클레오파트라의 재위 기간
율리우스 카이사르와의 관계

율리우스 카이사르의 전역, 알렉산드리아 공방전 (기원전 47년) 및 나일강 전투 (기원전 47년) 문서에 이 부분의 추가 정보가 있습니다.
앞면에서 기원전 51년-31년 당시의 흉상을 나타낸, 이집트 알렉산드리아에서 발행된 클레오파트라의 주화
율리우스 카이사르의 청동으로 만든 로마 시대 흉상 (좌)과, 왕실의 다이아뎀을 착용한 클레오파트라의 로마 시대 흉상인 베를린의 클레오파트라 (우). 베를린의 클레오파트라는 기원전 1세기 중엽의 것으로 (기원전 46–44년에 그녀가 로마를 방문하던 당시), 아피아가도에 있던 한 저택에서 발견되었으며 현재는 베를린 구 박물관에 소장되어 있다.
카이사르는 즉시 군비로 사용하기 위해 로마에 대한 빚 1,750만 드라크마를 부분 상환하라고 요청했다. 포테이노스는 이 요청에 대해 카이사르가 알렉산드리아를 떠나면 받아들이겠다고 응답했으나 이는 거부되었다. 한편 프톨레마이오스 13세는 카이사르가 도착하기 전에 군대를 해산하고 떠나라는 요구를 완전히 무시하고, 군대의 선두에 서서 알렉산드리아에 도착했다. 클레오파트라는 처음에는 카이사르에게 사절을 보냈으나, 카이사르가 왕족 여성과 관계를 맺고 싶어한다는 소문을 듣고 직접 카이사르를 개인적으로 만나기 위해 알렉산드리아를 방문했다. 역사가인 디오 카시우스는 클레오파트라는 남동생에게 알리지 않고 알렉산드리아를 방문했고, 매력적인 옷을 차려 입고 그녀의 재치와 언변으로 카이사르를 매혹시켰다고 기록했다. 플루타르코스는 클레오파트라가 카이사르를 만나기 위해 몰래 궁으로 들어갈 때 침대 자루 안에 들어가 있었다는 완전히 다른 설명을 하는데, 아마도 신화적인 요소가 가미된 것으로 여겨진다.
프톨레마이오스 13세는 그의 누이가 펠루시온이 아닌 궁에서 카이사르와 직접 협력하고 있다는 것을 알아차리자 알렉산드리아의 대중들 사이에서 폭동이 일어나게끔 시도했다. 카이사르는 그를 저지하고 궁전 밖에 모인 성난 군중들을 웅변술을 이용해 진정시켰다. 그 후 카이사르는 클레오파트라와 프톨레마이오스 13세를 알렉산드리아 회의 앞에 세웠다. 여기에서 카이사르는 이전에 폼페이우스가 소유했던 프톨레마이오스 12세의 유언장을 공개했는데, 프톨레마이오스 12세는 클레오파트라와 프톨레마이오스 13세를 공동 상속자로 지명했다. 그런 다음 카이사르는 다른 두 형제인 아르시노에 4세와 프톨레마이오스 14세가 함께 키프로스를 다스리도록 하여 이집트 왕좌에 대한 잠재적 경쟁자를 제거하려고 했다. 또한 이를 통해 기원전 58년에 로마에 키프로스를 잃은 것에 대해 여전히 괴로워하는 프톨레마이오스 신민들을 달래주는 효과도 있었다.
포테이노스는 이 협정은 실제로 프톨레마이오스 13세보다 클레오파트라 쪽에 유리했으며, 가비니아니를 포함한 프톨레마이오스 13세의 20,000명의 군대가 지원을 받지 못하고 있는 카이사르의 4,000명의 군대를 무찌를 가능성이 높다고 판단했다. 그는 아킬라스가 군대를 이끌고 알렉산드리아로 가 카이사르와 클레오파트라를 공격하도록 결정했다. 이로 인해 카이사르와 클레오파트라는 이듬해인 기원전 47년까지 성 안에 갇혔다. 카이사르는 항구의 배를 불태웠고 불은 번져 알렉산드리아 도서관 일부까지 태웠다. 포테이노스는 카이사르를 암살하려고 시도했고, 이후 카이사르는 그를 처형했다. 아르시노에 4세는 아킬라스와 연합하여 여왕으로 추대되었다. 얼마 지나지 않아 그녀는 그녀의 교사였던 가니메데스에게 아킬라스를 죽이게 하고 군대의 사령관 자리를 맡겼다. 가니메데스는 카이사르를 속여 당시 포로로 잡혀 있던 프톨레마이오스 13세를 중재자로 초대한 후 아르시노에 4세의 군대에 합류하도록 만들었다. 가니메데스는 성에 대한 지식이 해박하여 그 지식을 이용해 배관을 통해 바닷물을 저수지로 들여보내려고 했다. 이에 클레오파트라와 카이사르는 민물이 나오는 우물을 짓도록 지시하여 대응했다.
클레오파트라를 묘사한 것으로 추정되는, 폼페이 제3양식으로 그려진 고대 로마의 프레스코화 (1세기 중엽, 이탈리아 폼페이의 과수원의 집)
기원전 47년의 1월과 3월 사이의 어느 날, 카이사르의 군대가 도착하였다. 이 병력에는 페르가몬의 미트리다테스와, 시기적절한 도움으로 로마 시민권(이 신분은 아들 헤로데 대왕에게 전해졌을 것이다)을 획득했을 에돔의 안티파테르가 이끄는 병력들이 있었다. 프톨레마이오스 13세와 아르시노에 4세는 나일강에서 병력을 철수했는데, 카이사르는 이들을 공격했고 프톨레마이오스 13세는 배를 타고 달아날 수밖에 없었다. 그러나 이 배는 뒤집혀 파라오는 익사하고 말았고, 시신은 이후에 근처 진창에서 발견됐다. 가니메데스는 아마도 이 전투 중에 전사한 것으로 본다. 테오도토스는 이후에 아시아 지역에서 마르쿠스 브루투스에게 발견되어 처형되고 만다. 아르시노에 4세는 에페소스의 아르테미스 신전에서 처형되기 앞서 로마에서 열린 카이사르의 개선식에 전시됐었다. 클레오파트라는 이 사건들에 모습을 보이지 않았고 궁전에 있었는데(아마 기원전 47년 9월 이래로), 카이사르의 아이를 그녀가 임신했기 때문이었을 것이다. 그녀는 기원전 47년 6월 23일에 카이사리온을 낳았다. 카이사르와 클레오파트라는 다 같이 알렉산드로스 대왕의 무덤을 방문한 것으로 보인다. 카이사르는 또한 알렉산드리아의 동쪽 성벽 인근에다가 방부 처리된 폼페이우스의 머리에 대한 적절한 장례를 치르기로 하였다.
집정관으로서 카이사르의 임기는 기원전 48년을 끝으로 종료되었다. 하지만, 최근 파르살루스 전투를 마치고 로마로 복귀한 그의 부관 마르쿠스 안토니우스는 카이사르의 독재관 선출을 해내는 데 도움을 주었다. 이 직위는 기원전 47년 10월까지 1년간 임기가 유지되며, 카이사르에게 이집트에서 벌어진 왕가의 분쟁을 해결할 합법적 권한을 부여하였다. 단독 여성 군주를 세우며 일어난 베레니케 4세의 실수를 반복하는 것을 우려한, 카이사르는 12세의 프톨레마이오스 14세를 명목상의 결혼을 통해 22세의 클레오파트라의 공동 통치자로 세웠고, 그렇지만 클레오파트라는 계속해서 카이사르와 거주했다. 키프로스가 그녀의 통치권으로 돌아간 정확한 시기는 알려져 있지 않지만, 기원전 42년 쯤에 그녀는 그곳에 총독을 두었었다.
긴급한 정치적 문제 때문에 로마로 귀환하기 전, 카이사르는 클레오파트라와 함께 나일강을 유람하며 조형물들을 관람했다는 주장이 있다. 그러나 이는 실제 역사적 사건이 아닌 후기 로마의 부유함을 반영하는 낭만적인 이야기일 수 있다. 역사가 수에토니우스는 이 여행에 대해 상당히 자세히 기술하였는데, 그중에는 탈라메고스를 유람용 바지선으로 썼다는 기록도 있다. 이 배는 프톨레마이오스 4세가 그의 재위 기간 동안 처음으로 건조하였는데, 길이는 91m에 높이는 24m에 이를 정도였으며 떠 다니는 건물을 닮은 두 개의 갑판을 따라 식당, 침실, 신을 모시기 위한 방, 산책로 등도 완비되어 있었다. 클레오파트라는 몇 년 뒤 타르수스에 있는 안토니우스의 임시 본부로 항해하기 위해 탈라메고스를 다시 사용했다고 추정된다. 탈라메고스의 디자인은 거의 확실히 후기 로마의 네미선에 영향을 미쳤다. 카이사르는 로마의 지리학에 매료되어 있었기 때문에 나일강의 크루즈선에 흥미를 가졌을 수 있다. 그는 에라토스테네스와 피테아스의 저서를 탐독했었고, 그로 인해 나일강의 근원을 발견하고 싶어했을 수 있다. 그러나 전하는 바에 따르면 그의 군대는 에티오피아에 거의 다다른 후 돌아갈 것을 요구했다고 한다.
카이사르는 기원전 47년 4월경에 이집트를 떠났다. 이 이유는 미트리다테스 대왕의 아들 폰토스의 파르나케스 2세가 아나톨리아에서 문제를 일으켜 해결해야 할 필요가 있어서라고 한다. 그렇지만 저명한 로마 여성 칼푸르니아와 혼인한 몸이던 카이사르가 자신의 아이를 낳은 클레오파트라와 같이 있는 모습을 보이고 싶지 않아 그랬을 가능성도 있다. 그는 클레오파트라의 미약한 위치를 지키고 또한 그녀의 활동을 감시하기 위해 이집트로 해방 노예 출신 루피오 휘하의 군단 세 개를 보냈고, 그 뒤에는 네 개로 늘렸다.
멤피스의 세라페이온에 있는 석비에 따르면, 클레오파트라와 카이사르 사이에서 태어난 걸로 추정된 자녀가 기원전 47년 6월 23일에 태어났다. 스텔레에서 그는 '파라오 카이사르'라 불렸지만, 알렉산드리아인들은 아버지의 이름을 딴 카이사리온이라 부르는 걸 선호했다. 카이사르는 칼푸나리아와의 사이에서 여전히 아이가 없었기 때문에, 카이사리온에 대해서는 침묵을 지켰다. 카이사르는 공개적으로 아버지가 된 것에 대해서 부정했지만, 사적으로는 그를 아들로 받아들였다는 상충되는 증거들이 있다. 반면 클레오파트라는 카이사리온이 자신의 혈통이며 카이사르가 아버지라는 공식적인 선언을 반복하여 내세웠다. 또한 그녀는 카이사르를 숭배하기 위해 케사리움 사원을 알렉산드리아 항구 근처에 지었다.
왼쪽 사진: 아르시노에 2세나 클레오파트라를 여신으로서 묘사한 이집트의 조각상. 검은색 현무암을 이용하여 기원전 1세기 후반에 만들어졌다. 에르미타시 박물관, 상트페테르부르크
 오른쪽 사진: 로마나 그리스-이집트식의 비너스 조각상인 에스퀼리노의 비너스로, 클레오파트라를 묘사했을 가능성이 가장 크다. 카피톨리니 미술관, 로마
클레오파트라와 그녀의 명목상의 공동 통치자였던 프톨레마이오스 14세는 기원전 46년 후반의 언젠가에, 아마도 카이사리온 없이 로마를 방문했다. 그들은 호티 카이사리스 내의 카이사르의 빌라에서 묵었다. 그들의 아버지인 프톨레마이오스 12세에게 했던 것과 똑같이, 카이사르는 클레오파트라와 프톨레마이오스 14세 모두에게 '로마인들의 친구이자 동맹'(라틴어: socius et amicus populi Romani)이라는 법적 지위를 부여했는데, 이는 사실상 로마에게 충성하는 종속국의 통치자라는 뜻이었다. 테베레강 건너편에 있는 카이사르의 빌라에서 클레오파트라를 방문했던 저명한 인물에는 상원의원 키케로가 있었다. 키케로는 그녀에게 아첨하지 않았으며, 특히 그녀의 고문 중 한 명이 키케로가 알렉산드리아 도서관에서 요청했던 책을 그에게 주지 않은 후에 그녀가 오만하다는 것을 알았다. 클레오파트라 궁정의 구성원 중 한 명이었던 소시게네스는 기원전 45년 1월 1일 새로이 발효되었던 율리우스력의 계산을 할 때 카이사르를 도왔다. 기원전 46년 9월 25일 카이사르 포룸에 세워진 베누스 게네트릭스 신전에는 클레오파트라 황금상 (이 조각상은 서기 3세기에도 존재했다)이 있었는데, 로마인들의 어머니 신 베누스를 카이사르의 자녀의 어머니와 직접적으로 연관시켰다. 이 황금상은 또한 이집트의 토착신인 이시스와 로마 종교를 미묘하게 연결시키기도 했다. 카이사르는 그가 죽은 뒤에 1년 안에 로마 원로원의 표결을 통하여 로마에 이시스 신전을 세울 계획이 있었을 수도 있다.
플레처는 클레오파트라가 기원전 44년까지 로마에 계속 있었는지 혹은 폼페이우스의 아들들과의 전쟁을 위해 기원전 46년 11월에 카이사르가 로마령 스페인으로 떠나자 이집트로 잠깐 돌아갔는지는 불분명하다고 주장하였다. 클레오파트라는 또한 카이사르가 암살되던 때인 기원전 44년에는 로마에 있었는데, 이것이 한번에 2년간 로마에 장기간 머물렀던 것인지 아니면 별도의 두 차례 방문인지는 확실치 않다. 롤러에 의하면 후자가 가능성이 더 높다고 한다. 그가 주장하는 가장 가능성 높은 클레오파트라의 로마 체류는 카이사르가 암살되기 한달 전에 열린 루페르칼리아 행사 때 영향을 주었다고 한다. 마르쿠스 안토니우스는 카이사르의 머리에 다이아뎀을 씌워주려고 했으나, 그가 거부하였다. 이는 미리 각본을 짜둔 의도적 행동일 확률이 높으며, 아마 헬레니즘 방식의 왕권 통치를 받아들이는 것에 대한 로마 대중들의 분위기를 파악하려 했던 것으로 추정된다. 이 행사 때 있던 키케로는 조롱하듯이 그 다이아뎀을 어디서 났냐고 물었는데, 그가 혐오하던 프톨레마이오스의 여왕을 분명하게 언급하는 것이었다.
카이사르는 기원전 44년 3월 15일 암살되었으나, 클레오파트라는 카이사리온이 카이사르의 후계자로 인정 받기를 원하는 헛된 희망을 품고 4월 중순까지도 로마에 머물렀다. 그러나 카이사르는 유언에서 그의 조카인 옥타비아누스를 주요 후계자로 지명했다. 클레오파트라가 이집트로 떠나기로 결심했을 때와 동시에 옥타비아누스는 이탈리아에 도착했다. 수 개월 뒤 클레오파트라는 프톨레마이오스 14세를 독살하고 그녀의 아들인 카이사리온을 대신 공동 통치자로 세울 계획을 꾸민다.