過去に存在した長崎屋の店舗
過去に存在した店舗 > 北海道

（初代）札幌店（札幌市中央区南2条西1丁目3、1967年（昭和42年）10月1日開店 - 1972年（昭和47年）閉店）
店舗面積1,980m2。
長﨑屋が1967年（昭和42年）に北海道に初上陸を果たした店舗であった。1972年（昭和47年）に、近隣に2代目店舗を開設、増床移転したために閉店となった。建物は現存、「北専ビル」となっており、ブックオフ南2条店が入居している[要出典]。
（2代目）札幌店 → Big-Off札幌店（札幌市中央区南1条西1丁目、1972年（昭和47年）1月27日開店－（2002年（平成14年）2月11日閉店）
店舗面積約5,181m2 → 約6,972m2。
開業時には地下2階に札幌フードセンター（売場面積約660m2）が出店していた。
1987年（昭和62年）10月10日にディスカウント店のBig-Off札幌店へ業態転換した。2000年（平成12年）11月23日には約1億円を投じて総菜売り場を約1.5倍に拡張するなど食品売り場を強化する大規模な改装を行ったが、2002年（平成14年）2月11日に閉店となった。
2002年（平成14年）11月8日に丸井今井札幌本店南館となり、2008年（平成20年）12月にジュンク堂書店が出店。その後、2018年8月26日をもって丸井今井は同建物から撤退している（ジュンク堂書店などは引き続き入居）。
ラパーク篠路店（札幌市北区大平12の1、1991年（平成3年）3月29日開店⇒2001年（平成13年）1月閉店）
跡地には「カウボーイ篠路店」が2001年（平成13年）11月に開店し、のちにカウボーイのトライアルカンパニー傘下入りにより「スーパーセンタートライアル篠路店」と改称したものの、移転のため2018年（平成30年）8月26日に閉店した。跡地にはMEGAドン・キホーテ篠路店が2019年（平成31年）3月22日に開店した（同店舗の運営は長崎屋ではなく(株)ドン・キホーテが行っている）。
釧路店（釧路市幸町14-1、1976年（昭和51年）4月4日開店 - 2002年（平成14年）2月11日閉店）
店舗面積約5,643m2 → 約9,207m2。
店舗跡には建物を所有する地元企業の武田商事が運営する形で、2003年（平成15年）9月6日にアベニュー946が開業した。
長崎屋も衣料のみ1テナントとして再出店したが2008年（平成20年）8月再撤退。店舗跡には同年10月16日に「ショウエーアベニュー・クシロ店」が開店。しかしアベニュー946自体も2016年（平成28年）8月31日に閉店した。建物が解体されたのち、跡地にはパチンコ店のベガスベガスが出店を表明、2018年（平成30年）12月28日に「ベガスベガス釧路店」として開店した。
倶知安店（虻田郡倶知安町南2条西1-1、2002年（平成14年）2月11日閉店）
店舗面積約1,968m2。
店舗跡には、2002年（平成14年）5月にスーパーJOY倶知安店が出店したものの、これも2012年8月に閉店した。閉店後、建物は解体されたのちに新築され、北雄ラッキーの「ラッキー倶知安店」が2014年3月7日に開店した。
小樽奥沢店（小樽市奥沢2-27-4、1982年（昭和57年）3月5日開店 - 2002年（平成14年）2月11日閉店）
敷地面積約3,281m2、鉄筋コンクリート造地上2階建て塔屋1階、延べ床面積約4,716m2、店舗面積約2,575m2（当社店舗面積約1,650m2）、駐車台数約80台。
店舗面積約2,570m2。
小樽市奥沢地区の商店街にあった北海製紙（企業としては現・王子ネピア）工場跡に「サンドール北海道」が出店した小樽市初の本格的な郊外型スーパーだった。
店舗跡には、スーパーチェーンシガ奥沢店が2002年12月7日に開店した（その後ラルズへ経営譲渡され、2016年10月6日に店名を「スーパーアークス奥沢店」へ変更）。
留萌店（留萌市花園町1-40、1981年（昭和56年）6月24日開店 - 2001年（平成13年）1月閉店）
敷地面積約4,807m2、鉄筋コンクリート造地上2階建て塔屋1階、延べ床面積約4,290m2、店舗面積約2,505m2（当社店舗面積約1,075m2）、駐車台数約300台。
サンドール北海道（約680m2）と共に核店舗として出店していた。
大型ショッピングセンターとの競争で売上が減少したため、開業から約17年で閉店となった。
店舗跡は売却対象となり、同所ではホッカイドウ競馬のミニ場外馬券場を開設する招致活動が行われ、2004年10月19日に「Aiba留萌」の名称で開業した。しかしこれも2008年12月29日をもって閉鎖された。
音更店（河東郡音更町木野大通東10丁目2、1979年（昭和54年）9月27日開店 -1998年（平成10年）5月閉店
店舗面積約1,203m2。
店舗は改装されパチンコ店が出店。[要出典]
（初代）帯広店（帯広市西2条南9丁目7、1970年（昭和45年）9月23日開店-1990年（平成2年）閉店）
西2条南9丁目の夷石チェーンのキネマ館や帯広大映などの跡地に建設された地下1階・地上7階のいせきビルに出店していたが、1990年（平成2年）11月に西4南12丁目の2代目帯広店の開店 に伴い閉店となった。売り場面積5,240m2。
店舗面積約4,042.5m2。
店舗跡はポポロ帯広（売り場面積4,973m2）として営業していたが、中心商店街の集客力の低下による売り上げ低迷で2002年（平成14年）9月29日に鈴丹が撤退して1階の大半が空き店舗となるなど空洞化が進み、2003年（平成15年）11月末まででビルを所有するいせきグループが同ビル内で経営していたキネマ館も閉館になって 解体され、サルのいる映画館として知られたキネマ館を記念したサルのモニュメントのある駐車場になった。
（2代目）帯広店（帯広市西4条南12丁目3、1990年（平成2年）11月22日開店 - 2023年7月31日閉店）
地上5階建て・塔屋2階。敷地面積25,500m2、延べ床面積80,615.5m2、売場面積12,830m2（直営8,980m2、テナント3,850m2）。駐車台数約1,600台。
1階と5階が駐車場となった建物で、2階から4階の一部には関連会社のサンファンタジーが運営する屋内遊園地「ファンタジードームおびひろ」が併設されて同時に開業した。
2011年（平成23年）11月5日に食品売り場を、直営から地元スーパーマーケットの「フクハラ」の店舗に変更した。
2023年（令和5年）6月14日に店舗の土地・建物を地元企業の「登寿ホールディングス」が取得した。
長崎屋直営売り場が閉店後、営業継続するテナントも2024年（令和6年）3月末をもって閉店する方針が示されている。2023年（令和5年）9月30日には、売り上げが低迷していた食品スーパー「フクハラ」が閉店。2024年（令和6年）3月31日に、同建物で最後まで営業していたダイソーが閉店し、建物自体の営業も終了した。建物は2025年（令和7年）9月までかけて解体される予定である。
名寄店（名寄市大通南10、1980年（昭和55年）10月開店 - 2001年（平成13年）1月閉店）
店舗面積約1,479m2。
伊達店（伊達市末永町42-1、1978年（昭和53年）3月開店 - 2001年（平成13年）1月閉店）
売場面積1,520m2。
伊達市内初の大規模小売店として開店し、食料品を主力として営業したが、近隣への競合店の進出などで競争が激化して業績が低迷していたところに、同社が会社更生法の適用を申請したため、閉店となった。
店舗跡は、閉店後も同社所有で空き店舗の状態が続いたが売却され、新たな所有者により2004年（平成15年）5月10日から解体工事が行われて駐車場として利用されることになった。
サンドール伏古店 → 伏古店（札幌市東区伏古6条3丁目、）
店舗跡は、1993年（平成5年）11月にラルズが出店した
サンドール北海道 → 北都店（札幌市白石区北郷三条12、）
店舗跡は、1993年（平成5年）12月にラルズが出店した
もみじ台店（札幌市厚別区もみじ台北5-1、1975年（昭和50年）7月6日開店 - 閉店時期不明）
敷地面積約29,869m2、鉄骨鉄筋コンクリート造地上3階建て、延べ床面積約14,439m2、店舗面積約4,986m2（当社店舗面積約777m2）、駐車台数約550台。
「ホクノースーパー」（約1,194m2）と共に公団もみじ台団地内の“もみじ台ショッピングセンター”の核店舗として出店していた。
（初代）旭川店（旭川市1条通7-47、1970年（昭和45年）5月28日開店 - 1992年（平成4年）閉店）
敷地面積約1,320m2、鉄筋コンクリート造地下1階地上7階建て、延べ床面積約12,457.5m2、店舗面積約6,342.6m2（直営店舗面積約4,290m2 → 約7,600m2）。
旭川駅前の平和通買物公園の一角にあった店舗で、建物は地上7階・地下1階建てだった。1974年（昭和49年）5月には仲通り側に約6932m2増築された。1992年（平成4年）11月1日に北部郊外に「ラパーク旭川」が開業したことに伴いスクラップアンドビルドで閉店となった。店舗面積は約6,930m2。
店舗跡は1993年（平成5年）から丸井マルサによるファッションビル「旭川マルサ」を経て、2002年（平成14年）9月に約60店舗が入居したテナントビル「!EXC（エクス）」となったが、売上の低迷や老朽化に伴う改修費を賄えないとして2014年（平成26年）3月末に閉店した。
老朽化による耐震性の問題から1階部分のみ利用することになり、同年7月末に「ツルハドラッグ旭川買物公園通店」（売場面積約830m2）、「ラオックス旭川駅前通り店」（売場面積約550m2）が 同年9月19日に出店した。しかし「ツルハ」も2020年（令和2年）5月末に閉店。地元の地権者5者と大和ハウス工業が売買契約を結び、同年9月から解体開始。跡地には2023年（令和5年）末に25階建て複合高層マンションが建設される予定である。
（初代）苫小牧店（苫小牧市木場町18、1973年（昭和48年）10月27日開店 - 1998年（平成10年）1月15日閉店）
岩倉組の木材工場跡地に出店した、地下1階地上2階建て、延べ床面積25,500m2、売り場面積9,900m2の店舗であった。1998年（平成10年）に、閉鎖された屋内遊園地ファンタジードーム跡に店舗を移転し、同年2月から閉鎖された。
閉店後、施設は「九段エステート」に売却され、当初2000年（平成12年）10月2日に「トマ・モール」としてオープンする予定となった。しかし出店予定だった中核テナントの撤退、出店手続きの変更に伴い、全館オープンは2001年（平成13年）10月以降となった。しかし駅前の空洞化などにより徐々に空き店舗が増え、最後まで残ったパチンコ店も2015年（平成27年）11月に閉店した。その後建物と土地はマルハンが取得し、2017年（平成29年）1月から解体工事を開始。しかし、アスベスト飛散防止対策の不備により、工事は2019年（令和元年）11月18日に再開するまで2年間中断した。2020年（令和2年）3月ごろに解体が完了し、跡地には「マルハンパチンコ」が建設された。
→詳細は「MEGAドン・キホーテ苫小牧店」を参照
サンロード苫小牧店（苫小牧市木場町18、1979年（昭和54年）11月開店）
店舗面積約333m2。
長崎屋苫小牧店（初代）に併設。
室蘭中央店 （室蘭市中央町3-1-8、1981年（昭和56年）4月15日開店 - 2012年（平成24年）8月31日閉店）
室蘭中島店と同じ地元のセブンが道南バス本社跡に建設したビルへ出店する形で開業した。
室蘭ファミリーデパート桐屋や丸井今井室蘭支店と同日に、同じ売り場面積7,000m2で開業した。
地域の人口減の影響など年々減少していた売上を地道な店舗改革で回復させて2009年（平成21年）には売り上げの伸び率が、長﨑屋全店のトップになり、2011年（平成23年）現在黒字経営を続けていた。
店舗の土地と建物を所有するキョウデンエリアネット と老朽化した店舗の修繕費などの支払いに関して民事訴訟に発展して 収拾のめどがつかないことを理由に2012年（平成24年）1月31日で閉店すると親会社のドン・キホーテが正式に発表した
地元住民側の強い存続要請もあり2011年（平成23年）11月22日に2012年（平成24年）5月末閉店となり、2012年（平成24年）4月13日には8月末となる など閉店予定日を2度延期された。
店舗跡の土地と建物は2013年（平成25年）12月にスーパー大手アークスグループのラルズが取得。
2014年（平成26年）7月25日に1階にラルズがスーパーの「スーパーアークス室蘭中央店」が先行して開業し、同年10月4日には2階に「スイートデコレーション室蘭店」が開業した。
サンドール北海道栗山店（夕張郡栗山町中央2-288