大分県の二級水系一覧

大分県の二級水系一覧では、大分県を流れる水系のうち、大分県が管理する二級水系を記述する。1995年4月30日現在、93水系、211河川ある。
リストの順序は、河口の位置を基準に、福岡県境から宮崎県境まで、北から南に向かって並んでいる。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。
| 水系名 | 流路延長(km) | 流域面積(km2) | 河川数 | 河口のある自治体 | 備考 |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- |
| （山国川） | 56.00 | 540.0 | 39 | 中津市 | 一級水系 |
| 蛎瀬川 | 3.00 | 13.4 | 2 | 中津市 |  |
| 自見川 | 2.20 | 3.7 | 2 | 中津市 |  |
| 大江川 | 0.72 | 2.1 | 1 | 中津市 |  |
| 舞手川 | 4.35 | 10.3 | 1 | 中津市 |  |
| 天貝川 | 2.03 | 3.0 | 2 | 中津市 | あまがいがわ |
| 犬丸川 | 23.81 | 27.8 | 13 | 中津市 |  |
| 伊呂波川 | 18.51 | 43.7 | 3 | 宇佐市 |  |
| 山城川 | 1.30 | 9.4 | 1 | 宇佐市 |  |
| 黒川 | 3.70 | 16.7 | 1 | 宇佐市 |  |
| 駅館川 | 14.10 | 15.0 | 23 | 宇佐市 | やっかんがわ |
| 寄藻川 | 17.12 | 33.1 | 6 | 宇佐市、豊後高田市 |  |
| 桂川 | 29.46 | 63.6 | 10 | 豊後高田市 |  |
| 石部川 | 4.50 | 3.4 | 1 | 豊後高田市 |  |
| 広瀬川 | 4.80 | 6.9 | 2 | 豊後高田市 |  |
| 赤坂川 | 2.00 | 11.9 | 1 | 豊後高田市 |  |
| 真玉川 | 11.89 | 20.9 | 2 | 豊後高田市 |  |
| 臼野川 | 3.15 | 5.8 | 1 | 豊後高田市 |  |
| 北川 | 1.80 | 1.7 | 1 | 豊後高田市 |  |
| 堅来川 | 5.00 | 4.7 | 1 | 豊後高田市 |  |
| 羽根川 | 4.50 | 3.9 | 1 | 豊後高田市 |  |
| 竹田川 | 13.53 | 15.8 | 2 | 豊後高田市 |  |
| 見目川 | 5.00 | 4.9 | 1 | 豊後高田市 |  |
| 竹田津川 | 9.50 | 11.5 | 1 | 国東市 |  |
| 伊美川 | 13.64 | 22.3 | 1 | 国東市 |  |
| 櫛木川 | 3.50 | 5.5 | 2 | 国東市 |  |
| 岐部川 | 4.00 | 8.5 | 1 | 国東市 |  |
| 向田川 | 0.48 | 2.6 | 1 | 国東市 |  |
| 来浦川 | 9.06 | 14.5 | 1 | 国東市 |  |
| 深江川 | 2.60 | 2.7 | 1 | 国東市 |  |
| 堅来川 | 3.50 | 5.4 | 2 | 国東市 |  |
| 富来川 | 16.85 | 12.3 | 2 | 国東市 |  |
| 北江川 | 1.50 | 5.8 | 1 | 国東市 |  |
| 田深川 | 14.07 | 20.1 | 2 | 国東市 |  |
| 清流川 | 5.00 | 6.7 | 2 | 国東市 |  |
| 次郎丸川 | 4.70 | 3.9 | 1 | 国東市 |  |
| 重綱川 | 3.00 | 4.2 | 2 | 国東市 |  |
| 内田川 | 3.70 | 2.8 | 1 | 国東市 |  |
| 武蔵川 | 12.00 | 16.8 | 5 | 国東市 |  |
| 小城川 | 2.40 | 2.6 | 1 | 国東市 | おしろがわ |
| 大海田川 | 1.90 | 2.0 | 1 | 国東市 | おおみだがわ |
| 安岐川 | 21.17 | 31.8 | 7 | 国東市 | あきがわ |
| 古町川 | 1.15 | 2.6 | 1 | 杵築市 |  |
| 住吉川 | 0.62 | 4.9 | 1 | 杵築市 |  |
| 天村川 | 3.59 |  | 2 | 杵築市 |  |
| 江頭川 | 3.00 | 7.0 | 1 | 杵築市 |  |
| 高山川 | 9.16 | 16.8 | 4 | 杵築市 |  |
| 八坂川 | 29.78 | 87.6 | 8 | 杵築市 |  |
| 丸尾川 | 3.00 | 5.1 | 2 | 日出町 |  |
| 金井田川 | 1.50 | 11.2 | 1 | 日出町 |  |
| 三川 | 2.10 | 14.6 | 1 | 日出町 |  |
| 江上川 | 0.73 | 1.6 | 1 | 日出町 |  |
| 新川 | 1.78 | 7.5 | 1 | 別府市 |  |
| 春木川 | 6.27 | 8.6 | 1 | 別府市 |  |
| 境川 | 6.90 | 12.2 | 2 | 別府市 |  |
| 朝見川 | 5.03 | 10.9 | 4 | 別府市 |  |
| 祓川 | 4.47 | 7.5 | 1 | 大分市 | はらいがわ |
| 住吉川 | 6.65 | 7.6 | 1 | 大分市 |  |
| （大分川） | 55.00 | 650.0 | 48 | 大分市 | 一級水系 |
| （大野川） | 107.00 | 1465.0 | 138 | 大分市 | 一級水系 |
| 日美天川 | 2.60 |  | 2 | 大分市 | ひみてんがわ |
| 旧日美天川 | 5.00 | 4.7 | 1 | 大分市 |  |
| 江川 | 2.40 |  | 1 | 大分市 |  |
| 丹生川 | 9.13 | 17.3 | 7 | 大分市 | にゅうがわ |
| 本田川 | 5.80 | 5.0 | 1 | 大分市 |  |
| 小猫川 | 4.47 | 3.8 | 3 | 大分市 |  |
| 湊川 | 2.50 | 2.3 | 1 | 大分市 |  |
| 志生木川 | 3.80 | 8.3 | 1 | 大分市 | しゆうきがわ |
| 有屋川 | 2.28 | 2.5 | 1 | 臼杵市 |  |
| 佐志生川 | 2.50 | 5.9 | 1 | 臼杵市 | さしうがわ |
| 下の江川 | 2.01 | 3.9 | 1 | 臼杵市 |  |
| 熊崎川 | 4.80 | 12.9 | 2 | 臼杵市 |  |
| 末広川 | 12.00 | 21.1 | 2 | 臼杵市 |  |
| 臼杵川 | 18.21 | 105.3 | 9 | 臼杵市 |  |
| 海添川 | 2.50 | 4.2 | 2 | 臼杵市 | かいぞえがわ |
| 堅浦川 | 0.59 | 1.4 | 1 | 津久見市 |  |
| 徳浦川 | 1.13 | 3.2 | 1 | 津久見市 |  |
| 青江川 | 7.12 | 14.7 | 4 | 津久見市 |  |
| 津久見川 | 1.50 | 9.0 | 3 | 津久見市 |  |
| 千怒川 | 2.30 | 2.5 | 3 | 津久見市 | ちぬがわ |
| 暁嵐川 | 2.00 | 3.9 | 1 | 佐伯市 | ぎょうらんがわ |
| 狩生川 | 2.60 | 3.9 | 1 | 佐伯市 | かりゅうがわ |
| 戸穴川 | 2.50 | 4.9 | 1 | 佐伯市 | ひあながわ |
| （番匠川） | 38.00 | 464.0 | 52 | 佐伯市 | 一級水系 |
| 吹浦川 | 2.80 | 2.9 | 1 | 佐伯市 |  |
| 色利川 | 2.00 | 6.4 | 1 | 佐伯市 | いろりがわ |
| 畑の浦川 | 3.00 | 6.6 | 2 | 佐伯市 |  |
| 楠本川 | 1.90 | 5.7 | 1 | 佐伯市 |  |
| 正金川 | 1.90 | 3.0 | 1 | 佐伯市 |  |
| 河内川 | 3.20 | 5.8 | 2 | 佐伯市 |  |
| 猪串川 | 0.65 | 0.8 | 1 | 佐伯市 |  |
| 森崎川 | 2.70 | 2.3 | 3 | 佐伯市 |  |
| 芹川 | 3.50 | 4.8 | 1 | 佐伯市 |  |
| 江川 | 1.95 | 3.4 | 1 | 佐伯市 |  |
| 大内川 | 3.65 | 5.0 | 1 | 佐伯市 |  |
| 波当津川 | 2.45 | 4.5 | 1 | 佐伯市 | はとつがわ |
↑  本流のみの面積。