Robert Heinrich Wagner
İkinci Dünya Savaşı ve Alsace'de Sivil İdare Şefi

Wagner, İkinci Dünya Savaşı'nın patlak vermesinden kısa bir süre sonra, Gau'nun bazı bölümlerinin bulunduğu Wehrkreise (Askeri Bölgeler) V ve XII Savunma Komitelerine seçildi. Fransa'nın düşüşünden sonra Almanya, Alsace'ı (Elsaß) Büyük Alman İmparatorluğu'na dahil etti ve 2 Ağustos 1940'ta Wagner, bölgenin Sivil İdare Şefi oldu. 22 Mart 1941'de Gau'nun adı Gau Baden-Elsaß olarak değiştirildi. 20 Haziran 1940'ta Hitler'le Lorraine Sivil İdare Şefi Josef Bürckel'in de katıldığı bir toplantıda Hitler, işgal altındaki iki Fransız bölgesinin on yıl içinde her ne pahasına olursa olsun tamamen Almanlaştırılmasını istediğini söyledi. Wagner, bu hedefe yarı sürede ulaşma sözü vererek, Alsace'de hemen agresif bir Almanlaştırma kampanyası başlattı. Topluluk önünde Fransızcanın konuşulmasını yasakladığını ilan etti. Ayrıca, 1918'den önce var olan eski Alman yer adlarının restorasyonunu emretti ve adları Fransızca olan kişilerin bunları Almanca karşılıklarıyla değiştirmeleri istendi. Okulların Nazi ırk teorilerini öğretmesi gerekiyordu ve Alsaslı gençliğe naziliği aşılamak için Hitler Gençliği ve Alman Kız Birliği'nin zorunlu birimlerini kurdu. Ayrıca, çalışma çağındaki Alsaslılar için Reich İşçi Servisi'ne zorunlu üyeliği zorunlu kıldı. Wagner ayrıca, 1942'de yaklaşık 1.400 mahkûmun hapsedildiği Schirmeck-Vorbrück toplama kampını da bizzat kurdu.
25 Ağustos 1942'de, askerlik çağındaki tüm Alsaslı erkeklerin Wehrmacht'a zorunlu askere alınmasını emreden bir kararname yayınladı. Bu politika pek popüler değildi ve Alman işgaline karşı artan muhalefetin etkisi oldu. Şubat 1943'te Wagner, yakınlardaki İsviçre'ye geçmeye çalışarak zorunlu askerlik görevinden kaçmaya çalışan Ballersdorf'tan 12 kişinin idam edilmesini emretti.
Wagner ayrıca Alsas'ı Yahudilerden kurtarmak için bir kampanya başlattı ve Alsace Kasabı (Schlächter vom Elsaß) takma adını kazandı. 22 Ekim'de, yedi tren dolusu Yahudi'nin toplanıp Alsace'den sınır dışı edilmesiyle, işgal edilmemiş Fransa'daki (Vichy Fransası) bölgelere büyük bir Yahudi sürgünü başlattı. Mal ve mülklerine el konuldu. 22 Ekim 1940'ta Berlin'e şunları bildirdi: "Baden ist als erster Gau judenfrei." — Baden, Yahudilerden arınmış ilk Gau'dur. Hem Baden'den hem de Alsas'tan kovulan Yahudiler, Pireneler'in eteğindeki Gürs toplama kampında acımasız koşullar altında barındırılıyordu. Yaklaşık 2.000 kişi Majdanek ve Auschwitz toplama kamplarına sürüldü ve 1942'de öldürüldü. Gürs toplama kampı'na gönderilen 4.464 Yahudiden 800'den azı hayatta kaldı.
16 Kasım 1942'de, Reich Savunma Komiserlerinin yargı yetkisi Wehrkreis'ten Gau seviyesine değiştirildi ve Wagner, Gau Savunma Komiseri olarak atandı. Sivil savunma, hava savunması ve tahliye önlemlerinin yanı sıra savaş zamanı karne yönetimi ve karaborsa faaliyetlerinin bastırılması sorumluluğunu üstlendi. 25 Eylül 1944'te, Gau'da Nazi milis birimlerinin (Volkssturm) komutanlığına getirildi. İşgalci Müttefik kuvvetler Alsas'a yaklaşırken, Wagner 23 Kasım 1944'te Strazburg'dan Ren nehri boyunca kaçtı. Müttefik kuvvetler 1945 baharında Baden'i işgal etti ve Wagner, Volkssturm taburlarını seferber ederek ve halihazırda Müttefikler tarafından işgal edilmiş olan bölgelerde Kurtadam birimleri tarafından sabotaj eylemleri ve partizan ayaklanmaları çağrısında bulunan broşürler dağıtarak askeri direniş sunmaya devam etti. Kaçmaya çalışan herkesi ölüm cezasıyla tehdit etti. Hitler'in Neron Kararnamesi'nde detaylandırılan kavurucu toprak politikasının ardından, Baden'deki şehirlere Müttefiklerin ilerlemesini engellemek için altyapılarını yok etmelerini emretti. Başkent Karlsruhe, 4 Nisan 1945'te Birinci Fransız Ordusu'nun eline geçti ve Wagner güneye, Konstanz'a kaçtı. Bildirildiğine göre, İsviçre'ye geçmeye çalıştı, ancak sınır muhafızları tarafından geri çevrildi.