多毛類
分類

多毛綱は1960年代ごろまでは、固着性の定在目 Sedentariaと自由生活をする遊在目 Errantiaの2目に分類されていたが、この分類法は従来から人為的な側面が強いと指摘されていた。その後、口器の形状、剛毛や疣足の構造などからScolecida・Canalipalpata・Aciculataの3群に分ける分類が提唱されたが、分子系統解析によってこれらも多系統群であることが分かっている。現在、かつてのSedentaria・Errantiaの2群に分ける分類法に、系統解析により得られたデータによる修正を加えた分類が提案されている。
環形動物門のうち、スイクチムシは独立したスイクチムシ綱とされてきたが、寄生生活によって特殊化が進んだ多毛類であるということがあきらかになり、多毛綱スイクチムシ目とされている。ムカシゴカイ類は原始的特徴を残した環形動物であるとして、原始環虫類とされたこともあるが、むしろ幼形成熟に由来するものと考えられるようになり、これも多毛類に含められた。
このような変遷の結果、多毛綱は環形動物門の基底に位置する側系統群であり、貧毛綱、ヒル綱も多毛綱の内部系統として含まれることが明らかになっている。また、星口動物門・ユムシ動物門・有鬚動物門（ハオリムシを含む）は、以前より多毛類との類縁性が指摘されていたが、初期発生、形質の分岐分類学的解析、EF-1αタンパク質のアミノ酸配列、遺伝子配列、ミトコンドリアの28SrDNAなどの多面的な比較から、従来考えられていた以上に一部の多毛類に近縁であることが判明している。このため、これらの動物を多毛綱に含めることも多い。
以下に下位分類群を示す。
ツバサゴカイ科 Chaetopteridae
スイクチムシ目 Myzostomida
スイクチムシ科 Myzostomidae
Endomyzostomatidae
ウミケムシ目 Amphinomida
ウミケムシ科 Amphinomidae Savigny in Lamarck, 1818
ケハダウミケムシ科 Euphrosinidae Williams, 1851
イソメ目 Eunicida
ギボシイソメ科 Lumbrineridae Schmarda, 1861
イソメ科 Eunicidae Berthold, 1827
ノリコイソメ科 Dorvilleidae Chamberlin, 1919
ナナテイソメ科 Onuphidae Kinberg, 1865
セグロイソメ科 Oenonidae Kinberg, 1865
サカナヤドリゴカイ科 Ichthyotomidae Eisig, 1906
ハートマンイソメ科 Hartmaniellidae Imajima, 1977
サシバゴカイ目 Phyllodocida
シロガネゴカイ科 Nephtyidae Grube, 1850
ユンドラシア科 Yndolaciidae Støp-Bowitz, 1987
Iospilidae Bergström, 1914
ヤムシゴカイ科 Typhloscolecidae Uljanin, 1878
オヨギゴカイ科 Tomopteridae Grube, 1850
コブゴカイ科 Sphaerodoridae Malmgren, 1867
ウロコムシ亜目 Aphroditiformia
コガネウロコムシ科 Aphroditidae Malmgren, 1867
ウロコムシ科 Polynoidea Malmgren, 1867
ボウセキウロコムシ科 Acoetidae Kinberg, 1856
ニイロウロコムシ科 Eulepethidae Chamberlin, 1919
Iphionidae Kinberg, 1856
ヒメウロコムシ科 Pholoidae Kinberg, 1858
ノラリウロコムシ科 Sigalionidae Malmgren, 1867
チロリ亜目 Glyceriformia
チロリ科 Glyceridae Grube, 1850
ニカイチロリ科 Goniadidae Kinberg, 1866
Lacydoniidae Bergström, 1914
カギアシゴカイ科 Paralacydoniidae Pettibone, 1963
ゴカイ亜目 Nereidiformia
シリス科 Syllidae Grube, 1850
ゴカイ科 Nereididae Blainville, 1818
Antonbruunidae Fauchald, 1977
タンザクゴカイ科 Chrysopetalidae Ehlers, 1864
オトヒメゴカイ科 Hesionidae Grube, 1850
カギゴカイ科 Pilargidae de Saint-Joseph, 1899
サシバゴカイ亜目 Phyllodociformia
サシバゴカイ科 Phyllodocidae Örsted, 1843
ウキゴカイ科 Alciopidae Ehlers, 1864
ユメゴカイ科 Lopadorrhynchidae Claparède, 1868
Pontodoridae Bergström, 1914
ケヤリ目 Sabellida
チマキゴカイ科 Oweniidae Rioja, 1917
Fabriciidae Rioja, 1923
カンザシゴカイ科 Serpulidae Rafinesque, 1815：イバラカンザシ
ケヤリ科 Sabellidae Latreille, 1825：ケヤリムシ
カンムリゴカイ科 Sabellariidae Johnston, 1865
シボグリヌム科 Siboglinidae：チューブワーム
スピオ目 Spionida
スピオ科 Spionidae Grube, 1850
モロテゴカイ科 Magelonidae Cunningham & Ramage, 1888
ツメゴカイ科 Trochochaetidae Pettibone, 1963
トックリゴカイ科 Poecilochaetidae Hannerz, 1956
ハグルマゴカイ科 Apistobranchidae Mesnil & Caullery, 1898
Aberrantidae Wolf, 1987
Longosomatidae Hartman, 1944
Uncispionidae Green, 1982
フサゴカイ目 Terebellida
ミズヒキゴカイ亜目 Cirratuliformia
ミズヒキゴカイ科 Cirratulidae Carus, 1863
ハボウキゴカイ科 Flabelligeridae de Saint-Joseph, 1894
ウキナガムシ科 Poeobiidae Heath, 1930
クシイトゴカイ科 Ctenodrilidae Kennel, 1882
クマノアシツキ科 Acrocirridae Banse, 1969：クマノアシツキ
ダルマゴカイ科 Sternaspidae Carus, 1863
Fauveliopsidae Hartman, 1971
フサゴカイ亜目 Terebelliformia
フサゴカイ科 Terebellidae Johnston, 1846
ウミイサゴムシ科 Pectinariidae Quatrefages, 1866
エラゴカイ科 Alvinellidae Desbruyères & Laubier, 1986
カザリゴカイ科 Ampharetidae Malmgren, 1866
タマグシフサゴカイ科 Trichobranchidae Malmgren, 1866
Scolecida
タマシキゴカイ科 Arenicolidae Johnston, 1835　タマシキゴカイ
イトゴカイ科 Capitellidae Grube, 1862
ヒトエラゴカイ科 Cossuridae Day, 1963
タケフシゴカイ科 Maldanidae Malmgren, 1867
オフェリア科 Opheliidae Malmgren, 1867
ホコサキゴカイ科 Orbiniidae Hartman, 1942
ヒメエラゴカイ科 Paraonidae Cerruti, 1909
トノサマゴカイ科 Scalibregmatidae Malmgren, 1867
incertae sedis
Dinophilidae
Diurodrilidae Kristensen & Niilonen, 1982
エビヤドリゴカイ科 Histriobdellidae Vaillant, 1890
Laetmonectidae
ホラアナゴカイ科 Nerillidae Levinsen, 1883
Parergodrilidae Reisinger, 1925
イイジマムカシゴカイ科 Polygordiidae
アシナシムカシゴカイ科 Protodrilidae Hatschek, 1888
Protodriloididae Purschke & Jouin, 1988
ギボシゴカイ科 Psammodrilidae Swedmark, 1952
ムカシゴカイ科 Saccocirridae Czerniavsky, 1881
ヒレアシゴカイ科 Spintheridae Johnston, 1865
多毛綱の解剖図
Alitta succinea（ゴカイ科）
イワムシ Marphysa sanguinea（イソメ科） 
イワイソメ、本虫、マムシ、エムシとも呼ばれる
Arenicola marina（タマシキゴカイ科）
Peinaleopolynoe elvisi（ウロコムシ科）