James Bryant Conant
Soğuk Savaş

1946 Atom Enerjisi Yasası, 1 Ocak 1947'de savaş zamanı Manhattan Projesi'nin yerini Atom Enerjisi Komisyonu (AEC) ile değiştirdi. Yasa ayrıca, AEC'ye bilimsel ve teknik tavsiye sağlamak için Genel Danışma Komitesini (GAC) kurdu. Conant'ın GAC'ye başkanlık etmesi bekleniyordu, ancak pozisyon, ilk atom bombalarını tasarlayan ve geliştiren Los Alamos Ulusal Laboratuvarı'nın savaş zamanı direktörü Robert Oppenheimer'e gitti. Aynı zamanda, savunma araştırmalarını koordine etmek için Ortak Araştırma ve Geliştirme Kurulu (JRDC) kuruldu ve Bush, Conant'tan Oppenheimer'ın da hizmet verdiği atom enerjisi alt komitesine başkanlık etmesini istedi. Yeni AEC başkanı David E. Lilienthal, Oppenheimer'ın erkek kardeşi Frank Oppenheimer, karısı Kitty ve eski kız arkadaşı Jean Tatlock da dahil olmak üzere Oppenheimer'ın komünistlerle ilişkileri hakkında güvenlik endişelerini dile getirdiğinde, Bush ve Conant, Oppenheimer'ı yerleştirdiklerinde bunu bildiklerine dair Lilienthal'a güvence verdi. 1942'de Los Alamos'ta sorumlu. Bu tür destek ifadeleriyle, AEC, Oppenheimer'a atomik sırlara erişim sağlayan bir Q izni verdi.
Eylül 1948'e gelindiğinde, Kızıl Korku tutmaya başladı ve Conant, daha önce işe alınanların işten çıkarılması için olmasa da komünist olan öğretmenlerin işe alınmasının yasaklanması çağrısında bulundu. Komünist eğitimcilerin apolitik konuları öğretip öğretemeyeceği konusunda bir tartışma başladı. Conant, 1941'de atandığı Eğitim Politikaları Komisyonu'nun (EPC) bir üyesiydi. Mart 1949'da bir sonraki karşılaşmada, Conant'ın yasaklama çabası, Columbia Üniversitesi Başkanı, Ordu Genel Başkanı Dwight D. Eisenhower tarafından desteklendi. İkili, Conant'ın "demokratik eğitim" adını verdiği ideoloji temelli eğitime olan inançlarında ortak bir zemin buldu. Halk eğitimini Amerikan demokrasisinin bir yan etkisi olarak değil, temel itici güçlerinden biri olarak gördü ve 1951'deki ziyareti sırasında Avustralya'da gözlemlediği mezhep okullarının kamu tarafından finanse edilmesini onaylamadı. Eğitim için artan federal harcamalar ve serveti yeniden dağıtmak için daha yüksek vergiler çağrısında bulundu. Düşüncesi, 1948'de Bölünmüş Bir Dünyada Eğitim ve 1951'de Eğitim ve Özgürlük kitaplarında özetlenmiştir. 1952'de daha da ileri gitti ve House Un-American Aktiviteleri Komitesi tarafından sorgulanan Beşinciyi çağıran akademisyenlerin görevden alınmasını onayladı.
Conant'ın azalan etkisinin bir işareti 1950'de, Conant'tan mutsuz bilim adamlarının "isyan" ının ardından, Johns Hopkins Üniversitesi Rektörü Detlev Bronk'un lehine Ulusal Bilimler Akademisi Başkanlığı görevine devredildiğinde ortaya çıktı. GAC, 1940'ların sonları boyunca muazzam bir etkiye sahipti, ancak Oppenheimer ve Conant'ın hidrojen bombasının geliştirilmesine, ancak 1950'de Truman tarafından geçersiz kılınan muhalefeti, onun gücünü düşürdü. Oppenheimer ve Conant, süreleri 1952'de sona erdiğinde yeniden atanmadığında, GAC'yi en iyi bilinen iki üyesinden mahrum bıraktığında daha da azaltıldı. Conant, yeni Ulusal Bilim Vakfını yöneten Ulusal Bilim Kuruluna atandı ve başkanı seçildi, ancak bu organın çok az mali veya siyasi nüfuzu vardı. Nisan 1951'de Truman, Conant'ı Bilim Danışma Komitesine atadı, ancak Eisenhower yönetimine kadar etkili bir organ haline gelmeyecekti.
Conant'ın Manhattan Projesi ile ilgili deneyimi, onu halkın bilimi daha iyi anlamaya ihtiyacı olduğuna ikna etti ve Harvard'daki bilim tarihini ve felsefesini yeniden canlandırmak için harekete geçti. Yeni bir lisans dersi olan Natural Science 4, "On Understanding Science" adlı dersi vererek kişisel olarak liderliği ele aldı. Ders notları, 1948'de yayınlanan aynı adlı bir kitabın temelini oluşturdu. 1952'de başka bir lisans dersi olan Philosophy 150, "A Philosophy of Science" dersini vermeye başladı. Bilim felsefesi üzerine öğretilerinde ve yazılarında, Harvard'daki meslektaşı Willard Van Orman Quine'inkilerden büyük ölçüde yararlandı. Conant, flojiston teorisinin devrilmesinin bir açıklaması da dahil olmak üzere, Deneysel Bilimde 1957 Harvard Örnek Olayları'na dört bölümle katkıda bulundu. 1951'de bilim adamlarının meslekten olmayan kişilere nasıl yaklaştığını açıklamaya çalıştığı Science and Common Sense'i yayınladı. Conant'ın bilimsel ilerleme hakkındaki fikirleri, başta Bilimsel Devrimlerin Yapısı'nda Thomas Kuhn olmak üzere, kendi çömezleri tarafından saldırıya uğrayacaktı. Conant, Kuhn'un taslak halindeki taslağına yorum yaptı.