Chuyến bay 17 của Malaysia Airlines
Cuộc điều tra của Đội Điều tra chung JIT

Cuộc điều tra vụ bắn rơi MH17 được cơ quan Truy tố của Bộ Tư pháp Hà Lan chủ trì. Đây là cuộc điều tra lớn nhất trong lịch sử Hà Lan  Các thám tử xem xét các mẫu pháp y từ các cơ thể và hành lý, các cuộc phỏng vấn với các nhân chứng, dữ liệu vệ tinh, thông tin liên lạc bị chặn, và các thông tin trên mạng.
Tham gia vào Đội Điều tra chung (JIT)  là bốn thành viên Hà Lan, Bỉ, Ukraina, Úc
Ngày 28/9/2016, JIT tổ chức một cuộc họp báo, qua đó tiết lộ địa điểm tên lửa đã được phóng lên. Nó tìm thấy tên lửa 9M38 Buk đã được bắn ra từ một khu vực phe nổi dậy kiểm soát gần Pervomaisky, 6 km (3,7 mi) về phía Nam của Snizhne  Họ cũng tìm ra hệ thống Buk tên lửa sử dụng đã được vận chuyển từ Nga sang Ukraina vào ngày xảy ra vụ tai nạn, và sau đó được đưa trở lại Nga sau vụ tai nạn. Trong cuộc điều tra, JIT phỏng vấn 200 nhân chứng, thu thập nửa triệu hình ảnh và video và phân tích 150.000 cuộc gọi điện thoại nghe lén được.
Ngày 24 tháng 5 năm 2018, JIT đưa ra kết luận rằng: “Tên lửa BUK-TELAR bắn rơi MH17 đến từ Lữ đoàn Tên lửa phòng không 53, đóng tại vùng Kursk thuộc Nga". Người đứng đầu Cơ quan điều tra quốc gia của cảnh sát Hà Lan yêu cầu các nhân chứng và người trong cuộc chia sẻ thông tin về danh tính của các thành viên phi hành đoàn Buk, hướng dẫn các thành viên phi hành đoàn theo dõi và người chịu trách nhiệm triển khai hoạt động của Buk liên quan vào ngày 17 tháng 7 năm 2014. Theo Cục Công tố Hà Lan, ngày 24 tháng 5 năm 2018 "các cơ quan chức năng của Liên bang Nga đã... không báo cáo (?) với JIT rằng một chiếc Buk của Lữ đoàn 53 đã được triển khai ở miền Đông Ukraine và phóng Buk vào chiếc máy bay MH17."
Phản ứng với báo cáo này, Tổng thống Nga Vladimir Putin tuyên bố rằng Nga sẽ phân tích kết luận JIT, nhưng chỉ khi Nga trở thành một bên trong cuộc điều tra mới có thể chấp nhận được. Bộ Quốc phòng Nga nhấn mạnh không có bất cứ tổ hợp tên lửa nào của nước này được đưa qua biên giới Nga - Ukraine.
Ngày 25/5/2018, chính phủ Hà Lan và Australia đã ban hành một tuyên bố chung, trong đó họ quy trách nhiệm cho Nga đối với vụ tai nạn. Bộ trưởng ngoại giao của Hà Lan và Australia tuyên bố rằng họ sẽ quy kết trách nhiệm pháp lý của Nga khi bắn rơi chiếc máy bay này. Ngoại trưởng Hà Lan Stef Blok nói rằng "chính phủ hiện đang thực hiện bước tiếp theo bằng cách quy trách nhiệm của Nga", và Hà Lan và Australia yêu cầu Nga tham gia đàm phán nhằm tìm kiếm giải pháp đến nỗi đau khổ và thiệt hại to lớn gây ra bởi sự sụp đổ của MH17. Một bước tiếp theo có thể là trình bày vụ án cho một tòa án hoặc tổ chức quốc tế về phán xét của họ. "
Một số quốc gia và tổ chức quốc tế bày tỏ sự ủng hộ của họ đối với các kết luận của JIT và tuyên bố chung của Hà Lan và Úc. Ngoại trưởng Anh Boris Johnson cho biết Vương quốc Anh "hoàn toàn ủng hộ Úc và Hà Lan", kêu gọi Nga hợp tác. Cao ủy Federica Mogherini của EU tuyên bố rằng Liên minh châu Âu "kêu gọi Liên bang Nga chấp nhận trách nhiệm của mình" và hợp tác tốt. Chính phủ Đức kêu gọi Nga "giải thích đầy đủ bi kịch." Bộ ngoại giao Hoa Kỳ phát hành một tuyên bố nói rằng Hoa Kỳ "ủng hộ mạnh mẽ các quyết định của Hà Lan và Australia," đề nghị Nga công nhận đã dính líu vào vụ này và "chấm dứt chiến dịch thông tin giả nhẫn tâm của mình." Tổng thư ký NATO Jens Stoltenberg kêu gọi Nga "chấp nhận trách nhiệm và hợp tác đầy đủ... phù hợp với Nghị quyết Hội đồng Bảo an Liên Hợp Quốc 2166."
Đáp lại kết luận của JIT, Tổng thống Nga Vladimir Putin nhắc lại rằng vụ việc xảy ra ở vùng FIR Ukraina và người Nga "không tham dự vào vụ này." và đặt câu hỏi về độ tin cậy của báo cáo, nêu rõ trọng tâm của cuộc điều tra Hà Lan về việc chứng minh đầu ra của mình thông qua hình ảnh từ các mạng xã hội bị xử lý máy tính . Ilya Ponomarev, nghị sĩ trong Duma quốc gia Nga cho biết trong một cuộc phỏng vấn với tờ báo Die Welt cho rằng quân ly khai đã bắn hạ chiếc máy bay do nhầm lẫn và giờ đây Putin nhận ra rằng ông đã cung cấp vũ khí cho sai người.
Nhóm điều tra do Hà Lan dẫn đầu đã công bố những đoạn ghi âm của cuộc điện đàm cho thấy các thủ lĩnh ly khai ở Ukraine yêu cầu hỗ trợ quân sự và nhận chỉ thị từ Nga trước khi bắn hạ máy bay MH17. Nhân vật được nghe thấy trong cuộc điện đàm gồm Vladislav Surkov, phụ tá chính trị của Tổng thống Nga Vladimir Putin, người được các thủ lĩnh ly khai gọi là "người đàn ông của chúng tôi tại điện Kremlin". Cuộc gọi cũng đề cập đến yêu cầu của Bộ trưởng Quốc phòng Nga, ông Sergei Shoigu, nhằm thay đổi hệ thống phân cấp và phối hợp quân sự của Đông Ukraine với giám đốc của Tổng cục An ninh Liên bang Nga FSB Alexander Bortnikov, để cung cấp viện trợ quân sự. Một trong những bản ghi âm tiết lộ Alexander Borodai, cựu lãnh đạo phe ly khai đã nói rằng: "Tôi đã thực hiện mệnh lệnh và bảo vệ lợi ích của một và chỉ một nhà nước Liên bang Nga. Đó là điều quan trọng nhất".