那智 (重巡洋艦)
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3月10日、「那智」は蘭印部隊から北方部隊に編入、第五戦隊旗艦は「妙高」に移った。
「那智」は3月17日に佐世保に入港し、同地で旗艦施設、防寒設備の工事等が行われた。4月7日佐世保発、4月11日厚岸に入港し第五艦隊司令長官の旗艦となった。
4月18日、敵機動部隊発見の報に続き、日本本土に対する空襲があった。室蘭在泊中であった「那智」は出港すると第二十一戦隊と合流し、南東へ向かった。4月19日、「那智」と第二十一戦隊は攻撃を受けて航行不能となっていた監視艇「第二十一南進丸」を発見。。「第二十一南進丸」は軽巡洋艦「木曾」が乗員を収容し、その後処分した。4月25日、「那智」は横須賀に帰着。
5月5日から6日にかけて巡洋艦や大型機発見の報告があり、5月6日に「那智」も厚岸より出撃して軽巡洋艦「多摩」や特設巡洋艦「赤城丸」とともに索敵を行うも何も発見されなかった。報告されたものが実際何であったのかは不明である。「那智」は舵が故障し航行不能となった給油艦「尻矢」を救援した後、5月12日に厚岸に帰投。5月15日、大湊入港。
「那智」は駆逐艦「電」、「雷」とともに主隊としてAL作戦（西部アリューシャン攻略作戦）に参加した。主隊は5月29日に川内湾を出港して6月2日に加熊別湾に着き、翌日同地より出撃した。AL作戦と同時に行われたミッドウェー海戦で日本軍は敗北したがアッツ島とキスカ島の攻略は実施された。そして主隊は空母部隊である第二機動部隊などとともにアメリカ艦隊の来襲に備えた。その後、主隊などは6月24日までに一度大湊機戻り、6月28日にはキスカ島への輸送部隊掩護のため再び出撃した。一部は7月7日に帰途に就き、残りも他の任務に就いた艦を除き7月18日までに横須賀に帰投した。「那智」は7月14日に横須賀に入港。同日、「那智」は第二十一戦隊に編入された。横須賀では入渠し防寒施設の新設等が行われた。また、艦尾への爆雷手動投下台2基装備と、内火艇2隻への爆雷投下台各1基の装備も行われたものと思われる。入渠中火災があったが、損傷は軽微なものにとどまった。
8月2日に「那智」と駆逐艦「初霜」は横須賀を出港し、8月6日に加熊別湾に着いた。このころの主隊は第二十一戦隊と駆逐艦3隻であった。
8月8日、アメリカ艦隊がキスカ島を砲撃。北方部隊は幌筵に集結し、8月12日に北方部隊の主隊（駆逐艦1隻欠）と護衛隊がアリューシャン方面へ向けて出撃した。しかし、同日日本の本土東方で不時着水偵を発見したとの報告があり、連合艦隊はアメリカ機動部隊出現と判断。北方部隊の主隊、護衛隊も南下して索敵に従事することとなった。しかし、結局なにも発見されず、北方部隊の主隊などは8月16日に大湊に入港した。水偵発見は誤報であったものと思われる。
8月27日にアトカ島東部のナザン湾に敵巡洋艦等発見の報告があり、8月29日に北方部隊の主隊、護衛隊は大湊を出港したが、台風のため加熊別湾に入泊した。9月3日には今度は「呂号第六十二潜水艦」が巡洋艦等の発見を報告し、第二十一戦隊などは再び出撃し、アッツ島南西方面へ向かった。しかしアメリカ艦隊の来襲はなく、主隊などは9月18日に大湊に帰投した。この間には陸軍部隊のアッツ島からキスカ島への移駐が行われていた。9月中頃の主隊は第二十一戦隊のみであった。監視艇からの敵味方不明の飛行機発見の報告を受けて9月30日に主隊および護衛隊は大湊から出撃するも、特に何もなかった。
10月下旬からアッツ島の再占領が行われ、第二十一戦隊の軽巡洋艦2隻は第一水雷戦隊と共に挺身輸送部隊となっている。「那智」は10月22日に陸奥海湾を出港し、小樽で陸軍船舶工兵40名を乗せて10月26日に加熊別湾に到着。10月27日に主隊（「那智」、駆逐艦「神風」）と挺身輸送隊は出撃した。10月29日に主隊と別れた挺身輸送部隊は10月29日から30日に陸軍部隊をアッツ島に上陸させた。「那智」は11月1日に幌筵に戻り、その後大湊へ移った。続いてアッツ島への増強部隊の輸送とセミチ島の攻略が挺身輸送部隊や陸軍輸送船によって行われ、「那智」は駆逐艦「薄雲」とともに主隊としてアッツ島への輸送を支援した。主隊およびアッツ島への輸送部隊は11月20日に小樽を出港し、加熊別湾を経由してアッツ島へと向かった。11月25日に輸送部隊は主隊と分かれて揚陸を行い、完了後両者は合同して11月28日に加熊別湾に帰投した。
アムチトカ島へのアメリカ軍上陸を受けて搭載機をキスカ島へ送るため1943年1月24日に「那智」は駆逐艦「若葉」の護衛で幌筵を出港したが、天候不良のため搭載機の空輸は行われなかった。「那智」搭載機3機は2月に「君川丸」によってアッツ島へ運ばれたが、うち1機はキスカ島へ進出する際に行方不明となった。
「那智」では予備水タンクなどで漏水が発生したことから、その修理などのため1月29日に幌筵を出港して横須賀へと向かった。第五艦隊司令長官は旗艦を「多摩」に変更した。横須賀には2月1日に到着したが修理は佐世保で行うことに変更され、2月5日に佐世保に到着して修理が行われた。また、この時には13ミリ連装機銃2基の撤去と25ミリ連装機銃4基の装備や、電探の装備準備工事なども行われた。修理完了後、「那智」は2月27日に出港し、大湊経由で3月4日に幌筵に到着して旗艦に戻った。
1943年（昭和18年）3月7日から13日、アッツ島への輸送作戦に参加。22日、2度目の輸送作戦で幌筵島を出撃。27日には重巡洋艦「摩耶」、軽巡洋艦「阿武隈」、第六駆逐隊（雷、電）、第二十一駆逐隊（若葉、初霜）と共にアッツ島沖海戦に参加し、米重巡洋艦「ソルトレイクシティ」、軽巡洋艦「リッチモンド」、駆逐艦「ベイリー」、「コグラン（英語版）」、「モナハン」、「デイル」と交戦する。だが、「ソルトレイクシティ」の攻撃を受け小破（戦死11名、負傷21名）、米艦隊の撃破にも失敗した。被弾により主砲射撃盤が故障したため各砲塔の照準器による各個射撃となったが、日本海軍は砲側照準による射撃訓練を実施しておらず、遠距離砲撃の命中率は更に悪くなったという。
「那智」は4月3日に横須賀に入港し、損傷の修理や21号電探、電波探知機の装備が行われた。5月11日、幌筵へ向けて横須賀を出港。
9月6日、大湊から幌筵島に向かっていた「那智」はアメリカ潜水艦「ハリバット」の雷撃を受けて魚雷2発が命中（右舷の後部煙突と舵付近）したが、ともに不発であった。1発は船体にへこみを生じさせたのみ、もう1発では浸水が生じたものの航行には支障はなかった。時期が10月中旬となっているなど若干の食い違いはあるが、「那智」乗組員であった竹本定男は次のように書いている。占守島泊地に到着後、艦尾付近に魚雷の頭部が刺さっているのを発見した。魚雷頭部は約1週間かけて引き抜かれ、調査ですべての起爆装置が作動していないことが判明。その後、起爆装置は横須賀海軍工廠に送られた。
11月22日、「那智」は佐世保に入港。2か月にわたる工事で21号電探の換装、22号電探2基や2式哨信儀装備、零式水中聴音機、魚雷反対舷移動装置の装備などが行われた。2月9日、「那智」は大湊に戻った。
1944年（昭和19年）6月上旬、マリアナ沖海戦で日本海軍は大敗。サイパンの戦いはアメリカ軍の勝利（マリアナ諸島の占領）という形で終わりつつあった。そこで神重徳連合艦隊参謀は戦艦山城、巡洋艦那智、足柄、多摩、木曽、阿武隈等の第五艦隊サイパン島突入作戦を発案、アメリカ軍に対し陸上砲撃をおこなう計画を提案した。第五艦隊は内地に戻り出撃準備を行うが、作戦は実施されなかった。