009ノ1
各話タイトル

| 話数 | タイトル | 内容 |
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| 指令No.1 | 頭脳を探せ！ | 「ウエストブロックの頭脳」とも呼ばれるR.A.クライン博士が行方不明となった。 ミレーヌは助手のナカヤマに接近して情報を探る。 |
| 指令No.2 | Dr.Xを連行せよ！ | ミレーヌはDr.Xと共にウエストブロックに脱出しようとして失敗、仲間とはぐれてしまう。 捕らわれたミレーヌには過酷な拷問が待っていた。 |
| 指令No.3 | 超能力者をわがポケットに | チベットの奥深くに住むという謎の超能力者。 彼を手に入れるべくミレーヌはミスター・ビックラスと共にチベットへと向かう。 |
| 指令No.4 | U.F.Oを確認せよ！ | イーストブロックとの国境近くにあるR村に墜落した謎の飛行物体。 村に潜入して調査するミレーヌは猟師のジム・ダンディと出会う。 |
| 指令No.5 | モンスターを殺せ！ | 突如現れた謎のモンスターに襲われて殉職した009ノ7。 彼女に代わって警備を命じられたミレーヌはホフマン研究所で事件の謎を探る。 |
| 指令No.6 | ジャンプせよ！ 時果つるまで | タイムマシンの実験中に消えたエディスン・ナイト博士と婚約者サン・ディ。 ミレーヌは2人を追って紀元前二百万年へ飛ぶ。 |
| 指令No.7 | 古城よりの招待状 | 謎の人物・Mr.リヴェンジの招待を受け、古城に招かれたスパイ達。 「宝探し」と称するゲームの過程でメンバーは次々と殺されてゆく…。 |
| 指令No.8 | ガールハント | イーストブロックに追われたミレーヌが逃げ込んだ謎の屋敷。 その敷地には塀で囲まれた森があり、女性達が「バニー」と呼ばれ狩りの対象にされていた。 |
| 指令No.9 | 魚の出てきた日 | イーストブロックのナターシャ大佐とイワンから謎の物質「X」を奪ったミレーヌだが、 争う間に「X」の入ったケースが紛失してまう。 |
| 指令No.10 | ドルフィン・ワールド | 次々と起きる客船や深海調査艇の爆発事故。 ミレーヌはドルフィンランドの所長・リミット博士を調査するが、彼は何かを隠しているらしい。 |
| 指令No.11 | Give and Take | レイプされ身投げした少女は偶然ナンバー0とミレーヌに助けられるが、記憶を失っていた。 ナンバー0の家に引き取られた彼女を謎のロボットが襲う。 |
| 指令No.12 | パロディ | ミレーヌそっくりの人物が本部に現れ重要機密を奪っていった。 スパイの嫌疑を晴らすためミレーヌは過去の記憶を探るXライン分析器にかけられる。 |
| 指令No.13 | 砂の城 | サハラ砂漠Xポイントに現れる謎の亡霊。 ミレーヌがその正体を調査するとDr.エスエフがタイムマシンを使って呼び出した過去の戦士達だった。 |
| 指令No.14 | 青銅の男 | Dr.シュトロハイムの研究を調査に来たミレーヌ。 ミレーヌの知人でもある夫人のリリオムは「夫は3ヶ月前に死んだ」と言うのだが…。 |
| 指令No.15 | ママ！ | 貧民街育ちのジミニイはウエストブロックのスパイに雇われ、ミレーヌの親友を殺してマイクロフィルムを奪った。 ミレーヌはジミニイを追う。 |
| 指令No.16 | クレバス | 機密を盗んだウエストブロックのスパイを追跡していたミレーヌはスパイと一緒にクレバスに落ちてしまう。 クレバスの底には謎の円盤があった。 |
| 指令No.17 | A Happy New Year | 演習に参加したミレーヌ達はロボット兵士やロボット戦闘機に襲われる。 ロボットに殺人指令を下したのは一体誰なのか？ |
| 指令No.18 | 鬼 | 森に現れる奇怪な「鬼」の噂。その正体はとある科学者が作り上げた合成人間だった。 科学者は調査に来たミレーヌに商談を持ちかける。 |
| 指令No.19 | ムゲン | 世界中の富豪の間で広まる麻薬「MUGEN」。 指令を受けたミレーヌは、中毒患者の1人である小説家マダム・ロイに接近する。 |
| 指令No.20 | 港 | とある港町にやってきたミレーヌは祖父と2人で暮らしている少年・卓に接近する。 酒浸りの祖父には何か秘密があるらしい。 |
| 指令No.21 | 復讐 | ミレーヌはウエストブロックのスパイを倒して重要機密を奪回する。 1ヶ月後、捕らわれたミレーヌの前に現れたのは倒したはずの男だった。 |
| 指令No.22 | トレヴィに三度くる | トレヴィの泉はイーストブロックのスパイ達の連絡場所になっているようだが、連絡方法が分からない。 ミレーヌは調査を開始する。 |
| 指令No.23 | No.100 | ミレーヌは新人であるNo.100の教育を任された。 実はイーストブロックの工作員だったNo.100は機密を奪って逃走する。 |
| 指令No.24 | 死霊の館 | 幽霊に怯える小説家ロマン・ギルの護衛を頼まれたミレーヌ。 だが、かつて倒した敵スパイ達の亡霊が現れてミレーヌを苦しめる。 |
| 指令No.25 | 夜明け | 月基地にやってきたミレーヌは消えたイーストブロックのスパイ、 ポール・ホフマンの消息を探るべく科学者のDr.グリーンに接近する。 |
| 指令No.26 | 深海魚 | 海底基地M-8からイーストブロックへの機密漏えいが発見された。 ミレーヌは機密を流していると思われるアクアノーツの調査を開始する。 |
| 指令No.27 | 目覚め | イーストブロックとの国境にある町「R」に突如現れた白いカプセル。中から現れた記憶喪失の男。 ミレーヌは男を看病して秘密を探ろうとする。 |
| 指令No.28 | R&B | 二重スパイの疑いがある同僚・36号に接近したミレーヌは36号と恋に落ちる。 しかし眠っている間に胎内に爆弾を仕込まれてしまう。 |
| 指令No.29 | 昨日の暦 | ミレーヌはイーストブロックのスパイ、ゴドノフを見逃した罪を問われてマシンで深層意識を検査される。 次々と浮かび上がるミレーヌの哀しい過去…。 |
| 指令No.30 | ポップ | 3年前に失踪した諜報部員Mr.アイアンハートはエクセトラ博士を殺して人間を進化させる理論を手に入れていた。 ミレーヌは彼を説得しようとするが…。 |
| 指令No.31 | 走る五人 | 亡命を望むイーストブロックのゾンド・ソユーズ博士を救出する為、 特殊技能を持った4人の民間人が集まってミレーヌとチームを組む。 |
| 指令No.32 | HARD BOILED | 「エッグ」と呼ばれる一匹狼の殺し屋はウエストブロックのスパイを狙撃してゆく。 5人目の標的となったのはミレーヌだった。 |
| 指令No.33 | 地平線の家 | 地平線に立つ謎の家。その家では既に4人のスパイが行方不明となっている。 潜入したミレーヌはそこで信じられない光景を目撃する。 |
| 指令No.34 | 聖夜 | No.109が超能力者に殺された。 ミレーヌは超能力者を抹殺する警官隊の作戦に同行するが、警官隊は圧倒的な超能力の前に全滅してしまう。 |
| 指令No.35 | 花と竜 | ヤクザの親分ばかりが集まる賭場でイカサマを使い大勝ちした男。 男の妻・美和子はイーストとウエスト両陣営から狙われる秘密を握っていた。 |
| 指令No.36 | 火星将軍 | 行方不明の火星探査船「軍神」号が突如帰還した。 唯一の生存者・バンド隊長が失踪し、ミレーヌとジャックはその調査に乗り出した。 |
| 指令No.37 | 黄金の女 | 旅客機の大爆発に紛れて空港から逃走した謎の女はイーストブロックのスパイ達に追われていた。 その正体は「運び屋」アンドロイドだったのだ。 |
| 番外編 | 真珠爆弾 | 舞台は現代。 パリから来た高級コールガールに扮したミレーヌは石油利権に絡む汚職の証拠を入手する為、日本の総理に接近する。 |