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西肥自動車
沿革 > 平成

1997年（平成9年） : 運賃改定。
2001年（平成13年） : 嬉野営業所を廃止し東部営業所に統合。
2002年（平成14年）1月21日 : 日本初の共通ICバスカードである長崎スマートカードを導入。
2005年（平成17年）3月1日 : オール九州高速バス予約システム「楽バス」運用開始。北部九州3日間フリー切符SUNQパスも発売開始。
加入各社が受け持つ路線（はかた号やフェニックス号など）の予約・購入が可能となる。
2007年（平成19年）10月 : 佐世保バスセンター併設の佐世保シティホテルの経営権をリゾートソリューション（現：リソルホールディングス）に譲渡、ホテルトリニティ佐世保として再オープン。
2007年（平成19年）10月1日 : 大野営業所を廃止し北部営業所に移転。同時に、佐々バスセンターを設置。
2008年（平成20年）12月 : 私的整理による経営再建を図ることでメインバンクである親和銀行（ふくおかフィナンシャルグループ傘下、現：十八親和銀行）と合意。
同行から取締役として2名（社長・常務）が派遣。西日本鉄道からも取締役として1名（常務）の派遣と出資を受ける。
2009年（平成21年）7月 : 本社を佐世保市万津町から佐世保駅前バスセンターに隣接するプラザシルバービル（佐世保市白南風町）に移転。
2012年（平成24年）4月 : 佐世保市大野地域において超小型バス「まめバス」の運行を開始。当社の路線バスとしては初となる旅客定員12名の超小型乗合バス（トヨタ・ハイエースコミューターをベースとしており、塗装デザインは貸切バスと同じ）を導入し、道路幅が狭いためにこれまでの路線バスでは運行できなかったエリアに導入される。
2014年（平成26年）4月 : 新上五島町から町営スクールバスとして運行されていた若松島内線と車両の一部を譲受、同社の一般路線として運行を開始する。
2014年（平成26年）10月 : 佐世保市内を運行する便（西海橋、伊万里・嬉野・波佐見、川棚バスセンター、北松地区、平戸・江迎、吉井・佐々、長崎空港線を含む）を対象に、路線バスのLED方向幕に行先表示番号を導入（同時に佐世保市営バスにも行先表示番号を導入しており、一部の行先番号・経由番号は佐世保市営バスと共通の番号である）。
2016年（平成28年）4月1日 : 本土乗合バスの運賃改定（新上五島内線や高速バスは除く）。平均改定率は12.65%、実施運賃改定率は11.73%であり、初乗り運賃が150円から170円になる。。
2019年（平成31年）3月24日 : 佐世保市営バスの廃止に伴い、大半の路線を引き継ぎ、させぼバスの受託も市営バスから引き継ぐ。
沿革 > 令和

2020年（令和2年）
6月28日 : 従来の長崎スマートカード対応端末の更新に伴い、nimocaの取扱を開始。
前述のとおり、長崎スマートカードは前日の6月27日をもって西肥バスでの新規発売（定期券を含む）や積増が終了となり、取扱開始に合わせて「nagasaki nimoca」の発売を開始（種類はnimoca・スターnimoca・小児用nimoca・障がい者用nimocaの4種類）。
交通系ICカード全国相互利用サービスにより、Kitaca・PASMO・Suica・manaca・TOICA・PiTaPa・ICOCA・はやかけん・SUGOCAも利用が可能となる。
当日より、長崎スマートカードの払戻時に発生していた手数料が無料化される（ただし、積増時のプレミアや利用ポイントは払戻の対象外となり、カード残額から11分の10に割り戻した額での払戻となるため、利用終了までに残額全てを使い切ることが推奨されていた）。
9月30日 : この日をもって、佐世保市敬老パス・福祉パスを除く長崎スマートカードの利用を終了。
2021年（令和3年）6月30日 : 併用利用していた長崎スマートカードベースの佐世保市敬老パス・福祉パスの最終有効期限到来に伴い、長崎スマートカードのサービスを全て終了。
2022年（令和4年）
3月24日 : 五島地区を除く各地区において一般路線バスのダイヤ改正を実施。
4月1日 : 新上五島町内の予約型乗合タクシー「smart GOTO」の若松島内への導入に伴い、若松島内線の運行から事実上撤退。
8月2日 : 紙券で発売されている1日乗車券をスマートフォンアプリ「my route」上でデジタルチケットとして販売開始（クレジットカード決済のみ対応）。
11月1日 : 社会実験の一環として、期間限定で相浦駐屯地線の運行を開始。
2023年（令和5年）2月28日 : スマートフォンのアプリやパソコンから運賃・時刻検索に加えて現在位置情報や運行状況の確認が可能なサービス「西肥バスナビ」と拡大表示機能を備えた停留所時刻表に加え、路線バスや高速バス※長崎県営バスはバス追跡不可（西鉄バスさせぼ号のみバス追跡可）の現在位置情報や最新の運行情報の表示が可能なデジタルサイネージ式バス停「スマートバス停」の運用を開始。
本社および営業所

本社
長崎県佐世保市白南風町9番2号（地図を表示）
北部営業所
長崎県北松浦郡佐々町小浦免1572番地28（北緯33度13分0.3秒 東経129度38分34.3秒）　（佐世保駅前バスセンター始発の北部路線、南部路線、長崎空港線、佐世保 - 長崎線、佐世保 - 福岡線を担当）
東部営業所
長崎県佐世保市重尾町3385番1号（北緯33度6分36.9秒 東経129度49分10.2秒）（早岐線、嬉野温泉線、川棚線等の南部路線および北部路線の一部を担当）
平戸営業所
長崎県平戸市大久保町1256番2号（北緯33度23分10.5秒 東経129度33分10.5秒）（佐世保平戸線、平戸松浦線、および平戸島島内線、佐世保駅前バスセンター始発の北部路線を担当）
新上五島営業所
長崎県南松浦郡新上五島町青方郷2277（北緯32度58分55.2秒 東経129度4分0秒）（上五島島内線）
長崎営業所
長崎県長崎市光町2番5号（北緯32度45分19.8秒 東経129度51分53秒）（佐世保 - 長崎線）
伊万里営業所
佐賀県伊万里市二里町八谷搦378番4号（北緯33度16分21.3秒 東経129度52分8.7秒）（伊万里発着路線、松浦発着路線、佐世保駅前バスセンター始発の北部路線を担当。伊万里市と西松浦郡有田町のコミュニティバスも受託運行している）
佐世保駅前営業所
させぼバスを参照
矢峰営業所
させぼバスを参照
黒髪営業所
させぼバスを参照
この他に、北部営業所管轄は柚木・大加勢・佐世保駅前バスセンター（いずれも佐世保市）に、東部営業所管轄は島地（佐世保市）、川棚（東彼杵郡川棚町）、嬉野（嬉野市）に、平戸営業所管轄は草積（平戸市）に、伊万里営業所管轄の松浦・福島（どちらも松浦市）に、新上五島営業所管轄の有川・奈良尾（どちらも南松浦郡新上五島町）に現地出退勤の車庫がある。以前は相浦・江迎・世知原・西海橋（いずれも佐世保市）、内海（波佐見町）、志々伎（しじき。平戸市）にも車庫があった。
かつては、早岐地域・大野（どちらも佐世保市）・平戸口（旧北松浦郡田平町）・宇久（旧北松浦郡宇久町）・大村（大村市）・武雄（武雄市）にも営業所があったが、順次廃止された。このうち早岐営業所（現・宮崎橋バス停）は現在の東部営業所に移転、跡地はイオンタウン早岐になった。大野営業所（現・大野バス停）は現在の北部営業所に移転、跡地は大野モールになった。平戸口営業所は、路線・車両は大野・平戸・伊万里の3営業所にそれぞれ移管され、跡地は平戸市役所田平支所になっている。大村営業所跡地はパチンコ店ダイナム、武雄営業所跡地はマックスバリュを経てザ・ビッグ武雄店になっている。
高速バス

＜ ＞内は共同運行会社。なお、「 」内の愛称は共同運行会社におけるものであり、西肥自動車では昼行便を「ハイウェイエクスプレス号(HIGHWAY Express)」、過去に運行していた夜行便では「コーラルエクスプレス号(CORAL Express)」という愛称で統一している。
高速バス > 現行路線

佐世保 - 福岡線「させぼ号」 佐々・佐世保 - 福岡、ハウステンボス - 福岡 ＜西鉄バス＞
佐世保 - 長崎線 佐々・佐世保 - 長崎 ＜長崎県交通局＞
高速バス > 休・廃止路線

佐世保 - 佐賀 ＜祐徳自動車＞
伊万里 - 武雄 - 佐賀 ＜祐徳自動車＞
伊万里 - 武雄 - 佐賀空港 ※1999年7月廃止
佐世保 - 北九州 ＜西日本鉄道＞ ※2008年5月廃止
ハウステンボス・佐世保 - 名古屋 ＜名古屋鉄道＞ ※2011年10月廃止
ハウステンボス・佐世保 - 神戸・大阪・堺 ＜南海バス＞※2013年9月30日の出発便を以て路線休止。
ハウステンボス・佐世保 - 熊本 ＜九州産交バス＞※2014年9月30日出発便を以って一度路線を廃止し、2019年4月1日より運行再開したが、2020年4月25日から新型コロナウイルスの影響により運休し、2024年3月31日をもって路線廃止した。
一般路線バス

長崎県の東彼杵郡川棚町以北一帯、および佐賀県伊万里市、西松浦郡有田町などを複数の路線で運行し、市中心部と郊外および周辺市町村を結ぶ路線が中心である。
また五島列島のうち上五島と呼ばれるエリア（東側の中通島・若松島）にも路線網を有しており、これらの路線でもnagasaki nimoca、およびSUNQパスが使用できる。
一般路線バス > 運行している市町村

※高速バスのみ運行している市町村は除く。
一般路線バス > 運行している市町村 > 長崎県

佐世保市
北松浦郡佐々町
平戸市
松浦市
東彼杵郡
川棚町
波佐見町
東彼杵町（長崎空港特急バスが彼杵本町に停車するのみ）
大村市（長崎空港特急バスが新大村駅前、試験場前、長崎空港に停車するのみ）
西海市（西海橋西口のみ）
南松浦郡新上五島町
一般路線バス > 運行している市町村 > 佐賀県

伊万里市
西松浦郡有田町
武雄市（三間坂線の赤田 - 三間坂駅前間）
嬉野市
一般路線バス > 主なターミナル > 長崎県

佐世保駅前バスセンター
佐々バスセンター
田平港
平戸桟橋
ハウステンボスバスセンター
川棚バスセンター
青方
有川港ターミナル
一般路線バス > 主なターミナル > 佐賀県

嬉野バスセンター
一般路線バス > 廃止されたターミナル

伊万里バスセンター ※2009年9月廃止
松浦バスセンター ※2012年10月廃止
江迎バスセンター ※2017年8月廃止
一般路線バス > 現行路線

別名は停留所の別名、別名はかつて実際にあった停留所の別名
させぼバスに委託運行している桜木町線、山手地区の循環線（高梨↔花園線、高梨↔俵町線、花園↔俵町線）、祇園循環線、清水循環線以外の清水地区の路線（日野峠(比良町経由)線、総合教育センター線）、赤崎団地・下船越・俵ヶ浦線、木場入口線は佐世保市交通局を参照。
一般路線バス > 現行路線 > 相浦地区

相浦桟橋線
（佐世保駅前以遠） - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - 日野峠 - 鹿子前入口 - 長崎県立大学前 - 木宮町 - 相浦 - 相浦桟橋
（松浦町国際通り以遠） - 佐世保市総合医療センター入口 - SSK西門口 - 鹿子前入口 - 長崎県立大学前 - 大潟町 - 水産市場入口 - 相浦桟橋
（小浦）真申・佐々バスセンター線
佐世保駅前 - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - 日野峠 - 鹿子前入口 - 長崎県立大学前 - 木宮町 - 相浦郵便局前 （ - 第二ニュータウン） - 真申駅前 - 真申
佐世保駅前 - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - 日野峠 - 鹿子前入口 - 長崎県立大学前 - 木宮町 - 相浦郵便局前 （ - 第二ニュータウン） - 真申駅前 - 小浦駅前 - 口石別道 - 佐々バスセンター
佐世保駅前 - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 皆瀬局前 - 本山 - 木宮町 - 棚方 - 第二ニュータウン - 真申駅前（ - 小浦駅前 - 口石別道 - 佐々バスセンター）
真申線は日野経由のみで、真申発の便は平日の朝に運行。2023年4月1日のダイヤ改正により、大野経由は平日のみ、2本が真申駅前までの区間便となった。
相浦循環線
佐世保駅前 - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - 日野峠 - 鹿子前入口 - 長崎県立大学前 - 木宮町 - 本山 - 皆瀬局前 - 大野 - 俵町 - 松浦町中央公園口 - 佐世保駅前
（左石以遠） - 俵町 - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - （日野峠 又は SSK西門口） - 鹿子前入口 - 長崎県立大学前 - 木宮町 - （中里以遠）
矢峰 - 労災病院入口 - 大野 - 皆瀬局前 - 本山 - 木宮町 - 長崎県立大学前 - （鹿子前入口以遠）
佐世保商業高校 → バイパス本山 → 木宮町 → 長崎県立大学前 → 鹿子前入口 → 日野峠 → （松浦町国際通り以遠）
相浦地区を循環する路線。日野峠又はSSK西門口から周る便と大野から周る便が設けられている。
大崎町線
佐世保駅前 - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - 日野峠 - 長崎県立大学前 - 朝日ヶ丘 - 美崎が丘 - 大崎町
佐世保駅前 - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 皆瀬局前 - 本山 - 木宮町 - 長崎県立大学前 - 朝日ヶ丘 - 美崎が丘 - 大崎町
佐世保実業高校線
（佐世保駅前以遠） - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - （日野峠 又は SSK西門口） - 鹿子前入口 - 椎木町 - 佐世保実業高校
矢峰 → 労災病院入口 → 大野 → 皆瀬局前 → 本山 → 木宮町 → 長崎県立大学前 → 椎木町 → 佐世保実業高校
佐世保実業高校 → 椎木町 → 長崎県立大学前 → 木宮町 → 本山 → 皆瀬局前 → 大野 → 俵町 → 松浦町中央公園口 → 佐世保駅前
佐世保実業高校 → 星和台入口 → 美鳥ヶ丘 → 鹿子前入口 → SSK西門口 → 佐世保市総合医療センター入口 → 松浦町国際通り → 佐世保駅前
美鳥ヶ丘・母ヶ浦循環線
（佐世保駅前以遠） - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - 日野峠 - 鹿子前入口 - 長崎県立大学前 - 木宮町 - 小野春陽台前 - 母ヶ浦町 - 星和台入口 - 美鳥ヶ丘 - 鹿子前入口 - SSK西門口 - 佐世保市総合医療センター入口 - 松浦町国際通り - （佐世保駅前以遠）
（佐世保駅前以遠） - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - 日野峠 - 鹿子前入口 - （佐世保実業高校 又は 長崎短大・九文高校） - 母ヶ浦町 - 小野春陽台前 - 木宮町 - 長崎県立大学前 - 鹿子前入口 - SSK西門口 - 佐世保市総合医療センター入口 - 松浦町国際通り - （佐世保駅前以遠）
2022年3月24日のダイヤ改正に伴い循環路線として新設。行きと帰りで経由地が異なり、行きが日野峠経由の場合は帰りがSSKバイパス経由、行きがSSKバイパス経由の場合は帰りが日野峠経由となり、ルートを問わず鹿子前入口で周回が完結する。大半は佐世保駅前を発着するが、一部、黒髪発又は黒髪着（黒髪着は平日のみ）となる便がある。
日野峠・母ヶ浦経由便とSSK・木宮経由便には朝夕の時間帯を中心に途中で佐世保実業高校又は長崎短大・九文高校に立ち寄る通学便が設けられているが、長崎短大・九文高校経由便は平日のみの運行となる。
本路線はさせぼバスへの委託運行となる。
一般路線バス > 現行路線 > 北松地区

（江迎）平戸口・平戸線
佐世保駅前 - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 吉岡団地 - バイパス本山 - 芳の浦 - 佐々バスセンター - 小春 - 吉井 - 潜滝 - 江迎 - 萩田 - 田平港 - 平戸新町 - 平戸桟橋 （※半急行）
佐世保市と平戸市を結び、日中ほぼ60分間隔で運転される幹線。佐世保駅前 - 吉井間を急行、吉井 - 平戸桟橋間を普通で運行する半急行のみ。半急行は、佐世保市内では国道204号のバイパスを通るため普通便や下記の北松線などとは一部経路が異なる。
ほぼ国道35号・国道204号に沿う。
2019年3月のダイヤ改正までは日中ほぼ30分間隔で運転されていて、かつては特急バスや普通便、長崎（長崎駅前）からの直通便もあったが、普通便に関しては佐々バスセンター発平戸桟橋行の始発のみとなっている。
貸切から路線改造されたトップドア車両も数多く存在していたが、混雑時には不向きであり2016年11月限りで全廃され、全て路線車に統一された。
2023年4月1日のダイヤ改正に伴い、「平戸口桟橋」は「田平港」へ停留所名が変更となった。
福井・松浦線
佐世保駅前 - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 吉岡団地 - バイパス本山 - 芳の浦 - 佐々バスセンター - 吉井 - 下直谷 - 福井 - 栢の木 - 庄屋 - 松浦駅前
佐世保市と松浦市を結ぶ路線で日中ほぼ60分間隔で運転される。始発は吉井 - 松浦駅前間の区間便が平日・土日祝問わず1往復運行されているほか、土日祝には佐々バスセンター発松浦駅前行も朝に1本運行されている。
2000年までは松浦・御厨からさらに平戸口桟橋（現・田平港）まで運転される便もあり、1995年までは急行の設定もあった。2016年3月までは平日4便のみ御厨駅前発着便が運行されていたが、同年4月の改正で全便が松浦駅前発着に変更された。
2022年3月24日のダイヤ改正により、佐世保駅前発着便は速達性向上を目的に全便皆瀬局前経由からバイパス本山経由（各停）へ変更され、佐々バスセンター発の草の尾入口経由便を廃止し、草の尾入口バス停も廃止された。
（肥首）農高前線
（平戸営業所 - ）平戸桟橋 - 平戸新橋 - 猶興館高校入口（ - 田平港）- 北小学校入口 - 農業高校前（ - 天主堂前 - 肥首 - 万場 - 末橘 - 江迎）
佐々バスセンター - 口石別道 - 見返橋 - 楠泊 - 大加瀬 - 江迎 - 末橘 - 万場 - 肥首 （ こえくび ） - 天主堂前 - 農業高校前 - 坊田 - 北小学校入口 - 田平港
平戸桟橋 - 農業高校前間のうち、田平港を経由する便は1日1往復のみで、平日のみの運行。また、平日は始発便以外は学休日運休となるが、北松農業高校の学校行事によりダイヤが変更される。
佐々バスセンター発田平港行は2022年3月のダイヤ改正によって新設された路線。平日・土日祝を問わず1日1本朝に運行されており、北松農業高校前を経由するため、通学便を兼ねる。
学休日を除く平日には平戸営業所 - 江迎間も1日1往復運行されているが、田平港を経由するのは平戸営業所発江迎行のみとなる。
（芳の浦）佐々バスセンター・北部営業所線
佐世保駅前 - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 皆瀬局前 - 本山 - 芳の浦 - 佐々バスセンター（ - 北部営業所）
（楠泊）大加勢・江迎線
（小春 - 佐々役場 - ）佐々バスセンター - 口石別道 - 小佐々支所 - 楠泊 （ くすどまる ） - 神崎入口 - 褥崎入口 - 大加勢 - 鹿町郵便局前 - 橋の元 - 鹿町工高前 - 江迎
2012年10月1日のダイヤ改正で佐世保駅前ではなく佐々バスセンターを始発・終点とする便が多くなり、2022年3月24日のダイヤ改正で佐世保駅前までの直通系統が廃止され、佐々バスセンター - 江迎間が主体となった。大加勢を発着地として佐々バスセンターや江迎を結ぶ区間便も設けられており、平日には江迎発小春行が朝に2本運行されている。
4月 - 5月の長串山公園つつじまつり期間には公園への登り口に臨時停留所が設置される。
一般路線バス > 現行路線 > 平戸地区

平戸高校前線
平戸口駅 - 田平港 - 猶興館高校入口 - 平戸新町 - 平戸桟橋 - 平戸新町 - 千里ヶ浜 - 川内 - 紐差 - 平戸市民病院 - 平戸高校前
平戸島内を縦断する路線である。平日昼間には平戸口駅 - 平戸桟橋間の区間便も1日1往復運行されている。
2020年9月30日までは平戸営業所 - 紐差 - 志々伎 - 宮の浦間を運行する路線だったが、同年10月1日のダイヤ改正に伴って起終点が平戸口駅に変更された一方、これまで志々伎始発・終着だった便のほとんどが平戸高校前始発・終着に短縮され、宮の浦を始終着とする便は宮の浦発が早朝、宮の浦着が最終便の各1便ずつとなり、全体の運行本数も2便減便された。さらに、2021年9月30日をもって平戸高校前 - 宮の浦間が廃止され、路線名が「平戸高校前線」となった。
なお、路線が短縮された平戸高校前－宮の浦間には代替路線として平戸ふれあいバスの紐差・宮の浦線が運行され、紐差で接続するダイヤが組まれるようになっている。
田助・薄香・田の浦線
（平戸営業所 - 供養川 - 平戸中学校下 - 平戸新町 - 平戸桟橋 - 供養川 - ）平戸営業所 - 田助 - 曲り公会堂前 - 平戸営業所 - 供養川 - 平戸桟橋 - 平戸新町 - 薄香桟橋 - 平戸新町 - 平戸桟橋 - 供養川 - 平戸営業所（ - 田助 - 光の園保育園前 - 田の浦）
平戸営業所を起終点に田助や薄香方面を周る循環路線。
系統は多岐にわたり、平戸桟橋 - 平戸営業所を直通する便、平戸営業所 - 田の浦の区間便、平戸桟橋（又は平戸新町）を出発して田助を経由して平戸桟橋に到着する便、平戸桟橋・平戸中学校下を経由する便も運行されている。朝の田の浦行は田助と薄香桟橋を交互に2回経由する複乗循環となる。
薄香系統はかつて1991年までは、薄香桟橋から生月島へのフェリーに接続する連絡路線として運転され、早朝に薄香桟橋から佐世保駅前や平戸口駅まで直通する便もあった。
一般路線バス > 現行路線 > 世知原・小川内地区

知見寺線
佐世保駅前 - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 四条橋 - 大野公民館前 - 天の久保 - 知見寺耳切 - 上野原 - 槍巻 - 世知原（ - 踊瀬 - 吉井）
2022年3月24日のダイヤ改正で槍巻 - 佐々線が廃止（後述）されたことに伴い、知見寺線は全便吉井発着となったが、2023年4月1日のダイヤ改正で世知原発着便が1日2往復設けられた。
妙観寺線
佐世保駅前 - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 皆瀬局前 - 下小川内 - 乙石尾 - 桶口 - 吉井
佐世保駅前 - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 西高校前 - 坂の上分道 - 十文野 （ ともんの ） - 小川内公民館前 - 乙石尾 - 桶口 - 吉井
2022年3月24日のダイヤ改正で旧道の妙観寺峠経由から新道の妙観寺トンネル経由へ変更（妙観寺峠 - 樽川内間のバス停4か所を廃止）されたほか、後述する十文野（小川内）線の廃止に伴う代替路線として、平日のみ、全5往復のうち、佐世保駅前発2本（朝・夕各1本ずつ）、吉井発3本が十文野経由となる。
菰田・世知原・松浦線
佐世保駅前 - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 皆瀬局前 - 下小川内 - 牧の地 - 小川内公民館前 - 菰田（ - 世知原）
世知原 - 長坂 - 高野 - 松浦駅前
かつて2001年までは佐世保 - 松浦間の直通運転もあったが、現在は世知原で運転系統が分かれている。また、菰田を発着する便は平日に1日1往復の運行となる。
2022年3月24日のダイヤ改正で妙観寺線の牧の地経由便が廃止されたのに伴い、下小川内 - 二反田橋間は、途中で牧の地に立ち寄るルート（複乗）へ変更された。
一般路線バス > 現行路線 > 柚木・大野地区

佐世保市内中心部では、佐世保駅前 - 松浦町間の市街地を中心にして南北に路線が延びており、市街地を通って各地を結ぶバスが多数運転されている。このうち、早岐方面（早岐地区、ハウステンボス・西海橋方面）への路線は柚木・大野地区、佐々バスセンター、佐世保市総合医療センター入口が発着点となっている。
柚木線
（佐世保駅前以遠） - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 四条橋 - ふたつ岩 - 池野 - 十郎井手 - 柚木中央区 - 柚木
（佐世保駅前以遠） - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 上の角 - 工業高校前 - 労災病院入口 - 淀姫神社前 - 矢峰 - 藤山神社入口 - 柚木
各路線と直通運転される市内路線。国道204号から分岐し、大野を通って左石駅前に入る池野経由と上の角から入る矢峰経由の2つのルートがあり、矢峰経由が国道498号に沿う。矢峰経由便は旧佐世保市交通局でも運行され、2000年代に一旦廃止されていたが、2022年3月24日のダイヤ改正に伴い、一部の便をさせぼバスへ委託運行する形で復活した。
柚木発の便は佐世保駅前行・重尾行が池野経由・矢峰経由それぞれに設定されており、重尾行には複数の経由ルートを設けている。また朝の通学便として、矢峰経由には佐世保東翔高校行、池野経由には長崎国際大学行や同大学を経由するハウステンボス西門行も運行されている。
佐世保商業高校線
（戸尾町以遠） - 松浦町中央公園口 - 俵町 - 大野 - 吉岡団地 - 佐世保商業高校
佐々バスセンター - 芳の浦  - バイパス本山 - 佐世保商業高校
佐々バスセンター - 第二ニュータウン - バイパス本山 - 佐世保商業高校
佐世保商業高校の通学路線であるが、吉岡団地等の住宅地を通るため、朝夕の通学時間帯だけでなく日中や休日にも一定の運行本数が確保されている。
平日には北松地区の佐々バスセンターを発着する便や、7時台に1本のみ鯨瀬ターミナルを出発する便が設けられている。
一般路線バス > 現行路線 > 山手・山祇地区

烏帽子岳線
佐世保駅前 - 松浦町 - 花園町 - 山手町 - 烏帽子岳
山手循環を抜けて烏帽子岳山頂目前の展望所まで向かう山岳路線。佐世保駅前発着で朝・夕の1日2往復を平日のみ運行。
戸尾・山祇循環線
（松浦町以遠） → 京町 → 戸尾中央通 → 山祗町 → 勝富町 → 島瀬町 → （松浦町中央公園口以遠）
（松浦町以遠） → 京町 → 戸尾中央通 → 山祗町 → 勝富町 → 京町 → 佐世保駅前（ → 大宮町 → 大和町西龍橋 → 日宇駅前 → 桜馬場 → 黒髪）
一般路線バス > 現行路線 > 木風地区

木風線
（佐世保駅前以遠） - 大宮町 - 藤原橋 - 木風橋 - 木風町
一般路線バス > 現行路線 > 清水地区

清水循環線
（佐世保駅前以遠） → 谷郷町 → 比良町 → 宮田町 → 谷郷町 → （佐世保駅前以遠）
一般路線バス > 現行路線 > 赤崎地区

九十九島水族館線
（佐世保駅前以遠） - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - 日野峠 - 鹿子前入口 - パールシーリゾート九十九島水族館
（佐世保駅前以遠） - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - SSK西門口 - パールシーリゾート九十九島水族館
パールシーリゾート九十九島水族館 → 鹿子前入口 → 長崎県立大学前 → 木宮町 → バイパス本山 → 佐世保商業高校
九十九島遊覧船が発着する九十九島パールシーリゾートへの連絡路線。佐世保駅前を発着するSSK経由便には快速便が毎日5往復運行されている。また、平日朝には相浦地区を周ってバイパス本山を経由する佐世保商業高校行も1本設けられている。
九十九島観光公園線
（佐世保駅前以遠） - 松浦町国際通り - 佐世保市総合医療センター入口 - 西小島町 - 天石 - 鴛の浦分道 - 九十九島動植物園前 - 船越 - 下船越 - 展海峰 （ てんかいほう ） - 九十九島観光公園
2022年3月24日のダイヤ改正に伴い、従来の展海峰線を動植物園経由に一本化したうえで、九十九島観光公園まで延伸した路線
2023年4月1日のダイヤ改正に合わせて停留所名が変わり、「動植物園前」は「九十九島動植物園前」に変更した。
一般路線バス > 現行路線 > 若葉

若葉循環線
（佐世保駅前以遠） → 福石観音前 → 観音裏 → 須田尾町入口 → 下須田尾 → 若葉中央 → 観音裏 → 福石観音前 → （佐世保駅前以遠）
1時間に1本程度運行。幹線の福石観音前から1区間先の観音裏以北で反時計回りの循環運転をする。
一般路線バス > 現行路線 > 天神地区

十郎原・東浜線
（佐世保駅前以遠） - 大宮町 - 東天神 - 天神町 - 西天神 - 十郎原 又は （ - 十郎原） - 東浜入口 - 東浜町
（佐世保駅前以遠） - 大宮町 - 中央病院入口 - 工業団地前 - 東大和 - 天神二丁目 - 西天神 - 十郎原 又は （ - 十郎原） - 東浜入口 - 東浜町
東浜町 → 東浜入口 → 十郎原 → 西天神 → 天神二丁目 → 天神二丁目入口 → 大宮町 → 佐世保駅前 → 松浦町中央公園口 → 俵町 → 上の角 → 工業高校前 → 労災病院入口 → 淀姫神社前 → 矢峰
東浜町 → 東浜入口 → 十郎原 → 西天神 → 天神町 → 天神二丁目入口 → 東大和 → 工業団地前 → 日宇駅前 → 桜馬場 → 黒髪
十郎原までの区間便があるほか、天神町経由東浜町行には十郎原を経由する便もある。また、十郎原団地内は自由乗降区間である。
2024年4月1日のダイヤ改正に伴い、天神二丁目経由の便は大宮町 - 天神二丁目間を西大和 - 東大和間で迂回するルートに変更され、天神二丁目入口を経由する便は朝の矢峰行と黒髪行（いずれも東浜町発）の2本のみとなり、黒髪行は平日のみの運行となった。
沖新町・東浜線
（佐世保駅前以遠） - 大宮町 - 中央病院入口 - 工業団地前 - 高専グラウンド前 - 沖新町（ - 辻の下 - 中波止 - 東浜入口 - 東浜町）
沖新町を発着する区間便もある。
天神循環線
（佐世保駅前以遠） - 大宮町 - 東天神 - 天神町 - 西天神公民館前 - 自衛隊官舎前 - 中大黒 - （佐世保駅前以遠）
福石観音前で周回が完結する大回り便が双方向あり、時計回りは「大宮経由」、反時計回りは「大黒経由」と呼ばれる。
教育隊線
（福石中学校以遠） - 中大黒 - 自衛隊官舎前 - 轟 - 教育隊前
（佐世保駅前以遠） - 大宮町 - 上東山 又は 天神町 - 轟 - 教育隊前
崎辺町にある佐世保教育隊（佐世保地方隊）を発着する路線。教育隊前発矢峰行のうち、大黒経由便の朝の1本は佐世保駅みなと口経由となる。また、天神町を経由する便は平日夕方の教育隊前行1本のみとなる。
一般路線バス > 現行路線 > 早岐地区

もみじが丘団地線
（佐世保駅前以遠） - 大宮町 - 大和町西龍橋 - 日宇駅前 - 桜馬場 - 南高校前 - 黒髪 - 椿ヶ丘 - もみじが丘 - 大塔小学校前（ - 食品団地会館前）
（白岳町入口以遠） - 日宇駅前 - 桜馬場 - 南高校前 - 黒髪 - 椿ヶ丘 - もみじが丘 - 大塔小学校前 - 卸本町入口 - 大塔新田 - 早岐田子の浦 - 早岐支所シルバーボウル前 - 早岐駅前 - 宮崎橋 - （金田橋 又は 広田三丁目） - 重尾（ - 佐世保東翔高校）
桜馬場 - 食品団地入口間を南高校前 - 大塔小学校前で迂回する路線。大宮市場下 - 大和町西龍橋間を通る大宮町経由が基本だが、重尾や佐世保東翔高校発着便には稲荷町 - 大和町間を通る藤原橋経由もある（佐世保東翔高校発着便は朝の到着便1本を除き、学休日を除く平日のみの運行）。
大塔小学校前と食品団地会館前を発着する便はさせぼバスによる委託運行である。
下の原線
（卸本町入口以遠） - 卸本町 - 陽光台入口 - 大塔インター口 - 大塔新田 - 早岐田子の浦 - 早岐支所シルバーボウル前 - 早岐駅前 - 小森橋 - 中原町入口 - 下原橋 （ しものはるばし ）
三川内地区直前の下原橋までを結ぶ路線。陽光台入口を経由する唯一の路線でもある。もみじが丘を経由する黒髪発着便のほか、日宇バイパスを経由する西高校入口（大野車庫）発着便は1日1往復（西高校入口（大野車庫）発は夕方、下原橋発は朝）の運行となる。
2022年3月24日の改正までは全便させぼバスによる委託運行であったが、西高校入口（大野車庫）発着便については西肥バスによる運行となった。
広田工業団地線
（佐世保駅前以遠） - 藤原橋 - 大和町 - 日宇駅前 - バイパス中央 - 卸本町入口 - 大塔新田 - 早岐田子の浦 - 早岐支所シルバーボウル前 - 早岐駅前 - 広田工業団地 - 石浜 - 広田三丁目 - 重尾（ - 佐世保東翔高校）
日宇駅前 - 卸本町入口間を日宇バイパス（バイパス中央）で経由し、住吉橋から広田工業団地を通り、石浜で折り返して広田駐在所前へ進む路線。朝には佐世保東翔高校までの通学便もある。
エコスパ佐世保・クレールの丘線
（佐世保駅前以遠） - 藤原橋 - 大和町 - 日宇駅前 - 桜馬場 - 卸本町入口 - 大塔インター口 （ - エコスパ佐世保） - クレールの丘中央 - 有福 - 観潮橋 - 早岐支所シルバーボウル前 - 早岐駅前 - 宮崎橋 - 広田三丁目 - 重尾
大塔町から大塔インター口に進み、クレールの丘団地内を横断、有福から観潮橋を周って早岐中町以降は重尾発着のルートに合流する路線。大半の便はエコスパ佐世保を経由する。
佐世保－花高団地線
（佐世保駅前以遠） - 藤原橋 - 大和町 - 日宇駅前 - 桜馬場 - 卸本町入口 - 大塔新田 （ - 若竹台県営アパート） - 花高一丁目 - 花高四丁目 - 早岐駅東口前 - イオンタウン早岐 - 広田三丁目 - 重尾（ - 佐世保東翔高校）
大塔新田から花高団地内を周る路線。早岐警察署前と陣の内の間に若竹台団地内を周る若竹台経由便があるほか、広田工業団地線同様、朝には佐世保東翔高校までの通学便もある。
以前は早岐支所シルバーボウル前を発着地とする便が存在したが、2022年3月24日のダイヤ改正により、発着地が重尾に一本化され、全便広田三丁目を経由するようになった。
花高－大塔循環線
重尾 - 広田三丁目 - イオンタウン早岐 - 早岐駅東口前 - 花高四丁目 - 花高一丁目 - 大塔新田 - 大塔インター口 - 大塔新田 - 早岐田子の浦 - 早岐支所シルバーボウル前 - 早岐駅前 - 宮崎橋 - 広田三丁目 - 重尾
2022年3月24日のダイヤ改正により新設された路線で、重尾を出発して大塔インター口で折り返して重尾に戻る路線。花高団地から回るルートと早岐支所シルバーボウル前から回るルートがある。
一般路線バス > 現行路線 > 大岳台

大岳台循環線
（佐世保駅前以遠） - 大宮町 - 中央病院入口 - 土場 - 造船所前 - 尼潟 - 大岳台中央 - 大岳台東口 - 卸団地南口 - 卸本町 -卸本町入口 - 桜馬場 - 日宇駅前 - 大和町西龍橋 （ やまとちょうせいりゅうばし ） - 大宮町 - （佐世保駅前以遠）
行きと帰りで経由地が異なり、行きが尼潟経由の場合は帰りが桜馬場経由に、行きが桜馬場経由の場合は帰りが尼潟経由となり、どちらのルートでも西大和で周回が完結する。
下の原線同様、2022年3月24日の改正までは全便させぼバスによる委託運行であったが、大半の便が西肥バス運行便となった。
一般路線バス > 現行路線 > ハウステンボス・川棚・宮津町・西海橋方面

長崎国際大学・ハウステンボス線
（佐世保駅前以遠） - 藤原橋 - 大和町 - 日宇駅前 - バイパス中央 - 卸本町入口 - 大塔新田 - 早岐田子の浦 - 早岐支所シルバーボウル前 - 早岐駅前 - 宮崎橋（ - 長崎国際大学） - ハウステンボス（ - ウインズ佐世保） - ハウステンボス西門
重尾 → 広田三丁目 → イオンタウン早岐 → 早岐駅東口前 → 花高四丁目 → 花高一丁目 → 早岐支所シルバーボウル前 → 早岐駅前 → 宮崎橋 → 長崎国際大学 → ハウステンボス → ハウステンボス西門
朝には花高団地や長崎国際大学を経由する重尾発の便や前述した柚木発長崎国際大学行の通学ダイヤが1本ずつ設けられている。土日祝のハウステンボス西門行（佐世保駅前以遠発の便のみ）は中央競馬開催時のみ、夕方以降の2本を除きウインズ佐世保を経由する。長崎国際大学行は2019年3月23日以前は大宮町を経由していたが、以降は藤原橋経由に変更されている。
ハウステンボス開業以来、ハウステンボス西門までの運転だったが、2010年に園内一部無料化にともない同年7月17日から園内のハウステンボス港町まで路線延長された。しかし、場内でイベント開催時はハウステンボス西門までの運行となる。
2012年10月1日のダイヤ改正より、一部の便の発着を針尾米軍住宅まで変更して運行開始した。
2015年5月1日より、園内の全面再有料化に伴いハウステンボス港町までの便はハウステンボス西門まで路線短縮された。また、4月30日をもって、ハウステンボス港町・ホテルヨーロッパ前の両停留所は廃止となった。
2019年3月24日まではクレールの丘 - 指方経由の便が運行されていたが、終着地変更に伴い運行がなくなった。また、針尾米軍住宅までの路線もハウステンボス西門までに短縮された。
2022年3月24日のダイヤ改正により、全便バイパス中央（日宇バイパス）経由となった。
佐世保－川棚線
（早岐中町以遠） - 早岐支所シルバーボウル前 - 早岐駅前 - 宮崎橋（ - 長崎国際大学） - 日陰 - 長畑町 - 白石 - 川棚バスセンター
かつては大村市内（大村営業所）まで運行されていたが、2002年に川棚までに路線短縮された。
藤原橋・早岐田子の浦を経由する佐世保駅前以遠便と、2022年3月24日のダイヤ改正により新設された花高団地・早岐支所シルバーボウル前を経由する重尾発着便がある。重尾発着便は佐世保－花高団地線の早岐支所シルバーボウル前発着便廃止による代替路線も担う。
佐世保駅前以遠便については、川棚バスセンター発の始発便が佐世保市総合医療センター入口行となる以外は佐世保駅前を発着する。川棚バスセンター発重尾行は土日祝のみ、夕方の2本が長崎国際大学経由となる。
佐世保－西海橋線
（観潮橋以遠） - 有福 - 指方 - 浦頭 （ - 口木 - 針尾小学校前） - 葉山 - 西海橋東口 - TAOYA西海橋 又は 西海橋西口
指方 → 有福 → 観潮橋 → 早岐支所シルバーボウル前 → 早岐駅前 → （宮崎橋以遠）
西海橋西口発の重尾行には、口木経由便がある。
平日の朝には、指方から佐世保東翔高校や長崎国際大学へ行く通学ダイヤが運行されている（学休日運休）。
西海橋西口 - 佐世保東翔高校間の通学ダイヤは行きと帰りで経由地が異なり、朝の佐世保東翔高校行は金田橋経由、夕方の西海橋西口行は広田三丁目経由となる。
TAOYA西海橋/西海橋西口発の便は佐世保市総合医療センター入口行が大半で、西海橋西口発の始発便は佐世保商業高校行となるが、2023年4月1日のダイヤ改正に伴い、TAOYA西海橋便はTAOYA西海橋発の平日朝の1本のみに縮小された。
2023年8月1日、『西海橋コラソンホテル』から『TAOYA西海橋』に改めた。経営は旧施設と同じ大江戸温泉物語である。
針尾小学校・口木線
（佐世保東翔高校 - ）重尾 - 広田三丁目 - 宮崎橋 - 早岐駅前 - 早岐支所シルバーボウル前 - 観潮橋 - 有福 - 指方 - 浦頭 - 口木 - 針尾小学校前 - 浦頭 - 指方 - 有福 - 観潮橋 - 早岐支所シルバーボウル前 - 早岐駅前 - 宮崎橋 - 広田三丁目 - 重尾
平日のみの運行。口木を経由して重尾 - 浦頭間を往復する循環路線が主体だが、重尾 - 針尾小学校前の区間便が朝に1本運行されている。
宮津町線
（佐世保東翔高校 - ）重尾 - 広田三丁目 - イオンタウン早岐 - 早岐駅東口前 - 花高四丁目 - 花高一丁目 - 早岐支所シルバーボウル前 - 早岐駅前 - 宮崎橋 - 金田橋 - 重尾 - 東部営業所 - 長畑町 - 宮津町
2022年3月24日のダイヤ改正により、佐世保駅前以遠を発着する便が廃止され、後述する東部営業所線の代替路線として、重尾を発着点として早岐・花高団地を周回するルートに変更された。
一般路線バス > 現行路線 > 嬉野・波佐見・伊万里

佐世保－波佐見・嬉野線
（早岐中学校前以遠） - 三川内駅前 - 岩崎 - 波佐見役場前 - 舞相 - 内海 - 永尾山 - 内野住宅前（ - 嬉野） （ - 嬉野医療センター）
（早岐中学校前以遠） - 三川内駅前 - 岩崎 - 下宿 （ しもしゅく ） - 川内 - 波佐見高校
藤原橋や早岐田子の浦を経由する佐世保駅前以遠発着便と早岐支所シルバーボウル前や宮崎橋を経由する重尾発着便がある。なお、嬉野医療センター便は重尾発と佐世保駅前行が各1本ずつ運行、波佐見高校発の便は佐世保駅前行のみとなる。平日の朝には内海発金田橋経由佐世保東翔高校行も1本運行されている。
2014年4月のダイヤ改正で佐世保市内から波佐見高校まで直通する路線が新設された。
2019年6月2日から、嬉野医療センターの移転に伴い、嬉野医療センター前を嬉野老人福祉センター前に改称するとともに、嬉野から先に6つのバス停を新設して嬉野医療センターまでに路線延長された（路線延長により嬉野医療センター行が新設された）。
2022年3月24日のダイヤ改正に伴い、嬉野線に佐世保駅前を発着する便が新設された。
2024年4月1日のダイヤ改正に伴い、嬉野線に内野住宅前（嬉野車庫）を発着する便が新設された。
佐世保－伊万里線
（佐世保駅前以遠） - 藤原橋 - 日宇駅前 - 桜馬場 - 卸本町入口 - 大塔新田 - 早岐田子の浦 - 三川内支所前 - 伊万里口 - 前田（ - 伊万里有田共立病院前） - 作井手 - 川西 - 伊万里駅前
2012年3月1日から、平日の一部の便が伊万里有田共立病院を経由するようになり、伊万里駅前から伊万里有田共立病院までの区間便も運転されていた。また、曲川 - 伊万里有田共立病院前間は有田町コミュニティバス（西肥自動車に運行委託）も運行している。
川棚－石木－内海線
（川棚高校下 - ）川棚バスセンター - 川棚役場前 - 石木 - 梅高野 - 万年橋 - 田の頭 - 下宿 （ しもしゅく ） - 舞相 （ まいそう ） - 内海 （ うちのみ ）
東彼杵郡川棚町と同郡波佐見町を結ぶ路線で、1時間に1 - 2本運行されている。
川棚高校下から発着する便があり、川棚高校下発は平日の夕方のみで学休日は運休。内海発は朝の一部の便が川棚高校下行となる。また、川棚バスセンター - 川棚高校下までの区間便もある。
伊万里－西分－松浦線・松浦－平戸線
伊万里駅前 - 川西 - 里 - 久原 - 干把町（ - 西分） - ぎぎが浜入口 - 今鶴 - 調川 - 松浦駅前
松浦駅前 - 松浦市消防本部前 - 松浦発電所 - 御厨 - 大崎下 - 草切入口 - やよい幼稚園前 - 田平港 - 平戸新町 - 平戸桟橋
かつては伊万里 - 平戸間の直通運転もあったが、現在は松浦駅前で運転系統が分かれ、伊万里－西分－松浦線と松浦－平戸線となっている。1995年までは急行も設定されていて、武雄から平戸まで直通する便もあった。
浦ノ崎駅前 - 今福間で土肥ノ浦を経由する便もあったが2002年に廃止され、現在は松浦観光バスが代替運行している。
伊万里－西分－松浦線のうち、西分を経由する便は平日のみ1日2往復運行されている。この便は2017年のダイヤ改正に伴って経由便として整理されたもので、伊万里駅前から西分に向かった後浦ノ崎駅前まで引き返し、そのまま松浦駅前行になる形に変更された。
平戸口駅から平戸桟橋までの区間便も、本数は少ないが運転されている。
2021年4月1日のダイヤ改正に合わせて区間内の一部の停留所名が変わり、伊万里－西分－松浦線の「伊万里農林高校前」は伊万里農業高校と伊万里商業高校の統合により「伊万里実業高校農林キャンパス前」に、松浦－平戸線の「中央診療所前」は診療所の廃止により「松浦市消防本部前」にそれぞれ名称変更されている。
大川内山線
伊万里駅前 - 東町 - 小式原 - 平尾 - 下吉田 - 正力坊 - 大川内山
伊万里駅前 - 総合庁舎前 - 立花中央 - 伊万里温泉前 - 平尾 - 下吉田 - 正力坊 - 大川内山
伊万里市役所前を経由する系統は、かつての伊万里市役所循環線だったものが2002年に廃止されて本路線に統合されたものである。それ以前に、1999年から2001年までは伊万里 - 三間坂 - 武雄線に大川内山を経由する系統も設定されていた。
三間坂線
伊万里駅前 - 東町 - 小式原 - 大川内小学校前 - 鼓 - 岩谷 - 宮の上原 - 大野 - 白水 - 三間坂駅前
かつては武雄温泉駅前・甘久（武雄営業所）まで運行されていて、武雄市内の御船が丘小学校を経由する系統もあったが、2002年に三間坂駅前までに路線縮小された。さらに1995年までは、平戸桟橋から伊万里を経由して武雄まで直通する急行バスもあった。なお、路線内にある「大野」は佐世保市にも同じ停留所名が存在しているため、時刻表では「大野(伊万里)」と表記し、区別されている。
伊万里－波多津－福島線
（伊万里実業高校農林キャンパス前 ← ）伊万里駅前 - 相生橋 又は 本町 - 生島橋 - 本瀬戸 - 黒川 - 青嶺中学校 - 波多津 - 福島公園入口 - 福島支所前
福島支所前を出発する便のうち、平日朝の1本は伊万里実業高校農林キャンパス前行となる。
1995年までは、大野（佐世保市）・佐世保駅前から伊万里を経由して福島港（現・福島支所前）まで直通する便もあった。
2023年4月1日のダイヤ改正により、社会福祉センター前 - 福島支所前の運行区間が変更となり、新たに福島養源小学校前停留所が設置された。
一般路線バス > 現行路線 > 長崎空港

長崎空港線
〈空港特急〉（佐々IC - 佐々バスセンター - 松浦町国際通り - ）佐世保駅前 - 藤原橋 - 日宇駅前 - バイパス中央 - 早岐田子の浦（ - ハウステンボス）- 川棚バスセンター - 彼杵本町 - 新大村駅前 - 試験場前 - 長崎空港
2011年11月のダイヤ改正で西九州自動車道佐々IC - 佐世保中央IC経由に変更となった。それ以前は、佐世保駅前から佐世保市街へは、京町、島瀬町、佐世保市役所前、俵町に停車し、大野発着だった。
2014年10月のダイヤ改正で長崎空港行1便のみ、佐世保駅前始発となった。
2015年1月6日のダイヤ改正で、高速道路経由の実証実験開始に伴い、7便が西九州自動車道佐世保みなとIC - 長崎自動車道大村IC経由のノンストップ便となった。ノンストップ便は、佐々インター→長崎空港(1便)、ハウステンボス⇔長崎空港（2.5往復）、長崎空港→佐世保駅前（1便）の運行であった。
2015年2月1日のダイヤ改正で、高速道路経由の長崎空港行1本が試験場前を経由するようになった。
2015年3月29日のダイヤ改正で、高速道路経由の実証実験終了に伴い、全便空港特急に変更となった。
2015年12月1日のダイヤ改正で、長崎空港行2便が佐世保駅前始発に、佐々バスセンター行2便が松浦町国際通りまでに短縮になった。
2018年3月25日のダイヤ改正で、佐々発着の便が大幅に佐世保市内発着に短縮され、ハウステンボス - 長崎空港間の区間便が新設された。
2023年10月29日のダイヤ改正で、彼杵本町と試験場前の間に新大村駅前が新設され、同時に、所要時間維持を図るため、彼杵本町 - 新大村駅前間が長崎自動車道（東そのぎIC - 大村IC）経由に変更された。
2023年10月のダイヤ改正時点では発着地は佐々（長崎空港着はインター発、長崎空港発はバスセンター着）又は佐世保駅前となる。また、長崎空港行の始発便を除く全便がハウステンボスを経由するため、ハウステンボス区間便は運行されていない。
一般路線バス > 現行路線 > 上五島地区

2014年10月1日のダイヤ改正で全域にわたって土休日運行の減回が行われている。また2021年10月以降、予約制乗合タクシー「Smart GOTO」の導入に伴い運行休止となった路線もある（後述）。
なお、カッコ内はこの停留所を経由しない便があること、太字はこの停留所を終着とする便があることを意味する。また、一部の路線・便では、3月から10月までの夏ダイヤと11月から2月までの冬ダイヤがあり、最終便の運行時間が変わる。
青方循環線
青方 - 上五島高校前 - 榎津 - 青砂浦別道 - 奈摩 （ - 矢堅目 ） - 青方
榎津を先回りする榎津経由と奈摩を先回りする奈摩経由がある。
矢堅目を経由する便は奈摩経由便のうちの2本である。
青方－有川線
（青方港相河ターミナル - ）青方 - 上五島高校前 - （箒山） - 有川 - 有川港ターミナル
上五島地区の幹線路線である。時間帯により、箒山を通らず七目トンネルを経由する便もある。
有川港ターミナル行の始発便は青方港相河ターミナル発となり、野母商船が運航するフェリー太古の下り便に接続するダイヤで運行される。このため、フェリー太古の休航日は青方港相河ターミナル - 青方間が運休となる。
青方－船崎線
（上五島高校前 ←）青方 - 大曽 - 船崎
平日のみ、船崎からの始発便は上五島高校行きとなる。
青方－立串線
青方 - 上五島高校前 - 榎津 - 青砂浦別道 - 青砂ヶ浦天主堂前 - 小串入口（ - 小串） - 立串
青方 ← 上五島中学校前 ← 奈摩 ← 青砂浦別道 ← 青砂ヶ浦天主堂前 ← 小串入口 ← 小串 ← 立串
上りのみ1日2本、奈摩経由の便が設定されている。
青方－江の浜・頭ヶ島教会線
（青方 - ）有川港ターミナル - 有川 - 赤尾 - 友住 - （江の浜 ） - 頭ヶ島天主堂
頭ヶ島天主堂を発着する便は平日1日3往復・土休日1日2往復の運行となっている。
有川港ターミナルから青方へ足を延ばす便、また青方から江の浜へ向かう便も運行されている。
有川－阿瀬津－鯛の浦線
有川港ターミナル - 有川 - 箒山 （ - 阿瀬津） - 鯛の浦
青方 - 上五島高校前 - 箒山 （ - 阿瀬津） - 鯛の浦 - 干切
有川－太田線
有川港ターミナル - 有川 - 太田
有川－高井旅－奈良尾線
（有川港ターミナル - ）青方 - 相河 （ あいこ ） 桟橋 - 今里 （ - 今里峠） - 浜の浦入口 - 郷の首 - 白魚 （ しろお ） 入口 - 高井旅 （ - 奈良尾幼稚園）（ - 奈良尾医療センター）（ - 奈良尾港ターミナル） - 奈良尾支所前 - 奈良尾車庫前
国道384号の道路改良により一部区間の経路変更や短絡化が行われているが、旧道の今里峠を経由する便もある。
旧奈良尾町内では経由地が複数存在するため、奈良尾幼稚園入口・奈良尾医療センター・奈良尾港ターミナルを経由しない便、また通過バス停の順番が前後する便もある。
2022年3月31日までは平日のみ1日1往復、上五島病院前 - 青方 - 白魚入口 - 若松港ターミナル間を結ぶ便も運行されていたが、2022年4月1日より予約制乗合タクシー「Smart GOTO」の導入に伴い運行休止となった。
奈良尾－浜串線
奈良尾車庫前 （ - 奈良尾港ターミナル）（ - 奈良尾医療センター） - 小奈良尾脇 （- 中五島高校） - 高井旅 - 奈良尾中学校前 - 福見 （ - 福見教会下） - 中山体育館 （ - 岩瀬浦 - 中山体育館） - 浜串入口 - 浜串
岩瀬浦経由便は中山体育館から岩瀬浦内や天満神社前を回って再び中山体育館に戻る循環ルートとなる。
奈良尾車庫前行の昼の1便は高井旅の1つ前の奈良尾中学校発となる（学休日運休）。
有川－（青方）干切・浜串線
有川港ターミナル - 有川 - 中野 - 鯛の浦 - 上の佐野原 - 神之浦 - 船隠入口 - 船隠教会（ - 船隠）- 干切
有川港ターミナル - 有川 - 中野 - 鯛の浦 - 神之浦 - 船隠入口 - 浜串入口
有川港ターミナル → 有川 → 青方 → 三日浦 → 上の佐野原 → 神之浦 → 船隠入口 → 浜串入口 → 浜串
有川港ターミナル ← 有川 ← 中野 ← 鯛の浦 ← 神之浦 ← 船隠入口 ← 干切 （ ひぎれ ） ← 船隠入口 ← 浜串入口 ← 浜串
浜串発着便は1日1往復の運行。行き帰りで経由地が異なり、浜串行は青方・上の佐野原経由、有川港ターミナル行は干切・鯛の浦経由となる。また三日浦 - 上の佐野原 - 神之浦間の道路が非常に狭隘なため、小型バスで運行されている。
学休日を除く平日には、鯛の浦発干切行の区間便（学休日の平日は出発地が有川港ターミナルとなる）や干切発中野行がそれぞれ1本ずつ運行されている。
奈良尾－中五島高校線
奈良尾車庫前 - 高井旅 - 中五島高校
浜串 - 奈良尾中学校前 - 高井旅 - 中五島高校
中五島高校行は朝の1便が浜串発（岩瀬浦・福見教会経由）となるのを除いて奈良尾車庫前発となる。また、中五島高校発の便は朝の始発が奈良尾福祉センター前・奈良尾医療センター経由、夕方以降の便は高井旅経由奈良尾車庫前行または浜串行となる。
中五島高校発の夏ダイヤ・冬ダイヤに加え、奈良尾車庫前発・中五島高校発の各1便は3月 - 9月までのダイヤと10月から2月までのダイヤもある。
学休日や土日祝は中五島高校行は朝の浜串発のみ、奈良尾車庫行は朝の始発便のみの1日1往復となる。
一般路線バス > 現行路線 > 上五島地区 > 運行休止路線

青方－津和崎線（2021年10月1日より運行休止中）
（青方 - 上五島高校前 - 榎津（奈摩） - 青砂浦別道 - 青砂ヶ浦天主堂前 - 小串入口（ - 小串） -） 立串 - 江袋教会前 - 仲知教会前 - 赤波江入口 - 津和崎
青方から中通島の最北部に当たる津和崎まで運行されていたが、2021年10月1日より路線の末端部に当たる立串－津和崎間は予約制乗合タクシー「smart GOTO」の運行開始に伴って運行を休止し、残った区間は青方－立串線に改名されている。
若松島内線（2022年4月1日より運行休止中）
若松港ターミナル - （土井ノ浦） - （里の浦） - （中央小学校） - 筒ノ浦 - 堤
若松港ターミナル - 中央小学校 - 月ノ浦終点
若松港ターミナル - 中央小学校 - 筒ノ浦 - 漁生浦 - 有福西 - 有福東 - 日島
新上五島町スクールバスとして運行されていたものを引き継いで2014年4月1日から運行を開始した。
若松島内線は平日と土休日でダイヤが大幅に変わる。また、学校行事がある場合にのみ中五島高校から若松島内へ直通運行される便も存在する。
若松島内線ではnagasaki nimocaは利用できない。
予約制乗合タクシー「Smart GOTO」の導入に伴い、2022年3月31日限りで運行休止となった。
奈良尾－若松港線（2022年9月1日より運行休止中）
奈良尾車庫前 - （奈良尾港ターミナル） - （奈良尾医療センター） - 桐古里 - （ 白魚 （ しろお ） 入口） - （中五島高校） - 若松港ターミナル
一部の便では桐入口と白魚入口の通過順番が前後するものもある。また青方-奈良尾線と同様に旧奈良尾町内では経由地が複数存在するため、奈良尾幼稚園入口や奈良尾港ターミナルを経由しない便、あるいは通過バス停の順番が前後する便もある。
中五島高校 - 若松港ターミナル間は新上五島町スクールバスとして運行されていたものを引き継ぎ、2014年4月から西肥バスの一般路線として運行されており、この区間ではnagasaki nimocaは利用不可となる。学休日は中五島高校を経由せずに若松港ターミナルへ向かう。
予約制乗合タクシー「Smart GOTO」の導入に伴い、2022年8月31日限りで運行休止となった。これに伴い、中通島と若松島の間を公共交通機関で移動することはできなくなった。
青方－飯の瀬戸線（2022年9月1日より運行休止中）
（上五島中学校前 - ）青方 - 今里大橋 （ - 小浜） - 浜の浦小学校前 - 浜の浦 - 猪の浦入口 （ - 猪の浦）（ - 青木）（ - 焼崎 （ やけざき ） ） - 飯の瀬戸
浜の浦 - 飯の瀬戸間は道路が狭隘なため、中型車で運行されている。
猪の浦・青木・焼崎の各バス停は上りか下りのいずれかの便が経由する。例えば下り便がこれらのバス停を経由する場合、折り返しの上り便はこれらのバス停には寄らない。
早朝には青木発飯の瀬戸行の区間便も運行されている。
予約制乗合タクシー「Smart GOTO」の導入に伴い、2022年8月31日限りで運行休止となった。
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（西肥自動車が運行を担当するコミュニティバス）
「まめバス」（佐世保市大野地域）
有田町コミュニティバス（西松浦郡有田町）
「いまりんバス」（伊万里市）