索藻科
分類

本科包括下列各屬：
Acrocytis Rosenvinge（英语：）, 1933
Acrospongium Schiffn.（英语：）, 1916
顶毛藻属 Acrothrix Kylin（英语：）, 1907
Acrotrichium Womersley & Skinner, 1987
Actinema Reinsch（英语：）, 1874-1875
Adriogloia Ercegovic, 1955
Ascocyclus Magnus（英语：）, 1874
Ascoseirophila A.F.Peters, 2003
Asperococcus J.V.Lamouroux（英语：）, 1813
聚果藻属 Botrytella Bory de Saint-Vincent （英语 ： ） , 1822
Botrytella micromora Bory
太平洋聚果藻 Botrytella pacifica (Hollenberg) G.I.Hansen
聚果藻 Botrytella parva (Takamatsu) H.S.Kim
云氏聚果藻 Botrytella reinboldii (Reinke) Kornmann & Sahling
Buffhamia Batters, 1895
Buffhamia speciosa Batters, 1895
Castagnea A.Derbès（英语：） & A.Solier, 1851
Chilionema Sauvageau （英语 ： ） , 1898
Chilionema hispanicum (Sauvageau) R.L.Fletcher, 1987
Chilionema ocellatum (Kützing) Kornmann, 1953
索藻属 Chordaria C.Agardh（英语：）, 1817
Chukchia R.T.Wilce, P.M.Pedersen & Sekida, 2009
Cladochroa Skottsberg, 1921
枝管藻屬 Cladosiphon Kützing（英语：）, 1843
Cladothele J.D.Hooker & Harvey（英语：）, 1845
Clathrodiscus Hamel（英语：）, 1935
Climacosorus Sauvageau（英语：）, 1933
Coelocladia Rosenvinge（英语：）, 1893
Coilodesme Strømfelt, 1886
Corycus Kjellman（英语：）, 1889
Corynophlaea Kützing（英语：）, 1843
Cylindrocarpus P.L.Crouan & H.M.Crouan, 1851
Dalmatogloia Ercegovic, 1955
Delamarea Hariot（英语：）, 1889
Dermatocelis Rosenvinge（英语：）, 1898
Desmotrichum Kützing（英语：）, 1845
Dichosporangium Hauck, 1884
网管藻属 Dictyosiphon Greville（英语：）, 1830
短毛藻属 Elachista Duby（英语：）, 1830
Elachistiella Cassano, Yoneshigue-Valentin & M.J.Wynne, 2004
Elachistiella leptonematoides Cassano, Yonesh. & M.J.Wynne
Entonema Reinsch （英语 ： ） , 1875
Entonema polycladum (Jaasund) Jaasund, 1965
真丝藻属 Eudesme J.Agardh, 1882
Flabellonema Skinner & Womersley, 1984
Fosliea Reinke（英语：）, 1891
Giraudia Derbès（英语：） & Solier（英语：）, 1851
Gononema Kuckuck & Skottsberg, 1921
Gontrania Sauvageau（英语：）, 1936
Halodictyon Kützing（英语：）, 1843 (nomen dubium)
Halonema Jaasund, 1951
Halorhipis Saunders, 1898
Halorhiza Kützing （英语 ： ） , 1843
Halorhiza vaga Kützing
Halothrix Reinke （英语 ： ） , 1888
褐毛藻 Halothrix lumbricalis (Kützing) Reinke, 1888
Hamelella Børgesen（英语：）, 1942
Hecatonema Sauvageau（英语：）, 1898 '1897'
Heterophycus Trevisan（英语：）, 1848
Heterosaundersella Tokida, 1942
Hummia J.Fiore, 1975
Isthmoplea Kjellman（英语：）, 1877
Kolderupia S.Lund, 1959
Kurogiella Kawai, 1993
带绒藻属 Laminariocolax Kylin （英语 ： ） , 1947
Laminariocolax aecidioides (Rosenv.) A.F.Peters
Laminariocolax atlanticus M.S.Bernard, Strittmatter & A.F.Peters, 2018
短囊带绒藻 Laminariocolax draparnaldioides Noda, 1971
Laminariocolax macrocystis (A.F.Peters) A.F.Peters
绒状带绒藻 Laminariocolax tomentosoides (Farl.) Kylin, 1947
Laminarionema Kawai & Tokuyama, 1995
黏膜藻属 Leathesia S.F.Gray, 1821：舊屬黏膜藻科（）；
Leblondiella G.Hamel（英语：）, 1939
Leptonematella P.C.Silva（英语：）, 1959
Levringia Kylin（英语：）, 1940
Liebmannia J.Agardh, 1842
Litosiphon Harvey（英语：）, 1849
Melanosiphon M.J.Wynne, 1969
Melanosiphon intestinalis (De A.Saunders) M.J.Wynne
Melastictis Reinsch（英语：）, 1890
Mesogloia C.Agardh （英语 ： ） , 1817
Mesogloia japonica
Mesogloia lanosa P.L.Crouan & H.M.Crouan, 1867
Mesogloia mediterranea J.Agardh
Mesogloia vermiculata (Sm.) Gray
Mesogloiopsis Womersley & Bailey, 1987
Microcoryne Strömfelt, 1888
Microspongium Reinke（英语：）, 1888
Microsporangium
Mikrosyphar Kuckuck, 1895
Monosiphon L.Volkov, 1916
髓叶藻属 Myelophycus Kjellman （英语 ： ） , 1893
简单髓叶藻 Myelophycus simplex Harvey Papenfuss, 1967
多毛藻属 Myriactula Kuntze （英语 ： ） , 1898：舊屬黏膜藻科；
Myriactula arabica (Kützing) Feldmann, 1937
Myriactula areschougii (P.Crouan & H.Crouan) Hamel
Myriactula chordae (Aresch.) Levring
Myriactula clandestina (P.Crouan & H.Crouan) Feldmann
粗丝多辐藻  Myriactula clavata (Takamatsu) Feldmann, 1943
Myriactula elongata (Sauv.) G.Hamel, 1939
Myriactula fucorum (Rosenv.) Kylin
Myriactula gracilis van der Ben, 1969
Myriactula haydenii (Gatty) Levring
Myriactula minor (Farl.) W.R.Taylor
Myriactula oxalifera (Sauv.) G.Hamel, 1939
Myriactula pulvinata (Kützing) Kuntze, 1898
Myriactula rigida (Sauv.) G.Hamel, 1939
Myriactula rivulariae (Suhr ex Aresch.) Feldmann
马尾多辐藻 Myriactula sargassi (Yendo) Feldmann, 1943
Myriactula stellulata (Harvey) Levring, 1937
Myriactula vlastae Feldmann, 1954
Myriocladia J.Agardh, 1841
Myriocladia ekmanii (Aresch.) Kylin
Myriocladia lovenii J.Agardh
Myriocladia tomentosa P.L.Crouan & H.M.Crouan, 1867
Myriogloea P.Kuckuck ex F.Oltmanns, 1922
Myrionema Greville （英语 ： ） , 1827
Myrionema conchicola (Feldmann 1936) Boudouresque 1992
Myrionema crustaceum Agardh 1842
Myriotrichia Harvey（英语：）, 1834
海蘊屬 Nemacystus Derbès（英语：） & Solier（英语：）, 1850：舊屬海蘊科（，又名狹果藻科）
Neoleptonema E.-Y.Lee & I.K.Lee, 2002
Neoleptonema yongpilii E.-Y. Lee & I.K. Lee
Omphalophyllum Rosenvinge （英语 ： ） , 1893
Omphalophyllum ulvaceum Rosenvinge, 1893
Papenfussiella Kylin （英语 ： ） , 1940
Papenfussiella callitricha (Rosenvinge) Kylin
异丝藻 Papenfussiella kuromo (Yendo Inagaki, 1958)
Papenfussiella lutea Kylin
Phaeophysema A.Tanaka, S.Uwai & H. Kawai, 2010
Phaeostromatella P.J.L. Dangeard, 1970
Phycocelis Strömfelt, 1888
Pilocladus Kornmann, 1954
Platysiphon R.T.Wilce, 1962
Polycerea J.Agardh, 1882
Proselachista Y.P.Lee & Garbary, 1999
Protasperococcus Sauvageau（英语：）, 1931
Protectocarpus Kornmann, 1955
点叶藻属 Punctaria Greville（英语：）, 1830
Rhadinocladia Schuh, 1900
Saundersella Kylin （英语 ： ） , 1940
Saundersella crassa
Saundersella simplex
Sauvageaugloia G.Hamel（英语：） ex Kylin（英语：）, 1940
Soranthera
Soranthera Postels（英语：） & Ruprecht（英语：）, 1840
狹果藻屬 Spermatochnus Kützing（英语：）, 1843
球毛藻属 Sphaerotrichia Kylin（英语：）, 1940
Stictyosiphon Kützing（英语：）, 1843
Stilophora J.Agardh, 1841
Stilopsis Kuckuck, 1929
扭線藻屬 Streblonema Derbès et Solier, 1851：舊屬水雲科：
Streblonemopsis R.Valiante, 1883
Strepsithalia Bornet（英语：） ex Sauvageau（英语：）, 1896
Striaria Greville（英语：）, 1828
Suringariella Womersley & Bailey, 1987
面条藻属 Tinocladia Kylin （英语 ： ） , 1940
Tinocladia australis (Harvey) Kylin, 1940
面条藻 Tinocladia crassa Suring.
拟真丝面条藻 Tinocladia eudesmoides Ding et Lu, 2004
纤细面条藻 Tinocladia gracilis Ding et Lu, 2004
微孢面条藻 Tinocladia microsporangiis Ding et Lu, 2004
Tinocladia novae-zelandiae Kylin
张氏面条藻 Tinocladia zhangii Ding et Lu, 2004
Trachynema P.-M.Pedersen, 1985
Ulonema Foslie, 1893
Vimineoleathesia A.Tanaka, S.Uwai & H. Kawai, 2010
Zeacarpa Anderson, Simons & Bolton, 1988
Zonarina Ørsted
Zonarina abbreviata (Dolin & Lozouet, 2004)
Zonarina aturensis Dolin & Lozouet, 2004
Zonarina estotiensis (Dolin & Lozouet, 2004)
Zonarina exglobosa Sacco, 1894
Zonarina liviae Fehse & Vicián, 2004
Zonarina maynotensis Dolin & Lozouet, 2004
Zonarina parasigmapertura (Dolin & Lozouet, 2004)
Zonarina pinguis (Grateloup, 1846)
Zonarina subelongata (d'Orbigny, 1852)
Zonarius Ørsted
Zosterocarpus Bornet （英语 ： ） , 1890
Zosterocarpus abyssicola W.R.Taylor
Zosterocarpus oedogonium (Menegh.) Bornet, 1890
此外，部分舊有原被劃歸本科的物種，在較新（2014年）的文獻被重新歸類到萱藻科。