スーパーアルプス
店舗

店舗のうち半数以上が八王子市に出店している。現行店舗の詳細については、公式サイト内「店舗情報」を参照。
数字は店番で、出店順に「○号店」と称する。店舗名および店番の出典は、公式サイト内「会社概要・会社沿革」より。出店時期については「#沿革」節を参照。
1号店
所在地：東京都昭島市拝島町
創業の地である東京都昭島市に出店したスーパーマーケット1号店。現存しない。
2号店
所在地：東京都八王子市長房町
現存する最古の店舗。クリーニング店を併設。
都内屈指のマンモス都営団地である長房団地内の商店街「長房新栄商店街」に出店。過去に2度建て替えを行っている。都営長房団地の老朽化による建て替えと再開発事業「八王子市長房地区まちづくりプロジェクト」により、2代目店舗は2021年2月に営業を終了し、再開発区域に3代目店舗が開店する。
かつては2代目店舗の2階には銭湯があった。これは初代店舗を2代目店舗に建て替える際に、当時隣接していた銭湯も取り壊す計画であった。しかし風呂のない周辺住民からの反対に遭い、そのような住民への配慮として2代目店舗の2階に銭湯「長房湯」を設けた（TBS系テレビ番組『まんがはじめて物語』でも紹介されていた）。
2021年4月28日、コピオ長房が開業。同日、核店舗として長房店（3代目）が開店。他にカインズ、セリア、クリエイトSDなど16店舗が出店。
3号店
所在地：東京都八王子市中野山王
1973年出店という古参店舗だが、2003年3月に隣接地に移転改築したため建物は新しい。併設店舗なし。
4号店
所在地：東京都八王子市散田町3丁目（開店当時の住所表示は八王子市散田東町）
西八王子駅南口。外観が特徴的なボウリング場の居抜き店舗で、建物内の随所にもその名残が見えた。併設店舗は2階の美容室。かつてはサンテオレが出店していた。
老朽化による建て替えのため、2019年11月4日より一時閉店。「休業中は近隣店舗をご利用ください」として台町店の案内がある。
2021年10月、西八王子店の店舗が改築され、SC業態の「コピオ西八王子駅前」としてオープン。核店舗「スーパーアルプス西八王子駅前店」としてリニューアル。
5号店
所在地：東京都八王子市高倉町
北八王子駅付近、ショッピングセンター「コピオ高倉」内の店舗。リトルマーメイド、マクドナルドなどを併設。日野市との市境に位置するため、日野市指定ごみ袋の取り扱いもある。
6号店（7号店は欠番）
所在地：東京都日野市南平
京王線南平駅付近（駅前ではない）。日野市へ初出店した店舗。クリーニング店を併設。
8号店
所在地：東京都八王子市椚田町
京王高尾線狭間駅付近（駅前ではない）。東京工業高等専門学校そば。2013年に大規模な内装リニューアルを行った。過去には衣料品も取り扱っていた。また、マクドナルド→モスバーガーが出店していた時期もあるが、現在は11cutやカーブスなどが出店。
9号店
所在地：東京都八王子市西寺方町
クリーニング店を併設。付近に八王子繊維工業団地、西東京バス恩方営業所（恩方ターミナル）がある。
10号店
所在地：東京都八王子市久保山町
UR宇津木台（うつきだい）団地内に出店。インストアベーカリーはリトルマーメイドではなく「COCOBAKE」を併設。
11号店（12号店は欠番）
所在地：東京都八王子市中野町
工学院大学八王子キャンパス付近。クリーニング店を併設。
13号店
所在地：神奈川県相模原市緑区原宿（開店当時は津久井郡城山町）
ショッピングセンター「コピオ城山」の核店舗。他にコルモピア、ダイソーなどが出店。
14号店（15号店は欠番）
所在地：東京都日野市日野
リトルマーメイド、クリーニング店などを併設。
16号店
所在地：神奈川県愛甲郡愛川町角田
ショッピングセンター「コピオ愛川」の核店舗。リトルマーメイドを併設。マクドナルド、セリア、マツモトキヨシ、コルモピアなど多数出店。
17号店
所在地：東京都八王子市台町
八王子駅南口などから京王バス、富士森公園そば。クリーニング店を併設。
18号店
所在地：東京都あきる野市秋留
ショッピングセンター「コピオあきる野」の核店舗。クリーニング店を併設。100円ショップ、ゲームセンターなどが出店。
19号店（20号店は欠番）
所在地：東京都八王子市横川町
クリーニング店、美容室などを併設。
21号店
所在地：東京都町田市小山ヶ丘
小山内裏公園そば。2000年にアクロス多摩境に開店。2005年7月に開業したコピオ多摩境へ移転。リトルマーメイドを併設。他にセリア、スギ薬局などが出店。
22号店
所在地：神奈川県相模原市中央区田名塩田（開店当時は相模原市田名塩田）
クリーニング店、100円ショップなどを併設。
23号店
所在地：東京都日野市豊田
豊田駅南側（駅前ではない）。リトルマーメイド、理容室、クリーニング店を併設。八王子市からも近いため、八王子市指定ごみ袋の取り扱いもある。
24号店
所在地：埼玉県飯能市新光
リトルマーメイド、美容室などを併設。敷地に隣接してマツモトキヨシ、西松屋、ダイソーなどのロードサイド店舗が立ち並び、その一角がショッピングセンターのようになっている。
2021年3月31日閉店。跡地にはフーコットが2021年8月3日にオープン。
25号店
所在地：神奈川県相模原市緑区橋本3-3-1
2004年7月15日、橋本駅北口のショッピングセンター「SING橋本」に出店。同年7月3日には映画館「MOVIX橋本」もオープンしている。リトルマーメイドを併設していた。
2014年1月5日閉店。跡地にはドン・キホーテが出店している。
26号店
所在地：埼玉県入間市下藤沢
インストアベーカリーはリトルマーメイドではなく「COCOBAKE」を併設。他にサンドラッグ、100円ショップなど多数出店。隣接してケーヨーデイツーが出店し、その一角がショッピングセンターのようになっている。
27号店
所在地：神奈川県相模原市中央区陽光台2丁目1-3（開店当時は相模原市陽光台2丁目1-3）
上溝駅東側（駅前ではない）。2005年4月26日開店。リトルマーメイドを併設していた。
2019年9月29日の19時をもって閉店。跡地にはスギ薬局陽光台店が居抜き出店。
28号店
所在地：神奈川県伊勢原市歌川
リトルマーメイドを併設。サーティワン、はなまるうどん、サンドラッグなど多数出店。
29号店
所在地：東京都八王子市北野町
京王線北野駅北口駅前。駅前再開発で建設された「きたのタウンビル」の核店舗。元忠実屋北野店→ダイエー北野店。ダイエー閉店後に「コピオ北野」となり、地下1階にスーパーアルプスが出店。リトルマーメイドは2020年10月31日閉店。その他、マクドナルド、コルモピア、モードオフ、八王子市北野市民センターなどが入居する。
2021年2月23日リニューアルオープン。
30号店
所在地：東京都八王子市楢原町
ショッピングセンター「コピオ楢原」の核店舗。リトルマーメイドを併設し、コルモピア、ハックドラッグ、ミスタードーナツ、ダイソー、ケーヨーデイツーなど多数出店し、地域における大規模なショッピングセンターを形成している。
31号店（32号店は欠番）
所在地：東京都羽村市神明台
ショッピングセンター「コピオ羽村」の核店舗。リトルマーメイド、クリーニング店を併設。スギ薬局、100円ショップ、美容室などが出店。
33号店
所在地：埼玉県飯能市美杉台
飯能駅南側の飯能市美杉台にURが開発したニュータウン「ビッグヒルズ飯能美杉台」へ出店。インストアベーカリーはリトルマーメイドではなく「COCOBAKE」を併設。クリエイトエス・ディーが出店。
ニュータウンの住宅地をはさんで西武バス飯能営業所がある。
34号店
所在地：東京都八王子市子安町
八王子駅南口再開発で建設されたサザンスカイタワー八王子の核テナントとして2階に出店。元の計画では2・3階に東急ストアが出店を予定していたが、東急側の都合で突然白紙撤回したため出店見送りとなった。そのため地元企業であるスーパーアルプスが新たに出店表明し、2010年11月20日に八王子南口店として開業した。
35号店
所在地：東京都八王子市七国
八王子みなみ野駅周辺にURが開発したみなみ野シティ（八王子ニュータウン）内に出店。同駅から京王バス「みなみ野循環」で「七国南」停留所前。リトルマーメイド、100円ショップワッツ、クリーニング店を併設。町田市との市境に近いため、町田市指定ごみ袋・粗大ごみ券も取り扱う。通りをまたぎ隣接してウエルシアが出店する。
36号店
所在地：神奈川県相模原市緑区向原
ショッピングセンター「コピオ相模原インター」の核店舗。橋本駅と相模原インターチェンジや津久井湖の中間地点にある。インストアベーカリーは「COCOBAKE」。ドラッグストアや100円ショップの他にノジマ、ニトリデコホームなど大型店舗も出店している。。人工砂浜バーベキュー場「TACHIHI BEACH スーパーアルプス相模原インター店」もオープンした。
37号店
所在地：東京都東村山市久米川町
北多摩地区唯一の店舗。
既存店と印象の異なる店舗デザインは、八王子市散田町のデザイン会社「アイキャンディ」が担当。同社は全従業員が女性であることから、「女性視点」のデザインを企画して依頼された。白い屋根の外観はアルプスの山々をイメージし、トイレもデパートのように凝ったものとなっている。併設店舗はなし。
38号店
所在地：東京都八王子市散田町
オリンパスの社宅跡地に2019年11月13日開店。めじろ台住宅地とJR中央線の間に位置する。通常のロゴマークのほか、白基調の看板にアルプスの山々を象った模様が描かれている。
2023年3月頃に閉店。
39号店
所在地:東京都八王子市大和田町
2020年11月27日開店。フォレストモール八王子大和田の開業と同時に核店舗として出店。
リトルマーメイドを併設。その他にダイソー、サンドラッグ、眼鏡市場、ホワイト急便が入居する。