日本國鐵EF65型電力機車
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| EF65型电力机车配属表（1968年4月）> 配属区所 | EF65型电力机车配属表（1968年4月）> 车型 | EF65型电力机车配属表（1968年4月）> 机车编号 | EF65型电力机车配属表（1968年4月）> 数量 | EF65型电力机车配属表（1968年4月）> 共计 |
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| 东京机关区（日语：） | 一般型 | 60 - 64 | 5 | 22 |
| 东京机关区（日语：） | P型 | 501 - 512、527 - 531 | 17 | 22 |
| 新鹤见机关区（日语：） | 一般型 | 36 - 45、53 - 59 | 17 | 17 |
| 稻泽第二机关区（日语：） | 一般型 | 17 - 35、46、47、51、 52、65 - 70、77 - 84 | 37 | 37 |
| 吹田第二机关区（日语：） | 一般型 | 1 - 16、48 - 50、71 - 76 | 25 | 42 |
| 吹田第二机关区（日语：） | F型 | 513 - 526、532 - 534 | 17 | 42 |

| EF65型电力机车配属表（1979年）> 配属区所 | EF65型电力机车配属表（1979年）> 车型 | EF65型电力机车配属表（1979年）> 机车编号 | EF65型电力机车配属表（1979年）> 数量 | EF65型电力机车配属表（1979年）> 共计 |
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| 宇都宫运转所（日语：） | PF型 | 1001 - 1051 | 51 | 51 |
| 东京机关区 | F型 | 527 - 531 | 5 | 26 |
| 东京机关区 | PF型 | 1096 - 1116 | 21 | 26 |
| 新鹤见机关区 | P型 | 505 - 512 | 8 | 52 |
| 新鹤见机关区 | F型 | 535 - 542 | 8 | 52 |
| 新鹤见机关区 | PF型 | 1056 - 1091 | 36 | 52 |
| 沼津机关区（日语：） | P型 | 501 - 504 | 4 | 4 |
| 米原机关区 | 一般型 | 4 | 1 | 13 |
| 米原机关区 | F型 | 518 - 526、532-534 | 12 | 13 |
| 稻泽第二机关区 | 一般型 | 17 - 37、46、47、51、52、 65 - 70、103 - 120、129、130 | 51 | 51 |
| 吹田第二机关区 | 一般型 | 1 - 3、5、6、8 - 16、 38 - 45、48 - 50、53 - 64、 71 - 76、85 - 86、128 | 46 | 51 |
| 吹田第二机关区 | F型 | 513 - 517 | 5 | 51 |
| 冈山机关区（日语：） | 一般型 | 87 - 102、121 - 127、131 - 135 | 28 | 28 |
| 广岛机关区（日语：） | PF型 | 1052 - 1055 | 4 | 4 |
| 下关运转所（日语：） | PF型 | 1092 - 1095 | 4 | 4 |

| EF65型电力机车配属表（1984年4月）> 配属区所 | EF65型电力机车配属表（1984年4月）> 车型 | EF65型电力机车配属表（1984年4月）> 机车编号 | EF65型电力机车配属表（1984年4月）> 数量 | EF65型电力机车配属表（1984年4月）> 共计 |
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| 东京机关区 | 一般型 | 17 | 1 | 28 |
| 东京机关区 | P型 | 501、502 | 2 | 28 |
| 东京机关区 | PF型 | 1089 - 1091、1096 - 1116、1118 | 25 | 28 |
| 田端运转所 | PF型 | 1003、1006 - 1051 | 47 | 47 |
| 新鹤见机关区 | P型 | 505 - 512、539 - 542 | 12 | 57 |
| 新鹤见机关区 | F型 | 527、528、536 - 538 | 5 | 57 |
| 新鹤见机关区 | PF型 | 1004、1005、1052 - 1088、1117 | 40 | 57 |
| 沼津机关区 | 一般型 | 2 - 4、6、85 - 87、128 | 8 | 17 |
| 沼津机关区 | P型 | 503、504 | 2 | 17 |
| 沼津机关区 | F型 | 513 - 519 | 7 | 17 |
| 稻泽第二机关区 | 一般型 | 5、18 - 37、46、47、51、52、 65 - 70、103 - 120、129、130 | 55 | 65 |
| 稻泽第二机关区 | F型 | 520 - 526、532 - 534 | 10 | 65 |
| 吹田第二机关区 | 一般型 | 1、8 - 16、38 - 45、48 - 50、 53 - 64、71 - 76 | 37 | 37 |
| 宮原机关区 | PF型 | 1001、1128 - 1139 | 13 | 13 |
| 岡山机关区 | 一般型 | 88 - 102、121 - 127、131 - 135 | 27 | 27 |
| 下关运转所 | PF型 | 1002、1092 - 1095、1119 - 1127 | 14 | 14 |
1965年，因应货物列车增发的需要，EF65型基本番台电力机车开始投入中央本线、山阳本线、东海道本线运用。同年10月1月国铁运行图调整，EF65型500番台客运机车（P型）作为EF60型500番台的后继车型，开始在东海道、山阳本线担当五对“九州蓝色列车”（东京至下关间）和一对“晓号”卧铺特急列车（新大阪至下关间）的牵引任务。在正式担任“蓝色列车”本务机车之前，EF65型500番台机车曾经在同年8月25、26日率先在“富士号”列车投入试运转。
当时，首批12台P型机车（501～512）均配属东京机关区，所有机车皆投入日常运用而没有后备机车，因此同时期制造的首批500番台货运机车（F型，513～517）初期首先配属东京机关区并与P型机车共同运用，而另外五台基本番台机车（60～64）亦配属到东京机关区，以缓解机车运用紧张的状况。1966年3月25日国铁运行图调整后，第二批P型机车（527～531）配属东京机关区，而F型机车则转配属吹田第二机关区。1968年10月，为了应付卧铺特急列车增发的牵引需要，8台基本番台机车被改造成P型机车（535～542）并配属到东京机关区。
1966年10月国铁运行图调整，开行了两对由10000系货车组成的特急鲜鱼货物列车（日语：），由吹田第二机关区所属的F型机车担当牵引任务，当牵引定数为600吨以下时采用单机牵引，当牵引定数为600～1000吨时采用双机牵引。至1968年10月，随着专门牵引高速货物列车的EF66型电力机车登场，部分F型机车转配属新鹤见机关区，并投入东北本线和上越线运用，主要牵引东北至北海道方向的特急货物列车。因应寒冷地区的使用需要，部分车辆加装了冰柱切割板、汽笛外罩、除雪式排障器等简易耐雪耐寒设备。
1969年，由于东北本线黑矶以北区段完成交流电气化，上野至黑矶之间直流电气化区段需要一种客货运通用的直流电力机车。因此，EF65型1000番台机车（PF型）首先配属新鹤见机关区，后来又集中配属到宇都宫运转所，置换出东北本线和上越线的F型机车。1970年7月1日，上野至青森的“曙号”卧铺特急列车改为定期开行，并使用宇都宫运转所的PF型机车担当上野至黑矶之间的牵引任务，这是EF65型1000番台电力机车首次牵引蓝色列车。同时，由于P型机车的数量不足以应付需要，新大阪至宫崎的“彗星号”列车亦改由下关运转所所属的PF型机车担当牵引任务。从1970年起，随着机车运用紧张的情况得到改善，以东海道、山阳本线为运用中心的EF65型电力机车，亦开始投入到山手货物线、宇野线、赤穗線、冈多线运用，主要用于牵引高速货物列车B以下等级的货物列车。
1972年3月15日国铁运行图调整，为了提高山阳本线的区间通过能力，日本国铁采取缩小客货列车速度差的办法，对山阳本线在深夜时间的最高速度限制降为95公里/小时，因此“晓号”、“彗星号”和“日本海号”三对卧铺特急列车得以再次恢复使用EF58型电力机车牵引。EF58型电力机车逐步进行加装对应20系客车的总风管的改造过程中，还使用了下关运转所配属的F型机车作为补充。1972年10月2日以后，这三对卧铺特急列车的牵引任务均改由EF58型电力机车担当。此后，由于东京机关区产生了富余的P型机车，加上下关运转所开始对EF65型电力机车集中进行转向架检查，同年9月至10月期间原配属东京机关区的501～504号机车转配属下关运转所。
1978年7月28日起，东京机关区开始配属新造的EF65型1000番台机车（PF型），置换出原本配属的500番台机车（P型）。同年10月2日国铁运行图调整，东京机关区的PF型机车开始担当8对在东京车站到发的卧铺特急列车的牵引任务。1984年2月1日国铁调图后，东北方向的旅客列车牵引任务由宇都宫运转所移交田端运转所。至此，东京机关区（共计8对）、宫原机关区（共计5对）、下关运转所（共计3对）、田端运转所（共计3对）担当的大多数卧铺特急列车，皆使用EF65型1000番台电力机车作为本务机车。随着1000番台机车大量投入运用，500番台机车则转为牵引东海道、山阳本线的普通货物列车。