1991년 크로아티아의 유고슬라비아 전역
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1992년 1월 기준 크로아티아의 주요 도시 점령국 상황 지도. 빨강으로 칠해진 곳은 세르비아계 국가인 세르비아 크라이나 공화국이 장악한 영토이다.
크로아티아에서의 유고슬라비아 인민군 전역은 교착 상태로 끝났고 양 측은 국제적으로 감독하는 휴전 협상을 받아들었다. 11월 말 들어 유고 인민군은 더 이상 실질적으로 성과를 얻을 수 있는 상황이 아니었고 밀로셰비치는 더 이상 달성할 수 없다고 생각되는 목표는 추구해선 안된다고 말했다. 1991년 9월에서 12월 사이 크로아티아 육군은 많은 무기를 노획하고 전투력이 크게 올랐다. 1992년 1월 중순에는 155,772명의 병력에 전차 216대, 기타 장갑차 127대, 포 1,108문을 보유했다. 서슬라보니아의 유고 인민군 진지는 군사적 붕괴 직전에 놓였으나 크로아티아 육군은 다른 곳에서 보급에 어려움을 겪어 군수품 비축량이 바닥났고 여기에 유엔의 무기 금수 조치까지 겪어 신속한 재보급이 불가능했다. 1991년 말까지 분쟁으로 크로아티아인 6천명이 사망했다. 또한 23,000명이 부상을 입었고 40만명 이상이 국내실향민이 되었다. 일부 출처에서는 국내실향민의 수를 최대 60만명까지 잡아 추정한다. 6천명의 사망자에는 군인 사망자 3,761명도 포함된다. 유고 인민군의 피해는 공식적으로 사망자 1,279명이지만 전쟁 중 사망자는 지속적으로 과소보고되었으므로 실제 사상자수는 이보다 훨씬 높다고 추정된다. 서슬라보니아에서 있었던 크로아티아군의 반격 작전으로 세르브인 2만명의 난민이 발생했다. 이들은 유고 인민군이 세르브계 군사에 철수 명령을 내리자 이 지역에서 도망쳤고 이후 유고 인민군이 점령한 버러녀 지역에 정착했다.
1991년에서 1992년 초까지 크로아티아 시민 약 18,000명이 실종되었거나 유고 인민군 혹은 그 동맹군에게 구금당했다. 이 중 약 8천명이 세르비아, 몬테네그로, 보스니아 헤르체고비나 또는 유고 인민군이 통제하는 크로아티아 영토 내 강제수용소에 구금되었다. 유고 인민군이 운용한 대표적인 수용소로는 베게이치 수용소, 스타이체보 수용소, 스렘스카미트로비차 감옥, 니시 수용소, 알렉시나츠 수용소, 마냐차 수용소, 바냐루카 수용소, 크닌 수용소, 부체 수용소, 벨리마나스티르 수용소, 네고슬라브치 수용소, 벨레프로메트 수용소, 모린 수용소 등이 있다. 수용소에 구금되었던 죄수 중 약 300명이 사망했다. 수감자 대부분은 1992년 8월에 석방되었다. 2013년 5월 기준 1991년 전역 과정에서 발생한 1,703명은 현재까지도 실종 상태이다. 양 측은 분쟁 기간 많은 잔학 행위를 일으켰다. 크로아티아군이 저지른 가장 큰 규모의 학살은 고스피치 학살이다. 세르브인의 잔학 행위는 그 규모가 이보다 훨씬 컸다. 가장 큰 학살이 발생한 곳으로는 키예보 마을 학살, 부코바르 점령 이후 발생한 200명 이상의 학살 사건인 부코바르 학살, 두브로브니크 포격 등이 있다. 이런 전쟁범죄를 일으킨 피의자는 이후 유엔 안전 보장 이사회 결의 제827호에 따라 1993년 설립된 구유고슬라비아 국제형사재판소(ICTY)에 기소되었다.
세르브인이 일으킨 여러 잔학 행위 때문에 독일은 1991년 11월 중순 크로아티아와 정식으로 수교를 맺었다. 독일은 12월 말에는 영국, 프랑스, 미국의 반대를 물러내고 1991년 12월 23일 크로아티아를 독립국으로 정식으로 인정했다. 독일의 결정에 이어 1992년 1월 15일에는 다른 유럽 공동체 회원국도 크로아티아의 독립을 인정했다. 세르브계 크로아티아인은 1991년 12월 21일 크로아티아 영토의 약 30%를 차지하는 유고 인민군 점령 지역을 자칭 독립국인 세르비아 크라이나 공화국(RSK)의 영토라고 선언했다. 세르비아 크라이나 공화국은 경제적, 재정적으로 모국 세르비아에 의존했다.
전장의 교착 상태로 유엔 사무총장 특사였으며 협상 과정에서 미국 외교관 허퍼트 S. 오쿤과 유엔 특별정치담당 사무차장이었던 마라크 굴딩의 도움을 받아 미국의 국무장관 사이러스 밴스가 만든 평화안인 밴스 계획이 입안되었다. 밴스 계획은 크로아티아에서의 적대 행위를 확실하게 종식시킨다는 목표를 가졌다. 밴스 계획에서는 휴전, 유엔 보호구역으로 지정된 특정 지역의 민간인 보호, 크로아티아 내 유엔 평화유지군인 유엔보호군 배치 등이 담겼다. 밀로셰비치, 카디예비치, 투지만은 이 계획을 승인했고 세 사람은 1991년 11월 23일 스위스 제네바에서 제네바 협정에 서명했다. 제네바 협정에서는 크로아티아의 유고 인민군 막사 봉쇄 종료, 크로아티아 내 유고 인민군의 병력과 장비 철수, 휴전 이행 및 인도주의적 지원 제공 촉진 등이 담겼다. 또한 서명 당사자는 크로아티아 내 유엔 평화 유지 임무인 유엔보호군 투입에 찬성했다. 이후 평화 유지 임무는 유고슬라비아 정부가 제출한 유엔 평화 유지군 배치 공식 요청에 따라 11월 27일 유엔 안전 보장 이사회 결의 제721호에서 승인받았다. 평화유지군 배치에 필요한 휴전을 보장하는 이행협정은 1992년 1월 2일 크로아티아의 국방부 장관 고이코 슈샤크와 유고 인민군 제5군구 사령관인 안드리야 라셰타가 보스니아 헤르체고비나의 사라예보에서 만나 서명했다. 휴전은 1992년 1월 3일 오후 6시부터 발효되었으나 두브로브니크 지역은 1992년 7월까지 유고 인민군이 두브로브니크와 코나블레 마을 주변에 계속 주둔하며 분쟁이 계속되었다. 두브로브니크의 해상 봉쇄는 1992년 5월 26일에 해제되었다. 조직 문제와 정전 협정 위반 때문에 3월 8일이 되어서야 크로아티아에 평화유지군이 배치되기 시작했다. 역사학자인 마르코 아틸라 화레는 밴스 계획이 세르브계 반군을 패배로부터 구해냈다고 평가했다.
1991년 크로아티아 내 유고 인민군의 작전 계획 지도
1991년 9월부터 1992년 1월까지 동슬라보니아 지역의 전황도
1991년 9월에서 1992년 1월 사이 서슬라보니아 지역의 전황도
1991년 10월에서 1992년 1월 사이 바노비나, 코르둔, 리카 지역의 전황도
1991년 10월에서 1992년 1월 사이 두브로브니크 지역의 전황도
1992년 1월 기준 북달마티아 지역의 전황도