法轮功
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《中华人民共和国公安部关于认定和取缔邪教组织若干问题的通知》（公通字[2000]39号）中关于“现已认定的邪教组织情况”表明，到目前为止共认定和明确的邪教组织有14种。其中，中共中央办公厅、国务院办公厅文件明确的有7种，公安部认定和明确的有7种。这是到目前为止关于邪教认定最新的一个正式文件。公安部在认定邪教组织时，明确是根据《刑法》和一系列处理邪教组织的文件精神，参考了两高司法解释的定义，然后重新定义。其中沒有法輪功。BBC報導，公安部2014年公布的「邪教名單」亦不包括法輪功。
根据《中华人民共和国刑法》第300条规定：组织和利用会道门、邪教组织或者利用迷信破坏国家法律、行政法规实施的，处三年以上七年以下有期徒刑；情节特别严重的，处七年以上有期徒刑。而关于中华人民共和国政府对邪教的定义，《中国最高人民法院最高人民检察院关于办理组织和利用邪教组织犯罪案件具体应用法律若干问题的解释》一文中指出：刑法第三百条中的“邪教组织”，是指冒用宗教、气功或者其他名义建立，神化首要分子，利用制造、散布迷信邪说等手段蛊惑、蒙骗他人，发展、控制成员，危害社会的非法组织。
2014年6月中共官媒公布「邪教組織的六個特徵」，不少網民揶揄這說的是中國共產黨，都能在共產中國找到現實證據，「這段話在網上被大量轉發，許多人都有意地將它指向共產黨自身，含蓄地發表評論道：感謝政府感謝黨，我終於知道哪個才是最大的邪教了。」
北京維權律师莫少平表示：「无论从刑法的三百条还是全国人大的决定，以及两高的解释里面都没有明确说法轮功是邪教，只有两高颁布司法解释的通知里面才确认说法轮功是邪教，两高的这个通知本身是不符合中国立法的规定。」另一位国内律师针对两高司法解释的通知，表示：这文件是内部通知，不是公开的法律文件，法律文件必须公之于众才生效，否则就是不教而诛；两高在公开的文件中不认定法轮功是邪教，在内部通知中又说成邪教，是很不严肃的，而且最高法院只能就司法审判如何适用法律进行解释，不能超越这个职权去认定什么社会组织是邪教组织或者非法组织，这是行政权力而非司法权力的范围；这文件是对刑法300条的越权解释。
《纽约时报》报道称中国政府将法轮功学员未经律师辩护甚至未经任何审判就投入狱中，即使辩护权是中国刑法授予的。此外，香港人权监察2000年称至1999年7月以来，中国政府至少将5000名法轮功学员未经审判而直接监押。
鎮壓发生后，李洪志開始減少公開場合的活動。中國共產黨當局於中國境內的打壓政策反而造成自1989天安門抗議以來歷時最久，最著名的人權抗議活動，而法輪功也成為中華人民共和國人權的主要議題之一。
中共黨媒與官方媒體稱法輪功是「邪教」；然而邪教這概念本身的有效性有爭議，學界多半不認可邪教這概念的有效性，邪教一詞常被認為是一種人身攻擊用的標籤；[來源請求]此外，國際上對法輪功是否合乎邪教的定義，多有懷疑，甚至中國政府內部對法輪功的意見也有分歧。據路透社報導，聯合國人權專員為法輪功辯護，在2010年在聯合國大會上報告指出，法輪功等社會弱勢信仰團體經常遭誣衊為「邪教」，因此常受社會歧視、甚至升級為針對「顛覆陰謀」的打擊。但一名與會的北京政府代表對此提出抗議，稱「中國所有宗教都在和諧並存」，並強調法輪功是邪教而非宗教，因此政府「根絕」法輪功是合理的。聯合國大會連續五年通過了「譴責誹謗宗教行為」的無約束力決議，一些西方國家認為，這類行為對言論自由構成威脅。比勒費爾特在其發言中沒有直接提及誹謗宗教一詞，但他說，宗教自由並不代表任何教派都不應被批評。1999年7月22日，中华人民共和国公安部发布通告称，“中華人民共和國民政部已于1999年7月22日認定法輪大法研究會及其操縱的法輪功組織為非法組織，決定予以取締。”1999年10月28日，《人民日报》发表特约评论员文章《“法轮功”就是邪教》，此后大陆媒体开始称法轮功为邪教。2014年6月3日，央视网称中国已明确认定14个邪教组织，均为中央办公厅、国务院办公厅或公安部下发文件明确和认定，但名单中没有法轮功。[來源請求]
中国政府媒体指稱，法輪功「威脅大眾生活」、「洗腦」，後來又稱是「反華團體」，破壞了中國大陸的社會安定。何祚庥在《我不赞成青少年炼气功》一文（此文據信得到北京政府的羅干背書）中認爲，法輪功是僞科學，對青少年身心健康無益。何祚庥也在官媒中，稱他在發表反對法輪功言論後受到了法輪功學員的騷擾。
何祚庥是马列主义理论家，现任中央610办公室学术顾问。有西方研究者认为，时任国务委员、中共政法委書記罗干为可能为谋职位晋升于1996年开始调查法轮功准备鎮壓，但找不到证据发动鎮壓，何祚庥是罗干的亲属，两人策划1999年鎮壓之前一系列事件，如天津教育学院事件，以激起并指引法轮功学员到北京中央政府上访，引发425上访事件。罗干进而指挥北京警察带领法轮功学员包围中南海，从而为江泽民发动鎮壓准备证据。4.25事件之后，1999年6月罗干被任命为权力巨大的中央610办公室负责人，何作庥则担任中央610办公室学术顾问。兩人被質疑，如果说这两人有计划的话，可以说计谋完全成功。中國政府鎮壓法輪功的特點是“全世界”性宣傳運動。 事實上，捏造新聞（不幸的是被西方媒體一字不差傳播）和操縱輿論是中國當局除酷刑以外對法輪功採取行動的兩個關鍵部分，這使迫害得以開始、持續甚至升級。[可能侵权]一個例子是有西方媒體傳播中共黨媒稱：2003年5、6月，"法輪功追随者陳福兆"故意殺人,曾親自或雇傭他人先後5次購得滅鼠藥200餘包，將滅鼠藥摻入飲料或開水中，先後毒死16人。以這起所謂「浙江毒乞案」栽贓法輪功，據自由亞洲電台報導，香港法輪功發言人表示，法輪功的法理要求學員慈悲眾生，反對殺生，更不會自殺。又稱如果真是有這宗案件，「一定不會是法輪功學員所為」。中國當局多年來持續迫害法輪功學員，誣衊法輪功，這宗案件便是其中一個例子。
意大利宗教社會學權威學者、新宗教研究中心創辦人及主任馬西莫·因特羅維涅教授表示，中共政府邀請「西方反邪教人士」甚至名聲不好的「西方反邪教人士」，中国共产党要他們說什麼，他們就會說什麼，但他們說的不令人信服、也不權威。例如被中国共产党找來的瑞克·阿蘭·羅斯曾有用暴力對待瑞克所認定「邪教」的犯罪紀錄。馬西莫還表示，中国共产党定性所謂「邪教」的主要標準，是該組織是否「被中国共产党認為是反中国共产党的團體」，這與西方觀點完全不同。中国共产党作法嚴重危害宗教自由；中国共产党統治下的中國，沒有宗教自由。
國際教派研究協會ICSA於2004年發佈聲明說，ICSA對此議題未持特定立场，「许多有声誉的国际人权组织发布报告称，在中国，法轮功和其他宗教信徒的人权遭系统性侵犯，ICSA敦促中国政府、学者和专家对此做出建设性回应。这些报告中描述到的肉体暴行等人权侵害不应被容忍。包括中国媒体在内的一些报道宣称『ICSA认定法轮功是邪教』，这和『ICSA表明法轮功不是邪教』的报道一样，都是不正确的。」。
以色列猶太教拉比最高評議會及最高法院，曾經過一年半調查後在2008年做出裁判，認為中国共产党要對謀殺法輪功學員及摘取器官承擔責任，且若中国共产党不停止鎮壓，參與北京奧運將等同支持鎮壓。知名拉比什洛莫·阿维纳強調，法輪功「先他後我」且並未脫離社會，「除了從中国共产党那裏之外，我們沒有聽說任何關於法輪功不利言論。」
香港中文大學教授彭麗君提出，中国共产党要求被官方承認的五宗教成為「和諧宗教」，要「符合中国共产党的要求」；（中國大陸）「佛教認爲法輪功扭曲了佛教」，「不只因為他們沒有選擇，更因為這直接牽涉不同宗教個別的利益。」。香港《基督教週報》2001年刊登一篇牧師評論稱個人認為法輪功不屬於邪教，但在佛教角度看來、可能是一種「異端」。另一方面，香港社會民主論壇、基督教及天主教團體、香港天主教大專聯會、香港支聯會、中文大學學生會等三十個團體的一封曾聯署表示：「特區政府還未發現法輪功學員有任何違法行為，也未列出證據證明法輪功是邪教」，並要求停止針對及壓迫法輪功的言論及行為。
曾任特罗姆瑟大学副教授、後任職中國武漢大學教授的宗教学者詹姆斯·刘易斯聲稱法轮功完全基于其创始人李洪志的教义而建立，在著作认为法轮功和气功与科学相抵触，并就相关内容批评了法轮功，。刘易斯该著作中的子作者、南昆士蘭大學的副教授海伦·法利質疑法轮功起源自伪科学。不過法利的專業能力遭質疑，加拿大副教授特里·拉塞爾評論法利發表的文章，「法利博士至少可以被指控為對學術嚴謹性的褻瀆，她文中對法輪功的許多說法都缺少應有的證據。」澳洲雪梨大學教授瑪麗亞·辛格指出，法利寫作方式「把一些似是而非的事當成事實。」吳建國指出法利文章論證不符學術規範，在闡述一項「事實」時的三作法，並不提供證據支持，或不指出其信息來源； 而且使用中共當局的單方面言論作為唯一證據； 甚至直接捏造證據。吳建國指，法利的專業在教育技術，很少涉及宗教，法利發表這些文章，筆風像中國共產黨中央宣傳部，全都由劉易斯擔任編輯。吳建國寫信給法利討論文章的問題，吳稱被劉易斯要求停止質疑。
左派媒體NBC稱，在他的追随者看来，李是“一个神一样的人物，可以悬浮、穿墙行走并看到未来”。他的极端保守和有争议的教义包括拒绝现代科学、艺术和医学，以及谴责同性恋、女权主义和普遍世俗主义。
李洪志曾经声称，外星实体正在积极干预人类事务 ，外星人开发并引入了今天人类使用的技术 ，包括机械飞行和电子计算机。他谴责现代技术是外星人破坏道德阴谋的一部分。
维基百科创始人之一吉米·威爾斯在一次接受網路媒體Vice時談到，中國大陸缺乏網絡自由，如天安門事件、法輪功、異教團體，都無法在中國的互聯網上公開討論。