stanford-oval/wikipedia huggingface dataset:
Limfjorden

Vị trí Limfjorden trên bản đồ bán đảo Jutland.
Một cầu ngang qua Limfjorden nối 2 thành phố Aalborg và Nørresundby)
Limfjorden ([ˈliːmˌfjoːˀɐn]) là tên  1 Vịnh hẹp khoét sâu vào đất liền của Đan Mạch, ở phần bắc bán đảo Jutland, nay đã thành 1 eo biển, ngăn cách đảo Nørrejysk với phần bán đảo Jutland còn lại ở phía nam. Limfjorden bắt đầu từ Kênh Thyborøn ở phía  Bắc Hải tới thành phố Hals phía Kattegat, dài khoảng 180 km và có dạng bất thường với nhiều vịnh nhỏ bên trong và có một số đảo, trong đó đảo lớn nhất là đảo Mors. Chỗ sâu nhất của Limfjorden ở Hvalpsund (24 m). Cảng chính trong Vịnh hẹp này là cảng Aalborg, nơi có 1 cầu dành cho xe hơi và xe lửa ngang qua vịnh hẹp Limfjorden tới thành phố Nørresundby, trong khi xa lộ châu Âu E45 chạy xuyên qua vịnh hẹp này trong 1 đường hầm ở phía đông.
Tên Limfjorden gồm Lim (gốc từ tiếng Đức vùng cao - High German)(tiếng Anh: lime=vôi) + fjord(en): vịnh hẹp khoét sâu vào đất liền. Đá vôi ở Vách đá Bulbjerg gần Vust (cửa phía tây cũ của Vịnh) vẫn bị các đợt sóng từ Bắc Hải làm cho xói mòn, chảy vào vịnh này. Bề mặt vôi được nhìn thấy rõ ở Aalborg, (vôi được dùng để sản xuất xi-măng trong nhà máy xi-măng Aalborg)
Lịch sử

Ban đầu, Limfjorden nối với Bắc Hải ở cửa vịnh phía tây tại Vust. Vua Knud Cả (tiếng Anh: Canute the Great) đã đi tàu buồm từ Anh về Đan Mạch qua Limfjorden năm 1027. Theo Saxo Grammaticus thì cửa chỗ Vust đó bị cát lấp đầy và trở thành vịnh hẹp khoảng năm 1200. Ngày 3.2.1825 một trận bão lụt đã phá vỡ quãng gọi là kênh Agger ở phía tây bắc dài khoảng 13 km và rộng gần 1 km khiến Limfjorden trở thành eo biển. Rồi quãng này lại bị cát lấp đầy dần năm 1877.
Nhưng trước đó, năm 1862, một trận bão lụt khác đã phá qua eo đất chỗ kênh Thyborøn (xem hình vệ tinh), nên Limfjorden ngày nay trở thành eo biển.
Limfjorden nổi tiếng về loài vẹm  (Mytilus edulis) và loài hàu (oysters) rất lớn và rất ngon.
Các cầu qua Limfjorden

(từ tây qua đông):
Cầu Oddesund, bắc Struer tới Thyholm.
Cầu Sallingsund, nố Salling với đảo Mors và cầu Vilsund tiếp tục tới Thy.
Cầu Aggersund, nối Han Herred với Himmerland ở Løgstør.
Cầu đường sắt ở phía tây trung tâm thành phố Aalborg.
Cầu Limfjord ở trung tâm thành phố Aalborg tới thành phố Nørresundby.
Ngoài ra, còn đường hầm Limfjord phía đông trung tâm thành phố Aalborg.
Vịnh nhỏ Odby
Les Bordes, Indre

| --- | --- |
 Les Bordes
Les Bordes

Hành chính
Quốc gia:  Pháp
Vùng: Centre-Val de Loire
Tỉnh: Indre
Quận: Issoudun
Tổng: Issoudun-Nord
Liên xã: Pays d’Issoudun
Xã (thị) trưởng: Dominique Delpoux (2001-2008)
Thống kê
Độ cao: 123–164 m (404–538 ft) (bình quân 176 m (577 ft)[chuyển đổi: tùy chọn không hợp lệ])
Diện tích đất1: 16,3 km2 (6,3 dặm vuông Anh)
Nhân khẩu1: 936  
 - Mật độ: 57/km2 (150/sq mi)
INSEE/Mã bưu chính: 36021/ 36100

2 Dân số không tính hai lần: cư dân của nhiều xã (ví dụ, các sinh viên và quân nhân) chỉ tính một lần.
Les Bordes là một xã tại tỉnh Indre khu vực trung bộ Pháp. Xã này có diện tích 16,3 km², dân số thời điểm năm 1999 là 936 người. Khu vực này có độ cao trung bình 176 mét trên mực nước biển.
Nyctemera venata

| Nyctemera venata> Phân loại khoa học |
| --- | --- |
Giới (regnum): Animalia
Ngành (phylum): Arthropoda
Lớp (class): Insecta
Bộ (ordo): Lepidoptera
Họ (familia): Erebidae
Chi (genus): Nyctemera
Loài (species): N. venata
Danh pháp hai phần
Nyctemera venata
Nyctemera venata là một loài bướm đêm thuộc phân họ Arctiinae, họ Erebidae.
Chú thích

↑  Bisby, F.A.; Roskov, Y.R.; Orrell, T.M.; Nicolson, D.; Paglinawan, L.E.; Bailly, N.; Kirk, P.M.; Bourgoin, T.; Baillargeon, G.; Ouvrard, D. (2011). “Species 2000 & ITIS Catalogue of Life: 2011 Annual Checklist”. Species 2000: Reading, UK. Truy cập ngày 24 tháng 9 năm 2012.
Nyírvasvári

| Nyírvasvári |
| --- | --- |
—  Thị trấn  —
 
 Huy hiệu của Nyírvasvári Huy hiệu
Nyírvasvári
Quốc gia:  Hungary
Hạt: Szabolcs-Szatmár-Bereg
Tiểu vùng: Nyírbátori
Diện tích
 • Tổng cộng: 28,43 km2 (10,98 mi2)
Dân số (2010)
 • Tổng cộng: 1.932
 • Mật độ: 68/km2 (180/mi2)
Múi giờ: CET (UTC+1)
 • Mùa hè (DST): CEST (UTC+2)
4341 
Mã điện thoại: 42 
Nyírvasvári là một thị trấn thuộc hạt Szabolcs-Szatmár-Bereg, Hungary. Thị trấn này có diện tích 28,43 km², dân số năm 2010 là 1932 người, mật độ 68 người/km².
Nothochrysa capitatus

| Nothochrysa capitatus> Phân loại khoa học |
| --- | --- |
Giới (regnum): Animalia
Ngành (phylum): Arthropoda
Lớp (class): Insecta
Bộ (ordo): Neuroptera
Họ (familia): Chrysopidae
Chi (genus): Nothochrysa
Loài (species): N. capitatus
Danh pháp hai phần
Nothochrysa capitatus Fabricius, 1793 
Nothochrysa capitatus là một loài côn trùng trong họ Chrysopidae thuộc bộ Neuroptera. Loài này được Fabricius miêu tả năm 1793.
Chú thích

↑  Oswald, J. D. (2007). Neuropterida Species of the World. Version 2.0.
Nyctemera warmasina

| Nyctemera warmasina> Phân loại khoa học |
| --- | --- |
Giới (regnum): Animalia
Ngành (phylum): Arthropoda
Lớp (class): Insecta
Bộ (ordo): Lepidoptera
Họ (familia): Erebidae
Chi (genus): Nyctemera
Loài (species): N. warmasina
Danh pháp hai phần
Nyctemera warmasina
Nyctemera warmasina là một loài bướm đêm thuộc phân họ Arctiinae, họ Erebidae.
Chú thích

↑  Bisby, F.A.; Roskov, Y.R.; Orrell, T.M.; Nicolson, D.; Paglinawan, L.E.; Bailly, N.; Kirk, P.M.; Bourgoin, T.; Baillargeon, G.; Ouvrard, D. (2011). “Species 2000 & ITIS Catalogue of Life: 2011 Annual Checklist”. Species 2000: Reading, UK. Truy cập ngày 24 tháng 9 năm 2012.
Lute

Vài loại đàn luýt được trưng bày tại Viện bảo tàng Đức
Lute (/ljuːt/  hoặc /luːt/), còn gọi là đàn luýt là bất kỳ nhạc cụ dây nào có cổ đàn và lưng tròn sâu bao quanh một khoang rỗng, thường có lỗ âm thanh hoặc mở trong thân đàn. Nó có thể được chặn khung hoặc không có chặn khung
Cụ thể hơn, thuật ngữ "lute" có thể chỉ một nhạc cụ từ gia đình của những người châu Âu. Thuật ngữ này cũng thường dùng để chỉ bất kỳ nhạc cụ dây nào có dây chạy trong mặt phẳng song song với bảng âm thanh (trong hệ thống Hornbostel-Sachs).
Các dây được gắn vào các chốt hoặc cột ở cuối cổ đàn, có một số loại cơ chế xoay để cho phép người chơi tăng độ căng của dây hoặc nới lỏng độ căng trước khi chơi (tương ứng tăng hoặc giảm độ cao của âm thanh của dây), sao cho mỗi dây được điều chỉnh đến một cao độ cụ thể (hoặc nốt). Cây đàn được gảy hoặc đập bằng một tay trong khi tay kia "chặn dây" (ấn xuống) dây trên bảng điều khiển của cổ đàn. Bằng cách nhấn các chuỗi trên các vị trí khác nhau của bảng điều khiển, người chơi có thể rút ngắn hoặc kéo dài phần của chuỗi đang rung, do đó tạo ra các nốt cao hơn hoặc thấp hơn.
Đàn luýt châu Âu và đàn oud Cận Đông hiện đại có nguồn gốc từ một tổ tiên chung thông qua các con đường tiến hóa khác nhau. Đàn được sử dụng trong rất nhiều nhạc cụ từ thời trung cổ đến cuối thời đại Baroque và là nhạc cụ quan trọng nhất cho âm nhạc thế tục trong thời Phục hưng. Trong âm nhạc Baroque thời đại, đàn luýt được sử dụng như một trong những công cụ mà chơi basso continuo đệm phần. Nó cũng là một nhạc cụ đi kèm trong các tác phẩm thanh nhạc. Người chơi đàn lute ngẫu hứng ("nhận ra") một bản đệm hợp âm dựa trên phần bass đã tìm, hoặc chơi một bản nhạc đệm (cả ký hiệu âm nhạc và bản nhạc ("tab") được sử dụng cho đàn). Là một nhạc cụ nhỏ, đàn lute tạo ra âm thanh tương đối yên tĩnh.
Nothochrysa capitata

| Nothochrysa capitata |
| --- | --- |

Phân loại khoa học
Giới (regnum): Animalia
Ngành (phylum): Arthropoda
Lớp (class): Insecta
Bộ (ordo): Neuroptera
Họ (familia): Chrysopidae
Chi (genus): Nothochrysa
Loài (species): N. capitata
Danh pháp hai phần
Nothochrysa capitata Fabricius, 1793 
Nothochrysa capitata là một loài côn trùng trong họ Chrysopidae thuộc bộ Neuroptera. Loài này được Fabricius miêu tả năm 1793.
Chú thích

↑  Oswald, J. D. (2007). Neuropterida Species of the World. Version 2.0.
Limonen

Limonen là một hydrocarbon aliphatic lỏng không màu được phân loại là một monoterpene tuần hoàn. Đây là thành phần chính trong dầu của vỏ trái cây có múi. Đồng phân D, xuất hiện phổ biến hơn trong tự nhiên dưới dạng hương thơm của cam, là một chất tạo hương vị trong sản xuất thực phẩm. Nó cũng được sử dụng trong tổng hợp hóa học như một chất tiền thân của carvone hoặc như một dung môi trong các sản phẩm tẩy rửa. Đồng phân L - ít phổ biến hơn có mùi giống như nhựa thông, và được tìm thấy trong các bộ phận ăn được của các loại thực vật như cây caraway, thì là hay cam bergamot.
Liparis refracta

| Liparis refracta> Phân loại khoa học |
| --- | --- |
Giới (regnum): Plantae
(không phân hạng): Angiospermae
(không phân hạng): Monocots
Bộ (ordo): Asparagales
Họ (familia): Orchidaceae
Chi (genus): Liparis
Loài (species): L. refracta
Danh pháp hai phần
Liparis refracta J.J.Sm. 
Liparis refracta là một loài thực vật có hoa trong họ Lan. Loài này được J.J.Sm. mô tả khoa học đầu tiên năm 1928.
Chú thích

↑  The Plant List (2010). “Liparis refracta”. Truy cập ngày 7 tháng 6 năm 2013.
Lucida (bướm nhảy)

| Lucida |
| --- | --- |

Phân loại khoa học
Giới (regnum): Animalia
Ngành (phylum): Arthropoda
Lớp (class): Insecta
Họ (familia): Hesperiidae
Tông (tribus): Moncini
Chi (genus): Lucida
Lucida là một chi bướm ngày thuộc họ Bướm nâu.
Oxanthera neocaledonica

| Oxanthera neocaledonica> Tình trạng bảo tồn |
| --- | --- |
 Nguy cấp  (IUCN 2.3)
Phân loại khoa học
Giới (regnum): Plantae
(không phân hạng): Angiospermae
(không phân hạng): Eudicots
(không phân hạng): Rosids
Bộ (ordo): Sapindales
Họ (familia): Rutaceae
Chi (genus): Oxanthera
Loài (species): O. neocaledonica
Danh pháp hai phần
Oxanthera neocaledonica (Guillaumin) Tanaka 
Oxanthera neocaledonica là một loài thực vật thuộc họ Rutaceae. Đây là loài đặc hữu của New Caledonia.
Metagenomics

Với Metagenomics ta có thể nghiên cứu các quần xã vi sinh vật, ví dụ như quần xã vi sinh ở dòng suối bị axit hóa do khai khoáng như ở hình trên.
Metagenomics là nghiên cứu về metagenomes, nhằm thu vật liệu di truyền trực tiếp từ các mẫu trong môi trường. Lĩnh vực rộng lớn này có thể được hiểu là di truyền học môi trường, di truyền học sinh thái hay di truyền học quần xã. Nếu như di truyền học và vi sinh vật học truyền thống giải trình tự bộ gen (genome sequencing) của vi sinh vật dựa trên mẫu là các mẫu dòng đã nuôi cấy, thì ngay từ những nghiên cứu đầu tiên, di truyền học môi trường đã nhân dòng các đoạn trình tự gen đặc hiệu (thường là gen 16S rRNA) để xây dựng dữ liệu về đa dạng sinh học của các mẫu môi trường. Với những nghiên cứu bước đầu đó, người ta đã nhận ra rằng nếu chỉ tiếp tục nghiên cứu theo kiểu truyền thống thì sẽ không thể tìm hiểu về sự đa dạng sinh học của vi sinh vật được. Những nghiên cứu metagenomics gần đây thường thực hiện bằng phương pháp Sanger ("shotgun" Sanger sequencing), hoặc song song với phương pháp pyrosequencing để có các mẫu của tất cả các gen từ mỗi cá thể trong quần xã mẫu. Chính vì vai trò quan trọng trong việc khám phá đa dạng vi sinh vật mà metagenomics có thể được coi như một lăng kính giúp ta hiểu hơn về thế giới của các sinh vật nhỏ bé, đóng góp vào hiểu biết của nhân loại về toàn bộ thế giới sống.
Nguồn gốc từ

Thuật ngữ "metagenomics" được giới thiệu bởi Jo Handelsman, Jon Clardy, Robert M. Goodman và một số người khác, và xuất hiện lần đầu trong một bài báo vào năm 1998. Thuật ngữ metagenome phản ánh ý tưởng về bộ sưu tầm các gen được giải mã trực tiếp từ môi trường với cách tương tự như nghiên cứu về từng genome. Kevin Chen and Lior Pachter (University of California, Berkeley) đã định nghĩa metagenomics là " việc ứng dụng các kỹ thuật di truyền hiện đại trong nghiên cứu về quần xã vi sinh vật một cách trực tiếp trong môi trường tự nhiên của chúng mà không cần phải phân lập và nuôi cấy chúng trong phòng thí nghiệm".
Lịch sử

Việc giải trình tự theo kiểu truyền thống thường bắt đầu bằng việc nuôi cấy các tế bào giống hệt nhau để làm nguồn phân lập DNA. Các nghiên cứu metagenomic đã cho thấy vẫn còn rất nhiều nhóm vi sinh vật trong tự nhiên mà chúng ta không thể phân lập và nuôi cấy được, và vì vậy không thể giải trình tự của chúng được. Những nghiên cứu đầu tiên của metagenomic tập trung vào đoạn trình tự của rRNA 16S (16S ribosomal RNA), là đoạn trình tự tương đối ngắn, bảo thủ và đặc trưng cho mỗi loài. Từ đó người ta đã phát hiện ra rất nhiều đoạn trình tự rRNA 16S mới, không giống bất cứ một loài đã biết nào. Những khảo sát về gen trên rRNA thực hiện trực tiếp từ môi trường đã cho thấy, số lượng loài vi khuẩn và vi khuẩn cổ (archaea) đã tìm thấy trước đây bằng phương pháp giải trình tự theo kiểu truyền thống chỉ tương đương khoảng 1% số lượng thực của chúng trong môi trường.
Những nghiên cứu đầu tiên ở mức độ phân tử đã được thực hiện bởi Norman R. Pace và các cộng sự. Họ sử dụng PCR để khám phá ra sự đa dạng của các trình tự rRNA. Với những kết quả của nghiên cứu này, vào năm 1985 Pace đã đề xuất ý tưởng nhân dòng DNA trực tiếp từ môi trường. Tới năm 1991 ông và cộng sự tại Khoa Sinh học, trường đại học Indiana đã có báo cáo đầu tiên về nhân dòng một lượng lớn DNA từ môi trường. Nghiên cứu của họ đã khẳng định rằng không hề có lỗi trong quá trình thực hiện PCR và những loài mới trong quần xã vi sinh vật là thực sự tồn tại. Mặc dù chỉ thực hiện với đoạn trình tự bảo thủ và không mã hóa, công trình trên đã chứng minh và giải thích tại sao các nghiên cứu về đa dạng sinh học trước đây bằng phương pháp hình thái học thường mang lại nhiều kết quả hơn so với phương pháp phân tích qua phân lập và nuôi cấy. Ngay sau đó, vào năm 1995 Healy đã công bố kết quả phân lập metagenomic của các gen chức năng trong "thư viện động vật" xây dựng từ hệ sinh vật tự nhiên trên cỏ khô trong phòng thí nghiệm. Sau khi rời phòng thí nghiệm của Pace, Edward DeLong  tiếp tục nghiên cứu về lĩnh vực này và đã xuất bản công trình làm nền móng cho phân loại sinh vật môi trường dựa trên trình tự 16S, đó là thành lập thư viện trình tự của các mẫu lấy từ biển.
Vào năm 2002, Mya Breitbart, Forest Rohwer và các cộng sự đã sử dụng phương pháp shotgun sequencing để chứng minh rằng trong 200 lít nước biển có chứa trên 5000 loài virus khác nhau. Nghiên cứu sau đó đã tìm ra khoảng hơn 1000 loài virus trong phân người và khoảng 1 triệu virus trong mỗi kilogam trầm tích biển, trong đó có rất nhiều thể thực khuẩn. Năm 2004 Gene Tyson, Jill Banfield và cộng sự tại trường đại học California, Berkeley và Joint Genome Institute đã giải mã DNA từ mẫu môi trường bị axit hóa do khai khoáng (acid mine drainage, AMD). Nghiên cứu đã tìm ra một số nhóm vi khuẩn và vi khuẩn cổ mà trước đó chưa thể phân lập được.
Năm 2005, Stephan C. Schuster ở trường đại học Penn State University và các cộng sự đã công bố những trình tự đầu tiên giải bằng phương pháp hiện đại (kỹ thuật Pyrosequencing phát triển bởi 454 Life Sciences). Năm 2006 Robert Edward, Forest Rohwer và cộng sự ở San Diego State University cũng đã công bố thêm một công trình thuộc lĩnh vực này.
Giải trình tự

Bài chi tiết: DNA sequencing
Phục hồi các đoạn trình tự DNA lớn hơn vài nghìn bp từ mẫu là việc làm rất khó và chỉ có thể thực hiện mới đây nhờ những tiến bộ trong kỹ thuật sinh học phân tử, cho phép ta thiết lập các thư viện nhiễm sắc thể nhân tạo của vi khuẩn (bacterial artificial chromosomes, BACs), tạo vector phục vụ cho việc nhân dòng.
Giải trình tự > Shotgun metagenomic

Nhờ các tiến bộ trong ngành tin sinh học, trong khuếch đại DNA và sự phát triển của công nghệ tính toán mà ta có thể phân tích các đoạn trình tự DNA từ các mẫu môi trường và ứng dụng giải trình tự shotgun cho các mẫu metagenomic. Có thể kể đến một số kết quả giải trình tự của vi sinh vật và của hệ gen người, ghép nối các đoạn DNA ngẫu nhiên ngắn thành các đoạn trình tự consensus. Giải trình tự shotgun và sàng lọc thư viện dòng cho biết các gen tồn tại trong mẫu môi trường. Nhờ vậy mà ta sẽ biết được loại sinh vật nào hay quá trình trao đổi chất nào đang diễn ra trong quần xã , từ đó có thể hiểu rõ hơn về sinh thái học và so sánh các mẫu môi trường với nhau.
Bên cạnh đó có thể dùng Shotgun metagenomic để giải trình tự gần như hoàn toàn hệ gen của vi sinh vật trực tiếp từ môi trường. Phân tích DNA của một mẫu thường cho kết quả là dữ liệu DNA của vi sinh vật có nhiều nhất trong mẫu. Để có được cái nhìn toàn diện hơn ta cần tìm cách giải trình tự bộ gen của các thành viên khác trong quần xã bằng cách phân tích một lượng mẫu lớn. Với giải trình tự shotgun ngẫu nhiên ta có thể phát hiện được các thành viên này ngay chỉ với các đoạn trình tự vô cùng nhỏ bé.
Giải trình tự > Giải trình tự hiện đại (High-throughput sequencing)

Những nghiên cứu metagenomic giải trình tự hiện đại đầu tiên đều được thực hiện bằng phương pháp 454 Pyrosequencing. Các kỹ thuật tiếp theo được ứng dụng là Giải trình tự Ion Torrent PGM, Phân tích genome Illumina và Hệ thống SOLiD. Bằng những kỹ thuật này ta chỉ đạt được các đoạn trình tự ngắn hơn so với phương pháp giải trình tự Sanger: các reads với IonTorrent PGM và 454 Pyrosequencing thường có độ dài khoảng 400 bp, với Illumina và SOLiD dài 25-75 bp , trong khi đó với phương pháp Sanger ta có các reads với độ dài khoảng 750 bp. Tuy vậy, để bù lại điều này, các phương pháp mới cho số lượng reads nhiều hơn hẳn so với phương pháp Sanger truyền thống: Pyrosequencing cho 200-500 megabases, Illumina cho khoảng 20-50 gigabase metagenome. Một ưu điểm nữa của giải trình tự đoạn ngắn (short-read) là các phương pháp này không đòi hỏi phải nhân dòng trước khi giải trình tự, vì vậy có thể duy trì được tính đa dạng của mẫu phân tích.
Tin sinh học - Bioinformatics

Dữ liệu của metagenomics thường rất lớn và tương đối nhiễu, vì nó chứa các mảnh dữ liệu của hàng chục ngàn loài sinh vật trong quần xã. Khi giải trình tự metagenome của dạ cỏ bò người ta đạt được dữ liệu chứa 279 gigabase (279 tỉ bp), và hệ quần xã ở ruột người có chứa các gen khoảng 3,3 triệu bp (sau khi đã ghép nối từ 567,7 gigabase dữ liệu). Chính vì thế việc thu thập và xử lý các dữ liệu này đã từ lâu trở thành thách thức không nhỏ cho các nhà nghiên cứu.
Tin sinh học - Bioinformatics > Bước đầu sàng lọc trình tự

Bước đầu tiên của phân tích dữ liệu metagenome đòi hỏi thực hiện một số bước lọc nhất định (loại bỏ chất tạp, các đoạn trình tự chất lượng kém và các trình tự (có thể) của sinh vật nhân chuẩn eukaryotes). Một số phương pháp loại bỏ trình tự DNA của sinh vật nhân chuẩn có thể kể đến phương pháp Eu-Detect và DeConseq.
Tin sinh học - Bioinformatics > Assembly (ghép các đoạn trình tự)

Bài chi tiết: Sequence assembly
Có thể nói dữ liệu DNA từ metagenomic và từ genomic tương tự nhau, nhưng dữ liệu của các trình tự genomic cho tỉ lệ coverage cao trong khi dữ liệu metagenomic thường rất ít khi dư thừa. Hơn nữa với sự phát triển của công nghệ giải trình tự thế hệ mới (với kết quả dưới dạng các short-read) thì việc bị lỗi trong xử lý dữ liệu là điều rất dễ mắc phải. Như vậy việc ghép nối các đoạn trình tự của metagenomic thành các hệ gen sẽ rất rắc rối và khó tin cậy, đặc biệt khi lắp ghép các đoạn DNA lặp hay khi ghép các đoạn trình tự của các loài khác nhau thành một contig.
Phrap hay Celera Assembler là một số chương trình chỉ phục vụ cho ghép trình tự genomic, nghĩa là giải trình tự của một bộ gen riêng biệt, chứ không hiệu quả cho metagenomic. Một số chương trình khác như Velvet assembler đã được thiết kế tối ưu để lắp ghép các short-read nhờ sử dụng Bruijn graphs.
Tin sinh học - Bioinformatics > Dự đoán gen

Bài chi tiết: Gene prediction
Dự đoán gen của phân tích metagenomic sử dụng hai hướng tiếp cận trong việc chú thích (annotation) vùng mã hóa trong các contig đã được ghép nối trước đó. Hướng tiếp cận đầu tiên để phát hiện gen dựa trên sự tương đồng với các trình tự trong ngân hàng gen, thông thường bằng cách tìm kiếm BLAST. Hướng tiếp cận thứ hai là ab initio, dựa trên những đặc điểm bên trong mỗi đoạn trình tự để dự đoán vùng mã hóa dựa trên đơn vị gen đã biết của những sinh vật họ hàng. Có thể kể đến một số chương trình như MEGAN4  phục vụ cho hướng thứ nhất và các GeneMark và GLIMMER phục vụ cho hướng thứ hai. Ưu điểm đầu tiên của dự đoán ab initio là nó cho phép dò các vùng mã hóa không có homolog tương đồng trên ngân hàng dữ liệu, tuy nhiên để phương pháp này thật chính xác thì cần có những đoạn DNA đủ lớn để so sánh.
Tin sinh học - Bioinformatics > Đa dạng loài

Bài chi tiết: Species diversity
Việc chú thích gen giúp trả lời cho câu hỏi "cái gì", trong khi việc xác định độ đa dạng loài giúp trả lời cho câu hỏi "ai". Để xác định cấu trúc và chức năng của quần xã trong metagenomes, các đoạn trình tự phải được cố định hóa. Việc cố định này được hiểu là quá trình gắn một đoạn trình tự với một sinh vật cụ thể. Cố định hóa dựa trên sự tương đồng bao gồm các phương pháp như BLAST, được sử dụng để tìm kiếm marker hoặc các đoạn trình tự tương tự trong những dữ liệu có sẵn đã công bố. Theo cách này có thể sử dụng chương trình MEGAN. Một công cụ nữa để cố định hóa các reads là PhymmBL. Cố định hóa dựa trên thành phần tập trung vào đặc tính của các đoạn trình tự, như tần số của các oligonucleotide hoặc codon biểu hiện (codon usage bias). Sau khi phân nhóm các đoạn trình tự có thể phân tích so sánh độ đa dạng và phong phú của chúng nhờ một số chương trình khác, vd. như Unifrac.
Giải trình tự shotgun từ môi trường (Environmental Shotgun Sequencing, ESS). (A) Thu mẫu từ môi trường; (B) sàng lọc mẫu theo kích cỡ; (C) phân tích và phân lập DNA; (D) nhân dòng và lập thư viện; (E) giải trình tự các dòng (clones); (F) ghép nối trình tự (sequence assembly) để tạo thành các contig và scaffold.
Les Bordes-Aumont

| --- | --- |
 Les Bordes-Aumont
Les Bordes-Aumont
Vị trí trong vùng Champagne-Ardenne Les Bordes-Aumont 
Hành chính
Quốc gia:  Pháp
Vùng: Grand Est
Tỉnh: Aube
Quận: Troyes
Tổng: Bouilly
Xã (thị) trưởng: Simone Buisson (2001-2008)
Thống kê
Độ cao: 138 m (453 ft) bình quân
Diện tích đất1: 5,49 km2 (2,12 dặm vuông Anh)
INSEE/Mã bưu chính: 10049/ 10800

Les Bordes-Aumont  là một xã ở tỉnh Aube, thuộc vùng Grand Est ở phía bắc miền trung nước Pháp.
Liparis capensis

| Liparis capensis |
| --- | --- |

Phân loại khoa học
Giới (regnum): Plantae
(không phân hạng): Angiospermae
(không phân hạng): Monocots
Bộ (ordo): Asparagales
Họ (familia): Orchidaceae
Chi (genus): Liparis
Loài (species): L. capensis
Danh pháp hai phần
Liparis capensis Lindl. 
Liparis capensis là một loài thực vật có hoa trong họ Lan. Loài này được Lindl. mô tả khoa học đầu tiên năm 1840.
Chú thích

↑  The Plant List (2010). “Liparis capensis”. Truy cập ngày 7 tháng 6 năm 2013.
Lobelia mildbraedii

| Lobelia mildbraedii> Phân loại khoa học |
| --- | --- |
Giới (regnum): Plantae
(không phân hạng): Angiospermae
(không phân hạng): Eudicots
Bộ (ordo): Asterales
Họ (familia): Campanulaceae
Chi (genus): Lobelia
Loài (species): L. mildbraedii
Danh pháp hai phần
Lobelia mildbraedii Engl., 1911 
Lobelia mildbraedii là loài thực vật có hoa trong họ Hoa chuông. Loài này được Engl. mô tả khoa học đầu tiên năm 1911.
Chú thích

↑  The Plant List (2010). “Lobelia mildbraedii”. Truy cập ngày 18 tháng 6 năm 2013.
Ngày Quốc gia Dân tộc ký, Dân tộc học và Nhân chủng học Văn hóa Ba Lan

Ngày Quốc gia Dân tộc ký, Dân tộc học và Nhân chủng học Văn hóa Ba Lan (tiếng Ba Lan: Ogólnopolski Dzień Etnografii, Etnologii i Antropologii Kulturowej) là một ngày lễ được tổ chức vào ngày 9 tháng 2 để kỷ niệm ngày thành lập Hội Dân tộc học năm 1895 tại Lviv. Ngày lễ được thành lập theo nghị quyết của Hội đồng Hội dân tộc học Ba Lan vào ngày 26 tháng 10 năm 2019.
9 tháng 2 - Ngày Quốc gia Dân tộc ký, Dân tộc học và Nhân chủng học Văn hóa
Hoàn cảnh

Vào ngày 1 tháng 10 năm 2018, quy định của Bộ Khoa học và Giáo dục Đại học về cách phân loại mới các ngành khoa học có hiệu lực được ban hành. Dân tộc học được xếp vào các ngành khoa học về văn hóa và tôn giáo.
Ủy ban Khoa học Dân tộc học của Viện Hàn lâm Khoa học Ba Lan và Hội Văn hóa Dân gian Ba Lan, cũng như các nhà khoa học liên kết với các trung tâm dân tộc học Ba Lan phản đối quy định tách dân tộc học như một môn khoa học độc lập.