離島航路整備法
対象

2011年度（平成23年）以降は、この法律による国庫補助は、地域公共交通確保維持改善事業費補助金の一部として行われている。対象数は、21航路109事業者（平成30年度）。
参考までに、2007年度（平成19年）の国庫補助対象航路は以下の通りである。合計122航路のうち、民営は53事業者53航路、公営は36事業者45航路、第三セクターは23事業者24航路である。
| 運輸局 | 都道府県 | 事業者 | 航路 |
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| 北海道 | 北海道 | 羽幌沿海フェリー | 羽幌 - 天売 |
| 東北 | 青森県 | シイライン | 青森 - 佐井 |
| 東北 | 宮城県 | シーパル女川汽船 | 女川 - 江島 |
| 東北 | 宮城県 | 塩竈市営汽船 | 朴島 - 塩竈 |
| 東北 | 宮城県 | 網地島ライン | 石巻 - 長渡 |
| 東北 | 山形県 | 酒田市定期航路事業 | 酒田 - 勝浦 |
| 北陸信越 | 新潟県 | 粟島汽船 | 粟島 - 岩船 |
| 北陸信越 | 石川県 | へぐら航路 | 輪島 - 舳倉島 |
| 関東 | 東京都 | 小笠原海運 | 東京 - 父島 |
| 関東 | 東京都 | 伊豆諸島開発 | 八丈島 - 青ヶ島 |
| 関東 | 東京都 | 伊豆諸島開発 | 父島 - 母島 |
| 関東 | 東京都 | 東海汽船 | 東京 - 八丈島 |
| 関東 | 東京都 | 神新汽船 | 神津島 - 下田 |
| 中部 | 愛知県 | 一色町営渡船 | 一色 - 佐久島 |
| 中部 | 三重県 | 鳥羽市営定期船 | 鳥羽 - 神島 |
| 中部 | 三重県 | 志摩マリンレジャー | 和具 - 賢島 |
| 神戸 | 兵庫県 | 沼島汽船 | 沼島 - 洲本 |
| 中国 | 岡山県 | 豊浦汽船 | 飛島 - 笠岡 |
| 中国 | 岡山県 | 六島航路 | 六島 - 真鍋 - 笠岡 |
| 中国 | 広島県 | 走島汽船 | 走島 - 鞆 |
| 中国 | 広島県 | 斎島汽船 | 斎島 - 久比 |
| 中国 | 広島県 | 阿多田島汽船 | 阿多田 - 小方 |
| 中国 | 広島県 | 大崎上島町営フェリー | 白水 - 契島 |
| 中国 | 広島県 | 備後商船 | 常石 - 尾道 |
| 中国 | 広島県 | 呉市離島航路事業 | 三角 - 久比 |
| 中国 | 広島県 | 尾道市公営渡船 | 細島 - 西浜 |
| 中国 | 山口県 | 上関町定期船 | 八島 - 上関 |
| 中国 | 山口県 | 上関航運 | 祝島 - 柳井 |
| 中国 | 山口県 | 野島海運 | 野島 - 三田尻 |
| 中国 | 山口県 | 牛島海運 | 牛島 - 室積 |
| 中国 | 山口県 | 萩海運 | 見島 - 萩 |
| 中国 | 山口県 | 大津島巡航 | 大津島 - 徳山 |
| 中国 | 山口県 | 岩国柱島海運 | 岩国 - 柱島 |
| 中国 | 山口県 | 平郡航路 | 平郡 - 柳井 |
| 中国 | 山口県 | 熊南総合事務組合 | 馬島 - 麻里府 佐合島 - 佐賀 |
| 中国 | 山口県 | 周防大島町営渡船 | 樽見 - 土居 |
| 中国 | 山口県 | 周防大島町営渡船 | 情島 - 伊保田 |
| 中国 | 山口県 | 周防大島町営渡船 | 久賀 - 前島 |
| 四国 | 香川県 | 本島汽船 | 本島 - 丸亀 |
| 四国 | 香川県 | 観音寺市営伊吹航路 | 伊吹 - 観音寺 |
| 四国 | 香川県 | 雌雄島海運 | 男木 - 高松 |
| 四国 | 香川県 | 三洋汽船 | 多度津 - 佐柳 |
| 四国 | 香川県 | 粟島汽船 | 須田 - 粟島 - 宮の下 |
| 四国 | 香川県 | 小豆島フェリー | 宇野 - 土庄 |
| 四国 | 香川県 | 備讃フェリー | 丸亀 - 広島 |
| 四国 | 愛媛県 | 上島町営フェリー | 魚島 - 弓削 - 土生 |
| 四国 | 愛媛県 | 今治市営渡船 | 岡村 - 今治 |
| 四国 | 愛媛県 | 新喜峰 | 安居島 - 北条 |
| 四国 | 愛媛県 | 青島海運 | 青島 - 長浜 |
| 四国 | 愛媛県 | 田中輸送 | 大島 - 八幡浜 |
| 四国 | 愛媛県 | 盛運汽船 | 日振 - 宇和島 |
| 四国 | 愛媛県 | えひめ南汽船 | 九島 - 宇和島 |
| 四国 | 愛媛県 | 中島汽船 | 三津浜 - 中島 |
| 四国 | 愛媛県 | 津島渡船 | 津島 - 今治 |
| 四国 | 愛媛県 | くるしま | 馬島 - 波止浜 |
| 四国 | 愛媛県 | シーセブン | 尾浦 - 宮窪 |
| 四国 | 徳島県 | 伊島連絡交通事業 | 伊島 - 答島 |
| 四国 | 徳島県 | 出羽島連絡事業 | 牟岐 - 出羽島 |
| 四国 | 高知県 | 須崎市営巡航船 | 坂内 - 埋立 |
| 四国 | 高知県 | 宿毛市営定期船 | 沖の島 - 片島 |
| 九州 | 山口県 | 下関市営渡船 | 竹崎 - 六連島 |
| 九州 | 山口県 | 下関市営渡船 | 蓋井島 - 吉見 |
| 九州 | 福岡県 | 宗像市営渡船 | 地島 - 鐘崎 |
| 九州 | 福岡県 | 宗像市営渡船 | 大島 - 神湊 |
| 九州 | 福岡県 | 志摩町営渡船 | 姫島 - 岐志 |
| 九州 | 福岡県 | 福岡市営渡船 | 玄界島 - 博多 |
| 九州 | 福岡県 | 福岡市営渡船 | 小呂島 - 姪浜 |
| 九州 | 福岡県 | 新宮町営渡船 | 相島 - 新宮 |
| 九州 | 佐賀県 | 郵正丸 | 馬渡島 - 呼子 |
| 九州 | 佐賀県 | 川口汽船 | 小川島 - 呼子 |
| 九州 | 佐賀県 | 加唐島汽船 | 加唐島 - 呼子 |
| 九州 | 長崎県 | 九州郵船 | 博多 - 比田勝 |
| 九州 | 長崎県 | 対馬市営渡海船 | 樽ヶ浜 - 仁位 |
| 九州 | 長崎県 | 壱岐市営渡船 | 大島 - 郷ノ浦 |
| 九州 | 長崎県 | 黒島旅客船 | 黒島 - 高島 - 相浦 |
| 九州 | 長崎県 | 崎戸商船 | 友住 - 佐世保 |
| 九州 | 長崎県 | 九州商船 | 佐世保 - 上五島 |
| 九州 | 長崎県 | 西海沿岸商船 | 佐世保 - 神浦 |
| 九州 | 長崎県 | 長崎汽船 | 長崎 - 伊王島 - 高島 |
| 九州 | 長崎県 | 野母商船 | 福江 - 青方 - 博多 |
| 九州 | 長崎県 | 佐世保市営交通船 | 神浦 - 寺島 - 柳 |
| 九州 | 長崎県 | 五島旅客船 | 郷ノ首 - 福江 |
| 九州 | 長崎県 | 五島市営定期船 | 浦 - 前島 |
| 九州 | 長崎県 | 五島市営定期船 | 富江 - 黒島 |
| 九州 | 長崎県 | 五島市営定期船 | 玉之浦 - 荒川 |
| 九州 | 長崎県 | 木口汽船 | 久賀 - 福江 |
| 九州 | 長崎県 | 黄島海運 | 黄島 - 福江 |
| 九州 | 長崎県 | 桑原海運 | 椛島 - 福江 |
| 九州 | 長崎県 | 竹山運輸 | 度島 - 平戸 |
| 九州 | 長崎県 | 鷹島汽船 | 阿翁 - 御厨 |
| 九州 | 長崎県 | 津吉商船 | 津吉 - 相浦 - 佐世保 |
| 九州 | 長崎県 | 小値賀町営渡船 | 笛吹 - 大島・野崎 |
| 九州 | 長崎県 | 小値賀町営渡船 | 納島 - 柳 |
| 九州 | 長崎県 | 新上五島町営渡船 | 鵜ノ瀬 - 月ノ浦 |
| 九州 | 長崎県 | 新上五島町営渡船 | 大平 - 若松 |
| 九州 | 長崎県 | 嵯峨島旅客船 | 嵯峨島 - 貝津 |
| 九州 | 大分県 | 姫島村営フェリー | 姫島 - 国見 |
| 九州 | 大分県 | やま丸 | 津久見 - 保戸島 |
| 九州 | 大分県 | 佐伯市営定期船 | 大島 - 佐伯 |
| 九州 | 大分県 | 蒲江交通 | 蒲江 - 深島 |
| 九州 | 宮崎県 | 日豊汽船 | 島浦 - 浦城 |
| 九州 | 鹿児島県 | 甑島商船 | 串木野 - 甑島 |
| 九州 | 鹿児島県 | 奄美海運 | 鹿児島 - 喜界 - 知名 |
| 九州 | 鹿児島県 | 十島村営フェリー | 鹿児島 - 十島 - 名瀬 |
| 九州 | 鹿児島県 | 三島村営フェリー | 鹿児島 - 三島 |
| 九州 | 鹿児島県 | 上屋久町営フェリー | 宮之浦 - 口永良部・島間 |
| 九州 | 鹿児島県 | 瀬戸内町営フェリー | 与路 - 古仁屋 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 伊平屋村営フェリー | 伊平屋 - 運天 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 伊是名村営フェリー | 伊是名 - 運天 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 渡嘉敷村営フェリー | 泊 - 渡嘉敷 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 座間味村営フェリー | 泊 - 座間味 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 粟国村営フェリー | 泊 - 粟国 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 波照間海運 | 石垣 - 波照間 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 福山海運 | 与那国 - 石垣 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 久米商船 | 泊 - 渡名喜 - 久米島 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 多良間海運 | 多良間 - 平良 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 大神海運 | 大神 - 島尻 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 水納海運 | 水納 - 渡久地 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 久高海運 | 久高 - 安座真 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 船浮海運 | 船浮 - 白浜 - 網取 |
| 沖縄 | 沖縄県 | 大東海運 | 那覇（泊） - 南大東・北大東 |