京都駅
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1876年（明治9年）9月5日：大宮通仮停車場（現在の京都貨物駅付近） - 向日町駅間の官設鉄道が仮開業。
1877年（明治10年）
2月5日：京都停車場（京都駅）が開業。これに伴い大宮通仮停車場を廃止。明治天皇を迎えて鉄道開業式を挙行。
1879年（明治12年）8月18日：官設鉄道が当駅から大谷駅まで延伸。この路線はその後大津駅（後の浜大津駅）まで延伸され、さらに後には東海道本線の一部となった。
1895年（明治28年）9月5日：奈良鉄道（現在の奈良線）が当駅 - 伏見駅間を開業させて乗り入れ。
1897年（明治30年）
4月1日：奈良鉄道の京都駅を七条駅として分離。
11月16日：京都鉄道（現在の山陰本線）が大宮駅（のちに廃止）から延伸して当駅に乗り入れ。
1905年（明治38年）2月7日：奈良鉄道が関西鉄道に事業譲渡。七条駅は関西鉄道の駅となる。
1907年（明治40年）
8月1日：京都鉄道が国有化。
10月1日：関西鉄道が国有化。七条駅は国有鉄道の駅となる。
1908年（明治41年）6月1日：旧・奈良鉄道の七条駅を当駅に統合。
1909年（明治42年）10月12日：国有鉄道の線路名称制定。新橋駅（のちの汐留駅） - 当駅 - 神戸駅間は東海道本線、旧・奈良鉄道の路線は奈良線、旧・京都鉄道の路線は京都線となる。
1912年（明治45年）1月31日：線路名称改定。京都線が山陰本線に編入される。
1913年（大正2年）6月21日：貨物の取り扱いを新設の梅小路駅に分離。
1914年（大正3年）8月15日：2代目駅舎の使用を開始。木造ルネサンス様式の建物で豪華な貴賓室を備えていた。最終的に1915年10月完成。
1921年（大正10年）8月1日：新逢坂山トンネルの完成により、馬場駅（現在の膳所駅） - 当駅間を新線に切り替える。同時に奈良線旧線（伏見駅 - 当駅間）が廃止され、桃山駅 - 稲荷駅間に新線を建設し、東海道本線旧線（稲荷駅 - 当駅間）を奈良線に編入。
1934年（昭和9年）1月8日：駅構内で呉海兵団入営臨時列車の見送り客圧死事故（京都駅跨線橋転倒事故）が発生。
1950年（昭和25年）11月18日：駅構内の食堂からアイロンの不始末により出火し、駅舎が全焼。
1952年（昭和27年）5月27日：3代目駅舎が完成し、使用を開始。
1964年（昭和39年）10月1日：東海道新幹線の京都駅が開業。
1970年（昭和45年）10月1日：東海道本線で新快速の運転が開始され、当駅が東側の終点となる。
1985年（昭和60年）3月14日：日中時間帯の快速列車が高槻駅まで各駅に停車することに伴い、この時間帯の当駅始発・終着の普通の運行を廃止。
1987年（昭和62年）4月1日：国鉄分割民営化に伴い、新幹線部分を東海旅客鉄道（JR東海）、在来線部分を西日本旅客鉄道（JR西日本）が継承。
1988年（昭和63年）
3月13日：路線愛称の制定により、東海道本線の当駅 - 米原駅間および北陸本線の米原駅 - 長浜駅間で「琵琶湖線」、東海道本線の当駅 - 大阪駅間で「JR京都線」、山陰本線の当駅 - 園部駅間で「嵯峨野線」の愛称を使用開始。
10月1日：総工費3億円をかけて4月から建設していた山陰3・4番のりば（現在の32・33番のりば）を使用開始。
1989年（平成元年）7月22日：スーパーくろしおの一部が当駅への乗り入れが開始される。
1990年（平成2年）10月26日：奈良線用ホーム8・9番のりばを増設。従来の8番のりばを10番のりばに呼称変更。
1992年（平成4年）10月1日：旧1番線を廃止してホームを築造し、貨物通過線として使用していた旧2番線を旅客線として、1番のりばを拡幅。
1993年（平成5年）
10月1日：駅ビル建設のため、プレハブの仮設駅舎の使用を開始。
12月：駅ビル建設着工
1994年（平成6年）
9月4日：山陰1番のりばを「はるかホーム」に、山陰2 - 4番のりばを山陰1 - 3番のりばに呼称変更。
12月3日：「はるかホーム」を30番のりばに、山陰1 - 3番のりばを31 - 33番のりばに呼称変更。
1997年（平成9年）
6月28日：烏丸東口および八条東口に自動改札機を設置し、供用開始。
7月12日：4代目駅舎となる新・京都駅ビルが完成。駅部分の供用が開始される。エレベーター、エスカレーター、電光掲示板の使用を開始。在来線に接近メロディ導入。在来線改札口と近鉄京都駅との改札を分離。中央口、西口、地下中央口に自動改札機設置。
8月1日：全国でも珍しい、京都駅と京都駅ビルの専属マスコットキャラクター「テット」と「スカーラ」を制定。
9月1日：駅ビル開業を控えて日中の当駅始発・終着の普通列車の運行を復活。
9月11日：京都駅ビルが全面開業。ジェイアール京都伊勢丹が開業。
1998年（平成10年）
3月4日：新幹線の改札口に自動改札機を設置。
12月1日：京都駅・京都駅ビルのマスコットキャラクター「テット」と「スカーラ」が初お目見えする。以降、2002年春まで春・夏・冬の季節毎と毎週土日にキャラクターがショウやグリーティングを行う。
2002年（平成14年）
3月23日：1番のりばを0番のりばに呼称変更。
7月29日：JR京都・神戸線運行管理システム導入。
2003年（平成15年）11月1日：JR西日本の駅で「ICOCA」の利用が可能となる。
2007年（平成19年）
3月18日：6・7番のりばのホームかさ上げによる段差解消工事と0番のりばの待合室の設置工事が完成。駅自動放送を更新。
4月1日：自動券売機がタッチパネル式のものに交換される。
8月23日：JR京都駅NKビルが開業。ビックカメラJR京都駅店が入店。店内に嵯峨野線ホーム（30・31番のりば）と直結する改札口の西洞院口を開設。
2008年（平成20年）
2月13日：南北自由通路の西側橋上（西口改札前）に「スバコ（SUVACO）・ジェイアール京都伊勢丹」が開業。
3月30日：異常時情報提供ディスプレイが設置される（使用開始は4月1日）。
2009年（平成21年）7月20日：嵯峨野線の当駅 - 丹波口駅間が複線化される。ただし京都駅構内の一部は単線のままである。
2015年（平成27年）
3月12日：入線警告音の見直しに伴い、在来線ホームの接近メロディを音質見直し版に変更。
12月21日：8・9番のりばを拡幅。
2016年（平成28年）
3月10日：新幹線ホームにおいて、可動式ホーム柵の設置が完了。
3月26日：ダイヤ改正に伴い、特急「しなの」の乗り入れが廃止される。また、西口の改札内に電光掲示板が増設される。
11月10日：8・9番のりばのエスカレーターが供用開始。奈良線ホームのエレベーターが移設される。
12月11日：0番のりばの軌道かさ下げによるホーム段差解消工事が完了。
2017年（平成29年）
1月20日：奈良線ホームの改良工事が完成。
2月16日：中央口および西口の改札内コンコースの電光掲示板の一部がフルカラーのものに交換される。
6月1日：地下東口の改札内コンコースに電光掲示板が新設される。
6月17日：周遊型臨時寝台列車「TWILIGHT EXPRESS 瑞風」の停車駅となる。
2018年（平成30年）
3月17日：在来線に駅ナンバリングが導入される。
9月4日：台風21号の影響により天井のガラス板が落下し、数人が怪我をする事故が発生。
2020年（令和2年）9月11日：当駅を始発・終着とする特急「WEST EXPRESS 銀河」の運行を開始。
2022年（令和4年）
3月6日：2番のりばに昇降式ホーム柵が設置され、供用開始。
10月19日：5番のりばに昇降式ホーム柵が設置され、供用開始。
12月25日：地下中央口改札を閉鎖。
2023年 (令和5年)
5月7日：ビックカメラJR京都駅店の閉店に伴い、西洞院口が閉鎖。
2024年（令和6年）3月16日：ダイヤ改正に伴い、らくラクはりまの発着駅となる。