아미노산
물리화학적 특성 > 표준 아미노산의 약어 및 특성에 관한 표

이 부분의 본문은 단백질생성성 아미노산입니다.
비록 한 문자 약어가 표에 표시되어 있지만 IUPAC-IUBMB는 "한 문자 약어의 사용은 긴 서열을 비교할 때로 제한되어야 함"을 권장하고 있다.
| 아미노산 | 3문자 및 1문자 약어> 3 | 3문자 및 1문자 약어> 1 | 곁사슬> 부류 | 곁사슬> 극성 | 곁사슬> pH 7.4에서의 순전하 | 소수성 지표 | 분자 흡수 계수> 파장, λmax (nm) | 분자 흡수 계수> 계수 ε (mM−1·cm−1) | 분자량 | 단백질에서의 풍부도 (%) | 표준 유전 부호, IUPAC 표기법 |
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| 알라닌 | Ala | A | 지방족 | 비극성 | 중성 | 1.8 |  |  | 89.094 | 8.76 | GCN |
| 아르기닌 | Arg | R | 고정 양이온 | 염기성 극성 | 양전하 | −4.5 |  |  | 174.203 | 5.78 | MGR, CGY |
| 아스파라긴 | Asn | N | 아마이드 | 극성 | 중성 | −3.5 |  |  | 132.119 | 3.93 | AAY |
| 아스파르트산 | Asp | D | 음이온 | 브뢴스테드 염기 | 음전하 | −3.5 |  |  | 133.104 | 5.49 | GAY |
| 시스테인 | Cys | C | 싸이올 | 브뢴스테드 염기 | 중성 | 2.5 | 250 | 0.3 | 121.154 | 1.38 | UGY |
| 글루타민 | Gln | Q | 아마이드 | 극성 | 중성 | −3.5 |  |  | 146.146 | 3.9 | CAR |
| 글루탐산 | Glu | E | 음이온 | 브뢴스테드 염기 | 음전하 | −3.5 |  |  | 147.131 | 6.32 | GAR |
| 글리신 | Gly | G | 지방족 | 비극성 | 중성 | −0.4 |  |  | 75.067 | 7.03 | GGN |
| 히스티딘 | His | H | 방향족 양이온 | 브뢴스테드 산 및 염기 | 양전하, 10% 중성, 90% | −3.2 | 211 | 5.9 | 155.156 | 2.26 | CAY |
| 아이소류신 | Ile | I | 지방족 | 비극성 | 중성 | 4.5 |  |  | 131.175 | 5.49 | AUH |
| 류신 | Leu | L | 지방족 | 비극성 | 중성 | 3.8 |  |  | 131.175 | 9.68 | YUR, CUY |
| 리신 | Lys | K | 양이온 | 브뢴스테드 산 | 양전하 | −3.9 |  |  | 146.189 | 5.19 | AAR |
| 메티오닌 | Met | M | 싸이오에터 | 비극성 | 중성 | 1.9 |  |  | 149.208 | 2.32 | AUG |
| 페닐알라닌 | Phe | F | 방향족 | 비극성 | 중성 | 2.8 | 257, 206, 188 | 0.2, 9.3, 60.0 | 165.192 | 3.87 | UUY |
| 프롤린 | Pro | P | 고리 구조 | 비극성 | 중성 | −1.6 |  |  | 115.132 | 5.02 | CCN |
| 세린 | Ser | S | 하이드록실기가 있음 | 극성 | 중성 | −0.8 |  |  | 105.093 | 7.14 | UCN, AGY |
| 트레오닌 | Thr | T | 하이드록실기가 있음 | 극성 | 중성 | −0.7 |  |  | 119.119 | 5.53 | ACN |
| 트립토판 | Trp | W | 방향족 | 비극성 | 중성 | −0.9 | 280, 219 | 5.6, 47.0 | 204.228 | 1.25 | UGG |
| 티로신 | Tyr | Y | 방향족 | 브뢴스테드 산 | 중성 | −1.3 | 274, 222, 193 | 1.4, 8.0, 48.0 | 181.191 | 2.91 | UAY |
| 발린 | Val | V | 지방족 | 비극성 | 중성 | 4.2 |  |  | 117.148 | 6.73 | GUN |
일부 생물종에서는 일반적으로 종결 코돈으로 해석되는 코돈에 의해 암호화되는 두 가지 추가적인 아미노산이 있다.
| 21번째 및 22번째 아미노산 | 3문자 약어 | 1문자 약어 | 분자량 |
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| 셀레노시스테인 | Sec | U | 168.064 |
| 피롤리신 | Pyl | O | 255.313 |
특정 아미노산 코드 외에도 플레이스홀더는 펩타이드 또는 단백질의 화학적 또는 결정학적 분석이 잔기의 정체를 확실하게 결정할 수 없는 경우에 사용된다. 이들은 또한 보존된 단백질 서열 모티프를 요약하는 데 사용된다. 유사한 잔기의 세트를 나타내는 단일 문자의 사용은 축퇴 염기에 대한 약어 코드의 사용과 유사하다.
| 모호한 아미노산 | 3문자 약어 | 1문자 약어 | 포함되는 아미노산 | 포함되는 코돈 |
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| 모두 / 알 수 없음 | Xaa | X | All | NNN |
| 아스파라긴 또는 아스파르트산 | Asx | B | D, N | RAY |
| 글루타민 또는 글루탐산 | Glx | Z | E, Q | SAR |
| 류신 또는 아이소류신 | Xle | J | I, L | YTR, ATH, CTY |
| 소수성 아미노산 |  | Φ | V, I, L, F, W, Y, M | NTN, TAY, TGG |
| 방향족 아미노산 |  | Ω | F, W, Y, H | YWY, TTY, TGG |
| 지방족 아미노산 |  | Ψ | V, I, L, M | VTN, TTR |
| 크기가 작은 아미노산 |  | π | P, G, A, S | BCN, RGY, GGR |
| 친수성 아미노산 |  | ζ | S, T, H, N, Q, E, D, K, R | VAN, WCN, CGN, AGY |
| 양전하를 띤 아미노산 |  | + | K, R, H | ARR, CRY, CGR |
| 음전하를 띤 아미노산 |  | − | D, E | GAN |
Unk는 때때로 Xaa 대신 사용되지만 덜 표준적이다.
Ter 또는 * (종결에서)는 종결 코돈이 존재할 때 단백질의 돌연변이 표기법으로 사용된다.
또한 많은 비표준 아미노산에는 특정 코드가 있다. 예를 들어 보르테조밉 및 MG132와 같은 여러 펩타이드 약물들은 인공적으로 합성되며 특정 코드가 있는 보호기를 유지한다. 보르테조밉은 Pyz–Phe–boroLeu이고 MG132는 Z–Leu–Leu–Leu–al이다. 단백질 구조의 분석을 돕기 위해 광반응성 아미노산 유사체를 사용할 수 있다. 여기에는 포토류신(pLeu)과 포토메티오닌(pMet)이 포함된다.