理番同知分廳於大肚城，以作為中央政治機構，並設置義學。
1876年設立埔裡社堡的十九所義學及五城堡（即銃櫃、水社、貓蘭、司馬按及新城五庄）的七所義學。
1877年臺灣總兵吳光亮建造大埔城（今埔里街區前身）及建築廳署，壘土為城，外植刺竹，環以濠溝，並設東、西、南、北四門，周圍凡七百餘丈，號稱「大埔城」，是為控制臺灣中部番境之重鎮。福建巡撫丁日昌擬定撫番開山善後章程二十一條，由分巡臺灣道夏獻綸札飭(官府上級對下級發文訓示)各廳縣。同知吳本杰擬定撫番章程。
1878年粵人林阿琴移居集集社仔莊，以熬製樟腦為業。五城堡的七所義學，經理番委員調整為頭社、水社、貓蘭、木屐蘭、大林等五處。臺灣總兵吳光亮建造大埔城（今埔里街區前身）並建造主要官署，以堅硬的土壤建造城垣，外面種植刺竹，以濠溝環繞，並設置東、西、南、北四座城門，周圍凡七百餘丈，號稱「大埔城」，是為控制臺灣中部番境的重鎮。設置地方官制總理制度。
1879年吳光亮頒佈「化番俚言」三十二條。夏季剛開始時，水社發生嚴重的疾病傳染事件，前後二年連續有兩百多人死亡，邵族族人為了避難，逐漸遷居中茅埔、新興、水尾、竹湖等村莊，以致於水社衰頹。廢止招墾局。濁水莊童生董榮華建造永濟義渡完工。牛相觸（今埔里鎮南村）庄民刈香於竹北二堡枋寮庄芝義民爺廟，建廟祀之。
1882年為防禦生番，左水社總帶綏靖左營內分別派遣兩哨至獅仔頭及蜈蚣崙，並設屯丁營（名營50人）二所於埔裡社史櫓塔（今十一份仔山麓）及生番望頂（現水尾山麓），這些屯丁全部都只錄用平埔族人。撫民通判進駐
1884年招待佃人黃達理，在日月潭畔的卜吉庄（今德化社）墾殖。設置地保、鄉保、總甲，地保辦理人民訴訟，鄉保司搜查，總甲司捕拿。
1885年臺灣建省，劉銘傳就任為首任巡撫，到任後向朝廷陳述臺澎善後事宜，以「練兵」、「清賦」、「辦防」、「撫番」四大政務為治理臺灣的主要重點，即設立防務、籌辦軍政、清理賦稅、安撫生番等，其中以「撫番」為治臺首務。此時，埔里是主要的撫番中樞。成立埔裡社廳撫民通判，也就是「分府丁」。福建臺灣巡撫劉銘傳，委棟軍統領林朝棟辦理中路營務處及撫墾局給與「林合」墾契，許在北港沿山招佃墾耕，並專賣全臺樟腦獲利。
1886年設埔裡社撫墾局於番界，合併理番同知與撫墾委員。設立屯兵營盤，以五三五人為一營，一面防備，一面耕耘，營盤分為中、左、右、前、後五哨，中哨派一三五人任營盤，任埔裡社城內警備，其餘四百人，分為四哨派遣蜈蚣崙、十一份仔、守城份、蔍高仔、水尾、三條崙等六屯營，另配置四人於小銃櫃，由埔裡社附近更深入松柏崙設防。巡撫劉銘傳選定林杞埔為新設雲林縣治。十月斗六門縣丞陳世烈進駐，成立雲林城工總局及雲林撫墾局。
1887年7月，埔里社的平埔族與邵族四社，聯合布農族的卓大社起來反抗，清廷派林朝棟率領「棟軍」入山攻伐。1888年設埔里社廳。實施埔里社廳的清丈和清賦工作，實施「減四留六」佃租政策，由小租戶直接繳納賦稅，並徵收「亢五租」作為撫番及義塾的資金來源。改埔里社撫墾局為招墾局，並設蜈蚣崙及木屐蘭分局。設東勢角撫墾局水長流分局、北港分局。
1889年設置北路協鎮府於大埔城內。林朝棟自東勢角之馬鞍嶺至埔裡社之大坪頂間，開闢官道，沿途駐軍以護腦丁，其左哨隊在水長流，中哨隊在北港溪。