Giai đoạn vòng loại và vòng play-off UEFA Europa League 2019–20
Vòng loại thứ hai > Xếp hạt giống

Tổng cộng có 18 đội tham dự vòng loại thứ hai Nhóm các đội vô địch giải quốc nội.
Nhóm hạt giống: 15 trong số 16 đội thua của vòng loại thứ nhất Champions League (ngoại trừ đội thua của vòng loại thứ nhất Champions League được nhận suất vào thẳng vòng loại thứ ba được xác định bởi một lượt bốc thăm bổ sung sau khi bốc thăm vòng loại thứ nhất Champions League)
Nhóm không hạt giống: 3 đội thua của vòng sơ loại Champions League
Các đội được chia làm ba nhóm 6 đội, trong đó 5 đội được xếp vào nhóm hạt giống và một đội được xếp vào nhóm không hạt giống.
| Nhóm các đội vô địch giải quốc nội> Vào thẳng vòng loại thứ ba (được xác định bởi lễ bốc thăm).Vào thẳng vòng loại thứ ba (được xác định bởi lễ bốc thăm) | Nhóm các đội vô địch giải quốc nội> Nhóm 1.Nhóm hạt giống | Nhóm các đội vô địch giải quốc nội> Nhóm 1.Nhóm không hạt giống | Nhóm các đội vô địch giải quốc nội> Nhóm 2.Nhóm hạt giống | Nhóm các đội vô địch giải quốc nội> Nhóm 2.Nhóm không hạt giống | Nhóm các đội vô địch giải quốc nội> Nhóm 3.Nhóm hạt giống | Nhóm các đội vô địch giải quốc nội> Nhóm 3.Nhóm không hạt giống |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- |
|  Sarajevo |   Piast Gliwice   Partizani   Sūduva   Sheriff Tiraspol   Riga  |  Tre Penne |   Ludogorets Razgrad   Valur   Feronikeli   Slovan Bratislava   Ararat-Armenia  |  Lincoln Red Imps |   Astana   Linfield   HB Tórshavn   F91 Dudelange   Shkëndija  |  FC Santa Coloma |
Tổng cộng có 74 đội tham dự vòng loại thứ hai Nhóm chính: 27 đội tham dự vòng đấu này, và 47 đội thắng của vòng loại thứ nhất. Các đội được chia làm bảy nhóm: năm nhóm 10 đội, trong đó 5 đội được xếp vào nhóm hạt giống và 5 đội được xếp vào nhóm không hạt giống, và hai nhóm 12 đội, trong đó 6 đội được xếp vào nhóm hạt giống và 6 đội được xếp vào nhóm không hạt giống. Các nhóm được ấn định trước cho mỗi đội bởi UEFA, với lễ bốc thăm được tổ chức trong hai lượt, một lượt cho Nhóm 1–5 với 10 đội và một lướt cho Nhóm 6–7 với 12 đội.
| Nhóm chính> Nhóm 1.Nhóm hạt giống | Nhóm chính> Nhóm 1.Nhóm không hạt giống | Nhóm chính> Nhóm 2.Nhóm hạt giống | Nhóm chính> Nhóm 2.Nhóm không hạt giống | Nhóm chính> Nhóm 3.Nhóm hạt giống | Nhóm chính> Nhóm 3.Nhóm không hạt giống |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- |
|   Espanyol (2)   Hapoel Be'er Sheva (3)   Arsenal Tula (5)   Liepāja (1)   Atromitos (4)  |   Kairat (9)   Stjarnan (8)   IFK Norrköping (6)   DAC Dunajská Streda (10)   Neftçi Baku (7)  |   Legia Warsaw (5)   AEK Larnaca (3)   FC Utrecht (2)   Sturm Graz (1)   Jablonec (4)  |   Zrinjski Mostar (8)   KuPS (7)   Haugesund (6)   Pyunik (10)   Levski Sofia (9)  |   Eintracht Frankfurt (4)   Fehérvár (3)   Brøndby (1)   Yeni Malatyaspor (2)   Gabala (5)  |   Flora (10)   Vaduz (9)   Lechia Gdańsk (6)   Olimpija Ljubljana (8)   Dinamo Tbilisi (7)  |
| Nhóm 4 | Nhóm 4 | Nhóm 5 | Nhóm 5 |  |  |
| Nhóm hạt giống | Nhóm không hạt giống | Nhóm hạt giống | Nhóm không hạt giống |  |  |
|   Malmö FF (1)   Molde (3)   Zorya Luhansk (4)   KAA Gent (2)   Aberdeen (5)  |   Čukarički (9)   Domžale (6)   Viitorul Constanța (8)   Chikhura Sachkhere (7)   Budućnost Podgorica (10)  |   Torino (3)   Gżira United (4)   Osijek (1)   Luzern (5)   Rangers (2)  |   Debrecen (9)   Ventspils (10)   Progrès Niederkorn (8)   CSKA Sofia (6)   KÍ Klaksvík (7)  |  |  |
| Nhóm 6 | Nhóm 6 | Nhóm 7 | Nhóm 7 |  |  |
| Nhóm hạt giống | Nhóm không hạt giống | Nhóm hạt giống | Nhóm không hạt giống |  |  |
|   FCSB (2)   Apollon Limassol (3)   Strasbourg (4)   AZ (5)   Spartak Trnava (6)   Mladá Boleslav (1)  |   Alashkert (9)   BK Häcken (8)   Shamrock Rovers (12)   Ordabasy (7)   Maccabi Haifa (11)   Lokomotiv Plovdiv (10)  |   Partizan (6)   Wolverhampton Wanderers (4)   Vitória de Guimarães (3)   Honvéd (5)   Esbjerg (2)   Aris (1)  |   AEL Limassol (7)   Connah's Quay Nomads (10)   Shakhtyor Soligorsk (9)   Crusaders (11)   Jeunesse Esch (12)   Universitatea Craiova (8)  |  |  |
† Đội thắng của vòng loại thứ nhất. Đội bóng được thể hiện bằng chữ in nghiêng đánh bại đội bóng có hệ số cao hơn, qua đó chiếm lấy hệ số của đối thủ trong lễ bốc thăm.
‡ Roma và Antwerp ban đầu được thêm vào trong lễ bốc thăm nhưng sau đó lần lượt được vào thẳng vòng bảng và vòng loại thứ ba, sau khi Milan và KV Mechelen bị loại trừ khỏi giải đấu. Họ được thay thế ở vòng loại thứ hai lần lượt bởi Torino và KAA Gent (nếu ban đầu họ được thêm vào ở lễ bốc thăm, cả hai đội cũng được xếp vào nhóm hạt giống).