清华大学院系
改革開放以来

改革開放以来，清华大学开始大力恢复综合性大学，先后逐步建立、复建各类理科、文科、管理学科、高新技术专业等类院系。
理科方面：1979年成立应用数学系；1982年6月恢复物理系；1984年6月成立生物科学与技术系；1985年10月恢复化学系；1985年12月，恢复理学院建制，周光召兼任院长。
人文社科方面：1983年7月恢复外语系；1984年4月建立社会科学系；1985年3月恢复中国语言文学系；1993年12月恢复人文社会科学学院建制，滕藤兼任院长，同时撤销社会科学系；2000年复建社会学系；2008年恢复心理学系，成立马克思主义学院，邢贲思任院长。
工科方面：大规模调整院系建制名称；1988年整合建立建筑学院；1994年整合建立信息学院建制；1996年整合建立机械工程学院建制；2000年整合建立土木水利学院建制；2001年分离建立工业工程系；2004年整合建立航天航空学院；2009年成立生命科学学院。
管理学科方面：1979年成立经济管理工程系；1984年扩建为经济管理学院，朱镕基任院长；2000年整合建立公共管理学院。
其他方面：1984年建立研究生院；1985年建立继续教育学院；1999年恢复法学院；1999年并入原中央工艺美术学院为美术学院；2001年建立医学院；2002年整合建立新闻与传播学院；2006年，与中国协和医科大学紧密合作办学，成立北京協和醫學院—清華大學醫學部联合培养八年制临床医学专业的学生；2009年，恢复清华国学研究院，成立教育研究院。
2012年12月，撤销人文社会科学学院，分别成立人文学院和社会科学学院。11月10日，举行清华大学医学院基础医学系、药学系成立仪式。12月27日，在原机械工程系、精密仪器与机械学系、材料科学与工程系的基础上，成立清华大学材料学院、精密仪器系和新的机械工程系。
2015年10月，正式成立蘇世民書院；12月，成立药学院。
2016年12月30日，成立地球系统科学系。
2017年3月4日，成立临床医学院。2017年5月16日，清华大学第23次校务会议决定成立清华大学科学史系。
2019年3月28日，清华大学官方微博宣布，正式成立天文系。同年4月2日，清华大学宣布成立车辆与运载学院，简称车辆学院，並撤销汽车工程系建制。
2020年4月2日，成立萬科公共衛生學院。
2024年4月10日，心理學系更名心理與認知科學系。同年7月，成立統計與數據科學系。
| 学院 | 系 | 系馆 | 学院 | 系 | 系馆 | 学院 | 系 | 系馆 |
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| 建築學院  | 建築系 | 梁𨱇琚樓 | 美术学院  | 藝術史論系 | 美术学院大楼 | 航天航空学院  | 航空宇航工程系 | 蒙民伟科技大楼 |
| 建築學院  | 城市規劃系 | 梁𨱇琚樓 | 美术学院  | 工業設計系 | 美术学院大楼 | 航天航空学院  | 工程力學系 | 蒙民伟科技大楼 |
| 建築學院  | 建築技術科學系 | 梁𨱇琚樓 | 美术学院  | 環境藝術設計系 | 美术学院大楼 | 机械工程学院   | 機械工程系 | 李兆基科技大楼 |
| 建築學院  | 景觀学系 | 梁𨱇琚樓 | 美术学院  | 陶瓷藝術設計系 | 美术学院大楼 | 机械工程学院   | 基礎訓練中心 | 李兆基科技大楼 |
| 社會科學學院  | 社會學系 | 熊知行楼 | 美术学院  | 視覺傳達設計系 | 美术学院大楼 | 机械工程学院   | 精密儀器系 | 曾宪梓楼 |
| 社會科學學院  | 心理與認知科學系 | 伟清楼 | 美术学院  | 服裝藝術設計系 | 美术学院大楼 | 机械工程学院   | 能動工程系 | 動力機械館 |
| 社會科學學院  | 政治學系 | 明齋 | 美术学院  | 資訊藝術設計系 | 美术学院大楼 | 机械工程学院   | 車輛與運載學院 | 汽车楼 |
| 社會科學學院  | 國際關係學系 | 明齋 | 美术学院  | 工藝美術系 | 美术学院大楼 | 机械工程学院   | 工業工程系 | 舜德楼 |
| 社會科學學院  | 經濟學研究所 | 明齋 | 美术学院  | 繪畫系 | 美术学院大楼 | 人文學院   | 中國文學系 | 新齋 |
| 經濟管理學院 | 會計系 | 伟伦楼 | 美术学院  | 雕塑系 | 美术学院大楼 | 人文學院   | 哲学系 | 新齋 |
| 經濟管理學院 | 經濟系 | 伟伦楼 | 理学院  | 數學系 | 理科楼  | 人文學院   | 历史系 | 文北楼 |
| 經濟管理學院 | 金融系 | 伟伦楼 | 理学院  | 物理系 | 理科楼  | 人文學院   | 外國語文學系 | 文南楼 |
| 經濟管理學院 | 市場營銷系 | 伟伦楼 | 理学院  | 化學系 | 何添楼 | 人文學院   | 科學史系 | 蒙民伟科技大楼 |
| 經濟管理學院 | 组织管理系 | 伟伦楼 | 理学院  | 地球系统科学系 | 蒙民伟科技大楼 | 醫學院 | 基础醫學系 | 医学科学楼  |
| 經濟管理學院 | 創業戰略系 | 伟伦楼 | 理学院  | 天文系 | 蒙民伟科技大楼 | 醫學院 | 生物醫學工程學院 | 医学科学楼  |
| 經濟管理學院 | 管理科學系 | 伟伦楼 | 土木水利學院  | 土木工程系 | 何善衡楼 | 醫學院 | 臨床醫學院 | 医学科学楼  |
| 信息科學技術學院  | 電子工程系 | 羅姆樓 | 土木水利學院  | 建設管理系 | 何善衡楼 | 醫學院 | 公衛研究中心 | 医学科学楼  |
| 信息科學技術學院  | 微纳電子系 | 东主楼 | 土木水利學院  | 水利水電工程系 | 新水利館 | 药学院 | 药学院 | 医学科学楼  |
| 信息科學技術學院  | 計算機科學與技術系 | 东主楼 | 環境學院 | 環境工程系 | 环境节能楼 | 材料學院 | 材料學院 | 逸夫技术科学楼 |
| 信息科學技術學院  | 軟件學院 | 东主楼 | 環境學院 | 環境科學系 | 环境节能楼 | 生命科学学院 | 生命科学学院 | 生命科学馆 |
| 信息科學技術學院  | 自動化系 | 中央主楼 | 環境學院 | 環境規劃與管理系 | 环境节能楼 | 電機工程與應用電子技術系 | 電機工程與應用電子技術系 | 西主楼 |
| 信息科學技術學院  | 信息技術研究院 | 信科大楼 | 新闻与传播学院 | 新闻与传播学院 | 宏盟楼 | 工程物理系 | 工程物理系 | 刘卿楼 |
| 信息科學技術學院  | 網絡研究院 | 中央主楼 | 法學院 | 法學院 | 明理楼 | 化學工程系 | 化學工程系 | 英士楼 |
| 統計與數據科學系 | 統計與數據科學系 | 伟清楼 |  |  |  |  |  |  |
| 马克思主义学院 | 马克思主义学院 | 善齋 | 公共管理学院 | 公共管理学院 | 伍舜德樓 | 交叉信息研究院 | 交叉信息研究院 | 信科大楼 |
| 五道口金融学院 | 五道口金融学院 | 五道口金融学院 | 蘇世民書院 | 蘇世民書院 | 蘇世民書院 | 教育研究院 | 教育研究院 | 文南楼 |
清华大学主要实验室、研究中心、研究基地
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 國家研究中心 北京信息科学与技术国家研究中心 重大科技基础设施 国家蛋白质科学基础设施（北京基地）  地球系统数值模拟装置  未来网络试验设施  极深地下低辐射本底前沿物理实验设施 国家大型科学仪器中心 北京电子能谱中心  北京电子显微镜中心 国家重点实验室（13个） 化学工程联合国家重点实验室#  环境模拟与污染控制国家重点联合实验室#  低维量子物理国家重点实验室  生物膜与膜生物工程国家重点实验室#  精密测试技术及仪器国家重点实验室#  集成光电子学国家重点联合实验室#  微波与数字通信技术国家重点实验室  智能技术与系统国家重点实验室  水沙科学与水利水电工程国家重点实验室  摩擦学国家重点实验室  汽车安全与节能国家重点实验室  电力系统及发电设备控制和仿真国家重点实验室  新型陶瓷与精细工艺国家重点实验室 国家工程实验室（11 个） 数字电视国家工程实验室 （北京）  电子商务交易技术国家工程实验室  神经调控技术国家工程实验室  抗肿瘤蛋白质药物国家工程实验室  下一代互联网核心国家工程实验室  特高压工程技术（昆明、广州）国家实验室  工业酶国家程实验室  城市轨道交通绿色与安全建造技术国家工程实验室  烟气多污染物控制技术与装备国家工程实验室  危爆物品扫描探测技术国家工程实验室  大数据系统软件国家工程实验室  :  国家工程研究中心（4个） 光盘系统及应用技术国家工程研究中心  工业锅炉及民用煤清洁燃烧技术国家工程研究中心  燃气轮机与煤气化联合循环国家工程研究中心  生物芯片北京国家工程研究中心 国家工程技术研究中心（3个） 国家道路交通管理工程技术研究中心（清华分中心）  国家计算机集成制造系统工程技术研究中心  国家企业信息化应用支撑软件工程技术研究中心 重大事故防控技术支撑基地（ 1个） 城市安全重大事故防控技术支撑基地 国家国际科技合作基地(联合研发中心)（6个） 新能源与环境国际研发中心  清华大学新材料国际研发中心  功能材料国际联合研究中心  中美清洁汽车技术国际联合研究中心  中拉清洁能源与气候变化国际联合研究中心  中俄航天航空创新技术国际联合研究中心 国家国际科技合作基地(示范型合作基地) 摩擦学国家重点实验室(清华大学)  清华大学中俄战略合作研究所 国家产教融合平台（1个） 国家集成电路产教融合创新平台 “一带一路”联合实验室（1个） 中国-印尼高温气冷堆“一带一路”联合实验室 习近平新时代中国特色社会主义思想研究院（1个） 清华大学习近平新时代中国特色社会主义思想研究院 清华大学-北京大学生命科学联合中心（1个） 清华大学-北京大学生命科学联合中心  
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|  教育部重点实验室 生命有机磷化学及化学生物学教育部重点实验室  工业生物催化教育部重点实验室  应用力学教育部重点实验室  地球系统数值模拟教育部重点实验室  蛋白质科学教育部重点实验室  生物信息学教育部重点实验室  普适计算教育部重点实验室  粒子技术与辐射成像教育部重点实验室  信息系统安全教育部重点实验室  生态规划与绿色建筑教育部重点实验室  土木工程安全与耐久教育部重点实验室  固体废物资源化及应急控制工程教育部重点实验室  先进成形制造教育部重点实验室  热科学与动力工程教育部重点实验室  先进反应堆工程与安全教育部重点实验室  先进材料教育部重点实验室  有机光电子及分子工程教育部重点实验室 教育部-微软重点实验室 清华大学媒体与网络技术实验室 教育部工程研究中心 教育部建筑节能工程研究中心  教育部固体器件与集成技术工程研究中心  教育部辐射技术与辐射成像工程研究中心  教育部清洁能源化工技术工程研究中心  教育部核电技术工程研究中心  教育部计算机网络技术工程研究中心   |  教育部人文社会科学重点研究基地 清华大学现代管理研究中心  清华大学技术创新研究中心  清华大学高校德育研究中心  清华大学出土文献与中国古代文明研究中心 教育部战略研究基地 清华大学科技教育发展战略研究中心 教育部教育战略与规划研究中心 教育部-清华大学教育战略决策与国家规划研究中心 环保部重点实验室 国家环境保护微生物利用与安全控制重点实验室  国家环境保护生态工业重点实验室# 环保部工程技术中心 国家环境保护技术管理与评估工程技术中心 国家体育总局体育社会科学重点研究基地 清华大学国家体育总局体育社会科学重点研究基地 国家安全生产技术支撑体系专业中心实验室 国家安全技术支撑体系国家级中心关键储备设施火灾安全与应急技术基础研究实验室 国家文物局重点科研基地 空间信息技术在文化遗产保护中的应用研究国家文物局重点科研基地（清华大学） 国家中医药管理局中医药科研三级实验室 中药化学实验室 文化部国家文化产业研究中心 国家文化产业研究中心   |  北京市重点实验室 传热与能源利用北京市重点实验室  绿色反应工程与工艺北京市重点实验室  膜材料与工程北京市重点实验室  蛋白质药物北京市重点实验室  精细陶瓷北京市重点实验室  二氧化碳资源利用与减排技术北京市重点实验室  城市综合应急科学北京市重点实验室  微量分析测试方法与仪器研制北京市重点实验室 北京市工程实验室 电子商务交易技术北京市工程实验室 北京市(高等学校)工程研究中心 北京市集中生物燃气利用工程技术研究中心  可视媒体智能处理与内容安全北京高等学校工程研究中心  铁路客运服务系统北京市工程研究中心 北京市哲学社会科学研究基地 清华大学应急管理研究基地 校际合作 清华大学-北京大学生命科学联合中心 具有认可资质的科技服务机构 清华大学建筑环境检测中心  清华大学土水学院建筑材料实验室  清华大学房屋安全鉴定室  清华大学结构工程检测中心  清华大学水利系水文水资源所  清华大学环境影响评价室  清华大学环境质量检测中心  清华大学汽车安全与节能国家重点实验室汽车碰撞实验室  清华大学放射性防护室  清华大学分析中心   |
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1934年6月，清华的院系研究所（原载《清华周刊》1934年向导专刊）
1952年高校院系调整前后，清华大学院系突出性变化