哺乳類レッドリスト (環境省)
リストおよびカテゴリーの変遷 > コウモリ目（翼手目）

| 和名 | 学名 | 1991年版 | 1998年版 | 2007年版 | 2012年版 | 備考 |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- |
オオコウモリ科
| オキナワオオコウモリ | Pteropus loochoensis | 絶滅種 | 絶滅 | 絶滅 | 絶滅 |  |
| ダイトウオオコウモリ | Pteropus dasymallus daitoensis | 希少種 | 絶滅危惧IA類 | 絶滅危惧IA類 | 絶滅危惧IA類 |  |
| エラブオオコウモリ | Pteropus dasymallus dasymallus | 希少種 | 絶滅危惧IA類 | 絶滅危惧IA類 | 絶滅危惧IA類 |  |
| オガサワラオオコウモリ | Pteropus pselaphon | 危急種 | 絶滅危惧IA類 | 絶滅危惧IA類 | 絶滅危惧IB類 |  |
| オリイオオコウモリ | Pteropus dasymallus inopinatus | 希少種 | - | - | - |  |
キクガシラコウモリ科
| ミヤココキクガシラコウモリ | Rhinolophus pumilus miyakonis | 希少種 | 絶滅危惧IA類 | 絶滅危惧IA類 | 絶滅 |  |
| オリイコキクガシラコウモリ | Rhinolophus cornutus orii | - | 絶滅危惧II類 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 |  |
| オキナワコキクガシラコウモリ | Rhinolophus pumilus pumilus | - | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 |  |
| ヤエヤマコキクガシラコウモリ | Rhinolophus perditus | - | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧II類 | 2006年版までは亜種別に評価していた。 |
カグラコウモリ科
| 与那国島のカグラコウモリ | Hipposideros turpis | 希少種 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 | 個体群 | 2006年版までは種で評価していた。 |
| 波照間島のカグラコウモリ | Hipposideros turpis | 希少種 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 | 個体群 | 2006年版までは種で評価していた。 |
ヒナコウモリ科
| オガサワラアブラコウモリ | Pipistrellus sturdeei | 絶滅種 | 絶滅 | 絶滅 | 絶滅 |  |
| クロアカコウモリ | Myotis formosus | 希少種 | 情報不足 | 情報不足 | 絶滅危惧IA類 | 2006年版までは亜種ツシマクロアカコウモリとして評価していた。 |
| ヤンバルホオヒゲコウモリ | Myotis yanbarensis | - | 絶滅危惧IA類 | 絶滅危惧IA類 | 絶滅危惧IA類 |  |
| コヤマコウモリ | Nyctalus furvus | - | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧II類 | 絶滅危惧IB類 |  |
| リュウキュウユビナガコウモリ | Miniopterus fuscus | - | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 |  |
| リュウキュウテングコウモリ | Murina ryukyuana | - | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 |  |
| クビワコウモリ | Eptesicus japonensis | - | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧II類 |  |
| ヤマコウモリ | Nyctalus aviator | - | 絶滅危惧II類 | 準絶滅危惧 | 絶滅危惧II類 |  |
| モリアブラコウモリ | Pipistrellus endoi | 希少種 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧II類 |  |
| ウスリホオヒゲコウモリ | Myotis gracilis | - | 絶滅危惧II類 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧II類 |  |
| ホンドノレンコウモリ | Myotis nattereri bombinus | - | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧II類 | 絶滅危惧II類 |  |
| クロホオヒゲコウモリ | Myotis pruinosus | 希少種 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧II類 |  |
| オオアブラコウモリ | Pipistrellus savii | 希少種 | 情報不足 | 情報不足 | 情報不足 | 2006年版までは亜種別に評価されていた |
| ヒメヒナコウモリ | Vespertilio murinus | - | - | 情報不足 | 情報不足 |  |
| クチバテングコウモリ | Murina tenebrosa | 希少種 | 情報不足 | 情報不足 | 情報不足 |  |
| 本州のチチブコウモリ | Barbastella leucomelas darjelingensis | 希少種 | 絶滅危惧II類 | 地域個体群 | 地域個体群 | 1998年版ではチチブコウモリで評価した。 |
| 四国のチチブコウモリ | Barbastella leucomelas darjelingensis | 希少種 | 絶滅危惧II類 | 地域個体群 | 地域個体群 | 1998年版ではチチブコウモリで評価した。 |
| 近畿地方以西のウサギコウモリ | Plecotus sacrimontis | - | 絶滅危惧II類 | - | 地域個体群 |  |
| 紀伊半島のシナノホオヒゲコウモリ | Myotis ikonnikovi hosonoi | 希少種 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧II類 | 地域個体群 | 1991年版では種ヒメホオヒゲコウモリ、2006年版までは亜種シナノホオヒゲコウモリで評価されていた。 |
| 中国地方のシナノホオヒゲコウモリ | Myotis ikonnikovi hosonoi | 希少種 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧II類 | 地域個体群 | 1991年版では種ヒメホオヒゲコウモリ、2006年版までは亜種シナノホオヒゲコウモリで評価されていた。 |
| ヒメホリカワコウモリ | Eptesicus nilssonii parvus | - | 絶滅危惧IB類 | - | - |  |
| ニホンコテングコウモリ | Murina ussuriensis silvatica | - | 絶滅危惧II類 | - | - |  |
| テングコウモリ | Murina hilgendorfi | - | 絶滅危惧II類 | 絶滅危惧II類 | - | 1998年版ではニホンテングコウモリで評価した。 |
| ウスリドーベントンコウモリ | Myotis daubentonii ussuriensis | - | 絶滅危惧II類 | - | - |  |
| カグヤコウモリ | Myotis frater kaguyae | 希少種 | 絶滅危惧II類 | - | - |  |
| フジホオヒゲコウモリ | Myotis ikonnikovi fujiensis | 希少種 | 絶滅危惧II類 | 準絶滅危惧 | - | 1991年版では種ヒメホオヒゲコウモリで評価した。 |
| ヒメホオヒゲコウモリ | Myotis ikonnikovi ikonnikovi | 希少種 | 絶滅危惧IB類 | - | - |  |
| オゼホオヒゲコウモリ | Myotis ikonnikovi ozensis | 希少種 | 情報不足 | 情報不足 | - |  |
| エゾホオヒゲコウモリ | Myotis ikonnikovi yesoensis | 希少種 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧IB類 | - | 1991年版では種ヒメホオヒゲコウモリで評価した。 |
| ヒナコウモリ | Vespertilio superans | - | 絶滅危惧II類 | - | - |  |
オヒキコウモリ科
| オヒキコウモリ | Tadarida insignis | 希少種 | 情報不足 | 絶滅危惧IB類 | 絶滅危惧II類 |  |
| スミイロオヒキコウモリ | Tadarida latouchei | 希少種 | 情報不足 | 情報不足 | 情報不足 | 1991年版では種オヒキコウモリで評価した。 |