スター☆トゥインクルプリキュア
あらすじ

観星町に住む、宇宙と星座が大好きで「キラやば〜っ☆」が口癖の観星中学校2年生、星奈ひかるは、星空を観察していた夜、天文台を管理する空見遼太郎にもらったノートに自作の星座を描いていたところ、その星座が生き物となって現れ、突如宇宙空間にワープする。気づくとベッドで寝ており、夢かと落胆していたところ再びその生物が姿を現し、ひかるはそれに「フワ」と名付ける。その最中、空からロケットが着陸し、中から少女と謎の生物が出てくる。フワを知る謎の生物はひかるにスターパレスから来たプルンスと自己紹介し、そして少女は惑星サマーン出身のララと紹介する。
そこに宇宙の支配を企む謎の組織「ノットレイダー」の幹部・カッパードと戦闘員・ノットレイが現れる。ララたちはフワを連れてロケットで宇宙へ逃げるが、ロケットが攻撃を受けた弾みでフワが宇宙空間へ放り出される。ロケットに乗り込んでいたひかるはフワを助けるために宇宙に飛び出し、これを守ろうと決意したとき、フワの力でひかるのノートが「トゥインクルブック」へと変化し、さらに「スターカラーペンダント」と「変身スターカラーペン」が現れる。ひかるはそれらを用いて「星のプリキュア」キュアスターへと変身し、ノットレイダーを退散させる。
フワがふたたび不思議な力を発揮し、ひかるとララは互いの言葉を解するようになる。損傷したロケットは制御不能となり観星町に不時着し、修理のためララたちは観星町に留まることになる。ララとプルンスはひかるに、地球から遠く離れたところに「星空界」の聖域「スターパレス」があり、そこでは12星座の「スタープリンセス」が宇宙の均衡を保っていたこと、スターパレスがノットレイダーの襲撃を受けプリンセスたちは12本のプリンセススターカラーペンとなって宇宙に散らばったこと、このままでは地球や宇宙が飲み込まれるため、プリンセスの力を解放できる伝説の戦士プリキュアを捜す旅をしていたことを説明し、また、地球は宇宙星空連合の管轄外のため、地球人との交流は連合が定める宇宙法で禁じられており、それに抵触すると宇宙の旅が100年間禁止になるので、決して他言しないように口止めを依願する。
一方、ララはデータ上自分と同じ低確率である地球人のひかるがプリキュアになれたのを疑問に思っていた。しかしひかるは「過去のデータにこだわってもこれからは分からない」と諭す。そのときふたたびカッパードたちが現れ、ひかるはスターとして応戦する。プリキュアになれず、自分ではフワを助けられないと思い込み落胆するララにスターは「大切なのは自分の気持ち」と告げ、その言葉に感銘を受けたララはフワを助けたいという強い気持ちを持ったことで「天の川のプリキュア」キュアミルキーへと変身し、スターに共闘を誓う。
カッパードたちを退散させた直後ペンダントが音を発しだし、ララは分析を試みるも分からないままだった。ひかるとララの対照的な性格から軋轢が生じるが、商店街で出会った「観星中の太陽」と呼ばれるひかるの学校の先輩・天宮えれなの忠告、そして仲良くして欲しいというフワの懇願から冷静となり、それぞれの考えをまとめてプリンセスペンを見つける。そこに新たな幹部・テンジョウが現れペンを奪われるが、2人は連携攻撃を仕掛けペンを奪還し、おうし座のスタープリンセスの力を解放することに成功する。プリンセスにフワを育てるよう託され、その後ひかるとララは互いに謝罪し、呼び捨てで呼び合う仲となる。
その後、ふたりはえれなに仲直りの報告をしに行った帰りにテンジョウの奇襲を受けるが、異変を察知し駆けつけたえれなが「太陽のプリキュア」キュアソレイユへと変身し2人に加勢する。一方えれなと人気を二分し「観星中の月」と呼ばれる生徒会長の香久矢まどかがララとフワの姿を見て疑念を抱き、ひかるたちを尾行しロケットを見て驚愕する。そこにふたたびテンジョウが襲撃するが、まどかが状況を酌み「月のプリキュア」キュアセレーネへと変身し、テンジョウらを退かせる。4人は契りを交わし「スター☆トゥインクルプリキュア」を結成する。
ノットレイダーは次に3人目の幹部・アイワーンとその執事・バケニャーンを仕向け、人間をダークペンで怪物・ノットリガーに仕立てる。そのペンの正体は闇に染まったプリンセスペンであった。それを知った4人はチームプレーを仕掛け奪還し、しし座のプリンセスを解放する。その後ララが「ひかるたちにもロケットを直してほしい」と願い一致団結、プリンセス救出に大きく前進する。そしてひかるたちの頑張りにより修理と改造が終わり、さらにペンダントの導きとフワの力により星空界へ赴く。一行はペンダントが示した惑星ケンネルへ降り立ちプリンセスペンを発見するが、そこでカッパードと遭遇する。4人は対峙してペンを掴み取り、てんびん座のプリンセスを解放し地球へと帰還する。次に惑星クマリンへ赴くが、そこでカッパードらに隙をつかれプリンセスペンを奪われる。三幹部はそれをダークペンに変え、その力で3人が合わさったノットリガーへと変貌し4人の前へ現れる。力の差を見せつけられピンチになるが、奮起した4人の決意が合わさり「トゥインクルステッキ」が誕生する。4人はそれを用いた必殺技でノットリガーを撃破し、あわせて三幹部も退かせる。この戦闘で遼太郎がララたちの正体を知るが、状況を酌みひかるたちに秘密を共有することを誓う。
この戦闘を政府の命で宇宙人に関する調査を行っていたまどかの父で政府高官の香久矢冬貴に見られ、4人は事情を問われる。そこにハリウッドで活躍する映画監督のP.P.アブラハムが突然現れ、「映画撮影の特撮」と説明して冬貴を納得させる。アブラハムは自身が宇宙星空連合の調査員だと明かし、宇宙法に違反したララたちに故郷への強制帰還を命じる。それに納得できないひかるは、4人出演の映画撮影を依願し、撮影が成功したら取り消しという案を承諾させる。アイワーンらの妨害で撮影中止となるが、アブラハムは友情に感涙してララたちの帰還を見送る。ひかるは、ララが演じた「羽衣天女」から「羽衣」という名字を提案し、ララは地球人「羽衣ララ」として、アブラハムの根回しにより観星中へと編入し、ひかるとクラスメイトになる。しかし、AIがすべてを決めるサマーンで育ったララは、地球人との習慣の違いから奇妙な目で見られてひかるたちに迷惑をかけることを恐れ、パーソナルAIの力を借りて周囲と同じように振る舞うことを決める。しかし、ひかるの言葉を受けて自分を偽らないことを決め、クラスメイトたちにも自身の個性を受け入れられていることに気づく。
ひかるたちは残りのプリンセスペンを探すべくゼニー星へ赴き、そこで宇宙怪盗・ブルーキャットの噂を耳にする。そしてペンダントが示した場所へ向かうと宇宙アイドルのマオがおり、ファンであるプルンスは狂喜乱舞するが、アイワーンが現れた際、マオは自身がブルーキャットと同一人物であることを明かす。4人は、自分たちがプリキュアだと知るブルーキャットに協力を依頼される。次に惑星レインボーへ赴くが、そこは荒廃した土地と石化した住民という光景が広がっていた。そこにアイワーンとバケニャーンが現れる。バケニャーンの正体は、レインボー星人であるブルーキャットが変身した姿であり、アイワーンに滅ぼされた故郷の復活に必要なプリンセスペンの情報を得るために近づいたと真実を明かす。4人はブルーキャットと共闘してアイワーンを退け、ひかるは彼女の思いに感銘を受け協力を誓う。しかし彼女はこれを拒み、プリンセスペンとフワを奪って逃げる。追うひかるは再度説得を試みるが、彼女は聞く耳持たずまたも逃走を図り、4人はやむなく対峙を決める。そしてスターとブルーキャットの一騎討ちのさなか、突然ブルーキャットがネコのような人間に変身する。ブルーキャットは自分が変化の能力をもつ種族であることを明かし、そして惑星レインボーの成り立ちから滅亡までの経緯を4人に説明する。その直後、ノットリガー化したアイワーンが現れ、スターたちは力負けし変身が解け、ブルーキャットはみんなを助けたいと決心する。そのとき、彼女の思いにトゥインクルブックが呼応し、変身ペンとペンダントが誕生する。彼女はそれらを用いて「宇宙のプリキュア」キュアコスモに変身し、4人を助けるべくアイワーンと対峙する。そんな矢先、突然アイワーンにノットレイダーの支配者「ダークネスト」の力が憑依し強大な力を得る。5人は苦戦を強いられるが、スターはアイワーンが苦しんでいるのを見抜き救うことを決める。コスモも彼女に同意したその時、香水が変化し「レインボーパフューム」が誕生する。それを用いた必殺技でアイワーンをもとに戻すが、宇宙船を奪われ、恩を仇で返される。それを見たひかるはブルーキャットをスターパレスへと誘い、プリンセスたちと謁見させる。プリンセスたちはブルーキャットに力強い言葉を掛け、彼女もそれを聞き故郷を必ず復興させると決意する。その後ひかるの誘いを受けたブルーキャットはこれを受け入れ、「ユニ」という本名を明かし仲間になることを誓う。こうしてひかるたちはユニとともに地球へ無事帰還し、新たな生活を始める。ユニは地球でも相変わらず単独で行動するが、えれなに仲間の良さを聞いて考えを改め、4人と共闘するようになる。
4人がユニを観星町星祭りに誘い、さらなる親睦を深めていたとき、突然ララの端末に、双子の兄ロロから「サマーンへ戻れ」と通信が入る。夏休みを利用し、ひかるたちはララとともにサマーンへ向かうことになる。道中、ロケットが故障するハプニングが発生するが、無事修理を済ませてサマーンに到着し、ひかるたちはロロと両親に会い親睦を深める。それも束の間、サマーンはノットレイダーの襲撃に遭い、マザーAIを乗っ取られ大混乱に陥る。ララのパーソナルAIとプリキュアの活躍で事態は解決し、ララも家族とのわだかまりを解き地球へ帰還する。そこに4人目の幹部・ガルオウガが現れ最後のプリンセスペン誕生を阻止すべく立ちはだかる。5人はこれに辛勝し、最後のプリンセスを復活させる。これで12人のプリンセスと12本のペンが揃い、その瞬間「シャイニートゥインクルペン」が誕生する。それをトゥインクルブックに使ったとたん、フワがユニコーンのような容姿になる。さらなる成長が必要だというフワを5人が世話していたとき、ふたたびガルオウガが襲来し苦戦を強いられる。絶体絶命のそのとき、5人はユニコーンフワから発生した不思議な力に包まれ、「トゥインクルスタイル」へと変化を遂げる。そして合体必殺技でガルオウガを退却させる。プリンセスたちは5人に、フワの「大いなる力」を完成させるには「トゥインクルイマジネーション」を探さねばならないと告げる。
5人はトゥインクルイマジネーションが何なのか分からず苦悩の日々が続く。ウラナイン星へ赴いた際、ユニは居場所を失ったアイワーンとの戦いの果てに、その罪をゆるして未来に生きることを決意し、自身の心からトゥインクルイマジネーションを生みだす。自分が異星人だとクラスメイトに疑念を向けられたララは、カッパードから友達を救うために正体を明かし、自分らしく生きるという決心によってトゥインクルイマジネーションを生む。卒業後の未来に迷い悩んでいたえれなとまどかも、ノットレイダーと一戦を交えるなかで迷いを吹き飛ばしてトゥインクルイマジネーションを発現させ、自身にふさわしい未来を決める。そしてひかるも、最後の決着をつけるべく挑んできたカッパードとの戦いのなかで自分の夢を見つけだし、トゥインクルイマジネーションを誕生させる。
5つのトゥインクルイマジネーションをそろえたひかるたちはスターパレスを訪れ、プリンセスの儀式を見守ることになる。そこへノットレイダーの大軍勢が出現し、加勢に現れた宇宙星空連合の艦隊と激戦を交わす。ひかるの懸命な説得により争いが止みかけたとき、ダークネストが真の姿を現す。その正体は、宇宙創造時にイマジネーションを命に与えることに反対しスターパレスを追われた蛇遣い座のスタープリンセスで、プリンセスたちの力を宿したフワを器として「大いなる闇」を広げることで、歪みに満ちたこの宇宙を消し去り、新たな宇宙を創造しようとしていた。ノットレイダーたちは主に騙されていたことを知り、歪んだイマジネーションに飲まれ暴走したところをプリキュアに救われる。蛇遣い座のプリンセスはスターパレスを破壊してフワとプリンセスを奪い去り、プリキュアは宇宙星空連合やノットレイダーと協力して立ち向かう。しかし、大いなる闇を止めるにはスターパレスの一部であるフワの消滅を代償とせねばならないことを知る。フワは自分の使命を果たして消えるが、ひかるたちのフワへの思いが仇となって力を発揮しきれず、宇宙は大いなる闇に飲み込まれてゆく。静寂のなかで、ひかるたちは「心の宇宙」がまだ消えていないことに気づき、イマジネーションの力を取り戻す。宇宙に生きる命たちのイマジネーションの輝きを重ね、プリキュアは大いなる闇を消し去り宇宙を取り戻す。蛇遣い座のプリンセスはこの宇宙に生きる者たちの可能性を信じ、スターパレスを去ってゆく。プリンセスを超える力を得たひかるたちは、プリキュアの力を失うことを代償にフワをよみがえらせる。そしてひかる、えれな、まどかはララとユニに別れを告げ、蛇遣い座のプリンセスがガルオウガに渡した腕輪の力で地球へと帰還する。
それからしばらくして、ララたちがふたたび地球へとやって来る。ガルオウガがひかるたちを送り出す際、誤って試作品のノットレイのマスクも送られ、回収を依頼されたからだという。フワもすっかり能力を取り戻し、ふたたび変身できるようになったひかるたちは、マスクを被りノットレイと化した父・陽一を救うためにプリキュアに変身する。そこに現れた新たなプリキュア、キュアグレースの協力もあり、無事に陽一を浄化する。しかしそれは、15年後のひかるが見た夢のなかでの出来事であった。15年後のひかるは宇宙飛行士となり、日本初の有人ロケットのパイロットに選ばれ「自分の力で宇宙へ行く」というララとの別れ際の約束を果たそうとしていた。えれなは通訳、まどかは宇宙開発特別捜査局の職員として活躍し、ララ、ユニも星空界でそれぞれの生活を送り、かつてのノットレイダーの構成員たちは新たな星を与えられ、平和な生活を手に入れつつあった。そして地球の人々が見守るなか、有人ロケットは発射の時を迎え、ひかるは宇宙へと旅立つ。宇宙へ飛び出したロケットは突如まばゆい光に包まれ、それを見たひかるが涙を流し「キラやば」とつぶやくところで物語は終わる。