鶴岡市立加茂水族館
沿革

加茂港を抱える加茂村（当時）は江戸時代、庄内藩の鶴ヶ岡城下に最も近い北前船の寄港地として繁栄し、城下とを結ぶ加茂坂峠は鉄門海上人（即身仏）や、明治期になって鉄龍海上人（即身仏）あるいは三島通庸・山形県令によって道路の改修があり、現・鶴岡市中心部との間の交通利便性が図られ、加茂港には蒸気船も寄港して鶴岡の外港の地位を維持した。また、1889年（明治22年）の町村制施行に際しては周辺5村（湯野浜村含む）と合併して（新）加茂村が発足し、翌年には町制を施行した。
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  庄内交通・湯野浜線
  山形県水族館 全景 1
  山形県水族館 全景 2
  山形県水族館 内部水槽
  山形県水族館ノ魚槽
  山形県水族館 浦島の大魚槽
  山形県水族館の孔雀
  山形県水族館内売店及休憩所
  「加茂水族館」に看板が替えられた初代の建物の写真ほか
  旧館の全景
  新館のアシカショー
しかし、大正期に鶴岡駅が開業して羽越本線が整備されると、外港としての地位を失った（漁港としての地位は維持）。さらに高舘山をはさんで町外れにある旧・湯野浜村の湯野浜温泉に1930年（昭和5年）、鶴岡駅から庄内電気鉄道・湯野浜線が開業するにあたり、鉄道が通らない加茂町中心部近くにおいて加茂港の山形県水産試験場の隣接地に「山形県水族館」が地元有志の水族館組合によって設立され、当館の端緒となった（初代館長は湯野浜温泉の旅館「亀や」社長）。
戦時中に水族館は廃止されて県に譲渡され、男子青少年の修練施設の海洋道場となり、戦後も山形県水産学校（現・山形県立加茂水産高等学校）の仮校舎となっていたが、県から加茂町に建物が戻り、鶴岡市に編入合併された翌年の1956年（昭和31年）、10年以上の歳月を経て「鶴岡市立加茂水族館」として水族館が再開館した。
高度経済成長期にあって東京オリンピックが開催された1964年（昭和39年）、特別豪雪地帯の当地にあって従前の冬季休館を余儀なくされていた状況を改善する目的で、通年営業が出来る建物での新館が、旧館から西側約500mの「荒崎」と呼ばれる岬に移転・開業。秋田県男鹿水族館（現・男鹿水族館GAO）および新潟市立新潟水族館（現・新潟市水族館 マリンピア日本海）といった大型水族館が国道7号沿道かつ羽越本線沿線でどちらも鶴岡市から約150kmの隣県に開館した1967年（昭和42年）、市の意向で、湯野浜温泉一帯の観光開発を目的とする第三セクターの株式会社庄内観光公社に売却され「庄内浜加茂水族館」となった。翌年度には入館者数が過去最高の「21万7372人」となった。
しかし、庄内観光公社の湯野浜温泉地区にある他施設の経営失敗により、水族館の利益は他施設の赤字穴埋めに使われ、当館は1971年（昭和46年）末を以って閉鎖、従業員も全員解雇された。自主的に残った元従業員4人が自らの住居を担保にしたり、生命保険を解約したりするなど金策をして、水族館の生き物の餌代などを捻出しては世話をしていた。その窮状が『荘内日報』で伝えられると市民からの寄付も受けるようになり、翌1972年（昭和47年）3月には経営問題が未解決のまま再開館した。
同年6月には地元出身者が経営する佐藤商事（東京都）が負債1億4000万円を含めて経営を引き継いだ。それでも経営は上向かず、1976年（昭和51年）10月29日の酒田大火の日には強風と高波により当館は大きな被害を受け、さらに日本経済が安定成長期に入ったため入館者数は長期低落傾向を示した。同じ日本海側にあり競合相手の新潟市立新潟水族館が1990年（平成2年）に「マリンピア日本海」として移転オープンし、さらに大型化して注目される中、打開策としてバブル景気期から計画し、多額の資金を投じて1993年（平成6年）に実現した人気のラッコの飼育・展示でさえ低落傾向を止めることが出来ず、かえって負債を増やす結果になった。
1997年度（平成9年度）には過去最低の入館者数「9万2183人」となった（入館者がゼロという日もあった）が、サンゴの水槽で偶然クラゲが発生すると、それを見逃さずに展示に結びつけるセレンディピティがあり、ここから反転攻勢が始まった。クラゲに特化した展示や商品開発をすることで年度当たり10万人の入館者数に戻し、2000年（平成12年）にはクラゲ展示種類数日本一となった。
しかしその後、3ヶ月連続で入館者数が減少。ここで遠洋漁業の元船長からクラゲが美味しいことを聞いた館長が、「クラゲを食べる会」の企画を立ち上げた。関連商品やイベントは、客を大笑いさせることを企図し、クラゲをしゃぶしゃぶや握り寿司にしたほか、「ナタデココ風クラゲココ」など10種類を用意したところマスコミが報道してくれ、客足が増加に転じた（後に開発された商品も含め、クラゲ入りのアイス、まんじゅう、羊羹等あり）。また、館内に「クラゲレストラン」を開業し、クラゲ定食およびクラゲラーメンを提供したところ、従前の4倍以上の売上を達成した。
2001年（平成13年）3月23日に日本クラウンから全国発売されたDVD『クラゲの神秘 α波 1/fのゆらぎ』では、クラゲ鑑賞とリラックスやヒーリング（癒やし）との関係が示唆される題名であり、その後に発売されたクラゲ関連DVDも同様の傾向をみせた、マスコミが取り上げる当館のクラゲの訴求力も、クラゲを食べるという色物の「食」から、次第に「癒やし」へと移っていくことになる。
競合相手の秋田県立男鹿水族館が建て替えのため一時閉館した2002年（平成14年）、市が買い戻して35年振りに「鶴岡市立加茂水族館」に名称復帰した。2005年（平成17年）にクラゲ展示種類数世界一となった。同年から日本大学生物資源科学部において、クラゲのヒーリング（癒やし）効果の科学的な検証がなされた。この頃から、当館の客層が従前のファミリー層や高齢者中心から、女性やカップルにまで広がる現象が見られた。またこの頃から、全国の水族館でもクラゲ展示に力を入れる例が増加し、競合相手が全国各地に現れることになった。中国の水族館までも視察に来たが、クラゲの飼育・繁殖は資本力に比例するものではなく様々なノウハウがあるため、当館の競争力は維持された。
2008年（平成20年）には日本動物園水族館協会より第22回「古賀賞」を受賞。さらに同年、下村脩がノーベル化学賞を受賞した際には、その研究対象となった「オワンクラゲ」を展示しているのが日本国内では当館しかなかったため全国的に注目されて、多くの入館者が訪れる幸運も得た。2009年度（平成22年度）には入館者数が1968年度の「21万7372人」を超えた。競合相手の秋田県立男鹿水族館や新潟市立新潟水族館は自治体からの補助を受けて運営されているが、当館は市からの補助金なしで運営し、黒字から1億2千万円を市に寄付した。
半世紀使用した旧館から、東隣に新館を建設して、2014年（平成26年）6月1日に移転・開館した。開館は「山形デスティネーションキャンペーン」（2014年6月14日 - 9月13日）に間に合わせることができたが、旧館を解体して駐車場にする工事については東日本大震災（2011年3月11日発生）に伴う復興特需や消費税増税（2014年4月1日に5%から8%に税率変更）に伴う駆け込み需要により工期が延び、新館開館には間に合わなかった。新館は鉄筋コンクリート地上3階建てで、延べ床面積が約4,000m2と旧館の約2.5倍となり、クラネタリウムも4倍規模になった。総工費約30億円のうち約27億円が合併特例債であり、その1/3にあたる9億円分をミニ公募債（住民参加型市場公募地方債）で調達することとして、1回目の募集の3億円分を「加茂水族館クラゲドリーム債」として発行したところ、発売20分で完売するほどの盛況を見せた。
2014年（平成26年）6月1日の新館への移転開業からの1年間の入館者数を、鶴岡市は年間30万人、同館館長の個人的な予想では50万人と見込んでいたが、83万5796人を数え、クラゲ特化が始まった年のそれの9倍以上にのぼった。
1968年（昭和43年）から館長を務め、経営危機の際にも身銭を切り、クラゲ特化の先導もした村上龍男が、2015年（平成27年）3月で退任。独自のクラゲ飼育技術を開発して当館を世界一に導いた奥泉和也副館長が後任として昇格した。