新世紀福音戰士 (漫畫)
各集簡介

| 集數 | 標題   |  |  |  |  |  |
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| 1 | 使徒、來襲（） |  |  |  |  |  |
|  14歲的少年‧碇真嗣被自己的父親‧NERV總司令碇源堂叫到了第三新東京市，同時第三使徒‧Sachiel來襲，見到自己的父親後，父親要求自己做的第一件事，竟然是駕駛NERV製造的對使徒兵器「EVANGELION」與使徒對戰，雖然心裡百般不願意，但真嗣為了自己的面子還是硬著頭皮駕駛EVA初號機出擊...... 收錄話數 STAGE.1 使徒、來襲（）（月刊少年ACE 1995年2月号）  STAGE.2 再會…（）（月刊少年ACE 1995年3月号）  STAGE.3 初號機、出擊（）（月刊少年ACE 1995年4月号）  STAGE.4 沉默…（）（月刊少年ACE 1995年5月号）  STAGE.5 光的深淵中所見之物（）（月刊少年ACE 1995年6月号）  STAGE.6 我哭了（）（月刊少年ACE 1995年7月号）  |  14歲的少年‧碇真嗣被自己的父親‧NERV總司令碇源堂叫到了第三新東京市，同時第三使徒‧Sachiel來襲，見到自己的父親後，父親要求自己做的第一件事，竟然是駕駛NERV製造的對使徒兵器「EVANGELION」與使徒對戰，雖然心裡百般不願意，但真嗣為了自己的面子還是硬著頭皮駕駛EVA初號機出擊...... 收錄話數 STAGE.1 使徒、來襲（）（月刊少年ACE 1995年2月号）  STAGE.2 再會…（）（月刊少年ACE 1995年3月号）  STAGE.3 初號機、出擊（）（月刊少年ACE 1995年4月号）  STAGE.4 沉默…（）（月刊少年ACE 1995年5月号）  STAGE.5 光的深淵中所見之物（）（月刊少年ACE 1995年6月号）  STAGE.6 我哭了（）（月刊少年ACE 1995年7月号）  |  14歲的少年‧碇真嗣被自己的父親‧NERV總司令碇源堂叫到了第三新東京市，同時第三使徒‧Sachiel來襲，見到自己的父親後，父親要求自己做的第一件事，竟然是駕駛NERV製造的對使徒兵器「EVANGELION」與使徒對戰，雖然心裡百般不願意，但真嗣為了自己的面子還是硬著頭皮駕駛EVA初號機出擊...... 收錄話數 STAGE.1 使徒、來襲（）（月刊少年ACE 1995年2月号）  STAGE.2 再會…（）（月刊少年ACE 1995年3月号）  STAGE.3 初號機、出擊（）（月刊少年ACE 1995年4月号）  STAGE.4 沉默…（）（月刊少年ACE 1995年5月号）  STAGE.5 光的深淵中所見之物（）（月刊少年ACE 1995年6月号）  STAGE.6 我哭了（）（月刊少年ACE 1995年7月号）  |  |  |  |  |
| 2 | 短刀與少年（） |  |  |  |  |  |
|  擊敗第三使徒後，見到真嗣與其父親的互動，美里決定帶真嗣住進自己的家裡，同時真嗣也試著對周圍的人敞開心胸，但在看到美里的「監視記錄簿」後，又龜縮回自己的內心世界中...... 收錄話數 STAGE.7 閉鎖的心靈（）（月刊少年ACE 1995年8月号）  STAGE.8 真嗣不高興了（）（月刊少年ACE 1995年10月号）  STAGE.9 狂熱的災難（）（月刊少年ACE 1995年11月号）  STAGE.10 短刀與少年（）（月刊少年ACE 1995年12月号）  STAGE.11 徬徨的第三適任者（）（月刊少年ACE 1996年1月号）  STAGE.12 溫柔的輪廓（）（月刊少年ACE 1996年2月号）  |  擊敗第三使徒後，見到真嗣與其父親的互動，美里決定帶真嗣住進自己的家裡，同時真嗣也試著對周圍的人敞開心胸，但在看到美里的「監視記錄簿」後，又龜縮回自己的內心世界中...... 收錄話數 STAGE.7 閉鎖的心靈（）（月刊少年ACE 1995年8月号）  STAGE.8 真嗣不高興了（）（月刊少年ACE 1995年10月号）  STAGE.9 狂熱的災難（）（月刊少年ACE 1995年11月号）  STAGE.10 短刀與少年（）（月刊少年ACE 1995年12月号）  STAGE.11 徬徨的第三適任者（）（月刊少年ACE 1996年1月号）  STAGE.12 溫柔的輪廓（）（月刊少年ACE 1996年2月号）  |  擊敗第三使徒後，見到真嗣與其父親的互動，美里決定帶真嗣住進自己的家裡，同時真嗣也試著對周圍的人敞開心胸，但在看到美里的「監視記錄簿」後，又龜縮回自己的內心世界中...... 收錄話數 STAGE.7 閉鎖的心靈（）（月刊少年ACE 1995年8月号）  STAGE.8 真嗣不高興了（）（月刊少年ACE 1995年10月号）  STAGE.9 狂熱的災難（）（月刊少年ACE 1995年11月号）  STAGE.10 短刀與少年（）（月刊少年ACE 1995年12月号）  STAGE.11 徬徨的第三適任者（）（月刊少年ACE 1996年1月号）  STAGE.12 溫柔的輪廓（）（月刊少年ACE 1996年2月号）  |  |  |  |  |
| 3 | 白色傷痕（） |  |  |  |  |  |
|  在美里的動之以情下，真嗣終於被說服，並回到了NERV，同一時間，NERV正緊鑼密鼓進行零號機的再啟動試驗，就在這個時候，第五使徒‧Ramiel朝第三新東京市發動攻擊...... 收錄話數 STAGE.13 白色傷痕（）（月刊少年ACE 1996年3月号）  STAGE.14 歪斜的房間（）（月刊少年ACE 1996年5月号）  STAGE.15 紅色眼眸相信的是…（）（月刊少年ACE 1996年6月号）  STAGE.16 被丟棄的記憶（）（月刊少年ACE 1996年7月号）  STAGE.17 決戰前夜（）（月刊少年ACE 1996年8月号）  STAGE.18 血戰！（）（月刊少年ACE 1996年9月号）  STAGE.19 黑暗中之月（）（月刊少年ACE 1996年10月号）  |  在美里的動之以情下，真嗣終於被說服，並回到了NERV，同一時間，NERV正緊鑼密鼓進行零號機的再啟動試驗，就在這個時候，第五使徒‧Ramiel朝第三新東京市發動攻擊...... 收錄話數 STAGE.13 白色傷痕（）（月刊少年ACE 1996年3月号）  STAGE.14 歪斜的房間（）（月刊少年ACE 1996年5月号）  STAGE.15 紅色眼眸相信的是…（）（月刊少年ACE 1996年6月号）  STAGE.16 被丟棄的記憶（）（月刊少年ACE 1996年7月号）  STAGE.17 決戰前夜（）（月刊少年ACE 1996年8月号）  STAGE.18 血戰！（）（月刊少年ACE 1996年9月号）  STAGE.19 黑暗中之月（）（月刊少年ACE 1996年10月号）  |  在美里的動之以情下，真嗣終於被說服，並回到了NERV，同一時間，NERV正緊鑼密鼓進行零號機的再啟動試驗，就在這個時候，第五使徒‧Ramiel朝第三新東京市發動攻擊...... 收錄話數 STAGE.13 白色傷痕（）（月刊少年ACE 1996年3月号）  STAGE.14 歪斜的房間（）（月刊少年ACE 1996年5月号）  STAGE.15 紅色眼眸相信的是…（）（月刊少年ACE 1996年6月号）  STAGE.16 被丟棄的記憶（）（月刊少年ACE 1996年7月号）  STAGE.17 決戰前夜（）（月刊少年ACE 1996年8月号）  STAGE.18 血戰！（）（月刊少年ACE 1996年9月号）  STAGE.19 黑暗中之月（）（月刊少年ACE 1996年10月号）  |  |  |  |  |
| 4 | 明日香、來日（） |  |  |  |  |  |
|  第二適任者‧明日香終於要前往日本，真嗣在美里的簡介下看到了明日香的戰鬥過程，對明日香充滿了憧憬，想不到他竟然在街上偶然碰到明日香，夢想瞬間幻滅...... 收錄話數 STAGE.20 明日香、來日（）（月刊少年ACE 1997年1月号）  STAGE.21 受召喚而來的人（）（月刊少年ACE 1997年3月号）  STAGE.22 明日香攻擊（）（月刊少年ACE 1997年5月号）  STAGE.23 TRY AGAIN（）（月刊少年ACE 1997年6月号）  STAGE.24 不協和音（）（月刊少年ACE 1997年7月号）  STAGE.25 Shall we dance?（）（月刊少年ACE 1997年8月号）  STAGE.26 瞬間、心靈合一（）（月刊少年ACE 1997年9月号）  |  第二適任者‧明日香終於要前往日本，真嗣在美里的簡介下看到了明日香的戰鬥過程，對明日香充滿了憧憬，想不到他竟然在街上偶然碰到明日香，夢想瞬間幻滅...... 收錄話數 STAGE.20 明日香、來日（）（月刊少年ACE 1997年1月号）  STAGE.21 受召喚而來的人（）（月刊少年ACE 1997年3月号）  STAGE.22 明日香攻擊（）（月刊少年ACE 1997年5月号）  STAGE.23 TRY AGAIN（）（月刊少年ACE 1997年6月号）  STAGE.24 不協和音（）（月刊少年ACE 1997年7月号）  STAGE.25 Shall we dance?（）（月刊少年ACE 1997年8月号）  STAGE.26 瞬間、心靈合一（）（月刊少年ACE 1997年9月号）  |  第二適任者‧明日香終於要前往日本，真嗣在美里的簡介下看到了明日香的戰鬥過程，對明日香充滿了憧憬，想不到他竟然在街上偶然碰到明日香，夢想瞬間幻滅...... 收錄話數 STAGE.20 明日香、來日（）（月刊少年ACE 1997年1月号）  STAGE.21 受召喚而來的人（）（月刊少年ACE 1997年3月号）  STAGE.22 明日香攻擊（）（月刊少年ACE 1997年5月号）  STAGE.23 TRY AGAIN（）（月刊少年ACE 1997年6月号）  STAGE.24 不協和音（）（月刊少年ACE 1997年7月号）  STAGE.25 Shall we dance?（）（月刊少年ACE 1997年8月号）  STAGE.26 瞬間、心靈合一（）（月刊少年ACE 1997年9月号）  |  |  |  |  |
| 5 | 墓碑（） |  |  |  |  |  |
|  為了調查NERV背後的馬爾杜克機關，加持前往京都進行調查；同時為了慶祝美里升官和明日香搬進美里的家中，劍介自作主張為兩人開了慶祝派對，真嗣第一次了解到和朋友在一起玩樂是多麼快樂...... 收錄話數 STAGE.27 PARTY（）（月刊少年ACE 1998年1月号）  STAGE.28 碰觸到傷痕的話（）（月刊少年ACE 1998年3月号）  STAGE.29 墓碑（）（月刊少年ACE 1998年5月号）  STAGE.30 承受重力攻擊！(Catch the G-shock!)（）（月刊少年ACE 1999年7月号）  STAGE.31 NERV、停電（）（月刊少年ACE 1999年8月号）  STAGE.32 真實的深淵（）（月刊少年ACE 1999年9月号）  STAGE.33 水族館（）（月刊少年ACE 1999年10月号）  |  為了調查NERV背後的馬爾杜克機關，加持前往京都進行調查；同時為了慶祝美里升官和明日香搬進美里的家中，劍介自作主張為兩人開了慶祝派對，真嗣第一次了解到和朋友在一起玩樂是多麼快樂...... 收錄話數 STAGE.27 PARTY（）（月刊少年ACE 1998年1月号）  STAGE.28 碰觸到傷痕的話（）（月刊少年ACE 1998年3月号）  STAGE.29 墓碑（）（月刊少年ACE 1998年5月号）  STAGE.30 承受重力攻擊！(Catch the G-shock!)（）（月刊少年ACE 1999年7月号）  STAGE.31 NERV、停電（）（月刊少年ACE 1999年8月号）  STAGE.32 真實的深淵（）（月刊少年ACE 1999年9月号）  STAGE.33 水族館（）（月刊少年ACE 1999年10月号）  |  為了調查NERV背後的馬爾杜克機關，加持前往京都進行調查；同時為了慶祝美里升官和明日香搬進美里的家中，劍介自作主張為兩人開了慶祝派對，真嗣第一次了解到和朋友在一起玩樂是多麼快樂...... 收錄話數 STAGE.27 PARTY（）（月刊少年ACE 1998年1月号）  STAGE.28 碰觸到傷痕的話（）（月刊少年ACE 1998年3月号）  STAGE.29 墓碑（）（月刊少年ACE 1998年5月号）  STAGE.30 承受重力攻擊！(Catch the G-shock!)（）（月刊少年ACE 1999年7月号）  STAGE.31 NERV、停電（）（月刊少年ACE 1999年8月号）  STAGE.32 真實的深淵（）（月刊少年ACE 1999年9月号）  STAGE.33 水族館（）（月刊少年ACE 1999年10月号）  |  |  |  |  |
| 6 | 第四適任者（） |  |  |  |  |  |
|  知道父親將亞當藏在地底下以後，真嗣受到強烈的打擊，加持的一番話更讓他想起母親的EVA同步率試驗，就在此時，冬二得知自己被選為第四適任者，也即將成為EVA參號機的駕駛員...... 收錄話數 STAGE.34 第四適任者（）（月刊少年ACE 1999年12月号、2000年2月号）  STAGE.35 光和影（）（月刊少年ACE 2000年3月号）  STAGE.36 吿白（）（月刊少年ACE 2000年4月号）  STAGE.37 禮物（）（月刊少年ACE 2000年7月号）  STAGE.38 迎擊（）（月刊少年ACE 2000年8月号）  STAGE.39 替代系統（）（月刊少年ACE 2000年9月号）  STAGE.40 用黑色暈染黃昏（）（月刊少年ACE 2000年11月号）  |  知道父親將亞當藏在地底下以後，真嗣受到強烈的打擊，加持的一番話更讓他想起母親的EVA同步率試驗，就在此時，冬二得知自己被選為第四適任者，也即將成為EVA參號機的駕駛員...... 收錄話數 STAGE.34 第四適任者（）（月刊少年ACE 1999年12月号、2000年2月号）  STAGE.35 光和影（）（月刊少年ACE 2000年3月号）  STAGE.36 吿白（）（月刊少年ACE 2000年4月号）  STAGE.37 禮物（）（月刊少年ACE 2000年7月号）  STAGE.38 迎擊（）（月刊少年ACE 2000年8月号）  STAGE.39 替代系統（）（月刊少年ACE 2000年9月号）  STAGE.40 用黑色暈染黃昏（）（月刊少年ACE 2000年11月号）  |  知道父親將亞當藏在地底下以後，真嗣受到強烈的打擊，加持的一番話更讓他想起母親的EVA同步率試驗，就在此時，冬二得知自己被選為第四適任者，也即將成為EVA參號機的駕駛員...... 收錄話數 STAGE.34 第四適任者（）（月刊少年ACE 1999年12月号、2000年2月号）  STAGE.35 光和影（）（月刊少年ACE 2000年3月号）  STAGE.36 吿白（）（月刊少年ACE 2000年4月号）  STAGE.37 禮物（）（月刊少年ACE 2000年7月号）  STAGE.38 迎擊（）（月刊少年ACE 2000年8月号）  STAGE.39 替代系統（）（月刊少年ACE 2000年9月号）  STAGE.40 用黑色暈染黃昏（）（月刊少年ACE 2000年11月号）  |  |  |  |  |
| 7 | 男人的戰鬥（） |  |  |  |  |  |
|  因為等於是自己親手殺死了冬二，真嗣對NERV也產生了不信任感而選擇離開NERV。同時第九使徒‧Zeruel來襲，並輕鬆擊敗了明日香和零，在加持的勸說下，真嗣回到NERV並駕駛初號機作戰，然而，在戰鬥中，初號機的電力竟然用罄了...... 收錄話數 STAGE.41 拳頭（）（月刊少年ACE 2001年1月号）  STAGE.42 灰色天空（）（月刊少年ACE 2001年2月号）  STAGE.43 詢問（）（月刊少年ACE 2001年5月号）  STAGE.44 贖罪（）（月刊少年ACE 2001年6月号）  STAGE.45 男人的戰鬥（）（月刊少年ACE 2001年7月号）  STAGE.46 覺醒·前篇（）（月刊少年ACE 2001年8月号）  STAGE.47 覺醒·後篇（）（月刊少年ACE 2001年10月号）  STAGE.48 消滅（）（月刊少年ACE 2001年11月号）  |  因為等於是自己親手殺死了冬二，真嗣對NERV也產生了不信任感而選擇離開NERV。同時第九使徒‧Zeruel來襲，並輕鬆擊敗了明日香和零，在加持的勸說下，真嗣回到NERV並駕駛初號機作戰，然而，在戰鬥中，初號機的電力竟然用罄了...... 收錄話數 STAGE.41 拳頭（）（月刊少年ACE 2001年1月号）  STAGE.42 灰色天空（）（月刊少年ACE 2001年2月号）  STAGE.43 詢問（）（月刊少年ACE 2001年5月号）  STAGE.44 贖罪（）（月刊少年ACE 2001年6月号）  STAGE.45 男人的戰鬥（）（月刊少年ACE 2001年7月号）  STAGE.46 覺醒·前篇（）（月刊少年ACE 2001年8月号）  STAGE.47 覺醒·後篇（）（月刊少年ACE 2001年10月号）  STAGE.48 消滅（）（月刊少年ACE 2001年11月号）  |  因為等於是自己親手殺死了冬二，真嗣對NERV也產生了不信任感而選擇離開NERV。同時第九使徒‧Zeruel來襲，並輕鬆擊敗了明日香和零，在加持的勸說下，真嗣回到NERV並駕駛初號機作戰，然而，在戰鬥中，初號機的電力竟然用罄了...... 收錄話數 STAGE.41 拳頭（）（月刊少年ACE 2001年1月号）  STAGE.42 灰色天空（）（月刊少年ACE 2001年2月号）  STAGE.43 詢問（）（月刊少年ACE 2001年5月号）  STAGE.44 贖罪（）（月刊少年ACE 2001年6月号）  STAGE.45 男人的戰鬥（）（月刊少年ACE 2001年7月号）  STAGE.46 覺醒·前篇（）（月刊少年ACE 2001年8月号）  STAGE.47 覺醒·後篇（）（月刊少年ACE 2001年10月号）  STAGE.48 消滅（）（月刊少年ACE 2001年11月号）  |  |  |  |  |
| 8 | MOTHER（） |  |  |  |  |  |
|  在戰鬥的最後，初號機吞掉了Zeruel的S2機關，也將真嗣給吸收了，NERV於是進行打撈計畫，試圖將他搶救出來；在自己的精神世界中，真嗣似乎看到了自己已經消失的母親...... 收錄話數 STAGE.49 …Kiss.（）（月刊少年ACE 2002年2月号）  STAGE.50 到我心裏…（）（月刊少年ACE 2002年3月号）  STAGE.51 MOTHER（）（月刊少年ACE 2002年4月号）  STAGE.52 回想（）（月刊少年ACE 2002年6月号）  STAGE.53 光之巨人（）（月刊少年ACE 2002年7月号）  STAGE.54 NERV誕生（）（月刊少年ACE 2002年9月号）  STAGE.55 留言（）（月刊少年ACE 2002年10月号）  STAGE.56 嫉妒（）（月刊少年ACE 2002年11月号）  |  在戰鬥的最後，初號機吞掉了Zeruel的S2機關，也將真嗣給吸收了，NERV於是進行打撈計畫，試圖將他搶救出來；在自己的精神世界中，真嗣似乎看到了自己已經消失的母親...... 收錄話數 STAGE.49 …Kiss.（）（月刊少年ACE 2002年2月号）  STAGE.50 到我心裏…（）（月刊少年ACE 2002年3月号）  STAGE.51 MOTHER（）（月刊少年ACE 2002年4月号）  STAGE.52 回想（）（月刊少年ACE 2002年6月号）  STAGE.53 光之巨人（）（月刊少年ACE 2002年7月号）  STAGE.54 NERV誕生（）（月刊少年ACE 2002年9月号）  STAGE.55 留言（）（月刊少年ACE 2002年10月号）  STAGE.56 嫉妒（）（月刊少年ACE 2002年11月号）  |  在戰鬥的最後，初號機吞掉了Zeruel的S2機關，也將真嗣給吸收了，NERV於是進行打撈計畫，試圖將他搶救出來；在自己的精神世界中，真嗣似乎看到了自己已經消失的母親...... 收錄話數 STAGE.49 …Kiss.（）（月刊少年ACE 2002年2月号）  STAGE.50 到我心裏…（）（月刊少年ACE 2002年3月号）  STAGE.51 MOTHER（）（月刊少年ACE 2002年4月号）  STAGE.52 回想（）（月刊少年ACE 2002年6月号）  STAGE.53 光之巨人（）（月刊少年ACE 2002年7月号）  STAGE.54 NERV誕生（）（月刊少年ACE 2002年9月号）  STAGE.55 留言（）（月刊少年ACE 2002年10月号）  STAGE.56 嫉妒（）（月刊少年ACE 2002年11月号）  |  |  |  |  |
| 9 | 第五適任者（） |  |  |  |  |  |
|  連續敗給兩名使徒，明日香的自尊心大受影響，連帶的EVA貳號機的同步率也下降了，就在這時，第五適任者‧渚薰來到NERV，出現在明日香的面前...... 收錄話數 STAGE.57 第五適任者（）（月刊少年ACE 2003年2月号）  STAGE.58 拒絕（）（月刊少年ACE 2003年4月号）  STAGE.59 尊嚴（）（月刊少年ACE 2003年6月号）  STAGE.60 洋娃娃（）（月刊少年ACE 2003年9月号）  STAGE.61 朗基努斯之槍（）（月刊少年ACE 2003年11月号）  STAGE.62 distance（）（月刊少年ACE 2003年12月号）  STAGE.63 應戰（）（月刊少年ACE 2004年2月号）  |  連續敗給兩名使徒，明日香的自尊心大受影響，連帶的EVA貳號機的同步率也下降了，就在這時，第五適任者‧渚薰來到NERV，出現在明日香的面前...... 收錄話數 STAGE.57 第五適任者（）（月刊少年ACE 2003年2月号）  STAGE.58 拒絕（）（月刊少年ACE 2003年4月号）  STAGE.59 尊嚴（）（月刊少年ACE 2003年6月号）  STAGE.60 洋娃娃（）（月刊少年ACE 2003年9月号）  STAGE.61 朗基努斯之槍（）（月刊少年ACE 2003年11月号）  STAGE.62 distance（）（月刊少年ACE 2003年12月号）  STAGE.63 應戰（）（月刊少年ACE 2004年2月号）  |  連續敗給兩名使徒，明日香的自尊心大受影響，連帶的EVA貳號機的同步率也下降了，就在這時，第五適任者‧渚薰來到NERV，出現在明日香的面前...... 收錄話數 STAGE.57 第五適任者（）（月刊少年ACE 2003年2月号）  STAGE.58 拒絕（）（月刊少年ACE 2003年4月号）  STAGE.59 尊嚴（）（月刊少年ACE 2003年6月号）  STAGE.60 洋娃娃（）（月刊少年ACE 2003年9月号）  STAGE.61 朗基努斯之槍（）（月刊少年ACE 2003年11月号）  STAGE.62 distance（）（月刊少年ACE 2003年12月号）  STAGE.63 應戰（）（月刊少年ACE 2004年2月号）  |  |  |  |  |
| 10 | 淚（） |  |  |  |  |  |
|  遭到第十使徒‧Arael的精神攻擊，明日香終於精神崩潰，並由渚薰接任貳號機的駕駛員，此時，第11使徒‧Alsamiel展開攻擊，零號機被侵蝕，為了保護真嗣，零決定將機體自爆...... 收錄話數 STAGE.64 淚（）（月刊少年ACE 2005年2月号）  STAGE.65 想與你合而為一（）（月刊少年ACE 2005年4月号）  STAGE.66 來不及說（）（月刊少年ACE 2005年6月号）  STAGE.67 輾轉徹夜（）（月刊少年ACE 2005年8月号）  STAGE.68 交錯（）（月刊少年ACE 2005年10月号）  STAGE.69 污穢的血（）（月刊少年ACE 2005年12月号）  STAGE.70 虛無群集（）（月刊少年ACE 2006年1月号）  |  遭到第十使徒‧Arael的精神攻擊，明日香終於精神崩潰，並由渚薰接任貳號機的駕駛員，此時，第11使徒‧Alsamiel展開攻擊，零號機被侵蝕，為了保護真嗣，零決定將機體自爆...... 收錄話數 STAGE.64 淚（）（月刊少年ACE 2005年2月号）  STAGE.65 想與你合而為一（）（月刊少年ACE 2005年4月号）  STAGE.66 來不及說（）（月刊少年ACE 2005年6月号）  STAGE.67 輾轉徹夜（）（月刊少年ACE 2005年8月号）  STAGE.68 交錯（）（月刊少年ACE 2005年10月号）  STAGE.69 污穢的血（）（月刊少年ACE 2005年12月号）  STAGE.70 虛無群集（）（月刊少年ACE 2006年1月号）  |  遭到第十使徒‧Arael的精神攻擊，明日香終於精神崩潰，並由渚薰接任貳號機的駕駛員，此時，第11使徒‧Alsamiel展開攻擊，零號機被侵蝕，為了保護真嗣，零決定將機體自爆...... 收錄話數 STAGE.64 淚（）（月刊少年ACE 2005年2月号）  STAGE.65 想與你合而為一（）（月刊少年ACE 2005年4月号）  STAGE.66 來不及說（）（月刊少年ACE 2005年6月号）  STAGE.67 輾轉徹夜（）（月刊少年ACE 2005年8月号）  STAGE.68 交錯（）（月刊少年ACE 2005年10月号）  STAGE.69 污穢的血（）（月刊少年ACE 2005年12月号）  STAGE.70 虛無群集（）（月刊少年ACE 2006年1月号）  |  |  |  |  |
| 11 | 掌中的記憶（） |  |  |  |  |  |
|  在零的真相被公開後，真嗣的心情更是低落，同學們也接二連三的離開第三新東京市了，之後渚薰更是以第12使徒的身分，操縱貳號機企圖進入終極核心區。而在親手殺死渚薰後，真嗣更是掉入了無底深淵中......然而，SEELE對於碇源堂的忍耐也到了極限，並命令日本自衛隊對NERV總部進行攻擊。 收錄話數 STAGE.71 亞當的末裔（）（月刊少年ACE 2006年6月号）  STAGE.72 使者，死者（）（月刊少年ACE 2006年8月号）  STAGE.73 終至極境（）（月刊少年ACE 2006年10月号）  STAGE.74 掌中的記憶（）（月刊少年ACE 2006年12月号）  STAGE.75 殘缺之心（）（月刊少年ACE 2007年1月号）  STAGE.76 最後的敵人（）（月刊少年ACE 2007年2月号、2007年3月号）  |  在零的真相被公開後，真嗣的心情更是低落，同學們也接二連三的離開第三新東京市了，之後渚薰更是以第12使徒的身分，操縱貳號機企圖進入終極核心區。而在親手殺死渚薰後，真嗣更是掉入了無底深淵中......然而，SEELE對於碇源堂的忍耐也到了極限，並命令日本自衛隊對NERV總部進行攻擊。 收錄話數 STAGE.71 亞當的末裔（）（月刊少年ACE 2006年6月号）  STAGE.72 使者，死者（）（月刊少年ACE 2006年8月号）  STAGE.73 終至極境（）（月刊少年ACE 2006年10月号）  STAGE.74 掌中的記憶（）（月刊少年ACE 2006年12月号）  STAGE.75 殘缺之心（）（月刊少年ACE 2007年1月号）  STAGE.76 最後的敵人（）（月刊少年ACE 2007年2月号、2007年3月号）  |  在零的真相被公開後，真嗣的心情更是低落，同學們也接二連三的離開第三新東京市了，之後渚薰更是以第12使徒的身分，操縱貳號機企圖進入終極核心區。而在親手殺死渚薰後，真嗣更是掉入了無底深淵中......然而，SEELE對於碇源堂的忍耐也到了極限，並命令日本自衛隊對NERV總部進行攻擊。 收錄話數 STAGE.71 亞當的末裔（）（月刊少年ACE 2006年6月号）  STAGE.72 使者，死者（）（月刊少年ACE 2006年8月号）  STAGE.73 終至極境（）（月刊少年ACE 2006年10月号）  STAGE.74 掌中的記憶（）（月刊少年ACE 2006年12月号）  STAGE.75 殘缺之心（）（月刊少年ACE 2007年1月号）  STAGE.76 最後的敵人（）（月刊少年ACE 2007年2月号、2007年3月号）  |  |  |  |  |
| 12 | 父與子（） |  |  |  |  |  |