拆弹专家2
劇情

一列載有核彈的港鐵列車衝入香港國際機場後發生爆炸，造成巨大破壞及人命傷亡，為何會發生這樣的悲劇？答案是人的憤怒可以摧毀一切，然而慶幸的是，有人戰勝憤怒從而阻止這場災難的發生。
一個劫匪打劫一間鐘錶店，離開前他將一枚手榴弹交給一個女孩用手握住。身穿防爆衣的拆彈專家潘乘風（劉德華飾）進入店內，他脫下防爆衣蓋住女孩，然後將手榴彈拿出來扔進一個沙包陣裡引爆，引起拆彈隊友董卓文（劉青雲飾）對其脫掉防爆服的責怪，乘風辯護道他這樣做是為了令女孩的緊張情緒穩定下來。某天夜晚，有人從七樓投擲腐蚀性液體砸到廟街樓下大排檔的餐桌上，造成食客恐慌並報警。重案組總督察李耀昇（姜皓文飾）帶人上樓搜查，進入一個布滿線路的住宅單位內，有一對夫婦分別被綁在裝有炸彈的相鄰兩個房間，原來是那名女子前男友的報復行為。涉案男子被重案組探員拘捕後，穿著防爆服的乘風和卓文分別進入兩個房間，二人將被綁的夫婦救出後，採取同時剪線的辦法成功拆除壓力引爆炸彈。但就在他們準備離開時，乘風發現有隻貓被關在單位大廳內的微波炉裡，當他打開爐門將貓放出來時，暗藏在微波炉內的壓力炸彈被引爆，造成七樓單位地下被炸毀，乘風被炸傷後跌落六樓導致左腿重傷，以及卓文的一隻手被燒傷。事後乘風左腿被截肢，而卓文則無大礙。失去一條腿的乘風戴上義肢，在同是當警察的女友龐玲（倪妮飾）和隊友卓文的關照下，憑藉其頑強的意志和優異的身體素質，做了大量超出常人的身體鍛鍊和康復工作，並經常服用加巴喷丁治癒疼痛，只為能儘快回到小組繼續拆彈工作。
五年後，戴上口罩的乘風將一個手提包放進一個儲物櫃裡，後來一個年輕男子取出手提包，並身穿博士服來到一座政府辦公大樓，進入四十樓的教育統籌局辦公室後拿出遙控器引爆藏在博士服內的炸彈，造成多名人員傷亡。針對此次人體自爆事件引起的恐慌，警方對媒體表示香港不是恐怖組織襲擊的目標；另一方面，身為反恐特勤隊總督察的玲則被警務處副處長陳Sir（鄭子誠飾）委以重任，負責調查此宗爆炸案。原來那名自爆的博士生叫張志文（蔡瀚億飾），他的博士生女友於六個月前跳樓自殺，導致他最近加入一個叫「復生會」的極端組織展開獨狼式的恐怖襲擊。該組織首腦為馬世軍（謝君豪飾）和「大衛」，世軍是一個香港富家子弟，畢業於倫敦政治經濟學院，後來成為一個無政府主義者，參加過西雅圖示威活動，回港後因痛恨其家族財富來自於鸦片贸易，就在港策劃領導一次襲擊國際快餐連鎖店的暴力事件，保釋期間棄保潛逃離港。幾年前警方得知世軍利用假護照秘密回港，並招募一批人準備伺機展開恐怖活動，陳Sir讓玲追查馬的下落，並查清另一領導人「大衛」的真實身份。
幾個月後，乘風駕駛一輛車子到一間餐館附近，他在餐館內喝咖啡時一名年輕男子上前檢查裝載於車子內的手提包，卻在開走車子時與另一輛剛經過的車子發生碰撞，引來交通警察前來調查，在旁觀望的乘風悄悄將車內的手提包取走。晚上，在一間五星級酒店「香島酒店」裡，穿上酒店員工制服的乘風將一個啟動亮燈儀式的控制架擺好，當他在三樓準備搭升降機離開時遇到酒店一名外籍保安的盤問，乘風就在升降機內與之打鬥並制伏對方，酒店安保中心通過閉路電視發現此情況就鎖住該升降機並派人去圍捕乘風。乘風將保安絞暈後拆掉閉路電視攝像頭，再經升降機井道爬到一部運行中的升降機而逃到十樓。乘風為躲避保安闖進一間客房，在聽到亮燈儀式即將開始和房外保安獲得房卡開門後，就從客房露臺跳進酒店的游泳池，亮燈操控杆啟動後發生大爆炸造成巨大傷亡和破壞力，並使得游泳池底外牆被震至碎裂，導致躲在池底的乘風隨著水流墜落到地面撞傷頭部陷入昏迷，其義肢也脫落。帶隊前來調查爆炸案的玲和卓文在此見到許久未見並昏迷中的乘風，儘管兩人都不願相信案件是乘風所為，不過其已成為爆炸案的重大犯罪嫌疑人。陷入昏迷的乘風被送入「明心醫院」接受治療，負責偵辦爆炸案的總督察耀昇在乘風醒來後質問其所幹之事，然而此時乘風卻已失憶，對他自己、別人以及自己的所作所為毫無印象。通過醫療儀器對其腦部的檢測，警方得知乘風患上「創傷後失憶」，其「陳述性記憶」全失，只保留「程序性記憶」。世軍與「復生會」成員見面，包括「金錢（袁富華飾）」錢家安、「奴隸（劉浩龍飾）」司徒偉、「狙擊手（凌文龍飾）」小克、還有「犀牛（馬浴柯飾）」以及其所領導的一批僱傭兵，世軍表示「復生日」即將來臨，而這一計劃的實現除了等待「大衛」的到來，不能缺少組織重要成員「暴雪」的參與，原來「暴雪」就是乘風的暗號，所以「復生會」就派人到醫院把乘風救出。
坐在輪椅上的乘風被帶去進行磁力共振掃描時，從升降機告示上得悉義肢及矯形部在二樓，準備伺機逃離醫院，他趁掃描前被除下手銬時，從負責看守的一名警察搶到一支手枪，恰好遇到世軍派來解救他的多名「復生會」僱傭兵，手持重型槍械的僱傭兵與總督察耀昇帶領的警察在醫院發生激烈槍戰導致多人傷亡，乘風就趁機躲避警察的追捕，並進入二樓的義肢房找到一副義肢裝到自己腿部，再跳到地下用槍脅迫一名廂型車司機逃離醫院。後來他用被劫持司機的錢購買一部舊式手機和一張电话卡，根據腦中記憶撥打一個手機號碼，原來是玲的手機號碼，但她收到後並未接聽。乘風又到一個网吧上網，通過搜索「潘乘風」得知自己以前是名拆彈專家，在一次任務中失去一條腿。跟他關係很好的同事叫董卓文，並用手機拍下卓文的相片。在乘風準備離開網吧時，被通過天網監控得知其下落前來追捕他的耀昇人馬發現，反恐特勤隊隊員亦加入追捕。身手敏捷的乘風拼命逃竄，跑進人流密集的花園街與市集內，可是都還是被追捕他的隊員包圍，於是闖入一間超級市場利用麵粉製造粉塵燃燒，再從後門躲入通菜街一個小巷並遇到玲，通過確認其撥打過的那個手機號碼，得知玲就是他要找之人。玲問乘風「執行的任務」是否還要繼續下去，令他感到茫然，之後玲幫他躲避警方的追捕。
乘風根據搜尋得來的資料，跟蹤卓文並進入他的車子內，翌日卓文上車時，乘風用槍脅迫卓文到一個偏僻之地，追問他自己是一個怎樣的人。卓文講出三個階段的潘乘風：斷腿前他是一個不顧個人安危盡職盡責的拆彈專家，斷腿後行事偏激與周圍同事關係都鬧僵。只因他不願屈從上級吩咐他從事非前線職位的安排，不僅與上司當面言語衝突，還在一次警隊的授勳典禮會場上公開展示一個寫上「警隊忘恩負義 用完即棄」的黑色橫幅表達對警隊的不滿情緒，被新聞媒體大肆報導。後來乘風離開警隊從事修車工作，很少與以前的警隊同事來往，只出席過卓文母親的喪禮。乘風又問，玲告知他還有任務在身，但不知是什麼任務，卓文對此也感到費解，因為乘風已離開警隊多年。事後卓文去找玲詢問乘風有什麼任務，玲以乘風的任務是警隊機密為理由不能回答。
玲約乘風在車內會面，講述乘風的一些過往經歷，包括兩人在酒會上的相遇、乘風在斷腿後的性情大變、因工作調動的不滿導致他主動提出的分手，還有就是乘風在做修車工作時玲請他成為潛入「復生會」之「臥底任務」。後來玲又帶乘風到一個聲稱是其秘密居住地的住址，並交給他一個有竊聽和定位功能的手表，期望他能繼續完成任務，制止「復生會」的恐怖襲擊。玲離開後，乘風以「臥底」的身份在互聯網聯繋「復生會」，並相約前往其秘密據點。
卓文在警局內向陳Sir查問乘風的「任務」是什麼，原來乘風在酒店爆炸案中失憶後，玲向陳Sir獻出一計，在心理學家和腦科醫師的幫助下，向乘風的腦部植入一些假記憶。例如：龐玲、電話號碼和「臥底任務」等信息，以讓乘風能成為玲聯繫負責的「臥底」，為警隊效力。卓文指責玲與陳Sir不該如此利用乘風，玲則辯稱這樣做其實是在幫助乘風和救贖他所牽涉的酒店爆炸案，使乘風因為協助警方制止「復生會」的恐襲，而有機會得到法官輕判。
乘風在咖啡店被「復生會」派岀的一輛多功能休旅車送往「復生會」的秘密據點，這是一艘躉船，躉船內幾名成員都歡迎暗號為「暴雪」的乘風歸來。乘風通過視頻連線看到世軍以及「大衛」，原來大衛不是人物，而是美军在冷战時期研發的一種小型核彈——「大衛炮」。「犀牛」還告訴乘風原來居住的地方已被警察包圍並呼吁他不要再回去，乘風通過視頻看到該處與玲之前帶他去的住址並非同一地點，使他意識到玲所言並非實情，自己是「復生會」真正成員而非臥底，之後他將那塊手錶取下裝入一個袋子裡，令警方無法再竊聽到「復生會」的情況。
「復生會」成員「狙擊手」小克放置一個箱式炸彈置於一處廣場地面上，其他成員把躉船開到公海後通過現場直播來讓他們觀看過程。卓文身穿防爆服負責拆解炸彈，發現此炸彈若爆炸會破壞地下電纜並引起地下天然氣的大爆炸，造成區域性災難。卓文通過炸彈上面所放的一部手機與身在廣場附近一座樓頂的「狙擊手」通話。「狙擊手」問卓文能不能一邊拆彈一邊拯救同事，接著卓文吩咐拆彈同事陳景圖取工具給他，豈料景圖受到狙擊腿部受傷倒地，另一位同事想要救景圖時也中彈倒地。忙於拆彈的卓文背部受到多次狙擊但因有防爆服保護並無大礙，多次被擊中的景圖與另外一人則不幸罹難，卓文成功拆彈後，玲率領隊員抵達「狙擊手」所在之樓頂將其擊斃。兩名警員與「狙擊手」之死分別讓警方與「復生會」都感到悲痛，並使到觀看直播的乘風再次發生重要的內心轉變，為警員殉職難過的他又重新戴上那塊手錶決心為警方效力。
警方在兩名警員殉職的地點做法事時，乘風再次去見玲，對她表示已知道自己是真的恐怖分子而非臥底，但是願意繼續為警隊效力，亦告訴她「大衛」就是一組核彈以及其破壞力，最後兩人吻別分開。乘風回到躉船後被同夥綁起來帶到世軍所在的大本營，並把躉船炸毀，原來乘風與玲秘密碰面被發現，結果乘風被世軍禁錮。乘風辯解自己只是去跟前女友見面，可是她的身份已被「復生會」成員查出。世軍稱自己像《水滸傳》裡的晁盖負責出錢，而乘風似宋江負責出點子，但是最後宋江卻被朝廷招安出賣組織害了大家。世軍質問乘風為何要出賣組織，因為參考1993年世界貿易中心爆炸案的「復生日」計劃可是乘風自己想出來的。乘風辯稱自己什麼都不記得，世軍就向其說出兩人過往經歷：小学時乘風出手相助經常被同學欺負的世軍，二人成為好友，但後來世軍往英國留學，兩人漸漸沒有來往。年輕時厭惡政府的世軍後來發現乘風加入警隊成為拆彈專家，感到十分失望，直到世軍看到乘風因拆彈工作時斷腿以及後來與警隊間出現矛盾的新聞，以及從網上看到疑似是乘風寫下極端思想的留言，促使世軍主動寫信給乘風並附上一張機票，令二人多年後終於在尼泊尔重逢。在玩高空跳伞時兩人產生一致的極端報復思想——需要用游離輻射去「淨化」這個已經「病態癌化」的世界。已失去這段記憶的潘乘風此時知道「復生日」的策劃乃源自他本人，卻因為良心發現，所以苦苦哀求世軍停止恐襲，但世軍決心已定，他開啟綁在乘風頸上的倒數計時炸弹裝置後，帶領大批人馬以及裝有武器的車子離開大本營去執行2月26日當天的「復生日」恐襲計劃。玲和卓文等人通過追蹤手錶定位來到大本營，乘風就告訴他們「復生會」正前往國際金融中心展開恐襲計劃，卓文拆除炸彈時乘風回憶起小時候與世軍玩過的一款排列組合遊戲珠璣妙算，讓卓文用一致的四個紅色小珠幫其解開密碼鎖逃過一劫。「復生會」據點的圖紙令乘風回想起來部分記憶，於是與隊員一起立即趕赴國金阻止恐襲。
「復生會」兩名成員「金錢」與「奴隸」將一輛載有大量C4炸药的廂型車開入國金地庫停車場的主力結構柱旁，計劃炸倒二期再砸倒西南方的一期。同時，「犀牛」率領一組僱傭兵衝入青衣車務控制中心，世軍就率領另一組僱傭兵衝入港鐵香港站挾持多位人质，將數枚小型核彈「大衛」和另一批C4炸药搬進一列機場快綫車廂內由世軍駛離香港站。
根據乘風回憶與陳Sir指揮調度，拆彈小組警長倫定邦（吳卓羲飾）與另一名同事肥司（趙永洪飾）在停車場裡尋找炸藥車，「金錢」與「奴隸」開槍試圖制止他們時被擊斃。拆彈小組找到那輛已開啟引線的炸藥車後，隨即熄滅引線並把車子開走。當得知「復生會」已將核彈和C4炸药搬運到世軍駕駛的機場快綫列車上，乘風回想起「復生日」計劃還利用炸開的兩節C4炸藥車廂炸毀沿途重要基建、最後利用裝有核彈的前部車廂炸毀香港國際機場，於是提議通過青衣車務控制中心將世軍駕駛之列車煞停於青馬大橋，然後再用炸藥車內的炸藥炸斷兩端大橋將列車落入馬灣海峽中引爆核彈，以此來降低核輻射之破壞力。駕駛列車的世軍在經過九龍站時將後面一列車廂炸斷，欲利用車廂裡的C4炸藥炸毀九龍站及附近的西九龍環球貿易廣場和圓方，定邦駕駛一輛停在附近軌道上的空置列車推動那列車廂向大橋方向而去。警方使用一架直升機吊起乘風與卓文搭乘的那輛炸藥車趕赴青馬大橋，兩人將車上的炸藥綁在大橋南側兩邊的吊柱上。同時玲帶領一批特警乘坐另一架直升機從樓頂攻入青衣車務控制中心，切斷照明後佩戴夜視鏡並打死劫持那裡的多名「復生會」成員，然而列車控制設備卻因中彈而失去控制功能，無法截停世軍的列車。當得知無法截停列車而引爆後乘直升機逃離安全區域的時間又不夠時，乘風堅持獨自留下來引爆炸藥，讓卓文乘坐直升機立即離開，因為他要對自己犯下的過錯負責。世軍的列車行駛到大橋東端後又有一節車廂被炸停，乘風在列車到達大橋中間時引爆炸藥，大橋斷裂令急駛而來的列車墜入海底，劇烈撞擊力引爆車內核彈，乘風與世軍同歸於盡，大爆炸引起的衝擊力令珀麗灣的玻璃震碎，而爆炸引起的海啸向馬灣衝去。面對此次毀滅性的爆炸場面以及乘風的壯烈犧牲，讓坐在直升機裡的卓文、駕駛列車的定邦，以及在電話那端負責指揮調度的玲等人都悲痛不已。
事後，一直對於乘風念念不忘的玲對臨床心理學家王教授說自己想通過醫療手段清除個人記憶，但她卻不願忘記與乘風在酒會上初次相識的那次經歷。當時乘風故意將紅酒倒在她的制服上而引起她注意。