石山寺
歴史

当地は、石山寺が創建される以前の天智天皇の660年代には石切り場とされていた。また、天武天皇元年（672年）の壬申の乱後には現在多宝塔がある地の東側で大友皇子が手厚く葬られたという。
『石山寺縁起絵巻』によれば、聖武天皇の勅願により、天平19年（747年）に良弁（東大寺開山・別当）が聖徳太子の念持仏であった如意輪観音像をこの地に祀ったのが始まりとされている。聖武天皇は東大寺大仏の造立にあたり、像の表面に鍍金（金メッキ）を施すために大量の黄金を必要としていた。そこで、良弁に命じて黄金が得られるよう吉野の金峯山に祈らせた。金峯山はその名の通り、「金の山」と信じられていたようである。そうしたところ、良弁の夢に吉野の金剛蔵王（蔵王権現）が現われ、こう告げた。「金峯山の黄金は、（56億7千万年後に）弥勒菩薩がこの世に現われた時に地を黄金で覆うために用いるものである（だから大仏鍍金のために使うことはできない）。近江国志賀郡の湖水の南に観音菩薩の現われたまう土地がある。そこへ行って祈るがよい」。夢のお告げにしたがって石山の地を訪れた良弁は、比良明神（≒白鬚明神）の化身である老人に導かれ、巨大な岩の上に聖徳太子念持仏の6寸の金銅如意輪観音像を安置し、草庵を建てた。そして程なく（実際にはその2年後に）陸奥国から黄金が産出され、元号を天平勝宝と改めた。こうして良弁の修法は霊験あらたかなること立証できたわけであるが、如意輪観音像がどうしたことか岩山から離れなくなってしまった。やむなく、如意輪観音像を覆うように堂を建てたのが当寺の草創であるという。そもそも正倉院文書によれば、この石山の地は、東大寺を建立するために近江国の甲賀郡や高島郡など各所から伐採してきた木材を集めておく場所であったのが知れる。この地が東大寺や良弁と強い繋がりがあったことが分かる。
その他資料としては『元亨釈書』 や、後代であるが宝永2年（1705年）の白鬚大明神縁起絵巻がある。
その後、天平宝字5年（761年）から造石山寺所という役所のもとで堂宇の拡張、伽藍の整備が行われた。正倉院文書によれば、造東大寺司からも仏師などの職員が派遣されたことが知られ、当寺の造営は国家的事業として進められていた。これには、淳仁天皇と孝謙上皇が造営した保良宮が当寺の近くにあったことも関係しているといわれる。本尊の塑造如意輪観音像と脇侍の金剛蔵王像、執金剛神像は、天平宝字5年（761年）から翌年にかけて制作され、本尊の胎内に聖徳太子念持仏の6寸如意輪観音像を納めたという。こうして石山寺は華厳宗の寺院として寺観が整えられていった。
それ以降から平安時代前期にかけての寺史はあまりはっきりしていないが、寺伝によれば、初代の座主（ざす、「住職」とほぼ同義）に聖宝が就いて真言宗の寺院となっている。その後も観賢などの当時高名な僧が座主として入寺している。聖宝と観賢はいずれも醍醐寺関係の僧である。石山寺と醍醐寺は地理的にも近く、この頃から石山寺の密教化が進んだものと思われる。
当寺の中興の祖といわれるのが、菅原道真の孫の第3世座主・淳祐内供（寛平2年〈890年〉 - 天暦7年〈953年〉）である。内供とは内供奉十禅師（ないくぶじゅうぜんじ）の略称で、天皇の傍にいて常に玉体を加持する僧の称号である。高僧でありながら諸職を固辞していた淳祐は、やがてこの内供と称されるようになった。「石山内供」・「普賢院内供」とも呼ばれている。淳祐は体が不自由で、正式の坐法で坐ることができなかったことから学業に精励し、膨大な著述を残している。彼の自筆本は今も当寺に多数残存し、「匂いの聖教（においのしょうぎょう）」と呼ばれ、一括して国宝に指定されている。このころ、石山詣が宮廷の官女の間で盛んとなり、『蜻蛉日記』や『更級日記』にも描写されている。
承暦2年（1078年）1月2日、落雷によって本堂が半焼し、本尊の塑造如意輪観音像も損壊したため、永長元年（1096年）に本堂（国宝）を再建し、新たな本尊として如意輪観音坐像（重要文化財）を祀る形となった。
東大門、多宝塔、勝南院毘沙門堂は鎌倉時代の初期に源頼朝の寄進により建てられたものとされる。この頃には、だいたい現在見るような寺観が整ったと思われる。
戦国時代の元亀4年（1573年）2月に光浄院暹慶が室町幕府第15代将軍足利義昭の味方をして織田信長に背き、石山寺の南にあった石山城に立て籠もったが、すぐに柴田勝家の攻撃を受けて降伏している。この合戦によって石山寺のいくつかの堂舎が被害を受けている。その後、信長によって寺領5,000石が没収されてしまったが、信長の死後に豊臣秀吉によって文禄5年（1596年）にいくつかの寺領が返還されている。
慶長18年（1613年）には徳川家康によって寺領579石が認められている。
慶長年間（1596年 - 1615年）に淀殿によって石山寺の復興が行われ、慶長7年（1602年）には本堂の合の間と礼堂が改築されている。
石山寺は全山炎上するような兵火には遭わなかったため、建造物、仏像、経典、文書などの貴重な文化財を多数伝存している。
2021年（令和3年）12月17日に第52代座主鷲尾遍隆が死去。同年12月21日に長女の鷲尾龍華が第53代座主に就任。奈良時代の747年創設以来、初の女性座主となった。
行幸啓・御幸・御成の一覧
| 年月日 | 参拝者 | 備考 |
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| 917年（延喜17年）9月23日 | 宇多法皇 |  |
| 985年（寛和元年）10月 | 円融法皇 |  |
| 986年（寛和2年）9月29日 | 円融法皇 |  |
| 1005年（寛弘2年）8月25日 | 敦康親王 |  |
| 1087年（寛治元年）12月21日 | 堀河天皇 |  |
| 1176年（安元2年）3月25日 | 後白河法皇 |  |
| 1299年（正安元年）1月13日 | 後宇多上皇 |  |
| 1357年（延文2年）8月20日 | 後光厳天皇 |  |
| 1643年（寛永20年）4月10日 | 儲君紹仁親王（後の後光明天皇） |  |
| 1829年（文政12年）4月4日 | 山階宮晃親王 |  |
| 1871年（明治4年）4月21日 | 山階宮晃親王 |  |
| 1878年（明治11年）4月11日 | 山階宮晃親王 |  |
| 1878年（明治11年）6月12日 | 山階宮晃親王、梨本宮守脩親王 |  |
| 1878年（明治11年）11月13日 | 明治天皇 |  |
| 1878年（明治11年）11月23日 | 山階宮晃親王 |  |
| 1880年（明治13年）4月29日 | 山階宮晃親王 |  |
| 1880年（明治13年）8月28日 | 山階宮晃親王、定麿王 |  |
| 1880年（明治13年）9月19日 | 山階宮晃親王 |  |
| 1881年（明治14年）5月10日 | 山階宮晃親王 |  |
| 1881年（明治14年）8月18日 | 山階宮晃親王 |  |
| 1882年（明治15年）3月28日 | 山階宮晃親王 |  |
| 1887年（明治20年）2月18日 | 昭憲皇太后 |  |
| 1893年（明治26年）5月8日 | 山階宮晃親王、小松宮彰仁親王、村雲日栄 |  |
| 1904年（明治37年）9月11日 | 賀陽宮邦憲王、好子妃 |  |
| 1910年（明治43年）8月5日 | 李垠 | 大韓帝国皇太子。同月29日に韓国併合条約により王公族に |
| 1910年（明治43年）10月7日 | 皇太子嘉仁親王（後の大正天皇） |  |
| 1914年（大正3年）3月29日 | 山階宮武彦王、藤麿王、朝融王、邦久王、賀陽宮恒憲王 | 学習院春期休暇中の見学旅行 |
| 1915年（大正4年）8月25日 | 淳宮雍仁親王 |  |
| 1917年（大正6年）7月18日 | 賀陽宮恒憲王、賀陽宮大妃好子、佐紀子女王 |  |
| 1918年（大正7年）4月4日 | 皇太子裕仁親王（後の昭和天皇） |  |
| 1920年（大正9年）5月22日 | 博義王、朝子妃 |  |
| 1920年（大正9年）5月29日 | 山階宮武彦王、山階宮大妃常子、安子女王 | 京都旅行 |
| 1921年（大正10年）3月30日 | 竹田宮大妃昌子内親王、竹田宮恒徳王、禮子女王 |  |
| 1921年（大正10年）5月7日 | 久邇宮邦彦王、多嘉王、智子女王 | 金勝村にあった久邇宮家の御料林検分の帰途 |
| 1922年（大正11年）11月12日 | 貞明皇后 | 大門前に記念公園を新設 |
| 1925年（大正14年）12月20日 | 久邇宮邦彦王、俔子妃 |  |
| 1926年（大正15年）4月12日 | 閑院宮載仁親王、華子女王 | 閑院宮は20年以上前の将校演習の折に宿泊（詳細不明） |
| 1930年（昭和5年）5月4日 | 邦英王 | 園城寺での灌頂に併せて。小野蕪子が供奉 |
| 1938年（昭和13年）4月4日 | 照宮成子内親王 |  |
| 1938年（昭和13年）6月16日 | 春仁王、直子妃 |  |
| 1938年（昭和13年）8月7日 | 三笠宮崇仁親王 |  |