Hydra (çizgi roman)
Örgüt

"Yaşasın, Hydra! Ölümsüz Hydra! Asla yok edilmeyeceğiz! Bir kafasını kesersen yerine iki tane daha çıkar! Sadece efendimize hizmet ediyoruz—tıpkı dünyanın yakında bize hizmet edeceği gibi! Yaşasın Hydra!"
—Strange Tales #135'te geçen Hydra yemini. (Ağustos 1965)
İnsanlığın evriminden önce, şeytani bir girişim başlatmayı planlayan kukuletalı bir (ölümsüz sürüngen insansılardan oluşan) reptoid grubu  dünyaya geldi. Milyonlarca yıl sonra, "Mızrak Birliği" olarak bilinen Asyalı gizli dahiler topluluğunu dağıttılar ve bu da Kalkan Birliği tarafından "Canavar" olarak adlandırılmasına neden oldu. Mızrak Birliği'nin yozlaşması sonucu bilime, sihire ve siyasete dâhil olmak üzere toplumun her tarafına çok başlı bir yılan gibi yerleşerek yayıldı. Örgütün adı zaman geçtikçe değişti ve üyeleri Kathari mezhebinin yanı sıra Thule Cemiyeti'ni de içeriyordu. Thule Cemiyeti tarafından finanse edilen Nazi alt grubu, II. Dünya Savaşı'nın sona ermesinden sonra Hydra ana katına getirildi.
Nazi üyelerinden biri olan Baron Wolfgang von Strucker, Hydra örgütünün kontrolünü hızla ele geçirdi ve örgütü, çeşitli cephelerde terörizm ve yıkıcı faaliyetler yoluyla dünya hâkimiyetine adanacak şekilde yeniden yapılandırdı. Bu yapılandırma, küresel bir neo-faşist Yeni Dünya Düzeni anlayışıyla sonuçlandı. Bu amaçla Baron von Strucker, II. Dünya Savaşı'ndan elde ettiği Nazi ganimetine ve Hydra'nın eski bir parçası olan Japon gizli toplumunun orijinal liderleri tarafından kurulan fonlara dayanarak kişisel servetini aracılığıyla örgütü kurdu. Bununla birlikte, von Strucker'ın ilk ölümünden sonra Hydra, her biri yeniden düzenlenmiş modus operandi anlayışını benimseyen gruplara (AIM, Secret Empire, THEM vb.) ayrıldı. Bu parçalanmanın sonucunda Hydra'da, von Strucker'ın dirilişinden sonra bile iç savaş patlak verdi.
Nick Fury tarafından keşfedilen dosyalara göre Hydra, dört bağımsız sektöre ayrılmıştır:
Uluslararası Şirketler (Yasa dışı faaliyetleri gizlemek amacıyla yasal bir işletme kullanılarak oluşturulan ön örgütler)
Devlet Varlıkları (Emir komuta zinciri dâhilindeki kişiler. Bürokrasilerde bulunan minimum cirodan yararlanan uzun vadeli kaynaklar)
Küresel Suç Grupları (Kısa vadeli hedefler için oluşturulan yan kuruluşlar. Ayrıca, istenmeyen ilgiyi küresel kolluk kuvvetleri topluluğundan uzaklaştırmak için kullanıldı)
İstihbarat Toplama (S.H.I.E.L.D. ve tüm temel kaynakları) Hydra, S.H.I.E.L.D.'ı "en değerli proaktif istihbarat varlığı" olarak görmekte ve bununla birlikte hükûmet varlıkları arasında ABD Hazine Bakanlığı, FBI ve NSA'nın yanı sıra Kanada Güvenlik İstihbaratı Servisi ve Rusya'nın GRU ve SVR'si bulunmaktadır.
Nick Fury, Hydra'ya karşı önceki başarılarının, gruba karşı ilerleme kaydettiğine ya da Hydra ile olası rekabeti veya olası yasa dışı alt örgütleri ortadan kaldırmak için manipüle ettiğine inanılmasını sağlamak için bir aldatmaca olduğunu öne sürdü.
Gizli İstila'nın (Secret Invasion) ve Baron von Strucker'ın ikinci ölümünün sonrasında Hydra'nın resmî bir lideri olmaması nedeniyle birçok güç gösterisi yapıldı. Hydra'nın parçalanması, görünüşe göre bağımsız olarak çalışan çeşitli hücrelerle hızlandı. Sonucunda, Nazi inançlarını benimsemeye başlayan Kızıl Kafatası (Red Skull), sıfırdan yeni bir Hydra inşa etmeye başladı; ancak bu durum, onu, Hydra'dan geriye kalan şeyleri yönetmeye etmeye çalışan Baron Zemo ile anlaşmazlık yaşamasına neden oldu.
Kızıl Kafatası, varlığından haberdar olduğu Kozmik Küp ile Kobik'i yaratmak ve Pleasant Hill Hapishanesi'ne hapsetmek için S.H.I.E.L.D. ile iş birliği yaptı ve Kobik'e insanların anılarını, Kızıl Kafatası'nın onlara anlattığı hikâyeleri, Hydra'nın üyeleri olduklarına inandırabileceğini anladı ancak Red Skull, Kobik'in iki farklı şey hakkında sahte anılar yarattığını fark edemedi ve sonucunda Kaptan Amerika, Kızıl Kafatası'na itaatsizlik etti ve farklı şeyler planladı.