The Witch's House
Cốt truyện

Lưu ý: Bài viết sau đây sẽ tiết lộ toàn bộ cốt truyện của trò chơi.
Ellen là một bé gái 7 tuổi, sống cùng cha và mẹ. Ngay từ nhỏ, Ellen đã mắc một căn bệnh nan y vô cùng nặng, không thể chữa khỏi mà cũng không hề có dấu hiệu thuyên giảm. Căn bệnh này đã cản trở Ellen có được tuổi thơ của 1 cô bé bình thường, không thể ra khỏi nhà, không thể đi đâu và nó đã khiến cô bé cảm thấy bị tù túng, bị giam hãm trong chính nhà của mình, thiếu tự do và thiếu tình yêu. Người mẹ luôn quan tâm đến Ellen nhưng người cha luôn thờ ơ, không quan tâm gì đến con gái của mình.
Sau một thời gian, bỗng nhiên mẹ của Ellen biến mất một cách bí ẩn. Trong ngôi nhà, chỉ còn mỗi Ellen và người cha. Sự mất tích của vợ mình khiến người cha suốt ngày đau khổ, nhưng tuyệt nhiên ông ta vẫn không đoái hoài gì đến người con gái của mình. Thuốc đã gần hết, thức ăn cũng dần cạn kiệt. Ellen tưởng như mình sắp chết đến nơi thì bỗng nhiên, vào nửa đêm, người mẹ của Ellen quay về, nhưng lại mặc bộ đồ sang trọng cùng với thứ trang sức mà Ellen chưa bao giờ thấy. Người mẹ nói rằng:"Ở lại mạnh khỏe nhé, Ellen". Lúc này Ellen nhận ra rằng người mẹ đã có nhân tình ở bên ngoài và người mẹ sẽ sắp sửa bỏ rơi Ellen để đi theo người tình mới. Ellen đã sốc trước viễn cảnh này, nên cô đã lấy con dao ở gần đó và đâm chết người mẹ của mình. Người cha nghe thấy tiếng động liền vội chạy ra, thấy vợ đã chết liền lao vào ôm lấy người vợ và than khóc. Ellen đã thú nhận với người cha về hành động giết người mẹ của cô, nhưng người cha vẫn không quan tâm mà chỉ tiếp tục khóc. Ellen không thể chịu thêm được nữa, liền vung con dao lên và đâm chết luôn người cha của mình. Một làn gió thổi vào nhà, làm cây đèn dầu đang thắp sáng rơi xuống đất, bén lửa vào đồ vật trong nhà, làm căn nhà cháy rụi (Giải thích cho việc người chơi tìm thấy bài báo về vụ cháy trong trò chơi). Ngay sau đó, một con quỷ đã hiện ra, ăn trọn linh hồn cha mẹ cô bé. Sau đó, con quỷ đã đề nghị tặng Ellen một căn nhà để cảm ơn. Vì ngôi nhà cũ đã bị thiêu rụi hoàn toàn, và Ellen không còn nương tựa vào ai nữa, nên cô đã đồng ý. Con quỷ liền đưa cô bé tới một căn nhà mới trong khu rừng cách đó thật xa, và vụ án về gia đình bị giết hại, đứa con gái 7 tuổi mất tích đã khép lại trong bỏ ngỏ.
Ở ngôi nhà mới, nhờ phép thuật mà Ellen có một cơ thể lành lặn, có đầy đủ mọi thứ, nhưng vì ngôi nhà nằm biệt lập trong khu rừng, nên cô không có bạn bè. Cô lúc nào cũng mong muốn mình có một người bạn. Một hôm, một đứa trẻ đi lạc vào trong rừng đã phát hiện ra ngôi nhà của Ellen và đã gặp được cô. Ellen đã chủ động kết bạn với cậu bé. Cả hai người cứ thế mà trở nên thân thiết với nhau. Vào một ngày, đứa trẻ rủ Ellen ra ngoài chơi, cô có vẻ lưỡng lự nhưng vẫn đồng ý. Ngay khi Ellen bước chân ra khỏi nhà, hình dạng cũ của cô xuất hiện, khiến cho cậu bé hoảng sợ đến mức chỉ biết chạy thật nhanh ra khỏi rừng. Lúc này, con quỷ đã tiết lộ với Ellen rằng:"Do được bảo vệ bởi phép thuật trong ngôi nhà nên cô mới có thể khỏe mạnh. Nhưng nếu bước ra khỏi nhà, cô sẽ quay trở về nguyên trạng ban đầu". Ellen vì quá thất vọng trước tình cảnh éo le của mình, nên cô có ý định muốn tự sát. Lúc đó con quỷ đưa ra một lời đề nghị là bẫy người khác vào ngôi nhà, giết chết họ và cống nạp linh hồn cho nó, khi có đủ phép thuật, nó sẽ dạy Ellen câu thần chú chữa khỏi căn bệnh. Tuy nhiên con quỷ lại không nói rõ ràng việc câu thần chú hoạt động như thế nào.
Cứ như thế, đã nhiều năm trôi qua, Ellen vẫn không hề già đi, và câu chuyện những đứa trẻ đến nhà cô rồi mất tích đã được đồn thổi rộng rãi, đến mức trở thành một “truyền thuyết” được lưu truyền rộng rãi trong nhân gian. Nhiều người lớn đi vào rừng tìm kiếm con cũng chịu hoàn cảnh tương tự những đứa trẻ xấu số kia. Cứ như thế, khu rừng đó gần như không còn ai xuất hiện nữa. Một hiệp sĩ đã quyết định vào rừng tìm hiểu sự thật, vô tình phát hiện ra Ellen, liền lao tới giết cô rồi bước ra khỏi khu rừng và thông báo rằng mình đã giết thành công phù thủy. Đúng lúc đó, con quỷ đã giúp cô sống lại. Sau khi tin đồn hiệp sĩ giết thành công phù thủy lan ra, người dân đã không còn sợ hãi và đã có thể thoải mái đi vào rừng. Tuy nhiên đôi lúc người dân vẫn nhìn thấy sự xuất hiện của phù thủy cùng căn nhà.
Một thời gian sau, con quỷ chúc mừng Ellen vì đã có đủ phép thuật để sử dụng câu thần chú giúp chữa bệnh. Lúc này con quỷ mới nêu rõ cách hoạt động của câu thần chú, đó là hoán đổi thân xác. Một câu thần chú đơn giản, tác động đến 2 đối tượng và chỉ hoạt động dựa trên sự tự nguyện của cả hai bên. Con quỷ nói với Ellen hãy tìm đối tượng để thực thi câu thần chú. Ellen sau đó đã dùng phép Mắt Thần để quan sát mọi thứ từ xa và đã phát hiện ra Viola, một cô bé có hoàn cảnh trái ngược hẳn với mình, có cơ thể khỏe mạnh và sống hạnh phúc dù cho gia đình chỉ có hai người là cô và cha cô, một người thợ săn. Ellen đã làm bạn với Viola, hay nói đúng hơn là Viola đã rất quan tâm tới Ellen và bệnh tình của cô, với bản tính tốt bụng, Viola không khỏi xót thương trước tình cảnh hiểm nghèo của Ellen. Khi mối quan hệ của cả hai đã thân thiết, Ellen đã đề nghị Viola tráo đổi thân xác trong 1 ngày để Ellen được trải nghiệm cuộc sống bên ngoài. Khi Viola biết tình cảnh của Ellen, lại sẵn tâm hồn trong sáng, tốt bụng nên Viola đã đồng ý. Họ hẹn nhau vào ngày hôm sau sẽ tiến hành làm phép, và Viola ra về, mà không hề biết rằng Ellen đã nói dối.
Ở nhà, Viola đã nói chuyện với cha, nhưng không tường tận, sau đó họ đã có một cuộc cãi vã, bởi cha cô đã nghe truyền thuyết về ngôi nhà của phù thủy và không đồng ý. Tuy nhiên có vẻ sau đó ông rốt cuộc cũng đồng ý, không khỏi dặn Viola có đến chơi nhà bạn thì cũng tránh xa ngôi nhà của phù thủy ra, vì ông không biết về Ellen. Và cứ như vậy, Viola lại đến ngôi nhà đó.
Trong khi Viola đi, Ellen đã tự móc mắt, cắt bỏ cả hai chân của chính mình, để như vậy, khi hai người tráo đổi thân xác, Viola sẽ hoàn toàn bất lực, và cái chết sẽ cận kề sớm hơn. Và bùa chú đã có hiệu lực, 2 thân xác đã bị hoán đổi. Xác của Ellen là một cái xác tật nguyền, lại thêm bị móc mắt và cắt chân, Viola đã không thể chịu đựng được mà rên khóc thảm thiết. Ellen đã cho Viola uống một loại thuốc, nói là để giảm đau, nhưng thực chất nó đã khiến Viola không thể nói được nữa, bởi Ellen không muốn nghe tiếng hét của chính mình.
Ellen bỏ ra khỏi nhà, ở trong thân xác Viola, lần đầu tiên Ellen cảm thấy được khỏe mạnh. Và cô cứ thế tính rời đi, bỏ mặc Viola ở trong nhà. Tuy nhiên 1 bụi hoa hồng lớn đã mọc lên ngay giữa đường đi, mà nguyên do là Viola, ở trong thân xác của Ellen đã dùng phép thuật của chính Ellen để chặn lại. Và cách duy nhất để diệt bụi hoa và đi qua là dùng 1 thứ dung dịch (Cute Little Bottle) cất ở tầng cao nhất của ngôi nhà. Và cô đã quyết định bước vào trong nhà, vì cô biết rất rõ về cấu trúc của những cái bẫy trong nhà, cũng như cách mà chúng vận hành. Bao nhiêu cạm bẫy đều được Ellen (Trong thân xác của Viola) vô hiệu hóa hết. Cuối cùng, Ellen đã đến được căn phòng của chính mình, và gặp được Viola (Trong thân xác của Ellen). Viola cố gắng đuổi theo để đòi lại cái xác của mình, nhưng thất bại. Khi Viola gặp được người cha của mình, Viola đã cố gắng nói  "Ghg......gha..h. (Give it back)", "Fh... fha... aa... th... (Father)", "...dh...dha... di (Daddy)" and  "Dhh... gha... thh.....gh...gh......hh... ghp......pp... (Daddy, father, help)" nhưng người cha không thể nghe được, và kết quả là Viola đã bị chính cha mình bắn chết. Từ đó, Ellen (Trong thân xác của Viola) đã có một cuộc sống hạnh phúc với người cha mới của mình.
Nếu như người chơi không di chuyển, không làm gì trong 1 tiếng, Viola (Trong thân xác của Ellen) sẽ chết vì tuyệt vọng trong ngôi nhà (Chìa khóa để tiêu diệt một phù thủy được phép thuật bảo vệ chính là Sự tuyệt vọng, nó sẽ ăn mòn thân xác của phù thủy từng chút một, và cuối cùng là chiếm hữu toàn bộ tâm can và giết chết phù thủy). Và phép thuật sẽ mất tác dụng, bụi hoa hồng sẽ biến mất. Ellen (Trong thân xác của Viola) có thể dễ dàng ra khỏi rừng mà không gặp trở ngại nào (Giải thích cho Bonus Ending).