Taç grup
Taç grup kavramı altında bulunan diğer gruplar > Kök grup > Geniş anlamıyla kök gruplara örnekler

Kök kuşlar bu grubun filojenisinin oldukça iyi bilinmesi nedeniyle belki de en çok atıfta bulunulan kök grup örneğidir. Aşağıda, Michael Benton'dan alıntılan kladogram kök grup kavramını açıklayıcıdır:
Burada son ortak atalarına kadar tüm modern kuş soylarını içeren Neornithes taç gruptur. Kuşların yaşayan en yakın akrabaları timsahlardır. Eğer Neornithes'e kadar gelen filogenetik soylar diyagram üzerinde sola doğru izlenirse, soyların timsahlarla birleştiği noktaya kadar olan soy çizgisinin kendisi ile birlikte tüm yan dallar kök kuşlar grubuna dahildir. Archaeopteryx, Hesperornis ve Confuciusornis gibi taç grup dışında kalan ilkel kuşların yanı sıra kök kuşlar grubunun içinde dinozorlar ve teruzorlar da yer alır. Kuşların ve timsahların en son ortak atası, yani arkozor taç grubu ne kuş ne de timsahtı ve her iki gruba da özgü olan özelliklerin hiçbirine sahip değildi. Kök kuşlar grubu evrimleştikçe tüyler ve içi boş kemikler gibi ayırtedici kuş özellikleri ortaya çıktı. En sonunda, taç grubun başlangıç noktasında yaşayan tüm kuşlara özgü özellikler mevcuttu.
Geniş anlamda kullanılan bütün grup açısından bakılınca Crocodylomorpha Crocodilia ile ve Avemetatarsalia da kuşlar ile sinonim hâline gelir ve yukarıdaki filogenetik ağaç şu şekilde özetlenebilir:
Theropoda'yı kuşlar içinde ya da Pan Aves olarak tanımlayan bu yaklaşım Crocodilia dalını hariç tutmadan Theropoda'yı Archosauria'nın bir üyesi olarak tanımlamaktan daha belirli bir tanımlamadır. Avemetatarsalia gibi bazal dal isimleri genellikle daha muğlaktır. Ancak "Pan Aves" ve "Aves" gruplarının aynı olmaması, Avemetatarsalia ile sinonim olan "Pan Aves" kavramının yalnızca yukarıdaki ağacın incelenmesiyle açıklanabilmesi sınırlaması gibi olgular avantajlı olmayan yanlarıdır ve her iki gruptan da "kuşlar" diye söz etmek müphem bir anlam taşır.
Kök memeliler, Sauropsida'dan soyun ayrıldığı noktadan yaşayan memelilerin en son ortak atasına kadar yan dallarıyla birlikte yer alan tüm hayvanlardır. Bu grup sinapsidlerin yanı sıra morganucodontlar ve docodontlar gibi memelibiçimlileri de içerir; memelibiçimliler taç grup memelilerin dışında da olsa geleneksel ve anatomik olarak memeli olarak kabul edilmişlerdir.
Kök tetrapodlar, soy ağacı üzerinde balıklar arasında en yakın akrabalarımız olan akciğerli balıklardan ayrılan noktadan tetrapodlara kadar olan soylarda yer alan hayvanlardır. Bir dizi et yüzgeçli balığın yanı sıra ilk labyrinthodontların bir kısmını da içerir. Tam olarak labyrintodontların neden taç grup içinde değil de kök grup içinde yer aldığı belirsizdir çünkü ilk tetrapodların filojenisi tam olarak anlaşılamamıştır. Bu örnek, üstünde hemfikir olunmuş bir filojeni olmadığında taç ve kök grup tanımlarının sınırlı bir değere sahip olduklarını gösterir.
Kök eklem bacaklılar, Burgess Şeyli faunasıyla bağlantılı olarak üzerine eğilinmiş bir grubu oluşturur. Aralarında gizemli Opabinia ve Anomalocaris'in de bulunduğu çeşitli fosillerin hepsinde olmasa da bazılarında eklem bacaklılar ile ilişkilendirilen özellikler bulunduğundan kök eklembacaklılar olarak değerlendirilmişlerdir. Burgess Şeyli faunasının çeşitli kök gruplara ayrılması bu gizemli topluluğun filogenetik ayrımını sonuçlandırarak eklem bacaklıların en yakın yaşayan akrabaları olarak kütük ayaklıları tanımlamaya olanak sağladı.
Kök yırtıcı deniz solucanları Chengjiang'tan Burgess Şeyli'ne fosillerde karşılaşılan erken ve orta Kambriyen faunasında yer alan başka hayvanlardır. Ottoia cinsi hemen hemen günümüz yırtıcı deniz solucanları ile aynı yapıya sahiptir ama filogenetik analiz taç grubun dışına düştüğünü, yani bir kök yırtıcı deniz solucanı sayılabileceğini gösterir.