日本のアニメーションの歴史
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2000年
『鋼鉄天使くるみ』が世界初の8cmDVDシングルアニメとして発売される。
4月26日、『NieA 7』がWOWOWノンスクランブル枠で放送される。放送後はその回が公式サイトで無料配信される、日本初のインターネット再放送を行った。
妖怪神社/むじゃら（水木しげる）鳥取県境港市にオープン。
『はじめの一歩』 深夜アニメとしては異例の視聴率4.5%（平均）を記録する。
日本国内でBSデジタル放送が放送開始。地上波キー局ほどではないが、次第にBSアニメを含めたテレビアニメ作品が放送されるようになる。
2001年
10月6日、『Sci-Fi HARRY』が初の日韓同時放映テレビアニメとして放映される。
『I-wish you were here-』がネット専用ストーリーアニメとして日本で初めてストリーミング方式で放送される。
宮崎駿の『千と千尋の神隠し』が興行収入300億円を記録し、歴代邦画収入記録を二作続けて更新。
『フィギュア17 つばさ&ヒカル』の放映開始。1977年の『野球狂の詩』以来久しくなかった月1回1時間枠となる。
三鷹の森ジブリ美術館（正式名称は三鷹市立アニメーション美術館）オープン。美術館の管理運営は財団法人『徳間記念アニメーション文化財団』
三鷹の森アニメフェスタ第一回開催。
東京杉並区で、アニメーションフェスティバルin杉並第一回開催。
練馬アニメーションフェスティバルin大泉第一回開催。
2002年
『NARUTO -ナルト-』が放映。アメリカで人気を博し、世界各国で放送された。
2001年度からアカデミー賞に長編アニメーション部門が新設される。最初の受賞作となったのは、『シュレック』（アメリカ）。
第一回目の東京国際アニメフェアを東京国際展示場で開催。
日本動画協会設立。経済産業省の呼び掛けによるもので、アニメ制作会社36社が正会員、18社が準会員。
デジタルへの移行は以前から進んでいたが、まだ大半のアニメでセル画を使用していた。しかし、この年は転機となり、おじゃる丸、忍たま乱太郎（NHK教育テレビ）、名探偵コナン（よみうりテレビ）・ドラえもん、クレヨンしんちゃん（テレビ朝日）・ポケットモンスター（テレビ東京）など多くのアニメが一気にセル画からデジタル制作へ移行。翌年2003年以降に制作される多くのアニメがはじめからデジタル制作になっていった。
2003年
ディズニーではジョン・マスカーやロン・クレメンツらを解雇して手描きアニメからの撤退を表明（後にディズニーがピクサーを買収し、チーフクリエイティブオフィサーに就任したジョン・ラセターがディズニーの手描きアニメの復活を表明）、また韓国では『ポンポン ポロロ』を境に韓国製アニメはフルCGでの制作が非常に多くなったが、日本では手描きアニメの時代が続くことになった。
アメリカで2002年に劇場公開された宮崎駿の『千と千尋の神隠し』がアカデミー賞・長編アニメーション部門賞を受賞。
『アストロボーイ・鉄腕アトム』フジテレビ系にて、リメイク放送。
『ダック・ドジャース』放送開始。(アメリカ)
『カレイドスター』が放映。21世紀のアニメーションで人気を博した。
東映アニメーションギャラリーが大泉スタジオ内（練馬区東大泉）にオープン。主に東映作品を展示・紹介（大泉スタジオ建て替え後の2018年7月に東映アニメーションミュージアムとして再開館）。
2004年
朝日放送の『プリキュアシリーズ』の第1作『ふたりはプリキュア』が放送開始。10年以上続く人気シリーズとなる。
テレビ東京の『ケロロ軍曹』が放送開始。サンライズが制作したテレビアニメとしては最長の話数（7年間全357話）となった。
日本では、押井守（『イノセンス』）、大友克洋（『スチームボーイ』）、宮崎駿（『ハウルの動く城』）といった、当時の言葉でいう「ジャパニメーション」の巨匠が相次いで劇場作品を発表したが、『ハウルの動く城』以外は興行的に振るわず、成功を収めた『ハウルの動く城』にしても最終的な興行成績は前作『千と千尋の神隠し』には届かなかった。また、『APPLESEED』は公開前から続篇製作の決定がなされるなど話題が多い年であったが、『アップルシード』シリーズの続篇製作は当時の発表より大幅に遅れている。
練馬アニメーション協議会（前身「アニメミュージアムの会」）が、虫プロや東映アニメーションなど、練馬区内の約50の事業所で設立され、練馬区のアニメ振興を計っている。
コナミの『Get Ride! アムドライバー』が放送。玩具やゲームもすぐに発売された。一年放送アニメにしては、豪華な商品展開だった。
2005年
フジテレビのノイタミナ枠が開始される。一般女性向け深夜アニメという新たな分野が開拓された。
アニメ『テレビ朝日版 ドラえもん』がリニューアル。主演声優陣が交代し、ドラえもん役は大山のぶ代から水田わさびに代わった。
『機動戦士Ζガンダム』20周年記念作品『機動戦士Ζガンダム 星を継ぐ者』が公開。『Ζガンダム』の劇場版3部作が来春までに公開されている。
東京杉並区に杉並アニメーションミュージアム竣工。
吉祥寺アニメワンダーランドの目玉企画の一つ、吉祥寺アニメ映画祭第一回開催。
秋葉原UDXの東京アニメセンターなどで、東京国際映画祭との共催企画として、アニメを上映したり、声優のイベントなどを行う『秋葉原エンタまつり』が開始。
2006年
日本のTVアニメにおいて、HDTV対応16:9の画面サイズ（アスペクト比）で作成された作品数が、初めて過半数に達する。
地上波初のFlashアニメ『THE FROGMAN SHOW（『秘密結社鷹の爪』、『古墳ギャルのコフィー』）』がテレビ朝日系でアニメ化。
独立局各局にて『涼宮ハルヒの憂鬱』放送。深夜アニメヒットの起爆剤的存在となる。
ニコニコ動画がサービス開始。MAD動画などの投稿で作品がヒットする要因となった。
『ゲド戦記』公開。作品以上に監督の世襲という点が注目された。
フジテレビがアニメ映画に参入し、『ブレイブ・ストーリー』公開。
秋葉原UDXに、日本のアニメを内外に発信する情報拠点、東京アニメセンター開設。
練馬アニメーション協議会がフランスのアニメ企業との交流事業で渡仏。
広島アニメーションセンター事業本部、期間限定開催（新同センター建設構想あり）。
『トムとジェリーテイルズ』放送開始。初期の作品ではトムとジェリーの生みの親ジョセフ・バーベラが脚本・プロデューサーとして参加している。(アメリカ)
京都国際マンガミュージアム京都市にオープン。
『時をかける少女』公開、最初東京都内一館のみでの放映だったが、ネット、口コミでの話題を集め、全国でのロングラン興行となった。
TBS系列でTVアニメ『コードギアス 反逆のルルーシュ』が放送開始。『ガンダム』『トランスフォーマー』『エヴァンゲリオン』など、それぞれの世代で革新的な設定であったロボットアニメ作品に続く、新たな世代のロボットアニメーションとして、ロボット、学園、神秘、超能力など、さまざまなジャンルを併せ持つ作品として知られている。
『四谷怪談』（原作鶴屋南北）、『天守閣物語』（原作泉鏡花）などが、従来のアニメ制作者の枠を越え「怪 ～ayakashi～ 製作委員会」という、ドラマやバラエティのプロデューサーらとのコラボチームで制作されフジテレビ系にて深夜に放送される。
2007年
日本アカデミー賞にアニメーション作品賞が新設される。『時をかける少女』が最優秀アニメーション作品賞を受賞。
世界初のFlashアニメ映画、『秘密結社鷹の爪 THE MOVIE 〜総統は二度死ぬ〜』が公開。NY国際インデペンデント映画祭のアニメーション部門 最優秀作品賞とアニメーション部門 国際アニメーション 最優秀監督賞の2部門を受賞。
『ゲゲゲの鬼太郎』が日本の最多リメイク記録を更新（5回目のアニメ化）。
世界名作劇場シリーズがBSフジで復活。復帰作は『レ・ミゼラブル 少女コゼット』。
空気系がブームになる。代表的な作品として『ひだまりスケッチ』『らき☆すた』がある。
2007年3月、フランスのアニメ関係者が練馬区を訪問するなどの交流事業がきっかけとなり、2007年6月11日からフランスのアヌシーで毎年開催されている世界で最も歴史が長いアヌシー国際アニメーション映画祭と同時に開かれているアヌシー国際アニメーション見本市に、練馬区のアニメ企業10社が出展した。アニメの販売や共同制作など具体的な事業交流を進めていくこととなった。
『新世紀エヴァンゲリオン』のリブート映画シリーズの第1作目『ヱヴァンゲリヲン新劇場版:序』が公開。
京田辺警察官殺害事件をきっかけに『ひぐらしのなく頃に解』『School days』放映自粛騒動が発生。また、同時期に札幌での教頭児童買春事件をきっかけに『こどものじかん』を放映予定だった一部ネット局が急遽放映休止を決定する事態も発生した。
東京国際映画祭が、アニメ、漫画などの紹介や商談会、シンポジウムなどを催す国際コンテンツ・カーニバルに改称して、10月に開催予定。
『ゲゲゲの妖怪楽園』が鳥取県境港市にオープン。
『横浜アンパンマンこどもミュージアム』横浜市にオープン。
『のだめカンタービレ』がノイタミナで放映。第2期『のだめカンタービレ 巴里編』では、深夜枠では異例の視聴率6.6%を記録する。
『ジョジョの奇妙な冒険』のOVA（2001年製作）の一部話がイスラム教のコーランの描写を巡って、中東のムスリムから猛抗議を受け、翌年に該当話のDVDが出荷停止になる。
2008年
『ゲゲゲの鬼太郎』シリーズ放映40周年を記念し、『墓場鬼太郎』放映開始。
『河童のクゥと夏休み』が、アニメ作品では『千と千尋の神隠し』以来6年ぶり、ジブリ作品以外では初となるキネマ旬報ベスト・テンに選出。
「マクロスシリーズ」生誕25周年記念作品『マクロスF』が放映。
3月16日『ねりたんアニメプロジェクトin大泉』（旧練馬アニメーションフェスティバルin大泉）開催。松本零士が大泉学園駅の1日駅長就任。銀河鉄道999のキャラクタ車掌像を同駅に設置。
3月27日『東京国際アニメフェア2008』東京国際展示場で開催。特別企画として、宝塚市立手塚治虫記念館や三鷹の森ジブリ美術館など、全国43の漫画・アニメミュージアムの原画や絵コンテなどを展示。カナダ大使館、韓国文化コンテンツ振興院、米国企業、UAEからも参加。手塚治虫生誕80年、石ノ森章太郎生誕70年記念特別展示も。
4月24日 『なまくら刀』（幸内純一）の復元・上映。東京国立近代美術館フィルムセンターは、日本で劇場公開されたアニメ映画としては現存するものでは最古とされる『なまくら刀』のフィルムをデジタル技術で復元。同時に発見された「浦島太郎」などとともに『発掘された映画たち2008』で一般公開。
6月 加藤久仁生の「つみきのいえ」がアニメ界最高の権威、アヌシー国際アニメ映画祭で、クリスタル賞（グランプリ）、短編部門若手審査員賞を併せて受賞。その他同作品は2008年中に、第12回文化庁メディア芸術祭アニメーション部門大賞や、イタリアのミラノ映画祭2008のフォーカス・オン・アニメーション・アワードなど、国内外12の映画祭で19の賞を獲得した。
『崖の上のポニョ』、『スカイ・クロラ The Sky Crawlers』が公開。
『劇場版ポケットモンスター ダイヤモンド&パール ギラティナと氷空の花束 シェイミ』が公開。前売り券が238万4198枚を売り上げて、ギネス・ワールド・レコーズから「最も前売り券が売れたアニメ映画」として世界記録の認定を受けている。
2009年
1月8日、『黒神』が初の日米韓同時放映テレビアニメとして放映される。
加藤久仁生の『つみきのいえ』が、第81回米アカデミー賞（現地時間2月22日、日本時間同23日）の短編アニメ賞を受賞した。
『けいおん!』がアニメ化。作中に登場する楽器などが、一時品薄状態となった。
6月27日にヱヴァンゲリヲン新劇場版:破が日本の38都道府県、120館で公開されひと月後の7月28日には動員数200万人を突破。
7月、フランスパリ郊外で開催された日本文化を紹介する博覧会Japan Expoの入場者数が過去最高の164,000人を記録する。
8月、ロカルノ映画祭において日本のアニメや漫画を紹介する特別企画『Manga Impact』が開催される。
10月、細田守の『サマーウォーズ』が第42回シッチェス・カタロニア国際映画祭のアニメーション部門長編作品グランプリを受賞した。