จักรพรรดิโคโก
พระมเหสีและพระราชโอรสธิดา

พระมเหสี (ภายหลังเป็นโคไตโง ): เจ้าหญิงฮันชิ (班子女王; 833–900) ภายหลังเป็นโทอิน-คิซากิ (洞院后) พระราชธิดาในเจ้าชายนากาโนะ (พระราชโอรสในจักรพรรดิคัมมุ)
พระราชโอรสองค์แรก: มินาโมโตะ โนะ โมโตนางะ (源元長; เสียชีวิต ค.ศ. 883) เสียชีวิตก่อนจักรพรรดิโคโกขึ้นครองราชย์
พระราชโอรสองค์ที่ 12: เจ้าชายโคเรตาดะ (是忠親王; 857–922)
พระราชโอรสองค์ที่ 13: เจ้าชายโคเรซาดะ (是貞親王; สวรรคต ค.ศ. 903)
พระราชโอรสองค์ที่ 15: เจ้าชายซาดามิ (定省親王) ภายหลังเป็นจักรพรรดิอูดะ
พระราชธิดาองค์ที่ 4: เจ้าหญิงทาดาโกะ (忠子内親王; 854–904) สมรสกับจักรพรรดิเซวะ
พระราชธิดาองค์ที่ 5: เจ้าหญิงคันชิ (簡子内親王; สิ้นพระชนม์ ค.ศ. 914)
พระราชธิดาองค์ที่ 8: เจ้าหญิงยาซูโกะ (綏子内親王; สิ้นพระชนม์ ค.ศ. 925) สมรสกับจักรพรรดิโยเซ
พระราชธิดาองค์ที่ 16: เจ้าหญิงอิชิ (為子内親王; สิ้นพระชนม์ ค.ศ. 899) สมรสกับจักรพรรดิไดโงะ
พระมเหสี (เนียวโง): ฟูจิวาระ โนะ คามิโกะ (藤原佳美子; เสียชีวิต ค.ศ. 898) ธิดาในฟูจิวาระ โนะ โมตตสึเนะ
พระมเหสี (เนียวโง): ฟูจิวาระ โนะ เก็นจิโกะ (藤原元善子) ธิดาในฟูจิวาระ โนะ ยามากาเงะ
พระมเหสี (เนียวโง): ไทระ โนะ โมโตโกะ/โทชิ (平等子) ธิดาในไทระ โนะ โยชิกาเซะ
ชาววัง (โคอูอิ): ชิเงโนะ โนะ นาโอโกะ (滋野直子; เสียชีวิต ค.ศ. 915)
พระราชธิดาองค์ที่ 4: เจ้าหญิงชิเงโกะ (繁子内親王; สิ้นพระชนม์ ค.ศ. 916) ไซโอคนที่ 23 ในศาลเจ้าอิเซะ (884–887)
ชาววัง (โคอูอิ): ธิดาในซานูกิ โนะ นางานาโอะ
พระราชโอรสองค์ที่ 9: มินาโมโตะ โนะ โมโตมิ (源旧鑒; สิ้นพระชนม์ ค.ศ. 908)
ชาววัง (โคอูอิ): ฟูจิวาระ โมโตโกะ (藤原元子)
นางกำนัล: ซูงาวาระ โนะ รูอิชิ (菅原類子) ธิดาในซูงาวาระ โนะ โคเรโยชิ
นางกำนัล: เจ้าหญิงเคชิง (桂心女王) พระธิดาในเจ้าชายมาซามิ
พระราชธิดาองค์ที่ 7: เจ้าหญิงโบกูชิ (穆子内親王; สิ้นพระชนม์ ค.ศ. 903) ไซอิงคนที่ 8 ในศาลเจ้าคาโมะ (882–887)
นางกำนัล: ธิดาในตระกูลทาจิฮิ (多治氏の娘)
มินาโมโตะ โนะ คันชิ/อายาโกะ (源緩子/綾子; เสียชีวิต ค.ศ. 908)
นางกำนัล: ธิดาในตระกูลฟูเซะ (布勢氏の娘)
พระราชโอรสองค์ที่ 12: ชิเงมิซุ โนะ คิโยซาเนะ (滋水清実) จักรพรรดิพระราชทานชื่อตระกูล "ชิเงมิซุ" (Shisei Kōka, 賜姓降下) ใน ค.ศ. 886
ชาววัง (โคอูอิ): ธิดาในฟูจิวาระ โนะ คาโดมูเนะ, ภายหลังสมรสกับมินาโมโตะ โนะ โนโบรุ
พระราชโอรสองค์ที่ 13 (พระโอรสบุญธรรม): มินาโมโตะ โนะ โคเรชิเงะ (源是茂; 886–941) บุตรในมินาโมโตะ โนะ โบโบรุ
(จากสตรีไม่ทราบชื่อ)
พระราชโอรสองค์ที่ 2: มินาโมโตะ โนะ คาเนโยชิ (源兼善; สวรรคต ค.ศ. 879)
พระราชโอรสองค์ที่ 3: มินาโมโตะ โนะ นาซาเนะ (源名実)
พระราชโอรสองค์ที่ 4: มินาโมโตะ โนะ อัตสึยูกิ (源篤行)
พระราชโอรสองค์ที่ 5: มินาโมโตะ โนะ เซโยชิ (源最善)
พระราชโอรสองค์ที่ 6: มินาโมโตะ โนะ ชิกาโยชิ (源近善; สวรรคต ค.ศ. 918)
พระราชโอรสองค์ที่ 7: มินาโมโตะ โนะ โอตตสึเนะ (源音恒)
พระราชโอรสองค์ที่ 8: มินาโมโตะ โนะ โคเร็ตสึเนะ (源是恒; สวรรคต ค.ศ. 905)
พระราชโอรสองค์ที่ 10: มินาโมโตะ โนะ ซาดัตสึเนะ (源貞恒; 857–908)
พระราชโอรสองค์ที่ 11: มินาโมโตะ โนะ นาริกาเงะ (源成蔭)
พระราชโอรสองค์ที่ 14: มินาโมโตะ โนะ คูนิโนริ (源国紀; สวรรคต ค.ศ. 909)
พระราชโอรสองค์ที่ 16: มินาโมโตะ โนะ โคเซ็ง (源香泉)
พระราชโอรสองค์ที่ 17: มินาโมโตะ โนะ โทโมซากะ (源友貞)
พระราชธิดาองค์แรก: มินาโมโตะ โนะ โอโซโกะ (源遅子)
พระราชธิดาองค์ที่ 2: มินาโมโตะ โนะ เรชิ (源麗子)
พระราชธิดาองค์ที่ 3: มินาโมโตะ โนะ อนชิ/คูซูโกะ (源音子/奇子; สวรรคต ค.ศ. 919)
พระราชธิดาองค์ที่ 6: มินาโมโตะ โนะ ชูชิ (源崇子)
พระราชธิดาองค์ที่ 7: มินาโมโตะ โนะ เร็นชิ/สึราโกะ (源連子; สวรรคต ค.ศ. 905)
พระราชธิดาองค์ที่ 9: มินาโมโตะ โนะ เรชิ (源礼子)
พระราชธิดาองค์ที่ 10: มินาโมโตะ โนะ ไซชิ (源最子; สวรรคต ค.ศ. 886)
พระราชธิดาองค์ที่ 11: มินาโมโตะ โนะ ไคชิ (源偕子)
พระราชธิดาองค์ที่ 12: มินาโมโตะ โนะ โมกูชิ (源黙子; สวรรคต ค.ศ. 902)
พระราชธิดาองค์ที่ 13: มินาโมโตะ โนะ โคเรโกะ (源是子)
พระราชธิดาองค์ที่ 14: มินาโมโตะ โนะ เฮชิ (源並子; สวรรคต ค.ศ. 906)
พระราชธิดาองค์ที่ 15: มินาโมโตะ โนะ ชินชิ (源深子; สวรรคต ค.ศ. 917)
พระราชธิดาองค์ที่ 17: มินาโมโตะ โนะ ชูชิ (源周子; สวรรคต ค.ศ. 912)
พระราชธิดาองค์ที่ 18: มินาโมโตะ โนะ มิตสึโกะ (源密子)
มินาโมโตะ โนะ วาชิ (源和子; เสียชีวิต ค.ศ. 947) สมรสกับจักรพรรดิไดโงะ
มินาโมโตะ โนะ เค็นชิ (源謙子; เสียชีวิต ค.ศ. 924)
มินาโมโตะ โนะ ซายาโกะ (源袟子)
มินาโมโตะ โนะ ไคชิ (源快子; เสียชีวิต ค.ศ. 910)
มินาโมโตะ โนะ เซ็นชิ (源善子)