日本の歴史
原始 > 縄文時代

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縄文時代（じょうもんじだい）は、年代でいうと今から約1万6,500年前（紀元前145世紀）から約3,000年前（紀元前10世紀）、地質年代では更新世の末期から完新世にかけて日本列島で発展した時代であり、世界史では中石器時代ないし新石器時代に相当する時代である。旧石器時代と縄文時代の違いは、土器の出現や、定住化に伴う集落（環状集落など）の形成、長期使用可能な建物（竪穴建物・平地建物・掘立柱建物）の普及、貝塚の形成などがあげられる。
草創期・早期・前期・中期・後期・晩期の6期に区分される。この頃の日本列島人は縄文土器を作り、早期以降定住化が進んで主に竪穴建物に住んだ。縄文土器については、青森県大平山元I遺跡にて約1万6,500年前の世界最古と言われる土器が発見されている。弓矢を用いた狩猟、貝塚に見られる漁撈、植物の採集などで生活を営み、打製石器、磨製石器、骨角器などを用いた。
雑穀や堅果などの栽培も行われたとする仮説も提示されており、野生のイヌビワから穀物のヒエへの栽培化のプロセスが追跡できるとする研究や、クリの選択が行われて栽培化の動向がうかがわれるとされる研究も公表されている。稲作については、約6,000年前の岡山県朝寝鼻貝塚から稲作を行っていた証拠が見つかり、縄文時代前期から稲作が行われていたことが判明した。
縄文人の主要な遺伝子として、ハプログループD-M64.1(M55)、ハプログループC-M8が想定されている。
縄文人と弥生人の父系関連を表すY染色体の分岐図
A0000 A000-T                    {{{A0000}}}  
                                       
  PR2921 A00  A0  A1a  A1b1  サン族   {{{PR2921}}}           
      L1090  P305  V221  M42  M168           
                                                       
       E系統                   {{{E系統}}}  
  YAP  CTS3946                    {{{YAP}}}     
                                         
    A5580.2 ナイジェリア  F6251 M15 チベット       {{{A5580.2}}}      
                  Y34637 ジャラワ族          
    M174 CTS11577  Z3660  M64.1            {{{M174}}}      
        L1366 フィリピン      ※以下日本固有の系統         
                                                 
    CTS131 CTS220 CTS10495 Z17176 BY113470       {{{CTS131}}}        
                   FT413039             
              CTS11285 PH2316 Z38287 Z38284          
              Y456902       Z38289           
         CTS1824  CTS11811  CTS288 CTS1815             
             礼文島人骨      Z40665         
    M116.1 加徳島人骨  CTS103 Z42462           {{{M116.1}}}      
        CTS6609^^  CTS1897 CTS11032 CTS218 CTS6909           
                      F8521.3  CTS3033     
                          M151    
        P120      CTS1964 BY169023 CTS964         
                      CTS722  BY169030     
                 Z30644 CTS4292 Z31517        
                 CTS429  Z31512  CTS1798      
        M125 CTS291 P12.1               
            JST022457 P53.2              
                Page3 CTS3397 Z1500        
                                                         
    Z1504 BY149852 FGC34008  L137.3 Z40625               
        Z45993      Z40609  CTS217          
        CTS3327      FT8762  Z38475          
        CTS8093 FGC6373  FGC6372 FGC6384            
            BY45234 BY26014^^              
            Z40614  Z46276             
            FGC30021                
            Z31548                
            FT262409 Z31553             
            FT117379 CTS4093              
            CTS6223  BY166058             
            Z40687 Z35641              
                Z40688            
  P143 M89 F1329 M578 L15                       
           Y27277       H系統          
      M216       G系統 アイスマン           
                                       
  F3393 CTS11043 M8 CTS9336 CTS6678 Z7972             
                                         
                   Y170131 Y170130      
  M217 F1067 Z1312 F2613 CTS4021 CTS2657            
                                                        
  CTS11990 Z31664 Y112121 MF1792      Z31665            
      CTS3579      MF2816 Y86025  Y87983          
                                        
                  Y89130 MF2828      
                                                              
  M9(P128) LT系統                      
       M526 M2308 F549 M214 M175             
           YSC0000186 PF5850       N系統        
  IJ系統 I系統 クロマニョン人                     
      J系統                      
                                                      
  V1651 M1254 P337 P284 P226               
                                                          
  R系統 Y482 M173 L146                  
  Q系統 L472  L722  M343                 
      L275                     
                                                        
  F265 M268 M176 (P49) F855 CTS9259 F1204(K10)            
  M122 漢民族                       
                                                        
  47z (K7) CTS1348 K2  ※以下弥生人の系統                
                                        
       CTS8379 ACT4054                  
       Y130364 CTS2748                   
           Z24599 CTS1351               
                BY146002 Y130014         
                CTS9852             
           K14 Z24594 CTS525 FT217340          
                FT350225 CTS11088         
           BY179281 BY178096 BY178807           
           Y126340                 
  F2868 L682 CTS723 Y24057                  
      F940                     
                                               
  CTS7620 CTS4596 Y61286                    
            Page90 BY162375             
            CTS1175                
       MF14346                    
  A12446 PH40                      
       FGC67537 FT41750                  
  MF14220       FGC67568                 
  Y72859  MF16242 MF14245 FT281275               

(出典)"ISOGG Tree"(Ver.15.73), "Y-Full"(Ver.12.00), "FTDNA Big Y Tree"