Wolfenstein: The New Order
Cốt truyện > Cuộc chiến Wolfenstein mở màn

Sau chín tuần điều trị tại 1 bệnh viện ở Ba Lan, Blazkowicz hồi tỉnh nhưng anh không gặp may khi biết mình đang điều trị tại bệnh viện của Đức Quốc xã chiếm đóng trong trang thái sống thực vật. Một cô y tá tên Anya Oliwa người Phần Lan đã chăm sóc cho anh trong suốt quãng thời gian sống thực vật, thấm thoát thoi đưa đã hơn 14 năm. Một ngày nọ khi phát xít Đức thấy bệnh viện nơi chăm sóc Blazkowicz đã trở thành một mối phiền toái, bọn chúng đã đến giết những bác sĩ và bệnh nhân ở đó, trong đó có cha mẹ của Anya, rồi chúng bắt cô mang đi. Blazkowicz lúc đó đã thực sự phẫn nộ trước những cảnh tượng ghê rơn trước mắt nên đã thoát khỏi trạng thái sống thực vật và ngay lập tức hạ sát một tên lính Đức đang định bắn anh, cầm khẩu súng lên và giết hết tất cả lũ phát xít ở trong bệnh viện, rồi đưa Anya chạy trốn khỏi đó.
Anya sau đó đã lái xe đưa Blazkowicz đến nhà bà của cô. Khi xuống xe, Blazkowicz phát hiện ra tên chỉ huy của toán lính Đức tấn công bệnh viện, Keller, đang nấp trong cốp xe, và anh đã đánh gục hắn. Tại đây Blazkowicz phát hoảng khi biết được mình đã sống thực vật hơn 14 năm (tính từ 1946 đến 1960) trong lúc nói chuyện. Chiến tranh đã kết thúc (kể từ sự kiện phát xít Đức ném bom nguyên tử xuống Thành phố New York gây chấn động thế giới), phát xít Đức đã thắng và quân Đồng minh Mỹ đã bị tiêu diệt hoàn toàn từ 12 năm về trước (tính từ 1948 dến 1960) và giờ Đức Quốc xã đã chính thức trở thành bá chủ thế giới. Không chấp nhận sự thật đó, Blazkowicz quyết tâm thành lập 1 đội quân kháng chiến nhằm lật đổ ách thống trị của phát xít Đức, anh tra hỏi tay tướng Đức Keller bị anh bắt giữ trong thời gian thoát khỏi bệnh viện về nơi giam giữ những người lính thuộc các phe đồng minh cũ chống Đức. Do Blazkowicz tra tấn dã man và cũng do sự hèn nhát của mình, Keller đành phải khai ra nơi giam giữ là nhà tù Eisenwald tại thủ đô Berlin. Nhưng do tư tưởng phát xít của hắn khá cao và cho rằng cả thế giới vẫn sẽ phải quỳ dưới chân người Đức nên Blazkowicz đành phải giết hắn.
Blazkowicz cùng Anya đi tàu hỏa đến Berlin, trên chuyến tàu này họ gặp nữ tướng Irene Engel thuộc Bund Deutscher Mädel (nôm na là Liên đoàn hiệp hội phụ nữ Đức) và người tình của bà ta, tướng Bubi. Blazkowicz nhận ra rõ rằng người Đức sau khi trở thành bá chủ thế giới, họ xuất hiện tại bất cứ đâu ở mọi địa điểm. Sau khi đến được nhà tù Eisenwald, anh giải cứu vài thành viên cũ đã từng chiến đấu trước kia và cùng họ đến một nơi bí mật có những người phản kháng lại phát xít Đức cuối cùng. Tại đây anh gặp lại Caroline Becker - lãnh đạo của hội Kreisau Circle ( người chơi có thể gặp bà già này hồi trẻ tại Wolfenstein làm năm 2009), người đã chiến đấu cùng anh và bị coi là đã chết trong cuộc chiến trước đấy nhưng giờ đã ngồi xe lăn không khá hơn anh là bao.
Blazkowicz thời điểm này bắt đầu cùng Anya tham gia vào các phi vụ chống lại quân Đức thông qua sự chỉ huy của Caroline, họ giải cứu thành công nhà khoa học Set Roth nhằm thông tin chi tiết hơn về các loại vũ khí máy móc của quân Đức nhất là những cỗ máy giết người hàng loạt. Và Set Roth tiết lộ rằng ông thuộc 1 tổ chức có tên là Da’at Yichud, đây là một tổ chức bí ẩn đã xuất hiện hàng nghìn năm về trước, tổ chức này đã tạo ra vô số thiết bị đi trước kỷ nguyên của loài người hàng thế kỉ, và ông còn nói rằng những thứ công nghệ của phát xít Đức thực chất không phải là do Deathshead tự tay phát minh mà là do Đức Quốc xã đã vô tình phát hiện ra trụ sở của họ và ăn cắp toàn bộ công nghệ ở đó. Thế nhưng ông còn nói rằng có 1 căn cứ bí mật dưới biển còn lưu giữ những tài liệu và công nghệ của tổ chức, ông đưa Blazkowicz cùng một số người xuống đó và tìm thấy 1 bộ giáp, Caroline được mặc bộ giáp này và bà đã có thể đi lại được. Tuy nhiên do giải cứu Set Roth mà thân phận của Blazkowicz đã bị lộ do gặp lại nữ tướng Irene Engel, từ đây bà ta đã ra lệnh cho toàn thể lính Đức lùng sục quân kháng chiến suốt toàn bộ Berlin sau vụ giết hụt bà ta tại nhà tù. Kết quả phần lớn quân kháng chiến bị giết sau khi bị lộ danh tính, Set Roth và Anya thì bị bắt còn Caroline thì nhanh chân hơn nên thoát được vì biết rằng Blazkowicz sẽ còn cần đến bà ta trong việc anh ta còn sống.