Haruhi Suzumiya'nın Kaybolması
Seslendirme

| Karakterler | Japonca | İngilizce |
| --- | --- | --- |
| Haruhi Suzumiya | Aya Hirano | Wendee Lee |
| Kyon | Tomokazu Sugita | Crispin Freeman |
| Yuki Nagato | Minori Chihara | Michelle Ruff |
| Mikuru Asahina | Yuko Goto | Stephanie Sheh |
| Itsuki Koizumi | Daisuke Ono | Johnny Yong Bosch |
| Ryoko Asakura | Natsuko Kuwatani | Bridget Hoffman |
| Tsuruya | Yuki Matsuoka | Kari Wahlgren |
| Taniguchi | Minoru Shiraishi | Sam Riegel |
| Kunikida | Megumi Matsumoto | Brianne Siddall |
| Kyon'un küçük kız kardeşi | Sayaka Aoki | Kari Wahlgren |
Haruhi Suzumiya'nın Melankolisi hafif roman serisinin dördüncü cildi olan Haruhi Suzumiya'nın Kaybolması ilk olarak anime şovunun ikinci sezonunun bir parçası olarak uyarlanması planlanmıştı. Stüdyo,Kyoto Animation, Haziran 2007'de yeni sezonun üretimine başladı. Yapım ekibi, gerekli tüm sahnelere bolca zaman tanımak için senaryo bitene ve hikaye çizimleri iyice gelişene kadar Disappearance'ın çalışma süresi hakkında endişelenmemeye karar verdi; geçici toplam yedi bölüm için yedi el yazması ile sona erdirdiler. Bir süre sonra Haruhi Suzumiya'nın Kaybolması'nı film olarak uyarlamak için planlar değişti. Bu, filmin 162 dakika uzunluğu ile o zamandaki en uzun ikinci animasyon filmi olmasına yol açtı. Yönetmen Tatsuya Ishihara, romandan daha fazla sahneyi filme uyarlamak için aslında filmin biraz daha uzun olmasını dilediğini, ancak yine de ortaya çıkan sahne sayısından memnun olduğunu belirtti.
Yönetmenler Tatsuya Ishihara ve Yasuhiro Takemoto, sahnelerin atmosferini ve Kyon'un yalnızlığını vurgulamak için çok az kamera hareketi kullanmaya karar verdi. Noriko Takao, kendi isteği üzerine film şeridi çizimlerinde yönetmenlere katıldı. Her iki yönetmen de özellikle Yuki Nagato karakteri açısından farklı olan yaratım sürecinde kadın bakış açısına sahip olmanın faydalı olduğunu ifade etti. Film şeridi, Ishihara ve Takemoto'nun başı ve sonunu bölüştüğü ve Takao'nun C ve D kısımlarının çizimlerini üstlendiği A'dan F'ye kadar adlandırılan altı bölüme ayrıldı. Diyalogları, karakterlerle mümkün olduğunca bütünleştirmek için kapsamlı bir şekilde tartıştılar.
Ishihara, Takemoto ve Takao, zamanlarının çoğunu Ryoko Asakura ve Itsuki Koizumi karakterlerinin tasvirini tartışarak geçirdiklerini söyledi. Filmin anlatısında, Ryoko Asakura ve Itsuki Koizumi karakterlerinini "seçilmemiş" insanlar olarak değerlendirdiler. Özellikle Takemoto, Koizumi'nin seslendirme sanatçısı Daisuke Ono'dan üzgün bir palyaçonun üzüntüsünü ifade etmesini istedi. Film şeridi çizimlerinde "seçilmemiş insanlar" tasvir etmenin ana sorumluluğu Takao'daydı. Asakura ve Koizumi karakterlerinin sahnelerinin aksine, Haruhi Suzumiya'nın birkaç sahnesinin "aydınlık" bir his yaratmasını istediler.
Kameranın, animasyonu sıfırdan geleneksel eskiz yöntemleriyle üretmenin çok zor olacağı kadar uzakta kaldığı zamanlarda stüdyo yerleşimlerdeki ayrıntı miktarını artırmak için 3DCG ve fotoğrafçılık gibi tekniklerden yararlandı.
Filmin A-F bölümlerinin her biri farklı bir animasyon yönetmeni tarafından kontrol ediliyordu. Bu kontrol sürecinde animasyon yönetmeninin kontrolünden sonra çalışma yönetmene, ardından baş animasyon yönetmeni Futoshi Nishiya'ya ve son olarak süper baş animasyon yönetmeni Shoko Ikeda'ya gidecekti. Nishiya, poz verme, jestler ve yüz ifadeleri üzerine özenle çalışırken, Ikeda'nın görevi karakterlerin tasarımlarına uygunluğunu sağlamaktı. Daha iyi bir sonuç için, Ikeda, her karakter tasarımının ayrıntılarını, nelerin ortaya çıkarılması ve nelerden kaçınılması gerektiğini açıklamak için animasyon yönetmenlerini filmin prodüksiyonunun başlangıcında bir araya getirdi. Ayrıca dramatik sahneler sırasında karakterlerin ifadelerinde ve vücut duruşlarında daha fazla esneklik sağlamak için aşırı düzeyde gerçekçi ayrıntılardan nasıl kaçınılacağı konusunda tavsiyelerde bulundu. Nishiya, film boyunca karakterin yaşadığı çok çeşitli duygular nedeniyle en çok Kyon üzerinde çalışırken zorlandı. Ikeda ise, karakterin sahip olduğu oldukça fazla sayıdaki jest ve karakterin duygularındaki incelik nedeniyle Nagato Yuki üzerinde çalışmayı daha zor buldu.
Seslendirmelerde genelde ortak sahneler ilk önce kaydedilirken Haruhi Suzumiya'nın Kayboluşu, ana karakter Kyon'un duygusal gelişimini izleyiciye film boyunca daha etkili bir şekilde aktarabilmek için hikâyenin gelişim sırasına göre kaydedilmiştir Ses yönetmeni Youta Tsuruoka sonuçtan oldukça memnun kaldı ve Kyon'un seslendirme sanatçısı Tomokazu Sugita'yı performansından dolayı övdü. Tsuruoka, filmin tüm uzunluğunu doğru seslerle birleştirmenin zor olduğunu söyledi.
Roman serisinin yazarı Nagaru Tanigawa, senaryo yazım sürecinde geri bildirimde bulundu. Tanigawa ayrıca filme özel bir son söz yarattı ve bitiş şarkısının sözlerini yazdı. Yapımcı Atsushi Itō, bitiş şarkısınınbir akapella olmasını önerdi.