G.I. Joe: Kobra'nın Yükselişi
Yapım aşaması > Gelişim

2003'te, Amerikan yapımcı Lorenzo di Bonaventura, ileri askeri teknoloji hakkında bir film yapmak istedi. Hasbro'dan Brian Goldner onu aradı ve G.I. Joe üzerine bir film yapma teklifi sundu. Daha önce de birlikte çalıştıkları olmuştu. Goldner ve Bonaventura senaryo üzerinde üç ay uğraştılar ve senarist olarak senaryosunu beğendikleri 300 Spartalı filminin senaristi Michael B. Gordon'ı seçtiler. Bonaventura ana karakterlerin hikâyelerinin ön tarafta olmasını istedi ve Rex'i ise Duke'yi daha iyi anlamak amacıyla yarattı. Rex'e ismi ise Hasbro tarafından verilmiştir. Don Murphy filmi çekmeye karar verdi ancak Irak Savaşı'nın patlak vermesi sonucunda bu filmin uygunsuz olacağını düşündü ve başka bir Hasbro projesi olan Transformers filmine odaklanmaya karar kıldı. Bonaventura filmle ilgili düşüncesini şöyle belirtiyor; "Joe Takımının ve Duke'nin uğruna savaştıkları şey bence Dünya üzerindeki herkesi ekrana bağlayacağı düşüncesindeyim"
Şubat 2005'te Bonaventura için Dört Kardeş filminin senaryosunu yazan Paul Lovett and David Elliot, Gordon'un taslağını yeniden gözden geçirdiler. Yazdıkları senaryoda Rex mutasyona uğrar ve Destro'nun ve Kobra'nın Komutanı olur. Skip Woods Mart 2007'de senaryoyu tekrar düzenlemiştir ve Action Man dan bilinen Alex Mann karakterini hikâyeye dahil etmiştir. Bonaventura: "Başkan bizi uluslararası öyle bir pozisyona koydu ki G.I. Joe adında bir film çıkarmak imkânsız hale geldi. Yeni bir karakter eklemek yapmak için eğlenceli bir şey." demiş ve böyle açıklama getirmiştir. Senaryo bir süre sonra internetteydi. Bu taslakta Scarlett Action Man ile evliydi fakat Duke'e beslediği hisler vardı ve Baroniçe tarafından öldürüldü. Snake-Eyes konuşur fakat hikâye sırasında ses telleri kesilir ve sessizliğe boğulur. Mayimbe Stuart Beattieye senaryoyu düzenlemesi teklifi yaptı. Metin incelemesinden sonra hayranların filme bakışı negatifti. Art arda gelen düzenlemelerden sonra Bonaventura "Umuyorum bu sefer doğru yapıyoruzdur" dedi. Kobra'nın yaratılışında bir eksiklik olduğunu kabul etti ve "Onlar, orada muhtemelen en aptal kötü organizasyonuydu [Çizgi filmde öyle yansıtıltı]" diye ekledi. Hasbro Kobra'yı senaryoya dahil edebileceğini söyledi.
Ağustos 2007'de Paramount Pictures Brad Grey'e sunumundan sonra filmi çekmesi için Stephen Sommersı işe aldı. Sommers J.I. Joe Dünyasıyla tanışma fırsatını Hasbro'nun Rhode Islanddaki merkezinde bulmuştur. Bonaventura'nın Murphy ile beraber çalıştığı Transformers'taki başarının nedenini buldular. Sommers düşünmeden imzaladı çünkü bu proje ona James Bondu hatırlattı ve Thunderball filmine gönderme yaparak su altı savaş sahnelerini ekledi. Senaryoyu tekrar yazması için Stuart Beattie filme alındı ve G.I. Joe'nun yaratıcısı Larry Hama filme danışman olarak alındı. Hama hayranların sevmediği bazı şeyleri değiştirmede yardımcı oldu ve bunun filmi çizgi roman serisine daha da yaklaştıracağını söyledi, kararlaştırılan senaryo hayranlar tarafından da sevildi. Snake-Eyes'ın filmin sonundaki konuşup konuşmaması hakkında görüşünü belirtti ve onları ikna etti. 2007-2008 yazar grevlerinden önce senaryoyu bitirebilmek için John Lee Hancock, Brian Koppelman ve David Levien yardımcı olmuşlardır. Goldner asıl olarak J.I. Joe'nin çizgi filminin yerine çizgi romanlarından esinlendiklerini söylemiştir. Sommers hikâyenin grev yüzünden geri kalacağını ve böylece aşırı zengin bi altyapısının olamayacağını söylemiştir.
Bazı kişiler Paramount'u hikâyeyi değiştirmekle suçlamış ve Hasbro ise böyle bir şeyin olmadığını söylemiştir.