John Gotti
Chúa trùm Gambino > Tổ chức lại

Trong khi Gotti thoát bị kết án, các cộng sự ông không may mắn như vậy. Hai người khác điều hành gia đình Gambino, underboss Armone và cố vấn Gallo, đã bị truy tố về tội đòi bảo kê trong năm 1986 và cả hai đều bị kết án vào tháng 12 năm 1987. Vụ án heroin của cựu thành viên nhóm Bergin Ruggiero và Gene Gotti cũng bắt đầu vào tháng 6 năm đó.
Trước khi họ bị kết tội, Gotti cho phép Gallo về hưu và thăng tiến Sammy Gravano vào vị trí của ông ta trong khi đề cử Frank LoCascio sẽ giữ vai trò underboss tạm thời trong trường hợp Armone bị bỏ tù. Các Gambinos cũng đã làm việc để thỏa hiệp với bồi thẩm đoàn vụ bạch phiến, kết quả là 2 vụ án xử sai. Khi Ruggiero bị bệnh nan y và được thả ra năm 1989, Gotti từ chối liên lạc với ông, đổ trách nhiệm cho ông về những bất hạnh của Gambino. Theo Gravano, Gotti cũng nghĩ tới việc giết Ruggiero và khi ông ta cuối cùng chết, "Tôi đã phải, đúng theo nghĩa đen, kéo anh ta đến dự tang lễ."
Bắt đầu từ tháng 1 năm 1988, Gotti, không theo lời khuyên của Gravano, đòi các capos của mình gặp ông tại Ravenite Social Club mỗi tuần một lần. Gene Gotti cho đó là một nguy cơ phù phiếm không cần thiết, và theo FBI Tiểu đội trưởng Gambino Bruce Mouw, nó trái ngươc với "xã hội kín". Quyết định này cho phép FBI giám sát để ghi lại và xác định phần lớn hệ thống phân cấp Gambino. Nó cũng cung cấp bằng chứng chi tiết mạnh mẽ rằng Gotti là chúa trùm; giao thức lâu dài trong Mafia đòi hỏi sự phô trương trước công chúng về lòng trung thành với ông chủ. FBI cũng nghe trộm club Ravenite, nhưng không đưa ra được bất kỳ những thu âm có chất lượng cao nào để buộc tội.
1988 cũng chứng kiến Gotti, Gigante và ông trùm mới của Lucchese, Victor Amuso tham dự các cuộc họp của Ủy ban đầu tiên kể từ vụ án Ủy ban. Năm 1986, underboss Lucchese tương lai Anthony Casso đã bị thương trong cuộc hành quyết trái phép của Gambino capo Mickey Paradiso. Năm sau, FBI cảnh báo Gotti họ đã thu âm Consigliere Genovese Louis Manna thảo luận về một cuộc tấn công John và Gene Gotti. Để tránh chiến tranh, các nhà lãnh đạo của ba gia đình đã gặp nhau, chối là không biết gì về bạo động của họ chống lại nhau, và đồng ý sẽ "liên lạc tốt hơn."  Các ông trùm cũng đồng ý cho phép ông trùm đang nắm quyền tạm thời của gia đình Colombo Victor Orena tham gia Ủy ban, nhưng Gigante, lo sợ Gotti sẽ chiếm được đa số khi chấp nhận một đồng minh khác, đã ngăn chặn Joseph Massino, trùm của gia đình Bonanno, vào.
Gotti tuy nhiên vẫn có khả năng kiểm soát gia đình tội phạm DeCavalcante ở New Jersey vào năm 1988. Theo capo DeCavalcante Anthony Rotondo, mà sau này trở thành người cung cấp thông tin, Gotti tham dự lễ thức canh xác chết cha mình với nhiều thành viên Gambino khác trong một "biểu dương lực lượng" và buộc ông trùm John Riggi đồng ý điều hành gia đình của mình trên danh nghĩa của Gambino. Các DeCavalcantes tiếp tục thuộc phạm vi ảnh hưởng của Gambino cho đến khi John Gotti bị bỏ tù.
Con trai của John Gotti Gotti Jr. đã bắt đầu vào gia đình Gambino vào đêm Giáng sinh năm 1988. Theo tên cướp đồng nghiệp Michael DiLeonardo, mà cũng gia nhập cùng đêm, Gravano đã tổ chức buổi lễ để Gotti khỏi bị cáo buộc về gia đình trị. John Jr đã nhanh chóng thăng chức capo.