2019冠狀病毒病日本反應與影響
政府

条目：2019冠狀病毒病日本行政應對
2020年1月20日，大分县大分市表示，出于对肺炎疫情的担忧，将延遲与武汉市结为友好城市40周年的交流纪念活动。
1月21日，日本召开阁僚会议商讨新型冠状病毒肺炎对策。厚生勞動省计划在所有机场及港口对旅客进行体温检测，并要求上海和武汉抵日旅客填写个人健康状况卡；国土交通省将要求航空公司和旅行社提供相关地区旅客的健康信息；观光厅将发出对于旅行团成员回日接受检查的呼吁；外务省将对日在海外人员定期发布全球疫情信息。
1月28日，日本政府將新型冠狀病毒肺炎定為“指定感染症”，2月7日生效，生效後患者可被強制入院。1月31日，因應世界衛生組織宣告肺炎疫情是國際關注的公共衛生緊急事件，將生效日期提前至2月1日。
1月28日，厚生勞動省設置電話諮詢熱線。2月1日，要求各都道府縣在2月上旬設置歸國者、接觸者諮詢中心（日语：），接受民眾諮詢及引導患者就診。2月7日，厚生勞動省的熱線改為免費電話（0120－565653，全日9-21時）。
而日本驻华大使馆官网刊载的內閣總理大臣安倍晋三新春贺词，因贺词中提及的邀请中国人在春节假期期间和东京奥运会期间“期待大量中国游客到访日本”，由于疫情持续出现质疑声音，其后外务省致歉称“不合时宜”，于1月30日将其删除。
2月5日，因應在橫濱港停靠的鑽石公主號郵輪，曾接載過1名確診香港人，且船員、乘客3700人中初步檢測有10名確診，日本政府要求所有人在船上隔離14天。翌日，防衛省決定主動以救災名義派遣（日语：）自衛隊（自主派遣），向船上人員提供生活及醫療支援。
2月12日，安倍晉三在總理大臣官邸召開第7回新型冠狀病毒感染症對策本部會議，表示經與民間機構合作，檢測能力將在2月18日前由每日300個提升至1000個。相關對象亦有放寬，各地方自治體可自行判斷，決定檢測有一定症狀者。
2月13日，厚生勞動大臣加藤勝信宣布翌日實施新政令，無症狀感染者亦可如普通患者一樣被強制入院，醫療費由公費負擔。
除此之外，各地政府亦有向中國大陸捐贈口罩等醫療物資，包括名古屋市向因市長河村隆之否認南京大屠殺事件而交流中斷8年的「友好城市」南京市捐贈10萬個口罩。
2月15日，厚生勞動大臣加藤勝信在記者會上承認陸續出現感染路徑不明確的確診個案，認為狀況已發生變化，有分析指此番說話等於事實上承認新型冠狀病毒已開始在日本流行。翌日，政府召開專家會議，國立感染症研究所所長脇田隆字稱仍處於國內發生的早期階段，未至流行，惟疫情可能會繼續擴大。
2月17日，厚生勞動省擴大病毒檢測對象，並對公眾公布求診參考標準，明確37.5度發熱持續4日以上等情況下應考慮諮詢及求診。同日，宮內廳宣布取消天皇誕生日的一般參賀（日语：）活動，上次取消是1996年，因日本駐秘魯大使館人質危機取消。
2月24日，政府專家會議發表意見，指無法完全防止傳染，但可控制傳播速度，往後1-2星期是抗疫關鍵期，決定疫情會否大，需致力減慢速度及減少重症或死亡人數。
2月25日，政府公布對策基本方針，指國內多地出現散發的感染路徑不明個案，一些地方掌握到有小規模集團感染，列出防止感染擴大及感染擴大後的應對措施。政府並宣布在厚生勞動省設置由學者組成的集團感染對策班，並向懷疑發生集團感染的北海道派遣專家協助應對，而確診個案位於全國前列的北海道亦已成立跨部局的對策團隊應對疫情。由於其他地方亦陸續出現多人感染情形，厚生勞動省此後向大阪府、高知縣等地亦派出專家協助應對。
2月26日，因應北海道教育委員會（日语：）向各市町村的教育委員會（日语：）發出中小學校臨時停課請求，北海道所有公立中小學校於27日或28日開始停課。在千葉縣市川市，由於有3宗確診個案曾去同一間體育俱樂部健身，而這一俱樂部的客戶600多人中有不少教師，市川市決定所有60多間中小學校及幼稚園28日起臨時停課2星期。
2月27日，安倍晋三宣布，因防疫需求，将請求全国所有中小学从3月2日起停课，直至春假结束。厚生勞動省指考慮到有家庭夫妻均要工作（日语：），措施對象不含保育所（日语：）。
2月28日，北海道知事鈴木直道發出為期3星期的緊急事態宣言（等同於他國的紧急状态，但強制力相對較低），指疫情日益嚴峻，呼籲道民避免外出。翌日，安倍晉三在記者會上形容請求全國停課是一個「肝腸寸斷」的決定，指政府會幫助疫情中受影響者，並研究疫情應對方法，又稱僅以政府之力是無法取勝，呼籲全民協力共抗疫情。
3月1日，厚生勞動省決定，若一個地方疫情大規模，令重症者難以入院治療，則允許所在都道府縣決定讓輕症者在家療養及優先讓重症者進行病毒檢測。同日，多間傳媒引述政府消息人士指，受兩國疫情影響，中華人民共和國領導人習近平原定4月以「國賓」身份訪問日本的安排預計將延期至秋季。
3月2日，政府專家會議分析指北海道感染擴大，可能是因為當地中國遊客較多，由他們帶入病毒後，再由道內受感染的輕症年輕人將病毒傳播至道內各地；認為若2星期內盡可能減少社交接觸，感染將不會繼續擴大，否則可能會迅速蔓延至整個北海道，呼籲年輕人及道民避開人多或通風差的場所，防止感染擴大。專家會議成員、北海道大学教授西浦博推測截至2月25日，北海道可能已經有940人感染。
3月3日，政府表示全國口罩產量將在月內增至月產6億個，並決定從年度預算的預備費（日语：）中支出22.85億日元，引用1973年第一次石油危機時制定的《國民生活安定緊急措置法》，命令口罩業者賣口罩給政府，採購約320萬個口罩後再發放給北海道約8萬戶家庭，是同法制定以來首次發出此類命令。
3月4日，宣布6日起病毒檢測加入公費保險範圍，醫生可自行判斷患者是否接受病毒檢測，無需取得保健所同意，患者亦無需支付任何檢測費用，惟患者仍需事先電話聯絡歸國者、接觸者相談中心（日语：）以前往指定醫院。
3月5日下午，內閣官房長官菅義偉在記者會上宣布中國最高領導人習近平原定4月以「國賓」身份訪日的安排延期。同日，政府決定除增產口罩外，還將用《國民生活安定緊急措置法》首次禁止網絡轉賣口罩。
3月6日，決定取消2020年皇居春季一般公開及原定3月11日舉行的東日本大震災犧牲者追悼式，內閣總理大臣安倍晉三並就後者向遇難者家屬等相關人士致歉。東京都亦決定取消原定3月10日舉行的東京大空襲犧牲者追悼式，是1991年每年舉行以來首次中止。
3月16日，厚生勞動省向各都道府縣發布通知，要求地方靈活應對不符合厚生勞動省就診標準的新型冠狀病毒肺炎求診個案。
4月1日，安倍晉三宣佈将向所有日本家庭发放可以重复利用的布口罩，每戶發放2个。
4月7日，安倍晉三針對东京、大阪、埼玉、千叶、神奈川、兵库、福冈等7個都府縣，援引新修正的《新型流行性感冒等對策特別措置法》發布為期一個月的緊急事態宣言，時間橫跨黃金週，為該法修正後首次引用。同日，内阁府通过了108兆日圓的紧急经济对策，规模相当于日本国内生产总值的20%。这一规模超过了2008年金融危机期间日本政府的经济刺激计划。
4月10日，愛知縣知事大村秀章自行宣佈愛知縣進入緊急事態宣言狀態。
4月16日，內閣總理大臣安倍晋三宣布将紧急事态宣言对象從7都府縣扩大至日本全国，其中疫情較嚴重的13都道府縣劃為「特定警戒都道府縣」，時效仍然維持至5月6日為止。同時將發給每位公民10萬日圓現金。
5月4日，安倍晋三决定将全国緊急事態宣言狀態延长至5月31日。
5月14日起，日本政府解除39個縣的緊急事態宣言，至此緊急事態宣言發布範圍縮減至東京、大阪等8個都道府縣。
5月21日起，日本政府解除大阪府、京都府、兵庫縣的緊急事態宣言，至此緊急事態宣言發布範圍縮減至北海道與南關東一都三縣。
5月25日，安倍晋三於當晚宣布，解除北海道與南關東一都三縣的緊急事態宣言。这标志着日本47个都道府县全部实现解禁。28日，東京塔恢復營業。
6月1日，东京都进入疫情恢复第二阶段，剧场、电影院等娱乐设施与百货店等多种商业设施恢复营业。
7月31日，冲绳县知事玉城丹尼宣佈该县進入緊急事態宣言狀態，期限为8月1至15日，並把警惕级别提高到该县规定的4个级别中第二高的“感染流行期”。
2021年11月30日0时起，由於擔心新冠病毒变异株奥密克戎蔓延，日本禁止外国人入境日本。
东京都等18个都道府县实施的“蔓延防止等重点措施”于2022年3月21日到期后解除。