BioShock 2
Cốt truyện

BioShock 2 mở đầu vào đêm giao thừa năm 1958, khi Subject Delta tuần tra Rapture với Little Sister của anh tên là Eleanor. Eleanor bị tách ra khỏi Delta bởi mẹ mình là Sofia Lamb, kẻ sử dụng plasmid kiểm soát tâm trí lên Delta để khiến anh ta tự bắn mình. Mười năm sau, Delta thức tỉnh, được Little Sisters hồi sinh dưới sự kiểm soát của Eleanor. Delta bị thu hút về phía Eleanor bởi mối gắn kết Big Daddy-Little Sister trước đây giữa hai người bọn họ. Brigid Tenenbaum gặp Delta và giải thích rằng trừ khi Delta tái hợp với Eleanor, anh ta sẽ rơi vào tình trạng hôn mê. Với sự giúp đỡ của Little Sisters dưới sự kiểm soát của Eleanor và đồng minh của Tenenbaum, cựu doanh nhân Augustus Sinclair, Delta tìm đường đến căn cứ địa của Lamb. Đi qua thành phố, Delta gặp các thành viên của gia đình Rapture như Grace Holloway, một ca sĩ đã phải chịu đựng theo luật bất công của Ryan chống dấy loạn; Stanley Poole, tay họa sĩ lừa bịp đã sát hại nhiều thành viên của Gia đình tại Quảng trường Dionysus sau khi dại dột cố gắng che đậy những sai lầm ngớ ngẩn của mình khỏi Lamb; và Gil Alexander, một nhà khoa học đáng kính, từng làm việc tại Fontaine Futuristics trước khi Lamb biến anh ta thành một quái vật dị dạng được bộ giáp che phủ, anh ta có thể giết hoặc tha mạng, và tìm hiểu kế hoạch của Lamb: cô tìm cách sử dụng ADAM để biến Eleanor thành hiện thân hoàn hảo của lòng vị tha của mình. Mục đích cuối cùng của Lamb là thu thập tâm trí và ký ức của mọi người trong Rapture trở thành một phần của Eleanor thông qua việc sử dụng bộ nhớ di truyền trong ADAM, do đó biến cô thành "Hiện thân của Gia đình" mà Lamb tin rằng sẽ chấm dứt "The Self".
Delta đến một căn phòng giam nơi Eleanor bị nhốt lại, nhưng Lamb đã bắt giữ Delta và cắt đứt mối quan hệ của anh ta với Eleanor bằng cách tạm thời làm ngừng trái tim cô. Mặc dù Eleanor sống sót, Delta bắt đầu chết dần vì mối ràng buộc không thể được thiết lập lại. Sử dụng một Little Sister, Eleanor biến mình thành một Big Sister và giúp Delta thoát khỏi chốn ngục tù. Họ cùng nhau hướng đến một nhóm trốn thoát mà Sinclair đã sắp xếp để rời Rapture. Cả hai phát hiện ra rằng Lamb đã chuyển đổi Sinclair thành Subject Omega, tuyên bố rằng Delta sẽ trở thành cái mà Sinclair hiện đang có, và Delta buộc phải kết liễu anh ta. Sau trận đấu đỉnh cao cuối cùng với tàn dư của Gia đình Rapture nhằm tạo cơ hội cho Eleanor chuẩn bị lớp vỏ bọc, Delta buộc phải làm ngập cả khu vực và trốn thoát trong bộ đồ này. Eleanor và Delta đi đến khu vực thoát hiểm nhưng một quả bom do Lamb đặt khiến Delta bị thương nặng. Eleanor dịch chuyển tức thời và đến được buồng thoát hiểm trước khi quả bom nổ tung, trong khi Delta cố gắng túm lấy bên hông buồng và trèo lên trên khi nó nổi lên.
Kết thúc của trò chơi phụ thuộc vào cách người chơi tương tác với Little Sisters, và số phận của Holloway, Poole và Alexander trong game. Eleanor có thể cứu Sofia Lamb hoặc buộc cô ta chết đuối, tùy thuộc vào việc người chơi tha mạng hay xử tử các nhân vật không phải người chơi. Nếu Delta giải cứu tất cả các Little Sisters anh ta sẽ trút hơi thở cuối cùng trong vòng tay của Eleanor, thời tiết sẽ trở nắng và sạch đẹp, sau đó cô sẽ hấp thụ tính cách và ký ức của anh ta và rời khỏi Rapture cùng các Little Sisters để thay đổi thế giới tốt đẹp hơn, thả rơi con búp bê mà một trong những little sisters đã cho cô bé ở đại dương, hơi giống với Delta, để thương tiếc cái chết của anh ấy, và làm cho cái chết của anh ấy xứng đáng hơn. Nếu Delta thu về tất cả các Little Sisters thì Eleanor sẽ trích xuất ADAM của Delta và tiến tới thống trị thế giới, thời tiết trở nên tối tăm và bão tố khi xác chết của cư dân Rapture nổi lên mặt nước. Một sự pha trộn giữa giải cứu và gom góp các little sisters cho người chơi một sự lựa chọn; hoặc Eleanor có thể hấp thụ ADAM của mình và trở thành ác quỷ, hoặc Delta có thể ngăn cô bé lại và chết, trong trường hợp đó, Eleanor sẽ thương tiếc cái chết của anh ta và tự kết liễu đời mình.