日本の哺乳類一覧
ネコ目（食肉目）

〔在来6科（迷行の1科除く）・移入3科：計9科〕
（ヒグマ Ursus arctos 【北】）
エゾヒグマ（亜種） U. a. yesoensis （ウスリーヒグマ U. a. lasiotus と同亜種とされることもある）【北/絶滅のおそれのある地域個体群（環境省レッドリスト）：石狩西部、天塩・増毛地方】 日本最大の陸生哺乳類。
（ツキノワグマ（ヒマラヤグマ、アジアクロクマ） Ursus thibetanus または Selenarctos thibetanus ）
ニホンツキノワグマ（亜種） U. t. japonicus （かつては Selenarctos thibetanus japonicus とされることもあった）【本/絶滅のおそれのある地域個体群（環境省レッドリスト）：下北半島、紀伊半島、東中国地域、西中国地域、四国山地】 四国・九州では絶滅または絶滅寸前。
ホッキョクグマ Ursus maritimus 【北・本】 北海道、新潟県で各1例があり、北極圏から漂流したものと思われるが、後者はツキノワグマ（アルビノ）の誤記載の疑いあり。
【移】 アライグマ Procyon lotor 【北・本】 北米原産。1962年以来、ペットが各地で野生化。「日本の侵略的外来種ワースト100」に選定。
（タヌキ Nyctereutes procyonoides ）
ホンドタヌキ（亜種）【屋久島では国内外来種】N. p. viverrinus 【本・島(佐)】 隠岐諸島には人為分布。山口県向島タヌキ生息地は天然記念物。
エゾタヌキ（亜種） N. p. albus 【北】 奥尻島には人為分布。
（キツネ（アカキツネ、アカギツネ） Vulpes vulpes ）
ホンドキツネ（ホンドギツネ）（亜種） V. v. japonica 【本】
キタキツネ（亜種） V. v. schrencki 【北】
【移】ギンギツネ V. v. fulva 【北】 シベリアやアラスカのキツネで、黒い体毛の血統。毛皮獣だが、野生化したものがキタキツネと交雑している可能性がある。
（オオカミ（ハイイロオオカミ） Canis lupus ）
エゾオオカミ（亜種） C. l. hattai 【北/絶滅（環境省レッドリスト）】 最後の記録は1896年。
ニホンオオカミ（亜種） C. l. hodophilax 【本/絶滅（環境省レッドリスト）】 1905年奈良県もしくは1910年福井県での捕獲が最後。
【家】 イエイヌ（亜種）（ノイヌ） C. l. familiaris 【北・本・島】 離島などで固有種を圧迫。
（テン Martes memlampus ）
ホンドテン（ニホンテン）（亜種）【北海道・佐渡島では国内外来種】 M. m. memlampus 【北・本・島(佐)】 サドノウサギを激減させた。
ツシマテン（亜種） M. m. tsuensis 【島(対)/準絶滅危惧（NT）（環境省レッドリスト）】 天然記念物。
（クロテン Martes zibellina ）
エゾクロテン（亜種） M. z. brachyura 【北/準絶滅危惧（NT）（環境省レッドリスト）】
ニホンイタチ（イタチ）【北海道・南西諸島などでは国内外来種 】 Mustela itatsi 【北・本・島(南)/固 】 三宅島などで在来動物を圧迫。シベリアイタチの亜種とする説もある。「日本の侵略的外来種ワースト100」に選定。
コイタチ（亜種） M. i. sho 【島(屋)】
（シベリアイタチ（タイリクイタチ） Mustela sibirica ）
チョウセンイタチ【対馬以外では移】 M. s. coreana 【本・島(対)/準絶滅危惧（NT）（環境省レッドリスト）】 西日本から分布を広げつつあり、ニホンイタチを圧迫。亜種に分けない説もある。「日本の侵略的外来種ワースト100」に選定。
（イイズナ Mustela nivalis ）
キタイイズナ（亜種） M. n. nivalis 【北】 大陸に分布するものと同じ亜種。
ニホンイイズナ（亜種） M. n. namiyei 【本/準絶滅危惧（NT）（環境省レッドリスト）/固】
（オコジョ Mustela erminea ）【高山帯】
エゾオコジョ（亜種） M. e. orientalis 【北/準絶滅危惧（NT）（環境省レッドリスト）】 平地では移入種のニホンイタチ・ミンクの圧迫により姿を消す。
ホンドオコジョ（亜種） M. e. nippon 【本/準絶滅危惧（NT）（環境省レッドリスト）/固】
【移】 アメリカミンク（ミンク） Mustela vison 【北】 北米原産。1960年代から。平地でエゾオコジョ・ニホンイタチを圧迫。養魚場等にも被害。
【移】 フェレット Mustela furo 原種はヨーロッパケナガイタチ。
ニホンアナグマ Meles anakuma
（カワウソ（ユーラシアカワウソ） Lutra lutra ）
ニホンカワウソ（亜種） L.l.nippon 【本/絶滅（環境省レッドリスト）】 1983年高知県の死体発見が最後。特別天然記念物。2012年絶滅種に指定。
ニホンカワウソ（亜種） L.l.whiteleyi 【北/絶滅（環境省レッドリスト）】 2012年絶滅種に指定。
ラッコ Enhydra lutris 【海/絶滅危惧IA類 (CR)（環境省レッドリスト）】 北海道東部沿岸で一旦絶滅。近年、千島列島のものが冬期に知床・根室周辺に出現。
【移】 ハクビシン Paguma larvata 【北(奥尻島)・本】 かつては在来種であるとの説もあった。
【移】 フイリマングース Urva auropunctatus 【島(南)】 ハブ駆除のため沖縄島（1910年）、奄美大島（1979年）で放された。2005年に特定外来生物に指定され、2024年奄美大島では根絶された。鹿児島県本土で逸出個体が発見されたことがある。
（ベンガルヤマネコ Prionailurus bengalensis ）
イリオモテヤマネコ（亜種） P. b. iriomotensis 【島(西)/絶滅危惧IA類 (CR)（環境省レッドリスト）/固/希少】 1967年新種記載。100頭前後か。特別天然記念物。かつては独立種とされることもあったが、現在はベンガルヤマネコの亜種とされる。
ツシマヤマネコ（亜種） P. b. euptilura 【島(対)絶滅危惧IA類 (CR)（環境省レッドリスト）/希少】 100頭前後か。天然記念物。かつては独立種とされることもあったが、現在はアムールヤマネコ P. b. euptilura の対馬個体群とされる。
（ヤマネコ Felis silvestris ）
【家】 イエネコ（亜種）（ノネコ） F. s. catus 【北・本・島(南)】 南西諸島などで固有種を含む多くの在来小動物を捕食、ヤマネコ類への病気伝播も。
（アシカ（カリフォルニアアシカ） Zalophus californianus ）
ニホンアシカ（亜種） Z. c. japonicus 【海(竹)/絶滅危惧IA類 (CR)（環境省レッドリスト）】 すでに絶滅している可能性が高い。
トド Eumetopias jubatus 【海/準絶滅危惧（NT）（環境省レッドリスト）】 10-5月に北海道沿岸に回遊。
オットセイ（キタオットセイ） Callorhinus ursinus 【海】 冬から春に、銚子沖に至る近海沖合いに回遊。
セイウチ Odobenus rosmarus 【海】 北極海周辺から、ごくまれに北海道・青森県に迷行。
ゴマフアザラシ Phoca largha 【海】 冬に北海道東部周辺に南下。
ゼニガタアザラシ Phoca vitulina 【海/絶滅危惧II類 (VU)（環境省レッドリスト）】 日本で繁殖する唯一のアザラシ類。北海道東岸を中心に生息。
ワモンアザラシ Phoca hispida 【海】 冬に少数が北海道東部周辺に南下。
クラカケアザラシ Histriophoca fasciata 【海】 冬に北海道東部周辺に南下。
アゴヒゲアザラシ Erignathus barbatus 【海】 北極圏から稀に迷行。2002年「タマちゃん」が話題に。
キタゾウアザラシ Mirounga abgstirostris  【海】北米西岸から稀に迷行。明確な記録は1989年に伊豆諸島新島に衰弱した雄（保護され、1996年まで鴨川シーワールドで飼育された）と2001年に館山市波左間で確認され、日本海側では2017年に山形県沿岸に漂着し加茂水族館で飼育されている雌のみ。