ムシクイ類
系統と分類

分類対照表を以下に示す。現在の科それぞれについて、どれだけの種がムシクイ類に含まれていたかを示している。列（縦）のうち、Old World Warblers とされてきた伝統的なウグイス科、および、Sibley & Ahlquist (1990) により Old World Warblers とされた（彼らによる）ヨシキリ亜科の背景を緑色にしている。また行（横）のうちでは、英語名に Warblers が現れる科の背景を緑色にしている。Sibley & Ahlquist は伝統的なオーストラリアムシクイ科を複数科に分割したが省略している。「P」はその分類群の一部 (part) のみ記されていることを示す。その他の詳細は#属と種を参照。
| 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 |
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| 伝統 分類 | 伝統 分類 | 伝統 分類 | 伝統 分類 | ウグイス科 | ウグイス科 | ウグイス科 | ウグイス科 |   |   | そ の 他 | 各 科 の 合 計 |
| 伝統 分類 | 伝統 分類 | 伝統 分類 | 伝統 分類 | ウグイス科 | ウグイス科 | ウグイス科 | ウグイス科 |   | オ ｜ ス ト ラ リ ア ム シ ク イ 科 | そ の 他 | 各 科 の 合 計 |
| 伝統 分類 | 伝統 分類 | 伝統 分類 | 伝統 分類 | ウグイス科 | ウグイス科 | ウグイス科 | ウグイス科 | キクイタダキ科 | オ ｜ ス ト ラ リ ア ム シ ク イ 科 | そ の 他 | 各 科 の 合 計 |
| Sibley & Ahlquist | Sibley & Ahlquist | Sibley & Ahlquist | Sibley & Ahlquist |   | ウグイス科 P | ウグイス科 P | セッカ科 | キクイタダキ科 | オ ｜ ス ト ラ リ ア ム シ ク イ 科 | そ の 他 | 各 科 の 合 計 |
| 現在の分類 | 現在の分類 | 現在の分類 | 現在の分類 |   | ヨ シ キ リ 亜 科 | そ の 他 | セッカ科 | キクイタダキ科 | オ ｜ ス ト ラ リ ア ム シ ク イ 科 | そ の 他 | 各 科 の 合 計 |
| ミツスイ上科 P | ミツスイ上科 P | オーストラリアムシクイ科 | Maluridae |  |  |  |  |  | 028 |  | 028 |
| ミツスイ上科 P | ミツスイ上科 P | ミツスイ科 | Meliphagidae |  |  |  |  |  | 005 | 178 | 183 |
| ミツスイ上科 P | ミツスイ上科 P | ヒゲムシクイ科 | Dasyornithidae |  |  |  |  |  | 003 |  | 003 |
| ミツスイ上科 P | ミツスイ上科 P | トゲハシムシクイ科 | Acanthizidae |  |  |  |  |  | 063 | 001 | 064 |
| ミツスイ上科 P | ミツスイ上科 P | 科不明 | incertae sedis |  |  |  |  |  | 003 |  | 003 |
| カ P | カ P | オウギビタキ科 | Rhipiduridae |  |  |  |  |  | 001 | 044 | 045 |
| スズメ小目 P | センニョヒタキ科 | センニョヒタキ科 | Stenostiridae | 001 | 001 |  |  |  |  | 008 | 009 |
| スズメ小目 P | ウグイス上科 P | ハシナガムシクイ科 | Macrosphenidae | 018 | 018 |  |  |  |  |  | 018 |
| スズメ小目 P | ウグイス上科 P | ウグイス科 | Cettiidae | 034 | 034 |  |  |  |  | 004 | 038 |
| スズメ小目 P | ウグイス上科 P | エナガ科 | Aegithalidae | 002 | 002 |  |  |  |  | 011 | 013 |
| スズメ小目 P | ウグイス上科 P | メボソムシクイ科 | Phylloscopidae | 075 | 075 |  |  |  |  |  | 075 |
| スズメ小目 P | ウグイス上科 P | ヨシキリ科 | Acrocephalidae | 055 | 055 |  |  |  |  |  | 055 |
| スズメ小目 P | ウグイス上科 P | センニュウ科 | Locustellidae | 055 | 020 | 035 |  |  |  |  | 055 |
| スズメ小目 P | ウグイス上科 P | テトラカヒヨドリ科 | Bernieridae | 002 | 002 |  |  |  |  | 009 | 011 |
| スズメ小目 P | ウグイス上科 P | セッカ科 | Cisticolidae | 157 | 030 |  | 127 |  |  | 003 | 160 |
| スズメ小目 P | ウグイス上科 P | チメドリ科 | Pellorneidae | 001 |  | 001 |  |  |  | 069 | 070 |
| スズメ小目 P | ウグイス上科 P | ダルマエナガ科 | Sylviidae | 029 |  | 028 | 001 |  |  | 041 | 070 |
| スズメ小目 P | キクイタダキ科 | キクイタダキ科 | Regulidae | 006 |  |  |  | 006 |  |  | 006 |
| スズメ小目 P | ムシクイヒタキ科 | ムシクイヒタキ科 | Hyliotidae | 004 | 004 |  |  |  |  |  | 004 |
| スズメ小目 P | ス P | セキレイ科 | Motacillidae | 001 | 001 |  |  |  |  |  | 068 |
| スズメ小目 P | ス P | オリーブアメリカムシクイ科 | Peucedramidae |  |  |  |  |  |  | 001 | 001 |
| スズメ小目 P | ス P | アメリカムシクイ科 | Parulidae |  |  |  |  |  |  | 120 | 120 |
| 計 | 計 | 計 | 計 | 440 | 242 | 064 | 128 | 006 | 100 |  |  |
ムシクイ類は Hartert (1910) により拡大したヒタキ科 Muscicapidae に含められた。その後 Delacour (1946) などにより、ムシクイ類はヒタキ科ウグイス亜科 Sylviinae に分類された。Amadon (1951) などによりヒタキ科は解体され、ウグイス亜科はウグイス科 Sylviidae となった。
キクイタダキ科とオーストラリアムシクイ科（現在の分類ではミツスイ上科の数科に分散する）をウグイス科に含めるかどうかについては議論があった。ここではキクイタダキ科を含めオーストラリアムシクイ科を含めないのを基準としたが、両方含める説、オーストラリアムシクイ科のみを含める説もあった。
Sibley & Ahlquist (1990) は、ウグイス科を拡大してチメドリ類・ダルマエナガ類を含め、ムシクイ類はウグイス科の中のヨシキリ亜科 Acrocephalinae とした。ただし、かつてのウグイス科の一部はヨシキリ亜科から除かれ、ウグイス科オオセッカ亜科 Megalurinae・ウグイス科ダルマエナガ亜科ズグロムシクイ族 Sylviini・セッカ科・キクイタダキ科となった。これらはムシクイ類とされることが比較的少ない群だったが、中には典型的な (typical) ムシクイ類とみなされていたズグロムシクイ属 Sylvia もあった（現在はチメドリ類に近いとして Sylviid Babblers などと呼ぶことも多い）。
ムシクイ類は現在は多くの科に分割されたが、そのほとんどはウグイス上科に含まれる。下に、Johansson et al. (2008); Gelang et al. (2009)によるウグイス上科の系統樹を示す。英語名に Warblers が含まれる科（表の緑背景）に ★ を、それ以外でムシクイ類を含む科に ☆ をつけた。