ドラえもん のび太と雲の王国
あらすじ

難破して無人島で助けを待つ少年とその家族は「すぐに船でこの島を離れろ。さもなくば大雨によってこの島は消滅する」という何者かの警告を受ける。しかしどの道、船など無く「雨なんか降るものか」と思ったが、実際にその夜、実際に島を覆うような黒雲が大雨を降らせ、島が溶けて流れてしまった。
同じ頃、雲の上には天国があると信じてそれをからかわれたのび太にドラえもんはありもしないものを探すより、実際に自分たちで雲の上に天国（理想の王国）を作ろうと提案する。雲かためガスと雲を均す雲ローラー、雲人形を動かせるロボッター、雲ブロックを作る工事機、芝生や苔に川も作り始める。そんなおり、まるで大洪水で流されてきたような木々が海に浮いているのを見つけて調査してみるが、海底は島の上の方だけちょん切ったように不自然に浅かった。その時、のび太が落雷に襲われ転落する。それはやけに低い雷雲であった。雲に戻ると苔が伸び始めているが、城の工事は遅々として進んでいない。しかし人手を増やそうにも、工事機もロボッターも安いものでなくこのままでは完成に2〜3年もかかってしまう。その日の夕食時、たまたまパパから株式会社の仕組みを聞いたのび太はその夜、友人たちから出資を募る「株式王国」というアイデアを閃く。これによって集めた資金で雲の王国を完成させ、楽しいひと時を過ごすドラえもん達。しかし、突如として王国が地震のように揺れた。いつの間にか気流に流された王国が槍ヶ岳の頂上に引っかかってしまったらしい。そこで吹き荒ぶ極寒の山中にて謎の巨大亀（のび太曰く「ミミガメ」）とその背中に乗ったまま意識を失った少年に遭遇する。治療を施した少年はまだ意識が戻らないものの、明日には目が覚めるだろうと帰宅した5人。その夜調べてみると、あの巨大亀は6千年前、人類に刈り尽くされた絶滅動物「グリプトドン」の生き残りであったことが判明する。
後日、王国へ行くと少年の姿は無かった。消えた少年を探す為に、ごはんの匂いを放つ迷子探し機を設置して彼が戻ってくるのを待つことになったが、その間にジャイアンとスネ夫が揉め事を起こし、のび太はそれを制止する。のび太が身につけている雲の国王冠は、王国内に限り他人に命令できる機能があったのだ。一方、王国内にいれば確実に探し出せるはずの迷子探し機の甲斐も無く、あの少年は戻ってくる気配はない。一行はあのグリプトドンに手掛かりを求め、再び槍ヶ岳へ向かったが、探せども見つける気配がない。やがて頂上にあったはずの王国が消えていることに気付く。どうやら風で流されてしまったらしい。一行は王国を探すうち、豊かな自然に恵まれ地上では絶滅した動物が多数生息する謎の雲に迷い込む。そこは本物の「天上人」が住む「天上世界」の「絶滅動物保護州」であり、保護管理員のパルパルとグリオに出会う。王国から少年を連れ出したのは彼女らだった。友好的な態度のパルパルに連れられて管理施設を案内されるが、その実、彼女もグリオと同じく、地上人には警戒心と偏見を持っており、一行を大人しく帰す気はなかった。5人は食事を摂って宿泊施設で夜を明かすことになったが、鍵を掛けられ監禁されていた。その待遇に不快感を持った5人は脱出を図るもタケコプターで飛行中、黒雲の落雷に見舞われる。しずか達3人はパルパルとグリオに保護され、天上世界の首都「中央州」へと案内されることになった。一方ののび太は飛行スカーフがボロボロになって飛行不可になり、合流したドラえもんも昨夜の雷でコンピュータがやられてしまっていた。途方に暮れるのび太だが、保護州にて以前助けた小人・ドンジャラ村のホイと再会する。彼らが移住していたはずのアマゾン奥地も開発が進み、天上人に保護されていたのだ。ホイの助けを受け、追っ手の円盤から隠れつつ、湖を見つけてネッシーに乗って向こう岸へ渡る。
一方、中央州を案内されたしずか達は天上人の自然への意識の高さを知り、しずかは素直に関心したものの、ジャイアンとスネ夫は警戒心を解かない。逆に彼らの上から目線が気に入らないとして不信感を強め、何かを企んでいるのではないかと勘繰る。その後、天上人の創世神話となる映画の鑑賞をする。それは、天上人の祖先たる王が地上の楽園を別の2人の王の戦争で追われ、雲の上に逃れた後に楽園を築いたということ。そして雲の上をも狙った2人の王は大雨によって地表ごと洗い流されたという内容だった。映画が終わった頃、ドラえもん達は王国から消えた少年タガロの住む村へと到着し、彼と再会する。タガロの一家は海難事故によって無人島で暮らしていたが、天上人によって島の動植物ごと天上世界へと連れてこられたという。そしてタガロは天上人への不信感から脱走を試み、その結果、吹雪で低体温症に陥ってしまったらしい。そこをドラえもん達に助けられたのだった。彼らの協力を得て一緒に脱出しようとするも、同行すれば指輪の発信機により捕まってしまうという。そこで成功を祈ると託し、ドラえもん達はホイの手綱を巨大なコンドルに付けて飛び立った。
しずか達はその後、地上の大気汚染に苦しむ天上界が大雨を降らせて地上文明の世界を洗い流すノア計画を実行しようとしていることを、パルパルより聞かされる。地上人や動植物はあらかじめ避難させるというが、このままでは何もかもなくなってしまう。しずか達は計画の実行を決める最後の審判へ地上人代表として法廷に立つことになる。当然抗議するも「君達の先祖だってほんの何万年か前までは何もないところで生活していた」と聞く耳を持たない。同じく拉致されていた密猟者たちの悪行も被害動物によって暴露されており、地上人への印象は最悪であった。しずかの痛切な訴えすらも一蹴されてしまうが、彼女らに共感しつつあったパルパルが何も知らず連れて来られたのだから不公平と指摘した事により審議は延期となった。しかしジャイアンとスネ夫が地上に危機を知らせるべく脱走。入国記念と称して配られていた発信機付き指輪によってそれはすぐに阻止されたが、密猟者たちが円盤（パトカー）を盗んで脱走しており、地上人への反感はますます強くなってしまった。
一方、ドラえもん達は脱出できたものの場所がわからず途方に暮れていた。しかしコンドルは迷子探し機の放つ匂いを嗅ぎ付け、王国へと辿り着いた。ドラえもんとのび太は食事を取って家に戻るが、地上は大洪水に見舞われており、街は今まさに沈みゆく最中だった。押し寄せる水に呑まれるも、水に浸かったことで偶然にもドラえもんが復活する。なんとか雲の王国へ避難するが、のび太は世界が流されては全てが終わりだと絶望する。その夜、のび太は夢を見た。のび太が100点を取って見せようとするもパパやママ、更に先生までが船に乗って遠ざかっていく夢であった。目が覚めると、ドラえもんは呑気にも朝食の準備をしていた。その無神経さに「22世紀のロボットのくせに」と毒づくが、そこで「地上世界が滅ぶなら22世紀もドラえもんもないはず」という点に気付く。確認してみると、ドアの時差調整ダイヤルが10日も進んでいた。「皆で宿題をしている」というのび太の嘘に気付いたママが怒って適当にダイヤルをいじっていたのだ。そして現時点の野比家ではいつもと変わらない光景にママがいた。大洪水の発生は確定していない未来の一つであったのだ。その未来を変えるべく、ドラえもんとのび太は天上世界を煙のように消してしまう雲もどしガスを抑止力として天上人との交渉に臨む。
その夜、密猟者たちの円盤が王国の湖に墜落した。更に円盤の大編隊が包囲するも、のび太はそれを追い返し、密猟者から初めてノア計画のことを聞かされ、いよいよ交渉は失敗できなくなった。翌朝、計画の中止を迫るドラえもん達に対し、天上人に動揺が走る。密猟者は私欲と復讐心から攻撃を主張するが、あくまで抑止力だとドラえもん達は反対し、のび太が王冠の力で屈服させる。しかし隙を見せた途端に王冠を奪われ、密猟者に王国を乗っ取られてしまった。同時に、雲戻しガスの使用を止めに来たパルパルとしずか達3人ともども縛り上げられてしまう。そして主砲の第一射により「エネルギー州」は崩壊した。更に王国が中央州へと迫り、やむを得ず撃ち落とすべく一斉攻撃を開始するもシールドに守られた王国はビクともしない。ドラえもんは最後の手段として、ガスタンクに穴を開けることを決断。唯一残された武器である石頭によって扉を破り、そのままタンクに特攻し王国の歴史に終止符を打った。
天上人を救う為とはいえ、雲の王国を滅ぼし、抑止力としての武器も失って丸腰となり、更にドラえもんは意識不明の重体と、絶体絶命かに思われた。しかし、再び法廷へ立たされた4人は、ドラえもんの自己犠牲的精神を評価したパルパルや、かつてドラえもんとのび太に助けられたホイやモア、ドードーらが弁護する。更に天上人移住交渉のため植物星から派遣されていた大使が現れる。彼はドラえもんに念を送ると目を覚ました。そこで自身は地球の出身であること。正体は以前ドラえもんのひみつ道具「植物自動化液」によって知性を与えられた苗木キー坊だったことを明かす。そして地球人の中にも自然環境を省みる者が現れていることを訴え、環境が再生するまで天上人の移住を受け入れることを発表。こうしてノア計画は白紙となった。パルパルによって学校の裏山へ送られた5人は、自然環境の再生と天上人たちとの再会を誓い、どこでもドアのダイヤルを戻しては、宿題の溜まった日常へと戻っていくのだった。