Marnie Oradayken
Olay örgüsü

Anna Sasaki, koruyucu anne-babası Yoriko ve kocası ile Sapporo'da yaşayan düşük özgüvenli 12 yaşında bir kızdır. Bir gün okulda astım krizi geçirir. Doktoru, Anna'nın havası temiz bir yere gönderilmesini tavsiye eder. Bunun üzerine anne ve babası Anna'yı Kushiro ve Nemuro şehirlerinin arasında kalan bir sahil kasabasında yaşayan, Yoriko'nun akrabaları Setsu ve Kiyomasa Oiwa'nın yanına yaz tatilini geçirmeye gönderirler.
Anna, tuz bataklığının karşısındaki terk edilmiş bir konağı araştırır. Konağa aşina olduğunu hisseder. Gelgitin su seviyesini yükseltmesiyle orada mahsur kalır. Toichi adlı yaşlı bir balıkçı onu kurtarır. Anna konakta sarışın bir kız görür. Tanabata festivalinde konakta gördüğü sarışın kız Marnie ile tanışır. Marnie, Anna'yı konakta bir partiye davet eder ve Anna partide Marnie'yi Kazuhiko adında bir çocukla dans ederken görür.
Anna, resim yapan yaşlı bir kadın olan Hisako ile tanışır. Hisako, Anna'nın çizimlerinin gençken tanıdığı bir kıza benzediğini söyler. Bir aile konağa taşınır. Taşınma sırasında Anna, Sayaka adında bir kızla tanışır. Sayaka ona bir çekmecede saklı bulduğu Marnie'nin günlüğünü verir. Anna, Marnie'ye ona bakmaları için koruyucu anne babasına para ödendiğini gösteren belgeler bulduğunu söyler. Koruyucu anne babasının para için onu seviyormuş gibi davrandıklarını düşünen Anna, onu geride bırakıp öldükleri için biyolojik ailesini affedemediğini söyler. Marnie, Anna'ya ailesinin hep yurt dışı seyahate çıktığını ve onu zalim bir dadıyla bıraktıklarını söyler. Hizmetçiler ona zorbalık yapmakta ve onu konağın yakınındaki siloya kilitlemekle tehdit etmektedir. Anna, Marnie'yi korkusuyla yüzleşmesi için siloya götürür. Marnie korkusunu yener ve Kazuhiko, Marnie'yi teselli eder.
Sayaka, Marnie'nin günlüğünden kayıp bazı sayfaları bulur. Bu sayfalarda Kazuhiko ve silo hakkında pasajlar vardır. Sayaka ve erkek kardeşi Anna'yı yüksek ateşle baygın bulurlar. Anna'yı Oiwa'ların evine götürürler. Anna, Marnie ile yüzleşir. Marnie, ondan ayrıldığı için üzgün olduğunu ve artık görüşemeyeceklerini söyler. Anna iyileştiğinde, Hisako, Marnie'nin hikâyesini anlatır: Marnie, Kazuhiko ile evlendi ve Emily adında bir kızı oldu. Ancak Kazuhiko ani bir hastalıktan öldü ve Marnie, kaybıyla başa çıkmak sanatoryuma gitti. Ona bakacak başka bir aile üyesi olmayan Emily, yatılı bir okula gönderildi. Marnie geri geldi ama küçük Emily annesine onu terk ettiği için kızgındı. Yetişkinliğinde Emily evden kaçtı ve bir kızı oldu, ancak o ve kocası bir araba kazasında öldü. Marnie torununu büyütmeye başladı. Marnie öldükten sonra torunu koruyucu aileye verildi.
Yaz sonunda Yoriko, Anna'yı eve götürmek için gelir ve Anna'nın yeni arkadaşlar (Hisako, Toichi ve Sayaka) edindiğini görünce sevinir. Anna'ya konağın bir fotoğrafını verir ve konağın Anna'nın ninesine ait olduğunu söyler. Anna fotoğrafın arkasında Marnie'nin adının yazılı olduğunu görünce, Emily'nin kızı ve Marnie'nin torunu olduğunu fark eder. Bu bilgi Anna'nın, kimliği hakkındaki sorularını cevaplamış olur. Yoriko, Anna'yla devlet ödemeleri hakkında konuşur ve onu hep sevdiklerini söyler. Anna ilk kez Yoriko'ya ilk defa "anne" der.
Film biterken, Anna arkadaşlarına veda eder ve gelecek yaz tekrar ziyarete geleceğine söz verir. Marnie'yi malikanenin penceresinde görür ve ona el sallar.