ニッポン放送
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2000年（平成12年）
3月25日：ニュース、交通情報のジングルを塩塚博作曲のものに変更し、2011年7月まで使用。
12月1日：BSフジの超短波放送チャンネルの一つとして「LFX488」の放送を開始。『ブロードバンド!ニッポン』など一部番組はインターネットラジオとしても送信する。BSデジタルラジオ用サイトlfx488.comを開設する。
インターネットショップを開設。
2001年（平成13年）
BSデジタルラジオ用サイトを、lfx.jpへ移転。
8月：旧糖業会館ビルの解体開始。
11月：フジテレビ系列で『福山雅治と西川貴教のオールナイトニッポンTV』を放送。
2003年（平成15年）
3月31日：新年度開始・「LF+R」ブランド廃止と同時に夜番組のサイト「allnightnippon.com」公式ウェブサイトを刷新。
7月：村上ファンドがニッポン放送発行済み株式の7%を取得し、以後2004年3月までに19%近くまで買い増して筆頭株主となる。
10月10日：エフエム東京、ジャパンエフエムネットワークと共同で地上デジタルラジオ実用化試験放送「Digital Radio 98 The Voice」を開始。1セグメント放送だけでなく3セグメント放送の試験放送も行う。
2004年（平成16年）
3月29日：新年度開始と同時に昼番組のサイト「1242.com」、夜番組のサイト「allnightnippon.com」、会社要覧・ラジオリビングのサイト「jolf.co.jp、jolf.net」の各全公式ウェブサイトを刷新。
7月15日：開局50周年を記念した特別番組「ニッポン放送開局記念日スペシャル 笑顔が一番!あなたと一緒に50年」を放送。
9月6日：糖業会館・ニッポン放送本社ビルが竣工し、FCGビルから8年ぶりに有楽町に戻る。
2005年（平成17年）
ここからの事象はニッポン放送の経営権問題も参照のこと。
1月17日：フジテレビジョンがニッポン放送発行済み株式の公開買付（TOB）を発表。両社の資本関係を逆転させてフジテレビの子会社となる予定だった。
2月8日：インターネット関係会社ライブドアが子会社のライブドア・パートナーズと合わせて株式の35%を取得し、ライブドアグループが筆頭株主となる。
2月10日：フジテレビが、ニッポン放送株式TOBの株式保有比率目標を「50%超」から「25%超」に引き下げ、買い付けの期限を3月2日まで延長すると発表する。
2月23日：フジテレビに4720万株分の新株予約権を割り当てると発表。
2月25日：ライブドアがフジテレビを対象とした新株予約権発行を不服として東京地裁に発行差し止めの仮処分を申請。
3月8日：フジテレビのニッポン放送株式TOBが成立し、発行済み株式総数3280万株の36.47%を取得したと発表。
3月11日：ライブドアの差止請求が認められて上記の新株予約権発行は無効となり、ニッポン放送は東京高裁に対して即日抗告する。
3月23日：上記の新株予約権発行差し止めの仮処分を不服としたニッポン放送の東京高裁に対する抗告が棄却され、新株予約権発行を断念する。
3月24日：ニッポン放送はソフトバンク・インベストメント（SBI）に、ニッポン放送が現在所有するフジテレビ株を5年間の期限付きで貸し与えた。
3月27日：1955年以来、50年間続いた長寿番組『新日鉄コンサート』が終了。
4月：ビデオリサーチ首都圏ラジオ聴取率調査で首位。
4月18日：ライブドアとフジテレビが和解し、ライブドアグループが所有するニッポン放送株式全てをフジテレビに譲渡すると発表。フジテレビによる完全子会社化に目途が立つ。
4月22日：ライブドアが「ニッポン放送株式をフジテレビと“共同保有している”」とした「大量保有報告書」を関東財務局に提出。
5月23日：フジテレビがライブドア・パートナーズを買収し同社の商号を「LFホールディングス」（2006年4月に存在した「ニッポン放送ホールディングス」とは別の会社で、2005年7月12日にフジテレビと合併）に変更し、フジテレビ保有のニッポン放送株式が合わせて68.87%となる。フジテレビによるニッポン放送の子会社化を円滑に進めるため、産業活力再生特別措置法の適用認定を申請。
5月24日：ニッポン放送株式を東京証券取引所が監理ポストに割り当てる。
5月25日：ニッポン放送が自社株式のTOBを開始する。
6月10日：総務省が産業活力再生特別措置法の適用を認定。
6月16日：ニッポン放送による自社株式のTOBが完了し、ライブドアが保有する株式の大半を含む964万株を取得する。ライブドアは主要株主から外れる。
6月22日：フジテレビの深夜ドラマ枠『ディビジョン1』で、ニッポン放送のオールナイトニッポン制作現場を舞台としたドラマ『1242kHz こちらニッポン放送』が放送を開始。22日深夜（23日未明）放送の『松浦亜弥のオールナイトニッポン』でドラマの模様を解説する。
6月24日：磯原裕専務が社長に就き、亀渕昭信社長は退任して相談役に就く。
6月28日：ニッポン放送株式が東京証券取引所の整理ポストに移行。
6月30日：SBIに貸し出されていたフジテレビ株式がニッポン放送に返却され、ニッポン放送がフジテレビの筆頭株主に復活。
7月28日：ニッポン放送株式が東京証券取引所の上場を廃止。
9月1日：フジテレビと株式交換を実施し、フジテレビによるニッポン放送の完全子会社化が完了。
10月3日：「ニッポン放送Podcasting STATION」を開設し、ポッドキャスティングによるインターネットラジオ配信を開始。
2006年（平成18年）
1月19日：総務省がニッポン放送のラジオ事業部門の会社分割に伴う免許承継を認可。
3月31日：BSフジの超短波放送チャンネル撤退に伴い「LFX488」の放送を終了し、4月1日付けでインターネットラジオ「LFX BB」と統合してステーション名を「LFX mudigi」に改称。
4月1日（休日につき、登記は4月3日に実施）：（旧）「株式会社ニッポン放送」保有の資産をフジテレビに吸収させるため会社分割を実施し、社名を「株式会社ニッポン放送ホールディングス」に商号変更すると共に、中波放送局免許及び中波ラジオ放送事業を、新たに設立した（新）「株式会社ニッポン放送」に承継。ロゴマークも新会社がそのまま承継。
「ニッポン放送ホールディングス」をフジテレビが吸収合併。フジテレビは（旧）ニッポン放送が保有していたフジテレビ株式の20.80%とニッポン放送子会社ポニーキャニオンなどの株式を取得し、ニッポン放送保有のフジテレビ株式がなくなるとともに、ニッポン放送の子会社がフジテレビの直接子会社となりフジテレビが事業持株会社化した。
アナウンサー11人を含む全社員の約2割の47人を除き、全社員がニッポン放送に残留のため（新）「ニッポン放送」へと自動的に転籍し、47人はニッポン放送ホールディングスとフジテレビの合併によりフジテレビへと自動的に転籍となり、完全にフジテレビの社員となった。
8月：ビデオリサーチ首都圏ラジオ聴取率調査で首位。
9月30日：4月の会社再編でフジテレビの社員になっていた自動的に転籍前のニッポン放送アナウンサー全てが番組から降板、もしくは番組終了。
10月1日：地上デジタルラジオ実用化試験放送のチャンネルが、9501チャンネル（愛称mudigi）に移動し、1セグメント放送のみに変更。
2007年（平成19年）
4月2日：LFX mudigiを地上デジタルラジオ実用化試験放送及びインターネット放送を行うデジタルステーションSuono Dolceとして刷新し、同年3月中旬にWebサイトを開設。地上デジタルラジオのチャンネル名をD-JOLFに変更し、サブチャンネルのJOLF+を開始。
10月1日：深夜放送『オールナイトニッポン』放送開始40周年。
2008年（平成20年）
1月29、30日：2008年北京オリンピックハンドボールアジア地区最終予選の再試合を、日本で行われる国際試合としてラジオ史上初のハンドボール実況生中継を放送。ハンドボールのラジオ実況は、1997年世界男子ハンドボール選手権の熊本放送以来である。
2月18日：番組が受け付けるファックス番号を一般電話番号からナビダイヤルへ変更。
2月23日：『オールナイトニッポン』40周年の特別番組として、同日 13:00から翌2月24日 29:00（午前4時）迄『俺たちのオールナイトニッポン40時間スペシャル』を放送。ビートたけし・笑福亭鶴光・タモリ・松任谷由実・ウッチャンナンチャンなどの歴代パーソナリティーが久々に放送し、福山雅治・ナインティナインと現在のパーソナリティも放送した。
9月29日：地上デジタルラジオ「D-JOLF」のサブチャンネル「JOLF+」を、「ニッポン放送DIGITAL」に改称。地上波ニッポン放送のサイマル放送を開始。
10月1日：フジテレビの持株会社化により、フジ・メディア・ホールディングスの完全子会社となる。