飛地
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青森県むつ市宇曽利湖、恐山菩提寺周辺 北緯41度19分45秒 東経141度05分21秒﻿ / ﻿北緯41.32917度 東経141.08917度﻿ / 41.32917; 141.08917
周囲は、下北郡大畑町。2005年3月14日の合併（大畑町・川内町・脇野沢村のむつ市編入）により解消。
青森県弘前市大字国吉他（旧・東目屋村） （地図） [ 要検証 ]
周囲は中津軽郡岩木町、相馬村、西目屋村。2006年2月27日の合併（新・弘前市誕生）により解消。
福島県福島市立子山 北緯37度40分11秒 東経140度31分21秒﻿ / ﻿北緯37.66972度 東経140.52250度﻿ / 37.66972; 140.52250
周囲は伊達郡飯野町大字青木、大字明治。2008年7月1日の合併（飯野町の福島市編入）により解消。
群馬県高崎市倉渕地区（旧・倉渕村） 北緯36度26分 東経138度46分﻿ / ﻿北緯36.433度 東経138.767度﻿ / 36.433; 138.767
2006年1月23日の高崎市編入により飛地となったが、同年10月1日の合併（榛名町の高崎市編入）により解消。
埼玉県川口市新郷地区（旧・新郷村） 北緯35度49分25秒 東経139度46分02秒﻿ / ﻿北緯35.82361度 東経139.76722度﻿ / 35.82361; 139.76722
飛地状態解消直前時点での周囲は北足立郡鳩ヶ谷町・草加町・安行村・東京都足立区。1950年11月1日、旧鳩ヶ谷町地区の分離により飛地となった。その後1956年4月1日に、安行村の川口市への編入により解消。
埼玉県上福岡市南台 北緯35度51分52秒 東経139度30分40秒﻿ / ﻿北緯35.86444度 東経139.51111度﻿ / 35.86444; 139.51111
周囲は入間郡大井町鶴ケ舞、東久保。2005年10月1日の合併（ふじみ野市誕生）により解消。
神奈川県相模原市、旧相模湖町・津久井町地区 北緯35度34分 東経139度13分﻿ / ﻿北緯35.567度 東経139.217度﻿ / 35.567; 139.217
2006年3月20日の相模原市編入により飛地となったが、2007年3月11日の合併（城山町の相模原市編入）により解消。本体よりも大きいという珍しい飛地だった。
神奈川県小田原市前川（西半部）
かつては足柄下郡橘町前川の一部でありながら小田原市に囲まれた飛地であったが、同町の小田原市への編入により解消。
新潟県新潟市岩室地区（旧・西蒲原郡岩室村） 北緯37度43分 東経138度52分﻿ / ﻿北緯37.717度 東経138.867度﻿ / 37.717; 138.867
周囲は西蒲原郡巻町、吉田町、弥彦村、三島郡寺泊町。2005年3月21日の新潟市編入により飛地となったが、同年10月10日の合併（巻町の新潟市編入）により解消。
新潟県北蒲原郡水原町堀越・里の一部（陸上自衛隊大日原演習場周辺） 北緯37度46分45秒 東経139度18分37秒﻿ / ﻿北緯37.77917度 東経139.31028度﻿ / 37.77917; 139.31028
周囲は北蒲原郡笹神村、安田町、東蒲原郡三川村。2004年4月1日の合併（阿賀野市誕生）により解消。
新潟県北蒲原郡豊栄町岡方地区（旧・岡方村）
周囲は新潟市、北蒲原郡長浦村、京ヶ瀬村、中蒲原郡横越村。1959年7月22日の合併（長浦村の豊栄町編入）により解消。豊栄市を経て現在は新潟市北区。
福井県丹生郡朝日町大谷寺（越知神社室堂・奥の院周辺） 北緯35度59分39秒 東経136度01分37秒﻿ / ﻿北緯35.99417度 東経136.02694度﻿ / 35.99417; 136.02694
周囲は福井市尼ヶ谷町、丹生郡織田町茗荷・笈松（現・越前町）。2005年2月1日の合併（新・越前町誕生）により解消。
長野県飯田市座光寺 北緯35度32分 東経137度51分﻿ / ﻿北緯35.533度 東経137.850度﻿ / 35.533; 137.850
周囲は下伊那郡上郷町、高森町。1993年7月1日の合併（上郷町の飯田市編入）により解消。
静岡県静岡市清水区蒲原 北緯35度07分 東経138度37分﻿ / ﻿北緯35.117度 東経138.617度﻿ / 35.117; 138.617
2006年3月31日の合併（蒲原町の静岡市編入）により飛地となったが、2008年11月1日の合併（由比町の静岡市編入）により解消。
静岡県浜松市篠原町（一部） 北緯34度41分35秒 東経137度37分03秒﻿ / ﻿北緯34.69306度 東経137.61750度﻿ / 34.69306; 137.61750
周囲は浜名郡舞阪町・雄踏町。2005年7月1日の合併（舞阪町・雄踏町の浜松市編入）により解消。
三重県桑名郡長島町の一部 （長良川・揖斐川の背割堤部分）
木曽三川分流工事に伴い、長良川の新河道が通されたため飛地化。背割堤の長島町部分には（通過のみの東名阪道揖斐長良川橋を除けば）橋はなく、北端で岐阜県海津町と、南端で三重県桑名市と接していた。2004年12月6日の合併（新・桑名市の誕生）により解消。
三重県一志郡三雲町米ノ庄地区 北緯34度36分01秒 東経136度30分32秒﻿ / ﻿北緯34.60028度 東経136.50889度﻿ / 34.60028; 136.50889
周囲は松阪市、一志郡嬉野町。2005年1月1日の合併（新・松阪市誕生）により解消。
滋賀県東浅井郡湖北町延勝寺の一部及び伊香郡高月町片山の一部 北緯35度27分 東経136度09分﻿ / ﻿北緯35.450度 東経136.150度﻿ / 35.450; 136.150
琵琶湖対岸の伊香郡西浅井町の半島東岸。2010年1月1日に3町とも長浜市に編入され、解消。明治11年まで西浅井町（旧塩津村、永原村）は浅井郡の所属であり、伊香郡を間に挟んで飛び地になっていた。
奈良県桜井市上之郷地区（旧・上之郷村）
周囲は天理市、磯城郡大三輪町、初瀬町、山辺郡都祁村、宇陀郡榛原町。1959年2月23日の合併（初瀬町の桜井市編入）により解消。
兵庫県神戸市生田区港島、港島中町 （ポートアイランド第1期）
葺合区の対岸で埋め立てが行われたが、生田区に編入された。1980年12月1日に両区が合併し中央区が成立したことで解消。
兵庫県津名郡淡路町浦、仮屋、久留麻、釜口 [ 要検証 ]
淡路町から東浦町が分立した際に戸別に淡路町に残った世帯が存在した。2005年4月1日の合併（淡路市誕生）により解消。
和歌山県那賀郡打田町黒土
周囲は那賀郡粉河町と桃山町。2005年11月7日の合併（紀の川市誕生）により解消。
広島県福山市内海町、内海町イ、内海町ハ、内海町ロ 北緯34度21分 東経133度17分﻿ / ﻿北緯34.350度 東経133.283度﻿ / 34.350; 133.283
周囲は沼隈町。2005年2月1日の合併（沼隈町の福山市編入）により解消。
広島県呉市下蒲刈町（下蒲刈島） 北緯34度11分 東経132度40分﻿ / ﻿北緯34.183度 東経132.667度﻿ / 34.183; 132.667
2000年に架橋により広島県本土と陸続きになったが、架橋で結ばれた先は川尻町。2003年4月1日の呉市編入により飛地となった。2004年4月1日の合併（川尻町の呉市編入）により解消。
山口県新南陽市高瀬・和田地区 北緯34度09分 東経131度44分﻿ / ﻿北緯34.150度 東経131.733度﻿ / 34.150; 131.733
周囲は徳山市、鹿野町、徳地町。2003年4月21日の合併（周南市誕生）により解消。
香川県三豊郡大野原町青岡 北緯34度05分54秒 東経133度41分00秒﻿ / ﻿北緯34.09833度 東経133.68333度﻿ / 34.09833; 133.68333
周囲は観音寺市木之郷町、粟井町。2005年10月11日の合併（新・観音寺市誕生）により解消。
徳島県徳島市入田町（旧・名西郡入田村の一部） 北緯34度02分16秒 東経134度26分47秒﻿ / ﻿北緯34.03778度 東経134.44639度﻿ / 34.03778; 134.44639
周囲は石井町、阿野村、鬼籠野村、上八万村、国府町。1955年1月1日の徳島市編入により飛び地となったが、同年2月11日の合併（上八万村の徳島市編入）により解消。
徳島県麻植郡山川町字西野峰 北緯34度00分14秒 東経134度14分00秒﻿ / ﻿北緯34.00389度 東経134.23333度﻿ / 34.00389; 134.23333
周囲は美郷村。2004年10月1日の合併（吉野川市誕生）により解消。
佐賀県東松浦郡浜玉町鳥巣 北緯33度24分02秒 東経130度06分50秒﻿ / ﻿北緯33.40056度 東経130.11389度﻿ / 33.40056; 130.11389
周囲は七山村、厳木町。2005年1月1日の合併（新・唐津市誕生）により厳木町側を解消、2006年1月1日に唐津市が七山村をようやく編入して完全に解消。
長崎県佐世保市浅子町、旧小佐々町地区 北緯33度13分35秒 東経129度36分14秒﻿ / ﻿北緯33.22639度 東経129.60389度﻿ / 33.22639; 129.60389
周囲は北松浦郡鹿町町、佐々町。2005年4月1日の合併（吉井町の佐世保市編入）、そして2010年3月31日の合併（鹿町町、および鹿町町に隣接する江迎町の2町が共に佐世保市編入）により解消。
鹿児島県鹿児島郡西武田村大字武の一部 北緯31度34分24秒 東経130度33分46秒﻿ / ﻿北緯31.57333度 東経130.56278度﻿ / 31.57333; 130.56278
周囲は鹿児島市。1911年に大字武の飛地部分が分割され鹿児島市下荒田町及び高麗町に編入されたことにより解消。現在の鹿児島市天保山町、高麗町。
鹿児島県鹿児島市東桜島地区 北緯31度35分 東経130度42分﻿ / ﻿北緯31.583度 東経130.700度﻿ / 31.583; 130.700
周囲は垂水市、鹿児島郡桜島町。2004年11月1日の合併（桜島町の鹿児島市編入）により解消。
鹿児島県薩摩郡宮之城町柊野 北緯32度00分 東経130度26分﻿ / ﻿北緯32.000度 東経130.433度﻿ / 32.000; 130.433
周囲は出水市、薩摩郡鶴田町。2005年3月22日の合併（薩摩郡さつま町誕生）により解消。
鹿児島県出水市荘 北緯32度05分36秒 東経130度16分35秒﻿ / ﻿北緯32.09333度 東経130.27639度﻿ / 32.09333; 130.27639
周囲は出水郡高尾野町、野田町。2006年3月13日の合併（新・出水市誕生）により解消。
鹿児島県出水郡高尾野町江内 北緯32度06分 東経130度15分﻿ / ﻿北緯32.100度 東経130.250度﻿ / 32.100; 130.250
周囲は出水市、阿久根市、出水郡野田町。2006年3月13日の合併（新・出水市誕生）により解消。
鹿児島県川辺郡坊津町秋目 北緯31度21分31秒 東経130度11分50秒﻿ / ﻿北緯31.35861度 東経130.19722度﻿ / 31.35861; 130.19722
周囲は笠沙町、大浦町。2005年11月7日の合併（南さつま市誕生）により解消。
沖縄県那覇市首里（旧・首里市） 北緯26度13分18秒 東経127度43分32秒﻿ / ﻿北緯26.22167度 東経127.72556度﻿ / 26.22167; 127.72556
1957年12月7日、真和志市の那覇市編入により解消。