Bölgesel Kontrol Planı
Arka plan > 2012-2014 çete ateşkesi

Mart 2012'de; El Salvador hûkümeti, Katolik Kilisesi ve çeteler, hapsedilen çete üyelerine bazı tavizler verilmesi karşılığında ülkenin cinayet oranını düşürmek için Çete Ateşkesi olarak bilinen bir anlaşmaya vardı. Ateşkes, MS-13 ve Barrio 18'in 30 tutuklu liderinin maksimum güvenlikli Zacatecoluca hapishanesinden daha düşük güvenlikli hapishanelere transfer edilmesiyle başladı. InSight Crime'dan Ramsey Geoffrey, bu süreci "ülkenin üç yıldır gördüğü en az şiddetli gün" olarak tanımladı ve polis sadece iki cinayet kaydetti. Ateşkes, Piskopos Fabio Colindres [es], Yasama Meclisi eski üyesi Raúl Mijango [es] ve Kamu Güvenliği Bakanı David Munguía Payés  tarafından müzakere edildi. Ancak hükûmet çetelerle müzakere ettiğini yalanladı; Funes, "hükûmetin çetelerle oturup müzakere etmediğini" belirtti, Munguía ise "cumhuriyet hükûmetinin hiçbir zaman herhangi bir çeteyle müzakere etmediğini" söyledi ve polis, cinayetlerin azalmasını "iyileştirilmiş koordinasyon ve istihbarata" bağladı. Ocak ve Şubat 2012'de günde 14 cinayet yaşanırken; Mart 2012'nin ilk 21 gününde, ülke günde ortalama 5 cinayet kaydetti.
Kasım 2012'de ateşkesin bozulmaya başlaması ve cinayetlerin artmasıyla, Mijango ve Colindres "barış bölgeleri" uygulamasını duyurdu. Bu bölgelerde çeteler tüm suç faaliyetlerini durdurmayı, silahlarını teslim etmeyi ve rakip çete üyeleriyle barış yapmayı hedefledi. Bu bölgelere karşılık, polis gece operasyonlarını sona erdirecek ve hükûmet çete üyelerine iş sağlayan programlar uygulayacaktı. Mayıs 2013 itibarıyla ülkede 19 barış bölgesi bulunuyordu, ancak cinayetler artmaya devam etti. Mart 2013'te hükûmet ateşkesin bazı bölgelerde işe yaramadığını belirtti. Temmuz 2013'te La Prensa Gráfica, çetelerin ateşkesi sona erdirmeye hazırlandığını, silah ve araç stokladığını bildirdi. Mart 2014'te, günde ortalama 8 cinayet işlenmesi dolayısıyla PNC direktörü Rigoberto Pleités, "son aylarda cinayetlerin artması nedeniyle ateşkesin teknik olarak artık var olmadığını" belirtti. 26 Mayıs 2014 tarihinde, görev süresinin bitmesine dört gün kala Funes, "ateşkesin başarısız olduğunu, sadece ona katılanların kararı nedeniyle değil, ona karşı bir kamuoyu oluşturulduğu için" olduğunu belirtti ve "ateşkesin gerekli veya tek seçenek olduğunu söylemiyorum" dedi. O zamana kadar El Salvador'da günde ortalama 14 cinayet işleniyordu. 2014 ve 2015'te çeteler ateşkesi yeniden başlatma teklifi sundu, ancak Funes'in halefi Salvador Sánchez Cerén yeni bir ateşkes başlatmayı reddetti. El Salvador Teknoloji Üniversitesi tarafından Ağustos 2013'te yapılan bir ankete göre, katılımcıların %47'si ateşkesin çetelere fayda sağladığını, %50'si ise ateşkesin hiçbir sonuç vermediğini düşünüyordu.
Sonraki yıllarda, ateşkesi organize etmede rol oynayan çeşitli hükûmet yetkilileri suçlandı. Temmuz 2020'de Başsavcı Raúl Melara, Funes hakkında ateşkesi organize ettiği için tutuklama emri çıkardı. Funes, sürgünde olduğu Nikaragua'dan Melara'nın duyurusunu reddetti ve yanlış bir şey yapmadığını belirtti. Kasım 2022'de Başsavcı Rodolfo Delgado, Funes'in "hapishanedeki çete üyelerine sosyal yardım sağladığı" ve çetelerle yasadışı ilişkilerde bulunduğu iddiasıyla yargılanmasını emretti. Funes, 26 Nisan - 29 Mayıs 2023 tarihleri arasında gıyaben yargılandı ve bu süre zarfında kendisine yöneltilen tüm suçlamalardan suçlu bulunarak, 8'i yasadışı ilişkiden ve 6'sı görevini yerine getirmemekten olmak üzere 14 yıl hapis cezasına çarptırıldı. Cezasının ardından Funes, "cezanın bana yönelik kısmı yasadışıdır, yasal temeli yok" diyerek hükûmetin suçlamaları kanıtlayamadığını iddia etti. Mayıs 2016'da Mijango, ateşkesteki rolü nedeniyle tutuklandı. Ağustos 2017'de "Ateşkes Davası"nda diğer 17 sanıkla beraber yargılandı ancak beraat etti; savcılar karara itiraz etti ve Mayıs 2019'da yeni bir duruşma yapılsa da yine beraat kararı çıktı. 2018'de ateşkesle ilgili olmayan suçlamalarla 13 yıl hapis cezasına çarptırıldı. Ağustos 2023'te hapiste öldü. Temmuz 2020'de Munguia, ateşkesi organize etmedeki rolü nedeniyle tutuklandı. Mayıs 2023'te 8 yıl yasadışı dernek, 6 yıl görevini yerine getirmeme ve 4 yıl keyfi eylemde bulunmak nedeniyle toplam 18 yıl hapis cezasına çarptırıldı. Munguía, cezasını "siyasî bir mahkumiyet" olarak nitelendirdi. Colindres ise ateşkes müzakerelerindeki rolü nedeniyle tutuklanmadı veya suçlanmadı.