アロイジエ・ステピナツ
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1946年9月より、ユーゴスラビア当局はステピナツを、 - ナチスとの共謀罪、ウスタシャ政権下での大量虐殺との関係、宗教的扇動者としてウスタシャ軍内で従軍司祭を務めたこと、銃口をつきつけてのセルビア正教からカトリックへの強制改宗、ユーゴスラビア政府への大逆罪 - などの訴訟で訴えた[要出典]。ステピナツは1946年9月18日に逮捕され、裁判は9月30日から始まった。
ティトー側近のユーゴスラビア高官ミロヴァン・ジラス（Milovan Đilas）は、ステピナツが『私は戦争での疑わしい行為で裁判になることはおそらくないだろう。私は新しいユーゴスラビア国家に公に反対し続けてこなかったのだから。』と言ったと証言した。
ステピナツは、元ウスタシャ政権高官と並んで法廷に立った。エリフ・リサクは死刑を宣告された。イヴァン・シャリチの裁判は、傀儡政府とカトリック教会分子の間でなされた共同関係の解明に取り組むユーゴスラビア政府による決定を反映していた。全部で16人の被告人がいた。
裁判の方法は、カトリック教会、スイス、その他西側数カ国と愛国者らによって批判された。ステピナツは、この裁判は世論操作のための裁判だと主張した。彼は、弁論第4日目の10月3日に長い、38分間のスピーチを行った。その時、彼は自分の良心は告発全てに関連することが明白であると述べ、また自分は自身を守るつもりはなかったし、有罪判決に不服申し立てするつもりもないと述べた。代わりに、自分は嘲笑や軽蔑、屈辱だけでなく、信条のために死も受け入れると述べた。ステピナツはさらにこう述べた『国家が教会を攻撃するのために自分を攻撃している。悪意による改宗はなされなかった』。彼は、同時期にユーゴスラビア王国内にあったように、軍属司祭がクロアチア独立国内で設置された、それは一般兵士の信仰の必要性に呼びかけたもので、軍そのもののためでなかったし、またこれをもって軍による行動の全てを是認した証とはならない、と非難した。さらに、彼は自身がウスタシャであったことは一度もなく、自分のクロアチア愛国心は、セルビア人が治めたユーゴスラビア王国内で国の不平不満から生じたものだと主張し、セルビア人また国家に対する、いかなるテロ活動や反政府活動にも参加したことはないと断言した。
ステピナツは、パルチザンによって260人から270人の聖職者が殺害されたと再び主張し、これらの即決処刑を野蛮だと考えると述べた。彼は教会財産 - 学校、神学校、印刷所の国有化を非難した。そして聖職者の妨害と脅迫と同様に、教育における教会の妨害の連座、出版、慈善活動（慈悲は社会主義者によって堕落だと考えられた）、学校での宗教教育などの妨害を非難した。彼は、一般的な無神論、進化論、実利主義と共産主義のような問題にも不満を申し立てた。
国側は、起訴事実を支持する証拠と、従軍司祭が行った強制改宗と処刑に関係した証人を連れてきた。国側は、たとえステピナツが彼らに直接命じなかったとしても、それを止めようとはしなかったと主張した。彼らはクロアチア独立国軍内で従軍司祭の不均衡な数を指し示し、ウスタシャ当局とステピナツの協力関係の詳細を進呈しようとした。当時の外交問題政治は、バチカンがこれらの告発において可能な限り裁判に関係するよう要求した。告発が本当だろうとそうでなかろうと、ステピナツの共謀を示唆するためにあらゆる機会が利用された。
裁判は教皇庁によってすぐに非難された。多くのカトリック教徒と非カトリック教徒は、裁判の過程で強制された目撃者の声明、偽証と偽装された文書によって致命的に裁判が危うくされているとみなした。そういった批判は、教皇に宛てて書かれた手紙を証拠として引用したのが一例である。その手紙は1943年にステピナツが書いたといわれたものだった。手紙はウスタシャの大量改宗プログラムと政権そのものに支持を表明したとする罪に陥れるものだった。しかしステピナツはそれを書いたことを否定した。検察官は、ステピナツの署名の入ったコピーがあると主張したが、コピーは提示されなかった。
1946年10月11日、法廷はステピナツへ重大な反逆罪と戦争犯罪を犯したという判決を下した。彼は懲役16年を宣告された（反逆罪にしては軽い懲罰だとみなされた）。公判の進行に参加した、大部分の陪審員を含む全てのカトリック教徒は、教皇によってすぐさま破門された。
1946年10月13日、ニューヨーク・タイムズ紙はこう書いた。"大司教ステピナツの裁判は、前もって決められた結果に沿った政治的なものだった。このクロアチア人高位聖職者の裁判と判決は、人種、性別、言語、信条に関係なく人権と全ての基本的自由権を尊重するというユーゴスラビアの誓約と矛盾する。大司教ステピナツは、共産主義の敵であるというだけで有罪を宣告され、反教会運動の一部分として投獄されるだろう"。在アメリカ・ユダヤ人協会は、このように厳しい姿勢を表明した。"ステピナツは、反ナチスを表明することが非常に難しく危険であった頃、ヨーロッパで当時のナチス独裁政治に反対する声をあげた非常に希な人物であった。"。1946年11月1日、ウィンストン・チャーチルは裁判についてイギリス下院に宛てて書き、その結果について大きな悲しみを表明した。ステピナツの不在で、ベオグラード大司教ヨシップ・ウイツィッチがユーゴスラビア司教会議議長代理に就任し、ステピナツの死までその職位を務めた。
1947年3月、クロアチア社会主義共和国大統領ヴラディミル・バカリッチは、ステピナツに会うためレポグラヴァ刑務所を公式訪問した。彼は、ユーゴスラビアの首領ヨシップ・ブロズ・ティトーに宛てた大赦嘆願に署名すれば、ステピナツが出国するのを許すだろうと提案した。その代わりに、ステピナツはバカリッチに、中立の法廷で再び裁判をするようティトーへの要望を預けた彼は、ザグレブ最大の広場でクロアチア国民を前に、自分の行動を説明すると申し出た。肯定的な反応は、バカリッチからもティトーからも得られなかった。1951年11月11日、ニューヨーク・タイムズ紙記者ズルツバーガーが、レポグラヴァ刑務所のステピナツを訪問した。ズルツバーガーは、ステピナツへのインタビューによって1951年度のピュリッツァー賞を獲得した。
レポグラヴァ刑務所で懲役の5年間を務めた後、そこで彼の教会内での高い地位を認められて通常より良い設備を提供された（2つの房に加え私的礼拝堂となる房が加わった）。アロイジエ・ステピナツは、ユーゴスラビア首相ティトーによる懐柔的意思表示で釈放され、ローマへ向かい引退するか、故郷のクラシッチ教区に監禁されるかいずれかの状況を提示された。ステピナツは母国を去ることを拒み、クラシッチで晩年を生きることを選んだ。彼はクラシッチへ1951年12月5日に移送された。彼はこのように言った。"彼らが力尽くで私を飛行機に乗せ、国境を越えて連れて行かない限り、彼らは私をここから去らせないだろう。このような困難な時期に人々の元にとどまることが、私の義務なのだ"。1952年1月31日、共産主義体制は、公立学校での宗教教育を廃止した。4月、ステピナツはベルギーのラ・リベルテア紙ジャーナリストにこう話した。"私はカトリック教徒の若者たちを非常に心配している。学校で政府は、真実を否定することに基づく強力な共産主義プロパガンダを実行しているからだ".
1952年11月29日、ステピナツの名前がピウス12世が新たにつくった枢機卿の名簿に載った。その返答として、1952年12月17日、非同盟国であるユーゴスラビア政府はバチカンとの外交関係を断絶した。政府はザグレブ大学からカトリックの神学部を追放し、1991年にクロアチアが民主制に変わるまで学部は復活しなかった。ステピナツは自宅監禁状態であったため、1958年のコンクラーヴェに参加することができなかった。1959年6月2日、彼はイヴァン・メシュトロヴィッチへ宛てて手紙を書いた: "私はおそらく、体調の悪化のために世界で共産主義が崩壊するのを生きて見ることはできないだろう。しかし、私は共産主義の崩壊を全く確信している。"