熊本県の市町村旗一覧
廃止された市町村旗

| 市郡 | 町村 | 市町村旗 | 制定有無 | 制定日 | 廃止日 | 旗の色 | 備考 |
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| 飽託郡 | 北部町 |  | なし | なし | 1991年2月1日 | - |  |
| 飽託郡 | 河内町 | （著作権存続） | なし | なし | 1991年2月1日 | - |  |
| 飽託郡 | 飽田町 | （著作権存続） | なし | なし | 1991年2月1日 | - |  |
| 飽託郡 | 天明町 |  | あり | 1975年9月16日 | 1991年2月1日 | 地色は紺色であり、紋章は黄色が指定されている |  |
| 球磨郡 | 上村 |  | あり | 1973年7月4日 | 2003年4月1日 | 地色は緑色であり、紋章は黄色が指定されている |  |
| 球磨郡 | 免田町 |  | あり | 1982年1月25日 | 2003年4月1日 | 地色は海老茶色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 球磨郡 | 岡原村 | （著作権不明） | なし | なし | 2003年4月1日 | 地色は青色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 球磨郡 | 須恵村 | （著作権不明） | なし | なし | 2003年4月1日 | 地色は緑色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 球磨郡 | 深田村 | （著作権存続） | なし | なし | 2003年4月1日 | 地色は海老茶色であり、紋章は輪の部分は黒色で、矢印の部分は金色が指定されている |  |
| 天草郡 | 大矢野町 |  | なし | なし | 2004年3月31日 | 地色は青色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 天草郡 | 松島町 |  | なし | なし | 2004年3月31日 | - |  |
| 天草郡 | 姫戸町 |  | なし | なし | 2004年3月31日 | - |  |
| 天草郡 | 龍ヶ岳町 |  | なし | なし | 2004年3月31日 | - |  |
| 下益城郡 | 中央町 | （著作権存続） | なし | なし | 2004年11月1日 | - |  |
| 下益城郡 | 砥用町 |  | なし | なし | 2004年11月1日 | - |  |
| 葦北郡 | 芦北町 |  | なし | なし | 2005年1月1日 | - |  |
| 葦北郡 | 田浦町 | （著作権存続） | なし | なし | 2005年1月1日 | - |  |
| 宇土郡 | 三角町 |  | なし | なし | 2005年1月15日 | - |  |
| 宇土郡 | 不知火町 | （著作権存続） | なし | なし | 2005年1月15日 | - |  |
| 下益城郡 | 松橋町 |  | なし | なし | 2005年1月15日 | - |  |
| 下益城郡 | 小川町 |  | なし | なし | 2005年1月15日 | - |  |
| 下益城郡 | 豊野町 |  | あり | 1968年9月26日 | 2005年1月15日 | 地色は臙脂色であり、紋章は白色が指定されている | 豊野村旗として制定され、町制施行後に継承された |
| 山鹿市 |  |  | あり | 1984年5月 | 2005年1月15日 | 地色は臙脂色であり、紋章は白色が指定されている | 初代の市旗である |
| 鹿本郡 | 鹿北町 |  | なし | なし | 2005年1月15日 | - |  |
| 鹿本郡 | 菊鹿町 | （著作権存続） | なし | なし | 2005年1月15日 | - |  |
| 鹿本郡 | 鹿本町 |  | なし | なし | 2005年1月15日 | - |  |
| 鹿本郡 | 鹿央町 | （著作権存続） | なし | なし | 2005年1月15日 | - |  |
| 阿蘇郡 | 一の宮町 |  | あり | 1981年11月15日 | 2005年2月11日 | 地色は臙脂色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 阿蘇郡 | 阿蘇町 |  | あり | 1998年3月2日 | 2005年2月11日 | 地色は濃紫色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 阿蘇郡 | 波野村 |  | なし | なし | 2005年2月11日 | - |  |
| 阿蘇郡 | 蘇陽町 |  | あり | 1972年12月7日 | 2005年2月11日 | 色は緑色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 上益城郡 | 矢部町 |  | あり | 1955年2月1日 | 2005年2月11日 | 色は臙脂色であり、紋章は白色と黄色が指定されている |  |
| 上益城郡 | 清和村 |  | あり | 1956年7月1日 | 2005年2月11日 | 色は臙脂色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 阿蘇郡 | 白水村 |  | なし | なし | 2005年2月13日 | - |  |
| 阿蘇郡 | 久木野村 |  | なし | なし | 2005年2月13日 | - |  |
| 阿蘇郡 | 長陽村 |  | なし | なし | 2005年2月13日 | - |  |
| 菊池市 |  |  | なし | なし | 2005年3月22日 | 地色は臙脂色であり、紋章は白色が指定されている | 初代の市旗である |
| 菊池郡 | 七城町 |  | あり | 1989年3月22日 | 2005年3月22日 | 地色は紫色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 菊池郡 | 旭志村 | （著作権存続） | なし | なし | 2005年3月22日 | - |  |
| 菊池郡 | 泗水町 |  | あり | 1970年10月1日 | 2005年3月22日 | 地色は青色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 八代市 |  |  | あり | 1970年8月17日 | 2005年8月1日 | 地色は白色であり、紋章は濃緑色が指定されている | 初代の市旗である |
| 八代郡 | 鏡町 |  | なし | なし | 2005年8月1日 | 地色は緑色であり、紋章は橙色・縁部分は白色が指定されている |  |
| 八代郡 | 東陽村 |  | あり | 1971年11月1日 | 2005年8月1日 | 地色は濃紺色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 八代郡 | 千丁町 |  | なし | なし | 2005年8月1日 | 地色は緑色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 八代郡 | 坂本村 |  | あり | 1967年6月1日 | 2005年8月1日 | 地色は青色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 八代郡 | 泉村 |  | あり | 1969年12月20日 | 2005年8月1日 | 指定されていない 慣例として地色は臙脂色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 八代郡 | 竜北町 |  | なし | なし | 2005年10月1日 | - |  |
| 八代郡 | 宮原町 | （著作権存続） | なし | なし | 2005年10月1日 | - |  |
| 玉名市 |  |  | あり | 1954年7月18日 | 2005年10月3日 | 地色は黄緑色であり、紋章は白色が指定されている | 初代の市旗である |
| 玉名郡 | 岱明町 |  | なし | なし | 2005年10月3日 | - |  |
| 玉名郡 | 横島町 | （著作権存続） | なし | なし | 2005年10月3日 | - |  |
| 玉名郡 | 天水町 | （著作権存続） | なし | なし | 2005年10月3日 | - |  |
| 菊池郡 | 合志町 |  | なし | なし | 2006年2月27日 | - |  |
| 菊池郡 | 西合志町 |  | なし | なし | 2006年2月27日 | - |  |
| 玉名郡 | 菊水町 | （著作権存続） | なし | なし | 2006年3月1日 | - |  |
| 玉名郡 | 三加和町 |  | なし | なし | 2006年3月1日 | - |  |
| 本渡市 |  |  | あり | 1954年12月22日 | 2006年3月27日 | 地色は水色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 牛深市 |  |  | あり | 1954年10月20日 | 2006年3月27日 | 地色は紫色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 天草郡 | 有明町 |  | あり | 1966年11月15日 | 2006年3月27日 | 地色は紺色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 天草郡 | 御所浦町 |  | あり | 1973年11月1日 | 2006年3月27日 | 地色は藍色（海の色）であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 天草郡 | 倉岳町 |  | なし | なし | 2006年3月27日 | - |  |
| 天草郡 | 栖本町 |  | あり | 1993年6月24日 | 2006年3月27日 | 地色は紺色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 天草郡 | 新和町 | （著作権存続） | なし | なし | 2006年3月27日 | - |  |
| 天草郡 | 五和町 |  | なし | なし | 2006年3月27日 | - |  |
| 天草郡 | 天草町 |  | なし | なし | 2006年3月27日 | - |  |
| 天草郡 | 河浦町 |  | なし | なし | 2006年3月27日 | - |  |
| 下益城郡 | 富合町 |  | なし | なし | 2008年10月6日 | 地色は臙脂色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 下益城郡 | 城南町 |  | なし | なし | 2010年3月23日 | 地色は緑色であり、紋章は白色が指定されている |  |
| 鹿本郡 | 植木町 |  | あり | 1980年1月1日 | 2010年3月23日 | 地色は海老茶色であり、紋章は白色が指定されている |  |