比叡 (戦艦)
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午後0時30分、阿部司令官は比叡の処分を命令した。1時30分、阿部司令官は比叡処分のため「各艦魚雷2本ヲ準備シオケ」と命令した。
西田艦長は艦の保全に努力していたが、機関室全滅の報告を受けるとついに諦めて総員退艦準備、総員後甲板を下令した。坂本（比叡信号長）は、右舷機械室に命中した魚雷は不発だったが、魚雷命中と同時に命中した爆弾の火災により「機械室全滅」の誤報が西田艦長の元に届いたと推測している。最終的に、比叡には魚雷4本以上が命中したと推定される。西田艦長は後部砲塔の上から乗組員に対して訓示を行い、最後に総員退艦と注水弁（キングストン弁）開けを命じた。
乗組員がカッターボートで駆逐艦に移乗を始めた時、右舷後甲板から海面まで2mもなかったという。西田艦長はこの期に至っても比叡とともに自決するつもりで、総員退艦下命後も生還を望む部下達と1時間半にも渡る押し問答をしていた。それを察知した雪風艦上の阿部司令官は、直筆の命令書を比叡に送り、比叡の現状報告のため「雪風に移乗するように」と命令したが、西田艦長はこれも無視した。比叡上甲板が波に洗われる状態となったとき、もはや説得は不可能と判断した部下が西田艦長の手足を掴んで担ぎ上げ、強引にカッターボートに載せて比叡を離れた。雪風移乗後に比叡の機関室が無事だったことが判明したが、もはや手遅れであった。午後4時、比叡乗組員は随伴駆逐艦に移乗を完了、阿部司令官は第27駆逐隊（時雨、白露、夕暮）に比叡雷撃処分を命じた。
時雨等による魚雷処分直前の午後4時40分前後、阿部中将に山本司令長官より「比叡の処分待て」の命令がある。これを受けて第27駆逐隊司令駆逐艦（時雨）に雷撃中止命令が出た。この少し前、トラック島の戦艦大和の連合艦隊司令部では比叡処分を巡って対立があった。宇垣の『戦藻録』によれば、比叡は味方航空機行動圏内にいることから、宇垣は放置して様子を見ることを考えていた。すると山本長官が宇垣の部屋を訪れ『如何にも明日の撮影に依り宣伝の国米国に利用せらるる事心苦し。サインはしたるも如何かと思ふ』との心中を述べた。宇垣は山本長官の提案に同意して比叡の処分を決定しかけたが、黒島先任参謀が「比叡が浮いている限り輸送船団に対する攻撃を吸収する可能性がある」と反論した。山本長官は黒島の主張を採用し、比叡の処分命令を撤回したのである。宇垣は「中将たる司令官の意志を酌み長官の立場に於て其の責を引受くるの心情及敵手に委して機密暴露の惧を来たす事なからしむるの用心ある事なり。先の見えざる主張は理屈に偏して之等機微の点を解し得ざるものあるのみ」と記した。第十一戦隊参謀として現場(駆逐艦雪風)にいた千早正隆は「宇垣は現場の事情を少しは理解しているが、黒島は全く理解していない」と評している。
第十一戦隊戦闘詳報によれば阿部司令官が第27駆逐隊司令駆逐艦（時雨）に「処分待て」を命令して雷撃処分を中止しており、魚雷発射の記録はない。「西田は雪風の艦内で魚雷発射音を聞いた」との記述は吉田俊雄（元軍令部参謀で、第3次ソロモン海戦には参加していない）の昭和31年の著書『海戦』による。また「雪風が魚雷2本を発射した」は同じく吉田の昭和41年の著書『軍艦十二隻の悲劇』による。
雷撃処分が実行された描写は吉田の考察に基づくもので、吉田は昭和48年の著書『戦艦比叡』でも比叡沈没に際し『海戦』と同様の場面を書いたが、その後書きで比叡が雷撃処分されたと推測した理由を説明している。当時の吉田は「本当に比叡のキングストン弁を開いたかどうか多少の疑問が残っている。仮にキングストン弁を開いていなかったとしたら、比叡が沈むのに十分な海水が艦内に入らない」と考えており、戦闘概報や戦闘詳報の記録に反して比叡が雷撃処分される展開を記述したと述べている。吉田は雑誌丸昭和33年1月号（1957年11月発行）でも護衛駆逐艦に雷撃処分される比叡の最後を記したが、記事の冒頭で「読まれる方へ」と欄を設け、「内容について責任はすべて筆者にある」、「比叡の最後の是非について現在も重要な問題が残っており、事態を明確にするには詳細に亘らなければならないが、誌面の都合で割愛した」と断りを入れるなど、自身の記述の不明確さと文責について警告している。
吉田の疑念に反して、柚木哲（比叡発令所所長）が、司令部の命令の趣旨に従い西田艦長が機関長に注水弁開けを伝達し、最後に柚木が艦内下甲板まで巡回して兵の脱出を確認した際に注水弁を開いた兵からも実行を確認したので間違いないと証言した。柚木発令所所長からこの証言を得た豊田穣は、昭和52年の著書『四本の火柱』で「比叡の自沈は注水弁開放による」と記した。また安田喜一郎（比叡砲塔長）が自沈のため注水弁を開けたと言う証言がある。
吉田は平成7年の著書『日本帝国海軍はなぜ敗れたか 戦後五十年目の総括』の中で「比叡はキングストン弁開放による自沈」と記し、「比叡のキングストン弁は開かれず、味方の魚雷によって沈められた」と言う嘗ての見解を翻した。
西田艦長が戦闘詳報の草稿として作成したメモ（作成日は第三次ソロモン海戦から一週間後の11月20日）には、「雪風に収容された後、GF司令部から「比叡の処分待て」の命令があり、それならば比叡に帰還すべきと申し出たが許されず、遂に比叡をそのままにして海域を離れた」とあり、比叡の雷撃処分は実行されていないと記録されている。雪風の水雷員兼暗号担当や、同じく比叡を護衛していた照月主計長も連合艦隊からの命令により駆逐艦による比叡の雷撃処分は中止されたと証言しており、これらの証言は第十一戦隊戦闘詳報の記録とも合致している。
午後5時、駆逐艦5隻（雪風、照月、時雨、白露、夕暮）は、ガ島飛行場砲撃にむかう外南洋部隊支援隊（指揮官西村祥治第七戦隊司令官）と同士討ちすることを避けるため、比叡の傍を離れてサボ島西方に退避した。放棄時の比叡は右に15度傾斜し、艦尾も沈下していた。午後11時ごろ雪風達が戻ると比叡の姿は既になく、沈没したものと判定された。また、同じく比叡が沈んだかどうかの確認と、沈んでいない場合に雷撃処分を行うべくショートランドに向かっていた伊16も比叡が放棄された海域に到着したが、やはり比叡の姿を見つけることはなかった。比叡の戦死者は188名、負傷者は152名だった。比叡に勤務して『最も好きな軍艦の一つ』としている吉田俊雄は著作で「比叡の最期は、しかし、たいへん後味の悪いものであった」と述べている。
翌日、金剛型4番艦霧島も11月15日第2夜戦に参加し、同艦より30年も新しいノースカロライナ級戦艦ワシントン (USS Washington, BB-56)、サウスダコタ級戦艦サウスダコタ (USS South Dakota, BB-57)と交戦、砲撃戦の末に沈没した。金剛型戦艦は一度の海戦で4隻中2隻を喪失した。
本作戦が実行される直前の11月8日、昭和天皇は日露戦争の旅順港閉塞作戦で戦艦2隻（初瀬、八島）が漫然と行動中、ロシア海軍が仕掛けた機雷により沈没したことを引き合いに出し「注意を要す」と警告していた。日本海軍は10月16日の戦艦金剛・榛名の飛行場砲撃と同じ手を繰り返し、現存する敵兵力を軽視し、充分な護衛部隊をつけず、結果として2隻（比叡、霧島）を失ったのである。天皇は侍従武官から比叡処分の報告をうけて「残念だが戦果はあり、止むを得ざらん」と評している。
『比叡』という艦名は公表されなかったが、第三次ソロモン海戦で戦艦1隻が沈没、1隻が大破（本当は霧島沈没）したことは報道された。
と評しているが、
とも述べている。
これにより、国民の間に建艦運動が起きている。第十一戦隊幹部と比叡乗組員約1200名は水上機母艦日進に便乗し、内地にむかった。その後、一部は最新鋭の軽巡洋艦大淀に配属され、太平洋戦争終盤を戦うことになった。西田艦長に対しては言い分を聞く査問会すら開催されず、時の海軍大臣・嶋田繁太郎海軍大将により、現役を解き予備役とする懲罰処分を受けた。山本長官はこの処分に激怒し、宇垣纏中将を派遣して抗議したが、もともと山本と嶋田が犬猿の仲であったため裁定は覆らなかった。
西田艦長はその後も閑職を転々として終戦を迎えた。戦後も決して言い訳をすることなく、取材に応じたのも死の数ヶ月前に1度きりであった。
→詳細は「西田正雄」を参照
大分県竹田市にある広瀬神社には第二次改装のとき取り外された比叡のマストがある。
横須賀市衣笠栄町の光心寺には比叡にゆかりのある人らが結成した「軍艦比叡会」が建てた「軍艦比叡鎮魂碑」がある。