Columbine Lisesi Katliamı
Zaman çizelgesi > 11.29-11.36: Kütüphane katliamı

Harris ve Klebold saat 11.29'da kütüphaneye girdiler. İçeride elli iki öğrenci, iki öğretmen ve iki kütüphaneci vardı.
Harris tüfeğini bir masada iki kez ateşledi. Öğrenci Evan Todd, tetikçiler kütüphaneye girdiklerinde ve bir fotokopi makinesinin arkasına siper aldıklarında bir sütunun yanında duruyordu. Todd, gözüne ve sırtına tahta kıymıklarla vuruldu, ancak ciddi şekilde yaralanmadı.
Tetikçiler kütüphaneye, iki bilgisayar sırasına doğru yürüdüler. Kuzey sırada oturan engelli öğrenci Kyle Velasquez'di. Klebold tüfeğini ateşledi ve ölümcül bir şekilde kafasına ve sırtına vurdu. Cephaneli spor çantalarını güneydeki veya daha düşük sıradaki bilgisayarlara bıraktı ve silahlarını yeniden doldurdu. Bilgisayar sıralarının arasından dışarıdaki merdivene bakan pencerelere doğru yürüdüler. Özellikle Klebold, kütüphanedeki tüm öğrencilere bağırmaya ve konuşmaya başladı.[kaynak belirtilmeli]
Kütüphanedeki katliam boyunca, kütüphanenin patlayacağını söyleyerek herkesin kalkmasını emrettiler. Bunu ne kadar zamandır beklediklerini belirttiler ve çekimden sonra "yahoo" gibi şeyler bağırarak eğleniyor gibiydiler. Sporculara ayağa kalkma emrini verirken ikisinden biri "Beyaz şapka veya üzerinde spor amblemi olan herkes öldü" dedi.
Harris, av tüfeğiyle alt sıradaki bilgisayar masalarına doğru yürüdü ve tek dizinin üstüne çökerken birinci masanın altına tek bir atış yaptı. Boynundan ölümcül bir yarayla 14 yaşındaki Steven Curnow'u vurdu. Daha sonra bitişikteki bilgisayar masasına geçti ve 17 yaşındaki Kacey Ruegsegger'i sağ omzundan tamamen geçen bir kurşunla yaraladı.
Harris daha sonra alt bilgisayar masasının güneyindeki bir masaya, altında iki öğrenciyle yürüdü: Cassie Bernall ve Emily Wyant. Harris diz çöktüğünde masanın yüzeyine iki kez tokat attı ve Bernall'i kafasına bir kez av tüfeğiyle vurup onu öldürmeden önce "Peek-a-boo" dedi. Harris bu noktada silahı tek elle tutmuştu; silah geri teperek yüzüne isabet etti ve burnunu yaraladı.
Bernall'i ölümcül bir şekilde vurduktan sonra Harris, Bree Pasquale'in masanın altına değil de yanına oturduğu bir sonraki masaya döndü. Harris'in burnu kanıyordu; tanıklar daha sonra ağzının etrafında kan olduğunu bildirdi. Harris, Pasquale'e ölmek isteyip istemediğini sordu ve o, hayatı için bir ricada bulundu. Harris güldü ve "Herkes ölecek" diye cevap verdi. Klebold "onu vur" dediğinde Harris "Hayır, yine de okulu havaya uçuracağız" dedi.
Klebold, Ireland'nın dizinden yaralanmış olan Hall'a yardım etmeye çalıştığını fark etti. Bu esnada Ireland'ın başı masanın üzerinde gözükünce, Klebold onu ikinci kez, iki kez kafasına ve bir kez ayağına vurdu. Ancak Ireland hayatta kaldı. Klebold daha sonra başka bir masaya doğru yürüdü ve burada 18 yaşındaki Isaiah Shoels, 16 yaşındaki Matthew Kechter ve Craig Scott'ın (Rachel'ın küçük kardeşi) masanın altında saklandığını gördü. Klebold, Harris'e bir "nigger" bulduğunu ve Shoels'ı masanın altından çıkarmaya çalıştığını söyledi.
Harris, Pasquale'den ayrıldı ve ona katıldı. Tanıklara göre, birkaç saniye Shoels ile alay ederek, aşağılayıcı ırkçı yorumlar yaptılar. Silahlı adamlar masanın altına ateş etti; Harris, Shoels'ı göğsünden bir kez vurup onu öldürdü. Klebold ise Kechter'i öldürdü. Shoels başından vurulmasa da Klebold, "Siyah beyinlerin bu kadar uzağa uçabileceğini bilmiyordum" dedi. Bu arada, Scott yaralanmamıştı; arkadaşlarının kanında yatıyor, ölüm numarası yapıyordu. Harris sonra bağırdı; "Sırada kim ölmeye hazır ?!"
Ardından döndü ve Hall, Steepleton ve Ireland'ın bulunduğu masaya bir "kriket" fırlattı. Steepleton'ın kalçasına çarptı; Hall çabucak fark etti, bu yüzden arkalarına attı ve havada patladı. Harris, kütüphanedeki masaların batı ve orta bölümleri arasındaki kitaplıklara doğru yürüdü. Birinin üzerine atladı ve salladı, görünüşe göre onu devirmeye çalıştı, sonra düşen kitaplara ateş etti.
Klebold, kütüphanenin doğu tarafına yürüdü. Harris kitaplıktan çıktı, Klebold ile buluşmak için orta bölgeyi geçti. Sonuncusu, kapının yanındaki bir vitrini vurdu, sonra dönüp en yakın masaya doğru ateş ederek 17 yaşındaki Mark Kintgen'i başından ve omzundan vurarak yaraladı. Daha sonra solundaki masaya döndü ve aynı pompalı tüfek patlamasıyla 18 yaşındaki Lisa Kreutz, Lauren Townsend ve Valeen Schnurr'ı yaralayarak ateş etti. Klebold daha sonra aynı masaya yöneldi ve TEC-9 ile birkaç el ateş ederek Townsend'i öldürdü.
Bu noktada, ciddi şekilde yaralanan Valeen Schnurr, "Aman Tanrım, aman Tanrım!" diye bağırmaya başladı. Cevap olarak Klebold, Schnurr'a Tanrı'nın varlığına inanıp inanmadığını sordu; Schnurr yaptığı cevabı verdiğinde Klebold "Neden?" diye sordu. ve "Tanrı eşcinseldir" yorumunu yaptı. Klebold yeniden yüklendi ama masadan uzaklaştı.
Harris, iki kızın saklandığı başka bir masaya yaklaştı. Onlara bakmak için eğildi ve onları "zavallı" olarak nitelendirdi. Harris daha sonra iki kez ateş ettiği başka bir masaya geçti ve 16 yaşındaki Nicole Nowlen ve John Tomlin'i yaraladı. Ardından Klebold Tomlin'i defalarca vurarak öldürdü.
Harris daha sonra, Townsend'in ölü yattığı masanın diğer tarafına geri döndü. Masanın arkasında, Kelly Fleming adında 16 yaşındaki bir kız, Bree Pasquale gibi, yer olmaması nedeniyle masanın altına değil yanına oturmuştu. Harris, Fleming'i av tüfeğiyle vurdu, arkasından vurdu ve onu öldürdü. Fleming'in arkasındaki masaya ateş etti ve 18 yaşındaki Jeanna Park'ı yaraladı. Saldırganlar, bir masada silahlarını yeniden doldurdukları kütüphanenin merkezine yöneldi. Harris daha sonra karabinasını bir masanın altına işaret etti, ancak hedeflediği öğrenci yoldan çekildi. Harris silahını öğrenciye geri çevirdi ve kendisini tanıtmasını söyledi. Klebold'un tanıdığı John Savage'dı. Klebold'a ne yaptıklarını sordu, Klebold omuz silkti ve "insanları öldürmek" diye cevapladı. Savage, onu öldüreceklerini sordu. Muhtemelen bir yangın alarmı yüzünden Klebold, "Ne?" dedi. Savage onu öldürüp öldürmeyeceklerini tekrar sordu. Klebold hayır dedi ve ona koşmasını söyledi. Savage kütüphanenin ana girişinden koşarak kaçtı.
Savage gittikten sonra Harris döndü ve 15 yaşındaki Daniel Mauser'in kulağına ve eline vurarak karabinasını bulunduğu yerin tam kuzeyindeki masaya ateşledi. Mauser, Harris'e bir sandalye ittirerek ya da bacağını kaparak tepki verdi; Harris tekrar ateş etti ve Mauser'i yakın mesafeden yüzünün ortasından vurarak öldürdü.
Her iki saldırgan da güneye hareket etti ve başka bir masanın altına rastgele ateş açtı. Saat 11.35'te iki 17 yaşındaki Jennifer Doyle ve Austin Eubanks'i ciddi şekilde, 17 yaşındaki Corey DePooter'ı ise ölümcül şekilde yaraladı. Başka kurban yoktu. Kütüphanede 10 kişiyi öldürüp 12 kişiyi yaraladılar.
Bu noktada Klebold, hiç yapmadıkları halde insanları bıçaklamaya başlayabileceklerini söyledi. Kütüphanenin ana gişesine yöneldiler. Harris, kütüphanenin güneybatı ucuna bir molotofkokteyli attı, ancak patlamadı.
Klebold sandalyeyi masadan çıkardı, sonra TEC-9'unu beyaz şapka giyen Todd'a doğrulttu. Klebold onun bir sporcu olup olmadığını sordu ve Todd hiçbir Klebold dediğinde "Bu iyi. Sporcuları sevmiyoruz." Klebold daha sonra yüzünü görmek istedi; Todd şapkasını kısmen kaldırdı, böylece yüzü gizli kalacaktı. Klebold, Todd'a onu neden öldürmemesi için bir neden vermesini istediğinde, Todd "Ben bela istemiyorum" dedi. Klebold öfkeyle yanıt verdi "Sorun mu? Belanın ne olduğunu bile bilmiyorsun!" Todd kendini düzeltmeye çalıştı: "Demek istediğim bu değil! Yani, sizinle bir sorunum yok. Asla yapmayacağım ve asla yapmadım." Klebold daha sonra Harris'e Todd'un yaşamasına izin vereceğini, ancak isterse Harris'in onu öldürebileceğini söyledi.
Harris çok az ilgi gösteriyor gibiydi ve "Ortaklara gidelim" dedi. Klebold, açık bir kütüphane personeli dinlenme odasına tek bir el ateş ederek küçük bir televizyonu vurdu. Harris oradan uzaklaşırken Klebold, "Bir şey daha!" dedi, ardından Patti Nielson'ın altında saklandığı kütüphane tezgahının yanındaki sandalyeyi kaldırdı ve sandalyeyi bilgisayar terminali ve kütüphane tezgahının üstüne çarptı.[kaynak belirtilmeli]
Klebold, kütüphane girişinde Harris'e katıldı. İkili saat 11.36'da kütüphaneden çıktı. Saldırganların dönüşünden korkan 10 yaralı ve 29 yaralı olmayan kişi, batı girişine bitişik kaldırıma açılan kuzey acil çıkış kapısından kütüphaneyi boşaltmaya başladı. Kacey Ruegsegger, Craig Scott tarafından kütüphaneden tahliye edildi. Bu noktada tahliye edilmemiş olsaydı, Ruegsegger muhtemelen yaralarından ötürü kan kaybedecekti. Bilinci kapalı olan Patrick Ireland ve hareket edemeyen Lisa Kreutz binada kaldı. Patti Nielson, Klebold'un daha önce ateş ettiği ve bir dolapta saklandığı dış dinlenme odasına girdi.