Lịch sử anime
Thập niên 2000

Bên cạnh những xu hướng mang tính thử nghiệm, thập niên 2000 còn nổi bật bởi việc xuất hiện nhiều thiết kế nhân vật bishōjo, bishōnen và lối nghệ thuật phong cách moe. Do đó ngày càng gia tăng sự xuất hiện và phổ biến của các dòng phim như lãng mạn, harem và đời thường. Những bộ anime dựa trên nguyên tác eroge và visual novel ngày càng phổ biến, dựng nên một xu hướng đã khởi nguồn từ cuối thập niên 1990 bởi những tác phẩm như Sentimental Journey (1998) và To Heart (1999). Ví dụ về các tác phẩm như vậy có thể kể đến Green Green (2003), SHUFFLE! (2006), Kanon (2002 và 2006), Fate/Stay Night (2006), Higurashi no Naku Koro ni (2006), Ef: A Tale of Memories (2007), True Tears (2008) và Clannad (2008-09). Nhiều chương trình được chuyển thể từ manga và light novel, bao gồm cả những tựa anime đình đám như Yu-Gi-Oh! (2000), Inuyasha (2000), Naruto (2002), Fullmetal Alchemist (2003), Monster (2004), Bleach (2004), Rozen Maiden (2005), Aria the Animation (2005), Shakugan no Shana (2005), Pani Poni Dash! (2005), Death Note (2006), Mushishi (2006), Sola (2007), The Melancholy of Haruhi Suzumiya (2006), Lucky Star (2007), Toradora! (2008–09), K-On! (2009), Bakemonogatari (2009) và Fairy Tail (2009); thông thường những tựa anime trên kéo dài vài năm và đạt được một lượng người hâm mộ hùng hậu. Tuy nhiên, các tựa anime gốc vẫn tiếp tục được thai nghén với thành công tương tự.
Thập niên 2000 còn đánh dấu sự hiện diện rõ ràng của tiểu văn hóa otaku. Một bài phê bình tiểu văn hóa otaku này được phát hiện trong bộ anime Welcome to the N.H.K. (2006) - có sự góp mặt của nhân vật chính kiểu hikikomori (dạng tách biệt khỏi xã hội), khám phá những ảnh hưởng và hệ quả của nhiều tiểu văn hóa Nhật Bản như otaku, lolicon, tự sát internet, trò chơi trực tuyến nhiều người chơi và kinh doanh đa cấp. Thập niên còn cho thấy sự hồi sinh của các bộ anime điện ảnh thời lượng dài có kinh phí cao như Millennium Actress (2001), Metropolis (2001), Appleseed (2001), Paprika (2006) và tác phẩm đắt giá nhất trong số trên là Steamboy (2004) với kinh phí sản xuất 26 triệu USD. Kon Satoshi đã tạo dựng được danh tiếng cùng với Otomo và Oshii như là các đạo diễn anime điện ảnh hàng đầu, trước khi ông qua đời khi còn rất trẻ, thọ 46 tuổi. Các đạo diễn trẻ khác, như Hosoda Mamoru, người cầm trịch Cô gái vượt thời gian (2006) và Cuộc chiến mùa hè (2009) cũng bắt đầu nổi tiếng.
Trong thập niên này, những phim lẻ anime đã nhận được đề cử và lần đầu tiên gặt hái những giải thưởng tại các liên hoan phim lớn trong lịch sử ngành công nghiệp. Năm 2002, Sen và Chihiro ở thế giới thần bí, một tác phẩm của Studio Ghibli do Miyazaki Hayao đạo diễn được xướng tên ở giải Sư tử vàng tại Liên hoan phim quốc tế Berlin và còn đoạt giải Oscar cho phim hoạt hình hay nhất tại lễ trao giải 2003. Đây là bộ phim ngoài nước Mỹ đầu tiên đoạt giải này. Đây còn là tác phẩm điện ảnh có doanh thu cao thứ hai mọi thời đại trong lịch sử anime nói riêng (chỉ sau Your Name) và doanh thu nội địa cao nhất mọi thời đại trong lịch sử điện ảnh Nhật Bản nói chung, với doanh thu phòng vé nội địa là 30,8 tỷ Yên và doanh thu toàn cầu là 347,7 triệu USD.
Sau sự ra đời của Toonami trên Cartoon Network và kế đến là Adult Swim, anime đã có bước tăng trưởng lớn tại thị trường Bắc Mỹ. Những bộ anime thân thiện với thiếu nhi như Pokémon, Yu-Gi-Oh!, Digimon, Doraemon, Bakugan, Beyblade và bản chuyển thể One Piece của 4Kids Entertainment đều gặt thành công theo từng mức độ khác nhau. Kỉ nguyên này còn chứng kiến sự nổi lên của phim hoạt hình chịu ảnh hưởng từ anime, đáng chú ý là Avatar: the Last Airbender và các phần tiếp theo của những tác phẩm như The Legend of Korra, Ben 10, Chaotic, Samurai Jack, The Boondocks, RWBY và Teen Titans.
Tại Liên hoan phim Cannes 2004, Ghost in the Shell 2: Innocence của đạo diễn Oshii Mamoru đã lọt vào vòng tranh cử chính cho danh hiệu Cành cọ vàng vào năm 2006, Lâu đài bay của pháp sư Howl, một sản phẩm khác của Studio Ghibli và vẫn do Miyazaki Hayao làm đạo diễn giành được đề cử cho Phim hoạt hình hay nhất tại lễ trao giải Oscar lần thứ 78. 5 Centimet trên giây của đạo diễn Shinkai Makoto giành giải điện ảnh Châu Á - Thái Bình Dương cho phim hoạt hình xuất sắc nhất đầu tiên cho Nhật Bản vào năm 2007 và từ đó cho đến nay, nhiều tác phẩm anime vẫn đi tranh giải hàng năm. Tính đến năm 2004, đã có hơn 200 chương trình phát sóng trên truyền hình.