Altaïr Ibn-La'Ahad
Cốt truyện > Cuộc Thập Tự Chinh Thứ Ba

Năm 1191, sau khi thất bại trong việc đoạt lại quả táo địa đàng tại Đền thờ Solomon dẫn đến cái chết của Kadar Al-Sayf và Malik bị trọng thương, quân Templar có cớ đánh vào thành Masyaf, Altaïr bị giáng chức, từ một Master của Assassin trở thành lính mới. Để chuộc lại lỗi lầm, anh phải tiêu diệt chín mục tiêu vốn là chín thủ lĩnh cao cấp bí mật của Templar ở ba thành phố lớn Damascus, Acre và Jerusalem.
Tại thành Damascus, ba thủ lĩnh Templar là mục tiêu của Altaïr gồm Tamir: một tay thương nhân chợ đen (khu Poor District), Abu’l Nuqoud: vua lái buôn (khu Rich District) và Jubair al Hakim: một học giả nổi tiếng của Saladin (khu Middle District).
Ở thành Acre, nhiệm vụ của Altaïr là phải ám sát Garnier de Naplouse: Master của các hiệp sĩ thánh John, tức các hiệp sĩ Hospitalier (khu Poor District), William de Montferrat: một tướng thập tự chinh của vua Richard I (khu Rich District) và Sibrand: Grand Master của các hiệp sĩ Teutonic (khu Middle District)
Nơi cuối cùng, thánh địa Jerusalem, là nơi Altaïr thực hiện nốt nhiệm vụ của mình. 3 mục tiêu còn lại là Talal: một tay buôn nô lệ (khu Rich District), Majd Addin: viên quan nhiếp chính người Saracen của thành Jerusalem (khu Poor District) và Robert de Sable: Grand Master của các hiệp sĩ Templar (khu Middle District). Một biến cố xảy ra trong khi Altaïr làm nốt nhiệm vụ cuối cùng, Maria Thorpe đã cải trang thành Robert để cản đường Altaïr trong khi hắn đang có mặt ở chiến trường Arsuf, với mục đích hợp nhất người Saracen cùng quân Thập tự chinh chống lại Hội sát thủ.
Sau khi tiêu diệt Robert, Altaïr khám phá ra được một bí mật động trời: thủ lĩnh của Hội sát thủ, Al Mualim cũng là một thành viên của Templar. Ngay lập tức anh trở về Masyaf để tìm hiểu sự thật.
Trở về Masyaf, Altaïr nhanh chóng nhận ra mọi người dân ở đây đã bị kiểm soát bởi quả táo địa đàng trong tay Al Mualim. Một cuộc chiến giữa Altaïr và người từng là thầy của mình đã diễn ra. Cuối cùng Al Mualim cũng bị giết, trước khi qua đời ông ta thừa nhận tất cả những gì mình làm là để đảm bảo cho một hòa bình mãi mãi trên toàn thế giới và nói Altaïr không thể nào hủy diệt được quả táo địa đàng.
Sau khi Al Mualim qua đời, Altaïr đem xác ông ra khỏi pháo đài và tiến hành hỏa táng để đảm bảo chắc chắn ông ta không còn tồn tại. Do hỏa táng bị cấm đối với người theo đạo Hồi nên việc làm này đã khiến Abbas, người có thù oán từ trước với Altaïr có cớ để gây sự. Lấy lý do Altaïr giết Al Mualim để giành chức Mentor, Abbas đã thuyết phục những người xung quanh chống lại anh. Một cuộc chiến nhỏ nổ ra giữa những sát thủ ủng hộ Altaïr và những người cho rằng anh là kẻ soán ngôi. Trong lúc hỗn loạn, Abbas cướp được quả táo địa đàng và sử dụng nó, tuy nhiên năng lượng của quả táo phát ra quá mạnh và rút dần sự sống của hắn cùng một vài người khác, tất cả đều có thể chết nếu Altaïr không kịp ngăn chặn việc này lại. Với lời hứa không có sát thủ nào chống lại anh bị trừng phạt và việc thể hiện được khả năng lãnh đạo, tất cả mọi người đều bằng lòng tôn Altaïr làm Mentor mới của Hội.
Trở thành lãnh đạo, Altaïr bắt đầu viết các cuộn giấy Codex(tổng cộng có 30 cuộn), nội dung chủ yếu kể lại các cuộc hành trình của mình. Anh cũng bắt đầu thay đổi lại hoạt động của Hội sát thủ, lui dần vào bí mật chứ không còn công khai, sửa lại hidden blade để không phải chặt bỏ ngón tay đeo nhẫn và có thể dùng thuốc độc, đồng thời cùng người bạn Malik nghiên cứu những cách thức ám sát mới.