ジェイアールバス関東
高速バス > かつて運行していた高速バス

廃止路線を除き、運行支援業務は継続。ニューブリーズ号については、後述の理由により代替運行の形で一時的に復帰した。
ラ・フォーレ号（東京 - 青森）<羽田京急バス・JRバス東北・弘南バス>《他社へ移管→JRバス東北単独化（TDL・東京 - 青森）》
シリウス号（東京 - 八戸）<国際興業・十和田観光電鉄・南部バス>《他社へ移管→国際興業・十和田観光電鉄がシリウス号（東京 - 八戸・七戸十和田）として運行》
ドリーム盛岡 (らくちん) 号（東京 - 盛岡）<国際興業・岩手県交通・JRバス東北>《他社へ移管→国際興業・岩手県交通・JRバス東北が（TDL/渋谷・東京 - 盛岡）として運行》
政宗号（新宿駅 - 仙台駅東口）<東北急行バス・JRバス東北>《他社へ移管→JRバス東北単独化（新宿/東京 - 仙台）》
ニューつくばね号（東京駅 - 谷田部・筑波山）<関東鉄道>《廃止》
さいたま・つくば号（さいたま新都心駅 - つくばセンター）《廃止》
山あげ号・常陸大宮号（新宿駅・東京駅 - 常陸大宮・烏山駅）《新宿駅 - 常陸大宮に短縮、「常陸大宮号」に統合ののち茨城交通の単独運行化》
いたこ・あそう号（東京駅 - 潮来駅・麻生町役場）<関東鉄道>《関鉄グリーンバスへ移管（東京駅 - 鉾田駅）》
常総ルート（東京駅 - 水海道駅・岩井・猿島）<関東鉄道>《関鉄パープルバスへ移管→廃止》
らくらくミッドナイト守谷号（東京駅→新守谷駅入口）《廃止》
ミッドナイトアロー湘南（東京駅→辻堂駅・平塚駅）<神奈川中央交通（神奈川中央交通西）>《同社の単独運行化》
伊香保温泉号（新宿駅 - 伊香保温泉）<関越交通>《同社の単独運行化→廃止》
ファンタジア号（東京湾岸線：東京駅八重洲北口 - TDL）<東京空港交通>《廃止》
ファンタジア号は元都営バスからの引き継ぎで運行していた
上野湾岸線（上野駅 - TDL）<京成電鉄>《廃止》
きよさと号（東京駅 - 清里駅・八ヶ岳高原）<山梨交通>《同社の単独運行化→休止》
松本号（東京駅 - 松本バスターミナル）<松本電気鉄道>《廃止》
伊良湖ライナー号（東京駅 - 伊良湖岬）<豊橋鉄道・JR東海バス>《他社（JR東海バス・豊橋鉄道）へ移管→廃止》
ドリーム志賀号（東京駅・新宿駅 - 湯田中駅）<長野電鉄>《廃止》
ドリーム難波号（東京駅 - 湊町バスターミナル）<南海バス・西日本JRバス>《「ドリームなんば・堺号」に統合→南海バスの単独運行に→廃止》
ドリーム堺号（東京駅・新宿駅 - 堺駅）<南海バス>《「ドリームなんば・堺号」に統合→南海バスの単独運行に→廃止》
ドリームふくふく号（東京駅 - 下関駅）<中国JRバス・サンデン交通>《他社（中国JRバス・サンデン交通）へ移管→廃止》
江戸川台線（東京駅 - 江戸川台駅）<東武バスイースト>《廃止》
新宿昼特急金沢号（新宿駅 - 金沢駅）<西日本JRバス>《「金沢エクスプレス」に統合》
足利わたらせ号（東京駅 - 足利駅）《東京駅 - 佐野新都市バスターミナルに短縮、マロニエ東京号として運行》
スーパーニュードリーム号（新宿駅 - 大阪駅）<西日本JRバス>《中央ドリーム大阪号に名称変更》
ニュードリーム神戸号（新宿駅 - 神戸駅）<西日本JRバス>《「ドリーム神戸号」に統合》
ベイライナー水戸・横浜号（みなとみらい・横浜 - 水戸駅南口）<京浜急行バス・茨城交通>《廃止》
スパライナー草津号（草津温泉 - 名古屋駅）《廃止》
塩原温泉 - 福島空港<東野交通・福島交通>《廃止（実験運行のみで終了）》
勝田・東海号（新宿駅・東京駅 - 勝田/東海・原子力機構前）<茨城交通>《同社の単独運行化（東京駅 - 原子力機構前）》
東京駅 - 大洗原研・日揮正門前 <茨城交通>《2001年4月6日～同年9月28日までの試験運行のみで終了》
東京 - 江戸崎線<関東鉄道>《同社の単独運行化→廃止》
ドリームなんば・堺号（東京駅・新宿駅 - 堺）<西日本JRバス・南海バス>《南海バスの単独運行化後に廃止》
ニューブリーズ号（東京駅 - 広島）<広島電鉄・小田急シティバス・中国JRバス>《小田急シティバス・中国JRバスの2社運行化→廃止。ドリーム岡山・広島号が実質上の代替。なお、2018年8月2日より、平成30年7月豪雨の災害復旧のため、同年11月30日出発便まで 中国JRバス担当便を代替運行した。》
沼津ライナー号（東京駅 - 沼津）<富士急シティバス>《同社の単独運行化》
ONライナー号（さいたま新都心・大宮駅 - 成田空港）<東武バスウエスト・国際興業・西武バス・京成バス・千葉交通>《左記5社による運行化》
南アルプス号（新宿駅 - 高遠・伊那里）<京王電鉄バス・伊那バス>《廃止》
青春メガドリーム号（東京駅 - 大阪駅）<西日本JRバス>《廃止（青春エコドリーム号に移行）》
かぐや姫EXPRESS（東京駅 - 富士）<富士急静岡バス>《同社の単独運行化》
与一号（新宿駅 - 西那須野駅・大田原）《他社（東野交通）へ移管（新宿駅 - 西那須野駅）》
青春ドリーム号（東京駅 - 大阪駅ほか）<西日本JRバス>《廃止（青春エコドリーム号に移行）》
超得割青春号（新宿駅 - 大阪駅ほか）<西日本JRバス>《廃止（青春エコドリーム号に移行）》
東名高速バス（東京駅 - 浜松駅）<JR東海バス>《昼行便をJR東海バスの単独運行化》
新宿ライナー三河・なごや号（新宿駅 - 名古屋駅）<JR東海バス>《廃止》
東名高速バス（東京駅 - 静岡駅）<JR東海バス>《JRバステックに移管》
新宿ドリーム三河・なごや号（新宿駅 - 名古屋駅）<JR東海バス>《ドリームなごや・三河号に移行》
中央ドリームなごや号（新宿駅 - 名古屋駅）<JR東海バス>《ドリームなごや・新宿号に移行》
ドリーム高松・松山号（TDL・東京 - 高松・松山）<JR四国バス>《ドリーム松山号に移行》
ドリーム静岡・浜松号（東京 - 静岡・浜松）<JR東海バス>《JR東海バスの単独運行化》
ヤキソバEXPRESS（東京 - 富士宮・大石寺）<富士急静岡バス>《富士急静岡バスの単独運行化》
ドリーム和歌山号（新木場・東京・新宿 - 和歌山）<南海ウイングバス南部>《南海ウイングバス南部の単独運行化の後、御坊南海バスが参入。さらに難波経由化などの経路変更によりサザンクロス和歌山号に変更》
金沢エクスプレス号（新宿 - 金沢）<西武バス・西日本JRバス>
圏央道北東エリア連携交流協議会 高速バス実証実験（あみプレミアム・アウトレット - 成田空港）<関東鉄道>《終了》
ドリーム金沢号（東京 - 富山・金沢）<西日本JRバス>《グランドリーム金沢号に移行》
常陸太田号（新宿・東京 - 常陸太田）<茨城交通>《茨城交通の単独運行化》
プレミアム昼特急号（東京 - 京都・大阪）<西日本JRバス>《青春昼特急号に変更》
ドリームなごや・新宿号（東京・新宿 - 名古屋）<JR東海バス>《青春ドリームなごや号に変更》
ドリームなごや・三河号（東京・新宿 - 名古屋）<同上>《青春ドリームなごやに変更》
ドリーム松山号《JRバス関東撤退》
ドリーム高知・徳島号（東京ディズニーランド(TDL)・東京・新宿 - 徳島・高知）<JR四国バス>《廃止》
スカイツリーシャトル（東京 - 両国・江戸東京博物館前 - 東武ホテルレバント東京 - 東京スカイツリータウン）< 東武バスセントラル>
2012年（平成24年）5月22日 - 運行開始。1日44往復。
2013年（平成25年）4月16日 - 1日36往復に減便。
2014年（平成26年）8月1日 - 朝夕の一部便が「東武ホテルレバント東京」（錦糸町）を経由。ダブルデッカー使用便が朝の東京発1便（1便減便）のみとなる（当該便ではSuica・PASMOの使用及び車内精算は不可）。
2015年（平成27年）4月1日 - 1日22.5往復（下り23本、上り22本）に減便。JRバス関東担当便は下り5本、上り4本のみとなる。
2015年（平成27年）5月11日 - 「両国・江戸東京博物館」バス停を新設（一部便を除き停車）。1日フリーパス券の発売を開始。
2016年（平成28年）12月22日 - 1日12.5往復（下り13本、上り12本）に減便。JRバス関東便は1日4往復となる。
2019年（平成31年）3月31日 - この日の運行をもって廃止。
中央道昼特急号（東京・新宿 - 大阪・なんば）<西日本JRバス>
東京 - 御殿場・箱根線 <小田急箱根高速バス>《小田急箱根高速バスの単独運行化→休止》
あぶくま号（新宿 - 郡山）<JRバス東北・福島交通>
中央ドリーム号・青春中央エコドリーム号（東京・新宿 - 大阪・USJ）<西日本JRバス>
新宿君津号（新宿 - 君津）<日東交通>《新宿なのはな号に統合》
東京駅 - 流山おおたかの森・柏の葉キャンパス線 <東武バスセントラル、京成バス>
秦野丹沢登山号（東京 - 秦野丹沢登山口大倉）
2021年9月11日運行開始。
2022年4月2日より東名高速上のバス停（東名向ヶ丘、東名江田、東名大和）に停車。同年4月17日より新東名高速道路経由に変更、所要時間を短縮。
2022年9月30日をもって路線廃止。
はさき号（東京 - 神栖・波崎）< 関東鉄道>
2023年3月31日をもって撤退
東京 - 富里・航空科学博物館・多古台BT < 千葉交通>
2023年11月30日をもって撤退
中央ライナーなごや号（東京・新宿 - 名古屋）
青春ドリーム信州号（軽井沢・小諸・佐久平・長野 - 京都・大阪）< 西日本JRバス>
2024年6月1日より運行休止
新宿いわき号（新宿 - 北茨城IC・いわき）
2024年6月30日をもって廃止