エナンティオルニス類
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エナンティオルニス亜綱
基底エナンティオルニス類と位置不明のエナンティオルニス類
カタイオルニス・チャブエンシス Cathayornis chabuensis (白亜紀前期の中国・チャブに生息) – カタイオルニス類?
ダピンファンゴルニスen:Dapingfangornis (白亜紀前期)
エナンティオルニス類の一種Enantiornithes gen. et sp. indet. CAGS-IG-02-0901 (白亜紀前期の中国・甘粛省に生息)
エナンティオルニス類の一種Enantiornithes gen. et sp. indet. CAGS-IG-04-CM-023 (白亜紀前期の中国・甘粛省に生息)
フオシャノルニスen:Huoshanornis (白亜紀前期) – エウエナンティオルニス類?
リャオシオルニス"en:Liaoxiornis" (白亜紀前期) – 疑問名
ペンゴルニスen:Pengornis (白亜紀前期)
チリアニアen:Qiliania (白亜紀前期の中国・甘粛省に生息)
エルソルニスen:Elsornis (白亜紀後期) – フレクソモルニスに近縁?
エナンティオルニス類の一種Enantiornithes gen. et sp. indet. (白亜紀後期のフランス・en:Cruzyに生息)
エナンティオルニス類の一種Enantiornithes gen. et sp. indet. MCSNM V3882a (白亜紀後期のレバノンに生息)
エナンティオルニス類の一種Enantiornithes gen. et sp. indet. MZ (白亜紀後期のブラジル・en:Presidente Prudenteに生息) – エナンティオルニス形類?
エナンティオルニス類の一種Enantiornithes gen. et sp. indet.  Patrick Mechin collection 606 (白亜紀後期のフランス・en:Bastide-Neuveに生息) – アレクソルニス類?
フレクソモルニスen:Flexomornis (白亜紀後期) – エルソルニスに近縁?
イベロメソルニス形目
イベロメソルニス科
エナンティオルニス類の一種Enantiornithes gen. et sp. indet. CAGS-IG-07-CM-001
イベロメソルニスen:Iberomesornis (白亜紀前期)
ノグエロルニスen:Noguerornis (白亜紀前期)
エウエナンティオルニス上目
基底エウエナンティオルニス類
エオアルラヴィスen:Eoalulavis (白亜紀前期)
位置不明のエウエナンティオルニス類
ボハイオルニスen:Bohaiornis (白亜紀前期)
クスピロストリソルニスen:Cuspirostrisornis (白亜紀前期)
エオエナンティオルニスen:Eoenantiornis (白亜紀前期)
エルブレトルニスen:Elbretornis (白亜紀後期)
エナンティオルニス類の一種Enantiornithes gen. et sp. indet. CAGS-IG-04-CM-007 (白亜紀前期)
エナンティオルニス類の一種Enantiornithes gen. et sp. indet. RBCM.EH2005.003.0002 (白亜紀後期)
グリリニアen:Gurilynia (白亜紀後期) – エナンティオルニス形類?
ヘベイオルニスen:Hebeiornis (白亜紀前期) –おそらく裸名。ヴェスコルニスとジベイニアの項目を参照のこと。
マルティナヴィスen:Martinavis (白亜紀後期)
ラルギロストロルニスen:Largirostrornis (白亜紀前期)
レクタヴィスen:Lectavis (白亜紀後期) – エナンティオルニス形類?
レネソルニスen:Lenesornis (白亜紀後期)
ロングチェンゴルニスen:Longchengornis (白亜紀前期)
ユンガヴォルクリスen:Yungavolucris (白亜紀後期) – エナンティオルニス形類?
クスゾリア科
クスゾリアen:Kuszholia (白亜紀後期)
アレクソルニス形目
アレクソルニス科
アレクソルニスen:Alexornis (白亜紀後期)
キジルクマヴィスen:Kizylkumavis (白亜紀後期)
サザヴィスen:Sazavis (白亜紀後期)
プロトプテリクス形目
プロトプテリクス科
プロトプテリクスen:Protopteryx (白亜紀前期)
ロンギプテリクス形目
ロンギプテリクス科
ボルオキアen:Boluochia (白亜紀前期)
カンプトドントゥス"en:Camptodontus" (白亜紀前期の中国・朝陽市に生息)
ロンギプテリクスen:Longipteryx (白亜紀前期)
ロンギロストラヴィスen:Longirostravis (白亜紀前期)
ラパクサヴィスen:Rapaxavis (白亜紀前期の中国・朝陽市に生息)
シャンウェイニアオen:Shanweiniao (白亜紀前期の中国・遼寧省に生息)
カタイオルニス形目
アレトアラオルニス科
アレトアラオルニスen:Alethoalaornis (白亜紀前期の中国・遼寧省に生息)
カタイオルニス科
カタイオルニスen:Cathayornis (白亜紀前期)
エオカタイオルニスen:Eocathayornis (白亜紀前期)
シノルニスen:Sinornis (白亜紀前期)
ゴビプテリクス形目
ゴビプテリクス科
ゴビプテリクスen:Gobipteryx (白亜紀後期)
ジベイニアen:Jibeinia (白亜紀前期)
ヴェスコルニス?en:Vescornis (白亜紀前期)–おそらくシノニム。ヘベイオルニスとジベイニアの項目を参照のこと。
エナンティオルニス形目
エナンティオルニス科
エナンティオルニスen:Enantiornis (白亜紀後期)
アヴィサウルス科
アヴィサウルスen:Avisaurus (白亜紀後期)
バウクシトルニスen:Bauxitornis (白亜紀後期)
コンコルニスen:Concornis (白亜紀前期)
エナンティオフォエニクスen:Enantiophoenix
ハリモルニスen:Halimornis (白亜紀後期)
インティオルニスen:Intiornis (白亜紀後期)
ネウケノルニスen:Neuquenornis (白亜紀後期)
ソロアヴィサウルスen:Soroavisaurus (白亜紀後期)
以下の属はエナンティオルニス類に含まれることがある。
アベラティオドントゥスen:Aberratiodontus (白亜紀前期) – エウエナンティオルニス類 (あるいは独自の目)?
ダリンヘオルニスen:Dalingheornis (白亜紀前期の中国・遼寧省に生息)
パラプロトプテリクス en:Paraprotopteryx (白亜紀前期の中国・遼寧省に生息)
ウィレイニア en:Wyleyia (白亜紀前期) – 祖先的なエナンティオルニス類?
ナナンティウス en:Nanantius (白亜紀前期〜後期) – エナンティオルニス形類?
アバヴォルニス en:Abavornis (白亜紀後期) – エウエナンティオルニス類?
カテノレイムス en:Catenoleimus (白亜紀後期)
エクスプロロルニス en:Explorornis (白亜紀後期) – エウエナンティオルニス類?
ホレツマヴィス en:Horezmavis (白亜紀後期のウズベキスタン・Kyzyl Kumに生息) – ゴビプテリクス形類?
ガルガントゥアヴィス en:Gargantuavis (白亜紀後期)
インコロルニス en:Incolornis (白亜紀後期) – エウエナンティオルニス類？
パタゴプテリクス en:Patagopteryx (白亜紀後期)
ズィラオルニス科 – エナンティオルニス形類?
ズィラオルニスen:Zhyraornis (白亜紀後期)
ジベイニア、ヴェスコルニス、ヘベイオルニスは互いにシノニムの可能性がある(詳細は各項目(英語版)を参照)。ジベイニアは1997年に、ヘベイオルニスは1999年に、ヴェスコルニスは2004年にそれぞれ報告されたが適切な記載ではなかった可能性がある。そのためこの3属はジベイニア一属に統合される可能性がある。不幸なことに、ジベイニアの模式標本は2001年に紛失してしまった。
白亜紀後期の化石鳥類、ケレバヴィスは一つの頭蓋骨内側のキャストのみにもとづいて記載されている。記載内容としては不確実であるが、その特徴は真鳥類のものとは大きく異なっており、エナンティオルニス類と何らかの関わりがあるのかもしれない。
カタイオルニス（英語版）の頭骨
ロンギプテリクス（英語版）の化石。香港科学博物館蔵。
イベロメソルニス（英語版）の完模式標本。 パリ自然史博物館所蔵。
Museo di Storia Naturale di Venezia(ヴェネツィア自然史博物館)にあるリャオシオルニス（英語版）の幼体標本
イベロメソルニス（英語版）の復元模型