닥터 스트레인지: 대혼돈의 멀티버스
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2020년 1월, 마블 스튜디오와 데릭슨은 작품 방향성의 차이로 인해 더 이상 영화를 감독하지 않을 것이라고 발표했다. 양측 모두 별도의 성명을 내고, 지금까지의 협력에 감사하며 데릭슨은 영화의 총괄 프로듀서로 남을 것이라고 말했다. 2020년 5월로 예정된 촬영이 이것으로 지연될 것으로는 예상되지 않았다. 카길은 자신과 데릭슨이 마블이 원하는 것과 다른 방향으로 이야기를 구상했으며, 두 사람이 아직 각본 초안을 작성하지 않았기에 최종 판본에는 그들의 작업물이 반영되지 않을 것이라고 설명했다. 데릭슨은 영화를 떠나는 것이 어려운 결정이었지만 자신이 만들고 싶었던 것과는 다른 영화에 대해 타협하고 싶지 않았다고 말했다. 그가 원했던 또 다른 영화인 《블랙폰》(2022년) 제작을 더 빨리 할 수 있다는 점은 하차 결정을 더 쉽게 만들었다. 컴버배치는 감독 변경에 대해 사전에 상의받지 못했고, 이후에 들은 뒤 슬프지만 그는 결정과 처리 방식을 존중한다고 말했다.일부 보도에 따르면 데릭슨은 A24의 영화 《마녀》(2015년)나 《유전》(2018년)과 비슷한 '거침 없는 기괴하고 섬뜩하고 무서운 영화'를 만들고 싶었으나 마블 스튜디오는 이를 원하지 않아 하차했다. 그러나 페이기는 이를 부인하고 스튜디오는 그 아이디어가 좋았다고 말했다. 그는 데릭슨이 떠났어도 본작의 제작 의도는 MCU의 "훨씬 더 섬뜩한 면"으로 안내하는 것이며, 그들은 멀티버스의 "마음을 뒤흔드는 무서운 면"을 탐구하고 싶어한다고 설명했다.
샘 레이미는 2월 초까지 감독직 인수인계 협상에 들어갔다. 그 당시 추이텔 에지오포는 칼 모르도 역을 다시 맡고 맥아담스는 더 이상 출연하지 않을 것으로 예상되었으며, 《로키》의 수석 작가 마이클 왈드론이 영화 대본을 다시 작성하기로 했다.레이미는 몇 주 후 영화 감독직에 서명했다. 그는 《스파이더맨 3》(2007년)에서 엇갈린 비평을 받은 이후 다른 마블 슈퍼히어로 영화에서 감독하기를 꺼려했고, 그 장르에서는 휴식이 필요하다고 느꼈다. 그러나 그는 제의를 수락했다. 제작 중인 영화에 즉시 전력으로 투입된다는 도전과, 그가 닥터 스트레인지 캐릭터와 데릭슨이 촬영한 첫 닥터 스트레인지 영화의 팬이어서였다.레이미는 이전 영화인 《오즈 그레이트 앤드 파워풀》(2013년) 이후 대규모 자본이 투입된 영화 제작 환경이 어떻게 변했는지 궁금했고, 영화의 기존 MCU 스토리와 캐릭터에 익숙해져야 했다. 왈드론은 데릭슨과 바틀렛의 작품을 바탕으로 한 새로운 대본 초안을 쓰는 데 3주가 걸렸다. 그는 이것이 "거의 불가능"하다고 말했고, 레이미는 2020년 5월 제작 시작일을 맞추어야 한다는 "조급함과 패닉"을 느꼈다. 코로나19 범유행은 처음 3주 동안 영화 제작에 영향을 미쳤고 사전 제작은 원격으로 이루어지기 시작했다. 2020년 5월 촬영 예정이 잡혀있었으나, 디즈니가 팬데믹으로 인해 페이즈 4 영화 일정을 연기했고, 《대혼돈의 멀티버스》 개봉일도 2021년 11월 5일로 미루어졌다. 레이미는 이 지연에 안도했다. 이로써 그와 왈드론은 적당한 시간에 처음부터 대본을 쓰기 시작하고, 영화를 그들 자신의 것으로 만들 수 있게 되었다.
왈드론 레이미의 스파이더맨 영화 (2002–2007)를 보며 감독의 강점을 식별하고 그에 대한 글을 쓸 수 있었다.왈드론은 《대혼돈의 멀티버스》를 레이미의 "대형 슈퍼히어로 영화" 복귀작이라 묘사하며, 샘 레이미 영화의 모든 면이 반영될 것이라 말했다. 그러면서 레이미가 좋은 실적을 보인 "조금 공포스러운 방향"도 그 중 하나라고 덧붙였다. 팔머는 왈드론이 《로키》에서 다중 우주를 도입하여 마블 스튜디오는 관객들에게 개념을 다시 설명할 필요 없이 "좋은 이야기를 전달하는 단계로 건너뛸 수 있었고" "SF 개념에 생동감을" 불어넣는 데 도움이 되었다고 말했다. 왈드론이 《릭 앤 모티》 시리즈를 집필하면서 얻은 경험은, 그가 "커다란 공상과학적 개념을 지루한 세부 사항에 얽매이지 않고, 청중이 이해하고 즐길 수 있도록 소개"하는 데 도움이 되었다. 왈드론은 멀티버스로 영화의 범위와 분량을 확장하는 것보다, 그것을 각자의 방식으로 사용할 수 있는 이야기의 "감정적 핵심"로 보았다. 멀티버스를 통해 "가상 시나리오"나 인물의 다른 버전과 같이 영화의 주인공을 성찰하거나, 인물의 대체물을 통해 좋고 나쁜 선택지가 있었음을 탐구한다는 것이다. 왈드론은 《닥터 스트레인지》를 여러 번 보았고, 원작에서 스트레인지의 이야기를 이해하기 위해 자신이 그 영화의 "학생"이 되었다고 말했다. 또한 다른 MCU 영화를 거치며 캐릭터가 어떻게 발전했는지 살펴보았고, 레이미는 왈드론의 상상력과 마블 역사 지식이 각본에 보탬이 되었다고 호평했다. 크리에이티브 팀은 애니메이션 시리즈 《왓 이프..?》의 초기 제작 작업도 참관했다. 그 시리즈에서 스트레인지가 어떻게 묘사되었는지 알기 위해서였다.
월드론은 막시모프를 "가장 큰 총알"이라고 묘사했으며, 그녀는 만화에서 그랬던 것처럼 MCU에서 악당이 될 운명이었다고 말했다. 특히 《완다비전》의 후반부에서 "'그녀의 가족은 진짜가 아니다'라는 사실이 밝혀진 이후 "다크홀드를 얻고... 저편에 그녀의 진짜 아이들이 존재한다는 사실을 알게 됩니다. '저주받은 책'이 당신의 귓가에 아이들이 저편에 있고 데려올 수 있다고 속삭인다면, 끔찍한 짓을 하게 만들 수도 있겠죠." 완다가 영화 후반부에서 악당이 된다면, 또 다른 프로젝트가 그녀를 악역으로 사용할 "재미"가 생길 것을 알고 있었다. 그는 또한 정복자 캉과 같은 다른 멀티버스 관련 악당을 추가함으로써 영화가 "오버"하는 건 피하고 싶어했다. 그렇게 되면 "주인공도 진정한 악당도 못 되는 바람 빠진 완다"가 나올 것이라고 느꼈다.올슨은 자신이 그저 "찬조 출연"일 것이라 생각해서 악역 연기를 망설였지만, 《완다비전》과 《대혼돈의 멀티버스》의 조합은 TV 시리즈의 가련한 캐릭터 연기를 본 관객이 영화를 관람하며 상반된 감정을 느끼게끔 할 기회를 주었다고 생각하게 되었다. 왈드론은 막시모프의 이야기가 시리즈의 연속이라는 점을 확실히 하기 위해, 올슨, 《완다비전》의 수석 작가 잭 셰퍼와 긴밀히 협업했다. 레이미도 영화가 그녀의 캐릭터에 맞는 "적절한 이야기 흐름과 캐릭터 성장 동력"을 유지하도록 하기 위해 시리즈를 연구했다.올슨에게는 이 영화가 《완다비전》의 반복이 아닌 캐릭터의 진화라는 점이 중요했다. 올슨은 시리즈와 너무 비슷하다고 생각하는 장면을 피하기 위해 대본에 몇 가지 조정을 요청했다. 이 영화에서 막시모프의 수많은 살인을 정당화하기 위해, 올슨은 시리즈에서 그녀의 아이들을 잃은 후 그녀의 말을 듣지 않고 되려 가로막는 사람들에 대한 캐릭터의 관점에 초점을 맞췄다.
《완다비전》의 컴버배치 출연 계획이 기획 후반부에 엎어지자, 《대혼돈의 멀티버스》 대본을 다시 작성해야 했다. 페이기는 이를 "매우 헌신적인 조정과 혼돈의 멋진 조합"으로 묘사했다. 이때 영화에서 스트레인지와 막시모프가 만나는 방식 등 여러 사항이 바뀌었다. 《대혼돈의 멀티버스》의 이야기는 여전히 《완다비전》이 사전에 설정하지만, 이 영화는 시리즈를 보지 않은 관객들도 이해할 수 있도록 기획되었다. 다크홀드의 외양이 일관성있게 보이도록, 영화의 소품부는 《완다비전》에 사용된 소품을 디자인한 다음 영화에 재사용했다. 그의 첫 번째 초안을 쓰는 동안 왈드론은 알려진 마블 캐릭터의 대체 우주 버전을 도입함으로써 영화가 "멀티버스에서 혼미해지고 광기를 마주하도록" 해야 한다고 느꼈다. 이 발상은 코믹스의 비밀 결사인 일루미나티 도입으로 이어졌다. 왈드론은 대본의 스릴러 느낌을 주려고 영화 《에이리언 2》(1986)를 보고 있었고, 영화 후반부에 에일리언을 공포스러운 악당으로 보이기 위해 "양아치" 스페이스 마린들이 그들에게 어떻게 "그냥 도륙되는지" 즐겼다. 그는 팬들이 보고 싶어하는 캐릭터들을 일루미나티로 모아 등장시키고, 완다가 그들을 모두 죽이도록 함으로써 저 영화와 비슷한 장면을 연출하고 싶어했다. 영화 후반부에 스트레인지가 시체를 조종한다는 아이디어는 그가 다른 우주의 완다를 만나는 방법을 토의하던 중 왈드론과 팔머가 고안한 것이다. 영화 초반부에 이미 다른 스트레인지의 시체가 등장했다. 처음에 레이미는 이전 좀비 영화에서 반복했던 좀비 시퀀스는 피하고 싶어했으나, 이후 그와 페이기, 컴버배치는 이 아이디어에 대해 모두 흥분했다.
2020년 4월 말, 소니 픽처스가 《스파이더맨: 노 웨이 홈》의 배봉일을 2021년 11월로 변경하면서, 본작의 일정도 다시 2022년 3월 25일로 변경되었다. 그때까지 월드론은 《노 웨이 홈》 이전에 《대혼돈의 멀티버스》가 개봉될 것으로 예상하며 대본을 쓰고 있었다. 그는 노웨이 홈 작가 크리스 매케나, 에릭 소머스와 집필 중 접촉했고, 발매일 변경 후 그들은 각자의 대본을 조정하여 《대혼돈의 멀티버스》가 "멀티버스의 뚜껑을 여는" 대신, "《노 웨이 홈》 with 스트레인지"에서 먼저 선보이기로 했다. 이 변경으로 대본의 나머지 부분은 "강타"를 받았다. 본래 아메리카 차베즈는 《노 웨이 홈》에서 첫 등장할 계획이었다. 레이미는 대본상 《노 웨이 홈》에서 다른 우주의 캐릭터들이 MCU에 들어가는 것을 보고, 《대혼돈의 멀티버스》는 MCU의 캐릭터들이 멀티버스에 들어가 다른 우주를 탐험하는 모습을 담고 있었다고 언급했다. 에지오포는 6월에 참여를 확언했고, 10월에는 소치 고메즈가 합류했다. 컴버배치는 그 달 런던에서 11월 초까지 촬영을 시작할 것이라고 밝혔다. 제작 과정은 영국의 코로나19 확산으로 2020년 11월 5일부터 12월 2일까지 이뤄진 봉쇄 조치에 영향을 받지 않았다.