2019冠狀病毒病臺灣疫情
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4月1日，本土單日確診再次破100例。
4月15日，首次本土單日確診破1,000例。
4月17日，衛福部食藥署召開專家會議，核准莫德納疫苗用於6至11歲兒童的基礎接種，施打兩劑，每劑0.25毫升（50微克，為成人一半），兩劑間隔28天。
4月20日，「衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組」（ACIP）將「6至11歲」（兒童）接種莫德納疫苗兩劑間隔延長至12週。通過「青少年族群」（12-17歲）建議完成基礎劑接種且無發生嚴重不良反應者，於最後1劑基礎劑接種後5個月，接種追加劑。並通過「三大類族群」（65歲以上長者、長照機構住民、18歲以上免疫不全及免疫力低下且病情穩定者(即建議接種基礎加強劑之對象)）建議接種「第四劑」（第二次追加劑），接種時間與「第一次追加劑」（間隔5個月），且不論前面劑次接種廠牌，可接種以下廠牌：莫德納（半劑量）、輝瑞-BNT（全劑量）、蛋白質次單元疫苗（高端、Novavax，全劑量）。
4月21日，指揮中心估染疫率約萬分之17，並表示若染疫率達15%至20%，就是實質「與病毒共存」，目前政策以減災為目標，重點在疫苗、藥物與輕重症分流。
4月23日，臺灣總確診數突破5萬例。
4月24日，首次本土單日確診破5,000例。
4月27日，指揮中心宣布取消簡訊實聯制，並以臺灣社交距離APP取代
。
4月28日，首次本土單日確診破1萬例。「快篩實名制」正式上路。衛福部食藥署召開專家會議，核准輝瑞-BNT疫苗用於5至11歲兒童的基礎接種。
4月29日，臺灣總確診數突破10萬例。
5月4日，指揮中心表示，「COVID-19疫苗接種作業」已於2022年5月2日起推動「6至11歲」（兒童）基礎劑接種，除持續以全國「疫苗不良事件通報系統(VAERS)」進行監測外，「Taiwan V-Watch疫苗接種-健康回報」自5月3日起亦將小於18歲的兒童及青少年納入追蹤監測對象，經由父母手機在「疾管家介面」申請加入，代為填寫接種後健康回報，以加強兒童及青少年「COVID-19疫苗」接種後安全性監測，並及時將國內該族群接種後常見不良反應發生情形，提供醫療端、公衛端向家長說明接種後常見副作用發生概況，以及持續不適及時就醫提醒等。
5月6日，單日死亡再次突破10例。即日起增加公費PCR篩檢服務診所，可以透過採檢地圖查詢，目前要先電話預約。診所名單已公布於衛福部疾管署全球資訊網「COVID-19防疫專區」、臺灣社交距離App及採檢地圖「COVID-19全國指定社區採檢院所地圖」。
5月10日，首次本土單日確診破5萬例。
5月11日，臺灣總確診數突破50萬例。
5月12日，正式實施修訂「2019年冠狀病毒病」定義，新增「居家隔離」及「自主防疫」或「居家檢疫」期間使用「家用快篩」檢測陽性，經醫事人員確認為確診條件。
5月13日，臺灣總死亡人數突破1,000例。
5月14日，指揮中心宣布，為降低「COVID-19」感染後中、重症風險，5月16日起開放部分對象接種「第一次追加劑」滿5個月後，可接種「第二次追加劑」，開放對象：65歲以上長者、長照機構住民、18歲以上免疫不全及免疫力低下且病情穩定者(即建議接種基礎加強劑之對象)，前述對象不論先前劑次接種廠牌，「第二次追加劑」可打「莫德納疫苗」（半劑量）、「BNT疫苗」（全劑量）或「蛋白質次單元」之高端、Novavax疫苗（全劑量）。
5月16日，首批輝瑞－BioNTech疫苗(兒童劑型)到貨。
5月18日，正式實施修訂「2019年冠狀病毒病」定義，65歲(含)以上且非居家隔離、自主防疫、居家檢疫者，使用家用抗原快篩試劑檢測結果陽性，經醫事人員確認，或由醫事人員執行抗原快篩結果陽性者，即可研判為確定病例。
5月19日，臺灣總確診數突破100萬例。
5月25日，兒童(5-11歲)首劑及青少年(12-17歲)第三劑(追加劑)輝瑞－BioNTech疫苗正式開打。
5月26日，正式實施修訂「2019年冠狀病毒病」定義，民眾使用家用抗原快篩試劑檢測結果陽性，不分年齡及族群，經醫事人員確認，或由醫事人員執行抗原快篩結果陽性者，即可研判為確定病例。首次「單日死亡」突破百例。
5月27日，單日新增「確診」94,855例、單日新增「本土」94,808例，創「歷史最高」紀錄。
5月31日，臺灣總確診數突破200萬例。
6月1日，正式暫停「國際機場」的「落地採驗」政策，改採「唾液採驗」措施。
6月9日，單日新增中重症個案575例(中症384例，重症191例)，創「歷史最高」紀錄。
6月10日，單日新增死亡人數213例，創「歷史最高」紀錄。「衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組」（ACIP）召開專家會議，建議「5-11歲」(兒童)應完成2劑「COVID-19疫苗」接種，以降低染疫後重症及死亡的風險，並經參考疫苗臨床試驗結果及各國疫苗接種政策，建議2劑間隔4-8週以上；且基於目前尚無兒童族群以不同廠牌「COVID-19疫苗」完成基礎劑接種之安全性及有效性數據，建議兒童族群以同廠牌「COVID-19疫苗」完成2劑接種。惟特殊情形(如第1劑接種後出現嚴重不良反應、指揮中心評估疫苗供應情形等)下，可以不同廠牌疫苗完成2劑接種。
6月14日，臺灣總確診數突破300萬例。
6月17日，衛福部食藥署召開專家會議，核准莫德納疫苗用於6個月至5歲兒童的基礎接種，施打兩劑，每劑0.25 ml(含25微克的mRNA)，施打間隔28天。並核准Novavax疫苗專案輸入，適用於18歲以上成人主動免疫接種以預防COVID-19，用法用量為施打兩劑，每劑0.5毫升(含5微克的SARS-CoV-2棘蛋白)，兩劑施打間隔3週。
6月18日，臺灣總死亡人數突破5,000例。
6月21日，正式實施修訂「2019年冠狀病毒病」定義，新增民眾使用經衛福部食藥署核准通過之「家用新型冠狀病毒核酸檢驗試劑」檢測陽性，並經醫師確認即為確診。
6月27日，「衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組」（ACIP）召開專家會議，正式宣布提供「6個月至5歲」（幼兒）莫德納疫苗接種、「5至11歲」（兒童）COVID-19疫苗「基礎加強劑」及「追加劑」接種、「機場港埠、居家檢疫、航空機組員及機構與社福照護系統相關工作人員」接種「第二次追加劑」、Novavax疫苗使用於「18歲以上」民眾「基礎劑」、「基礎加強劑」，及「第1次、第2次追加劑」接種，並公告「COVID-19確診者」疫苗接種建議。
6月30日，首批Novavax疫苗到貨。
7月1日，正式實施「機場港埠、居家檢疫、航空機組員及機構與社福照護系統」相關人員為「第二次追加劑」接種對象。指揮中心修訂「COVID-19重複感染之定義及個案處置原則」：解隔治療之COVID-19確診個案，除症狀惡化等特殊情況外，建議於發病日或採檢日3個月內無需再進行SARS-CoV-2檢驗。惟如於發病日或採檢日1至3個月內症狀惡化，且SARS-CoV-2 RT-PCR檢驗陽性且Ct值<27或抗原/核酸快篩陽性；已解除隔離治療之確診個案，於發病日或採檢日間隔3個月後再次SARS-CoV-2 RT-PCR檢驗陽性且Ct值<30或抗原/核酸快篩檢驗陽性。
7月6日，首批莫德納疫苗(幼兒劑型)到貨。
7月8日，臺灣總確診數突破400萬例。Novavax疫苗正式開打。
7月15日，因應民進黨台北市長參選人陳時中，近日正式請辭衛福部部長，投入台北市市長選戰，因此行政院召開記者會宣布，新任衛福部部長由次長薛瑞元接任；次長一職則由「醫福會」執行長王必勝接任，並兼任指揮中心指揮官；行政院首席防疫顧問為張上淳，並於7月18日正式生效。
7月21日，正式開放「滿6個月至5歲」（嬰幼兒）接種莫德納疫苗。
7月22日，正式開放「50歲以上」（成人）及「18歲以上」之因工作需求需出國（包括因外交、公務、洽商等工作需求需出國）民眾接種「第二次追加劑」。
8月1日，衛福部食藥署召開專家會議，核准輝瑞－BioNTech疫苗用於6個月至4歲兒童的基礎接種，用法用量為施打3劑，每劑0.2毫升(含3微克的mRNA)，前2劑施打間隔至少21天，第2劑後間隔至少8週再施打第3劑。
8月8日，「衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組」（ACIP）召開專家會議，正式宣布「6個月至5歲」（幼兒）輝瑞－BioNTech疫苗提供接種建議，以3劑基礎劑，每劑3微克(mcg)，第1劑與第2劑間隔至少4週，第2劑與第3劑間隔至少8週，並建議以同一廠牌完成應接種劑次。
8月19日，首批輝瑞－BioNTech疫苗(幼兒劑型)到貨。
8月20日，臺灣總確診數突破500萬例。
8月27日，正式開放「滿6個月至5歲」（嬰幼兒）接種輝瑞－BioNTech疫苗。
9月2日，衛福部食藥署召開專家會議，核准莫德納-雙價次世代疫苗（原型株+Omicron BA.1變異株），每劑0.5 mL含有25微克原型株mRNA及25微克Omicron BA.1變異株mRNA，並適用於「18歲以上」（成人）主動免疫之追加接種，其用法用量為在國內已授權的「COVID-19疫苗」（基礎接種或追加劑）後，間隔至少3個月施打。
9月3日，臺灣總死亡人數突破10,000例。
9月5日，「衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組」（ACIP）召開專家會議，正式宣布「莫德納次世代雙價疫苗」將於2022年9月底進口的「雙價疫苗」，建議分兩階段開放提供作為「追加劑」接種使用：第一階段（65歲以上長者、長照機構住民、18歲以上免疫不全及免疫力低下者）、第二階段（第一類醫事人員、機場港埠、居家檢疫相關工作人員及航空機組員/船員、機構與社福照護系統相關工作人員、50至64歲成人、18歲以上因外交、公務、洽商等工作需求需出國者）；並建議調整「追加劑」(包含現行單價及次世代雙價疫苗)接種間隔為與上一劑間隔為至少3個月以上：包含「基礎劑最後一劑/基礎加強劑與第一次追加劑」、「第一次追加劑與第二次追加劑」、「第二次追加劑與第三次追加劑」、「確診後」亦需間隔3個月後接種；「12至17歲」（青少年）追加劑接種間隔亦調整為與「基礎劑最後一劑/基礎加強劑」間隔至少3個月以上；將提供Novavax疫苗給予「12至17歲」（青少年）接種2劑「基礎劑」，2劑間隔至少4週以上，建議以同製程疫苗完成「基礎劑」接種；亦可提供作為「12至17歲」（青少年）追加劑接種使用(可與基礎劑不同廠牌)。
9月8日，指揮中心宣布首批1,728劑「COVID-19預防用Evusheld單株抗體」已於9月6日晚間抵臺，並於今日配送。
9月16日，首批莫德納-雙價次世代疫苗（原型株+Omicron BA.1變異株）到貨。
9月20日，臺灣總確診數突破600萬例。
9月24日，正式開放「65歲以上」（長者）、長照機構住民、「18歲以上」（免疫不全及免疫力低下者）接種莫德納-雙價次世代疫苗（原型株+Omicron BA.1變異株）。
9月30日，開放12至17歲（青少年）接種Novavax疫苗（包含：第一劑、第二劑與追加劑）。
10月3日，開放醫事人員、機場港埠、居家檢疫相關工作人員及航空機組員/船員、機構與社福照護系統相關工作人員、50至64歲成人、18歲以上因外交、公務、洽商等工作需求需出國者接種莫德納-雙價次世代疫苗（原型株+Omicron BA.1變異株）。
10月11日，開放18至49歲民眾接種莫德納-雙價次世代疫苗（原型株+Omicron BA.1變異株）。
10月13日，臺灣總確診數突破700萬例。時隔936天，宣布「全球嚴重特殊傳染性肺炎」（COVID-19）旅遊疫情建議等級調降至第二級：警示(Alert)，出國旅遊應採取加強防護措施。另外入境者取消已實施936天的居家檢疫。
10月24日，指揮中心記者會時隔896天拿掉台上的透明隔板。
10月27日，指揮中心宣布，18至49歲（青壯年族群）想打第四劑（第二次追加劑），除了次世代疫苗之外，即日起也可選擇其他單價疫苗，和前一劑間隔12週以上。
11月1日，開放12至17歲（青少年）接種莫德納-雙價次世代疫苗（原型株+Omicron BA.1變異株）。
11月7日，確診者隔離改為「7+n(n=0~7)」；取消居家隔離及防疫補償。公共場所不再強制量體溫。另外確診者的接觸者取消已實施超過1000天的居家隔離。
11月10日，首批莫德納-雙價次世代疫苗（原型株+Omicron BA.4/BA.5變異株）到貨。
11月12日，臺灣總確診數突破800萬例。
11月14日，確診者隔離改為「5+n(n=0~7)」。
11月18日，開放「12歲以上」接種莫德納-雙價次世代疫苗（原型株+Omicron BA.4/BA.5變異株）。
12月1日，取消參與戶外活動全程佩戴口罩規定，而室內及乘坐公共交通工具等維持全程戴口罩。
12月2日，開放已完成接種「莫德納」或「輝瑞-BNT」（基礎劑）之「滿6歲至11歲」（兒童）接種「Moderna雙價疫苗」（原型株+ BA.4/BA.5）作為追加劑接種；並開放「滿5歲至未滿6歲」（兒童）接種「輝瑞-BNT單價疫苗」（兒童劑型）作為追加劑接。
12月23日，臺灣總死亡人數突破15,000例。
2022年度累積：確診數8,830,331例（本土8,792,505例、境外37,826例）、空號11,458例、死亡14,403例。
2023年1月6日，臺灣總確診數突破900萬例。
1月10日，單日新增560例境外移入，創「單日境外移入」史高紀錄。
2月6日，指揮中心表示，「COVID-19疫情」持續，近期重症對象「多未曾接種疫苗」或「未完成基礎劑接種」，尤其「65歲以上」（長者），應儘速完成「基礎劑」接種，以獲得保護力。又國內現有之「輝瑞-BioNTech COVID-19疫苗」即將於2023年3至4月間屆未解凍效期，由於「未滿18歲族群」之基礎劑需以同廠牌或同製程疫苗完成接種，針對欲接種「第1劑」（基礎劑）的民眾，請留意以下注意事項：一、「滿6個月至未滿5歲」（幼兒）基礎劑需以同廠牌疫苗接種，「輝瑞-BioNTech疫苗」基礎劑需接種3劑，其中第1、2劑及第2、3劑之最短接種間隔分別為4週及8週。自即日起未曾接種基礎劑第1劑者，請接種「Moderna」（單價疫苗），接種單位將不再提供(含預約作業)第1劑接種「Pfizer-BioNTech疫苗」；二、「滿5歲至未滿12歲」（兒童）基礎劑需以同廠牌疫苗接種，兩劑接種間隔4週以上。尚未接種基礎劑第1劑者，自4月2日以後，請接種「Moderna」（單價疫苗），接種單位於4月2日以後將不再提供(含預約作業)第1劑接種「Pfizer/BioNTech疫苗」；三、滿「12歲至未滿18歲」（青少年）兩劑基礎劑需間隔12週以上以同製程疫苗接種。自即日起未曾接種基礎劑第1劑者，請接種「Novavax疫苗」，接種單位將不再提供(含預約作業)青少年第1劑接種「BioNTech疫苗」；四、「18歲以上」（成人）如預定以同廠牌完成接種，第1劑「BioNTech疫苗」必須於2月21日以前接種。如於2月22日以後接種第1劑(可擇定「BioNTech」或「Novavax」COVID-19疫苗)，但後續第2劑請以「Novavax疫苗」銜接接種。
2月20日，實行「811天」的室內口罩令正式放寬，並剩下在「指定場所」的室內空間（包括醫療機構、醫事機構、老人福利機構、長照服務機構、榮譽國民之家、兒少服務機構、身心障礙服務機構、公共運輸及特定運具等8類指定場所），仍須全程佩戴口罩。
2月23日，指揮中心宣布，為達穩健開放，恢復正常生活，自2023年3月6日至4月30日，推動「112年全民COVID-19疫苗接種運動」，活動主軸為「疫苗加一，解封安心」，呼籲「未曾接種任何一劑」、「尚未完成基礎劑」及「6歲以上於今年1月1日起未接種過莫德納BA.4/5次世代疫苗」的對象響應接種，以增進免疫保護力，做好開放準備。活動期間將透過與各地方政府共同推動，由各縣市安排/指定合約醫療院所提供接種服務，並運用增設疫苗診次及設置社區接種站等方式，增進民眾接種可近性。
2月25日，臺灣總確診數突破1,000萬例。
3月6日，各級學校、補習班、幼兒園及課後照顧中心，解除室內配戴口罩措施。
3月28日，連續336天（2022年4月27日至2023年3月28日）新增死亡個案，創「連續新增死亡案例」最長紀錄。
4月17日，解除大眾運輸配戴口罩措施，但醫療場所仍要配戴。