Nechronpa
故事簡介

第0章　永夜后日谈
七海邀約狛枝、日向一起遊玩《永遠的後日談》，但是由於只有3人的緣故，在七海考慮自己來負責當NC的時候，七海的遊戲機說話了，裏頭的人物（疑似苗木誠）表示要自己擔當NC好讓七海三人能夠一起遊玩，接著在狛枝的提議之下，三人在餐廳進行了《永遠的後日談》的遊戲......
第一章　Cotton Picker
在黑暗之中主角醒來，考慮自己是被一個能夠破壞的東西給困住，卻一個不小心破壞了自己的腳部，才把困住自己的東西打破。眼前出現了一位白色的少年。
少年稱自己為「凪（なぎ）」，堅信著眼前的蛋裡頭有著對自己來說很重要的人並小心翼翼的替蛋取暖，保護著蛋，殊不知主角便從蛋裡面出現了。
主角一時不能意會凪所說的蛋為何，轉身一看，那是剛才困住自己的東西，明顯能夠包住自己的巨蛋，以及從裏頭流出來紅色的液體，一時情緒失控的他打傷了凪，明則出來守護了凪。
原來凪與明為姊弟，並且兩人都是非人類的玩偶。同時凪也聲明主角也是玩偶，卻與人類一樣有著痛覺感到好奇，但是主角並不相信自己是玩偶，堅信著自己確確實實是人類的事情。
明給主角取名為「HINA（ヒナ）」，因為是從蛋裡面出現，亦有雛鳥的意思。
在周圍都遭到破壞的場所，HINA的蛋也是有遭受疑似人類的破壞的情形，三人決定調查此場所。凪在抽屜裡發現了一堆紙，裡面有著誰寫給誰的信封，以及被鮮血擋住了一半，但是有一位少女笑得很開心的照片，HINA看到照片表示與自己口袋裡的寶物照片裡的女性長的一模一樣，但是思考著既然有人放在這裡的話，估計是那個人重要的東西則沒帶走。
三人決定離開這個地方的時候，在路上遇見了一名少女，「秋澤琴律」。
琴律一眼見到HINA便堅信對方就是自己等待已久的レイイチ，開心的衝上去想要抱住HINA，HINA閃開表示自己不知道琴律說的レイイチ是誰，自己也不是レイイチ。
琴律懷疑是レイイチ不要自己，拋棄自己而開始暴走，HINA等人的第一次戰鬥就此開始。
琴律消滅後，從她身上掉下來一副過大的眼鏡，HINA想撿起確認的時候因為腳滑（骰到大失敗）而遭自己的日本刀破壞腸子。換凪試著撿起眼鏡的時候，同樣腳滑（骰到失敗）跌入一旁的池子中。
在池子當中，凪想起了部分的記憶，在大海邊的時候自己的確是跟誰做了交易，失去了什麼得到了什麼。在一個建築物裏頭，似乎誰暴走，自己遭到波及，即將面臨死亡的凪，似乎感受到什麼，一直以來因為痛苦而說不出話的他說著.........「不要哭啊，hajime（はじめ）」，醒過來，是HINA的眼淚，因為自己掉入池子裡，救出來也像是死了一樣動彈不得的緣故讓HINA心急。
在巨大的搖籃裡，三人想要窺探裡面究竟有著什麼，凪卻因為HINA一個手滑，撞進搖籃裡頭。HINA跟明費力將凪從搖籃拔出來後看見凪拿著一位女性的左手，而明又發現凪似乎還抓著一隻手，凪沒有想太多便把那隻手從搖籃裡拔出來，那隻手...不，那個人長得跟HINA一模一樣，讓三人嚇了一大跳，他隨即睜眼，不能開口說話的他，明讀懂了嘴型，知道他認識凪。
那個人表示自己什麼都記不得，但是記得凪記得在遠方的海岸邊凪曾經叫過他的名字「創（はじめ）」。並表示凪視為寶物的「女人的左手」很危險，想要破壞掉，可是凪死守著，兩人對此之間關係似乎不太好。
發覺場地隨即就要塌泄，四人急急忙忙衝到出口，卻發現外頭的世界早就一片死寂，沒有任何生物活動的跡象，沒有任何水源。
就在這個時候，創指向了遙遠的某處，在那裏，似乎是一切的開始，那燦藍的海岸........
玩偶們決定以那裏為目標，再度踏上旅程。
第二章   银钥匙
HINA等人走了一段路之後，來到了一座森林，在明得確認之下證實這是真實存在並且活生生的森林，突然之間，HINA與明疑似聽見了熟人的叫聲，兩人向著不同方向衝了出去，留下凪與創。
在凪的指示下，自己去追明，創則去追HINA。就在HINA只隨著聲音的方向奔跑時，創推開了HINA才使HINA沒有被突然出現的岡格尼爾之槍貫穿，聽了創的意見才發現剛才的叫聲可能只是騙人進入這個陷阱的，但是聲音的樣本又是怎麼得到的呢?HINA隨即向創詢問明與凪的所在地。
明同樣被凪所救，但是凪的腹部卻遭岡格尼爾之槍貫穿，在以為暫時沒事的時候，插在凪身上的岡格尼爾之槍突然膨脹，在明的面前將凪的身體給炸裂開來，明陷入了恐慌，並告訴隨即趕來的HINA與創凪的事情，但是隨後又發現地面上的血塊並不構成凪的身體，以及一道血痕延續到森林深處，三人決定去尋找凪.......
凪醒來，發現了自己身前的姊姊╴古枝稚空就在面前，同時也漸漸地想起了自己的記憶。自稱龍崎的少年將鳥籠與鳥籠裡的銀鑰匙交給凪之後引發了稚空的不滿，而龍崎又將「不要吃下這裡的食物，若你想回去的話」以口語的方式告訴凪，隨後便離開了。
留下了姊弟兩人留在一個小房間。
明與HINA來到了一座建築物前，同樣的明也漸漸想起了部分的記憶，告訴HINA等人自己是在這個地方被人所救的。
突然間，龍崎出現，將HINA視為神木黎一當作敵人，將擁有稚空身前的身體的明視為神木黎一(HINA)的手下，並且似乎認識創。
龍崎懷疑凪會不認識稚空都是因為HINA等人所為，打算就此戰鬥。
同時間，就在凪拒絕稚空的食物時，稚空的身體突然出現，並且抓住了凪。
稚空不能理解為什麼自己原本的身體會突然出現，並眼看凪就要被帶走而哭喊著。
創抱著被蜘蛛絲纏住的球體從二樓的窗戶跳了下來，來到HINA等人身邊，急忙要求用HINA的日本刀砍開卵，裏頭出現的是凪。
稚空來到龍崎身邊，與龍崎為了奪回凪與HINA等人開戰。
戰鬥途中，由於稚空的身體被破壞，從身體當中爬出了一隻巨大的蜘蛛，導致龍崎大受打擊，隨著NC的嘲笑不斷的還疑自己的所作所為......
結束後，凪向明詢問稚空的事情，明向制空坦白凪在發高燒時稚空一直沒回來，但是因為敵人的關係自己模仿了稚空的聲音帶凪逃走。凪諒解了明的所作所為，認為當下的自己突然發現稚空不見的話，一定會抱著自己沒用的身體衝出去，一定會被神木黎一抓到。而凪知道了明不是自己的親姊姊，表示自己從今往後不在以姊弟互相稱呼，而是完全的作為朋友看著對方。
龍崎將銀鑰匙交給凪，要凪去拿回稚空珍惜的寶相，等待期間向HINA等人訴說回憶的時候森林突然發生變化，在凪抱著寶相回來的時候龍崎遭受長槍貫穿身體，並要所有人趕快逃離這個森林。在最後認同了凪是重要的家人，留下自己一個人在森林奮戰。
HINA等人跑出森林之後只能默默地聽著森林的聲音蓋過了槍響，而隨著凪用銀鑰匙開啟了寶相，裡面的照片，是已經失去的過去......
第三章　谁也不知道
HINA雖然認識了許多的人，卻依然還不清楚自己究竟是否是神木黎一，而凪卻相信自己的直覺，堅信HINA就是自己在海邊的小屋認識的HAJIME，認定創是個冒牌貨而遭到創的不滿，被創使用能力掉入一個洞裡，明隨即掉進去拉住了凪，但是HINA卻被創給制止，被創認為HINA突然下去的話可能會不小心壓碎兩人提議找其他道路下去。
而掉到疑似是演藝廳的凪與明，卻在那裏看見了大量與HINA長得一模一樣的人......
大量長的與HINA相似的不死族突然一口氣遭受破壞，隨之出現的是自稱「神木黎一」的男人，凪與明從對方的語氣得知對方也只不過是神木黎一的複製品-01，卻被01要求說「既然你們都能夠創造出比神木美香子還是更完美的01，那麼就把你們那標得01交給我，我把這裡的複製品給你們繼續創造出完美的01」（暗指與凪跟明相處的HAJIME或者是HINA是01所追求的完美品）並以修復他們為交換條件，凪當場拒絕則被01告訴「自己在被破壞幾次將會失去自我次元」的事實，凪想起當年要求hajime殺死自己也是因為「害怕自己不再是自己」而開始膽怯，但是經過明的話語，決定否決01的話並與明一起對抗01。
而hina等人找尋凪的時候，打開一扇門正好撞見那曾經在01的記憶裡出現，那被稱作神木美香子的女子。神木美香子堅決hina就是神木黎一，而遭到hina否定，此時神木美香子注意到hina身後的hajime，hajime則確定與神木美香子聯手對付hina。然而hina不敵數量，依舊遭到「完全破壞」，hajime也開口訴說也許自己很羨慕hina的時候，hina犧牲記憶的碎片復活了，並且透過犧牲戰法，hina終於戰勝了神木美香子與hajime。
凪與明找到了只剩下手的hina並且拼裝起來，hina也表示自己想起了什麼，在研究室裡暴走的01，在海岸邊的小屋一同生活的hajime，甚至也有著神木黎一的記憶，hina希望獲得凪與明的復仇。但是兩人決定不憎恨hina，也不打算原諒他，但是只要彼此還是姊妹，就要一起走下去。而之後，被神木美香子的殘骸給抓住的凪被hajime所救，hajime給予凪「保險（棋子）」之後再次用自己的聲音道別之後消失，hina等人再次步上只有3姊妹們的旅程。
第四章　聖艾爾摩之火
在沙漠中間休息的hina等人透過地圖發現他們曾經在海岸邊所住過的那個家遭到atene摧毀並蓋了一間聖教堂在那，反覆的思考hajime曾經所說過的意思，凪突然咳個不停，從嘴裡以及腹部的洞不斷掉出了花瓣，明馬上就察覺到是岩田骸狼所為，但卻又被突然長出來的植物所困，植物放射出來雪白色的東西之後hina等人陷入昏睡，並且帶有明顯敵意的骸狼現身，想要做什麼的時候卻遭到「藍色眼睛」的凪給攻擊，骸狼馬上就察覺到操控凪的人物，而對方卻希望骸狼能夠遵守「遊戲規則」，不遵守的話便是放棄約定。一段威脅之後凪便疑似斷線人偶一樣倒在地面，留下了三具屍體跟一具屍體。骸狼帶走了明的屍體，並將另外兩人丟到垃圾場去，在垃圾場醒來的hina遭屍體所救，發現跟自己長的一模一樣的人倒在身邊，才發現自己變成了凪的樣子，眼前的自己是明，而只剩下不在場的持有明身體的凪。而凪被骸狼認出非明本人之後，告訴凪要明去找他，並讓他掉進洞內。得到自稱「流歌」的人幫助，明找到了骸狼的筆記，裡面並沒有任何寫著關於自己的事情，在依然不知道骸狼的目的之下，眾人來到骸狼的面前，即使如此心裡依然想著要幫助骸狼的hina與明，卻依然不被骸狼認同而開始了戰鬥。
戰鬥結束，骸狼認同了明，並向明所詢問「你覺得你幸福嗎?」。告訴hina等人自己要幫助他們帶到atena的面前，還有自己所知道有關於「特異點」，也就是hajime的事情，相信hina與特異點不同能夠前往正確的道路。此時骸狼突然察覺到櫻之樹(克里斯)與佐川遭火吞噬，上前試著滅火而把hina等人擋住，推往救生艙的逃生口，並把hina給他的迷你靜歌丟還回去，消失在火海之中，hina等人逃脫之後，交換身體的狀態也因為衝擊恢復了，眾人在看著宛如照耀他們前路的火燈塔，帶著見到atena的覺悟，再次踏出旅程。
現實(遊戲外)當中，結束遊戲的三人正在整理著第四章節的內容時，畫面以及聲音突然出現雜訊，變調。難不成就有什麼事情要發生了嗎......?
第五章　你向著名為樂園的ＯＯ展露微笑
開頭，失去了兔美的身影，音樂變調，漸漸的就連NC似乎也像是換了一個人一樣....?
hina等人終於來到目的地，自己曾經生活的家被摧毀，取而代之的是一顆宛如巨大的蛋立在那邊一樣，長方形有如鏡子的門豎立在那哩，hina與凪看見了門上還夾著一個疑似照片的紙，想要抽出來的時候，卻反被拉進門哩，而在門裡所看見的，正是三人曾經生活過的那個地方。雖然知道是假的，但看見就連那曾經生活過的家都保存在hajime破壞前的樣子，簡直就像是在否定他們所做的事情，hina大喊著，此時發現這個機倆多了一個奇怪的金屬大門，輸入了三人的姓名(凪、明、hajime)的名字之後，透過電梯下來到一個巨大的建築物裡，在那裏看見了疑似被糟蹋很慘的atena的屍體，但hina很快地就知道那只是atena的惡作劇，要atena出來，等此時說話的，卻是狛枝.......不，atena，hina生氣的像atena詢問對凪做了什麼，atena並沒有回答，只是說著對這些「預定調和」感到無聊的話語而被hina與明認為atena因為無聊所以喚醒他們想要奪取他們的身體，在一番解釋之下，atena受夠了只是不停說著相同的事情，雙方就此展開戰鬥。