銀河鉄道999の鉄道路線
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ここに記載されている大銀河本線を含めて各路線の駅一覧は、TVアニメ放送中に出版された「銀河鉄道大時刻表」の記載内容に準じている。そのため、サマルカンド以降は原作、TVアニメの停車駅と名称が異なる。これらの停車駅の名称は松本の別作品『クイーン・エメラルダス』に登場する天体からのものが多く使用されている。★があるものは、「銀河鉄道大時刻表」オリジナルのものである。
大銀河本線 111号・998号・999号 停車駅一覧
| 星／駅名 | 営業キロ | 着 | 発 | 停車時間 | 特急 | 特急 | 超特急 | 接続路線 |
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| 地球 | 0.0 |  | 01月01日00:00 |  | ● | ● | ● | 銀河中央線（乗り入れ）・カペラ高速線・内銀河環状線・オリオン大環状線・謎の外銀河線 |
| 火星 |  | 01月01日06:00 | 01月02日06:25 | 1日00時間25分 | ｜ | ● | ● |  |
| タイタン　 |  | 01月02日16:00 | 01月18日16:00 | 16日00時間00分 | ｜ | ● | ● |  |
| 冥王星 |  | 01月19日04:13 | 01月25日09:34 | 6日05時間21分 | ● | ● | ● | 銀河中央線 |
| コメット・ゾーン |  | 01月25日21:40 | 01月25日23:10 | 1時間30分 |  | ● | ● |  |
| メフィスト　 |  | 01月26日01:50 | 01月26日02:00 | 10分 |  | ● | ● |  |
| 4D3　 |  | 01月27日08:08 | 01月29日08:08 | 2日00時間00分 |  | ● | ● |  |
| 明日の星 |  | 01月31日03:00 | 02月14日03:00 | 15日00時間00分 |  | ● | ● |  |
| エルアラメイン |  | 02月15日03:13 | 02月15日13:23 | 10時間10分 |  | ● | ● |  |
| プラネットベガーズ　 |  | 02月17日04:41 | 02月18日04:39 | 23時間58分 |  | ● | ● |  |
| 空洞惑星バレラー　 |  | 02月20日10:18 | 02月21日06:18 | 20時間00分 |  | ● | ● |  |
| 枯葉の墓標 |  | 02月23日07:07 | 02月23日12:07 | 5時間00分 |  | ● | ● |  |
| かげろうの星 |  | 02月25日12:31 | 02月27日12:31 | 2日00時間00分 |  | ● | ● |  |
| 不定形惑星ヌルーバ　 |  | 03月01日23:44 | 03月06日17:44 | 4日18時間00分 |  | ● | ● |  |
| 化石の星　 |  | 03月07日19:09 | 03月09日00:27 | 1日05時間18分 |  | ● | ● | オリオン大環状線 |
| 思い出星 | 800000.0 | 03月14日06:00 | 03月28日06:00 | 14日00時間00分 |  | ● | ● |  |
| けんか別れ |  | 03月31日04:13 | 03月31日10:13 | 6時間00分 |  | ● | ▲ |  |
| ヤミヤミ　 |  | 04月02日09:34 | 04月02日11:34 | 2時間00分 |  | ● | ● |  |
| 装甲惑星　 |  | 04月05日21:40 | 04月07日23:10 | 2日01時間30分 |  | ● | ● |  |
| 雨の都 |  | 04月09日01:50 | 04月16日01:50 | 7日00時間00分 |  | ● | ● |  |
| 真理子の蛍 |  | 04月17日23:49 | 04月19日23:49 | 2日00時間00分 |  | ● | ● |  |
| 海賊惑星ジュエル　 |  | 04月21日08:08 | 04月22日08:07 | 23時間59分 |  | ● | ● |  |
| ざんげの国　 |  | 04月24日07:31 | 05月08日13:53 | 14日06時間22分 |  | ● | ● |  |
| なまけものの鏡 |  | 05月10日04:41 | 05月22日06:46 | 12日02時間05分 |  | ● | ● |  |
| サケザン大陸 |  | 05月24日08:52 | 05月24日12:02 | 3時間10分 |  | ● | ● |  |
| 完全機械化 |  | 05月26日21:27 | 05月28日01:07 | 1日03時間40分 |  | ● | ▲ |  |
| 賽の河原 |  | 05月31日17:33 | 05月31日18:03 | 30分 |  | ● | ● |  |
| 海の星 |  | 06月03日04:44 | 06月08日05:55 | 5日01時間11分 |  | ● | ● |  |
| 昨日の歌をうたう星 |  | 06月11日19:27 | 06月12日03:04 | 7時間37分 |  | ▲ | ▲ |  |
| 葬送惑星 |  | 06月14日04:28 | 06月14日08:08 | 3時間40分 |  | ● | ● |  |
| トレーダー |  | 06月16日01:45 | 06月20日00:00 | 3日22時間15分 |  | ● | ● | アルデバラン環状線 |
| 雪の都 |  | 06月24日03:22 | 06月24日06:32 | 3時間10分 |  |  | ● |  |
| マスプロン |  | 06月26日19:57 | 06月28日20:00 | 2日00時間03分 |  |  | ● |  |
| バカタレ | 1050000.0 | 06月30日23:35 | 07月01日00:00 | 25分 |  |  | ● |  |
| 怒髪帝国 | 1100000.0 | 07月03日03:53 | 07月04日03:53 | 1日00時間00分 |  |  | ● |  |
| 銀の谷 |  | 07月07日02:23 | 07月07日07:08 | 4時間45分 |  |  | ● |  |
| プレーテッド惑星 |  | 07月09日01:45 | 07月10日01:45 | 1日00時間00分 |  |  | ● |  |
| 惑星ウラトレス |  | 07月13日18:06 | 07月22日07:07 | 08日13時間01分 |  |  | ● |  |
| ゴーストコロニー |  | 07月24日13:28 | 07月24日15:48 | 2時間20分 |  |  | ▲ |  |
| ミーくんの命の館　 |  | 07月27日21:11 | 07月29日11:12 | 1日14時間01分 |  |  | ● |  |
| 卑怯者の長老　 |  | 08月02日20:07 | 08月03日08:07 | 12時間00分 |  |  | ▲ |  |
| 霧の都 |  | 08月05日07:28 | 08月11日07:00 | 5日23時間32分 |  |  | ● |  |
| 球状住宅団 |  | 08月15日07:03 | 08月15日08:03 | 1時間00分 |  |  | ● |  |
| 思い出の顔　 |  | 08月18日16:17 | 08月21日08:41 | 2日16時間34分 |  |  | ● |  |
| 枯木の山 |  | 08月23日14:17 | 08月23日14:43 | 26分 |  |  | ● |  |
| 嵐が丘 |  | 08月25日06:04 | 08月26日14:41 | 1日08時間37分 |  |  | ● |  |
| これからの星 |  | 08月29日12:00 | 08月30日12:00 | 1日00時間00分 |  |  | ● |  |
| ライフルグレネード |  | 09月03日19:35 | 09月04日23:35 | 1日05時間00分 |  |  | ● |  |
| マンモスの墓場　 |  | 09月06日07:07 | 09月07日07:07 | 1日00時間00分 |  |  | ● |  |
| 終りなき夏の惑星 |  | 09月09日14:43 | 09月11日03:00 | 1日12時間17分 |  |  | ● |  |
| 冷血帝国 |  | 09月15日23:03 | 09月16日15:36 | 16時間33分 |  |  | ● |  |
| 足音村 |  | 09月28日23:39 | 10月01日00:28 | 2日00時間49分 |  |  | ● |  |
| 夜のない街 |  | 10月06日00:20 | 10月07日05:58 | 1日05時間38分 |  |  | ● |  |
| ★サマルカンド |  | 10月09日13:34 | 10月23日01:50 | 13日12時間16分 |  |  | ● |  |
| ★サイレンの女神 |  | 10月25日09:34 | 10月30日11:10 | 5日10時間36分 |  |  | ● |  |
| ★トリケラトプス |  | 10月31日04:13 | 11月02日10:13 | 2日06時間00分 |  |  | ● | 　 |
| ★アンモナイト |  | 11月04日00:27 | 11月04日19:09 | 8時間42分 |  |  | ● |  |
| ★ゾーバグ |  | 11月06日23:44 | 11月07日17:44 | 18時間00分 |  |  | ● |  |
| ★セルス |  | 11月09日12:31 | 11月10日12:31 | 1日00時間00分 |  |  | ● |  |
| ★トリさんの楽園 |  | 11月12日10:18 | 11月12日16:18 | 6時間00分 |  |  | ● |  |
| ★ゼーラ |  | 11月13日04:41 | 11月30日04:39 | 16日23時間58分 |  |  | ● |  |
| ★コロニー |  | 12月02日08:08 | 12月04日08:08 | 2日00時間00分 |  |  | ● |  |
| ★クロレティア |  | 12月05日01:50 | 12月05日02:00 | 10分 |  |  | ● | 　 |
| ★モスガルート |  | 12月06日00:50 | 12月06日02:20 | 1時間30分 |  |  | ● |  |
| ★ミュクレット |  | 12月06日04:26 | 12月06日06:32 | 2時間06分 |  |  | ● |  |
| ★ガモズジー星 |  | 12月13日00:47 | 12月14日08:00 | 1日06時間13分 |  |  | ● |  |
| ★ベラベラス |  | 12月30日08:00 | 12月30日17:35 | 9時間35分 |  |  | ● |  |
| アンドロメダ | 2200000.0 | 12月31日12:00 |  |  |  |  | ● | 999号のパスには、地球⇔アンドロメダと記載。 |
↑  『クイーン・エメラルダス』第2巻に登場する緑豊かな惑星。読切版冒頭のモノローグでは、三連星と語られるだけで詳細は不明。『新竹取物語 1000年女王』では、小惑星の名称となっている。
↑  『エメラルダス』第2巻に登場する種族の名称。
↑  『エメラルダス』第4巻、アニメ映画『わが青春のアルカディア』に登場する惑星。
↑  『エメラルダス』第2巻に登場する太陽系の名称。馬の首星雲に存在する。
↑  『エメラルダス』第4巻に登場する赤色巨星の名称。
↑  『エメラルダス』第3巻に登場する惑星の名称。第4巻にも同名の惑星が登場する。
↑  『エメラルダス』第2巻に登場する惑星の名称。エメラルダスがトチローと初めて出会った場所。
↑  『エメラルダス』第1巻に登場するクイーン・エメラルダス号の前所有者・ソナラーナの故郷。
↑  『エメラルダス』第2巻で登場する星座の名称。前述の惑星サマルカンドが存在する。
↑  『エメラルダス』および『わが青春のアルカディア』には、宇宙の難所として「二重太陽ベスベラス」が登場。