ニノイ・アキノ国際空港
就航航空会社

2020年以降、新型コロナウイルス感染症の影響により、多くの定期便が運休、減便、経路変更となっている。
| 航空会社 | 就航地 | ターミナル |
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|  フィリピン航空 （国際線）  |  東アジア 東京/羽田、東京/成田、大阪/関西、名古屋/中部、福岡、ソウル/仁川、釜山、北京/首都、上海/浦東、厦門、泉州、広州、香港、マカオ、台北/桃園 東南アジア ハノイ、ホーチミン、プノンペン、バンコク/スワンナプーム、クアラルンプール、シンガポール、ジャカルタ、バリ島 中東 ドーハ、ドバイ、リャド、ダンマーム 北米 ホノルル、ロサンゼルス、サンフランシスコ、ニューヨーク、バンクーバー、トロント オセアニア グアム、ポートモレスビー、シドニー、メルボルン、ブリスベン、パース  |  T1  |
|  フィリピン航空  （国内線）  |  セブ、イロイロ、ダバオ、ジェネラル・サントス  |  T2  |
| PAL エクスプレス  |  ルソン バスコ (en:Basco Airport) 、ブスアンガ島 (en:Francisco B. Reyes Airport)、ラオアグ、レガスピ (en:Bicol International Airport)、プエルト・プリンセサ、サン・ホセ ビサヤ バコロド、カルバヨグ（英語版） (en:Calbayog Airport)、カタルマン（英語版） (en:Catarman National Airport)、カティクラン、セブ、ドゥマゲテ (en:Sibulan Airport)、イロイロ、カリボ、パングラオ、ロハス、タクロバン ミンダナオ ブトゥアン、カガヤン・デ・オロ、コタバト、ダバオ、シアルガオ島 (en:Sayak Airport)、ディポログ (en:Dipolog Airport)、ジェネラル・サントス、オザミス (en:Labo Airport)、パガディアン (en:Pagadian Airport)、サンボアンガ  |  T2  |
|  セブ・パシフィック航空 （国際線）  |  東アジア 東京/成田、大阪/関西、名古屋/中部、福岡、ソウル/仁川、上海/浦東、厦門、広州、香港、マカオ、台北/桃園 東南アジア ハノイ、ホーチミン、バンコク、クアラルンプール、コタキナバル、ブルネイ、シンガポール、ジャカルタ、バリ島 中東 ドバイ オセアニア シドニー、メルボルン  |  T3  |
|  セブ・パシフィック航空 （国内線）  |  ルソン カウアヤン（英語版） (en:Cauayan Airport)、ラオアグ、レガスピ (en:Bicol International Airport)、プエルト・プリンセサ、トゥゲガラオ (en:Tuguegarao Airport)、ヴィラク（英語版） (en:Virac Airport) ビサヤ バコロド、カルバヨグ (en:Calbayog Airport)、カティクラン、セブ、ドゥマゲテ (en:Sibulan Airport)、イロイロ、カリボ、パングラオ、ロハス、タクロバン ミンダナオ ブトゥアン、カガヤン・デ・オロ、コタバト、ダバオ、ディポログ (en:Dipolog Airport)、ジェネラル・サントス、オザミス (en:Labo Airport)、パガディアン (en:Pagadian Airport)、サンボアンガ  |  T3  |
|  Cebgo  |  ブスアンガ島 (en:Francisco B. Reyes Airport)、カティクラン、セブ、シアルガオ島 (en:Sayak Airport)、レガスピ (en:Bicol International Airport)、マスバテ（英語版） (en:Moises R. Espinosa Airport)、ナガ (en:Naga Airport)、サン・ホセ、スリガオ (en:Surigao Airport)  |  T4  |
|  フィリピン・エアアジア （国際線）  |  東京/成田、大阪/関西、ソウル/仁川、広州、深圳、香港、マカオ、台北/桃園、高雄、バンコク/ドンムアン、コタキナバル  |  T3  |
|  フィリピン・エアアジア （国内線）  |  カティクラン、セブ、バコロド、ダバオ、ドゥマゲテ (en:Sibulan Airport)、ジェネラル・サントス、イロイロ、カリボ、ラギンディガン、プエルト・プリンセサ、タクロバン、パングラオ、サンボアンガ  |  T2  |
|  ロイヤルエア・フィリピン（英語版）  |  カティクラン  |  T2  |
|  ロイヤルエア・フィリピン（英語版）  |  ダナン  | T1  |
|  en:AirSWIFT  |  エルニド (en:El Nido Airport)  |  T4  |
|  en:Sunlight Air  |  （チャーター便）  |  T4  |
|  エアアジア  |  クアラルンプール  |  T3  |
|  中国国際航空  |  北京/首都、成都/天府  |  T1  |
|  ニューギニア航空  |  ポートモレスビー  |  T1  |
|  全日本空輸  |  東京/羽田、東京/成田  |  T3  |
|  アシアナ航空  |  ソウル/仁川  |  T1  |
|  キャセイ・パシフィック航空  |  香港  |  T3  |
|  チャイナ・エアライン  |  台北/桃園、高雄  |  T1  |
|  中国東方航空  |  上海/浦東  |  T1  |
|  中国南方航空  |  広州  |  T3  |
|  エミレーツ航空  |  ドバイ  |  T3  |
|  エチオピア航空  |  アディスアベバ、香港  |  T3  |
|  エティハド航空  |  アブダビ  |  T3  |
|  エバー航空  |  台北/桃園  |  T1  |
|  ガルフ・エア  |  バーレーン  |  T3  |
|  香港エクスプレス航空  |  香港  |  T3  |
|  日本航空  |  東京/羽田、東京/成田  |  T1  |
|  チェジュ航空  |  ソウル/仁川  |  T3  |
|  ジェットスター・アジア  |  シンガポール、 大阪/関西 |  T3  |
|  ジェットスター・ジャパン  |  東京/成田、名古屋/中部  |  T3  |
|  大韓航空  |  ソウル/仁川  |  T1  |
|  クウェート航空  |  クウェート  |  T1  |
|  マレーシア航空  |  クアラルンプール  |  T1  |
|  オマーン・エア  |  マスカット  |  T1  |
|  カンタス航空  |  シドニー  |  T3  |
|  カタール航空  |  ドーハ  |  T3  |
|  ロイヤル・ブルネイ航空  |  ブルネイ  |  T1  |
|  KLMオランダ航空  |  アムステルダム、クアラルンプール  |  T3  |
|  サウディア  |  リャド、ジッダ  |  T1  |
|  深圳航空  |  深圳  |  T1  |
|  シンガポール航空  |  シンガポール  |  T3  |
|  スターラックス航空  |  台北/桃園  |  T3  |
|  タイ国際航空  |  バンコク/スワンナプーム  |  T3  |
|  スクート  |  シンガポール  |  T3  |
|  ターキッシュエアラインズ  |  イスタンブール  |  T3  |
|  ユナイテッド航空  |  サンフランシスコ、グアム、コロール  |  T3  |
|  厦門航空  |  厦門、泉州  |  T1  |
|  ZIPAIR  |  東京/成田  |  T1  |
2023年7月1日現在