遠藤周作
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『フランスの大学生』（1953年、早川書房）のち角川文庫、ぶんか社文庫
『カトリック作家の問題』（1954年、早川書房）
『堀辰雄』（1955年、一古堂）「堀辰雄覚書」講談社文芸文庫
『白い人・黄色い人』（1955年、講談社）のち文庫、新潮文庫、講談社文芸文庫
『神と悪魔』（1956年、現代文芸社）
『青い小さな葡萄』（1956年、新潮社）のち講談社文庫、文芸文庫
『タカシのフランス一周』（1957年、白水社）
『恋することと愛すること』（1957年、実業之日本社）
『月光のドミナ』（1958年、東京創元社）のち新潮文庫
『海と毒薬』（1958年、文藝春秋新社）のち角川文庫、講談社文庫、新潮文庫
『恋愛論ノート』（1958年、東都書房）
『恋の絵本』（1959年、平凡出版）のち大和書房・女性論文庫
『おバカさん』（1959年、中央公論社）のち角川文庫、中公文庫、ぶんか社文庫
『蜘蛛 周作恐怖譚』（1959年、新潮社）
『若い日の恋愛ノート』（1960年、青春出版社）「恋愛とは何か」角川文庫
『新鋭文学叢書6 遠藤周作集』（1960年、筑摩書房）
『火山』（1960年、文藝春秋新社）のち角川文庫
『あまりに碧い空』（1960年、新潮社）
『聖書のなかの女性たち』（1960年、角川書店）のち講談社文庫
『ヘチマくん』（1961年、新潮社）のち角川文庫
『結婚』（1962年、講談社）のち文庫
『宗教と文学』（1963年、南北社）
『わたしが・棄てた・女』（1964年、文藝春秋新社）のち講談社文庫、改版2012
『浮世風呂』（1964年、講談社）
『一・二・三!』（1964年、中央公論社）のち文庫
『偽作』（1964年、東方社）
『留学』（1965年、文藝春秋新社）のち新潮文庫
『狐狸庵閑話』（1965年、桃源社）のち新潮文庫『狐狸庵閑話』（「古今百馬鹿」「現代の快人物」も併録）
『哀歌』（1965年、講談社）のち文庫、文芸文庫
『沈黙』（1966年、新潮社）のち文庫
『金と銀』（1966年、佼成出版社）のち文春文庫
『楽天主義のすすめ』（1966年、青春出版社）
『協奏曲』（1966年、講談社）のち文庫
『さらば、夏の光よ』（1966年、桃源社）のち講談社文庫
『闇のよぶ声』（1966年、光文社）のち角川文庫、ぶんか社文庫
『ぐうたら生活入門』（1967年、未央書房）のち角川文庫
『キリシタン時代の知識人-背教と殉教』（1967年、日本経済新聞社）
『現代の快人物-狐狸庵閑話巻之弐』（1967年、桃源社）のち角川文庫
『どっこいショ』（1967年、講談社）のち文庫
『私の影法師』（1967年、桂書房）
『古今百馬鹿-狐狸庵閑話巻之参』（1967年、桃源社）のち角川文庫
『影法師』（1968年、新潮社）のち文庫
『快男児・怪男児』（1968年、講談社）
『それ行け狐狸庵』（1969年、文藝春秋）のち文庫
『遠藤周作ユーモア小説集』（1969年、講談社）のち文庫
『大変だァ』（1969年、新潮社）のち文庫
『薔薇の館・黄金の国』（1969年、新潮社）
『楽天大将』（1969年、講談社）のち文庫
『遠藤周作怪奇小説集』（1970年、講談社）のち文庫
『愛情論-幸福の手帖』（1970年、虎見書房）
『遠藤周作の本』（1970年、KKベストセラーズ）
『石の声』（1970年、冬樹社）
『切支丹の里』（1971年、人文書院）のち中公文庫
『母なるもの』（1971年、新潮社）のち文庫
『黒ん坊』（1971年、毎日新聞社）のち角川文庫
『埋もれた古城』（1971年、新潮社）のち集英社文庫
『遠藤周作シナリオ集』（1971年、講談社）
『ただいま浪人』（1972年、講談社）のち文庫
『狐狸庵雑記帳』（1972年、毎日新聞社）
『ぐうたら人間学』（1972年、講談社）のち文庫（狐狸庵閑話）
『牧歌』（1972年、番町書房）のち新潮文庫
『狐狸庵型』（1973年、番町書房）のち角川文庫
『灯のうるむ頃』（1973年、講談社）のち角川文庫
『ぐうたら愛情学』（1973年、講談社）のち文庫（狐狸庵閑話）
『死海のほとり』（1973年、新潮社）のち文庫
『メナム河の日本人』（1973年、新潮社）
『ぐうたら会話集』（1973年、角川書店）のち文庫
『イエスの生涯』（1973年、新潮社）のち文庫
『遠藤周作第二ユーモア小説集』（1973年、講談社）のち文庫
『ぐうたら好奇学』（1974年、講談社）
『ピエロの歌』（1974年、新潮社）のち文庫
『周作快談』（1974年、毎日新聞社）
『口笛をふく時』（1974年、講談社）のち文庫
『うちの女房、うちの息子』（1974年、講談社）
『喜劇 新四谷怪談』（1974年、新潮社）
『最後の殉教者』（1974年、講談社）のち文庫
『恋愛作法』（1974年、いんなあとりっぷ社）
『日本人を語る』（1974年、小学館）
『白い風船』（1974年、教育出版「小学校国語」6年昭和49年度版）
『君たちの悩みにまじめにお答えします』（1975年、集英社）
『彼の生き方』（1975年、新潮社）のち文庫
『この人たちの考え方』（1975年、読売新聞社）
『身上相談』（1975年、毎日新聞社）「小説身上相談」文春文庫
『ぼくたちの洋行』（1975年、講談社）のち文庫
『吾が顔を見る能はじ』（1975年、北洋社）
『観客席から』（1975年、番町書房）「観客席から 私の大好きな映画と芝居」角川文庫
『続・日本人を語る』（1975年、小学館）
『遠藤周作ミステリー小説集』（1975年、講談社）
『ボクは好奇心のかたまり』（1976年、新潮社）のち文庫
『勇気ある言葉』（1976年、毎日新聞社）のち集英社文庫
『私のイエス-日本人のための聖書入門』（1976年、祥伝社）
『砂の城』（1976年、主婦の友社）のち新潮文庫
『悲しみの歌』（1977、新潮社）のち文庫
『鉄の首枷-小西行長伝』（1977年、中央公論社）のち文庫、ぶんか社文庫
『走馬燈-その人たちの人生』（1977年、毎日新聞社）のち新潮文庫
『旅は道づれ世は情け』（1977年、番町書房）
『自選作家の旅』（1977年、山と渓谷社）
『日本人はキリスト教を信じられるか』（1977年、講談社）
『愛情セミナー』（1977年、集英社文庫）
『白い風船』（1977年、教育出版6年生国語教科書昭和52年度版）
『ウスバかげろう日記』（1978年、文藝春秋）のち文庫、河出文庫
『人間のなかのX』（1978年、中央公論社）のち文庫
『キリストの誕生』（1978年、新潮社）のち文庫
『ぐうたら会話集』第2-3集（1978、80年、角川書店）のち文庫
『王妃マリー・アントワネット』全3巻（1979-80年、朝日新聞社）のち新潮文庫
マリー・アントワネット (ミュージカル) - 2006年にミュージカル化され、ブレーメンにてドイツ語でも上演された。
『銃と十字架』（1979年、中央公論社）のち文庫(ペトロ岐部)
『十一の色硝子』（1979年、新潮社）のち文庫
『異邦人の立場から』（1979年、現代の随想 日本書籍）のち講談社文芸文庫
『お茶を飲みながら』（1979年、小学館）のち集英社文庫
『ぐうたら社会学』（1979年、集英社文庫
『結婚論』（1980年、主婦の友社）
『天使』（1980年、角川書店）のち文庫
『侍』（1980年、新潮社）のち文庫
『狐狸庵二十面相』（1980年、文藝春秋）
『父親』〈上・下〉（1980年、講談社）のち集英社文庫、講談社文庫、集英社文庫
『かくれ切支丹』（1980年、角川書店）
『作家の日記』（1980年、作品社）のち講談社文庫、福武文庫、講談社文芸文庫
『遠藤周作による遠藤周作』（1980年、青銅社）
『真昼の悪魔』（1980年、新潮社）のち文庫
『狐狸庵うちあけ話』（1981年、集英社文庫）
『愛と人生をめぐる断想』（1981年、文化出版局）のち光文社文庫
『王国への道-山田長政』（1981年、平凡社）のち新潮文庫
『名画・イエス巡礼』（1981年、文藝春秋）「イエス巡礼」文庫
『女の一生』（1982年、朝日新聞社）のち新潮文庫
『足のむくまま 気のむくまま』（1982年、文藝春秋）のち文庫
『自分をどう愛するか〈生活編〉』（1982年、青春出版社）のち文庫
『冬の優しさ』（1982年、文化出版局）のち新潮文庫
『あべこべ人間』（1982年、集英社）のち文庫
『遠藤周作と考える-幸福、人生、宗教について』（1982年、PHP研究所）
『悪霊の午後』（1983年、講談社）のち文庫
『私にとって神とは』（1983年、光文社）のち文庫
『よく学び、よく遊び』（1983年、小学館）のち集英社文庫
『イエス・キリスト』（1983年、新潮社） - 『イエスの生涯』『キリストの誕生』の合本
『イエスに邂った女たち』（1983年、講談社）のち文庫
『自分づくり-自分をどう愛するか〈生き方編〉』（1984年、青春出版社）のち文庫
『私の愛した小説』（1985年、新潮社）のち文庫 - 「テレーズ・デスケルウ」作品論と訳
『何でもない話』（1985年、講談社）のち文庫
『ほんとうの私を求めて』（1985年、海竜社）のち集英社文庫
『宿敵』〈上・下〉（1985年、角川書店）のち文庫(小西行長・加藤清正)
『心の夜想曲（1986年、文藝春秋）のち文庫
『ひとりを愛し続ける本』（1986年、青春出版社）のち講談社文庫
『スキャンダル』（1986年、新潮社）のち文庫
『風の肉声』（1986年、大和出版）
『私が見つけた名治療家32人』（1986年、祥伝社）
『遠藤周作のあたたかな医療を考える』（1986年、読売出版社）
『あなたの中の秘密のあなた』（1986年、ハーレクイン・エンタープライズ支社）のちPHP文庫
『男感覚女感覚の知り方』（1986年、青春出版社）のち文庫
『わが恋う人は』（1987年、講談社）のち文庫
『死について考える-この世界から次の世界へ』（1987年、光文社）のち文庫
『ピアノ協奏曲二十一番』（1987年、文藝春秋）のち文庫
『眠れぬ夜に読む本』（1987年、光文社）のち文庫
『あまのじゃく人間へ』（1987年、青春出版社）のち文庫
『妖女のごとく』（1987年、講談社）のち文庫 (長崎俊一監督で「妖女の時代」として映画化）
『こころの不思議、神の領域』（1988年、PHP研究所）のち文庫
『ファーストレディ』〈上・下〉（1988年、新潮社）のち文庫
『その夜のコニャック』（1988年、文藝春秋）のち文庫
『“逆さま流”人間学』（1989年、青春出版社）「らくらく人間学 逆さまに見れば何んでも面白くなる」文庫
『春は馬車に乗って』（1989年、文藝春秋）のち文庫
『こんな治療法もある』（1989年、講談社）
『反逆』〈上・下〉（1989年、講談社）のち文庫 （織田信長）
『落第坊主の履歴書』（1989年、日本経済新聞社）のち文春文庫、日経文芸文庫（私の履歴書）
『変るものと変らぬもの』（1990年、文藝春秋）のち文庫
『心の海を探る』（1990年、プレジデント社）のち角川文庫
『考えすぎ人間』（1990年、青春出版社）のち文庫
『生き上手 死に上手』（1991年、海竜社）のち文春文庫
『決戦の時』〈上・下〉（1991年、講談社）のち文庫(織田信長、生駒吉乃）
『男の一生』〈上・下〉（1991年、日本経済新聞社）のち文春文庫、日経文芸文庫 (前野長康)
『ヘンな自分を愛しなさい』青春出版社、1991 「ちょっと幸福論 あなたの中の未知のあなたへ」文庫
『心の砂時計』（1992年、文藝春秋）のち文庫
『王の挽歌』〈上・下〉（1992年、新潮社）のち文庫 （大友宗麟）
『異国の友人たちに』（1992年、読売新聞社）
『狐狸庵 歴史の夜話』（1992年、牧羊社）のちPHP文庫
『万華鏡』（1993年、朝日新聞社）のち朝日文芸文庫
『深い河』（1993年、講談社）のち文庫
『心の航海図』（1994年、文藝春秋）のち文庫
『女』（1995年、講談社）のち文春文庫
『戦国夜話』（1996年、小学館）
『風の十字路』（1996年7月、小学館）
『なつかしき人々』1・2（1996年、小学館）
『生きる勇気が湧いてくる本』（1996年、騎虎書房）のち祥伝社黄金文庫、青志社
『最後の花時計』（1997年、文藝春秋）のち文庫
『無鹿』（1997年、文藝春秋）のち文庫
『好奇心は永遠なり』（1997年、講談社）
『「深い河」創作日記』（1997年、講談社）のち文庫、講談社文芸文庫
『夫婦の一日』（1997年、新潮社）のち文庫
『心のふるさと』（1997年、文藝春秋）のち文庫
『ルーアンの丘』（1998年、PHP研究所）のち増補版
『信じる勇気が湧いてくる本』（1998年、祥伝社）のち黄金文庫
『愛する勇気が湧いてくる本』（1998年、三笠書房）のち黄金文庫
『十頁だけ読んでごらんなさい。十頁たって飽いたらこの本を捨てて下さって宜しい。』（2006年、海竜社）のち新潮文庫
『遠藤周作短篇名作選』（2012年、講談社文芸文庫）
『人生の踏絵』（2017年、新潮社）のち文庫
『沈黙の声』（2017年、青志社）、1992年時の著作
『影に対して―母をめぐる物語』（2020年、新潮社）のち文庫
『秋のカテドラル―遠藤周作初期短篇集』（2021年、河出書房新社）
『薔薇色の門 誘惑―遠藤周作初期中篇』（2021年、河出書房新社）
『稔と仔犬 青いお城―遠藤周作初期童話』（2022年、河出書房新社）
『善人たち』（2022年、新潮社）、戯曲集
『フランスの街の夜―遠藤周作初期エッセイ』（2022年、河出書房新社）
『現代誘惑論―遠藤周作初期エッセイ』（2023年、河出書房新社）
『ころび切支丹―遠藤周作初期エッセイ』（2023年、河出書房新社）
『人生を抱きしめる―遠藤周作初期エッセイ』（2023年、河出書房新社）
『沈黙の声―遠藤周作初期エッセイ』（2024年、河出書房新社）
『アラベスケ―遠藤周作初期エッセイ』（2024年、河出書房新社）
『遠藤周作短篇集』（2024年、岩波文庫、山根道公編）
CD版 遠藤周作講演選集〈全6巻〉アートデイズ、2002年3月、新版2017年
CD版 日本人とキリスト教ほか、新潮社、新版2010年