大垣藩
幕末の領地

美濃国
石津郡のうち - 12村
下境村	462石881531・大里村　353石364014・安江村　120石660004・下一色村　221石266998・太田本新田村　79石505997・松山村　387石679993・馬沢村　120石000000・羽根村　257石529999・奥条村　210石000000・庭田村　133石690002・徳田村　121石347000・乙坂村　175石380005
多芸郡のうち - 24村
志津村	848石596008・柏尾村	89石709999・勢至村	51石459999・鷲之巣村　501石703003・竜泉寺村　126石279999・野口村　877石354004・上笠村	234石117004・高淵村	155石511002・大塚村	188石360001・安久村	94石180000・高畑村	226石190002・宇田村	1100石364990・豊村	242石500000・中村	245石350998・橋爪村	499石571014・石畑村　528石109985・上方村　354石049011・　津屋村	520石559998・舟見村　42石840000・若宮村	12石610000・桜井村	218石250000・多芸島村　1525石686035・上屋村　187石528000・大外羽村　1150石243042
不破郡のうち - 10村
徳光村	505石519989・中曾根村　710石317993・矢道村	440石790009・荒尾村	815石510010・昼飯村	636石770020・赤坂村	1081石140015・長松村　1634石411987・若森村　745石320007・青柳村	577石117004・与市新田　54石671001
安八郡のうち - 90村
草道島村　367石287994・割田村	642石174011・切石村	269石888000・宮村　244石072998・西崎村	131石951004・室村　596石114014・南寺内村　170石604004・南頬村	303石459015・禾森村	1225石608032・今福村　521石856018・難波野村　118石775002・牧新田村	141石292007・深池村　265石766998・古宮村	1182石824951・平村	677石117004・直江村	460石747009・西高橋村	256石863007・東高橋村	188石858994・長沢村	484石420990・江崎村	357石779999・今宿村	847石440979・三塚村	734石645996・津村　318石394012・上開発村　1030石180054・大島村　447石464996・加賀野村　683石854980・貝曾根村　331石011993・高屋村　120石617996・犬ヶ淵村　257石826996・東前村	586石744019・藤江村　357石574005・林本郷村	575石184998・林中村　460石480011・林東村　482石496002・楽田村　1099石057007・中川村　667石062012・領家村　1198石586060・興福地村　483石615997・河間村　451石186005・笠木村　404石153015・笠縫村　292石812988・中野村	506石822998・一色村	482石945007・木戸村　1203石782959・大村　260石937988・三本木村　374石087006・万石村　234石528000・波須村　359石862000・沢渡村	367石000000・小野村　283石704010・	・下開発村	739石770996・東結村	1406石310059・新屋敷村	27石868999・下宮村	509石054993・川西村	260石011993・前田村	419石886993・八条村	442石246002・和泉村	194石363998・中沢村	408石446991・青木村	284石144012・市島村	187石757004・北方村　918石911011・南方村　659石640991・		
更屋敷村　366石790009・末守村　1150石224976・一色村　850石473022・田村	207石619995・安次村	314石240997・丈六道村　236石811005・曾根村	697石000000・瀬古村　940石000000・柳瀬村　1004石450989・加納村	707石742981・今村　1032石052002・小泉村　539石487976・横井村　736石250000・池尻村	1200石582031・釜笛村　441石562012・島里村　244石742004・友江村	201石578003・外花村　376石968994・川口村　952石419983・米野村	427石263000・内阿原村　725石638000・築捨村	998石767029・浅草西村　859石130981・浅草東村　779石442993・浅草中村　883石663025・塩喰村　52石346180・豊喰新田村　334石512939
池田郡のうち - 53村（うち2村が廃藩置県後に笠松県に編入された。）
池田野新田	221石598007・東野村　300石424011・八幡村　226石903000・大門村　245石380005・溝尻村	261石929993・片山村　601石526978・市橋村	924石544983・藤代村　344石730011・田畑村　665石784973・小寺村　243石520004・宮地村	476石675995・小牛村　419石997009・段村　149石304001・舟子村	35石624001・市場村	462石772003・瑞岩寺村　89石449997・白樫村　513石908997・堀村　87石438004・和田村　394石269989・黒田村	221石162994・田中村　194石891998・萩原村　399石774994・本郷村　718石908020・上野村　365石208008・畑尻村	322石011993・広尾村	56石981998・三倉村	49石122002・外津汲村　90石806999・西津汲村	134石485001・日坂村　171石352997・羽根村　113石643997・川上村　51石821999・西村　96石470001・親村	63石650002・杉原村	83石861000・北村　129石457993・池戸村　19石561001・中郷村　51石823002・寺本村　120石568001・中山村	26石775000・香六村	40石096001・川合村	60石980999・上ヶ流村　47石393002・下ヶ流村	44石094002・坂本村	198石815002・種本村	183石557007・江渡村　76石996002・砂畑村　81石355003・上田村　378石875000・新宮村　154石244003・青柳村	163石731995・願成寺村　231石653000・粕河原新田	360石894348
大野郡のうち - 45村（うち2村が廃藩置県後に笠松県、4村が野村藩に編入された。）
島村　158石526001・西方村　515石000000・一ツ木村　554石703979・志名村　196石345001・上磯村	445石309998・岐礼村　525石627014・高科村	330石483002・大衣斐村　306石260010・古橋村　407石839996・宝江村　465石184998・堤村	196石384003・横屋村　466石947998・北脇村　233石419998・大月村	457石709991・呂久村　592石320007・中宮村　356石880005・宮田村　520石010010・福島村	238石020004・森村　608石799988・政田村　835石775024・下磯村　464石820007・加納村　425石519989・相羽村　428石799988・野村　1470石859985・六里村	385石899994・桜大門村　278石510010・東黒野村　360石149994・西上秋村　1350石000000・木振村　59石263000・更地村　1493石729980・赤石村　127石043999・石神村　303石940002・高屋村	760石344971	・屋井村　501石420013・有里村　362石149994・海老村	129石229996・下方村　457石739990・国領村　208石259995・
谷汲村	56石330002・下長瀬村　354石200012・上長瀬村　322石167999・東津汲村	91石320000・樫原村	34石009998・宇津志村　21石430000・小津村	268石220001・本庄村　212石091003・高尾村　159石292007・水鳥村　134石677002・大井村　129石087006・大河原村　42石313000・稲畑村　101石542000
版籍奉還後に、下岡島村	旧旗本領）岡田二之助知行　11石486000が大垣藩領に加えられた。
本巣郡のうち - 31村
山口村	315石929993・神海村	118石362000・佐原村	86石407997・木倉村	94石953003・川内村	249石253006・奥村　118石150002・金原村	92石379997・平野村	28石770000・板所村	202石024994・市場村	61石212002・神所村	104石875999・中村　80石514999・越卒村　146石854996・門脇村	61石092999・長嶺村	130石626007・天神戸村　121石806000・長島村	67石345001・黒津村	75石116997・越波村	109石813004・上大須村　81石430000・下大須村　173石925995・松田村　84石584000・西小鹿村	15石463000・東小鹿村　23石420000・東坂屋村	157石052002・西坂屋村　92石662003・口谷村	34石465000・奥谷村	108石143997・樽見村　71石149002・内野村　121石846001・木知原村	76石487999
方県郡のうち - 2村（廃藩置県後に笠松県に編入された）
岩崎村	748石484009・東粟野村　345石769012