Bảng tổng sắp huy chương Thế vận hội Người khuyết tật Mùa hè 2020
Bảng huy chương

Judo, bóng bàn và taekwondo trao hai huy chương đồng cho mỗi nội dung. Môn bóng bàn trao 2 huy chương đồng cho các vận động viên thua trận bán kết. Judo và taekwondo trao huy chương bằng hệ thống thi đấu lại để tranh huy chương đồng, theo đó các vận động viên bị loại từ vòng đầu đến bán kết bởi hai vận động viên vào chung kết sẽ tham gia lại để tranh huy chương đồng.
Hai huy chương bạc đã được trao cho hai người đồng hạng nhì trong nội dung nhảy cao nam hạng T47. Vì vậy, không có huy chương đồng nào được trao.
Hai huy chương đồng đã được trao cho hai người đồng hạng ba trong nội dung chạy 100 mét nam hạng T64.
Hai huy chương đồng đã được trao cho hai người đồng hạng ba trong nội dung bơi 100 mét tự do nữ hạng S7.
Do hai vận động viên bị truất quyền thi đấu, huy chương đồng đã không được trao trong nội dung chạy 100 mét nữ hạng T11 (nội dung này chỉ có 4 vận động viên thi đấu chung kết).
Đoàn chủ nhà (Nhật Bản)
| Hạng | NPC | Vàng | Bạc | Đồng | Tổng số |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- |
| 1 |  Trung Quốc | 96 | 60 | 51 | 207 |
| 2 |  Anh Quốc | 41 | 38 | 45 | 124 |
| 3 |  Hoa Kỳ | 37 | 36 | 31 | 104 |
| 4 |  Ủy ban Paralympic Nga | 36 | 33 | 49 | 118 |
| 5 |  Hà Lan | 25 | 17 | 17 | 59 |
| 6 |  Ukraina | 24 | 47 | 27 | 98 |
| 7 |  Brasil | 22 | 20 | 30 | 72 |
| 8 |  Úc | 21 | 29 | 30 | 80 |
| 9 |  Ý | 14 | 29 | 26 | 69 |
| 10 |  Azerbaijan | 14 | 1 | 4 | 19 |
| 11 |  Nhật Bản | 13 | 15 | 23 | 51 |
| 12 |  Đức | 13 | 12 | 18 | 43 |
| 13 |  Iran | 12 | 11 | 1 | 24 |
| 14 |  Pháp | 11 | 15 | 28 | 54 |
| 15 |  Tây Ban Nha | 9 | 15 | 12 | 36 |
| 16 |  Uzbekistan | 8 | 5 | 6 | 19 |
| 17 |  Ba Lan | 7 | 6 | 12 | 25 |
| 18 |  Hungary | 7 | 5 | 4 | 16 |
| 19 |  Thụy Sĩ | 7 | 4 | 3 | 14 |
| 20 |  México | 7 | 2 | 13 | 22 |
| 21 |  New Zealand | 6 | 3 | 3 | 12 |
| 22 |  Israel | 6 | 2 | 1 | 9 |
| 23 |  Canada | 5 | 10 | 6 | 21 |
| 24 |  Ấn Độ | 5 | 8 | 6 | 19 |
| 25 |  Thái Lan | 5 | 5 | 8 | 18 |
| 26 |  Slovakia | 5 | 2 | 4 | 11 |
| 27 |  Belarus | 5 | 1 | 1 | 7 |
| 28 |  Tunisia | 4 | 5 | 2 | 11 |
| 29 |  Algérie | 4 | 4 | 4 | 12 |
| 30 |  Maroc | 4 | 4 | 3 | 11 |
| 31 |  Bỉ | 4 | 3 | 8 | 15 |
| 32 |  Ireland | 4 | 2 | 1 | 7 |
| 33 |  Nigeria | 4 | 1 | 5 | 10 |
| 34 |  Nam Phi | 4 | 1 | 2 | 7 |
| 35 |  Cuba | 4 | 1 | 1 | 6 |
| 36 |  Jordan | 4 | 0 | 1 | 5 |
| 37 |  Colombia | 3 | 7 | 14 | 24 |
| 38 |  Venezuela | 3 | 2 | 2 | 7 |
| 39 |  Malaysia | 3 | 2 | 0 | 5 |
| 40 |  Đan Mạch | 3 | 1 | 1 | 5 |
| 41 |  Hàn Quốc | 2 | 10 | 12 | 24 |
| 42 |  Thổ Nhĩ Kỳ | 2 | 4 | 9 | 15 |
| 43 |  Indonesia | 2 | 3 | 4 | 9 |
| 44 |  Cộng hòa Séc | 2 | 3 | 3 | 8 |
| 45 |  Serbia | 2 | 3 | 1 | 6 |
| 45 |  Chile | 2 | 3 | 1 | 6 |
| 47 |  Na Uy | 2 | 0 | 2 | 4 |
| 48 |  Singapore | 2 | 0 | 0 | 2 |
| 49 |  Áo | 1 | 5 | 3 | 9 |
| 50 |  Thụy Điển | 1 | 5 | 2 | 8 |
| 51 |  Hy Lạp | 1 | 3 | 7 | 11 |
| 52 |  Kazakhstan | 1 | 3 | 1 | 5 |
| 52 |  Phần Lan | 1 | 3 | 1 | 5 |
| 54 |  UAE | 1 | 1 | 1 | 3 |
| 55 |  Costa Rica | 1 | 1 | 0 | 2 |
| 56 |  Ecuador | 1 | 0 | 2 | 3 |
| 57 |  Síp | 1 | 0 | 1 | 2 |
| 57 |  Sri Lanka | 1 | 0 | 1 | 2 |
| 59 |  Pakistan | 1 | 0 | 0 | 1 |
| 59 |  Ethiopia | 1 | 0 | 0 | 1 |
| 59 |  Mông Cổ | 1 | 0 | 0 | 1 |
| 59 |  Peru | 1 | 0 | 0 | 1 |
| 63 |  Argentina | 0 | 5 | 4 | 9 |
| 64 |  Ai Cập | 0 | 5 | 2 | 7 |
| 65 |  Croatia | 0 | 3 | 4 | 7 |
| 66 |  Latvia | 0 | 3 | 2 | 5 |
| 67 |  Gruzia | 0 | 3 | 0 | 3 |
| 68 |  Hồng Kông | 0 | 2 | 3 | 5 |
| 69 |  Bulgaria | 0 | 2 | 0 | 2 |
| 70 |  Iraq | 0 | 1 | 2 | 3 |
| 71 |  România | 0 | 1 | 1 | 2 |
| 71 |  Slovenia | 0 | 1 | 1 | 2 |
| 71 |  Kuwait | 0 | 1 | 1 | 2 |
| 71 |  Namibia | 0 | 1 | 1 | 2 |
| 75 |  Việt Nam | 0 | 1 | 0 | 1 |
| 76 |  Litva | 0 | 0 | 3 | 3 |
| 77 |  Bồ Đào Nha | 0 | 0 | 2 | 2 |
| 78 |  Uganda | 0 | 0 | 1 | 1 |
| 78 |  El Salvador | 0 | 0 | 1 | 1 |
| 78 |  Qatar | 0 | 0 | 1 | 1 |
| 78 |  Bosna và Hercegovina | 0 | 0 | 1 | 1 |
| 78 |  Đài Bắc Trung Hoa | 0 | 0 | 1 | 1 |
| 78 |  Kenya | 0 | 0 | 1 | 1 |
| 78 |  Ả Rập Xê Út | 0 | 0 | 1 | 1 |
| 78 |  Montenegro | 0 | 0 | 1 | 1 |
| 78 |  Oman | 0 | 0 | 1 | 1 |
| Tổng số (86 đơn vị) | Tổng số (86 đơn vị) | 539 | 540 | 589 | 1668 |