秋田新幹線
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→東京駅 - 盛岡駅間の東北新幹線区間は「東北新幹線#沿革」を参照
1992年（平成4年）
1月28日：JR東日本が秋田・盛岡間のミニ新幹線化を運輸省に事業申請。
1月30日：運輸省が事業認可。
3月13日：秋田駅前で起工式を挙行。
1994年（平成6年）7月6日：3線軌化着工。
1995年（平成7年）
4月19日：線区愛称を「秋田新幹線」に決定。
5月16日：秋田新幹線車両保有株式会社が設立。
1996年（平成8年）
7月30日：列車愛称を「こまち」に決定。
10月 : E3系が秋田新幹線内で初めて試験運転を開始。
12月6日：開業日とダイヤが発表される。
1997年（平成9年）
3月22日：開業。東京駅 - 秋田駅間に「こまち」がE3系5両編成で運行開始。東北新幹線内は200系やE2系と併結。
8月15日：乗車累計100万人達成。
1998年（平成10年）12月8日：全列車が6両編成に増結。
1999年（平成11年）
6月13日：乗車累計500万人達成。
12月4日：東北新幹線内の併結車両をE2系に統一、全列車最高速度275km/h運転となる。
2001年（平成13年）9月16日：乗車累計1,000万人達成。
2002年（平成14年）12月1日：全列車を全席指定席化する。
2003年（平成15年）12月20日：乗車累計1,500万人達成。
2006年（平成18年）
1月5日：日本海側を中心とした大雪の影響で、開業以来初めての終日運休。
2月11日 前日に発生した「こまち3号」の雪崩による抱き込み に伴う除雪作業の影響で、2度目の終日運休。
3月11日：乗車累計2,000万人達成。
2007年（平成19年）
3月18日：全車両を禁煙とする。
4月30日・5月6日：全国花火競技大会（大曲の花火）開催時を除いて初めての大曲駅始発列車が運転される（「こまち26号」、5026M - 5026B）。
2010年（平成22年）
2月2日：新型車両E6系の投入が発表される。2013年の営業運転開始を目標に試運転を行う。車体構造上の理由による編成定員の大幅な減少を防ぐため、1編成あたりの車両数はE3系の6両に対し、1両増の7両に増やされた。このE6系の乗り入れ準備工事として、従来6両編成までしか対応できなかった秋田駅と大曲駅ではホームを1両分延長する工事を行い、両駅共に同年夏頃までに完成した。
3月31日：秋田新幹線車両保有（株）が解散。
7月7日 : E6系（Z1編成、元S12編成）の量産試作車が落成し、秋田新幹線内で試験運転を初めて開始。
8月15日 : 乗車累計3,000万人達成。
2011年（平成23年）
3月11日：東北地方太平洋沖地震（東日本大震災）が発生。地震直後から全線で運転を見合わせ。
3月18日：盛岡駅 - 秋田駅間で4往復のみで運転再開。
3月22日：盛岡駅 - 秋田駅間で5往復に増発。
4月7日：東北地方太平洋沖地震の余震発生により全線で再び運転を見合わせ。
4月9日：盛岡駅 - 秋田駅間で運転を再開。
4月29日：東北新幹線運転再開に合わせ秋田駅 - 東京駅間の全線で運転を再開。これに合わせて有志が九州新幹線のCMに倣い下り一番列車に沿線から手を振る企画を実施（「祝!九州#反響」も参照）。
9月23日：震災前の通常ダイヤで運行開始。
11月19日：「はやて」へのE5系投入に伴い、一部列車の東北新幹線内の併結車両がE5系に変更。
2012年（平成24年）3月31日：NTTドコモのmovaサービス停波に伴い、同日を以って在来線区間の車内公衆電話サービスを終了。
2013年（平成25年）
3月2日：神宮寺駅 - 刈和野駅間で、下り「こまち25号」の先頭車両が脱線。乗客130名には負傷なし。この事故の影響で盛岡駅 - 秋田駅間で運転見合わせ。4日に運行再開。
3月16日：E6系による「スーパーこまち」運行開始。「スーパーこまち」の最高速度を宇都宮駅 - 盛岡駅間で300km/hへ引き上げ。
7月20日：E3系の量産先行車R1（元・S8）編成の定期運用を終了。秋田駅にてラストランのセレモニーを実施。
8月9日：東北地方の集中豪雨の影響により線路内に土砂が流入する等の被害が発生して全線で運転を見合わせ。12日に運転再開。
9月28日：東北新幹線内の併結車両をE2系からE5系に統一。
2014年（平成26年）3月15日：「スーパーこまち」を廃止、列車名を「こまち」に統一し、秋田新幹線全列車をE6系に置き換え、E3系の定期運用終了。東北新幹線区間の最高速度を宇都宮駅 - 盛岡駅間で320km/hへ引き上げ。
2015年（平成27年）6月12日：乗車累計4,000万人達成。
2017年（平成29年）
3月25日：E3系（0番台）による臨時列車（びゅう旅行商品ツアー列車）「秋田新幹線開業20周年記念号」を秋田駅 - 上野駅間に1往復運転。R21編成が充当された。
7月22日：大雨の影響で地盤崩落等の被害が発生し全線で運転を見合わせ。24日に盛岡駅 - 大曲駅間で運転再開の後、29日に全線で運行再開。
2019年（令和元年）
10月11日：乗車累計5,000万人達成。
12月11日 - 12月12日：秋田新幹線で秋田県産朝採り野菜を大宮駅まで運ぶ実験が行われる（JR東日本秋田支社、ジェイアール東日本物流、日本郵便東北支社による）。
12月15日：大釜駅で融雪装置が稼働開始。
2020年（令和2年）
7月8日：この日までに、赤渕駅 - 田沢湖駅間で、トンネル内携帯電話不通区間が解消。
11月14日 - 11月15日：田沢湖線羽後長野駅 - 鑓見内駅間の斉内川橋梁架替工事に伴い、一部列車が部分運休。
2022年（令和4年）
3月12日：「こまち」の特急料金を改定。
3月16日：深夜に発生した福島県沖地震の影響により、翌17日から東北新幹線への直通を見合わせ、東京駅 - 盛岡駅間を運休。4月3日まで盛岡駅 - 秋田駅間7往復の臨時ダイヤで運行された。また3月22日の秋田新幹線開業25周年を控え予定されていた記念行事が中止されている。東北新幹線の復旧の進捗に合わせ、4月4日から仙台駅 - 秋田駅間14往復で東北新幹線への直通を再開し、4月14日から東京駅 - 秋田駅全区間での運行を再開（13往復の臨時ダイヤ）、併せて秋田駅では延期されていた開業25周年記念の出発式が行われた。5月13日から通常ダイヤによる東京駅 - 秋田駅間の運行に復帰している。
5月21日：西武秋田店とJR東日本秋田支社、ジェイアール東日本物流が共同で、秋田新幹線を使って、週2回の定期的な首都圏の商品輸送を開始。
12月10日：秋田未来物流協議会は丸水秋田中央水産と連携して、秋田新幹線を使って、男鹿市船川沖で取れたハタハタを東京へ輸送する実証実験を実施。アンテナショップ「あきた美彩館」で即売。
2023年（令和5年）
7月15日：停滞する梅雨前線の影響により大雨が予想されるため、始発など上下3本を除き終日運休。
7月16日 - 7月19日：県内記録的大雨の影響により終日運休。
7月20日：始発より運転を再開。
11月18日：秋田県は県産水産物の需要拡大を図る事業の一環で、秋田新幹線を使って、男鹿市船川沖で取れたハタハタを東京へ輸送する試験輸送を実施。同日、詩の国秋田もホウレンソウなどの県産農産物を都内に輸送。
2025年（令和7年）
3月6日：東北新幹線 上野駅 - 大宮駅間で「はやぶさ・こまち21号」の連結部分が走行中に外れて両列車が分離し、西日暮里駅付近で緊急停止。半年前にも同様のトラブルがあったこともあり、当面の間、東北新幹線への直通を見合わせ、東京駅 - 盛岡駅間を運休し、盛岡駅 - 秋田駅間での折り返し運転とする。
3月14日：分離操作に関わる機器を固定する応急対策を施し、東北新幹線「はやぶさ」との連結運転および東京駅直通運転を順次再開。