Bob Kerrey
Binh nghiệp > Thảm sát Thạnh Phong

Bài chi tiết: Thảm sát Thạnh Phong
Năm 2001, tạp chí The New York Times và Chương trình 60 Minutes II tiến hành các báo cáo về một sự cố đã xảy ra trong chiến tranh Việt Nam của Kerrey. Vào ngày 25 Tháng Hai năm 1969, ông đã dẫn dắt một cuộc đột kích dùng tàu chiến PCF (tàu chiến) vào một làng nông thôn hẻo lánh của Thạnh Phong, Việt Nam, nhắm mục tiêu một nhà lãnh đạo Việt Cộng mà tình báo chỉ ra sẽ có mặt. Ngôi làng được coi là một phần của một khu vực hỏa lực tự do của quân đội Hoa Kỳ.
Đội SEAL của Kerrey đầu tiên gặp phải nhà của một người dân trong thôn. Sau đó, theo Kerrey, đội bị bắn ở trong làng và bắn trả, chỉ để tìm thấy sau cuộc chiến mà một số người đã chết dường như là dưới 18 tuổi, tụ lại cùng nhau ở trung tâm của làng. "Điều mà tôi sẽ nhớ đến ngày tôi chết là đi bộ và phát hiện thấy, tôi không biết, 14 hay gần như vậy, tôi thậm chí không biết những gì con số này, phụ nữ và trẻ em đã chết", Kerrey nói năm 1998. "tôi đã chờ đợi để tìm thấy những người lính Việt Cộng có vũ khí và bị giết. Thay vào đó tôi thấy phụ nữ và trẻ em."
Ngược lại, Gerhard Klann, một thành viên của đội SEAL của Kerrey, đã đưa ra một phiên bản khác được hỗ trợ một cách độc lập bởi một cuộc phỏng vấn riêng với một người phụ nữ Việt Phạm Trí Lãnh. Theo Klann, đội vây bắt các phụ nữ và trẻ em và quyết định "giết chúng và ra khỏi đó", vì sợ rằng họ sẽ cảnh báo cho quân địch. Kerrey phản ứng vào tài khoản của Klann bằng cách nói "đó không phải là những gì tôi nhớ về nó", và cáo buộc Klann là ghen tuông vì Kerrey đã không giúp ông trong việc có được một huy chương danh dự cho một nhiệm vụ sau này. Các thành viên khác của đội SEAL Kerrey có những phản ứng khác nhau về vấn đề này: Gene Peterson và Lloyd Schreier chỉ nói rằng họ "không làm gì sai cả", và từ chối cho biết chi tiết. William Tucker cũng không đồng ý cho biết thêm điều gì, ngoại trừ chuyện sau khi vụ việc xảy ra, ông nói với Kerrey là "Tôi khôg thích vụ này.", và Kerrey trả lời "Tôi cũng chẳng thích thú chút nào." Rick Knepper từ chối mọi câu hỏi: "Thời gian ở Việt Nam của tôi, nếu nói về nó thì chẳng dễ chịu chút nào. Làm ơn để tôi yên." Ambrose thì kể một phiên bản đôi khi giống chuyện Klann kể, đôi khi lại đồng tình với Kerrey, và đôi khi lại thay đổi vì nhớ ra chi tiết khác - Cả ba người đều đồng tình với nhau về việc họ có giết một ông già, mà theo Ambrose là ông đã làm hiệu cho Klann làm, còn Klann cho rằng Kerrey ra lệnh.
Kerrey bày tỏ nỗi đau đớn và tội lỗi về vụ việc, nói:. "Bạn có thể không bao giờ, không bao giờ có thể lấy đi từ nó. Nó làm đen tối ngày của bạn. Tôi nghĩ chết cho đất nước của bạn đã được điều xấu nhất có thể xảy ra với bạn, và tôi không nghĩ nó là vậy. Tôi nghĩ rằng chết chóc cho đất nước của bạn có thể tồi tệ hơn rất nhiều. "
Kerrey đã được trao một Ngôi sao đồng cho các cuộc tấn công vào Thạnh Phong. Giới thiệu về huy chương viết, "Kết quả của tuần tra của ông là 21 Việt Cộng bị giết, hai hầm trú ẩn bị phá hủy và hai vũ khí của địch thu giữ."
Theo lời kể bà Bùi Thị Lượm, nạn nhân duy nhất sống sót sau thảm sát Thạnh Phong, không có ai khác may mắn sống sót trong đêm đó. Trong số 21 người chết, có một người cô và một người mợ đang mang thai. Nếu tính cả thai nhi chưa lọt lòng, con số chính xác là 23 nạn nhân.
Theo hiện vật trưng bày tại Bảo tàng Chứng tích chiến tranh tại TP HCM về vụ thảm sát, có một số ảnh và một ống cống, mô tả chỗ mà ba đứa trẻ đã trốn trước khi bị tìm thấy và giết. Hiện vật có viết (xem ảnh bên) .
Việc điều tra về thảm sát bắt đầu từ năm 1994 khi nhà báo Gregory Vistica, lúc đó làm cho tờ Newsweek, bắt đầu nghe về vụ việc xảy ra với một nhóm lính SEAL tại Việt Nam. Sau đó nhà báo này có được báo cáo về vụ thảm sát. Cuối năm 1998 khi Kerrey định ứng cử bầu cử tổng thống Mỹ lần thứ 2, báo cáo này đến tay ông, và Kerry từ bỏ ý định tranh cử tổng thống. Năm 2001, vụ thảm sát được công bố ra công chúng. Kerrey đã phải minh bạch hóa và trả lời phỏng vấn về vụ việc. Ông có xin lỗi. Ông không từ bỏ Huy chương Sao Đồng vì coi vụ việc là chuyện không may xảy ra. Ông cũng từ bỏ không ra tranh cử Thượng viện năm 2000 và năm 2004, rút khỏi cuộc sống chính trị . Tới năm 2012, ông mới quay lại tranh cử ghế ở nghị viện nhưng thất bại.