シダ植物
分類の歴史 > 分子系統解析による分類体系

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:  ヒカゲノカズラ科 ミズニラ科 イワヒバ科 種子植物 トクサ科 マツバラン科 ハナヤスリ科 リュウビンタイ科 ゼンマイ科 コケシノブ科 マトニア科 ヤブレガサウラボシ科 ウラジロ科 カニクサ科 フサシダ科 アネミア科 サンショウモ科 デンジソウ科 チルソプテリス科 ロクソマ科 クルキタ科 キジノオシダ科 タカワラビ科 メタキシア科 ディクソニア科 ヘゴ科 サッコロマ科 キストディウム科 ロンキティス科 ホングウシダ科 イノモトソウ科 コバノイシカグマ科 ナヨシダ科 ヌリワラビ科 イワヤシダ科 デスモフレビウム科 ヘミディクティウム科 チャセンシダ科 イワデンダ科 コウヤワラビ科 シシガシラ科 メシダ科 ヒメシダ科 ディディモクラエナ科 キンモウワラビ科 オシダ科 タマシダ科 ツルキジノオ科 ナナバケシダ科 ツルシダ科 シノブ科 ウラボシ科
PPG I
「PPG I」も参照
分子系統解析により、系統関係が明らかになってくるにつれ、維管束植物は小葉植物と大葉植物（大葉シダ植物 + 種子植物）という大きなクレードに分かれることが分かってきた。シダ植物における分子系統樹に基づいた分類体系の先駆けはスミスら (2006)の分類体系である。スミスら (2006)の分類体系では、大葉シダ植物のみを Hasebe et al. (1995)、Pryer et al. (2004)、Schneider et al. (2004)、Korall  et al. (2006)などの分子系統解析に基づき分類した。その後、ChristenhuszとChase (2014)はSchuettpelz and Pryer (2007)、Lehtonen (2011)、Rothfels et al. (2012)およびSchneider et al. (2013)の分子系統解析に基づき分類した。現在では、小葉植物、大葉シダ植物を包括的に扱った community-derived（研究者のコミュニティで広く受け入れられている分類を整理したもの）のPPG I分類体系が提案されている。
以下に上記の3分類体系の科までの比較を示す（Christenhusz & Chase (2014)では亜科まで）。和名は主に『岩波生物学辞典 第5版』 (2013)、海老原 (2016; 2017)に基づく。ただし、各分類群を対応させるため Smith et al. (2006)ではトクサ綱とマツバラン綱の順番を実際の論文と逆に示している。
| Smith et al>  (2006) | Christenhusz & Chase (2014) | PPG I (2016) |
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| （なし） | ヒカゲノカズラ類 Lycopodiophyta | ヒカゲノカズラ綱 Lycopodiopsida |
| （なし） |  ヒカゲノカズラ亜綱 Lycopodiidae ヒカゲノカズラ目Lycopodiales  イワヒバ目 Selaginellales  ミズニラ目 Isoëtales |  ヒカゲノカズラ目 Lycopodiales  ミズニラ目 Isoëtales  イワヒバ目 Selaginellales |
| 大葉シダ植物 Moniliformopses | シダ類 Polypodiophyta | ウラボシ綱 Polypodiopsida |
 トクサ綱 Equisetopsida (Sphenopsida) トクサ目 Equisetales トクサ科 Equisetaceae:  トクサ亜綱 Equisetidae トクサ目 Equisetales トクサ科 Equisetaceae
|  マツバラン綱 Psilotopsida ハナヤスリ目 Ophioglossales ハナヤスリ科 Ophioglossaceae  マツバラン目 Psilotales マツバラン科 Psilotaceae |  ハナヤスリ亜綱 Ophioglossidae ハナヤスリ目 Ophioglossales ハナヤスリ科 Ophioglossaceae  マツバラン目 Psilotales マツバラン科 Psilotaceae |  ハナヤスリ亜綱 Ophioglossidae マツバラン目 Psilotales マツバラン科 Psilotaceae  ハナヤスリ目 Ophioglossales ハナヤスリ科 Ophioglossaceae |
|  リュウビンタイ綱 Marattiopsida リュウビンタイ目 Marattiales リュウビンタイ科 Marattiaceae |  リュウビンタイ亜綱 Marattidae リュウビンタイ目 Marattiales リュウビンタイ科 Marattiaceae ダナエア亜科 Danaeoideae  リュウビンタイ亜科 Marattioideae |  リュウビンタイ亜綱 Marattiidae リュウビンタイ目 Marattiales リュウビンタイ科 Marattiaceae |
|  ウラボシ綱 Polypodiopsida (Filicopsida) ゼンマイ目 Osmundales ゼンマイ科 Osmundaceae  コケシノブ目 Hymenophyllales コケシノブ科 Hymenophyllaceae  ウラジロ目 Gleicheniales ウラジロ科 Gleicheniaceae  ヤブレガサウラボシ科 Dipteridaceae  マトニア科 Matoniaceae  フサシダ目 Schizaeales カニクサ科 Lygodiaceae  アネミア科 Anemiaceae  フサシダ科 Schizaeaceae  サンショウモ目 Salviniales デンジソウ科 Marsileaceae  サンショウモ科 Salviniaceae  ヘゴ目 Cyatheales チルソプテリス科 Thyrsopteridaceae  ロクソマ科 Loxsomataceae  クルキタ科 Culcitaceae  キジノオシダ科 Plagiogyriaceae  タカワラビ科 Cibotiaceae  ヘゴ科 Cyatheaceae  ディクソニア科 Dicksoniaceae  メタキシア科 Metaxyaceae  ウラボシ目 Polypodiales ホングウシダ科 Lindsaeaceae  サッコロマ科 Saccolomataceae  コバノイシカグマ科 Dennstaedtiaceae  イノモトソウ科 Pteridaceae  （真正薄嚢シダ類Ⅱ "Eupolypods II"） チャセンシダ科 Aspleniaceae  ヒメシダ科 Thelypteridaceae  イワデンダ科 Woodsiaceae  シシガシラ科 Blechnaceae  コウヤワラビ科 Onocleaceae  （真正薄嚢シダ類Ⅰ "Eupolypods I"） オシダ科 Dryopteridaceae  ツルキジノオ科 Lomariopsidaceae  ナナバケシダ科 Tectariaceae  ツルシダ科 Oleandraceae  シノブ科 Davalliaceae  ウラボシ科 Polypodiaceae |  ウラボシ亜綱 Polipodiidae ゼンマイ目 Osmundales ゼンマイ科 Osmundaceae  コケシノブ目 Hymenophyllales コケシノブ科 Hymenophyllaceae  ウラジロ目 Gleicheniales ウラジロ科 Gleicheniaceae  ヤブレガサウラボシ科 Dipteridaceae  マトニア科 Matoniaceae  フサシダ目 Schizaeales フサシダ科 Schizaeaceae カニクサ亜科 Lygodioideae  フサシダ亜科 Schizaeoideae  アネミア亜科 Anemioideae  サンショウモ目 Salviniales デンジソウ科 Marsileaceae  サンショウモ科 Salviniaceae  ヘゴ目 Cytheales ヘゴ科 Cyatheaceae チルソプテリス亜科 Thyrsopteridoideae  ロクソマ亜科 Loxsomatoideae  クルキタ亜科 Culcitoideae  キジノオシダ亜科 Plagiogyroideae  タカワラビ亜科 Cibotioideae  ヘゴ亜科 Cyatheoideae  ディクソニア亜科 Dicksonioideae  メタキシア亜科 Metaxyoideae  ウラボシ目 Polypodiales キストディウム科 Cystodiaceae  ロンキティス科 Lonchitidaceae  ホングウシダ科 Lindsaeaceae  サッコロマ科 Saccolomataceae  コバノイシカグマ科 Dennstaedtiaceae  イノモトソウ科 Pteridaceae リシリシノブ亜科 Cryptogrammoideae  ミズワラビ亜科 Ceratopteridoideae  イノモトソウ亜科 Pteridoideae  subfamily Chelianthoideae  シシラン亜科 Vittarioideae  チャセンシダ科 Aspleniaceae ナヨシダ亜科 Cystopteridoideae  ヌリワラビ亜科 Rhachidosoroideae  イワヤシダ亜科 Diplaziopsidoideae  チャセンシダ亜科 Asplenioideae  ヒメシダ亜科 Thelypteridoideae  イワデンダ亜科 Woodsioideae  メシダ亜科 Athyrioideae  シシガシラ亜科 Blechnoideae  ウラボシ科 Polypodiaceae subfamily Didymochlaenoideae  キンモウワラビ亜科 Hypodematioideae  オシダ亜科 Dryopteridoideae  ツルキジノオ亜科 Lomariopsidoideae  ナナバケシダ亜科 Tectarioideae  ツルシダ亜科 Oleandroideae  シノブ亜科 Davallioideae  ウラボシ亜科 Polypodioideae |  ウラボシ亜綱 Polypodiidae ゼンマイ目 Osmundales ゼンマイ科 Osmundaceae  コケシノブ目 Hymenophyllales コケシノブ科 Hymenophyllaceae  ウラジロ目 Gleicheniales マトニア科 Matoniaceae  ヤブレガサウラボシ科 Dipteridaceae  ウラジロ科 Gleicheniaceae  フサシダ目 Schizaeales カニクサ科 Lygodiaceae  フサシダ科 Schizaeaceae  アネミア科 Anemiaceae  サンショウモ目 Salviniales サンショウモ科 Salviniaceae  デンジソウ科 Marsileaceae  ヘゴ目 Cyatheales チルソプテリス科 Thyrsopteridaceae  ロクソマ科 Loxsomataceae  クルキタ科 Culcitaceae  キジノオシダ科 Plagiogyriaceae  タカワラビ科 Cibotiaceae  メタキシア科 Metaxyaceae  ディクソニア科 Dicksoniaceae  ヘゴ科 Cyatheaceae  ウラボシ目 Polypodiales サッコロマ亜目 Saccolomatineae サッコロマ科 Saccolomataceae  ホングウシダ亜目 Lindsaeineae キストディウム科 Cystodiaceae  ロンキティス科 Lonchitidaceae  ホングウシダ科 Lindsaeaceae  イノモトソウ亜目 Pteridineae イノモトソウ科 Pteridaceae  コバノイシカグマ亜目 Dennstaedtiineae コバノイシカグマ科 Dennstaedtiaceae  チャセンシダ亜目（= 真正薄嚢シダ類Ⅱ） Aspleniineae ナヨシダ科 Cystopteridaceae  ヌリワラビ科 Rhachidosoraceae  イワヤシダ科 Diplaziopsidaceae  デスモフレビウム科 Desmophlebiaceae  ヘミディクティウム科 Hemidictyaceae  チャセンシダ科 Aspleniaceae  イワデンダ科 Woodsiaceae  コウヤワラビ科 Onocleaceae  シシガシラ科 Blechnaceae  メシダ科 Athyriaceae  ヒメシダ科 Thelypteridaceae  ウラボシ亜目（= 真正薄嚢シダ類Ⅰ） Polypodiineae ディディモクラエナ科 Didymochlaenaceae  キンモウワラビ科 Hypodematiaceae  オシダ科 Dryopteridaceae  タマシダ科 Nephrolepidaceae  ツルキジノオ科 Lomariopsidaceae  ナナバケシダ科 Tectariaceae  ツルシダ科 Oleandraceae  シノブ科 Davalliaceae  ウラボシ科 Polypodiaceae |
シダ植物の生活環（世代交代）
diploid generation: 複相世代、haploid generation: 単相世代、(developing/mature) sporophyte:（未熟な/成熟した）胞子体、meiosis: 減数分裂、spores: 胞子、mitosis: 有糸分裂、prothallus (gametophyte): 前葉体（配偶体）、male/female gametes: 雄性/雌性配偶子、fertilisation: 受精
前葉体と発芽したばかりの本体（コウヤワラビ）