武蔵国
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細かい管轄区域の変更は各郡の項目を参照。
「旧高旧領取調帳」に記載されている明治初年時点での国内の支配は以下の通り（3,031村・1,270,550石2斗5升）。太字 は当該郡内に藩庁が所在。国名のあるものは飛地領。他に吉井藩領が存在したが、記載が岩鼻県への統合後の状況となっているため詳細は不明。
豊島郡（160村・48,733石余） - 幕府領、旗本領、伊賀者給知、明屋敷番伊賀者給知、鉄砲玉薬組同心給知、鉄砲玉薬組恩給知
荏原郡（105村・33,607石余） - 幕府領、旗本領、近江彦根藩
足立郡（397村・145,869石余） - 幕府領、旗本領、忍藩、岩槻藩
葛飾郡（290村・123,633石余） - 幕府領、旗本領、一橋徳川家領、岩槻藩
多摩郡（388村・139,468石2斗5升） - 幕府領、旗本領、鉄砲玉薬組同心給知、伊賀者給知、岩槻藩、出羽長瀞藩、上野前橋藩、三河西端藩、近江彦根藩
久良岐郡（55村・17,226石余） - 幕府領、旗本領、金沢藩
橘樹郡（134村・55,610石余） - 幕府領、旗本領
都筑郡（78村・28,579石余） - 幕府領、旗本領
埼玉郡（438村・274,873石余） - 幕府領、旗本領、一橋徳川家領、忍藩、岩槻藩、金沢藩、陸奥泉藩、出羽長瀞藩、上野前橋藩、下野足利藩、常陸下妻藩、下総古河藩、下総佐倉藩、上総久留里藩
比企郡（144村・58,581石余） - 幕府領、旗本領、川越藩、上野前橋藩、上総久留里藩
高麗郡（132村・27,543石余） - 幕府領、旗本領、一橋徳川家領、岩槻藩、上野前橋藩、下総古河藩、下総佐倉藩、上総久留里藩
男衾郡（33村・9,249石余） - 幕府領、旗本領、忍藩
入間郡（252村・100,128石2斗5升） - 幕府領、旗本領、川越藩、上野前橋藩、下総古河藩、下総佐倉藩、上総久留里藩
榛沢郡（73村・31,293石余） - 幕府領、旗本領、岡部藩、忍藩、川越藩、上野前橋藩、上総久留里藩
児玉郡（60村・27,543石余） - 幕府領、旗本領、上野前橋藩、上総久留里藩
秩父郡（86村・31,399石余） - 幕府領、旗本領、忍藩、川越藩、上野前橋藩、因幡鳥取藩
那珂郡（11村・6,943石余） - 幕府領、旗本領、上野前橋藩
横見郡（46村・20,113石余） - 幕府領、旗本領、下総古河藩、下総佐倉藩
大里郡（40村・24,359石余） - 幕府領、旗本領、忍藩、上野前橋藩、常陸下妻藩、下総古河藩
賀美郡（27村・12,666石余） - 幕府領、旗本領、上総久留里藩
新座郡（25村・14,219石余） - 幕府領、旗本領、上野高崎藩、出羽長瀞藩
幡羅郡（57村・38,908石余） - 幕府領、旗本領、忍藩、岩槻藩、上総久留里藩
慶応4年
3月19日（1868年4月11日） - 神奈川奉行が新政府軍に接収されて横浜裁判所となり、金沢藩領を除く久良岐郡・都筑郡・橘樹郡全域を管轄。ただし、旧韮山代官所、松村支配所管轄地域の一部事務は引き続き両支配所が扱った。
4月3日（1868年4月25日） – 岡部藩が藩庁を移転して三河半原藩となる。
4月20日（1868年5月12日） - 横浜裁判所が神奈川裁判所に改称。内務は管下の戸部裁判所が担当した。
5月12日（1868年7月1日） - 江戸府を設置。朱引内を管轄。
6月17日（1868年8月5日）
関東在方掛の岩鼻陣屋に岩鼻県を設置。男衾郡、幡羅郡、榛沢郡、那珂郡、児玉郡、賀美郡、秩父郡および高麗郡、横見郡、埼玉郡の一部の幕府領・旗本領を管轄。
神奈川裁判所が神奈川府に改称。
6月19日（1868年8月7日） - 忍藩士の山田政則が武蔵知県事に就任。大里郡および足立郡、横見郡、豊島郡の各一部の幕府領・旗本領を管轄（後の大宮県）。
6月29日（1868年8月17日） - 韮山代官所に韮山県を設置。比企郡および入間郡、高麗郡、久良岐郡、多摩郡の各一部の幕府領・旗本領を管轄。久良岐郡では一部事務のみ引き継ぐ。
7月10日（1868年8月27日） - 旧幕府代官の松村長為、桑山効がそれぞれ武蔵知県事に就任。松村が新座郡および入間郡、高麗郡、久良岐郡、都筑郡、多摩郡、橘樹郡、荏原郡、豊島郡の各一部（後の品川県）、桑山が足立郡、豊島郡、葛飾郡の各一部（後の小菅県）の幕府領・旗本領を管轄。久良岐郡・都筑郡・橘樹郡では一部事務のみ引き継ぐ。
7月17日（1868年9月3日） - 「江戸ヲ称シテ東京ト為スノ詔書」により、江戸府が東京府（第1次）に改称。
8月8日（1868年9月23日） - 武蔵知県事・松村長為が古賀定雄（一平）に交代。
8月25日（1868年10月10日） - 外国人の遊歩区域に含まれる多摩川南岸の区域について神奈川府の管轄とされる。移管は12月28日（1869年2月9日）に行われた。
明治元年
9月21日（1868年11月5日） - 神奈川府が神奈川県に改称。
11月5日（1868年12月18日） - 葛飾郡・足立郡・豊島郡・多摩郡・荏原郡のうち、町地とその周辺が東京府（第1次）に編入。
12月23日（1869年2月4日） - 武蔵知県事・桑山効が河瀬秀治に交代。
明治2年
1月10日（1869年2月20日） - 武蔵知県事・山田政則が宮原忠英に交代。
1月13日（1869年2月23日） - 河瀬知県事の管轄区域に小菅県を設置（太政官達第36）。
2月9日（1869年3月21日） - 宮原、古賀各知県事の管轄区域にそれぞれ大宮県、品川県を設置。
2月9日（1869年3月21日） - 久良岐郡・都筑郡・橘樹郡での武蔵知県事の一部事務を品川県が引き継ぐ。
4月10日（1869年5月21日） - 品川県のうち高麗郡と比企郡および入間郡の一部を多摩郡内の韮山県管轄地域の一部と交換、また大宮県のうち比企郡を韮山県に移管することとされた。韮山県から品川県への移管は7月11日、品川県から韮山県への移管は8月7日に実施された。
6月23日（1869年7月31日） - 金沢藩が任知藩事にともない六浦藩に改称。
9月29日（1869年11月2日） - 大宮県が県庁の移転により浦和県に改称。
11月1日（1869年12月3日） - 出羽長瀞藩が藩庁を移転して上総大網藩となる。
12月26日（1870年1月27日） - 廃藩となった吉井藩の領地（上総国の飛地を除く）を岩鼻県に編入。
明治4年
2月17日（1871年4月6日） - 上総大網藩が藩庁を移転して常陸龍崎藩となる。
7月14日（1871年8月29日） - 廃藩置県により、藩領が川越県、岩槻県、忍県、六浦県および泉県、前橋県、高崎県、足利県、下妻県、龍崎県、久留里県、古河県、佐倉県、半原県、西端県、彦根県、鳥取県の飛地となる。
10月28日（1871年12月10日） - 第1次府県統合により、岩鼻県・前橋県・高崎県が群馬県（第1期）に統合。
11月14日（1871年12月25日）
第1次府県統合により、国内は以下の各県の管轄となる。また、彦根県の国内の管轄地域の東京府への移管が太政官布告で命じられる。
東京府（第2次） - 町地とその周辺（後の東京市・東京15区）、豊島郡、荏原郡および足立郡、葛飾郡、多摩郡の各一部（おおよそ後の南足立郡、南葛飾郡、東多摩郡）。
埼玉県 - 埼玉郡および足立郡、葛飾郡の各一部（後の北足立郡、北葛飾郡）。
入間県 - 賀美郡、児玉郡、那珂郡、幡羅郡、榛沢郡、大里郡、男衾郡、秩父郡、比企郡、横見郡、入間郡、高麗郡、新座郡および多摩郡の一部（おおよそ後の北多摩郡、西多摩郡、南多摩郡）。
神奈川県 - 久良岐郡、都筑郡、橘樹郡。ほかに相模国の三浦郡と鎌倉郡も。
11月23日（同年1月3日） - 多摩郡全域は神奈川県が占めることと変更。
12月5日（同年1月14日） - 旧品川県から東京府への行政移管（多摩郡分を含む）。
12月17日（同年1月26日） - 旧浦和県から東京府への行政移管。
12月19日（同年1月28日） - 旧岩槻県から神奈川県への行政移管。
12月20日（同年1月29日） - 旧品川県から入間県への行政移管（多摩郡分を含む）。旧韮山県から神奈川県への行政移管。
明治5年
1月22日（1872年3月1日） - 多摩郡のうち東京府に移管された区域が神奈川県に移管される。
1月24日（同年3月3日） - 長浜県から荏原郡内の飛地を東京府へ編入（多摩郡内については神奈川県へ）。
1月29日（同年3月8日） - 多摩郡のうち入間県に移管された区域が神奈川県に移管される。
2月8日（同年3月16日） - 旧小菅県から東京府への行政移管。
8月19日（同年9月21日） - 多摩郡東部（現中野区・杉並区）が東京府の管轄に戻されることとされた。実際の移管は9月10日（10月12日）に実施された。
明治6年（1873年）6月15日 - 入間県が群馬県（第1期）と合併して熊谷県となる。
明治9年（1876年）8月21日 - 第2次府県統合により、熊谷県が武蔵国の管轄地域を埼玉県に合併して群馬県（第2期）に改称。埼玉県が現在の区域となる。
明治26年（1893年）4月1日 - 神奈川県のうち旧多摩郡の一部（南多摩郡・北多摩郡・西多摩郡）が東京府に移管。神奈川県が現在の区域に、東京府が現在の東京都の区域となる。
昭和18年（1943年）7月1日 - 東京都制施行（東京府廃止）。