Hizbullah çatışması
PKK ile çatışma

Kürt Hizbullahı, başlangıcında PKK ile savaşmak istemedi ve hatta zaman zaman PKK ile barış yapmayı defalarca denediler, ancak başarısız oldular. Barış yapmak ve PKK ile gelecekteki iş birliğini görüşmek üzere Bekaa Vadisi'ni ziyaret etmek üzere bir heyet gönderdiler, ancak 17 Mayıs 1991'de PKK'nın sebepsiz yere Şırnak'ta üst düzey bir Kürt Hizbullahı üyesinin ailesini öldürmesiyle kesintiye uğradılar. Kürt Hizbullahı, cenaze töreninde PKK'ya savaş ilan etti ve 3 Aralık 1991'de Kürt Hizbullahı üyesi Muhammed Ata, PKK bölge görevlisi Mihail Bayro'yu ve korumalarını öldürdü. Ata daha sonra Türk güçleriyle çatışmalarda öldürüldü. PKK ile Kürt Hizbullahı arasındaki çatışmalar 1995'e kadar devam etti ve PKK yaklaşık 500 savaşçısını, Kürt Hizbullah ise yaklaşık 200 savaşçısını kaybetti. 1995'ten sonra Hizbullah ve PKK birbirlerini hedef almayı bıraktılar ve resmi bir anlaşmaları olmamasına ve düşman olarak kalmalarına rağmen tüm dikkatlerini Türk hükûmeti ile savaşmaya verdiler.
1990'lar boyunca Kürt Hizbullah, PKK ile savaşmak istemediğini ve aralarındaki çatışmanın sadece Kürtlere zarar verirken Türkiye ve derin devlete fayda sağladığını sık sık dile getirdi. Hizbullah ayrıca PKK'nın hoşgörüsüz olduğunu ve çatışmayı başlatanın kendisi olduğunu iddia etti.
Türkiye'ye göre, PKK ve Hizbullah 1998'de resmi ve tamamen etkili bir ateşkes yaptı ve ilişkileri yavaş yavaş gelişmeye başladı ve gelecekteki iş birliklerinin yolunu açtı. Hüseyin Velioğlu, Abdullah Öcalan'dan sonra Türkiye'de en çok aranan adam olarak hızla yükseldiğinde bu sıralardaydı.
Kürt Hizbullahı, Türk devletiyle işbirliği yaptığına dair suçlamaları reddetmekte ve bunun PKK propagandası olduğunu iddia etmektedir. Türk hükûmeti de Kürt Hizbullahı'nı bir terör örgütü ve tehdit olarak görüyor, ancak ilk başta Kürt Hizbullahı'na, PKK ile savaştıkları için müsamaha gösterdikleri iddia edildi. Hüseyin Velioğlu'nu şahsen tanıyan bir Kürt Hizbullah muhalifi, bir röportajında, Kürt Hizbullahının Türk devletiyle hiçbir bağının olmadığını ve Türk devletinin de Hizbullah'a müsamaha göstermediğini iddia etti. Türk devletinin Hizbullah'a odaklanmak yerine PKK ile savaşmakla çok meşgul olduğunu ve bunun da Hizbullah'ın büyümesine olanak sağladığını, ancak Öcalan tutuklandığında ve PKK zayıfladığında Türk devletinin Hizbullah'ı hızla yendiğini belirtti. Emekli bir JİTEM yetkilisi, Türkiye'nin Kürt Hizbullahına PKK'ya karşı yardım teklif ettiğini doğruladı, ancak Hüseyin Velioğlu bunu reddetmeye devam etti ve Türkiye'ye olan nefretlerini ve PKK ile barış çabalarını yeniden teyit etti.
Kürt Hizbullahı, Türk devletinin Hizbullah'ı kurduğunu ve kullandığını söyleyen kişilerin tüm ifadelerinin yalan olduğunu iddia etmiş, buna karşılık Kesire Yıldırım (Öcalan'ın eski eşi) ve MİT içinde yer alan kişilerin ifadelerine yer vermiş, ayrıca Ergenekon iddialarına yer vererek Türk devletinin PKK'yı kurduğunu ve kullandığını ileri sürmüştür. Hizbullah, bu açıklamaları yalnızca PKK'ya sürekli olarak asılsız suçlamalarla karşı karşıya kalmanın nasıl bir şey olduğunu göstermek için yaptıklarını belirtmiş ve ayrıca "PKK'nın 'devlet kurdu' veya 'devlet Hizbullah'ı kullandı' ifadelerini kullanmayı bırakması gerektiğini" ve "ne PKK devlet tarafından kuruldu ne de Hizbullah. Ne PKK devletin işbirlikçisi ne de Hizbullah." ifadelerini kullandı.
2012'deki bir röportajında Cemil Bayık, "Hizbullah'a karşı herhangi bir saygısızlık, gerginlik, çatışma ve nefret başlatma niyetimiz yok. Geçmişte çok derin acılar ve ağır bedeller yaşanmış olsa da, bunu hala bir kan davasına dönüştürmüyoruz. Bizim için önemli olan halkımızın özgürlüğü ve çıkarlarıdır. Yaklaşımımız bu şekildedir." demiştir. Hizbullah, PKK'nin Hizbullah'ı dışlayarak Kürt halkı adına konuşmasını eleştirmesine rağmen Bayık'ı ve açıklamasını övdü ve PKK'nin "dün 'düşman' dediği şeyi bugün 'dost'a dönüştürdüğünü, bugün 'dost' dediğini yarın 'düşman' ilan edebileceğini" iddia etti. Hizbullah ayrıca "Cemil Bayık'ın verdiği mesajlar kısmen zehirli bal olsa da dileğimiz ve umudumuz balın galip gelmesi ve zehir etkisini yenmesidir." dedi.
2013 yılında Dicle Üniversitesi'nde kışkırtıcı bildiriler atıldıktan sonra Hizbullah taraftarları ile PKK taraftarları 3 gün boyunca çatıştı. Hür Dava Partisi Genel Başkanı Hüseyin Yılmaz, Türkleri iki taraf arasında kışkırtma yapmakla suçladı ve "PKK-Hizbullah çatışması kasıtlı olarak yaratılmak isteniyor." dedi. Yılmaz, Hür Dava Partisi'nin Çözüm Süreci'ni desteklediğini iddia etti ve PKK ile Hizbullah arasında kalıcı bir ateşkesin onlar için daha da önemli olduğunu belirtti. HDP milletvekili Altan Tan da bunu destekledi ve "PKK-Hizbullah çatışmasının her ne pahasına olursa olsun önlenmesi gerektiğini söyledi. Bunu ısrarla isteyen insanlar var." Tan ayrıca Hür Dava Partisi taraftarları ile HDP taraftarları arasındaki gerginliğin sona ermesi çağrısında bulundu.
2014 yılı sonlarında Diyarbakır'da PKK yanlılarıyla Hizbullah yanlıları arasında çıkan çatışmada 10 kişi hayatını kaybetmişti. Hizbullah, "Allah adına, kamuoyuna PKK ile çatışma istemediğimizi, bu çatışmanın savunucusu olmadığımızı ve Müslüman halkımızın böyle bir çatışmadan büyük zarar gördüğünü defalarca duyurduk. Ancak bu politikaya rağmen, bize başka alternatif yol bırakmayan PKK'nın kışkırtması sonucu aramızda kavga çıktı. PKK bu çatışmanın başlatıcısı olduğu gibi, onu kötüye kullanan ve yayılmasına ve Kürdistan halkına zarar vermesine neden olan da onlar. Bu nedenle kendimizi eleştirmek veya özür dilemek için hiçbir nedenimiz yok. Suçlu özür diler, af diler. Suçlu olan PKK olduğu için özür dilemesi ve af dilemesi gerekenler onlardır." İsa Altsoy, çatışmalar hakkında konuşurken, ölen Hizbullah destekçilerinden "şehit" olarak bahsetti ve "PKK, Hizbullah'ı Kürdistan'ın meşru bir gücü olarak kabul etmediği ve Hizbullah'ı ortadan kaldırmak istediği bir düşman olarak gördüğü sürece sorunları etkili ve kalıcı bir şekilde çözmenin mümkün görünmediğini" iddia etti.