Hổ Siberia
Phát sinh loài

Một số báo cáo đã được công bố từ những năm 1990 về cấu trúc di truyền học của hổ Siberia và mối quan hệ của nó với các phân loài khác. Một trong những kết quả quan trọng nhất là phát hiện ra sự biến đổi di truyền thấp trong quần thể hoang dã, đặc biệt là khi nói đến các dòng DNA của mẹ hoặc DNA ty thể. Dường như một haplotype đơn mtDNA gần như hoàn toàn thống trị dòng dõi mẹ của những con hổ hoang dã Siberia. Mặt khác, những con hổ bị giam cầm dường như cho thấy sự đa dạng mtDNA cao hơn. Điều này có thể gợi ý rằng các phân loài đã trải qua một quá trình cổ chai di truyền rất gần đây do áp lực của con người gây ra, với những người sáng lập quần thể nuôi nhốt đã bị bắt khi khả năng biến đổi gen cao hơn trong tự nhiên.
Vào đầu thế kỷ 21, các nhà nghiên cứu từ Đại học Oxford, Viện Ung thư Quốc gia Hoa Kỳ và Đại học Hebrew Jerusalem đã thu thập các mẫu mô từ 20 trên 23 mẫu hổ Ba Tư được lưu giữ trong các bảo tàng trên khắp lục địa Á-Âu. Họ đã giải trình tự ít nhất một đoạn gồm năm gen ti thể và tìm thấy một lượng biến đổi thấp của DNA ti thể trong hổ Caspian so với các phân loài hổ khác. Họ đã đánh giá lại các mối quan hệ phát sinh loài của phân loài hổ và quan sát thấy sự tương đồng đáng chú ý giữa hổ Caspian và Siberia chỉ ra rằng hổ Siberia là họ hàng gần nhất về mặt di truyền của hổ Caspian, nó ngụ ý mạnh mẽ về tổ tiên chung gần đây. Dựa trên phân tích về phát sinh chủng loại học, họ cho rằng tổ tiên của hổ Ba Tư và Siberia đã xâm chiếm Trung Á cách đây chưa đầy 10.000 năm qua khu vực Con đường tơ lụa ở tỉnh Cam Túc, Trung Quốc ở phía đông, và sau đó đi qua phía đông để thành lập quần thể hổ Siberia ở Viễn Đông Nga. Các sự kiện của Cách mạng công nghiệp có thể là yếu tố quan trọng trong sự cô lập đối ứng của hổ Ba Tư và Siberia khỏi những gì có khả năng là một quần thể tiếp giáp duy nhất.
Các mẫu của 95 con hổ Amur hoang dã đã được thu thập trong phạm vi bản địa của chúng để điều tra các câu hỏi liên quan đến cấu trúc di truyền quần thể và lịch sử nhân khẩu học. Ngoài ra, các cá thể mục tiêu từ quần thể ex situ Bắc Mỹ đã được lấy mẫu để đánh giá biểu hiện di truyền được tìm thấy trong điều kiện nuôi nhốt. Các phân tích cấu trúc di truyền và cấu trúc Bayes đã xác định rõ hai quần thể được ngăn cách bởi một hành lang phát triển ở Nga. Mặc dù đã suy giảm tài liệu từ thế kỷ 20, nhưng các nhà nghiên cứu đã không tìm thấy bằng chứng về sự tắc nghẽn quần thể gần đây, mặc dù các dấu hiệu di truyền của một sự giới hạn lịch sử đã được phát hiện. Sự chênh lệch về tín hiệu này có thể là do một số lý do, bao gồm cả sự thay đổi lịch sử trong biến thể di truyền quần thể liên quan đến sự xuất hiện của thế Holocen và dòng gen tiềm năng từ một quần thể Trung Quốc hiện đã tuyệt chủng. Phạm vi và sự phân bố của biến thể di truyền ở các quần thể nuôi nhốt và hoang dã là tương tự nhau, tuy nhiên các biến thể gen vẫn tồn tại ở khu vực đã bị mất tại chỗ. Nhìn chung, kết quả của họ cho thấy sự cần thiết phải bảo đảm kết nối sinh thái giữa hai quần thể Nga để giảm thiểu mất đa dạng di truyền và tính nhạy cảm chung đối với các sự kiện ngẫu nhiên, và hỗ trợ một nghiên cứu trước đây cho thấy rằng quần thể nuôi nhốt có thể là ổ chứa các biến thể gen bị mất tại chỗ.
Năm 2013, toàn bộ bộ gen của hổ Siberia đã được giải trình tự và xuất bản.
Những quần thể hổ ở lục địa châu Á rơi vào hai nhánh: nhánh phía bắc bao gồm quần thể hổ Siberia và Ba Tư, và các nhánh phía nam bao gồm tất cả các quần thể hổ lục địa còn lại.
Một nghiên cứu được công bố vào năm 2018 dựa trên 32 mẫu hổ sử dụng trình tự toàn bộ bộ gen để phân tích. Kết quả hỗ trợ sáu nhánh hổ đơn ngành và chỉ ra rằng tổ tiên chung gần đây nhất đã sống cách đây khoảng 110.000 năm.