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樂高旋風忍者 (動畫)
劇情 > 第三季「重新啟動」「Rebooted」(8 集) > 主線劇情

在上一季的最後，當綠忍者勞埃德消滅了黑暗之主，並把自己的父親伽瑪當洗白後，忍者沒有了對手，世界來到和平時代，Ninjago City 如今發展成一個充滿科技的大都會：「New Ninjago City」，一切科技由一個坐著輪椅的科學家 賽勒斯·博格 (Cyrus Borg) 提供。為了方便管理，博格甚至創造了一個電子網路「數位宇宙」(Digiverse)，串聯起整座城市的網路與電子迴路。四色忍者到學校教書，成天面對一堆屁孩；勞埃德則與父親伽瑪當還有美沙子四處旅行。
正當忍者們在懷念以前大冒險的日子時，博格忽然邀請忍者們到他的科學大樓「博格大廈」(Borg Tower) 參觀。忍者們起初感到不解，但才發現博格是利用這個機會，偷偷塞給他們全新的服裝與武器「Techno-Blades」，並表示黑暗之主還活著，只是換成數位形式，存在一只硬碟裡。現在黑暗之主操控起博格大廈的科技，大量製造機器忍者，甚至控制了博格的數位網路，控制了整座城市，準備東山再起。現在需要忍者們重新出動，對抗復活的黑暗之主。
面對大量出現的機器忍者，甚至還有一隻被製造出來的機械巨龍，忍者們幾乎招架不住，只得使用打帶跑策略。在戰鬥的過程中，為了掩護忍者，吴大師也遭到機器忍者挾持，被帶去改造成邪惡機器人，博格也被控制心靈，變成邪惡蜘蛛型機器人。忍者們必須想辦法來對付這些機器人。既然整個城市的電子網絡都被控制，忍者們的策略，就是先關閉城市內的發電廠，當失去能源後，就能大幅度削弱黑暗之主的能力。
經過一翻努力，忍者們終於突破發電廠，衝回科學大樓，準備要把藏有黑暗之主數位資料的硬碟破壞掉。正當計畫都進行地相當順利時，竟出現一個穿白衣服、沒有露臉的神秘人，拿走硬碟並逃跑，並在現場留下一片白色的鱗片。
黑暗之主的硬碟被白袍神秘人士帶到一個秘密實驗室，雖然發電廠被破壞，整座城市都是屬於無電狀態，讓黑暗之主無法輕易操控網路，機器忍者也無法啟動，但神秘人卻用一種特殊的電鰻製造電力，為機器忍者大軍充電。對於為什麼被神秘人拯救，黑暗之主也感到困惑，僅知這兩人從此結盟。
只差一點就能徹底把黑暗之主消滅掉，但這個留下白鱗片的人究竟是誰？除了它可以隨時隱身外，對它實在沒有概念。但看到鱗片，忍者們直覺就是「又是蛇族搞的鬼」，所以來到城市的下方，要對質過去曾與他們大戰的蛇族，發覺蛇族如今很享受當個平民的生活，無意再發起任何戰爭，看來兇手並不是牠們。
但跟蛇族對談的過程中，忍者得知了另一個預言。在蛇族的預言中，除了人類之外，將會有一個「黃金大師」的降臨。這黃金大師是個邪惡的存在，他將會掌握初代旋風術大師的能力，並將世界上的人類與蛇族全數消滅。
如果預言是真的，那忍者們感到很害怕。「黃金大師」？掌握初代旋風術大師的能力？難道......是指勞埃德會成為一個惡魔，消滅這個世界？畢竟，在上回，勞埃德最後是激發出體內的力量，成為「黃金忍者」，打敗惡魔！
本來與父親一邊躲藏、一邊受訓的勞埃德，卻遭到機器忍者大軍，以及生化版吴大師與白袍神秘人突擊。在突擊過程中，神秘人才終於揭曉身分，竟然是彼拉！
在第二季率領全部蛇族團結，並召喚出巨蛇魔王的紫蛇族最後成員：彼拉，當時雖然一起被巨蛇魔王吞下去，但很明顯當巨蛇魔王被打爆後，他也倖存下來，只是因為毒液關係，使皮膚被漂白。今日他決定與黑暗之主聯手，一起重新掌握這世界，並向忍者們復仇。他們就把勞埃德帶上機械巨龍，飛回到黑暗之主的大樓。
原來，上一次忍者攻擊行動後，彼拉要打造一具身體，讓黑暗之主可以擺脫數位形式，再次來到世界上。除此之外，他們準備奪取勞埃德的黃金之力，並用來統治世界。原來蛇族預言中的「黃金大師」，就是指東山再起的黑暗之主！
在此同時，在博格的數位助理皮克莎 (P.I.X.A.L.) 幫助下，忍者們進入數位宇宙，與數位形式的黑暗之主大戰一場。若能在數位世界中徹底消滅黑暗之主，就能阻止他的計畫。但在戰鬥過程中，因為身體已經製造完成，黑暗之主就來到現實，離開了數位宇宙。最後在冰忍爆發下，讓 New Ninjago City 中被駭入的機器與載具，連同生化版胡大師都恢復正常，黑暗之主的機械巨龍也瞬間變一團廢鐵。在此同時，雖然黑暗之主的新身體已經打造完畢，勞埃德也趁機逃出敵人的掌握，在機械巨龍墜入海底時，趕快逃出。
既然已經讓對方的戰力大幅削弱，黑暗之主與其新身體也跟著失去動力的機械巨龍沉入海底，暫時可以喘口氣。但彼拉還是把黑暗之主從海底打撈了出來，準備執行一個「Project: Arcturus」的計畫。看對方還有些動作，赤地進行跟監活動，跟著彼拉前進牠們的秘密基地，發現這個「Project: Arcturus」，是打造一只太空火箭：牠們準備飛到太空中，帶回「巨大兵器」( Mega Weapon )，完成獲得黃金之力的最後一步！
巨大兵器！就是在前導季中，忍者們最一開始使用的四把黃金神器，在第二季裡，因為伽瑪當君王的關係，把四把黃金神器融在一起，變成這把「巨大兵器」，當時在不當使用之下，巨大兵器飛往宇宙，卡在一顆彗星之上。本來以為這把神器就這麼從這齣劇裡退場，沒想到又在這季中出現。彼拉等人查到了這把巨大兵器的所在位置，製造火箭，前往太空來尋找，這就是黑暗之主獲得強大力量的最後一步。
忍者們躲在火箭上，跟著機器忍者們飛上彗星，並在上頭開戰，但最後還是被機器忍者們找到了黃金神器並帶回 New Ninjago City，打造出全新的黃金裝甲，給 Overlord 穿戴，最終讓黑暗之主掌握強大的力量，並正式成為預言中將消滅世人的「黃金大師」。
忍者們回到地球上，與掌握全新力量的黑暗之主大戰一場。現在，黑暗之主拿到了由巨大兵器打造而成的武器，掌握了初代旋風術大師的力量後，能夠呼風喚雨，甚至讓自己巨大化。當忍者靠近黑暗之主時，全部都被擒拿住。冰忍卻利用最後的機會，將自己的冰元素能力開到最大，將黑暗之主摧毀，但也因此犧牲掉了自己，離其他忍者們而去。
劇情 > 第三季「重新啟動」「Rebooted」(8 集) > 支線劇情 > 伽瑪當師傅

在第二季的最後，勞埃德打敗了黑暗龍型態的黑暗之主後，除了讓世界恢復光明，也讓伽瑪當君王徹底洗白。因為巨蛇魔王毒液影響，伽瑪當君王體內被灌輸了邪惡意識，最終變成全身黑、又有四條手臂的大反派，但最後還是變回凡人，體內的毒液也被徹底清空，變成凡人樣貌，並被改稱為伽瑪當師傅 (Sensei Garmadon)。
在這一季中，雖然暫時沒有完全展現伽瑪當恢復正常後的身手，但他在傳授武術，改成「防守」：不主動攻擊，藉由引導對手的進攻，轉過去攻擊對手，跟過去的黑暗帝王有非常大的落差。
劇情 > 第三季「重新啟動」「Rebooted」(8 集) > 支線劇情 > 赞的戀情史

從第一季就揭曉是一名機器人，赞不只是帥氣機械忍者而已。前面看到對自己的迷惘，還有與父親的親情，這一季則是往戀愛這一塊發展。在忍者們一開始來到科學大樓時，遇到了博格的個人助理：皮克莎 (P.I.X.A.L.)，這就展開了赞與皮克莎的戀愛史。當然，兩人畢竟是機器人，所以無法理解「愛」為何物，更不熟悉那種喜歡上對方的感覺，但就是彼此吸引。
劇情 > 第三季「重新啟動」「Rebooted」(8 集) > 支線劇情 > 赞戰死

赞最後犧牲了自己，才打敗了黑暗之主，拯救忍者夥伴們，與整個城市。他將自己的冰元素之力開到最大，才終於消滅掉黑暗之主的形體，卻也因為身體負荷不了而全部摧毀。為了感謝赞的犧牲，在博格主持下，於市中立了一座赞的金屬像。
原來這赞只是身體被摧毀，但心靈與意志還是以數位形式存在著。事實上，劇中最後就演到赞的聲音出現，與皮克莎對談，接著就看到當初製造機器忍者大軍的工廠自己動了起來，暗示赞又將製造新的身體，重新回到世界上。
劇情 > 第三季「重新啟動」「Rebooted」(8 集) > 支線劇情 > 杰與寇開始為追尼雅而開戰

從前導季開始，杰就迷戀上尼雅，甚至從第一季開始，就能感受到這小兩口吸引彼此，但從這一季開始，「三角戀」戲碼挑撥杰、寇、尼雅之間的感情。原先寇與尼雅兩人之間並無特別好感，但當忍者們拜訪博格大樓，皮克莎看見了他們，立即計算出「寇與尼雅是最佳的配對」，就這麼開啟了這兩人的曖昧關係。就從這時候開始，寇與杰無時不為吸引尼雅注意，而彼此競爭，兩人也越來越水火不容。
劇情 > 第三季「重新啟動」「Rebooted」(8 集) > 支線劇情 > 吳大師變成邪惡機器人！

在劇中，吴大師曾被黑暗之主改造成一只邪惡機器人，並一起對抗忍者與伽瑪當師父。不過，劇中變成邪惡版的機器人，並沒有因此成為忍者的極大威脅。
劇情 > 第三季「重新啟動」「Rebooted」(8 集) > 支線劇情 > 這一季中使用的武器：Techno Blades

雖然先前已經失去黃金神器，但這回忍者們還是有武器可以使用，這是由博格發明的『Techno Blades』。當黑暗之主控制程式內的機械時，只要被這把刀具碰觸，就可以重新設定，解除黑暗之主的控制權。
劇情 > 第四季「元素擂台賽」「Tournament of Elements」(10 集) > 支線劇情 > 忍者們並不是唯一能操縱元素之力的人

這一季的第一集揭曉，世界上擁有元素之力的還有很多人。其他包括有「重力」、「影子」、「聲音」、「金屬」、「煙霧」、「毒」......
連同五名忍者在內，另外新登場的元素大師還有 11 位。
劇情 > 第四季「元素擂台賽」「Tournament of Elements」(10 集) > 支線劇情 > 赞轉變成「鈦忍者」

在上一季，赞為了擊敗 Overlord 而壯烈犧牲，但在最後一集的最後，有暗示他的意識尚存在於電腦網路中，並以工廠開始打造全新機器人身體來做結尾。但復活的赞，卻要到這一季才真正公布出來。使用全新身體的赞，身上全都是直接以鈦金屬製成，變成名副其實的「鈦忍者」(Titanium Ninja)，而不像上一季中，還有露出黃皮膚的外殼。
打造全新身體的赞，一開始並沒有前面身為忍者的記憶，甚至對於自己竟握有某種冰的元素能力而感到懼怕。但最後還是發覺了自己，重新掌握住冰的能力。
另外，在上一季中，冰忍曾遇到的女機器人：皮克莎，也跟著赞一起被帶到島上。只是在被帶來的過程中，皮克莎的身體毀壞，只留下存在於硬碟中的意識。在赞掙脫鐵鍊後，就把硬碟中的資料灌入體內，讓皮克莎從此活在冰忍意識中。
劇情 > 第四季「元素擂台賽」「Tournament of Elements」(10 集) > 支線劇情 > 忍者們與元素大師，都能召喚自己的元素之龍

在這一季中，忍者們沒有帥氣載具可以坐，在第一二季中乘坐的龍也早就飛走了，但在這一季中，當陳大師把所有人留在島上，獨自回到 Ninjago City 的時候，為了追趕上對方，大夥忽然激發出自己的元素之力，召喚出屬於自己的元素之龍。每一種能力都能召喚出一隻專屬自己的龍出來。
劇情 > 第四季「元素擂台賽」「Tournament of Elements」(10 集) > 支線劇情 > 尼雅與凯兄妹的父母的故事

凯與尼雅的父母，一直沒有被碰及到，就連在前導季的一開始，也只是講述這對兄妹經營著父母留下來的打鐵舖而已。
在這一季伽瑪當的回憶中，凯的父母也是能操縱元素之力的能力者。父親能操縱「火」元素，就如凯一樣；而母親則是能操縱目前為止還沒看過的「水」元素。當年當人蛇戰爭開打時，他們的父母就是重要戰力之一，一起對抗陳大師與蛇族。
劇情 > 第四季「元素擂台賽」「Tournament of Elements」(10 集) > 支線劇情 > 人蛇大戰，伽瑪當的過去

在前面幾季中，我們知道伽瑪當因為巨蛇魔王的毒液，性情大變，變成「伽瑪當君王」，失去理智的他犯下非常多錯誤，最後在勞埃德的黃金之力下，讓伽瑪當得以洗白，變回正常人，並成為一名與吴大師有所不同的睿智師父。
在伽瑪當被毒液影響心智後，他曾前往陳大師的道場，拜師學藝，當時就有遇到同是學徒的克勞斯。當時人蛇大戰剛爆發，但雙方寫下休戰條例，陳大師知道這消息時，表示休戰的話就不好玩了。不久之後，人蛇大戰又再度爆發，消息指出是蛇族先違反條例，所以當時的元素大師們又不得不集結起來，對付蛇族。
已經受到毒液的影響的伽瑪當，本來對戰爭沒有太大興趣。這時陳大師就故意提到「美沙子」，是伽瑪當與弟弟胡一起追求的女子，陳大師這時拿起一封信，是胡大師寫給美沙子的情書，用字遣詞非常優美，肯定會讓美沙子選擇胡。陳大師故意拿給伽瑪當看，並說「你不怕她被你弟弟搶走嗎？」害怕失去美沙子的伽瑪當，就拿起墨水，把胡的署名改成自己，再寄給美沙子。而自己也回去幫助其他人，打擊蛇族大軍。
後來大家發現，那場休戰其實是陳大師打破的，他在人類與蛇族兩邊挑撥離間，重新點燃這場戰爭。最後在蛇笛影響之下，把每一個蛇族都關進古墓 (然後在第一季被勞埃德打開，重新放出來)。其中，紫蛇族的將軍是最有野心跟戰力，他們則被流放到讓人生不如死的「詛咒魔域」。而陳大師與其弟子克勞斯，則被流放到離島上，也就是他今天用來舉辦錦標賽的地點。
劇情 > 第五季「幽靈霸主」「Possession」(10 集) > 主線劇情

在第四季的事件結束後，當一切都平穩下來，吴大師準備要展開他的「退休」生活，在郊區開一間茶店，美沙子、尼雅，以及其他忍者們都幫忙準備店鋪。但在這時，市內的博物館傳出有竊賊闖入，勞埃德隻身一人前往調查，卻遇到一隻「鬼」，這隻鬼可以附身並操控任何人甚至物。
在此同時，正當其他忍者們在市內，利用自己的元素能力來宣傳吴大師的茶店時，忽然之間能力全數消失。感到奇異的忍者們，趕緊回到茶店，想要從吴大師身上搞清楚究竟發生什麼事情，看到勞埃德也回到店內，但表情看起來相當怪異，並且一開口就說要搶走吴大師手上的竹拐杖。一看到怪異的勞埃德，吴大師馬上就搞清楚發生什麼事：勞埃德已經被附身了，而附身他的是一隻從 詛咒魔域 ( Cursed Realm )，也就是上一季中，伽瑪當被送往的地方，逃出來的鬼，而這個鬼正是吴大師第一個弟子：能操縱「風」的元素大師「摩罗」(Morro)。
在經過一陣打鬥後，命运赏赐号墜毀森林中，吴大師也趕緊把藏有秘密訊息的枴杖丟去，藉此引走摩罗，吴大師才講出過去的事情。原來凯等人並不是吴大師的第一個弟子們。當年，當伽瑪當離去，拜師陳大師後，一日，吴大師在山上的道場，遇到了一個窮困的孩子，因此被收留下來。他發現這個孩子天生具有操縱「風」的能力，因此認定他或許就是預言中的「綠忍者」，所以就早早跟摩罗講這件事。
當吴大師用四把神器來判斷摩罗時，才發現神器沒有反應：摩罗並不是傳說中的綠忍者。但摩罗早已把吴大師的話當真，接著就為了成為綠忍者，要求更多訓練，甚至到了一種狂熱、過頭的地步。接著，摩罗就表示，他一定要找到初代旋風術大師，也就是吴大師的父親，被埋葬的墳墓，就離開道場。但即使是吴大師也不曉得他父親的墓在哪，因為他父親並沒有留下任何訊息。
回到現在，吴大師才意識到，原來初代旋風術大師所埋葬之地，這個訊息一直藏在他每天不離身的拐杖上。雖然為了引走摩罗，已經把枴杖丟掉，但他已從上頭解讀出三個圖樣訊息。第一個圖樣，就是要忍者們學習一項已失傳的武術：由已死去多年的「陽大師」(Sensei Yang)創造，能夠飛上天空的「飞天旋转术」(Airjitzu)。忍者們必須搶在摩罗找到飞天旋转术卷軸前，先搶到手。
原先飞天旋转术卷軸是存放在多姆图书馆中，但這時，忍者們得知，卷軸早在數日前就遭到一名竊賊偷取。仔細觀看監視器，忍者們馬上就認出，偷竊者竟然是羅南 (Ronin)。忍者們馬上就前往羅南的住處，試圖取得飞天旋转术卷軸。
就在忍者前往目的地時，吴大師找了尼雅說話，提起了尼雅與凯的父母。他表示，他們兄妹都知道他們的父親，是能操縱火的元素大師，但他們不曉得的是，他們的母親，也是操作水的元素大師。就如同火的能力遺傳給了凯，水的能力也遺傳給尼雅。接下來，時間到了，該是讓尼雅卸下武士身分，成為「忍者」。
當忍者們來到羅南的住處時，發現魔洛也帶著他召喚出來的鬼弓箭手現身，經過打鬥之後，魔洛順利取得卷軸，馬上習得失傳已久的「飛天術」。看到這樣的狀況，忍者們感到失落，但還是從羅南口中得知：還是有機會學到飛天術的，只要前往楊大師生前住的「鬧鬼寺」，就有機會習得飛天術。
為了習得飛天術，忍者們在夜晚潛入鬧鬼寺，但鬧鬼寺有一個傳說：如果無法在日出前離開寺院，就會永生變成鬼魂。忍者們在寺內尋找，最終遇到楊大師的鬼魂，而且還遭遇楊大師的各種試煉，最終還是得到了飞天旋转术的捲軸。但當他們要趕在日出前逃出寺院時，寇卻沒能在時間內逃出，變成了一隻鬼。
雖然寇也變成了一隻鬼，但忍者們還是習得了飞天旋转术。他們下一個任務，就是取得放在「腾云国」的寶物：「庇护之劍」(Sword of Sanctuary)，是一把能預知敵人下一步的神器。而為了登上腾云國，忍者們來到 Ninjago 境內的最高山峰，在山頂上使用飞天旋转术，利用一塊名為「盲者之眼」的風暴加速，進入腾云國。雖然在路途中曾遭遇試圖走同樣路徑的摩罗，展開戰鬥，但忍者們還是順利抵達腾云國，把摩罗留在地表上。
忍者們來到腾云國，這是建立在雲上的世界，他們發現一個名叫 Fenwick 的男子早已在門口等待他們。Fenwick 引領忍者去尋找「庇护之劍」，在過程中 Fenwick 解釋，這個宇宙分為 16 個「國度」 (Realm)，與 Ninjago平行。在參觀雲中王國的同時，忍者們發現摩罗也已來到王國，並與忍者們展開戰鬥。在戰鬥的過程中，摩罗一方率先拿下了庇护之劍，並回到地表上，忍者們緊追在後，試圖把劍拿回來。好在這時勞埃德試圖奪回身體，暫時擋掉摩罗的主導權，這才讓凯最終把庇护之劍搶回到手上。
回到地表上，忍者們重新檢視自己手上的線索。他們已經學會了「飛空術」，現在也有了神器「聖殿之劍」，接著就是要找到初代旋風術大師的墓地。正當忍者們在思索最後一到線索，卻發現羅南把庇护之劍給偷走。原來羅南身上有著把柄，他不得不背叛忍者們，最後在調虎離山之計下，把劍帶往 Stiix，交到摩罗手上。當摩罗利用庇护之劍的逆轉時空之力，把卷軸上的紀錄逆轉之後，終於鎖定了初代旋風術大師的墓地確切下落，接著再附身到罗南身上，把忍者們騙往錯誤的地方。
雖然被錯誤的訊息給誤導，忍者們最終還是藉由羅南的 R.E.X. 飛行器，逃出陷阱。這時忍者們收到羅南本尊的道歉訊息，並得知了墓地的真確位置。這才發現，墓地之所以一直沒被找到，是因為並不在本島上，而是在深海中！
當忍者們終於進入到深海底的墓地入口，他們必須與時間競賽，因為摩罗早搶先他們一步，在墓中探索。由於守護者初代旋風術大師的遺體，以及最終的神器「國度水晶」(Realm Crystal)，整個墓由三大考驗守護者。忍者們順利解開前兩大考驗，來到最後一個考驗：一座冰凍的迷宮，並在此地遭遇摩罗。經過一翻交戰後，忍者們將摩罗困在陷阱中，並解開最後一個考驗，最終找到了初代旋風術大師的遺體。
忍者們來到初代旋風術大師的遺骸旁，他不但是忍術「旋風術」的創始者，整個Ninjago世界都是由他創造出來，更不用說他就是吴大師與伽瑪當師父的父親。這時，忍者們拿起了大師手中守護著的最後一樣神器，這是摩罗一直在尋找的「國度水晶」，這顆水晶是連接先前提到的16 個國度的橋樑，拿到這只水晶的人，可以自由前往任何地方。
看到忍者們已經搶先拿下水晶，摩罗威脅，如果還想看到勞埃德，就拿水晶來交換。雙方再次交手，雖然最後成功讓摩罗離開勞埃德身體，但水晶卻也被摩罗給帶走。
原來摩罗的目的，是將詛咒魔域的統治者：魔魂者 (The Preeminent) 釋放出來，由她來吞噬掉一切，並一口氣詛咒十六個國度。魔魂者的外型非常噁爛，是一顆場有觸鬚的眼球，由於已經和詛咒魔域連為一體，所以她自身就是整個詛咒魔域，還會從中不斷吐出鬼魂。
當然，雖然巨大的魔魂者非常難對付，但她自己本身就是鬼魂，若能將她打入海中，肯定能從此將她消滅掉。但這計畫非常難執行，除了模魂者體積過大外，忍者們也在各地與鬼魂還有摩罗交戰。
所幸就在最後，尼雅終於找到了她體內的潛能，藉由自己的水之力，製造出巨大的海浪，消滅整個魔魂者，也將摩罗從此抹除。但隨著魔魂者的消滅，整個詛咒魔域也因此毀滅殆盡。
劇情 > 第五季「幽靈霸主」「Possession」(10 集) > 支線劇情 > 魔洛是胡大師的第一個學生！

當魔洛出現，並附身在勞埃德身上後，胡大師這才坦言，忍者們並不是胡大師的第一批學生。當年，當胡大師還年輕時，曾經在修道院外面遇到一個在外流浪的孩子，也就是魔洛，胡大師將他留在修道院，進行訓練。
當時預言中的「綠忍者」尚未出現，年輕的胡大師也尚缺乏往後的智慧，看到身手矯健的魔洛，學習速度很快，展現出相當的天分時，胡大師也一直跟他講「也許你就是預言中的綠忍者」。結果當把四把黃金神器，拿到魔洛身旁時，發現毫無反應，這才發覺魔洛並不是預言中的綠忍者。但因為胡大師一直在講這件事，讓魔洛一直相信自己就是那被選中的人，最後失望至極，憤怒之下，魔洛離開了修道院。
當忍者們在尋找初代旋風忍術大師遺骸的下落時，曾把忍者們誤導到錯誤地點，這個地點就是 Caves of Despair，也就是前導季中，藏著第一把黃金神器「地裂鐮」的礦場。忍者們在其中尋找的過程中，就找到了魔洛的遺體。原來當年離開胡大師後，魔洛試圖靠自己找到初代旋風忍術大師的墓地，就在這座礦場中尋找，最後死在裡面。
劇情 > 第五季「幽靈霸主」「Possession」(10 集) > 支線劇情 > 尼雅是第六個忍者，掌握「水」的元素之力

從第一季起，尼雅就一直展現出希望能成為忍者們的助力的企圖心，因此自己開發出了「武士X」機甲，甚至還擁有一個藏在沙漠中的地下基地，裏頭放置許多載具。儘管並沒有與忍者們一起受訓，但尼雅也有相當程度的武打實力，也能與忍者們一起飛簷走壁。在前一季中，劇情揭曉了尼雅與凯的父母，各是掌握有「火」與「水」元素之力的元素大師，這些能力是能遺傳到孩子身上，因此在這季中，揭曉了尼雅實際上也有「水」的元素之力。
在這一季中，當忍者們在外頭冒險時，尼雅也開始接受訓練，練習如何去控制水。個性急躁的她，不論怎麼練習都無法取得一點進展，對自己非常失望。但最終在羅南的一番話之下，有所頓悟，開啟控制水的能力，甚至在最後成為擊敗幽靈大軍的關鍵武器，正式穿上忍者服，成為忍者們的一員。
劇情 > 第五季「幽靈霸主」「Possession」(10 集) > 支線劇情 > 賞金獵人：羅南登場

除了魔洛之外，另一個在這一季中全新登場的，就是「羅南」(Ronin) 這個角色。身為顧傭兵的他，唯一聽命的只有「金錢」：誰願意付他錢，他就幫誰做事。原來當初冰忍復活，卻落入陳大師手中，就是因為羅南的關係。
總之，雖然他經常與忍者們一起搶寶物，甚至還背叛過忍者，但他實際上也算是半好人，會偷走寶物也是身不由己 的，因為羅南有欠債於魔洛一名幽靈手下。
劇情 > 第五季「幽靈霸主」「Possession」(10 集) > 支線劇情 > 寇變成鬼忍者

為了把卷軸帶走，寇是唯一一個沒能趕在天亮前離開鬼廟的忍者，讓他變成幽靈的形式。對於這件事，讓寇陷入無比低潮，他沒辦法感覺到冷熱，不會肚子餓，更重要的是：只要一不小心碰到水，他就從此消失在這世界上了。雖然變成鬼有很多不方便，但他也得以在戰鬥中，運用身為鬼的優勢，突破許多困境。
劇情 > 第五季「幽靈霸主」「Possession」(10 集) > 支線劇情 > 十六個國度 (Sixteen Realms)

另一個在這一季中，帶來的超重大劇情重點，就是正式介紹了「十六個國度」，簡單來說就是十六個平行宇宙。
當忍者們來到雲中王國 (Cloud Kingdom)時，裡面的人告知說原來有十六個國度，彼此平行。這十六個國度，包括有故事主要發生地「忍者國」、前導季中，伽瑪當君王與骷髏大軍所在的「地下世界」(Underworld)；第一季中，伽瑪當長出四條手臂的黑暗世界「瘋狂魔域」 (Realm of Madness)；在上一季中，伽瑪當師父犧牲掉自己後，所進入的「詛咒魔域」(The Cursed Realm)。另外，在這邊看到的「雲中國度」，實際上也是十六個國度之一。
雖然進入每個國度的方法不同，但這季中，被守護在初代旋風術大師之墓的「國度水晶」，卻可以任意開通前往大部分國度的通道。
劇情 > 第五季「幽靈霸主」「Possession」(10 集) > 支線劇情 > 伽瑪當師父與勞埃德的最後一面

在前一季中，自願犧牲，來開啟詛咒魔域的伽瑪當師父，被困在魔魂者的體內。雖然說詛咒魔域本身是一個平行國度，但已與魔魂者融為一體。當與魔魂者交戰時，勞埃德曾進入到魔魂者體內，找到了被囚禁的伽瑪當師父，但不管怎麼拉扯，都無法弄斷伽瑪當身上的鎖鏈；最後，勞埃德僅繼承了伽瑪當身上的道服，離開魔魂者身體。當魔魂者被赤蘭召喚的大浪吞噬而消滅時，伽瑪當也隨之與世長辭。
劇情 > 舞台劇「暗影魔域」「The Realm of Shadows」

設定在第五、第六季之間的外傳故事，描述剛逃脫出詛咒魔域的克勞斯企圖捕捉名為土匪（Bandit）的稀有陰陽龍，將其培養成令人畏懼的暗影龍使忍者國陷入黑暗，但忍者介入並使土匪轉而成長為光明龍，阻止了克勞斯的詭計。
劇情 > 第六季「天際飛行」「Skybound」(10集 ep55-64) > 支線劇情 > 納達可汗

天空海盜船長納達可汗是一隻有四條手臂，可以飛行的精靈，是精靈王之子，因為一些原因，在數百年前被流放到忍者國當海盜。
納達可汗本身是精靈，可以替任何人實現三個願望，但他實現願望全都是不懷好意，經常藉由話術來扭曲對方的意思，所以許願時真的要想清楚自己要說什麼。雖然可以幫任何人，卻無法幫自己實現願望，但只要藉由與自己的愛人「狄拉拉」結婚，成為新一任精靈王，納達可汗就可以從狄拉身上取得「無限願望」。
除了納達可汗外，基本上過往忍者們遭遇到的對手，其手下都是雜魚兵，這回納達可汗手下也是絕大多數都很雜魚，但卻個個都很有個人特色，其中最不雜魚的肯定就是留著八字鬍，基本上是從來不失手的狙擊手：火槍大副 (Flintlocke)，雖然中間他曾因為被許願的關係，成為怎麼樣都打不中的狙擊手。
劇情 > 第六季「天際飛行」「Skybound」(10集 ep55-64) > 支線劇情 > 「精靈之劍」、「靈魂之劍」

忍者故事中，總是會設計一些不同的神器出來。這一季登場的是拿在精靈手上的「精靈之劍」(Djing Blade)，或稱「靈魂之劍」(Sword of Souls)，這是一把能把任何人的靈魂，永遠禁錮在劍柄上的水晶中的武器。在故事中，原本由上一任的精靈王持有，但在精靈國崩解時，把這把劍交到納達可汗手上，成為他用來完成計畫的武器。
劇情 > 第六季「天際飛行」「Skybound」(10集 ep55-64) > 支線劇情 > 十六個國度是兩兩連結

在前一季中增加了「十六個國度」的設定，也就是除了忍者們存在的這個世界外，還有另外十六個國度與之平行，基本上就很類似「平行宇宙」的概念，其中包含到一些忍者們先前歷險過的地區。
在這一季中，則又對這部分再增加一些描述，當看到精靈國正在崩解時，精靈王表示，十六個國度是兩兩連結成「姊妹國度」，當其中一個崩解掉，另一個也會跟著崩解。而精靈國的姊妹國度，正就是前一季中，被赤蘭用大海消滅的詛咒魔域。而這也成為納達可汗誓言要向忍者們復仇的動機。
劇情 > 第六季「天際飛行」「Skybound」(10集 ep55-64) > 支線劇情 > 這一季的真正主角是心急的阿光

雖然說忍者們是一起行動，但這一季的真正主角則是其中的雷忍者阿光，從最初登場起就一直迷戀赤蘭的他，一直很希望能得到赤蘭芳心。在前一季《Possessions》中，忍者們一度進入到初代旋風術大師的古墓，並藉由裡頭神秘的冰倒影，見到自己的未來。其中阿光就看到自己的未來是與赤蘭在一起，基於不確定的原因，自己臉上帶著獨眼面罩。
在這一季中，就是講述阿光過於急躁，想趕快實現那倒影。因此當他看到天空海盜鬧著他玩，丟給他一只獨眼龍眼罩，他也急著把它戴起來。然後在冒險過程中，又不斷接近赤蘭，反而造成赤蘭非常不自在。
劇中，阿光曾經在喃喃自語中，講出「真希望我不是出生在那垃圾場家庭的小孩，這樣我就能買給赤蘭任何她想要的物品」。結果被納達可汗扭曲意思，讓他得知原來他那經營回收場的父母只是收養他，他實際上是一個剛過世的明星演員之子，繼承父親手上的豪宅與財富。從這邊就知道阿光個應太急躁，講話常常不經大腦。然而，養子這部分，應該也在最後被倒轉回去就是了。
劇情 > 第六季「天際飛行」「Skybound」(10集 ep55-64) > 支線劇情 > 赤蘭的心聲

面對阿光的追求，赤蘭表達心聲，她表示，阿光的追求讓她很不自在。雖然這兩人在第一二季曾有過曖昧關係，互相吸引，但中間曾因為阿剛的介入，讓赤蘭變得迷惘。
赤蘭坦言，長久以來，她一直被別人決定命運，從來沒有機會活出自己的路，而她不喜歡這感覺。這讓阿光感到很內疚，因為他一直相信當初看到的倒影，相信會與赤蘭成眷屬，但是否他也變成另一個決定赤蘭命運的人？或許阿光真的表現地太心急了。
劇情 > 第六季「天際飛行」「Skybound」(10集 ep55-64) > 支線劇情 > 陽大師的廟宇卻還飄在空中......預告下一次故事？

在劇中，為了重新建造精靈國，納達可汗將忍者城的土地都傳送到空中，飄浮在上頭，當時擷取的土地，就有包含到楊大師 (Master Yang) 的鬧鬼寺。是的，就是在前一季中，忍者們習得飛天術 (Airjitzu)，還害阿剛變成鬼魂的地方，連陽大師那一塊地都被送到空中去。
但當一切被阿光的最後一個願望逆轉後，本來所有飄在天空的土地都回到地面上，唯獨陽大師的鬧鬼寺仍在空中飄。整季最後的結尾，就是陽大師奸詐的笑容，預告著他就是下一次忍者們將遭遇的對手。
劇情 > 小說《黑暗之島三部曲》「Dark island trilogy」

設定在第六季《天際飛行》之後的外傳故事，結合了第六季動畫中登場的角色，與第二季登場的黑暗之島。故事描述會使用黑魔法的克勞斯 (Clouse) 帶領沒有頭子的天空海盜們，在黑暗之島中挖掘暗物質，而忍者們與賞金獵人羅南 (Ronin)，就一同前往島上，一探究竟。
劇情 > 萬聖節特別篇「亡靈紀念日」「Day of the departed」(1 集)

緬懷已逝之人、珍惜健在之人的開場劇情，說到萬聖節，那麼主角當然是鬼，本次主要反派由身為幽靈的楊大師擔綱，藉著僅數千年一見的陰陽月蝕，楊大師策劃計謀讓眾人遺忘阿剛、將已逝的反派們召回現世對付忍者們、更企圖讓自己重返世間，只要穿過由陰陽月蝕之魔力開啟的「歸來孔」，鬼魂就能變回人被暫時召喚回現世附身在博物館「反派大廳」雕像上的反派幽靈們。
「亡者之境」（The Departed Realm），看來是詛咒魔域的幽靈「死」後會去的地方。忍者國的神秘面紗又揭開了一道。
眾反派各自挑了要算帳的對象，魔洛的目標理所當然是胡大師，但事情並不是你我想像的那樣，魔洛先前只是裝作要復仇，事實上是前來幫助忍者們的，而且他幫完忙之後就回博物館乖乖站好。
眾反派一一被忍者打敗了。這次大家終於拿了不同的武器。
彼拉又黑了，雖然上次暫時跟你們合作過，如今還是要找綠忍者尋仇
楊大師倒是白了，囚禁幽靈弟子們只因害怕被世人遺忘，阿剛點醒他已有飛天術傳世，楊大師良心發現，幫助阿剛抵達歸來孔，使其變回人類，但自己仍是鬼魂。在事件結束之後，楊大師的寺廟成了亡靈節聚會講鬼故事的好去處。
劇情 > 小說《彼拉的復仇》「Pythor's Revenge」

設定在特別篇《亡靈紀念日》事件的隔天，忍者們被要求到紀念日當天遭受嚴重破壞的歷史博物館幫忙善後，同時彼拉偷走了博格企業尚未公開的新產品的原型，而忍者們必須在彼拉將該新商品公諸於世前將其奪回來。
劇情 > 第七季「時光之力」「The Hands of Time」(10 集)

甚麼！吳大師竟然犯錯了？旋風忍者為拯救世界再次身陷險境。而且吳大師生命面臨重大考驗！新一季旋風忍者要應付敵人呢？
劇情 > 第七季「時光之力」「The Hands of Time」(10 集) > 主線劇情

旋風忍者來到第七季，這季的標題為「時光之力」，這回遭遇到的對手，令胡大師相當恐懼。能控制時間流動，就等於是能控制任何事物。
第七季劇情，講述一對曾是掌握「時間之力」的雙胞胎元素大師，跳脫時間漩渦，來到現代與忍者們還有吳大師打對臺。他們的最終目標，是要完成一台自由穿梭時空的「時光機器」，並藉由手上的時光之力，以及逆天、度日、止水、擲梭四把能控制時間流動的「時光之刃」征服整個忍者城。為了達到這目標，時間雙胞胎以當年曾大鬧忍者城的「巨蛇魔王」(The Great Devourer) 的蛇卵為對象，研發出一種新的突變蛇：Vermillion，這種蛇是一條一條的小蛇，卻能像細胞一樣，聚集在一起，變成強壯的個體。有時可以長成一個人的大小，有時甚至更大。時間雙胞胎就試圖以這些小蛇為武力，再加上時光機器，完成他們的大業。
除了新的對手外，第七季的劇情還有另一個很大的特點，就是終於要認真跟觀眾，好好介紹火忍者赤地 (Kai)，與水忍者赤蘭 (Nya) 的父母。這對兄妹是最早跟觀眾們見面的忍者，身世卻一直是最神秘。在前面六年的劇情發展中，漸漸得知他們父母各是火與水的元素大師，經營一間打鐵舖，還參戰過人蛇戰爭，但他們後來究竟去了哪？為什麼留下赤地與赤蘭就不見？直到這季才終於交代。
這季勞埃德肩負起帶領整個團隊的使命，但最終時間雙子成功回到過去。凱和妮雅用雙元素神龍衝進時光隧道阻止他們並拯救了吳大師，但最終吳大師為了拯救被時光之拳擊中的雷，並將凱和妮雅連同時空倒轉的時光之刃扔出隧道，自己和時間雙子留在隧道。
劇情 > 第八季「伽瑪當之子」「Sons of Garmadon」(10 集)

第八季的劇情設定在吳大師落入時間漩渦之後一年，忍者們都略有成長。當旋風忍者繼續尋找胡大師下落時，旋風忍者城中又出現一群自詡為「伽瑪當之子」的重機幫派，出沒在街頭上，在下水道或高速公路上狂奔。這些幫派成員是過去伽瑪當君王的狂熱信徒，打著已逝之「伽瑪當」的名號結隊，到處搜查三個「妖怪面具」(Oni Masks) 下落。試圖藉由竊取擁有魔力的鬼面具，利用「復活神廟」的法力，將伽瑪當君王復活起來。
作為旋風忍者一份子，學習全新旋風攻擊模式，阻擋他們四處破壞及找出背後的目的！
劇情 > 第八季「伽瑪當之子」「Sons of Garmadon」(10 集) > 主線劇情

第1集: 一個不知名的秘密組織，正逐步威脅皇室。旋風忍者被急召回皇室，除必須保護皇室及公主等各成員外，還必須保護一個惡靈面具。
第2集: 皇室遭受到伽瑪當之子組織襲擊後，旋風忍者發現惡靈面具被伽瑪當之子偷走。旋風忍者邀請晴美公主加入他們的忍者家庭。
第3集: 晴美公主已慢慢適應旋風忍者的生活。勞埃德和阿光繼續尋找關於三個面具的秘密，而阿剛及冰忍就加入伽瑪當之子的組織。
第4集: 為了成功滲入伽瑪當之子組織，冰忍化名為美洲豹蛇 (Snake Jaguar) 參加了一場致命電單車街頭比賽。
第5集: 冰忍被襲後一直處於昏迷，易先生迫使各旋風忍者逃到使命號。忍者們發現在冰忍的傳輸系統中，有可能會顯示沉默者的隱藏位置。
第6集: 當勞埃德和晴美尋找第三個面具的下落時，其他旋風忍者亦試圖修復使命號，並發現了驚人的事情。
第7集: 當勞埃德和晴美在復活神殿找尋最後一個面具時，旋風忍者不小心成為人質，而晴美公主亦揭露她的背後目的。
第8集: 旋風忍者呼籲旋風忍者城的警察，合力協助勞埃德阻止晴美公主的計劃 - 喚醒沉睡中的伽瑪當。
第9集: 正當旋風忍者以為他們又再一次拯救了旋風忍者城時，伽瑪當又再回來了！他釋放了晴美公主，而她鼓勵他必須征服「通往成功路上的絆腳石」… 他的兒子 - 勞埃德。
第10集: 伽瑪當君王創造了一個更大，更邪惡的巨人來協助他打敗旋風忍者以及統治旋風忍者城。
劇情 > 第九季「狩獵行動」「Hunted」(10 集)

當勞埃德及赤蘭在旋風忍者城奮力抵抗伽瑪當時，另一邊小胡及其他忍者卻被鐵男爵及捕龍軍團捉拿到另一國度。
今次，真的要考驗忍者之間的信任，對抗伽瑪當！
劇情 > 第九季「狩獵行動」「Hunted」(10 集) > 主線劇情

第九季的劇情，將會接續在第八季後面，標題為「狩獵行動」(Hunted)，估計將會分成兩條支線來進行，在兩個支線中，忍者主角們，彷彿變成獵物一般，四處逃竄。
第一個要看到的支線，是忍者們與吳大師，一同掉落至「第一個國度」(First Realm)。總地來說，忍者們掉入異世界，這世界不但居住著元素之龍，而且還有全新的反派在裡頭。
整個異世界，架構在滾滾黃沙中，看似無盡的荒野，再加上各種用破銅爛鐵組裝起來的超誇張巨輪車輛，整個根本就是後啟示錄風格的路線，只是再混合樂高自家元素再裡頭。各種大型載具，有飛空型的飛行器，卻也有輪子很大顆的車輛。
在故事中，全新登場的反派被稱為「獵龍人」，專門狩獵這個國度中的元素之龍，並藉由牠們的元素之力來建造社會。最大的首領是一個身上有機械義肢，戴著禮貌與單邊眼鏡，好像是紳士的「鐵男爵」(Iron Baron)。當具有元素之力的忍者們掉入這世界，自然也成為獵龍人的目標。
而在這個世界中，獵龍人們使用一種名為「復仇石」(Vengestone)的石頭，可以讓忍者們的元素之力失效，並限制具有元素之力的生物的動作。而更可怕的是，只要他拿起石刀，就能把忍者們元素之力吸收起來，相當可怕。就連阿光都苦笑：「真是太好了，我還以為我們跌到谷底了呢。原來狀況可竟是更糟糕呢。」
獵龍人專狩獵這世界存有的元素之龍，將之俘虜，利用牠們的力量來當資源，建造自己的社會。
就如前面所說，第九季劇情將分兩條支線進行。第八季的反派「晴美公主」(Harumi) 因憎惡當年忍者們與巨蛇魔王的戰鬥，害她失去父母，所以重新召喚伽瑪當君王，一同統治這世界。果然，在伽瑪當、晴美還有重機幫派的淫威下，整個忍者城已變得殘破不堪。
四名忍者和胡大師被傳送到第一個國度中，而勞埃德不但留在原本的世界，還失去了自己的元素之力，變成平凡人。在同樣留在這世界的赤蘭 (Nya)，以及母親美沙子 (Misako)，以及凱樂 (Skylor) 和德瑞大師 (Dareth) 的幫助下，勞埃德不但要逃避伽瑪當的視線，還要號召民眾組織起來，反抗晴美和伽瑪當。
除了伽瑪當等人外，勞埃德還要面對另一個強大的敵人。在第八季最後，在伽瑪當的召喚下，一隻「鬼巨人」(Oni Titan) 在這個世界大搞破壞。
第2集: 阿剛和小胡試圖在捕龍團隊中拯救他們的朋友。另一邊廂，在旋風忍者城，勞埃德與一些老朋友團聚，並認為他們是對抗伽瑪當的可靠盟友。
第3集: 勞埃德必須將他的訊息透過電視廣播傳遞給隊友。與此同時，另一國度中的鐵男爵繼續帶著忍者們追捕逃走了的巨龍。
第4集: 當勞埃德和反叛者慶祝他們成功打擊伽瑪當時，其他忍者們成功對抗鐵男爵，並於捕龍獵人的魔掌中逃脫了！
第5集: 總部遭受到破壞，勞埃德不斷躱避以免被捕。與此同時，忍者被重金屬抓住了，但找到了一個非一般的盟友。
第6集: 由於勞埃德掩護她的真實身份而暴露了蜜絲婆婆 (Mystake) 的神秘面紗，伽瑪當將晴美公主視為他暗中的女兒。與此同時，小胡堅持信念，帶領朋友進入危險領土，希望能找到火焰巨龍的巢穴。
第7集: 勞埃德得到凱樂的幫助，消滅父親的力量，而忍者成功獲得到巨龍獵人所需要的東西。
第8集: 勞埃德和他的團隊計劃控制鬼巨人。與此同時，忍者再次落入鐵男爵的手中。
第9集: 當鐵男爵迫使小胡取回飛龍盔甲時，可幸地事情並沒有按計劃完成。在旋風忍者城，勞埃德只能一再等待忍者們的歸來。
第10集:旋風忍者最終聚集在一起並聯合起來阻止伽瑪當，為一心想消滅惡勢力，勞埃德做出一個改變忍者的重要決定。
劇情 > 微電影「旋風術道場傳說」Tales from the Monastery of Spinjitzu(6 集，每集長度3分鐘)

The weekend drill: 阿剛坐着鑽土機面對2個巨獸敵人，他有能力應付嗎？
元素騎士: 冰忍和赤地分別地駕駛着雙刄機車和冰雪機車對抗青毒族，又一次成功保衛旋風忍者之城！
藍色閃電: 胡大師和阿光正在研究壁畫時，卻發現蛇族的出現破壞！阿光駕駛暴風戰機迎戰！
武士X: 原來阿光和赤蘭日常相處活動就練武? 他們還很喜歡研究如何改裝武士X機械人，令機械人變得更有型，又具攻擊性！
忍術課: 胡大師在旋風忍者修道院教導忍師克服恐懼，才可成為更強的旋風忍者！
綠色與金色: 勞埃德心愛的超特四頭巨龍出現 ,勢要擊敗蛇族!
劇情 > 第十季「鬼族入侵」「March of the Oni」(4集)

鬼族的黑暗力量席卷了第一國度，菲斯來到忍者城求救，黑暗力量同時也以飛快的速度讓整個忍者城陷入黑暗。
忍者們全力抵抗無果，於是眾人前往監獄尋找伽瑪當，希望用鬼族打敗鬼族。
伽瑪當和勞埃德前往被黑暗吞噬的忍者城摧毀鬼族進入忍者國的通道——國度水晶，並遭遇鬼怪的首領歐米伽，雖成功摧毀穿越水晶但為時已晚，歐米伽仍成功召喚出鬼族大軍。在遭大軍追擊時，他們找到了第3季時黑暗之主融合黃金武器鑄造的黃金盔甲，並發現鬼族畏懼該盔甲的黃金之力。
其餘忍者則前往電視台營救困在高樓層的倖存者，卻於撤離時因赤蘭的操作失誤導致阿剛自命運賞金號的舷梯上摔落並墮入黑暗中；素素在關鍵時刻救下勞埃德和加滿都，回到命運賞金號。
加滿都也從忍者的互相關心中體會到了感情。一群人回到修道院，赤地將黃金盔甲融化並重鑄為原本的四件黃金武器，阿剛從黑暗中逃出。
於是阿剛、冰忍、赤地、阿光、赤蘭、素素、勞埃德、菲斯、加滿都以及吳大師一起抵抗進攻的鬼族大軍。
眾人齊心協力，但仍然無法打敗鬼怪。最後忍者們使用創世龍卷風，用創造的力量使所有的鬼怪消失，黑暗力量也消失了。最後阿光成功向赤蘭求婚，加滿都也離開了，不知所向。
劇情 > 第十季「鬼族入侵」「March of the Oni」(4集) > 主線劇情

第1集: 隨著忍者城開始重建，菲斯帶來嚴重警告：鬼族已經歸來，並一一摧毀各個國度。忍者們必須作好準備，而勞埃德也要認真考慮為了打敗這個敵人，需要向另一個敵人求救的可能。
第2集: 忍者們將伽瑪當君王從牢房放出來之後陷入猶豫，尤其是勞埃德。伽瑪當和勞埃德進入黑雲之中，企圖阻止鬼族的入侵。
第3集:進入忍者城的鬼族比任何人預料的還要強，而忍者們必須冒險營救勞埃德和伽瑪當。僅管仍有一絲希望，但忍者們仍將付出慘痛代價。
第4集: 忍者們趕回忍術修道院，以此當最後據點。與鬼族的最後大戰終於開打，他們聯手使出的忍術是否能徹底打敗鬼族？還是會讓忍者們分崩離析？
劇情 > 第十一季「」「Secrets of the forbidden spinjitzu」(30 集)(每集長度11分鐘)

沉浸在上次勝利的榮耀中的忍者一行人為了重新鍛鍊自己而深入沙漠中的金字塔裡探險，卻意外釋放了企圖利用禁忌忍術大肆破壞的邪惡烈焰毒蛇(Pyro Vipers)！忍者們爭奪禁術卷軸，阻止阿斯菲拉，戰鬥。
劇情 > 第十一季「」「Secrets of the forbidden spinjitzu」(30 集)(每集長度11分鐘) > 主線劇情（1-15集，火之章 Fire Chapter）

禁忌忍術卷軸已被祕密隱藏了數千年，但現在，原先被放逐的邪惡毒蛇女巫阿斯菲拉回來了，她渴望復仇，且準備再度將其魔爪伸向卷軸以奪回其力量。忍者們的能力、友誼、信仰和忠誠將面臨前所未有的考驗。
劇情 > 第十一季「」「Secrets of the forbidden spinjitzu」(30 集)(每集長度11分鐘) > 主線劇情（16-30集，冰之章 Ice Chapter）

冰忍被邪惡的冰皇帝抓走了，忍者們展開了一場孤注一擲的救援行動，但若要再次見到他們的朋友，他們得先在擊退成群的暴雪武士以穿越「虛無之境」，一個從未有闖入者能成功歸來的國度。
第16集:終於來到「虛無之境」，到底冰忍是否真的如傳聞所說的被關在這裡？
第17集:冰皇帝得知了旋風忍者們的來臨並派出暴雪武士軍隊要擊倒他們以及掩護他們的村民們。
第18集:勞埃德與冰皇帝的暴雪武士發生衝突，但是被一隻奇怪的白狼救了出來......
第19集: 在旋風忍者城的監獄裡，紫外線與機械工得知了忍者們失蹤的消息並藉機越獄，在逃跑的過程中遇到了另一名自稱為「報喪鴿」(Fugi-Dove)的逃犯。
第20集:勞埃德和被其命名為「小紅」的白狼找到了被遺留在洞穴中的鈦機械人和來自冰忍的信息，為尋找冰忍之旅提供了線索......
第21集: 因為弄丟了旅人茶而感到內疚，阿剛開始對附近的山丘進行危險的探索，希望找到傳說中被一隻可怕的雪怪守衛著的旅行者之樹。
第22集: 阿剛在傳說中雪怪聚集的冰冷洞穴中醒來，試圖逃跑，卻發現一個令人驚訝的事實。
第23集: 冰皇帝召喚巨大的冰巨獸攻擊勞埃德和他的白狼朋友，就在此時，勞埃德發現了小紅的真面目。
第24集: 小紅揭露其真實身分為名叫秋田的變形族 族人，並自述其過去遭遇。
第25集: 冰皇帝的可怕冰龍再次前來，給冰漁村帶來了麻煩，迫使忍者們去尋找勞埃德......
第26集: 在旋風忍者城裡，胡大師和素素試圖找到前往虛無之境的方法，卻誤闖亡者之境並意外地釋放出於已於第五季中被摧毀的大魔王「魔魂者」。
第27集: 故事講述冰忍到達虛無之境的故事以及他是如何受到邪惡的維克斯的影響。
第28集: 在發現了冰忍的可怕真相之後，勞埃德發現自己被監禁並獨自困在冰皇帝的魔掌中。
第29集: 終極一戰，赤蘭、阿光、阿剛和赤地終須面對冰帝的可怕冰龍，而勞埃德和他的新盟友卡塔魯以及Grimfax則與冰皇帝本人正面對決。
第30集: 冰之章的戲劇性結局，老朋友團聚，友誼的力量對決禁忌忍術卷軸的腐敗力量......
劇情 > 「第一帝國」短篇「Prime Empire Original Shorts」

第1集: 赤蘭說服阿光陪她一起上舞蹈課，但很驚訝的發現阿光是個天生的舞者，而她不是。
第2集: 機械工帶著他升級過的麵條卡車搶完銀行後，成功躲開忍者們，逃逸無蹤。原來他的背後有一位神秘人物，幫助機械工升級各種機械道具，好成就自己未來的大業。
第3集: 介紹飆風50億賽車大賽的廣告中訪問到各選手的背景以及對他們而言，勝利的意義。訪問之中，阿光出現了。他想要阻止這場比賽，但是他話還沒說完，就被追捕他的紅衛兵發現。
第4集: 故事大綱: 遭到紅衛兵追捕的阿光，遇上一樣遭到追捕的史考特。他們與紅衛兵上演了一場激烈的飛車追逐。
第5集: 故事大綱: 一頭霧水的阿光跟史考特在第一帝國中遭到紅衛兵的追捕。
第6集: 故事大綱: 密爾頓設計的電玩遊戲「第一帝國」爆紅，忍者國電視台的蓋兒認為其中有疑之處，因此針對這個遊戲，進行了深度報導。
劇情 > 第十二季「」「Prime Empire」

當古老的傳奇電玩遊戲「第一帝國」重現時，玩家開始消失。為了解開謎團，忍者進入了一個由神秘人物暗影至尊統治的危險數位世界。
劇情 > 第十二季「」「Prime Empire」 > 主線劇情

第1集: 在調查搶劫案時，忍者們無意間發現了《全盛帝國》這款傳奇性卻從未上市的街機遊戲突然出現並控制了旋風忍者城中的所有其他電玩遊戲……
第2集: 當旋風忍者將阿光的失踨與《全盛帝國》聯繫起來時，他們便前往戴爾島尋求遊戲設計師密爾頓·戴爾的答案。
第3集: 鈦特斯博·柏格發現了一個關於《全盛帝國》的驚人秘密，而忍者們則與帶領一批囚犯們逃獄的機械工進行了戰鬥，試圖達到第13級並親自進入遊戲。
第4集: 忍者們進入《全盛帝國》的電玩世界中尋找阿光，並發現自己的元素之力在電玩世界中無法使用。在遭到紅面罩攻擊時，一群打扮成阿光的玩家們現身並拯救了他們。
第5集: 在其中一個遊戲區中，一個名叫奧基諾的武士面臨一次信仰危機，因為他連續多次未能帶領主人取得勝利，這使他失去了所有希望-直到一些熟悉的忍者到來。
第6集: 為了阻止烏納加米，忍者們必須取得三把塔納之鑰。其中一把被藏在「不滿森林」-全盛帝國最危險的環境之一。
第7集: 忍者們在被紅面罩們追趕時，必須攀登「歇斯底里懸崖」。但他們得知了一個驚人的消息：烏納加米正在將玩家轉換為能量方塊，以便建造真理之門通往真實世界！
第8集: 在卡拉卡拉納內，奧基諾必須在幫助他的忍者盟友們或是服從他的主人烏納加米的邪惡指令兩者中作出抉擇。
第9集: 在成功獲得第一把塔納之鑰後，忍者們得知第二把塔納之匙只能透過在科技區贏得速路五十億競速大賽來取得。但由於沒有足夠的點數報名比賽，他們必須先想辦法賺取貼數。
第10集: 勞埃德前往賽道，希望藉由現場觀看以獲取更多關於這場殘酷比賽的資訊。在那裡，他遇到了一位可能持有勝利關鍵的賽車手。
第11集: 紅面罩們找到了斯考特的藏身處並對其發動攻擊，斯考特犧牲自己讓忍者們和7號車手逃離並及時抵達速路五十億競速大賽現場。被遊戲設定只會輸的7號車手能不能打破程式設定？
第12集: 在賽場上失去兩位同伴後，剩餘的忍者們可沒空為他們哀悼。他們進入全盛帝國的最後一個區域—卡拉多米納區，在那裡，烏納加米告訴他們其中一人必須面對其生平中最畏懼的對手。勞埃德被選中，而他的對手竟是晴美？！
第13集: 冰忍和碧素造訪密爾頓的一位故友，後者指引他們到一處從前密爾頓經常前往的電子遊樂場。兩人前往該處尋找密爾頓，但卻碰上了麥格力，冰忍遭到綁架，而最終素素成功找到了密爾頓，卻發現事實並非一如他們的推測。
第14集: 麥格力的手下捉走胡大師並將他帶到麥格力工的倉庫。麥格力以其作為人質迫使冰忍交出全盛帝國主機板以開啟傳送門。與此同時，碧素詢問密爾頓該如何關閉全盛帝國。
第15集: 阿光與赤蘭成功扺達第一帝國的最終關卡—帝國瘋狂神廟，但赤蘭替阿光擋下了蘇西米的攻擊並失去了最後一條生命。阿光必須在決戰中獨自對抗烏納加米，然而烏納加米此刻亦正經歷著面對自己身分真相的重大考驗。
第16集: 烏納加米進入現實世界並攻陷旋風忍者城，而阿光、冰忍和碧素試圖讓它與它的創造者密爾頓·戴爾團聚以阻止災難發生。
劇情 > 第十三季「勝利之路的抉擇」「Master of the Mountain」

忍者們受邀到美麗的慎太郎 (Shintaro)王國來慶祝年輕的范妮亞公主 (Princess Vania)的生日。乍看之下，象牙之城 (Ivory City)看似是個純樸的地方，但忍者們隨即發現了一個陰暗、隱密、被人們長期遺忘的下層世界：慎太郎地下城 (Dungeons of Shintaro)。一旦進入內部，他們必須在由無情的骷髏巫士 (Skull Sorcerer)統治著、充斥著危險又奇特的生物的迷宮般的地道中為自由而戰。忍者們必須明智地選擇自己的道路⋯⋯
劇情 > 第十三季「勝利之路的抉擇」「Master of the Mountain」 > 主線劇情

第1集：忍者們被邀請去一個神秘的國度參加公主的生日。他們整裝出發，卻在途中遭到慎太郎周圍山中的肉食動物萬惡蝠(Dire Bats)攻擊，並被由海默率領的護衛軍及時救出。

第2集：忍者們抵達慎太郎王國並接受范吉利斯國王以及范妮亞公主的歡迎。阿剛撞見一位戴著他母親項鏈的格克族，並在范妮亞公主的帶領下進入山中的隧道尋找線索，從而發現了由邪惡的骷髏巫士控制的礦場。

第3集：阿剛被骷髏巫士囚禁，同時范妮亞公主趕回地面告知忍者們與父親。忍者們立刻趕往營救阿剛。

第4集：忍者們得知格克族與莫安斯族的對立起因於雙方都認為對方偷走並獨占了兩把由一位被格克族稱為「吉利」(Gilly)的英雄分別贈與雙方的解救之刀。

第5集：在與其餘忍者們走散後，赤蘭、阿光與勞埃德被莫安斯族人莫特帶至他們的家園並介紹給莫安斯女王莫特沙，後者隨即愛上了阿光。在得知赤蘭已是阿光的伴侶後，女王向赤蘭發起挑戰以決定誰配得上阿光。

第6集：赤地與冰忍遇到一群格克族，後者誤認兩人為骷髏巫士的手下而將他們逮捕並送至格克族洞穴裏的法庭。在那裡，格克族首領格奇決定交由野獸「麥諾」(Mino)審判他們是否有罪。

第7集：阿剛為躲避一群萬惡蝠的圍攻而逃進充滿巨大蜘蛛的洞穴裡，幸好被范妮亞公主與她的寵物龍喬比(Chompy)及時解救。兩人逃回地面並告知范吉利斯國王關於骷髏巫士之事，但後者揭露了他自己正是骷髏巫士。

第8集：國王開啟密道使阿剛與胡大師墜落其中，范妮亞公主也追了進去，國王將此事嫁禍給喬比並令侍衛將其拿下。三人渡過了許多危機並抵達地底最深處名為岩石之底(Rock Bottom)的洞穴。在那裡，他們遇到了另外三位自稱為地底族(the Lowly)的人。

第9集：地底族告訴三人他們過去所發生的事情以及被放逐至此的原因。

第10集：阿剛帶領一行人尋找離開岩石之底的出路。

第11集：其餘忍者們分別說服格克和莫安斯兩族進行停戰協議。骷髏巫士得知此事後使用哈薩杜爾的顱骨將災難之龍復活。


第12集：阿剛一行人抵達一座古老的神殿，並於其中發現一臺岩石機甲以及關於阿剛的母親—莉莉使用旋風爆擊術擊敗災難之龍的壁畫。


第13集：由於巨龍加夫的到來，旋風忍者，蒙斯和吉克爾人在吉克爾強洞穴避難。但是，蒙斯和吉克爾之間的痛苦仇恨卻令他們不得不分開，就在最需要團結的時候即將要面對骷髏魔法師和巨龍加夫！


第14集：阿剛、「卑鄙的人」、凡妮雅公主和胡師父發現石頭機械是由大地元素產生出來的，並將其附加到礦車上，試圖衝出山頂與邪惡的骷髏魔法師對抗！


第15集：阿剛和烏普利到達骷髏魔法師的住所，希望能拯救勞埃德和其他忍者。但是，為了做到這一點，阿剛需要找回母親寓言中的寶劍，即解脫之刃，這些實劍藏在城堡的某個地方！


第16集：申塔羅的命運之戰結束了！
劇情 > 特輯「神秘島嶼」「The Island」

由美莎子、胡大師和克勞奇鮑爾斯率領的探險隊不見了！在如此多的危險之下，忍者開始了對一個充滿驚奇的神秘而未知的島嶼進行救援任務。
劇情 > 第十四季「航向大海」「Seabound」

忍者們離開神秘島後不久，赤蘭發現她的水元素之力漸漸地不受控制。為了調查水元素之力失控的原因，忍者們以及赤蘭的母親瑪雅一起搭乘潛水艦「水力使命號」前往深海一探究竟，卻無意闖入了水下五千英尋的無盡大海神殿。在那裡，他們發現了位在深海的「梅洛比安王國」。這個王國被崔瑪國王領導著，所有居民在那裡的生活無憂無慮，過得非常幸福。但是崔瑪的兒子柯瑪卻內心邪惡，他決定用護身符來喚醒海上巨獸「沃吉拉」，來侵略陸地上的世界。柯瑪為了自己的野心，殺死了他的爸爸並嫁禍給忍者們，並且找到了護身符，喚醒了沃吉拉，向忍者城進攻。忍者城淪陷，已經被淹的不像樣子，居民們的處境十分危險。就在這時，赤蘭為了大家，不顧一切與海洋融為了一體，最終與大家齊心協力打敗了柯瑪並消滅了沃吉拉。最後，赤蘭壯烈犧牲，化成了海水。
劇情 > 第十四季「航向大海」「Seabound」 > 支線劇情 > 梅洛比安人是這個國度的原住民

初代旋風忍術大師自起始國度移居過來之前，梅洛比安人就已經居住於此，當時在的世界是無盡海洋，由「沃吉拉」所支配。初代旋風忍術大師在梅洛比安人的協助下打敗沃吉拉，並創造了忍者國。
劇情 > 第十四季「航向大海」「Seabound」 > 支線劇情 > 風和水元素並非起始元素

初代旋風忍術大師留下的卷軸記載了他如何修習並精通了所有的元素之力，除了風和水元素，因為這兩種元素力並不屬於初代旋風忍術大師，而是屬於「沃吉拉」，這兩種元素之力，恰好與沃吉拉頭上的兩種元素護身符相應。
劇情 > 第十五季「水晶王國」「Crystalized」

忍者們因赤蘭的離開而各自消沉並另尋他職，旋風忍者城現由市長指派的新忍者們接管忍者們的位置。直到忍者們想出利用阿斯菲拉及其長刀的能力消除掉赤蘭的元素力量，這樣一來赤蘭便能從海水變回人類。忍者們的計畫成功，赤蘭變回了人類回到大家身旁，但忍者們也因幫助阿斯菲拉越獄而遭判刑。與此同時，神秘的「水晶國王」正組建由惡棍們組成的水晶議會，成員包括阿斯菲拉、彼拉、凡吉利斯和F先生（E先生的新型號）。忍者們在化身X武士的赤蘭拯救而逃獄，重返旋風忍者城尋找企圖加入水晶議會的機械工，但機械工從忍者們的手中逃脫，導致偽裝成機械工潛入議會的勞埃德曝露身分，同時揭曉協助水晶國王招募議會成員的神祕面具人是晴美。晴美欺騙勞埃德循線而來的四位忍者們已遭殺害並試圖說服其加入水晶議會，與此同時其餘議會成員攻陷旋風忍術道場並利用奪來的黃金武器召喚出水晶國王的實體，後者賦予其手下水晶力量並將議會所在的鬼怪神廟化為漂浮的水晶島朝著旋風忍者城逐漸逼近；失去道場的忍者一行人以武士X基地做為臨時據點重振旗鼓並隨後與成功逃出水晶島的勞埃德會合。吳大師與勞埃德找到隱居城內的伽瑪當，並發覺伽瑪當父子的鬼怪形體可能是擊退復仇石大軍的重要關鍵。
角色 > 正面 > Ninjago的創造者

初代旋風術大師（First Spinjitzu Master）