月刊アフタヌーン
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2000年-
のぶみのえほん（のぶみ）1月号 - -2001年1月号
クーの世界（小田ひで次）1月号 - 2001年1月号 ※2000年9月号からはタイトルが「クーの世界2」に変更。
ぽちょむきん（北道正幸）2月号 - 2002年12月号
家族のそれから（ひぐちアサ）2月号 - 5月号
ミルククローゼット（富沢ひとし）3月号 - 2001年10月号
イハーブの生活（小路啓之）4月号 - 2002年3月号
スマグラー（真鍋昌平）5月号 - 8月号
ANGEL DOLL（都築和彦）8月号 - 10月号
女神調書（小原愼司）9月号 - 12月号
天の回廊（秋山晟）10月号 - 2001年10月号
茄子（黒田硫黄）11月号 - 2002年10月号
2001年-
細腕三畳紀（あさりよしとお）1月号 - 10月号
ヤサシイワタシ（ひぐちアサ）1月号 - 2002年2月号
SPACE PINCHY（トニーたけざき）2月号 - 2002年9月号
夢使い（植芝理一）3月号 - 2004年2月号
緑の黙示録（岡崎二郎）3月号 - 2003年2月号 ※シリーズ連載
くまがゆく（あたまん）3月号 - 2004年3月号
THE END（真鍋昌平）4月号 - 2002年11月号
てんでフリーズ!（ISUTOSHI）6月号 - 2004年5月号
アベノ橋魔法☆商店街（鶴田謙二/GAINAX）9月号 - 2003年2月号
STONe（ヒロモト森一）11月号 - 2002年8月号
るくるく（あさりよしとお）12月号 - 2009年5月号
2002年-
空談師（篠房六郎）3月号 - 2003年7月号
蔵野夫人（一条裕子）5月号 - 2003年2月号
げんしけん（木尾士目）6月号 - 2006年7月号
悪1013（小川雅史）8月号 - 2003年6月号
ムーン・ロスト（星野之宣）11月号 - 2004年6月号
爆音列島（髙橋ツトム）12月号 - 2013年1月号
リトル・フォレスト（五十嵐大介）12月号 - 2005年7月号
2003年-
蟲師（漆原友紀）2月号 - 2008年10月号 ※『アフタヌーンシーズン増刊』より移籍、隔月連載、2014年1月号 - 2月号に「特別篇『日蝕む翳』」掲載
ヒストリエ（岩明均）3月号 - ※2013年10月号より隔月連載明記
もっけ（熊倉隆敏）3月号-2009年7月号 ※『アフタヌーンシーズン増刊』より移籍、隔月連載
愛読者ボイス選手権 特別版（カラスヤサトシ）3月号 - 2010年2月号 ※欄外などに掲載
SHADOW SKILL（岡田芽武）4月号 - 2006年2月号(一時休載)、2009年9月号 - 2014年5月号 ※事実上、不定期連載
ななはん〜七屋ちょこっと繁盛記〜（ももせたまみ）4月号 - 2007年11月号 ※『アフタヌーンシーズン増刊』より移籍
ラブやん（田丸浩史）4月号 - 2015年7月号 ※『アフタヌーンシーズン増刊』より移籍
ACONY（冬目景）5月号 - 2004年8月号(一時休載)、2008年9月号 - 2010年9月号
ラブロマ（とよ田みのる）5月号 - 2005年12月号
TOKKO 特公（藤沢とおる）6月号 - 2004年4月号
Kiss girl（上田宏則）7月号 - 9月号
ダンダラ（赤名修）8月号 - 12月号
マゴロボ（トミイマサコ）9月号 - 2004年5月号
犬姫様（二宮ひかる）10月号 - 2004年4月号
おおきく振りかぶって（ひぐちアサ）11月号 - 2011年2月号(一時休載)、2012年1月号 - 2016年10月号(一時休載)、2017年9月号 -
2004年-
ラヂオヘッド（内藤曜ノ介）1月号 - 12月号
俺と悪魔のブルーズ（平本アキラ）2月号 - 2008年4月号 ※未完のまま連載中断、『ヤングマガジンサード』へ移籍
カラプリ（麻宮騎亜）2月号 - 9月号
プ〜ねこ（北道正幸）2月号-
くまがくる（あたまん）2月号 - 2005年10月号
ほしのこえ（佐原ミズ/新海誠）4月号 - 2005年2月号
しおんの王（安藤慈朗/かとりまさる）5月号 - 2008年6月号
神社のススメ（田中ユキ）6月号 - 2006年8月号
アキバ署!（瀬尾浩史）7月号 - 2006年11月号 ※隔月連載
リンガフランカ（滝沢麻耶）8月号 - 12月号
リトル・ジャンパー（高田裕三）9月号 - 2008年10月号
GUNSMITH CATS BURST（園田健一）9月号 - 2008年11月号
アンダーカレント（豊田徹也）10月号 - 2005年10月号
ぺし（風呂前有）11月号 - 2007年12月号
2005年-
すずめすずなり（秋山はる）1月号 - 2006年6月号
愛読者ボイス選手権 超拡大版（カラスヤサトシ）3月号 - 2010年2月号
臨死!!江古田ちゃん（瀧波ユカリ）4月号 - 2014年9月号
終戦のローレライ（虎哉孝征/長崎尚志/福井晴敏）4月号 - 2007年11月号
ミシ（黒田硫黄）4月号 - 9月号
巌窟王（前田真宏/有原由良）5月号 - 2006年11月号、2008年5月号に完結編
ハツカネズミの時間（冬目景）7月号 - 2008年4月号 ※『モーニング』より移籍
ガガガガ（山下ゆたか）8月号 - 2007年11月号 ※『週刊ヤングマガジン』より移籍、『Michao』携帯配信へ移行
世界の孫（SABE）10月号 - 2008年3月号
宙のまにまに（柏原麻実）11月号 - 2011年8月号 ※2011年9月号に番外編となる「青春の光（マボロシ）編」掲載
3年G組長州先生（真右衛門）11月号 - 2006年1月号
2006年-
ヴィンランド・サガ（幸村誠）2月号 - ※『週刊少年マガジン』より移籍
雲のむこう、約束の場所（佐原ミズ/新海誠）2月号 - 10月号
G組のG 猛将伝（真右衛門）2月号 - 7月号
謎の彼女X（植芝理一）5月号 - 2014年11月号
ナチュン（都留泰作）8月号 - 2010年4月号
あたらしい朝（黒田硫黄）9月号 - 2010年12月号 ※実質的に不定期連載
パノラマデリュージョン（小原愼司）10月号 - 2008年3月号
くじびき♥アンバランス（小梅けいと/木尾士目）11月号 - 2008年2月号
呪街（惣本蒼）12月号 - 2010年1月号 ※隔月連載
2007年-
ミミア姫（田中ユタカ）1月号 - 2009年5月号
巨娘（木村紺）1月号 - 9月号 ※隔月連載。アフタヌーン増刊号『good!アフタヌーン』(2008年11月創刊)にて再開。
大江戸ロケット（浜名海/中島かずき）4月号 - 2009年9月号
ザリガニ課長（そにしけんじ）5月号 - 2010年5月号
吉田家のちすじ（中島守男）5月号 - 2010年11月号
チノミ（吉永龍太）6月号 - 2008年8月号
元祖ユルヴァちゃん（西本英雄）6月号 - 2010年11月号
みんなのきせき（内藤曜ノ介）7月号 - 2008年3月号
学園夢探偵 獏（鹿島麻耶）8月号 - 0月号
カブのイサキ（芦奈野ひとし）8月号 - 2013年1月号 ※当初不定期掲載、2008年4月号より隔月連載、2010年4月号より連載。
ファンシーGUYきゃとらん（くぼたまこと）11月号 - 2010年2月号
ヴァムピール（樹なつみ）12月号 - 2010年4月号
2008年-
スピリット魂（秋本こうじ）1月号 - 2009年11月号
トライアルライド（小林知恵子/魚住青時）1月号 - -2009年7月号 ※2009年8月号に作画担当の小林の出産報告と休載が告知され、2011年6月号に「特別編」掲載と『good!アフタヌーン』16号からの連載再開が発表された。
オクターヴ（秋山はる）3月号 - 2011年2月号
FLIP-FLAP（とよ田みのる）3月号 - 6月号
百舌谷さん逆上する（篠房六郎）3月号 - 2013年9月号
からん（木村紺）5月号 - 2011年6月号
珈琲時間（豊田徹也）7月号 - 2009年12月号
ぢごぷり（木尾士目）7月号 - 2010年8月号
ハックス!（今井哲也）7月号 - 2010年6月号
もえタイ（杉基イクラ）7月号 - 9月号
ベントラーベントラー（野村亮馬）8月号 - 2010年5月号 ※第2回は11月号、以降連載
火曜午後9時（岡戸達也）9月号 - 11月号 ※「DoLL」「夏をおぼえる」との 3作同時連載開始。
DoLL（岡戸達也）9月号 - 2009年10月号
夏をおぼえる（岡戸達也）9月号 - 12月号
世界に羽ばたけ轟先生!（神原則夫）11月号 - 2010年1月号
2009年-
アストライアの天秤（小川悦司/竹内一郎） ※1月号に『さばき、さばかれ、アストライアの天秤』の題名で掲載、以降2011年6月号まで不定期連載。
ZOMBIEMEN（岡エリ/樹崎聖）1月号 - 3月号 ※シリーズ連載
バーサス!（和田依子）2月号 - 5月号
ウタマロ 紅蓮の女（永井豪）2月号 - 2010年5月号 ※シリーズ連載
コス丸くん（猪熊あき代）2月号 - 4月号
友達100人できるかな（とよ田みのる）3月号 - 2011年4月号
いもうとデイズ（田中ユキ）3月号 - 2011年4月号
菱川さんと猫 -ゲバラシリーズ-（萩尾望都/田中アコ）5月号 - 2010年10月号 ※シリーズ連載
薬師寺涼子の怪奇事件簿（垣野内成美/田中芳樹）5月号 - 2013年11月号 ※『月刊マガジンZ』より移籍。エピソード毎の集中連載方式。
武士道シックスティーン（安藤慈朗/誉田哲也）5月号 - 2010年12月号
シドニアの騎士（弐瓶勉）6月号 - 2015年11月号
少年式少女（和田依子）10月号 - 2010年12月号
雪月記（猪熊しのぶ/山上旅路）11月号 - 2011年2月号