第二次大陸間戦争
年表

| ZAC暦 | 出来事 |
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ZAC2097年: ガイロス皇帝崩御。
ZAC2098年10月: ガイロス帝国にてルドルフ・ツェペリン皇太子が新帝として戴冠。同時にギュンター・プロイツェンが摂政に就任。
西方大陸戦争
ZAC2099年6月: ガイロス帝国軍による西方大陸エウロペ侵攻。トライアングル・ダラスを迂回した帝国軍90個師団が北エウロペ大陸へ上陸。
ZAC2099年8月: ガイロス帝国、宣戦布告。第二次大陸間戦争（西方大陸戦争）勃発。ガイロス帝国の西方大陸侵攻を察知したヘリック共和国軍も西方大陸へ派兵。レッドラスト砂漠にて両軍が初めて激突（第一次全面会戦）。この戦いはガイロス帝国が勝利を収め、帝国軍が同大陸の最大の要衝オリンポス山を制圧。
ZAC2099年9月: オリンポス山中腹にてヘリック共和国のエル・ジー・ハルフォード中佐率いる独立第二高速戦闘大隊とガイロス帝国のステファン・スコルツェニー少尉のセイバータイガーが交戦。激戦の末にセイバータイガーは撃破される。
ZAC2099年10月: 独立第二高速戦闘大隊がオリンポス山山頂の帝国軍基地に到達し、そこで再生させられた実験体デスザウラーと交戦。再生したデスザウラーは不完全ゆえに暴走するが、ハルフォード中佐の決死の行動によりデスザウラーは破壊され、デスザウラー復活計画は阻止された。
ZAC2099年11月: 共和国軍、西方大陸東部へと撤退。トミー・パリス中尉がオリンポス山頂の帝国軍基地跡地より「オーガノイドシステム」のデータを持ち帰る。
ZAC2100年1月: 帝国軍より新システム、オーガノイドシステムを搭載した「ジェノザウラー」がロールアウト。ガイロス本国から派遣されたリッツ・ルンシュテッド中尉をテストパイロットとしての戦闘試験をクリアし、正式配備が決定。
ZAC2100年3月: ガイロス帝国軍が未発見遺跡調査のため、エルガイル海岸にリッツの駆るジェノザウラーおよびレブラプターなど新型ゾイド部隊を派兵。共和国軍が阻止のため1個大隊を派遣するも、新型ゾイドの性能の前に防衛線は容易く突破される。後日、共和国軍もジェノザウラーと同じくオーガノイドシステムを持ったアーサー・ボーグマン少佐の「ブレードライガー」を筆頭とする新型ゾイド部隊を同地に送り込み、帝国軍とガリル遺跡にて交戦。遺跡にあった古代ゾイドの核は帝国軍が奪取した。
ZAC2100年5月: 共和国軍は新型飛行ゾイドのストームソーダーにより制空権を確保。帝国軍の補給線を徹底的に叩く。これにより帝国軍の最前線は慢性的な物資不足に陥り、侵攻作戦は一時停滞した。
ZAC2100年6月: 共和国はついに中央大陸に残る本土防衛軍20個師団の西方大陸派遣を決定、ユビト港より同師団が西方大陸に向けて発進する。帝国軍はこれを阻止するべくシンカー大隊を送り込み、デルダロス海にて共和国艦隊を襲撃するが、帝国軍は共和国軍の策にはまり撃退される。
ZAC2100年7月: 帝国軍が陸海からロブ基地を強襲。「第二次全面会戦」の火蓋が切られる。本国から派遣された部隊の再編成が終わらず、動けない共和国軍をプロイツェンが本国より派遣したアイアンコングPKを筆頭とする帝国軍部隊が襲いかかるも傭兵アーバインの操縦する「ゴジュラス・ジ・オーガ」や最新ゾイド、ハンマーヘッドなどの活躍により帝国軍の攻撃は失敗。この戦いで敗れた帝国軍部隊はニクシー基地へ撤退を開始。一方、帝国軍技術部は撤退部隊の護衛のため、リッツのジェノザウラーを「ジェノブレイカー」に改造し、さらに「ライトニングサイクス」および「デススティンガー」を投入した。撤退路のうち南のルートではジェノブレイカーと本国から呼び寄せたブラックライモスの活躍で共和国軍の追撃を振り切ることに成功するが、北のルートではデススティンガーの暴走事故が発生、両軍とも甚大な被害を受ける。
ZAC2100年8月: アーサーのブレードライガーの強化テスト実施。結果、アタックブースターユニットが採用されることになる。
ZAC2100年9月: 共和国軍は現存する最後のウルトラザウルスを西方大陸に派遣。さらにこのウルトラザウルスを最終兵器1200mmウルトラキャノンを搭載した「ウルトラザウルス・ザ・デストロイヤー」に改装し本機を中核とした「デストロイヤー兵団」を編成。ロブ基地に迫る帝国軍ゾイド5000機を一発の砲撃で撃破し、ニクシー基地への進撃を開始。
ZAC2100年10月: リッツのジェノブレイカーがウルトラザウルス迎撃作戦のため、レッドラストを移動中にアーサーのブレードライガーと遭遇し、交戦。その途中で暴走したデススティンガーが乱入。両者は協力してこのデススティンガーを撃破するもアーサーは戦死。リッツはこの戦いを最後に姿を消し、帝国軍では生死不明とされた。一方、帝国軍の防衛線を突破したデストロイヤー兵団はニクシー基地への砲撃を開始。帝国軍は西方大陸からの完全撤収を決定し、エレファンダーを殿軍として撤退行動に移る。基地内部では先行突入した共和国パイロット、レイ・グレック中尉と謎の男の戦闘があったが、謎の男はティラノサウルス型と思しきゾイドと竜に似た小型ゾイドと共に基地から脱出した。帝国軍は西方大陸から完全に撤退しニクシー基地は共和国のものとなった。
時期不明: ボビー・マクスウェル少佐、完成直後のタイプゼロアーマーを装着したライガーゼロの試験走行中にガイロス帝国軍残党のライトニングサイクスと交戦。脱出に成功する。
暗黒大陸戦争
ZAC2101年1月: ルイーズ・エレナ・キャムフォード共和国大統領は帝国に向けて停戦を勧告するも、帝国はこれを黙殺。基地陥落から二ヵ月後、帝国軍は改造型ホエールキングの「モビーディック」と同艦に搭載されたザバットの部隊によるニクシー基地空爆を敢行。これに対し共和国軍は再配備したサラマンダーをもってモビーディックを撃沈した。
ZAC2101年3月: 帝国軍はさらなる時間稼ぎのためオーガノイドシステムで大量生産したウオディックとインターフェースの力で制御可能にしたデススティンガー改造機のKFD部隊でニクシー基地を襲撃。しかし、閃光師団の活躍によってKFD部隊も全機撃破された。
ZAC2101年6月: 共和国軍、「ウルトラザウルス・ザ・キャリア」を旗艦とする艦隊を編成し、アンダー海より暗黒大陸に向けて出港。迎え撃ってきた帝国艦隊と激突するが、大量生産されたシンカーがウルトラザウルスを猛攻。ウルトラは進路を変え、トライアングル・ダラスへ逃げ込む。共和国艦隊は強電磁波を伴う嵐に巻き込まれ航行不能となるが、そこに謎の小型ゾイドのマッカーチスが現れ、このゾイドの導きで共和国軍はダラス海の電磁波が及ばない安全航路を発見し、暗黒大陸へ上陸した。
ZAC2101年7月: アンダー海の海戦から二週間後、暗黒大陸に上陸した共和国軍はエントランス湾を制圧。先行偵察に出たシャドーフォックスは帝国軍本土守備隊と謎の軍団の戦闘を目の当たりし、謎の軍団は帝国軍本土守備隊を次々と撃破していった。
ZAC2101年8月: 帝国からの激しい抵抗も無く破竹の快進撃を続ける共和国軍の閃光師団は進路の途中で謎の施設を発見する。しかし、それこそ本土防衛隊を壊滅させた謎の部隊「鉄竜騎兵団（アイゼンドラグーン）」の秘密基地であった。「バーサークフューラー」をはじめとする未知のゾイドを操る鉄竜騎兵団の前に閃光師団は全滅の危機に陥るが、共和国司令部が秘かに派遣したガンブラスターの支援によりこの危機を脱する。鉄竜騎兵団は最後の手段として実験型デスザウラー「ブラッディデーモン」を起動させて迎え撃つ。激戦の末にブラッディデーモンは撃破されるが、鉄竜騎兵団の本隊はそのまま中央大陸へ向かった。一方で、共和国軍主力はエントランス湾を橋頭保として進軍を開始。トライアングルダラスを踏まえて別の地域に防衛線を構築していた帝国軍は上陸戦緒戦において敗れる結果となった。
ZAC2101年9月: この戦争に裏があると感じはじめていた共和国のロブ・ハーマン中佐および帝国のカール・リヒテン・シュバルツ中佐はトリム基地で極秘の停戦会談の予定を取り付けるが、それを察知した鉄竜騎兵団の妨害を受けてシュバルツは負傷し、停戦への道のりは遅滞する。
ZAC2101年10月初旬～中旬: 両軍合わせてゾイド10万機、兵員200万人、戦線距離100kmの大会戦が勃発し、暗黒大陸全土が戦火に包まれる。
ZAC2101年下旬: ヴァーヌ平野～セスリムニル市ではデスザウラーおよびマッドサンダー部隊合計80機が激突、第二次大陸間戦争最大の市街戦となり、最終的に全機戦闘不能となるほどの苛烈な戦いが繰り広げられた。戦闘開始から6日後、ハーマンとシュバルツの呼びかけで両軍は戦闘を停止した。
ZAC2101年11月: 雪の降る帝国首都ヴァルハラにて遂にプロイツェンおよびPK師団が帝国に反旗を翻し、ヴァルハラを占拠。臨時同盟を結んだヘリック共和国とガイロス帝国の連合軍がプロイツェンを倒すべくヴァルハラに進撃し、PK師団と激戦を繰り広げる。一方、皇帝官邸地下でも本性を露わにしたプロイツェンの「ブラッディデスザウラー」とルドルフの「セイバータイガーゴールド」との決闘が行われていた。ルドルフはその場に乱入したシュバルツの手で救い出されるが、プロイツェンは乗機の核を自爆させてヴァルハラを破壊。共和国軍と帝国軍にも多大な被害を与えた。
ZAC2101年12月: 鉄竜騎兵団が中央大陸に上陸。中央大陸に残った共和国軍部隊がこれを迎え撃つものの、主戦力の欠如、鉄竜騎兵団のジャミングウェーブ戦法、さらに旧ゼネバス人の反旗などの要因により共和国軍の防衛線は短期間で突破され、そして共和国大統領も行方不明になったことでヘリック共和国は崩壊。最終的には鉄竜騎兵団は中央大陸の完全制覇を果たし、ここにネオゼネバス帝国が誕生する。
ZAC2102年1月: 残存戦力の再編を終えた共和国軍がルドルフとシュバルツに見送られつつエントランス湾から中央大陸へ向けて出港する。
中央大陸大戦
ZAC2102年～2104年: ヘリック共和国中央大陸残存部隊は「ヘリック・クルセイダーズ」として、西方大陸からの小規模な輸送を頼りにゲリラ戦を展開した。これを見越したネオゼネバス帝国軍は外洋部隊と沿岸守備隊を強化し、補給ルートへの攻撃と西方大陸からの上陸阻止を画策している。2104年4月、同年10月の大海戦を経て、2104年末には共和国軍の大規模な中央大陸上陸作戦が敢行されている
ZAC2105年: デルポイ中央山脈にある共和国軍残存部隊の秘密基地を帝国軍が発見。ジーニアス・デルダロス少佐のステルススティンガーおよびダークスパイナーを擁する「黒の竜騎兵団」が同基地を襲撃。同じ基地に居たゴジュラス・ジ・オーガの奮戦でダークスパイナー部隊は倒され、そしてここで建造が進められていた最新型ゾイド「ゴジュラスギガ」がスティブ・ボーン少佐の操縦で起動。このゴジュラスギガの活躍によりステルススティンガーも撃破、黒の竜騎兵団は撤退した。
ZAC2106年早春: 共和国軍の残存部隊、ゴジュラスギガとアロザウラー部隊を前面に立てクック要塞を攻略。
ZAC2106年春: 共和国軍、クック要塞を拠点とし、戦力の回復を画策。しかし、ネオゼネバス帝国は対ゴジュラスギガ用ゾイドの「セイスモサウルス」をロールアウト。セイスモサウルスの超集束荷電粒子砲（通称ゼネバス砲）によるアウトレンジ戦法でゴジュラスギガをはじめとする共和国戦力は壊滅的打撃を受ける。共和国軍は要塞を放棄し、東方大陸へ落ち延びる。
ZAC2106年秋～？: 共和国軍残存部隊、東方大陸の企業「ZOITEC」の助力を得て戦力を再構築し、「凱龍輝」をロールアウト。実戦テストを兼ねて中央大陸南沿岸に奇襲攻撃を敢行。
ZAC2107年: 共和国軍、東北部海岸より中央大陸へ再上陸し、ライガーゼロフェニックス部隊29機を持ってネオゼネバス帝国のキマイラ要塞を攻撃。セイスモサウルスの迎撃によりライガーゼロ部隊およびゴジュラスギガ部隊に多数の犠牲が出るが、凱龍輝部隊の到着で形勢は逆転。ゼロフェニックス部隊はセイスモサウルスの鹵獲に乗り出すも、突如現れた帝国の新型ゾイド「エナジーライガー」の乱入によりセイスモサウルスを取り逃がす。しかし、結果的には共和国軍はこの戦いに勝利し同要塞を陥落させた。
ZAC2108年10月: 共和国軍のレオゲーターをはじめとするブロックスゾイド部隊がウィルソン川水路を攻略。
ZAC2108年11月: 共和国軍のディメトロプテラをはじめとするブロックスゾイド部隊がマウントアーサー防衛線を突破。
ZAC2109年春: 共和国全軍が旧共和国首都であるヘリックシティ奪還に向け進軍。帝国軍は総力の30%の戦力ながらも、ヘリックシティから100キロ北の地点で防衛線を張り、両軍総数10万機超のゾイドが激戦を繰り広げる。一方、都市部では親衛隊に紛れ込んでいた元閃光師団のレイ・グレックのライガーゼロフェニックスとネオゼネバス皇帝のヴォルフ・ムーロアのエナジーライガーが激突。ゼロのアーマーを破壊され危機に陥ったレイの前にZOITECが新たに開発したジェットファルコンが飛来。ライガーゼロは「ライガーゼロファルコン」となってエナジーライガーを撃破。同時刻、前線でもセイスモサウルスがゴジュラスギガと凱龍輝の前に倒れ、勝負はついたかに思われたが、倒されたヴォルフのエナジーライガーの動力機関が暴走を始め、このままでは敵味方に多大な被害が出ると知ったレイとヴォルフは協力してゼロファルコンの機能を使ってエナジーライガーのエネルギーを処理、大爆発の危機を回避した。以降の両軍の歴史については明らかにされていない。