Mehmed Ali Paşa'nın Mısır iktidarı olması
El-Bardisi ve Arnavutlar arasındaki olaylar

Bu arada El-Alfi'nin ana Memluk rakibi El-Bardisi'nin kaderi düşmeye başladı. Arnavut birliklerinin ücret taleplerini karşılamak için Kahire vatandaşlarından ağır katkılar alınması emrini verdi. Bu da vatandaşları isyana teşvik etti. Güvenlikleri konusunda alarma geçen Arnavutlar, halka kamu düzeninin çökmesine izin vermeyeceklerine dair güvence verdi ve Muhammed Ali bu yönde bir bildiri yayınlayarak halkı sakinleştirmek için başka tavizler de teklif etti.
Her ne kadar el-Bardisi'nin ağır vergiler almasına ve halkta kargaşaya yol açmasının nedeni onların ücret talepleri olsa da, Muhammed Ali Paşa'nın bildirisi ve tavizleri, Memlükler pahasına Arnavut kuvvetlerinin vatandaşlar arasında popülerlik kazanmasıyla sonuçlandı. Bu fırsattan çok geçmeden yararlandılar. Üç gün sonra (12 Mart 1804) Arnavutlar el-Bardisi'nin ve yaşlı Memluk lideri İbrahim Bey'in evlerine saldırdı. Her ikisi de zar zor kaçmayı başardı. Liderlerinin evlerine yapılan saldırıyı duyan Kahire kalesindeki Memlükler, Azbakeya'da bulunan Arnavutların evlerine topçu bombardımanı başlattı; ancak şeflerinin kaçtığını duyunca kaleyi boşalttılar.
Muhammed Ali Paşa, Kahire kalesini ele geçirince, Muhammed Hüsrev Paşa'yı Mısır valisi ilan etti. Bir buçuk gün boyunca Hüsrev bu unvanın tadını çıkardı; daha sonra merhum Tahir Paşa'nın arkadaşları onu öldürmeyi başardılar. Kahire, haremleri onlara hiç merhamet göstermeden karşılanan Memlük şeflerinin evlerini yağmalayan ve yağmalayan muzaffer Arnavutların elinde şiddetli bir kaosa sürüklendi.
Arnavutlar daha sonra Hurşit Ahmed Paşa'yı hükûmetin dizginlerini devralmaya davet etti ve o da gecikmeden İskenderiye'den Kahire'ye doğru yola çıktı.
Bu arada el-Bardisi partizanlarının güçleri başkentin birkaç mil güneyindeki kırsal bölgeyi yağmalıyor ve nehirden gelen mısır tedarikini ele geçiriyordu. Kısa süre sonra Kahire'nin kuzeyine ilerlediler ve sırasıyla Bilbeys ve Kalyub'u ele geçirdiler, her ikisini de yağmaladılar, mahsulleri yok ettiler ve hayvanları katlettiler.
Kahire bir kargaşa içindeydi, tahıl kıtlığının yanı sıra paşanın sayıları bir Türk müfrezesi tarafından artırılan birliklerinin taleplerini karşılamak için uyguladığı ağır haraçlardan da ciddi şekilde acı çekiyordu. Dükkânlar kapandı, bahtsızlar büyük kalabalıklar halinde toplanıp Ey Latif! Ey Latif! diye bağırdılar. (Ey Rahman).
Osman Bey Hasan'la güçlerini birleştiren el-Alfi'nin yeniden ortaya çıkmasıyla olaylar daha da karmaşık hale geldi. Hem Al-Alfi hem de Hasan paşaya bağlılıklarını açıklamışlardı, ancak kısa süre sonra ona karşı çıktılar ve güneyden başkente doğru ilerlediler. Güçleri Muhammed Ali Paşa'nınkilerle çatıştı ve Tur'un iki kalesini ondan ele geçirmeyi başardı.
Mehmed Ali, 4.000 piyade ve süvarinin kullanıldığı bir gece saldırısında kaleleri hızla geri almayı başardı. Ancak daha sonra dikkatini Kahire'nin o tarafındaki diğer Memlüklerin saldırıp başkentin banliyölerine girdiği kuzeye çevirmek zorunda kaldı. Onlar da birkaç gün sonra Şubra'da yapılan bir savaşta her iki tarafta da ağır kayıplarla mağlup oldular. Bu çifte terslik, el-Bardisi ve el-Alfi adlı iki Memlük partisini geçici olarak birleştirdi, ancak iki lider kişisel olarak düşmanlığını sürdürdü.
El-Bardisi, kuvvetlerini Kahire'nin güneyine kaydırdı ve Memlükler yavaş yavaş Kuzey Mısır'a doğru çekildi. Orada, vali onlara karşı art arda üç sefer gönderdi (bunlardan biri Mehmed Ali Paşa'nın komutasındaydı) ve pek çok savaş kesin bir sonuç olmadan yapıldı.
Bu dönemde Mısır'ın başına başka bir felaket geldi; Suriye'den Kahire'ye yaklaşık 3.000 Kürt şarküteri hafif süvari geldi. Bu birlikler Hurşit Ahmed Paşa tarafından Arnavutlara karşı kendisini güçlendirmek için gönderilmişti, ancak onların gelişi Muhammed Ali ve Arnavutlarının güneydeki Memlüklere karşı yürüttükleri seferden hemen geri dönmeleriyle sonuçlandı.
Deliler, Hurşit Ahmed Paşa'ya yardım etmek yerine, onun devrilmesine en yakın sebep oldu. Kahire isyan için olgunlaşmıştı; Hurşit Ahmed Paşa, zorbalığı ve gaspı nedeniyle nefret ediliyordu ve birliklerinin, özellikle de Delilerin kötü davranışları nedeniyle azarlanıyordu. Şeyhler halka dükkânlarını kapatmalarını emretmiş, askerler ise maaşlarını talep etmişti. Bu noktada Konstantinopolis'ten Mehmed Ali'ye Cidde valiliğini veren bir ferman geldi. Ancak birkaç gün içinde Mısır'ı ele geçirmeyi başardı.