Metal Gear Solid 4: Guns of the Patriots
Hikâye

Shadow Moses Operasyonu'ndan 9, Tanker kazası'ndan 5 yıl sonrası, 2014 yılında Solid Snake Liquid Ocelot'u bulmak için Güney Amerika'da bir çatışma bölgesine gider. Artık ülkeler ordulardan çok PMC(Pirivate Military Companies-Özel Ordu Şirketleri)'leri kullanmaktadır. 2005'te Snake'e yardım eden Coronel Campell artık PMC Kontrol Komitesinde çalışmaktadır. Otacon ile Snake'e, 2009 (MGS 2)'ta ölen Olga Gurlukovich'in çocuğu olan Sunny Gurlukovich'de onlara katımıştır. Artık Sistem ya da SOP (Sons Of Patriots-Vatanseverlerin oğulları) savaş alanında kişiselliği sağlamıştır. (Kişiye özel kilitli silahlar vb.) Ama Snake, G. Amerika'da Drebin 893 adlı bir silah satıcısıyla karşılaşır. O, SOP'a girerek silahları kırabilir. Bu arada Snake, 2009'dan beri çok yaşlanmıştır. Nedeni ise bilinmemektir. (Otacon, Werner sendromu olarak tahmin eder.) G. Amerika'da Naomi Hunter ile karşılşan Snake, ona 2005'te kandisine gizlice enjekte ettiği FOXDİE virüsünün böyle bir şey yapmiş olabilirliğni sorar.Naomi testler yapar.Ama gizlice Snake'in kanını çalmıştır çünkü o, Liquid için çalışmaktadır ama sonradan onlara kısa süreliğne geçerek SOP virüsü olan FOXALİVE'ı Sunny'e verir. (FOXALİVE aslında birazını Naomi'nin yaptığı, Sunny'nin ise Emma'nın solucanını ile tamamladığı bir virüs programıdır.) Ayrıca Vamp'da Liquid'e yardım etmektedir. G. Amerika'da olduklarını öğrenen Liquid, Vamp'ı Snake'i halletmesi için gönderir ama bir anda Raiden ortaya çıkar (Ama artık mükemmel bir izci olmuştur, Gray Fox'ta da olan exoskeleton'a saliptir ve kanı beyaz kan ile değiştirilmiştir.) ve Vamp'ı engeller ama yaralanır. Giderken Snake'e Big Boss'un cesedinin LRA'nın (Lord's Resisdance Army-Tanrı'nın Ordusu) elindedir. Snake, Doğu Avrupa'ya giderek LRA'ların lideri olan Big Mama'yı bulur. Big Mama, Snake'e kendisinin onu doğurduğnu yani onun annesi ve kendisinin EVA olduğnu söyler. Big Boss artık bir sıvıdan ibarettir. PMC'ler onları bulunca kaçarlar ama tüm sahte vanlar yok edilir. Ama Big Mama, cesedin vanlarda değil, Volta gölünde bir botta olduğnu söyler. Bu aarada Naomi, Liquid'e sinsice geri dönmüştür. Snake ve Big Mama, Volta'ya gelince Liquid onları durdurur. Planı Patriot'ları yine yaratmaktır. Bunu da 4 AI'dan (Yapay zeka) lider olan JD'yi yokederek (REX'in lazer silahı ile), GW'u (Çünkü GW onun kontrolündedeir.)lider edip Patriot'ları yeniden kuracaktır. Snake, Liquid tarafından durdurulur, Snake artık sadece Shadow Moses'a geri dönebilir. Shadow Moses'ta REX'in silahı alınmıştır ve Vamp onları öldürmeye çalışır ama Snake, Vamp'ın Nanomakinelerini etkisiz hale getirerek onu normal hale getirir ve Raiden onu öldürür. (Tamamen) Bu arada Naomi açıklamaları yapar ve kendine Vamp'a yaılanları uygular. Snake, REX'i kullanarak dışarı çıkar ve Outer Haven'a (Liquid'in Arsenal Gear'ı) atlar. Burada son çare FOXALİVE'ı GW'a bulaştırarak Liquid'i önlemektir ve bunu da yapar. Foxdie'ın etkisiyle bayılır. Uyandığında ise Liquid tam karşısındadır. Snake, Liquid ile dövüşerek oyunu sonlandırır. Tüm bunlardan sonra mezarlıkta intihara kalkışır. (Muhtemelen o sahneyi gören tüm hayranlar ağlamıştır.) ama yapamaz. O arada Big Boss kanlı canlı karşısına gelir! Snake'e Volta'da yokedilen cesedin Solidus'un olduğnu, orijinal Patriot'ları ve ölümlerini anlatır. Bu arada 105 yaşındaki Zero'yu yanında getirmiştir. Onu tüm bunlardan suçlar ve onu boğar. Sonra ise FOXDİE ile ölür ki ölümünden önce The Boss'un mezarının önünde saygı duruşu sergiler ve Big Boss ölür.