日本航空航點
國際航線

註：
下列的航班編號只會顯示日本航空的自營航班
| 区域 | 国家 | 航点 | 机场 | IATA | ICAO | 航班編號／备注／聯號經營 | 每周班次 (星期) |
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| 北美 |  美国 | 三藩市 | 三藩市國際機場 | SFO | KSFO | 東京成田：JL058/JL057 東京羽田：JL002/JL001所有航班：美國航空 JL002/JL001：馬來西亞航空 | 現時：14 |
| 北美 |  美国 | 纽约 | 甘迺迪國際機場 | JFK | KJFK | 東京羽田：JL004/JL003、JL006/JL005JL003：智利國家航空、美國航空 JL006/JL005：智利國家航空、美國航空、馬來西亞航空、英國航空 | 現時：14 |
| 北美 |  美国 | 波士頓 | 爱德华·劳伦斯·洛根将军国际机场 | BOS | KBOS | 東京成田：JL008/JL007所有航班：美國航空、馬來西亞航空 JL007：智利國家航空 | 現時：7 |
| 北美 |  美国 | 芝加哥 | 奥黑尔国际机场 | ORD | KORD | 東京羽田：JL010/JL009美國航空 | 現時：7 |
| 北美 |  美国 | 达拉斯/沃思堡 | 达拉斯/沃思堡国际机场 | DFW | KDFW | 東京羽田：JL012/JL011美國航空 | 現時：7 |
| 北美 |  美国 | 洛杉矶 | 洛杉磯國際機場 | LAX | KLAX | 東京成田：JL062/JL061 東京羽田：JL016/JL015 大阪關西：JL060/JL069所有航班：美國航空、智利國家航空 JL060/JL069、JL062/JL061：馬來西亞航空 | 現時：17 |
| 北美 |  美国 | 聖地牙哥 | 聖地牙哥國際機場 | SAN | KSAN | 東京成田：JL066/JL065美國航空、馬來西亞航空 | 現時：4 |
| 北美 |  美国 | 西雅圖 | 西雅圖-塔科馬國際機場 | SEA | KSEA | 東京成田：JL068/JL067 7月至9月增至4班美國航空 | 現時：7 |
| 大洋洲 |  美国 | 檀香山 | 丹尼爾·井上國際機場 | HNL | PHNL | 東京成田：JL786/JL785、JL784/JL783 東京羽田：JL072/JL071、JL074/JL073 大阪關西：JL792/JL791 名古屋：JL794/JL793 JL786/JL785暫停服務至2021年9月30日所有航班：夏威夷航空 JL784、JL786/JL785：馬來西亞航空、國泰航空 JL783：馬來西亞航空 JL792/JL791、JL794：國泰航空 | 現時：26 |
| 大洋洲 |  美国 | 凱魯瓦－科納（英语：） | 科納國際機場 | KOA | PHKO | 東京成田：JL770/JL779 暫停服務，復航日期未定JL770：夏威夷航空、馬來西亞航空 |  |
| 北美 |  加拿大 | 温哥华 | 温哥华国际机场 | YVR | CYVR | 東京成田：JL018/JL017美國航空、馬來西亞航空 | 現時：7 |
| 欧洲 |  英国 | 伦敦 | 希斯路機場 | LHR | EGLL | 東京羽田：JL041/JL042、JL043/JL044所有航班：英國航空 | 現時：14 |
| 欧洲 |  法國 | 巴黎 | 戴高乐机场 | CDG | LFPG | 東京羽田：JL045/JL046 | 現時：7 |
| 欧洲 |  德国 | 法兰克福 | 法兰克福机场 | FRA | EDDF | 東京成田：JL407/JL408英國航空、芬蘭航空 | 現時：7 |
| 欧洲 |  芬兰 | 赫尔辛基 | 赫尔辛基-万塔机场 | HEL | EFHK | 東京羽田：JL047/JL048英國航空、芬蘭航空 | 現時：5 |
| 欧洲 |  俄羅斯 | 莫斯科 | 谢列梅捷沃国际机场 | SVO | UUEE | 東京羽田：JL049/JL040 暫停服務至無期限 |  |
| 北亚 |  俄羅斯 | 海參崴 | 海參崴國際機場 | VVO | UHWW | 東京成田：JL423/JL424 暫停服務至無期限 |  |
| 南亚 |  印度 | 德里 | 英迪拉·甘地國際機場 | DEL | VIDP | 東京羽田：JL039/JL030 | 現時：7 |
| 南亚 |  印度 | 班加羅爾 | 班加罗尔国际机场 | BLR | VOBL | 東京成田：JL753/JL754 | 現時：3 |
| 东南亚 |  新加坡 | 新加坡 | 樟宜機場 | SIN | WSSS | 東京成田：JL711/JL712 東京羽田：JL035/JL038、JL037/JL036所有航班：美國航空、澳洲航空、斯里蘭卡航空、夏威夷航空 | 現時：21 |
| 东南亚 |  泰國 | 曼谷 | 蘇凡納布國際機場 | BKK | VTBS | 東京成田：JL707/JL708、JL718 東京羽田：JL031/JL034、JL033/JL032 大阪關西：JL727/JL728所有航班：曼谷航空、斯里蘭卡航空 JL707/JL708：S7航空、美國航空 所有羽田航班：美國航空 | 現時：28 |
| 东南亚 |  马来西亚 | 吉隆坡 | 吉隆坡国际机场 | KUL | WMKK | 東京成田：JL723/JL724馬來西亞航空、美國航空、斯里蘭卡航空、夏威夷航空 | 現時：7 |
| 东南亚 |  越南 | 胡志明市 | 新山一國際機場 | SGN | VVTS | 東京成田：JL759/JL750 東京羽田：JL079/JL070所有航班：美國航空、夏威夷航空 | 現時：14 |
| 东南亚 |  越南 | 河內 | 內排国际机场 | HAN | VVNB | 東京成田：JL751/JL752美國航空、夏威夷航空 | 現時：7 |
| 东南亚 |  印度尼西亞 | 雅加达 | 苏加诺－哈达国际机场 | CGK | WIII | 東京成田：JL725/JL726、JL729/JL720所有航班：夏威夷航空 JL725：加魯達印尼航空 JL726：美國航空、加魯達印尼航空 JL729/JL720：美國航空 | 現時：14 |
| 东南亚 |  菲律賓 | 马尼拉 | 尼诺伊·阿基诺国际机场 | MNL | RPLL | 東京成田：JL741/JL742、JL745/JL746 東京羽田：JL077/JL078 | 現時：21 |
| 大洋洲 |   | 悉尼 | 悉尼機場 | SYD | YSSY | 東京羽田：JL051/JL052 | 現時：7 |
| 大洋洲 |   | 墨尔本 | 墨爾本機場 | MEL | YMML | 東京成田：JL773/JL774 | 現時：4 |
| 大洋洲 |  關島 | 關島 | 安東尼奧·汪帕特國際機場 | GUM | PGUM | 東京成田：JL941/JL942、JL943/JL944 JL943/JL944為季節性航班 所有航班暫停服務，復航日期未定馬來西亞航空、夏威夷航空 |  |
| 东亚 |  中華民國 | 台北(桃園) | 台灣桃園國際機場 | TPE | RCTP | 東京成田：JL805/JL804、JL809/JL802 大阪關西：JL815/JL814 名古屋：JL821/JL822 除JL809/JL802，其餘航班暫停服務至2021年9月30日所有航班：夏威夷航空 JL805：中華航空、馬來西亞航空 JL804：中華航空、馬來西亞航空、美國航空 JL809/JL802：中華航空、美國航空 JL815/JL814：中華航空 | 現時：7 |
| 东亚 |  中華民國 | 台北(松山) | 台北松山機場 | TSA | RCSS | 東京羽田：JL097/JL098、JL099/JL096所有航班：中華航空 | 現時：14 |
| 东亚 |   | 首尔(金浦) | 金浦国际机场 | GMP | RKSS | 東京羽田：JL091/JL092、JL093/JL094、JL095/JL090所有航班：大韓航空 | 現時：21 |
| 东亚 |   | 釜山 | 金海国际机场 | PUS | RKPK | 東京成田：JL957/JL958、JL969/JL960 所有航班暫停服務至無期限所有航班：大韓航空、夏威夷航空 JL957、JL960：芬蘭航空 JL958：美國航空 JL969：芬蘭航空、美國航空 |  |
| 东亚 |  中国 | 北京 | 首都国际机场 | PEK | ZBAA | 東京羽田：JL021/JL022（每日）、JL025/JL020（每日）所有航班：中國東方航空、中國南方航空 | 現時：14 |
| 东亚 |  中国 | 天津 | 滨海国际机场 | TSN | ZBTJ | 名古屋：JL841/JL840（周四、周日）中國東方航空、上海航空 | 現時：2 |
| 东亚 |  中国 | 上海(浦东) | 浦东国际机场 | PVG | ZSPD | 東京羽田：JL085/JL086（每日）、JL089/JL080（每日） 所有航班(除JL089/JL080)：中國東方航空、上海航空 所有成田航班：中國南方航空 | 現時：14 |
| 东亚 |  中国 | 上海(虹桥) | 虹桥国际机场 | SHA | ZSSS | 東京羽田：JL081/JL082（每日）中國東方航空 | 現時：7 |
| 东亚 |  中国 | 大连 | 周水子国际机场 | DLC | ZYTL | 東京羽田：JL023/JL024（每日） JL829/JL820：中國東方航空 | 現時：7 |
| 东亚 |  中国 | 廣州 | 白云国际机场 | CAN | ZGGG | 東京羽田：JL087/JL088（每日）JL088：中國東方航空、中國南方航空 | 現時：7 |
| 东亚 |  中国 | 香港 | 香港國際機場 | HKG | VHHH | 東京成田：JL735/JL736（每日） 東京羽田：JL029/JL026 所有航班：國泰航空、夏威夷航空、阿拉斯加航空  JL735/JL736：馬來西亞航空、美國航空、西捷航空 | 現時：14 |
东亚: