닥터 후의 역사
2000년대 > 9대 닥터 (2005년)

9대 닥터  문서를 참고하십시오.
2003년 9월, 헤제시는 휴방된 지 이미 수년이 흘렀고 영화 제작도 실현될 기미를 보이지 않는 만큼, BBC 텔레비전에서 새 시리즈를 만들어야 한다는 끈질긴 설득으로 BBC 월드와이드 측으로부터 제작허가를 받아내기에 이른다. 트렌터와 헤제시는 다른 프로듀서 후보 제의에도 불구하고 다시 한번 데이비스를 찾아가기로 결정했다. 데이비스도 BBC에서 다른 프로젝트 제작 건으로 연락할 때 닥터후 새 시리즈가 아닌 이상 돌아가지 않겠다고 답했던 만큼, 두 사람의 제의를 곧바로 수락하였다. 2003년 9월 26일, 마침내 닥터 후가 부활한다는 소식이 공식적으로 발표됐다. 2004년부터 BBC 웨일스에서 제작하여 2005년 BBC One에서 방영될 예정이라는 소식이었다.
러셀 T 데이비스는 수석작가이자 총괄 프로듀서로서 드라마를 이끌게 되고, 다른 작가로 마크 게이티스, 스티븐 모펏, 폴 코넬, 롭 셰어맨이 섭외됐다. 프로듀서로는 필 콜린슨이, 공동 총괄프로듀서로는 맬 영과 BBC 웨일스 드라마국장 줄리 가드너가 임명됐다. 다만 맬 영은 제작이 한창이던 2004년 말 BBC를 떠나면서 드라마 제작에서도 하차하였다. 새 테마곡의 작곡담당은 머리 골드가 맡기로 하였다. 한편 드라마의 제작을 기존의 런던이 아닌 웨일스 카디프에서 진행하기로 결정된 데 대해 줄리 가드너는 복합적인 요인의 결과라고 밝혔다. 우선 줄리 가드너와 러셀 T 데이비스 본인들이 웨일스 출신으로서 BBC 드라마 《카사노바》에서 호흡을 맞춘 바 있었고, BBC 측에서도 더 많은 프로그램이 런던에서 벗어나 제작되기를 바랐을 뿐만 아니라, 촬영 장소로 따져봐도 런던보다 웨일스가 훨씬 다양하는 이유에서였다.
데이비스는 올드 시즌의 마지막 시즌이었던 시즌 26에서 넘버링을 잇지 않고 '시리즈 1'로 처음부터 다시 시작하기로 결정했다. 새 시리즈의 구성은 45분 분량의 13개 에피소드였으며, 첫번째 에피소드의 제목은 닥터의 새 동행자 로즈 타일러의 이름을 따온 "Rose"였다. 올드 시즌이 주로 여러 화로 구성된 하나의 이야기, 즉 시리얼 방식을 취했던 것과는 달리, 뉴 시즌에서는 한 화당 하나의 이야기, 또는 2부작으로 구성된 에피소드 방식을 취하도록 했다.
뉴 시즌의 첫번째 닥터가 될 9대 닥터에는 영화와 드라마에서 활동했던 맨체스터 출신의 배우 크리스토퍼 에클스턴이 캐스팅됐다.  러셀 T 데이비스는 뉴 시즌의 시작과 관련해 이전 닥터의 재생성을 보여주기보다는 새 닥터와 함께 시작하기로 결정했는데, 한 인물과 시작했다가 시청자들이 감정이입하기도 전에 바꿔버리는 것은 '정신나간 짓'이라고 생각해서였다. 한편으론 뉴 시즌이 "새로운 프로그램"으로 접해지길 바랐던 러셀의 의도와도 일맥상통했다. 에클스턴의 캐릭터는 이전 닥터들보다 더 현실적인 성격으로, 여전히 재미와 유머를 가지고 있긴 하지만 '쓸데없는 건 다 버렸다'는 것이 러셀의 해설이었다.
첫번째 시즌의 촬영은 2004년 7월 8일 웨일스 카디프에서 시작되었다. 새 로고와 예고편 공개, 인터넷 사전 유출 해프닝에 이어 2005년 3월 26일 오후 7시, BBC One에서 뉴 시즌의 첫번째 에피소드인 "Rose"가 전파를 타면서 닥터후는 15년간의 휴방을 끝내고 비로소 부활하게 되었다. BBC 웨일스는 드라마 본편과 더불어 매주 방송이 끝난 직후 BBC Three에서 방송되는 13부작 비하인드 씬 다큐멘터리 시리즈인 《닥터 후 컨피덴셜》도 기획 제작하였다. "Rose"의 밤사이 평균 시청률은 990만 명을, 순간 최고 시청자수는 1050만 명을 기록하였다. 비디오 녹화분 시청자를 합산한 최종 시청자수는 1081만 명으로 기록되어, 그 주 BBC One 방영 프로그램 가운데 3위, 전 채널 프로그램 가운데 7위를 차지했다. 첫방송이 큰 성공을 거두자, 3월 30일 BBC 드라마국장 제인 트렌터는 2005년 12월 크리스마스 스페셜과 2006년 시즌 2가 제작될 것이라는 소식을 전격 발표하였다.
2005년 방영된 시즌 1은 평론가들과 시청자 모두에게 호평받은 시즌으로 기록됐다. 2005년 TV 초이스/TV 퀵 어워드 배우상 부문에 주연 크리스토퍼 에클스턴이 지명되어 수상의 영예를 안았으며, 작품상 부문에도 닥터 후가 후보로 올랐다. 2005년 10월 25일에는 내셔널 텔레비전 어워드에서 전 부문을 수상하였으며, 이듬해 5월 영국 아카데미상 드라마상을 비롯한 2개 부문에서도 수상하였다. 2004년 4월 6대 닥터 시절 공백기를 주도했던 마이클 그레이드가 BBC 이사회 의장으로 복귀하였는데, 닥터후의 새 시리즈에 관해서는 무관심한 것으로 알려졌으나, 시즌 1이 성공리에 방영을 마친 2005년 6월 BBC 사무총장 마크 톰슨에게 드라마의 인기를 인정하는 이메일을 보냈다.
시즌 2 제작 소식이 발표된 지 머지않아 타블로이드지 더 선과 데일리 익스프레스에서는 크리스토퍼 에클스턴이 닥터 역에서 하차한다는 소식을 전격 보도하였다. 그로부터 머지않아 BBC는 공식 성명을 통해, 에클스턴이 자신의 배역이 굳어지는 것을 우려해 크리스마스 스페셜에 앞서 하차한다는 소식을 확인했다. 닥터후 팬덤에서 인기 있는 포럼인 아웃포스트 갈리프레이에서는 에클스턴의 갑작스러운 하차 소식으로 인한 분노의 게시글이 쇄도하면서, 웹사이트 운영자 숀 리온이 상황 진정을 위해 이틀간 홈페이지를 폐쇄하기도 했다.
에클스턴의 하차가 하루이틀만에 결론날 일은 아니었을 만큼, 제작진이 에클스턴의 하차 의사를 얼마나 오랫동안 알고 있었는지에 관한 추측이 이어졌고, 결국 처음부터 하차가 예정되어 있었으며, 에클스턴의 결정을 수용하기 위해 각본도 그에 맞춰 작성됐다는 사실이 밝혀졌다. 여기에 BBC 측에서 시즌 1 방영이 끝나기 전까지는 하차 소식을 비공개할 것을 에클스턴과 합의했던 사실이 밝혀졌다. BBC 측은 하차 소식을 발표한 성명을 에클스턴의 뜻에 따른 것으로 거짓 발표하였으며, 하차 소식을 공개적으로 밝히지 않기로 한 이전의 합의를 위반했다고 해명했다. 타블로이드의 보도 이후 BBC 언론국에 기자들의 문의가 이어지자 정보 공개가 섣불리 이뤄졌던 것이다.
하차 당시 에클스턴이 밝힌 사유는 이미지가 굳어지는 것이 싫다는 것이었으나, 이후 인터뷰를 통해 제작 도중의 불합리한 상황, 혹은 제작진과의 갈등이 극심했던 것이 진짜 사유라고 밝혔다. 2010년 이브닝 스탠더드와의 인터뷰에서 처음으로 "내가 잘못했다 생각했던 것에 눈이 멀어야 했다"고 털어놓은 에클스턴은 2018년 라디오 타임스와의 인터뷰를 통해 "쇼러너, 프로듀서, 공동프로듀서의 직속상관 세 명과의 관계"를 거론하며 "첫번째 촬영 일정에서 돌이킬 수 없을 정도로 망가졌고 신뢰를 잃었다"고 밝혔다.