中日ドラゴンズ
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広島との開幕戦はFA移籍から3年間一軍登板がなかった川崎憲次郎が先発。2回途中5失点で降板するも、その後チームは逆転勝ち。開幕3連勝するなど、4月を勝率5割で終えるが、5月11日には2000年以来4年ぶりに最下位に転落。しかし、中旬以降は立ち直り、26日には首位に浮上。6月は巨人と首位争いとなり、20日から7連勝で首位に立つと以降は首位を譲ることなく、安定した戦いぶりを見せ、10月1日にマジック対象の3位のヤクルトが敗れた事で、1999年以来5年ぶり6度目のリーグ優勝を達成。本拠地でのリーグ優勝は1988年以来16年ぶり、ナゴヤドームでは初となった。巨人とヤクルトには負け越したものの、他球団には大きく勝ち越した。アライバコンビが本領を発揮し、チーム防御率3.86と12球団トップの投手陣とリーグ初となる同一チームから6人のゴールデン・グラブ賞受賞となったリーグ記録の45失策という堅い守備力でリーグ最少の本塁打とリーグ5位のチーム打率と得点をカバーした。日本シリーズでは西武と対戦、2度の逆転負けもあり、3勝4敗で敗退。
ドラフトでは中田賢一を始め、即戦力となりうる新人を獲得した。オフにリナレスが戦力外通告を受け、現役を引退し、バルガスが自由契約となった。横浜からタイロン・ウッズ、ロッテから山北茂利とのトレードで清水将海を獲得。
球団史上初の開幕から2試合連続のサヨナラ勝ちなど滑り出しは好調だったが、この年から導入されたセ・パ交流戦で15勝21敗と苦戦を強いられ、一時は交流戦最下位にまで低迷した上に首位を走っていたリーグでも3位にまで転落したことから、「降竜戦」と揶揄された。特にそのシーズンからパ・リーグへ新規参入した東北楽天ゴールデンイーグルスには初の3連戦（ナゴヤドーム、5月24日 - 26日）で3連敗を喫し、同球団にとっては球団史上初となる3連勝を献上したほか、セ・パ11球団で唯一負け越す結果となった。交流戦での低迷により、首位を阪神に明け渡す。オールスター前後の11連勝など、後半戦には粘り強さを見せ、首位阪神に2度にわたって0.5ゲーム差まで迫ったものの、連覇はならず、最終的には優勝した阪神と10ゲーム差の2位に終わった。岩瀬が佐々木主浩の日本記録を塗り替えるシーズン46セーブを挙げた。
オフに大西崇之が金銭トレードで巨人に移籍。野口が巨人にFA移籍。日本ハムを自由契約となった上田佳範、巨人にFA移籍した野口の人的補償として小田幸平、元横浜のデニー・友利を獲得。
投手陣と堅守、打撃陣がうまく絡み合う「オレ竜野球」で6月半ばから首位を独走。一方、6月20日に日本ハムから金銭トレードで奈良原浩を獲得。8月12日の阪神戦（ナゴヤドーム）に勝ち、球団史上最速でマジックナンバー（M40）を点灯させた。9月16日の対阪神戦では山本昌が史上最年長でのノーヒットノーランを達成。シーズン終盤には阪神の猛追に遭うものの、1度も首位を明け渡すことなく、10月10日の巨人戦（東京ドーム）で2004年以来2年ぶり7度目のリーグ優勝を達成。セ・リーグ5球団に勝ち越しての「完全優勝」だった。川上憲伸が最多勝、最多奪三振、岩瀬が最多セーブ、福留孝介が首位打者とMVP、ウッズが本塁打王と打点王のタイトルを獲得するなど、個の力が際立ったシーズンでもあった。しかし、北海道日本ハムファイターズと対戦した日本シリーズではシリーズ全試合1番・2番を張ったアライバコンビが38打数5安打（1番・荒木が18打数2安打、2番・井端が20打数3安打）と絶不調。本塁打王と打点王のタイトルを獲得したはずのウッズが本塁打も打点も全く稼げず、1勝4敗で敗退した。
オフに川相、落合英二、奈良原が現役を引退し、アレックスが自由契約となった（広島に移籍）。新外国人として李炳圭、ジョー・バレンタイン、サンティアゴ・ラミレス、フランクリン・グラセスキーを獲得したと同時にエンリケ・ラミレス、ラファエル・クルス、オリックスを自由契約となった中村紀洋と育成契約を結んだ。
翌年からセ・リーグはパ・リーグと共にクライマックスシリーズを導入するので、中日は「リーグ優勝 = 日本シリーズ進出を経験した最後のセ・リーグ優勝球団」となった。
3月22日に中村紀洋を支配下選手に昇格させた。前年MVPだった福留孝介が怪我もあって、シーズン中に戦線離脱するものの、前年レギュラーに定着した森野将彦がその穴を埋めるように打撃面でさらなる成長を見せた。一方、6月8日にバレンタインが解雇された（ロングアイランド・ダックスに移籍）ため、27日にクルスを支配下選手に昇格させた。しかし、8月17日にグラセスキーがウェイバー公示された（ニューアーク・ベアーズに移籍）。投手陣では川上憲伸、朝倉、中田を中心としたローテーション投手が活躍した常に上位を保ち、終盤には巨人、阪神との三つ巴の展開となったが、勝負どころでの取りこぼしが響き、最終的には2位に終わる。セ・リーグで初めてプレーオフとなるクライマックスシリーズでは第1ステージでは3位阪神と対戦し、2連勝、第2ステージではレギュラーシーズン1位の巨人と対戦し、3連勝。計5連勝で球団史上初の2年連続日本シリーズ出場を決めた。日本シリーズでは2年連続で日本ハムと対戦し、第5戦で山井大介と岩瀬の継投による完全試合もあり、4勝1敗で日本ハムに前年の雪辱を果たし、1954年以来53年ぶり2度目の日本一を達成し、球団史上初の年間勝率1位によるリーグ優勝をせずに日本シリーズを制した球団となった。年間勝率2位からの日本一は球団史上初となった。落合は球団OBとして初の日本一監督となった。これにより、この年からセ・パ両リーグ共にクライマックスシリーズを導入してからは年間勝率1位によるリーグ優勝をせずに日本シリーズを制するようになった。アジアシリーズでは初戦の韓国代表SKワイバーンズに敗れ、予選2位で決勝戦に進むが、予選1位のSKワイバーンズに勝って優勝し、日本勢として3年連続のアジア王者となった。
オフに渡邉博幸、デニーが戦力外通告を受け、2人ともその後現役を引退し、E.ラミレスとS.ラミレスの両外国人選手が自由契約となった（S.ラミレスはモンテレイ・サルタンズ、E.ラミレスは2009年にヌエボラレド・オウルズに移籍）。福留孝介がシカゴ・カブスにFA移籍。西武からFA宣言した和田一浩、新外国人としてトマス・デラロサ、マキシモ・ネルソンを獲得。FA入団した和田の人的補償として岡本真也が西武に移籍。
落合は「レギュラーの野手（荒木、井端、和田、ウッズ、森野、中村紀、李炳圭、谷繁）は決まっている」と宣言した。就任当初は一軍と二軍の枠を撤廃してまでチーム内の競争を煽った事を考えれば、方針を大きく転換したが、5月14日の東京ヤクルト戦で森野が左脹脛肉離れを起こしたのをはじめ、6月には李炳圭と井端、8月の北京オリンピックでは森野と荒木、レギュラーが次々と離脱した。平田良介以外に、それを補うべき若手も現れず、535得点と111併殺打はセ・リーグワースト、チームの得点圏打率とチーム打率（共に2割5分3厘）は12球団ワーストだった。しかし、6月16日に横浜から石井裕也とのトレードで小池正晃を獲得。また、投手面も前年活躍を見せた中田（14勝）は怪我と不振、朝倉（12勝）は7月に右腕の血行障害を発症、川上（12勝）は北京オリンピック参加での離脱およびその後も調整に時間がかかった事も重なって、3人合計で19勝どまり。山井も怪我で2試合の登板に終わった。7月11日にクルスがウェイバー公示された。吉見一起が先発・中継ぎフル回転し、後半戦は2年目の清水昭信が完投するなど、若手でカバーしたが、先発ローテーションが1年間固まらず、チーム史上初の規定投球回到達者なしに終わった（最も多く投げたのは山本昌の133回と3分の2）。また、中継ぎの勝ちパターンも、1年間固まらず、当初の構想から修正を余儀なくされ、新セットアッパーを予定していた鈴木義広が開幕から8試合投げただけで右肘を疲労骨折してシーズン絶望となったのを皮切りに、ベテランの平井正史が37試合で防御率5.14と不振に陥った。54試合登板の高橋聡文と44試合に登板した2年目の浅尾拓也でカバーしたが、投手陣で固まったのがクローザーの岩瀬仁紀だけだった。事実5人以上投手を起用した試合は前年は30勝16敗1分けだったのが、16勝22敗5分けと投手陣を多く起用すればする程苦しい展開だったが、3位となり、クライマックスシリーズの出場権は確保した。9月27日にナゴヤドームで行われた引退試合を最後に上田佳範が現役を引退した。クライマックスシリーズ第1ステージは阪神との接戦を2勝1敗で制したものの、第2ステージでは拙攻と投手陣の不調（特に救援陣）もあり、巨人に1勝3敗1引分けで敗退、3年連続日本シリーズ進出はならなかった。8月4日、山本昌が史上最年長となる42歳11カ月で通算200勝を達成した。
オフに浪人していた河原純一が入団テストに合格。ウッズが自由契約となった。日本ハムを自由契約となった小山桂司、新外国人としてトニ・ブランコ、ネルソン・パヤノを獲得。中村紀洋が楽天、川上憲伸がアトランタ・ブレーブスにFA移籍。
ワールド・ベースボール・クラシック日本代表の候補にドラゴンズから4選手が選ばれたが、全員が辞退したことが話題となった。序盤は下位に低迷したが、交流戦辺りから追い上げを見せ、一時は首位巨人とのゲーム差を1.5まで縮めた。しかし、巨人に8勝16敗と大きく負け越したのが最後まで響き、最終的には首位巨人に12ゲーム差をつけられ、2位に終わった。3位ヤクルトとのクライマックスシリーズ第1ステージは初戦を落とした後に連勝し、2勝1敗で制したが、巨人と対戦した第2ステージは初戦に勝利した後、3連敗で1勝4敗で2年連続敗退。新外国人のブランコが本塁打王と打点王の二冠に輝く活躍を見せ、前年不振だった立浪も代打で好成績を残して勝利に貢献した。川上の移籍に伴い、生じた先発投手陣の穴もそれぞれ16勝で最多勝と防御率1.51で最優秀防御率のタイトルを獲得した吉見やチェン・ウェインの活躍によって埋まり、また川井雄太が球団新記録の開幕11連勝を達成した。立浪、井上一樹、デラロサが現役を引退した。
オフに李炳圭がウェイバー公示され、中里篤史、パヤノが自由契約となった（中里は巨人、パヤノはカンザスシティ・ロイヤルズに移籍）。新外国人としてエドワード・バルデス、ディオニス・セサルを獲得したと同時にフォアキン・サンタマリア、カンディド・ヘススと育成契約を結んだ。
6月25日にソフトバンクから清水将海とのトレードで三瀬幸司を獲得。8月9日にサンタマリアが自由契約となった。
チーム打率（.259）、チーム得点（539得点）が12球団中11位だったものの、チーム防御率3.29、チームセーブ43、チームホールド113、チームホールドポイント135はいずれも12球団最高だった。特に山井、中田、チェンが先発した7月16日 - 18日にそれぞれ完封勝利を成し遂げると、同月19日は先発岩田慎司が7回2/3まで無失点で抑えた後、浅尾-髙橋が救援しての完封、20日はネルソン-清水-髙橋-浅尾-河原-岩瀬-平井がシャットアウトした結果の延長11回サヨナラ勝ちと5試合連続完封勝利のプロ野球新記録を樹立（翌年、日本ハムも同じく5試合連続完封勝利のタイ記録を達成）するほどだった。また、ホームゲームでは53勝18敗1分けと圧倒的な強さを見せた。巨人戦はナゴヤドームでは9連勝を含む10勝2敗（クライマックスシリーズでは3勝1敗）、対阪神戦も10勝2敗と大きく勝ち越している一方で、ロードでは26勝44敗2分けと差が激しかったが、セ・リーグ5球団で負け越したのはヤクルトだけだった。
1年を通してみると、序盤には先発投手陣の不調およびネルソンが逮捕されたことによる調整不足、野手では主力の井端がシーズン中盤から故障による長期離脱などがあり、一時は首位巨人に最大8ゲーム差をつけられたが、浅尾や髙橋ら中継ぎ投手陣の活躍、和田や森野らがチームを牽引する一方で、井端に代わってレギュラーに定着した堂上直倫ら若手の台頭などもあり、後半戦から追い上げを見せた。優勝マジックを1とした10月1日、チームは試合がなかったものの、マジック対象の阪神が広島に敗れたため、2006年以来4年ぶり8度目のリーグ優勝となり、巨人のリーグ4連覇を阻止した。なお、この年はJリーグ・名古屋グランパスもJ1リーグ初制覇を果たしており、プロ野球・Jリーグの双方で名古屋市に本拠地を置くチームが優勝に沸くことになった。自己最多の37本塁打を放った和田一浩がMVPに輝いた。クライマックスシリーズでは3位の巨人と第2ステージを戦い、4勝1敗で2007年以来3年ぶりに日本シリーズ出場を決めた。千葉ロッテマリーンズとの日本シリーズでは第6戦（延長15回、シリーズ歴代最長時間試合となる5時間43分の末に引き分け、16残塁は日本シリーズ史上最多）、第7戦で2試合連続の延長戦となるなど、接戦を演じたが、21試合連続ホールドポイントを達成、最終的には日本新記録となるシーズン47ホールド、59ホールドポイントを記録し、大車輪の活躍だった浅尾が名古屋に戻った第6戦、第7戦で打たれたのが祟り、2勝4敗1分で2006年以来4年ぶりの日本シリーズ敗退となった。
オフに横浜を自由契約となった佐伯貴弘、新外国人としてジョエル・グスマン、フェリックス・カラスコ、エンジェルベルト・ソトを獲得。日本ハムを自由契約となった木下達生と育成契約を結んだ。
交流戦ではセ・リーグで唯一の勝ち越しチームとなり、首位にも立つなど、好調であったが、髙橋聡文、中田、山本昌、ブランコ、谷繁、井端ら主力選手の故障が相次いだことに加え、統一球の影響などで前年MVPの和田を中心に打撃陣が絶不調に陥り、7月に大きく失速。一方、7月15日に木下達生を支配下選手に昇格させた。8月3日には首位ヤクルトに10ゲーム差が付き、10日には借金6で5位にまで転落したが、リーグトップの投手陣の働きに加え、中継ぎから先発に転向したソトの活躍などで巨人、阪神、広島との2位争いに踏み止まり、9月になると、谷繁、ブランコ、井端の復帰や大島洋平、平田良介ら若手の成長もあり、徐々に首位ヤクルトとの差を縮めていく。その最中、9月22日に任期満了による落合博満のシーズン限りでの監督退任と高木守道の2度目の監督就任、10月6日にヘッドコーチの森繁和、総合コーチの辻発彦、バッテリーコーチの田村藤夫、打撃コーチの石嶺和彦、外野守備走塁コーチの笘篠誠治、野手コーチの高柳秀樹、両二軍投手コーチの小林誠二・高木宣宏、両二軍野手コーチの奈良原浩・垣内哲也、二軍コンディショニングコーチの勝崎耕世の退団が発表された。谷繁は「落合さんはナゴヤドームの観客減を理由に解任されました。」と述べている。発表と前後して、9月を15勝6敗3引分け、10月を11勝5敗2引分けと勝ち越し、10月6日に首位に浮上。10月18日の対横浜戦でブランコの同点本塁打で引き分けに持ち込み、142試合目にして球団史上初の2年連続リーグ優勝を果たし、1982年以来29年ぶりの横浜スタジアムでの胴上げが実現した。チーム打率（.228）、得点数（419得点）は共にリーグワーストであり、両部門がワーストでのリーグ優勝はプロ野球史上初である。セットアッパーとして0.41という防御率を記録した浅尾拓也がセ・リーグMVPを獲得した。ヤクルトとのクライマックスシリーズファイナルステージは4勝2敗で2年連続となる日本シリーズ出場を決めた。9月28日にヘススとカラスコの両外国人選手との契約を解除し、11月1日にグスマンがウェイバー公示された（シンシナティ・レッズに移籍）。福岡ソフトバンクホークスとの日本シリーズでは第6戦までお互いの本拠地で敗戦する展開（外弁慶シリーズ）となったが、ダイエー時代に続いて名古屋で3戦全敗したことが祟ったのと、キャッチャーの谷繁がヤクルトとのセ・リーグクライマックスシリーズファイナルステージ第1戦の第1打席から43打席連続無安打と極度の不振で足を引っ張り、ヤフードームでの第7戦に敗れ、3勝4敗で2年連続日本シリーズ敗退となった。2年連続日本シリーズ敗退は球団史上6チーム目。
オフにチェン、河原、佐伯、木下が自由契約となった。楽天を自由契約となった山﨑武司が10年ぶり、アトランタ・ブレーブスを自由契約となった川上憲伸が4年ぶりに復帰。小池正晃がFAでDeNAに復帰。小山桂司が金銭トレードで楽天に移籍。新外国人としてビクトル・ディアス、ホルヘ・ソーサを獲得。